CHR BP REF ALT NEW TS MAF MAF_allele Prop_missing_genotypes Prop_missing_alleles Allfreq_ref Allfreq_alt Genofreq_ref Genofreq_het Genofreq_alt Allcount_ref Allcount_alt Genocount_ref Genocount_het Genocount_alt 19 3102624 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3117753 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3128225 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3130418 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3141803 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3150328 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3151739 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3152250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3154965 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3157244 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3159638 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3160277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3178437 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 3181640 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 3182130 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 3188642 T G N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.428571428571429 0.142857142857143 0.428571428571429 14 14 6 2 6 19 3190297 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 3196673 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 3202439 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 3204416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3222294 G C Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 3222627 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3222805 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 3223258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3230358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3232083 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 3232514 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 3235906 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3236144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3237815 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3238453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3238475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3240121 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 3240699 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 3240760 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3248881 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3248976 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3250126 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 3250436 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 3252084 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 3252665 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 3256031 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 3257234 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 3257648 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 3258396 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3259456 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3260642 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3262865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3263752 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 3266989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3267748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3269631 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3270326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3271509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3273406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3276684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3277901 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3281751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3282655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3284133 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3285406 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3285750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3287231 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3289789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3290453 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3292469 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3293125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3293172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3293735 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3295398 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3295723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3296266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3298539 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 3298738 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 3298879 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3300008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3300107 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3300459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3300977 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 3301232 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 3301750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3303072 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 3303302 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3303743 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 3304282 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 3304388 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3304877 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3305032 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3305202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3305655 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 3305804 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3309576 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 3310209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3312016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3314140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3315566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3316332 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 3317361 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 3320567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3322512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3325224 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3326350 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3331660 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 3332211 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3334848 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 3335747 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3336553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3346671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3347911 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3348253 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3348886 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3349495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3349640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3349643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3349668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3355459 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 3355567 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 3355589 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 3356365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3356479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3357005 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3357006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3357007 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 3358159 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 3360780 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 3360928 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 3361149 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3361195 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3362608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3363148 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3365893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3366835 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3367296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3367602 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3369946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3370491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3371170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3371813 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3373090 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3373380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3375059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3376141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3377233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3377526 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 3377527 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 3377840 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3378079 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 3378181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3378195 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3378552 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 3378687 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 3378852 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3378919 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 3378970 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 3379045 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3379080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3379083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3385498 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3386467 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 3387808 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3388457 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 3389087 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3389633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3390209 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 3390412 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3390815 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 3390952 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 3391101 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 3391250 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 3391266 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 3391953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3392782 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3394076 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3394686 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3394898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3395326 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3396211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3398745 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3398955 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3399172 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3399933 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3399953 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 3399965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3400471 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3400723 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3401050 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3401502 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3402767 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3403041 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3403242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3403302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3403854 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3407658 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 3408287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3408338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3408746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3408994 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 3409119 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 3409131 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3409166 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 3409225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3409313 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3409416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3409473 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 3409836 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 3409975 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3410004 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3410087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3410158 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 3410284 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 3410396 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3412410 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3412427 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 3412717 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 3412804 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 3412884 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 3412982 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 3412986 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 3413095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3413242 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 3413253 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 3413721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3413731 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 3413865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3414221 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 3414296 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 3414304 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 3414713 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 3414750 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 3415037 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 3415045 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 3415113 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 3415116 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 3415120 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 3415194 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 3415208 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 3415342 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3415353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3415444 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 3415744 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 3416053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3416798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3417154 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3417270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3417630 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 3417638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3417673 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 3417818 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 3417830 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 3417861 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3419192 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 3419599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3420175 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 3420233 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 3420710 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 3420834 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 19 3421127 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 3421129 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 3421278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3421292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3421866 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 3421903 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3421923 C T Y Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 19 3422108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3422158 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3422945 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3423084 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3423142 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 3423375 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3423397 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3423850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3423904 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3423969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3424057 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 3424396 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 3424978 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 3425087 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 3427307 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3429357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3431773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3432172 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 3432256 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 3433956 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3434440 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 3434569 G T Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 3434841 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 3434847 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 3434892 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 3435060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3435061 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 3435153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3435851 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 3435935 A C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 3436241 C A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 3436613 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3436822 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 3437041 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 3437502 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 3437589 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 3437595 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 3437810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3438718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3439853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3440417 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3440827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3442220 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3442231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3442237 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3442347 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 3442387 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 3442767 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 3443914 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3448447 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3449837 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3449838 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3450009 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 3450035 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 3450059 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 3450088 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 3450093 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 3450237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3452453 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3453954 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3457602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3459266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3459301 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3461020 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3461406 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3463913 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3467875 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3471352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3471822 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3472525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3476090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3477350 C A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 3478440 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 3479346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3479880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3480358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3480418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3482253 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 3482903 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 3482905 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 3483246 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 3483256 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3483344 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 3483623 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 3484143 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 3486712 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3488279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3489177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3490564 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3490581 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3491292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3493720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3494417 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3496812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3497694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3498099 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 3498112 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3498232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3504777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3504871 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3505541 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3506263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3513796 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3513962 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 3523606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3524915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3526833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3529621 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 3532875 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3532955 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 3533021 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3533301 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3533425 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 3533814 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3534180 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 3536712 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3536994 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 3537480 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3539006 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3539491 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3539633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3539644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3539749 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3539763 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3540027 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 3540191 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 3540402 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 3540427 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 3540452 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3540593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3540664 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 3540801 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 3541479 G A Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 3541543 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3542233 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3542607 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 3542755 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 3543367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3543406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3543935 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3544641 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3545228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3546748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3546843 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 3548290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3548630 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3549079 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 3549282 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 3549331 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3549806 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 3549954 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 3550538 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3550550 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3550654 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3551869 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 3551888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3552792 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3553220 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3553377 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 3553512 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 3554061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3554378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3555538 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3555851 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 3555858 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 3556153 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3556547 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 3556929 A G N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 19 3557246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3559901 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 3560191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3560207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3560226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3563337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3564473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3565124 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3565210 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3567298 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3567929 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 3572903 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3573331 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 3575502 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 3577997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3578847 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3579420 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3580052 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3580350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3581771 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3582358 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3583113 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3583495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3583708 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3588481 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 3589287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3590280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3591055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3591221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3592867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3595546 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3596687 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 3596949 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 3598381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3598927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3599018 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 3599175 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 3599385 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 3599407 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 3599844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3600109 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 3600622 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3600996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3601073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3601074 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 3601202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3601280 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3601547 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 3601731 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 3601746 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3601750 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3601766 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 3601831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3601914 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3602216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3602617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3602992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3603553 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 3605231 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3605564 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 3605659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3605702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3605811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3606332 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3606341 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 3606711 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 3606823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3606854 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3606977 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 3608366 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 3609131 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3609152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3609469 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 3609475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3609514 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 3610008 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3610387 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 3610494 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3610697 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3610997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3611280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3611952 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3612086 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 3612690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3613338 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3613613 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 3614666 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 3615074 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3615196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3615235 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3615642 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3615896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3615904 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3616701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3616793 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3617197 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3617294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3617307 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3617387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3617395 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3618255 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3618877 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3619183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3619275 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3619507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3619619 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3619938 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3620522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3620673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3620914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3620991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3620993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3621520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3621746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3621894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3622329 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3622351 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3622406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3622414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3622532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3622670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3622712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3622821 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3622830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3622866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3623058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3623921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3624102 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3624181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3624277 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3624305 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 3624429 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3624473 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3624589 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3624596 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3624641 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3624648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3624711 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3625661 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3625983 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 3626293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3626500 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3626503 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3626514 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3626546 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3626938 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3626993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3627397 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3628103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3628109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3628208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3628228 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3628236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3628943 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3631056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3631062 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3631237 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3631285 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3631332 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3631544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3631613 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3632026 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3632079 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3632293 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3632310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3632521 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3632528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3632659 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3633009 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 3633026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3633179 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3633349 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3633615 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 3633950 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 3635046 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3635978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3636308 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 3636313 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3636454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3636656 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3636883 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3637134 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 3637198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3637339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3637559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3638495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3638525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3638737 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3638948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3639061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3639183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3639324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3639369 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3639452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3639906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3640112 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3640207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3640411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3640651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3640842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3640969 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3640982 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3641545 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3642434 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3643461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3645419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3646298 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3646328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3647104 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3647339 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3647743 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3647860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3648001 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3651857 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3653424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3654689 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 3654713 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 3655745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3655903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3657436 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 3658092 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3659654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3660078 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 3669782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3671408 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 3672687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3672785 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3675320 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 3678984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3679773 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 3680582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3682423 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3682582 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3682728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3682941 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3683051 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3683211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3683294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3683544 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3684652 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3688483 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3688771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3690044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3691036 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3691553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3695193 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3695361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3695363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3696886 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3697137 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 3697669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3699326 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 3699983 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 3700058 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 3701779 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3702050 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3702100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3702410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3704021 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3704610 C T Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 3704986 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 3705916 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 3705983 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 3706211 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 3707283 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3707501 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3708432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3708442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3710085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3710919 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3711395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3711955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3712847 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3713791 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3716559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3717105 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3717263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3718552 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3719530 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3721674 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3721675 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3722158 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3722534 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 3723306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3723939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3724166 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3725278 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 3725560 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 3726024 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3726225 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 3726827 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 3727080 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 3728152 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 3731134 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 3731499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3732495 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 3732498 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3732700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3734059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3734368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3734653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3737631 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3737790 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3738505 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3738768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3743344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3743784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3747574 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 3747582 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3747658 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3748230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3748633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3749935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3750143 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3750235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3750240 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3750615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3750803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3750820 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3750900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3751137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3751455 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 3752603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3752623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3752629 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3753110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3753152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3753370 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3753513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3754395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3757524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3759002 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3761124 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 3762880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3762896 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3764024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3764428 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3765588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3767555 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3767795 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3768727 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 3769106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3772158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3773550 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3774375 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3774615 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3776626 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3776656 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 3778596 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3780426 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 3781858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3782095 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3785953 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3786318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3786796 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3786827 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3788562 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3790076 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3790086 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3790341 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3791193 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3792005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3793304 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3793843 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3795114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3797213 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3797381 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3797568 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3799189 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3805727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3805760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3806474 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3808050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3808547 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3811404 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3811467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3813877 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3813950 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3815235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3815610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3823791 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3824954 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3824970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3825068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3825129 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 3826104 G T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 3826108 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 3826247 G A Y Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 9 11 2 5 3 19 3826255 C T Y Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 19 3826513 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 3826840 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 3827001 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 3827003 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 3827201 G C Y N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.333333333333333 0.0666666666666667 0.6 11 19 5 1 9 19 3827342 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 3828008 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3828572 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3828943 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3829157 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3829292 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3829518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3830038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3830412 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3833983 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3834384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3834589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3834825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3834894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3837075 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 3837681 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 3840469 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3840562 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 3840672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3840837 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 3840888 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3840890 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3841055 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 3841097 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 3841307 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 3841314 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 3841609 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3841994 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3842056 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3842066 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3842083 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 3842102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3842184 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 3842237 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3842414 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3843227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3844133 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 3844298 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 3844324 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 3845411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3846208 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 3847245 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3857456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3858720 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3859768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3860086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3862282 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3863722 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3864299 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 3867042 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3867473 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 3868290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3870160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3872458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3873406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3873967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3874317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3876427 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3876754 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3878658 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 3881525 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3882500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3882659 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3883828 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3884545 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3884754 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3885295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3885825 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3888282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3889275 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3889698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3890203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3890290 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 3890424 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3891580 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3895241 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3895431 G T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 3899913 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3906136 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3908358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3908661 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3909237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3909350 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 3909354 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 3909518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3909533 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3909636 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 3909693 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 3911051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3911081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3911110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3911199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3912744 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3912872 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 3913268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3913325 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 3913483 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3914216 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3914349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3914892 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 3915645 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3915771 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3916494 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 3916575 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 3916911 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3917136 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3918287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3919237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3920850 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3921131 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3921540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3921934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3922747 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3922796 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3923014 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3924219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3924338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3924460 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3924717 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 3924830 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 3925005 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3925006 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 3925010 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3925746 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 3925978 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 3926053 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3926164 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 3926175 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 3926185 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 3926619 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 3926967 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3927008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3927063 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3928137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3929059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3930410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3930505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3930555 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 3930577 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 3930581 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 3931029 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 3931466 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3931700 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 3931868 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 3931960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3932413 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 19 3932906 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 3933222 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 3933258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3933324 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3934105 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3934137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3934353 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 3934464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3935593 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 3935933 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3936114 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3936173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3937013 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 3937347 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 3937546 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3937559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3938075 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 3939691 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3939851 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3939967 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3940064 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 3940067 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 3940180 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 3940182 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 3940201 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 3940232 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 3940265 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 19 3940365 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 3940374 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 3940395 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 3940725 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 3941061 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 3941407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3941963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3942210 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 3942317 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 3942508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3942547 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3943046 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3943091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3943164 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 3943585 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 3943627 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 3943793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3943965 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 3944569 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 3944671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3944729 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3945600 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 3945707 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 3945822 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3945850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3945891 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3946129 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 3946713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3946831 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 3947200 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 3947305 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 3947665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3948355 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3948513 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3949360 T C Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 19 3949392 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 3949395 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 3949400 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 3949623 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 3949669 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3949963 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3950087 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 3950122 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 3950263 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3950396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3950438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3950788 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3950861 A C N N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 9 7 2 5 1 19 3951419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3951804 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 3951815 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 3952176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3952310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3953066 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 3954009 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 3954553 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 3954746 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3954906 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 3954970 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 3957956 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 3957962 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 3959061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3959493 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 3959510 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 3959692 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 3960182 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 3960640 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 19 3961120 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3961132 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 3961142 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 3961151 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 3962574 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3962585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3962619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3962623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3962698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3962699 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 3962721 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 3962722 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 3966363 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3969438 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 3971472 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3971678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3972245 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3973002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3973276 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3976612 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 19 3977371 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3977391 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 3977764 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 3980112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3980478 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3980577 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3980664 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3980812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3981334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3981845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3983547 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 3984076 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 3985526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3986772 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3987485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3988676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3990758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3991176 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3992103 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3993703 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3994908 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3994926 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 3995738 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 3997218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3998280 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 3998525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 3999296 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4001698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4004486 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4004557 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4005608 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4006216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4007618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4014741 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4014947 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4015274 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4016015 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 4016017 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4016337 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4017890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4019173 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4019186 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4019497 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4021411 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 4021758 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4022441 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4025338 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 4026534 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 4026765 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 4027121 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 4028665 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 4029370 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 4030107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4030698 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4031354 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 4031728 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4031984 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 4032764 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 4033271 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 19 4034826 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4034827 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4036794 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4038137 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 4039134 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 19 4039146 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 4039609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4040268 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 4040972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4041027 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 4041905 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4044497 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4046204 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4046519 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4054641 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 4056311 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 4057900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4059158 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4059432 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4067703 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4067779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4068053 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 4069115 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4069373 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 4069390 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4069938 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4070171 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4070250 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 4070403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4071373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4071672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4072251 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 4072579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4072659 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 4072694 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4073002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4073117 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4073282 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 4074465 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 4075339 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 4075538 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4075874 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 4076611 A C N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 19 4076700 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 4076701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4076826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4077644 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4077733 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 4078121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4078145 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 4078396 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 4078779 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 4078787 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 4078831 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 4078862 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 19 4079437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4079790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4080561 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 4080631 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 4080724 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4080882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4081029 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 4081167 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 4081168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4081220 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 4083781 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4084384 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4084405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4085413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4100321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4102066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4105043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4106036 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 4111008 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 4116517 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4117608 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4117930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4117950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4119714 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4120316 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4123819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4123864 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 4124358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4126226 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 4127078 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 4128890 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 4129731 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4130139 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4130448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4131822 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4138412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4142079 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4142644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4143834 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4144188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4144191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4146650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4147810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4148206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4148571 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 4149633 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 4149856 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4150712 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4151338 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 4152220 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 4152361 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 4152833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4155100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4155701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4155838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4156095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4156265 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4156636 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4156770 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4157477 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 4157800 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 4158161 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4158444 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4158582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4159579 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4159631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4160252 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 4160321 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4161256 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 4161500 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 4163126 C A Y N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 19 4165291 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 4165856 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4166397 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 4167933 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4168230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4168933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4169016 G A N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 19 4170971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4171827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4171871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4174108 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 4174219 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4174716 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 19 4175430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4176459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4177016 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 4177070 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4177208 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4177270 T A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 19 4178069 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4178178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4178390 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 4178495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4181910 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4184350 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4188072 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4191953 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.375 0.1875 0.4375 15 17 6 3 7 19 4192863 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4193341 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 19 4193342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4193529 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4196407 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4197708 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4199437 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4199581 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4208370 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4208532 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4208535 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4210394 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4210992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4212786 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 4212813 C A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 4213165 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4216205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4216384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4217467 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 4217912 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 4220038 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4222588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4224635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4225652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4225979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4226315 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4227592 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4228828 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4233324 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4233523 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4234758 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4235092 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 4235196 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4235371 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4238351 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 4239013 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 4239040 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4239815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4244111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4244655 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 4245205 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4246183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4246323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4248143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4248505 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4249293 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 4249995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4250415 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 4253073 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4253928 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4254139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4254388 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4255510 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4255634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4255975 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 4256200 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4256596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4258589 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 4259008 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4259039 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4259388 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 4259398 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4259411 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4259596 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 4259885 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4260675 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4261575 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 4262157 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4262283 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4262698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4264849 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4265423 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4265434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4265800 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 4266286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4266670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4266847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4267245 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4268751 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4269132 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4269189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4269398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4270543 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4271400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4272287 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4272801 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 4273391 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 4274503 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 4277527 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4277543 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4280285 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4282257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4282279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4282670 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4284602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4287996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4289356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4291453 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 4294025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4294170 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 4294975 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 4295976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4296953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4298425 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4298534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4300578 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 4301527 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4301859 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4304630 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4305545 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4307392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4307416 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 4308731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4309324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4309514 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4311428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4311697 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4312178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4312183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4312190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4312477 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4313164 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4313826 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4314287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4314493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4319562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4319606 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4319622 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4319643 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4319798 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4320065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4320715 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4321380 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 4324078 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4324088 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4324271 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4326118 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4326410 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4327058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4327572 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4327611 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4327811 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4328506 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4330485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4331032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4331486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4332015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4333549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4333823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4335641 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4336748 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4337455 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 4337955 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4339138 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4339761 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 4340198 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4340421 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4341689 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4342488 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4347141 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4347720 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 4349879 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4352774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4353803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4357402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4358730 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4358743 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4358960 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4369406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4369819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4372523 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4372574 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4373881 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4374609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4376976 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4376995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4377187 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 4377487 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4380487 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4380495 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4381229 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4384978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4385331 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 4386854 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4389069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4390605 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4396954 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4397787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4400323 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4401692 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 4406550 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4408965 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4412782 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 4413051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4413947 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4413959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4416152 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4416242 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4418567 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4419466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4421843 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4423382 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4423480 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4426342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4427422 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4429844 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4429926 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4429949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4429950 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4433253 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4433258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4434419 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 4435039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4435574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4435747 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4435871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4436538 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4436618 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4437101 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 4437379 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4437592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4438709 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 4442364 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4443037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4443275 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4443467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4443781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4443976 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4444162 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4444210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4444506 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4444730 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 4444757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4445033 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4447380 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 4447956 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4448326 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 4449022 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 4450911 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 4452785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4452980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4453167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4454590 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 4455437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4455661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4456801 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4457124 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4457661 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 4460740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4460843 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 4461337 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 4461338 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4461601 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 4462285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4465928 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4468703 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4471122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4471125 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4471139 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 4472551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4475082 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 4475261 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4475350 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 4475382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4476027 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 4476028 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 4476151 G A N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 19 4476245 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 4476331 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 4476550 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 4476814 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 4476845 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 4476978 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 4477805 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 4477843 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 4477863 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 4478339 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 4478413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4478845 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 4478855 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 4478891 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 4479051 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 4479107 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 4479236 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 4479306 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 4479317 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4479562 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 4480253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4480326 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 4480340 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 4480411 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4480418 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 4480431 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 4480614 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 4480623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4480985 T A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 19 4481055 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4481250 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4481565 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 4481603 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 4481804 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 4481976 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4481988 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4482076 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 4482094 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 4482105 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 4482751 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 4482777 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 4483136 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4483169 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4483293 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 4483337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4483359 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 4483501 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 4483550 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 4483589 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 4483591 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 4483639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4483664 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4483775 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 4484186 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 4484287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4484311 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 4484327 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 4484401 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 4484435 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 4484620 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 4484625 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 4484887 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4484902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4485086 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 4485092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4485101 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4485110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4485575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4485981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4486714 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 4486773 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 4486774 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 4487012 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 4487182 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 4487754 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 4488003 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4488013 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4488210 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4488382 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 4488548 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 4488712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4489391 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4489507 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4489563 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4490177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4490324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4490554 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 4490702 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4490912 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4492016 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4492739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4493244 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 4493257 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 4493552 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 4493672 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4494159 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 4494442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4494541 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 4494548 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4494557 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 4494628 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 4494700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4495462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4495518 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4495755 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4498489 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4499172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4499936 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 4500268 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4500279 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 4500432 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 4501096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4501207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4501873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4502613 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4503741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4505840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4506186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4506326 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4508046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4508391 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 4508406 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 4511213 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4515069 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4515345 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4515675 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 4516287 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4517114 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4517125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4517189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4517428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4517519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4519156 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4519224 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 4519911 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 4521401 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4524663 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4525210 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 4525847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4527528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4527607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4527723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4528179 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 4531067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4533992 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 4534369 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 4534890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4534911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4534914 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4539371 G A N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 12 12 3 6 3 19 4540018 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4540019 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4540105 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 4540382 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 4540389 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4540404 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4540453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4541125 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4541156 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 4541651 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4541783 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 4542003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4542098 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4542222 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 4542924 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4542929 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 4543548 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4543762 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4543811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4544564 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4544888 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 4545009 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 4545160 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4545830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4546318 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 4546517 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4547100 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4547989 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4550544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4550817 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 4550819 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4553743 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 4555339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4557237 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4557349 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4557626 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4562835 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4564054 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4564543 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4565299 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4566636 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4569781 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4572220 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4573485 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 4578298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4580192 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 4581066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4582352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4583934 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4585593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4587609 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4587693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4588253 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 4588408 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 4588788 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 4589638 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4595870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4596863 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4597992 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4599091 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4599482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4599555 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4603941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4604113 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4604450 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4608529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4609575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4610061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4610756 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4612856 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4612994 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4616112 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4617287 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4617433 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 4617506 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 4617522 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4618269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4620766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4622153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4622269 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 4622368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4624413 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4625727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4625742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4625903 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 4626097 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4626098 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4626195 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4626266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4626335 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4626379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4626672 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4626757 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4626778 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4626829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4627003 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4627162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4627265 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4627718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4627781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4627852 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4627984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4628100 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4628131 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4628277 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4628450 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 4628452 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4628540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4628587 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4628624 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4628648 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4628719 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 4628816 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4628856 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 4629378 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 4629419 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4629754 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4629897 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 4630175 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4630532 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 4630538 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4630742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4630914 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 4630919 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4630947 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4631043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4631185 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4631187 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4631225 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4631398 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4631615 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4631631 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4631634 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4631675 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 4635789 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4636686 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4636920 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 4637644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4637886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4638030 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 4638033 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4638075 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 4638192 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4638430 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 4638497 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4638571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4638576 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4638616 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4638681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4638745 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4638823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4638879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4638895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4638911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4639129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4639198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4639207 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4639232 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4639248 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4639266 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4639285 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 4639287 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4639629 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 4639750 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4639752 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 4640049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4640059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4640069 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4640550 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 4640559 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 4640798 A T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 19 4640868 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 4641138 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 4641164 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 4641175 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 4641310 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 4641582 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 4641899 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4641964 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4642036 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4642166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4642204 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4642241 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 4642254 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4642310 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4642333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4642542 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 4642607 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 4642613 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 4642713 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4643718 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 4643788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4644397 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4645337 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4646410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4646626 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 4646659 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4646841 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4647167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4647213 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4647430 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 4647637 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 4648917 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 4649314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4649370 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4650500 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4650759 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4651184 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4652596 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 4652712 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 4653115 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 4653116 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 4653937 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 4654251 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 4654443 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 4654494 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 4654517 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 4654583 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 4654680 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 4654745 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 4654746 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 4654765 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 4654817 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 4655025 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 4655027 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 4655304 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 4655313 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 4655701 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 4655721 C T N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0 1 0 12 12 0 12 0 19 4655722 C G N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0 0.916666666666667 0.0833333333333333 11 13 0 11 1 19 4655776 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 4655913 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 4655932 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 4655935 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 4656080 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 4656358 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 4656427 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 4656520 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 4657243 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.214285714285714 0.142857142857143 0.642857142857143 8 20 3 2 9 19 4657373 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 4657460 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 4658025 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 4658362 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 4658524 A T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 4658675 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 4658765 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 4658786 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 4658843 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 4659065 A T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 4659074 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 4659107 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4659126 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 19 4659585 C G N N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 19 4659590 A G N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 19 4659681 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 19 4659764 A G Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 19 4659770 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 4659786 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 4659826 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 4659878 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 4659879 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 4659883 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 4659885 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 4659889 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 4659926 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4659950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4660040 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 4660179 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4661270 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4661294 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 4661315 G T Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 4661346 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 4661367 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 4661545 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 4661564 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 4661572 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 4661674 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 4661689 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 4661724 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 4661726 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 4661822 A C Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 4662068 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 4662072 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 4662081 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 4662255 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 4662259 A C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 4662312 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 4662313 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 4662340 T G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 4662380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4662496 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 4662521 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 4662536 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 4662611 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 4662614 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 4662632 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 4662687 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 4662828 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 4662861 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 4663198 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 4663222 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 4663228 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 4663246 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 4663366 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 4663394 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 4663412 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 4663442 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 4663467 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 4663634 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 4664462 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 4664823 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 4664867 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4664981 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4664999 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 4665011 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 4665056 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 4665666 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4666217 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4669029 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4670500 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4671739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4672661 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 4673356 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 4673777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4674387 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 4674610 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 4674657 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 4674739 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 4675198 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 4675410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4675595 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 4675608 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 4675617 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 4675635 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 4676074 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 19 4676093 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 19 4676099 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 4676159 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 4676168 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 4676312 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 4676574 A T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 4676838 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 4676864 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 4676924 A T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 4677049 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 4677153 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 4677281 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 4677385 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 4677393 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 4677564 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 4677777 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4677875 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 4677995 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 4678440 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 4678588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4678823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4679044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4679219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4680270 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 4682052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4682601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4683718 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4684420 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4685791 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4686790 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4686791 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4688278 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 4688302 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4688421 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4689168 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 19 4689173 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 4689539 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 19 4691075 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4691179 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 4691251 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4691519 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4692300 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4693189 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 4693192 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 4693264 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4694325 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 4694373 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 4694510 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4696023 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 4696047 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 4696050 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 4698280 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4698372 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4698705 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4699221 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 4699270 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 4699445 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4699862 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 4699954 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4699962 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4700197 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 4700494 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4700730 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 4700752 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 4701018 C G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 19 4701145 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 4701950 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 4703312 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4704067 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4704286 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4705263 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 4705818 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 4708499 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 4712732 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4715860 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4715962 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4716846 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 4716863 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 4716884 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 4716993 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 4717151 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 4717175 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 4717401 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 4717507 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 4717747 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 4717770 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 4717832 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 4717968 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 4717974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4718014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4718161 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4718665 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4720352 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 4720940 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 4721495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4721797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4722670 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 4722672 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 4723168 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 4723176 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 4723216 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 4723737 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 4723875 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 4724528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4725784 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 4725794 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 4726249 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 4727247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4727396 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 4727398 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 4727412 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 4728169 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4728424 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 4728448 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 4728888 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 4729243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4729307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4730205 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4730458 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 4730482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4731463 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 4731621 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 4731641 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 4731676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4732273 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4732274 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4732504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4733253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4733398 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 4733515 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4733825 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 4733912 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4733917 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4733995 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 4734281 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 4735832 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4736391 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 4739145 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4739419 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 4739818 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 4740220 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 4741320 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4741589 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 4741621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4743101 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4744883 A C N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 19 4745678 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4747336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4749329 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 4749767 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4750402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4750643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4753125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4755687 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4758096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4758368 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4759091 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4759909 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4760060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4760490 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4762981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4763335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4763366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4763544 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4764092 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4765733 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4765760 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4765773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4767310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4767430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4768755 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4769723 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 4770415 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4770681 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4771347 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4771679 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4771700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4771950 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4772230 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4773277 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4773679 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4775028 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4776119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4776767 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 4777086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4777252 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4777468 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4777741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4778869 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4779502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4780503 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 4781208 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4782446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4783950 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4787126 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4787508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4788113 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 4789716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4790177 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4793168 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4793639 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4794208 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4794627 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4794768 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4795039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4795517 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4795819 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4796764 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4797018 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 4797288 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 4799323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4803576 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 4806043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4806139 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4806389 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4806880 G C Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 19 4807530 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 4809090 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 4812374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4814686 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4815588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4821631 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4823162 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4823451 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 4825167 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4826191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4826406 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4828891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4829961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4836042 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 4836275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4837232 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4837633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4839239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4842045 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 4842228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4842328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4842512 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4842930 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4843208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4843429 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 4843434 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 19 4843488 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 4843592 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 4843655 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 4843781 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4844010 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4844022 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 4845664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4845803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4848251 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 4848845 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 4849285 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4849785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4850473 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4850897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4852504 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4852595 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4852655 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 4852659 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 4852662 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 4852900 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4853094 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 4853999 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4854383 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4855351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4856898 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 4857380 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 4857533 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 4857700 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 4857853 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4858728 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 4859225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4859353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4860770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4860778 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 4860806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4860823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4860967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4861299 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4861914 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 4861921 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 4862626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4862856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4863815 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 4863845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4864055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4864259 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 4864383 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 4864615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4864734 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4865571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4866366 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4866908 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4866927 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 4866957 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4867050 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4867061 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4867074 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4867292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4867333 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4867427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4867489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4870196 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4872523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4872682 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 4873057 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 4873476 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 4873491 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 4873747 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 4874079 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 4874116 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 4875523 T G N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 19 4876745 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4876925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4877370 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 4878102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4878291 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4879430 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4879674 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 4880106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4880555 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 4880811 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 4881413 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 4881719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4883361 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 4884035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4884976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4885773 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4885879 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4885949 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4886084 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4886222 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4887029 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4888763 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4889530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4889820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4890052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4890584 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4890867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4892575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4892630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4892692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4893076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4893723 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4894807 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 4894905 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4895378 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 4895409 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 4895422 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 4895782 T G N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 19 4895890 A C N N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 19 4895906 G A N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.545454545454545 0.363636363636364 8 14 1 6 4 19 4895925 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 19 4896258 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 4896552 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 4896583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4896696 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 4896997 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4897199 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 4897712 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 4897713 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 4897822 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 4897997 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 4898030 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4898116 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4898135 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 4898142 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 4898152 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 4898291 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 4898436 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 4898457 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 4898721 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 4899010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4899363 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 4899601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4899638 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 4899657 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 4899675 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 4900013 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 4900069 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 4900082 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 4900444 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4900676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4900809 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 4900844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4900918 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 4901066 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4901823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4902998 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4906543 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4906647 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4907165 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4907657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4907824 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4907828 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4908249 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 4908557 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 4908586 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 4908698 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 4909099 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 4909703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4910312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4910705 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 4911019 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 4911116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4911175 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4911337 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4911374 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4911397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4911684 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4911718 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4911776 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4911819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4912178 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 4912311 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 4912508 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4912521 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 4914232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4914869 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 4915763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4916612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4916993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4917228 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 4917321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4918163 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4919561 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 4919840 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4919900 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4919952 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4920119 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 4920146 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4920196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4920643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4922260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4923427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4925418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4926739 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4927783 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4928430 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4929604 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4930373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4930433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4934499 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4935487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4937687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4938821 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4940379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4941302 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 4943475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4943636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4943904 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4944699 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4945334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4946295 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4946827 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 4947805 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4949621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4950940 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 4952361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4952431 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4952836 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 4953554 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 4953653 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 4953743 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 4953771 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 4953965 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4955280 T C Y Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 19 4955636 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 4956407 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 4956529 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 4956550 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 4956712 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 4958289 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4959023 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 4959045 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 4959220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4960604 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 4961035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4963125 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 4963391 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 4963691 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4963747 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4965711 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 4966199 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4966498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4966516 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 4967511 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4967620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4967740 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 4967824 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 4968037 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4968072 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 4968473 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 4969466 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 4971415 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4971491 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 4971557 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 4971579 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 4971587 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 4971619 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 4971717 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 4971718 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 4971720 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 4971731 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 4971834 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 4972049 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 4972056 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 4972125 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 4972147 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 4972148 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 4972153 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 4972306 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 19 4972312 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 19 4972353 T C N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 19 4973575 T C N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 15 15 6 3 6 19 4973587 A C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 4973593 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 4973618 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 4973630 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 4973695 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 4974004 G A N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 19 4974010 T A N N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 11 9 4 3 3 19 4974391 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 4974507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4974725 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 4974730 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 4975012 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 4975707 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4975710 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4975999 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 4976140 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4976159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4976698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4976869 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4977057 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 4977919 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4979108 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 4979323 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 4979838 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 4980101 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4980312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4980377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4981055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4983504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4985046 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4985631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4987340 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4987467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4987472 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4988409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4989178 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4990363 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4992724 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 4992862 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4995601 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 4996138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4996466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4997636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4997767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 4997968 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4997977 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 4997978 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 4998028 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 4999269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5000161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5000223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5001061 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5002838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5004317 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5005285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5006951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5006963 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 5006999 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 5007963 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 5007965 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 5008785 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 5009561 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5011787 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 5012241 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5012554 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 5012906 G T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 5012959 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 5013005 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 5013029 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 5013092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5013101 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 5013159 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5013312 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 5013499 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 5013571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5013677 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 5013728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5014203 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 5014366 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 5014547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5015445 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 5015921 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 5015953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5016039 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5016336 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 5016632 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5016756 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 5017496 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5017605 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 5019021 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5019411 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 5019634 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 5019658 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 19 5019849 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 5020078 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 5020119 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 5020126 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 5020342 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 5020437 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 5020476 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 5020722 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 5020737 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 5020972 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 5021673 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5021923 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5021929 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5022454 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5022583 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5022985 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 5022987 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5023482 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5023838 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 5023862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5024411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5024483 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 5027368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5027721 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 5027742 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 5028065 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5028902 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 5028914 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 5029333 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 5029437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5030927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5031014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5031870 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 5031986 C G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 5031988 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 5032013 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 5032019 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 5032084 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 5032086 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 5032101 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 5032679 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 19 5032742 A G N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 19 5033052 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 5033137 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5033526 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 5033531 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 5033602 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 5033666 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 5033685 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 5033748 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 5034171 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 5034602 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5034776 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 5034988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5035194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5035309 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5035855 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5036038 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 5036054 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5036066 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5036753 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 5036756 A C Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 5038393 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 5038493 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5039498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5040087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5040630 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5041854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5041859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5045579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5046317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5046736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5047247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5047987 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5048221 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5048781 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 5051350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5052238 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5052340 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5052728 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5055055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5055930 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 5056117 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5056449 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5058461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5059027 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 5059217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5061403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5063545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5064999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5065557 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 5065566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5065640 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5065749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5065795 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 5066357 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 5066587 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 5067310 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5067695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5067844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5069698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5069873 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5073073 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 5074528 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5077308 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 5078776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5080561 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5089938 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5091809 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5093254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5095390 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5095400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5095619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5095776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5096573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5097077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5097159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5099202 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5099313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5102314 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 5103225 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 5105101 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5105585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5106142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5106555 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5109469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5116292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5117466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5118478 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5119543 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 5119810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5121756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5123642 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5124369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5125678 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 5127229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5128122 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5128872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5131188 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5133797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5134668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5135472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5136348 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5139394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5139898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5140311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5141878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5144276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5144960 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5145465 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5145578 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 5145730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5146060 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5146078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5146182 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5146415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5147372 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5147703 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 5147780 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 5147835 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 5147984 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5147991 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 5148689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5149482 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 5149626 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 5150403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5150540 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 5151810 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5151961 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5151996 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 5152268 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 5152439 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5152763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5153403 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 5153450 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5153597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5155500 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5155868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5155874 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5156189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5156430 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5156591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5157154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5157163 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5157333 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 5157464 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 5158188 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 5158328 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5158717 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 5159490 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5159673 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 5160464 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 5160589 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 5160694 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5160895 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5161329 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 5161581 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 5162225 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 5162335 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5163575 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 9 5 3 3 1 19 5164139 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5164482 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 5164605 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5165298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5165784 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5166446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5166553 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5166964 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5167132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5168122 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5168261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5168711 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 5168761 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 5169540 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 5169806 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 5169824 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 5170841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5170879 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5170884 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5171754 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5174245 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5174330 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5176262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5176459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5179078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5180782 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 5180863 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 5187202 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 5189228 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5193282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5193526 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 5195775 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5196439 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 5197073 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 5197196 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5200858 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 5200859 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 5201552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5202128 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5202488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5202994 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5203525 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 5205622 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 5208576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5209612 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5211100 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 5214322 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 5215634 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5219858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5219873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5220507 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5220673 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5222784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5224788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5226825 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5227244 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5228289 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5228530 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 5229144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5229882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5232313 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5234450 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5236152 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5236386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5236932 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 5237055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5240318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5244454 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5244789 C G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 5253147 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5253461 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 5253509 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5254101 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5255634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5255832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5257847 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5258778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5260682 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 5260966 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5264850 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5265232 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5265410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5266420 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5266982 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 5268200 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5268749 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5270716 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5271231 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5271697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5272320 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5272438 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5276501 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 5278497 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5279073 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5279087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5280065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5280095 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5281789 T A N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 19 5281931 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 5282184 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5282513 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5283459 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5284734 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5285977 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5287507 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5289352 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 5289433 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 5290293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5291417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5296955 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5297329 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 5298308 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5298386 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5299064 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5301613 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 5302596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5303325 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 5304108 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 5304218 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 5304413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5308710 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 5310351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5319919 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 5320316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5320878 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 5320891 T C N Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 19 5321056 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 5322004 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 5323460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5323623 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5324728 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5326067 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5326476 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5326484 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5328065 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 5328161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5328356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5328405 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5328445 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 5332730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5333737 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5334001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5334584 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5335120 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5337219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5337488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5340409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5340514 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5340893 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5341185 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 5342214 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 5342970 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5343392 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5345026 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5345732 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5348368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5349521 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 5349642 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5350660 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5350823 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5350824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5350884 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5350926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5351016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5351078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5351956 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 5352132 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 5352224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5352706 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5352903 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 5353007 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5353466 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5354163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5355602 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5359356 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 5359450 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 5360454 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 5360458 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 5361009 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5361098 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 5361620 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 5361655 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5362061 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5363118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5364489 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 5364490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5366956 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5370325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5370328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5370368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5370558 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 5370997 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5373091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5373228 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 5374215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5374685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5374719 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 5375539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5375888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5379508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5381337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5382724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5384326 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5385203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5385566 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5387341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5388418 C G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 5393934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5395271 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 5398381 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 5399183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5400200 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 5401324 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 5401435 G T N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 19 5401776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5402709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5403406 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5403468 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 5404308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5405164 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 5405874 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 5406092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5406094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5406103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5408082 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 5408119 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5408223 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 5408328 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 5408333 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 5408346 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 5408360 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 5408363 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 5408465 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 5408782 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5408832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5408844 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 5409273 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 5411623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5411811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5412297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5413155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5413450 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5414439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5419038 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 5419321 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5419755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5421963 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 5422161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5422669 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 5422898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5423405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5424021 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 5427109 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5428561 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 5433468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5433780 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 5433909 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 5434703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5437121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5437320 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 5438289 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 5438300 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5438343 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5438939 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5439834 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 5439978 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 5439982 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5440167 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 5440769 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5441512 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5441911 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5441932 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5441940 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5441941 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5442016 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5442024 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 5442063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5442135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5442243 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5442363 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5442599 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5442738 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5442844 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 5443782 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5443802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5444265 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 5444713 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 5446358 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 5448031 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5450108 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5450498 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5454093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5454261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5454342 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 5455092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5455603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5455723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5455774 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5456357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5456455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5458569 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 5462882 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5463755 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5464592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5464867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5467724 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5467967 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5468676 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5468814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5469348 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5471286 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5473568 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5475777 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5475798 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5476295 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5477857 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5478093 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5479081 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5479201 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5480938 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5481089 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5481361 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5481790 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5482631 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5483094 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5483160 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5484461 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5485416 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5486836 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5487253 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5487293 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5487533 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5488822 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5489197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5489672 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5491979 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5492863 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5494572 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 5494687 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 5495332 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5496038 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5499477 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5500028 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5501383 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5501731 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 5503649 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5504985 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 5505964 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5506473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5508658 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 5512924 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5516080 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5516561 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5516710 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5518114 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 5518270 G T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 5518836 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5519477 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5520089 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5520462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5521511 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5521638 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5521702 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5522099 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 5522414 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 5522422 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 5522592 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 5522689 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 5522911 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5523178 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5523203 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5523297 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5524084 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5525005 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5525366 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5526036 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5527430 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5527665 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5528439 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5528853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5529507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5529920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5530060 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5531157 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5532280 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5532296 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5534486 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5534762 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5534868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5539031 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5539827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5539932 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5540533 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5541035 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5542270 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5542953 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 19 5543534 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 5543642 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 5543832 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 5544865 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5546806 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5548188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5548751 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5548852 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5550563 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5550756 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5550775 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5555709 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5555957 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5556544 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5558133 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5562929 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 5565704 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5566865 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5568641 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5568823 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5569842 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5570327 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5570503 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5571245 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5571293 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5571947 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5572817 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5573137 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5573954 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 5575104 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 5578901 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5579941 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 5581124 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 5581534 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5581580 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 5581706 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 5583844 A T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 5584731 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5585314 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5586030 C G Y N 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 19 5586065 G A N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.4 0 0.6 4 6 2 0 3 19 5586165 G C N N 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 19 5586458 A G Y Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 19 5586463 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 19 5586477 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 5586480 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 5586488 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 5586507 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 5586641 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 5586671 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 5586712 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 5586714 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 5586990 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 5587097 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 5587143 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5587236 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 5587374 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 5587375 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 5587390 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 5587695 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 5588010 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 5588021 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 5588105 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 5588200 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 5588277 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 5588289 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 5588577 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 5588639 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 5588646 A T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 5588745 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 5588892 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5588916 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 5588946 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5589306 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5589324 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 5589370 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5589472 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 5589512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5589568 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 5589622 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 5589777 C T N Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 19 5589844 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 19 5589993 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 5590229 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5590396 A G Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 5590741 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5590748 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5590750 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5590910 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5590919 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5590922 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5590946 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5590991 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 5591020 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 5591071 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5591097 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5591213 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 5591217 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5591225 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 5591230 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5591362 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5591412 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 5591485 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 5591497 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 5591517 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 5591529 T A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 5591762 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 5591833 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 5591921 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 5592040 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 5592297 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5592462 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5592485 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 5592751 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 5595230 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 5595360 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5595634 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 5596097 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 5596879 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 5598119 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5599369 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5600203 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5601031 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5601541 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 5603190 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 5603222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5603797 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5604357 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 5604784 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 5604881 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5605318 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5605816 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5606013 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 5607434 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 5607535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5609568 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5612085 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 5612202 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 5613503 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5613851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5614157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5614855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5615239 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5615920 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5615937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5617703 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5620934 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5621103 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5621865 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5622063 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5622105 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5623830 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 5623846 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5624133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5627111 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5627115 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 5627557 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5628464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5628554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5629136 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 5629597 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5630983 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5631117 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5631215 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5631369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5631824 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 5634984 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 5636803 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5637034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5639368 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5640596 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5641108 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5642819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5643220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5643339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5645060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5646579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5647347 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5647477 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5648548 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5649752 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5649863 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5649898 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5650883 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 5651270 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5651541 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 5652819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5653283 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5654769 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5655117 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 5656218 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 5657738 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5659159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5659923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5659935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5660287 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5660571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5662159 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 5662815 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 5662819 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 5662867 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 5663211 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 5663236 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5663385 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 5663482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5664346 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5664393 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5667785 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5668123 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5668323 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 5671963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5672254 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5674698 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 5680835 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5682494 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5682506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5682989 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5683205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5684557 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5685594 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5686239 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5686580 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5688817 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5688831 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5689216 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 5689248 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5689430 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 5689974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5691917 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5691952 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5691966 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5693177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5693452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5694472 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5694797 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5695985 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5696406 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5696991 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 5699055 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5699375 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5702634 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5702819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5704725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5706868 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5706937 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5707034 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5707049 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 5707924 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 5708819 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 5708896 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 5709434 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5710623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5710801 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 5710897 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 5710902 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 5711182 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5711237 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5711475 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 5712600 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 5712739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5714082 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5716643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5717577 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5717773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5718169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5718275 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5718279 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5718295 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 5718297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5718490 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 5718680 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5718681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5718894 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 5718949 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 5719036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5719205 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5719387 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 5720008 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5720545 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 5721206 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 5721216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5721233 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5721267 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5721325 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5721335 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5721481 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 5721660 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5722490 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5724280 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5726785 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 5727437 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5727949 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5728294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5729578 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 5729834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5729933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5730271 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5732295 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5733821 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5734552 C T N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 5734954 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 5736596 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5737223 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5737238 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5737626 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5738038 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 19 5738039 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 5738184 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 5738509 C G N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 19 5738549 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 19 5738634 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 5738702 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5738752 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 5738760 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 5738832 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 5738884 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 5738958 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 5738982 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5739000 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5739022 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5739053 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 5739057 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 5739415 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5739559 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5739909 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5740012 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5740019 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5740119 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5740321 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5740587 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5740674 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 5742180 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 5742435 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 5742814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5743743 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5744234 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5744310 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5744311 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5744439 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5744613 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5744664 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5744853 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5745001 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5745203 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5745302 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5745304 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5745401 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5746053 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5746072 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5746239 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5746778 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5748040 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 5751156 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5751413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5752215 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 5754035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5754537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5755260 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5756053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5757584 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5757978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5758286 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5759146 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5759902 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5763305 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5763734 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5763922 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5764386 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5764437 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5765589 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5766415 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5766796 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5766840 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 5766947 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5767071 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5768193 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 5768635 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5771836 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5772351 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5775925 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5776047 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5776834 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5776845 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5776857 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 5776871 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 5777046 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5777789 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5777952 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5777965 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5777966 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5778007 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5778022 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5778219 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5778545 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5782092 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5782834 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 5783073 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5783433 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5783510 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5783568 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 5783592 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 5784299 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5785531 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5785966 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 5788198 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5789210 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5791578 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 5791641 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5792922 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5793780 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5795603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5801702 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5803568 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5805097 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 5806205 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5807217 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5807753 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5809485 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5809522 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5809730 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5809881 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5809923 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5810398 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5810596 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5810745 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5812296 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5816179 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5817262 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5817802 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5817919 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5818483 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5820643 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 5821963 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5822441 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5822814 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 5823121 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 5823406 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5823985 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5825899 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5825900 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5828624 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5828677 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 5828714 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5829347 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5832260 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5832969 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5834015 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5834234 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5834837 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5835207 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5835504 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5835755 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5836589 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5836628 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5838302 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5839995 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5841310 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5841542 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5841747 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5843462 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 5843983 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5844100 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5844173 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 5844594 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 5844622 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5844869 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 5845144 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 5845168 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5846736 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5847031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5847855 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5848236 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 5849211 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5849908 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5850456 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5851460 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5851504 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5851626 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5851939 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5852119 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5853791 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 5853892 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 5854413 T G Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 5854667 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 5854931 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 5854961 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 5855097 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 5855295 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5855407 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 5855450 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5855646 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5855660 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5855674 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5855790 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5856039 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5856114 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5856142 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5856196 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 5856310 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 5856739 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5857144 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5857198 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 5857234 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 5857251 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5857353 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 5857453 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5857896 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5857918 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 5857923 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 5858012 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 5858374 A C Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 5858379 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 5858381 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5858394 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 5858423 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 5859332 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 5859696 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 5859699 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 5859786 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 5859910 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 5860015 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 5860045 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 5860112 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5860271 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5860420 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5860589 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 5860593 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 5860604 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 5860623 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 5860642 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 5860657 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 5860798 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 5862438 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5862757 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5862938 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5862956 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5862979 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 5862991 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 5863394 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5863419 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5863540 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5863676 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 5863908 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5864085 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5864112 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5864348 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5864947 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5865057 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5865137 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5865145 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5865191 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5865422 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 5865536 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5865548 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 5865603 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 5865612 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 5865650 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5865722 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 5865775 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 5865835 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5865886 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5866002 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5866027 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5866034 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5866121 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5866155 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 5866510 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5866620 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 5867021 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5867291 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5867513 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5867541 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5867545 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5867572 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5867786 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 5867850 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5868196 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 5868908 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5869176 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 5869329 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 5869810 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5870208 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5870351 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 5870983 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5871124 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5871142 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5872016 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 5873724 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5873806 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5874191 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5875875 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 5876196 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5876342 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 5876607 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5876640 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 5876993 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5876997 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5877446 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5877471 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5878024 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5881595 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 19 5882061 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 5883789 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5884113 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5884251 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5885308 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5885838 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 5889293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5889571 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5895563 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5896975 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 5899985 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5900712 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5901437 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5903047 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 5904415 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 5904655 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5905075 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5910990 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5913144 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5913978 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5915190 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 5915247 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5915646 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5916448 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5916647 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 5916907 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 5917189 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5917371 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5917572 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5918217 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 5918358 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 5923591 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 5923606 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 5923642 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 5923721 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 5924002 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 5924024 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 5924126 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5924213 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 5924294 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 5924326 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 5924439 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 5924526 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 5924592 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 5924601 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5924953 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 5924956 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5924964 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 5926820 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 5927486 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5927514 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5928175 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 5928385 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5928386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5928561 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5928863 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5929105 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5929114 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5929121 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5929142 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5929153 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5929176 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 5929475 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5929520 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 5929531 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 5929539 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 5930028 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5931229 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5934719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5937030 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5937985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5938271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5939238 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5940634 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5940639 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5940762 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5940976 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5941550 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 5941607 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 5942122 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5942207 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5942470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5943907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5944728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5949009 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5949369 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5953333 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5954493 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5955056 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5955148 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5955170 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5955889 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 5956250 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5957294 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5958695 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5958912 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 5959061 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5959074 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5959092 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5959184 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5959227 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5959389 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 5959406 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5959943 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 5960049 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5960087 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5960165 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 5960281 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5960466 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5960506 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5960522 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5960738 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5960746 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5960769 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5960799 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5961566 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5962131 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5964095 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 5964200 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 5965329 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5965341 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5965882 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5966311 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 5967667 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 5968011 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5969270 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 5972860 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5975013 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5975064 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5975487 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5976091 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5977331 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 5979350 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5979739 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5980204 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5980587 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5980631 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 5981169 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5981438 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 5981852 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5982410 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 5982572 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 5982681 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5982750 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5983044 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5983133 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5983698 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5983925 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 5984003 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 5984031 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5984189 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5984190 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5984256 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5984456 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5984488 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5984610 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5984621 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5984748 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5984760 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5984814 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5985015 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5985065 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5986039 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5986165 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5986347 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5986418 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 5987058 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 19 5987399 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 5987868 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 5987885 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 5988015 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 5988096 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 5988102 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5988189 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 5988429 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5988477 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 5988478 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 5988482 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 5988505 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5988549 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5988594 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5988683 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 5989478 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 5990059 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5990279 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5990299 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5990666 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 5990826 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5990831 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5990939 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5990948 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5990996 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 5991249 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5992311 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 5992648 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 5992653 G C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 5992755 A C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 5992806 C A N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 19 5992847 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 19 5992851 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 5992876 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 5992987 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5993125 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 5993225 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 5993472 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 5993737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5995069 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5996378 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 5997169 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 5997484 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 5997485 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 5997632 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 5997694 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 5997736 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 5998095 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 5998258 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 5998356 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 5998388 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 5998587 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 19 5998664 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 19 5998673 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 5999603 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 5999692 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 5999766 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 6000299 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 6000568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6000571 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6000780 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 6001278 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6001353 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 6001851 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6001887 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6001962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6001996 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 6002525 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 6002619 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 6003510 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 6003615 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 6003644 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 6003669 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 6003705 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6003745 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 6006044 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6006585 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 6006907 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 6007059 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 6007060 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 6007349 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 6007385 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6007646 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 6007724 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6007844 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 6007884 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 6007922 C T N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 19 6008022 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6008266 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 6008275 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 6008320 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 6008524 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 6008542 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6008574 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6008600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6008830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6011332 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 6011987 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 6012143 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 6013045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6013490 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 6014896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6017114 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 6017351 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 6018424 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6018986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6019232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6019241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6019443 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 6019444 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 6019457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6019589 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6019986 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6020030 A G N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 19 6020436 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6020497 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 6020525 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6020915 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6020920 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6021066 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6021067 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6021453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6021640 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6022391 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6023238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6023331 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6023341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6023546 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6023586 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 6023606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6023736 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6024245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6024633 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6024872 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 6024968 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 6025690 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6025695 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6025727 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 6026799 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 6026801 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 6026803 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 6028015 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6028656 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6029015 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 6030112 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6031056 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 6031125 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 6031222 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 6031748 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6031752 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6031768 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 6031955 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6032047 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 6032230 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 6032457 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6033028 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6033176 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6033334 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 6033402 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 6033485 C A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 6033503 T C Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 11 5 5 1 2 19 6033689 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 6033842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6033967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6034062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6036169 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6036441 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6037277 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6040930 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 6041080 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 6041170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6041679 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6041938 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6041964 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6042371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6042379 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6042886 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6042898 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6043218 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6045859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6045940 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6046293 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6047259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6047375 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6048215 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6048442 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6049518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6050373 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6050721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6051715 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6051951 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6052057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6052067 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6052588 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6052821 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6053039 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6053294 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6053774 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 6053843 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6054096 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6054369 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6055368 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6057405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6058624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6059091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6060181 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6060800 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6061780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6062976 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 6063026 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6063607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6065281 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6065432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6067115 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6068772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6070862 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6072294 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6072363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6073325 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6073383 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 6075404 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6076232 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6077131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6078662 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6081821 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6082935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6084659 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 6086484 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 6087729 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6088266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6089509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6091354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6091557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6091570 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6091623 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6091645 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 6095544 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6096838 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6097169 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6098455 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6098464 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6098795 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6099288 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6099827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6100050 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6100128 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6100327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6100851 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 6101809 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6103259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6103508 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6103522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6103525 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6103595 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6103933 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6104156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6104365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6104392 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6104426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6104501 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6104623 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6104850 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6105170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6105513 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6105520 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6105546 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6105742 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6106799 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6106930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6107017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6107438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6107597 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 6107618 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 6107691 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 6107801 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6107812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6108852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6109677 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6110006 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 6111414 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 6111666 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 6112145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6112288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6112373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6112586 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 6113224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6113791 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 6114103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6114726 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6114867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6115936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6117735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6118005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6118221 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6118441 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6118443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6119057 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6119062 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6119184 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6119428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6119804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6119998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6120114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6120236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6120241 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6120269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6120288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6120291 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6120757 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 6122651 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6122864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6123107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6123231 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 6123444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6123655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6124246 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6124479 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6124878 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 6125297 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 6125301 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 6125422 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6125816 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6125931 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6125950 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6125972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6126244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6126295 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6126363 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 6127526 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 6127554 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 6127660 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 6127815 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 6127904 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 6128159 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6128426 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6128737 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6128778 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6128848 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6129217 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6129633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6129761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6129817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6129927 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6129972 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6130396 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6130402 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6130417 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6130713 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6131167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6132422 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6132806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6135621 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6138739 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6138951 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6138968 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6139675 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6140016 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6140021 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6140138 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6140557 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6142958 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6143681 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 6145106 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6145119 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6145179 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6145598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6146040 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6146416 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6147420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6148979 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6149897 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6150749 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6150985 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6151017 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6151021 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6151798 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6152276 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6153279 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 6154047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6155105 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6156102 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6157077 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6157183 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6158655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6158858 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6159309 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6161307 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6161698 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6162176 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6162820 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6162836 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6162843 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6162901 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6163266 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6163389 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 6163400 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 6163423 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 6163668 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6163721 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6163742 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6163755 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6163766 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6163934 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6164066 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6164236 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6164996 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6165416 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6165435 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6166258 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6166264 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6166588 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6167328 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6167603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6168024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6168687 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 6169103 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6170637 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 6173139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6173881 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6174039 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6174174 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 6176101 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6176984 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6177367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6177744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6177981 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6178250 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6178714 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6178782 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 6178792 G T Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 6179159 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 6179173 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6179672 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6181196 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 6181694 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6182660 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6182886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6182908 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6183120 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6183424 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 6184074 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 6184096 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6184229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6184238 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 6185595 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 6185859 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6185903 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 6185948 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6185962 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 6189866 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6191265 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6191277 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 6191918 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 6192249 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 6192475 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 6192580 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 6193249 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 6193250 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 6194883 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 6200190 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6201799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6202796 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6203000 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 6204173 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 6204907 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 6205183 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 6205434 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6205703 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 6207182 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 6207469 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 6207476 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 6208000 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 6208001 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 6208336 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 6208547 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6208844 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 6209110 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6210016 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6210464 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 6210496 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 6210741 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 6211390 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 6211645 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 6211819 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 6211898 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 6212058 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 6212244 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 6212269 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 6212284 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 6212316 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6212609 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 6213073 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 6214548 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6215037 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6215492 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 6215808 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 6216624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6216694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6216697 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 6216735 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6216749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6218702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6219815 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 6219948 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 6219983 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 6220419 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6220442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6220729 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6220800 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 6220813 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 6220895 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 6221028 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 6221538 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 6221619 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6221677 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6221821 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6221959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6222201 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 6222205 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 6222547 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6222609 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6222857 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6222951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6223163 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 6223220 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 6223326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6223455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6223746 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 6224942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6225434 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6225569 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6225910 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6226547 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6227588 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6229496 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6229752 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6231331 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6232782 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6234966 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6235060 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6236039 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6237197 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6237527 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6238901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6241178 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6241775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6242271 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6242757 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6243338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6245621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6245681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6246136 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6246474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6246695 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6247255 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6247300 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6250472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6251372 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6252303 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 6252368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6252369 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6252645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6253384 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6253390 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6254507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6254512 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6254673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6255066 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6255372 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6255498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6255518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6255573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6255767 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6256023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6256170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6257152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6257221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6257351 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6257522 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6257573 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6257713 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6258206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6258651 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6258672 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6258681 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6259019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6259215 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6259262 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6259500 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6259503 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 6259689 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6259734 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6259766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6260185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6260195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6260203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6260338 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6260757 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6262521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6262577 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6262837 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6263578 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6263594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6263645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6264080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6265320 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6265395 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6266162 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6266167 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6266543 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 6270826 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6272192 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6274316 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6274805 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6275114 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 6277805 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6278393 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6280080 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6280122 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6280187 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6281400 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6282536 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6284003 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6284125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6284135 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6284689 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6285004 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6285009 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6285207 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6285534 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6285866 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6286901 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6287053 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6287227 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6288050 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6288216 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 6288494 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6289180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6289204 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6289294 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6290001 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6291129 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 19 6291130 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 19 6291646 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6292241 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6292565 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 6292600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6292682 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6292709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6292796 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6292912 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6293018 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6293081 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6293321 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6293324 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 6293658 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6293903 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6294897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6295066 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6295097 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 6295521 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 6296133 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6296482 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6297045 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6297880 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6297926 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6299753 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 6299803 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 6300050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6300120 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 6300186 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 6300302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6300412 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6301055 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6301264 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6301517 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 6302183 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 6302209 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6302363 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6303370 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 6303519 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 6303560 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 6303572 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 6303587 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6303963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6303966 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6304452 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 6304557 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6304759 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6304885 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6305625 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 6307485 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6308442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6311582 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6312495 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 6312638 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 19 6312691 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 6312771 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 6316499 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6317985 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6318108 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6325760 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6326229 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 6326233 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 6326294 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6326848 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6326885 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 6327525 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6327724 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6328780 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6328903 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6328980 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6330196 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6331249 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6331313 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 6331727 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6333696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6334599 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6337728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6338153 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6344457 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6344575 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6345239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6345240 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6346941 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6347846 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6347948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6349004 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6350466 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 6351382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6351610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6352139 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 6353557 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6354368 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6354722 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 6356128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6356175 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 6356249 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6356465 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 6357123 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 6360317 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6361196 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6362901 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6362947 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6365647 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6366373 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6370052 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 6376707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6376769 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 6378831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6379089 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6379279 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6380643 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6380664 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 6381252 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 6381275 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 6381521 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 6381524 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 6381815 G A Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 19 6382789 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6383195 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6383609 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6386868 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6387232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6387417 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6390296 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6390913 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6392302 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6393978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6396699 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 6398451 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 6400412 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6402725 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6403356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6404939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6405100 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6405240 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6405576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6406068 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6406440 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6408604 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6409946 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 6411768 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6411803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6412760 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6414037 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6414162 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6414395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6414410 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6415037 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 6415486 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6417168 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6417176 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6417511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6417797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6418047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6419646 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 6421171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6421354 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6422004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6423868 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6423900 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6429052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6429814 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6430031 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6430332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6430596 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6430916 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6430918 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6430929 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6431088 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 6431800 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 6432483 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 6435663 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6435992 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6436113 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6436324 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6436325 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6436389 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6439100 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 6441809 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 6441903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6442245 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 6443098 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6443556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6444886 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 6445145 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6447118 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 6449650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6451233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6451446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6451834 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 6451884 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6452953 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6454418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6454532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6454683 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6454897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6454908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6455440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6455501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6455617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6455982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6456170 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6456735 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6457158 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 6458114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6458333 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 6458458 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6458569 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 6458874 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6463981 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6463998 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6464148 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6464153 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 6465633 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6466149 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 6466950 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6474263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6474267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6478204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6480487 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6481201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6481781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6482013 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6483441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6484351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6484499 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6484932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6485094 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6485214 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 6488590 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6489683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6489950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6490511 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6492054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6493504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6493516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6495364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6496479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6496853 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 6499246 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 6500528 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 6500620 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6501278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6502949 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6503839 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 6504694 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6504787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6504948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6504984 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6505042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6505141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6505282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6505962 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6506122 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 6506192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6507458 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6507863 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6508553 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6508656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6509743 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6510158 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 6510170 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 6510217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6510522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6510552 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 6511333 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 6511471 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 6511478 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 6512596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6512673 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6513106 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6513158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6513592 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 6514137 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6514169 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 6514188 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6514213 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 6515219 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 6516488 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 6517651 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 6519885 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 6520706 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 6520795 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 6523937 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 6524301 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 6524592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6524620 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 6525361 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 6525921 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 6526521 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 6526829 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 6527689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6528434 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 6529059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6529491 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 6529734 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6531314 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 6531560 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6532855 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 6534215 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 6534432 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6535513 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 6535666 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6536009 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 6537049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6537452 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6537953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6538398 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 6538763 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 6539220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6540977 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 6542312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6542585 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6542811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6543179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6543182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6543426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6543435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6544314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6544421 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6544513 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6544531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6544703 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6544770 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6544914 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6545344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6545354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6545635 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6546085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6546363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6547003 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6547240 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6547253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6547300 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6547585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6547627 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6548009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6548138 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6548150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6549233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6549315 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6549447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6549589 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6549639 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6549740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6550056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6550164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6550301 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6550327 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6550664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6550791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6551122 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6551803 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6551948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6551972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6551996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6553097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6553337 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6553596 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6553630 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6553874 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6553883 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6554045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6554312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6554444 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6554475 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6554511 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6554702 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6554773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6554933 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 6555800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6556759 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6556868 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6556956 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6557001 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6557019 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6557192 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6557202 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6557587 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 6557588 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 6557596 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6557617 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6557642 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6557723 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6557806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6557879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6557910 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6557933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6557961 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6557962 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 6557975 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6557983 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6557991 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6558002 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6558133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6558148 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6558157 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6559349 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6559438 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6559488 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6559959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6560113 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6561634 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6561842 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6562093 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6562384 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6562391 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6562395 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 6562446 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6562560 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6562691 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6562693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6562725 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6562984 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6563330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6563332 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6563422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6563469 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6563869 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 6563892 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6564154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6564161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6564188 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6564277 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6564557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6564579 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6564631 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 6564657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6564680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6564965 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6564992 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6565213 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6565229 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6565290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6565296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6565311 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6565324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6565582 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6565588 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6565593 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6565627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6565638 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6565653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6565866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6566182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6566489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6566535 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6566537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6567455 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6568414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6569189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6569207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6569498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6571054 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6571339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6571661 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6571759 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6571899 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6571909 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6572594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6572717 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6572851 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6572898 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6572938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6573344 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6573481 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6575046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6576168 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6577007 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6579372 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6579555 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 6580042 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6580076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6580189 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6580191 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6580258 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6580357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6580402 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6580653 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6580747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6581246 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6581447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6581496 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6581619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6581824 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6581840 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6581867 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 6582040 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 6582101 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6582312 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6582411 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 6582474 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 6582770 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 6582914 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6582939 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6582946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6583736 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6583954 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 6585063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6585395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6585563 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6585957 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6586743 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6587187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6587485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6587654 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 6587956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6588490 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6588513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6588567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6588582 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6588790 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6588920 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6588921 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6588972 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6588993 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6589889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6590617 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6595435 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 6596364 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6596563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6596627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6596628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6596736 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6596815 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6596978 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6597214 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 6597448 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6597988 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6598798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6599825 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6599972 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6601164 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6601266 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6601280 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6601384 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6601632 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6601863 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6602667 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6604303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6608850 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6608967 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6609525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6609534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6610570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6611688 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6612351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6613263 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6613937 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6613943 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6614043 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6614245 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6614727 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6615096 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6615099 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 6615110 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6615173 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 6616028 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6617653 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6618058 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6618121 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6619032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6620142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6620516 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6620842 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6620885 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6620959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6620989 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6621062 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6621264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6621393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6621868 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6622547 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6623048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6623801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6625570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6626724 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6626933 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6627142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6627194 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6627448 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 6627449 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 6627499 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6627522 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6627527 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6627528 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6627612 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 6627658 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 6627794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6627882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6627967 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 6628197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6628364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6628476 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6628504 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6628525 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 6628538 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 6628881 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6629097 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 6629182 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 6629341 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 6629525 A G N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 19 6629547 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 19 6629568 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 6629585 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 6629602 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 6629670 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 6629695 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6629800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6629910 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6629998 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6630171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6630204 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6630400 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6630415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6630442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6631493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6632131 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 6632321 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6632340 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 6632466 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 6632612 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 6632743 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 6632895 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 6633004 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 6634892 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 6635086 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 6635359 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6635437 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6635571 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6636388 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 6638311 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 6638561 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 6638613 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 6638736 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 6638798 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 6638816 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 6638835 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 6638885 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 6639296 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 6639468 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 6639483 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 6639643 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 6639698 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 6639753 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6639990 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 6640033 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 6640204 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 6641237 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 6641466 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 6641512 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 6641572 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 6641574 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 6641689 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 6641920 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 6641972 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 6642095 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 6642507 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 6642843 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 6643010 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 6643615 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6643797 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 6643985 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 6644009 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 6644020 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 6644021 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 6644054 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6645020 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 6645055 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6645065 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6646170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6646945 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 6647219 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 6648743 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6648745 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6649268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6649293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6649614 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6649701 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6649726 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6649778 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6650144 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 6650173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6650642 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 6650810 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 6651210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6651458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6651546 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 6651592 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6651603 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6652091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6652159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6652534 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6652559 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6652577 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 6652672 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6652745 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6652810 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6652907 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 6653035 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6653364 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6653702 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6654457 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 6655055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6655075 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6655174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6655242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6655886 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6656541 T C N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.230769230769231 0 0.769230769230769 6 20 3 0 10 19 6656642 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.1875 0 0.8125 6 26 3 0 13 19 6656656 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 6657094 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6657294 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6657591 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6657789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6657821 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6658524 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6658529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6659903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6659904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6660997 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 6663177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6663345 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6663754 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6663763 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6663776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6663777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6663837 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 6663996 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6664348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6664418 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6664771 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 6664818 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 6665035 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 6665735 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6665804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6666180 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 6666194 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 19 6666294 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6669246 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6670592 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 6670611 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 6670622 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 6670790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6670905 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6671020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6671542 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 6671559 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6672877 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6673043 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 6673206 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6673273 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6673352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6674701 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6675000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6675158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6675324 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 6675558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6676198 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6676202 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6676568 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6676806 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 6676896 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 6677020 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 6677710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6677712 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6677755 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6678377 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 6678438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6679493 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 6680278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6680627 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6681372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6681464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6681669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6682224 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6682227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6682234 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6682397 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6682575 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6683093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6683357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6683379 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6684559 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 6684878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6685647 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 6686068 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 6686106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6686518 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6686618 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6686885 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6686900 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 6687250 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6687691 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6687766 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6888504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6888779 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6888906 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6889166 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 6889249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6889252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6889293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6889498 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6889499 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6889552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6889691 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 6889784 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 6889801 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6889915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6890049 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 6890055 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6890118 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6890243 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6890289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6890377 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6891056 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6891210 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 6891274 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 6891518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6891542 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6891657 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 6891872 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6891881 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6892205 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 6892267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6892268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6892283 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 6892336 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 6892369 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6892398 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6892488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6892748 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 6893033 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6893220 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 6893578 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6893606 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 6893687 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 6893928 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 6894008 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 6894586 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 6896625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6896663 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6896859 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 6897215 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 6897234 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6897249 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6897254 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6899091 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6899574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6900812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6901828 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6901947 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 19 6902339 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 6904140 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 6904525 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 6904537 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 6904704 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6905854 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6906047 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 6906110 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6906490 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6906587 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 6906601 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 6906606 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 6906782 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 6906794 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 6906800 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6906906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6906938 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 6906966 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6907287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6907293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6907332 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 6907351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6907950 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6908365 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6908387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6909133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6909275 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 6909405 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6909627 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 6910159 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6910686 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 6910896 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 6911100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6911367 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6911411 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6911612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6911744 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6913270 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6913327 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6913507 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 6913775 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 6913935 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 6914239 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6914321 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6915238 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6915949 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6916772 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 6916845 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6916894 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 6917565 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6917611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6917975 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 6918146 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 6918183 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6918218 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 6918913 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 6919022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6919059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6922840 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6925500 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 6926349 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6926706 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6926845 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6926999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6928007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6928392 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 6928520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6929331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6929554 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6929555 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6929556 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6929557 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6929780 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6930002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6930229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6930313 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6930647 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6931677 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 6931773 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 6931958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6932469 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 6933032 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 6933227 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 6933273 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 6934900 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6935182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6937644 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6939889 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 6941254 C T N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 6942568 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6944976 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6946415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6948449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6948715 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6949758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6951083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6951351 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 6951554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6953034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6953042 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 6953407 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 6954558 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 6955315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6956217 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6957152 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6957453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6958312 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6958448 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6959310 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6959661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6959731 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6960487 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6961038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6966744 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6972515 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 6974731 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6982911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6984396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6986779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6988410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6990124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6993128 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 6994821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6994954 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6995529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6997555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6997562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 6997782 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 6998064 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7000890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7003121 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7006929 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7016506 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7030114 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7033152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7037633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7042423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7050366 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7053713 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7054349 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7055111 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 7055169 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 7055666 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7057550 A T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 7057919 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7058075 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7058218 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 7058242 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 7058359 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 7058431 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 7059252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7059318 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 7059652 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 7062818 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7062904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7064820 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 7065694 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 7066251 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 7066425 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7066832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7067744 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 7067869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7068038 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 7068596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7068661 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 7068729 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7069306 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 7069326 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7069338 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7069340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7069454 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 7069581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7070823 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 7071790 G C Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 7071972 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 7072188 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 7072475 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7072921 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 7073203 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 7073443 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7073728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7073924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7074440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7074574 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 7074749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7075056 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 7075077 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 7075542 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7075909 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 7075989 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7076092 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 7076133 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 7076173 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 7076736 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 7077170 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 7077388 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 7077591 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 7078614 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7078859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7079285 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7079366 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 7079406 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7079599 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 7079752 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 7080139 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 7081285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7081465 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 7081639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7081657 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 7081928 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7082265 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7082496 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7082553 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 7082588 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7082924 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 7083020 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 7083231 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 7083244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7084354 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 7084357 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 7084596 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 7084602 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 7084669 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 7084736 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 7084738 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 7084768 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 7084872 A T N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 19 7084919 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 7084941 A G Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 19 7085370 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 7085565 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 7085663 C T Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 7085679 A G N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 19 7085681 T C N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 19 7086071 C T Y Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 9 11 2 5 3 19 7086172 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 19 7086371 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 19 7086588 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 19 7086771 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 7087053 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 7087136 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7087295 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7087312 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7087329 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 7087505 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 7087506 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 7087588 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 7087589 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 7087612 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 7087639 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7087894 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7087914 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7088179 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7088982 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7089003 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7089081 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 7089135 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7089951 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 7090791 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7091139 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7091659 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 7091840 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7092522 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7092921 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7095692 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7096382 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7097073 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7097516 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7097589 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7097739 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7097797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7097809 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 7097867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7097912 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7098004 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 7098228 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7098460 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 7098686 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7099793 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 7100410 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7100493 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7100544 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7100548 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7100554 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7101054 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 7101058 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 7101352 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7101967 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 7101988 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7102009 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 7102072 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7102075 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 7102091 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 7102262 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7102434 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7102970 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 7103022 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7103226 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 7104580 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 7105795 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7106111 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 7106253 C A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7106609 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7106888 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 7107313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7107360 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7107430 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7107517 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7107620 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 7107671 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 7107709 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 7108844 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7109261 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 7109315 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 7109395 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7109406 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 7109530 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7109537 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7109564 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7109622 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7109647 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 7109672 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7109674 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7109826 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7109865 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7110010 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7110446 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 7110492 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 7110912 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7111340 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7111621 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 7112431 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7112539 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 7112579 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7113333 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 7113346 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7113358 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7113375 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7113515 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7113798 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 7113885 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7114124 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 7115314 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7115364 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7115870 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 7115991 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 7116142 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 7116450 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 7116511 G C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 7116514 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 7116578 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 19 7116743 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 7116774 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 7117828 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7117861 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7117877 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7117896 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7118073 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7118080 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7120298 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7121422 C T N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 19 7121835 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7122335 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 7122342 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 7122926 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7123938 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 7123987 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 7124425 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 7124914 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 7124922 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 7125229 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 19 7125579 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7126594 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 7126610 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 7126981 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 7127066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7127284 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7128306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7128887 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 7129043 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7129173 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7129348 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7130922 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 7132819 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7132843 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7133322 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7135128 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 7136348 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7136721 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7136831 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7138883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7138978 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7139049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7139159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7140656 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7140725 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7140767 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7141347 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7141447 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7141666 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7141938 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 7143433 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 7143854 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7143858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7144004 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7144040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7144118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7145188 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7145236 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7145238 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7145548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7146276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7146403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7147372 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7147431 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7148478 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7148485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7149913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7152742 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7153136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7153457 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7153466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7154248 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7155106 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 7155751 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7155765 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7155868 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7155932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7156650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7156656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7157240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7157942 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7158467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7158985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7161327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7163912 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7164198 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7164745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7164905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7165193 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7165709 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7165884 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7166949 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7167368 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 7170066 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7170072 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7170117 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7170640 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7171089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7171283 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7171983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7172087 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7172647 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 7173494 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7173689 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7174162 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7174501 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7174682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7174840 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 7175047 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 7175062 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7175335 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7175355 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7175390 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 7175521 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7175603 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7175867 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7175905 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7176270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7176349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7176453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7177100 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7177327 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7177493 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7178099 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7178194 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7179145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7179715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7179743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7180536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7183728 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7185912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7186615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7187839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7188560 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 7188683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7189503 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7190484 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7190748 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7192598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7192642 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7194012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7194393 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7199428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7200041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7200096 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7202442 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 7202906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7203840 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7204436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7204986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7206128 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7206281 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 7206437 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7206509 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7206594 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7207758 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7209215 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7210375 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7210399 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7211309 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 7211419 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7212321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7213427 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7213556 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7215861 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7217060 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 7221674 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7222239 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7222584 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7222648 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7222749 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 7223037 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 7224334 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7224412 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7224722 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 7224890 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7225072 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7225112 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7225910 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7226426 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7227471 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 7227753 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7228540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7228868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7229147 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7229438 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7230292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7231578 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7231810 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7232433 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7232584 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7233465 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7234730 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7235590 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 7235807 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7235860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7236300 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7236571 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 7237955 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7240004 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 7240011 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 7240025 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 7242429 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7242926 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7242927 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7243868 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7244151 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7244658 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7245242 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 7245485 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7245511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7245880 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7247261 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7247923 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7248196 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7248511 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7248587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7249052 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7249182 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7249214 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 7249241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7249303 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 7249313 C G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 7249331 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7249558 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7249675 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7249696 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7249852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7249970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7250045 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7250114 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7250242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7250883 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7251088 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7251133 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7251462 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7251969 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7252037 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7252192 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 7252657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7253382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7253537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7253677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7253917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7255057 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7255205 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7255533 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7256298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7256453 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7256802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7256857 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 7256914 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 7257373 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 7257893 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 7257912 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 7258567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7258612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7259636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7259925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7260323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7260937 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7261740 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 7261848 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 7262308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7262468 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 7262846 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 7262915 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 7263366 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7264148 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 7265300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7265605 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7266147 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 7266148 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 7266482 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 7266487 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 7266526 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 7266580 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 7267071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7267104 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7267791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7268904 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 7272084 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7272865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7272876 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 7273565 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 7279133 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7279749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7281392 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7282753 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 7285118 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 7287392 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7287881 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 7288122 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7292791 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 7293616 A G N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.181818181818182 17 5 8 1 2 19 7294815 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 7296986 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7297255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7299526 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 7300708 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 7303753 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 7306235 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 7306735 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 7307263 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 7307654 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 7308377 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 7308556 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 7311047 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7314008 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7317439 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7317538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7318196 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 7320248 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7321481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7323768 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 7323931 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7324114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7324657 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 19 7324707 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 7324750 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 7325498 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 7325584 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 19 7325617 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 7327059 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 7327913 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 7328279 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 7328307 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 7328354 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 7328359 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 7328698 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 7328831 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 7328949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7329639 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 7330237 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 7330561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7330996 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 7331349 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 7332467 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 7334034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7334956 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 7336210 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7337895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7339353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7340341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7341642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7343888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7349882 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7354026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7356592 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7357704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7359342 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 7359800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7363761 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7366103 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 7366530 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7368961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7370476 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7373994 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 19 7376089 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 7376611 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7376923 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 7377615 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 7378502 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 7378836 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7379126 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 7381797 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7381799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7383487 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 7386192 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 7387288 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 7387293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7387562 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 19 7388207 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7388526 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7391114 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 7391588 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.176470588235294 27 7 13 1 3 19 7393534 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7394190 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7394678 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 7394682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7395037 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7395900 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7396479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7397332 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7397634 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 7398311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7398788 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7399418 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 19 7400897 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 19 7401302 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7401489 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7401923 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7403172 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 7403679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7404060 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 7405296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7406389 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 7406437 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7407530 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7408155 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 7408210 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7408240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7408318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7408319 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7409007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7409360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7409668 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 7410113 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7410854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7411712 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7411819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7411966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7412061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7412093 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 7412331 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7412922 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 7413091 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7414316 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7416778 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7416860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7417279 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 7417476 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7417483 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7417523 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7417598 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 19 7417630 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7417654 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7417662 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7418187 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7418217 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 7418272 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 7418373 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 7418377 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 7418504 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 7418746 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7418976 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7419067 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7419476 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7419485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7420101 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7420293 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7420580 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 7420888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7421069 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 7421998 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 7422065 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 7422379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7422452 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 7422535 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7422604 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 7422622 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7423109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7423124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7423167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7423473 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 7423638 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7425771 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 7426221 T C N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 19 7427227 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7427428 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 7428074 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7428196 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 7428236 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 7428557 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 7428589 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 7428595 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 7428619 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 7428713 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 7428923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7429849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7430219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7430459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7430629 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7431635 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7431728 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7432144 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7432650 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7432672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7433027 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7433105 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7434133 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 19 7434634 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 7434710 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 7435189 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7435380 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7435392 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7435582 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7436011 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 7436417 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 7436679 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7436746 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7437732 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7437879 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7438030 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7438102 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 7438311 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7438637 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 7438686 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 7438747 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 7438916 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 7439165 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7439385 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7439465 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 7439658 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 7440094 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7440270 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 7440772 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7440860 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 7441209 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 19 7441244 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 19 7441612 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 7441988 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 19 7442636 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 7444141 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7444557 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 7445479 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 7446252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7446622 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7446843 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7447476 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7447620 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7448125 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7448313 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7448467 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7449645 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7449780 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 7449923 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 7450048 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 7450115 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 7450695 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 7450725 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7450909 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7450923 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7451062 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7451329 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7451357 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7453185 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 7453309 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7453340 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7453366 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7453397 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7453673 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7453797 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7454151 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 7454480 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7454485 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 7454528 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 7455290 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 7457314 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7457649 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7460748 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7460998 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7461197 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7461285 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7461313 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7461314 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7461354 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 7461480 C T N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 5 15 2 1 7 19 7461789 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 7462351 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7462679 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 7462709 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 7463927 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 7464483 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7464730 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7464748 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 7465015 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 7465174 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 7465210 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 7465221 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 7465286 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7465470 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7465753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7465754 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7465856 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7466064 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7466151 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7466249 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7466954 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7466963 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 7467002 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7467008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7467060 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7467063 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7467067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7467138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7467157 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7468613 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 7468973 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7468998 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7469109 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 7469264 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7469266 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 7470107 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7470687 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7471111 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7471204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7471320 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7471323 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 7471362 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7471624 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7471669 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7471709 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7473740 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 7473789 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7473848 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 7474502 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7474751 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 7474785 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 7474786 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 7474984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7475639 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 7475876 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 7475960 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 7476070 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 7476246 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 7476262 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 7476347 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 7476359 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 7476364 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 7476582 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 7476909 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7476950 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 7477558 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 7477599 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 7477615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7477652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7477663 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 7477693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7478650 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7479024 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 7479129 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7479160 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7479468 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 7479579 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 7479581 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 7479582 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 7479612 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7479666 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 7479704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7479832 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7480000 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 7480109 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 7480208 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 7480242 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 7480376 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 7480381 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 7480453 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 7480536 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7480879 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7480942 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7481564 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7481796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7481996 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 7482059 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 7482901 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7482963 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7483105 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 7483136 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 7483521 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 7483523 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7483537 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 7483604 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 7483609 A T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 7483795 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 7484114 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7485854 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 7486437 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7486624 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 7486840 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 7487365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7488508 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 7488910 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 7489192 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7491429 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7492826 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 7493155 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7493317 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 7494085 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7497675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7500213 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 7502262 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7503073 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 7504980 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7505833 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7505968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7507314 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7507399 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7510671 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7510760 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7512265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7512506 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7512599 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7513842 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 7513957 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7514218 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 7514221 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 7515651 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7516929 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7516936 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7519371 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7520266 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 7520450 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7521149 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7522809 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7523108 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7523121 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7523676 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 19 7524784 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 7526860 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 7527197 A G N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 19 7528139 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7529045 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 7530321 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 7530390 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 7532929 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7533049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7533413 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 7533809 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7534586 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 7536569 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7536862 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 7539864 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 7542004 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 7543051 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7544317 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 7544813 C A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 7547297 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7548389 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7551297 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 7551670 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 7551815 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 7553360 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7553370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7554534 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 7554589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7555134 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 7555533 C T N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 7556140 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 7556886 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 7557724 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7559119 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7559884 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7559922 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7560328 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 7560429 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7560842 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7560875 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7562079 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7562189 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7563033 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 7564734 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7565864 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 7567413 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7568287 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7569189 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7572594 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 7572708 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7572738 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 7572841 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 7573915 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7574523 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7575156 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7576249 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7576912 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7579392 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7581473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7581524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7582761 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 7583094 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 7585215 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 7585782 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 7585846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7585953 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7587344 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7587697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7587741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7588893 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7589193 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7589346 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7589973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7590419 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7592912 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 7594648 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 19 7596094 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7597046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7597596 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 19 7599336 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7599648 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 7599649 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 7600148 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7601754 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 7601931 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 7602077 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7602430 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 7603365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7603735 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 7603966 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 7604386 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 7605432 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7607262 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7607381 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 7607700 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7607802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7608388 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 7611818 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 7611880 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7612474 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 7612528 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7612845 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 7613120 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7614169 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 7614904 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 7615150 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7615704 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 7615903 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7616095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7616422 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7616472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7616590 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 7617099 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 7617409 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 7617549 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 7617573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7617901 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7618858 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7619259 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 7619418 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 7619647 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7619699 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 7621006 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 7621173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7621481 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7621619 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7622658 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7622721 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 7622951 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 7624083 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7624475 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 7626077 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 7626199 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7629673 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 7629679 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 7629867 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 7629940 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 7630105 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7630429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7630681 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 7630742 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 7630784 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 7630857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7631047 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 7631240 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 7631251 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 7631458 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 7631536 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 7631903 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 7632261 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7632351 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 7633164 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7633347 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 7633654 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 7633678 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 7633693 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7633700 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 7633760 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7634122 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7634139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7634370 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7634371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7634543 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7634600 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7634605 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7634644 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7634713 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7634739 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 7634762 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7634921 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7635069 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 7635197 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 7635449 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 7635642 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7635871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7636029 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 7636460 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 7636712 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7636970 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7637081 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 7637245 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7637711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7638171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7638295 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7638478 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7638571 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7639667 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 7640019 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 7640053 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 7640068 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 7640126 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 7640408 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 7640749 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 7640773 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 7640935 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 7641074 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 7641103 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 7641642 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 7641758 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 7641823 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 7641929 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 7642193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7642194 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7642414 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 7642535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7642650 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 7642750 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 7642837 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7642972 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 7642973 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 7643497 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 7643505 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.222222222222222 27 9 13 1 4 19 7643529 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 19 7643606 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 7643870 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 7643894 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 7643927 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7644609 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 7646030 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 7646155 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 7646208 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7646260 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 7646374 T G N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.25 0.0625 0.6875 9 23 4 1 11 19 7646613 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 7646749 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 7646820 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 7647627 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7647903 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 7647995 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 7648301 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 7648307 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 7648398 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 7648400 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 7648600 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 7648808 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 7649302 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 7649611 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 7649840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7650418 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 7650735 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 7651149 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7652305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7652795 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7653324 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7654182 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 7654823 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7654837 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7654905 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7655137 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7656055 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 7656201 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 7656322 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 7656409 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 7656412 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 7656413 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 7656425 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 7656511 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7656851 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7657298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7657364 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 7657570 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 7657646 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 7657768 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 7657817 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7657818 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7658243 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7658424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7658934 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7659225 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 7659600 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 7659817 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 7660871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7661053 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7661055 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7661090 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7661093 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7661253 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 7661329 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7661363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7661376 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 7661451 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7661508 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 19 7661735 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7661751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7661762 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7661935 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7661963 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7663503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7664129 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7664844 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7667018 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 7669148 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7671662 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 7671824 C A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 19 7671868 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 7671869 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 7672074 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7675240 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 7677706 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7678083 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 7678889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7679301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7679431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7679856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7682416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7682713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7684333 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7684491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7685525 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7685616 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 7686086 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7686636 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7686663 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 7687260 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7689870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7690145 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7691192 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7691340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7691512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7692305 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 7692614 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7692682 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7693046 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7693279 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7693556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7694174 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 7694178 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 7694247 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 7694674 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7694688 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 7694832 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 7694987 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 7695230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7695293 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7695456 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7695625 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 19 7697380 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 7697517 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 7697654 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 7697677 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 7697920 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 7697943 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7697999 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 7698018 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 7698551 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 7698599 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7698845 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 7698851 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 7699219 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 7699783 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 7699840 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 7699940 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7700167 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 7700215 G T N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 19 7700241 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 7700243 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 7700401 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 19 7700718 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 7701058 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 7701187 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 19 7701246 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 7701268 A C N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 19 7701432 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 7701591 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 7701840 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 7701936 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 19 7702002 C T Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 19 7702024 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 7702075 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7702249 A T Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 19 7702310 C T Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 19 7702689 C G N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 19 7702742 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 19 7703022 T A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 19 7703078 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 19 7703418 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 7703760 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 19 7704036 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 7704430 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 7704995 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 19 7705115 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 7705235 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 7705305 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 19 7706863 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 7707116 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 7708016 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 7708532 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7708995 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7709106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7709218 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 7709276 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7709323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7709568 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 7710347 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 7710384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7710514 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7710556 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 7710760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7711098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7711104 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7711374 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7711541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7712917 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7713450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7713619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7714283 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 7714550 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7716277 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7717074 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7717333 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7717865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7718721 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7719643 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7721046 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 7721422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7721858 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7721874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7721881 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 7721922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7721951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7722199 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 7722321 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7722455 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 7722456 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 19 7722481 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 7722593 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7722778 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 7722940 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 7723065 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 7723160 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 7723193 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 7723207 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7723218 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 7723222 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 7723415 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 7723467 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 7723510 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7723585 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 7723624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7723860 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7724815 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 7725788 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7726086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7726103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7726144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7726189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7726335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7726382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7726401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7726414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7726549 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 7726562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7726623 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 7726718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7726719 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 7726744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7726765 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 7726828 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 7726853 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 7726905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7727317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7727345 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 7727352 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 7727396 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 7727472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7727596 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7727623 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 7727641 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 7727883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7727927 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7728105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7728136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7728299 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 7728309 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 7728311 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 7728344 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 7728351 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 7728385 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 7728399 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7728420 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 7728470 T G N N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.181818181818182 17 5 8 1 2 19 7728551 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 19 7728552 G T N N 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 19 7728708 C G N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 19 7728741 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 7729492 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 7729640 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7729732 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 7729953 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7730147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7730209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7730789 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 7731168 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7731293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7731348 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 7731373 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 7731823 A G Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 7731845 T G Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 7732013 G A Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 7732129 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 7732240 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 7732356 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 7732430 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 7732443 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 7732475 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 7732518 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 7732522 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 7732607 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 7732666 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 7733478 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7733488 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 7733530 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 7733556 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7733773 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7733797 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 7733815 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 7733851 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 7733895 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 7733946 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 7734103 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 7734306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7734340 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 7735431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7742220 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 7744173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7745094 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7746270 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7760372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7764249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7764277 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7764580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7764613 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7765903 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7766747 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7767582 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7767814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7768273 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 19 7768524 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7770174 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7771074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7771311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7771914 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 7772452 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 7773083 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 7773181 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 7773670 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7773783 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 7774132 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 7784868 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7784988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7785275 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7786183 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7786677 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 7786959 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 7790067 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7797555 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7798560 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7799613 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7802202 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 7802943 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7812529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7812960 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7819268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7819605 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7819778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7820205 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 7820508 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7823225 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7823226 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7832672 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 7836515 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7841416 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7841948 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7853210 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7854304 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7856363 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 7858606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7860834 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 7862423 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7865540 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 7865800 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 7866571 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7868615 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7869196 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 7871548 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 7871985 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7874443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7874942 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7876569 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7877255 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7878881 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7878920 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7879393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7880763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7881335 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7881683 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 7881959 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7882649 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 7884931 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 7901052 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7902028 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 7902935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7903077 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7904106 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7905887 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7906660 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7908891 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7910332 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 7924312 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7929847 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 7933026 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7933644 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7933793 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7934642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7936071 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 7937072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7937209 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7951419 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7951739 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7952460 G T Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 7953224 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7956430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7957343 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7958142 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7963395 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 7963411 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7964221 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7965352 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7966361 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 7976108 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7976692 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 7977841 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7978082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7983966 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 7984774 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 7985884 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 7995880 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 7996071 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 7999837 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8001487 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8001510 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8002429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8003391 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8003392 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8003431 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8009764 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 8014216 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8014631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8014692 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8015948 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8016399 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8016668 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8018502 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8018529 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8021322 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 8021747 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8021775 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8022024 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8022651 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8023437 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 8023903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8025858 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8026975 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8027069 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8028776 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8030967 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8036361 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8036405 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8036509 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 8037881 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8039338 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8041491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8043098 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8043350 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8044564 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8046879 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8050588 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8051127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8051673 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8051674 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8054120 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8054800 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 8061821 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8061978 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8077236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8077697 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8077907 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8079314 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8079417 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8079427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8079719 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8083129 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8083512 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8084149 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8084892 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8085107 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 8085907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8087035 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8087036 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8087285 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8087696 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8088428 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 8088578 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8089740 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 8090500 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 8091255 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8091525 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8093477 A T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 8094456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8094863 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8095159 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8096428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8096474 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8098135 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8106161 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8106215 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 8111168 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8112651 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 8113151 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 8113582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8113679 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8114254 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8114298 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8115032 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8115991 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8116055 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8116730 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 8117193 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8118255 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 8118580 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8121258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8122020 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8122848 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8125098 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8125314 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 8125580 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8125732 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8125927 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8126269 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8126606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8128759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8130249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8131298 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8132137 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8132720 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8132721 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8134927 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8134970 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8135149 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8135871 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8136225 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8136434 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8136999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8139746 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8141958 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8142503 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8143953 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8145191 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 8146956 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8147160 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8147610 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8147675 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 8148504 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 8148721 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 8148834 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8149045 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8149116 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8150056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8151267 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8152147 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 8152757 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 19 8153060 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8154495 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 8154700 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 8155153 G C N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 19 8155508 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8155653 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8156031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8156309 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8156387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8156441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8157045 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 8157046 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 8157641 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8157828 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 8158015 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8158588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8158604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8158984 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8159452 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 8160146 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8160504 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 8160593 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 8160644 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8164390 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8167096 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 8167441 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8168030 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8168622 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 8168640 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 8169291 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8169574 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8169618 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8170949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8171006 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8171168 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 8171231 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8171282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8171649 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8172522 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 8173031 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 8175463 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8177933 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8179726 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8180701 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8180751 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8181305 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8181404 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8181818 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8182731 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8182936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8183364 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8183365 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8184392 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 8186060 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 8186335 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8186892 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 8186904 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8187367 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8188476 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8188912 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8189337 A T N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 19 8189499 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8189979 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8190236 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 8190446 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 8190562 C G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 19 8191860 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 8192247 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 8197803 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8197890 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8198846 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8199554 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8199814 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8202338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8202529 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8202802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8202803 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8202835 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8203194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8203220 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8203457 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8203708 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8204901 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8205469 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 8206724 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 8207379 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8207717 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8208012 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8208446 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 8208499 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 8209793 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8210011 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8210384 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8213114 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8213295 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8213445 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8234750 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 8234809 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 8235078 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 8235155 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 8244100 G A Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 8269005 T C Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 8338981 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8362111 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 8409493 T A Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 8418781 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 8421578 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 8428820 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 8465816 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 8467280 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 8482419 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8488573 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8490245 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8490247 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8490249 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 8490294 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8490413 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8490424 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8490855 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8492495 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8497623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8501265 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 8501418 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 8509440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8509805 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8511135 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8511409 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8512029 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8513080 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8513124 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8518200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8518475 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8519442 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8520669 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8521409 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8521979 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8521997 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8522538 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 8523518 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 8534410 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8537350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8539030 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8541204 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 8541856 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8542230 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8542843 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8543464 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8543633 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 8543648 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8543666 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8543773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8544176 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8544620 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 8545104 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8545597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8545695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8545896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8546643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8548006 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8548126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8549724 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8550407 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8550622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8550921 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8551865 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8552221 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8552520 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8554013 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8554045 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8554845 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 8555027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8555393 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8556529 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8557661 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8557690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8557874 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 8558474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8559502 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 8564293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8564295 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8564574 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8564644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8566124 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8566326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8566664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8567524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8567710 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8567742 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8567871 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8568896 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8569283 T A Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 8569873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8569968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8570385 A T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 8571358 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8572007 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 8572524 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8579176 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 8579301 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8580694 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8582045 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 8582686 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8583132 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8583172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8583390 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8583491 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8586251 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 8591112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8593276 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 8596919 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8598321 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8600467 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8600861 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 8609717 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8611140 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 8614814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8615896 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8616746 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 8622410 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8624628 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8625307 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8631926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8632531 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 8633086 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.578947368421053 0.0526315789473684 0.368421052631579 23 15 11 1 7 19 8633396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8633690 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8633894 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8635464 C T N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.466666666666667 0.133333333333333 0.4 16 14 7 2 6 19 8635830 G T N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.307692307692308 0.230769230769231 0.461538461538462 11 15 4 3 6 19 8635846 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 19 8635968 T C N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 19 8636022 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 19 8636570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8636708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8636718 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 8637951 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8638125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8638555 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8638566 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8638893 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8639654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8639822 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8639825 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8642186 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8643592 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 8643883 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8644610 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 8644736 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 8645248 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.4 0.05 0.55 17 23 8 1 11 19 8645371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8645404 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8645482 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8645875 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 8645978 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 8646074 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8646109 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 8646162 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 8646549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8646727 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 8646841 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 8646999 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 8647087 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 8647156 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 8647158 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 8647159 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8647222 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 8647227 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8647636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8647669 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 8647837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8647870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8647937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8647987 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8647989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8648022 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 8648389 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8648511 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.315789473684211 0.105263157894737 0.578947368421053 14 24 6 2 11 19 8648542 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8648550 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 8648553 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 8649050 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8649181 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8649310 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8650063 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8650316 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8650679 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.35 0.1 0.55 16 24 7 2 11 19 8654237 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 8655244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8656103 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8660828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8661611 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 8661768 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 8661872 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8661901 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 8662202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8663126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8663834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8663899 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.588235294117647 0.0588235294117647 0.352941176470588 21 13 10 1 6 19 8663952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8663964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8664074 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 8664247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8665537 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 8665978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8667748 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8668099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8669607 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 8669766 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8669849 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.315789473684211 0.105263157894737 0.578947368421053 14 24 6 2 11 19 8670247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8670964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8671055 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8671102 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8671122 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8671128 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.55 0.1 0.35 24 16 11 2 7 19 8671198 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.55 0.1 0.35 24 16 11 2 7 19 8671213 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 8671682 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8672385 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 8672409 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.35 0.1 0.55 16 24 7 2 11 19 8672520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8672532 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8672637 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.315789473684211 0.105263157894737 0.578947368421053 14 24 6 2 11 19 8672662 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 8672718 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.55 0.1 0.35 24 16 11 2 7 19 8672957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8672967 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 8673686 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8676935 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 8677604 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 8678491 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.315789473684211 0.105263157894737 0.578947368421053 14 24 6 2 11 19 8678560 G C Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 8678584 G T Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.315789473684211 0.105263157894737 0.578947368421053 14 24 6 2 11 19 8678767 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.35 0.1 0.55 16 24 7 2 11 19 8678850 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.315789473684211 0.105263157894737 0.578947368421053 14 24 6 2 11 19 8679492 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.55 0.1 0.35 24 16 11 2 7 19 8679608 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8680424 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.55 0.1 0.35 24 16 11 2 7 19 8680494 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.35 0.1 0.55 16 24 7 2 11 19 8680616 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 8680735 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 8680924 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 8681236 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 8681295 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 8683299 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 8683350 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8685723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8687730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8688035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8689205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8689323 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8689378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8689936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8692201 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8692302 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8692319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8692757 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8693173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8694112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8695585 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 8698837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8699043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8699656 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8699729 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 8699818 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8701108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8701209 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 8701243 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 8701503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8701581 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 8701648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8702094 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 8702294 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8702468 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8702518 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 8702615 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8702624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8702772 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 8702871 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8702945 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8702964 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8703062 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8703242 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 8703260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8703293 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8703474 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 8703491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8703612 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8703707 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8703760 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8703831 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 8703833 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 8703908 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 8703913 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 8704639 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8704721 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8704755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8704765 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8704962 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8705139 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8705844 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8705869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8705876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8705950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8706122 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 8706138 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 8706214 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 8706781 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8706956 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 8707005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8707041 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8707629 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 8707703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8707992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8708141 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 8712591 T C Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 19 8712801 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8714573 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8714637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8714646 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8714806 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 8715364 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 8715727 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8716144 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8716206 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 8716284 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8716636 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 8716667 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8716995 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 19 8717156 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 8717242 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8717527 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 8717592 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 8717686 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 8719029 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 8719031 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 8719148 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8719180 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 8719221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8719227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8719628 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 8719760 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8719853 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 8722124 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 8725276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8725286 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8725323 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 8725350 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 8725408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8726100 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8726118 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 8726769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8726863 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8728731 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8728773 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8728851 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8728895 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8729506 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 8729510 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 8729563 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8729949 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 8730651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8731498 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8731643 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8732357 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8732842 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 8733353 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8733484 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8733672 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 8734226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8734293 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8734506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8735505 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8736369 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 8737608 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8737781 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8738962 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8739188 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8740019 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8741804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8742316 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8742361 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8742362 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8742535 C T Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 8742538 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 8742707 T G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 19 8742810 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 8742967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8743037 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8743389 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 8743430 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 8743431 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 8743510 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8743523 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8743525 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8743710 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8743730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8743904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8743947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8744059 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8745693 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 8745698 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8745760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8746339 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8746516 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8746533 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 8746548 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 8748061 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 8748474 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 8751302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8753376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8754076 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8754410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8754554 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8755149 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8755438 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8755450 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8755694 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8755894 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 8755916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8755948 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 8756019 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8756267 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 8757104 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 8757620 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 8757998 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 8758064 A C Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 19 8758310 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8758871 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 8759140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8759261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8759585 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 8759911 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8760777 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 8760808 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 8760849 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 8761001 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 8761073 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 8761717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8762316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8763348 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 8763454 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 8763461 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8763593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8764303 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8765595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8766169 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8766496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8766689 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 8767196 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8767367 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 8767573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8767696 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8767895 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 8768132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8768469 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8768898 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 8769167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8769300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8769359 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8769607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8769825 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8770203 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8771602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8772354 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 8772378 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8772386 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8772433 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 8772435 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 8772442 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 8772865 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 8773220 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 8773944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8774102 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 8774152 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 8774222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8774229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8774233 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 8774467 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 8774561 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8774567 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 8774569 C G N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 19 8774959 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 8775004 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 8775337 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8775792 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8775882 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8775999 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8776141 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8776614 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 8776949 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 8778630 A G N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 19 8778934 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 8780978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8781154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8781510 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8782988 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 8783024 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8783288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8783372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8783627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8784602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8784921 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8784942 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8784956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8785021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8785033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8785043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8785261 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 8785703 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8785726 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8785771 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 8786288 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 8786503 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8786609 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 8787852 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8788940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8789299 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8790472 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8791463 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8792542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8794594 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8797188 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8797387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8797991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8799006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8799236 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8799298 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8799485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8803202 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 8803441 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 8803635 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 8804001 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 19 8804271 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 19 8804415 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8804829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8805728 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 8806664 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 8806699 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8807394 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 8807792 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8807837 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8812105 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8812964 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8813433 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8815082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8815747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8818351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8820538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8820684 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8823113 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8825033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8825497 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8827120 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 8827769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8828354 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8830225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8830310 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 8830469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8833788 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8834177 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8834676 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8836326 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 8836467 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 8838423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8839975 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8846093 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8847142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8848275 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8850457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8853539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8854267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8856678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8857096 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8860579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8861054 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8863231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8864445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8864451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8867287 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 8868030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8874626 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8878475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8879987 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8880171 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8881825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8884936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8889140 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8891228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8892418 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8892444 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8892826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8892947 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8893694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8896888 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 8898629 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8898903 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8899171 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8901566 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8901581 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8901607 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8902032 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8902422 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8902457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8906793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8911871 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8913101 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8913679 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8914927 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8915310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8917005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8917043 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8918497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8919037 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8919426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8920297 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8923218 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8924172 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 8926210 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8930730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8931163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8933084 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 8933912 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8935662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8936055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8936092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8936616 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8940382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8940401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8940680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8941236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8943494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8950727 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8951729 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8952732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8954285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8955487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8955538 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8955686 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8956814 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8957704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8959418 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8964134 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 8964613 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 8965361 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8969962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8972620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8974993 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8975822 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8976585 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8977184 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8977815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8978064 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8978374 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8978582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8979103 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 8979365 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8982485 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8983343 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 8984233 T A Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 8984504 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 8984922 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8985259 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 8985268 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 8985564 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 8985859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8985909 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8986590 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 8986745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8986854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8990729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8991954 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8992571 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8992617 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 8993977 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8994278 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8995754 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8995802 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 8996612 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 8999446 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 8999475 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 9002741 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9007001 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9008085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9008158 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9009915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9010993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9012797 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9017419 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9018148 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9018451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9019040 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9019267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9020229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9021967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9022626 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9022695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9028051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9028410 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9028637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9029068 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9029329 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9029642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9030426 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9031572 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9031616 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9031898 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9034166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9035981 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9039396 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9041740 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9044162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9044782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9045237 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 9045460 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9045953 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 9045974 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 9045994 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 9046187 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 19 9046676 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 9046927 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 9047337 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 9048668 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9050969 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9051184 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 9052657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9053862 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9053957 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9054951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9055697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9056298 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9058208 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9058436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9059550 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9060292 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 9060350 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9060956 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9061024 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9061477 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9061658 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9061756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9062534 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 9063152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9063448 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 9063509 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9067447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9068576 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9069241 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9069541 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 9070337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9070481 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9070538 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9070683 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9071159 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 9071601 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9071964 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9072840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9073662 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 9073689 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 9073700 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 9073774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9073818 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 9073819 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 9074757 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 9074806 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 9074825 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 9075317 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 9076098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9076104 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9076670 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9076806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9076960 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9077081 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9077268 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9077343 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9077344 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9077663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9077826 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9079455 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9079681 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9084796 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 9085455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9088380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9088758 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 9089610 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 9089646 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 9090831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9091770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9093543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9094202 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9094557 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9094570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9094638 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 9094789 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 9095056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9095093 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9095271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9095443 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9095464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9095503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9095546 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 9095610 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 9095689 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 9095754 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9095776 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 9096004 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 9096050 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 9096106 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9096133 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 9096217 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 9096225 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 9096744 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9096899 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9097013 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9097083 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9097098 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9097107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9097139 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9097160 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9097187 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 9097552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9097556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9097717 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9098406 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 9098439 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9098731 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 9098733 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9098866 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9099165 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 9099408 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9099440 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 9099495 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 9100150 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 9100154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9100165 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 9100173 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 9100273 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 9100492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9101085 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 9101197 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 9101475 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 9101523 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 9101989 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 9102000 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 9102242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9102264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9102886 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 9103250 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9103816 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 9103924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9104005 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 9104026 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 9105007 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 9105541 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 9105894 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9105897 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 9106491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9106622 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 9106727 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 9107592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9107780 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 9107809 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 9107914 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 9108183 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 9108213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9108236 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 9108410 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 9108424 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 9108556 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 9108558 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 9108584 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 9108635 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 9108723 T G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 9108758 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 9108815 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 9108816 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 9108994 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 9109090 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 9109470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9109893 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 9110102 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9110334 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9110426 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 9111044 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 9111426 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9111792 G T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 19 9113537 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 9114910 G A N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 19 9114933 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 9114955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9115958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9116393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9116653 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 9118422 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 9118509 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9118585 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9118758 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9118998 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9119024 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 9119400 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9119440 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9119524 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9119538 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9119661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9119688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9120376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9121507 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9121539 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9121664 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 9123426 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9123650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9126854 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9126857 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 9127809 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9127891 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9128526 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 9129680 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 9130242 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9130992 T G Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 9131232 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 9131233 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9131243 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 9131357 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 9133719 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 9134043 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 9134166 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9134407 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9134500 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 9134679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9135605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9135919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9138953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9141941 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9143954 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 9144091 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 9144131 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9144231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9144675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9145575 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9145582 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 9147105 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 9147106 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 9147196 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 9147215 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 9147483 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 9147603 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 9148301 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 9148310 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 9148313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9148745 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9148754 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9148809 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 19 9148967 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 9149240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9149400 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 9149811 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 9149843 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 9150828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9150938 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9151559 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 9152051 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9152306 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 9152403 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 9152954 C A N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 19 9155244 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9157932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9159902 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 9159903 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 9160090 G A N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 9160166 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 9160265 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 19 9160470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9160865 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 9161433 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 9162002 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 9162051 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 9162429 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9162712 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9163026 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9163080 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9163519 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9165056 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9165828 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 9167458 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9167864 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9168229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9168675 G C Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 9168942 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 9169008 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 9169041 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 9169043 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9169327 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 9169376 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 9169382 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 9169822 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9169828 G C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 9169917 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 9169965 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 9170149 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9170179 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 9170190 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 9170368 G C Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 9170426 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 9170442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9170473 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 9170517 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 9170554 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 9170625 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 9170647 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 9170661 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 9170673 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 9170759 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 9170783 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 9170995 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 9171001 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 9171038 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 19 9171074 C T Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 19 9171171 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9171334 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 9171392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9171415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9171639 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9171663 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 9171664 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 9171693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9171715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9171731 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9171791 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9171846 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 19 9171868 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9171937 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9171941 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9171953 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 9172034 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 9172196 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 9172253 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9172375 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9172613 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 9172714 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9172730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9172735 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 9174945 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 9174990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9175007 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 9175377 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 9175439 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9175536 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 9176419 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 19 9176496 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 9176929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9177102 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9177281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9177328 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 19 9177330 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 19 9177595 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 19 9177618 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 19 9177713 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9178133 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9178220 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 19 9179058 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9179167 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9179391 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9179433 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9179448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9179472 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9180320 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9180324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9180474 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9181760 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9183622 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9186041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9186713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9187722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9189463 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 19 9189983 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9190456 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9190706 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 19 9192115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9193531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9195708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9196802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9198235 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9198897 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9200634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9203190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9205162 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 9205177 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 9205687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9206403 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9206415 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 9207372 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9208832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9210395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9210673 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 9210763 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9211099 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 9211342 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9211473 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9211603 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9211778 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9212298 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9213237 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9213306 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9217158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9218414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9218470 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9218604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9218623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9218666 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9218710 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9218817 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9218838 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9219074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9219243 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9219306 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9219510 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9219578 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9219588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9219685 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9219743 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9219940 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9219989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9220090 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9220109 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9220157 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9220174 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9220184 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 9220208 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9220243 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9220312 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9220333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9220391 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9220398 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9220462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9220535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9220557 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9220720 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9220758 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9220767 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9220773 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9220843 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 9220872 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 9220904 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 9221025 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9221159 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 9224049 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9224078 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9224211 G T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 9224252 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9224254 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9224269 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9224348 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9224451 T C Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 9224998 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9225220 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 9225235 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 9225273 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 9225295 G A Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 9225442 C A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 9225510 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 9225515 T G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 9225519 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 9225530 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9225552 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9225615 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 9225622 C T Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 9225677 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 9225683 T A Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 9226210 C T Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 9226270 C G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 9226378 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9226392 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9226396 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9226463 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9226491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9226509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9226590 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 9226592 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 9226594 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 9226595 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 9226623 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 9226686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9226690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9226694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9226729 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9236244 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 9236365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9236378 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9236702 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9236768 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9236772 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9236778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9236794 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9236795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9236927 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9236965 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 9237013 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9237102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9237134 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9237163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9237169 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9237179 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9237212 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9237220 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 9237222 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 9237235 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9237280 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9237545 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9237627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9237698 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9237711 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9237791 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 9237795 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9237806 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 9237807 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 9237871 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9238160 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9238206 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9238225 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 9238454 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9238830 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9239316 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9239326 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9239551 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 9239746 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9239830 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9240062 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9240146 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9240147 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 9240157 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9240168 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9240176 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9240194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9240207 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9240360 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9240363 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9240408 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9240439 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9240444 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9240452 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9240453 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 9240576 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 9240606 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9240627 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9240652 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9240683 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9240714 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9240797 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9240810 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9240824 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9241019 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9241028 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9241137 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9241193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9241205 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9241308 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9241345 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9241437 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9241453 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9241474 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9241477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9241494 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9241521 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9241542 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9241576 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9241578 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9241579 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9241602 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9241604 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 9241614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9241653 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9241663 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9241665 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9241688 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9241717 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9242013 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 9242124 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 9242131 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 9242140 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 9242444 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9242504 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9242517 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9242571 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9242749 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9242930 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9243090 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 9243125 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9243186 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9243197 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 9243229 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 9243809 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9243841 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9243883 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9244032 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9244164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9244279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9244304 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9244401 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9244414 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9244470 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9244698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9244950 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9245117 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9245416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9245563 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9245741 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9245745 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9245840 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9245985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9246098 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9246187 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9246297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9246302 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9246459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9246479 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9246567 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9246585 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9246613 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9246874 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9246892 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9253777 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9253784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9254330 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9265427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9267989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9275614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9277065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9277625 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9284818 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9290532 C A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 9305362 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9305565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9307394 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9309766 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 9312820 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9313811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9321519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9321872 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 9322163 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9322179 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9322546 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9412189 G A Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 9437775 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 9437782 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 9463114 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 9482695 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9482898 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9482939 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 9482988 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9483012 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9483588 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9483615 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9494976 C G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 19 9495032 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9495084 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9495115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9496878 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 9497320 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9497378 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9498589 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 9498703 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9498822 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9498965 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 9499123 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 9499158 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9499249 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 9499452 T A N N 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 19 9499583 A G Y Y 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 19 9499859 A T Y N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 19 9499930 A G Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 19 9500012 T C Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 19 9500469 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9500706 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 9500763 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 9500969 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 9501022 G C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 9501030 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 9501291 T C Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 9501368 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9501858 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 9502136 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 9502308 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 9502315 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9502369 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9502388 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9502491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9502507 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9502631 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9502692 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 9502742 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 9502757 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9502983 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9503139 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9503142 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9503258 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9503341 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9503460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9503474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9504032 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9504223 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9505208 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9505212 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9505271 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9505302 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9505897 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9505919 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 9506176 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9506266 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 9506365 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9506506 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 9506525 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 9506612 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9506861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9507003 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9507082 T C N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 19 9507273 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 19 9507295 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 9507355 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 9507436 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 9508108 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 9508133 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9508137 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9508138 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9508187 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 9508318 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9508391 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 9508564 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9508589 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9508638 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9509074 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 9509313 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9509430 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 9509739 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9509836 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 9509837 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 9509957 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 9509965 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 9510123 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 9510275 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9510290 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9510586 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9510876 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9510924 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9510939 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 9510940 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9511032 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9511034 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9511195 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 9511701 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9511714 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9511923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9512009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9512010 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9512108 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9512154 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9512290 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9512526 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9512965 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9513132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9513364 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9513627 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9513655 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9513857 C G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 9514402 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 9515190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9515346 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9515376 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 9515685 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9515956 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 9516032 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 9516413 C A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 9516708 A C N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 9516906 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 19 9516963 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 9517063 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 9517503 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9517514 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9517702 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 9517800 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9517931 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9517963 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9517982 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9518028 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 9518629 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 9518666 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9519426 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9519463 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9519477 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9519485 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 9519526 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9519609 A T N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 19 9519618 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 9519763 T C Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 9519853 G C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 9520327 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9520347 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9520401 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9520441 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9520552 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 9520698 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9520894 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9520937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9521019 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 9521054 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9521100 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9521258 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 9521434 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9521511 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 9521869 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9522030 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 9522104 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 9522148 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9522159 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 9522169 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9522199 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9522254 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 9522558 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 9522615 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9522624 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 9522724 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 9522740 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 9522948 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 9523019 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9523108 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9523187 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 9523199 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 9523427 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9523435 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 9523483 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9523608 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9523646 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9523671 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9523742 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9523770 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9523784 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9524468 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9524646 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 9524874 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 9524894 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 9524974 T C Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 9525004 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 9525192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9525298 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9525323 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9525618 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9525621 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9525687 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9529618 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9529718 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9530086 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 9530144 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9530236 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9530246 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 9530291 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9530337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9530459 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9530482 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9530627 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9530702 G A N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 19 9530741 G A N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 19 9530765 A G N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 19 9530804 T C Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 9531482 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9531735 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9531835 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9532294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9532371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9532569 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 9532578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9532617 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9532739 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9532870 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9532956 A C Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 9532991 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 19 9532992 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 9533152 C T Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 19 9533206 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 9533207 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 9533423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9533620 A C Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 9533662 G C Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 9533787 T C Y Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 19 9534043 C G Y N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 19 9535376 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9535394 G T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9535670 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9535671 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9535754 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9535793 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9535825 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9536120 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 9536194 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 9536291 G C Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 9537740 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9538143 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9538560 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 9538886 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9538964 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9538990 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 9539142 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 9539230 A T N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 19 9539323 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9539327 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 9539419 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9539479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9539631 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9539664 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 9539816 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 9540178 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9540223 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9540620 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9541013 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 9541205 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 9541220 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 9541981 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9542034 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9542061 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9542079 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9542084 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9542099 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 9542358 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 9542384 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9542396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9542419 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 9542420 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 9542730 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9542803 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9542976 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 9542979 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 9543120 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9543163 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9543236 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9543497 G T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 9543638 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 9543653 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9543669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9543851 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9543868 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9543937 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9543949 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9543979 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9544018 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9544658 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 19 9544676 T A N N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 19 9544693 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 9544738 C G N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 19 9544855 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 19 9544861 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 5 9 2 1 4 19 9544887 A C N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.307692307692308 0.153846153846154 0.538461538461538 10 16 4 2 7 19 9544915 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 19 9545031 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 9545076 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9545132 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9545182 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 9545188 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 9545215 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 9545225 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 9545423 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 9545493 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9545529 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9545611 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 9545617 A T N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 19 9545956 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9546090 A C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9546142 T C Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 9546150 T C Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 9546211 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 9546266 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 9546275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9546348 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 9546352 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9546353 G C Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 9546413 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 9546547 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 9546600 G C Y N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 19 9546681 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 9546750 T C Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 19 9546867 T G N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 19 9547073 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 19 9547144 A C Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 9547188 A G Y Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 19 9547238 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9547290 A C Y N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 19 9547332 T A Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 9547370 C T Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 19 9547493 A T Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 9547540 T G Y N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 5 5 2 1 2 19 9547620 A G N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.181818181818182 0.454545454545455 0.363636363636364 9 13 2 5 4 19 9547764 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 9547770 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 19 9547772 C G N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 19 9547922 A T N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 19 9547923 A C N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 19 9547989 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 9548066 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 19 9548170 C T N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 19 9548288 G A N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 19 9548297 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 9548366 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9548388 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9548517 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9548518 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9548523 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 9548573 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 9548643 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9548693 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 9548719 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 9548811 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9548815 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9548902 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9548905 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9548912 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9548942 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9548976 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9548990 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9548999 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9549040 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9549055 T G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 9549100 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 9549113 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9549114 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 9549179 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9549194 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9549308 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9549338 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9549385 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9549387 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9549416 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 9549492 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9549551 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 9549600 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9549705 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9549709 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9549754 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 9549844 T G Y N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.214285714285714 0.142857142857143 0.642857142857143 8 20 3 2 9 19 9549847 A G Y Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.230769230769231 0.153846153846154 0.615384615384615 8 18 3 2 8 19 9549873 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 19 9550032 G T N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 19 9550055 G A N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 19 9550085 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 9550203 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 9550211 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 9550242 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 9550251 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9550269 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9550276 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9550296 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9550493 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 9550580 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 9550685 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 19 9550724 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 9550730 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 9550831 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 9550863 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 19 9550871 A G N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 19 9550882 G C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 9550888 T G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 9550902 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 9550963 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 19 9550978 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 9550985 T G N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 19 9550997 A T N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 19 9551040 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 19 9551215 G C N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 19 9551340 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 19 9551403 C A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 19 9551478 G T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 9551586 G C N N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 19 9551734 A C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 19 9551740 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 19 9551958 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 9552045 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 9552267 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 9552470 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 9552615 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 9552691 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 9557862 C A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 9557925 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 9558059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9558072 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 9558090 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 9558189 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 19 9558196 T G N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 19 9558220 T A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 19 9558291 C T N Y 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 19 9558292 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 19 9559262 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9559265 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9559271 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9561039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9562163 A T Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 9562171 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 9562828 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 9562934 C A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 9562961 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 19 9562974 A C N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 19 9562977 G A Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 9562983 T A Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 9562985 T G N N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 7 11 1 5 3 19 9563192 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9563194 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 9563209 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9563216 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 9563336 T C Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 19 9563884 C G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 9564138 T G Y N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 19 9568106 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 9568126 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 9568239 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 19 9568263 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 9568296 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 9568555 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9568573 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9568596 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9568664 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 9568837 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9568920 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9568995 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9569009 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9569021 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 9569067 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9569168 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 9569197 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 9569201 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 9569311 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9569417 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9569462 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9569740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9569859 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 9569877 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 9570012 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9570042 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9570043 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9570080 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9570475 C T N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.272727272727273 0.181818181818182 0.545454545454545 8 14 3 2 6 19 9570564 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 9570565 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 9570569 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9570698 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9570742 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9570972 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 9570983 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 9571001 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9571019 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9571020 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9571046 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9571098 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9571243 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 9571381 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 9571398 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9571426 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9571439 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 9571440 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 9571504 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9571671 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9571752 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9571813 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9571864 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9571915 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9572020 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 9572082 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 9572096 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9572144 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 9572177 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 9572204 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 9572220 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 9572258 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 9572267 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 9572277 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 9572397 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 9572566 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 9572876 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 19 9572884 A T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 9573097 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 9573272 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 9573282 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 9573297 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9573324 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9573332 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9573483 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9573503 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9573504 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9573536 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9573538 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9573799 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9573825 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9574131 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9574143 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 9574251 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 9574255 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 9574256 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 9574394 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 9574409 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9574536 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 9574631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9574770 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9574860 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 9575159 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9575164 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9575581 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9575673 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9575975 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 9576241 C A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 9576256 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 9576293 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 9576469 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 9576547 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9582908 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9583066 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9583163 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9583269 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9583446 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 9583519 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9583695 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9584000 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9584072 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 9584208 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 9584213 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9584608 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9584682 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9584693 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9584812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9585172 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9585453 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 9585754 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9585946 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9585947 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 9586046 T A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9586047 A T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9586434 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 19 9586583 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9586592 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9586644 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 9586674 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 9587095 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 9587533 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9587711 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 9587970 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9588116 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9588152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9588556 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9588795 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 9589783 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 19 9589856 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9591019 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 9591105 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 9591395 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 9591648 C T N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 19 9591730 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 9591790 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9591791 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9596670 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 9602033 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9620914 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 9620920 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 9621429 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 9621472 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 9633663 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 9634394 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 9636564 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 9638029 A C Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 9638648 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 9641581 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 9643012 G A Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 9644207 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 9646865 C G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 9646885 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9647938 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9649413 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 9651167 T A Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 9652624 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9652966 C G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 9654057 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 9655129 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9681272 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9685658 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9685877 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9686421 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9689081 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 9690320 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9715686 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9720318 A G Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 9758528 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9768403 G C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 9768712 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9771319 A T N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 9771706 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9813015 A T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 9813101 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 9813376 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9814661 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9821347 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9821362 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9823161 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9826868 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9843111 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9845363 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9846735 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9847488 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9848163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9848936 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9851062 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9853485 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 9853770 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 9853917 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 9855100 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 9858631 C T Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 9868766 G A Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 9869976 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 9869977 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 9870422 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 9870994 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 9871376 C T Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 19 9871473 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 9878360 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9878364 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9879649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9881670 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9883324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9884880 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9889035 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9889483 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9892095 A C N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.4 0.133333333333333 0.466666666666667 14 16 6 2 7 19 9892389 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9895714 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9896672 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9897419 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 9897518 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9897792 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9897965 A C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 9899168 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 9911975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9912091 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9912689 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9913980 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9915166 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9916720 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9916915 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 9917400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9921766 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9921775 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9924974 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9925289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9927075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9927380 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9930161 T A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 19 9941635 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9943781 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9943792 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9943967 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 9944108 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9944151 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9944550 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 9944587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9944603 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9944619 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 9945126 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 9945151 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 9945677 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9946221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9946796 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9948549 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 9949636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9949844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9952374 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9952547 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 9957895 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9958326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9958360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9958446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9958491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9958671 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 9958787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9959256 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 9959509 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9961339 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9961973 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9962126 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9962608 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9964653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9967623 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9969714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9970131 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9970564 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 9972251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9973234 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 9973407 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 9974138 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 9974201 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 9974833 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 9974948 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 9975031 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 9975189 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 9975353 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 9975853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9976129 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 9976165 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 9976976 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 9977219 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 9978688 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 9979411 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 9979424 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 9979515 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9980202 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 9980203 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 9980374 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 9982270 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 9982271 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 9982930 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 9983156 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 9983219 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 9983251 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 9983252 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 9983382 C A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 19 9984106 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 9985747 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 9986445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 9992135 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 9992406 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 9992438 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 9992947 C T Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 9993403 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 9995372 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 9995696 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 9996579 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 10001491 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10002132 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10002523 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10002796 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10004136 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 10004207 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10004815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10005270 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 10006177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10007398 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 10009357 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 10009514 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10009916 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10010925 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10013598 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 10013995 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 10014494 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10015322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10016098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10016145 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10017434 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10019735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10020767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10021014 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 10021178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10021508 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10021716 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 10021912 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10021949 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 10022245 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10022320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10025418 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10025570 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10027303 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10027372 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10027801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10028596 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10029932 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 10030113 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 10030244 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10030285 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10030290 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10030291 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10030310 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10030312 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10030454 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10030657 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10030722 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 10030739 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 10030842 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 19 10030850 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 10030870 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 10030922 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 10030967 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 19 10033573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10035769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10035868 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10036079 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10036301 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 10036342 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 10036369 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 10036429 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 10036466 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 19 10036486 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 10036605 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 10036701 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10036719 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10036927 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 10036950 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 10037037 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 10037054 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 10037063 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 10037104 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 10037127 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 10037131 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 10037214 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 10037387 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 10037404 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 10037439 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 10037448 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 10037472 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 10037490 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10037500 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 10037629 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10037671 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 10038052 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 10038076 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 10038100 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10038178 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 10038242 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 10038284 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 10038772 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10039066 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 10039162 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 10039939 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 10040072 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10040162 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 10040304 T C N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.363636363636364 0.272727272727273 0.363636363636364 11 11 4 3 4 19 10040539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10040990 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10041075 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10041080 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 10041503 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 10041601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10041647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10041676 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 10041704 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10041941 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10042110 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 10042169 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 10042319 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 10043097 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 10043349 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 10043375 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 10043383 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 10043642 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 10043665 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 10043670 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 10043682 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 10043692 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10043813 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 10043858 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 10043862 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 10043873 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 10043922 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 10043990 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 10044006 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 10044083 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 10044097 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 10044244 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10044417 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 10044502 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10044528 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 19 10044638 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 19 10044640 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 19 10044644 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 19 10044664 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 10044676 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 10044894 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10044974 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 10045025 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 10045100 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10045188 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10045225 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 10045259 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 10045341 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 10045412 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 10045424 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 10045476 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 10045700 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10045736 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 10045933 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 19 10046176 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 10046374 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 10046533 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 10046742 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 10047571 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 10047798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10047953 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 10049936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10050000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10050121 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 10052606 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10053337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10056138 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 10057122 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 10058319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10058393 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10059767 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10060656 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 10060897 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10061664 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10061755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10062042 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10062547 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 10062603 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 10063261 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 10063418 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 10063482 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 10063581 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10064060 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 10064290 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10064304 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 10064423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10064667 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 10064716 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 10066282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10066999 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10067850 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 10067954 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 10068900 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 10068983 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 10069044 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 10069064 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 10069358 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 10069501 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 10069629 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10069986 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 10070042 G T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 19 10070269 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 10070460 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 10070503 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.105263157894737 0.789473684210526 0.105263157894737 19 19 2 15 2 19 10070506 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.111111111111111 0.777777777777778 0.111111111111111 18 18 2 14 2 19 10070571 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 10070641 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 10070709 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 10070737 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 10071343 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 10071366 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 10071471 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 10071787 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 10071818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10072553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10072575 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 10072602 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 10072979 C G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 10073054 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 10074169 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 10075458 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 10076436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10077166 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 10077738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10078019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10078037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10078362 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10078365 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 10078518 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 10078602 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10078692 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 10078738 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 10078739 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 10078829 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 10078845 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 10078869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10078929 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 10079010 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 10079070 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 10079103 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 10079136 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 10079303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10079340 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10079791 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 10079821 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 10079841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10079890 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 10080277 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 10080312 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 10080377 G C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 10080390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10080470 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 10080720 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 10080739 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 10080969 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 10081025 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10081205 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10081441 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 10081588 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 10082190 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10082293 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 10083821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10084295 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10084939 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10085145 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10087555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10088749 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 10088914 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10089428 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10092271 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10092725 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10098945 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10099056 C G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 10099123 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10099465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10099517 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10099597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10099652 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 10101867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10103007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10103150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10104598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10105259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10105843 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10105878 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 10105893 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10105992 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 10106002 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 10106777 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 10107515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10107595 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 10108447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10116795 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10119919 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10120911 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 10123715 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10125503 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10127663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10128672 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10129731 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10130883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10131554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10132249 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10134428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10136785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10138233 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10139517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10140906 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10141265 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10142501 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10142521 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 10143010 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 10143030 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10143186 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10144886 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10146092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10146812 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10147039 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10147113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10147668 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10148326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10148425 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10148445 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10148494 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10148507 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 10149481 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10149482 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10150189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10150407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10150647 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10150654 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10150690 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 10151078 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10152256 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10152409 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 10152550 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 10153424 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10153429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10153520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10153527 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10153881 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 10154566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10154697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10155561 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 10156407 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 10156693 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 10157475 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10157776 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 10157796 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 10157901 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 10157933 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 10157987 A C Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 10158164 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 10158179 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10158221 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 10158263 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 10158287 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 10158779 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 10158899 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 10158948 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 10159110 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10159206 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 10159235 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 10160023 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10160428 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 10160640 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 10161021 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 19 10161133 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 10161416 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 10161483 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 10161732 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 10163906 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 10163927 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 10164182 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 10164620 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 10164684 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10164889 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 10164902 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 10164947 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 10164949 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 10165249 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10165315 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10165460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10165798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10166015 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 10166105 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 10166408 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10166509 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 10166538 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10166906 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10166961 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10167055 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10167056 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 10167061 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 10167085 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 10167114 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10167158 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 10167317 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 10169221 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 10169724 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10169839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10170276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10171515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10172322 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10172747 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10172946 A T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10173846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10174514 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10175425 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10178143 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10179107 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10179214 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10180106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10181636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10181660 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10182204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10183590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10183792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10184019 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 10184371 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10184392 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 10184534 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10185253 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 10185372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10185408 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10185427 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10185432 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10185456 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10185879 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10185880 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10185950 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10186227 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 10187306 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10187915 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10191068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10191885 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10192371 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 10193660 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 10194061 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 10194062 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10194606 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10194698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10196064 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 10196145 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 19 10196307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10196580 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10196898 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10196985 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10202489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10205558 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10206493 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 10206522 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10206838 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 10206885 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10206949 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 10207762 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 10210928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10211689 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10212867 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10212969 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 10213018 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 10213967 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 10214046 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 10214440 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10214447 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10214459 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 10214555 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 19 10214812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10214970 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 10214997 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 10215254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10215478 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10215641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10215791 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10216042 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10216075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10216114 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10216142 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10216159 A T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 10216203 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10216711 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 10216722 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 10217857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10220225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10220716 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 10220861 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 10221893 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 10222009 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10222010 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10222340 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10222343 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10222725 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 10222741 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 10222796 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10223133 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 10224169 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10224235 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10224258 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10224400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10224777 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 10225030 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10225182 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 10225231 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 10225315 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10225607 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 10225608 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10225632 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10225662 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 10225697 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10225708 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10225752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10225886 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 10225926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10226386 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10226940 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10227366 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10227587 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 10227688 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10227706 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 10227730 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 10227809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10227850 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 10227968 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 10227978 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 10228328 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 10229199 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10229544 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10230119 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10230691 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10230715 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10230828 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 10230854 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 10230877 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 10231301 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 10231384 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 10231662 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10231766 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 10232700 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10232749 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10233437 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10233525 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10233707 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10234490 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 10234838 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10236843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10236961 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10237920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10239147 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 10239428 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10239895 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 10239989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10240103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10240357 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10240550 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 10240635 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 10241597 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 10241924 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10241954 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 10242426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10242541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10243501 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 10243523 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10247599 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10247854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10249021 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10249259 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 10249896 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 10249964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10250417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10253091 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 10255063 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10255761 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10255918 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10255997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10256021 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10256086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10256092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10256115 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10256128 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10256225 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 10256311 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10256332 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 10256521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10256783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10257109 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 10257302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10257853 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10258045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10258504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10259855 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10261391 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 10261458 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 10261689 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 10261808 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10262274 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10263133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10263233 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 10263480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10263769 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 10263793 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10263950 C T Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 10263962 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 10264204 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 10264243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10264252 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 10264276 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 10264324 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 10264332 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10264360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10264367 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10265057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10265088 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10265159 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 10266026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10266960 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10267033 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 10267178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10267275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10267469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10267521 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 10267678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10267952 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 10267967 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 10268019 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10268402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10268588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10270169 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10270468 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 10270472 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10270776 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10271524 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10271608 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10272098 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10272390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10273745 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10273973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10274168 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 10274945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10275788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10275868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10275949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10276250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10276460 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10276606 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10276710 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 10277959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10278023 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10279018 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10279477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10280060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10280266 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10280453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10280485 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10280799 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10281196 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 10281554 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10281620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10282750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10282854 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10283804 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10283862 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10283967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10284027 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10284089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10285019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10285055 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10285254 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10285839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10285858 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10285893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10286051 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10286055 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10286078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10286123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10286371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10286372 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10286408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10286415 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 10286479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10287175 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10287311 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10287877 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 10287886 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 10287895 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 10287912 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 10287944 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 10288011 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10288076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10288219 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 10288616 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10288848 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 10289410 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 10289478 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 10290001 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10290006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10290044 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 10290051 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 10290053 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 10290203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10290211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10290279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10290476 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 10290766 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 10290863 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 10291411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10291420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10291460 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 10291480 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10291534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10291550 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10291583 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 10292068 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10292795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10292803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10292924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10293464 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 10293625 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 10293634 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 10293659 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 10293711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10293733 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 10293758 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 10293845 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10293846 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10293912 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10294092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10294942 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10296146 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 10296538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10299382 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 10299733 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 10300683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10301039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10302999 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10304290 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10305047 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10305062 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10305882 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10308826 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 10309009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10310841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10311606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10314981 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 10316030 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10316898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10319043 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10319669 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10326115 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10327074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10327689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10327889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10328732 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 10328863 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10328886 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10328910 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 10329241 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 10329626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10329821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10329967 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 10331020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10331123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10331266 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10332635 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10332671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10333081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10333122 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 10333154 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 10333790 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 10333954 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 10334057 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 10334185 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 10334315 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 10334492 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 10334693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10337347 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10337475 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10337623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10338537 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10339903 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10340889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10340921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10341172 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10341648 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10343230 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 10346186 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10347115 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10350724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10354904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10354935 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10355565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10356086 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10356135 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10356935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10358278 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10358620 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10358941 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10359393 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10359722 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 10360006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10360888 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 10360948 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10360994 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 10361084 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 10361273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10361507 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 10361508 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10361726 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10361867 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10362464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10362676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10362691 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 10362693 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10362909 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 10363494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10363568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10364544 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 19 10365131 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10365372 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10366047 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10366454 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10376192 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10383363 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10389461 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10390243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10392005 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 10393896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10394311 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 10401957 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 10402001 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10402545 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 10402662 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10402666 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 10402687 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 10402830 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10402852 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10402867 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10402871 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10403359 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10403698 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10403767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10406233 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10408118 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10412595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10412802 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 10413430 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10413863 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 10414547 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10417495 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10419601 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10421203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10422577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10424381 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 10425476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10425503 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 10425546 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 10425689 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 10426040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10426082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10426650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10428305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10428440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10428528 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10428744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10428904 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 10429088 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 10429142 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 10429561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10429869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10430306 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 10430420 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10430568 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 10430659 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10430661 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 10430698 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 10430735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10430752 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 10430862 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 19 10430980 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 19 10431046 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 19 10431054 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 10431061 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 10432884 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 19 10432927 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 10433458 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10433583 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 10433893 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 10433895 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10434107 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10434319 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 10435270 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10435414 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10435436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10435615 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 10435631 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 10436189 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 10436661 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 10436697 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10437322 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 10437341 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 10437563 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 10437781 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 10438441 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 10438442 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 10438480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10438744 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10438907 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 10439062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10439130 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10439133 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 10439222 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 10439234 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10439336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10439353 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 10439367 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 10439797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10440027 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 10440028 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 10440051 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10440185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10440346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10440450 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 10440637 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 10441225 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 10441413 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 10441492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10441951 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10442911 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 10443242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10443486 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10443505 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10443564 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 10445181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10445676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10446317 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 10446327 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 10446493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10446775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10447173 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10447339 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 10447973 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10448039 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 10448339 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10449279 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10450434 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10450728 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10451951 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 10452740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10452749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10456860 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 10457164 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 10457285 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 10457357 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 10457633 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 10457646 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10457849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10457942 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 10457995 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 10458440 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10458507 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 10458555 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10458703 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 10458750 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 10458803 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 10458869 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 10458883 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 10459055 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 10459153 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 10459371 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 10459490 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 10459530 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 10462321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10462575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10462673 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10466467 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10467158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10470037 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 10470564 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10471490 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 10471718 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 10472265 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 10473662 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10474167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10474168 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 10474493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10474494 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10474744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10474834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10476803 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10477432 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10477556 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 10478269 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10478352 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10478959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10479580 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10480601 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 10482621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10483575 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10485716 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10486652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10488084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10491312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10491341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10494859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10494960 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10500923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10502182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10503469 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 10504265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10511640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10511674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10513242 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10514625 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10514826 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10515237 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 10515286 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 10515309 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 10515314 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 10515701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10515784 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 10515786 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10515883 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 10516259 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10516437 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 10516533 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 10516556 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10516563 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 10516622 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 10518055 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10518782 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10518882 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10519165 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 10519301 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 10519347 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10519731 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 10519818 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 10520064 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 10520088 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 10520267 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 10520425 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 10520688 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10520999 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10521216 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 10522324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10523858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10524859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10524939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10524973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10524976 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10524982 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10526149 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 10526517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10526925 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10527141 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10527557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10527808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10527979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10530797 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 10531245 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 10534085 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 10534213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10534593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10535208 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10535634 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10535763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10536657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10536847 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10537007 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10538046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10538142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10539089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10542474 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 10544831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10548353 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10548415 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 10548630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10550396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10550446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10551301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10551676 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10551678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10551787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10551885 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10551912 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10551934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10552172 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 10552186 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10552303 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10552497 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10552657 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 10552708 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10552833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10553354 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 10553399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10553432 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10553449 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 10553507 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 10553525 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 10553562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10553741 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 10553776 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 10553787 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 10554317 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10554318 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10554827 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 10555053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10555205 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10555552 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10556065 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 10557686 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10558756 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 10558936 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 10559426 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 10559919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10560093 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10561262 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10561263 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10561303 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 10561481 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10561482 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10561575 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10561579 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10561707 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10561943 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10561969 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 10561970 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10561971 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10562014 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10562395 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10562478 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 10562489 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 10562530 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 10562539 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 10562543 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 10562549 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 10562581 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 10562593 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 10562607 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10562617 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10562817 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10562877 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10562994 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10562995 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10563155 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 10563173 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10563213 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10563284 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 10563312 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 10563318 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 10563613 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 10563641 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 10563692 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10563852 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10564155 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10564176 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10564225 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 10564277 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10564309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10564359 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10564429 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10564574 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10564648 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 10564763 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 10564791 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 10565436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10565483 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10565711 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10565802 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10565939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10565985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10566016 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10566150 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10566259 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10566464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10566471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10566534 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10566568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10566572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10566585 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 10566741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10567181 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10567439 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 10567487 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 10567496 T A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 10567520 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 10567539 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 10567544 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 10567970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10568174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10568409 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 10568410 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 10568591 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10568592 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10568635 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10568678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10569133 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10569241 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 10569974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10570100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10570106 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10570107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10570164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10570188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10570280 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10570577 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10570608 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10570625 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10570739 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10570780 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10570800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10570857 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10570865 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10571445 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10571454 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10571961 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10574013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10575070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10575208 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10575213 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10575268 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10575290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10575293 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10575546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10576171 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 10576861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10578063 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10579017 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10579018 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10579192 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10579670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10579838 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10579841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10580241 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10581065 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10581420 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10581472 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10582078 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10582421 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10584657 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10584840 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10585510 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10585513 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10586059 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10586117 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10586129 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10586162 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 19 10586271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10586629 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 10586852 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10587020 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 19 10588587 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 10588590 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 10588605 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 10588760 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 10588809 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 19 10589146 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10589480 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10589790 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10589809 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10590350 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10590685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10591022 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 10594255 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 10594811 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10595492 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10596017 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 10596457 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10596569 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10597186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10597293 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10597651 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10598027 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 10598155 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10599999 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10600252 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 10600395 G C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 10600662 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10601018 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10601076 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10601609 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10601656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10601660 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10602325 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10602877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10602901 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10604278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10604325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10613402 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10615018 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10616268 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 10618405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10618492 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10621347 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10621693 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10627271 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 10627400 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10627550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10627649 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10627695 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 10627725 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10627938 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10628105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10628816 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 10629471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10629704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10630613 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10630838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10631441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10631506 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10631701 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10633032 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 10633067 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 10633072 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 10633081 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 10633665 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 10633984 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 10634161 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 10634179 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 10634181 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 10634198 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 19 10634283 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 10634419 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10634558 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10634650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10634713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10634774 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10635617 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10635884 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10636005 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 10636748 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10636757 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10636997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10637086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10637183 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10637506 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10637753 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 10637797 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 10638387 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10638524 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10638533 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10638909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10638938 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10638949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10639086 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10639151 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10639336 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10639438 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10639579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10639830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10640524 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10640562 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10640897 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10642187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10642505 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10642579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10642649 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10642697 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 10642882 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10642984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10642987 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10643136 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10643361 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10643592 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 10643722 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10643737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10643850 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10643924 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10644002 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 10644030 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10644048 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10644817 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10645296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10645420 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 10645518 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10646157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10646346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10646912 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10647484 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 10647490 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 10647575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10648994 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10649042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10649828 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10650016 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10650146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10650220 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10650314 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10650466 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10650736 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 10651167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10651675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10651744 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10651768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10651990 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 10652202 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 10652208 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10652658 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 10652677 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 10652753 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10653017 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 10653083 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10653190 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10653434 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10653760 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10653870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10653886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10653892 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10654139 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 10654200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10654269 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10654276 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10654310 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10655065 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10655632 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10655854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10656040 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10656063 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10656789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10657536 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10658099 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10660094 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10660616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10660775 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10660787 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10660824 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10660996 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10661058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10661120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10661459 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 10661813 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10661852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10662677 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10663286 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 10663395 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10666577 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 10666864 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10667009 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 10668478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10668541 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10668543 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10668552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10668914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10669079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10669132 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10669308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10670708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10671304 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 10671579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10671933 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 10672347 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 10672362 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 10672369 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 10672481 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 10673927 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10674357 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10674629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10675684 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10675731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10675920 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 10675927 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 10676008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10676024 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10676234 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 10676626 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 10676644 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 10676646 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 10677349 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10677754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10678141 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10678145 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10678615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10678923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10680512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10681221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10681968 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 10683946 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 10686629 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10686637 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10686782 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 10687146 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 10688448 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 10689016 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10689113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10689168 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 10689201 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 10689277 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 10689288 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 10690230 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 10690391 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10696245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10696537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10697387 A T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 10698709 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10698991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10700301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10701073 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10705799 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10707640 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 10709134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10710009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10710162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10710334 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10710438 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10711070 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 10711071 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 10711223 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 10711502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10711630 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 10714045 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 10714264 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10714270 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10714447 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 10714517 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10715361 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 10715534 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10715819 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 19 10715841 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 19 10716235 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 10716459 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 10716509 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 10717280 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10718376 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 10718398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10718802 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10718917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10719431 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 10719761 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 10719857 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10720065 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 10720210 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 10720318 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 10720501 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10720787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10721267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10721359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10721370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10721518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10721679 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 10721917 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10722549 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 10722840 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 10722851 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 10722868 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 10722905 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 10723008 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 10723023 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 10723107 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10723120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10723274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10723305 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 10723616 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10723698 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10723771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10724419 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 10725400 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10726535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10728651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10730228 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10731681 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10731949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10732539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10732667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10733536 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 10733713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10734042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10734871 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 10734874 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 10734900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10737076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10737200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10737581 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10738876 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10739107 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10739505 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 10740132 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 10740282 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 10740621 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10741539 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10741581 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10742467 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 10742470 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 10742677 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10742985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10743169 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10744303 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 10744400 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10744986 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 10745038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10745234 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 10745255 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10745297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10745435 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10745699 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10745801 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 10746606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10746749 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 10746897 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10747691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10748687 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10749086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10749490 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 10749732 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 10749908 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 10749924 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 10750103 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 10750116 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 10750160 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10750368 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 10750386 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 10750655 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 10750903 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 10751353 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 10751358 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 10751359 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 10751362 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 10751363 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 10751371 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 10751666 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 10751687 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 10751696 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 10751706 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 10751819 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 10751820 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 10751844 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 10751938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10751951 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10751973 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10752111 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10752124 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10752147 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10752165 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10755936 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10756233 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10757065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10757196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10757247 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10758073 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10759214 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10759251 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10760826 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10761292 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10761350 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10761848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10761996 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 10764816 C A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 10765939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10765962 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 10766276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10767258 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10769378 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10769433 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 10769502 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 10769506 A T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 10769884 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10770130 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 10770132 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 10770566 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 10770725 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 10771169 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 10771247 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 10771250 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 10771493 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10771613 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10771743 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10772678 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 10772684 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 10772956 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10773159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10773186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10773485 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10773545 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 10774056 G C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 10774159 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 10774559 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10775708 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10776302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10777032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10777373 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 10777921 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 10778295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10778515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10780403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10781201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10782373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10782904 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10783848 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10784165 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 10785122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10785257 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 10786277 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10786329 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10786412 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 10786886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10786975 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 10787217 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 10787631 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 10787634 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 10788192 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10788242 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10788393 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10788815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10788840 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10789005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10789034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10789151 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10790088 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 10790610 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 10790708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10790917 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10791021 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 10791078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10791103 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 10791168 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10791279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10791849 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 10791895 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10791972 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 10792033 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 10792422 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 10794145 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10794852 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 10795064 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 10795288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10796052 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 10796063 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 10796104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10796123 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10796165 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10796220 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 10796243 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 10796261 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10796709 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 10796905 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10797507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10798501 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10798548 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10798564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10798675 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 10799031 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10799038 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10799071 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10799074 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10799280 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10799357 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 10799371 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10799491 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10799922 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10800230 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10802238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10804212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10804225 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10804911 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 10807079 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10807083 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10807136 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10807170 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 10807202 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 10807661 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10807719 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10807799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10807806 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10807842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10807879 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 10807895 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10808316 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 10808831 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10808888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10808912 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10809068 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 10809080 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10809210 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10809260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10809317 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10809458 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10810525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10811502 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 10811784 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10813237 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 10813304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10815200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10816349 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 10816376 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 10816459 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 10816565 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 10816611 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 10817360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10817496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10818759 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10818885 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 10819864 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 10820354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10820628 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 10820653 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10820690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10821839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10822021 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 10822184 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10822739 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 10822798 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10822922 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10823251 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10823556 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10823685 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10823690 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10823839 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10823846 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10823847 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 10823871 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10823954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10823980 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10824028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10824029 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10824046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10824104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10824153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10824569 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 10824612 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10824646 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 10824818 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10824841 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10824850 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10824882 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10824930 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10824931 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10824962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10824986 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10824997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10825031 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10825081 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10825249 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10825666 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 10825723 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10825798 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 10825909 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10826199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10826209 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10826303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10826365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10826471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10826898 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10826975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10827132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10827202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10827403 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 10827406 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 10827449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10827500 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 10827520 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 10827566 G C N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 19 10827648 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10827652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10827678 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10827691 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 10827825 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 10828008 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 10828091 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 10828791 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 10829048 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 10829190 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10829200 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10829240 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10829243 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 10829818 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10829876 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 10830597 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 10830617 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10830644 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 10830902 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 10830922 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10830923 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10831009 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10831022 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10831158 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10831168 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10831174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10831187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10831375 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10831498 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10831640 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10831641 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10831646 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10831707 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10831773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10831880 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10831943 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10831992 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10832026 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10832059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10832078 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 10832094 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10832969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10833535 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10833671 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 10833858 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 10834358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10835158 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10836193 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 10837835 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 10838143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10838148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10838375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10839296 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10839998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10841049 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10841379 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10841661 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10842222 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 10842223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10842938 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 10843104 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 10843480 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 10843576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10843632 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 10843807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10844003 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10844276 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10844309 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 10844365 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 19 10844501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10844591 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10844904 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 10845091 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 10845226 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10845492 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10845508 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 10845584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10846186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10846448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10846476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10846642 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10846770 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10846846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10847136 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 10847281 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 10847514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10847773 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10847807 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10848229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10848310 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10848459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10848582 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10848613 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10848744 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10848935 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10848976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10848989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10849086 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10849268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10849291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10849409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10849413 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10849628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10849713 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10849997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10850114 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10850408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10850743 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10850851 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10850872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10850887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10850940 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10850975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10851180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10851289 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 10851305 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10851315 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10851753 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10851808 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10851943 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10852305 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10852352 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10852594 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 10852604 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10853055 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 10853141 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 10853183 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 10853317 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 10853788 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10853800 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10854334 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10854353 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10854441 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 10854563 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10855290 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10855376 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10855582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10855586 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10856924 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10856996 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10857594 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10857685 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10858285 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10859083 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10859087 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10859262 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 10859263 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10859266 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10859363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10859377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10860094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10860330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10860387 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10860388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10860468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10860477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10860671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10860693 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10860694 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10860862 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10860873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10860921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10861043 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10861159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10861590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10861670 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10861689 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10861812 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10862060 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10862293 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10862594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10862748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10862815 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10862920 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10863001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10863022 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10863037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10863409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10863423 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10863469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10863499 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10863529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10863544 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10863655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10864243 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10864672 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10864696 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10864931 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10865477 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10865719 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10865729 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10865827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10866537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10866853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10867149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10867343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10867515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10867778 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 10867979 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 10868172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10868201 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10868202 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10868563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10868750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10869335 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10869920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10870032 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 10870242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10870260 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10870261 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10870273 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10870287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10870792 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10873180 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10873194 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10873367 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10873421 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10873506 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10874077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10874163 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10874659 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10874668 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10874773 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10874807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10876490 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10877103 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10877169 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10877332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10883019 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10883308 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10888210 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10891583 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10891609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10894700 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10894926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10896170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10899403 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10899412 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10899517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10900838 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10900981 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10901910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10903079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10908264 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10908564 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 10908650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10909648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10909906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10910238 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10910428 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 10910904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10911007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10911416 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10912727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10914055 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10916117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10916304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10916425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10916739 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10917855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10917909 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10919487 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10919598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10919616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10919797 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10920457 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 10920777 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10921642 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10921707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10921708 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10921758 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 10921763 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10923183 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10926419 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 10926433 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 10926449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10926644 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10926945 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 10928377 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10928407 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10928420 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10928428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10928829 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10929142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10929175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10929219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10930070 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10930114 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 10930254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10930509 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10931263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10934102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10934131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10936275 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10936963 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10937033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10937116 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10937803 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 10937915 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10937925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10938343 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 10938565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10938665 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 10938694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10938762 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 10938866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10938987 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 10938988 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10938996 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 10939091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10939171 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 10939248 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 10939256 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10939889 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 10940241 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10940406 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 10941297 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10941459 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 10941680 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10942263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10942573 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10944635 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 10945139 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10945565 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10946832 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10946993 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 10947577 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10948069 T A Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 10948145 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 10948276 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 10948551 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 10949001 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 10949381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10950513 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 10950619 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 10950901 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 10950991 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 10951003 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 19 10951444 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 10951447 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 10951481 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 10951803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10951948 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10951987 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 10952324 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 10952449 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 10952508 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10952621 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10952815 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10952845 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10953603 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 10953618 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10953936 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10954228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10954563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10955929 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10956895 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10957955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10958090 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10958433 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 19 10958466 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10958483 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 19 10958487 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 19 10958516 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 19 10958714 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10959455 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10959458 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 10959673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10959898 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10959904 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10961478 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.5 0.111111111111111 0.388888888888889 20 16 9 2 7 19 10962600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10962833 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 10963745 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 19 10963753 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10964218 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 10964301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10964348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10964620 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 10964630 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 10964902 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 10965308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10966071 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 10966113 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10966467 G T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 19 10966611 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10968071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10970809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10971654 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10974694 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 10978681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10979166 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10979260 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 10979299 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 10979305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10979799 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 10980512 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10980521 C A N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 12 16 0 12 2 19 10980623 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 10980817 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10980829 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10980886 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10981065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10981174 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10981215 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10982488 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 10982930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10984109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10985037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10985394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10985812 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 10987056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10987292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10987402 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10987563 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 10987647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10987691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10988007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10988536 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10988568 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 10988599 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 10988963 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 10988995 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10989012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10989079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10989172 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 10989722 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 10989787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10989793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10989872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10990210 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 10990291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10990347 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 10990489 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 10990578 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 10990864 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 10991163 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 10991196 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 10991197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10991401 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10991727 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 10992090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10992313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10992862 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 10993025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10994012 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 10994300 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10994442 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 10994507 T C Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 10994516 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 10994676 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 10994778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10994866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10995000 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10995145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10995459 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 10995520 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 10995531 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 10995540 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 10995552 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 10995591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10995656 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 10995666 A C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 10995708 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 10995764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10995786 A T Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 10995812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10995829 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10996219 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10996263 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 10996276 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 10996280 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10996344 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 10996448 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 10996491 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 10996495 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 10996671 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10996760 A T Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 10996761 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 10996842 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 10996930 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 10997171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10997185 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 10997200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10997358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10997469 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10997888 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 10998148 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 10998336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10998399 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10998401 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10998613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10998690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10998723 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10998779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10998824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 10998896 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 10999075 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 10999102 C G N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 10999187 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 10999206 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 10999385 G T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 10999533 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 10999804 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 11000108 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 11000135 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 11000157 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11000176 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 11000210 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 11000211 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 11000215 G T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 11000241 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 11000271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11000379 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 11000399 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 11000414 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 11000798 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 11001123 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 11001285 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11001554 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 11001728 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11001781 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 11001865 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 11001922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11001992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11002003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11002029 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11002044 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11002146 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 19 11002200 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 11002276 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 11002281 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 11002333 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 11002348 T C N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 19 11002379 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 19 11002395 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 11002398 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 11002582 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11002588 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11002835 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 11002873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11003541 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11003550 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11003864 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 11005612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11005982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11006072 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11006237 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11006238 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11006333 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11006389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11006410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11006448 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11006570 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11006594 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11006600 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11006740 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 11006770 A C N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 11006848 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 11006943 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 11007079 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11007086 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11007089 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11007101 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11007159 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11007164 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11007256 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11007307 G T Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 11007336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11007352 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11007377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11007407 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 11007445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11007470 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 11007472 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11007489 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11007653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11007782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11008019 G C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11008032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11008109 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 11009511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11009798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11009866 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11009963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11009982 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11010101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11010506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11011322 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11011402 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11011709 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11011711 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11011714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11011984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11012078 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11012349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11012352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11013983 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11014186 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11014205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11015775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11016062 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11018389 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11022555 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11027647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11028082 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11032449 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11032883 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11033784 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 11033971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11034723 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 11034741 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11034808 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 11035196 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11035579 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 11036235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11036703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11037656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11037997 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 11038130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11038246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11038259 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11038462 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 11038485 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11038728 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 11038768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11038853 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11038855 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11038868 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 11039051 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11039078 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11039122 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11039123 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11039630 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 11039631 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11039792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11039925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11040079 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11040104 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11040168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11040170 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11040556 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11040598 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11040947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11040950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11041030 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11041080 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11041853 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11043247 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 11043434 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11043539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11044094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11044217 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 11047850 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11049012 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11050229 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11050258 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 19 11051051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11051099 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11051204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11051232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11051543 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11051603 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 19 11051627 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 11051671 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11051672 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11051889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11051893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11051902 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11051965 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 11051999 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 11052087 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11052304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11052404 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11052623 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 11052643 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11053152 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 11053463 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11053565 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11053566 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11056237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11056622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11056958 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 11057964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11060007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11062032 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11062251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11062796 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11062798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11063088 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11063452 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11063605 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 11063647 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 11063659 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11063676 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11063740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11063752 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11063872 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 11064108 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11064546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11064879 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11064894 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11064941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11065020 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11065098 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11066344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11066449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11066716 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11066877 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11066936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11066963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11067221 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11067872 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 11067944 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11068668 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11068752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11068934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11069234 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11069346 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11069525 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11069647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11069720 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11069758 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 11070077 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 11070171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11070559 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11070861 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11070898 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11070975 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11070994 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11071087 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11071106 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11071243 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11071718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11071844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11071983 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11072168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11072218 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11072256 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11072486 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11072729 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11072730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11072886 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 11073047 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11073104 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 11073179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11073269 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11073713 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 11073774 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11073804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11073835 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11074077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11074078 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11074124 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11074158 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11074406 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11074769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11075093 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11075168 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11075644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11076209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11076559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11077487 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11077955 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11078099 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11078115 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11078163 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11078493 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11078597 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11078825 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11078877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11079076 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11079879 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11080094 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 11080144 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11080567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11080694 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11080771 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11081144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11081383 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11082679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11083203 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11084097 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11084766 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 11085307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11085607 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11086281 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11086348 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11087348 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 11087660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11087811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11088655 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11090204 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 11090213 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 11090407 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 11090413 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 11090603 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11091619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11091706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11091902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11092467 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11093168 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11093931 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11094200 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11094245 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11094636 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11094688 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11094901 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 11095827 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 11095839 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11096397 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11096472 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11096563 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11096570 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11096706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11096782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11096875 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11096938 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 11097103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11097104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11097125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11097194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11097212 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11097327 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11097517 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11097643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11097662 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11097668 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11097705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11097793 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11097869 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11097929 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11097931 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11097942 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11098032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11101083 T A Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 11101095 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 11101195 A C Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 11101431 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 11101483 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 11101518 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 11101521 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.214285714285714 0.142857142857143 0.642857142857143 8 20 3 2 9 19 11101540 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11101557 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11101652 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11101709 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11101794 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11101831 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11101859 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11101875 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11101918 C G N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0 0.769230769230769 0.230769230769231 10 16 0 10 3 19 11101944 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 11102027 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11102040 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11102079 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11102151 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11102167 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11102182 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11102258 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11102295 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11102347 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11102388 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11102459 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11102464 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11102473 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11102544 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11102573 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11102692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11103037 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11103301 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11103386 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11103450 C A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 11103571 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 11103656 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 11103789 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11103959 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11104016 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11104017 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11104020 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11104148 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11104309 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 11104356 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11104463 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11104557 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11104813 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11104842 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11104904 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 11105240 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11105309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11105428 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11105451 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11105489 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11105597 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 11105598 C A Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 11105601 G T Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 19 11105667 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 11105671 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 11105672 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 11105744 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 11105767 A T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 11105790 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 11105998 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 11106117 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 11106460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11106468 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11106574 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11106626 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11106655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11106834 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11106894 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11106920 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 11106953 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11106982 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11107049 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11107050 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11107063 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11107101 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11107103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11107117 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11107122 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11107143 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11107210 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11107220 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11107241 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11107242 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11107355 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11107371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11107410 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11107411 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 11107492 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11107540 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11107544 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11107571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11107588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11107602 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11107603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11107770 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11107788 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11107806 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11107816 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11107891 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11108020 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11108023 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11108034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11108123 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11108154 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11108215 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 11108216 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 11108286 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11108552 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11108887 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11108917 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11108990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11109013 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11109089 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11109193 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11109448 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11109511 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11109651 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11109786 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11109793 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11109800 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11109997 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11110006 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11110007 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11110033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11110043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11110052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11110146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11110150 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11110164 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11110209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11110423 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11110465 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11110558 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11110563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11110571 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11110581 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11110612 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11110619 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11110660 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11110692 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11110703 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11110731 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11110865 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11110918 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11110952 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11111064 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11111089 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11111164 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11111294 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11111907 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11111927 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11111983 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11112047 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11112051 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11112095 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11112153 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11112304 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11112325 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 11112348 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 11112414 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 11112433 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 11112490 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 11112719 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 11112759 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 11112867 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 19 11112879 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 11112881 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 11112952 G C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 11118782 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11118827 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 11118841 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 11118860 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 11118882 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 11118883 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 11118915 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11118919 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11118941 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11118946 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11118956 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11119041 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11119052 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11119069 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11119162 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 11119246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11119257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11119258 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11119823 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11119987 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 11119994 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11120111 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11120143 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11120374 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11120564 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11120580 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11120744 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 11120783 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 11120851 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11120878 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 19 11120898 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11120969 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 11121063 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 11121185 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 11121377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11121397 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 11122116 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 11122467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11122664 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 11122876 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11122915 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 11122930 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 11123077 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 11123294 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11123933 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11123999 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11124158 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11124184 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 11124194 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 11124479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11125748 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11126099 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11126910 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11128281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11129118 G T Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 11130978 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11131367 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11132732 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11133709 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11134118 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11134173 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11134480 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11135357 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11135788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11136271 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11136279 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11137457 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 11137658 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 11137661 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 11137662 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 11137692 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11137746 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11137747 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11137961 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11138162 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11138739 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 11138943 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 11139515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11139622 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11141834 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11142606 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11142673 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 11142949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11143188 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 11143362 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 11143402 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 11143775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11143906 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11144739 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 11144795 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 11145069 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 11145105 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 11145108 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 11146396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11147223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11150610 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11152005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11152176 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11152713 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11153191 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 11154443 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11154873 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 11155353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11155376 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 11155636 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 11155745 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11156020 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11156877 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 11157118 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 11157571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11157640 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11169816 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11170617 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11170966 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11176791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11176823 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 11176827 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 11176867 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 11176871 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 11176923 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 11177176 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 11177341 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 11177394 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 11177949 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11178142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11178805 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11180702 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11180734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11181238 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11181648 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11181707 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11182412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11182576 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 11183973 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11185076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11185136 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11185795 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11186221 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11189701 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11191411 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11192627 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11194051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11194300 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 11199255 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11199542 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11199548 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11203440 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11204098 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 11204786 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11205166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11206441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11206871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11207870 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 11208152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11208205 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 11211526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11211969 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 11212797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11213991 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11216202 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 19 11216206 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 11216227 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 11216233 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 11216332 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 11216338 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 11216340 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 11216493 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 11216530 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11216760 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 11216932 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 11217203 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 11217670 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 11217705 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11217867 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 11217919 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 11218161 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11218172 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11218234 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 11218325 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 11218418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11218432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11218613 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 11218638 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 11218710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11218758 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11218788 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11218845 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 11218888 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 11218909 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11219053 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 11219105 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 11219113 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11219163 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11219200 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 11219204 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 11219224 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 11219616 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 11219975 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 11220330 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 11220406 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11220458 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 11221178 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 11221316 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 11221460 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 11222034 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 11222187 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11222290 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 11222581 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 11222599 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11224270 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11224443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11228194 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 11228705 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11228746 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11229535 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11231027 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 11231796 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 11232861 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11235757 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11235770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11236346 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 11238223 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 11238224 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 11238413 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 11238592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11238670 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 11238732 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11238739 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 11238833 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 11239012 T C N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 19 11239112 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 11239369 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11239852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11239945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11240069 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 11240188 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 11240330 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 11242244 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 11242864 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 11243171 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11243533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11245605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11245663 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11246467 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 11246605 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11246743 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11247317 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11247739 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11247987 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11249318 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11249319 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11249756 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 11249805 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11249809 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11250007 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 11250335 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 11250337 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 11250918 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 11251777 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 11251866 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 11251934 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11251948 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11252236 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11252265 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 11252325 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 11252429 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11254342 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11254549 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11255053 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 11255071 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 11255075 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 11255089 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 11255090 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 11255098 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 11255154 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 11255368 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 11255511 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11255559 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 11255792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11255836 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 11255855 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 11255975 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 11255997 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 11256013 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 11256086 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11256123 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 11256267 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 11256378 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 11256468 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 19 11256577 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 19 11256605 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 11256812 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11258051 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11258679 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 19 11259400 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11259954 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 11260098 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 11260137 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11262505 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11264989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11266705 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11266846 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 11266892 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11267355 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 11269693 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11269767 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11270972 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 11271060 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 11271384 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 11271397 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 11280740 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11281864 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 11282282 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 11282289 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11282482 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 11282830 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 11283401 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 11284326 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 11284328 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11284395 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 11284477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11284960 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11285216 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11285416 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 11285916 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 11286142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11286699 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11286766 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 11286809 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11287079 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 11287495 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11287604 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11287985 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 11288086 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 19 11288139 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 11288300 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 6 12 2 2 5 19 11288761 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 11288889 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11289182 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11289299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11289391 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11289563 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 11289579 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 11289768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11290779 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 11291015 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11291096 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 11291514 T C N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 19 11298521 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 11298547 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 11298618 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 11299749 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 11300429 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11300673 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 11301431 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 11301667 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 11301687 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 11301790 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 11302633 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 11304109 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11304986 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11308992 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11309068 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 11309362 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 11309476 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 11309593 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 11309604 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 11309641 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 11309862 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 11309961 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 11309964 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11310053 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 19 11310107 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 19 11310153 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 11310822 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11314661 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11314979 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 19 11315128 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.222222222222222 27 9 13 1 4 19 11315143 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11315398 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11315539 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 11315571 C T N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 15 5 7 1 2 19 11315985 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 11316124 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 11316188 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 11316212 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11316241 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11316431 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 19 11316487 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11316548 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 19 11316574 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 19 11316580 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.222222222222222 27 9 13 1 4 19 11316650 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 11316816 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 11316851 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 11317110 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11317389 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11317438 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11317597 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 11318155 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 19 11318196 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 19 11318235 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11318326 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 11318391 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 19 11318394 G T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 19 11318747 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11318959 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11318984 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 11318985 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 11319346 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 11319557 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 11319884 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11319953 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11320060 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 11320120 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 11320144 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 11320154 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 11320187 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 11320265 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 11320347 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11320462 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 11320471 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 11320487 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 11320526 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 11320584 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 11320720 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 19 11320764 G T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 19 11321048 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 11321160 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11321167 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 11322043 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11323090 T C N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.230769230769231 0.0769230769230769 0.692307692307692 7 19 3 1 9 19 11323247 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 19 11323325 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 19 11323851 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 11324126 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11324149 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11324281 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 11324392 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11324578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11324584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11324615 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11324757 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11324875 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 11324918 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11325008 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11325071 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11325319 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 11325495 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 11325506 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 11325558 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 11325596 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 11325754 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 11325873 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11326006 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 11326069 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 11326480 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11326509 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 11326613 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 11326696 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 11326750 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11326823 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 11326962 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 11327252 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11327254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11327424 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 11327498 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 11329640 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11330466 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11330699 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11330856 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11332761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11333436 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11333968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11334661 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11334663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11335056 T C Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 11335059 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 11335400 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 11335550 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 11335617 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 11335674 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 11335892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11337122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11337474 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11340183 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 11340424 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11340681 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 11341253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11341584 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11341619 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 11341904 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 11344413 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 11344639 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 11344647 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 11344650 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 11344671 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 11344679 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 11344829 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11344884 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11344983 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 11345008 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 11345156 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 11345168 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 11345225 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11345273 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 11345376 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 11345966 C G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 11346867 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 11347152 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 11347220 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 11347228 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 11347297 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 11347574 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 11347909 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 11348014 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11348082 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 11348214 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 11348288 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 11348296 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 11348305 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 11348342 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 11348372 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11348378 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 11348579 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 11348644 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 11349592 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 11349666 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 11349677 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 11349691 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 11349702 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 11349861 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11350170 A T N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 19 11350401 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 11350458 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 11350509 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 11350523 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 11350555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11350973 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 11351119 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11352515 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11352991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11353126 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11353185 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 11353206 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 11353215 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 11353978 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 11354134 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 11354495 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11354634 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 11355000 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11355326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11355623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11355918 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11356838 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11358567 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11358691 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 11359317 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11359342 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 11359505 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 11359552 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11359926 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11360196 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 11360223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11360329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11360729 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 11361512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11361589 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11362196 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 19 11363376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11364700 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11366038 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11366140 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11368120 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11368224 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 11368974 A C Y N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 19 11373501 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 11373783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11373790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11374267 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 11374277 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11375171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11375857 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11377322 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11378937 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11379480 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11380048 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 11380137 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 11381461 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11381565 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11381684 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11381705 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11381807 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11382180 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11382412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11385265 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 11386938 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 11387325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11389177 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 11390447 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11392186 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11393764 G A Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 11393987 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11394561 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11395218 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11396028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11396714 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11397145 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 11397215 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11399935 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11400498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11400598 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 11401534 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11402880 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 11403160 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 11403192 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 11403356 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 11403439 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 11403806 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 11403939 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 11404030 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11404192 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11404257 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11404338 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 11404456 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 11404874 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 11405298 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 11405308 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11405398 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11405550 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 11406077 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 11406166 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 11406537 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 11406573 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 11406644 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 11406695 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 11406763 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 11407409 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11408688 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11408802 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11409548 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11410071 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11410102 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 11410121 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 11410159 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 11410209 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11410387 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11410460 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11410578 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11410643 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11410653 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11410704 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11410806 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11410974 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11411205 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 11411221 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 11411271 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11411339 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 11411368 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 11411541 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11411542 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11411667 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11411854 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11411885 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11411966 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11412115 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11412285 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 11412444 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11412603 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11412625 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11412679 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 11412729 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11412845 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11412871 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11413030 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 11413052 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11413059 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11413285 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11413500 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11413686 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 11413792 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 11414040 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11414367 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11414413 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11414432 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11414460 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11414509 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11414647 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11414679 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11414779 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11414939 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11414950 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11415062 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 11415103 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11415190 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 11415304 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11415418 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11415447 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11415464 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11415482 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11415554 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11415580 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11415920 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11415929 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11416151 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 19 11416163 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11416165 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 11416178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11416180 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 11416191 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11416257 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11416311 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 19 11416346 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 19 11416441 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 11416605 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11416622 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 11416860 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11417025 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11417057 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11417068 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11417086 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11417225 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11417236 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11417266 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11417561 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11417565 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11417579 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11417608 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11417649 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11417852 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11417882 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11417911 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11418013 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11418109 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11418204 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 11418239 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11418243 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11418298 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11418377 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 11418482 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 11418574 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11418635 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11419018 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11419023 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11419067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11419087 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11419432 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11419457 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11419463 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11419479 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11419554 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11419636 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11419642 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11419653 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11419793 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11419809 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 11419811 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11419853 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11419875 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 11419878 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11419899 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11419937 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11419939 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11419977 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11420015 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11420052 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11420103 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11420179 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11420291 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 11420398 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 11420410 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 11420548 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 19 11420556 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 11420557 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 19 11420773 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 19 11420775 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 19 11420846 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 11420890 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 11420896 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 11420981 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11421470 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 11421678 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 11421799 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11422237 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 11422285 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 11422315 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11422330 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 11422344 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 11422458 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11422478 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 11422512 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11422664 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 11422702 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 11422724 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11422741 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11422877 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 11422893 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11422905 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11423123 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11423143 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11423462 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11423481 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11423517 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11423547 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11423638 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11423639 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11423671 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11423695 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11423718 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11423721 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11423790 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11423895 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 11423965 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 19 11423984 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 19 11424021 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 19 11424025 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 19 11424027 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 19 11424036 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 19 11424128 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11424149 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11424162 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11424172 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11424188 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11424539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11425047 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 11425259 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11425818 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11426971 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11427458 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11427660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11428047 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11428078 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11428303 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11428472 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11428774 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 11428967 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 11429088 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 11429265 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11429420 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 11429731 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11430042 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 11430232 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11430260 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 11430280 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11430497 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11430569 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11430878 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 19 11430902 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 19 11430926 T G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 11430940 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 11430989 A T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 19 11431217 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 11431923 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 11432818 G A Y Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 19 11433000 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 11433311 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 11433321 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11433333 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11433353 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11433369 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 11433372 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 11433604 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11433790 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11433896 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11434135 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 11434507 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11434725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11436269 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 11436478 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11436639 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11436855 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 11436867 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 11439316 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11441539 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11441823 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 11441829 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 11441942 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 11441995 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 11442051 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 11442243 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 11442309 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 11442399 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 11442434 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 11442540 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 11443044 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 11443328 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 11443364 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 11443398 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 11443553 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 11443669 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 11444071 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 11444297 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11444311 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11444813 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 11444816 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 11444862 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11445033 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 19 11445170 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 11445483 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 11445960 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 11446385 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 11446474 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11447150 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 11447216 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 11447308 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 11447358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11447399 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 11447404 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 11447456 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 11447830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11447932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11448240 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11448260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11448303 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11448306 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11448381 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11448454 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11448731 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11448756 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11448769 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 11448956 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11449411 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 11449745 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 11449837 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11449856 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11449888 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11450616 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 11450637 A G N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 19 11450667 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 11450675 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 11450709 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 11450732 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 11450754 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 11450820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11452134 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 11452177 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 11452412 A C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 11452497 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 11452807 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 11453055 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 11453446 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 11453514 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 11453561 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 11454286 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 11454691 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 11454734 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 11454745 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 11454801 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 11454866 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11455072 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 11455320 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 11455615 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11455639 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 11455746 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11456088 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 19 11456392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11456506 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11456592 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11456664 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11457002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11457127 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 11457386 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11457938 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 11457996 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 11458143 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 11458921 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 11458973 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 11459448 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11459983 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11461782 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 11461919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11462080 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 19 11462082 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11462146 C A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 11462400 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 11462702 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11462937 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11462988 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11463038 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 11463156 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11463427 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 11463640 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11463713 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11463821 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11463856 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11463895 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11464126 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11464186 C G Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 11464203 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 11464237 C T Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 19 11464307 C T Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 19 11464320 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11464353 C A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 11464363 T A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 11464378 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11464419 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 11464433 G T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 11464473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11464503 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11464741 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11465047 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11465056 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 11465063 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11465306 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11465437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11465705 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 11465768 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11465880 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 11465935 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11466424 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 11466559 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 19 11468091 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11468265 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11468473 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 11468582 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11468595 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 11468601 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11468757 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11468833 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11468899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11468919 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 11468931 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 11469335 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 11469776 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 11469962 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 11470145 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 11470282 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 11470289 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 11470297 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 11470332 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 11470429 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 11470531 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 11471217 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11471824 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 11471983 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 11472372 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 11472393 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 11473226 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 11474598 T C N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 19 11474999 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 11475282 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 11475557 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 11475889 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 11476151 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 19 11476176 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 19 11476224 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11476249 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11476322 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 11476369 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11476389 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11476493 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 11476582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11476933 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11476952 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 11477594 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 11477623 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 11477771 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 11477802 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 11477827 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 11478003 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 11478053 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 11478057 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 11478058 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 11478099 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 11478220 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 11478429 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 11478494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11478795 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 11479402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11479436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11479856 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11479924 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11480144 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 11480157 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 11480185 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 11480216 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 11480269 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 11480440 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 19 11480446 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 19 11480525 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 11480631 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 11480642 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 11480684 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 11480692 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 11480976 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 11480991 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 11481004 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 11481308 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 11481322 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 11481667 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 11482282 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11482372 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 11482380 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11482599 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 11482835 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 11482900 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 11483226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11483700 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 11486584 G C Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 11486585 G T Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 19 11486906 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 11486916 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 11487286 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 11487383 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11487426 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11487451 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11487452 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11487886 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11487933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11487967 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11488116 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11488139 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11488168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11488304 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11488869 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 11490107 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11490917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11491104 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11491393 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11491437 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11491593 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 11491598 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 11491878 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 11492493 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11494449 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11494927 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11495678 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11496008 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11496077 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11496144 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 11496330 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11500232 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11500339 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11500809 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11500955 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11501077 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11501083 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11501103 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11501396 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11501469 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 11501511 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 11501588 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11501610 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 11501782 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11502007 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11506921 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 11506987 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 11507146 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11507426 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11507945 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11507956 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 11508139 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 11508307 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 11508318 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11508416 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11508583 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 11509417 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 11509850 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11510017 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 11511372 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11511401 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 11511482 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11512263 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 11512598 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 19 11512775 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 11512817 T G Y N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 19 11512878 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11513396 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11513590 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 11513635 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 19 11513694 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 11513695 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 11513706 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11513941 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 11514360 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 11514863 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11515033 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 11515487 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11515836 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11515915 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 11515986 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 11516259 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 11516315 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11516639 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11516954 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 11516968 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11517132 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11517453 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11518401 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11518633 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 11520222 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11521166 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 11521410 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11521444 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11521466 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11521699 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11521928 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11522059 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 11522138 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11522752 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11523282 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11523322 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11523916 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 11524781 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11529163 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 11529420 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 11529493 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 11529567 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 11529810 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 11530359 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 11530704 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 11530901 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 11531048 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 11531590 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 11532181 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 11532239 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 11533583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11533648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11534641 A C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11534753 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 11535170 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 11535591 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 11535628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11535678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11535931 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 11536282 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11536651 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11537281 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11537378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11537559 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 11538263 T A N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 19 11538784 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 19 11538797 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 11540506 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 11540648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11540909 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 11540931 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 11540945 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 11541129 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11541259 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 11541295 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11541312 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11541354 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 11541724 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11541875 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11541924 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 19 11542041 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11542231 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11542280 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11542311 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11542329 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11542475 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11542555 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11542904 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11543330 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 11543373 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 11543614 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11543679 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 11543901 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11543921 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11543998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11544033 G A Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 19 11544343 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 11544534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11544590 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 11544661 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 11544781 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 11544937 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 11545119 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 11545186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11545665 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 11545776 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11545857 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 11545990 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 11546343 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 11546806 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 11547104 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11547227 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11547349 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11548325 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 11548423 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 11548459 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 11548517 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 11548678 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 11548716 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 19 11548777 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 11548900 A T N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 19 11548944 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 19 11549010 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 19 11549017 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 11549156 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 11549375 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11549412 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 11549419 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 11549450 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 11549471 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 11549492 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11549506 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 11549518 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 11549633 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 11549635 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 11549713 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 11549725 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 11549840 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 11549841 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 11550007 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11550173 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 11550451 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 11550623 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 11550645 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 11550863 G T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 19 11551147 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 11551376 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 11551508 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11551695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11551810 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11552417 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11552610 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11553213 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11553249 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11553376 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11553793 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11554550 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11554576 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11554696 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11555213 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 11555708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11556001 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11557388 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11557451 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11557504 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 11557633 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11557769 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 11557775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11557803 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11557859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11557966 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11558647 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11559324 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 11559436 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11559464 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11559480 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 11559513 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 11559570 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 11559845 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 11559894 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 11560105 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11560250 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11560517 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11560561 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 11560717 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 11560756 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 19 11560806 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 11560815 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 11560877 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 19 11560878 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 19 11560911 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 11560912 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 11560927 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 11561043 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11561088 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 19 11561437 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 11561446 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11561489 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 11561553 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 11561564 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 11561605 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 11561670 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 11562330 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 11562522 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 11562559 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 19 11562572 A T N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 19 11562807 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 19 11563012 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 11563782 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 19 11564091 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11564301 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11564396 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11564399 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11564818 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11565105 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 11565197 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 11565230 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 11565445 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 11565533 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 11565553 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 11565630 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 11565664 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11565880 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 11565953 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11566018 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 11566094 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 11566116 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 11566133 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11566492 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 11566498 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 19 11566612 C T N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 19 11567617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11568197 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 19 11568364 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 11568386 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 11568663 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 11568676 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 11568715 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 11568777 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11568780 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 11569015 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11569092 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11569096 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 11569286 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 11571096 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11571270 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 19 11571278 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11571300 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 11571350 G C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 19 11571364 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 11571987 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 19 11572030 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 11572327 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11572985 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 11573147 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 11573163 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 11573190 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11573310 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11573380 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 11573436 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 11573465 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 11573503 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 11573598 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 11573913 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 11573935 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 11574026 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11575258 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 19 11575433 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 11575839 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 11576001 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 11576309 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11576311 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11576666 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 11576718 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11576808 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11576872 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11576987 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11577039 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11577149 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 11577268 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 19 11577302 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 19 11577354 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 11577847 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11577989 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11578533 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 19 11579090 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11579126 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11579462 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11579518 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11579525 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11579532 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 11579622 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11579625 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11579906 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11580179 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11580211 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11580574 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11580633 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11581013 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 11581086 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11581533 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11581547 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 11581562 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11581579 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 11581593 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 11581640 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 11581695 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 11581792 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11581892 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 11582036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11582086 T A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 19 11582309 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11582617 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 11582659 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11585010 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11585026 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11585258 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11585456 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11585494 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11585547 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 11585575 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 11585670 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11585883 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11585921 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11585932 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11586635 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 11587192 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11587199 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11587478 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11587484 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11587658 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11587706 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11588471 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11589647 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11589862 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11591134 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11591345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11591360 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 11591378 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 11591525 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11591609 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11591887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11592004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11592360 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 19 11592547 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11592602 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11592650 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 11592813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11592877 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11592930 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11593044 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11593075 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11593251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11593278 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11593297 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11593300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11593479 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11593660 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 11593714 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 11593909 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11593951 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 11594003 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11594005 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11594080 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11594095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11594110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11594205 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 11594315 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11594444 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 11594780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11594786 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11595029 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11595172 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11595273 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 11595422 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11595482 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11595495 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11595640 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 11595686 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11595740 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11595792 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11595858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11596281 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 11596736 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 11596737 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 11596742 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 11596936 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11597213 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11597365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11597435 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11597454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11597509 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 11597645 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 11597681 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 11597833 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 11597865 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 11597908 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11597964 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 11598164 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 11598332 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 11598426 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 11598445 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11598470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11598568 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 11598785 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11598828 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 11598872 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11598883 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 11598960 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 11599232 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11599466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11599500 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11599588 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11599666 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11600017 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 11600447 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11600448 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11600457 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 11600790 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 11600818 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 11600994 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11601895 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 11602533 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11602852 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 11602901 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11602909 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11603435 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11603457 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 11603569 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11603811 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 11604159 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11604285 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 11604291 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11604452 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11604475 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11604955 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11605003 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 11605455 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 11605539 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 11605621 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 11606087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11606399 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11606445 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 11606446 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 11606476 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 11606478 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 11606485 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 11606665 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 11606768 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11606930 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11607462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11607512 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11607574 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11607693 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11608109 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11608115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11608316 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11608434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11608624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11608634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11608820 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11611066 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 11611407 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11611493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11612533 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 11612762 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 11612772 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 11612921 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 11612943 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 11612966 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 11613059 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11613191 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11613727 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 11613878 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11614068 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11614086 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11614180 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 11614214 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 11614216 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 11614220 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 11614256 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 11614310 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11614390 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11614391 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 11614479 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 11614506 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11614512 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11614645 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11614696 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 11615799 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 11616005 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 11616258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11616322 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11616533 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11616717 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11616773 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11616938 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11617688 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11618142 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 11618318 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 11618696 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 11619133 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11619139 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11619157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11619181 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 11619183 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11619256 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11619629 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11619744 C A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 11619753 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 11619800 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11619816 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11619868 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 11620111 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11620127 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11620210 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 11620363 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 11620434 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11620546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11620572 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11620597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11620598 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11621153 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11621403 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 11621605 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 11621625 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11621899 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11621998 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11623231 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11623545 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11623683 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11624214 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11624586 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 11624936 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11625082 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11625341 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 11626412 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11626646 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 19 11626782 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11626911 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 11626950 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 11626951 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 11627022 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 11627188 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 11627387 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 11627444 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 11627632 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 11627637 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11627641 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 11627765 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 19 11628286 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 11628398 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11628425 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 11628508 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 11628532 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 11628535 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 11628721 A T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 19 11628908 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11629109 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 11629261 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 11629262 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 11629326 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 11629562 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 11629563 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 11629636 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 11629665 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 11629830 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 11630089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11630341 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 11630550 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11630574 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11630666 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11630870 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11631177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11631201 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11631215 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11631216 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11631236 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 11631336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11631396 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11631527 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11631573 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11631607 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11631608 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11631912 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 11631920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11632011 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11632449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11632663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11632812 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11633083 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11633559 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 11633600 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11633828 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11634377 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 11634740 A T N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 19 11634743 G A Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 11634810 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 11634855 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 19 11634927 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11638360 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 11638406 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11638419 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11638473 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 11638587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11638717 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 11638741 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 11638787 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 11638803 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 11639107 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 11639534 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 11639833 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11639853 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11639990 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 11640356 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 11640407 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11640938 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 11640943 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11641034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11641417 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 11641593 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11641600 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11641701 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11642031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11642155 A T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 19 11642554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11642581 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 11642709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11643059 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11643103 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11643175 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 11643311 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 11643337 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11643340 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11643415 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 11643476 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 11643854 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 11643879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11643882 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 11643903 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 11643943 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11643946 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 11643998 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11644061 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11644078 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 11644080 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 11644099 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 11644120 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 11644131 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 19 11644145 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 11644196 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 11644236 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 11644278 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11644489 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11644495 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11644525 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 11644562 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 11644597 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 11644658 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 11644699 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 19 11644734 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 11645007 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 11645015 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 11645019 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 11645446 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 19 11645591 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 11645598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11645643 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 11646051 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 11646114 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 11646197 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 11646303 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 11646396 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 11646472 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 11646898 G C N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 19 11647082 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 11647212 T A Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 11647361 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 11647493 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 11647514 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 11647909 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 11647928 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 11647960 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 11647962 G T Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 11648070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11648158 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 11648279 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 11648472 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11648550 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 11648572 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 11648584 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 11648662 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 11649098 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11649365 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11649473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11649483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11649736 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11649769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11649833 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11649900 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 11649901 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 11649974 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 11650023 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11650238 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11650351 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11650360 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 11650390 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 11650404 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11650426 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 11650449 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 11650562 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 11650651 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11650782 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 11650786 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 11650981 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11651018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11652344 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11652422 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11652426 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11652645 T C N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 19 11652675 G A N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 19 11652696 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 11652710 C T N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 19 11652803 C T N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 19 11653112 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 11653237 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11653239 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 11653257 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 11653329 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 11653380 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 11653381 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11653553 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11653601 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 11653760 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11653856 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11653891 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11653922 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11654092 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11654138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11654221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11654280 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 11654385 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11654396 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11654430 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 11654666 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11654672 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 11654832 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 11655165 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 11655178 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 11655237 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11655438 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11655447 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 11655520 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 11655526 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 11655578 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11655735 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 11655783 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 11656168 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 11656203 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 11656235 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 11656270 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 11656327 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11656394 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11656442 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 11656453 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11656496 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11656512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11656671 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11656805 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 11657012 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11657068 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 11657073 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 11657074 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 11658949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11659052 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11659433 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11661945 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11662068 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11662420 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 11662599 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 11663087 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11663696 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 11664111 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 11664267 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 11664426 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 11664543 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 11664868 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11664916 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11664945 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 11664964 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11664984 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11664986 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11665002 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11665056 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 11665152 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11665166 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11665188 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11665198 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11665219 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11665344 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 11665436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11665477 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11666096 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 11666217 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 11666254 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11666322 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11666336 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11666658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11666666 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11666849 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 11666894 T C N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 19 11666989 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 11667013 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 11667036 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 11667100 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 19 11667162 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 19 11667196 G A N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 19 11667200 T A N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 19 11667204 G C N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 19 11667220 G C N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 19 11667418 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 19 11667450 C G N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 19 11667483 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 19 11667493 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 19 11674376 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 11674401 C G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 19 11674498 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 11674642 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11674676 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 11674735 T A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 11674736 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 11674741 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 11674773 C G N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 19 11674817 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 11674965 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 11674971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11675018 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11675084 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 11675146 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 11675244 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 11675310 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11675327 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11675364 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11675366 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 11675382 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11675413 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 11675478 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 11675599 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 11675737 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11675779 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 11675784 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 11675787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11675869 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 11675878 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11675879 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11675887 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11675894 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11675913 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 11675927 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 11675950 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 11675966 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11675983 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 11675990 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 11676018 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11676019 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11676042 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11676139 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 11676226 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 11676463 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 11676930 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11677025 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 11677427 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 11677428 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 11677792 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11677903 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 11678060 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11678063 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11678090 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11678158 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11678251 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 11678327 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11678456 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 11678800 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 11678826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11678919 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 11679020 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 11679075 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11679271 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11679493 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11679531 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11679711 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 11679799 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 11679866 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11679870 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11679990 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11680021 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 11680022 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 11680110 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 11680182 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 11680361 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11680603 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 11680982 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 11681013 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 11681230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11681512 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11681544 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 11681593 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 11681647 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 11681756 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 11681768 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11681956 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11682356 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11682471 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11682541 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11682563 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 11682982 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 11683096 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11683240 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11683647 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11684183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11684187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11684214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11684246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11684258 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11684271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11684405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11684490 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11684544 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11684616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11685442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11686601 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 11686678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11686685 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 11687114 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11687349 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 11687700 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 11687948 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 11687956 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 11688092 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 11688458 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 11688503 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11688614 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11688747 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11689115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11689139 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11689152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11689154 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11689167 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11689199 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11689374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11689377 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11689380 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11689700 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 11689910 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 11689924 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 11690441 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11690704 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 11690742 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 11691038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11691153 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11691514 G T Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 11691569 A G Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 11691572 T C Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 11691838 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 11691844 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 11692047 A T Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 11692079 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 11692119 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11692199 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11692224 G A Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 11692378 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 11692472 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11692490 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11692496 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11692635 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 19 11692664 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11692689 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11692697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11692843 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 11692874 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11692882 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11692918 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11693011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11693024 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11693129 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11693214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11693380 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11693409 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11693420 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11693528 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11693565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11693642 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 11693686 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11693821 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 11693883 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 11693913 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 11694033 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11694437 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 11695225 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11695236 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11695449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11695492 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11695738 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11695794 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11696048 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 11696112 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11696896 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11696907 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11696941 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11696948 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11696986 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11696994 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11697055 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11697245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11697300 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 11697363 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11697485 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 11697548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11697643 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11697911 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 11698076 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 11698275 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 11698284 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 11698398 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 11698422 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 11698489 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11698611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11699700 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11699959 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11701093 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 11701736 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 11701751 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 11701808 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11701929 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11702030 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11702447 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11702490 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11702838 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11702848 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11703493 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11703653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11703709 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 11703766 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 11703808 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11703823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11704047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11704157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11704159 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11704316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11704448 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11704649 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 11704740 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11704762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11705121 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11705205 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11705292 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11705508 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11705749 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11705893 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11706117 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11706118 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11706120 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11706134 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11706233 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11706265 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11706392 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11707178 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11707208 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 11707591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11707730 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 11707848 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11708047 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11708077 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 11708139 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 11708148 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11708217 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 11708306 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11708330 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 11708346 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11708411 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 11708413 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11708530 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 8 6 2 4 1 19 11708601 T A N N 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 19 11708697 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 11708709 C A N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 19 11709239 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11709356 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11709363 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11709375 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 11709577 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11709685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11709781 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 11709960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11709966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11710055 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11710182 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11710251 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11710328 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11710428 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 11711075 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11711476 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11711484 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11711547 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11712118 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11712491 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11713322 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 11713425 A C N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 19 11713794 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 11713920 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11713941 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11714016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11714157 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11714307 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11714378 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11714438 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11714677 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 11714983 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 11715020 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11715292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11715405 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11715596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11715902 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11716227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11716679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11716718 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11717743 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11717989 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11718086 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11718241 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11718323 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11718370 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11718381 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11718523 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11718642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11718792 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11718895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11718905 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11719055 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11719064 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11719139 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11719173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11719307 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11719485 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 11719666 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11719700 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 11719797 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11719910 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11719983 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11720150 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11720227 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11720270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11720331 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11720520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11720528 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11720599 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11721093 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11721098 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11721348 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11721380 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 11721392 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 11721643 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11721750 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11722028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11722469 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 11722509 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 11722527 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 11722677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11722709 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11722849 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11723008 T A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 19 11723184 T G N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 19 11723238 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11723421 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 11723498 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11723545 T A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 19 11723703 T G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 19 11723880 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 11723881 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 11723942 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 11724052 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11724239 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11724241 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11724312 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11724846 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 11725269 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 11725330 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 19 11725355 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11727919 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 11729092 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11729400 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 11729572 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11729649 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 11729722 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11731379 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 11731408 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 11731503 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11732368 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11732537 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 11732614 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11733466 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11734666 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 11734943 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11735064 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11735130 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11735691 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11735708 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11736279 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11737782 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11738314 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11738427 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11738641 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11739925 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11740354 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11740538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11740604 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11742024 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 11742291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11742523 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11742743 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11742961 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 11744215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11744302 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11744951 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 11745142 G T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 11745445 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11745623 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11750019 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11751722 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11751751 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11751795 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11752141 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11752289 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 11752334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11752651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11752796 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11753083 G A Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 19 11753160 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11754014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11754254 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11755485 C A N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 19 11756376 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11756821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11757036 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 11757119 T C Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 11757224 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11757291 A C Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 11757395 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11757432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11758007 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 11758859 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11758995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11760636 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11761024 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11761107 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11761166 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11761476 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11761590 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 11761612 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11762604 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 11762736 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11762742 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 11762930 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11763819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11763897 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11763912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11763950 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11763958 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11764189 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11764228 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11764731 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11765533 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11765716 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11765902 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11766105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11766305 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11766417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11767095 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11767122 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11767166 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11767190 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11767250 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11767416 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11767650 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11768375 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11768394 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11768405 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11768451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11768452 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11769426 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11770321 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11770997 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11771009 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11772906 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11773240 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11774663 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11774983 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11775177 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 11775279 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11775644 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11777504 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 11777732 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11777923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11778123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11778335 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11779598 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 11779628 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 11780171 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 11780294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11780622 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 11780697 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11780930 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11781178 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 11781188 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11781301 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 11781629 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 11781844 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 11781987 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 11782141 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 11782242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11782285 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11782353 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11782374 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11782401 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11782420 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11782435 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11782460 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 11782503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11782504 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11782575 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11782737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11782987 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11783002 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11783087 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11783108 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11784155 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11784378 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11784392 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11784427 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11784433 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 11784440 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 11784491 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 11784599 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11784620 A G Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 11784682 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11785165 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11785184 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11785186 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11785202 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11785453 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11785679 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 11785780 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11785890 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 11785906 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 11786956 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 11787285 G T N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 19 11787401 C A N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 19 11787445 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 11787544 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 11787829 T G N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 19 11787993 A G Y Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 19 11788076 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 11788113 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 11788310 C T Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 11788356 C T Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 11788385 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 11788645 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 11788718 A G N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 19 11789053 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 11789131 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 11789653 A T Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 11789804 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 11792476 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11792596 G A Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 19 11792939 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11793025 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11793106 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 11793127 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 19 11793167 G T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 11793387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11793445 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11793815 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11794092 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 11794095 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11794233 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11794244 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 11794326 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 11794332 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 11794338 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 11794542 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 11794657 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 11795072 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11795341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11795351 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 11795495 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 11795523 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11795536 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 11795552 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11795614 G C N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 19 11795681 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 11796395 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11796411 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11796516 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11796519 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11798148 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11799284 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11799674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11799732 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11800143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11800375 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11801004 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 11801430 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11802133 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11802835 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11803044 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11803429 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 11804389 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11804775 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11807236 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11810644 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11810691 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11810747 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11811157 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 11811464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11811583 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11811695 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11812377 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11812593 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11813396 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 19 11814311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11814325 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11814414 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11815000 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11815057 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11815555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11815740 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 11815764 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11815830 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11816066 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11816719 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11816816 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11819160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11819341 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11820079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11820100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11820284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11821267 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11824636 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 11824946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11825045 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 11825219 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 11825235 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 11825774 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11825814 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11825959 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11825989 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11826009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11826261 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11826465 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 11826581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11826955 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 11826978 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11828606 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11828731 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 11829028 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11829322 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 11829427 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 11829900 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11830332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11830673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11830728 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11830847 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11831019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11831161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11831205 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11831377 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11831754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11831795 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 11831881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11832234 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 11832440 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 11832441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11832500 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11832587 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11832691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11832886 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11832918 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 11832934 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11833014 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11833090 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11833292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11833399 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11833646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11833773 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 11834461 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11834838 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11834940 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11835191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11835322 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11835515 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11835546 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11835883 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11836008 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 11836034 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 11836128 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 19 11836178 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 11836332 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11836483 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11836567 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 11836608 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 11836729 G T N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 19 11836758 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 19 11836818 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 19 11836901 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 19 11836916 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 19 11836922 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 19 11837539 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 11837661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11837928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11837958 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 11838281 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 11838317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11838416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11838472 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 19 11838474 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 11838595 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 11838743 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 11838872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11838874 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11838912 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11839018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11839188 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 11839476 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 11839485 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 11839487 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 11839912 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 11840318 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 11840350 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11840380 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11840915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11841316 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 11841701 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 11841703 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 11842193 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 11842999 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 11843047 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 11843206 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 11843468 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11843479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11843526 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 11843553 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 11843556 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 11843633 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 11843636 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 11844185 T G N N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 8 8 3 2 3 19 11844761 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 11844830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11845499 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11845639 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11845835 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11846345 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11846586 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11846652 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 11846670 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11846918 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 11846956 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 11847320 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 11847324 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11847334 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 11847468 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11847909 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11847911 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 11847915 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11848328 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11848531 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11851047 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 11851695 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 11851739 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 11851782 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 11852069 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 19 11852147 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 11852231 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 11852311 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 11852503 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 11852541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11852906 C A N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 19 11852950 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 11853990 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 11854035 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 11854188 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 11854535 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 11854595 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 11854616 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11854736 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 11854763 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 11854809 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 11854970 G T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 11855451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11855601 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 11856043 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 11856275 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 11856340 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 11856416 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 11856604 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 11856676 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 11856694 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 11856877 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 11856882 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 11856902 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 11856978 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 11857024 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 11857065 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 11857831 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 11857860 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 11857870 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 11857896 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 11858010 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 11858838 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 11858858 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 11858936 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 11858946 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 11859029 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 11859043 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 11859116 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 11859268 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 11859442 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 11860169 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11860297 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 11860302 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 11860532 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 11860543 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 11860827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11861187 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 11861569 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11861609 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11861775 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11861835 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11862170 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11862250 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11862371 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11862390 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11862428 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 11862454 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 11862477 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 11862695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11862835 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 11862850 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 11862867 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 11863085 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 11863468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11863495 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 11863640 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 11863673 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11863700 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11863812 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 11863932 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11863967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11864040 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11864228 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11864239 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 11864333 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11864564 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11864575 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11864598 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11864706 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 11864775 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 11864786 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11864808 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 11864840 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11864887 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 11864909 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11864921 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 11864935 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 11865017 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 11865021 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11865082 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 11865086 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 11865128 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11865132 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11865152 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 11865157 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 11865192 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 11865279 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 11865280 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 11865310 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 11865335 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 11865349 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 11865377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11865405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11865527 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 19 11866006 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 11866119 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 11866139 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 11866223 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 11867002 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 11867192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11867582 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 11867619 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 11867630 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 11867850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11867881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11868833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11868840 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11869182 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11869646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11869954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11871870 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 11872190 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11872298 G T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 11873811 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11874342 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 11874584 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11875376 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 11875502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11875609 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11875631 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11875651 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 11875722 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 11876914 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11877262 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11877644 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11877779 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 11878490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11879953 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 11880002 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 11880025 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11880481 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 11882066 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 11883021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11883180 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 11884063 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11884789 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11885120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11886152 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 11886268 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11886519 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 11886562 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11886568 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11886625 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11886629 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11886890 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11887185 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 11887348 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11887431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11887859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11887898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11888378 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11888565 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 11888587 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 11889595 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11889748 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 11889764 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 11889859 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11889911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11890232 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11890343 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 11890498 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 11890692 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 11890812 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 11890838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11890859 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11890895 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11890918 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11890923 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11890940 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11891113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11891154 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 11891297 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11891317 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 11891467 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11891479 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 11891495 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 11891645 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 11891649 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 11892229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11892312 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 11892352 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11892419 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 11892528 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 11893714 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 11893768 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11893876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11893944 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11893956 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 11893968 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11894006 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11894019 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11894037 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11894052 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11894255 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11894300 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11894418 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11894456 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11894457 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11894491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11894499 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 11894615 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11894672 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 11894792 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11894811 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11894976 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11895091 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 11895251 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11895411 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 11895554 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 11895754 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 19 11895793 G C N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 19 11895821 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 19 11895836 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 19 11895875 A T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 11895940 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 19 11896543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11896570 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11896885 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 11896949 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 11897198 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11897268 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 11897290 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11897525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11897603 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 11897652 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11897765 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11898114 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 11898310 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 11898461 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 11898622 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 11898629 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 11898820 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 11898883 A T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 19 11898934 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 19 11898943 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 11898948 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 11899109 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 11899132 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 11899145 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 11899183 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 11899343 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 11899435 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 11899527 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 11899766 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 11899767 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 11899793 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 11899865 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 11899890 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 11900183 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 11900197 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 11900240 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11900303 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 11900315 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 11900322 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 11900407 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 11900414 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 11900449 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 11900514 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 11900540 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 11900545 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 11900549 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 11900570 G T Y N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 19 11900613 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 11900624 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 11900658 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 11900980 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11900998 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 11901366 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 19 11901470 A G Y Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 19 11901524 T C Y Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 19 11901621 G A Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 19 11901658 T C Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 19 11901662 G A Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 19 11901693 A G Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 11901779 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 11902053 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 11902079 C A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11902084 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11902265 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 11903831 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 11903834 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 11903937 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11903945 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 11903960 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 11903988 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11904347 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11904577 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11904594 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11904626 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11904671 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11904736 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11904905 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11905128 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 11905370 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 19 11905477 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 11905802 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 11905892 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 11906323 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11906347 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11906365 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11906589 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 11906966 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 11907000 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 11907058 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11907215 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 19 11907311 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11907642 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 11907722 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11907852 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 11908077 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 11908104 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11908637 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11908697 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 11908805 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 11908853 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 11909168 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 11909197 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 11909224 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 11909225 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 11909286 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 11909417 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 11909456 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 11909469 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11909482 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 11909523 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 11909526 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 11909537 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 11909541 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 11909832 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 11910182 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 11910210 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 11910336 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 11911176 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11911829 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11913314 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11913330 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11913340 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11913403 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11913407 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11913634 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 11913684 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11914051 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11914062 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11914087 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 11914111 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11914136 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11914389 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 11914405 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11914540 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11914550 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11914593 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11914661 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 11914704 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11914777 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11914873 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11914881 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 19 11914915 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11915014 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11915217 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11915273 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11915287 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11915379 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11915407 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 11915408 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11915671 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11915686 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11915716 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11915745 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11915875 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 11916015 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11916152 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 11916168 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11916237 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 11916248 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 11916312 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11916425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11916452 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11916820 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11916832 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 11916860 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 11916861 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11916868 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 11916869 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 11916900 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11916954 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11916955 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 11916963 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11917054 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11917104 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11917112 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11917131 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 11917141 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 11917224 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 11917244 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11917309 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 11917322 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 11917341 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 11917350 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 11917369 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 11917494 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 19 11918248 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 11918284 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 11918426 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 19 11918486 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 11918654 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 19 11918754 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 19 11918868 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 11919289 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 11920148 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 11920439 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11920847 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11920909 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11921327 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 11921583 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 11921698 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 11921730 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 11921739 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 11921752 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 11921782 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 11921861 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 11921896 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 11921963 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 11922006 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 11922008 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 11922031 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 11922069 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 11922077 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 11922090 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 11922094 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 11922189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11922212 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 11922400 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11922731 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11922990 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11922998 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11923526 G A Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 11923577 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 11923616 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11923801 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 11924112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11924129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11924275 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 11924479 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 11924613 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 11924934 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 19 11925108 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 11925263 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 11925327 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 11925480 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11925496 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11925588 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 11925605 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 11925897 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11925928 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11926121 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 11926133 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 11926568 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 11926570 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 11926596 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 11926943 G C Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 11927096 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11927132 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 11927146 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 11927482 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 11927547 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 19 11927598 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 19 11928092 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11928299 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 11928375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11930782 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 11930783 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 11930820 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 11930825 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 11930839 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 11931059 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 11931237 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11931262 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11931290 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11931608 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 11931739 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 11931771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11932106 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11932188 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11932449 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11932499 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 11932779 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11933042 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 11933060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11933116 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11933446 G A Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 19 11933477 A C Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 19 11933490 A T Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 19 11934192 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 11934419 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11934527 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11934597 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 11934718 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11934768 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 11935171 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11935195 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11935329 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11935535 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 11935608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11935629 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11935722 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11935741 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11935763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11935833 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11935857 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11935904 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11936051 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11936061 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11936099 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11936161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11936164 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11936184 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11936191 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11936235 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11936428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11937494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11937525 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11937544 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 11937892 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11937979 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11938154 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11939203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11939435 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11939738 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11940206 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 11940286 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 19 11940926 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 11941304 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11941413 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11941444 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 11941987 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11942148 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11942210 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11942398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11942404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11942565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11943088 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11943194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11943762 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11943797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11944367 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11944418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11944555 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11944633 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11944667 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11944808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11944832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11945750 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11945767 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11945817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11945882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11945978 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11945991 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11946058 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11946359 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11946551 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11947200 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 11950145 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11950442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11950727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11950842 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11951258 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11951394 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11951405 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11951442 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11951455 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11951579 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11953231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11953948 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11954032 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11954044 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11954228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11954338 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11954563 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11954906 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11954993 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11955083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11955366 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11955393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11955489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11955768 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 11956173 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11956317 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11956500 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11957165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11957369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11957478 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11957550 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11957988 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 11959142 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11959856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11960163 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11960836 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11960924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11960979 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11961487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11961736 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 11961754 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 11962141 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11962186 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11962194 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11962654 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11962862 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11962864 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11963085 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11963363 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11963621 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11963919 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 11966457 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11969727 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11970228 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11970256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11970443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11970707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11971329 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11971654 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11971815 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11972265 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11972286 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11972291 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11973215 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11973673 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11973705 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11973763 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11973765 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11973885 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11974047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11974090 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11974107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11974281 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11974519 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11974547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11974605 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11974794 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11974810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11974858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11974902 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11974993 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11975188 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11975364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11975511 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11975560 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11975568 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11975676 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11975898 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11976346 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11976401 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11976578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11976603 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11976740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11976741 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11977107 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11977120 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11977138 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11977156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11977416 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11977585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11978320 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11978328 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11979051 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11981262 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11981305 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11981824 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11981961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11981992 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11982070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11982546 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11982852 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11982947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11983251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11983262 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11983265 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11983316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11983489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11983692 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11983888 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11984180 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11984552 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11984577 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11984633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11984700 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11984734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11985185 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11985197 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11985198 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11985205 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11985654 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11985700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11985926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11986351 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11987317 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 11989755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11989841 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11990742 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11991058 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11991129 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 11991220 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11991543 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11992078 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11992081 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11992520 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11992535 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11992592 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11993005 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11993068 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11993234 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11993521 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11993522 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 11993613 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11993681 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11993703 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11994070 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11994563 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11994632 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11994954 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11995436 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11995609 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11995656 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 11995755 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11995856 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11996505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11996662 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11997282 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 11997977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11998534 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 11998893 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 11999999 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12000497 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12000940 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12000942 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12000946 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12001125 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12001312 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12001618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12001645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12002117 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12003416 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12003422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12003536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12003784 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12004035 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12004088 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12004253 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12004409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12005001 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12005245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12006020 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12006284 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12006539 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12006546 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12006569 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12006572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12006592 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12006644 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12009062 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12010743 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12010841 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12010874 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12012328 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 12012784 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12013425 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12013488 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12013765 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12013948 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12014660 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12015077 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12015088 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12015478 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12015495 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12015731 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12016154 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12016610 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12016760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12018204 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12018482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12018522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12019982 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12019994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12022082 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12022986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12023912 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12024067 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12024130 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12024245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12024820 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12024976 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12024984 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12025301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12025456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12026544 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12026873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12027176 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12027277 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12027480 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12027739 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12028428 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12028612 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12028751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12028778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12028892 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12029761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12030025 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12030036 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12030096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12030122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12031397 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12031781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12031861 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12031907 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12033238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12033304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12033499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12034204 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12034602 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12037827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12038273 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12040284 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12042973 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12044218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12044505 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12044591 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12044667 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12044859 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12045407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12045968 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12046290 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12046331 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12046414 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12046474 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12046497 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12046887 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12047430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12047893 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12049600 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12050448 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12052544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12053035 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12053787 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12054146 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12054209 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12054589 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12054660 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12054663 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12055901 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 12055911 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 12055936 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12055966 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12055969 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12055974 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12056049 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12056354 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12056355 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12056357 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 12056414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12056686 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12057115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12057358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12057569 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12057599 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12058065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12058068 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12060838 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12061859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12062312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12063184 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12064777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12064832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12065592 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12067747 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12067784 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12067922 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12067991 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12068186 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12068237 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12068243 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12068771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12068797 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12068801 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12069232 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12069779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12069873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12070696 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12070768 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 12070916 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12070947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12070948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12071079 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12071895 C T N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 19 12072620 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 12072654 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 12072794 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 12072821 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 19 12073208 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12073297 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12073350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12073947 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 12073963 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 12074319 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12074380 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 12074535 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 19 12074604 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12074614 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12076011 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 12076448 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12076533 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12076971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12078294 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12078375 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 12078767 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12078822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12078845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12079110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12079112 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 12079274 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 12081017 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12081244 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12081262 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12081374 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12082497 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12083998 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12084268 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 19 12084725 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12084860 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12085004 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 12085512 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12087548 A G N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.454545454545455 0.363636363636364 0.181818181818182 14 8 5 4 2 19 12087777 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 12087803 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 19 12087871 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 12087949 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12088181 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12088824 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12088841 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12088842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12088878 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12089332 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12089432 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 12089693 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12089782 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 12089912 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 12090091 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 12090105 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12090157 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 12092947 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 12093041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12093089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12093485 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12093486 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12093543 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 12093629 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12093650 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 12093937 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 12093958 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 12093973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12094255 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 12094258 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 12094276 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12094288 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12094294 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12094299 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12094316 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12094332 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 12094333 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 12094550 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12094699 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 12094811 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 12095028 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12095210 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 12095870 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 12096091 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 12096447 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 12096530 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 12096988 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12096997 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 12096998 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 12097263 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 12097316 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12097326 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12097630 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 12097645 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 12097973 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 12098050 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 12098053 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 12098639 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12098947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12099091 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 12099148 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 12099456 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 12099501 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 12099779 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 12100221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12100396 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 12100470 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 12100881 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 12101480 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 12101725 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 12104032 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 12104102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12104142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12104174 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 12104239 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 12104793 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 12105224 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12105512 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 12105514 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 12105586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12105645 C A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 12106275 G C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 12106903 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 12106969 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12107149 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 12107339 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 12107377 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 12107382 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 12107418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12107610 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 12107625 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 12107647 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 12107697 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 12107943 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 12108094 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 12108757 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 12109043 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 12109642 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 12109735 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 12110092 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12111148 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12111458 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 12111726 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 12114495 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12114818 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12115490 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12115811 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12116412 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 12117297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12117765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12117848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12118258 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 12118421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12118825 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12119011 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12119175 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12119202 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 12119542 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 12120183 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12120435 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12121262 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12121331 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 12121376 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 12121460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12121579 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12121631 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 12121739 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12121771 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 12121772 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 12121785 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 12121825 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 12122051 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 12122454 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 12122527 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 12122534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12122538 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 12122558 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 12122603 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12122656 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 12122722 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12122751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12122770 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 12122876 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 12122916 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 12122919 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 12123001 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 12123168 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 12123252 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 12123286 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 12123293 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 12123299 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 12123447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12123508 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 12126762 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 12127335 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12127561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12127705 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12128145 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12128727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12128747 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12129867 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12132068 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 12132755 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 12134456 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 12135820 G A N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 19 12136092 T A N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 19 12136791 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12137360 G C N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 19 12137728 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 12140023 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 12141985 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 12141998 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 12143019 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 12144685 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 12145128 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 12149438 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12149457 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12149594 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12150535 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 12150969 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 12151010 C A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 12152760 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 12152855 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 12152965 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 12153193 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 12153350 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 12153433 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 12153447 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 12153476 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 12153542 C T N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 19 12153556 A G N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 19 12153871 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 12153900 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 12153931 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 12154077 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 12154264 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 12154348 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 12154356 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 12154429 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 12154437 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 12154463 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 12154472 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 12154473 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 12154508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12154576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12154680 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 12155181 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 12155287 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 12155293 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 12155407 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 12155430 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 12155432 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 12155474 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 12155947 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 12155973 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 12156056 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 12156075 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12156079 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 12156084 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 12156093 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 12156175 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 12156204 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 12156210 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 12156308 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 12156330 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 12156510 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 12156515 A T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 19 12156662 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 12156745 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 12156752 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 12156788 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 12157122 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 12157130 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 12157139 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 12157263 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 12157271 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 12157289 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12157302 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 12157308 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 12157336 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 12157364 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 12157637 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 12157666 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 12157699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12157701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12157724 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 12157772 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 12157801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12157823 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 12157831 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 12158042 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 12158045 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 12158066 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 12158116 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 12158121 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 12158338 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 12158405 G T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 19 12158407 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 12158408 G A Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 19 12158849 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 12158897 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 12158944 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 12158997 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 12158998 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 12159011 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 12159094 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 19 12159210 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 12159253 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 12160100 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 12160167 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 19 12160178 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 12160180 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 12160196 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 12160211 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 12160258 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 12160368 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 12160405 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 12160409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12160440 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 12160447 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 12160490 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 12160568 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 12160575 C G N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 19 12161472 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 12161499 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 19 12161500 A T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 19 12161523 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 12161593 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 12161648 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 12161655 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 12161670 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 12161678 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 12161723 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 12161741 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 12161859 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 12161898 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 12161946 G T N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 19 12161949 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 19 12161975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12162161 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 12162262 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12162340 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 12162486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12162507 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 12163269 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 12163516 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 12163574 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 12164670 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12164732 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 12165118 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12165523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12172227 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12174544 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12174547 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12174726 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 12174939 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12174957 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 12175089 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 12176683 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12178998 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12179471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12180639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12181638 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12181701 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12181940 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12183355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12183450 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12184263 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 12184264 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 12184380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12186484 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 12186486 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 12186505 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 12186958 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12187831 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 12188233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12188274 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12188847 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12189570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12190532 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 12193233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12193535 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 12193876 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 12194863 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12198948 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12199592 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12199675 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12199982 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12200089 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12201583 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12201670 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12202741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12203878 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 12206991 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12212801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12215497 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 12216064 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12216090 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 12216494 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12216805 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12216824 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 12218253 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12218366 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12218766 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12218796 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12220137 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 12220166 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12220199 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 12220212 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 12220344 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 12220610 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 12231032 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 12231199 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 12231435 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 12231436 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 12231536 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 12231572 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 12231585 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 12231668 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 12231769 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 12231805 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 12231819 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 12231825 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 12231829 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 12231939 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12232035 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 12232057 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 12232088 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 12232120 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 12232533 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 12236652 G A Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 19 12236835 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 12236887 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 12237100 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 12237253 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 12237329 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 12238541 G T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 19 12238987 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 19 12238999 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12239309 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12239314 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12239343 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 19 12239372 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 12239402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12239466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12239584 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 12239664 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12239886 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 12239888 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 12239890 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 12244125 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12250305 G T Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 12250448 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12251033 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12251334 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12252894 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12253009 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12253344 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12254199 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 12254482 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12254620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12254944 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 12255809 A T N N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.454545454545455 0.363636363636364 0.181818181818182 14 8 5 4 2 19 12255868 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 12255979 C T N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 19 12256018 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 19 12256747 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 12256883 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 12256916 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 12257030 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12257570 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 12257667 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 12257996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12258000 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12258707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12258955 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12258977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12259453 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12259900 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 12262928 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 12263195 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 12263755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12263831 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12263843 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12264296 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12264368 C G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 12264978 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12268176 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 12268619 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12270812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12272369 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12272521 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 12272738 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 12273254 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12273285 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 12273461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12274084 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 12275166 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 12275941 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12276239 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12277018 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 12277430 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 12277563 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 12277725 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 12281077 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 12281556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12281592 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12281684 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12282163 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 12282231 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 12282435 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12283539 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 12283664 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12284327 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12285030 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12285226 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 12285289 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 12285362 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12285837 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 12285930 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12285979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12286090 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 12286159 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12286266 T G Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 12286284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12286313 T G Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 12286314 C A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 12286329 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12286545 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12286697 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12286869 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 12286885 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12286896 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 12287369 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12287561 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 12287719 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12287725 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 12287830 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 12288119 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 12288191 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 12288232 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 12288779 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12289171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12289177 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 12289281 C G Y N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 19 12289588 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12289766 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12289809 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 12289912 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 12289984 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 12290198 T G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 12290277 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 12290334 G T Y N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 19 12290688 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12290709 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 12291192 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12291229 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12291398 C G Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 12291665 C A Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 12291864 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12291943 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12292034 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12292145 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12292338 G T Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 12293175 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12294147 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 12294845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12294903 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12295018 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 12295188 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 12295548 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12296018 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12296020 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 12296131 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 12296252 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12296271 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 12296289 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12296383 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12296590 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 12296870 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12296881 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 12296931 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12296956 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12297075 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 12297125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12297142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12297421 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12297423 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 12297562 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12297797 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12297842 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12298295 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12298439 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12298614 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12298860 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12298864 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 12298902 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 12299027 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 12299144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12299545 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12299554 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 12299583 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 12299600 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 12299691 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 19 12299755 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12299836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12299867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12299987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12300059 A T Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 12300387 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 12300489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12300587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12300632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12300932 C T Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 19 12300951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12301206 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 12301254 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 12301634 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12302104 C T Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 19 12302465 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12302533 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12302766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12302834 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12302889 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12313362 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12313379 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12313482 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 12314461 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12314935 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12315955 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12317118 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12317152 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 12317587 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 12317661 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12317858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12318411 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 19 12319147 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12320167 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12320380 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12320817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12321387 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12321512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12321800 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12322987 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12323745 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12325655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12326412 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12326634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12326715 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 12326745 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12327484 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12327547 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 12327883 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12328005 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12328294 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12329113 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12329243 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12329259 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12330210 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12330641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12330954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12331167 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12331425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12331732 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12331778 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12332043 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12332693 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12335650 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12335670 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12336518 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12336918 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 12336962 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 12337138 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 12337361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12339101 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 12339194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12339527 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12339692 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12339730 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12339771 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 12339773 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 12339845 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 12340018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12340027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12340848 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12341179 C T Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 12341208 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 12341426 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12341772 C T Y Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 19 12342667 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12342991 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12343898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12344059 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12344530 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12344608 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 12344980 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 12345041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12345167 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 12345325 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 12345348 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 12345356 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 12346143 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 12346234 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12346288 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 12346572 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 12348596 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12349318 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12349384 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 12349405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12349565 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 12349891 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 12350073 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12350217 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 12350485 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 12350522 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 12350525 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 12350626 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 12350802 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12350806 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12350851 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 12350880 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12350889 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 12350919 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 12350959 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 12351059 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 12351121 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 12351131 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 12351345 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 12351451 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 12351455 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 12351469 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 12351483 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 12351533 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 12351555 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 12351575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12351661 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 12351787 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 12351797 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 12351903 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 12351937 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 12351958 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 12351961 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 12351968 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 12352000 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 12352075 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12352218 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 12352290 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 12352356 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 12352382 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 12352407 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 12352511 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 12352677 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12353655 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 12353908 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 12354198 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 12354318 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12355037 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12356164 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12356590 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 12356715 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12357066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12357107 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 12357970 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12358043 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 12358053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12358760 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12359105 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 12359231 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 12359242 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 12359391 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12359407 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 12359493 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 12359574 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 12359743 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 12359834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12360048 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 12360871 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 12361075 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 12361852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12361986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12365852 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 12366467 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12368396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12369629 A T N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0 0.75 0.25 12 20 0 12 4 19 12369759 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 12371986 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12373096 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 12373375 G T N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 0.142857142857143 0.214285714285714 20 8 9 2 3 19 12373675 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 12373802 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 19 12373815 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 12373869 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 12373907 T A N N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 14 6 6 2 2 19 12374205 C T N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 19 12374872 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 12375339 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 19 12375844 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 12376689 C T N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 19 12376710 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 12376783 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 19 12376921 C T N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 19 12377360 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 12377378 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 12377430 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 12378439 A C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 12379356 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 12383038 G A N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 19 12383242 T A Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 12383270 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 12385859 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 12386187 T C N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 19 12386307 A G N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 19 12386407 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 12386580 T A N N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 8 8 3 2 3 19 12388362 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 12388669 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 12388878 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 19 12388906 T G Y N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.545454545454545 0.181818181818182 0.272727272727273 14 8 6 2 3 19 12388917 C A Y N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 14 6 6 2 2 19 12389155 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 12389157 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 19 12389163 G A Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 19 12389349 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 12389480 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 12389487 T C Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 19 12390279 A G Y Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 19 12390687 C A N N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.454545454545455 0.363636363636364 0.181818181818182 14 8 5 4 2 19 12390695 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 19 12390717 G T N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 19 12391206 T C N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 19 12391283 A G N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 19 12391575 C T N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 19 12391669 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 12391862 T C N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 19 12392197 T A Y N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 19 12392917 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 12392967 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 12393506 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 12393511 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 12393702 G C N N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.454545454545455 0.363636363636364 0.181818181818182 14 8 5 4 2 19 12394735 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 12394763 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 12394952 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 12395143 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 12395379 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 12395546 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 12396028 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 12396065 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 12397632 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12398186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12398556 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 12400138 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 12400615 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12401558 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 12402451 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 12402539 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 12404609 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 12404856 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12404867 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12404936 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 12405295 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12405460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12405743 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 12405757 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 12405788 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 12405801 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12405855 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 12406078 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 12406180 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 12406181 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12406232 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12406281 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 12406391 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12406452 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 12406646 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12406779 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 12406832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12406879 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12407011 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 12407022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12407152 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 12407205 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 12407211 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 12407216 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 12407252 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 12407274 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 12407287 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 12407306 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 12407475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12407607 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 12408821 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 12409090 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 12409147 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 12409714 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12409763 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 12409858 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12410019 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 12410039 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 12410241 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12410259 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 12410329 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 12410375 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 12410438 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 12411422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12411485 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 12411534 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 12411711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12413806 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12414800 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12415137 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 12415243 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12420282 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12420283 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12421917 G T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 12424615 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12428107 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12428145 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12428318 A T N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 19 12428388 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 12428412 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12428618 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12428701 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 12428795 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12429245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12429285 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 12429371 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 12429587 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 12429868 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 12429928 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 12429942 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12430016 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12430136 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 12430258 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 12430310 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 12430314 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 12430437 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 12430616 C T N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 19 12430709 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 12430838 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 12430841 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 12430898 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12430902 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 12431310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12431461 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12431524 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 12431565 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 12432095 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 19 12432144 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 12432420 A G N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 19 12434705 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12447191 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 12447224 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 12447627 G C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 12447665 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 12447714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12448138 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 12448447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12448505 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 12448675 T G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 12448757 T C Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 19 12448781 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 12448830 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 12448898 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 12449365 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 12449391 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 12450426 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12450992 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 12451242 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 12451412 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12451540 G C Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 12452908 A C Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 12452989 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 12453149 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12453251 A T Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 12453440 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12453546 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12453623 A G Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 19 12455162 C A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 12456679 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12456797 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 12456824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12457323 A G Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 12457393 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12457951 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 12459154 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12459659 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12459717 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12460518 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 12461319 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 12461513 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12462015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12462086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12462091 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 12462153 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 12462314 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 12462335 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 12462368 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 12462369 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 19 12462400 A G Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 12462436 T C Y Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 19 12462497 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 12462543 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 12462562 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12462731 T A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 12462784 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 12463062 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 12463294 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 12463338 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12463454 G A Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 19 12463721 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 12463739 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 12463798 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 12463834 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 12463836 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 12463846 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 12463981 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 12464056 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 12464059 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 12464166 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 12465034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12465118 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 12465553 T C N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 19 12465594 A G N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 19 12465766 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 12465904 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 9 5 3 3 1 19 12465940 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 12465970 T G N N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.6 0 0.4 6 4 3 0 2 19 12466281 T A N N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 19 12466517 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 12467446 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12468213 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12468845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12469174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12469315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12469648 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12469805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12469860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12469885 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12469943 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12470018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12470059 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 12470191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12470193 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 12470240 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12470256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12470263 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 12470264 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 12470320 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 12470456 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 12470459 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12470463 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 12470464 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 12470494 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 12470554 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12470675 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12470683 C G Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 12470813 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 12470961 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12471112 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12471174 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12471444 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12471466 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12471678 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 12472117 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12472188 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 12472288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12472554 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 12473115 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12473182 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12473762 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 12473879 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12473948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12473957 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12474001 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12474386 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 12474485 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 12474508 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 12474548 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12474598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12474736 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12474763 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 12475034 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 12475088 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 12475098 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12475111 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 19 12475373 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12475379 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12475443 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 12475448 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 12475790 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 12475805 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12475928 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 12475947 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 12476028 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 12476197 G A N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 19 12476224 G A N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 19 12476599 G A N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 19 12476668 A G N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.181818181818182 0.0909090909090909 0.727272727272727 5 17 2 1 8 19 12476899 A T N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 19 12476939 G A N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 19 12476995 A G N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 19 12477047 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.2 0.0666666666666667 0.733333333333333 7 23 3 1 11 19 12477087 A T N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.2 0.0666666666666667 0.733333333333333 7 23 3 1 11 19 12477095 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.25 0.0625 0.6875 9 23 4 1 11 19 12477180 G A N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 19 12477181 T G N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 19 12477184 A G N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 19 12477400 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 4 20 2 0 10 19 12477415 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 19 12477765 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 12477770 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 12477905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12477974 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 12478250 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 12478576 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 12478578 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12478691 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 12478731 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 12478767 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 12478856 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 12478890 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 12478982 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 12479008 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 12479011 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 12479104 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 12479127 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 12479174 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 12479260 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 12479277 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 12479347 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 12479563 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 19 12479621 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12479676 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 12479777 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12479820 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 12479844 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12479849 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12479876 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12479901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12479991 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12480097 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12480193 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12480246 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12480494 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 12480592 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12480866 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 12480876 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 12480940 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 12480948 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 12480973 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 12481011 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 12481579 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12481599 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 12481677 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 12481880 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12482101 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 12482259 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 12482937 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 12483062 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 12483078 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 12483188 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12483309 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 12483538 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12483588 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 12483614 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 12483640 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 12483647 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 12483661 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 12483676 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 12483685 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 12483716 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 12483725 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 12483726 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 12483821 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 12483828 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 12483837 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 12483851 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 12483855 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 12483866 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 12483886 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 12483902 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 12483927 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 12483931 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 12484118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12484329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12484343 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 12484376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12484516 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12484670 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12484787 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12484825 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12485090 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12485093 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12485122 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12485217 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12485271 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 12485282 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 12485291 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 12485292 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12485304 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12485338 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12485523 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 12485524 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 12485526 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 12485701 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 12485933 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 12486115 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 12486193 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 12486241 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 12486472 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 12486483 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12486719 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 12486733 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 12486990 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 12487015 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 12487221 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 12487222 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 12487348 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12487351 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12487359 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12487389 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12487513 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 12487530 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12487862 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 12487904 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12488021 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12488305 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12488381 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12488382 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12488399 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12488455 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12488541 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12488631 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 12488659 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12488667 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 12488669 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12488851 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12489032 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 12489069 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 12489103 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 12489146 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 12489158 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 12489270 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 12489305 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 12489316 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 12489352 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12489377 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 12489398 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 12489464 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 12489562 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 12489613 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 12489764 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 12489777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12489804 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 12490060 A T N N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 19 12490205 G T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 12490290 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 12490329 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 12490331 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 12490340 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 12490403 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 12490407 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 12490413 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 12490481 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 12490604 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 12490738 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 12490753 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 12490838 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 12490935 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12490978 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 19 12491038 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 12491122 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 12491153 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 12491186 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 19 12491190 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 19 12491192 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 12491512 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 19 12491602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12491645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12491745 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 12491997 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 12492160 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12492415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12492433 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12492481 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12493219 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12493577 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12493741 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 12493932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12494064 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 12494935 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 12495354 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 12495366 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12495367 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 12495473 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 12496133 C A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 12497314 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12497533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12498036 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12500012 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 12500163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12500409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12500928 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 12503995 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12504236 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12505021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12505077 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12505258 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12505282 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12505288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12505304 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12505532 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12506046 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12506130 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12507060 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12507786 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 12508419 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12508866 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12508939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12509117 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12509226 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12509255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12509509 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12509853 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 12510391 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 12511071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12511269 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12511477 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12511480 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12511484 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12511522 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12511800 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12512515 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12512595 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 12512615 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 12512708 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 12512791 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 12512795 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12512833 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 12512856 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 12512900 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 12513056 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12513120 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12513121 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12513156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12513187 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12513191 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 12513569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12514167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12514993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12515012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12515561 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 12515585 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 12516108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12516661 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 19 12516688 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12516740 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 12516957 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 12517023 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 12517468 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 12517487 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 12517488 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12517504 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 12517557 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 12517628 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 12517686 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 12517780 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 12517830 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 12517851 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 12517865 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 12518036 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12518227 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12518527 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12519328 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 12519894 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12519920 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12520223 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12520440 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 12520558 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12521177 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12521215 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12521584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12529462 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12529594 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12530219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12530336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12530377 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 12530657 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 12530662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12530712 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12530780 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12530823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12531001 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 12531843 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 12532311 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12533018 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 12533328 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12533548 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12533658 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 12533728 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12533892 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12533902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12533927 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12533958 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12533965 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12534027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12534337 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 12534350 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 12534549 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 12534815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12534853 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 12535166 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12536167 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12536323 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12536332 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12536794 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12537481 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12537896 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 12537911 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 12538204 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 12538233 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 12538372 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12538690 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12538817 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12539039 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 12539219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12539284 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12539319 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12539326 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12539622 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 12539625 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 12540595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12540695 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12540696 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12540758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12541109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12541110 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12541334 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12541335 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12542002 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12542050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12542655 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12542835 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12542854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12543063 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12543252 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12543382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12544089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12544210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12544258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12544405 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12544414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12544635 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12544946 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12545284 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 12545338 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 12545460 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12545502 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12545776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12545972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12546319 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12546515 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12546612 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12546758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12546849 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12546914 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 12547008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12547189 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 12547277 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12547958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12548189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12548193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12548714 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12549033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12549157 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12549170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12549328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12549395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12549503 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12549539 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12549542 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12549577 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12549894 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12549969 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12549984 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12550082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12550206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12550222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12550345 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12550376 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12550549 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12550581 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12550962 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 12551117 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12551457 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12551605 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12551792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12552110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12552112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12552324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12552356 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 12552403 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12552411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12552515 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12552603 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12552606 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12552664 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12552929 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12553018 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12553062 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12553184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12553200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12553341 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12553377 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12553393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12553550 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12553563 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12553616 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12553634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12553774 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12554224 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12554376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12554551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12555387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12555533 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12555620 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12555714 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12556830 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12556897 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12556907 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12557000 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 12557138 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 12557355 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12557482 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12558753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12558956 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12559468 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12559527 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12559863 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12560231 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12560248 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12561071 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12561415 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12561530 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12561937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12562237 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12562623 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12563029 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12563233 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12564497 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12564592 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 12566199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12566285 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12566385 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12566982 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12566988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12567009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12567196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12567225 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12567278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12567304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12567741 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12567859 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 12568762 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 12569069 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12569264 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12569370 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12569430 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 12569556 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 12569607 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 12569694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12570074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12570076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12570092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12570099 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12570225 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12570433 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12570472 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12570542 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12570693 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12570762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12570768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12570770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12570836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12570904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12571346 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12575408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12575811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12584157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12585131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12585583 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12585623 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 12585678 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 12585681 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 12585776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12585913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12585974 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 12585981 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 19 12585982 G A N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 19 12586173 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12586198 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 12586257 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 12586861 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 12586924 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 12587395 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12587494 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12587904 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12587961 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12588263 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12588445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12588607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12589366 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12589448 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12594578 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12595071 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 12595293 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12597590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12598543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12598875 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 12598902 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 12599363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12599430 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12599470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12599927 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12600605 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 12600920 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 12600936 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 12601846 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12603098 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12603252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12605609 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12607476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12610379 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12610550 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12612408 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12613421 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12613434 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12614648 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12614668 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12614688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12614713 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12614992 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12615081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12616326 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12617420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12619833 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12619889 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12620381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12622655 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12623202 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 12624148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12624420 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12624602 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12624860 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12625297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12625821 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 12626672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12627168 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12628596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12630226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12630604 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12630936 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 12631358 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12631476 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12631807 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12632218 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12632727 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 12634521 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12634579 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12634629 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 12634932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12634980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12635005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12635059 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 12635122 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12635263 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12635282 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 12635283 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 12635431 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12635485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12635489 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 12635556 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12635591 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12635605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12635618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12635694 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12635708 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12635808 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 12635812 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 12636078 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12636107 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 12636109 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 12636176 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12636181 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12636301 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12636307 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 12636370 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12636387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12636398 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12636399 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12636438 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12636506 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12636532 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12636555 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12636566 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12636580 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12636585 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12636654 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12636664 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12636698 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12636782 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12636908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12636922 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12636933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12636998 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12636999 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12637052 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12637074 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12637103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12637130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12637565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12637599 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12637871 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12638182 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12638648 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 12639562 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 12639817 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 12639819 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12639878 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12640655 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 12640719 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 12641201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12641831 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 12642033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12642332 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 12642371 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 12642558 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 12643336 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 12643361 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12643512 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12643546 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 12643704 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12643782 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 12643975 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 12644029 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 12644047 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 12644083 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12644100 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 12644419 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 12644452 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12644479 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12644706 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12644739 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12644789 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12644806 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 12644807 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12644840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12644864 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12644907 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 12644919 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 12645018 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12645023 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 12645101 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12645192 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12645289 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 12645332 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12645345 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12645376 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12645392 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12645587 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12645604 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 12645605 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 12645638 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12645899 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12645930 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12646021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12646407 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12646869 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 12647287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12648014 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12648992 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 12649347 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12649513 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12649685 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12649708 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12649865 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12650134 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12650153 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12650712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12651401 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12651830 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12651899 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12651919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12651932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12651965 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 12651979 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 12652565 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12652634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12652716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12653046 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12653130 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12653236 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12653247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12653259 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12653276 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12653300 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12653328 T C N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0 0.769230769230769 0.230769230769231 10 16 0 10 3 19 12653425 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12653708 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 19 12653727 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 12653760 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 12653762 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 12653763 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 12653808 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12653821 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 12653864 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 12653866 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 12653921 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 12653953 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12653992 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 12657520 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12657662 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12657669 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12657711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12657736 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12657745 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12657891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12658737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12659144 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12659252 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12659365 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 12659591 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12659631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12659645 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12660838 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12661657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12661754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12661961 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 12661962 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12661964 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 12661973 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12662270 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12662634 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12663489 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12663680 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12663771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12663969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12664084 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12664167 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 12664187 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12664371 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12664795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12665022 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12666129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12666890 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12667053 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12667196 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12667493 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12667554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12667565 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12667594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12667622 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12667664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12667735 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12667737 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12667747 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12669781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12669852 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12669854 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12669922 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12669958 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12670000 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12670064 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12670163 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12670238 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12670278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12670302 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12670307 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12670312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12670318 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12670350 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12670408 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12670479 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12671169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12671361 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12671485 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12671732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12671913 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12671931 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12672572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12673014 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12673069 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12673073 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12673091 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 12673092 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 12673102 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12673271 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12673730 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12674361 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12674634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12674856 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12674896 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12675146 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12675367 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12675371 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12675387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12677575 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12677688 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12677759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12678043 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12679059 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12679060 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12679520 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 12679717 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12679843 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12679895 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12679914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12680072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12680989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12682104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12682105 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12682665 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12683050 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12683558 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12683788 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12686640 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12686808 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12687222 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 12687508 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12687522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12688990 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 12688999 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 12689038 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 12689896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12690288 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 12691783 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12692005 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12692016 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 12692049 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 12692110 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12692155 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 12692158 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 12692183 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 12692467 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12692471 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12692489 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12692498 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 12692636 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12692661 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12692798 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 12692967 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12693417 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12693428 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12693945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12694011 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12694053 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12694483 T G N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 19 12697855 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12698179 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 12698356 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12698508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12699001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12699027 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12699037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12699477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12699947 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12700157 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12700554 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 12700933 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12701611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12702019 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12702628 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 12702721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12702776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12702781 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12703063 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12703319 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12703604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12703616 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12704032 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12704598 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12704685 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12704729 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12705082 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12705211 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 12705212 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12705388 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12707340 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12708478 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12708947 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12709556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12709956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12710070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12710462 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12711128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12711383 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 12711803 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12712622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12712764 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12712773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12712853 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12712945 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12713044 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12713054 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12713109 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 12713150 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 12713155 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12713172 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12713198 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 12713199 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 12713242 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 12713253 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12713256 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12713307 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 12713341 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 12713343 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 12713394 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 12713571 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12713580 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12713595 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 12713603 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 12713625 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12713633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12713651 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12713694 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12713743 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 12713890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12713919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12713922 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12714014 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12714109 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12714237 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12715094 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12715101 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12715180 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12715195 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12715289 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12715362 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12715497 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12715503 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12715626 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12715651 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12715668 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12715782 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12715795 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 12715796 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 12715989 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12716038 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12716105 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 12716245 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12716279 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12716288 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12716292 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12716439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12716449 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12716495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12716529 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12716550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12716574 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12716628 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 12716893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12716899 G T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12716925 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12716967 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12717082 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12717098 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12717102 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12717132 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12717572 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12717580 A T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12717746 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12717763 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 12719247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12720006 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12720319 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 12720381 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 12722264 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 12722756 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12722842 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12723169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12723769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12724216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12725126 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12725653 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12727418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12729362 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12730659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12731796 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12736057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12742259 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12742414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12742493 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12742891 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 12742905 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 12743498 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 12743910 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 12743947 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 12743964 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 12744064 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 12744165 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 12744637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12744655 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 12744880 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 12745094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12745145 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 12745167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12745480 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 12745549 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12745812 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 12746177 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12746184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12746335 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12746452 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12746780 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 12746807 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12746902 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 12746978 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12746981 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12747073 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12747135 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12747205 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12747259 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12747273 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12747293 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12747304 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12747337 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 12747338 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 12747391 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 12747404 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12747406 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12747528 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12747592 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12747608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12747634 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12747655 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12747750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12747804 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 12747962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12747967 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12748015 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12748129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12748202 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 12748438 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12748600 C G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 12748602 A T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 12748616 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 12748643 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12748673 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12748680 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12748741 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 12748846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12749138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12749503 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 12749638 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 12749661 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12749662 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12749897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12750229 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 12750346 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12750433 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 12750517 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12750537 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12750628 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 12750655 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 12750687 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12750715 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12750738 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12750890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12751008 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12751407 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12751594 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 12751639 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 12751825 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12751886 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 12752081 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12752083 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 12752095 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12752127 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 12752267 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12752294 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12752370 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12752426 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12752465 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12752914 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12753800 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 12754088 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 19 12754424 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 12754426 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 12754430 C G Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 12754469 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12754812 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12755008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12755412 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12755472 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12755511 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12755740 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12755930 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12756008 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12756082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12756217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12756270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12756528 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12756648 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12756658 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12756685 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12756952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12757069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12757153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12757749 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12757967 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 12758204 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12758257 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 12758489 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12758715 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12758731 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12758804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12758896 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12758934 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12758964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12759002 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12759086 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12759200 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12759202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12759203 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12759216 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12759229 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12759554 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12759983 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 12760381 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 12760746 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 12760832 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 12760931 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 12760997 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 12761101 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 12761275 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 12761542 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 12761547 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12761632 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12761636 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 12761695 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12761793 A T N N 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 5 9 0 5 2 19 12762009 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 12762230 C A N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 19 12762275 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 12762415 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12762626 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 12762718 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 12762728 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12762830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12762893 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12763012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12763018 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12763084 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12763104 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12763255 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 12763297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12763687 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12763712 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12764138 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 12764448 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12764753 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12764772 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 12764914 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12765777 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12765791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12766096 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12766207 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12766277 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12766318 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12766842 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 12766990 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12767230 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12767234 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12767306 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12767859 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 12767888 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12768067 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12768111 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 12768228 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 12768336 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12768339 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12768410 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 19 12768465 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 12769312 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 12769476 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 12769664 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 12770437 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12770725 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12771468 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 12771486 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12771540 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 12771553 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 12771647 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 12771669 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12771689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12771943 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12772805 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 12772939 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 12773469 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 12773489 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 12773504 A C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 12773534 C A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 12773619 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12773628 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12773644 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12773654 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12773697 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12773720 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12773800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12773828 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12773963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12774014 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12774044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12774050 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12774218 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12774239 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12774280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12774381 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12774453 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12774478 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12774504 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12774523 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 12774524 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 12774543 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12774572 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12774622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12774672 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 12774679 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12774743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12774748 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12774854 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12774858 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12775104 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 12775187 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12775196 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 19 12775231 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12775249 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12775254 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12775326 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 12775368 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12775412 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12775452 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12775461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12775539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12775786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12775798 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 12775857 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 12775878 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12775926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12775969 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 12775997 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 12776007 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 12776036 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 12776070 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12776085 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12776227 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12776250 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12776251 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 12776276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12776306 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 12776319 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12776330 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12776383 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 12776388 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 12776407 A T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 12776453 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 12776738 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 12776745 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 12776748 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 12776776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12776913 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12777099 G T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 12777123 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 12777234 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12777428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12777502 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12777523 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12777576 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 12777756 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12777801 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 12777802 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 12778043 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 12778062 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 12778245 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 12778246 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 12778465 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 12778505 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 12778638 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 12778642 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 12778658 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12778675 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 12778747 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 12778766 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12778783 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 12779049 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 12779051 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 12779055 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 12779084 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 12779115 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 12779243 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 12779468 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12779612 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12780007 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12780039 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 12780045 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 12780054 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12780070 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12780090 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12780106 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 12780122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12780129 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 12780192 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12780273 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 12780277 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 12780308 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 12780320 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12780407 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 12780412 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12780438 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 12780452 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12780473 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 12780486 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12780514 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 12780549 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 12780683 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12780692 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12780702 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12780734 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 12780883 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12780906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12780934 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 12781007 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12781116 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 12781169 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12781185 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 12781368 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 12781463 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 12781499 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12781503 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12781526 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12781557 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12781683 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 12781817 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12781931 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 12782233 G C N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 19 12782591 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 12782783 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12782970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12783184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12783402 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 12783413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12783524 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 12783591 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12783792 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 12784192 T G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 12784228 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 12784251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12784394 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 12784397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12784408 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 12784526 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 12784569 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 12784641 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 12784905 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12785014 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 12785157 C T N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 19 12785819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12785909 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12786127 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12786161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12786229 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12786274 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12786616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12786663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12786839 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 12786911 C A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 12787836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12787870 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12787948 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12788109 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12788272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12788383 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 12788510 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 12788693 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 12788751 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12788805 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12788886 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12788917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12789348 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12789376 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12789717 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12789800 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12789847 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12789912 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12790040 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 12790145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12790239 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12790297 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12790314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12790332 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12790579 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 12790811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12791083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12791725 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12791945 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12792078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12792735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12792852 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12792957 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12792987 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12793816 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12794343 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12794516 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12794696 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12795057 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12795099 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 12795343 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 12795376 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 12795705 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 12795756 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12795950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12796229 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12796589 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12797564 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12797649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12797675 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12797684 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12797854 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12798780 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12799310 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12799398 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12799704 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 12800132 T C N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 19 12800297 A G N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 19 12800336 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 19 12800373 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 12800379 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 12800416 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 12800438 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12800458 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12800685 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12800687 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12800701 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12800755 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12800783 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 12800795 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 12800820 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 12800849 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 12801034 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12801053 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12801085 T A Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 12801178 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 12801303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12801758 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12801982 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12801989 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 12802067 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 12802692 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12802905 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12802984 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12803096 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12803097 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12803116 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12803579 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 12803685 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12803887 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12804099 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12804711 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12804713 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12805788 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12806043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12806144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12806265 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12806580 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12806731 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12808704 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12809047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12809134 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12811077 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12811985 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 12812090 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 12812133 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 12812586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12812609 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12813237 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12813472 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12813773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12814699 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 12815292 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 19 12815333 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12815388 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12815634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12815950 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 12816138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12816156 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 12816242 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 12816278 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 12816282 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 12816287 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 12816436 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 12816552 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 12816695 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12816735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12816855 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 12816878 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12816898 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12817000 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 12817103 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 12817282 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 12817537 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12817581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12817619 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12817622 C G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12817652 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12817669 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12817738 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12817771 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 12818190 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12818254 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 12818257 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 12818313 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 12818511 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12818721 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 12818722 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 12818837 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12819348 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12819363 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12819701 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12819870 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 12820103 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12820131 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12820265 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12820495 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12820756 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12820802 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12820836 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12820925 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12821061 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12821073 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12821087 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12821246 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12821395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12821481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12821538 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12821543 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12821724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12821830 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12822126 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 12822668 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 12822941 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12823087 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12823095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12823307 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12823328 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12823341 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12823608 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12823910 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12823912 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12824023 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12824066 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12824106 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 12824132 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 12824179 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 12824363 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 19 12824365 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 19 12824828 G T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 12824911 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 12824995 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 12825122 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 12825181 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12825205 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12825238 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12825299 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12825302 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12825530 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12825568 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12825579 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12825616 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 12825627 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 12825748 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 12825843 G A N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 19 12825903 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 12826080 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12826440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12826571 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 12826584 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 12826596 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 12826634 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 12826699 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 12826735 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 12826887 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12827024 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12827129 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12827156 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12827177 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 12827800 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 12827855 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12827863 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12827899 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12827950 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 12827985 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 12828097 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12828190 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 12828241 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 12828279 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 12828284 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 12828492 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12828509 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12828511 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 12828683 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12829353 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12829356 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 12829965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12829998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12830093 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12830400 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12830666 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12830911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12831119 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12831307 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12831352 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12831550 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12831691 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12832369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12832434 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12832512 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12832513 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12832709 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12832822 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12832850 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12833830 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 19 12834692 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12835472 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12836154 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12836628 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12836658 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12837623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12839091 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12839326 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12841707 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12842054 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12842589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12845307 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 12845477 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12846760 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12849984 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12850425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12852074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12854707 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12855289 T A Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 12855348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12855812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12857615 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 12859265 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12860510 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12861506 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12861991 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12862300 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 12863370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12866592 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12867676 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12868783 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12868868 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12868987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12870909 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12871066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12873144 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 12873149 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 12873310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12873408 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12873723 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 12874585 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12875208 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 12877049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12877218 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12877285 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12878362 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12878409 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12878842 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 12879094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12879206 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 12879218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12879378 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 12879453 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12879454 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 12879809 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 12880264 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12880302 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12880611 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12880732 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 12880761 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 12880871 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12881356 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12882490 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12882911 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12883268 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 12883419 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 12883738 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 12886321 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12887090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12887412 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12888578 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12890920 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12891228 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 12891663 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12892137 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 12892411 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 12892812 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 12893561 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12894786 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12895289 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 12895836 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 12898228 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 12898372 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 12898631 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12898633 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12898698 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12898778 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12898838 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12898998 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12899011 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12899416 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 12899465 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12899546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12899698 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 12899800 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12899887 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12899968 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12900182 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12900198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12900405 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12900527 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12901880 A T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 12903614 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 12903662 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 12903668 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 19 12903795 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12904164 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12904230 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12904318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12904613 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 12904683 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 12904856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12904942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12905381 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 12905390 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12905847 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12905857 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 12905955 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12906049 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12906180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12906222 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12906315 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12906402 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12906414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12906469 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12906502 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12906503 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12906535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12906550 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12906694 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12906708 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12906730 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12906737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12906950 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 12906981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12907162 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12907442 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12907551 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12907571 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12907622 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12908055 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12908138 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12908222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12908353 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 12908380 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12908566 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 12908586 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 12909077 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12909181 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12909184 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12909255 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 12909264 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 12909274 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 12909327 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 12909339 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12909439 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12909463 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 12909494 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 12909496 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 12909534 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 12909620 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12909740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12909787 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 12909852 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12910015 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 12910091 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 12910639 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12910718 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 12910861 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 12910940 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12910959 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 12911006 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12911007 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 12911021 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 12911071 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 12911372 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 12911377 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 12911496 G T Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 12911502 A C Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 12911663 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12911788 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 12911948 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12911973 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 12911999 C G Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 12912092 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12912404 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12912412 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 12912489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12912587 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12912794 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 12912996 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 12913654 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 12913674 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 12914213 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 12914476 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 12914531 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 12914886 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 12915263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12915575 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12916240 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 12916306 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 12916504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12916527 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 12916554 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 12916663 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 12916684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12916813 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 12916894 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 12917025 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 12917138 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 12917670 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 12917700 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 12918713 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12918949 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12919212 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12919336 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 12919480 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 12919524 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 12919595 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 12919603 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 12919627 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 12919839 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 12919896 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12920427 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12920468 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12920588 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12921981 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12922157 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 12922617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12923179 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12923960 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12923979 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12924270 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12924327 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 12924505 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 12924517 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12924580 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12924774 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 12924923 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12924987 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12925014 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 12925016 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12925018 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 12925019 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 12925124 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12925144 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12925191 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12925192 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 12925203 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12925250 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 12925398 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12925404 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12925440 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12925521 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12925552 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12925584 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12925720 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12926122 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 12926143 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 12926542 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 12926571 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12926701 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 12926788 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 12926809 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12926851 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12927398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12927850 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12927875 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12928090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12928351 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 12928774 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12930340 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 19 12931204 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12931568 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 12931739 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 12932338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12932744 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12932903 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12932964 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12933055 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12933194 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12933217 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12934761 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 12935046 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12935508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12935671 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12937034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12937712 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12938512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12940393 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12941251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12941269 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 12941748 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12942111 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12952399 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12953524 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12953653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12954772 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 12955791 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 12957389 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12958183 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12958613 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12959010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12961809 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12964645 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 12965243 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12965257 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12965375 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 12965586 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12965773 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12966095 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12966854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12966918 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12967416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12967776 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12967981 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12968048 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 12968053 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12968067 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 12968074 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12968187 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 12968569 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 12968898 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12968957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12969028 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 12969039 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12969247 T C Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 12969594 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 12969706 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 19 12969737 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12969928 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12970091 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12970256 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 12970274 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 12970284 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 12970289 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 12970291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12970454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12970622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12970635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12972648 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12973787 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 12973941 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12974247 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 12974922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12974974 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12974991 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12975004 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 19 12975022 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12975209 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 12975278 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12976402 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 12976619 G T N N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 19 12977027 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12977175 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12977496 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12978486 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 12982126 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 12983383 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12984432 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 12984451 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 12984567 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 12984871 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 12984965 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 12985131 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12985277 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 12985403 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 12985496 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12985514 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12985673 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12985753 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 12985771 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 12985782 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 12985964 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 12986304 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12986320 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 12986544 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 12987026 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 12987116 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 12987362 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12987375 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 12987376 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12987402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12987538 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 12987683 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 12987715 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 12987832 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12988889 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 12989114 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12989141 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12989488 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12989535 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 12989548 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 12989634 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 12989962 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 12990535 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12990547 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12991117 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 12991273 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 12991392 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 12991414 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12991470 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 12991576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12992001 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 12992735 C T N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 12992987 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 12994099 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12995017 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12995429 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 12995468 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12995677 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 12995818 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 12996073 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 19 12996115 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 12996840 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12996878 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 12997356 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12997469 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12997889 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 12997950 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 12998107 T G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 12998116 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 19 12998188 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 12998395 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 12998409 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 12998496 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 12998574 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 12998621 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 12998623 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 12998633 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 12998637 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 12998694 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 12998817 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 12998915 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 12998927 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12998953 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12999082 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 12999192 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12999255 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 12999326 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 12999426 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 12999686 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 12999867 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 13000084 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13000642 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 13000657 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13000734 A T N N 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 19 13000769 T C N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 19 13001199 G C N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 13001478 A C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 13001706 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13001943 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13002202 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13002219 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13004267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13004433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13004540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13004901 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13005072 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13005091 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 13005581 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13006008 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13006019 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13006764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13006814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13006953 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 13007005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13007217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13007227 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 13007397 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13007442 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13007453 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13007503 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13007681 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 13008265 C G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 13008340 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 13008930 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13009370 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 13010279 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 13010529 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13010600 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 13010680 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13010920 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13011108 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13012085 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 13012668 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13012692 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13012818 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13013261 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 13013876 T C Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 13014278 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 13014809 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 13015184 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 13015194 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13015442 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13016196 A G Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 13016197 T G Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 13016629 T C Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 13017227 C A Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 13017978 G A Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 13018101 T C Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 13018205 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 13018270 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 13018469 G A Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 13018574 A T Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 13018588 T C Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 13020440 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 19 13020695 T C Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 13020939 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 13021433 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 13022709 C A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 13022992 T A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 13024880 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13024881 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13026111 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13027298 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13027871 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13028484 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13032009 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13032925 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13033342 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13033816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13033897 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 13034335 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13036846 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13036859 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13037226 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13037711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13038498 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13041128 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13042721 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13042886 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13042887 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13042920 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13042966 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13043920 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13044567 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13045209 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13045297 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13045395 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13052969 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13053064 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13053234 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13053415 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13055954 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13056468 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 13056526 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 13058232 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13058327 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13058757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13058962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13059294 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13059362 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13059956 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13060852 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 13061522 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13062724 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13065575 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13070239 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13071295 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 13074515 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13075121 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13075730 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13076621 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13077729 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13078114 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13078875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13079147 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13079755 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13082252 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13082315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13083105 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13085173 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 13085574 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13085922 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13087022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13088364 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13088382 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13091904 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 13092169 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 13092262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13092428 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 13092433 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 13092469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13092660 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 13092844 C A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 13092931 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 13093031 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 13093265 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 13093403 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 13093538 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 13093777 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 13093800 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 13093861 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 13093887 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 13094035 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 13094171 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 13094308 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13094584 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13095125 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13095659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13096544 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 13101442 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 13101827 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13101943 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13101976 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13101977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13102110 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 13102746 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13102840 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13102877 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 13102897 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13102977 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 13103276 A C N N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 19 13103302 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 19 13103308 T G N N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 19 13103319 G T N N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 19 13103328 G A N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 19 13103354 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 19 13103380 T C N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 19 13103392 C G N N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 19 13106001 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 19 13106091 A T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 19 13106096 G T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 19 13106114 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 19 13106118 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 19 13106119 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 19 13106134 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 19 13106726 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13106744 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 13107148 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 13107149 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 13107243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13107470 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13107545 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 13107559 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13108141 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 13108371 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13108881 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 13108899 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 13108980 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 13109022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13109216 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 13109230 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 13109234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13109257 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 13109270 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 13109290 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 13109391 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 13109406 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 13109538 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 13109668 A C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 13109681 G C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 13109811 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 13109908 A T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 13109939 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 13110041 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 19 13110042 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 19 13110077 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 13110180 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 13110697 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13110792 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 13111082 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 13111111 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13111739 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13111749 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13112053 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13130943 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13130961 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 13131564 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13131781 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 13131827 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 13132140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13132188 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 13132189 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 13132225 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13132311 T A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 13132557 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13132563 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13132806 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13132860 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13132914 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13132939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13132950 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13132979 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 13133145 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13133159 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13133225 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13133264 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13133280 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13133355 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13133496 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13133551 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13133581 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13133586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13133604 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13133629 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13133633 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13133655 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13133665 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13133719 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 13133812 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13133828 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 13133829 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 13133842 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 13133861 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 13133886 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 13133909 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 13133968 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 13133970 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 13133981 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 13134045 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 13134228 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 13134229 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 13134312 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 13134322 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13134345 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 13134422 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 13134474 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 13134480 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 13134533 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13134549 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 13134602 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 13134618 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 13134621 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13134667 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13134678 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13134706 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13134729 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13134745 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13134764 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13134864 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13134873 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13134902 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13134903 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13134912 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13134964 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13134975 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13134986 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13135067 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 13135346 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13136286 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 13137253 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13137492 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13137519 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13137527 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 13137528 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 13137632 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 13137738 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 13137843 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 13137914 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 13139321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13139842 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 13139988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13140001 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 13140492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13140531 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 13140782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13140816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13141610 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 13141839 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13141916 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 13141988 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 13142004 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 13142164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13142424 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13142552 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 13142681 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 13142990 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 13143024 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13143509 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 13143813 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13143993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13144280 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 13144545 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13144564 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13144644 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13144706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13144747 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13144759 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13144819 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13145274 G A N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 13145604 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 13145679 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 13145708 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 13145715 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 13145997 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 13146000 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13146807 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13146931 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13147578 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13147824 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13148012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13148044 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 13148260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13148328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13148883 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13149249 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 13149323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13149354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13149711 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13153239 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13153320 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 13153516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13154013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13154799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13155088 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13155393 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 13155793 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13156259 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13156307 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 13156436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13156765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13156768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13157123 G T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 13157326 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 13157329 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 13157511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13157763 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13157854 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13157862 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 13157942 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13158174 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 13158382 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 13158400 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13158562 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 13158903 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 13159202 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 19 13159279 C A Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 13159361 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13159561 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13159666 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13159798 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13160776 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13160845 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 13161510 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13161531 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13161605 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 13161823 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13161936 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13162728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13163218 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13163660 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 13163981 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 13163988 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 13164147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13164629 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13164695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13165074 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13165338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13165573 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 13165710 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13165741 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 13165830 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 13165962 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13166778 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13166859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13167290 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13167331 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 13167594 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13167668 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 13167709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13168180 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13168332 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 13168673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13169152 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13169419 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13169557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13169558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13169597 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13169933 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 13170334 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13171347 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13171419 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 13172754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13173372 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 13173832 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 13173835 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 13174650 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13175470 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 13175475 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13177766 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13177819 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13177866 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 13178588 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13179070 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 13179442 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13180807 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 13180809 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 13181066 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 13181211 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13182505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13182649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13182796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13183043 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13183279 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13183312 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13184528 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13185942 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13187451 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13188327 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13188879 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13189343 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13190107 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13190339 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13190497 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13190909 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13191058 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13191156 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13193720 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13202385 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13204240 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13204460 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 13204872 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13205024 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13205154 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13205778 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13205944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13205964 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13206420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13207571 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13207654 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13207705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13207735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13208125 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13208261 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13208514 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13209520 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 13209925 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13210075 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13210635 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13211231 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13211415 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13211651 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 13222090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13224983 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13227058 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13227291 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13228791 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13229920 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13235642 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 13236099 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13237814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13238999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13242338 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 13242845 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13243010 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13243277 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13243626 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13244683 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13246396 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13246616 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 13246688 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 13247549 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13248034 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13248729 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13249436 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13249510 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 13250294 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13251104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13251785 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13251887 G C Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 13252262 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 13252879 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13253146 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13256516 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13258241 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13258484 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13259649 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 13261911 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13262637 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13265500 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13265517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13268023 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 13268130 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13269093 T G N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 13269135 C G N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 13269295 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 13269629 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13271045 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13273101 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13273346 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13274155 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13276111 A C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 13276181 A T N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 19 13280430 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 13281180 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13282865 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13283528 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13283587 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13290995 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 13291088 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13292204 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13293415 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13293869 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13295062 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13296128 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13296174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13296294 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 13297824 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13298304 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13298570 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13298787 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13300928 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 13301731 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13302046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13302505 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13302631 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13303438 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13304702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13305339 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13308658 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13309481 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13310678 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13311975 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13311979 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13312184 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13312383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13312899 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13313181 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13313506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13314026 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13314319 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13314750 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13315729 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13316716 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13317466 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13317893 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13322145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13322249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13322804 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13322922 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13323151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13323333 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 13330963 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 13331014 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 13331947 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13332024 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13332262 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13334403 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13334789 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13336782 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13336892 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13337385 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13338302 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 13339328 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13339473 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13339606 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 13340178 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13340718 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13340749 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13340822 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 13346574 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 13347288 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13349942 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13350230 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13350420 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 13350767 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13353111 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 13353308 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 13354264 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13354798 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 13354882 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13356424 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13358312 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 13360511 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13361578 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 13367277 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13367347 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13367354 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13367807 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13368306 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13368512 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 13370700 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13370791 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13376421 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 19 13376667 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13377074 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13377143 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13377777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13377833 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13378396 A C N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 19 13378789 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 13379973 G T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 13382636 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 13382651 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13382780 G C N N 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 19 13385969 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13386149 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13386794 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 13387625 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 13388646 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 13388851 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13389156 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13393693 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 13394084 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13394137 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13395255 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13395662 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13398344 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13399967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13400018 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13401468 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 13401824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13402138 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13402403 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13403117 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13408160 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13410817 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13411018 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13411329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13413603 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13414208 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13414342 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13414519 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13416615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13417717 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13417885 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 13418275 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13418279 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13418437 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13419673 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13419922 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13420763 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13421455 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13421839 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13422102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13422905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13422993 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13423281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13423772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13424068 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13424583 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13424705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13425058 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 13425077 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 13425082 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 13425330 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13425375 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13425403 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13425581 T A N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 19 13425661 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13425761 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13426205 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 13426289 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 13426377 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 13426425 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 13426456 G T Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 13426808 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 13432987 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 13433371 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13433461 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13433527 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13433532 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13433653 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13433752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13433800 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13434100 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 13434105 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13434106 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13434133 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13434322 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 13434808 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13434836 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13435020 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 13435057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13435117 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13435127 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13435148 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13435189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13435239 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13435463 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13435710 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13435716 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13436074 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13436105 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13436178 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 13436247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13436288 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 13436519 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13436553 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13436661 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13436935 G A N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 19 13437278 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13437631 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13437734 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13438354 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13438807 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 13438892 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13439181 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13440321 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13440322 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13440439 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13440507 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13440810 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13440826 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13440830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13440926 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 13440967 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13440968 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13441128 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13441839 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13441863 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13441880 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 13442127 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 19 13442238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13442336 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 13442387 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13442575 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13442634 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13442949 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13443154 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13443207 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13443382 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13443494 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 13443522 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13443664 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13443796 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13443893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13443934 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13444065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13444496 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13444809 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 13445034 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13445239 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13445367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13445468 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13445537 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 13445577 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 13445967 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 13446260 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13446315 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13446977 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13447029 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13447862 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13448023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13448373 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13448598 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13448857 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 13448897 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 13449098 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 13449333 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13449413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13449916 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 13450558 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13450706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13451037 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 19 13451158 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 13451166 T G N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 19 13451652 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 13451836 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 13453106 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13453212 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13453383 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13454347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13454436 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 13454610 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13454709 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13455811 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13456669 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 13457469 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 13457988 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13457997 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13458294 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 13458447 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13458640 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13458826 C A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 13458827 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 13458830 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 13459466 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13459954 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 13460398 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 13460520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13461403 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13461425 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13462018 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13462236 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 13462393 A T N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 13463728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13463923 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13464216 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13464242 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13464293 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13464430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13464505 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13464651 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13464668 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13464958 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13465748 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13465833 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13465844 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13466223 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 13466521 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13466591 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13466702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13466703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13466958 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13466962 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 13467283 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13467406 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13467625 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13467735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13467853 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13468090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13468277 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 13468579 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 13469001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13469322 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 13469703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13469791 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13469974 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13470021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13470253 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 13470260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13470558 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 13471303 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 13471436 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 13471694 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13471771 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13471821 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13471852 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13471957 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13471990 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13472226 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13472499 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 13472565 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 13473107 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13473150 C T N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0 0.615384615384615 0.384615384615385 8 18 0 8 5 19 13476567 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13477115 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 13477337 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13477410 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 13477688 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13477952 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 13478052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13478128 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 13478146 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 13478217 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 13478522 G C N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 19 13478550 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 19 13478562 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 13478689 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 13478903 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 13478949 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 13479013 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 13479071 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 13479113 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13479258 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 13479376 G T N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 13479392 C G N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 13479538 T G Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 13480198 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13480433 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 13480499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13480567 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13480600 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13480602 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 13480645 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13480869 G T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 13481241 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 13481407 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13481655 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 13482236 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13482271 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 13482324 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 13482560 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 13482569 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 13482599 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 13482973 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13483164 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13483179 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 13483421 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13483533 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 13483577 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 13483922 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 13484525 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 13484537 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 13484619 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 13485060 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 13485084 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13485090 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13485476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13485858 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 13486155 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 13486223 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 13486281 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 13486350 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 13486371 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 13486530 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 13486666 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 13486755 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 13486798 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 13486851 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13486858 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 13486936 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 13486972 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 13487490 T A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 13487527 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 13487604 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 13487825 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 13487897 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 13488020 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13488038 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13488310 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 13488311 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13488437 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13488519 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13488643 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13488817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13488861 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13488948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13489043 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13489051 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13489118 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13489148 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 13489298 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13489329 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13489362 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13489383 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 13489386 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13489399 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13489438 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13489455 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13489547 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13489560 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13489622 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13489640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13489668 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13489711 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 13489748 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13489988 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13490140 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13490172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13490194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13490281 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13490346 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13490410 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13490528 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13490537 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13490564 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13490585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13490622 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 13490669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13490677 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13490685 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13490711 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13490785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13490788 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13490825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13490858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13491000 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13491038 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13491105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13491142 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13491349 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13491384 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13491409 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13491501 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13491632 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13491767 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13492053 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13492169 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13492342 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13492357 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13492528 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13492593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13492624 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13492685 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13492785 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13492796 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13492917 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13492925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13492932 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13493005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13493044 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13493100 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13493195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13493304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13493307 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13493378 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13493415 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13493495 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13493514 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 13493536 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13493537 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13493578 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13493699 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13493844 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13493857 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13493948 G C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 13494048 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13494225 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 13494241 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 13494251 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 13494819 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13494820 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13495008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13495037 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13495068 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13495069 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13495139 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13495251 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13495445 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13495608 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13495874 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13495936 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13496426 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 13496488 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13496522 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13496536 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13496543 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13496606 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13496696 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13497234 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13497247 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13497384 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 13497403 G T Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 13497512 C T Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 13497516 A G Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 13497604 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13497731 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13497815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13497910 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13497950 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13498155 G T Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 13498321 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13498388 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13498499 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13498652 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13498678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13498691 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13498880 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13499001 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13499097 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13499324 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 13499389 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13500074 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13500638 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13500644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13500926 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 13500932 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 13501164 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13501284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13501420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13501965 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13502087 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 13502162 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13502514 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 13502787 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13503363 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13503809 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13503981 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13504572 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 13504653 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13504971 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 13505041 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13505071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13506015 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13506110 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 13506171 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 13506285 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 13506477 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 13506586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13506611 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 13506869 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13506903 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13506932 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13507146 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 13507158 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 13507159 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 13507289 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13507635 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13507729 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13507765 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13507785 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13507962 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13507963 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13508860 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13509635 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13510292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13511285 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 13511375 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 13511997 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 13512378 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13512409 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13513110 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 13513137 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13513351 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13513526 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13514413 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13514624 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13514762 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 13515285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13515508 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 13515750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13516458 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13516630 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 13517140 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 13517367 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 19 13517368 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 19 13517935 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13517936 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13518135 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13518264 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13519354 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13519432 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13520456 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13520657 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 13520762 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 13520858 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 13520872 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13521170 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 13521345 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13521543 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13521872 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13522147 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13522441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13522521 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 13522671 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13522767 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 13523036 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13523126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13523595 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13523611 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13523724 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13524152 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 19 13524244 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13524310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13524778 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13524972 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13525298 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13525757 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13525814 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 13526920 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 13527523 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13527746 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13527821 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13529430 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13529660 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13529713 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13529714 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13529748 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13529842 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13531266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13534591 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13535776 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13537924 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13538428 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13538977 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13539384 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13539413 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13540109 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13541947 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13542407 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 13542674 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13542695 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13543950 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13544994 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13545566 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13547278 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13553331 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13558004 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13558221 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13564278 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 13567118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13567978 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13570826 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13571459 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13571531 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13572226 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13572547 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13572776 T C N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 19 13574914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13576713 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 13580101 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 13581245 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13581246 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13582617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13586918 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13593064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13598615 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13601941 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13603793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13616794 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13624491 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13626321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13630242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13630693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13644788 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13645075 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13645171 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13645240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13647786 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13648524 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13653522 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 13653734 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 13653831 G A N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 13664327 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13664567 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13664961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13666197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13671014 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13671731 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 13673788 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 13674614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13675139 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13680456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13681356 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13683394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13683706 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13688057 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13689086 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13692068 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13693233 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13700635 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13703809 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13708938 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13710943 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13725609 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13726836 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13726971 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13736826 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13737653 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13738990 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13739000 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13739455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13739458 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13740978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13742171 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13742286 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13743977 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 19 13745098 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13745215 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13745315 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13747476 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13753968 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13757776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13758498 G T Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 13758873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13778929 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13783380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13783426 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13785186 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13787764 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 13790113 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13794110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13797453 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 13799657 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13800673 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13801298 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13801937 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13802888 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13803218 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13803795 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13804079 C G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13804438 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13805628 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13806349 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13806871 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13807411 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13807872 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 13809396 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 13810575 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13810677 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13812084 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13812372 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13813887 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 13816088 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13818908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13819839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13822397 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 13823096 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13823736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13825949 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13826061 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13826792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13826811 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13827556 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 13828272 G A Y Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 19 13829510 A C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 13829648 A C N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 13832278 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 13832439 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13832869 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 13833272 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13833732 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 13834183 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13837560 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 13838838 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13838904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13838954 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 13839478 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 13840034 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13840309 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 13840386 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13840558 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 13841717 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13842431 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 13842790 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13844688 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13851977 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13852150 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13852469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13852677 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13852879 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13853364 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13853416 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13853825 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 13853831 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 13854003 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 13854031 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 13854107 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 13854185 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 13854205 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13854230 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 13854273 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13854844 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13854875 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 19 13854931 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 13854999 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 13855227 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 13855538 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 13855541 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 13855802 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 13856074 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 13856085 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 13856280 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 13856422 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13856726 G A N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 19 13857001 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 13857188 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 13857265 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 19 13857327 A C N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 19 13857607 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 19 13857719 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13858071 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 13858737 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13858759 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 13858825 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13859050 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13859775 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13859829 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13860702 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 13861192 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 13863107 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 13863717 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 13864024 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13864144 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 19 13864219 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 13864361 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13864528 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13865379 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 13865563 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 13865749 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13865750 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13865825 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 13866267 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13866694 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 13866715 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 13866731 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 13866952 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13867710 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13868461 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13868615 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13868647 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13869221 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 13869740 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 13870554 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 13870742 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13870818 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 13870868 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13871201 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 13871572 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13871602 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 13872346 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 13872461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13872753 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 13872960 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 13873179 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13873766 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13874004 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 13874337 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13876642 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 13876933 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 13876981 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13876986 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 13877082 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 13877096 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13877098 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13877117 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 13877250 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13878137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13879450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13881117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13881854 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13881877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13882007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13882681 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13884230 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13884520 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13884818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13885032 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13885054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13885946 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13887732 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13887794 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 13887937 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13888014 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13889018 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13889162 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 13890168 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13890335 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13890644 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13892562 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13893950 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13894952 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13895631 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13898051 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13900861 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13901494 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 13902147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13902938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13903183 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13904495 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13904909 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 13905106 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 13905168 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13908921 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13909471 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 13910912 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13911095 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13911282 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 13911283 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 13911776 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 13911792 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 13911814 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13912077 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 13912135 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13912544 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13912654 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13912737 C T Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 19 13913479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13913726 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13913837 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13914477 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 13914948 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 13914968 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 13915069 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 13915164 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 13915172 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13915409 G A Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 19 13915630 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 19 13915687 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13916288 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 13916454 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13916551 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 13916612 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 13916826 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 13916904 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13918193 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13918359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13921602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13922064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13922134 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13923045 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13923050 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 13923301 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 13923343 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 13923784 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 13924000 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 13924053 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13924383 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13924890 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13924900 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13924938 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13924939 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13925169 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 13925176 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13925467 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 19 13925507 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 19 13925613 A T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 19 13925797 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 13925974 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 13926411 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 13926464 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 19 13926521 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 13926677 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 13926810 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 19 13926925 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 13927129 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 13927306 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13927503 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13927608 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 13927705 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13928376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13928671 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 13930404 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 13930964 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 13931339 C T Y Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 19 13931340 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 19 13931530 C G Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 13931544 G C Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 13931695 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13931878 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 13931890 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 13931899 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 13931905 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 13931998 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 13933202 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13933323 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13933462 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13933611 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13933711 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13933947 T A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 13934054 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 13934627 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 13934683 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13935141 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13935302 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 13935387 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 13935833 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 13937450 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 13937512 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 13937766 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13937813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13937883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13938072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13938083 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13938392 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13938517 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13938563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13938744 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13938937 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13938969 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 13939006 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13939064 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13939073 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13939170 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13939181 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 13939208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13939225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13939235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13939282 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 13939285 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13939295 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13939304 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13939403 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13939407 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13939428 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13939498 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13939526 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13939569 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 13939624 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13939644 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13939647 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13939743 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13939748 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13939756 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13939789 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13939835 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13939852 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13939864 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13939956 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13940036 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13940049 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13940058 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13940096 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13940116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13940175 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13940187 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13940194 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13940251 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13940261 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13940288 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13940319 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13940330 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13940540 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 13940640 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 13940650 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 13940672 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13940685 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13940738 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13940902 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13940933 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13940964 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13941026 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 13941080 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13941548 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13941554 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13941589 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13941660 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13941681 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13941686 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 13941694 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 13941728 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13941762 T G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 13941763 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 13941963 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 13941984 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 13942025 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 13942139 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 13942170 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13942178 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13942180 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13942201 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 13942231 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13942285 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13942324 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13942451 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 13942465 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13942467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13942512 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 13942517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13942564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13942592 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 13942615 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 13942688 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13942698 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 13942733 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13942753 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 13942780 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 13942795 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 13942797 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 13942841 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13942978 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13942979 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13943036 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13943103 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13943116 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13943121 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 13943134 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 13943139 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 13943153 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13943182 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 13943276 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 13943279 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 13943306 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 13943307 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 13943333 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13943369 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 13943480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13943485 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13943508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13943566 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13943605 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 13943606 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 13943617 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 13943631 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 13943638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13943657 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13943658 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 13943739 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13943741 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13943744 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13943766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13943837 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13943846 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13943860 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13943871 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13943912 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13943941 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13943956 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13943982 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13944000 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13944007 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13944018 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13944136 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13944173 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13944182 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 13944239 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13944242 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13944281 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13944396 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13944432 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13944440 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13944459 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13944527 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13944559 C A Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 13944660 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13944724 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13944764 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13944776 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13944843 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13944874 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13944889 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13944893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13944962 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13945005 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13945009 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13945018 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13945071 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13945084 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13945090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13945117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13945224 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13945270 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13945275 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13945348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13945369 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 13945403 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13945454 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13945504 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13945505 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 13945583 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13945618 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 13945642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13945679 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13945703 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13945827 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13945838 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13945857 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13945874 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13945881 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13945888 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13945891 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13945925 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13945953 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13945962 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13945991 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13946016 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13946026 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13946049 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13946054 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13946115 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 13946117 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13946122 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13946812 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13946816 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13946915 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13946917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13946968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13946969 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13947120 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13947126 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13947327 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 13947378 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 13947418 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 13947498 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 13947701 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 13947721 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 13947739 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 13947762 G A Y Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 19 13947764 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 13947767 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 13947958 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 13948465 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13949458 T C Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 19 13949847 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13949855 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13950004 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13950179 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 13950188 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13950222 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 13950226 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13950237 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 13950246 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13951537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13951613 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13951712 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13951741 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13951761 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13951801 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13951822 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 13951849 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 13951866 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13951877 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13951958 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 19 13951980 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13952016 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 13952018 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 13952215 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13952219 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13952234 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13952341 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 13952375 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 13952518 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 13952567 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13952716 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13952720 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13952728 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13952729 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13952793 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13952867 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13952894 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 13952936 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13952951 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13952968 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 13953259 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 13953416 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13953449 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13953524 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13953582 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 13953606 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13953617 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13953641 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13953663 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13953707 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13953807 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13953816 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13953835 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13953860 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13954022 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13954131 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13954282 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13954314 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13954328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13954409 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13955000 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13955033 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13955157 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 13955266 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 13955316 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13956609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13956744 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13959671 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13960485 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13960640 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13960906 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13960918 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13961415 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13961452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13961458 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13961627 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13962149 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13962516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13962612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13962749 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13962751 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13962754 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13963006 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 13963162 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13963299 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 13963370 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13963401 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 13963448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13963510 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13963660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13963813 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 13963840 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 13963862 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 13963889 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13964081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13964512 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13964960 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13965353 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13965977 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13966042 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 13966053 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13966068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13966150 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13966155 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 13966925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13967075 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13967090 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13967153 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13967175 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13967245 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13967352 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13967382 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13967394 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13967454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13967456 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 13967464 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13967475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13967707 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 13967758 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 13967771 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 13968056 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 13968057 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 13968264 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13968340 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13968343 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13968633 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13968704 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0 0.75 0.25 12 20 0 12 4 19 13968791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13969059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13969256 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13969388 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 13969403 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 13969452 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13969456 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13970366 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13971710 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13971939 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13972541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13972748 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 13972954 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13973590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13981124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13982282 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 13982407 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13983167 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13983695 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13986220 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13986221 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13986312 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13986751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13986994 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13987855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13987902 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13988179 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13988617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13991810 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13993106 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 13994885 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13994952 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13995118 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13995148 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13995182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13995196 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 13995852 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 13995975 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13996141 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 13996193 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13996269 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 13997949 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14009999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14010651 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14011949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14012586 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14012597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14012656 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14012681 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14012735 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14012827 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14012846 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14012859 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14013264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14013297 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14013313 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14013365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14013392 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 19 14013403 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14013427 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14013434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14013464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14013472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14013477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14013526 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14013534 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14013538 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14013552 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14013902 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 14013972 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14013974 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14013983 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14013992 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14014031 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14014072 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14014080 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14014126 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14014174 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14014208 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14014214 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14014217 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14014535 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14014559 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14014631 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14014643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14014697 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14014736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14014789 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14014817 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14014861 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14014862 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14015027 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14015222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14015435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14015460 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14015469 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14015600 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14015812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14015908 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14015976 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14015980 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14016018 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14016028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14016040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14016044 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14016075 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14016143 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14016164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14016277 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14016278 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14016706 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14016796 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14016840 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14016848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14017023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14017057 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14017060 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14017074 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14017099 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14017182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14017196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14017258 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14017273 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14017281 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14017351 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 14017427 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14017479 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14017519 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14017627 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14017693 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14017712 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 14017722 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 14017727 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 14017783 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14017802 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14017833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14017888 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14017982 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14018295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14018348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14018369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14018370 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14018407 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14018572 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14018712 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14018782 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14019055 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14019331 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 14019790 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 14019908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14019909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14020027 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14020042 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14020074 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14020102 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 14020108 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14020114 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 14020295 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14020296 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14020337 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14020435 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14020479 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14020490 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14020600 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 14020697 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14020702 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14020703 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14020847 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 14020912 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 14020936 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 14020980 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 14021012 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14021036 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14021052 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14021127 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14021216 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14021449 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14021643 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14021664 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14022366 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14024798 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14024886 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14025085 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14025103 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14025200 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14025213 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14025220 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14025226 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14025321 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14025324 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14025369 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14025436 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14025460 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14025473 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14025549 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 14025553 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 14025574 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 14025584 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14025614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14025633 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14025648 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14025681 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14025751 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14025795 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14025796 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14025817 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14025847 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14025873 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14025885 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14025920 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14025929 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14025936 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14025966 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14026029 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14026093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14026124 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14026137 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14026187 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14026196 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14026277 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14026283 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14026337 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14026604 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14026698 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14026711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14026918 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 14026923 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14026993 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 14027001 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 14027096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14027125 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14027164 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 14027245 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14027487 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 14027515 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14027567 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14027570 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14027579 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14027615 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14027655 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14027802 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14027835 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 14027879 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14027978 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14028010 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14028068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14028076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14028230 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14028243 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14028285 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14028298 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14029032 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14029122 A T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 14029213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14029223 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 14029299 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14029319 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 14029322 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 14029452 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14029458 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14029536 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14029557 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14029679 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14029702 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14029819 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 14029832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14029966 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 14030018 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14030049 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14030055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14030060 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14030076 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14030104 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14030108 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14030163 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14030213 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14030220 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14030296 A T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 14030322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14030389 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14030414 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 14030416 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14030446 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14030453 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14030500 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14030578 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14030591 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14030622 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14030623 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14030886 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14030900 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14030967 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14030975 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14030994 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14031066 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14031098 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14031195 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14031238 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14031288 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14031370 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14031445 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 14031475 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 14031478 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 14031647 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 14031873 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 14031887 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14032055 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14032079 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14032145 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14032173 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 14032189 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14032190 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14032261 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14032277 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14032286 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14032309 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14032359 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14032399 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14032451 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14032470 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14032476 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 14032518 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14032550 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14032653 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14032680 C A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 19 14032700 C T N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 19 14032715 G T N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 19 14032734 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 14032748 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 14032753 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 14032766 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 14032914 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 14032930 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 14033027 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 14033048 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 14033069 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 14033078 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 14033090 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 14033136 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 19 14033181 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 14033261 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14033267 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 14033273 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 14033361 C A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 14033378 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 14033395 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14033579 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14033583 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14033591 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14033601 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14033624 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14033850 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 14033893 A C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 14033956 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 14034294 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14034405 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14034423 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14034466 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14034485 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14034487 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14034500 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14034542 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 14034707 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14034733 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14034737 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14034795 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14034842 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14035029 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 14035085 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14035148 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14035310 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14035316 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14035330 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14035377 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 14035378 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 14035410 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14035529 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 14035566 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14035569 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14035572 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 14035751 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 14036068 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 14036207 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14036251 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14036746 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14036796 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14036897 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14036950 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 14037501 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 14038260 C G Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 14038461 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 14038651 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14039193 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14039562 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14039666 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 14039945 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14040202 G A Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 19 14041450 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 14041477 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 14041545 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 14041612 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14042074 T G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 14046229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14048842 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14049081 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14049661 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14050136 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14050272 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 14050278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14050377 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14050430 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 14050474 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14051372 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14052886 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14053557 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14054180 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 14054294 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 14054380 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 14054603 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 14054651 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 14054932 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 14055085 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14055242 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14055250 T G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14055294 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14055357 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14055502 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 14055821 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 19 14055974 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 14055983 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 14056024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14056044 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14056293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14056558 A T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14056690 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 14056766 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14056885 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14056906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14056929 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 14056974 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14057617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14057672 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 14057713 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14058086 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 14058128 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 14059374 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14062677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14062768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14065167 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14065631 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14066324 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14066379 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14068185 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 14069202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14069257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14069323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14070287 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14070818 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14070883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14070934 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 14070939 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 14070957 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14070999 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14071488 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 14086128 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14086129 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 14086230 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 14086342 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14086425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14086549 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 14086741 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 14086960 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 14087231 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 14087338 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14088049 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14088481 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14088577 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14089019 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 14090337 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14090533 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14090658 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 14090713 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 14090922 A C N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 14091547 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14091575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14091612 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14091701 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14091772 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 14092299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14092649 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14094144 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14095852 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14097745 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14098228 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14098546 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14101110 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14101920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14102608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14104559 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14104624 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14106762 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 14107173 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14107200 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14107934 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14109316 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14109525 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14110782 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14110806 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14111558 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14111685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14112206 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14112256 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14113513 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14113974 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14114509 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14114626 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14114870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14115236 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14115498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14115554 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14115661 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14116312 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14117047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14117210 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14117312 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14117313 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14117454 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14117839 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14117969 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14118418 T A Y N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 19 14118837 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14119109 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14119192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14119378 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 14119402 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 14119547 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14119777 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14120150 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14120162 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14120171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14120286 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14120511 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14121022 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14121152 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 14123341 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 14123432 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14123576 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 14123600 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14123678 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14123790 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 14123807 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 14124217 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14124260 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14124352 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14124382 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14124467 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14124585 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14124593 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14125124 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14125131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14125135 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14125233 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14125278 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14125288 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14125579 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14125598 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14125600 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 14125649 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14125680 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14125713 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14125764 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 14125834 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 14126004 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 14126136 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14126220 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14126961 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14127161 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14127170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14127261 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14127421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14127563 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14127783 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14128134 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14128360 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14128364 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14128404 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14128602 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14128654 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14128712 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14129019 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14129204 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 14129516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14129634 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 14130054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14130126 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14130146 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14130238 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14130283 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14131652 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 14133245 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14133774 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14134383 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14135025 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14136128 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14136227 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 14136232 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14136264 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14136337 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 14136480 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14136491 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14137501 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14138037 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14139130 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14139995 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 14140406 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14140535 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 14141216 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14141226 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14141306 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 14141745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14141775 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 14142354 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14143038 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14143609 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14143803 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 14144937 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14145208 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14145653 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14145962 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14147324 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14147394 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14147487 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14148232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14148385 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14148891 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14150042 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14150861 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14151591 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 14152452 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 14153230 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14153312 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14154357 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14154415 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14154911 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14156845 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 14156855 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14156887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14157063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14157171 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14157367 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14157407 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14157434 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14157512 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14157517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14157644 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14157689 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14157699 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14158081 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14158204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14158205 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14159216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14159225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14159234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14159240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14159262 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14159263 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14159306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14159357 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14159376 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14159528 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14159800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14159883 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14160031 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14161665 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14162704 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14163539 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14163560 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14163803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14163954 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14165592 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14165670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14165990 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14166157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14166326 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 14166429 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 14166595 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 14166896 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 14166947 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 14167009 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14167165 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 14167167 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 14167247 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 14167596 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14167627 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 14167838 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14167876 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14167976 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14167988 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14168148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14168337 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14168408 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14168877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14170953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14173184 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14173275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14173490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14175106 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 14175561 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14175931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14176477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14177023 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14177703 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14180799 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 14182183 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14183829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14191504 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14192379 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14193170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14195891 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14196644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14201195 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14202465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14206064 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14207404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14210734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14212789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14213306 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14213635 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14214089 A C N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 14214585 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14214856 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14215260 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14216118 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14216307 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14216338 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14216445 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14216639 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14216735 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14216891 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14216937 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14217152 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 14217304 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14217308 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14217317 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14217473 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14217570 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14217596 C G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14217724 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14218020 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14218172 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14218412 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14218529 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14218581 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14218685 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14218960 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14218964 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14219004 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14219008 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14219040 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14219111 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14219180 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 14219202 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14219217 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 14219388 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14219496 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14219518 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14220167 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14220238 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14220758 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 14221193 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14221295 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14224042 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14224556 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14224745 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14224772 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14224791 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14224983 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14225091 C A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 14225310 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14225322 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14225344 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14225354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14225562 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 14225569 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14225867 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 14225870 G C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 14226003 A C N N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 19 14226065 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 14226073 G A N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 19 14226076 A G N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 19 14226170 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 19 14226218 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 14226280 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 14227398 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14227903 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14228133 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14228167 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14228336 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14228458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14229969 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14230183 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14231147 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14231333 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14231926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14232471 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14232566 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14232724 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 14233328 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 14233329 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 14233735 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14234853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14234896 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14235091 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 14235970 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14236870 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14238357 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14238760 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14238815 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14238991 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14239003 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14239203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14239651 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14239719 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 14239894 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14240218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14240629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14241193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14241284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14241474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14241496 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14241601 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14241730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14241779 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14241966 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 14241990 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14242106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14243090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14243203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14243640 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14244091 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14244331 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 14245061 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 14245242 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 14245489 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14245639 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14245974 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14245999 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14246190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14246236 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14246396 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14247745 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 14247912 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14247927 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14247963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14247972 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14247992 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14248115 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 14248129 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 14248221 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14248670 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 14248704 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14249082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14249084 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14249092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14249104 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14249197 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14249198 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14249234 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14249315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14249404 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 14249590 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 14249661 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14249818 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 14249942 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 14249944 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 14250012 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14250057 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14250115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14250124 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14250163 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 14250197 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14250416 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14250542 C A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 14250701 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 14250702 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 14250936 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14251098 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 14251110 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 14251175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14251376 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14251533 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14251593 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14251605 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14251656 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 14251659 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14251667 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 14251728 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14251928 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 14252096 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14252117 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14252180 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 14252349 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14252352 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14254727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14255305 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14255590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14255760 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14256492 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14256500 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14257053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14257847 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14258153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14258807 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14259714 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14260002 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14260132 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14260133 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14260171 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14260615 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 14260674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14261069 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14262166 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 14262226 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14262238 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14262420 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14262748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14262766 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14263011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14263022 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14263077 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 14263119 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14263244 A G N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 19 14263337 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 14263373 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 14263464 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 14263548 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14263596 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14263673 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14264205 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14264269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14264331 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14264554 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14264644 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 14264901 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 14265157 G T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 14265207 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 14265393 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 14265898 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14266699 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14267064 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 14267123 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14267193 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14267265 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14267436 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14267474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14267541 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14267578 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14267740 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 14267764 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 14267771 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 14267794 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 14267874 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 14267887 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14267908 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14267924 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14267944 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14267972 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14268062 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14268063 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14268312 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 14268315 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14268319 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14268321 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 14268378 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14268405 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14268435 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14268508 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14268692 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14268712 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14268713 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14268811 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14268832 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14268833 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14271228 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14272043 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14272378 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14272693 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14272741 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14272776 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 14272889 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14273128 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14273780 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14273842 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14273949 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 14274038 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14274261 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14274276 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14274294 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14274528 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14274552 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14274745 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14275105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14275586 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14275649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14275736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14275740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14275828 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14275896 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 14276046 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14276568 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14276849 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14278906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14279361 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14280254 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14280339 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14280631 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 14281114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14282426 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14283074 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14283753 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14283968 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14284028 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14286300 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14287252 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 14288243 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14288501 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14290629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14290937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14291254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14291554 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14295410 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14295770 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14296369 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14297199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14297403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14297442 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14298073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14298726 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14299126 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 14300966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14301821 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 14301904 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14301996 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 14302188 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 19 14302204 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 19 14302418 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 14302482 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 14302634 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14302814 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14309332 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14309701 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 14309866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14310429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14310471 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14310663 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14310741 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14310872 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14311835 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 14312178 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14312609 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14312788 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14313361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14313386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14313837 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14314052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14314915 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14315149 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14315451 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14316039 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14316414 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14316642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14318348 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14318532 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14318922 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 14319068 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 14319430 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 14319543 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 14319680 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 14319774 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 14320162 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 14320326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14320369 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14320665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14320944 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14322144 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14322305 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 14322846 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 14322918 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 14323066 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 14323241 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 14323351 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 14323396 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 14324141 A C Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 14324333 G T Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 14324345 C G Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 14324437 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 14324471 G A Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 14324474 C A Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 14324487 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 14324582 C G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 14324595 T C Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 14324638 C G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 14324844 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 14324873 G T Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 14324919 A T Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 14324936 T C Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 14324974 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 14325075 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 14325299 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 14325704 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14325776 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14325804 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 14326000 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 14327031 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 14327165 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 14327214 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 14327270 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 14327297 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 14327376 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 14327577 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 14327718 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 14328436 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 14329267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14330045 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 14330101 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14330289 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14330570 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 14330848 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14330906 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14332470 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14332473 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 14334075 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14335273 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14335277 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14335284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14335300 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14335597 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14335629 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14335823 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14335889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14342634 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14342635 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14342639 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 14342728 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14342739 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14342740 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14342781 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14342799 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14342827 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14342860 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14342865 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14342997 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14343555 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 14343618 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 14343691 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14343773 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14343968 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14343974 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14343980 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 14344138 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 14344357 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14344394 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14344432 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 14344515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14344526 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14344579 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14344638 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 14344689 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14344787 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 14344795 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 14344854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14344880 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14344881 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14344886 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 14344930 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14344983 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 14345016 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 14345291 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 14345351 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14345398 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14345524 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14345527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14345565 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 14345626 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14345651 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 14345670 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14345675 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14345868 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 14346090 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14346537 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14346635 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14349562 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14350947 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14351244 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 19 14353144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14353390 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14353969 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14353998 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14354044 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14354093 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 14354118 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14354251 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 14354295 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14354319 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14354517 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 14354549 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 14354608 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14354714 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 14354983 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 14355436 C T N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 19 14355441 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 14355531 C T N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 14355534 T G N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 14355821 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 14355833 T C N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 19 14355870 A C N N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 19 14355911 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 14355924 A T N N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 19 14356814 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 14357192 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 14357208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14359057 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14359356 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14359406 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14360009 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 14362516 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14362965 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14362991 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14364075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14365693 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14369392 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14369418 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14370325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14370500 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14371797 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 14371818 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14371864 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14374546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14375339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14376900 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 14377221 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14377238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14377900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14378474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14379364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14380599 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14380640 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14383265 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 14383322 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 14383422 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 14384678 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14384692 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14384738 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 14384739 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 14385060 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14385130 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14385172 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 14385254 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 19 14385265 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 19 14387871 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14389559 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14390009 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 14391452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14392059 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14392227 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14393016 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14395820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14396556 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14396730 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14396850 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14398776 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14399181 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14403965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14405877 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 14409129 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 14409440 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14409461 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14410271 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 14410801 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 19 14411034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14411214 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14411433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14413048 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 14415921 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14417244 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 14417337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14418536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14418560 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14418940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14421220 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 14421398 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14422812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14424825 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14425181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14425833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14426674 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14427092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14427290 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14428326 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 14429674 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 14430178 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14430881 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14431313 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14431524 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14431551 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14431950 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14432532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14432980 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14433029 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14433166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14434420 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14435761 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 14439448 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 14439961 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 14441006 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14441351 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14441801 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14441920 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 14442503 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 14442539 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 14442599 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14442702 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 14442917 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14443097 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 14443126 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 14443630 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14444426 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14444736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14444982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14445097 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14445184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14445251 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14445351 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 14445376 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14445391 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 14445438 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14445456 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 14445711 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 14445778 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 14446279 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 14446280 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 14446433 G A N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 19 14446456 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 14446620 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 14447106 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 14447216 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14447329 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14447351 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 14447701 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 14447841 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 14448120 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 14448146 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14448428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14450092 G T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 19 14450963 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 14452207 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14452322 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14452788 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 19 14452867 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14453482 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 19 14453644 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14454317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14454413 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14454589 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14454869 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14455092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14456693 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14456702 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 14457177 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14458732 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14459086 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14459557 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14460773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14460926 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14461631 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14461675 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14461719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14461725 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14461985 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 14461997 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 14462362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14462579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14464665 T A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 19 14465005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14465210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14465445 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 14467551 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14471187 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14471388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14472287 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14472359 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 14472630 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14474542 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14475527 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 14476258 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14476399 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14477491 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 14477554 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 14477886 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 14478119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14478337 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 14478684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14478725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14478742 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14479265 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14479449 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14479604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14480369 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14480446 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14480520 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14480763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14480990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14481034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14481218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14481575 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 14481645 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14482908 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14483016 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14483024 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 14483147 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14483157 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 14483192 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 14483199 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 14483301 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 14483670 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 14483671 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 14483675 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 14484026 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14484276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14486002 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14486113 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14486146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14486231 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 14486307 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 14486948 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14487133 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 14487191 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 14487280 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 14487557 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14488400 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 14489676 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14490425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14490802 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14491942 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 14492774 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14492808 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 14492815 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 14493173 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 14493218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14493281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14493351 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14493397 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 14493413 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 14494147 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14494289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14494612 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14494694 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 14494815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14495205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14495217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14495295 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14495732 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 14495972 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 14496294 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 14496640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14496702 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 14497649 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14498035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14498075 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 14498118 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14498263 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 14498280 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14498348 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14498375 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 14498405 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 14498689 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14498692 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14498835 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14499208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14499597 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 14499986 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14500174 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14500175 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 14500190 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14500213 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14500456 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14500466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14500528 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14500537 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14504173 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 14505227 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14505365 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14505718 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 19 14505785 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 14506016 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 14506080 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14506324 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14506560 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 14506617 C G Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 19 14506646 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14506739 A G Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 19 14506796 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 14506836 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14507079 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14507190 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14507231 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14507496 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14507544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14507546 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 14507673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14510342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14511384 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14511483 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14511674 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14513288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14513947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14513993 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14514042 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 14514213 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14514214 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14514437 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 14514611 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 14514622 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14514733 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14514740 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14514760 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 14515013 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 14515097 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 14515128 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 14515451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14515539 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 14515605 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14515755 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 14515968 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 14516056 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 14516206 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 14516249 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 14516261 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 14516691 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 14516755 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 14517151 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 14517293 T A Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 14517302 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 14517305 A T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 19 14517324 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 14517343 C A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 14517354 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 14517386 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 14518172 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14518530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14518531 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14519682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14520085 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14520301 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14520377 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 14521040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14521374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14522237 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14524440 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14524616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14524665 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14525064 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14528566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14530877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14531355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14531411 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 14532537 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 14532995 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14534766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14536693 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14536915 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 14537539 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14539945 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14540272 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14540321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14540591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14543450 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 14543579 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 14544204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14547272 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14547577 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14548017 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14548703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14548734 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14548939 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14550289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14551369 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 14551531 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14551688 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14551711 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 14552212 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14552723 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14554057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14554217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14555238 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14555292 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 14555883 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14557735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14557897 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14558356 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14561723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14563142 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14563905 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14564531 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14567716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14569974 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14570863 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14572152 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14572362 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14572387 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14572546 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14573028 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14575465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14577614 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14579412 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 14579450 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14583283 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 14585958 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 19 14587445 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14587686 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14588620 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 14589015 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14589125 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 14589446 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14589650 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 14591530 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14592661 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14593407 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 14593516 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14593816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14594218 A T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 19 14594410 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 14595705 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14596515 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14597029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14597467 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14598848 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14598851 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14599727 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 14599923 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14600236 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14602562 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14603516 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14603522 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14603531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14603565 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14604583 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14604860 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 14605720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14607557 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14608192 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14608338 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14608738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14609517 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14609824 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14610670 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14611191 A C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 14611258 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 14611409 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14611411 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 14612347 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 14612592 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 14612926 A G N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 19 14613350 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14613476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14613567 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14613823 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 14613840 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 14614182 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14614183 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 14614818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14615040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14618444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14618819 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14622151 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14624597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14625035 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14626317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14626637 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14626721 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14627100 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14628906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14629245 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14630317 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 14630795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14632171 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14632439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14633117 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 14633911 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14634846 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 14636495 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14637084 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14640384 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14642534 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 14642541 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14643826 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14645202 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14646226 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14646899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14648210 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14649029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14649048 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14649213 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14649327 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14650034 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14650869 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14653054 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14653282 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14655909 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 14655953 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14656006 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14656058 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14656158 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14656172 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14656581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14656783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14657880 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14662037 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14664069 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14665376 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14667221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14672873 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 14673133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14675007 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14675243 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 14675739 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14675742 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14676155 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14676453 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14677149 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 14677434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14678093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14679000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14686078 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14687705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14689226 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14690385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14690871 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14691051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14693086 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14697259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14698471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14698518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14698640 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14698642 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14698645 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14698718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14698734 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14698735 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14699526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14699922 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14699997 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14700006 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14700183 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14700413 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14700863 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14701015 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14701121 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14702144 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14702488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14703006 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14703697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14703731 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14703868 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14703920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14704668 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14704738 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14704858 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14705197 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14705316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14705323 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14705500 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14705643 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14705730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14705818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14705910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14705946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14706021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14706127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14706148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14706246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14706442 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14706776 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14706887 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14707049 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14707160 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14707172 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14707306 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14707387 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 14707793 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14708186 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14708209 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14708657 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14708828 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14709306 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14709515 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14710194 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14710234 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14710864 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14712065 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14712076 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 14712077 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 14713997 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14714181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14714708 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14715092 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14715102 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14719437 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14720094 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14721113 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14721496 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14722850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14723216 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14724576 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14725225 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14725236 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14725707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14725708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14725856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14725886 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14725976 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 14727057 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14727837 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14728101 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14728110 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14728912 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14729297 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 14729373 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14729723 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14729726 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14730523 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14731313 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14733334 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14733670 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14733834 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14734194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14734963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14735618 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14737266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14738045 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14738678 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14738705 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14739514 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14739833 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14741634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14741903 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14744183 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14745464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14745494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14745872 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14747287 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14747468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14747682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14747747 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14747872 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14747895 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14748191 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14748238 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14751144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14751194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14751743 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14751944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14752008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14752085 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14752897 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14753294 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14753653 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14753660 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14753690 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14754364 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14754476 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14754765 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14754994 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14755041 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14755053 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14755340 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14755408 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14756029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14756343 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14756378 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14757350 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14760874 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14762716 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14766627 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14768081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14770174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14770981 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14773086 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 14782235 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14782347 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 14782532 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 14782568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14782573 G T Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 14782712 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14782720 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 14782781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14782843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14782940 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 14783023 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14783103 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 14783106 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 14783107 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 19 14783402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14784260 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14784304 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14784441 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14785842 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 19 14785876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14786967 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14789998 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14791845 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14795123 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14795183 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14795410 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14796325 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 19 14797083 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14797142 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14797223 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14797234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14797266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14797290 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14797319 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14797452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14797810 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 14797829 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 19 14797831 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.235294117647059 25 9 12 1 4 19 14798176 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 14798318 T G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 14798330 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 14798401 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14798472 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 14798624 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 19 14798694 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 14798740 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 14798796 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 14798797 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 14798846 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.277777777777778 0.0555555555555556 0.666666666666667 11 25 5 1 12 19 14799283 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14803870 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 14804897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14805964 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14805966 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14808845 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 14809189 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14809965 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14813329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14817126 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 14817319 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 14817401 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 14817427 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14818905 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14819844 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14822017 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 14822669 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 14823850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14825991 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14825997 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 14826291 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 14826424 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 14826614 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14827123 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 14827199 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14827283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14827603 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14827785 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14827837 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 14827973 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 14828044 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14828111 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 14828112 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 14828172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14828851 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14829162 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14829252 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14831356 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 14831665 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14832206 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14835063 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14835433 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14835881 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 14836530 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 14837578 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14837712 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14837764 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14837834 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14837871 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14837990 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14838089 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14838119 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14838315 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14838448 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14838511 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14838577 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14838686 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14838856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14838865 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14838914 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14839080 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14839084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14839355 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14839470 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14839552 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14839559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14839944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14840008 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14840362 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 14840400 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14840404 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14840488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14840530 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 14840545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14840564 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14840718 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14840863 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14840891 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 19 14841398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14841498 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 14841579 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 14841583 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 14841611 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 14842148 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 14842149 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14842321 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14842344 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 14842475 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 14842545 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 14842716 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 14842785 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 14842791 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 14842835 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 14842854 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 14842941 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14842973 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 14842988 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 14843017 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 14843038 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 14843056 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 14843359 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 14843432 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 14843693 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 14843696 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 14844032 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 19 14844176 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 14844323 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 14844355 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14844411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14844431 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 14844432 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 14844777 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 14844837 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 19 14845131 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 19 14845132 T C N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 19 14845174 A T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 19 14845705 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 14846467 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 14846809 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 19 14847068 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 14847109 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 19 14847306 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 14847307 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 14847332 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 19 14847747 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 14847825 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 14847891 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.8125 0 0.1875 26 6 13 0 3 19 14848005 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 14848109 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 19 14848306 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 14848402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14848764 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 14848766 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14848808 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 19 14848821 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 19 14848834 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 14848868 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 19 14849031 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14849184 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 14850795 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 14850796 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 14850797 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 19 14850906 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14850941 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 14851403 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 19 14851520 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14851570 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14852607 C G Y N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 19 14852852 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 19 14853264 A C Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 14853340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14853347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14853402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14853421 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 14853427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14853506 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 14853753 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 14853792 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14853835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14853842 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 14853849 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14853857 G T Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 14853908 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14853980 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14853991 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 14854083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14854327 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 14854417 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 14854632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14855261 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 14855262 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 14855335 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 14855380 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 14855502 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 14855540 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 14855573 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 14856198 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14856496 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 14856501 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 14856552 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 19 14856561 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 19 14856571 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 19 14856639 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 14856786 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 19 14856796 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 14856834 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 19 14856898 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 19 14857353 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 14857471 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 14857595 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 14857711 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 14857801 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 14857838 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 14857891 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 14857992 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 14858074 T G N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 19 14858160 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 14858287 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 14858375 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 14858413 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 14858713 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 19 14858865 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 14858904 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 14859054 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 14859170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14859264 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 14859310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14859388 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14859495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14859536 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 14859641 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14860009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14860257 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 14860706 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14860721 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14860856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14861203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14861451 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14861854 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14861969 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14862182 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14863075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14863246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14864148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14864167 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14864303 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14865101 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 14869043 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14869084 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14869474 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14870326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14870483 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14870552 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 14870710 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 14870731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14870972 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14871145 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14871299 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14871308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14871415 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14871426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14871444 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14871730 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 14871818 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14871867 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14872506 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 14873612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14873732 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14874097 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14874258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14874419 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14874507 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 14874594 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14874601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14874615 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14874737 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14874899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14874978 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 14875032 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14875081 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 14875150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14875325 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 14875346 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 14875495 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14877171 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 14877331 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 14877848 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14877850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14878640 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 14878968 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14879471 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 14880260 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14880688 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 14880690 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 14881479 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 14882023 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 14882167 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 14882194 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 14882675 G T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 14882734 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 14882777 C A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 14882839 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 14882858 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 14882907 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 14883004 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14883044 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 14883072 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14883262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14883480 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14883559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14883577 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 14883581 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 14883587 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 14883629 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 14883671 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 14883701 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 14883750 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 14883803 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 14883827 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 14883868 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 14884206 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 14884526 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 14884549 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 14884553 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 14884557 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 14885023 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 14885200 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 14885269 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14885646 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14886153 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 14886596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14886708 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 14886789 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 14886847 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 14886863 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 14886915 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 14886977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14887438 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 14887439 C A Y N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 19 14887440 A G N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 19 14888591 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14888654 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14888759 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 14888953 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 14889549 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14889793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14889814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14890230 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 14890450 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 14890503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14890528 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 14890800 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 14890823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14890834 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14890991 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 14891134 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14891226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14891282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14891463 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 14891482 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 14891564 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 14891789 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14891983 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 14892158 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14892313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14892385 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14892411 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 14892453 T C Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 14893097 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14893234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14893593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14893805 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 14893914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14893976 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14894133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14894362 G T N N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 19 14894561 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14894914 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 14895038 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14895119 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 19 14895782 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 14895803 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14895906 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 14895953 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14896103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14896185 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14896226 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 14896283 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14896296 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14896423 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 14896445 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 14896555 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14896781 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14896901 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 14896902 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14896911 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 14896994 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14897804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14897839 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14898349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14898366 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14898449 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 14898862 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 14899192 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 14899200 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 14899480 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 14899540 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 14899813 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 14899826 T G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 19 14899927 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 14900319 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 14900529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14900672 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 14900849 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 14901175 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 14901177 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 14901187 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 14901419 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14901444 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14901512 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14901514 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14901516 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 14901537 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14901540 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 14901547 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14901563 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 14901629 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 14901638 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14901651 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14901705 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 14901752 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 14901802 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 14901952 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 14901985 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 14902629 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 14902806 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 14902911 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 14903172 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 14903283 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 14903304 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 14903348 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 14903389 C A Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 14903397 C G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 14903426 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 14903457 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 14903585 T G N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 19 14903588 A G Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 19 14903605 C G Y N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 19 14903607 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 14903624 G A Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 19 14903797 G C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 19 14903803 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 19 14903841 T C Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 19 14903878 G T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 19 14903957 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 14903970 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 14904036 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 14904067 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 14904069 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 14904116 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 14904356 T C N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 19 14904536 G T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 19 14904619 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 14904897 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 14904983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14904999 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 14905088 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 14905198 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 14905349 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 14905381 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 19 14905621 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 14905688 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14905699 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 14905723 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 14905802 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14905827 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14905848 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 14905921 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14905975 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 14906065 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14906092 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 14906182 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 14906184 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 14906246 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 14906247 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 14906330 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 14906426 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 14906534 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 14906572 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 14906597 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 14906631 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 14906640 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 14906697 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 14906704 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 14906859 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 14906892 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 14906926 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 14906947 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 14906981 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 14907089 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14907091 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 14907212 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14907344 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 14907359 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 14907408 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 14907431 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 14907468 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 14907718 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 14907766 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 14907791 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 14907974 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 14908059 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14908339 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14908559 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14908613 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 14909509 G C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 19 14909526 G C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 14909624 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 14910033 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 14910093 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14910153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14910177 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 14910200 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 14910213 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 14910232 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 14910612 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 14910749 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 14910806 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 14910826 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 14910887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14910952 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14911110 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14911142 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14912046 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 14912060 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 14912062 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 14912274 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 14912491 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 14912532 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 14912613 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 14912690 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14912704 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 14912977 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 14912995 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 14913003 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 14913041 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 14913179 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 14913264 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 14913294 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 14913297 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 14913333 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 14913524 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 14913959 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14913983 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 14914521 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 14915334 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14916039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14916756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14917175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14917362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14917690 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 14917993 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 14918041 G A Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 14918377 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 14919233 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 14919432 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 14919712 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 14919770 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 14920892 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14920986 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 14921010 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 14921186 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 14921403 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 14921444 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14921528 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 14921531 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 14921571 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 14921661 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 14922059 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14922345 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 14922875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14923032 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 14923044 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 14923404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14923454 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 14923561 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14924350 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 14924662 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 14927407 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14929012 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 14929060 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 14929087 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14931129 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14935234 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14939217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14942026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14943847 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14945407 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14945416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14946383 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14946713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14948146 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14948229 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14948518 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14951072 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14951702 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14952074 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14952096 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14953131 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 14953284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14953567 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14954112 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 14954681 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14954820 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14954981 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14956237 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14956488 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14957263 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14958019 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14958504 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14958933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14962233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14963373 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14964023 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14964165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14964686 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14969348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14969638 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14969684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14969685 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 14969822 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14969886 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14970714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14971278 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 14971759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14971868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14972507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14972974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14974272 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14974292 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14974576 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 14974697 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14974703 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14974722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14974724 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 14974799 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 14974802 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 14974904 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14975508 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14975746 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14975753 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14976381 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14976936 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14979810 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 14981900 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14981901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14982040 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14982071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14983539 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14984740 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14984783 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14985030 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14987022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14987866 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14988582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14991510 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14991753 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14993347 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 14994502 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14994874 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 14996147 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 14996155 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14997398 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 14998570 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 14998859 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 14998862 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 14998863 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 14998900 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 19 14998901 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 14998974 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 14999071 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 14999598 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 14999600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 14999601 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 14999684 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15000059 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15000062 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15000068 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15000091 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15000121 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15000174 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 15000236 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15000343 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 15000384 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 15000538 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15000755 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15000806 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15000871 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15000934 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15000959 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15000983 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15000996 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 15000998 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 15001065 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15001072 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 15001091 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 15001099 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 15001532 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15001629 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15001677 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15002078 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 15003114 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15003614 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15003616 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15007673 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15007949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15008251 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15011030 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15013224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15013602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15014380 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15014402 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15015717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15015987 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15016145 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15016163 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15016390 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15016391 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15016527 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 15016800 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15017171 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15018441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15018827 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15019345 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15019707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15019951 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15020169 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 15020170 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 15020171 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15020172 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 15020185 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15020194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15021531 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15021859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15023389 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15023402 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 15023404 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 15023432 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15023527 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15023561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15023569 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15026734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15028459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15028475 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15028486 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15028746 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15028764 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15028906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15029058 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15029074 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15029158 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15029408 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15029624 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15029776 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15029908 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15030049 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15030116 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15030365 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15030372 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15030391 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 15030414 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15030490 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15030498 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15030506 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15030548 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15030566 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15030718 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15030918 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15030958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15031348 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15033439 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 15033477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15035587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15035700 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15035969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15036505 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15036751 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15036863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15037604 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15037842 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15039733 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 15039985 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15040009 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15040097 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15040213 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15040259 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15040393 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15040635 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15040956 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15041622 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15041786 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15041788 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15043183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15044583 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15044597 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15046059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15046216 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15046487 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15047194 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15047818 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15048303 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15049068 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15049193 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15049293 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15049979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15050026 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15050250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15050738 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15050838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15050880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15051318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15052537 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15052758 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15053181 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15053589 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15054544 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15056518 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 15060521 G T Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 15063269 C A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 15063383 C T Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 15065594 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15065729 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15066251 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15066770 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15067020 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15067802 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15069735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15070377 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15070967 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15071027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15073053 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15076013 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15076039 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15076820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15078017 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15078030 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15078055 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15078138 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15078260 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15078303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15078359 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15078408 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15078415 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15078445 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15078765 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15078772 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15078780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15078865 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15078876 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15079406 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15079585 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15079600 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15079943 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15080107 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 15080277 C G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 15080357 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 15080448 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 15080491 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 15080580 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 15080650 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15080781 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 15080811 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15080815 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 15080907 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 15080930 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 15080959 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 15080968 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 15080969 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 15081030 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 15081039 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15081071 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 15081122 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 15081128 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 15081158 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15081266 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 15081400 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15081463 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15081511 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15081531 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15081582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15081640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15081750 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15081765 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15081772 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15081773 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15081968 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15081969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15082021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15082123 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15082641 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15083409 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 15084928 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15090109 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 15092303 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15092580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15092721 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15092762 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15093283 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15093303 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15094330 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15094944 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15097651 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15099740 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15100095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15100222 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15101887 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 15101921 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15102158 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15102287 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 15102607 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15102751 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15102995 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 15103027 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 15104157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15104646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15105557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15105861 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15107050 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15107295 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15107451 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15107701 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15110623 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15110633 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 15110835 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15111089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15111450 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15114146 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15114239 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15114803 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15115232 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15116910 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15118512 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15118649 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15118653 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 15119197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15121177 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15122716 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15123435 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15125525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15128345 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 15129147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15130747 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 15131263 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15133259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15135020 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15136548 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15136749 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15137372 T G N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 19 15138328 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15139706 C A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 15141705 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 15141987 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15146231 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15146692 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 15148863 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 15149981 G C N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 15150786 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 15153416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15153500 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15154235 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15154973 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15157155 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15157678 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15157855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15157965 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15158923 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15160035 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15161491 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15163081 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15163922 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15165779 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 15166390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15166481 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15167173 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15167368 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 15167492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15168472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15168576 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15168618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15168870 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 15168878 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 15168979 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 15169270 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15169389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15169390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15169418 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15169419 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15169507 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 15169995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15170015 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15170083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15170097 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 15170475 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 15170496 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 15170518 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 15170543 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 15171205 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 15171413 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 15171425 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 15171426 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 15171474 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 15171570 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 15171676 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 15171789 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 15171969 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15172057 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 15172233 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 15172336 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15172521 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15172925 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 15172946 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 15173269 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 15173327 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 15173461 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 15173504 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 15173622 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 15173687 C G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 15173736 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 15173792 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 15173838 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15174556 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 15174573 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 15174759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15174871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15175543 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15175760 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15176146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15177275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15177728 C G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 19 15178232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15178805 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15179451 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15179472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15179981 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15180028 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15180147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15180218 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15180289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15180641 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15180672 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15180677 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15180767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15180836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15180920 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15180929 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15180965 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15181988 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15182084 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15182278 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15182309 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15184181 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15185050 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15185922 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15185933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15185957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15186936 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15187485 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 15189500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15189588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15189623 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15189924 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15190443 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15190551 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15190706 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 15190707 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15190717 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15190982 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15191084 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15191199 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15191347 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15191645 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15191858 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15191885 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15191909 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 15192000 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 15192050 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 15193831 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15195179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15195602 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15197841 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15198030 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15199048 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15200612 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15201283 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 15201746 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15202251 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15202428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15202467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15202639 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15203176 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15203375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15203492 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15203670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15203740 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15204847 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 15205935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15205974 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15206133 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15206849 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15206907 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 15206908 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 15207037 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 15207272 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 15207732 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15207803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15207913 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15208585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15209561 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15209715 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15210114 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15210152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15210894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15210899 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15211622 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15211702 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15211792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15211822 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15211823 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15211994 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 15212010 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15212329 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15212457 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15212704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15212750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15212787 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15212802 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15213135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15213306 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15213496 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15213671 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15213692 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15213825 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15213877 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15213907 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15214140 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15214220 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 15214456 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 15214648 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15214690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15215527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15216600 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 15216957 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 15217064 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 15217104 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15217498 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15217628 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15217729 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15217767 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15217786 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15217791 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 15217792 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15217818 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 15217821 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15217879 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15218120 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15218264 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15218480 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15218924 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15218940 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15219131 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15219440 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15219445 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15219460 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 15219461 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15219595 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 15219845 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 15219927 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15220074 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15220085 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15220637 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15221002 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15221074 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15221075 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15221086 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15221127 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15221421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15221506 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15221639 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 15221761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15221772 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 15222095 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15222168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15222273 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15222356 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15222371 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15222903 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 15222944 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15223043 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 15223422 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 15223424 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 15223457 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15223471 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 15223481 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 15224013 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15224050 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15224162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15224643 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15224700 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 15224749 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 15224785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15224821 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15224823 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15224893 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 15224941 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15225003 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 15225090 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 15225108 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 15225447 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15225877 C T N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 19 15225990 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 15226009 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 15226110 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15226146 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 15226210 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 15226305 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 19 15226306 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 19 15226377 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 15226420 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 15226620 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15226642 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 15226918 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 15226949 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 15227124 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 15227133 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 15227187 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 15227200 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15227210 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 15227263 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 15227308 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 15227395 C T N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 19 15227610 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 15227615 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 15227649 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 15227738 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 15228184 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 15228280 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15228371 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 15228389 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 15228526 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15228611 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15228727 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15228994 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15229256 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 15229408 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15229445 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 15229675 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15229683 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 15229797 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15229835 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 15229885 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15229918 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15229936 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15230035 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15230149 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 15230170 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 15230317 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 15230489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15230594 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15231214 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 15231354 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15231467 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15232598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15232754 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15232756 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15232825 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15232906 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15232911 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15232938 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15232948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15233003 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15233153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15233315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15233720 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15233790 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15234027 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15234347 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15234499 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15234548 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15235350 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15235641 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15235894 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15236253 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15236255 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15236456 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15236458 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15236462 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15236593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15236739 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15236825 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 15236898 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15236984 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15237158 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 15238288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15238858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15238872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15239432 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15239519 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15239812 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15239856 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 15240067 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15241124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15243409 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 19 15243417 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 19 15244195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15244196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15244275 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 15244305 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15244552 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15244793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15244871 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15245047 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 15245509 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15245583 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15245658 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15245741 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15245757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15245809 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15245810 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15246066 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15246205 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15246492 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15246556 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15246559 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15246578 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15246599 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15246654 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15246723 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15247619 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 15248096 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15248287 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15248319 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 15249275 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 15249708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15249710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15249730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15249951 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15250197 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 15250272 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15250440 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15250494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15250527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15250707 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15250728 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15250985 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15251053 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15251077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15251149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15251253 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 15251264 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 15251371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15251394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15251494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15251664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15251962 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 15252000 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15252047 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15252113 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 15252361 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 15252779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15252936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15253448 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15253607 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15253817 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15253858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15253905 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15253918 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15253966 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 15254165 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15254220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15254234 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15254295 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15254382 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15254392 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15254473 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15254531 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15254541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15254940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15254957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15255087 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15255101 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15255168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15255662 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 15255663 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 15255683 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15255763 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15255884 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15255903 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15255915 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15255922 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15255929 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15255930 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15255931 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 15256293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15256325 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15256423 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15256434 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15256458 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15256470 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15256471 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15256543 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15256916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15256943 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15257063 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15257077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15257130 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15257147 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15257220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15257223 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15257257 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15257306 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15257315 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15257332 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15257423 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15257430 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15257484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15257582 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15257613 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15257640 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15257656 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 15257741 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15257807 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 15257809 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15257832 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15257837 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 15257868 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15257906 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15257972 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15258016 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15258241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15258298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15258310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15258483 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15258798 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 15258842 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 15258880 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 15258890 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 15258967 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 15259081 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 15259189 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 15259207 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 15259214 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15259255 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15259267 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 15259305 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 15259345 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 15259360 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 15259446 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15259484 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 15259557 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15259599 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 15259652 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15260080 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 15260117 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15260231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15260387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15260491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15260534 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15260553 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15260711 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15260780 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15260825 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15260884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15260893 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15261024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15261087 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15261123 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15261161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15261299 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15261677 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 15261713 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15261788 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15261836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15261843 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15261870 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15261890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15261933 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15262034 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 15262065 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15262299 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15262300 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15263118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15263180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15264911 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 15265194 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15265572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15265706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15266307 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15266372 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15266635 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 15266896 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 15267058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15267603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15269177 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15272053 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15275966 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15277453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15279001 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15281569 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 15281583 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 15281793 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 15283185 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 15283236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15283246 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 15283673 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15283717 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15283774 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15283780 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15283842 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15283860 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15283912 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15283993 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15284072 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 15284087 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 15284237 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15284291 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 15285142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15285191 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 15285305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15286277 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 15286589 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15287412 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15289041 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15293252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15295453 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15295996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15296294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15297175 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15297347 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15297350 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15299363 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15299803 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15299806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15308311 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15308865 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 15309971 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15310276 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15310711 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15310888 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 15313074 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 15313092 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15315351 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15316109 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15316690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15317066 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15317105 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15317269 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15317562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15318510 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 15318515 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 15319001 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15319143 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15319208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15319279 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15319351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15320037 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15321010 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 15321382 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15321763 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 15323126 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15324089 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15324276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15324547 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15324549 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15324606 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15325319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15325656 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 15325667 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15325676 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15326049 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 15326491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15326827 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15327110 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 15327118 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15327122 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 15327181 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15327388 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 15327428 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15327556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15327782 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15327783 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 15328234 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 15329187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15329233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15329606 A C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 15329885 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 15329924 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15330124 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15330777 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15330992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15337773 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15338142 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15338163 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15338236 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15338790 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15339232 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15339298 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 15339304 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 15339478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15339511 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 15339579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15339635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15340017 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15340277 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15341567 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15342652 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15342743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15342975 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15343311 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 15344000 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15344273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15345475 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15346229 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15346335 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15347567 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15347870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15348052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15348965 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15351691 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15356616 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15359041 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15360426 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15360707 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 15361781 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15361915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15361940 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15362845 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15363353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15363515 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15363975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15365262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15367644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15368226 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15368536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15369307 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15369425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15369775 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15372335 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15372383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15372747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15373013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15373177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15373391 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15373398 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15373407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15373428 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15373445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15373558 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15373561 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15373652 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15373876 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 15373901 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 15374065 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15374113 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15374240 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15374501 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15374739 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15374881 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15374979 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15375216 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15375558 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15375570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15375860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15375891 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15375976 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15376018 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15376420 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15376502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15377839 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15379333 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15381838 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15382005 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15382601 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15382752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15391974 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15392789 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15394103 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15394231 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15395964 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15395988 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15396112 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15396147 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15396293 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 15396329 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 15396443 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15396529 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 15396541 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 15396571 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 15397565 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 15398271 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15398693 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15398714 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15398737 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15400026 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 15402102 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 15402108 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 15402164 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 15403096 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 15403178 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 15403501 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 15404159 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 15404167 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15405355 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15405814 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 15407135 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 15407507 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15408030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15408094 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 15408107 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 15408124 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 15408128 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 15408487 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 15408720 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 15409991 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15412434 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15413960 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15414114 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15416072 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 15417185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15417286 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 15420105 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15420402 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15420458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15421932 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15422033 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 15422110 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 15422286 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 15422490 T G N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 19 15422591 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15422596 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 15422803 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 15422811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15422902 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 15423269 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15423390 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15423547 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 15423664 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 19 15423857 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15423971 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15424225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15424529 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 15424737 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 15424763 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 15424787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15424919 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15425104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15425105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15425194 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 15425222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15425275 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 15425335 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 15425372 A T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 15425388 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 15425491 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 15425545 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 15425548 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 15425581 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 15425615 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 15425622 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 15425651 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 15425658 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 15425967 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 15426059 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 15426077 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 15426781 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 15426942 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15426968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15427013 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 15427178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15427325 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 15427523 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15427692 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 15427817 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 15427820 T A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 15428149 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 15428289 T C N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 19 15428308 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 15428549 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 15429058 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 15429063 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 15429179 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15429189 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15429447 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 15429546 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15429607 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15429730 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 15429768 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 15429771 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 15429773 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 15429779 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 15429795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15429824 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15430068 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 15430397 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 15430496 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 15430543 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 15430599 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 15430646 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 15430845 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 15430893 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 15430930 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15430952 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 15430993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15431135 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 15431351 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15431389 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 15431410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15431432 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15431599 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 15432397 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15432480 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 15432526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15432530 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15432763 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15432835 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15433024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15433044 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15433145 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15433190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15433261 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15433366 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15433390 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15433398 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15433574 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15433628 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15433746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15433762 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15433979 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15433987 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15434121 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15434134 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15434270 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15434287 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15434331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15434337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15434357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15434358 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15434365 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15434396 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15434398 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15434491 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15434530 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15434541 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15434548 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15434562 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15434563 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15434588 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15434592 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15434706 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15434721 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15434777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15434782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15434828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15435065 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15435143 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15435201 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15435636 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15436052 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15436148 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15437295 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15437706 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15438899 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15440117 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15440853 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 15442282 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15443477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15444300 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15445606 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15445842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15445969 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15446729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15449261 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15449271 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15450957 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 15451281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15452037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15452508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15453336 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 15453414 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 15453420 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 15453689 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 15453848 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15453875 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15453906 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15453939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15454095 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15454200 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 15454491 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15454647 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15454673 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15454846 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15454847 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 15455177 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15455324 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15455362 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15455675 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15455747 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15455844 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15455849 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15456036 G A Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 15456101 A G Y Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 19 15456116 G A Y Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 19 15456147 C T Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 15456154 G T Y N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 19 15456231 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 19 15456239 A C N N 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 19 15456268 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 15456276 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 15456366 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 15456371 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 15456386 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 15456734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15456754 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15456759 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15456800 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 15456801 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 15456819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15456893 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15456894 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15456897 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15456912 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15457057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15457067 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 15457068 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 15457084 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15457190 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15457221 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15457245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15457307 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15457360 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15457463 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15457504 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 15458534 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 15458535 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15458614 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 15458690 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 15458704 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 15458755 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15458806 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15458899 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 15458931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15461130 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15461606 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15462530 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15462933 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15463629 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15464376 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 15465372 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15469068 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 15473057 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15473565 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15474803 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 15475929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15476869 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15477387 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 15477638 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 15478100 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15480015 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15480162 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15480214 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15482534 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 15485637 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15486153 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15487258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15487996 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15488329 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15489487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15489980 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15490069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15490138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15490239 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15490905 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15491525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15493935 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 15495608 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 15496522 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15496608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15497067 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15497426 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15497707 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15497848 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15498068 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 15498204 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15498346 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 15498477 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15498574 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 15498817 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15499800 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15500134 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 15501382 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15507232 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15507421 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 15507423 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15514110 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 15514223 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 15515053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15515150 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15516008 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15518725 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15519345 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 15519635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15519822 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 15519849 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 15520923 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15520950 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15523784 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15524177 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15525288 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15525579 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15526729 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15526831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15526866 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15527424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15529485 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15529509 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15532888 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15536472 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15536516 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15538893 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15539005 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15539039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15539254 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15539511 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 15542044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15542167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15542179 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15542292 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15543065 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15543068 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15543669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15543713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15543762 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15544063 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15545113 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15546084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15546791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15546833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15546889 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 15547117 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15548315 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15549417 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15549429 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15551299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15552559 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15554794 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15556091 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 15556338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15556346 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 15556479 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15556515 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 15556643 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 15556662 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 15556784 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 15556890 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15557004 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 15557220 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15557487 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 15557507 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 15557645 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 15557667 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 15557682 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15557792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15557858 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15557909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15557990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15558060 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 15558100 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 15558129 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15558161 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15558329 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15558463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15558529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15558577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15558583 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15558599 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15558616 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15558713 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 15558738 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15558968 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 15558969 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 15559101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15559114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15559144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15559155 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15559579 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15560209 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15560321 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15560334 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15560374 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15560376 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15560434 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15560825 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15561093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15561273 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15561852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15561883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15561906 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15562448 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15562558 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 15562766 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15564095 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15564908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15566803 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15566841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15567649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15567716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15567976 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15568431 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 15569639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15569797 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15570438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15570477 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15570547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15570795 G T Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 15571020 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 19 15571618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15571836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15572070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15573062 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15573094 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 15573230 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15575808 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 15576025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15576249 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15576352 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 15576483 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 15576557 T A N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 19 15576813 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15576914 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 15581420 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15581619 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15581918 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 15582921 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 15582946 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 15583032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15584481 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 30 6 15 0 3 19 15584485 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15585075 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15585594 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 15586083 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15586933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15587221 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15587340 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15588740 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15589588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15589640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15590426 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15592209 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15592456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15593497 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15593508 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15593597 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15593706 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15594027 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15594075 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15594292 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15594564 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15594671 T C Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 15594687 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 15594824 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15594966 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15594969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15595089 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15595248 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15595384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15595484 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15595565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15595571 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15595884 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15596574 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 15596663 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 15596712 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 15596774 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 15597446 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15597471 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15597472 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15597496 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15597570 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 15597782 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15598108 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 15598135 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15598244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15599028 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15600386 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15600539 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15602132 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15602607 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15602666 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 15602677 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 15603033 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15603555 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15603560 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15603737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15603970 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15604014 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15604103 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15604146 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15604286 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 15604336 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 15604423 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 15604479 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 15604691 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15604736 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 15604800 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 15604810 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 15604930 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 15605049 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 15605201 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 15605224 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 15605284 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 15605295 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 15605321 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 15605582 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 15605621 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 15605665 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 15605758 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15605972 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 15605983 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 15606005 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 15606127 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 19 15606147 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 19 15606218 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 19 15606234 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 19 15606237 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 19 15606353 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 15606367 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 15606373 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 15606389 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 15606526 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15606738 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 15606754 C A Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 15606755 C G Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 15606766 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 15606771 G C Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 15606779 G C Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 15606780 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 15606941 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15607063 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15607084 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15607122 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15607130 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 15607153 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 15607579 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15607821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15608023 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 15608024 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 15608057 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 15608081 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 15608118 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 15608203 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15608418 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 15608432 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 15608516 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 15608552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15608577 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 15609310 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15609311 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15609382 C A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 15609765 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 15609791 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15609830 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 15609898 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 15609929 T G Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 15609981 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 15610253 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 15610270 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 15610297 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 15610354 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 15610487 T A Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 15610511 A T Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 15610563 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 15610817 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 15610889 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15610907 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 15610970 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 15611000 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 15611249 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 19 15611623 G C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 15611780 G C Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 15611793 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 15612245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15612347 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15613430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15613896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15614185 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15614277 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 15614680 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15614702 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15614715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15614766 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15614908 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15614914 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15614982 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15615018 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15615115 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15615123 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15615293 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15615366 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15615411 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15615481 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15615535 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15615796 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15615828 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15615840 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15615853 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15615928 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15615994 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15616469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15616511 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15616751 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15616840 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15618108 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15618124 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15618308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15618611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15618875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15619325 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15619357 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 15619527 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15619622 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15619721 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 15620011 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 15620235 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15620327 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 15620352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15620457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15620569 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15620722 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15620730 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15620747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15620780 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15620846 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15620916 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15621377 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 15621445 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15621446 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15621513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15621604 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 15621614 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15621685 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15621714 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15621722 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15621899 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15622005 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15622027 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15622048 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15622105 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15622263 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15622581 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15622759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15622849 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 15623003 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15623136 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15623164 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15623374 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15623453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15623456 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15623622 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15623722 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15623782 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15623859 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 15623878 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 15623945 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 15624010 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 15624046 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 15624757 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15624870 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15624875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15624892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15625322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15625360 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15626015 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15626026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15626071 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15626091 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15626289 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 19 15626506 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15626576 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15626953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15627183 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 15627260 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15627427 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15627531 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 15627684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15629084 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15631918 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15632090 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15632336 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15632520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15632936 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15632959 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 15633008 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15633021 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15633420 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15633421 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15633721 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15633732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15634316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15635071 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15636208 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15636417 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15636418 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15636479 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15636588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15636668 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15636674 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15636753 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15637349 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15637655 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15637668 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15637755 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15637903 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15637916 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15638233 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15638321 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15638699 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 15638771 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 15639001 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 15639077 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15639120 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15639290 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15639314 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15639429 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15639455 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15639484 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15639649 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15639704 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15639720 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 15640975 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15640982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15641036 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15641423 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15641518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15641824 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15641905 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15641925 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15641992 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15642103 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15642507 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15642787 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15642838 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 15642840 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15642843 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15642865 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15642880 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15642921 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15642942 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15642998 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15643007 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15643027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15643103 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15643183 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15643212 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15643219 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15643291 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15643951 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15644057 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15644159 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15644552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15645021 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15646418 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15646858 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15646868 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15647241 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15647322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15647513 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 15647522 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15647594 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15647612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15647819 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15647988 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15648160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15648307 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15648322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15648551 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15648634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15648896 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15649181 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 15649327 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 15651639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15653688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15656061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15656114 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15656154 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15656722 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15657951 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15657974 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15658007 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15658029 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15658164 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15659570 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 15659844 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15659920 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15660016 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15660111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15660187 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15660220 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15660342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15660490 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15660570 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15660574 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15660697 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 15660728 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 15660844 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 15660845 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 15662368 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15662956 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15663179 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15663228 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15663371 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15663447 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15663606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15663684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15663915 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15663938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15663986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15664321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15664581 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15664848 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15664913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15665425 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15665497 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15665557 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15665586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15665606 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15665609 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15665635 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15665640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15665710 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15665770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15665827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15666898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15667231 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15669051 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15670408 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15670420 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15670697 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15671350 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15671355 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15671361 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15671366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15671871 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15672683 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15672916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15672995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15674899 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15675080 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15675668 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15677212 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15677354 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15680508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15680513 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15681752 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15682214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15682216 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15682284 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15682529 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15682905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15687013 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15687055 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15687088 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15687241 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15687979 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15688072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15688890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15688988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15689100 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15689175 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15689205 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15690434 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15690463 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15690635 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15690647 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15690787 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15690981 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15691004 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15691036 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15691066 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15691153 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15691174 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15691268 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15691299 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15691488 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15691793 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15692248 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15692249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15692261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15692262 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15692283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15692314 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15692362 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15692386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15692395 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15692558 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15692679 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 15692733 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 15692753 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 15692832 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 15692853 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 19 15693037 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 15693067 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 15693080 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15693114 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15693141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15693304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15693490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15693511 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15693944 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15694166 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15694574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15694593 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15694700 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15694782 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15694807 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 15694870 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 15694896 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15694938 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15694968 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15695849 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15695886 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15695978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15696002 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15696003 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15696024 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15696110 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15696142 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15696177 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15696251 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15696263 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15696295 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15696307 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15696342 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15696417 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15696424 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 15696466 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 15696531 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 15696559 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 15696753 A G N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 19 15697354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15698186 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 15698733 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15699341 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15699574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15700070 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15701209 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15701237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15703038 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15703051 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15703149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15704053 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 15704859 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15705107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15705172 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15705183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15705219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15705343 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15705358 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15705386 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15705388 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15705429 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15705481 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15705482 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15705488 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15705741 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15706030 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15706053 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15706117 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15706450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15706777 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 15706833 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15707064 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15707724 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15707856 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15708650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15708895 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15708967 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15709000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15709060 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15709070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15709201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15709422 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15710866 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 15710911 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 15710926 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 15710927 T A N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 19 15711744 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15712299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15716880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15719082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15720655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15720861 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15722015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15722759 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15723072 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15723749 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15724103 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15724234 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15724825 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15724854 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15725833 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15726233 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15726363 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15726509 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15726565 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15726649 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15726886 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15726957 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 15727027 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15727124 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15727135 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15727277 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 15727314 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 15728006 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15728017 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 15728026 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 15728035 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 15728102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15728689 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15728698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15728736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15728771 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15728772 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15729405 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15729457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15729856 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15730900 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15731760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15732053 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15732576 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15732635 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15733384 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15733694 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15733752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15733808 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15733810 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15733948 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15733967 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15734258 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15734350 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15734361 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15734492 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15734596 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15734874 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15736183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15736264 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15737116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15737491 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15737864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15737913 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15739917 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15740385 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 15740737 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15741023 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15741157 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15741340 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 15741370 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 15741376 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 15742688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15742797 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15742840 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15743460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15744068 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15744069 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15744499 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 15744640 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15744775 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15745175 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15746454 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15746603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15746830 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15746851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15746896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15746897 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15746919 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15747005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15747051 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15747063 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15747801 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15748129 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15748231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15748309 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15748376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15748685 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15749135 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15749148 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15749432 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15749712 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15749841 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 15750243 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15752287 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 15754253 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 15758276 T C Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 15762277 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15763176 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15763438 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15766844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15766915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15768142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15768173 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15770058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15771059 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15771139 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 15771302 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 15771303 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 15771307 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 15771361 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 15771490 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 15771494 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 15771596 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15772174 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15772184 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 15772742 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15772808 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 15772950 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15773109 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 15773182 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 15773549 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 15773553 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 15773625 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15773852 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 15774118 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 15774347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15774355 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15774895 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 15774987 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15775085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15775259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15775331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15775332 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15776081 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 15776147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15776149 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15776316 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15776323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15776789 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15777370 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15777571 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15777757 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15777776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15778132 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15778286 G T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 15778575 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 15778848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15779388 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15780486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15780626 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15780722 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15780723 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15780798 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15780886 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 15780926 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15781369 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15781399 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15781488 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15781757 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15784105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15784263 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15784343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15784974 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 15785391 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15785453 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15785581 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15785604 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 15785630 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15785833 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15785913 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15785914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15786003 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15795253 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 15795670 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 15795707 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 15795744 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 15795752 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 15795767 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 15795891 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 19 15795898 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 15796060 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 15796151 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 15797570 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 15797873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15797921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15798092 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15798224 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15798425 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15799404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15799470 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15800023 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 15800024 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 15800034 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 15800104 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 15800156 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 15800256 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 15800320 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 15800322 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 15800650 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 15800659 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 15800760 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 15800840 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 15800849 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 15800876 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 15801131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15801151 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15801289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15801599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15802731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15802987 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 15803143 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15803236 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 15803450 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 15803497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15803507 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15803629 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15804090 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15804905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15806371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15806931 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15807785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15809760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15810195 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15811111 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15813011 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15814249 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 15815584 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 15816001 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15816621 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15820991 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15821814 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 15822237 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 15822481 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 15822587 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 15822707 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15822871 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15822897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15823250 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 15823266 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15823399 C G N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 19 15823408 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 19 15823900 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 15824279 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 15824385 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 15824946 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15824948 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15825019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15825020 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15825056 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15825263 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 15825271 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15825300 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15825307 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15825383 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15825897 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 15826058 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 15826075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15826076 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15826264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15826266 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15826400 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15826483 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 15826488 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15826517 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15826543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15826556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15826570 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15826644 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15826664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15826708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15826786 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 15827066 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 15827292 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 15827415 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15827887 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 15828415 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 15828805 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15828833 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 15828892 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 15829018 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 15829098 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 15829321 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15830186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15830274 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 15830332 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 15830447 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 15830484 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 15830539 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 15830723 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 15830740 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 15830748 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 15830770 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 15830787 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 15830919 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 15830952 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 15831077 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15831081 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15831203 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 15831272 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 15831296 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 15833697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15835946 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15836240 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15837152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15838522 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15838967 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15840586 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15842278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15842574 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15842996 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15843611 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15843736 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15843949 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15844787 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15847099 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 15847370 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15847383 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 15847416 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15854828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15855230 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 15855427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15855563 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15856691 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 15858132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15858970 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15859356 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15859593 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15860991 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15862595 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15863660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15864129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15864861 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 15865072 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 15865315 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 15865339 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 15865532 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 15865556 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 15865607 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 15865624 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 15865632 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 15866910 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15867176 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15867251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15867509 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 15867978 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 15868278 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15868286 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15868483 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 15868829 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 15868830 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 15868948 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 15868956 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15868959 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15869001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15869019 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 15869080 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 15869506 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 15869573 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 15869863 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15870056 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 15871068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15871758 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 15871761 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 15872500 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 15872795 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 15872839 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 15872871 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 15872949 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15873093 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 15873103 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 15873157 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15873731 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15874659 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15875204 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 15876445 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15876691 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15879192 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15880941 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15881175 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15881321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15881323 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15881581 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15881675 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15882281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15882386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15882431 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15882680 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15883287 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15883380 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 15884689 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 19 15886106 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15886342 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 15886601 G A Y Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 19 15886687 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 15886866 C G Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 15887078 G T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 15888003 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 15889307 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 15889458 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15889803 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 15889807 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 15890181 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 15890293 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 15890368 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15890576 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 15890599 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 15890820 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 19 15891106 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15891223 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 15891284 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 15891352 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15891408 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15891613 T C Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 19 15891742 A C N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 19 15891746 A G Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 19 15891849 G T Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 22 10 10 2 4 19 15891902 T C Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 19 15891944 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 15891979 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 15892017 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 15892020 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 15892131 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 15892521 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 15892619 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 15892624 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 15892858 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 15892863 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 15892934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15892978 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 15892997 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 15893005 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 15893053 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 15893065 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 15893075 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 15893089 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 15893136 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 15893174 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 15893177 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15893181 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 15893193 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 15893226 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 15893281 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 15893394 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 19 15893458 G T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 19 15893911 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 15893920 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15893948 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 15893968 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 15894026 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15894129 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 15894152 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 15894386 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 15894414 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 15894831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15894855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15895124 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 15895152 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 15895505 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15895756 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15895872 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15895956 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15895994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15896773 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 15897187 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 15897301 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 15897427 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 15897496 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 15897548 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 15897658 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 15897798 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15897833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15898046 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 15898251 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 15898346 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 15898901 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 15899011 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15899102 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 15899306 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15899368 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 15899370 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 15899547 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 15899806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15900361 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 19 15900386 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 15900764 T G N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 19 15900792 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15900833 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 19 15900843 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15900947 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15901108 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 15901134 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 15901140 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 19 15901167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15901195 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 15901417 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 15901418 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 15901478 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 15901538 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 15901563 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 15901582 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 15901671 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15901685 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15901710 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 15901818 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15901872 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15901909 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 15901915 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15902552 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 15903107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15903177 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15904274 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 15904325 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 15904430 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15904451 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 15904489 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 15904573 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15904801 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15905176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15905693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15905763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15906087 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 15907242 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15907623 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15908424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15908427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15908980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15909004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15909589 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15909852 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15913488 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15913497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15913500 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 15921291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15921305 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15921485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15921522 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 15921568 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 15921588 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15921600 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15921608 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15921617 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15921700 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 15921720 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 15921761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15921875 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 15921937 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 15921975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15921993 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 15922102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15922138 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15922151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15922183 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15922243 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 15922290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15922381 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15922410 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15922535 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 15922637 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 15922763 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 15922843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15922899 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 15922917 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 15923186 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 19 15923218 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 15923333 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 15923619 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15923787 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15923788 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 15923830 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15923860 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15923868 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15923892 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15923918 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15923920 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15923928 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15924017 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 15924025 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 15924052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15924233 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 15924471 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15924523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15924569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15924610 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15924744 A G N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 19 15924767 A T N N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 19 15925171 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 15925204 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 15925252 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15925253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15925424 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 15925451 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 15925756 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15925763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15925949 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15926349 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15926484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15926785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15927000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15927089 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15927570 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15927716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15928354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15928937 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15929572 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15930441 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15930460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15930746 T A Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 15930847 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 15930968 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15931096 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15931442 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15931872 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 15932088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15932094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15932322 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15932553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15932710 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15932730 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15932778 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 15933159 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 15933220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15933247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15933392 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 15933410 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 15933423 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15933446 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15933450 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15933537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15933559 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 15933578 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 15933622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15933952 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15933955 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15934152 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 15934422 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 15934996 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15935231 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15935233 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 15935728 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15935835 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 15935918 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 15935919 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 15935927 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15936046 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 15936128 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15936147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15936245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15937806 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15939467 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 15939745 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 15939749 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 15939757 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 15939823 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 15939852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15940668 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 15940884 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 15941725 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15942044 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 15942130 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15942232 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 15942782 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 15943564 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 15947991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15948321 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15948415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15948511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15948523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15948583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15950022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15950325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15950514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15950536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15950576 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15950651 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 15950728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15951082 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 15952959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15952970 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15953036 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 15953878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15954018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15954117 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15954434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15954734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15955853 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 15957491 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15958906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15959551 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15961732 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15962203 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15962520 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15963371 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15964152 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 15964357 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15966796 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 15968448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15969215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15970662 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15971641 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 15971735 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15973462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15973826 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15973967 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15975172 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15975229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15975505 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 15978787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15980917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15980957 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15981339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15981577 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15981611 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 15981736 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15981859 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 15981889 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15981959 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 15981971 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 15982152 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 15982234 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 15982257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15982397 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 15982466 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 15982492 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15982507 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15982529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15982593 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15982763 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15982796 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 15982797 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 15983101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15983240 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15983409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15983415 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 15983719 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 15984207 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 15984395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15984397 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 15984451 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 15984462 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 15984507 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 15984563 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 15984917 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15985096 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15985263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15985301 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15987954 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 15989141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15990207 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 15990288 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 15990334 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15990515 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15990579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15990980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15991224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15991930 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 15993707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15994799 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 15995072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15995078 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 15995206 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 15995382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15995392 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15995629 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15995642 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15995651 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15996048 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 15996566 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 15996706 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 15996757 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 15996799 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 15996800 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 15997009 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 15997275 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 15997772 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 15998403 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 15998638 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 15998639 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16000641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16000867 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16001061 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16001226 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16003480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16003636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16003810 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16006490 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 16007258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16007287 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16007474 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 16007501 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16007504 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16007549 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16008080 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 16008409 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16008458 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16008595 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 16008607 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 16008983 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16008985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16009002 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16009011 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16009053 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16009061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16009066 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16009146 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 16009241 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16009464 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 16009472 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16009512 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16009543 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 16009794 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16010115 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16010318 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16010351 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 16010358 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16010523 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16010681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16010699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16010712 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 16010757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16010956 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 16011053 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 16011151 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16011178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16011286 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 16011296 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16011346 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 16011352 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 16011559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16011599 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16011727 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16011780 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16011818 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16011847 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 16011861 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 16011886 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16012486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16012488 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16012584 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16012589 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16012624 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16012793 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16012846 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16012885 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16012893 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16012917 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16012928 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16012969 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16013258 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 16013440 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16013578 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16013622 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16013648 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16013688 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 16013764 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 16013879 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16013906 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 16013920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16013954 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16014002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16014089 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16014171 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16014212 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 19 16014441 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16014442 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 16014672 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 16014730 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 16014801 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 16014808 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16014823 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16014906 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 16014973 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16015003 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16015251 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16015305 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 16015416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16016262 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 16016317 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 16016540 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 16017456 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16017549 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16019124 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16020411 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 16020413 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 16020427 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16020532 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 16020633 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 16024028 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16024386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16024412 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16024797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16024921 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16024959 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16025109 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16025110 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16025130 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 16025131 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 16025132 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 16025606 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16025627 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16025640 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16025658 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16025659 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16025691 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16026220 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16026364 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16026381 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 16026382 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 16026455 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16026464 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16026475 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16026564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16026598 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16026694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16026782 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 16027796 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 16028372 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16028881 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 16034220 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16034952 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16036071 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16036111 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16036316 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16036319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16037047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16037080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16037938 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16038010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16038101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16038554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16039322 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16039439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16040727 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16040854 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16040951 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16041552 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16042979 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16043071 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16043186 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16043544 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16043755 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16043985 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16043999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16044010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16044270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16045716 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16046353 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16046454 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16047342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16047383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16047463 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16047604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16047636 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16047678 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16047771 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16047868 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16047872 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16047891 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16047894 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16047908 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16047989 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 16048189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16048331 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16049408 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16049659 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16050252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16050646 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 16050732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16050897 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16050903 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16050928 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16051007 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16051008 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16051022 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 16051023 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16051030 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16051413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16051647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16051962 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16051968 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16051988 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16051991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16051995 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16052082 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16052095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16052101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16052117 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16052119 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16052133 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16052137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16052181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16052278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16053163 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16053225 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16053238 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16053410 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16053530 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16053575 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16054016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16054720 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 16054772 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16055044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16055112 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 16055157 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16055503 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16056232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16056429 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16056440 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16056655 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16056800 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16056934 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16056945 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16056956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16057092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16057093 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16057181 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16057276 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 16057381 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 16057464 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 16057703 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16057805 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16057870 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 16058060 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 16058097 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 16058104 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 16058356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16058531 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 16058591 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16058610 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16058657 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16058743 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16059658 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16059947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16059989 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16060066 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16060245 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16060260 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16060273 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16060297 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16060363 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16060368 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16060370 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16060421 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16060524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16060545 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16060549 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16060574 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16060617 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16060691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16060718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16060776 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16060836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16060852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16060863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16060933 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16061123 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16061131 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16061469 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16061521 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16061657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16061769 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16061843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16062261 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16062435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16062489 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16062746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16063073 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16063138 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16063268 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16063449 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16063549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16063600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16063796 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16063906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16063959 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16063962 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16063991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16063999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16064026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16064143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16064211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16064215 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16064232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16064520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16064582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16064747 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16064937 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16064984 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16064985 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16065005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16065112 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16065163 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16065164 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16065177 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16065180 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16065208 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16065268 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16065328 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16065341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16065354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16065437 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16065588 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16065733 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16065870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16065903 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16066055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16066091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16066121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16066237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16066352 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16066566 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16066965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16066991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16067181 T A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 16067245 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16067256 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16067274 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16067280 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16067289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16067364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16067392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16067427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16067626 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16067721 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16067819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16067866 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16067868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16067988 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 16067989 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16067997 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16068002 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16068132 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16068255 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16068267 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16068778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16068868 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16068884 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16068886 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16068893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16068959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16068966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16069329 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16069384 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16069468 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16069607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16069705 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16069729 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16069749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16069769 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16069811 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16069820 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16069828 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16069837 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16069983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16070111 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16070347 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16070640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16070641 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16070670 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16070798 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16070816 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16070860 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 16070905 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16071221 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 19 16071347 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16071397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16071419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16071420 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16071434 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16071476 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16071682 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16071728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16071729 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16071811 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16071813 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 16071820 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 16071834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16071917 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16072041 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16072079 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16072168 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 16072299 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 16073501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16073997 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16074277 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16074473 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16075225 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16076777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16076884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16076891 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16077295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16077441 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16077494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16078030 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16078379 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16079371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16079449 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16079647 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16079657 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16079807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16079887 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16079888 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16079990 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16079992 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 16080086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16080129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16080193 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16080214 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16080250 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16080281 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16080324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16080336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16080507 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16080516 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16080631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16080833 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16080896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16080903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16081076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16081419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16081597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16081770 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16082603 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16082790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16083116 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16083296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16083347 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16083626 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16083975 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16084100 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16084106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16084193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16084384 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16084571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16084632 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16084709 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16084790 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16084901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16085002 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 16085146 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 16085473 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16085536 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16085577 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16085583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16085803 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16085815 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16085900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16085910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16085927 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16085951 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16085972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16086034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16086035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16086079 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16086134 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16086149 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16086167 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16086168 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16086182 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16086286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16086296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16086399 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16086423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16086507 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16086892 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16086971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16087850 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16087853 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16088378 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16088392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16088571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16088579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16088611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16088684 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16088727 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16088753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16088760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16088772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16088852 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16088862 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16088881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16088970 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16089053 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16089059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16089063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16089132 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16089154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16089494 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16089618 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16089768 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16090467 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 16090825 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16090936 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16091144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16091214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16092616 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16093618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16093712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16094005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16094132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16094232 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16095316 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16097449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16097826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16098737 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16100009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16101697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16105876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16105947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16106058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16106176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16106303 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16107574 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16107624 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16107663 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16108733 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 16108955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16109021 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16109050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16109054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16109068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16109185 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16110039 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16110209 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16110258 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16110625 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16110653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16110745 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16110747 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16110840 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16110876 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16112422 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16112621 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16112642 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16112740 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16112873 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16112900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16112990 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16113068 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16113127 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16113136 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16113140 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16113220 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16113331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16113350 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16113461 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16113594 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16113628 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16113796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16113842 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16113984 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16114017 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16114154 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16114163 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16114194 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16114304 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16114310 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16114551 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16114865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16115967 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16116445 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16116449 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16116655 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16116984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16117201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16117263 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16119137 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16120105 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16122255 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16122644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16123290 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16123700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16124068 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16124865 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16125568 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16129017 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16131671 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16131886 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16132218 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16132299 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16133181 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 16134658 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16136639 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16137535 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16138018 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 16139239 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16141020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16141120 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16141154 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16141243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16144585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16144667 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16145033 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16145454 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16147509 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16151921 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 16152047 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 16152123 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16153373 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16153410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16154144 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16154427 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16155468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16159259 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16159467 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16159987 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16160658 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16163524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16163741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16163956 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16164244 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16165074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16167287 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16167411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16167997 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16168391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16171714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16172494 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16173314 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16174634 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16177671 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16177746 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16177750 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16178313 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16178542 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16179421 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 16180998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16182444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16183241 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16185584 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16186372 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16186449 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16187181 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16188066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16188458 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16189437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16189551 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16190736 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16193579 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16197230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16197438 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16199516 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 16200595 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16202623 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16203420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16210039 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16211389 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16212815 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16213982 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16214104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16215482 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16216202 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16217269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16217951 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16218688 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16219801 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16222683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16222736 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16223846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16226447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16227624 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16227877 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16231702 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16232847 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16233762 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16234179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16237214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16240860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16240959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16241055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16241316 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16241489 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16243468 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16243535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16244070 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16244458 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16244913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16246007 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16247857 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16248015 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16248125 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16249129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16250013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16250970 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16253554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16254275 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16258180 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16258223 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16259054 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16261496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16261641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16261818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16261877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16264122 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16265770 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16266190 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16266937 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16273731 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16273854 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16274145 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16274229 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16275459 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 16275465 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 16275661 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16275879 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 16276005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16276102 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16277843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16278121 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16278664 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16278964 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16279343 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16279346 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16279467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16280077 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16280785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16280845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16280869 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16280932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16281089 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16281445 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16281567 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16281761 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16281946 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16282606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16283818 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16284425 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16284978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16285471 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16285472 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16285600 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16285621 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16285632 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16286140 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16286171 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16287359 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16287930 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 16288772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16289032 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16289105 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16289412 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16290360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16290450 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16290588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16290881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16290924 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16291279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16291393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16291429 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16292711 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16293031 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16295008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16295882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16296829 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16297008 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16297516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16297655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16297896 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16297932 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16298098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16298287 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16298429 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16298545 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16299135 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16299145 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16299407 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16299414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16299637 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16299900 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16299928 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16300069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16301475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16302175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16303091 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16303337 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16303659 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16306296 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16307181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16307810 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16309426 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16309508 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16310113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16312140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16313765 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16313901 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16315731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16315768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16316814 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 16317660 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 16317883 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 16318401 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16319523 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16322200 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 16322848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16323292 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 16323743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16323845 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16327305 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16328503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16328626 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16328780 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16328854 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16329266 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 16329873 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 16329875 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 16330554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16331818 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 16333529 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16334174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16334335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16336300 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16336704 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16344957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16345321 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16347619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16351436 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 16352107 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 16352603 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16353442 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 16354306 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 16354488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16354511 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 16355631 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16355650 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 16355716 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16356259 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16356272 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16356359 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16356363 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16356377 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16356413 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16356417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16356450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16356473 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16357075 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16357082 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 16357086 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 16357416 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 16357646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16357694 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16357702 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16358168 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16358390 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 16358396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16358420 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16358444 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16358518 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16358669 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16358956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16358994 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16359066 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16359075 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16359172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16359202 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16359303 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16359351 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16359352 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16359386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16359472 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 16359474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16360351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16361320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16361405 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16363891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16365440 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16365471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16366535 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16366829 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16366871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16367507 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16368258 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16371503 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16375436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16376281 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16376557 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16378118 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16380177 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16380664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16381415 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16382488 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16382502 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 16382527 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 16383176 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16383366 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 16383652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16383766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16387521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16389556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16390345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16394421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16398175 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16398584 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16398902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16399233 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16399552 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16400417 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 16400419 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 16401773 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16402011 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16402525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16402573 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16403749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16404796 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16405021 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16405926 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16406958 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16411357 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16415559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16417565 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 16417892 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16418331 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16420201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16420617 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16421158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16421275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16422652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16423239 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16423369 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 16423440 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16424127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16428554 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16428555 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16428570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16429232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16429527 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16429669 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16429674 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 16429834 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16430066 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16430613 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 16430726 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16430741 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16430930 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16431091 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 16431098 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 16431203 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16431374 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 16431478 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16431485 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16431623 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16431946 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16432012 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16432083 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 16432185 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16432366 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16432774 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16433224 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16433370 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16433538 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16433604 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 16433645 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 16433646 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16434404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16434615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16434678 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16435071 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16435490 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16436070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16436265 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 16436289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16436647 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16436664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16437017 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16437211 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 16437343 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16437561 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 16437725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16437838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16437839 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16438250 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 16438810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16438969 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16439595 C A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 16439666 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 16439727 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 16440300 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16440600 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 16440618 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 16440790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16440816 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 16440817 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 16440964 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16441303 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16441516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16441639 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16441964 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 16443533 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 16445155 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16445568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16447816 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 16447971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16448016 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16448343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16450544 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16450601 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16450734 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 16450893 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16450906 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16450949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16452396 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16453343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16455021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16455322 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16455986 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16456165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16457265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16457803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16458646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16459736 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16466493 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16466917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16467532 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16468136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16468201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16468416 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16468457 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16469375 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16470587 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16470809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16470961 C A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 16470965 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 16471069 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 16471086 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 16471108 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16471364 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16471367 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16471544 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16472460 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16472512 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16472530 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16472552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16472643 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16472678 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16472758 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 16472772 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 16472931 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16473038 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16473094 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 16473185 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 16473723 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16473773 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 16473774 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 16473842 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16474022 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 16474190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16474538 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16474599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16474830 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 16475093 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 16475096 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 16475247 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16475631 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 16475633 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16475766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16476148 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16476180 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16476286 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 16476299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16476348 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 16476359 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 16476511 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 16476621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16476727 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 16476743 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 16476903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16477007 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16477011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16477014 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 16477036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16477242 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16477254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16477378 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16477512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16477542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16477718 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16478025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16478309 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 16479454 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 16481110 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 16481225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16481321 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 16481336 T G N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 19 16482823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16483133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16483590 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16483775 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 16487202 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 16488381 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 16488459 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16489975 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16491678 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16491731 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16491749 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16491943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16493504 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 16493508 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 16496989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16497187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16497374 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16503061 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16508529 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16509153 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16509163 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 16509303 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16509325 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16509336 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16509510 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 16509581 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 16509596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16509640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16509793 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 16509811 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 16509900 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 16510159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16510183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16510567 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16510592 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 16510601 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 16510603 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16510646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16510652 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16510673 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 16510797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16511060 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16511077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16511099 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16511501 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16511846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16511972 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16512244 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 16512465 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16512912 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 16512937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16513074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16513075 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16513131 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 16513237 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16513264 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 16513289 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 16513322 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 16513353 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 16514483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16514574 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16514931 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 16515932 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16515954 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16516849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16516877 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 16516928 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16517472 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 16517562 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16517583 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16518182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16518282 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16518313 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 16518394 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16519664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16520079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16520752 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 16521236 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16522423 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16524185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16525556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16528115 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16528125 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16528133 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16529733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16531469 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16535102 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 16535728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16535779 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 16535782 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 16535997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16536249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16536379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16536826 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16537022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16537044 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16537150 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 16537153 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 16537211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16537353 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 16537479 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 16537490 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 16537681 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 16538001 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 16538140 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16538162 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 16538201 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16538241 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 16538312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16538987 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 16539013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16539036 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16539050 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16539061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16539122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16539135 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 16539236 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 19 16539282 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 16539375 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16539491 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 16539502 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16539520 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16539556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16539601 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 16539610 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16539734 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 16539749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16539803 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16539896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16539907 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 16539916 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16540116 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16540136 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 16540146 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 16540274 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16540646 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 16541190 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 16541270 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16541299 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 16541307 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 16541332 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16541415 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 16541556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16541622 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16542380 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16542931 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 16543053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16543106 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 16543177 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 16543922 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 16543940 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 16544009 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 16544270 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 16544358 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 16544364 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 16544486 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 16544590 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16544618 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 16544653 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 16544832 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16545312 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 16545461 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16545468 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16545492 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16546137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16546145 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 16546373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16546537 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 16547172 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 16547782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16548187 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 16548190 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 16548299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16548342 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16548437 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 16548449 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 16548488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16548793 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 16548802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16548902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16548908 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16548938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16549092 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16549169 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16549441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16549731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16549849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16549954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16550230 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16550256 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16550329 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16550409 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 16550430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16550544 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16550925 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 16550971 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 16551048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16551167 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 16551182 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16551249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16551400 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 16551990 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 16552027 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16552278 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16552294 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 16552372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16552654 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16552879 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16553847 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16555030 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 16555061 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 16555375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16555492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16555604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16555741 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 16556072 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 16556237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16556271 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 16556507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16556512 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16556675 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 16556738 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 16556961 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16557936 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 16557987 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 16558080 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 16558186 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 16558376 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 16558378 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16558382 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 16558503 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16558607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16558721 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 16558797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16558895 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16558970 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 16561121 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 16561239 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16562403 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 16562967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16562987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16563037 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16563380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16563383 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 16563388 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 16563420 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 16563434 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 16563733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16563816 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16563859 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16563868 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16563879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16563893 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16563899 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 16564010 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 16564114 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 16564576 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 16564599 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 16564861 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 16564936 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 16564982 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16565036 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16565080 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 16565081 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 16565082 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 16565140 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 16565219 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 16565304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16565357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16565589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16566208 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16566210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16566416 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16566678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16567024 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 16567162 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 16567555 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 16567644 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 16567680 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 16567689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16567697 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 16567709 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 16567844 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 16567855 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 16568042 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 16568049 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 16568056 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 16568114 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 16568130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16568251 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 16568427 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 16568488 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 16568514 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 16568535 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 16568543 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 16568791 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 16569031 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16569106 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 16569360 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 16569382 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16569394 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 16569395 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16569397 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 16569454 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 16569480 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 16569495 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 16569504 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 16569509 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 16570668 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 16570753 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16570897 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16571028 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 16571098 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 16571141 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 16571143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16571147 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 16571196 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 16571449 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 16571638 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 16571748 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 16571827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16571963 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 16572016 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 16572031 G C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 16572097 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 16572460 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16572902 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 16572958 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 16573014 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 16573019 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 16573054 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 16573319 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 16573483 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 16573691 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 16573814 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16573820 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16573821 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16574031 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 16574067 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 16574170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16574428 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 16574434 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16574533 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 16574811 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16575280 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 16575331 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 16575371 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 16576577 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 16576640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16576759 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16576793 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16578168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16578952 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16579934 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 16580844 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 16580965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16580994 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 16581883 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 16582549 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 16583848 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16584391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16585061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16585461 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16585774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16586053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16586683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16586805 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 16592702 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 16592750 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 16593061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16593209 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16593211 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 16594626 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16594897 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16596767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16597508 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 16597515 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 16597557 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 16597559 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 16598632 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 16598672 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 16598986 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 16599167 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16599168 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16599298 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16599474 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 16599589 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 16599612 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 16599760 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 16600846 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 16600976 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 16601116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16601185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16601187 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16601262 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 19 16601357 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 16601363 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 19 16602233 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 16602239 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 16602251 A T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 19 16602473 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 19 16602477 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 19 16602574 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 16603266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16605193 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 19 16606104 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16608490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16608985 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 19 16610436 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16612260 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 16612380 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 16612715 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 16612723 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 16614095 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16614225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16615097 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 16615798 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 16616032 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 16616177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16617245 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16617454 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 16617457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16618828 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 16624170 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16628769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16631719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16631785 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 16631802 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 16632020 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 16632670 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16632701 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 16632986 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16636626 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16638468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16640128 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16640396 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16640592 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16641133 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 16641218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16641703 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 16641739 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 16642278 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16642289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16642302 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16642307 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16642334 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16642359 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 16642401 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16642427 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16642445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16642463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16642477 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16642478 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 16643026 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16643083 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16643085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16643342 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 16643384 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16643408 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 16647333 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 16647731 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 16651511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16652031 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16652410 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16652539 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 16653033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16653082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16653090 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16653585 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 16653702 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 16653720 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 16653765 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 16653768 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 16654135 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16654464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16654708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16654821 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 16655357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16656743 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 16656959 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 16656989 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 16657012 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 16657024 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 16657101 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 16657204 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 16657253 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 16657359 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 19 16657390 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16657449 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 16657450 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 16657638 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 16657782 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 16657786 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 16657831 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16658101 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 16658207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16658309 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 16658447 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16658448 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16658450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16658579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16658768 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 16658831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16658900 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16658901 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16658929 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 16658937 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 16658942 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 16658955 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 16659946 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16659987 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16659989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16660017 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16661482 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16662185 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16662938 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 16663046 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16663372 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 16663480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16663891 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 16663892 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 16663975 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 16664251 T C N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 19 16664253 G A N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 19 16664331 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 16664445 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 16664506 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 16664572 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 16664972 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 16665438 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 16665810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16665895 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 16665914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16666836 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16667732 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16668350 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 16668357 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 16668599 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 16669486 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 16669505 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 16669580 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16669897 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16669965 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 16670028 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 16670057 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16670064 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 16670354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16670358 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16670404 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16670405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16670459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16670718 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 16670890 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 16670897 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16671561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16671577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16671581 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 16671677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16671680 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16671696 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16671702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16672220 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16672279 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16672380 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16672381 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16672388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16672893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16672897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16673154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16673289 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 16673323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16673784 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16673959 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 16674913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16675181 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 16675182 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16675203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16675254 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16675258 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16675283 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 16675284 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 16675670 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 16675671 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 16675793 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.7 0.05 0.25 29 11 14 1 5 19 16675917 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 16676014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16676022 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 16676232 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 16676247 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.6 0.133333333333333 0.266666666666667 20 10 9 2 4 19 16676345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16676482 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16676708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16676729 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16676871 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 16677016 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16677072 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 16677142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16677171 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 16677175 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 16677320 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 16677395 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16677459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16677531 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 16677824 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 16677904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16677932 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 16677939 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 16678320 T G Y N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 19 16678439 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16678453 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16678459 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16678498 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 16678570 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 16678755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16678797 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 16678857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16678945 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16678952 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16679168 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 16679256 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 16679742 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 16679761 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 16679795 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 16680063 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 16680064 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 16680234 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 16680238 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 16680292 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 16680387 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 16680425 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 16680519 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 16680557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16680772 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 16680896 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 16680938 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 16680968 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 16681476 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 16681596 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16681986 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16682203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16682379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16682966 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16683179 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 16683293 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16683798 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16683813 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16684282 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16684424 T A N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 19 16684658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16684701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16684722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16684926 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16684936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16685088 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16685176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16685190 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16685447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16685621 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16685661 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 16685750 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16686092 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16686152 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16686565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16687564 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 16687854 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 16688023 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 16688421 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16688608 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16688816 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16690229 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16690727 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 16691243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16691314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16693794 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16693818 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 16694487 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16695828 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 16696776 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16698045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16698327 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 16703541 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16703769 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 16705966 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16706600 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 16713986 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 16715174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16716619 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16716704 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 16716777 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16717491 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16717532 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 16717717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16717877 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 16718053 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 16718616 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 16719873 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 16719876 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16719887 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 16719988 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16720063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16720365 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 16720590 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16720633 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16720647 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16720678 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16720690 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16720800 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16724879 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16724958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16725364 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16725483 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16726437 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 16726763 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 16726851 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 16726852 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 16726938 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16726967 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 16727314 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16727547 T G Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 16727940 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 16729274 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 16730124 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 16730126 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 16730141 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 16730689 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 16730817 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16730969 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 16731353 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16731376 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 16731442 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 16731461 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 16731486 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 19 16731595 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 19 16731712 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 19 16731738 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 19 16731980 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 16732083 C A Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 16732124 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 16732220 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 16732244 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 16732362 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 16732434 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 16732565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16732660 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 16732733 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 16732831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16732909 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 16732929 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 16733328 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 16733340 C G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 16733420 A C N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 19 16733460 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 19 16733580 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 16733637 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16733919 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 16733971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16734018 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 16734037 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 16734501 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 16734564 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 16734583 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 16734763 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 16735048 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 16735051 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 16735148 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 16735159 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 16735643 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 16735650 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 16735761 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 16736009 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 16736083 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 16736085 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 16736267 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 16736405 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 16736482 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 16736840 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 16736848 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 16737154 T C N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 19 16737275 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16737324 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 16737373 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 16737451 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 16737556 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 19 16737986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16738071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16738608 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16738620 G C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 16738652 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16739548 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 16740069 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 16740432 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16740528 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16740900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16740998 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16741095 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16741265 A G Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 16741771 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16741938 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 16742025 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 16742324 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 16743256 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 16743603 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 16743611 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 16743629 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 16743978 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 16744103 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 16744115 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 16744667 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 16744740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16744932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16748986 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16749572 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16749595 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16750029 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 16750732 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 16750950 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 16751150 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 16751169 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16751498 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 16751683 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16751749 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16751842 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16751926 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16751972 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16752056 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16752077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16752126 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16752220 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16752597 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 16752727 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 16752948 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 16753011 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 16753119 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16753278 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 19 16753776 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16753833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16754139 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16754204 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 16754393 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 16754413 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 16754948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16755818 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16756350 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 16756357 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 16756392 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 16756791 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 16756880 T A N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 19 16757537 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16757607 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 16757608 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 16758128 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 16758169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16758294 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 16758386 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 16758511 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 16758563 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 16758648 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16758898 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 16758968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16758971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16759059 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 16759384 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 16760030 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16760425 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16760613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16760651 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16760735 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16761341 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 16761380 C A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 16761476 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 16761723 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 16762419 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 16762446 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 16762619 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16762778 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 16763199 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 16763661 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16763962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16764383 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16764422 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16764464 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 16764473 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 16764479 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 16764487 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 16765069 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16765141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16765221 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 16765478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16765611 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16765982 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16766138 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16766209 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16766250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16766628 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16766646 C T Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 16767793 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 16782893 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16784111 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16784965 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16786248 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16786680 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 16788606 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 16788995 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 16789281 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 16789357 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 16789638 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16790104 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 16790253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16790264 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 16790265 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16790453 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 16791386 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 16791447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16791448 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 16791466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16791512 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16791624 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 16791677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16792121 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 16792124 T A Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 16792205 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 16792559 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 16792626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16792897 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 16793334 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16793348 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 16793441 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16793456 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16794224 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 16794241 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 19 16794272 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 16794669 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 19 16794915 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16795857 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 16795887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16795910 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 16796503 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 16797021 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 16797430 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16797484 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16797559 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16797586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16797593 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16797661 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 16797734 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 16797742 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16798785 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 16798937 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 16799063 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16799928 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 16799990 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 16800083 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 16800276 C G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 16800277 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 16800859 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 16800924 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 16800937 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16801379 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 19 16801399 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 19 16801534 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16801546 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 16801920 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 16801923 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16802166 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16802594 T A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 19 16802602 T G N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 19 16803191 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 16803230 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 16803316 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 16803364 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 16803734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16803781 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 16804059 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 19 16804156 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16804308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16804395 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16805672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16806403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16806747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16807136 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16807147 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 16807354 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16807677 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 16807724 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16807741 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16808011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16808113 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 16808284 A T N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 19 16808453 T C N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 19 16808473 C A Y N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 19 16808506 A G Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 16808685 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16808694 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 16808744 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 16808832 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16809000 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 16809025 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 16809046 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 16809362 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16809378 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16809397 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16809531 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 16809666 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 16809767 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 16809772 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 16809783 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 16809828 A T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 16809840 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 16809914 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 16810066 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 16810738 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16810814 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 16810827 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 16810936 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 16811180 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 16811292 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16811428 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 16811502 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 16811524 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 16811525 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 16811623 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 16811701 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 16811842 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 16811948 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 16811955 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16811989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16812149 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 16812243 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 16812398 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 16812565 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 16812614 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 16812630 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 16812733 G C N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 19 16812921 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 16812930 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 16812950 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 16812953 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16812993 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16813333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16813426 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 16813429 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 16813445 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 16813497 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 16813703 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 16813928 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 16814086 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 16814212 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16814321 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 16814335 G C N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 19 16814339 T C N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 19 16814454 G T N N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 19 16814740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16814794 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 16815062 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 16815097 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 16815113 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 16815130 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 16815444 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 16815507 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16815593 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 16815775 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16816008 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 16816048 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16816079 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 16816354 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 16817100 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16817176 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 16817233 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16817315 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 19 16817774 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16817777 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 16817973 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16817974 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16818159 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16818262 G T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 16818401 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 16818805 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 16818894 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 16819033 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 16819074 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 16819132 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 16819164 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 16819242 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 16819930 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 19 16819933 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 16820006 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 16820011 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 16820022 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 16820157 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 16820611 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 16820648 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 16820758 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 16820926 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 16820948 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 16821290 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 19 16821323 T A N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 19 16821335 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 16821626 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16821788 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 16822097 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 16822180 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16822189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16822194 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16822219 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 16822247 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 16822258 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 16822348 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 16822411 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 16822484 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 16822529 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16822710 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 16822849 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 16823217 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 16823517 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16823545 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 16823689 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 16823695 T C Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 19 16823696 G C N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 19 16824213 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 19 16824340 C A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 19 16824663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16824808 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16825203 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 16825244 A T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 19 16825323 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 16825476 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 16825635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16825637 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16825809 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 16826479 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16826952 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16826991 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 16826996 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 16826997 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 16827232 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16827313 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 16827458 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 16828087 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16828130 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16828277 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16828973 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16829130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16829313 G T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 16829871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16829921 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 16830072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16830266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16830298 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16831136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16833740 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16834582 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16837949 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 16840970 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 16842925 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16846518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16848227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16850530 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16853126 G T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 16854147 G A Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 16854827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16855684 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16855748 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 16855838 G C Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 16855850 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 16855978 A T Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 16856043 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 16856094 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 16856712 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 16857874 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 16858592 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16859170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16859262 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16859875 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 16861094 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16861111 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16861230 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16861242 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16862482 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16865606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16865969 A T N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 19 16867735 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16868663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16869435 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 16869896 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16871421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16871624 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16872520 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 16872783 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 16872942 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 16872962 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 16873123 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 16873291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16873438 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 16873440 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 16873499 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16873562 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 16873592 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 16873604 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 16873621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16874226 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 16874273 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 16874332 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 16874376 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 16874392 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 16874526 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 19 16874656 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 19 16874698 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 16874874 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 19 16874970 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 16875000 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 19 16875044 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16875137 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 16876671 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 16877017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16877101 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16877102 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 16877153 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 16877204 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 16877213 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 16877494 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16877527 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16877944 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 16877949 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16877952 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 16877953 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 16877993 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16878075 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 16878089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16878133 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 19 16878183 C G Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 16878187 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16878203 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16878211 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16878338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16878436 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 16878539 A T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16878551 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16878703 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16878916 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16878929 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16879074 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16879855 C G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 16879887 C A Y N 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 19 16879890 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 19 16880002 T C N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.428571428571429 0.214285714285714 0.357142857142857 15 13 6 3 5 19 16880026 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 16880080 A C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.411764705882353 0.117647058823529 0.470588235294118 16 18 7 2 8 19 16880110 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 16882719 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16885271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16886076 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16886523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16886866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16887196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16888414 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16890660 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16892000 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16893701 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16894566 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16894950 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16898682 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 16900758 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16901132 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16901198 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16902171 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 16902355 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16904608 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 16905774 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 16905794 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 16905798 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 16905824 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 16906144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16906558 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 16906582 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 16906814 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 16906890 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 16906943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16906965 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 16906987 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 16907009 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 16907121 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 16907139 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 16907142 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 16907179 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 16907238 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16907310 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 16907377 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 16907382 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 16907406 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 16907438 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 16907454 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 16907456 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 16907521 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 16907536 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 16907549 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 16907626 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 16907639 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 16907790 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 19 16907837 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 16907910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16908236 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16908242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16908325 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16908339 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 16908362 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 16910108 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 16910931 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16911992 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16912278 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 16912397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16913498 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 16914358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16915618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16918977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16920750 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16921804 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16923375 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16924391 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16924416 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 16924649 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 16924725 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 16924755 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16925201 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 16925225 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 16925232 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 16925516 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 16925697 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 16925714 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 16925763 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 16925923 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16925956 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 16926050 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 16926057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16926067 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 16926090 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16926103 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 16926230 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 16926337 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 16926371 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 16926378 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16926562 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 16926602 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16926603 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16926657 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16926885 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 16926886 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16926902 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16927076 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 16927102 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16927198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16927650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16927663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16927718 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16927772 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 16927782 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16927952 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 16928018 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16928135 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16928200 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16928921 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 16928969 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 16929127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16929202 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 16929675 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 16930027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16930081 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16931645 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16931661 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16932133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16932235 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 16932520 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 16932532 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 16932839 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16932843 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16933121 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 16933128 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 16933225 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16933297 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 16933472 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 16934262 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 16934682 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 16934702 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16935031 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 16935094 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 16935207 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 19 16935347 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 19 16935349 T G N N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 19 16935421 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 16935499 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 19 16935572 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 16935585 A C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 16935622 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 19 16935662 C T N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 16935763 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 16935778 G A N Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 19 16935955 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 16936014 A T N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 16936025 G C N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 16936143 T C N Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 19 16936155 T G N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 16936217 C T N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 16936255 C T N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 16936256 G A N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 16936322 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 16936325 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 16936345 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 16937234 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 16937284 T G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 16937338 C A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 16937486 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 16938286 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16938597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16938967 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16938984 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16939456 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16939972 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 16940051 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 16940128 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 16942520 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16942752 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 16942830 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 16943458 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16943621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16943869 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16944138 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16944548 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 16944641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16945190 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16945216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16945279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16946193 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 16947735 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16948149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16948541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16948786 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 16948822 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 16949248 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16949462 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16950719 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16951391 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16951706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16951834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16952352 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16952355 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16952388 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16952926 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16954535 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 16955646 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 16955728 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 16955772 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 16955951 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16956569 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16956886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16956977 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16957006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16957361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16957363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16957527 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 16957809 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 16957919 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16957944 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 16958258 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 16958275 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 16958329 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16958614 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 16958743 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16958844 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16958846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16958847 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 16959996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16960084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16960452 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16960964 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16961408 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 16961942 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16962391 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 16966899 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 16966928 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 16966946 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16967059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16968203 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 16970000 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16970014 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16970341 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16974657 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16974685 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16974707 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 16974723 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 16974909 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16976444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16976722 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16977221 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16979435 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16979588 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 16979627 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 16980250 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16981765 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 19 16982050 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16982127 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 16982186 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16982228 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 16982930 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16982948 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 16983492 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16983977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16983998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16984221 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16984231 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 19 16984264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16984274 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16984337 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16984373 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 16984464 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 16984721 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 19 16985072 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.2 0 0.8 6 24 3 0 12 19 16985135 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16985268 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 16985574 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16985628 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 19 16985707 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16986282 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16986391 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16986432 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 16986460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16986585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16986624 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 19 16986650 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 19 16986651 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 16986842 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 19 16987465 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 6 30 3 0 15 19 16987555 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 19 16987628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16987727 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16987749 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 19 16987860 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 19 16987901 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 16987940 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16987941 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16988123 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16988127 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 16990551 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16992582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16993362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16993525 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16993978 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16994558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16994567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16996549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16996551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16996552 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16996555 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16996600 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16996631 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16996676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16996686 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 16996940 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 19 16997332 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17001137 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17001872 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 19 17002786 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17009817 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17010903 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17012198 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 19 17012320 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17012521 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 19 17012529 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 19 17012540 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.294117647058824 0 0.705882352941177 10 24 5 0 12 19 17012541 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 19 17012737 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 19 17012896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17013532 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 17013573 C G N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.75 0 0.25 18 6 9 0 3 19 17013794 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.1875 0 0.8125 6 26 3 0 13 19 17013811 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.277777777777778 0 0.722222222222222 10 26 5 0 13 19 17013812 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.277777777777778 0 0.722222222222222 10 26 5 0 13 19 17013861 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17013964 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 19 17014095 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.25 0 0.75 10 30 5 0 15 19 17014271 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17014622 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17015853 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17017694 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17019145 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17020472 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17021167 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17021415 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17021757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17025330 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17025801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17026634 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17027523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17027637 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17027811 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17030734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17030855 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17030863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17032411 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17032491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17033634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17034358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17035347 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17038158 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17038239 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17039326 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17040818 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17040962 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17041792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17042490 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17043255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17044055 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17044056 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17044455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17045172 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17046066 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17046576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17046613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17047552 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17047879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17048296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17050014 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17051248 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17051277 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 17051560 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17051768 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17052165 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17053512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17053557 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17053869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17053893 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17053937 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 17054110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17055308 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17056475 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17056583 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17056788 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 17056836 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 17056908 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 17057001 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17057062 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17057102 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17057236 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 17057357 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17057377 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17057461 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 17057738 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 17057803 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 17058181 G A N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.153846153846154 22 4 11 0 2 19 17058776 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17058932 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17059053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17059901 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 17060085 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17060135 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 17060141 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 17060215 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 17060785 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 17060880 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 19 17062636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17063051 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17063112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17063398 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 19 17063415 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 17063426 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 17064470 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17065020 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17065041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17065152 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17065173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17065230 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 17065254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17065457 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 17065541 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17065685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17065709 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17065855 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17066605 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17066610 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 17066636 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17066724 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17066730 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17066745 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17066794 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17066940 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17067272 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 17067382 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 17067678 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 17067688 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 17067726 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 17067736 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 17067815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17067911 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 19 17068283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17068284 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17068412 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17068460 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17068497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17069842 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 19 17070572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17070798 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17071130 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17071278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17071309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17071435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17072005 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17072053 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17072104 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17072180 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17072276 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17072888 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17073241 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 17073337 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17073570 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 19 17073573 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17073618 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 4 24 2 0 12 19 17073647 C T N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.181818181818182 0 0.818181818181818 4 18 2 0 9 19 17073702 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 17073708 G T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 19 17073712 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 19 17073728 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 19 17073736 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17073769 A C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 19 17073885 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 19 17074015 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17075173 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17075293 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17076090 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17076410 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17076920 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17078326 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17079268 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 17081364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17083272 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17083358 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17083555 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17083560 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17083690 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17085189 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17086034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17086360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17086392 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17086446 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17086767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17086956 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17087057 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17087079 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17087187 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17087555 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17087580 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17087594 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17087641 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17087643 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17087654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17088251 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17088935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17088966 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17089126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17089491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17089687 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17089833 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17089845 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 17090024 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17090087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17090325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17090485 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17090649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17090792 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17090909 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17091000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17091083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17091122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17091570 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17091718 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17091839 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17091883 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17091886 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 17091930 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 17091931 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 17091984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17092033 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17095195 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17095920 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17095998 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17096104 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17096177 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 17096522 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17096577 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17096580 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17096598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17096624 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17096890 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17096912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17096946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17097807 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 19 17097825 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17097847 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17097865 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17097996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17098017 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17098142 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17099421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17099485 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17100359 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17100976 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 17101523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17102925 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17105663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17106400 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17106809 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17106946 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17107326 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17107410 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17107654 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17108020 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17108216 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17108470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17108747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17108934 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17108943 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17109167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17109198 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17109218 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17109246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17109261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17109447 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17109681 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17109916 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17109960 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17109967 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17110147 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17110148 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17110189 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17110216 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17110249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17110361 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17110387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17110453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17110498 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17110529 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17110560 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17110577 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17110610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17110613 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17110648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17110665 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17110706 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17110755 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17110894 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 17111117 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 17111323 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17111327 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17111350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17111369 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17111376 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17111456 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17111464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17111656 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17111659 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17111753 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 17111778 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 17112762 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17112821 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17112832 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17112899 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17113017 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17113091 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17113800 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17113884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17114821 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17114922 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17115041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17115207 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 17115288 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 17115310 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17115321 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17115461 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 17116080 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 17116400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17116531 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17116724 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 17116799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17116870 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 17117212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17118026 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17118037 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17118078 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17118105 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17118220 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17118359 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17118360 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17118603 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17118632 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 17118634 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 17119540 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17122135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17122158 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17122229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17122259 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17122267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17122345 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17122677 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17122713 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17122838 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17122855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17122975 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17122993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17123372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17124007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17125014 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17125357 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17128387 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 17128577 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 17128613 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17128652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17129532 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 17129535 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17130046 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17130057 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 17130068 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17130283 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 17130447 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17130455 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 17130492 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 17130493 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 17130680 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 17130687 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 17130764 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 17130768 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 17130773 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 17130788 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 17130796 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 17130951 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17130952 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17131139 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17131148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17131243 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 17131253 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 17131264 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 17131623 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 17131750 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 17131793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17132133 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17132233 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 17132362 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17132439 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 17132492 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 17132497 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 17132723 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 17132945 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 17133176 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17133179 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17133291 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17133331 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17133352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17133395 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17133417 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17133458 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17133500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17133530 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17133613 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17133624 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17133625 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17133830 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 17133877 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17133889 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 17133922 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17133926 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17134105 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 17134245 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 17134294 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 17134299 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 17134311 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17134329 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 17134396 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17134520 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17135061 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17135113 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17135154 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 17135418 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 17135781 G C N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 19 17135829 C G N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 19 17135832 T A N N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 19 17136083 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 17136152 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 17136182 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 17136470 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 17136491 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 17136517 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 17136526 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 17136532 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 17136645 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 17136670 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 17136764 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 17136831 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 17136843 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 17136845 A C Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 17136864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17136887 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17136905 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17136908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17136933 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 17137102 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 17137116 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 17137126 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 17137140 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17137164 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 17137246 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 17137551 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 17137735 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 17138059 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 17138100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17138171 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 17138232 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 17138271 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17138421 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 17138510 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 17138588 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 17138610 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 17138708 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 17138711 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 17138767 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17138770 A G Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 17138799 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 17138818 G A Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 17138832 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 17139239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17139305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17139325 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 17139669 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 17139796 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 17139833 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 17139857 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17139882 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 17139965 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 17139989 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 17140030 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 17140050 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 17140588 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17140809 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17141604 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17142584 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17143069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17143080 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17143147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17143168 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 17143929 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17144592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17144774 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 17145376 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17145475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17145520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17145586 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17145625 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 17145797 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17146259 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 17146347 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 17146358 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17146565 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 17146804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17146825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17146856 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17146948 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 17147026 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 17147388 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 17147432 G T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 19 17147453 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 19 17148947 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 17149427 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 17150241 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17150356 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 17150365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17150376 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 17150383 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 17150447 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 17150547 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 17151256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17151283 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 17151314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17151386 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 17151449 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17151531 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 17151609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17152248 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 17152249 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 17152822 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 17153693 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 17156713 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 17156768 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17156992 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 17157028 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 17157113 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 17157132 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 17157136 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 17157333 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 17157372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17157879 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 17157910 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 17157961 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 17158322 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17158329 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17158440 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17158467 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17158629 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 17158694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17158899 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17159116 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 17159251 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 17159297 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 17159339 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 17159514 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 17159569 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 17159588 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 17159680 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 17159695 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 17159838 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 17159855 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17159931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17160006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17160092 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 17160122 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 17160159 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17160207 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 17160217 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 17160450 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 17160541 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17160782 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17161253 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17161331 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 17161437 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17161633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17161634 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17165087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17165322 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17165504 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17166093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17166573 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17167375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17167589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17169199 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 17170410 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 17170664 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17171436 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17171437 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17172175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17172782 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 17172828 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 17172915 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 17173204 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 17174713 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17175049 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 17175201 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17175225 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17175248 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17175327 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17176587 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 17176600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17177224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17177399 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17177602 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 17177613 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 17178111 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17178138 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17178163 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 17178196 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 17178474 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17178482 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17178527 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17178625 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17179110 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17179583 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17179978 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17180379 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 19 17181735 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17183917 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17184418 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17186217 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17187065 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17187485 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 17187725 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 17187736 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 17187872 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17187922 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17187923 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17187954 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17188018 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17188149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17188354 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17188456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17188509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17188550 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17188559 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17188560 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17188692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17188724 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17188734 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 17188737 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17188738 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 17188783 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17188824 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17188843 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17188856 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17188923 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17188939 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17188951 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 17188979 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17189006 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17189328 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17189363 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17189535 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 17189623 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17190097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17190221 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17190255 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17190256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17190400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17193065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17193559 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17194980 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 17196219 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17196447 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 17196761 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 17196815 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17197117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17197155 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17197257 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17197351 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 17197413 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 17197442 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 17197492 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 17197671 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17197698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17197746 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 17198817 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 17198820 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 17198920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17198935 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 17199280 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17199333 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 17199372 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17199397 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17199415 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17199712 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 17200019 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 17200187 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 17200360 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 17200658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17200795 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 17200814 A T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 17200817 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 17200923 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17200987 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17201015 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17201160 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17201241 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17201246 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 17201321 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 17201357 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 17201371 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 17201442 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17201676 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 17201731 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 17201818 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 17201985 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 17201989 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 17202088 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 17202094 C A Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 17202108 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17202132 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 17202393 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17202546 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 17202556 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17202577 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 17202604 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 17202634 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 17202777 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 17202780 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 17202923 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 17202980 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 17203073 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 17203154 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17203278 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 17203283 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 17203392 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17203417 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 17203482 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17203547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17203633 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 17203639 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 17204035 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 17204379 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 17204510 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 17204634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17205053 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17205782 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17205789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17206225 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 17206251 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 17206269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17206288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17206446 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 17206610 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 17207003 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17207351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17207390 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 17207433 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17207523 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 17207682 T C N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 19 17207715 A G N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 19 17207746 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 17207834 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 19 17207848 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17207857 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 17208014 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17208210 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 17208326 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 17208400 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17208653 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 17209918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17212712 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 17212938 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17214121 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17214669 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17215723 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 17215743 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 17216311 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17216884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17217078 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17217107 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 17217288 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17217436 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 17217653 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 17219396 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17219450 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 17219460 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 17219475 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17219485 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 17219528 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 17219537 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 17219592 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 17219736 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 17220952 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17221597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17221899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17222650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17223316 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17223343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17223376 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 17224114 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17224235 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 17224391 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 17224445 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 17224464 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 17224478 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 17226963 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 17226965 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 17227036 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 17227282 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 17227321 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 17227402 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17227419 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17227657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17228717 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 17228773 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 17228889 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 17228936 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17229010 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 17229033 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 17229058 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 17229118 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 17229151 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 17229214 A G N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 19 17229312 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 17229378 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 19 17229385 A C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 19 17229390 G T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 19 17229417 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 17229473 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 17229483 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 17229506 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17229661 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 17229717 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17229759 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 17230046 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 17230066 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 17230082 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17230091 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17230200 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 17230217 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 17230442 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17230489 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 17230538 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 17230698 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 17230722 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 17230723 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 17230973 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 17231076 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 17231125 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 17231152 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 17231157 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 17231162 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 17231278 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 17231292 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 17231346 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 17231355 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 17231754 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 17231914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17231953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17232377 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 17232533 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 17232568 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 17232627 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 17232772 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17232871 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 17232884 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 19 17232948 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 17232949 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 17233249 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17233332 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 19 17233642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17233878 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 17234016 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17234898 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 17236237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17236797 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 17236851 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 17236906 C G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 17236909 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 17236984 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 19 17237016 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 19 17237037 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 19 17237098 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17237723 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 17237902 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17238084 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 19 17238121 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17238176 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17240651 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17240856 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17241441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17243130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17243831 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 17244131 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17244143 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17244144 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17244176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17244305 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17244681 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 17244787 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 17245127 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 17245490 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17245540 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 17245541 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 17245578 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 17245584 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 17245632 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 17245660 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 17245715 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 17246357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17246925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17247559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17247845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17253872 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17254046 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17256492 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17256531 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17257720 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 17257784 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17261221 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 17261638 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17262300 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17262405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17262418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17262470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17263956 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17263957 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17265118 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 17265780 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 17268550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17269595 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17269613 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17269618 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17269677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17270342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17270620 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 17270725 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 17270754 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 17270824 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 17270890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17271287 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 17271597 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 17271611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17272011 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 17272536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17273012 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17276198 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 17276491 C A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 19 17278606 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 17279694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17280533 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17280628 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 19 17281039 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17281692 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 19 17281915 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 17282496 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17283121 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 17283958 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 17284053 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17284187 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17284264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17284310 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 17284347 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 17284392 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17284394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17284400 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17284411 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17284682 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17284700 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 17284753 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17284782 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17284864 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 17284866 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 17284896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17284940 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 17284992 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 17285156 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 17285159 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 17285205 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 17285220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17285269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17285347 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 17285357 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 17285471 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 17285511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17285517 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 17285536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17285605 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17285699 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 17285703 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 17285728 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 17286050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17286147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17286150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17286582 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17286620 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 17286671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17286678 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 17286695 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17286853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17286905 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17286929 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17286931 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17286967 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17287025 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17287037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17287234 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17287246 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17287273 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17287275 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17287284 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17287308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17287365 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17287395 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17287466 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17287467 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17287566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17287757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17287803 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17287809 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17287868 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17287905 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17287944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17287946 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17288045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17288061 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17288065 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17288082 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17288151 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17288256 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17288258 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17288279 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17288302 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17288411 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17288412 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17288514 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17288547 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17288572 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17288583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17288635 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17288672 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17288676 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17288682 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17288782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17288824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17288832 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17288890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17288895 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17288906 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17288927 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17288928 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17289034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17289196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17289199 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 17289303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17289308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17289333 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17289402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17289450 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17289466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17289482 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 19 17289517 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17289583 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17289594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17289605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17289616 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17289655 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17289685 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17289705 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17289764 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17289799 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17289976 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17289982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17290042 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17290114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17290120 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17290175 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17290278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17290356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17290575 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17290881 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 17290921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17290962 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17291001 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17291075 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 17291155 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 17291288 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17291493 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 17291626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17291629 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17291734 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17291789 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17291830 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17291864 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17291904 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 17291966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17292117 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17292188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17292208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17292224 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17292225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17292286 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17292376 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17292397 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17292444 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17292521 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17292593 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17292696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17292705 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17292736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17292757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17292769 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17292816 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17292817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17292820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17292842 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17292878 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17292946 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17293032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17293066 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17293130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17293273 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17293282 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17293295 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17293355 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17293370 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17293496 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17293591 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17293592 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17293622 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17293666 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17293892 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17293945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17293960 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17293961 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17293980 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 17294137 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17294147 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17294177 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17294203 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17294228 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17294241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17294335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17294374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17294404 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17294422 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17294492 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 17294693 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17294915 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17294953 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17295106 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 17295115 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17295118 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17295127 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17295148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17295172 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17295225 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17295260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17295356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17295423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17295582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17295629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17295663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17295717 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 17295772 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17295797 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17295851 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17295900 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17295929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17295935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17296102 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 17296120 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 17296134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17296144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17296393 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17296479 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17296511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17296574 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17296593 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17296679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17296689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17296700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17296822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17296833 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 17296934 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 17296952 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17297042 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17297075 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17297241 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17297312 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17297365 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 17297416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17297514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17297567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17297584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17297659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17297699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17297722 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17297747 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17297751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17297774 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 17297782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17297792 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 17297942 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17297967 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17298022 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 17298090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17298161 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 17298301 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17298567 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17298631 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17298646 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17299059 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 17299100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17299247 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17299257 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 17299346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17299349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17299388 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 17299446 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17299486 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17299930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17300122 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17300280 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 17300328 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17300341 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17300345 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17300574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17300658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17300761 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17300763 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17300835 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17300875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17300880 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17300897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17300955 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17301107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17301118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17301139 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17301185 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17301222 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17301382 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17301602 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17301608 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17301785 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17301811 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 17301878 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 17301918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17302074 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17302107 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17302117 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 17302166 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17302213 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 19 17302389 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17302402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17302422 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 19 17302446 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17302528 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17302599 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 17302630 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 17302677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17302730 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 17302751 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 17302797 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 17303010 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17303013 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17303075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17303112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17303136 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 17303180 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17303184 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 17303186 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 17303362 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17303366 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 17303388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17303396 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 17303411 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 17303613 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 19 17303649 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 19 17303656 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 19 17303670 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17303672 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17303725 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17303916 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17303962 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17303979 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 17304250 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17304280 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 17304441 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 17304458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17304496 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 17304521 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 17304523 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17304544 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 17304561 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17304767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17304977 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17305027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17305121 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 17305156 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 17305196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17305200 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17305215 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17305284 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17305298 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17305348 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17305368 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17305376 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17305378 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17305402 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 17305404 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 17305426 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 17305453 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 17305838 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 17305874 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 19 17305938 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 17305953 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17305988 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17305997 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17305999 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17306005 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17306019 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 17306042 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 19 17306054 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 17306065 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17306079 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17306136 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17306195 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17306225 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17306304 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17306340 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 17306388 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17306423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17306453 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 17306468 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 17306480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17306498 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 19 17306521 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17306581 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 17306622 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 17306651 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 17306653 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 17306654 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 17306665 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17306705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17306738 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 17306802 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17306859 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 17306916 A T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 19 17307016 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17307019 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 17307090 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 17307094 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 17307192 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17307193 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17307274 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17307314 T G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 19 17307430 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17307504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17307617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17307635 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 17307636 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 17307765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17307820 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17307984 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 17308010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17308040 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17308050 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 17308066 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17308225 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 17308555 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17308641 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 17308671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17308712 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17308723 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 17308747 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 17308835 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17308913 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 17308933 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17308999 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17309046 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17309096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17309131 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17309132 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17309230 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17309255 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 17309269 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 17309315 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17309324 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 17309378 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17309457 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 17309466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17309467 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17309549 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 17309724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17309801 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17309878 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17310347 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 17310627 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17310635 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 19 17310711 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 17310740 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 19 17310742 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 19 17310744 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.333333333333333 0.2 0.466666666666667 13 17 5 3 7 19 17310792 T G N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 19 17310848 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17310884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17310903 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17310943 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 17310957 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 17310988 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 17311016 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 19 17311068 A G N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 19 17311088 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 17311240 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17311262 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17311267 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17311268 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17311329 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 17311338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17311368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17311491 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17311502 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17311505 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17311509 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17311539 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17311575 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17311595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17311705 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 17311858 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17311960 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17312022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17312028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17312030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17312166 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 17312170 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 17312204 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 17312219 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17312347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17312351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17312370 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17312385 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17312413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17312463 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17312483 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17312511 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17312523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17312593 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17312721 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17312726 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17312844 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17313053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17313110 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17313128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17313130 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17313248 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17313323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17313332 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17313359 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17313386 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17313395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17313490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17313515 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17313535 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 17313546 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17313559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17313681 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 17313732 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17313733 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17313906 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17314019 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17314029 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17314050 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17314059 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17314066 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 19 17314073 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17314151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17314177 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17314200 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17314244 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 17314275 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17314307 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 17314324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17314353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17314402 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 17314544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17314621 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17314756 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17314883 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17314945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17315144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17315146 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17315294 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17315312 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17315388 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17315406 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17315434 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17315435 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17315485 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17315534 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17315732 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17315733 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17315794 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17315825 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17315889 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17315945 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17315982 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17316205 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17316229 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17316232 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17316482 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17316640 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17316819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17316873 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17317147 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17317186 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17317245 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17317388 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17317548 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17317657 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17317701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17317729 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17317742 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17317747 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17317873 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 17318075 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17318127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17318142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17318207 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17318215 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17318219 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17318319 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 17318328 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 17318450 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 17318601 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 17318806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17318861 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17318863 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17318907 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 17318946 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17319010 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 17319031 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17319042 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17319086 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17319109 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17319193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17319248 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 17319292 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17319327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17319333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17319381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17319531 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17319549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17319673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17319686 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17319687 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17319695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17319751 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17319758 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17319760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17319814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17319822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17319857 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17319867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17320165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17320273 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17320305 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17320308 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17320453 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17320472 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17320501 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17320668 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 17322008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17322059 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17322062 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17322137 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17322366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17322445 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17322470 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17322474 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 17322579 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 17322601 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 17322604 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 17322605 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 17322677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17322720 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17322796 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17322936 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 17322949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17323018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17323147 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17323196 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 17323262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17323300 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17323312 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17323315 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17323378 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17323409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17323561 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 17323564 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17323863 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17323892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17323906 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17323950 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17324323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17324509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17324513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17324530 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 17324555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17324572 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17324655 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17324696 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 17324773 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17324804 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17324807 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17324808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17324863 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17324900 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17324946 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17325002 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17325125 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17325141 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17325278 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17325387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17325411 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17325430 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17325443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17325561 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17325702 A T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 17325855 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 17325958 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 17325968 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 17326044 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 17326224 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17326278 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17326344 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17326387 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17326422 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17326483 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 17326497 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17326505 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17326593 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17326602 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17326662 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17326851 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17326909 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17326951 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 17326975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17327028 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17327115 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17327197 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17327226 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 17327260 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 17327328 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 17327459 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 17327529 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17327537 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17327572 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17327573 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17327696 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 17327705 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17327722 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17327772 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 17327774 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 17327780 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 17327807 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 17327860 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 17327917 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 17327947 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 17327948 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 19 17327958 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 17327959 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 17328186 G C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 17328187 C T N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 19 17328274 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17328282 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 17328283 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17328293 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17328309 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17328310 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17328374 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17328401 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17328460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17328474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17328496 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17328505 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17328512 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17328629 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17328638 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17328701 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17328972 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17329013 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17329092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17329199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17329294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17329357 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17329546 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17329560 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17329608 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17329660 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17329684 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17329790 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17329795 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17329845 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17329860 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17329862 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17329902 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 17329906 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 17329938 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 17330150 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 17330161 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 17330208 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17330320 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 17330358 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17330508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17330509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17330805 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17330899 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17331283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17331297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17331314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17331356 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17331406 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17331455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17331466 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17331505 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17331542 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17331620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17331777 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17331795 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17331883 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17331917 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17332270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17332338 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 17332604 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 19 17332941 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 19 17332968 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 17333073 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 17333083 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17333095 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17333107 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 17333620 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17333738 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17333879 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17333915 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17333945 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17334041 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17334089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17334158 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17334196 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17334270 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17334318 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17334323 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17334353 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17334442 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17334448 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17334552 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17334553 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17334578 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17334584 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17334691 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17334736 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17334743 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17334812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17334927 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17335088 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17335114 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17335261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17335294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17335336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17335373 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17335465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17335526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17335544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17335583 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17335727 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17335739 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17335796 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17335798 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17335897 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17335915 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17336033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17336287 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17336385 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17336471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17336481 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17336524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17336530 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17336534 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17336610 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 17336612 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17336628 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17336666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17336667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17336709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17336734 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17336753 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17336792 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17336886 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17336902 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17336949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17336955 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17336971 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17337027 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 17337052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17337213 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 17337224 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17337231 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17337258 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17337325 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17337669 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17337671 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17337824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17337937 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17337938 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17338228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17338318 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17338354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17338524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17338546 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17338549 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17338554 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17338599 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 17338657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17338674 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17338788 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17339107 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 17339139 A G N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 19 17339192 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 17339197 G C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 17339202 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 17339364 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17339439 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17339477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17339497 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17339518 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17339531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17339658 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17339691 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17339705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17339759 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17339834 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17339893 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17339903 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17339912 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17339938 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17339965 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17339984 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 17340046 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17340120 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 17340176 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 17340383 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17340387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17340464 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17340511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17340665 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17340830 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 17340860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17340912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17340966 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17341101 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17341222 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17341258 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 17341295 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 17341382 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 17341395 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 17341467 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17341476 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17341745 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17341826 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17341910 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17341914 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17342079 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17342142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17342180 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17342190 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17342208 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17342488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17342491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17342497 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17342542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17342566 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17342591 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17342725 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17342822 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17342833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17342905 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17342992 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17342993 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17343054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17343154 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17343166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17343283 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17343370 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17343515 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17343540 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17343552 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17343597 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17343642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17343747 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17343825 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 17343948 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17343990 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17344017 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17344028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17344087 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17344118 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17344155 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17344169 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17344212 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17344252 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17344272 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17344298 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17344390 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17344576 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 17344601 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17344674 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 17344729 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17344870 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17344932 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17345141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17345186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17345277 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17345405 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 17345714 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17346104 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17346116 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17346132 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17346177 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17346351 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17346361 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17346362 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17346384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17346619 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17346629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17347048 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17347258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17347308 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17347333 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17347454 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 17347498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17347506 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17347538 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17347547 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17347591 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17347669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17347698 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17347741 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17347750 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17347806 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17347852 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17347881 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17347919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17348064 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17348110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17348196 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17348280 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17348518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17348546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17348581 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17348702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17348715 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 17348789 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17348831 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17348845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17348885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17348940 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17349094 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17349141 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17349201 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17349360 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17349533 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17349581 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 17349665 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17349759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17349764 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17349775 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17350016 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17350172 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 17350463 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17350490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17350501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17350664 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17350677 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17350693 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17350696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17350752 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17350926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17351034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17351087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17351102 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17351224 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17351282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17351347 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17351510 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17351513 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17351546 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17351601 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17351602 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17351900 C G N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 19 17352330 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17352417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17352624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17352651 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17352655 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17352662 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17352663 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 17352692 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17352712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17352761 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17353117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17353152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17353222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17353236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17353294 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17353332 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 17353352 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 17353359 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17353370 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17353428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17353433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17353447 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17353482 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17353600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17353612 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17353671 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17353825 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17353966 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17353973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17353974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17354082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17354094 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17354126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17354143 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17354156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17354176 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17354182 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17354191 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17354239 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17354256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17354436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17354506 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17354519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17354579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17354587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17354703 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17354710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17354728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17355134 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 17355233 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17355248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17355292 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17355379 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 17355525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17355572 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17355674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17356025 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17356160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17356177 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17356181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17356354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17356471 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17356497 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17356532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17356547 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17356550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17356606 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 17356618 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17356650 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17356676 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17356725 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17356821 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 17356863 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17356903 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17356943 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17357025 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17357159 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17357208 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17357210 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17357241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17357294 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17357323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17357387 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17357444 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17357488 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 17357606 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17357611 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17357649 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17357701 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 17357848 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17357925 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17357977 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17357989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17358097 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17358139 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17358181 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17358182 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17358184 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17358316 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17358343 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 17358363 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17358489 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17358583 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17358629 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 17358715 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17358734 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17358761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17359002 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 17359008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17359052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17359108 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 17359230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17359252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17359358 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17359439 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17359450 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17359602 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17360083 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17360136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17360188 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17360210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17360252 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17360359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17360379 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17360447 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17360456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17360477 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17360525 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17360671 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17360808 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17360816 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 17360867 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17360891 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 17360914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17360918 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17360943 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17360975 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17360983 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17361046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17361057 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17361174 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17361250 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 17361290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17361307 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 17361381 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 17361438 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17361467 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17361484 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17361511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17361529 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17361532 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17361540 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17361541 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17361559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17361699 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17361774 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 17361781 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17361786 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17361808 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 17361840 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17361916 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 17361924 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 17361936 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17361940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17361970 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17362018 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 17362117 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17362186 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 17362248 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17362359 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17362400 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17362402 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17362436 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17362486 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17362663 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17362731 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17362758 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17362804 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17362857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17362858 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17362888 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17362929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17363014 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17363052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17363061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17363162 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 17363204 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17363270 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17363298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17363423 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17363484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17363566 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17363669 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17363880 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17363895 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17363948 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17364003 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17364061 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17364114 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 17364157 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17364277 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17364339 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17364446 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17364450 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17364458 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17364612 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 17364633 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 17364860 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17364936 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17364955 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17364963 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17364965 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17365008 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17365051 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17365217 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 17365221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17365269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17365312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17365322 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17365383 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17365488 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17365566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17365578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17365597 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17365975 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17366109 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17366378 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17366593 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17366655 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17366663 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17366700 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17366759 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17366909 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17366963 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17367475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17367558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17368114 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17368162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17368401 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17368408 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17368411 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 17368488 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17368525 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17368526 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17368604 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17368644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17368674 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17368721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17368751 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17368808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17368837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17368959 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17369047 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17369063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17369067 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17369084 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17369113 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17369116 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 17369157 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 17369171 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 17369197 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17369205 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 17369235 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 17369297 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 17369332 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 19 17369400 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17369424 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 17369463 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17369480 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17369692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17369714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17369847 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17370058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17370142 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17370169 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17370206 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17370524 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 17370695 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17370752 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17370800 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17370808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17370993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17371026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17371032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17371033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17371204 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 17371208 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 17371267 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17371445 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 17371448 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 17371607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17371619 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17371720 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17371732 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17371737 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17371740 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17371755 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17371779 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17371928 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17371933 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17371935 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17371979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17372031 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17372034 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17372046 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17372070 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17372098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17372106 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17372269 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17372508 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17372550 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17372581 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17372644 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17372652 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17372698 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17372715 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17372730 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17372737 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17372740 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17372742 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17372752 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17372767 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17372807 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17372841 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17372931 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17372963 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 17372964 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 19 17373148 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17373171 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17373202 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17373205 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 17373251 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 17373267 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17373308 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17373314 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17373329 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17373355 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17373367 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 17373379 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 17373508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17373519 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17373522 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17373540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17373567 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17373584 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17373616 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17373700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17373704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17373766 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17373922 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17373968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17374002 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17374157 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17374194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17374224 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17374227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17374245 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17374250 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17374263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17374349 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 17374456 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17374457 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17374469 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 17374527 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 17374535 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 17374574 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17374575 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 17374633 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17374713 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17374884 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17374945 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17374946 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17374999 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17375004 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17375053 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 17375087 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17375116 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17375201 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 17375424 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17375463 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 17375718 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17375725 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17375757 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17375764 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17375775 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 17375824 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17375880 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 17375966 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17375999 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17376005 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17376115 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17376147 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17376152 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17376292 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17376308 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17376346 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17376454 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 17376471 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 17376546 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 17377810 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 17377967 T A Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 17384105 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 17384127 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17384175 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17384190 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17384230 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17384308 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17384378 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17384489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17384496 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17384542 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17384620 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17384727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17384782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17384812 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17384826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17384833 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17384870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17385306 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17385330 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17385346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17385435 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17385456 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17385470 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17385508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17385599 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 17385609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17385613 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17385779 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17385869 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17385907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17385917 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17385941 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17385967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17386065 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17386219 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17386235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17386246 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17386254 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 17386261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17386268 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 17386404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17386776 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17386786 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17386791 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17386960 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17387025 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17387262 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17387331 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17387476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17387483 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17387565 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17387666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17387713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17387762 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17387868 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 17387928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17387945 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17387954 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17388045 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17388057 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17388095 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17388175 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17388348 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17388382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17388429 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17388437 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17388551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17388690 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17388775 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17388812 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17388838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17388900 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17388907 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17388923 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17388934 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17388950 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17388983 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17389016 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17389059 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17389060 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17389077 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17389119 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17389181 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17389208 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17389377 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17389408 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17389460 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17389462 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17389498 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17389724 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17389731 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17389815 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17389843 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17389845 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17389859 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17389860 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17389872 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17389944 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17389984 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17390078 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 17390305 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17390376 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17390377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17390435 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17390439 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17390510 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17390520 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17390695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17390799 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17390930 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17390985 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17391104 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17391124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17391143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17391165 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17391166 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17391201 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17391251 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17391254 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17391318 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17391792 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 17391928 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17392008 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17392026 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17392077 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17392083 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17392127 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17392141 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17392391 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17392503 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17392543 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17392569 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17392693 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17392723 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17392730 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 17392837 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 17393087 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 17393137 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 17393158 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 17393160 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 17393175 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 17393232 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 17393253 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17393266 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17393295 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17393321 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17393362 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17393363 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17393398 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17393416 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17393437 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17393469 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17393471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17393482 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17393560 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17393646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17393715 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17393822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17393829 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17393874 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17394008 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17394038 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17394113 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17394131 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17394137 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17394148 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17394163 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17394229 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17394307 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17394333 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 17394365 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17394464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17394470 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17394537 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17394829 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17394881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17394900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17394947 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17394961 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17395033 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17395082 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 17395163 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 17395178 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17395269 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17395277 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17395289 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17395359 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 17395361 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17395363 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17395382 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17395429 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17395471 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17395475 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17395574 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17395577 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17395636 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17395647 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17395671 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17395710 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17395774 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17395809 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17395840 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17395909 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17395924 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17395935 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17396093 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17396105 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17396138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17396250 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17396284 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17396285 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17396375 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17396441 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17396511 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17396591 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17396593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17396659 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17396915 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17397231 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17397374 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17397423 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17397540 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17397641 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17397682 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17397747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17397758 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17397765 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17397801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17397804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17397859 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17397873 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17397884 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17398166 C G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 17398207 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17398220 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17398309 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17398345 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 17398352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17398403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17398469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17398470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17398518 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17398538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17398562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17398563 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17398618 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 17398650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17398651 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17398846 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17398853 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17398858 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17398866 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17398875 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17398879 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17398891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17398895 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17398962 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17399031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17399151 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17399189 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17399218 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17399229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17399247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17399304 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17399312 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17399557 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17399831 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 17399893 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17399973 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17399976 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17399993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17400021 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17400031 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17400035 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 17400115 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17400145 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17400220 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17400238 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17400246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17400283 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17400508 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17400691 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17400742 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17400789 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 17400795 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 17400800 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 17400802 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17400827 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17400912 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17400962 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 19 17401016 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 19 17401090 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17401097 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 17401183 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17401191 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 19 17401199 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17401236 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17401626 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 17401654 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 17401666 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 17401735 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17401768 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17401816 T C Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 17401844 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 17402010 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 17402061 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17402078 G T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 19 17402141 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17402230 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 17402260 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 17402322 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17402344 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17402411 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17402415 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17402483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17402658 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17402661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17402690 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 17402691 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 17402695 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17402700 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17402707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17402719 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17402739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17402764 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 17402765 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17402781 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17402790 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17402837 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17402915 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17402929 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 17403046 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 17403103 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17403144 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17403210 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17403266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17403340 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17403493 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17403532 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17403591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17403602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17403755 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 17403766 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17404016 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17404040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17404072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17404268 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 17404520 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 17404571 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17404588 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17404727 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17404861 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17404881 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 17404890 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17404960 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17404994 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17405042 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17405349 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 17405375 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17405404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17405471 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17405576 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17405587 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17405598 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17405780 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17405794 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17405862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17405870 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17405881 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 17405895 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17405957 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17405962 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17405970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17405971 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17405980 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17406049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17406520 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17406552 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17406641 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17406701 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 17406714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17406796 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17407080 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17407112 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17407159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17407206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17407219 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17407294 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17407306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17407332 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17407334 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17407348 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17407356 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17407393 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 17407441 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17407456 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 19 17407457 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 17407463 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17407528 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17407592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17407616 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17407713 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17407813 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17407905 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17408007 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17408073 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 17408373 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 17408429 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17408447 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17408691 A G Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 17408724 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17408790 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17408896 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 17409157 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17409329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17409461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17409493 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17409500 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17409535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17409546 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17409554 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17409565 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17409575 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17409589 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17410108 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17410383 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17410424 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 17410748 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17410803 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 17410889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17410968 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 17411004 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 17411287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17411326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17411370 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17411411 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17411412 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17411694 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17411799 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 17411806 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 17411889 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 17411938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17411972 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 17411973 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 17412002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17412026 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 17412335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17412397 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17412413 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 17412430 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17412467 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17412488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17412517 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17412559 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17412594 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17412649 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 17412679 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 17412759 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17412828 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17412997 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17413050 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17413051 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17413074 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17413104 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17413138 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 17413174 G T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 19 17413224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17413249 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17413264 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17413269 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 17413275 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 17413279 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 17413308 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17413316 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17413567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17413664 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17413724 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17413771 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17413882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17413937 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17413961 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 17414167 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17414270 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17414313 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17414543 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 17414580 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17414622 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17414651 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17414652 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17414733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17414740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17414924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17414971 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17415009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17415038 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17415061 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17415075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17415141 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17415249 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17415348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17415362 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17415366 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17415428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17415761 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17415771 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17415792 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17415866 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17415867 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17415962 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17415985 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17416027 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 17416454 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17416523 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17416533 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17416583 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17416653 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17416656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17416683 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17416700 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17416704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17416711 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17416720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17416732 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17416742 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17416770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17416860 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17416880 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17416952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17416958 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17416964 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17416972 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17416973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17416996 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17417050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17417060 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17417062 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17417118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17417138 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17417240 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 17417267 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 17417379 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 17417569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17417583 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17417603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17417632 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17417709 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17417761 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17417938 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17418089 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 17418124 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 17418125 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 17418146 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 17418191 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 17418246 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 17418306 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 17418323 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17418368 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 17418519 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17418631 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17418642 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17418657 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17418684 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17418706 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17418736 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17418786 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17418902 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17419013 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17419023 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17419311 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17419352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17419453 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 17419454 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 17419475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17419603 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17419682 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 17419709 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17419732 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17419855 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17419929 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17419945 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17419964 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17420005 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17420014 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17420016 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17420079 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17420081 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17420097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17420104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17420192 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17420210 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17420251 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17420303 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17420355 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17420452 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17420459 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17420525 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17420599 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17420628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17420673 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17420711 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17420776 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17420861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17420922 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17420975 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17420976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17421222 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17421318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17421694 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 17421712 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 17421862 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17421926 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17421938 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17421949 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 17421951 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 17421961 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17422102 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17422170 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17422282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17422284 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17422421 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17422638 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17422983 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 17423244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17423366 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17423435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17423549 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17423575 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17423577 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17423653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17423719 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17423750 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 17423785 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17423858 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17423886 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 17423889 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 17423904 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 17424100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17424204 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17424221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17424269 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17424272 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 17424379 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17424449 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17424500 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17424501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17424503 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17424519 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17424593 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17424625 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 17424635 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 17424725 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17424758 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17424971 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17424976 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17425021 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17425054 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17425250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17425344 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17425452 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17425510 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 17425684 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 17425690 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17425816 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17425895 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17425924 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17425965 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17426005 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 17426049 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17426224 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17426438 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17426527 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17426540 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 17426666 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17426839 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 17427047 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17427077 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17427113 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17427159 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 17427285 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17427360 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17427511 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 17427571 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 17427671 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17427691 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 17427925 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 17427956 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17427990 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17428287 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 17428366 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17428507 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17429075 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 17429089 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 17429305 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 17429359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17429372 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17429432 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17429535 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17429631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17429696 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17429997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17430259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17430355 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17430428 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17430622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17430637 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17430647 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17430693 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17430756 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17430992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17431079 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17431273 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17431420 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17431455 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17431688 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 17431697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17431701 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17431962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17432098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17432643 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 17432846 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 17432922 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 17433073 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17433137 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17433138 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17433174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17433212 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17433261 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 17433291 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 17433299 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17433311 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17433347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17433391 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 17433423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17433540 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17433609 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 17433710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17433835 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17433851 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17433863 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17433925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17434160 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 17434166 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 17434172 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 17434215 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17434240 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17434338 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 17434394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17434449 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 17434466 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 17434494 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17434510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17434566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17434737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17435118 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17435289 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17435293 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17435834 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17435872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17435996 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17436339 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 17436596 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17436639 T A Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 17436816 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 17436872 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 17436916 A T Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 17436951 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17437019 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 17437058 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 17437188 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 17437230 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17437272 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 17438979 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17439090 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17439120 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17439368 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17439412 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17439449 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17439524 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17439569 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 17439649 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17440040 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17440363 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 17440658 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 17441121 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17441319 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 17441339 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 17441479 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17441620 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17441722 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17442997 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17443166 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 17443197 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 17443214 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17443322 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 17443323 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17443515 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 17443521 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 17443534 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 17443553 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17443607 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 17444142 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 17444305 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 17444324 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17444523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17444624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17444648 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17445764 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17445981 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 17446029 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 17446211 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 17446367 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 17446455 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17446614 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17446871 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 17447154 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 17447227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17447308 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 17447398 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 17447406 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17447411 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 17447471 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17447545 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 17447867 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 17448023 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 17448046 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 17448073 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 17448098 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17448100 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17448139 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 17448723 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 17448777 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 17449243 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17450433 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17450455 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17450556 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17450564 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 17450569 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17450641 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17450816 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17450866 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17450960 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17451230 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 17451235 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 17454049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17457698 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17461375 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17464176 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17464263 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 17464304 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17464567 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 17465887 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17468471 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17468473 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 17475406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17475407 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17475514 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17475751 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17476233 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17477469 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17478629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17481283 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17481632 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17482486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17483028 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17483034 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17483552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17483561 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17483742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17483772 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17484177 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17484476 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 17484772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17484823 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 17485838 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 17486366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17486552 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17486959 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17487514 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 17487593 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17487637 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17489122 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17489985 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17492499 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17492583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17492971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17493830 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17494071 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 17494306 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17494976 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17495066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17495267 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17495867 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17495952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17498713 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17500513 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17500515 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17500531 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17500664 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17500716 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17500750 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17500826 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17501008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17501122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17501211 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17501328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17501495 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17501622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17501776 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17502111 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17502245 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17502251 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17502353 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17502495 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17502576 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17502601 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17502703 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17502930 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17503183 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17504692 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17504754 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17504942 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17505023 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17505125 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17505173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17505292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17506298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17506479 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17506535 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17507093 A T N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 19 17507435 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17507452 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17507478 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17507821 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 17508195 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17508207 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17508231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17508956 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17509492 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 17509533 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17509644 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 17509970 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 17510086 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17510309 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 17510390 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17510416 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17510565 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17510586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17510655 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17510668 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17510696 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17510745 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17510836 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17510852 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17511400 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 17511553 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17512005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17512541 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17512705 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17512847 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17512874 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17512971 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17513504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17514986 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17515788 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17515959 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17515995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17516491 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17516498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17516529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17516548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17516583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17516614 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17516649 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17516650 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17516665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17516675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17516682 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17516793 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 17516836 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17516851 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17516878 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17516894 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17517079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17517987 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17517990 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17518001 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17518715 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17518736 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17518783 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17520818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17522116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17522157 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17522346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17522742 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17522888 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 19 17523024 T C N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 19 17523028 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 19 17523091 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 17523248 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 17523322 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17523329 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 17523371 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 17523413 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17523428 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 17523499 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 17523661 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 17523714 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17523794 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 17523869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17524034 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17524040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17524095 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17524111 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17524542 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 17524622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17525191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17525313 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17525346 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17525454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17525477 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17525954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17526006 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17526012 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17526133 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 17526172 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 17526544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17527330 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17527421 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17527561 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17527580 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 17527602 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17527636 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 17527685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17527999 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17528448 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17528449 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17528549 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 17528724 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 17528842 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17528969 G T N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 17529535 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 17529574 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 17530466 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17530915 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 17533728 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17533923 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 17534738 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17538748 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17541146 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17541248 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 17541833 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17541991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17542171 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 17544193 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17545391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17545412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17545880 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 17546550 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17546703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17546744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17546801 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17547001 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17547029 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17547153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17547326 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17547557 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17549050 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17549593 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17549597 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 17549600 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 17550003 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17550485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17550763 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17552106 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17552705 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17554062 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17554804 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17554844 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17554887 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17554900 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17554957 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17554958 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17554975 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17555805 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17556163 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17556177 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 17556854 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17557851 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 17558017 T A N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 17558685 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17559313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17560208 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17560642 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17560758 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17561044 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17561211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17561495 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17562234 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17562419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17562725 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17563132 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17563296 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17563495 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17563496 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17563935 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17563973 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17565381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17565861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17567082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17573331 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17575713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17575930 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17575975 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17577356 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 17577423 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17577684 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17577789 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17577876 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17577912 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17577946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17578110 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17578662 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17578785 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17579811 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17580647 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17580719 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17581276 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 17581288 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 17581542 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17581707 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17581872 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17582172 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17582173 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17583169 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17583221 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17583973 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17584313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17584944 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17585850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17586273 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17586401 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17586468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17586868 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17586993 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17587025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17587067 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17587353 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17587354 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17587370 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17588293 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17588316 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 17588354 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 17588516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17588562 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 17588597 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 17588598 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 17588767 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17589034 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17591276 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 17591341 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17591380 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 17591837 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 17592059 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17592066 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17592292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17592573 T C N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 19 17593171 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 17593179 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17593195 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 17593200 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 17593551 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 17593564 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 17593740 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 17593793 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 17594172 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17595027 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17595380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17597114 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 17597162 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 17597517 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17597702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17598116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17600580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17600947 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 17601088 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 17601556 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17603330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17603388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17604670 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17604757 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17605374 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17605600 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17607851 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17608065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17609103 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17609139 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17609588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17610729 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17610801 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17610843 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17610872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17611432 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17611563 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17611637 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17611765 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17612047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17612067 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17612133 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17612161 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17612180 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17612223 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17612290 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17612391 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17612410 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 17612453 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 17612524 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17612569 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17613258 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17613287 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17614802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17614806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17614948 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17615416 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17615557 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17615654 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17615834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17615883 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17616285 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17616932 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17617125 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17617324 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17617587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17617731 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17618025 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17618043 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17618067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17618188 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17618404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17619366 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17619636 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17620040 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17620836 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17621113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17621798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17622244 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17622413 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17624131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17625192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17625480 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17625812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17626096 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17626848 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17627961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17628203 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 17629504 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17630913 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17631824 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17633478 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17635331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17636390 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17636488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17637023 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17639482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17641881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17642305 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17642306 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17642334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17643006 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17643138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17643153 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17643240 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17643423 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17643500 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17643856 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17643879 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17643909 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17644079 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17644133 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17644237 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17644259 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17644329 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17644428 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17644522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17644842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17644977 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17645093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17645186 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17645311 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17645583 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17646202 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17646241 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17646622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17646662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17646720 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17646816 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17647056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17647223 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17647234 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17647254 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17647259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17647318 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17647322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17647716 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 17647719 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 17647876 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 17648003 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17648004 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17648015 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17648270 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17648311 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17648382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17648399 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17648501 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17648551 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17648628 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17648862 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 17648876 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17648978 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17649041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17649054 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17649061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17650095 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17650138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17650200 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17650265 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17650607 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17650618 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17650724 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17651302 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17651314 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17651358 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 17651359 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17651427 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17651460 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17651614 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 17651620 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 17652152 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17652170 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17652210 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17652440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17652465 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17652502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17652647 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 17652962 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 17653209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17653426 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17653513 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17653591 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17653605 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17653720 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17654055 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17654137 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17654999 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17655100 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17655868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17656510 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17656891 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17657318 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17658138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17658683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17658853 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17658905 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17658932 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17659437 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17659443 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17659446 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17659453 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 17659454 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 17659531 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17659541 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17659581 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17659735 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 17659737 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17659878 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17659993 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17659995 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17660124 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17660354 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17660633 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17660801 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 17660848 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 17660875 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 17661097 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 17661102 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17661181 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 17661315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17661673 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17661712 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17662489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17663367 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17664068 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17664792 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 17664896 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17665682 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17666387 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17666388 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17666492 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17666992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17667803 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17668911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17672163 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17673863 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17674022 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17674866 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17680808 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17680833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17680997 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 17681103 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17681174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17681452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17681501 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17681533 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17683292 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 17683757 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 17683814 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17684041 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17684060 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 17686635 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17686704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17688222 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17688707 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17688896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17690975 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17693964 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17694314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17695196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17695261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17695334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17695372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17695763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17695982 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17697441 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 17698035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17699120 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17699421 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17699529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17699907 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17700562 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17702147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17702227 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17702307 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17703488 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17704431 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17704501 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17704543 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17704778 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17704818 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17706334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17706842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17707224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17708796 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 17708870 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17710924 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17711297 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17711631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17712344 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17712438 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17713099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17713187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17713577 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17713619 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17713939 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17713981 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17714047 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17714196 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17714209 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17714239 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17714261 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17714272 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17714273 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17714296 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17714495 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17714869 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 17715032 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17715194 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17715556 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17715588 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17715596 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 17715695 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17715705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17715735 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17715785 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17715887 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 17715977 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17715980 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17716015 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17716062 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17716414 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 17716484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17716678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17716735 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 17716801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17716865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17716886 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 17716906 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 17716907 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 17716927 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17717036 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 17717169 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17717215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17717302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17717347 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17717350 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17717353 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17717483 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 17717582 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17717583 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 17717586 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 17718074 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17718388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17719504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17720558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17722088 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17723548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17723731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17723778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17723938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17724552 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17724926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17725219 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 17728295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17729008 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17729443 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17730100 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 17730840 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17731642 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17732501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17733268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17734126 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17734520 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 17735170 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17735518 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17736033 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17736305 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17738664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17739584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17741381 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17743348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17744572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17745376 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17745415 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17746253 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17746395 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17748435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17749244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17751628 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17752990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17753293 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17753477 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 17753525 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 19 17754373 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17754388 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17756712 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17757077 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17757308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17757694 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17760697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17761632 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 17761852 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17762190 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17762268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17762482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17762514 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 17763595 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17764660 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17764793 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17765530 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17769650 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17772892 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 17772915 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17777494 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17777532 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17777913 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17779866 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 17780318 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17780477 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17780822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17781028 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17783903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17785400 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17789789 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17792304 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 17793699 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17793709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17794259 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17794845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17795298 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17795299 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17797031 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17797113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17797452 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17797801 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17797802 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17798047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17798108 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17798118 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 17798120 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 17798137 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 17798397 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17798399 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 17798606 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 17798609 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 17798612 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17798832 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 17799169 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 19 17799191 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17799232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17799249 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 17799693 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17799750 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 17799977 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17800239 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 19 17800417 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 17800491 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17800588 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 17800677 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17800809 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 17800836 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 17801127 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 17801250 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 17801288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17801313 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17801390 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17801574 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 17801809 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17802048 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17802060 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 17802150 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17802171 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 17802251 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17802268 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 17802283 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17802444 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 17802548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17802555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17802592 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 17802601 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17802889 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17802904 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 17802919 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17802923 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17803016 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17803031 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 17803136 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17803176 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 17803219 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 17803236 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 17803407 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 17803662 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17803850 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17803857 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 17803874 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17803902 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 17803911 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17806177 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17808057 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17808302 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17809012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17811007 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17811046 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17811123 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 17811219 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17811341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17812080 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17812732 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17813209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17813973 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17814529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17815683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17815875 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17816057 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 17816115 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 17816126 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 17816338 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 17816402 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 17816505 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17816509 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17816515 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17816568 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 17816672 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 17816702 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17817007 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17817084 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17817106 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17817118 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 17817196 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17817274 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 17817333 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17817351 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 17817362 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 17817369 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17817376 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17817399 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17817424 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17817426 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17817467 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 17817529 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 17817538 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 17817592 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17817719 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 17817743 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17817752 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17817774 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17817781 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 17817783 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 17817799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17817844 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 17817856 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 17817885 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17817891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17817907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17817913 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17818051 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17818316 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 17818500 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 17818546 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 17818584 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 17818746 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 17818995 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 17819143 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 17819165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17819258 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17819326 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17819519 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 17819550 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17819855 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17819952 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17820240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17820585 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17820587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17820776 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 17820790 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 17820925 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17820972 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17821106 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17821175 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17821196 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17821468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17821476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17821740 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17821749 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 17822219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17822966 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 17823084 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 17823113 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 17823219 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 17823243 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17823653 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17823731 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17823894 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17823954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17824527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17824538 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17824582 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17824629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17824799 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17824811 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17824818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17824861 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17825087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17825230 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 17825306 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 17825346 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 17825366 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 17825368 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 17825428 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 17825694 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 17825750 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 17826003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17826108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17826263 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17826285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17826409 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17826765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17827060 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 17827064 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 17827081 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17827939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17828282 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 17828728 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17828788 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17828797 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 17829233 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17829279 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 17829377 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17829394 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 17829486 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 17829745 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 17830655 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 17830846 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 17830978 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17831192 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 17831256 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 17831519 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 17832118 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17832169 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 17832961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17833008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17833481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17833699 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17833808 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17833921 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17834072 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17834133 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17836537 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17836957 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 17837330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17838375 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 17838842 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17838903 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 17838904 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 17839040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17839188 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17839276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17839429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17839466 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17839517 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17839860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17840036 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 17840116 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 17846203 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17846734 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 17846905 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 17846912 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 17847090 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17847419 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17847812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17848700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17850659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17850776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17851537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17851611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17854738 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 17855058 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17855059 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17855492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17856576 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 17860531 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17861134 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17862293 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17862587 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17862594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17862712 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17867917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17868940 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17875545 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17877347 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17877463 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 17877649 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17877671 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17877709 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 17877757 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 17877801 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17877933 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 17878127 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17878455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17878517 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17878619 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17878620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17878625 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17878701 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 17878723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17879034 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 17879132 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 17879162 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 17879176 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 17879185 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 17879209 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 17879266 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17879319 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 17879337 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 17879702 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17879833 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 17880204 T G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 17880281 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 17880527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17880658 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 17880925 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 17880953 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 17880955 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 17880963 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 17880995 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 17881019 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 17881025 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 17881101 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 17881391 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17881477 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17881824 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 17881826 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 17882060 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17882106 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17882262 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 17882367 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 17882459 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17882483 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 17882652 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17882892 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17883039 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 17883175 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 17883820 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 17884195 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 17884483 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17884887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17885074 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17885186 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17885217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17885558 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17885593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17885689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17885690 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17885701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17885836 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17885884 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17885962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17885982 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17886069 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17886332 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17886335 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 17886419 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17886423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17886425 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17886458 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17886531 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 17886567 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17886655 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17886669 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17886754 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17886889 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17887300 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17887376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17887664 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17888338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17888348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17888363 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17888365 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17888431 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17888563 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17888994 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17888997 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 17889087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17889648 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17889905 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17890155 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17890806 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 17890918 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 17890919 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 17890926 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 17891497 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17891600 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 17891620 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 17891653 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 17891671 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 17891679 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 17891797 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17893359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17894790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17895303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17899299 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17901524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17902059 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17902907 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17904249 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17905209 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17906416 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17906866 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17907689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17908259 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 17908447 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 17908577 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 17912466 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 17912506 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 17912670 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17913357 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17913499 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17913675 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17914183 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17916409 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17918143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17918246 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17919556 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17920923 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 17921215 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 17921217 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 19 17921301 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 17921325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17922415 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17922986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17923000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17923263 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17923694 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17924072 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17925477 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17925730 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17926253 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17926719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17927449 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17927919 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17928025 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 17928162 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 17928606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17928728 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 17928738 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17928833 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17929359 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 17929491 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 17929575 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 19 17929620 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17929823 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 17930159 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17933373 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17935326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17936382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17936427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17937659 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 17938087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17938141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17939607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17940260 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17940263 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 17940560 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 17940929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17941868 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17941892 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17942104 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17942217 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17942268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17942271 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 19 17942295 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 0.105263157894737 0.421052631578947 20 18 9 2 8 19 17942406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17943590 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 17943614 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 17944199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17944381 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17944732 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17944828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17946636 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17947051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17947075 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17947453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17947566 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 17948525 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17948819 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17948896 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17948909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17948998 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17949026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17949107 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17949133 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17949869 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17950187 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17950629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17950682 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17950752 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17951228 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17951267 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17951411 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17951445 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17951503 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17951611 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 17951612 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 17951730 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17951842 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17951937 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17951996 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17952047 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17952217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17952280 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 17952369 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 17952378 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17953559 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 17953641 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17953660 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17953670 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17953730 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17954186 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 17954308 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 17954536 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 17954564 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 17954602 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 17954675 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17954719 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 17954725 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 17954760 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 17954842 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17954858 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 17954930 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 17954955 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 17954967 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17955018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17955029 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17955109 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 17955246 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17955357 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17955387 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17955393 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 17955407 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 17956151 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17956305 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17956636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17957047 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 17957109 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 17957296 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17957805 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17958087 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17958328 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 17958337 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 17958435 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 17958553 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 17958687 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 17958822 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 17958980 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 17958984 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 17959412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17959517 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 17959522 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 17959597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17959620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17960012 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17961519 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17962104 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 17962224 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17962423 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 17962467 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17965249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17966977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17968986 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17970266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17970324 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17970336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17974790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17975443 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17975770 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17975924 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17976060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17976218 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17976530 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 17979409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17980872 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17983250 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17983859 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17984348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17985314 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17985666 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 17985865 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 17987680 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 17990191 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17991515 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 17995207 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17997240 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17998621 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 17998982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17999165 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 17999543 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18000420 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18005243 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18005442 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 18005476 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18005502 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 18005526 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 18005543 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 18005767 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18005768 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 18006238 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18006252 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 18006515 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 18006517 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 18006518 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18006564 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18006606 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 18006924 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18006972 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18007509 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18008015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18008164 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18008813 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18009736 T G N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 19 18017450 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18019344 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18019641 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18020120 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 18021239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18023077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18023634 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18024265 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18025385 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18025641 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18026254 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 18026456 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 18027685 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 18028499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18028936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18029711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18029840 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18029874 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 18030268 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 18030634 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18030664 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 18030911 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 18030917 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 18030995 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 18031052 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 18031088 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 18031137 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 18031288 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18031347 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18031453 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18031681 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 18031693 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 18031768 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 18031795 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18032572 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18032634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18032680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18032760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18033329 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 18033381 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 18033752 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18033981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18034583 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18034606 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18035028 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18035257 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18035347 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 18035487 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 18035506 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 18035516 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 18035534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18035543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18035592 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 18035654 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 18035836 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18035864 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 18036064 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 18036167 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 18036349 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18036822 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 18036872 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 18036873 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 18036874 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 18037675 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18037767 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 18038598 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 18038728 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 18038730 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 18038731 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 18038800 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18038909 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 19 18039837 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 18040291 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18041301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18042627 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18043587 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 18045481 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18045780 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18047298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18048139 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18048704 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18049489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18050587 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18050629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18050884 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18051232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18052589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18052711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18052721 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18052826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18052894 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 18053314 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18053575 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 18054072 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18054078 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18054104 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 18054106 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 18054221 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 18054226 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 18054260 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18054270 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 18054701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18054803 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18055312 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 18055342 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 18055373 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 18055386 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 18055567 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 18055605 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 18055943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18055960 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 18056099 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 18056193 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18056214 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18056315 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 18056350 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 18056383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18056414 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18056445 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 18056526 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 18056625 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 18057097 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18057201 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18057288 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 18057541 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18057607 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 18057730 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 18057775 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 18057793 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 18057804 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 18058289 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 18058290 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 18058305 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18058334 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 18058346 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 18058607 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 18058923 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18059040 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 18059111 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 18059128 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18059767 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 18059792 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 18059985 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 18060068 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18060130 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 18060133 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18060196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18060228 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 18060278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18060325 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18060767 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18060789 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18060795 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18060816 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18060842 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18061255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18061389 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18061733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18064734 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18066210 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18066220 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18066317 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18066320 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18066439 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18066467 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18066635 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18066660 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18066723 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18067188 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18067248 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18067357 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18068557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18068844 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18068851 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18069023 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18069094 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18069587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18070004 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18071214 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18071448 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 18072880 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18073014 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18073514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18073920 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18074175 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 18074564 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 18074567 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 18075074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18077189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18079583 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18079613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18079633 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 18079834 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18079998 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18081264 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18083445 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18083460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18083562 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 18084629 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18085989 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18086481 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18086491 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18087773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18088098 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 18088122 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18088238 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 18088378 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18088608 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 18089168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18089185 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 18089646 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 18089994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18090722 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18091306 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 18091419 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 18091617 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18091846 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18092031 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 18092033 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18092586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18092602 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18092812 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18092814 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18093000 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 18093059 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 18093167 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18093178 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18093247 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 18093416 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18093547 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18093806 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 18094108 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18094513 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18094557 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 18094685 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18094900 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 18094981 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18095080 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18095425 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 18095635 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 18096142 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18096173 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18096670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18097015 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 18097484 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 18097492 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18097976 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 18097988 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18098706 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 18098848 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 18098959 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 18098981 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 18099059 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 18099091 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 18099135 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 18099174 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 18099237 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 18099624 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 18099796 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 19 18100798 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 18100887 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 18102877 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 18103012 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 18105992 T A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 18106073 C A N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 19 18106125 A C N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 19 18106220 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 18106284 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 18106306 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 18106364 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 18106583 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18106602 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 18106737 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18106896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18107063 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18107077 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18107155 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18107216 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 18107325 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 18107350 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 18108781 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 18108949 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 18110294 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 18110296 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 18110636 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18110781 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18111731 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18112035 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18112055 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18112486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18112841 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18112857 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18112880 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18112901 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 18112902 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18113365 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18113396 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18113426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18113471 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 18113542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18113720 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 18113910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18114215 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18114440 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 18115072 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18115128 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18115130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18115220 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18115317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18116027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18116096 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18117247 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18117584 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18117630 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18117649 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18117685 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18117810 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18117821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18117866 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18117898 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18117983 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18117992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18118003 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18118057 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18118103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18118125 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18118141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18118164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18118303 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18118313 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 18118638 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18118719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18118817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18118830 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18118834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18119035 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18119052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18119162 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18119242 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18119300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18119422 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18119489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18120006 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 18120169 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 18120896 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18120920 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18120928 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 18120929 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 18120949 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 18120995 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18121042 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18121069 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18121263 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18121305 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18121626 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18121860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18122401 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18122779 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18123110 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18123170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18123348 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18123600 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18124491 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18125375 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 18125405 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 18126198 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 18126204 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 18126231 G A Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 19 18126327 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 18126477 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 18126545 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 18126639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18126744 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18126935 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 18126939 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 18126942 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 18126973 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 18127070 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 18127117 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 18127151 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 18127191 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 18127235 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 18127506 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 18127858 C G N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 19 18128177 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18128207 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 18128507 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18128785 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 18128954 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 18132352 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 18135721 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18136089 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 18136098 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 18136104 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 18137334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18137729 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 18137841 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 18138128 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18138417 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 18139803 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 19 18140166 G A N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.461538461538462 0.0769230769230769 0.461538461538462 13 13 6 1 6 19 18140575 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18140646 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18140987 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 18141413 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18141796 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18142088 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18142299 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 18142655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18142871 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 18142884 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 18142944 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 18143159 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18143353 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18143605 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 18143642 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 18143800 T A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 18143994 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 18144091 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 18144099 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 18144159 G T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 18144161 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 18144162 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 18144229 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 19 18144263 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 18144342 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18144383 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18144393 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 18144497 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18144526 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18144534 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18144691 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 18144847 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18145201 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18145295 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18145733 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18145827 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18146117 T C Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 18146119 G T Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 18146179 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 18146232 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 18146332 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 18146354 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 18146356 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 18146394 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 18146396 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 18146429 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 18146483 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18146551 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 18146654 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18147099 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18147116 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18147392 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18147908 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 18147994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18148599 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18148654 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18148684 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18148728 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18148846 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18149283 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 18149363 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18149400 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18149516 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 18149538 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18149997 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 19 18150018 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18150045 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 18150115 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18150141 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18150165 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18150175 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18150489 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18150775 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18150779 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 18150809 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 18150840 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 18150869 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 18150960 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 18151052 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 18151056 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 18151465 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18151466 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18151544 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18151617 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18151922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18152011 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18152158 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18152255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18152319 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18152403 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18152481 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18152850 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 18153417 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 19 18153488 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 18153568 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 18153584 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 18153693 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 19 18153724 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 18153797 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 18153874 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 18153883 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 18153905 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 18153921 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 18153948 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 18154202 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18154208 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 18154238 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 18154261 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 18154279 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 18154475 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 18154526 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 18154585 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 18154603 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 18154604 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18154611 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 18154862 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18155040 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18155333 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18155341 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 18155432 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18155800 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 18156010 C T N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 19 18156021 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 18156033 T C N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 19 18156298 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 18156308 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 18156490 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18156493 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18156614 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 19 18156639 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18156794 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 18156800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18157068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18157209 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 18157281 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 18157572 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 18157592 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 18157603 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 18157620 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 18157622 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18157727 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18157853 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 18157886 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18158395 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18158948 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 18159073 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 18159074 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 18159366 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 18159756 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18159842 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18160165 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 18160197 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 18160206 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18160475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18161783 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18162697 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 18163098 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18163273 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18163985 T A N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 19 18164079 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 18164396 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 18164442 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18164465 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18164490 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 19 18164909 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 19 18165010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18165101 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5 0.1875 0.3125 19 13 8 3 5 19 18165173 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18165196 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 18165231 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18165247 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 18165285 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 18165422 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 18165473 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 18165477 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 18165483 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 18165492 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18165520 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18165583 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18165767 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18165865 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 18165931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18166254 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 18166301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18166386 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 18166402 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 18166405 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 18166531 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 18166646 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 18166657 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18166668 T G N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 19 18166676 G A N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 19 18167986 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18168102 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 18168174 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18168255 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18168275 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18168320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18168434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18169277 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18169283 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18169286 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18169289 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18169320 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18169468 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18169514 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18169730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18169781 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 18170115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18170313 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18170497 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18170506 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18170535 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18170702 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18170771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18170943 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18170968 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18171005 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 18171105 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18175128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18175309 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 18175310 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18175335 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18175409 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18175463 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18175576 C T N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 19 18175657 T C N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 19 18175741 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 18175804 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 18175807 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 18175816 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 18175994 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 18176257 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 18176603 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18176604 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18176619 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18176736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18176881 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18177336 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 18177384 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18177417 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18177714 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18177740 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18177798 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 18178378 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18178560 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18178799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18179560 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18179630 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 18179681 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 18179937 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 18180008 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 18180052 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18180156 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18180601 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18181455 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18181716 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 18183240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18183305 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18183548 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18184350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18184721 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18184838 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18184911 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18184955 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18185175 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18185550 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 18185684 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18185692 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 18185882 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18185972 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18186068 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18186081 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18186173 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18186202 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18186206 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18186210 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18186331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18186671 T G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 18187333 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18187417 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18187432 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 18187485 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18187639 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18187830 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18187837 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18187898 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18187915 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 18188070 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 19 18188102 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 18188132 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 18188283 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 18188297 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 18188302 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 18188340 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 18188370 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 18188906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18189002 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18189265 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18189311 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18189722 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18190426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18190467 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18190864 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18191224 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18191354 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 18191467 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18191801 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18191896 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18192645 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 18192759 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18192835 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 18192991 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 18193218 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 18193345 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18193383 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 18193568 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18193575 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18193915 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18193916 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18193930 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18193943 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18194192 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 18194231 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18194408 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18194449 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18194537 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18194547 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 18194662 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 18194756 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 18194910 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18194979 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 18195007 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 18195021 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 18195071 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18195126 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 18195141 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18195175 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 18195178 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 19 18195223 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 18195246 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18195444 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 19 18195666 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 18195742 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 18195746 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 18195958 C A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 18196002 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18196039 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18196063 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18196107 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18196149 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18196640 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18196681 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18196683 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18196766 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 18196989 T A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 19 18197006 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 19 18197287 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18197305 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 19 18197393 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 18197412 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 18197464 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 18197573 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 18197574 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18197795 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 18197841 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 18197848 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 18197866 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 18197868 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 18197945 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18197956 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18198128 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18198141 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 18198240 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 18198289 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 18198293 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18198385 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 18198496 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 18198546 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 18198558 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18198560 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18198594 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 18198629 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 18198776 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18198828 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18198865 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18198882 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 19 18198911 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 18199030 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18199039 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18199090 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 18199100 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18199145 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18199218 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18199219 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 18199266 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18199284 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18199303 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 18199351 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18199443 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18199465 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18199492 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18199583 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 18199589 G A N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.357142857142857 0.214285714285714 0.428571428571429 13 15 5 3 6 19 18199610 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 18199618 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 18199681 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 18199799 A G N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.454545454545455 0.272727272727273 0.272727272727273 13 9 5 3 3 19 18199849 A T N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 19 18199852 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 18199906 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18199966 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18199968 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18200102 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 18200146 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 18200160 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 18200161 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 18200275 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 18200295 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 18200311 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 18200315 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 18200352 C G N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 19 18200398 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 18200415 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 18200423 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 19 18200573 C T N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 18200580 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 18200587 T C N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 19 18200752 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 18200761 C A N N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 19 18200763 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 19 18200780 T A N N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 19 18200853 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 19 18200880 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 18200881 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 18200890 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 18200926 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18200995 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 18201164 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18201251 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 18201337 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18201353 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18201359 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18201360 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18201361 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18201510 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 18201520 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18201549 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18201551 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18201627 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18201674 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 18201826 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 19 18201833 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 19 18201947 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 18201966 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18202042 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18202148 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 18202149 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 18202169 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18202238 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18202239 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18202247 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 18202452 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18202460 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18202494 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18202584 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 19 18202755 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 19 18202879 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 18203266 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18203626 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 18203694 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 18203710 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 19 18203793 T C N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.363636363636364 0.545454545454545 0.0909090909090909 14 8 4 6 1 19 18203818 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 18204273 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 18204348 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 18204375 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18204540 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18204620 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18204691 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18204999 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18205090 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18205424 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 18206872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18207586 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18207647 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18207695 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18207722 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18207740 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18207741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18207752 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18207822 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 18207836 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18207918 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18207956 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18208059 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18208078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18208363 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 18208778 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18208898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18209665 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18209675 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18209681 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18209720 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18209737 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18209758 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 18209771 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 18210046 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 18210066 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 18210074 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 18210128 G T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 18210155 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 18210193 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 18210210 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 18210264 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18210311 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 19 18210438 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 18210455 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 18210498 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18210603 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 18210665 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 18210692 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 18210737 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 18210829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18210854 T A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 18210878 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18210911 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 18210919 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 18211000 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 18211627 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18211674 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18211687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18211767 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18211859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18211895 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 18211905 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18211923 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 18211926 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 18211958 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 18211961 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18212028 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 18212221 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 18212279 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 18212382 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 18212447 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 18212532 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 18212590 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 18212615 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 18212636 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 18212640 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 18212754 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 18213133 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 18213140 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 18213144 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 18213394 G A N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 19 18213429 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 18213471 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 19 18213522 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 18213732 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 18213779 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 18213789 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18213821 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 18213883 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 18214841 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 18214912 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18215246 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18215275 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 18215278 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 18215333 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 18215522 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 18215652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18215724 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18215725 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18215821 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18215850 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18216035 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 19 18216036 T G N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 19 18216041 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 18216730 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18216856 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 18216910 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 18217034 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 18217070 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18217087 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 18217109 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 18217145 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 18217315 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18217422 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18217568 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 18217597 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 18217613 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18217694 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 18217887 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 18218132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18218279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18218403 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18218407 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18219514 C T Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 19 18219851 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18220169 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18220283 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 18220466 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 18220856 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18220981 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18221131 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18221173 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18221568 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18222021 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18222446 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18222493 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18222494 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18222499 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18222527 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18222551 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18222716 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18222784 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18222810 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 18222899 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18223103 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 18223503 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 18223535 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18223666 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18223699 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 18223804 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 18223833 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18223836 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 18223951 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 18224003 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18224030 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 18224101 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 18224203 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18224220 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18224731 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 18224927 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18225101 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 18225238 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 18225261 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 18225446 C A Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 18225470 T C Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 18225643 G A N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 19 18225661 C T N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 19 18225837 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 19 18226098 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 18226116 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 18226147 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 18226180 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 18226210 G C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 18226272 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 18226296 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 18226312 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 18226337 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 18226400 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 18226417 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18226519 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 18226526 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 18226572 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 18226605 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 18226680 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 18226714 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 18226734 G A N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 19 18226738 G C N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 19 18226869 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 18227060 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 18227069 C G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 18227281 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 18227324 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 18227419 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 18227428 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 18227460 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 18227467 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 18227534 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 18227543 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 18227629 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18227683 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18227686 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18231113 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18231395 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18231396 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18231713 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 18231726 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 18231792 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 18232399 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 18232443 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 18232479 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 18232652 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18232700 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 18232721 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 18232780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18232799 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 18232934 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 18232968 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 18233092 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 18233099 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 18233104 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 18233297 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18233433 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 18233655 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 18233876 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18234528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18234799 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 18234886 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18234968 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 18234969 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18235633 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 18236557 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18236663 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 19 18237069 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18237984 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 18238004 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18238344 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 18239233 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18239260 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18239266 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18240834 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 18240850 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18241372 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18241917 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 18242566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18242619 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18243111 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18244341 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18246701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18247439 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18247456 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18248390 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 18248656 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 18248804 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 18249101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18249584 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18250141 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18250592 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18250725 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18252218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18252469 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18253122 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18253585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18254600 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18258335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18258418 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18259285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18259640 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18260235 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 18260325 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18260707 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18261541 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18262087 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18263162 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 18263168 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 18263184 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 18263333 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 18264586 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18265948 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18265970 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 18265972 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 18266036 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18266306 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 18266527 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18266528 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18267094 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 18267102 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 18267503 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18267525 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 18267599 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18267603 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18267612 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 18267613 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 19 18267658 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 18267698 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 18267752 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 18267809 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 19 18267820 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 19 18267824 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 18267912 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 18267933 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 18267964 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 19 18267976 G C N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 19 18268211 A C N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 19 18268236 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 19 18268247 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 18268321 T C N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 19 18268333 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 18268588 T A N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 19 18268607 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 19 18268717 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 18268736 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18268745 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18268756 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 18269017 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 18269038 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 18269289 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18269335 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 18269344 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18269405 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18269419 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18269494 G T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 19 18269506 G C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 19 18269510 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 19 18269532 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 19 18271873 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 18272021 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 18272031 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 18272065 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18272265 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 18272276 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 19 18272302 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 18272395 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18272417 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 18272475 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 18272563 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 18272571 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 18272644 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 19 18273094 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 18273129 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18273336 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 18273446 T G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 19 18273480 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 18273489 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 18273514 T A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 19 18273555 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 19 18273738 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18273829 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 18273855 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18273861 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18273930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18273997 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 18274046 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 18274139 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 18274149 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 18274339 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 18274343 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 18274352 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 18274387 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18274399 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18274402 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18274427 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18274552 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18274553 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18274717 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 18274772 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18274921 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18274966 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18275080 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18275098 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18275108 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18275315 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18275320 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18275507 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 18275674 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 18275868 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18278087 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 18279080 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 18279410 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 18279466 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 18280031 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 18280034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18280213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18280443 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18280487 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18280488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18280974 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18282962 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 18283406 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18283565 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 18283573 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 18283851 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18284022 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18284042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18284138 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 18284238 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18284349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18284425 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 18284609 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 18284783 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 18284842 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18285215 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18285283 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18285327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18285384 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18285806 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 18285810 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 18285825 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 18285845 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 18285864 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 18285969 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 18286005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18286055 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18286713 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 18287346 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 18287515 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18287676 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18288053 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 18288349 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 18288364 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 18289068 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18289105 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 18289190 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 18289400 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 18290142 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 18290232 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 18290356 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 18291160 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18291286 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 18291555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18292526 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 18292590 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18292675 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 18293038 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18293571 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18294410 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 18294604 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18294907 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18294908 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 18295199 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18296283 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 18296345 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 18296371 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 18296388 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 18296510 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 18296747 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18296935 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18298445 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 18298674 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 18300207 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 18300714 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18300966 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18307428 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18309119 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18310789 C A N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 19 18310797 T G N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 19 18310846 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 19 18310850 C T N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 19 18310869 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 19 18310887 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 18310946 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18311020 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 18311176 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 18311248 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18311392 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18311434 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18311833 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 18311864 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 18312132 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 18312209 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 18312575 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18312578 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18312603 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18312745 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 18312756 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 18312788 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 18312814 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18312827 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18312837 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18312895 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 18313415 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18313552 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 18313608 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 18315068 T A N N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 11 9 4 3 3 19 18316531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18317004 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18325567 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 18328422 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18328477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18329731 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 18329872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18330278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18330509 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18331436 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18331879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18332361 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 18332569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18333558 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18334169 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18334201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18334384 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18334806 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18335202 T G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 19 18336597 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18337242 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 18337274 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 19 18337370 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18337395 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18337397 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 18337517 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 18337518 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 18337521 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 18337537 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 18337645 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 18337829 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 18337835 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 18337922 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 18338019 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18342088 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 18342176 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 18342216 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18342242 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 18342243 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 18342541 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18342570 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 18342966 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 18343289 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 18343322 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 18343778 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18344891 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 18346094 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18346414 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 18346647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18346698 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18347989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18348969 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18349329 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 18350512 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18352017 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 18353087 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 18353717 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18357262 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18358870 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18359069 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 18359723 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 18359858 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 18359961 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18360001 T A Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 18368644 C T Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 18373186 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18373699 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18373881 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18374000 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18374520 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 18374784 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18374813 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18374991 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 18375230 G T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 18375236 A C N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.538461538461538 0.153846153846154 0.307692307692308 16 10 7 2 4 19 18375271 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 18375276 C T N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 19 18375313 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 18375472 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 18375553 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 18375586 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 18375797 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 18375819 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 18376109 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18376861 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18377233 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 18377422 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18377550 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 18377621 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 18377891 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 18378001 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 18378075 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 19 18378427 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 18378430 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 18378643 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 18378990 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 18379002 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 18379043 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 18379176 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 18379289 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 18379309 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18379312 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 18379313 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 18379326 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 18379334 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 18379566 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18379789 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 18379822 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 18379864 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 18379916 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 18380094 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 18380136 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 18380165 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 18380254 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 18380289 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 18380303 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 18380381 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 18380438 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18380463 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 18380529 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 18380754 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18380761 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18380887 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18380989 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 18381066 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 18381070 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 18381072 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 18381476 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 18381595 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 19 18381862 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 18381925 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 18381929 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 18381983 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 18382000 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 18382118 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 18382148 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 18382156 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 18382168 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18382178 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 18382191 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 18382338 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 18382963 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18383186 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18383233 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 18383285 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 18383321 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18383379 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 18383474 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 18383632 G A N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 19 18383684 A C N N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 19 18383746 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 18383898 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 19 18383913 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 18384074 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 18384126 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 18384159 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 18384226 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 18384331 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 18384517 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 18384532 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 18384650 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 18384811 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18384873 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18385535 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18385544 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18385609 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18385671 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 18385722 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18385753 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18385781 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18386106 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 18386200 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 18386230 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 18386294 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 18386321 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 18386377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18386635 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 18386696 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 18386733 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 18386795 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18386871 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18386898 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18386931 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 18387011 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18387019 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 18387029 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18387046 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 18387085 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 18387102 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 18387133 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 18387464 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 18387587 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18388259 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 18388555 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 18388789 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18388910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18389025 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 18389153 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 18389340 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 18389499 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 18389601 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18389609 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 18389627 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18389781 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18389798 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18389811 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 18389813 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 18389834 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18390023 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 18390035 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 18390243 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 19 18390265 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18390439 C A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 19 18390459 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18390480 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 18390733 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18390968 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18391143 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 18391361 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 18391390 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 18394301 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18394985 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18396372 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18396613 G C N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 19 18396700 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 18396848 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 18397453 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 18397784 T G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 18397931 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 18399115 A G N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 19 18399618 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18400091 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18400343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18400424 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18400670 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 18400717 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 18400987 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18402050 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18402709 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 18402771 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 18403611 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 18404100 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18404288 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 18405117 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18405620 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 18408662 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18408674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18410084 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18410349 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18410544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18410863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18410895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18411112 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18411115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18411921 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18412513 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 18412536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18414391 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18414544 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 18414665 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18414788 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18416634 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18417108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18419233 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18421246 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18421732 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18422322 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18422446 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 18423078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18424901 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18425970 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18426601 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18427713 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18427785 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18428668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18430112 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18431731 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18431796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18438708 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18438975 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 18438980 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 18440524 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18441963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18443441 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18443533 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18444427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18444609 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18445879 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 18447229 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 18448340 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 18448437 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 18448509 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18448517 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18448628 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 18449242 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 18449279 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 18449679 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 18449813 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 18449973 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18450027 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18450210 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18450607 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 18450943 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18450971 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 18450975 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 18450990 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 18451027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18451056 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 18451115 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 18451147 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 18451149 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 18451260 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18451285 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18451326 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 18451374 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 18451383 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 18451446 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 18451487 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 18451512 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 18451549 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 18451558 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 18451560 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 18451579 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 18451641 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 18451652 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 18451842 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 18451861 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 18451928 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 18452041 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 18452927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18454719 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18455212 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18457107 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18458262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18458268 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 18458269 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18458327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18461660 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18461866 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18462414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18464310 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18464369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18464454 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18465696 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18466107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18466735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18469123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18470312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18470503 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18470619 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18471805 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18473358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18473764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18473905 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18473991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18475056 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 19 18475908 C A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 18478230 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18489211 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18490487 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18493161 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18493853 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18507579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18509328 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18512527 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18537703 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18544106 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18549051 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18549921 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18550382 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18551034 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18552080 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 18555208 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18557950 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 18565864 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 18565966 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 18569791 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18573890 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18579032 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 18579214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18579472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18581094 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18583799 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18583933 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18583953 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18584103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18586213 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18586614 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 18586641 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 19 18587316 T C N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 19 18587331 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 19 18587337 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 18587368 C G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 19 18587376 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 19 18587432 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 18587507 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 18587533 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 18587608 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 18587675 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18587852 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 18587919 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 19 18588017 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18588034 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18588036 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18588065 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18588083 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 18588213 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 18588217 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18588243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18588244 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18588266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18588356 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 18588360 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 18588367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18588436 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 18588529 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 18588611 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 18588714 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18588717 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18588760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18589076 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18589084 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18589428 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18591189 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18592000 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18592990 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18593284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18593469 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 18593514 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 18593535 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 18593539 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18593762 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 18593770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18593939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18594113 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18594256 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18594742 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 18594818 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18594831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18594994 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18595196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18595282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18596123 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18598219 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18598524 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18598534 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18598663 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18598910 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 18598921 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 18598939 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 18599566 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18599809 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18599810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18601153 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 18602675 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18602744 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18602875 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18602877 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18603029 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18603218 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18603293 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18603919 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18603959 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18603997 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18604013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18604350 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18604538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18604593 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18604604 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 18604656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18604921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18604999 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18606982 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 18610464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18611212 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 18611452 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18612225 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18612249 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18612903 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18613332 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18613716 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18613823 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 18614030 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18614656 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18615089 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18615180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18615183 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18616481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18617266 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18618488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18618862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18619458 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18620881 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18620883 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 18623757 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 18623762 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 18624403 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18625134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18625192 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 18625775 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18626208 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18626520 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 19 18626538 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18626661 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 18626871 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18627206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18628386 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 18631649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18632188 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18634286 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18635659 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 18636077 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18639821 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18640360 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18641698 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18643037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18643920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18644452 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18645105 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18648368 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18648474 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 18648830 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 18649516 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18649904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18650226 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18650416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18650665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18650813 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18652209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18652886 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18654263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18654345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18654937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18655506 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 18655584 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18655778 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18655880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18657046 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18657064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18657286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18657702 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18658160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18658353 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18658402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18658440 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18658623 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18658651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18658731 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18658743 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18658744 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18658797 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18658805 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18658856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18659104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18659105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18659272 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18659299 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18659370 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18659649 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18659834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18659923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18660273 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18660483 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18660569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18660607 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18660904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18661242 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18661260 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18661339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18661519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18661526 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18661633 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18661763 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18661797 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18661972 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18662379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18662414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18662462 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18662648 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18663285 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 18663526 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18663886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18663999 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18664127 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18665667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18665878 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18666038 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18666045 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18666069 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18666140 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18666458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18666553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18667057 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18667060 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18667086 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18667253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18667361 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18667681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18668743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18669283 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18669375 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18669749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18669827 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18670080 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 18670082 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 18670083 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 18670455 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18670521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18670576 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18672885 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18673797 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18673906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18674682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18676375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18676512 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18677076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18677333 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18678448 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18679026 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18679420 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 18679750 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 18680578 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18681086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18681540 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18681565 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18681566 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18681756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18681983 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18683225 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18683576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18683612 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 18683613 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18683680 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18684176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18684177 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18684534 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18684684 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18684975 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18685354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18685368 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18685684 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18685946 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18686123 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 18686138 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18686710 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18687025 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18687818 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 18688160 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 18688187 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 18688412 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18688538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18688543 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18688638 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18689003 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18689022 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 18689036 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 18689495 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18689619 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18689673 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 18689684 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18689724 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 18689750 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 18689852 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 18690151 G T N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 18690525 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 18690868 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 18690912 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18690913 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 18690950 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18691603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18693974 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18694040 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 18694205 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 18694247 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18694315 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 18694488 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 18694648 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 18695229 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18695239 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18695249 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 18695257 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 18695258 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 18695461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18695831 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 18695861 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18696051 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18696130 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18696155 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18696330 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 18696721 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18696795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18696816 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18696859 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18696906 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 18699252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18701352 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 18702443 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18702640 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18702649 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18702652 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18702663 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18702720 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18702902 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18702980 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18703340 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18703359 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18703421 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18703496 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18703589 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18703597 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18703698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18703751 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 18703755 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18704517 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18705292 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18705524 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 18705532 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 18705582 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 18705615 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 18705667 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18705783 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 18705843 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18705860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18706196 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18706237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18706420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18706423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18706513 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 18706709 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18706754 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18707019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18707046 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18707577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18707608 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18707784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18707865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18707882 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 18707940 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 18708175 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18708234 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18708252 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18708384 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18708386 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18708445 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18708674 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18708697 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18708995 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18709038 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18709039 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18709091 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 18709147 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18709223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18710369 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18710528 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18710674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18710723 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18710815 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18710844 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18711217 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 18711426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18711522 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 18711578 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18711589 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18711750 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18711760 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18711766 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 18711908 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18711919 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18711929 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 18712036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18712088 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 18712168 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 18712278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18712527 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18712606 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18712722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18712796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18712851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18713629 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18713811 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18713958 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18714032 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18714274 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 18715039 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18715060 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18715105 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18715130 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 18715231 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18715394 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18715509 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 18715579 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18716185 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 18716193 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 18716198 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 18716214 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 18716215 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 18716226 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 18716254 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18716287 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18716298 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18716453 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18716454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18716470 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18716471 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18716485 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18717061 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18717143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18717218 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 18717317 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18717438 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 18717456 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 18717603 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18717751 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18717761 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18717778 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18718391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18720110 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18720931 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 18721341 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18721968 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 18722170 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18723015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18723563 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18725060 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18726999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18727611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18727803 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18728059 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18728388 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18728401 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18728846 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 18728853 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 18728864 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 18729239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18730835 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 18731993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18732145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18732364 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18732409 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 18732621 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 18733103 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18733385 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 18733498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18733537 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18733673 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18733749 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 18733776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18733799 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 18734264 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 18734440 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18734453 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18734509 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18734569 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18734585 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18734587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18734652 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18734697 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 18734772 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 18734873 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 18734916 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 18735424 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18735460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18735560 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18736512 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18736527 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18737256 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 18738735 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18740080 G C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 18740364 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 18740379 T G N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 18740647 G A Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 18740716 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 18740717 G T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 18740899 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 18741196 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 18741309 G T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 18741344 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 19 18741505 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 18741513 G A N Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 19 18741586 T C N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 19 18741592 C A Y N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 19 18741639 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 18741664 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 19 18741758 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 18742172 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 18742232 G T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 18742716 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 18742973 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 18743546 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 18743602 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 18743646 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18743677 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 18743679 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18743842 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 18744020 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 18744026 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 18744029 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18744062 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 18744117 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18744216 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18744287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18744300 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18744330 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18744348 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18744426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18744444 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18744481 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18744550 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18744578 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18744602 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18744624 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18745060 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18745973 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 19 18746375 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 18746601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18746902 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18746962 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18747049 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18747120 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18747136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18747267 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18747428 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18747574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18747961 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 18748015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18748742 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 18748805 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 18748806 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 18748911 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18748974 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 18749035 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 18749297 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18749406 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18749459 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18749701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18749703 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18749717 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18750010 T G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 18750205 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 18750577 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18750587 A T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 18750588 A T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 18750681 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18750767 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18750789 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 18750842 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18752522 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18753427 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 18753451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18753826 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18753844 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18754016 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 18754137 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 18754149 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 18754152 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18754238 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 19 18754252 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 19 18754300 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 19 18754368 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 18754397 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 18754523 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 19 18754653 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18754667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18754796 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18754807 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18754842 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 18754848 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18754857 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18754913 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18754933 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18754973 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 18755007 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18755029 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18755069 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18755073 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18755174 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18755185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18755314 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18755471 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18755484 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18755509 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18755577 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 19 18755960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18756064 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18756697 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.294117647058824 0.117647058823529 0.588235294117647 12 22 5 2 10 19 18756815 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18756903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18757483 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18757848 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18757861 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18759063 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18759777 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18760380 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18761045 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 18761086 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 19 18761175 G T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 19 18761590 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18761890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18762654 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18763627 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18763732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18763752 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18763872 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18763885 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18763891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18764043 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 18764313 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18764354 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 19 18765114 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18765440 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18765485 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18765577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18765649 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18765896 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18766078 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18766112 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18766158 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 18766340 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 18766352 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 18766576 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 18766632 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 18766700 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 18766820 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 18767060 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18767202 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18767251 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 18767418 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 18767500 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 18767780 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18768164 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18768209 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18768414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18768734 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18768889 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18769194 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 18769380 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 18769789 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 18770555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18770857 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18771563 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18771595 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 18771612 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 18771680 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 18771836 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 18771874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18772084 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 18772380 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 18772694 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 18773128 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 19 18773148 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 18773158 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 18773191 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 18773194 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 18773293 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18773437 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 18773700 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18773841 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 18773845 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 18773885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18774073 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18774109 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 18774442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18774538 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 18775064 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 18775119 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18777396 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 18777682 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18778007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18778482 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18780915 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18781694 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18782373 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 18782499 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18783170 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18783313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18783999 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 18784656 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18785063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18787011 C A Y N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 19 18787474 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18790260 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18790262 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18791435 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18795867 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 18795925 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 19 18795982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18795986 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18795992 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18796039 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 18796106 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18796108 T G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 19 18796175 A T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 19 18797153 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18797415 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 18797613 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 18800305 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 18800737 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18801011 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 18801295 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18802694 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18802786 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18804099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18804704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18804733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18805421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18805507 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18805545 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18805741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18805752 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18805755 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18805893 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18806059 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18806272 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18806306 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18806417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18806451 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18806760 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18806768 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18806800 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18806805 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18806895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18806917 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 19 18806926 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 18807100 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 18807103 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18807104 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 18807242 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 18807926 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 19 18807944 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 18807953 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 18808001 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18808010 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 18808015 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18808117 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 18808167 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18808263 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18808331 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 18808337 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18808496 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 18808576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18808786 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18809020 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 18809198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18809315 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18809860 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 18809895 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18809988 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18810053 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 18810101 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18810222 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 18810316 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18810479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18810937 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18811007 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18811650 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18811776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18811967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18812180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18812607 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18812653 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18812685 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 18812865 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18813252 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 18813636 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 19 18813749 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 18813750 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 18814934 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18814952 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18816391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18816392 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18816451 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18816676 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18816681 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18816834 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 18816841 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 18816977 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18817157 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 18817158 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 18817175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18817322 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18817331 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18817916 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 18818067 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 19 18818149 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 19 18818750 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18818751 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18819034 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 18822517 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18822716 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 18822724 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 18823391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18823572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18824049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18824140 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18824615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18824875 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18825183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18825187 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 18825266 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18825283 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18825426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18825442 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18827260 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18827656 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18827943 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18827981 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 18828438 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18828998 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18829378 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18829446 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 18829596 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18829668 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18829998 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 19 18831500 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18831507 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18833478 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18834197 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 18834295 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 18835959 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18837051 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18837598 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18839095 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18842255 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18842560 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 18842668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18842867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18845499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18846320 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18846562 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18846802 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18847109 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 18847253 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 18847993 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18847998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18848105 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 18848209 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 18856345 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18856927 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 18858619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18858781 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18858874 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18858937 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18859047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18859114 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18859126 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18859132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18859135 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18859285 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 18859289 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 18859309 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 18859355 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18859383 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 18859458 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 18859487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18859541 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18859546 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18859584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18859589 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18859592 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 19 18859671 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18859691 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18859699 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 18859790 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 18859796 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 19 18859829 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18859840 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18859883 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18859919 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 18859927 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 18859940 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18860268 A T N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 19 18860326 A G N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 19 18860382 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 18860735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18860763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18860859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18861797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18862250 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 18862802 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 18862852 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18863292 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 18864623 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 18865786 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18866959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18869012 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 18872260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18872277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18872317 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18872318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18872327 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18872330 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18872333 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18872393 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 18872396 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 18872636 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 18872750 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18872788 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 18872883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18872912 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18873068 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 18873187 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 19 18873287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18873618 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18873684 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 18873688 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18873769 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18873778 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18873918 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18874011 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18874219 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 18874230 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 18874234 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 18874243 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 18874258 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18874444 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18874466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18874614 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18874690 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18874818 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 18874833 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 18874850 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18874852 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 18874859 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 18874934 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 19 18874988 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 18875020 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 18875034 T A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 18875053 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 19 18875062 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 18875161 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 18875186 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 18875372 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 18875376 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18875379 C A Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18875399 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 18875535 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18875568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18875579 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18875633 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18875638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18875642 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18876045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18876542 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 18876889 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18877059 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 18877067 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18877334 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18877669 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 18877686 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 18877689 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 19 18877986 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18878835 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18879362 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 18879836 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18880972 C G N N 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 8 6 2 4 1 19 18880985 C G N N 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 8 6 2 4 1 19 18881021 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 18881393 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18881606 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18881696 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 18881698 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 18881737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18881750 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 18881787 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 18881833 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 18881880 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18881918 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18881987 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18882025 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18883102 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18883191 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18883203 C A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 18883224 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 18883276 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 18883381 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 18883392 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18883404 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 18883410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18883463 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 18883473 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18883487 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18883500 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 18883510 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 18883523 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 18883868 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18883921 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 18883948 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 18883962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18883977 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 18883978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18884008 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 18884144 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 18884175 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 19 18884217 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 18884235 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 18884285 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 18884436 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 18884560 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 18884688 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 18884815 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18884865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18884881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18885063 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18885330 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 18885685 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18885738 T G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 18885810 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18885943 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 18885987 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 18886036 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18886061 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18886074 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18886361 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 18886516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18886594 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18886606 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 18886757 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 18886836 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 18886914 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18886944 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 18887095 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 18887236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18887346 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18887357 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 18887403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18887447 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 18887716 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18888951 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18889245 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18889428 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 18889445 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18889446 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18889448 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18889523 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18889535 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18889854 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 18889857 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 18889908 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 18889968 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 18890009 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 18890010 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 18890016 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 18890032 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 18890132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18890174 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 18890390 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 18890484 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18890494 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 18890521 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18890532 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 18890540 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18890580 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18890651 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18890733 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18890933 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18890935 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 18891195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18891365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18891380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18891427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18891495 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 18891538 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 18892016 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18893812 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 18894814 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18895153 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18895669 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 18896388 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 18898532 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18900524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18901381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18902726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18902738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18902810 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 18902904 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18903165 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18903267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18903578 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18904189 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18904392 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 18904988 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 18904995 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 18905108 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 18905146 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 18905166 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 18905198 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 18905211 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 18905276 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18905389 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 18905407 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 18905411 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 18905433 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 18905448 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 18905629 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 18905752 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 18905874 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 18905921 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 18905967 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 18906019 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 18906020 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 18906025 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 18906038 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 18906099 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 18906164 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 18906483 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 18906571 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 18906594 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 18906638 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 18906813 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 18906898 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 18907085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18907088 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 18907208 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 18907213 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 18907243 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 18907250 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 18907268 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 18907269 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 18907428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18907591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18907965 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18908132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18908226 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18908341 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 18908345 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 18908365 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 18908423 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 18909820 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18910381 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 18911058 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 18911155 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 18911374 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 18911462 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18911514 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 18912420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18912430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18912470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18913647 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18919449 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18920530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18922528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18922661 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18922825 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18924288 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18924312 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 18924451 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 18924624 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18924758 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18924836 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 18927752 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 18927856 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 18927929 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18928410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18928732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18928768 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 18929043 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 19 18929467 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 18929487 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18929543 T G Y N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 18929973 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18931084 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 18931127 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18934199 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18934308 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18934925 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18935035 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18935413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18935562 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 18935749 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 18935982 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18936047 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 18936234 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18936331 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 18936378 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 18936605 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18936729 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 18936936 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 18937944 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 18937950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18938465 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 18938469 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 18938507 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 18938619 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 18938648 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18938830 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18939098 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 18939661 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 18939752 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 18939993 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 18940017 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 18940109 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 18940278 A C N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 19 18940950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18941092 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 18941101 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 18942473 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 18942883 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18943181 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 18943219 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 18943760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18943924 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18945231 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 18945642 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 18945718 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18945757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18945817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18945830 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 18945870 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18945911 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18945927 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18946265 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 18946305 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 18946594 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18946789 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18946823 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18946901 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 18946982 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18947138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18947182 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 18947200 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18947367 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18947501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18948129 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 19 18948207 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 18948231 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 18948403 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18948436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18948440 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18948837 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18948874 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18948989 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18949025 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18949027 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18949030 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 18949124 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 18949274 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 18950234 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18950244 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 18950290 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 18950308 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 18950495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18950558 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 18950620 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18950654 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 18950749 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18950970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18951525 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18951705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18951849 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 18952744 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 18952905 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18953587 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 18953609 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 18954133 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 18954141 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 18954315 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 18954427 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18954546 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18954629 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 19 18954684 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18954691 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 18954794 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 19 18954830 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 18954995 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18955456 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 18955469 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 18955494 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 18956458 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 18956676 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 19 18957027 A G N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 19 18957044 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 18957063 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 18957299 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 18957644 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18957769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18959316 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18959321 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18959365 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18959375 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 18959377 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 18959514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18959741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18959846 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18960260 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18960377 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 18960446 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 18961083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18961116 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 18962024 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 18962723 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 18963991 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18966481 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18967167 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 18967273 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 18967296 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 18967666 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 18967901 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 18967946 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18967974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18968078 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 18968885 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 18969015 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18969236 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 18969456 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 18969480 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 18969503 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 18969944 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18971530 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 18971535 G A N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 19 18971539 T C N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 19 18971638 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18971691 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 18971760 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18971827 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18972081 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18972096 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18972129 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18972130 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18972348 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 18972366 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 18972414 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 18972452 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 18972487 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 18972539 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 18972727 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 19 18972728 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 18972870 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 18972896 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 18973117 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 18973194 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 18973295 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 18973321 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 18973773 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 18973810 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 18973850 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 18973854 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 18973901 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 18973910 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 18974156 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 18974286 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 18974323 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 18974371 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 18974576 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 18974597 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 18974749 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 18974753 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 18974784 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 18974807 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 18974850 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 18974853 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 18975006 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 18975413 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 18976171 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18977674 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18977987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18978160 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 18978826 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 18979646 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 18979665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18980147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18980438 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 18981116 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 18981213 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 18981223 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18981334 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18981349 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18981431 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18981433 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18981670 T A N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 19 18982347 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18982545 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18982598 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 18982665 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 18982747 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 18983151 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 18983172 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 19 18983247 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 19 18983336 C T N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 19 18983351 A G N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 19 18983358 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 19 18983369 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 19 18983370 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 18983461 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18983528 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18983539 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 18983552 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 18983564 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 18983574 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 18983666 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18983691 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18983773 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18983861 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18983910 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18983941 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 18983946 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 18984446 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 18984579 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18985323 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 18985902 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 18986121 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18986280 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 18986344 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 18986804 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 18986882 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 18987017 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 18987265 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 18987783 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 18987838 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 18987851 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 18988080 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 18988105 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 18988288 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 18988306 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 18988316 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 18988711 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 18991850 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 18991855 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 18992025 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 18992082 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 18992218 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 18992278 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 18992511 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 18992635 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 18992722 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18993110 A C N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 19 18993120 G A N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 19 18993219 T C N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 19 18993227 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 19 18993384 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 18993407 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 18993545 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 18993550 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 18993617 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 18993632 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 18993642 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 18993726 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 18993741 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 18993750 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 18993753 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 18993772 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 18993842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18993870 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 18993914 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 18993981 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 18994255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18994327 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 18994341 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 18994420 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18994524 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 18994621 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 18998953 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 18998960 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 18998988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18999034 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 18999066 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 18999166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18999294 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 18999401 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 18999426 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 18999462 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 18999505 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 18999570 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 18999617 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 18999641 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 18999687 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 18999762 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 18999963 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 18999998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19000204 T G N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 19 19000516 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 19000583 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 19000584 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 19000616 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19000680 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 19000702 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 19000734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19000798 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 19001313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19001431 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 19001534 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 19001677 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 19001889 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 19001933 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19001938 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 19001977 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 19002077 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 19002078 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 19002161 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 19002314 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 19002445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19003322 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 19003748 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 19003815 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 19003838 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 19003849 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 19004070 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 19004123 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 19004218 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 19004221 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 19004272 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 19004317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19004435 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 19004480 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 19004503 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 19004583 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 19004658 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 19004673 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 19004801 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 19004834 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 19004842 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 19004848 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 19004864 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 19004978 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 19005558 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 19005729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19005733 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 19007113 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19007154 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 19007453 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 19007472 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 19007662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19007800 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 19007842 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19007873 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 19008165 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19008176 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 19008440 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 19008778 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 19 19009187 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19009651 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 19009987 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 19010016 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 19010156 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 19010527 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 19011285 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 19013266 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 19014274 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19015191 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 19015553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19015603 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19015764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19015898 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 19018201 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 19 19018590 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19018851 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 19019908 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19019909 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19019968 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19020518 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 19020702 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 19 19020719 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 19 19020725 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 19 19020751 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 19 19020888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19020894 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.421052631578947 0.105263157894737 0.473684210526316 18 20 8 2 9 19 19020953 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 19 19020970 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 19 19021036 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.388888888888889 0.111111111111111 0.5 16 20 7 2 9 19 19021087 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.411764705882353 0.117647058823529 0.470588235294118 16 18 7 2 8 19 19021125 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 19 19021512 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 19 19021715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19021761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19021852 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 19023165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19023591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19023615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19023868 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 19 19023887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19024418 A T N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 15 15 6 3 6 19 19024544 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 19 19024556 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 19024562 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 19024610 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 19 19024619 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 19 19024857 T C N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 15 15 6 3 6 19 19025362 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 19026348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19027799 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19028198 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19028775 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19029278 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19029824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19029850 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19030229 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 19030254 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 19030578 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 19031197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19031333 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 19031400 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 19031429 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19031473 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19031549 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 19031594 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19031652 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 19031667 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 19 19031671 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19032090 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19032156 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 19032165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19032220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19032245 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 19032274 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 19032313 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19032353 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19032604 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19032784 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 19033033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19033189 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19033419 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 19033931 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19034139 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19034200 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19034203 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19034208 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19034837 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19035082 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19035169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19035269 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19035293 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19035368 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19035448 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19035451 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19035477 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19035577 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19035700 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19035743 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19036287 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19036291 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19036310 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19036362 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 19036478 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19036495 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19036542 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 19036575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19036651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19036708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19036805 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19036817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19036958 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19036978 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19037019 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19037044 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19037262 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19037273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19037278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19037385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19037538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19037660 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19037788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19037795 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19037826 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19037884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19037916 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19037965 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19038394 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 19038459 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19038534 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19038595 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19038610 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19038634 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19038721 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 19039087 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19039152 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19039390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19039470 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19039496 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19039533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19039574 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 19040024 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19040147 C A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 19 19040160 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 19040173 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 19040662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19040751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19040767 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 19040793 T G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 19040795 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 19040796 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 19041053 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 19041159 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19041221 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19041263 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19041366 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19041367 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 19042284 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 19042695 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19042861 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19043180 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19044884 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 19044967 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 19045022 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 19045290 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 19045479 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19047855 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 19048030 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19048049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19048169 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 19048405 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19048488 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19048613 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 19048711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19048736 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19048887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19048938 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19048957 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 19049006 T C N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 19 19049205 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 19049488 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 19050013 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19050654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19050725 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19050794 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19051025 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19052750 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19053466 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 19053589 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 19053824 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 19053865 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 19053888 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 19053948 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 19054048 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 19054175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19054604 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 19054801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19055242 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 19055276 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 19055401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19055403 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19055614 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19056182 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19056630 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19058551 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19059285 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19059527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19059682 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19059738 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19064404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19064631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19065268 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19068640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19069622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19069741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19070282 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19070480 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19070665 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19071644 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19073063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19073738 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 19074087 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19075953 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 19078466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19079151 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 19079266 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 19079442 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19080625 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 19081160 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19081312 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19083813 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19084531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19085800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19086268 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19087741 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19088976 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19089514 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19090528 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19091992 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 19092031 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19092185 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19092209 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 19092275 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 19092377 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 19092567 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 19092575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19092579 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 19093357 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19093763 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19093986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19094529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19097357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19097545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19098602 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19099055 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 19099326 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19100794 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 19100934 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 19101010 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 19101338 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 19101402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19102262 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 19102489 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 19103130 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19103671 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19104549 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 19104630 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19105301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19105316 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 19105320 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 19105448 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19105529 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19108593 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19109312 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 19110722 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 19110952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19111464 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19112123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19112748 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19112845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19115221 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19115462 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19115598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19115786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19119024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19119691 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19119723 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19119853 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19119975 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19120279 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19120501 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19120852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19122050 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19122477 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19123114 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19124387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19132156 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 19134009 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19135892 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19136361 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 19137032 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19137209 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19138167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19138168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19138552 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 19139441 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19139983 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 19140424 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19143485 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 19143497 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 19143621 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 19143973 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 19144128 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19144329 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 19144430 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19144600 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 19144602 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 19144685 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 19144686 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 19144730 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 19144851 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 19144902 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 19144951 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 19144965 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 19144992 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 19145050 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 19145151 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 19145193 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 19145208 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 19145225 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 19145237 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 19145326 T G Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 19145350 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 19145372 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 19145419 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19145434 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 19145554 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 19145597 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 19145645 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 19145715 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 19145802 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 19145807 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 19145813 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 19146266 T C Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 19 19147188 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19147192 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19147227 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 19147228 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 19147305 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 19147486 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 19147637 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 19147659 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 19147671 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 19147833 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 19147857 T G Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 19147961 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 19148158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19149117 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19149447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19149532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19149548 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19149798 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19151654 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19154493 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 19154576 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19155605 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 19155760 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 19155803 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 19155833 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 19155876 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 19155917 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 19155980 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 19156019 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 19156068 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19156188 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 19 19156215 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19156346 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19156463 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19156552 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19156745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19156809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19156923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19157079 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19157136 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 19157570 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 19157713 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 19 19157989 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 19158527 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 19158537 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 19160577 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19161169 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19161831 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19162737 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19163287 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19164036 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19167626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19168441 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19168616 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 19168794 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 19 19169237 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 19169305 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19169345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19169347 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 19169382 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 19169403 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 19170003 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 19170264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19170274 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 19170336 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 19170816 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 19170818 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 19170821 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 19171355 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 19171698 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 19171849 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 19171894 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 19172011 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 19172289 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19172531 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19173487 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 19 19173571 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 19173762 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19173841 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 19173962 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 19 19174062 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 19175179 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19177188 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 19178187 C A N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 19 19178425 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 19179100 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19179755 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19180000 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19180378 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 19180767 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 19181075 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19181324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19182279 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 19182301 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 19182436 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19182493 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19182799 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 19183409 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 19183620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19184548 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19184716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19188340 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19188732 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19188985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19189541 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19192073 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19192478 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19195265 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19195630 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19196941 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19197042 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 19198694 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 19200037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19201140 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19202341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19205531 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19206528 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19206939 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19208852 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19209986 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 19210116 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 19211149 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 19214100 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19215772 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19215949 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19216711 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19217782 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19219111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19220211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19220227 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 19220304 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 19220508 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19220570 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 19220658 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 19220699 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 19220851 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 19220862 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 19220872 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 19220900 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 19221471 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 19223004 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 19223304 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 19223426 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 19223862 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19224737 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19224792 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19224838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19224927 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19224928 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19225416 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19225947 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19226874 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19227197 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19227411 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 19 19231125 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19237571 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19237678 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19238431 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19239810 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19239965 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19240309 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19242157 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 19243252 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 19243257 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19243960 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 19244047 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19244361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19244365 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19244394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19244513 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 19244538 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 19244623 G T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 19 19245032 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 19245595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19245757 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19245811 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 19245822 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19246656 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 19246743 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 19247010 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19248101 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 19248247 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 19248351 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19248356 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19248660 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 19248955 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 19248988 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 19248998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19249091 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 19249125 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 19249493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19249510 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19249598 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 19249733 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19250595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19250606 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19251731 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19251840 G C Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 19252024 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19252110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19253396 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 19253499 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 19253580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19253793 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 19254109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19254174 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 19254203 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 19254249 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 19254411 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19254961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19255501 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 19255705 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19256670 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 19257136 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 19257167 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19257639 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19257748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19258403 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 19260085 A G Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 19260328 C T Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 19260915 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19260945 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19260963 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19261140 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19262064 G T Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 19 19263146 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19263192 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19263480 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 19 19263524 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 19264239 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 19264356 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19264370 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19264465 A T N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 19 19264902 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19264966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19264989 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19265053 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 19265077 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 19265483 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19265584 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19265744 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 19266077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19266268 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19266402 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19266656 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 19266732 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19266752 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19266788 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19266795 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19266800 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19266815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19266873 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 19266945 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 19267079 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19267098 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 19267174 G T N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 19 19267185 G C N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 19 19267530 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 19 19267545 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 19267648 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 19 19267707 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 19267750 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 19267753 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19267792 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 19267829 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 19 19267836 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 19 19267839 C A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 19 19267864 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19267927 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 19267964 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 19268413 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 19268422 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19268506 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19268543 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 19268612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19268638 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 19268694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19268726 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 19268753 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 19268772 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 19268817 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 19268841 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 19268931 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 19269092 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 19269120 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 19269182 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 19269310 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19269345 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 19269346 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 19 19269421 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 19269476 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 19269507 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 19269908 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19270053 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 19270394 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 19270398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19270538 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 19270557 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 19270587 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 19270630 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 19270655 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19270662 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 19270674 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19271158 G C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 19271285 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 19271424 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19271496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19271563 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 19271564 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19271775 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 19271907 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 19271921 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 19271962 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19272000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19272002 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19272125 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 19272302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19272648 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19272684 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19272968 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 19272972 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 19 19273012 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19273048 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19273097 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19273361 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19273739 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 19273762 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19273926 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 19274225 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 19275023 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 19275082 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 19275108 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 19275116 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 19275144 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 19275244 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 19275282 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19275474 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19275505 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 19275506 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 19275568 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 19276108 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19276683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19277025 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 19277028 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 19277115 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 19277128 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 19277139 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 19277223 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 19277232 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19277398 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19277507 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 19277522 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 19277617 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 19277619 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 19278030 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 19278275 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 19278428 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 19278457 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 19278480 C A Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 19278534 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 19278535 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 19278635 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 19278728 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 19278753 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 19279533 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19280524 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19282200 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19283940 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 19284502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19284755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19286642 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19287077 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19287201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19288694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19289605 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19289609 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19289745 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19289783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19290635 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19292006 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19292637 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19293085 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19293382 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19293725 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19294131 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19294961 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 19296516 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19297502 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19298125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19298676 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19300542 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19300690 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19300766 T A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 19301303 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19301526 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 19301890 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 19302070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19302431 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19303849 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 19303911 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19305255 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19305271 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19305341 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 19305550 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19305855 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19306154 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 19306341 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19308012 C T N Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 19 19316192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19316742 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19317026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19317153 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19318306 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19320084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19320637 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19321618 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19321843 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19321985 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19322647 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 19322706 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19322755 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19323008 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19323211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19324277 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19326093 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19326203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19328603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19331766 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 19333092 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 19333111 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19334727 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 19336062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19341586 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19341752 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19342059 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19342238 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19342864 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 19342881 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19342931 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19342950 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 19342958 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19343211 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19343218 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19343309 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 19343575 T G N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 19 19343856 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19344318 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19344506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19344512 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19344625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19344629 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19344736 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 19344756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19344861 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 19345080 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 19345169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19345336 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 19345351 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19345391 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 19345558 C A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 19 19345586 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 19 19345699 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19345717 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 19345760 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19345774 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19345797 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 19345815 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 19345943 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19346060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19346231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19346234 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 19346271 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19346325 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 19346454 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 19346645 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19346819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19346834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19347326 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 19347383 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 19347699 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 19347708 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 19347811 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 19 19348125 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19348142 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19348187 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19348376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19348406 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 19348761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19348962 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 19349166 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19349235 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19349285 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 19349308 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 19349353 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 19350335 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 19350389 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19350390 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19350619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19350633 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19350893 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19351038 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19351095 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19351102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19351126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19351151 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19351321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19351342 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 19351539 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 19351561 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19351849 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 19352021 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 19352135 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 19352189 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19352520 A T N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 19352521 T G N N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 19 19352839 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 19352886 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19352902 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 19353007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19353520 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 19354055 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19354304 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19354479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19354659 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19355381 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 19355680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19358741 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19359217 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 19359560 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 19360829 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 19362002 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19362557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19363232 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 19363383 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 19363448 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19363500 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 19363513 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19363864 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 19363865 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 19363897 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 19363898 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 19363933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19363971 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19363977 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 19364018 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19364088 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19364098 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 19364242 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 19 19364799 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 19364875 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 19364932 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 19365002 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 19365076 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 19365133 G T Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 19365151 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19365407 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 19365482 T A Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 19365502 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 19365613 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 19365619 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 19365699 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 19365701 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 19365785 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 19365851 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 19365858 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 19365924 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 19366006 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 19366007 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 19366108 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 19366118 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 19366195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19367033 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 19367200 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 19 19367950 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19368211 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19368349 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 19368380 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 19368612 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19368703 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19370633 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19371003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19371023 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19373682 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 19 19375103 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 19375273 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 19377780 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19377781 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19377878 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19378837 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19379522 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 19379902 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19380076 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19380574 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19380735 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19380765 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19380851 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19384248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19384982 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19385590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19385715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19386196 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19386754 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 19386985 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19387099 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 19387135 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 19387338 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 19387410 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19387877 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19387900 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19388211 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 19388261 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 19388270 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 19388298 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19388378 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 19388396 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 19388522 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19388646 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 19388736 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19388768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19388846 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19388885 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19388965 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 19388980 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 19388983 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19389056 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 19389126 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19389131 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 19389153 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 19389378 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 19389422 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19389486 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 19389537 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19389731 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 19389782 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 19389804 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 19389869 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 19390075 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 19390126 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19390463 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 19390482 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 19 19390489 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 19390532 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19390556 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 19 19390589 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 19390590 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 19390608 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 19 19390636 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 19390657 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19390662 C A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 19 19390670 A C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 19 19390676 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19390690 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 19390710 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19390720 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 19390937 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19391065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19391108 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19391117 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 19391130 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 19391139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19391173 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 19391180 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 19391297 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 19391306 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 19391395 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 19391557 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19391824 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19391854 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 19391939 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 19391973 C G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 19391983 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19391998 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 19392010 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19392080 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 19392092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19392136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19392151 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19392157 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19392159 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19392212 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 19392610 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19392702 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 19392875 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 19392896 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19393001 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 19393110 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 19393147 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 19393164 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 19393232 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19393274 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 19393375 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19393417 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19393687 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 19393747 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19393805 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19393840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19393882 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19393943 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19393944 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19393950 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19393986 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19393989 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19393998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19394087 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 19394222 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 19394259 T A N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 19 19394276 C T N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 19 19394459 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 19394508 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19394916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19394923 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19394948 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 19395008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19395156 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19395207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19395245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19395254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19395263 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19395311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19395322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19395333 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19395383 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19395422 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19395429 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 19395529 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19395599 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19395624 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19395646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19395680 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19395922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19395978 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19396000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19396011 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 19396012 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19396016 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19396030 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19396043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19396055 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 19396067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19396071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19396080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19396082 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 19396083 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 19396113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19396360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19397443 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 19397528 G A N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 19 19397593 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19397641 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 19397680 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 19397707 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19397766 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 19397884 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 19397966 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 19398195 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 19398222 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 19398334 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19398477 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19398514 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19398517 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19398523 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19398536 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 19398581 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 19398617 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19398714 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 19398727 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19398761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19398794 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 19398852 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 19398857 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 19399051 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 19399070 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 19399081 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 19399150 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 19399206 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19399344 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 19399399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19399422 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19399423 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19399435 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 19399491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19399507 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 19399577 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19399627 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19399638 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 19399676 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19399706 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19399823 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19399840 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19399887 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 19399892 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19399934 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19400476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19400938 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19401510 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19402335 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 19402977 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 19403025 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19403141 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19403218 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 19403402 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 19405181 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 19405666 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 19405894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19406018 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 19406238 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 19406426 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19407065 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 19408724 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 19408785 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19408798 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 19409150 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19410108 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19410551 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 19411111 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 19411209 C G N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 19 19411419 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 19411977 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 19412294 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 19412645 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 19413795 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 19413978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19414210 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 19414237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19414288 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19414444 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 19414754 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 19414859 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 19414891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19415571 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 19 19415917 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19417583 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 19419041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19419149 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 19419849 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19419946 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 19420092 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19420205 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 19420286 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 19420334 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 19420362 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 19420461 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 19420465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19420869 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 19420911 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 19421104 A C Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 19421111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19421374 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19421495 G A Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 19421601 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 19421659 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 19421771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19421924 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 19421969 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 19424306 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19426056 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 19428910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19428942 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19430848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19433187 G T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 19 19438776 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19439058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19439227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19440453 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19440841 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19440877 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19446124 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19446981 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19448682 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19449091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19450893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19453283 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19453394 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 19453497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19455273 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 19455364 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 19455403 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 19456359 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 19456399 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 19456424 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19457084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19457612 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 19459966 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19460769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19461259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19461305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19462005 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19462403 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 19 19465563 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19466166 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19466392 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19468598 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19468929 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19469365 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19471142 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 19472458 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19473085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19473527 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19476524 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 19476551 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 19476594 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 19476607 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 19476667 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 19476669 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 19476701 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 19476755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19476768 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 19476798 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 19476880 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 19477826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19477833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19478368 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 19478542 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 19479383 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19479390 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19479448 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 19479636 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 19480131 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 19480211 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 19480491 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 19483270 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19483837 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19483917 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19485806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19486309 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19487274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19487790 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 19488333 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 19488665 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 19488843 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19490846 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19490921 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 19 19491066 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 19491138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19491216 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19491267 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19491350 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 19 19491362 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 19 19491551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19491616 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 19491624 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19491722 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 19492000 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 19492661 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 19 19492792 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 19492797 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 19493146 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19493172 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19493275 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19493293 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 19493365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19493418 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 19493459 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 19493469 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19493506 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19493536 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 19493599 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 19493632 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19493921 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 19493973 A C N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 19 19493974 A G N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 19 19494149 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 19494255 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19494472 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 19494553 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19494776 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19494966 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19494977 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 19494979 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19494987 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 19495052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19495068 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 19495095 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19495163 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19495231 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 19495462 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 19495561 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19495600 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19495676 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19495742 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19495765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19495780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19495827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19495884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19495897 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19496023 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 19496181 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 19496287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19496426 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19496427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19496483 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 19496509 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19497557 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19497654 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 19497667 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19497805 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19497883 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19497935 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 19498051 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19498148 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 19498541 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19498779 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19498872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19499004 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 19499031 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 19499274 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 19499465 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19499479 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19499544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19499561 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19499977 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19499996 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19500114 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 19500325 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19500467 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19500481 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 19500567 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19500610 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 19500619 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19500664 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19500768 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19500804 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19500806 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19500852 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19500943 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 19500971 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19500984 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 19 19501105 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19501115 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 19501411 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19501421 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19501448 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19501535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19501633 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19502529 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19502744 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 19 19502745 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 19 19503196 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19503453 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 19503668 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19503971 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 19505907 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19506116 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19506118 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19506541 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19507142 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19507160 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 19507161 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 19507226 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 19507339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19507355 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19507731 T G N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 19 19507949 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 19508196 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 19508920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19508973 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 19509770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19510061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19511819 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19511855 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19512532 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19512890 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19513001 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19513817 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19514987 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 19515231 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 19515249 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 19515293 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 19515464 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 19515521 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19515665 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19516347 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19516400 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 19518535 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 19519831 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19520734 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19520773 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19521776 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19522984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19523145 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19523435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19524103 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19524123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19524560 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19524659 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19524969 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 19524977 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19526592 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 19530542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19530835 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19534448 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19535885 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19541659 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19541682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19541877 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19544816 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19545982 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 19546669 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 19547549 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19550219 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 19551410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19551463 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 19551818 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19552268 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19553525 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19553797 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19555512 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19555911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19557883 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19559288 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 19570864 T A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 19575877 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19576543 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19577447 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 19581208 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19581428 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19597101 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19597538 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19599985 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19606085 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19608563 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19610366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19610559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19612589 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19613332 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19613644 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19613793 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19615330 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19615498 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19615710 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19615810 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 19618170 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19619152 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19619341 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19621663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19621732 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19621774 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19621798 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19622000 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19622324 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 19622660 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 19622988 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 19622989 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 19623174 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19623743 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 19623961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19624326 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 19625196 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19625339 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19625403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19625709 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19626578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19626622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19627074 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19627268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19627593 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19627806 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19627998 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19628196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19628892 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19629331 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19629542 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19631595 G C Y N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 19 19632332 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19632674 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19635094 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19635756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19637626 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19638559 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19642512 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19642868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19643748 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 19644260 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19645041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19645617 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19647114 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19647492 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 19 19647504 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 19648412 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19648923 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 19649137 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19649184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19649517 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19649518 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 19650569 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19650570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19650582 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19650596 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19650708 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19650823 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19650955 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 19651051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19651115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19651990 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19652078 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19652079 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19652217 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19652282 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19652600 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19653071 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19653237 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19653627 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19653778 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 19653787 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19653796 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19654206 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19654314 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19654471 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19654541 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19654567 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19654576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19654589 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19654628 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19654703 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19654722 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19654762 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19654804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19655024 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19655053 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19655109 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19655116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19655127 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19655133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19655162 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19655602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19655979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19656052 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 19656082 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19656243 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19656614 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19656836 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19656924 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19656946 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19656947 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19657216 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19657273 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19657290 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19657313 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 19657315 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19657342 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19657343 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19657398 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19657464 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19657490 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19657501 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19657502 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19657613 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 19657678 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19657681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19657691 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19657732 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19657733 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19657861 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 19657955 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 19658010 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 19658027 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 19658053 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 19658058 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 19658169 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19658197 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19658298 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19658350 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19658358 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19658380 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 19658818 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19658934 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19659016 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19659101 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 19659402 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19659408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19659416 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19659443 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19659592 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19659719 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 19659726 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19659750 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19659943 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19660052 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19660350 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19660353 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19660394 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19660774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19661186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19661205 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19661359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19661781 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 19661830 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19661875 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 19662011 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19664946 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19665925 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 19666134 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19666327 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19666429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19666710 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19666843 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19666871 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19667561 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19667754 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 19668183 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19668425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19671010 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 19671612 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19671977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19674994 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19675184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19675254 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19678976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19679166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19679352 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19680546 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19681247 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19681468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19682684 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19684015 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 19684168 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 19684729 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19685979 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19686812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19688609 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19688879 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19690756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19690821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19693541 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19696626 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19696627 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19696684 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19698090 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 19698262 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 19698377 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 19699018 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19701311 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19701400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19701915 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19703211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19704078 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19704298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19706378 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19708799 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19709458 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19710465 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19710959 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19711038 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19711558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19712404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19717388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19718101 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19719423 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19720047 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19724041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19727308 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 19727789 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19729506 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19730051 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19730479 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19730538 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19731406 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19731881 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19732265 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19733566 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19733721 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19733914 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19734862 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19735373 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19735986 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 19736273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19737493 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19738324 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19739482 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19741318 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19741467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19742681 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19742772 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19747874 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19748608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19748946 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19749160 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19753847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19754766 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19755215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19755300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19755465 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19755895 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19756710 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19757171 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19759253 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19759346 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19760013 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19760916 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19761222 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 19762542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19762559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19762776 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19763975 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19764287 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19764402 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19765907 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19766800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19767070 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19768172 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 19768229 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 19768702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19768770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19768862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19768876 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19769067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19769648 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19769707 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19769812 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19770246 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19770376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19770476 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19770747 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19771002 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19771113 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19771199 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19772068 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19772239 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19772467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19773152 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 19774812 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19776485 A G N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 19 19777693 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19778578 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 19780059 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19783001 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 19783962 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19784754 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19785073 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19786789 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 19787064 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 19787360 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19789323 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 19792882 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19792894 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19793377 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19793544 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 19794158 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19794713 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 19795900 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19797856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19800081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19800989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19801237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19803174 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19803354 G T Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 19804676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19807244 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19808554 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19808739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19809728 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19812115 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19813699 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19813873 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19814751 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19816492 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19817385 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19819375 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 19819880 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19819895 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19821434 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19823717 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19827392 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19827673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19830917 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 19831030 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19831581 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19831613 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19831632 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19831660 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19831662 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19832039 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19832088 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19832097 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19832124 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19832162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19832260 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19832294 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19832308 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19832623 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19833028 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19833138 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19833186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19833353 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19833459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19833713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19833792 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19833948 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19834181 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19834363 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 19834397 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 19834539 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 19834581 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 19834583 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 19834602 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 19834634 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 19834642 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 19834668 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 19834675 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 19834677 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 19834762 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19834943 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19835636 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19835970 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 19835983 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19836034 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19836114 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 19836142 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 19836948 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 19836961 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 19837033 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 19837061 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 19837116 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 19837119 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 19837408 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 19837435 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 19837587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19837608 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 19837617 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 19837637 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 19837689 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 19837690 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 19837718 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 19837810 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 19837920 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 19837931 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 19837940 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 19837967 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 19 19837969 G T N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 19 19837981 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 19837986 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 19838183 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 19838258 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 19838282 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 19838360 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 19 19838422 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 19838446 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 19838475 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 19838511 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 19838532 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 19838533 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 19838534 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 19838538 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 19838567 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 19838598 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 19838614 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19838620 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 19838664 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 19838755 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 19838772 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 19838813 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 19838851 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 19838933 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 19839037 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 19839090 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 19839204 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19839349 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 19839360 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 19 19839367 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 19 19839372 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 19839425 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 19839464 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 19839469 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 19839868 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 19 19839869 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 19 19839927 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19839993 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 19840002 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 19840004 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 19840032 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 19840146 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 19840269 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 19840340 A T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 19 19840479 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 19840537 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 19840622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19840623 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 19840640 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19840834 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 19840874 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 19841166 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19843860 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19847087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19847509 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19848008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19848141 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19848239 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19848631 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 19848847 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19849856 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19849959 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19850140 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 19850402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19850403 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19850864 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19851369 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19852222 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19852730 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19852981 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 19854146 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 19854957 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19855055 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19855706 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19855744 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19857533 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19857757 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19859682 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 19859727 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19860229 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19863213 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19863546 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19866341 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 19866366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19866383 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19866415 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 19866447 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 19866633 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 19866772 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19866948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19866972 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19866973 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 19867074 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19867280 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19867443 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19868356 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 19870759 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19871705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19872546 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 19872774 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19872906 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19873452 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 19874215 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 19874655 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19875102 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 19875663 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 19875730 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 19875797 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 19875813 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 19875836 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 19875884 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 19875885 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 19876218 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19876619 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19876678 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19878465 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 19 19878494 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 19878714 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19879021 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19880432 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19880881 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 19881308 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19881815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19883259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19884493 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19884859 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19884931 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 19885029 G C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 19885325 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19885666 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19886041 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19886334 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19887169 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19887408 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 19887455 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19887606 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 19889462 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 19889505 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 19889707 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 19889809 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 19889990 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 19890031 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 19890101 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19890141 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 19890290 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 19890325 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 19890337 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 19890366 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 19890456 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 19890473 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 19890537 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 19890587 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 19 19890685 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 19 19890821 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 19 19890827 C T N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 19 19890836 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 19890863 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 19 19890970 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 19 19891054 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 19891063 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 19891127 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 19891157 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19891239 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 19891279 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 19891315 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 19891374 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 19891377 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 19891402 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 19891409 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 19891417 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 19891422 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19891461 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 19891496 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 19891504 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 19891528 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 19891573 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 19891587 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 19891663 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 19891741 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 19891799 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 19891815 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 19891851 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 19891863 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 19891867 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 19891887 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 19891940 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 19892020 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19892089 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 19892097 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 19892138 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 19892179 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 19892225 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 19892238 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 19892256 G C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 19892257 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 19892270 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 19 19892340 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 19892342 T A N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 19 19892444 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 19892521 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19892551 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 19892553 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 19892568 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 19892569 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 19892592 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 19892616 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 19892641 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 19892674 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 19892683 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 19892690 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19892695 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 19892772 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 19892912 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 19892932 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 19893067 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 19893110 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19893200 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19893214 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19893544 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19893758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19894093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19894664 T A N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 19 19894668 C T N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 19 19894715 A T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 19 19894753 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 19894757 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 19894761 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 19894793 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19894898 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19894900 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19894977 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 19894985 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 19894995 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 19895045 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 19895168 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19895170 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 19895177 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 19895203 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 19895224 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19895429 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 19896379 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 19897035 G A Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 19897119 G A Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 19897219 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 19897281 T C Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 19897416 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 19897552 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19897723 G A Y Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 19 19898863 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19900329 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19900554 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19900657 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19900747 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 19900867 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19900900 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 19901027 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19901190 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 19901255 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 19901303 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 19901307 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19901459 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19901562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19901647 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19901905 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19902287 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 19902320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19902415 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19902416 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19902507 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 19902878 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0833333333333333 0.666666666666667 0.25 10 14 1 8 3 19 19903547 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19903564 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19903599 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19903853 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19904004 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19904532 C A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 19 19904713 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 19905433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19905471 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19905499 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19905955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19906128 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 19906718 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 19906891 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 19906933 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19907009 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 19907089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19907708 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 19908535 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 19908799 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 19908826 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19909135 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 19 19909143 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 19909196 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 19909265 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 19 19910187 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 19910244 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19910317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19910537 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19911197 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19911758 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19912430 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 19912488 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 19913280 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19913370 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 19914718 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 19914763 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 19914842 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 19914941 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19915613 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19915656 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19916099 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 19916312 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19916339 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 19917046 T G N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 19 19917633 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19917939 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 19918091 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 19918565 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 19918630 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 19918728 A T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 19 19918864 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 19918903 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 19918960 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 19 19919292 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 19919440 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 19919987 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19920332 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 19920448 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 19920632 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 19920730 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 19921124 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 19921147 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 19921608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19921959 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19922436 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 19922673 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 19922897 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19923074 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 19923111 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19923157 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 19923274 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 19 19923554 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 19923623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19923642 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 19 19923725 A C N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 19 19923763 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 19 19923922 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 19924011 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19924070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19924091 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 19924125 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 19924171 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 19924201 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 19924353 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19924381 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19924387 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 19924442 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 19924491 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 19924552 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 19924698 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 19924699 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 19924737 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 19924751 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 19924773 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 19924775 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19924798 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 19 19924867 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 19924884 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 19925006 G A N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 19 19925007 C T N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 19 19925019 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 19 19925030 A C N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 19 19925037 C A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 19925102 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 19925122 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 19 19925123 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19925445 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 19925472 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 19925699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19925980 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 19926075 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 19926818 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19927167 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19929472 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19930985 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 19931122 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 19931330 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 19931464 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19931839 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19931869 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 19931876 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19932001 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19932321 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19932776 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19933577 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 19933795 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19933820 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19933975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19934741 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19934784 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19935336 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19935590 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19935599 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19935613 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 19935715 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 19935948 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 19936492 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19937240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19937241 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 19937531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19937532 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19937617 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19938001 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 19938668 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19938683 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 19938775 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19938856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19938862 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19939101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19939116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19939557 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 19939935 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19940228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19941240 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19941373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19941832 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19941846 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19942056 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19942526 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19943348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19944656 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 19951896 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19952436 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 19 19953577 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 19953722 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19954115 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 19955117 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19955254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19955889 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19955984 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19956042 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 19956046 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 19956623 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 19956661 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 19956748 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 19958002 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 19958112 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 19958143 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 19958411 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19959846 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 19960549 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19960600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19960840 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19961194 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 19961329 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19962714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19963396 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19963542 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19964461 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19964547 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19964626 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19966972 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 19967688 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 14 10 4 6 2 19 19967869 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 19 19968541 C T N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 19 19972457 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 19973731 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19974633 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 19974655 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 19974871 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 19974931 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 19974999 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 19975531 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 19975592 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 19975628 C A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 19975821 A G N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 19 19975923 A T Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 19976416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19976455 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 19976653 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 19976659 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 19976689 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19976774 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 19976845 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19977966 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19977968 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19978012 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19978231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19978599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19978692 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19978861 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 19979619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19979796 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19980175 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 19980177 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 19980706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19980709 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 19980878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19980938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19981453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19981512 G C Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 19981639 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19981824 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 19982047 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 19982055 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 19982153 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19982206 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 19982226 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 19982376 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19982663 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 19983571 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 19983665 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 19983938 A G N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 6 8 2 2 3 19 19984358 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19984365 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19984592 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19984607 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19984638 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19985356 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 19985460 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 19985461 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 19985563 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19985602 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 19985654 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 19985680 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19985763 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 19985774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19985904 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 19985990 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 19985995 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 19986038 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 19 19986052 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 19 19986192 A G N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 19 19986221 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 19986393 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 19986480 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 19986553 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 19986712 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 19986736 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 19986767 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 19986799 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19986878 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 19986906 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 19986920 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 19986935 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 19986947 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 19987003 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 19987015 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 19987114 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 19987243 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 19987253 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 19987311 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 19987482 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 19987491 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 19987538 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 19987565 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 19987590 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 19987694 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 19987919 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19988037 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 19988170 A T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 19988622 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 19988635 C G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 19988667 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 19988792 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 19 19988866 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 19989244 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 19989338 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 19989489 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 19989518 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 19989610 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 19989643 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 19989788 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 19989849 A T N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 19 19989943 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 19990083 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 19990104 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 19990161 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 19990235 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 19990276 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 19990284 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 19990296 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 19991524 T A Y N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 19 19991650 A G N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 19 19991686 C A N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 9 15 3 3 6 19 19991703 G A N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 19 19991721 G T N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 19 19991852 T A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 19991859 C A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 19991881 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 19991908 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 19991914 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 19992023 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 19992098 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 19992147 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 19992269 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19992287 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19992292 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 19992314 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 19992379 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 19992389 G T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 19992479 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 19 19992600 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 19992605 G C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 19 19992710 C T N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 19 19992803 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 19992835 G T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 19 19992891 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 19993033 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 19993096 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 19993122 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 19993309 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 19993493 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 19993562 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 19993588 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 19993816 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19994667 T G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 19994942 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19995181 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 19995551 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19995902 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19995903 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 19995918 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19996525 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 19996641 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19996765 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 19997019 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 19997622 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 19997842 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 19998060 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19998147 T A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 19998368 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 19999120 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 19999369 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20000388 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20001272 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 20001274 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 20001277 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 19 20001286 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 20001349 C G Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 20001352 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 20001918 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20002489 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 20003501 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20003931 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20005675 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 20005960 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 20007125 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20008498 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20008531 A C Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 20008899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20009024 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 20009036 T C Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 20009046 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 20009269 T A Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 20009391 T C Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 20009403 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 20009585 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 20009603 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20009637 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20009640 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20009743 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 19 20009795 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 20009829 G T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 20009888 A G Y Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 19 20009918 T A N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 19 20010180 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 20010187 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20010255 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 20010369 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20010409 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 20010476 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20010497 A T Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 20010656 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 20010862 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 20010919 G A Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 20010980 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 20010982 A C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 20010985 A C N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 19 20010986 A C N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 19 20011011 C T Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 20011067 T C Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 19 20011068 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 20011114 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 20011237 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 20011304 T C Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 20011397 C T Y Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 19 20011441 T C Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 19 20011622 A C N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 19 20011669 G T N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 19 20011702 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 20011738 T A Y N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 19 20011743 T G N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 19 20011857 A C Y N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 19 20011929 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.25 0.166666666666667 0.583333333333333 8 16 3 2 7 19 20011969 A T Y N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 19 20012032 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 20012106 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 20012260 T A Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 20012340 A T Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 19 20012374 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 20012378 A G Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 20012441 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 20012554 T C Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 20012638 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20012700 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 20013013 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20013436 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 20013498 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 20013666 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 20015039 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 20015128 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20016043 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20017936 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20018241 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 20018702 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20018969 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20019040 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 20019087 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20019110 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 20019161 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20019316 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20019427 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 20019618 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20019619 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20019632 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 20019646 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20019785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20019841 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20020121 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20020152 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20020233 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20020236 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 20020259 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20020424 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 20020518 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 20021069 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20021427 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20021452 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 20021497 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 20021507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20021580 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20021831 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20021915 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 20021927 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 20021950 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 20021967 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 20022087 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 20022094 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 20022150 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 20022154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20022166 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 20022234 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 20022257 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 20022315 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 20022333 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20022509 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20022666 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 20022735 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20022738 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20023073 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20023133 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20023424 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 20023643 A T N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 19 20023816 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20023825 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20024072 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20024149 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20024152 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20024743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20026845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20028018 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 20028187 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 20028347 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 20028364 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 20028550 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 20028592 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20028597 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 20028934 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 20029046 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 20029097 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 20029098 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 20029151 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 20029343 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 20029507 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 19 20029620 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 19 20029749 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 20029860 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20029938 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 20029943 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 20029954 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 20029971 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 20029973 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 20030048 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 20030293 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 20030414 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 20030581 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 20030645 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20030752 C T Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 19 20031011 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 20031065 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 20031191 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20031621 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 20031631 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 20031703 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 20031716 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 20031738 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 20031780 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 20032051 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 20035362 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 20035423 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 20035584 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 20035608 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 20035691 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 20035919 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 20036372 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 20036612 A T N N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 19 20036784 G A N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 19 20036814 G A N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 19 20036837 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 5 9 2 1 4 19 20036940 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20037301 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 20037554 A T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 20037589 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 20037734 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20037829 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 20037956 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20037980 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20038001 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20038114 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 20038153 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 20038240 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 20038260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20038387 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 20038395 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 20038421 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 20038439 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20038837 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 20038868 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 20038957 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20039037 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 20039099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20039202 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 20039255 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20039260 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 20039278 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20039362 C A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 19 20039369 A T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 19 20039414 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20039521 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 20039694 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 20039725 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 20039780 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 20039784 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 20039812 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 20039852 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 20039862 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 20039899 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 20040010 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 20040012 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20040054 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 20040060 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 20040166 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 20040169 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20040178 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 20040330 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 20040788 T C N Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 19 20040957 C G N N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 9 5 4 1 2 19 20040967 T C N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 19 20040970 T C N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 19 20040985 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 20041011 G A N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 19 20041064 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 19 20041170 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 20041202 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20041210 A C N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 19 20041366 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 20041506 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 20041518 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 20041527 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 20041535 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 20041574 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 20041675 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 20041690 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 20041732 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 20041756 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 20041837 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 20041868 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 20041888 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 20041893 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20041901 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 20041911 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 20041915 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 20042005 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20042010 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 20042011 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 20042048 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 20042142 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 20042181 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 20042272 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 20042279 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 20042297 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 20042300 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 20042311 C G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 20042571 G T N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 19 20042649 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 20042675 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 20042678 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 20042705 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 20042714 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 20042772 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 20042845 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 20042947 A C Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 19 20042964 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 20043059 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 19 20043106 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 20043201 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 19 20043398 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 20043910 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20043912 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20044197 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 19 20044262 C A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 19 20044754 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20045251 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20045481 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20045887 A T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 20047060 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20047384 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 20047774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20048889 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 20049974 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20050187 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20050259 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20050271 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 20050309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20050372 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 20050493 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 20050630 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 20050660 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 20050883 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 20051209 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20053649 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20054575 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20055966 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 20060254 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20061123 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 20061191 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 20061288 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 20061291 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 20061310 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20061442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20061623 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20061632 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 20062136 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 20062414 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20062520 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 20062581 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 19 20062900 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20062992 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 20063030 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 19 20063234 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 20063246 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 19 20063254 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 20063310 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 19 20063548 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 20063616 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 20063649 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 20063776 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 20063779 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 20063803 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 20063816 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 20063844 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 20063916 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20064273 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 20064285 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 20064304 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 20064332 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 20064336 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 20064346 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 20064357 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 20064409 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 20064421 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 19 20064474 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 19 20064507 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 19 20064544 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 20064558 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 20064582 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 20064585 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 20064603 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 20065018 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 19 20065032 C A N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 19 20065095 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 19 20065217 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 20065355 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 20065413 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 20065425 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 20065460 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20065463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20065610 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 20065672 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 20065680 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 20065897 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 20065904 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 20065941 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 20065994 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 20066002 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 20066092 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 20066094 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 20066180 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 20066185 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 20066219 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 20066270 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 20066509 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 20066624 A T N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 19 20066733 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 19 20066734 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 19 20066739 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 20066954 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 20067007 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 20067103 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 20067225 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 20067228 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 20067271 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 20067297 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 20067333 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 20067335 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 20067415 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20067528 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 20067529 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 20067537 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 20067538 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 20067605 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 20067645 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 20067712 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 20068098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20068332 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 20068651 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 20068667 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 20068709 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 20068872 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 20069227 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 20069290 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 20069315 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 20069353 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 20069458 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 20069489 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 20069699 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20069752 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20071744 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20071849 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20071850 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 19 20072464 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20072825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20072837 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20073788 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20074593 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 20075300 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 20076422 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20076423 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20076508 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 20078391 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 20078790 C T N Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 11 9 4 3 3 19 20079318 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20080756 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 20081425 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20082380 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20083481 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20084104 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20085259 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20085266 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20085370 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20085411 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 20085494 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20085502 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 19 20085510 C A N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 19 20085547 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20085550 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20085570 C G N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 19 20085845 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 20085868 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 19 20086049 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 20086573 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 19 20086691 A G N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 19 20086839 T A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 19 20087382 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 20087840 T A N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 19 20089706 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 19 20090437 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 20091033 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 19 20091047 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 20091571 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 19 20092201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20092222 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 20092749 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 19 20093114 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 20093486 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20093933 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20094168 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20094401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20094427 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20095168 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20098296 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20099120 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 20099841 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20100120 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 20102799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20102865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20103195 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20103226 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20103230 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20103243 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 20106577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20106621 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20106640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20108202 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 20110523 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 20110724 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 20111264 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 20111296 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 20111476 T G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 19 20111596 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 19 20111606 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 20111693 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 20111909 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 20111932 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 20112038 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20112110 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 20112144 G C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 19 20112203 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20112269 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20112383 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20112569 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 20113113 C A N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 19 20113313 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20113369 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 20113377 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20113401 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 19 20113443 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 20113486 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 20113539 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 20113599 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20113626 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 20113647 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 20113690 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 20113691 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20113829 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 20113921 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 19 20114123 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20114214 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 19 20114386 A G N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 19 20114435 T A N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.214285714285714 0.0714285714285714 0.714285714285714 7 21 3 1 10 19 20114461 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20114494 G C N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 19 20114522 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 19 20114542 G A N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 19 20114562 C A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 20114633 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20114656 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 19 20114976 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 20114984 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 20115251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20115374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20115411 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 20115454 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 20115478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20115493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20115589 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20115659 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20115829 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 20115855 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 20115876 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 20116098 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 20116125 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 20116138 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20116139 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20116275 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 20116388 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 19 20116470 A G N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 19 20116477 C T N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 19 20116489 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 19 20116501 A G N Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 19 20116601 T C N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 10 6 3 4 1 19 20116653 A T N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 19 20116818 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 20116915 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 20116961 T A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 20117042 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 20117122 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 20117228 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 20117525 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20117533 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 20117545 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20117552 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 20117558 G C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 20117577 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20117581 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 20117648 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 20117664 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20117813 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 20117844 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20117868 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 20117894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20118035 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20118038 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20118108 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 19 20118163 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20118173 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20118175 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 20118187 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 20118289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20118291 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 20118458 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20118473 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 20118475 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 20118512 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 20118670 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20118713 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 20118944 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20119157 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 20119316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20119393 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20119609 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 20119701 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20119892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20120253 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 20120255 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 20120343 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 20120380 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20120549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20120591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20120870 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 20121030 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 20121096 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 20121126 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 20121245 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 20121267 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 20121433 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 20121537 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 20121603 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20121659 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 20121716 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 20122203 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20122897 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 20124082 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 20124130 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20124198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20124826 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 20124860 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 20124876 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 20124926 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 20125044 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 20125732 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 20125742 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 20125920 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 20125949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20125982 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20126252 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 20126343 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 20127351 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20127583 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 20127623 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 20127839 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 20127903 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 20128074 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 20128081 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 20128184 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 20128210 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 20128255 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 20128342 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 20129210 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20129661 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20130151 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20130243 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 20131464 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20132075 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 19 20132974 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 20134268 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20134272 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 20134699 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20134700 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20135442 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 19 20135562 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20135980 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 20136057 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 20136058 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 20136091 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 20136162 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 20136311 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 20136363 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 19 20136851 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20137465 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 20137762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20137797 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20137829 C G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 20138528 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20138545 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 20138577 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 20138597 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 20138690 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20138691 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20138866 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 20138906 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20139018 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20139035 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20139046 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20139089 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 20139146 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 20139184 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 20139549 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20139745 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20140122 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 20140198 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20140345 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 20140378 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 20140436 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 20140518 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 20140531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20140550 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 20140605 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 20140641 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20140746 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 20140817 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 20140860 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 20140967 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20140978 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 20141047 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20141051 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 20141054 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 20141075 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 20141091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20141105 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 20141150 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 20141234 A T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 20141253 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 20141272 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 20141378 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 20141567 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 20141569 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 20141594 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 20141619 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 20141683 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 20141707 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 20141859 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 20141884 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 20142107 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 20142357 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 20142522 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 20142868 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20143240 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20143241 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 20143389 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20143455 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20143545 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20143601 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 20143686 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20143723 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20143830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20143832 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 20143877 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20143899 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 20143952 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20143965 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20144060 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 20144215 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20144312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20144439 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20144458 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 20144482 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 20144564 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 20144570 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 20144614 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 20144707 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 20144763 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 20144882 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 20144995 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 20145009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20145021 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20145059 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20145093 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 20145168 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20145281 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 20145293 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 20145346 A C Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 20145387 G T N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.636363636363636 0.181818181818182 0.181818181818182 16 6 7 2 2 19 20145410 C A N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 19 20145733 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20145841 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 20145938 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20145980 G C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 19 20146074 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20146191 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 20146414 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20146603 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 20146632 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20146797 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20146821 C G Y N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 19 20146849 T C Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 19 20147116 C T Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 20147117 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20147123 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 20147229 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 19 20147356 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 20147574 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 20147595 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 20147748 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20147801 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 20147807 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20147809 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 20147829 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20147863 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 20147913 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20147957 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20148097 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 20148137 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 20148289 A C N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 19 20148404 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 20148412 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 20148682 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 20148795 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 20148883 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 20148999 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 20149038 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 20149084 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 19 20149087 A T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 19 20150175 C T N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 19 20150200 G A N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 19 20150247 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 19 20150253 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 20150257 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 20150345 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 20150356 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 20150367 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20150395 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 20150401 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 20150417 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 20150442 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 20150488 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 20150502 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 20150541 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 20150832 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 20150966 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 20151000 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 20151008 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 20151161 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 20151192 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 20151272 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 20151294 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 20151557 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 20151582 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 20151589 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 20151637 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 20151651 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20151670 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 20151715 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 20151879 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 20151889 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 20151945 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 20152012 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 20152022 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 20152306 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20152498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20152710 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 20153046 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20153047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20153478 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 20153519 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20154285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20154286 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 20154379 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20154423 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20154663 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20154788 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20156940 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 20156941 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 19 20157149 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 20157215 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 20157758 G C N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 19 20157854 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 20157879 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 20157971 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 20158023 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 20158254 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 20158604 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20159020 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 20159039 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 19 20159179 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 20159206 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 20159230 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 20159235 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 20159306 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 20159427 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 20159514 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 20159542 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 20159547 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 20159654 T G N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 19 20159676 C T N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 10 10 2 6 2 19 20159726 T C N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 9 11 2 5 3 19 20161526 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 20161624 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 20161903 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 20161946 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 20161951 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 20162254 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 20162438 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 20162454 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20162709 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 20162718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20162732 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 20162734 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 20162785 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 20162852 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 20162902 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 20162914 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 20162957 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 20163034 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 20163104 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 20163340 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 20163456 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 20163507 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 20163635 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 20163759 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 20164051 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 20164075 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 20164125 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20164130 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 20164146 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 20164155 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 20164188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20164211 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 20164309 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20164867 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20164991 G T N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 19 20164996 T C N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 19 20165059 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 20165651 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 20165664 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 20165863 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 20166145 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 20166153 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 20166228 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 20166245 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 20166272 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 20166681 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 20166730 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 20166748 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 20166897 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 20166929 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 20168282 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20168373 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 20168400 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20168547 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20168550 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20168587 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20168616 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20168618 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 20168693 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 20168694 C T Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 20168762 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 20168828 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 20168833 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 20168835 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 20168940 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 20168997 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 20169038 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 19 20169073 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 20169105 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 20169123 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 20169367 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 20169483 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 20169724 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 20170166 A G N Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 19 20170301 T A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 19 20170344 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 20170358 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 20170424 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 20170447 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 20170593 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 20170605 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 20170689 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 20171313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20171334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20171373 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 20171397 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20172074 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 20172258 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20172278 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20172567 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20172581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20172633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20173680 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20173734 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 20173780 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20174067 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20174140 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20174212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20174993 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20175405 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 20175661 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 20175664 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 20175685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20175768 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 20175999 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 20176062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20176188 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 20176216 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 20176218 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 20176296 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 20176492 G T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 20176498 G T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 20176517 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 20176547 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 20176562 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 20176787 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 20176788 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 20177143 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 20177263 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20177295 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 20177301 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 20177382 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 20177401 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 20177434 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 20177499 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 20177570 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 20177575 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 20177906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20177983 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 20178089 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 20178146 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 20178170 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 20178242 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 20178538 C A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 20178872 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 20178887 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 20178940 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 20178965 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 20178976 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 20179217 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 19 20179266 G C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 20179315 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 20179503 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 20179504 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 20179531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20179692 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 20179740 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 20179818 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 20180082 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20180127 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 20180145 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 20180163 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 20180180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20180183 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20180226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20180326 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 19 20180331 T C N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 19 20180621 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 19 20180629 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 20180667 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 20180669 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 20180817 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 20180840 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 20181032 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 20181058 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 20181063 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 20181103 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 20181183 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20181204 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 20181213 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 20181219 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 20181265 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 20181281 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 20181397 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 20181417 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 20181642 G C N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 19 20181680 A C Y N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 19 20181767 G A N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 19 20181823 G A Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 20182355 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20182761 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 20182772 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 19 20182836 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 20182846 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 20182875 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 20183036 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 20183423 T A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 20183653 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 20183893 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 20184017 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 20185204 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 20186280 A G Y Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.5 0.1 0.4 11 9 5 1 4 19 20186375 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 20186420 G T Y N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 19 20186562 T C Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 19 20186815 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 20187102 C A Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 20187207 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 20187297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20187310 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 20187312 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 20187412 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20187490 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 19 20187507 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5 0.1875 0.3125 19 13 8 3 5 19 20187516 C T Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 19 20187550 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20187693 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 20187830 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20187884 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 20188003 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20188347 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 19 20188521 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20188567 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 20188974 G T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 19 20189161 G T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 19 20189164 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 20189481 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20189672 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 20189881 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20189965 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20190150 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20190176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20190345 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20190495 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20190767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20191086 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20191188 A C N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.357142857142857 0.142857142857143 0.5 12 16 5 2 7 19 20191336 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20191496 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20191563 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20191591 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20191602 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20191643 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 20191644 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20192053 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 19 20192458 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 20192651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20192879 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 20192938 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20192982 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20193381 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 20194135 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 20194634 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20194638 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20194838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20195096 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 20195435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20195458 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20195725 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20195983 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 20196219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20196255 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20196320 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 20196670 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20196944 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20198050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20199349 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20199424 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 20199855 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 20200003 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 20200244 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20201763 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20203752 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20205374 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 20205412 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 20205488 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20205537 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 20205857 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 20205936 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 20205940 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 20206035 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 20206485 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 20206799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20206945 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 20207268 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 20207414 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 20207517 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 20207564 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 20207575 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20208220 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 20208242 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 20208505 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 19 20208528 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 19 20208572 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20208722 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 19 20209039 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 20209158 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 20209218 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20209719 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20209846 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20210133 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20210631 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 20210763 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 20210961 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20211002 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20211003 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20211296 C T N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 19 20211669 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 20211914 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 20212130 C G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 20212135 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 19 20212207 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 20212425 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 20212459 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 20212540 C T N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 20212566 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 20212839 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20213418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20213482 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 20213496 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20213799 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20213869 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 20214245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20218930 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 20219002 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 20219113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20219228 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20219620 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20220191 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20220511 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 20220932 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 20220961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20221060 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 20221091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20221245 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20221993 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 20222102 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20222161 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20222270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20222407 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20222890 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20223006 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20223110 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 19 20223142 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20223322 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 20223521 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 20223629 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20223732 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 20224016 C G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 20224834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20224968 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 20225258 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 19 20225295 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 19 20225395 G A N Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 19 20225396 G A N Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 19 20225654 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 20225877 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 20226166 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 20226167 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 20226344 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 20226416 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20226711 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 20226798 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20227375 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20227388 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20227427 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20227486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20227690 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20227867 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20227874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20227978 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20228214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20228572 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 20228628 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 20228702 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20229242 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 20229413 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 20229424 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 20229571 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 20229634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20229787 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20229821 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20230162 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 20230173 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20230178 C G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 20230551 A C N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 19 20230673 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 20230791 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 20230876 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20231213 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20231257 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20231646 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 19 20231671 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 20231733 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 20231761 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 20231792 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 19 20232008 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 20232814 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20232815 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 20233203 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 20233247 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20233704 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20233896 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20234160 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20234404 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 20234405 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20234650 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20234770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20235566 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 20236112 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20236633 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20236644 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20237141 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20237195 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 20237209 A T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 20237541 A G N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 19 20237564 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 19 20237696 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 19 20238690 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 20238813 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20239104 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 20239236 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 20239298 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20239547 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20239931 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20239968 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20239978 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20240140 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20240175 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 20240213 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 20240314 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 20240322 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 20240350 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 20240351 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 20240357 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 20240374 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20240390 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 20240395 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20240886 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20240994 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20241037 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 20241256 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20241265 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 20241643 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20241882 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 20242182 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20242359 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20242442 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 20242525 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 19 20242586 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 19 20242786 G A N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 19 20242918 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 19 20242952 T G N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 19 20243206 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 20243223 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 20243520 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20243527 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20243595 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 20243763 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20243934 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20244088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20244377 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 20244378 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 20244423 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 20244688 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20245318 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 20245340 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 20245546 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20245869 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20246018 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20246803 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 20247053 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 20247394 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20247479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20247488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20247518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20247560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20247644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20247725 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 20247730 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 20247738 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 20247741 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 20247847 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20248060 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 20248488 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20249470 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 20250554 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20250620 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20250725 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20251310 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 20251340 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20251402 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 20251888 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20252118 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 20252373 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20252494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20252841 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 20254160 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 20254256 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20255001 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20255002 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20255334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20256636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20257372 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 20257623 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20257816 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20258361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20258988 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 20259312 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 20259807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20259817 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20259948 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 20260180 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20260408 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20260645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20261328 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20262207 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20262698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20262709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20262869 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 19 20262904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20263351 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20263649 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 20264620 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 20264635 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 19 20265530 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20265599 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 20266174 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 20266422 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 20266948 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20266988 C G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 19 20267380 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 20267578 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 20267608 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 20267621 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 20267834 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 20267843 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 20267921 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 20268103 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 20268131 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 20268132 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 20268195 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20268667 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 20269464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20270168 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 20270625 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20270971 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 20270987 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20271072 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 20271073 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 20271120 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 20271130 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20271266 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 20271290 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 20271326 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20271334 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 20271446 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 20272538 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20272582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20274387 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 20274958 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20274998 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20275027 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20275116 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20275203 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20275246 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20275273 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20275362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20275392 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20275560 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20275603 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20275653 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20275677 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 20275678 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 19 20275786 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 20277870 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20277929 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20277950 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20277991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20278003 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20278027 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 20278028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20278122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20279096 T C Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 20279278 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20279309 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 20279338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20279420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20279504 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20279697 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20279801 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 20279803 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 20279810 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.214285714285714 0.142857142857143 0.642857142857143 8 20 3 2 9 19 20284405 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20284445 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20284576 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20284737 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20285002 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 20285311 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 20285389 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 20285475 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 20285887 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 20286300 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20286513 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 20286559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20286600 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20286922 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 20286933 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 20287047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20287213 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 20287648 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 20287659 C T N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 19 20288524 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20288588 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 20288608 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 20288652 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 19 20288807 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 20289544 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20289545 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20289747 C A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 20289987 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 20290202 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 20290244 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 20290503 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 20290672 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 20290904 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20291077 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 20291199 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20291879 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 20292885 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20293335 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 20293359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20293641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20294074 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 20294264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20294307 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 20294384 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20294587 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20294721 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20294911 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 19 20295121 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20298472 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 20298596 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 20298953 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 20299051 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 20299163 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 20299292 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 20299300 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 20299312 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 20299418 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 20299449 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20299498 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 20299558 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 20299601 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 20299602 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 20299654 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 20299772 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 20299844 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 20299875 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 20299896 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 20299908 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 20299924 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 20299928 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 20299951 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 20299977 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 20299978 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 20299984 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 20299995 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 20300188 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 20300391 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20300438 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 20300488 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 20300775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20300803 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 20301044 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 20301222 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 20301252 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 19 20301367 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20301561 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20301770 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 20301850 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 20302061 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 20302075 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 20302079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20302091 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 20302283 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20302300 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 20302312 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 19 20302396 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 20302526 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 20302539 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 20302567 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 20302568 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 20303048 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 20303081 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 19 20303693 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 19 20303868 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5 0.1875 0.3125 19 13 8 3 5 19 20303933 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 19 20304115 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 19 20304233 G T N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 19 20304415 G T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 20304632 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 20304736 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 14 22 6 2 10 19 20304786 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 20304881 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 20304969 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 20305070 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.5 0.111111111111111 0.388888888888889 20 16 9 2 7 19 20305152 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 19 20305464 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20305627 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 20305633 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 19 20305763 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 19 20305823 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20305865 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20305950 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20306642 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20307181 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 20307726 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 20307848 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20308047 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 20308049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20308332 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20308374 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20308687 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20309186 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 20309217 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 20309509 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 19 20309555 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 19 20309696 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 19 20309997 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 19 20310002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20311401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20312531 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 19 20316573 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 19 20316850 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20318300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20319281 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 20319460 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20319643 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20319698 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 20319859 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20323150 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20325294 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20325691 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20326605 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20327990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20328966 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20331105 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20331118 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 20331387 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 20332095 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20332233 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20333098 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20333176 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20334901 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 20335209 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 20335397 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20335451 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20335654 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20336641 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20338701 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20338779 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20339145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20339634 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20339814 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20340004 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20340423 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 20340437 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 20340448 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20341091 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 20341123 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 20343801 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20346715 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 20347106 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20350550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20352258 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20352896 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 20352917 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 20352931 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 20352997 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20353265 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 20353441 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20354876 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 20354901 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20354930 G T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 19 20354995 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 20355027 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 20355038 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 20355208 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 20355377 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 20355437 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 20355548 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 20355969 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 20356467 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 20356667 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 20356711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20356916 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20357159 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 20357327 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20357328 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20357380 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20357559 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20357566 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 20357614 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 19 20357903 A T Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 20357961 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 20357962 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20358056 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20358060 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 20358302 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 20358317 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 20358411 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 20358479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20358484 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 20358536 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 20358819 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 19 20359192 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20359265 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 20359326 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20359357 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20359389 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 20359391 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 20359424 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20359456 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20359495 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 20359529 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20359568 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 20359595 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 19 20359598 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 19 20359618 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 20359689 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20359750 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 20359858 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20359912 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20359942 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 20360026 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20360320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20360322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20360334 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20360768 T A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 20360769 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 20360772 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20360835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20360843 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20360870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20360893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20360944 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20361019 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20361039 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20361044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20361512 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20361517 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20361660 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20361661 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 20361667 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20361792 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20361815 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20361874 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20361920 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20361966 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20362080 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 20362105 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20362187 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20362260 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20362283 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20362291 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20362301 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20362403 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20362417 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 19 20362438 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20362444 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20362467 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20362472 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20362600 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 20362687 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 20364981 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 20365422 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 20365736 C G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 19 20365955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20366365 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20366989 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20367032 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 20367248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20367729 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 19 20367835 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20367933 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 19 20367978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20368062 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 20368086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20368094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20368446 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20369580 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 20369610 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20369616 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 20369622 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 20369629 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 20369646 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 20369767 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 20369801 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 20369819 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 20370056 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 20370212 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 19 20370461 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 19 20370730 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 20370760 T C N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 19 20370764 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 20370765 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 20370792 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 20370985 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 20371161 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 20372936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20373398 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20373441 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20373499 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20373687 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20374864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20375543 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 20375578 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 20376235 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20377171 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20378321 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20378463 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 20378825 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20380361 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20380620 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20383887 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 20384790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20386647 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20387106 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 20387439 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 20387527 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20387584 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20387649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20387668 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20387675 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20387679 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20387754 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20387804 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20388029 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20388038 T G Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 20388666 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20388685 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20389045 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 20389073 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20389091 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20389113 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 20389254 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20389500 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20390476 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20391297 C A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 19 20392144 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 20392397 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 19 20392469 G A N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.454545454545455 0.272727272727273 0.272727272727273 13 9 5 3 3 19 20392804 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20392943 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 20393030 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 20393032 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 20393056 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 20393177 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 20393231 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 20393247 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20393305 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20393335 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20393356 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.3125 0.125 0.5625 12 20 5 2 9 19 20393395 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20393463 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 20394152 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20394198 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 20394321 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20394579 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 20394593 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 20394711 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20394835 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20395011 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20395242 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 20395449 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20395489 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 20395528 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 20395588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20395622 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20395669 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20395683 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20395756 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20395921 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20396736 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20397184 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20397203 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20397293 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 20397303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20397516 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 20397610 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20397626 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 20397653 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 20397725 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 20397778 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20398530 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20398588 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20398597 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 20398713 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 20398725 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 20398730 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20398735 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 20398795 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 20398841 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 20401169 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 20401758 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20404281 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20404572 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20404592 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 20405012 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20405051 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20405052 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20405347 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 20405605 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 20405757 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 20405984 T A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 20405998 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20406014 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20406055 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 20406057 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 20406509 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 20406872 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20406892 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 20406962 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20407027 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20407194 G T N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.230769230769231 0.0769230769230769 0.692307692307692 7 19 3 1 9 19 20407459 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20407578 C A Y N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 19 20407591 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20407593 T C Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 19 20407852 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 20407910 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20408319 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20408327 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 20408344 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 20408358 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 20408424 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 20408643 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20409819 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 20410278 A T Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 19 20410604 C A Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 20410767 T G Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 20411139 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 20411371 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 20411561 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 20411673 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 20411795 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 20411886 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 20412212 A C N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 19 20412609 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 20412645 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20412825 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 20413007 A T Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 19 20413098 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 20413290 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 19 20413361 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 20413386 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 19 20413576 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 20413588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20413695 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 19 20413779 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 20414731 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 20414903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20415006 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 19 20415167 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 20415197 T G N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.25 0.0833333333333333 0.666666666666667 7 17 3 1 8 19 20415865 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 19 20415965 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20416052 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 19 20416762 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 20418306 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 19 20418882 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 20419901 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20419961 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 20420250 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 20420283 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20420532 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 20420931 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 19 20421292 G A N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 19 20421648 C T N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 19 20421825 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 20422121 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 20422140 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 20422167 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 20422207 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20422208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20422298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20422340 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20422980 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 19 20423228 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20423335 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20423416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20424768 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 20425134 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20425271 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20425786 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20425965 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 20426175 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20426303 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20426358 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.222222222222222 28 8 14 0 4 19 20426474 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20426493 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20426604 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20428147 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 20428512 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20428544 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20428627 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20429226 G T Y N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 19 20429228 C T Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 19 20429240 A C Y N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 19 20429340 G T Y N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 19 20430003 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 20430099 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 20430242 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 20430363 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 20430442 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 20430551 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 20430623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20430678 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 20430775 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 20430874 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 20430941 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 20431014 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 19 20431222 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 20431239 G A Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 19 20431881 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 20431898 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 20431910 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 20431926 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 20431940 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 20432246 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 20432312 G T Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 20432320 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 20432412 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 20432475 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 20432529 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 20432536 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 20432562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20432696 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 20432823 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 20432828 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 20432884 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20432908 A C Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 20432935 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 20432974 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 20433036 C A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 20433195 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 20433444 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20434189 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 20434287 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20434288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20434992 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20435036 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20435654 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 20435709 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 20435775 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 20435916 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 20436180 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 20436245 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 20436261 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 20436290 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 20436385 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 20436396 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 20436402 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 20436406 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 20436428 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 20436443 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 20436445 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 20436454 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 20436464 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 20436698 A C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 19 20436700 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 19 20436719 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 20437018 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.25 0.166666666666667 0.583333333333333 8 16 3 2 7 19 20437284 C T Y Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 19 20437333 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 19 20437355 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 20437704 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 20437818 T G Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 20437906 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 20438711 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 20439200 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 20439432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20439501 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 20439523 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 20439546 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 20439603 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 20439664 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 20439804 A C Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 20439941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20439969 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20439984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20440038 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 20440085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20440101 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 20440109 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 20440118 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 20440146 C G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 20440157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20440161 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 20440193 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 20440226 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20440309 T G Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 20440321 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 20440336 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 20440421 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 20440526 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20441288 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 20441292 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20441623 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20441688 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 20441798 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 19 20441825 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 20441954 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 20442330 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20442584 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 20442615 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20442616 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20442629 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20442793 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 20442800 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20442813 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 20442958 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 20442988 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20443006 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 20443283 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20443477 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20443503 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20443527 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 20443677 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 20444075 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20444415 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20444438 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 20444441 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 20444531 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 20444539 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 20444563 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 20444589 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 20444616 T A Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 20444732 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 20444850 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 20445143 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20445151 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20445154 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 20445304 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 19 20445729 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20445771 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20446047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20446101 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20446236 G A N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 19 20446485 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 20446490 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 20446582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20446863 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 20447220 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 20447223 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 20447243 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 19 20447357 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 20447361 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 20447380 T G N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 19 20447381 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 19 20447400 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 20447441 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 20447475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20447597 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 20447750 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.210526315789474 29 9 14 1 4 19 20448182 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 20448191 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 20449342 T G Y N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 19 20449360 G T N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.333333333333333 0.2 0.466666666666667 13 17 5 3 7 19 20449397 A G Y Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.428571428571429 0.0714285714285714 0.5 13 15 6 1 7 19 20449467 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 20449558 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 20449619 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 20449631 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 20449835 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 20449915 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20449930 A C Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 20450238 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 19 20450397 G A Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 19 20450636 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 20450993 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20451030 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20451280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20451295 G T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 20451479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20451560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20451756 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20451967 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20451990 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20451997 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20452054 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 20452206 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 20452275 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 20452612 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 20452659 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.263157894736842 27 11 13 1 5 19 20452675 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 19 20452743 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 19 20452745 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 19 20452911 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 20453000 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 20453658 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 20453698 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 19 20453803 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 19 20453835 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 19 20454400 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 20454413 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 20454516 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20454803 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 19 20455102 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 19 20455217 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 19 20455226 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 19 20455239 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 19 20455285 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 19 20455292 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 19 20455328 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 20455332 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 19 20455371 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20455384 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 19 20455815 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 19 20455878 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 19 20455962 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 19 20455966 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 19 20456038 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 20456044 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.222222222222222 0.0555555555555556 0.722222222222222 9 27 4 1 13 19 20456095 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.210526315789474 0 0.789473684210526 8 30 4 0 15 19 20456116 T A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.25 0 0.75 8 24 4 0 12 19 20456209 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 19 20456227 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 19 20456229 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 19 20456403 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 19 20456407 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 19 20456435 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 19 20456480 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.222222222222222 0.0555555555555556 0.722222222222222 9 27 4 1 13 19 20456508 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.235294117647059 0.0588235294117647 0.705882352941177 9 25 4 1 12 19 20456771 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 19 20457032 T A N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 19 20457542 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 20457839 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 20457847 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 20457906 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 20458134 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20458151 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20458192 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 20458205 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 20458520 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20458524 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20458596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20458611 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 20458625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20458633 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 19 20458751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20458779 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 19 20458816 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 20458825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20458888 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 20459120 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 20459402 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20459614 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20459751 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 20460108 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 20460208 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 20460321 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 20460348 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 20460615 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 20460688 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20460812 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 20460907 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 20461319 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 20461456 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 20461586 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 20461627 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 20461802 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 20461895 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 20461911 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 20461937 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 20461964 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 20462053 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 20462055 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 20462124 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 20462174 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 20462272 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20462357 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 20462513 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 20462672 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20462780 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 20462824 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 20462866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20463358 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20463829 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20464034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20464044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20464289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20464565 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20465389 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20465901 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20466258 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20466907 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 20468005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20468336 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20468373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20468490 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20468517 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 20468560 C A Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 20468584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20468715 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20468726 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20468748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20468817 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20468868 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20468999 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20469173 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20469225 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20469270 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20469294 C G Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.222222222222222 27 9 13 1 4 19 20469320 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 20469410 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 20469424 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 19 20469564 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20469708 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20470071 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20474948 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 20475069 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20475073 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 20475168 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20475351 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 19 20475481 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 19 20476088 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 20476205 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20476552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20476894 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20477249 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20477298 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20477600 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20477908 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20478123 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20478159 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20478179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20478325 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20478462 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.222222222222222 0.0555555555555556 0.722222222222222 9 27 4 1 13 19 20478970 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20479278 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20479510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20481800 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.222222222222222 0 0.777777777777778 8 28 4 0 14 19 20482033 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 20482036 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 20482040 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 20482102 C G Y N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 19 20482160 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 20482235 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 19 20482262 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 20482280 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 20482287 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20482299 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20482388 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20482447 A C Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 19 20482461 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 20482485 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20482679 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20482687 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 20482786 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 20482827 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 20482919 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 19 20483056 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 20483109 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 20483358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20483359 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 20483388 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 20483969 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 20484483 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 20485342 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20485895 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 19 20486062 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20486353 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 20487086 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20487187 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20487188 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20487348 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20487366 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 20487510 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20487694 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20487700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20487770 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 20487810 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20487818 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 20487871 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 20487879 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 20487925 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 20487950 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 20487955 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 20487962 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 20488107 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20488108 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 20488135 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 20488152 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 20488186 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 20488193 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20488318 C G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 20488423 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 19 20488441 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.210526315789474 0 0.789473684210526 8 30 4 0 15 19 20488450 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20488459 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20488473 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 20488522 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 20488526 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 20488571 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 20488904 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 20489040 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 20489120 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 20489169 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 20489409 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 20489640 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 20489663 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 20489675 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 20489725 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20489812 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20490202 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 20490208 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 20490216 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 20490377 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 20490486 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20490622 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.235294117647059 0.0588235294117647 0.705882352941177 9 25 4 1 12 19 20490703 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 20490794 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 20490847 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 19 20491076 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 19 20491094 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 20491285 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 20491397 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 20491570 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 19 20491575 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 20491581 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 20491652 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 20491661 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 20491761 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 20491925 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 20491999 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20492015 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 20492057 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 20492060 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 20492145 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 20492196 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20492268 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 20492660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20492785 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20492790 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20493057 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20493066 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 20493115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20493183 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20493243 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20493305 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20493456 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20493461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20493623 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20493693 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20494014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20494111 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20494328 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20494373 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20494517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20494613 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20494626 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20495302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20495442 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 19 20495456 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 19 20495571 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20496627 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 20498665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20499342 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20500245 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20501018 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 20501664 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20501928 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20502469 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 20502564 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 20502623 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 20502653 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20502654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20502683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20502749 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 20502764 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 20502797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20502840 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 20503059 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 20503112 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 19 20503134 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 20503178 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 20503213 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20503328 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 20503466 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20503498 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 20503588 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 20503693 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 20503894 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 19 20503899 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 20504004 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 19 20504218 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20504251 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 19 20504827 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 20504833 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 19 20504839 C T N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 19 20504851 C T N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 19 20504857 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 19 20505324 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 20505504 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 20505571 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 20505576 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 20505599 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 19 20505623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20505787 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 20506075 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20507370 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20508925 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20508956 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20508978 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20509167 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 20509257 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 19 20509518 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 20509647 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20509713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20509798 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.210526315789474 29 9 14 1 4 19 20509827 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 19 20509832 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 20510061 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 20510126 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 20510140 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20510207 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20510247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20510263 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20510317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20510505 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20510573 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 20510718 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20511059 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20511063 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20511209 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20511210 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 20511269 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20511370 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 20511372 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20511373 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20511467 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20511491 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20511507 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20511518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20511522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20511550 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20511564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20511571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20511591 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20511623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20511654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20511746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20511751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20511776 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20511795 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20511851 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 20512267 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20512273 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20512533 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20512649 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20512668 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 20512695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20512714 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20512724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20512738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20512870 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20513007 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 20513110 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20513279 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20513309 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20513361 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20513367 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20513424 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20513705 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20513717 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20513750 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20513836 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20513859 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20514157 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20514183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20514188 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20514362 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20514365 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 20514370 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20514392 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20514428 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20514552 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20514652 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20514772 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20514801 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20514947 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 20514996 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20515021 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20515039 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20515046 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20515123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20515134 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20515139 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20515147 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20515199 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20515258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20515261 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20515377 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20515431 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20515433 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20515641 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20515738 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20515859 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 20515913 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20515927 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20515959 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20516056 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20516329 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 20516330 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 20516349 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20516387 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20516536 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20516675 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20516719 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20516870 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20516886 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 20517073 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20519635 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20519903 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20519969 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20520245 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20522701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20523321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20524430 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20524730 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20525987 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 20526576 C A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 19 20528472 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20528673 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 20529233 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 19 20529239 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20537694 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20537775 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20537917 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20538509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20539658 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 20539939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20540682 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20543490 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.421052631578947 0.105263157894737 0.473684210526316 18 20 8 2 9 19 20545924 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20546096 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20547708 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20547920 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20551153 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 19 20551224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20551278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20552341 A C N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 20554034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20554177 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20554221 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 20555021 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20555213 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20555335 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20555369 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20555384 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 20555403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20555748 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20556479 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20558078 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20558129 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20558470 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20558614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20558697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20558963 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20559228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20559308 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20559334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20559442 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20559605 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20559611 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20559635 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20559645 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20559913 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 20560289 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20560389 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20561223 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20561228 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 20561319 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 20561340 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 20561345 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 20561381 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20561504 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20561613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20561756 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20561813 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20561875 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20561948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20561972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20562186 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 20562433 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20562478 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20562729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20562765 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20563268 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20563281 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20563297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20563372 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20563406 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20563671 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20563679 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20564071 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 20564101 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 20564213 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 20564218 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20564302 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 20564317 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 20564596 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20564626 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 20564688 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 20564699 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20564744 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 20564792 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 20564861 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 20564963 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 20564987 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 20565081 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 20565182 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 20565204 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 20565231 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 20565241 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 20565249 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 20565274 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 20565391 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20565481 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 20565503 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 20565656 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 20565777 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20565862 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20565863 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20565872 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20565884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20565895 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20565920 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20565972 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20566120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20566193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20566321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20566700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20566767 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20566869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20566980 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20567070 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20567140 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20567231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20567292 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20567318 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 20567395 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 20567463 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 20567476 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 20567489 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 20567498 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 20567515 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20567693 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 20567735 A T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 19 20568296 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 19 20568344 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20568666 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20568809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20568827 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20568854 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 19 20568861 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20568894 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 19 20569111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20569435 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 20569517 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20569580 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 20569581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20569597 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20569598 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 20569610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20569683 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20569899 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 20570448 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.25 0.05 0.7 11 29 5 1 14 19 20570475 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20570612 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 19 20570642 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 20570676 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 19 20570677 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 19 20570731 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.25 0.05 0.7 11 29 5 1 14 19 20570743 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.25 0.05 0.7 11 29 5 1 14 19 20570798 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.25 0.05 0.7 11 29 5 1 14 19 20570889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20570948 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20570952 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.263157894736842 0.0526315789473684 0.684210526315789 11 27 5 1 13 19 20571038 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.368421052631579 0.105263157894737 0.526315789473684 16 22 7 2 10 19 20571047 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 19 20571075 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.235294117647059 25 9 12 1 4 19 20571110 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20571133 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 20571164 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 20571260 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 20571288 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 20571654 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 20571711 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 19 20571727 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 19 20571758 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.421052631578947 0.105263157894737 0.473684210526316 18 20 8 2 9 19 20571946 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 20572123 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.222222222222222 0.0555555555555556 0.722222222222222 9 27 4 1 13 19 20572195 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.2 0.0666666666666667 0.733333333333333 7 23 3 1 11 19 20572324 T C Y Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 7 11 3 1 5 19 20572537 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20572645 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.263157894736842 0.0526315789473684 0.684210526315789 11 27 5 1 13 19 20572785 A T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 20572826 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.235294117647059 0.0588235294117647 0.705882352941177 9 25 4 1 12 19 20572967 T A N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 19 20572993 A T N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 19 20572999 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 20573242 A G Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 20573553 C A Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 20573647 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 20574227 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20574228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20574241 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20574393 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20574765 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.411764705882353 0.0588235294117647 0.529411764705882 15 19 7 1 9 19 20575228 A C N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 19 20575516 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 20575658 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 20575714 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.5 0.142857142857143 0.357142857142857 16 12 7 2 5 19 20576405 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 20576855 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 19 20576933 A T N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 19 20576960 A G N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 19 20576976 C T Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 19 20577101 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 19 20577950 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20578596 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20579136 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20579149 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20579663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20580072 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20580163 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20580295 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20580391 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20584450 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20586031 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 19 20586243 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 20586374 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 20586679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20586728 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.45 0.1 0.45 20 20 9 2 9 19 20586871 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 20586977 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 20586979 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 20587004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20587007 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 20587160 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 20587161 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 20587572 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 20588682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20589177 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.421052631578947 0.105263157894737 0.473684210526316 18 20 8 2 9 19 20590270 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 20590390 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 20591059 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20591330 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20591731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20593097 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20593919 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 19 20594231 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 20603138 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20603555 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20604662 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 20604750 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 19 20605292 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 20605384 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20605415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20605647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20605766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20606051 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20606290 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20606495 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20606694 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20607031 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 20607331 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20608307 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 20610243 T A N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 19 20610357 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20610509 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 20610679 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 20610818 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 20610918 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 20611054 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 20611181 T G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 20611292 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 20611341 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 20611618 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20611841 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20611935 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20612083 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 20612343 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 20612487 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 20612533 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 20612586 T A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 20612621 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 20612761 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20612936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20612958 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 20613244 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 20613373 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20613520 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20613546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20613612 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 20613787 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 20614037 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20614674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20614710 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 20615392 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20615528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20616768 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20616883 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 20616887 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20616957 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 20617733 C G Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 20618167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20618593 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20618908 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20621011 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 20621294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20621546 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20621637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20621840 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20622844 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20622971 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20623148 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20623287 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 20623375 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 20623522 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20623708 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20623711 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 19 20623906 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20623916 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 20624331 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 20624471 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 20624539 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 20624642 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20624913 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 20624952 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 20625084 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20625167 A C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 20625218 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 20625669 A G Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 20625701 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 20625843 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 20626202 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20626556 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20626600 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20626862 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 20626881 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 20626882 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 20627141 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 20627181 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 20627469 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 20627566 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 20627930 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20628067 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20628077 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20628142 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 20628381 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20628467 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20629329 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20629348 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 20629490 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 20629547 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20629834 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20629935 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 20630188 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20630359 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20630462 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20630671 T A N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 19 20630672 C A N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 19 20630676 A C N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 20630685 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 20630717 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 20630741 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 20630759 G T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 19 20630813 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.25 0.166666666666667 0.583333333333333 8 16 3 2 7 19 20630843 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 20631283 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 20631309 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 20631366 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 20631399 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 20631474 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 20631508 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 20631512 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 20631674 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 20631714 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 20631905 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 20632257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20632265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20632468 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 20632501 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20632574 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 20632676 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 20633074 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20633087 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20633236 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 20633429 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 20633535 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 20633840 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 20633861 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20633880 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20633912 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20633939 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20633949 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20633967 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20634015 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 20634025 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20634152 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 20634338 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 20634403 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 20634454 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 20634602 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 20634955 T G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 20634956 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 20635012 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 20635030 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 20635075 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 20635104 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 20635156 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 20635249 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 20635330 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 20635335 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 20635336 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 20635685 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 20636520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20636557 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 20636957 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 20637366 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 20637462 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20637558 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 20637718 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 20637790 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 20637908 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20638046 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20638047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20638128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20639058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20639132 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20639228 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 20639254 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 20639503 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 20639550 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 20639695 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 20639733 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 20639883 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 20639962 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 20639973 T G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 20639984 G T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 20640113 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 20640242 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 20648411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20650843 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 20650943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20651917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20652361 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20653057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20653279 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20655351 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20655655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20656287 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 20656742 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20657605 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 20657929 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 20658004 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20658408 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 20658626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20659099 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20659141 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 20659431 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20659813 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20660611 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20660656 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20663395 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 20663397 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 20663579 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 19 20664426 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20667148 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20667262 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20667382 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 20667754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20668852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20669078 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 20669572 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 20669597 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20669649 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 19 20669874 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20670103 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 20670155 A C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 19 20670163 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 20670667 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 20670780 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 20670901 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 20671871 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20672010 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 20672104 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 20672291 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20672297 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 20672441 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 20672571 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20672681 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20672690 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20672844 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 20672850 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 20672862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20673654 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 20673660 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 20673670 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 20673679 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 20673687 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 20673806 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 20673861 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 20674442 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 20674467 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 20674498 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 20674821 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20674877 C G N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 19 20674970 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 20675008 C A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 20675040 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 20675055 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 20675077 C A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 20675202 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 20675214 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 20675312 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 20675372 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 20675457 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 20675516 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 20675518 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 20675695 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 20675794 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 20675873 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 20676106 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 20676309 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 20676501 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 20676587 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 20676602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20676644 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 20677484 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 20677489 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 20677509 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 20677539 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 20677559 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 20677563 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 20677659 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 20677766 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 20677832 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 20677941 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 20678028 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 20678224 C A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 20678292 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 20678329 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 20678332 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 20678407 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 20678440 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20678663 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 20678725 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 20678813 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 20678971 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 20679432 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 20679812 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 20679952 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 20680331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20680873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20680917 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 20680934 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 20680939 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 20681684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20681886 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 20682077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20682344 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 20682478 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 20682532 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 20682861 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20682890 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20682905 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 20682938 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20682973 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20683035 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20683898 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 20684129 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20684297 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 20684885 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 20685159 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 20685160 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 20685191 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 20685271 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 20685438 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 20685453 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 20685474 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 20685512 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 20685753 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 20685786 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 20686002 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20686217 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 20686931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20687133 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20687134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20687139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20687910 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20688599 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 20688628 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 20688647 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20688717 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 20688872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20689298 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 20689321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20689385 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 20689540 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20689541 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20689553 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 20689813 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 20689860 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20690469 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20690918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20691206 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 20691305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20691344 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20691582 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 20691587 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 20691650 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 19 20691713 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 20691753 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 20691793 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 20691814 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 20691951 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 20692001 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 20692587 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 20692721 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 20692746 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 20692899 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 20692976 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 20693027 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 20693547 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20693620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20693697 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20693720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20694103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20694178 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20694946 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20695169 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20695313 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20695516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20696279 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 20696286 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 20696305 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 20696372 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 20696430 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 20696432 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 20696754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20697096 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 20697348 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20697515 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20697697 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 20697769 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 20697874 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 20698170 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20698438 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 20698512 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 20698537 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 20699225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20699478 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 20699590 T G N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 19 20699604 C A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 20699612 T G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 20699613 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 20699689 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 20699698 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 20699715 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 20699729 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 20699853 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 20700127 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 20700211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20700228 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20700229 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20700287 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20700428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20700499 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20700500 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20700583 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20700591 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20700629 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20700710 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20700779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20700783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20702022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20702051 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 20702070 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20702156 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20702181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20702237 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 20702293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20702321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20702341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20702481 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20702483 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20702511 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20702515 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20702587 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20702629 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20702689 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20702963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20702982 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20703004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20703008 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20703056 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20703077 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20703082 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20703115 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20703205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20703221 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20703222 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20703228 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20703243 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20703285 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20703286 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 20703606 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 20703712 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 20703867 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 20703879 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 20703941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20704025 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20704296 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20704342 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20704618 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20704813 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20704968 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 20704982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20704985 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 20705001 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20705025 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 20705037 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 20705078 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 20705090 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 20705211 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 20705362 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20705831 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20706049 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20706195 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20706506 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20706658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20706803 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20707129 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 20707182 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 20707223 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 20707390 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 20707589 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20707852 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20707897 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20707901 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20707946 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20708050 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20708097 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20708100 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20708105 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20708146 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20708148 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20708282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20708782 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20709040 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20709166 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20709260 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 20709425 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20709466 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 20709838 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20709953 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20710016 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20711022 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20711123 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20711503 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20711732 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20711747 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20711748 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20711781 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20711891 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 20712041 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20712042 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20712102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20712160 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20712173 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20712610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20712661 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20712799 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20712925 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20712956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20713062 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20713220 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20713252 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20713767 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20713774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20713932 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20714057 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 20714142 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 20714540 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20714696 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 20714842 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20716616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20716889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20716944 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20716948 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20717140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20717489 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20717617 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 20717766 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 20717873 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20717904 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20717961 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20718156 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 20718266 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20718286 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20718336 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20718352 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20718430 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 20718434 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 20718492 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20718562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20718577 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20718583 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20718591 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20718618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20718627 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20718683 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20718705 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20718727 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20718743 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20718794 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20718853 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20718998 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 20719061 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20719121 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20719151 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20719241 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20719246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20719248 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20719454 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20719512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20719730 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20719736 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20719818 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20719913 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20719928 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20719933 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20719934 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20719971 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20720019 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20720032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20720070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20720079 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20720190 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20720348 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20720403 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20720494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20720516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20721875 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20724281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20724368 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20725391 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20726884 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20727309 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20728497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20729601 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 20730263 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20730842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20731560 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20732414 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20733398 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 20733869 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 20734217 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 20737219 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20739081 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20739329 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 20740058 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20740407 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20740690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20741185 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20741806 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20747703 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20747804 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20748222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20749612 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20749883 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20749911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20749916 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 20749921 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 20749925 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 20749940 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20749966 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 20750002 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 20750027 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 20750032 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20750136 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20750137 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20750244 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20750254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20751492 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20754383 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20754505 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20754583 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20754598 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20754648 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 20754656 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20754660 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20754757 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 20754761 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20754781 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20754789 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20754817 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 20754834 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 20754869 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20754920 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 20755010 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20755017 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20755244 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 20755915 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20756381 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20756391 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20756494 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20756506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20758129 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20758260 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20758372 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20758379 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 20758402 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20758777 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 20758920 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20758989 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20759068 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 20759491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20760137 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20760281 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 20761350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20761367 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20761477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20762528 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20762594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20764151 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 20764517 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20764578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20765135 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 20765399 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 20765863 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 20765911 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20766576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20766594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20766666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20766715 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20766750 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20766847 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20766962 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20766969 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20767017 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20767027 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20767029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20767100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20767284 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20767358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20768877 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 20769598 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20771028 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20771098 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20772369 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20772419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20772787 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20773537 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20773919 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20774594 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20774993 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 20775117 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20775259 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20775373 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20776043 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 20776579 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 20776650 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20777230 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20777988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20778238 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20779593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20779745 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20780100 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 20780516 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 20780732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20781038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20781153 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 20781169 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20781298 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 20781350 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 20781588 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20782043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20782248 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20782268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20782288 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20782398 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20782433 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 20782440 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20782467 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 20782521 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20782661 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20782681 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 20782710 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20782790 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 20782831 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 20782863 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20782915 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20782989 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 20783032 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20783120 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20783165 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 20783181 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20783218 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20783257 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20783331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20783346 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 20783407 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 20783466 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 20783537 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20783774 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20783791 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20783797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20784668 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20785583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20786091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20786323 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20787979 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20788639 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20788721 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20789116 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20789642 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20790022 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20790160 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20791219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20791435 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20791741 T G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 20792327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20793012 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20793046 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20793070 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20793113 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20793122 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20793267 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20794481 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 20794555 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 20795611 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20795941 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 20797518 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20797714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20798666 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20798753 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20798851 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20798917 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20799247 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20799259 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 20799799 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 19 20799926 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 20800535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20801324 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20801516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20801592 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20801599 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20801734 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20802009 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 20802027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20802058 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 20802061 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 20802316 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 20802351 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 20802489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20802500 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20802543 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 20802587 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 20802657 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 20802658 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 20802688 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 20802858 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20802995 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 20803132 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20803254 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20803461 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 20803651 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 20803706 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20803716 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 20803742 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 20803850 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 20803858 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 20803862 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 20803879 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 20803901 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 20803904 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 20803976 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20804009 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 20804024 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 20804034 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 20804046 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 20804050 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 20804083 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 20804111 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20804255 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20804473 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20804546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20804793 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 20804933 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20805137 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20806347 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 20806449 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 20806503 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 20806577 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20806612 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 20806703 A T N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 19 20807054 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 20807105 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 20807106 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 20807152 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 20807161 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 20807276 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 20807307 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 20807432 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 20807469 A G N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 19 20807708 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20807822 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20807878 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20807899 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 20808146 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20809171 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 20809188 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20809535 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20809805 G C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20810404 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20810540 G C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20811054 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20813135 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20813166 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20813212 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20813242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20813337 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20813446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20813853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20814080 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 20814101 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 20814158 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 20814431 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 20814532 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 20814605 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 20814652 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20814678 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 20814761 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 20815111 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 20815137 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20815220 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 20815236 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 20815242 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 20815399 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 20815422 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 20816028 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20816051 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20816083 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 20816149 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 20816263 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 20816465 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20816535 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 20816669 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20816694 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20816697 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20816702 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20817856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20817922 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20817977 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20818274 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20818292 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 20818683 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 20818684 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 20818722 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20818770 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 20818780 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20818856 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20818864 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20818923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20818925 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20818943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20818984 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20818986 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20819004 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20819018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20819041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20819096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20819285 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20819313 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20819449 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20819461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20819487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20819664 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20820043 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20820418 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20820475 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20820577 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20820644 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20820798 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20821254 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20821444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20821665 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20822330 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20823052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20823167 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 20823327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20823348 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 20823397 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 20829993 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20830014 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 20830022 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20830023 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 20830041 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20830059 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20830111 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20830136 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20830151 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 20830318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20830383 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 20830596 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 20830609 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 20830729 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20831004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20831017 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 20831102 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 20831130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20831239 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 20831331 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 20831337 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 20831359 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 20831459 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 20831835 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 20831880 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 20832714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20832864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20833293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20833329 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20833342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20833346 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20833403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20833653 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20833709 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20833759 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20833806 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 20833885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20834083 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20834831 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20834911 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 20836317 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20836514 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20836522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20836598 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20836687 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20836724 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20836770 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20836778 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20836793 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 20836883 G A N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.75 0.0833333333333333 0.166666666666667 19 5 9 1 2 19 20836906 T A N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 19 20836984 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 20837075 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20837076 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20837094 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20837095 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 20837184 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 20837218 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 20837340 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 20837584 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 20837644 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 20837841 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 20837844 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 20837916 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 20837935 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 20837942 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 20838180 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20838196 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20838268 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20838409 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20838426 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20838609 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 20838632 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 20839165 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 20839331 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20840273 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 20840416 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 20840686 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 20840697 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 20840901 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 20841203 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 20849322 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.411764705882353 0.0588235294117647 0.529411764705882 15 19 7 1 9 19 20849512 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20849515 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20849530 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 20849601 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20849602 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20849669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20849857 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.444444444444444 0.111111111111111 0.444444444444444 18 18 8 2 8 19 20850222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20850229 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.4 0.1 0.5 18 22 8 2 10 19 20850890 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20851530 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20851771 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20853689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20853785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20854482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20854804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20854956 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.4375 0.125 0.4375 16 16 7 2 7 19 20859947 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20860776 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20861631 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 20861665 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20861760 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20861762 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20861803 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20862363 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20862571 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20863176 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20864514 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 19 20864536 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 20864809 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 20864883 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 20866806 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 19 20867245 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20867655 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 20867933 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20868443 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20868658 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20868660 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20868843 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20868971 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 20869005 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20869030 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 20869120 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 20869156 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 20869241 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 20869408 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20869420 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 20869427 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 20869522 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 20869534 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 20869656 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 20869707 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 20869857 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 20869955 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 20869974 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 20869977 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 20870287 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 20870434 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 20870525 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 20870623 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20870689 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 20870773 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 20870837 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 20870838 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 20870906 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 20871062 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 20871332 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 20871806 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 20871927 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20871932 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20872298 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 20872490 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 20872919 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20873022 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20873044 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20873133 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20873214 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 20875740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20875884 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 20876036 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20876130 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 20876479 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20876526 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20876543 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20876582 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20876672 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 20877000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20877455 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 20877472 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 20877554 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 20877581 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 20877663 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 20877740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20877876 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 20878058 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20878279 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 20878288 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20878308 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 20878338 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 20878570 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20878613 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 20878739 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 20878809 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 20878810 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 20878903 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20878944 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20878957 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 20879340 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 20879414 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20879455 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20879678 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 20879795 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20880092 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 20880135 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 19 20880144 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 19 20880215 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 20880231 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 20880256 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 20880529 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20880628 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20880856 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 19 20881124 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20881602 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 20881690 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 20881791 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 20882239 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 19 20882243 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 19 20882246 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 19 20882368 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 20882408 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 20882663 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 20882772 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20882991 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20883021 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20883100 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 20883108 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20883121 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20883131 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20883184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20883321 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20883346 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 19 20883530 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20883751 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 26 14 12 2 6 19 20883989 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20884091 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.222222222222222 0.0555555555555556 0.722222222222222 9 27 4 1 13 19 20884110 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.222222222222222 0.0555555555555556 0.722222222222222 9 27 4 1 13 19 20884177 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 19 20884204 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 19 20884376 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 19 20884397 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.263157894736842 0.0526315789473684 0.684210526315789 11 27 5 1 13 19 20884490 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 19 20884491 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 19 20884660 G A N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.285714285714286 0.0714285714285714 0.642857142857143 9 19 4 1 9 19 20884883 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 19 20884884 G T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.294117647058824 0.117647058823529 0.588235294117647 12 22 5 2 10 19 20884889 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 19 20884902 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 19 20884928 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 20884930 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 20884933 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 20884986 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 20884998 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 19 20885006 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 19 20885086 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.315789473684211 0.105263157894737 0.578947368421053 14 24 6 2 11 19 20885095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20885144 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.25 0.05 0.7 11 29 5 1 14 19 20885525 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 20885779 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20885784 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20885789 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20886069 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20886244 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 19 20886264 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 19 20886280 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 19 20886286 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 19 20886520 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 19 20886523 A C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 19 20886758 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 19 20886759 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 20886882 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 19 20886900 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 19 20887239 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 20887330 T G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 19 20887340 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 19 20887362 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 19 20887441 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 19 20887470 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 20887476 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 20887482 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 20887559 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 19 20887578 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 19 20887646 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 20887676 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 20887815 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 19 20887816 G T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 20889133 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.3 0.05 0.65 13 27 6 1 13 19 20889248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20889275 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20889405 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20889867 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20890034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20890093 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20890958 T C N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 19 20891086 C A N N 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 19 20891145 A T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 19 20891412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20891421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20891565 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20891735 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.235294117647059 0.0588235294117647 0.705882352941177 9 25 4 1 12 19 20891774 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20891779 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20891862 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20892121 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20892340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20892380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20892429 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20892624 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20892646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20892984 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20893063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20893566 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 20895024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20895036 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20895334 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20895366 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20895385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20896228 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20896773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20896787 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.3 0.05 0.65 13 27 6 1 13 19 20896797 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.65 0.05 0.3 27 13 13 1 6 19 20896867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20897208 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 20897746 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20897757 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20897792 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20897861 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20897978 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20898043 A T Y N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.357142857142857 0.0714285714285714 0.571428571428571 11 17 5 1 8 19 20898671 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.35 0.05 0.6 15 25 7 1 12 19 20899089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20899606 G C Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 20899854 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20900447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20901225 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20902025 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 19 20902290 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20902820 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20903064 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 20903119 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 20903132 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 20904165 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 19 20904392 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 19 20904415 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20904424 A C N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 19 20904691 A G Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.266666666666667 21 9 10 1 4 19 20904799 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 26 14 12 2 6 19 20904927 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 26 14 12 2 6 19 20905288 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20905372 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 20905541 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 20905630 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20905736 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 20905742 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 20905747 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 20905776 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 20905995 G C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 19 20906020 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 19 20906152 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20906975 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20908053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20909044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20909121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20909192 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 20909244 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20909522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20909625 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20909665 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20909759 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20909834 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 20910063 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 20910064 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20910086 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 20910164 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 20910374 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 20911362 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 20911384 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 20911555 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 20911562 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20911607 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20911913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20912217 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20912274 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20912968 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20913032 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20913161 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20913192 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20913231 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20913295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20913306 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20913311 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20913487 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20913518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20913594 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 20913601 T A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 20913614 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 20913658 A C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 20913677 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20913894 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 20913913 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 20918523 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20918916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20919020 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 20919063 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 20919122 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20919337 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20920952 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20920953 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20921403 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.55 0.1 0.35 24 16 11 2 7 19 20921698 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 20921707 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.6875 0 0.3125 22 10 11 0 5 19 20921730 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 22 14 10 2 6 19 20921751 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.578947368421053 0.105263157894737 0.315789473684211 24 14 11 2 6 19 20921785 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 19 20921806 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 22 10 10 2 4 19 20922011 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20922118 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20922559 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.55 0.1 0.35 24 16 11 2 7 19 20922588 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.55 0.1 0.35 24 16 11 2 7 19 20922638 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.55 0.1 0.35 24 16 11 2 7 19 20922664 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.55 0.1 0.35 24 16 11 2 7 19 20922711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20922777 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.55 0.1 0.35 24 16 11 2 7 19 20922895 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.333333333333333 23 13 11 1 6 19 20922897 G T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.333333333333333 23 13 11 1 6 19 20922989 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 19 20923024 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 19 20923048 T C N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.214285714285714 21 7 10 1 3 19 20923095 T C N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.181818181818182 17 5 8 1 2 19 20923100 G A N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.25 17 7 8 1 3 19 20923154 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.625 0.0625 0.3125 21 11 10 1 5 19 20924835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20925854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20926125 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20926286 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20926580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20926832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20927159 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20927289 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20927400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20928870 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 19 20928961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20930729 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20930879 G A Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.444444444444444 0 0.555555555555556 16 20 8 0 10 19 20930924 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20930996 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20931053 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20931398 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 20931817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20931882 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.222222222222222 0.0555555555555556 0.722222222222222 9 27 4 1 13 19 20931890 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20931945 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 20931954 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20931955 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20931960 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 20931970 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 20932063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20932078 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20932791 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.4 0.05 0.55 17 23 8 1 11 19 20932834 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20932880 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20932892 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 20932901 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 20932902 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 20932965 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.388888888888889 0.0555555555555556 0.555555555555556 15 21 7 1 10 19 20932974 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.388888888888889 0.0555555555555556 0.555555555555556 15 21 7 1 10 19 20933172 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20933488 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20933609 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 19 20933616 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 19 20933681 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20933698 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20933715 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20933744 T G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 20933755 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20934036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20934061 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.55 0.05 0.4 23 17 11 1 8 19 20934141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20934538 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.578947368421053 0.105263157894737 0.315789473684211 24 14 11 2 6 19 20934539 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.578947368421053 0.105263157894737 0.315789473684211 24 14 11 2 6 19 20934844 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 20936111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20936842 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 20938468 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 20938472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20938500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20938545 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20938554 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20938558 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20938606 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 20938735 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20938768 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 20938826 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 20938885 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 20939671 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 19 20939769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20940301 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 20940730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20940758 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 20940820 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 20941437 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 20941568 A T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.25 0.0625 0.6875 9 23 4 1 11 19 20941680 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20941709 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 20941740 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 20942138 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20942299 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20942567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20942664 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 20943061 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20943349 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20943645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20943650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20943835 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 20945624 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20946951 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.25 0.05 0.7 11 29 5 1 14 19 20947014 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20947038 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 20947221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20947427 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20948236 A C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 20948476 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20949097 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 20949259 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 20949527 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20950095 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20950551 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20951203 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 20951415 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 20951567 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 20951573 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 20951599 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 20951609 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20952402 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20953281 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20953288 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 20953613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20955088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20955106 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 20955164 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 20955688 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 20955732 C G Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 20955970 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 19 20955984 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 20956266 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 19 20956282 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20956317 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 20956368 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 20956552 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20956654 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 20956813 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 20956871 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 20956952 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 20957087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20957358 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20957369 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 20957580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20957640 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20957672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20957765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20957953 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20958176 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20958179 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20958188 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20958192 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20958209 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20958232 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20958452 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20958465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20958571 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 20959016 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 20959099 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 20959351 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 20959358 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 20959369 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 20959379 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 20959897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20960229 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 20962741 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20963774 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20963794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20963813 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 20965015 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 20965591 C T Y Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.285714285714286 10 4 5 0 2 19 20965990 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 20966072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20966669 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 20967088 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20967374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20967593 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 20967606 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 20967850 A T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 20968085 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 19 20968376 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20968384 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 20968676 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20968854 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 20969189 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 20969313 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20969343 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 20969956 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 20970640 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 20971523 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20971957 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20971966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20972149 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 20973064 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 20973077 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 20973089 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 20973412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20975709 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20976024 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20976189 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 20976407 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20976532 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20976716 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20977180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20977405 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20977685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20978388 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20979605 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20979764 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20979996 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20980034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20980559 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20981921 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20982708 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 20983248 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20983432 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20983891 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20983986 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20984235 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20985162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20985391 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 20985465 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 20985519 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 20985614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20986924 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 20987122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20987431 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20987783 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20988757 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 20989973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20991469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20991482 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20992011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20992079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20992660 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 20992736 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 20992739 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 20992771 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 20992859 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 20992882 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 20993447 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 20993481 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 20993620 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 20993630 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 20994466 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 20994504 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 20994515 T G Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 20994516 C A Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 20994520 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 20994522 A G Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 20994605 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 20994634 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20994733 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 20994780 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20994868 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 20994893 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 20994904 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20994963 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20995098 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20995161 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20995176 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20995183 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20995217 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20995252 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 20995262 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20995343 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 20995390 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 20995498 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 20995578 A C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 20995623 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 20995704 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20995713 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 20995841 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20995876 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 20995877 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20995904 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20996026 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20996129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20996450 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20996453 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 20996488 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20996548 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20997264 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 20997333 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 20997370 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20997784 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 20997828 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 20998086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20998125 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 20998222 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 20998404 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 20998969 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 20998988 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 20999095 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 20999151 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 20999306 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 20999313 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 20999371 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 20999548 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 20999829 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 21000064 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21000111 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 21000692 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21003870 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 21004028 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 21004373 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 21004712 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 21004735 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21004804 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21004860 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21004904 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21005138 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21005233 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21005275 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 21005320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21005435 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21006426 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 21006430 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 21008937 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21011733 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21012859 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21013004 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 21013078 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21013085 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21013318 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 21013387 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 21013419 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21013964 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21014170 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 21014171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21014186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21014197 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21014220 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21014288 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21014316 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21014440 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 21014606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21016166 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 21016207 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 21016289 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 21016417 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 21016482 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21016531 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 21016659 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 21017109 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21018313 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21020170 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21020778 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21020902 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21021270 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 21021282 A T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 19 21021295 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21021314 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21021449 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 21021454 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 21021614 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21021887 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21021987 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21022018 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21022499 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21022536 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 21023143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21023943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21024146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21024584 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21025876 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21026261 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 21026759 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21026999 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21027306 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21027664 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21028958 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21029721 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21033793 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 21034345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21034781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21034805 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21034832 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21035087 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21035521 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21035619 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 21035625 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21035754 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21035860 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21035872 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 21035873 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 21035913 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21036211 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 21036252 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 21036277 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21036809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21036925 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 21037026 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21037174 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21037181 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21037193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21037204 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21037312 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21037376 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21037385 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21037387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21037418 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21037419 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21037457 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21037492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21037496 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21037539 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21037567 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21037593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21037733 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21037743 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21037819 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21037841 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 21037904 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21037909 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 21037921 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21037960 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21037988 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21038056 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 21038131 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21038155 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 21038497 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21039074 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21039767 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 21039925 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 21040366 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21040374 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21040979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21040980 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 21041027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21041030 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21041286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21041389 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 21041390 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 21041690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21041828 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21041906 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21042043 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 21042153 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 21042262 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 21042289 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21042355 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 21042773 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21042795 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 21042907 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21042982 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21042989 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21042995 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21043175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21043277 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 21043451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21043508 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 21043588 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 21043674 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 21043675 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21044225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21044379 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 21044412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21045367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21045504 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 21045570 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21045597 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 21045611 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 21045712 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21045777 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 21045915 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21045920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21045972 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 21045996 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 21046002 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 21046057 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 21046059 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 21046130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21046238 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 21046261 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 21046265 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 21046271 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 21046276 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 21046277 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21046511 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 21046522 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21046694 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 21046709 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 21046728 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 21046746 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21046794 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21047120 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21047295 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 21047584 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21047651 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 21047723 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21048104 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 21048563 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21048569 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21048646 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 21048658 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 21048741 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 21048813 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 21048916 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 21048924 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 21048954 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21049452 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21049454 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21049581 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21049996 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21050075 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21050157 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21050273 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 21050418 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21050421 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21050423 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21050490 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21050501 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21050514 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21050722 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 21050767 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 21050799 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 21050826 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 21050932 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 21051508 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 21051569 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 21052130 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 21052301 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 21052505 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 21053215 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 21053216 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 21053466 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21053554 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21053567 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 21053568 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 21053625 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21054081 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21054141 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 21054244 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 21054245 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 21054274 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 21054362 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 21055280 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21055625 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21055643 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21055649 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 21055661 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 21055944 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 21056003 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 21056047 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21056261 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 21056360 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21056419 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 21056511 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 21056624 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 21056714 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 21057394 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21057409 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21057713 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 21057731 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21057945 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 21058442 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 21058476 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 21058517 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 21058527 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 21058673 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 21058675 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 21058784 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21058846 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 21058848 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 21058962 C A Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 21059534 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 21059575 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 21059594 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21059749 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 21059767 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21059831 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 21060087 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21060266 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21060275 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 21060290 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 21060299 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 21060391 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21060427 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 21060492 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21060502 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 21060771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21060776 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21060777 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21060838 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 21060840 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 21060862 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 21060974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21061137 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 21061496 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 21061614 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 19 21061763 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 21061938 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 21062021 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.133333333333333 26 4 13 0 2 19 21062760 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21064117 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21064139 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 21064447 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21064515 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21064786 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 21064788 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 21065146 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21065454 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21065527 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21065693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21065827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21066004 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21066200 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21066798 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21067231 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21067501 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 21067562 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21067699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21067912 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21067997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21068005 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21068051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21068136 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21068358 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21068437 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21068449 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21068497 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21068501 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21068503 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21068595 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21068639 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21068707 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21068717 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21068757 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21068779 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21068790 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21068930 C T N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 19 21068994 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 21069000 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 21069004 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 21069119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21069166 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 21069264 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21069387 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 21069410 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21069454 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21069532 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21069624 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 21069666 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21069727 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21069728 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21069791 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21069858 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 21069888 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21070051 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 21070110 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21070139 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21070149 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 21070225 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21070515 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21070551 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 21070552 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 21070607 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21072433 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21072563 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21075123 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21075156 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21075177 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21075325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21076210 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 21076462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21076858 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21076973 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21078431 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21080537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21081505 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21082369 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21082498 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21082798 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21082985 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21082987 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 21083007 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21083041 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21083160 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21083679 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21083809 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 21083813 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21083877 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21084348 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21084586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21085949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21086124 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21086427 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21091339 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 21092229 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21092507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21092994 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 21093861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21093934 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21094317 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21094774 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21095743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21095812 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21096167 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21096205 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 21096524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21096575 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21096730 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 21096807 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21096833 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21096879 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 21097265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21097354 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 21097430 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 21098032 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21098170 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 21098175 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 21098183 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 21098193 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 21098280 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 21098849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21098932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21099152 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21099743 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 21099987 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 21100024 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 21100195 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 21100204 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 21100207 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 21100260 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21100361 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 19 21100546 G A N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 19 21100590 T A N N 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 8 6 2 4 1 19 21100669 C T N Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 19 21100693 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 21100890 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 21100921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21100927 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21100967 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 21100983 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21101013 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 21101060 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21101448 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 19 21101511 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 21101955 T A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 19 21101967 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 21102128 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 21102147 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 21102180 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 21102263 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 21102265 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 21102366 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 21103684 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 21103951 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 21104010 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 21104062 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 21104098 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 21104231 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 21104430 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 21104809 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 21105446 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21106075 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 21106160 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 21106510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21106525 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 21106600 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 21106669 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21107308 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 21107510 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21107572 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 21107624 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 21107627 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 21107753 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 21107768 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21107788 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21107873 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21107965 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 21108000 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 21108003 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21108009 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21108875 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21110560 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 21110736 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 21110828 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 21111173 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21111382 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21112517 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 21113120 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21113181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21113456 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21113613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21114124 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 21114234 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 21115293 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 21115391 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21115488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21115687 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 21115790 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 21115936 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 21117801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21117842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21117901 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 21117975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21118275 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21118339 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21118651 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21118908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21119050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21120189 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 21120248 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21120284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21120531 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21120599 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 21120637 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 21120717 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 21120973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21121473 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 21121622 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 21121950 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 21122049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21122140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21122525 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21122663 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21123316 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 21124151 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 21124374 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 21124434 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 21124492 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 21124616 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 21124685 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 21124843 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 21124958 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 21125054 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21125238 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 21125261 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 21125262 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 21125397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21126328 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 21126332 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 21127039 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21127048 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21127102 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21127105 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21127648 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21127986 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 21128044 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21128460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21128786 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21129011 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21129111 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21129269 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 21129301 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 21129498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21129596 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21129608 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21129651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21129759 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21129813 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21129822 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21129922 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 21130084 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21130296 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21130311 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21130518 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21130535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21130563 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21130570 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21131104 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21131578 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 21132162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21132642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21140028 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21140195 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 21140206 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 21140209 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 21140217 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 21140219 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 21140356 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21140746 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21141011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21141064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21141243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21142187 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21142599 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 21142832 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21142884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21143519 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 21143554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21145306 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21145502 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21145914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21148685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21149232 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 21149243 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21149422 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21149555 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 21149618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21149879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21150283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21150395 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 21150406 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 21150439 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 21150440 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 21150486 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 21150499 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 21150543 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 21150571 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 21150572 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 21150600 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 21150651 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 21150800 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21152078 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 19 21152880 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 21152901 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 21154352 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 21154377 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21154493 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 21154510 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21155660 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21156015 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 21156043 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21156901 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 21156905 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 21157285 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 21157344 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 21157477 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 21157499 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 21158893 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21159290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21159606 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 21161666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21167810 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21167898 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21167965 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 21167985 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 21168138 C T Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 21168267 T C Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 21168470 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 21168482 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 21168527 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21168534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21168545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21168560 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21168574 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21168597 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21168603 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21168692 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21168700 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21168715 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21168718 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21168832 G T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21168836 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21168843 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21168851 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21168920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21168931 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21168979 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21169023 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21169263 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 21169299 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 21169305 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 21169312 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 21169329 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 21169370 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 21169376 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 21169389 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 21169400 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 21169408 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 21169467 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 21169544 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21169581 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 21169602 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21169615 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 21169734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21169744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21169919 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21169935 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21169937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21170164 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21170234 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21170243 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21170303 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21170305 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21170307 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 21170434 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21170512 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21170529 C G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 21170975 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 21171079 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21171223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21171361 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21171420 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21171444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21171481 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21171548 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21171583 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21171617 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21171621 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21171747 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21171772 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21171777 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21171833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21171842 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21171905 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21172199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21172433 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21172462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21172477 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21172507 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21172508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21172517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21172524 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21172576 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21172671 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21172672 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21172999 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21173000 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 21173023 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21173221 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21173231 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21173304 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21173316 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21173331 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21173344 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21173370 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21173451 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21173473 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 21173596 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21173759 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21173809 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21173857 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 21173890 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21173895 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21173896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21173899 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21174085 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21174111 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21175229 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 21175513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21175534 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21175535 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21175574 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21175654 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21175687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21175835 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21175908 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 21178659 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 21178753 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 21178766 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 21178957 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21179197 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 21179378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21179490 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21179930 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21180160 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21180510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21180735 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 21181420 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21182406 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21183829 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 21184123 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21185730 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 21186771 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21187100 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21188956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21189169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21189786 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21189811 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21189966 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 21190067 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21190083 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21190294 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21190494 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 21190552 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21191412 T C Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 21191511 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 21191815 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21192174 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21192527 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21193811 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21194286 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 21194474 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21194691 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 21194920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21195551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21195648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21195768 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21195868 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21196027 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21196135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21196189 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21196406 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 19 21196626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21196856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21197403 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 21198163 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21198207 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 21198259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21198563 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 21198865 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 21198887 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 21198915 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 21199172 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 21199278 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 21199858 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 21199947 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 21199951 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 21199964 G C Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 21199968 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 21200052 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 21200327 T G Y N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 19 21200607 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 21200788 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21200836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21201039 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21201087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21201122 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21201181 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 21201263 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21201280 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 21201783 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 21201917 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 21202035 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 21202740 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21202752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21202849 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 21202867 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21202890 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 21202897 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 21202913 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 21203129 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 21203145 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 21203506 C T N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.375 0.125 0.5 7 9 3 1 4 19 21203598 C T N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 19 21203876 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 21204050 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 21204098 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21204166 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 21204393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21204624 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 21204699 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 21204722 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 21204723 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 21204810 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 21204988 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 21204992 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 21205007 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 21205023 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 21205552 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21205986 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 21206393 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21206461 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 21206745 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21206789 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 21206866 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 21206916 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 21207425 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 21207467 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21207664 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 21207667 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 21208808 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21208809 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 21208814 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 21208838 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 21208849 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21209038 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21209227 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 21209614 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 21209741 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 21210061 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 21210089 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21210140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21210205 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 21210322 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21210324 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21210919 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 21211038 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21211060 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21211197 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21211300 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21211320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21211485 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 21211716 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 21211835 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21211840 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 21211937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21212018 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21212020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21212494 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21212517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21212529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21212539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21212600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21212748 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21213058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21213085 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21213425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21213491 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21213494 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21213502 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21213546 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21213559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21213866 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21213992 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21214006 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21214014 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21214027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21214047 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21214086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21214242 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21214373 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21214522 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 21214859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21214865 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 21214866 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 21214879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21215464 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 21215693 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 21215748 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21215771 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21215782 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 21215802 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 21218387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21218471 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 21218494 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21218537 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 21218635 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 21218858 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21219090 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21220363 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 21220760 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21221033 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21221158 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 21223176 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 21223243 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21224407 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21224917 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21224924 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21224925 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21224939 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21224947 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21224966 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21224969 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21225078 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21225324 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21225630 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 21225698 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21225699 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21225703 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21225927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21226086 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 21226104 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 21226114 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 21226346 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 21228214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21228516 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 21228604 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 21228734 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21228742 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21228778 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 21228795 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 21228820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21229130 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21229170 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 21229301 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 21229802 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 21230113 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21230116 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21230138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21230167 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21230187 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 21230279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21230927 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 21230933 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 21230944 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 21231051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21231069 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21231075 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 21231085 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 21231134 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 21231575 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21231643 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21231697 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21231704 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21231834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21231887 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21231917 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21232109 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 21232163 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21232345 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 21232355 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21232457 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 21232459 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21232872 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 21232874 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 21232904 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 21232984 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 21232996 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21233003 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21233016 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 21233048 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 21233052 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 21233055 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 21233113 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 21233185 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 21233254 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 19 21233640 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 21233647 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 21233749 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 21233763 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 21233892 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 21234560 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21234573 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21235053 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21235372 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 21235434 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21235564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21235607 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21235706 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 21235803 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21235840 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21236315 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 21236648 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21236835 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 21236854 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 21236985 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 21237004 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 21237044 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 21237050 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 21237133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21237417 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 21237576 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 21238320 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21238539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21238684 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 21238758 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21238932 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 21240028 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21240730 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 21240757 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 21241581 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 21241717 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 21242045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21243130 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21243250 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 21243311 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 21243313 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 21243330 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21243365 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 21243413 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 21243597 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 21243704 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21243725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21243848 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 21244050 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 21244181 G C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 19 21244193 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 21244199 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21244257 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 21244389 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 21244485 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 21245219 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21245220 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 21245472 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 21245676 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21245680 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21245858 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 21246275 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21246347 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21247704 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 21247762 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 21247886 G A Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 19 21247919 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 21247998 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 21248459 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 21248537 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 21248782 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 21248870 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 21248917 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 21248922 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 21248985 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 21249140 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21249244 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 21249263 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21249264 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21249305 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21249654 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 21249872 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 21250143 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 21250188 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 21250341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21250348 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21250619 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21250699 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21250707 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21250786 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 21250812 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21250822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21251179 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 21251272 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 21251370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21251615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21251765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21251926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21252317 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21253405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21253596 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 21253601 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 21253664 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 21253776 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 21253815 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 21253910 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21253922 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21254081 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21254113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21254119 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 21254134 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21254255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21254430 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 21254431 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 21254438 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 21254595 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21254620 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 21254657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21254693 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21254696 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 21254709 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21254944 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 21254978 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 21254992 A G N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 19 21255019 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 19 21255214 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 21255259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21255341 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21256975 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 21257209 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 21257759 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 21257790 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 21257791 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 21259142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21260893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21261041 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 21264623 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21264666 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21264845 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21264975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21265004 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21265366 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 19 21265417 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 21265426 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 21265438 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 21265494 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 21265502 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 21265508 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 21265703 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21265718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21265728 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21265757 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21265789 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21265822 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21265911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21265948 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21266248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21266261 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 21266278 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21266306 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21266332 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21266356 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21266401 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21266433 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21266463 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21266494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21266559 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21266608 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21266611 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21266622 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21266700 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21266725 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21266734 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21266761 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21266766 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21266769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21266819 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21266823 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21266824 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21266898 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21266952 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21267076 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21267115 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21267121 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21267138 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21267141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21267144 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21267150 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21267211 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21267260 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21267304 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 21267329 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21267439 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21267551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21267563 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21267571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21267618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21267658 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21267663 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21267666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21267673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21267765 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21267832 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21267834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21267842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21267850 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21267853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21267894 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21267908 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21267917 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21267925 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21267990 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21268187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21268253 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21268259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21268302 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21268459 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21268523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21268539 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21268787 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21268810 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21268819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21268872 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 21268886 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21268931 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21268934 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 21269019 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21269053 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21269081 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21269119 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21269121 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21269127 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21269189 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21269211 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21269242 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21269249 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 21269250 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 21269262 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21269338 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 21269815 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21271374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21273996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21274224 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21274869 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 21274897 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 21275094 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21275192 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21276126 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21277548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21277600 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 19 21278037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21278506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21278605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21278792 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 21278815 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 21279090 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21279281 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21279317 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 21279517 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21279782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21279875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21280374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21280579 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 21280688 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 21280704 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 21280890 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21280985 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21281620 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 21281837 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 21282913 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21283640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21284364 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21286076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21286216 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21286268 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21286341 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21286389 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21286391 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21286421 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21286738 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21286748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21286768 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21287987 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21288520 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21288523 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21288828 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21289404 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21289417 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21289427 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21289467 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21289506 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21289527 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21289543 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21289546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21289551 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21289605 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21289844 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21289850 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21289930 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21289932 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21290016 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21290086 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21290093 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21290146 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21290171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21290266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21290386 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 21290444 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21290501 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21290578 G C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 21290582 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 21290985 T A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 19 21291276 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 21291409 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21291673 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21300169 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21300234 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 21300241 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 21300294 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21300317 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21300350 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 21300511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21300520 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21300579 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21300605 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 21300930 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21301163 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21301379 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 21301400 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 21301477 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21301492 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21301591 A C N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 19 21301726 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 21301885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21302201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21302427 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21302731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21303336 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21303475 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 19 21303919 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21304052 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 21304620 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 21304737 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21305028 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21305129 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21305156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21305200 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21305321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21305564 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21305567 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21305816 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21305887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21306060 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21306150 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21306466 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 21306518 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21306775 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 21306887 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 21306892 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 21307012 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 21307034 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 21307051 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21307059 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 21307199 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 19 21307201 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 19 21307337 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 21307387 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21307392 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21307407 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21307456 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21307505 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21307550 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 21307582 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21307650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21307747 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21307813 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 21307836 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21307858 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21308109 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 21308129 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 21308211 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21308243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21308244 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21308301 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21308417 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21308564 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21308572 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21308753 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21308755 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21308760 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 21308795 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 21308824 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21308839 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21309084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21309137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21309193 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 21309334 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21309393 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21309790 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 21309891 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 21310838 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21318446 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21318977 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 21321813 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21321960 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 21322362 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21322451 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 21322583 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21322758 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 21323993 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21324018 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 21324052 A C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 21324418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21324626 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21324666 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 21324673 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 21324695 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21325025 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21325060 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 21325100 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21325729 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 21325804 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 21325813 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 21325816 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 21325826 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 21325827 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 21325891 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 21325915 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 21325942 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 21325955 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 21325956 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 21325964 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 21326019 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 21326156 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21326168 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 21326185 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 21326196 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 21326262 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 21326338 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 21326376 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21326594 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 21326855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21327077 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 21327120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21327351 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 21327374 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21327417 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 21327855 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21327913 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21328162 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21328355 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21329641 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 19 21330992 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21331108 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21331273 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21331398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21331676 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21331783 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21331794 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 21331795 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 21331882 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 21331887 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 21332105 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 21332472 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21332659 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 21332851 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 21332869 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 21332938 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 21333197 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 21333206 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 21333621 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 21333633 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 21333646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21333681 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21334192 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21334482 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 21334606 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 21334794 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 21334796 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21334830 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 21334946 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 21335008 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 21335018 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21335063 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 21335103 C T Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 21335303 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 21335369 T G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 21335391 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 21335409 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 21335475 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21335503 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21335591 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21335719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21335785 T G N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 19 21336069 C G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 21336197 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21336351 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 21336352 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 21336357 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21336360 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21336364 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21336370 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21336375 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21336649 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 21336655 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 21336669 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 21336690 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 21336875 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 21337074 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21337192 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 21337218 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 21337288 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21337520 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21337639 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 21338118 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 21338347 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 21338400 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21338427 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 21338463 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21338667 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21338867 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 21338902 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 21338967 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21339397 A C N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 19 21339993 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21340064 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 21341062 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21341560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21342146 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21342316 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21342718 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 19 21342882 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 21342907 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 21342951 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 21342952 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 21343017 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 21343178 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21343477 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 21343519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21343534 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21343553 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21345464 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21346329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21347910 G T Y N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 19 21348601 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21349261 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21349487 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21350143 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 21351097 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 21351256 T G N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 19 21352998 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21353239 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21353591 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21357067 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 21358585 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21359394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21360156 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21361116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21362281 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 21363101 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21363680 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 21363725 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 21363968 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21363988 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 21363995 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 21364030 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 21364275 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21364278 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21364661 G C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 21364664 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 21364736 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21364782 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21364867 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21364897 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 21364981 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21364985 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21365007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21365147 T G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 21365244 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 21365408 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21365493 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21365872 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21365896 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21365964 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 21365998 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21367183 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21367373 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21367395 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21367430 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21367438 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21367576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21367646 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21367677 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21367803 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 21367817 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 21367829 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 21367832 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21367862 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 21367962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21367969 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21367981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21369719 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21371143 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21371377 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 21371499 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 21371657 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21371675 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 21372304 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21373023 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 21373114 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 21373142 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 19 21373152 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 19 21373215 G C N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 21374182 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 21374266 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21374385 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21374644 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21374697 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 21374787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21374963 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21375167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21375247 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21375436 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21375606 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21375635 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21375688 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21376090 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 21376107 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21376108 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 21376130 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 21376212 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 21376513 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21377038 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21377042 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21377250 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21377313 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21377771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21377856 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21378123 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 21379012 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 21379045 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 21379198 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 19 21379861 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 21380110 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21380149 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 21380287 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21380317 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 21380318 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 21380778 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 19 21380827 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 19 21380873 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 19 21380912 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 19 21380916 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21381307 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21381312 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21382113 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 21382142 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21383523 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21383810 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 21383836 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 21384066 G A N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 21384082 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 21384148 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 21384222 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 21384275 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 21384332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21384756 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21384919 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21385814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21385946 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21386239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21386596 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21387609 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 21388036 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21388904 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21388950 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 21389054 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 21390758 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21390795 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21391102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21391600 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21391905 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21393513 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21394294 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 21394316 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 21394458 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 21394484 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 21394601 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 21394615 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 21394664 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 21394926 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 21395036 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21395077 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 21395106 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 21395179 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 21395272 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 21395275 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 21395532 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 21395548 A T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 21395580 C A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 21395596 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 21395803 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 21395919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21396269 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21396600 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21396692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21396876 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21396888 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21396930 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21397012 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21397020 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 21397198 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21397539 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 21397563 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 21397590 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 21397673 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21397674 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21397707 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 21397917 T A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 21398143 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 21398149 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 21398231 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 21398424 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21400023 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 19 21400105 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21400384 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21400405 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 21400407 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21400695 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 21400944 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21401134 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 21402113 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 21402161 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21402163 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21402394 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 21402575 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 21402703 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 21402706 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 21402733 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21402799 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21402803 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21402905 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21402914 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21402958 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 21402997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21403046 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21403387 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21403550 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 21403626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21403690 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 21403907 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 21403926 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 21403991 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21404115 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 21404309 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 21404407 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 21404541 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21404693 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21404869 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 21404933 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 21404989 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 21405026 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21405050 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 21405230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21405266 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21405293 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 21405330 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 21405350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21405820 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 21405896 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 21405983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21406266 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 21406304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21406476 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 21406511 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 21406520 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 21406525 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 21406539 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 21406710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21406728 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21406919 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 21407243 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 21407252 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 21407263 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 21407500 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 21407653 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 21407875 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 21408019 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 21408054 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 19 21408188 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 21408293 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 21408600 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 21408856 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 21408897 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 21409210 G A Y Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 19 21409243 G A Y Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 19 21409360 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 21409362 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 21409368 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 21409461 G C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 21409462 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 21409490 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 21409559 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 21409759 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 21409770 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21409772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21409785 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 21409873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21409985 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 21410373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21410771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21411013 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21411558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21411585 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21411592 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 19 21411706 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 21411809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21411846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21411868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21412103 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21412429 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 21412463 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 21412492 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 21412551 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 21412567 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21412726 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21412822 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 21413048 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 21413142 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 21413149 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 21413207 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 21413576 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 21413638 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 21413644 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21413912 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 21414065 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 21414066 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 21414287 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 21414522 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 21414780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21414781 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 21415262 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 21415290 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 21415359 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21415565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21415583 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21415822 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 21415825 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 21415975 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21416049 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 21416057 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 21416266 A G N Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 19 21416779 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21416881 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 21417038 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 21417196 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 21417295 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 21417301 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 21417335 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 21417344 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 21417424 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 21417461 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 21417494 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 21417521 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 21417805 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 21418235 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 21418929 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 21418942 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 21419012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21419039 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 21419171 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 21419211 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 21419214 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 21419345 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 21419436 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 21419490 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 21419498 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 21419574 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 21419812 A G Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 21420038 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 21420305 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 21420392 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21420423 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 21420452 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21420511 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 21420646 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 21420721 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 21420730 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 21420923 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21421003 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 21421131 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 21421135 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 21421212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21421213 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21421439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21421487 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 21421543 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21421589 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 21421749 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21421851 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21421908 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21421930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21421947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21422028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21422038 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21422048 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 21422080 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 21422158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21422234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21422259 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 21422266 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21422292 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21422332 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21422375 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21422422 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 21422474 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21422496 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 21422537 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21422546 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21422593 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 21422645 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 21422740 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21422755 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21422826 C A N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 19 21422864 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 21422877 G T N N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 19 21422884 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 21423018 A C N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 21423056 A G N Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 19 21423421 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 21423547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21423697 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21423769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21423926 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21424205 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 21424208 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 21424222 T A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 21424240 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 21424291 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 21424294 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 21424372 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 21424617 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 21424783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21424798 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 21424891 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 21424942 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 21425056 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 21425226 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 21425284 G C Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 21425316 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21425433 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 21425629 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 21425887 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 21425894 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 21426009 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21426034 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21426053 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 21426075 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 21426330 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 21426345 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 21426372 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 21426377 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 21426384 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 21426441 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21426465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21426486 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 21426491 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21426555 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 21426584 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21426618 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21426627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21426678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21426907 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21427040 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21427174 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21427768 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21427807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21429595 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21431518 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 19 21434356 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 21434470 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 21434549 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21434626 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21434645 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21434796 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 21434832 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21434925 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 21435063 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 21435065 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21435217 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21435228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21435364 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21435391 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21435406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21435441 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21435533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21435542 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21435560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21435822 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 21435837 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21435839 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 21435849 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 21435900 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 21435932 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 21435982 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 21435992 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 19 21436027 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 21436029 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 19 21436426 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21436445 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 21436451 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 21436469 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21436519 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21436525 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 21436546 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21436649 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21436752 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 21436960 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 21437508 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 21437769 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 21438276 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21438282 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 21438288 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21438450 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21438455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21438481 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21438482 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21438670 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 21439237 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 21439240 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 21439269 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 21439282 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 21439450 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21439460 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21439504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21439516 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21439619 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21439639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21439684 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21439813 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 19 21439814 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 19 21439858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21439876 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21439935 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 21440047 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21440115 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21440260 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 21440357 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 21440487 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 21440541 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21440697 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 21440767 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 21440802 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21440871 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 21441077 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21441110 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21441141 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 21441147 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 19 21441157 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 19 21441523 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 21441598 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 21441747 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 21441748 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 21441830 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 21441875 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 21441882 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 21441949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21441952 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21441994 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 19 21442038 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 21442060 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 21442154 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 21442193 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 21442214 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 21442313 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 21442319 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 21442346 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 21442355 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 21442359 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 19 21442422 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 21442499 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 21442553 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 21442554 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 21442641 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21442833 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 21443029 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21443172 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 21443584 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21443600 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21443684 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21443740 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 21443753 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 21443908 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 21443927 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 21444089 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21444100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21444106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21444127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21444496 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 21450149 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21451118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21451242 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 21452071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21452879 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 21453029 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21453610 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21454093 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 21454300 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 21454354 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 21454486 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 21454841 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 21454976 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21455126 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 21455151 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 21455705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21456106 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 21456161 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21456399 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 21456525 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 21457446 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21457487 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21458358 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21458574 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 21459141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21459743 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21459761 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 21459900 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21459911 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21459915 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21460112 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 21460539 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 21460656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21460769 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 19 21461152 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21461534 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21463689 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 21463925 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21464750 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 21464842 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 21465044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21465503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21465580 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 21465617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21465851 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21465974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21471262 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 21471274 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21471284 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21471392 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 21471575 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21471786 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21472208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21472319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21472479 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 21472488 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 21472560 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 19 21472606 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21472612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21472636 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21472671 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21472688 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21472706 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21473094 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 21473304 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21473592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21473642 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21473765 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21474087 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 21474119 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 21474211 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 21474245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21474417 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21474493 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 21474499 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 21474529 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 21474565 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 21474968 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 21475005 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21475011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21475038 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21475110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21475411 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21475520 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21475565 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21475618 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21475691 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21475731 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21475733 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21475761 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21475810 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21475816 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21475984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21476032 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21476091 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21476107 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21476178 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21476205 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21476212 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21476244 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 21476245 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 21476489 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21476561 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21476572 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 21476609 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21476687 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 21476691 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 21476839 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 21476866 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 21477013 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21477078 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 21477081 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 21477093 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 21477105 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21477131 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 21477234 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 19 21477240 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 21477314 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 21477402 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21477407 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21477429 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21477439 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21477520 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21477526 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21477527 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21477542 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 21477652 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21477694 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21477714 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21477729 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21477778 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21477788 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21477914 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21477929 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21477964 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21478018 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21478036 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21478054 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21478085 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21478247 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 21478264 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 21478324 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 21478374 A C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 21478440 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21478496 C A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 21478504 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 21478545 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 21478551 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 21478596 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 21478736 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21478740 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21478748 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 21478751 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 21478798 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21478799 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 21478817 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 21478828 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 21478954 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21478994 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 21479010 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21479229 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 19 21479313 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 21479433 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 21479661 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21479680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21479778 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21479946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21480007 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 21480094 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21480124 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21480248 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21480341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21480431 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21480653 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21480687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21480742 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21480805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21480847 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21480888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21480893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21480894 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21481022 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21481086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21481117 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21481128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21481151 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21481268 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 19 21481385 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21481436 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21481454 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21481464 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21481502 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21481865 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21481897 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21481901 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21481965 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21481979 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21482113 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21482275 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21482291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21482305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21482337 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21482359 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21482378 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21482424 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21482432 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21482486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21482500 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21482649 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21482663 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21482722 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21482849 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21482851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21482861 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21482890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21483016 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21483032 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21483039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21483107 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21483140 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21483143 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21483176 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21483178 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21483186 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21483250 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21483251 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21483298 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21483309 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21483314 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21483370 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21483386 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21483390 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21483430 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21483463 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21483485 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21483544 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21483850 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21483903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21483905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21483940 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21483959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21483974 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21484051 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 21484077 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 21484150 T G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 19 21484151 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 19 21484324 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 21484432 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 21484436 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 21484523 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21486224 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21486854 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 21487132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21489156 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21489201 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21489910 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21490058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21490214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21492065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21493110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21493223 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21494175 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21494194 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21494258 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21494288 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21494422 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21494424 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21494573 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21494839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21494841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21495043 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21495121 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 21495299 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21495302 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 21495593 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21495594 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21495597 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21495617 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21495620 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 21495977 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21496043 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 21496052 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21496126 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21496444 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 21496445 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21496525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21496632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21496781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21496803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21496807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21496829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21496960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21497321 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21497429 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21497463 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21497615 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21497857 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21497859 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21497863 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21497885 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21497887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21497956 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21498479 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 21500514 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21500544 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 21503041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21504240 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21505895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21506276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21506540 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21508055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21508865 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21509186 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21509328 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 21509352 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 21509535 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 21509895 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 21509976 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21510026 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 21510157 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21510170 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21510219 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21510320 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21510964 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21511006 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21511021 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21511114 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21511188 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 21511247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21511415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21511508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21511536 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21511604 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 21511624 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21511663 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21511829 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21511891 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 19 21511923 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21511944 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 21511945 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 21512128 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 19 21512129 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 21512367 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21512533 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21512558 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21512651 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21512951 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21512965 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21513091 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21513189 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21513398 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 21513466 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 21513498 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21513539 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21513592 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21513633 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 21513953 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21513966 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21513983 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21514220 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 21514272 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 21514318 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21514471 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21514500 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21514964 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 21515185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21515318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21515497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21515548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21515616 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 21515645 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21515657 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 21515720 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21515819 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21515861 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21515868 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21515918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21516034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21516038 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21516054 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21516450 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 21516451 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 21516845 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 21516994 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 21517366 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21517499 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 21517548 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21517723 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21517763 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21518449 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21518616 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21521255 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21522031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21522151 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21522267 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21522577 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 21522587 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21522688 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21522940 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21524459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21524566 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 21524576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21525148 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 21525196 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21525198 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21525336 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21525357 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21525421 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 21525568 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 21525629 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 21525646 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21525707 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21525779 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 21527254 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 21527273 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 21529695 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 21531534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21532053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21532112 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21533029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21534119 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21534161 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21534349 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21534740 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 21534810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21534847 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21535103 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21535112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21535329 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 21535352 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21535426 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 21536769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21537664 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21537860 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21538101 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21538107 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 19 21538211 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21538395 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 21538429 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 21538512 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21538701 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 21538713 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 21538735 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21538856 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 21538862 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21538864 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 21539027 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21539060 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21539155 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21539163 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21539173 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 21539316 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21539337 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21539442 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21539643 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 19 21539660 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21539723 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21539751 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21539769 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21539811 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21539818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21539823 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21539844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21539857 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 21539862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21539888 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21539891 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21540237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21540780 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21541249 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21543658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21545205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21545322 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21545378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21545576 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21546582 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21546790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21547931 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21548000 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21548206 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21548475 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 21548530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21549922 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 21549923 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 21551410 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21551823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21552143 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21552271 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21552535 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21552651 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 21552943 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21553196 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21553558 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 21553587 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21553845 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21553858 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 21553945 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21553947 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 21554073 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21554388 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 21554562 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21554608 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 21554621 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21554693 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21554714 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21554799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21554859 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 21555026 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21555044 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21555076 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 21555078 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 21555145 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21555182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21555198 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 21555368 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21555373 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21555396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21555614 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21555628 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21555705 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21555891 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21555964 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21555972 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21556426 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 19 21556466 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21556546 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21556593 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21556651 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 19 21556763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21556919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21556935 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21556937 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21557013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21557051 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21557058 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 21557061 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 21557117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21557125 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21557138 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21557141 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21557147 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 21557276 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21557305 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 21557326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21557454 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21557492 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 19 21557589 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 19 21557695 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21557732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21557754 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21557755 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 21557837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21557969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21558105 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21558181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21558221 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 21558225 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 21558247 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 21558429 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21558519 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21558573 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 21558611 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 21558614 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 21558651 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 21558692 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21558696 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21558842 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 21558909 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21559055 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21559258 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 21559326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21559360 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21559371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21559543 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21559616 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21559633 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21559644 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21559794 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 21559831 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21559839 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21560021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21560057 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 21560082 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21560092 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21560132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21560258 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21560304 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21560409 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 21560411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21560458 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21560510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21560518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21560531 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21560625 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 21560643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21560647 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21560656 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21560667 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 21560728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21560765 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 21561271 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 21561329 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 21561330 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 21561356 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 21561361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21561453 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 21561470 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 21561488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21561559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21561885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21561897 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 21561955 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21561996 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21562040 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 21562208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21562318 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 21562334 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 21562480 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 21562829 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21562906 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21563073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21563079 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 21563097 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 19 21563564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21563610 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21563716 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 21563864 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 21563920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21563921 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21564069 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21564411 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21564451 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 21564469 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 21564928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21565020 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 21565087 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 21565122 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 21565444 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 21565562 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 21565578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21565655 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 21565723 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21565894 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 21566191 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 21566205 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 21566206 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21566276 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 21566348 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21566452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21566606 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21566630 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 21566708 G T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 21566746 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21566952 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21567017 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 21567095 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 21567116 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 21567259 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21567616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21567773 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 21567780 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21570040 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 21570124 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21570883 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 21571147 G C Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 21571230 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21571248 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21571273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21571351 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21571352 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21571586 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 21571603 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21571693 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 21571906 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21572161 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 21572180 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 21572181 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 21572199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21572241 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 21572389 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21572465 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 21572537 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21572565 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 19 21572863 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21572881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21572928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21572933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21572999 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 21573025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21573116 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21573251 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 21573360 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21573418 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 19 21573419 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 19 21573471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21576477 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 21576645 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 21576690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21576836 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 21576869 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 21577043 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 21577101 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 21577106 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 21577117 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 21577148 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 21577182 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 21578787 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 21579007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21579054 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 21579117 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21580684 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 21581471 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 21581893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21581952 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21582223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21582328 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21582656 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 21582733 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 21583353 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 21583416 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 21583459 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 21583748 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 19 21583874 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 21583883 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 21583907 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 21583939 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 21583950 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 21584212 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 21584260 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 21584371 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21584617 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 21584851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21584862 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 21584966 T G Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 21584980 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 21584984 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 21585257 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 21585304 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 21585358 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 21585377 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21585425 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 21585853 G C Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 21585869 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 21585873 T G Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 21585957 A G Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 21586095 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 21586184 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 21586370 T C N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 19 21586690 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 21586713 A T N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 19 21586737 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 19 21587177 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 21587221 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 21587248 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 21587275 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 21587382 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 21587776 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21587812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21587941 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21587945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21588125 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 21588135 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 21588352 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 21588380 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 21588834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21588896 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21588964 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21589011 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21589036 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 21589120 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 21589198 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 21589542 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 21589555 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 21589575 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 21589665 T A Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 21589726 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 21589765 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 21589774 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 21589787 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 21590205 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 21590218 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 21590352 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 21590353 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 21591295 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 21591560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21591665 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 21591684 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 21591696 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 21591735 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 21592042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21592152 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 21592155 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 21592182 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 21593608 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 21593724 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 21593772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21593789 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21593873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21594088 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 21594289 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 21594489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21595044 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21595800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21596297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21597821 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 21598287 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 21600800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21601222 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21603029 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 21603138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21603618 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21604201 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 21610408 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 21611695 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21611778 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 21611793 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 21611794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21611893 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 21611900 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 21612025 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 21612050 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21612054 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 21612134 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 21612210 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 21612268 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 21612439 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21612468 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 21612483 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 21612686 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21612723 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 21612773 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 21612843 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 21612860 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 21612873 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 21612985 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 21613361 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21613379 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 21613466 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21613485 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21613489 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21613497 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 21613573 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21613581 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21613776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21614561 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 21614575 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21614582 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 21614593 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 21614594 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 21614599 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 21614603 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 21614636 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 21614641 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21614657 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 21614764 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 21614777 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 21614785 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 21614793 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 19 21614870 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21614993 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 21615006 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 21615263 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21615408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21615540 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 21615928 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 21616001 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 21616159 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 21616174 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21616184 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 21616190 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 21616277 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21616286 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 19 21616463 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21616498 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21616851 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21617171 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 19 21617478 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21617491 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 21617540 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 21617707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21617708 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21617858 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 21617901 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 21618063 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21618883 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 21618905 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 19 21618924 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 21619139 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 21619814 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 21619867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21620328 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21620801 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 21620802 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 21620870 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 21621036 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 21621136 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 21621193 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 21621214 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 21621273 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21621877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21621940 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 21622044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21622293 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 21622320 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 21622390 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 21622685 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 21622723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21623049 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21623170 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 21623311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21623435 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21623533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21623603 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 21623612 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 21623635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21623653 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 21623665 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 21623698 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 21623757 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21623789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21623814 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 21624020 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 21624049 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21624051 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21624196 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21624232 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 21624240 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 21624275 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 21624327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21624335 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 21624825 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 21624899 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21624962 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 21624964 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 21625225 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21625259 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21625374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21625421 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21625650 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21625982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21626549 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 21626580 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 21626630 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 21626645 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 21626657 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 21626834 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 21626900 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 21626984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21626998 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 21627183 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21627587 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 21627768 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 21628094 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 21628100 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 21628115 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 21628153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21628198 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 21628213 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 21628252 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 21628327 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 21628331 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 21628347 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 21628359 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 21628375 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 21628394 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 21628523 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 21628577 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 21628703 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 21628738 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21628869 T G N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 19 21628888 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 21630637 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 21631575 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21631824 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21631838 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 21631951 T A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 19 21632051 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21632481 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 21632711 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 21632759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21632925 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 21632934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21632973 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21632977 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21632980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21633120 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21633145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21633199 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 21633408 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21633434 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21633771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21633897 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 21633958 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21633967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21633968 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 21634069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21634070 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21634168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21634612 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 21634869 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21635903 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21635968 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21636037 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 21636403 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 19 21636615 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 21636728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21636958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21637031 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21637170 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21637220 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 19 21637225 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 21637239 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 19 21637422 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21637456 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 21637485 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21637499 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 21637646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21637727 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21637758 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 21637891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21638218 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21638278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21640259 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21640878 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 21642442 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21643290 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 0.117647058823529 0.352941176470588 20 14 9 2 6 19 21643361 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 21643807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21643879 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 21644216 C G N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 19 21644341 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 21644647 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21645040 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 21645543 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 21645626 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21646199 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21646433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21646448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21646480 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 21647121 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 21647368 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21647423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21647587 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21648064 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21648142 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 21648277 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 21648638 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21649458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21650462 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21650772 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21650790 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 21651045 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 21651712 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 21651925 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 21651927 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 21651974 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 21651987 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21652174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21652218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21652292 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 21652380 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 21652393 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 21652453 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 21652495 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21652790 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21652807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21652811 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 21653123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21653214 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21653260 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 21653282 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21653462 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21653586 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21653618 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21653641 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 21653685 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 21653778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21653804 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 21653840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21653955 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 21654029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21654031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21654051 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21654130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21654185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21654396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21654668 A C Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 21655048 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21655237 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 21655271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21655457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21655463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21655547 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 21655667 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21655669 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 21655675 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 21655678 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 21655787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21656035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21656066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21656277 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21656381 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 21656956 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21656977 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21657042 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21657058 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21657166 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21657206 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21657238 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21657257 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21657322 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21657363 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21657422 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21657438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21657448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21657494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21657530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21657650 G T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 19 21657656 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 21657860 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 21657930 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21657992 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21658038 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 21658093 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21658554 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21658899 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21659086 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 21659099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21659108 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 19 21659130 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 21659176 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 21659259 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 21659290 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 21659308 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 21659498 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21659582 T C N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.307692307692308 0.153846153846154 0.538461538461538 10 16 4 2 7 19 21659749 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 21659827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21659958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21659966 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 21660133 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21660147 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21660242 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21660261 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 21660389 T C Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 21661552 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21661565 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21661707 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21661922 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21662960 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21663018 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21663058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21663676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21663866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21664199 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21664228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21664279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21664338 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 21664356 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 21664392 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 21664396 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 21664415 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21664456 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 21664547 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21665809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21666479 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21668242 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21668716 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21670036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21670250 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21670526 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21670546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21670598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21670686 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21671164 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 21671518 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 21672384 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21672764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21672850 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21672851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21673537 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21674736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21675426 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21675742 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 21675952 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21676444 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21676572 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21676578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21676624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21677426 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 21678416 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 21678467 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 21678648 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 21679057 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 21679170 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 21679200 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 21679300 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 21679482 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 21681138 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 21681369 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21681383 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21682205 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 19 21682476 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 21682792 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 21682891 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 21683760 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 21684008 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 21684282 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 21684376 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 21684382 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 21684940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21685019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21686125 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 21686276 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21686705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21686856 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21687361 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21688248 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21688441 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21688529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21688943 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21689332 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 21689416 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 21689426 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21689533 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21689578 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21689888 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 21690011 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21690437 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21691070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21691632 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21694862 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21694931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21696584 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21696644 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 21698682 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21698711 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21699261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21699963 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21699982 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21700042 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21700068 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21700413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21701292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21701479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21702018 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 21702870 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21703566 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21703797 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 21703880 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 21704675 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 21704682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21704821 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21704837 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21705793 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 21706113 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 21706119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21708015 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 21712750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21716125 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21717731 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 21717996 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21719036 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21719335 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 21719337 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21719425 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 21719829 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21721223 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21721516 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21721989 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21721993 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21722130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21722472 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21722629 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 21723414 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 21723538 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 21723744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21723798 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21723950 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21723953 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21724151 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21724289 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 21726180 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21726620 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21727239 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 21729092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21729101 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21729677 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21729716 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21729746 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21729817 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21729985 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21730200 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21730637 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 21731148 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21731233 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21731269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21731867 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 21731887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21733155 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21733823 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 21733873 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 21734600 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21734636 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 21734799 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 21735101 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21735648 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21735669 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21736041 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 21736239 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 21736243 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 21736339 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21736343 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21736389 C A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 19 21736570 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 21736604 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 21736701 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 21736708 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 21736738 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 21736740 T A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 21736844 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 21737185 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 21737296 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 21737840 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 21737868 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21738202 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 21738265 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21738583 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21738845 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21739000 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 21739439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21739492 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 21739814 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 21739866 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21740017 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 21740054 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 21740415 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 21740416 G C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 21741208 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 21741580 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 21741606 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 21742541 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 21743966 A C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 19 21744383 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 21744502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21745813 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 21746110 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 21746140 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21746141 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 21746152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21746434 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 21746581 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 21746604 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 21746638 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 21746809 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21747015 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 21747752 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 21748583 A G N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 19 21748621 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21748637 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21748643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21748700 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21748804 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 21749029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21749352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21749840 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 21749936 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 21750022 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21750077 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 21750159 G T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 19 21750336 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21750664 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 21751309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21751593 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 21752403 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21752580 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 21752619 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21752794 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 21753001 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 21753561 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21753737 T A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 21753872 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 21754016 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21754156 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 21754324 T A N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 19 21754439 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 21754499 T A N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 21754539 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 21754622 T A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 21754697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21754953 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 21754996 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 21755049 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21755072 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 21755209 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21756289 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21756919 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21760487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21760536 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21760937 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21761741 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 21762155 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 21762241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21763030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21764280 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 21764294 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 21764696 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21764755 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21765303 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21766677 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21768015 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21769291 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21769563 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21769765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21770603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21778661 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 21778818 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 21778945 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21779304 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21779809 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 21780542 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21780613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21780622 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21780651 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21780661 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21780725 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21780757 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21780880 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21780975 C T Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 19 21781019 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 21781021 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 21781030 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 21781042 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 21781070 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21781097 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21781113 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21781734 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21781748 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21781773 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21781934 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21781956 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21782027 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21782039 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21782048 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21782196 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21782238 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21782244 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21782247 A C Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 21782282 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21782284 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21782342 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21782378 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21782423 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21782546 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21782598 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21782625 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21782781 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21782787 A T Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 21782791 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21782819 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21782835 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21782907 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21782970 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21783185 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21783212 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21783343 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21783364 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21783458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21783687 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21783749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21783808 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21783948 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21784033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21784180 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21784297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21784355 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21784406 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21784586 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21784813 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21785410 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 21785825 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 21785842 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21785857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21785866 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21785879 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21786043 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21786124 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 21786129 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 21786179 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 21786189 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 21786282 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 21786304 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 21786363 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 21786370 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 21786436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21786849 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21786939 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21787013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21787177 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 21787208 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 21787386 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21787392 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21787763 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21787775 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 21787963 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 21788059 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21788068 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21788074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21788077 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21788101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21788134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21788396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21788478 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 21788807 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 21788933 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 21789001 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21789049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21789128 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 21789137 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 21789242 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 21789254 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 21789280 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21789515 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 21789738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21789796 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 21789806 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 21790206 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21790218 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21790369 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21790375 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21790418 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 21790440 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 21790463 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 21790603 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 21790775 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 21790974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21791118 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 21791175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21791401 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21792049 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21792095 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 21792115 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 21792118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21792179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21792316 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 21792351 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 21792435 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 19 21792498 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 21792560 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 19 21792568 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21792574 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21792579 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21792585 C A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 21792630 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21792636 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 21792733 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21792797 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21792858 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21793017 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21793021 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21793038 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 21793052 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 21793097 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21793098 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21793405 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21793664 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21793688 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21793706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21793714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21793820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21793843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21793888 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 21793982 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21794023 G C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 21794170 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21794192 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 21794354 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 21794575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21794702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21794762 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 21794925 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21795065 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21795135 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21795171 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 19 21795195 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 21795277 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21795381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21795473 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21795484 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21795540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21795547 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 21795573 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21795592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21795595 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 21795648 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 21795812 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 21795825 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 21795829 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 21796013 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 21796113 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21796145 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21796156 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 21796637 C G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 21796803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21797082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21798095 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 21798489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21798957 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21799082 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 21799089 G T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 21799254 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21799981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21801323 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21801705 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 21801706 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 21801719 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 21801881 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21802214 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21802368 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21804242 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21804296 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21805255 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21805293 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21806123 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21806858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21807506 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21808102 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21808187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21808760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21808799 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 21808816 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 21808851 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 21809062 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21809114 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 21809171 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 21809175 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 21809292 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 21809344 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 21809346 G T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 21809396 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21809455 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21809464 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21809468 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 21809557 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21809558 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21809602 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 21809623 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 21809632 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 21809638 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 21809687 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 21809690 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 21809700 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 21809795 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 21809805 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 21809868 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 21809895 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 21810015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21810030 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 21810101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21810178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21810202 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21810245 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21810581 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 21810612 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21810617 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21810633 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21810664 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 21810674 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21810702 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 21810726 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21810863 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21810872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21810967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21810972 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 21811112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21811129 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21811218 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 21811329 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21811353 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21811363 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 21811461 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21811570 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21811814 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 21811828 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 21811831 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 21811886 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21812018 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 21812150 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21812533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21812780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21812903 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21812946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21813048 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21813077 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21813083 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21813186 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21813220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21813227 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 21813238 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 21813267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21813339 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21813351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21813489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21813549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21813872 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21813880 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21813922 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21813934 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21813972 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21814038 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21814043 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21814134 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 21814136 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21814149 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21814327 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 21814339 C T N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.75 0.0833333333333333 0.166666666666667 19 5 9 1 2 19 21814822 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21815179 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21815685 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21815742 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 21815793 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21815822 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21816156 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21816197 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21816271 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21816351 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21816357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21816404 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 21816413 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 21816432 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 21816488 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21816524 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 21816584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21816604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21816828 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 21816963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21817092 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 21817336 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 19 21817480 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 21817501 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 21817683 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 21817876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21817923 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 21817924 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 21817971 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21818173 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21818499 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21818500 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21818595 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21818601 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21818635 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21818993 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21819015 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21819279 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 21819294 T C N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 19 21819405 A C N N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 19 21819696 T C N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 19 21819697 G A N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 19 21819783 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 19 21819848 T A N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 19 21819994 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 21820053 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 21820054 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 21820145 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 21820325 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 21820331 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21820336 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 21820373 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 21820408 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 21820482 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 21820508 G T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 21820662 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21820767 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 21820786 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21820850 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21820996 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 21821065 C T Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 21821383 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 21821457 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 21821486 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21821742 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21821826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21821829 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 21822059 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21822315 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 21822469 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21822534 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21822751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21823132 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21823258 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21824186 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21824449 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 21824489 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21824846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21825017 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21825023 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21825394 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21825694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21825744 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 21825766 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21825767 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21826044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21826369 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21826481 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21826487 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 21827959 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 21828008 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21829090 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 21829223 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 21829801 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21830832 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21831543 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 21831726 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 21831959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21832215 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 21832415 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21832472 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 21832526 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 19 21834522 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 21835706 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21835788 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 21836018 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21836137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21836189 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 21836197 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 21836503 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21836509 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21836586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21836767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21837017 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21837434 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21837478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21838269 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 21838724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21838955 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 21839024 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21840335 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 21840987 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 21841998 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 21842022 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 21842035 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 21842196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21842209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21842210 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 21843360 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 21843369 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 21843535 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 21843547 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 21843642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21843771 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 21843830 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21843887 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21843907 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21844040 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21844154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21844226 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 21844271 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 21844280 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 21844465 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 21844566 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 21845347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21845350 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 21845478 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 21845504 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 21845562 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 21845563 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 19 21845570 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 21845576 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 21845583 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 19 21845634 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 21845684 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 21845691 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 21845891 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 21846116 A C N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 19 21846171 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21846173 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 21846193 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 21846229 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 21846326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21846339 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 21846589 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21846869 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21846991 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 21847154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21847601 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21848543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21848596 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21848836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21849350 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21849475 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 21849477 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 21849846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21849864 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 21849927 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21849941 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21850468 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 21850470 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21850471 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21851860 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 21852281 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 21852636 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21852696 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 21852742 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 21853217 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21854324 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21854349 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 21854492 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 21854576 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 21854642 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21855154 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 21855227 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21855246 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 21856085 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21856117 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21856191 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 21856282 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21856314 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21857456 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21857609 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21858166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21858537 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21858747 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21858902 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 21859459 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21859501 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 21859539 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21859628 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 21859647 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 21859688 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 21859701 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 21859727 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 19 21859784 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 21859851 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21859932 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21859946 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 21859972 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21859975 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21860031 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21860035 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21860047 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21860048 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 21860069 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21860087 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21860095 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21860108 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 21860164 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 21860210 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21860281 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 21860333 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 21860370 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21860463 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21860505 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21860516 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21860714 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 21860932 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 21861012 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21861085 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 21861155 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21861307 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 21861359 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 21861368 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 21861374 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 21861375 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 21861379 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 21861395 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 21861467 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 21861480 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21861639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21861730 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21861742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21861745 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 21861855 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 21861913 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 21862139 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21862154 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21862575 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21862616 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21862655 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21862663 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21862666 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21862707 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21862836 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 21863207 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 19 21863569 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 21863739 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 21863765 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 21863816 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 21863817 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 21863927 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 21863969 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 21864004 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 21864030 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21864257 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 21864384 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 21864400 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21864493 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21864774 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 21864898 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 21865004 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21865147 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21865241 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21865282 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 21865317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21866687 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21866702 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 21866923 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 21866937 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21866938 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21867007 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21867331 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 21867838 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21868853 T A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 21869769 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21869835 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 21869875 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 21870114 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 21870345 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 21870354 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 21870542 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21870692 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 21870883 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21870912 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21870944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21871019 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 21871080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21871106 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 21871135 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 21871801 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 21872012 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 21872076 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 21872090 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 21872184 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 21872739 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 21872939 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21873090 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 21873223 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 21873331 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 21873422 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 21873650 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 21873697 A C Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 21873763 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 21873790 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 21873791 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 21873850 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21873853 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21873984 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 21874155 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21874188 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 21874265 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 21874438 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 21874451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21874575 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 21874980 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21875424 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21875461 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 21875462 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 21875588 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 21876045 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21876078 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 21876081 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21876092 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 21876111 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 21876178 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21876185 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21876189 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21876193 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21876210 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21876215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21876439 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 21876577 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21876664 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21876689 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 21876709 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 21876758 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 21876762 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 21877086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21877122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21877125 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21877136 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21877274 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 21877295 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 21877421 C A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 0.117647058823529 0.352941176470588 20 14 9 2 6 19 21877431 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 21877457 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.5 0.111111111111111 0.388888888888889 20 16 9 2 7 19 21877490 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 21877545 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 19 21877555 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 21877601 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 19 21877658 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 21877805 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 21878074 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 21878081 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21878160 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 21878176 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 21878190 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 21878296 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 21878343 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21878349 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21878379 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21878629 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21878679 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 21878724 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 21878991 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21879072 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 21879228 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21879247 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 21879262 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21879427 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 21879758 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 21879955 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21880214 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21880457 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 21880504 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 21880505 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 21880549 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 21880888 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21881052 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21881155 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21881165 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 21881497 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 21881531 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 21881622 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 21882133 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21882275 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21882307 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 21882323 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 21882686 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 21882910 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 21883051 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21883305 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 21883314 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 21883390 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 21883482 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 21883500 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 21883513 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 21883529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21883587 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 21883588 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 21883604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21883814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21884045 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 21884314 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 21884344 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 21884551 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21884681 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21885018 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 21885060 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 21885236 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 21885575 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 21886067 C G Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 21886203 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 21886364 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 21886391 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 21886486 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 21886788 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 21886847 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 21886901 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 21886929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21886988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21887149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21887277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21887318 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 21887344 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 21887350 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 21887440 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21887795 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 21887854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21888027 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 21888038 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21888173 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21888339 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21888347 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 21888423 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21888524 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 21888679 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 21888777 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 21888852 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21888864 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 21889280 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 21889508 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21889632 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21889689 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21889780 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 21889944 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 21891170 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 21891837 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21892377 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 21892519 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 21892560 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21892561 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 21892567 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21892652 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 21893065 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21893080 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 21893086 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 21893199 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 21893448 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21893765 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 21894389 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 21895394 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 21895413 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 21895744 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 21895830 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 19 21895834 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 19 21895849 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21895863 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 21895903 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 21896133 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 21896167 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 21896176 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 21896199 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 21896310 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 21896315 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 21896331 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 21896600 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 21896869 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21897278 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 21897284 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 21897359 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21897391 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21897425 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 21897616 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 21897709 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21897744 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 21897974 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 21898028 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 21898139 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 21898254 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 21898323 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21898332 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 21898365 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 21898378 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 21898436 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 21898561 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21898830 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 21898894 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 21899076 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 21899132 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 21899146 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 21899154 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 21899226 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 21899613 C G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 21899665 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 21899978 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 21900123 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 21900272 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 21900311 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21900327 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 21900357 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 21901320 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21901328 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21901348 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 21901502 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21901794 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21901842 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 21902597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21902657 G C Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 21903435 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 21903751 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 21903914 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 19 21904365 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21904481 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21904494 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21905097 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 21906717 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 21907211 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21908167 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21908599 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 21908916 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 21909329 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 21909753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21909875 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 21910033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21911387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21912652 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21914322 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21914323 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 21914827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21914986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21915414 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21917692 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21918785 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21919659 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 21919673 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 21919981 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21921095 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 21921111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21921238 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21921471 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 21921496 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 21921572 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 21921573 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 21921812 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 21922017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21922121 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 21922125 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 21922132 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21922406 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 21922504 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21922640 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21922812 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21922920 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21923026 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 21923220 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 21923223 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21923229 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21923250 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21923264 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21923305 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21923327 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21923355 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21923363 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21923483 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 21923490 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 21923548 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21923564 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 21923568 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 21923613 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21923632 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21923635 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21923638 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 21923722 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21923772 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21923800 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21923902 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 21923988 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21924043 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21924146 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21924178 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21924191 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 21924291 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21924325 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21924341 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 21924428 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 21924431 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 21924451 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21924469 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 21924627 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21924658 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21924798 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 21925139 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 21926022 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21926060 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 21926181 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 21926333 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21926899 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 21926972 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21926973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21927094 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21927137 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 21927140 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21927209 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21927253 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21927283 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21927311 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21927319 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21927333 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21927420 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21927558 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21927581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21927596 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21927685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21927719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21928079 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21928152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21928229 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 21928501 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0 0.894736842105263 0.105263157894737 17 21 0 17 2 19 21928599 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21928636 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21928648 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 21928800 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 21928881 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 21929536 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 21929890 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 21929913 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21930029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21930075 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21930309 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21930400 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 21930685 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 21931309 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21931843 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21932257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21932264 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 21932324 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 21932340 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21932721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21932974 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21933062 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 19 21933170 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21933200 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21933393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21933744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21934295 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 21934426 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 21934982 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21935859 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 21936181 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21936188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21937304 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21937784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21937968 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 21938375 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21938382 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21938587 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 21938613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21938918 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 21938938 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 21939043 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 21939369 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 21939754 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21940033 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21940314 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21940334 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21940388 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21940504 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 21940987 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 21941176 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21941487 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 21941767 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 21943351 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21943515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21944015 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 21945734 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21945844 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 21945901 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21945960 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 21946607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21946651 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 21946842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21947561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21947713 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 21947736 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21947779 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 21947816 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21947949 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21947957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21948123 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21948240 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 21948241 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 21948292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21949751 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21950624 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21950669 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21950994 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 21950995 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 21951259 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21951283 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21951299 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21951304 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21951438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21951452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21952275 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 21952820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21952882 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21952909 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21953178 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 21953247 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 21953321 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21953324 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21953366 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 21953385 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 21953403 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21953410 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 19 21953411 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 21953419 C T Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 21953432 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21953438 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 21953448 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 21953491 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21953520 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21953557 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 21953578 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 21953618 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21953648 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 21953674 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21953709 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21953737 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21953758 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21953801 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 21953867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21953886 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 21953914 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 21953915 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 21953935 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21953945 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 21954009 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21954086 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21954116 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 21954162 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 21954189 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 21954214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21954223 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21954235 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21954334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21954340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21954408 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 21954418 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 21954443 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 21954452 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 21954596 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 21954672 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21954684 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 21954697 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 21954757 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 21954766 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 21954787 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 21954794 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 21954811 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 21954860 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 21955025 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 21955035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21955092 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 21955995 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 21956380 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21956420 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21956542 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21956942 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21956962 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21957414 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21957570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21957699 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21957876 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21958021 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 21958057 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21958087 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21958706 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21958821 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21958847 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21958939 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21959014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21960051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21960063 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21960079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21960083 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 21960263 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21960272 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 21960492 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21960638 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 21960690 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21960703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21960705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21960709 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21960732 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21960736 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21961499 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21961820 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21961825 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21961828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21961856 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21961875 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21962589 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21962636 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 21962650 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21963143 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 21963397 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21963547 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 21963668 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 21964104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21964117 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 21964230 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21964377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21965057 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 21965225 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21966020 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21966479 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21966632 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 21968806 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21968814 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 21970851 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21974622 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21975674 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 21980582 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21980922 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 21984087 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21984129 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 21984365 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 21985084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21985261 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21986616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21987553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21987813 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21988926 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21988996 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21989278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21991015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21992029 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21992311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21993142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21993408 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 21993600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21994029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21994309 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 21994500 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 22009543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22009619 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 22009772 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 22009783 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 22009787 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 22009949 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 22009984 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 22010024 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 22010030 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 22010038 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 22010090 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 22010096 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 22010162 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 22010180 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 22010339 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 22010424 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22010484 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22010504 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 22010644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22010748 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 22010776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22011164 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 22011301 G A N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 19 22011357 A C N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 19 22011459 A C N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.25 0.166666666666667 0.583333333333333 8 16 3 2 7 19 22013138 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 19 22013282 G A N Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 11 9 4 3 3 19 22013294 G T N N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 19 22013338 T G N N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 19 22013350 C A N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 19 22013433 T C N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 19 22013459 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 22013471 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 19 22013501 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 19 22013524 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 22013572 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 22014172 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22014359 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22014553 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22014590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22014597 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22014598 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22014677 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 22014688 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22014711 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 22014746 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22014752 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22014760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22014818 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 22014829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22015105 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 22015128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22016089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22016158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22016237 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 22016238 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 22016286 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 22016568 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22017029 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 22017073 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22017095 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 22017239 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22017444 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 22017572 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 22017767 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 22017810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22017815 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 22017877 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 22017879 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 22017889 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22017950 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 22017960 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 22017970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22018229 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 22018441 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22018809 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22018842 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22018921 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 22019524 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 22019587 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22019919 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 22020020 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22020129 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 22020522 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 22021061 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 22021110 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 22021154 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 22021578 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 22021758 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22022641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22023079 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 22024870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22024944 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 22024975 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22025618 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 22025871 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 22028603 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22028605 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22029591 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22029660 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22031678 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22033199 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22033777 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22034470 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22034603 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 22034614 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 22035461 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22036050 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 22036268 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22036384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22036911 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22037687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22037711 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22039115 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22041763 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22042948 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22044996 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22045980 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22046601 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22048045 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22048500 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22049254 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 22050554 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 22058216 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22058598 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 22058828 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22059917 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22060036 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22060091 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 22060231 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 22061626 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 22061707 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 22061970 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 22062056 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22062539 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22062674 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 22062706 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22062955 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22063585 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 22063989 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22064040 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22064646 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22065265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22065384 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22066660 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 22067613 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 22068036 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22071747 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22073524 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 22073525 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 22073815 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22073945 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 22073946 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22074015 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22074077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22074163 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 22074167 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 22074643 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22074722 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 22074806 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 22074835 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 22075167 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 22075244 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 22075273 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 22075336 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 22075337 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 22075395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22075423 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 22075501 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 22075534 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 22075620 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 22075934 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 22076017 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 22076088 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 22076151 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 22076226 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 22076417 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 22076437 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 22076445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22076489 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 22076504 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22076510 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 22076539 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 22076583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22076696 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 22076721 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 22076742 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 22076808 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 22077156 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 22077408 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22077507 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 22077578 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22077678 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 22077684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22077837 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 22077884 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22077924 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22077927 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22077940 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22078212 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22078238 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22078529 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22078535 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 22078548 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 22078596 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 22078642 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22078722 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 22078840 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22078901 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22079478 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 22079528 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22080492 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22080535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22081343 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22081351 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 22082837 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 22083419 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22083598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22083802 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22083806 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 22084303 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22084445 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 22084531 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 22084537 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22084767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22085835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22086314 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22087387 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22089742 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 22089828 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22089874 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22090333 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22090897 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22090916 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22091999 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22092653 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 19 22093522 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22095290 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22096193 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22096423 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22098127 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22098495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22099278 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22102736 C A N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 19 22103257 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22108322 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 22108858 G T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 22109904 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22112380 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22113946 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22113969 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 22114101 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22114815 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 22115475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22115623 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22115719 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22117244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22118392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22118817 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22119371 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 22121835 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22123302 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22123466 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22123738 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 22123747 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 22123983 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 22124123 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22124130 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22124162 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 22124185 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 22124189 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 22124317 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22124527 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22124711 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22125278 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 22125290 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 22125707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22125767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22126204 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22126218 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22126554 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22126613 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 22126678 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 22126946 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22127282 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22127398 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22127517 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 22127521 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 22127601 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 22127739 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22127848 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22127933 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22128542 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 19 22129383 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22129428 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 22129460 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 22129462 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 22129563 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 22129644 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 22129684 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 22130010 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22130096 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 22130345 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22130506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22130663 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 22130665 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 22130667 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 22130795 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22130796 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22130817 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22130867 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22130934 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22130935 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22130972 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22130977 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22130978 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22130983 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22131041 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 22131108 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22131115 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22131233 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 22131455 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 22131610 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 22132007 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22132101 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22132620 G A N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 19 22132843 G C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 22133460 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 22133511 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22133632 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 22133669 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22133702 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 22134091 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 22134270 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22134276 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22134344 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22134488 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 22134603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22134651 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 22134664 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22134679 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 22135834 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22135941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22136029 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22136048 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22136387 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22136747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22137124 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 22137204 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 22137221 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 22137250 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 22137334 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 22137368 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 22137442 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 22137457 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 22137546 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 22137551 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 22137586 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 22137602 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 22137658 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 22137659 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 22137673 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 22137699 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 22138064 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 22138419 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 22138474 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 22138523 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 22138601 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 22138683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22138786 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 22138792 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 22138863 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 22139504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22139535 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 22139657 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 22139666 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 22139721 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22139946 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22139980 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 22140004 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22140014 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22140027 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22140076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22140141 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 22140255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22140290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22140306 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22140415 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22140648 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22140669 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 22140714 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 22140728 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 22140770 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 22140898 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22140929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22141007 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 22141122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22141148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22141189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22141223 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 22141247 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 22141271 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22141323 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 22141817 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 22142270 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22142293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22142325 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22142341 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22142449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22142457 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 22142462 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 22142463 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 22142719 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 22142771 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 22142790 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 22142836 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 22142839 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 22142946 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22143197 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 22143202 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22143213 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 22143475 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22143476 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22143987 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22144046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22144154 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22144216 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22144265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22144462 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22145486 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22145609 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22145876 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22145925 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 22145972 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 22146007 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 22146019 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 22146028 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 22146100 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 22146548 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 22146549 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 22146621 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22147038 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 22147069 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 22147843 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 22148886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22149788 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 22149809 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22150029 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22150152 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 22150315 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 22151644 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 22152460 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 22152698 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 22154761 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22154807 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22154878 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22154888 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22155127 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22155187 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22155195 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22155211 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22155260 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22155418 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22155478 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22155523 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22155640 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22155662 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22155804 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22155830 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22155840 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22156326 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22156351 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22156373 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22156517 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22156522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22156760 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22156776 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22156809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22157359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22157382 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22157646 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 22157840 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 22157919 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22157968 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22157970 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22157988 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22158220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22158403 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22158437 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22158694 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 22158727 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22158806 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 22158829 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 22159001 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 22159025 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 22159085 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 22159195 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 22159435 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22161306 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22161315 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22161326 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22161841 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22162247 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22162301 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 22162409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22163041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22163110 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22163111 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22163248 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 22164112 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22164621 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 22165419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22166627 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22168062 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22170170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22170542 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22170999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22171678 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22174231 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 22174259 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 22176201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22176468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22176562 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22176632 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22176751 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22177632 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22177987 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22178041 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22178214 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 22178582 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22178643 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22178683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22178768 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22179271 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22179302 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22179603 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22179943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22179962 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22179976 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22180074 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22180631 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22182138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22182233 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 22182991 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 22183266 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 22183451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22183538 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22183734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22183753 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 22184097 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22184140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22184167 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 22184440 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 22184463 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 22184472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22184547 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 22184744 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22184820 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22184830 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 22184840 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 22184951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22185006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22185008 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22185067 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22185075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22185185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22185200 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22185201 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22185205 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 22185214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22185293 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 22185411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22185441 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22185496 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22185525 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22185603 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22185616 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22185623 A G Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 22185846 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 22185866 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 22185973 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22185980 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22185991 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22186079 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 22186162 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22186245 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 22186448 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22186524 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 22186565 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22186599 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 22186746 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22186780 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 22186920 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22187427 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 22187573 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 22188033 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22188177 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 22188380 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 22188921 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 22188939 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 22188973 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 22188984 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 22188995 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 22189123 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 22189248 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 22189350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22189543 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22189720 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 22189791 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 22189975 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22190070 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 22190922 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 22191248 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 22192231 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 22192376 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 22192697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22192874 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 22193593 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 22193834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22194000 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 22194338 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 22194347 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 22194463 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 22194605 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 22195087 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 22195201 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 22195239 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 22195275 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 22195285 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 22195288 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 22195335 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 22195506 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22196245 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22196370 A T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 22196794 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22196911 A T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 22197099 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22197349 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 22197555 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22197694 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 22197700 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22197764 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 22197798 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 22197824 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22198040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22198054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22198099 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 22198102 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 22198203 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22198471 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 22198740 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 22198755 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22198773 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22198869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22198883 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 22199004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22199309 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 22199334 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22199675 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22199738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22199757 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22199838 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22199849 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22199873 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 22199898 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 22199938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22199986 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22200021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22200050 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 22200126 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22200130 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22200142 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 22200354 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 22200463 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 22200840 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 22203406 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22205226 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22205356 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 22205584 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 22205807 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22206104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22206476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22207098 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 22207308 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22207820 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22208218 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22208244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22208859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22208951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22209767 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 22210907 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22211493 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22211494 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22211564 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22211608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22211766 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 22212132 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 22212156 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22212157 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22212444 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22212593 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22213135 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 22213252 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 22214174 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22214431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22214560 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22214607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22216573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22217038 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22217547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22217550 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22217703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22217726 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22217779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22217809 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22218021 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22219176 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22219259 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 22220411 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22220558 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.214285714285714 0.142857142857143 0.642857142857143 8 20 3 2 9 19 22220942 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 19 22221540 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 22221607 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 22221613 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 22221826 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 22221917 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 19 22222293 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 22222351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22222832 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22224009 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 19 22224099 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22224106 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22224264 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22224727 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22224763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22224766 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22224879 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 22224899 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 22225196 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 22225252 T A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 19 22225617 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.25 0.05 0.7 11 29 5 1 14 19 22225621 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.25 0.05 0.7 11 29 5 1 14 19 22225763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22225773 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 22225895 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 22226088 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 22226252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22226313 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 22227038 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22227120 C T N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.333333333333333 0.25 0.416666666666667 11 13 4 3 5 19 22227136 G A N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 19 22227324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22227338 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22227363 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22227487 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22227570 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22227678 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 22227720 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22227769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22227955 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 22228004 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 19 22228156 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 19 22228736 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 22228930 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 22228940 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 22229345 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22229438 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22229629 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22229634 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 22229641 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 22229658 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 22230125 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 22230200 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 22230227 C T Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 22230274 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 22230749 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 22230813 G T N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 22230819 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 22230880 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 22230895 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 22230945 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22230979 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22231222 T G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 19 22231369 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 22231370 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 22231399 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 22231489 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 22231938 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 22232313 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22232575 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22232616 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22232652 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22232706 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 19 22232731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22232864 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 22233968 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 22234188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22235380 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22235756 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 22240003 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22240637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22241309 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22241809 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22242103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22242646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22242675 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22242680 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22242758 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 22242762 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22242767 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22242771 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22243036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22243385 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 22243531 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22243934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22244812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22245349 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 22245402 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 22245576 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 19 22245611 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 22245618 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 22245643 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 22245670 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 22245715 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 22245724 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 22245735 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 22245831 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 22245859 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 22245927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22246055 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22246078 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 22246102 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 22246384 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22246458 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22246510 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.25 0.0625 0.6875 9 23 4 1 11 19 22246511 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22246733 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 19 22246852 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22247031 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22247038 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22247046 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 22247071 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 22247239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22247260 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22247391 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 19 22247406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22247418 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22247419 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22247564 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 22247575 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 22247627 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22247630 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22247661 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 22247738 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22247760 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22247765 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 22247767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22247792 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22247835 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22247883 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 22247927 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 22247928 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 22247977 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22247981 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22248102 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22248114 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22248128 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22248147 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22248185 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 19 22248195 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 22248219 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22248257 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22248275 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22248310 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22248353 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22248363 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22248446 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22248451 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22248475 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22248480 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22248505 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 22248516 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22248574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22248612 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22248636 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22248645 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22248689 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22248722 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22248739 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 22248741 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 22248756 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22248846 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22248897 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 19 22248955 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 22248966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22249080 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 22249081 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 22249100 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 22249102 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 19 22249128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22249129 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 22249293 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22249334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22249339 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 22249356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22249386 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 22249400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22249547 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 19 22249691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22249767 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 19 22250159 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22250167 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 22250217 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 19 22250259 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 19 22250382 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 22253235 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 19 22253471 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22253510 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22253535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22253704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22253961 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 22254008 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 22254315 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 22254444 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22254663 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.222222222222222 0.0555555555555556 0.722222222222222 9 27 4 1 13 19 22255008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22255247 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 22255250 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 22255338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22255345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22255397 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 22255447 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 19 22255495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22255498 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 22255589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22255619 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 22255624 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22255668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22255755 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 22255773 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 22255781 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 22255795 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 22255807 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 22255998 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 22256077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22256101 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 22256791 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22257022 G T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 19 22257160 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 19 22257270 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22257357 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 22257667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22258186 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22258234 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22258260 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22258354 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22258478 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22258495 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22258593 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22258726 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 22258876 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22259076 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22259077 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22259095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22259098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22259137 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22259140 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22259173 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22259227 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22259237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22259238 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22259251 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22259257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22259287 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22259331 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22259339 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22259353 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22259413 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22259449 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22259488 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22259489 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22259513 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22259527 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22259621 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22259646 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22259679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22259729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22259747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22259768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22259778 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22259803 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22259825 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22260010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22260025 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22260051 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22260052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22260103 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22260128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22260235 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22260241 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22260268 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 22260383 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22260441 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22260471 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22260516 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22260582 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22260591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22260620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22261107 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22261427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22261435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22261777 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22261866 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22262427 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22262481 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22262818 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22262839 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22262919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22262975 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22263054 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22263112 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22263168 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22263287 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22263305 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22263359 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22263385 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22263489 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22263805 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22263963 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22264049 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22264198 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22264722 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22264741 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22264792 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22264961 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22264964 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22265084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22265086 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22265095 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22265099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22265525 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22265700 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22265933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22265945 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22265980 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22266074 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22266467 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22266748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22267811 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22267890 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22267897 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22268125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22268295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22268323 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22268414 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 22268421 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 22268520 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.222222222222222 0.0555555555555556 0.722222222222222 9 27 4 1 13 19 22268565 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22268640 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22268675 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22269007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22269282 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 22269395 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22269436 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22269567 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 22269642 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 22269689 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22269709 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22269736 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22269824 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 22269940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22270009 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22270023 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0 0.684210526315789 0.315789473684211 13 25 0 13 6 19 22270100 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22270116 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 22270202 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 22270247 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 22270578 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 22270692 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 22270711 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 19 22270783 A G N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 19 22270784 C T N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 19 22270786 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 22271120 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 22271298 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 22271451 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 22271559 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 22271924 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 19 22271997 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22272032 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 22272063 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 22272082 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 22272083 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 22272167 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 22272177 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 22272212 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 22272225 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 22272270 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22272299 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 22272359 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 22272369 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 22272409 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 22272610 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 22272754 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 22272775 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22272870 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22272919 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 22273044 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22273630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22273924 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 22273937 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22274184 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22274203 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22274285 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22274325 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22275367 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 22275368 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 22275501 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 19 22275533 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22275603 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 22275686 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22275766 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 22275818 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 22275827 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 22276249 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 22276251 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 22276676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22278246 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 19 22278303 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 19 22278836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22285092 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22286080 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22286159 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22286468 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22287719 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22289905 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22290282 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 22292643 C G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 22294235 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22295640 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22296326 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22297417 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22298279 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22298318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22298483 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22298515 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 22298638 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.222222222222222 14 4 7 0 2 19 22298645 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 22298668 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 22298705 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 22298709 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 22298752 G A Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 11 5 5 1 2 19 22298956 C G N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 19 22298995 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 22299027 G T Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 22299072 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22299079 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 22299095 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 22299133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22299158 C T Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 22299204 G C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 22299217 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 22299287 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 22299359 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 22299454 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 22299482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22299528 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 22299561 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 22299599 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 22299602 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 22299638 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 22299716 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 22299719 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 22299884 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 22299891 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 22299921 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 22300262 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22300292 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22300585 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22300587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22300615 G T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 22300748 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22300779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22300787 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22300912 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22301079 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22301082 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22301094 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22301125 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22301133 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22302050 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 22302766 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22302800 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22303308 T G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 19 22303385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22303393 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 22303444 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22303468 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22303564 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22304046 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 22304183 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 22304212 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 22304294 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 22304328 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 22304419 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22304451 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22304463 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22304471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22304510 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22304719 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 22304926 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 22305200 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22305237 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22305672 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 19 22305863 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 22305990 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 22306080 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 22306302 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 22306355 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 22306800 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 19 22307444 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 22307459 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22307503 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 22307530 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22308100 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 22308520 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 22308535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22308556 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 22308566 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 22308596 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 22308605 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 22308695 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22308885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22309130 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 22309178 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22309185 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22309224 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22309246 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22309247 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22309341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22309494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22309538 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22309541 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 22310104 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22311594 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 22312238 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 19 22312689 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 22312989 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 22313037 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 22313197 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 22313261 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 22313303 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 22313423 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22313613 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22314102 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22314187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22314207 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22314256 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 22314373 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 22314400 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 22314608 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 22315393 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 22315738 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 22315746 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22315851 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 22315998 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 22316437 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22316803 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22316909 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22316968 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 22317117 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22317156 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22317216 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22317284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22317751 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22317757 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22317767 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22318056 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22318202 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 22318620 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 22319089 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22319812 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 22320088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22320885 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 22323188 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 22323840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22324550 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 22324605 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22325815 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22329754 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22329757 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 22331070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22331297 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22331404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22331407 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 22331415 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22331420 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 19 22331423 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22331434 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 22331460 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 22331504 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 22331552 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22331605 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22334086 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22337444 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22337454 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22337481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22337498 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22337503 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22337711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22337753 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22338106 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22339528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22339545 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 22339666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22339719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22339861 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 19 22340038 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22340053 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22340159 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 22341651 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22341783 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22341897 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22342200 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22342961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22343493 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 22343840 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 19 22343923 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22343951 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 19 22344225 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22344638 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22344804 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22344901 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 22345020 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22345096 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 22345115 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 22345122 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 22345619 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 22345624 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22345728 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22345800 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 22346078 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22346262 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 19 22346269 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22346818 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 22346909 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.294117647058824 0.117647058823529 0.588235294117647 12 22 5 2 10 19 22347398 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22347404 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 19 22347499 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 22347593 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 22347669 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22348397 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 22348439 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 19 22348480 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 22348530 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 22348593 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.222222222222222 0.0555555555555556 0.722222222222222 9 27 4 1 13 19 22348835 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 22349369 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 22349540 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 22349605 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22349935 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 19 22349947 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 22349985 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 22350060 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 22350133 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22350188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22350585 C G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 19 22351180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22351329 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22351413 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22351472 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22351581 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22351586 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22351593 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22351594 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22351599 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22351610 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22351666 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22351747 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22351840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22351991 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22352203 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 22352329 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22352359 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22352644 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 22352663 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 22352710 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22352747 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22352838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22352852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22352914 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 22353003 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 22353161 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22353225 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 22353230 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 22353234 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 22353947 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 22354804 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22354901 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22354923 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 19 22354967 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 19 22355049 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22355316 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22355728 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 22356135 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22356621 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22356719 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22357916 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22358140 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22359768 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 19 22360862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22360954 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22360955 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 22361072 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 22361526 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 22361550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22361621 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22362250 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22362397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22362692 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 22362822 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 19 22362899 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 22363374 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 19 22363720 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22364196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22364454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22365547 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22366144 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22366337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22366386 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 22366432 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22366434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22366455 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22366456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22366894 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22366961 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22366964 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22367263 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 19 22367425 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22367656 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22367857 A T Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 22367866 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 22367879 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 19 22367887 A C Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.5 0.125 0.375 18 14 8 2 6 19 22367918 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 19 22368001 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 19 22368551 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22368670 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 19 22368675 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22368714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22368788 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 19 22368791 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 19 22369158 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22369328 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 22369329 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 22369457 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 19 22369480 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22370079 A C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 19 22371111 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22371449 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 22371980 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22372293 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22372551 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22374891 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 22374892 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 22379856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22381281 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 22381861 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22381935 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22381949 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22382277 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 22382284 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22382403 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 22382483 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 19 22382514 G T N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 19 22382649 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 22382654 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 22382665 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 22382673 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 22382846 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22382879 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22383418 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22383457 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22383516 A G N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 19 22383520 G A N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 19 22383576 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22383627 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22383664 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 22383886 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 22383994 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 22384006 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 22384019 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 22384251 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22384276 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22384817 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22385864 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22387043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22387883 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22388444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22391109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22394372 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22394583 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 22396708 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22396977 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22397034 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22397046 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22397085 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22397225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22397507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22397527 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22397530 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22397590 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 22397591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22397660 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 22397672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22397810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22397843 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 22397866 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22397896 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 22397904 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22397955 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 22397956 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 22397965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22398171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22398699 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 22398719 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 19 22398788 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22398789 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 22399028 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 22399055 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 22399244 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 22399283 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22399354 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 22399460 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 22399465 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 22399523 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 22399534 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 22399536 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 22399568 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 22399573 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 22399602 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 22399607 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 22399621 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 22399647 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 22399650 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 22399662 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 22399683 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 22399684 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 22399713 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 22399721 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 22399772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22399850 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 22399902 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 22399911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22399991 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 22400001 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 22400078 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 22400251 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 22400283 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 22400296 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 22400463 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 22400533 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 22400577 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 22400662 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 22400819 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 22400973 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 22401080 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 22401188 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 22401198 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 22401381 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 22402523 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 22402556 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 22402591 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 22402599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22402607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22402613 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22402655 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 22402679 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 22402743 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 22402977 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22403024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22403062 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 22403075 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22403164 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22403192 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22403216 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 22403429 C T N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.545454545454545 0.272727272727273 0.181818181818182 15 7 6 3 2 19 22403476 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 22403495 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 22403550 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 22403708 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 22403755 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22403812 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 19 22403815 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22403866 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22403875 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22403899 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 22403916 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 22403927 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 22404084 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 22404107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22404130 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 22404177 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 22404222 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 22404299 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 22404343 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 22404534 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 22404592 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 22404608 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 22404660 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 22404665 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 22404748 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 22404766 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 22404787 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 22404804 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 22404882 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 22404906 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22404947 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 22405001 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 22405109 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 22405118 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 22405149 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 22405395 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22405497 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22405536 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 22405584 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 22405596 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 22405605 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 22405793 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 22405888 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22405913 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 22405919 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 22405971 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 22405994 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 22406015 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22406057 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22406131 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 22406179 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22406227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22406238 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 22406348 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22406349 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22406464 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 22406504 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22406510 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22406512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22406573 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 22406620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22406651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22406677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22406826 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22406870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22406908 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 22407035 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22407057 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22407138 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 22407188 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 22407230 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22407240 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22407268 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 22407272 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22407292 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 22407420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22407494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22407549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22408181 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22408380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22408970 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22409808 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22410109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22410362 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 22410398 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22411183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22411309 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22411620 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22412059 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 22412107 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22412124 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22412792 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 22413596 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22414531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22414562 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 22414775 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 22415109 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 22415202 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22416126 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 22416885 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 22417753 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22419477 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22419980 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 22421859 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22424640 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22424641 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22424977 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22425059 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 22425324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22426355 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 22427497 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22428149 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22429579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22429708 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22429871 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 22429876 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 22430018 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22430041 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22430048 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22430051 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22430169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22430398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22430483 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 22430484 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 22430533 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 22430688 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22430703 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22430861 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 22430869 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22431016 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 22431021 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 22431034 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22431109 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 22431287 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22431583 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 22431871 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 22432069 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 22432675 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22432676 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22432728 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22432767 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22432799 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22432999 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 22433065 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 22433152 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 22433213 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 22433219 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 22433237 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 22433241 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22433460 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 22433493 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 22433519 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 22433585 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22433920 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22433922 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22433944 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22433976 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22433991 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22434020 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22434028 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22434593 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22434600 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22434821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22434832 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 22435488 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 22436072 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 22436169 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 22436217 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22436314 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 22436404 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 22436491 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 22436770 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 22436848 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 19 22436906 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 22436913 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 22437086 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 22437443 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 22437757 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 22437899 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 22438013 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 22438288 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 22438433 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 22438478 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 19 22439057 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 22439090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22440045 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 22440435 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22441070 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22441438 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22441618 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 22441624 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 22441654 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22441940 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 22441971 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22441985 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 22442101 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 22442103 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 22442137 G C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 19 22442138 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 22442260 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22442322 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22442331 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22442433 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22442452 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22442500 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22442559 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22442653 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 22442765 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 19 22442771 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22442815 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22442850 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 22442854 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 22442870 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22442885 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 22442915 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22443055 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22443129 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22443160 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 22443250 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 22443300 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22443389 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22443395 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22443398 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22443431 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22443610 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22443839 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 22444166 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22444188 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22444198 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22444567 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 22444577 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 22444860 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 22444893 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22444928 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 22445060 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 22445106 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 22445237 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 22446092 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 22446465 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22446522 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22446546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22446781 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22447123 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 22447404 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22447766 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 22447847 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22448000 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 22448177 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22448183 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22448184 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22448199 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22448242 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 22448337 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22448341 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22448402 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 22448467 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 22448971 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 22449027 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22449303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22449328 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22449511 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22449757 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22449821 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22450300 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22452676 C A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 22452882 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22453944 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22454081 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22456129 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22456341 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22456353 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 22457095 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22457928 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22458308 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22458542 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22458571 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 22458593 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 22458700 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22458721 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 22458757 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22458782 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 22458795 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 22458816 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 22458875 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 22459045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22459151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22459353 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 22459447 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22459551 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 22459564 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22459652 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 22459680 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22459778 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22459785 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22459818 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 22459828 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 22460305 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22460313 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 22460317 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22460361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22460479 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 22460501 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 22460533 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 22460792 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 22461311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22461365 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22461465 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 22462015 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22462021 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22462105 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22462163 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22462234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22462243 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 22462244 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22462468 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22462503 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22462618 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22462658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22462681 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 22462834 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22462930 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 22463016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22463252 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22463368 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22463414 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22463681 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22463697 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 22464095 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 22464254 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 22464332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22464363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22464586 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 22464615 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22464705 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 22464852 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 22465014 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 22465134 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22465372 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22465373 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22465925 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22466475 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22466638 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 22466786 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 22466883 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 22466893 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 22466895 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 22467026 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 22467083 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 22467086 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 22467116 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 22467140 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 22467265 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22467760 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22467869 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22467925 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 22468491 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 22468741 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 22468984 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 22469444 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22469559 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22469836 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 22469848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22469851 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22469864 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22470055 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22470175 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 22470407 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 22470477 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22471117 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22472413 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22473563 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22474008 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22474283 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 22474295 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 22474352 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 22474353 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 22474371 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22474387 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22474925 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 22475057 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 22475584 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 22476069 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 22476179 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22476185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22476972 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22477247 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22477342 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22477523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22478000 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22478034 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22478035 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22478316 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22478528 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22478567 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22478922 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 22479160 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22479909 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 22480024 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 22480187 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 22480232 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 22480242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22480488 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22480489 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 22484335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22484922 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 22485284 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 22485354 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 22485510 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 22486022 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22486091 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 22486113 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 22486277 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 22486311 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 22486415 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 22486484 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 22488617 C G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 22488621 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 22489072 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 22489457 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22489549 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22489566 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22489588 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22489634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22489769 T A Y N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 19 22489773 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 22489784 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 22489850 A T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 22489866 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 22489906 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 22490174 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 22490243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22490274 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 22490395 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 22490415 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 22490439 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 22490475 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22490538 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 22490607 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22490632 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22490866 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22491460 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22492134 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22492399 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 22492649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22492826 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22492834 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22493137 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22493212 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22493511 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 22496419 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22496422 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22497502 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22497549 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22498142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22498152 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22498320 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22498646 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22498736 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22498883 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22499002 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 22499095 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 22499155 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 22499301 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 22499356 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22499604 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22499932 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22499976 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 22500000 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22500022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22500026 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22500037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22500076 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 22500219 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 22500271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22500364 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22500542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22500667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22500798 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22500800 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22501493 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22501519 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22502057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22502301 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22502310 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22502328 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22502356 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22502464 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22502523 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22502573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22502590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22502591 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22502707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22502736 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22502856 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22502934 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 22502996 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22503151 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 22503292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22503335 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22503418 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22503420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22503724 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 22504703 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22504720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22504807 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22504813 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22504847 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22505031 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 22505040 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22505046 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22505055 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22505109 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22505122 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22505150 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 22505188 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22505239 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 22505258 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 22505354 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22505356 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22505363 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22505364 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22505426 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22505570 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22505915 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 22506078 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22506162 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22506434 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 22506438 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 22506489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22506816 T C N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 19 22507260 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 22507279 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 22507282 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 22507349 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22507352 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 22507573 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22507586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22507591 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22507745 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22507795 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22507805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22507886 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22507969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22508013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22508231 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22508481 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 22508692 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22508758 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22508764 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22508854 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22508870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22508903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22508993 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22509081 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22509123 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22509595 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 22510049 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 22510097 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 22510226 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 19 22510246 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 22510953 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22511017 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22511089 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 22511091 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 22511122 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22511123 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22511188 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22511205 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22511235 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 22511237 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 22511518 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22511909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22511989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22512114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22512128 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22512134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22512160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22512221 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22512627 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22513034 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22513066 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22513199 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22513635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22514491 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 22519954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22520151 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22521576 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 22522015 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 22522480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22523219 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 22523582 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 22524385 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22525336 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22525542 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 22527751 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 22530396 C T N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 19 22531151 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22532121 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22532199 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 22532402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22532550 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22532586 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22532669 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22533147 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22533268 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 22533602 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22535011 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22535060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22535094 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22535095 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22535219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22535226 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22535260 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 22535691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22535797 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22537929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22538054 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 22540939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22541492 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 19 22541629 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 22541880 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 22541892 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 22542275 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22542294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22542296 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22542350 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22542514 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 22542571 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 22542591 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 22542625 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 19 22543907 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22545370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22546941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22547669 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22548865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22551566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22552382 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22556381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22556445 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 22556914 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22557027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22557197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22557488 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22557699 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22562780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22565242 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 22565568 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 22565668 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 22565670 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 22565904 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 22566023 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22566220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22566331 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22566546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22566912 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22567134 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 22567207 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 22567246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22567251 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22567283 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22567285 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22567380 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 22567382 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 22567416 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 22567712 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 22567743 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 22567757 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 22568321 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 22568326 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 22574607 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22577208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22577826 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 22577884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22578095 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22578096 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22578103 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22578131 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22578417 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22578574 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22578616 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 22578649 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 22578950 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 22579036 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 22579084 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 22579085 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 22579712 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 22579721 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 22579913 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 22579932 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 22579938 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22580029 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22580106 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 22580119 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 22580262 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 22580321 T A N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 19 22580336 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 19 22580349 C A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 19 22580677 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 19 22580696 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 22580713 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 22580714 G T N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 19 22580788 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22581137 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22581270 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22581329 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 22581424 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22581432 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 22581453 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 22581563 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 22582349 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22582374 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22583789 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22586718 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22587080 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22587164 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22587261 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22587731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22589850 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 22590497 C G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 19 22590705 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 19 22590800 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 22590882 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22591933 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22592210 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22592513 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 22592588 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22593041 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22594023 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22594229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22595689 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 22596272 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22599326 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22599489 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22599659 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22603774 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 22604121 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22605230 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 19 22605279 T A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 19 22605308 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 19 22606110 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 22606113 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 22606425 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22606804 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 22606966 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 22607029 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 22607229 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22607277 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22607542 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 22607596 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 22607677 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 22607699 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 22607752 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 22607754 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 22607764 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 22607810 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 22607838 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 22608151 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 22608161 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 22608234 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22608243 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 22608457 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22608698 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 19 22608770 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22608867 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 22608904 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22609247 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 19 22609261 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 22609311 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 22609325 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 22609326 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 22609455 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 22609626 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 22609785 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 22609786 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22609803 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 22610371 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 22610477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22610488 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 22610500 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 22610517 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 22610543 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 22610626 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22610654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22610752 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 22610755 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22610813 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22610846 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22610977 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 22611086 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 22611115 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 22611234 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 22611328 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 22611353 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 22611614 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 22611688 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 22611985 T A N N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 19 22612053 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22612755 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22613158 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22613345 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 22613604 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 22613630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22613836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22614110 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 22614550 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22614583 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22615319 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 22615333 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 22615334 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 22617856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22618957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22620583 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22620961 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 22621091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22621195 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22621207 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 22621282 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 22621331 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 22621503 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 22621517 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 22621529 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 19 22621589 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 22621599 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22621608 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 22621637 C T Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 19 22621654 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 19 22621695 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 19 22621702 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 19 22621780 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 19 22621865 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 19 22622188 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 22622242 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 22622252 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 19 22622257 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 19 22622259 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 22622351 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 22623441 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22623449 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 22623737 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 22623805 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 22623965 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 22624257 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 22624328 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 22624365 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22624539 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 22624588 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22624998 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 22625175 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22625210 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22625212 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22625829 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 22625894 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22625916 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22626071 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 22626157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22626414 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 22626531 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 22626540 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 22626554 A C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 22626838 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22626903 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 22626959 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 22626992 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 22627024 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22627287 C G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 22627366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22627399 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 22627651 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 22627980 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22628470 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22628637 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22628659 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 22629115 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22629174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22629661 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22629904 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 22629977 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 22630158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22630209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22630220 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 22630224 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22630226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22630636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22630765 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22630789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22630794 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22630796 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22630801 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22630838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22630855 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 22630856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22630889 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22630910 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22630926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22630968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22630985 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22631189 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22631339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22631450 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 22631458 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 22631471 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 22631565 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 22631843 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22631878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22631915 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 19 22632016 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22632042 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 19 22632097 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 22632207 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22632586 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 22632594 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 22632648 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22632834 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22632845 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22633212 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 22633266 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 22633353 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 22633598 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 19 22633686 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 22633692 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 22633699 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 22633708 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 22633723 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 22633771 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 22633971 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 22634182 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22634231 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 22634245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22634256 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22634306 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22634335 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22634355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22634493 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22634654 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 22634916 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22634918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22634960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22635334 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22635466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22635490 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 22635513 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 22636016 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 22636019 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 22636020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22636214 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 22636359 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 22636560 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22636573 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22636574 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22636594 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 22636610 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 22636677 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 22636840 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22636860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22636882 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22636906 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 22637534 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 22637543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22637735 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22637758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22637789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22637839 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22637998 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 22638008 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22638155 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 22638261 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22638417 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22638419 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22638440 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22638441 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22638451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22638462 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22638514 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22638543 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22638638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22638679 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22638717 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22638969 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22638983 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22639036 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22639038 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22639061 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22639173 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 22639426 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22639501 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22639571 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22639756 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22639795 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 22639825 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22639862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22639892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22640296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22640504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22640735 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 22640831 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22640941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22640986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22641208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22641403 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22641416 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22641459 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22641541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22641586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22641802 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22641803 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22641869 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 22641920 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22641969 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22642059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22642082 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22642440 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22642557 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 22642566 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 22642587 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 22642644 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22642655 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 22642668 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 22642761 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 22642764 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22642770 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 22642793 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 22642808 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22642819 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22642826 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 22642849 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 22642905 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 22642931 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22642934 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22642935 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 22642943 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 22642945 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22642948 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22643014 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 22643027 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22643045 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 22643051 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22643091 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 22643093 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 22643116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22643121 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22643129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22643139 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22643145 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 22643186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22643226 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 22643240 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22643287 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22643293 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 22643297 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22643336 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 22643390 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22643397 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22643429 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22643541 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22643554 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22643557 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22643558 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22643565 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22643577 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 22643637 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22643764 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22643786 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22643788 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22643798 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22643866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22643867 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22643875 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22643890 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22643954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22643992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22644003 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22644058 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22644101 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 22644104 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 22644129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22644131 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 22644145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22644210 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 22644217 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22644226 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 22644309 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 22644355 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22644403 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 22644404 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22644498 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 22644635 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 22644698 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22644757 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22644773 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22644792 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 22644853 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 22644865 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22644874 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 22644884 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 22644897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22644919 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22645060 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 22645063 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 22645064 T G N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 19 22645291 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 22645310 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 22645315 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22645465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22645573 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22645601 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22645728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22645738 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22645818 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22645905 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22646067 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22646171 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22646183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22646433 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22646442 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22646506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22646554 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22646584 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22646596 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22646642 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22646697 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22646755 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22646795 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22646816 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22646819 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22646826 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 22646844 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22646863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22646958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22646976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22647040 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22647087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22647089 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22647107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22647137 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22647139 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22647143 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22647146 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22647183 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 22647190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22647199 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22647257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22647310 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22647312 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22647418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22647769 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22647771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22647899 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22647930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22647935 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22647996 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22648003 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22648010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22648048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22648318 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22648367 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 22648401 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22648571 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22648846 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 22648888 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 22649332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22649353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22649387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22649488 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22649834 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22649849 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22649880 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 22649927 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22649964 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22649979 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22650231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22650320 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22650413 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22650581 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 22650676 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22650677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22650728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22650878 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 22650922 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 22651086 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22651090 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22651096 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22651119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22651186 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22651202 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 22651203 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22651245 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 22651352 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 22651360 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 22651379 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22651520 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22651651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22651693 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22651714 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22651767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22651771 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22651788 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 22651802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22651818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22651911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22651914 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22651930 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22651958 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 22652044 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 22652051 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 22652267 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 22652303 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 22652310 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22652409 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 22652514 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22652622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22652894 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22652926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22652951 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22653214 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22653313 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22653323 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22653406 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22653484 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22653511 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22653681 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22653774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22653810 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22653876 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22653967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22654089 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22654288 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22654318 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22654471 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22655089 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 22655090 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 22655094 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22655176 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22655225 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 22655356 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 22655371 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22655459 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 22655720 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22655725 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22655741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22655799 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22656100 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 22656227 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22656297 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22656434 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22656459 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22656556 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22656597 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22656616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22656676 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 22656721 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 22656865 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 22656917 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 22657041 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 22657056 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 22657071 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 22657092 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 22657135 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 22657175 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 22657232 C G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 19 22657245 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 19 22657257 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 22657267 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 22657409 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22657411 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 22657420 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 22657525 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22657542 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 22657596 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 19 22657969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22658031 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 22658066 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 22658168 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22658549 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 22658555 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 22658671 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 22659000 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22659434 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 22659649 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 22659896 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22659897 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22659980 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 22660021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22660065 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22660262 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 22660279 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 22660294 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 22660330 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 22660431 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 22661923 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 22663213 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22663332 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22663361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22663424 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 22663433 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 22663437 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 22663454 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 22663732 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 22663733 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 22663961 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 22663966 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22664060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22664073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22664185 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22664226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22664540 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 22664596 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22664858 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 19 22664876 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22665274 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22665438 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 22665450 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 22665674 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 22666190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22666256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22666267 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 22666410 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 22666516 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22667498 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 22667803 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 22667815 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 22667822 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 22667837 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22668167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22668299 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22668444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22668529 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22668548 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22668559 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 22668931 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22669057 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22669699 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 22670266 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22670306 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 19 22670489 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22670507 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22670601 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 22670614 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 22670619 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 22670637 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 22671176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22671188 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 22671681 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22671695 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 22671934 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22672030 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22672158 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 22673705 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 22673711 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22673771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22674184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22674350 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22674480 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22674504 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 22674522 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 22674652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22674721 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22674782 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22674881 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 22675100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22675511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22675713 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 22676141 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 22676216 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 22676803 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 22677689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22678269 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22678764 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22679246 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22679393 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22679532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22679568 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 22679669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22679873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22679999 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 22680167 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 22680177 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 22680220 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 22680364 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 22680415 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22680485 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 22680509 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 22680822 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22680904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22680949 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 22681453 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22681690 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 22681726 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 22681782 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22682202 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 22682303 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22682322 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 22682336 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 22682560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22682857 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22683395 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 22683435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22683467 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22683480 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22683717 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 22683817 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 22683863 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 22683899 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 22684057 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 22685616 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 22686335 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 22686357 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 22686417 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 22686472 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 22686596 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 22686655 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 22687530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22688034 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22688066 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22688237 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22688907 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 22688924 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 22689106 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 22689160 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22690694 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22690989 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22691006 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22691114 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22691319 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 22691381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22691453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22691584 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 22691601 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22691661 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 22691776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22691793 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 22692472 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22692605 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 22692619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22692758 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 22692785 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22692866 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22692989 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 22693007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22693404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22693443 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 22693684 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 22693946 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22694492 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22694747 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22698242 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22699003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22699995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22700549 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22700973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22701099 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22701144 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 22701409 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 22701613 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 22701636 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22701843 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 22701937 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22701951 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 22702309 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 22702351 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22702367 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 22702369 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22702406 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 22702771 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 22702833 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 22702859 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 22704119 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 22704571 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 22704720 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22704887 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 22704992 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22705019 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22705146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22705790 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22706369 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22706565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22707218 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 22707492 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 22707530 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22707674 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 19 22707738 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 22708079 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 22708495 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 22708712 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 22708856 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22709046 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 22709223 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 22709256 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 22709257 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 22710022 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 22710034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22710313 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22710319 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 22710334 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22710335 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22710682 A G Y Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 19 22711224 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 22711227 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22711251 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 22711253 C T Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 22711272 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22711295 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22711417 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22711431 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22711514 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 22711525 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22711614 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22711626 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22711646 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22711823 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22711847 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 22711939 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 22712110 C G Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 22712243 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 22712332 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 22712664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22712675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22712691 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22712748 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22712820 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22712937 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22713024 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 22713177 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22713196 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22713221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22713456 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22713491 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 22713603 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22713921 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22713948 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22713971 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 22714189 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22714218 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22714264 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22714530 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 22714630 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22715656 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22715755 A C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 22715756 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 22716034 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 22716174 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 22716190 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 22716757 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22717127 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 22718668 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22726636 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22726639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22726676 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 22729877 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22729909 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 22729961 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22730010 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 22730048 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22730153 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 22730222 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 22730267 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22730345 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 22730355 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 22730488 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22730506 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22730523 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22730585 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 22730598 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22730620 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22730624 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 22730799 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22730845 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 22731298 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22731770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22731970 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 22732741 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 19 22732810 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22732837 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22732927 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 22732944 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22732984 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22733033 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 22733055 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 22733206 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 22733210 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 19 22733250 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 19 22733368 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22733535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22733549 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22733603 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22733643 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 22733698 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22733795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22733820 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 22733887 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 22733891 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22733895 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 22733928 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 22734422 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22734471 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 22734556 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22734557 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22734948 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 22735292 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22735432 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22735499 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22735597 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22735680 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 22736293 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22736581 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 22736881 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 22736944 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22737503 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22737986 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22738354 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22739765 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22740055 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 22740276 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 22740296 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 22740303 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 22740327 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 22740343 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 22740380 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 22740392 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 22740411 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 22740430 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 22740598 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 22740678 G T Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 22740731 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 22740784 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 22740809 G T Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 22740903 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 22741477 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 22741578 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 19 22741704 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 22741959 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 19 22742052 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 22742087 G A Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 19 22742213 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 22743032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22743435 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 22743634 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 22743646 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 22744188 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22744233 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 22744251 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22744280 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 22744427 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22744506 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22744524 T A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 22744531 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 22744587 T G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 19 22744619 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 22744754 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 22744871 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 22745506 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22745516 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22745520 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22745553 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 22745570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22745847 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 22746151 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22746626 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22746881 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22747366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22747866 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 22749414 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 22750395 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 22750689 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 22750710 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 22751026 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 22751353 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 22751440 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22751576 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 22751610 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 22751623 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 22751640 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 22751656 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 22751658 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 22751772 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 22751778 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 22751811 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 22751836 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 22751919 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 22751925 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 22751939 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 22752084 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 22752238 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 22752592 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22752615 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 22752633 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 22752663 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 22752826 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 22753009 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22753646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22754453 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22754640 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 22755128 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22755152 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22755608 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22755864 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22756669 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 22756713 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 22756943 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22757106 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 22757938 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 22758027 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 22758078 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22758214 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 22758753 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 22758896 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 22759548 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 19 22759652 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22759853 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 22760134 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22760269 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 22769910 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 22770066 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 22771354 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22772597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22772904 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22773719 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22774672 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22775818 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22777337 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22777407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22777532 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 22777787 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22777869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22777914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22777948 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22777996 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22778125 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22778133 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22778174 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22778301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22778846 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22778877 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22778974 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 22779188 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22779271 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 22779499 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22779644 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22779654 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22779825 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22779840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22779847 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22780200 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 22780393 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 22780401 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 22780429 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 22780489 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22780850 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22780884 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22781108 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22781209 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 19 22781213 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 19 22781226 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 22781228 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 22781581 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22781608 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 19 22781650 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22781670 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22781687 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22781795 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22781822 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 22781881 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22781955 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 22782331 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 22782387 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 22782660 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 22782682 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22783160 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22783292 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 22783435 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 22783500 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22783587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22783616 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22783659 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22783681 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22783692 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22783694 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22783753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22783767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22783784 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22783808 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22783822 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 22783826 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22783829 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22783872 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22783878 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22783945 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 22784211 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22784219 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22784336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22784469 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22784490 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 19 22784573 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22784598 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 22784663 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22784739 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22784765 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 22784803 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 22784886 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 22784888 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 22784915 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22785135 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 22785136 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 22785238 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22785242 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22785338 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 22785357 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 22785636 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22785653 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 22785706 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 22786073 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 22786279 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 22786517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22786547 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22786587 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 22786693 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 22786884 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 22786956 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 22786965 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22787170 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 22787194 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 19 22787275 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22787367 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 22787387 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 22787394 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 22787437 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 22787442 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 22787518 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22787522 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 22787604 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 22787606 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 22787617 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 19 22787694 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 22787712 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 22787725 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 22787760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22788512 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22788610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22788721 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22788724 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22788751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22788869 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 22788937 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22789287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22789294 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 22789441 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22789487 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22790584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22791554 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 22791575 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 22791618 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 22791675 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 19 22791826 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 22791927 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 19 22791938 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 19 22792227 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 22792309 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 22792383 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 22792443 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 22792504 G C Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 22792521 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 22792644 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 22793006 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 19 22793008 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 19 22793011 G T N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 19 22793073 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 22793543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22793871 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 22793903 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 22793923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22793924 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22793956 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 22794135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22795377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22795510 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 22795710 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 19 22795905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22796505 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 22796763 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22796806 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22803108 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22803282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22803407 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22803963 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 22804129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22804862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22804914 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 22805027 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 22805702 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22805755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22805768 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22805945 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22806008 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 22806545 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22806971 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 22807213 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 22807794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22808800 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 19 22808801 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 22809023 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 22809340 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 22809404 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 22810588 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22811057 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 22811381 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 22811471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22811603 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 22811947 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 19 22811968 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22812020 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22812042 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22812123 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22812192 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 22812282 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22812301 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22812347 A T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 19 22812473 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 19 22812485 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 19 22812528 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22812543 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 22812566 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22812851 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22812965 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22813128 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22813139 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 22813233 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 22813336 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 22814265 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 22814268 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 22814352 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 22814537 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 22814549 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22814607 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 22814759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22814768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22815145 G C Y N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 19 22815457 C A N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.571428571428571 0.357142857142857 10 18 1 8 5 19 22815468 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.571428571428571 0.357142857142857 10 18 1 8 5 19 22815526 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 19 22815569 G T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 19 22815584 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 22815627 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 22815718 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 19 22815771 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 22816007 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 19 22816049 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22816110 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 22816437 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22818259 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22818473 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22818514 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22818680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22818694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22819364 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 22819679 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 22820115 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 22820473 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22820554 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 22820711 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22820972 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 22821012 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 22821785 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 22822330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22822410 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 22822768 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 22823053 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22823415 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22823632 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 22823786 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 22823852 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22823945 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22823948 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 22824147 T A Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 22824660 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 22824703 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 22824992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22825427 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22825478 A T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 22825591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22825845 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22826402 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22826452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22827032 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 22827177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22827223 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22827452 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22827453 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22827522 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22827576 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22827593 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22827646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22827756 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 22827869 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 22827984 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 22828494 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22828543 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22828757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22828773 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22828776 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22828790 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22828803 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22828840 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22828929 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22829011 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22829163 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 22829175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22829192 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 22829327 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22829452 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 22829471 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22829475 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 22829688 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22829763 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22829974 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22830048 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 22830076 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 22830112 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 22830685 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22830780 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 22830867 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22830872 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22830929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22831095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22831738 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22831839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22831866 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 22831894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22831913 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22831939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22831973 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22832185 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 22832340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22832415 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 22832474 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 22832589 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 22832692 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 22832703 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 22833000 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22833093 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22833167 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22834766 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 22834845 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22835022 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 22835489 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 22835812 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 22835926 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22835937 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22836025 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22836028 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22836328 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 22836370 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 22836376 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 22836489 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 22836503 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22836596 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22836602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22836820 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22836915 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 22836927 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22837064 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 22837095 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22837206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22837262 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22837276 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22837293 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22837353 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22837518 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 22837551 T A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 19 22837920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22838078 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22838504 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22838508 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22838676 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22838687 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22838694 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22838742 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22838744 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 22838999 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 22839039 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 22839053 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 22839071 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 22839148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22839224 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 22839302 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 22839500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22839513 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 19 22839843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22840466 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22840511 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22840874 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22841488 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 22841601 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22841720 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22841763 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 22841902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22841938 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 22842093 C G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 22842106 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22842312 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22842414 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22842420 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22842427 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22842831 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 22843009 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 22843062 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22844162 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22845998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22846138 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22846556 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22848404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22848476 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 22848491 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 22849107 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22849274 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22849372 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 22849640 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22849642 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22849670 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 22850061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22850068 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22850108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22850211 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 22850214 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 22850292 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 22850361 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 22850446 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 19 22850464 T A N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 19 22850468 A G N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 19 22850584 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 22850646 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 22850683 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 22850700 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22850710 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 19 22850755 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 22851069 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22851286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22851398 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22851474 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22851789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22852139 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22853291 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22853322 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22853563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22853683 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 22854647 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 22854886 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 22855149 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22855208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22856565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22856667 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22856731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22856818 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 22858606 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22858872 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22859131 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22860329 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22860592 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22862576 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 22864736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22864784 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22865925 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 22865999 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 22866463 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 22866522 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 22866571 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 22866701 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 22866717 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 22866986 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 22867027 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 22867055 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 22867787 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22867982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22868210 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22868366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22868396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22868986 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 19 22869144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22869365 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22869686 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 22871145 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 19 22871146 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 19 22871267 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 22871594 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 22871611 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 22871899 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 22871910 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 22872242 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 22872246 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 22872448 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22872512 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 22872678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22872710 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22872733 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 22872787 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 22873018 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22873162 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22873168 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22873258 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22873374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22873486 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 22873555 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22873572 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 22873590 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 22873755 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 22873827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22873877 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 22873917 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 22874010 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 22875366 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 22875847 C G Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 19 22876075 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22876153 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22876387 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22876575 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22876617 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22876765 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22876890 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22877002 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22877762 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22877794 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22878069 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22878169 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22878369 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22878931 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 22879029 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22879114 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22879271 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22879357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22879397 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22879419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22879549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22879652 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22879832 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22879856 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22879886 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22880141 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22880310 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22880599 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 22880720 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 19 22881224 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22881534 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22881939 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22881990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22882429 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 22882685 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22882729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22882787 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22883042 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 22883120 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22883198 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22883250 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 22883333 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22883769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22884009 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22884043 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22884073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22884090 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22884123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22884328 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22884334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22884344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22884433 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 22884503 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22884511 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22884643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22884779 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22884814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22884859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22884900 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22884934 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22884955 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22884956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22884975 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22884979 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22884995 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 22885004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22885015 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22885026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22885118 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22885291 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 22885363 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 22885370 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 22885373 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 22885423 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22885444 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 22885452 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22885478 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 22885483 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22885524 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22885632 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22885643 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22885720 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22885739 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22885795 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22885832 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 22885851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22885857 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22885875 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22885939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22885945 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22885965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22886141 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22886396 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22886432 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22886587 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 22886644 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 22886695 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 19 22886699 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 22886702 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 22886766 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 22886864 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 22886905 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 22886948 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 22886987 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 22887077 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 22887093 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22887160 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 22887196 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22887228 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22887298 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 22887360 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 22887365 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 22887449 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22887463 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22887497 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22887524 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22887590 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22887767 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 22887771 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 22888172 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 19 22888318 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22888337 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22888552 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22888553 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22888764 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22888878 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22888914 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22889247 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22889267 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22890019 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 22890211 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 22890352 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22890573 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 22891376 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22891379 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22891604 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 22891759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22891945 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 22891964 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 22891976 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 22892039 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 22892060 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 22892342 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 22892433 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22892446 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 22892839 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22893046 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22893194 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22893196 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 22893276 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22893409 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 22893463 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 22893754 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22893816 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 22893828 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 22893835 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 22893919 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 22893920 A C Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 22894232 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 19 22894328 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 22894358 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 22894381 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 22894396 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 19 22894471 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 22894654 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 22894933 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22895454 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22895740 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 22895778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22895997 G T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 19 22896000 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 19 22896051 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 22896312 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22896321 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22896966 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22897062 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22897280 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22897381 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22897976 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22897988 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 22898025 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 22898867 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22899734 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22902439 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 22903756 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 22905415 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 22906035 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22906239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22907021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22907122 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 22907275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22907338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22907661 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22915704 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22915758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22917186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22917857 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 22918931 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 22919201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22919613 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22920420 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22922419 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22923378 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 22923581 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 22923693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22923758 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22923812 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 22923842 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 22923881 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 22923936 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 22924112 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22924550 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22925372 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 22925421 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22925605 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 22925618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22925723 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22925762 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22925909 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22926144 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 22926166 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22926201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22926476 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22926627 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 22926694 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22927040 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 22927074 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22927136 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22927305 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 22927317 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 22927345 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 22927400 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22927599 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 22927691 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 22927841 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 22928020 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22928418 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 22928789 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 22928798 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 22928829 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22928853 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22928855 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 22928880 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 22928931 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 22928980 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 22929019 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 22929071 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 22929134 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 22929169 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 22929252 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 22929266 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 22929360 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 22929394 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 22929433 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 22929543 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 22929549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22929839 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22929906 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 22929958 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 22930042 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 22930163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22930176 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22930285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22930353 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22930527 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22930535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22930595 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22930651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22930663 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22930828 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 22930925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22932637 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 22933298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22933572 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 22933597 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22933676 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22933682 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22933712 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 22933841 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 22933865 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 22933867 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 22934204 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 19 22934382 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22934390 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22934455 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22934479 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22934516 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22934579 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22934583 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22934928 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22935046 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22935112 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22935202 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22935390 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22935474 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22935475 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22935540 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22935544 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22935571 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22935587 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22935588 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 22935603 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22935799 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22935835 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22935932 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 22936098 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 22936101 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 22936405 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22936602 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 22936604 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 22936747 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22936855 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22936871 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22937036 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22937261 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22937400 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22937423 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22937424 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22937468 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22937491 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 22937785 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22938434 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22938564 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22938834 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22938943 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22939113 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22939168 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22939214 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22939341 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22939667 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22939827 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 22939858 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22939902 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22939954 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22939981 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22939990 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22940011 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22940084 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 22940619 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22940860 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22941285 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22941384 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 22941394 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 22941818 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 22941867 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 22941873 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22941920 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 22942026 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22942027 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22942043 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22942157 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22942190 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22942304 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 22942382 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 19 22942466 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 22942616 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 22942908 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22942967 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22942998 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 22943076 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22943213 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 22943815 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 22943968 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 22944888 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 22945584 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 22945727 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 22945934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22945999 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 22946015 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 22946610 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 22946994 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 22947178 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 22947232 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 22947237 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 22947253 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 22947347 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 22947391 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22947545 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 22947623 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22947735 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 22948123 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 22948242 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 22948317 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 19 22948554 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 22948635 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 22948652 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 22948710 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 22948794 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 22948800 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 22948961 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22949068 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 22949084 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 22949335 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 22949427 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 22949444 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 22949931 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 22950120 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22950392 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 22950646 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 22950691 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22950708 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 22950731 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 22950748 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 22951170 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 22951197 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 22951235 G T Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 22951247 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 22954335 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22954791 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22956823 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22957795 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 22957845 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22958648 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22960102 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22960628 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 22960846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22961285 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22962288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22962290 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22963224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22964091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22964943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22965462 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 22966139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22966186 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 22971163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22972578 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 22972728 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 22972783 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 22972793 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22972902 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 22972907 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 22972959 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 22973041 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 22973194 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 22973336 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 22973824 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22974224 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 22974237 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 22974981 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 22975527 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 22975679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22975870 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 22975937 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 22976106 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22976376 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22976383 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22976435 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22976790 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22976986 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 22977004 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 22977020 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 22977040 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22977299 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22977544 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 22978092 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22978118 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 22978240 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 22978341 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22978480 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 22978546 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 22978706 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 22978731 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22978845 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 22978978 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 22979356 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22979458 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22979574 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 22979640 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 22979700 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 22979707 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 22980186 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22980189 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22980486 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 22981118 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22981158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22981207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22981233 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 22981281 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22981284 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22981443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22981669 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 22981676 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22981705 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22981744 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22981876 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 22981923 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22981928 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22982137 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 22982219 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 22982443 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 22982712 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22982726 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22982772 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 22982795 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22982808 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 22982935 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 22982941 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 22982964 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22983175 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 22983359 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22983376 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22983637 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 22983808 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22983859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22983933 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 22984191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22984458 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22984638 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22984700 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 22984750 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 22984762 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 22984765 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 22984774 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 22984837 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 22984985 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 22984989 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 22984999 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 22985002 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 22985079 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22985135 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 22985350 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 22985479 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 22985490 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22985492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22985644 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 22985812 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22986095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22986135 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22986138 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22986152 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 22986222 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 22986363 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 22986511 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22986668 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22986740 A C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 22986989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22987178 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 22987179 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 22987180 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 22987228 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 22987342 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22987531 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 22987569 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 22987714 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 22987807 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 22987856 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 22987944 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 22987987 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 22988007 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 22991557 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 22992532 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22993218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22993287 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22993592 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22993885 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22994112 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22996095 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 22997898 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 22997937 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 22998157 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 22998677 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 22998794 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 22998966 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 22999548 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 23000021 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23001111 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 23001420 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23001661 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 23001885 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23001938 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 23002251 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23002923 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 23003223 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23003664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23003880 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23003942 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23004248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23005044 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23005220 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23005404 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 23005524 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 23005533 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 23005959 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23006123 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 23006144 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23006189 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23006195 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23006314 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23006418 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 23006448 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23006617 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23006624 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23006909 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 23007071 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 23007196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23007234 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23007258 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23007594 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 23007706 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23007734 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23007790 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 23007955 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 23007965 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 23008009 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23008029 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 23008098 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23008112 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23008154 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23008351 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23008380 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 23009332 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 23009441 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 23009509 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 23009591 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23009966 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23010617 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23010625 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23011017 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 23011033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23011043 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23011098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23011106 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23011353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23011389 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23011406 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 23011583 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23011688 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 23011802 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23011873 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23011898 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23012185 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23012222 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 23012228 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23012243 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23012247 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23012470 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23012609 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 23012801 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23012973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23013009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23013026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23013334 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23013496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23013792 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23013804 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23013833 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23013872 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23013936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23014583 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23014637 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23015712 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23015756 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 23016083 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 23016262 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23016336 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23016572 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23016702 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23016832 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 23016846 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 23016849 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23016868 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23016880 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23016898 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23016971 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 23017102 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23017116 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23017141 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 23017226 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23017255 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23017263 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23017268 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 23017430 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23017434 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23017649 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23017751 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 23017755 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23017791 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 23017792 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 23018057 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23018169 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23018249 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23018345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23018427 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 23018449 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23018485 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23018574 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 23018659 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23019068 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23019088 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23019699 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23019702 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23019723 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23019733 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23019849 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 23019947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23020191 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23020272 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23020531 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 23020578 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23020590 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23020608 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23020636 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23022213 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23022259 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 23022429 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23022552 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 23022625 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23022628 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23022865 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 23022928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23023190 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23023193 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23023337 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23023340 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23023357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23023406 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23023416 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23023418 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 23023474 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23023493 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 23023582 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 23023598 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23023830 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 23024126 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 23024140 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 23024141 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 23024143 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23024182 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 23024248 T G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 23024255 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 23024789 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23024833 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23025309 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23025412 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23026011 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23026034 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23026070 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23026726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23027101 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 23027202 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 23027203 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 23027641 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 23027667 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23027725 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 23027922 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 23027952 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 23028301 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 23028333 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 23028334 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 23028366 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 23028376 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 23028414 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 23028432 C A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 19 23028462 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 19 23028623 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 23028719 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 23029092 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 23029094 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 23029169 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 23029176 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 23029189 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 23029311 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 23029399 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 19 23029570 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 23029587 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23030097 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23030166 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 23030350 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23030479 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 23030777 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23031023 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23031063 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 23031217 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23031526 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 23031573 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 23031630 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23031680 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 23031819 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23031860 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23031931 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23032336 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23032341 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23032576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23032679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23032730 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23032796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23032907 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23032934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23033121 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23033401 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23033692 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23033718 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23033737 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23033940 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 23034115 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23034179 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 23034266 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23034278 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23034342 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 23034393 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23034581 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23034598 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23034793 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23034838 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23034922 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23034958 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 23034989 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23034992 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23035012 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23035017 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23035063 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23035081 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 23035261 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23036179 A G N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 19 23036300 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 19 23036448 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 23036532 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23036546 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23036572 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23036769 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23036846 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23036847 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23037206 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 23037230 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23037329 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23037443 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23037446 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23037548 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23037573 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23037846 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23038457 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23038884 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 23038914 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23038963 G T Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 23039192 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23039214 T A Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 23039388 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 23039394 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 23039461 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 23039493 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23039692 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 23039783 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 23040204 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23040205 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23040266 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23040581 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23040689 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 23041005 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23041043 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23041054 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23041077 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23041085 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23041556 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 23041679 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23041694 A C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23041719 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23041759 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23041832 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 23042195 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23042459 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23042462 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23042489 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 23042545 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 23043165 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 23043764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23043967 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23044941 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 23045663 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23045925 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23045935 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 23045964 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 23046514 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 19 23046873 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23046906 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23047012 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23047097 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 23047310 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23047362 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23047588 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23047644 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23047741 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23048002 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23048025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23048474 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 23048754 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23049287 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23049288 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23049292 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23050788 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 23050819 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 23050903 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23051662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23052870 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23056887 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23057004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23057460 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23057499 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23057620 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 23057635 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 23057710 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 23057759 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 23057944 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 23058096 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 23058098 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 23058103 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 23058124 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23058268 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23058286 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23058451 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23058452 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23058489 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23058532 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 23058594 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 23058690 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23058869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23058890 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23059004 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23059026 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 23059054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23059165 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23059260 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23059397 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 23059408 A G Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 23059513 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23059637 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 23059638 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 23059687 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23059701 T G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23059837 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23059845 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23059921 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23060107 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 23060179 A G Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 23060705 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23060852 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23061159 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23063864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23064615 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 23064839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23067161 T A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23067885 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 23068487 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23069020 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 23069590 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 23070946 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 23072248 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23072344 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23073010 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 23074154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23074189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23074423 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23074664 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23074716 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23074744 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23075229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23075757 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23075808 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23076918 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23078322 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23078529 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23078829 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23078862 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23078863 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23082875 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 23083155 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23083359 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23083376 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23083419 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23083451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23083660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23083851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23085182 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23085634 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 23086157 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23086285 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23086929 T C N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 19 23087142 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 19 23087341 C T N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 19 23087409 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 23087489 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23087522 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 23087532 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 23087706 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23087796 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 23087878 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23087957 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23088043 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 23088058 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 23088066 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 23088098 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23088169 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 23088184 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 23088276 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 23088622 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 23088648 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23088649 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 23088674 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23088982 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23089034 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 23089040 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23089047 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23089069 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 23089090 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23089106 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23089264 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 23089333 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 23089620 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 23089632 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 23089643 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23089890 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 23089896 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 23089897 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 23089898 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 19 23089925 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 23090084 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 23090085 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 23090132 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 23090354 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 19 23090406 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 23090453 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 23090466 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 23090738 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 23090741 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 23090757 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 23090790 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 23090970 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 23091024 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 23091047 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 23091059 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 23091514 A C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 23091516 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 23091593 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 23091595 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 23091748 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 23091749 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 23091925 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 23092386 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 23092467 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 23092499 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 23092883 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23093312 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 23093501 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 23093722 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 23093740 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 23094037 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 23094047 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 23094084 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 23094114 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 23094265 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 23094371 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 23094523 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23094791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23095290 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23095291 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23095481 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23095548 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23095593 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23095594 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 23095609 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 23095838 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 23095892 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23095895 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 23095963 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 23096029 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 23096152 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23096154 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 23096157 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23096173 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23096448 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23096613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23096651 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 23096717 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 23097036 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23097318 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23098556 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23098854 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23098966 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23099647 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23099663 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23102496 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 23107188 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 23108362 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23110107 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23110229 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23110755 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 23110770 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 23110800 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 23111018 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 23111133 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 23111335 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 23111448 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23111460 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 23111462 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 23111593 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23111639 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23111745 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 23112049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23112405 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 23113096 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 23113348 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23113351 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 23113406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23113459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23113505 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23113904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23114244 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 23115292 A G N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 19 23115323 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 23115414 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 23115419 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23115654 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 23115691 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 23115696 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 23115877 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23116150 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 23116578 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23116864 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23116883 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23116974 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 23117206 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 23117211 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 23117217 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 23117318 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 23117353 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 23117380 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 23117426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23117539 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 23117626 C G Y N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 19 23117955 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 23117978 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 23117987 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 23118099 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 23118223 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 23118281 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 23118325 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 23118345 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 23118608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23118654 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 23118896 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 23119281 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 23119285 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 23119386 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 23119410 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 23119792 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 23120016 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 23120332 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23120411 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23120777 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23120906 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 23120967 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 23121052 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 23121075 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 23121173 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 23121262 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 23121306 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 23121454 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 23121538 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23121588 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 23121589 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 23121651 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 23121745 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 23121750 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 23121756 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23121776 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 23122971 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23122992 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 23123115 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23123171 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23123177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23123183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23123209 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 23123603 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 23123648 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23124142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23124400 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 23124757 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23124784 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 23124796 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 23124803 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 19 23124847 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 23125039 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23125059 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23125172 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23125472 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23125820 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 23125842 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23126004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23126028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23126032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23126049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23126223 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23126283 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23126673 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23126868 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23126869 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23126945 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23127456 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23127469 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23127545 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23127613 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23127824 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23127930 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 23128187 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23128261 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 23129342 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23129378 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23129471 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23129731 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23130092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23130284 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23130636 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23130739 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23131104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23131536 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 23131813 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 23131925 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 23131943 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 23131976 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23132146 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23132161 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23132209 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23132249 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23132301 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23132337 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23132413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23132414 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23132545 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 23132606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23132646 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23132647 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23132679 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23132747 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 23132939 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23132954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23133043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23133073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23133085 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23133248 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 23133362 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 23133365 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 23133671 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 23133691 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 23133692 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 23133704 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 23133754 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 23134266 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 23134287 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 23134307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23134359 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 23134511 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 23134738 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 23134857 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 23134881 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 23134959 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 23135020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23135289 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 23135442 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 23135444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23135446 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 23135667 C A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 23135987 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23136061 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23136064 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23136262 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23136380 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23136648 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23136708 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 23136746 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23137336 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 23137919 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 23137991 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23138087 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23138253 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23138261 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23139359 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23139530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23139887 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 23140005 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23140169 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 23140216 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23140398 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 23140420 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23140813 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 23140898 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23140919 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23140923 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23141016 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23141042 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23141234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23141576 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23141582 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23141634 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 23141670 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23141991 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 23142070 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 23142085 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 23142092 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23142134 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23142483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23142496 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 23142499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23143348 T G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23143833 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 23144122 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 23144372 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23144858 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23145165 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23145207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23145213 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23145233 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 23145247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23145833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23146055 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23146383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23146600 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 23146689 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23146870 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23147082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23147210 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23147387 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 23147399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23147447 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23148143 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 23148363 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23148632 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23148756 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23149271 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23149310 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23149577 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23149974 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23149995 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 23150001 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23150006 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 23150009 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23151094 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23151134 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 23151341 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23152698 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23153563 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 23153569 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23154141 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 23154590 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 23154783 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23155241 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23158733 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23158755 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23158791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23158792 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23158817 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23159032 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23159033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23159154 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23159339 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23160239 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23160296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23160422 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23160550 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 19 23160673 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 23160675 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23160796 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 23160799 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 23160810 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 23160885 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 23160942 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23161073 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23161141 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 23161149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23161188 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23161218 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23161457 A G Y Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 19 23162154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23162484 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 23162517 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23163417 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23163445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23164419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23164648 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 23164826 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 23164968 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 23165052 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23165117 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 23165122 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 23165132 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 23165134 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 23165219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23165241 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 23165267 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23165534 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 23165984 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 23166288 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 23166501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23166691 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 23166767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23168057 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23168915 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23170909 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23174296 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 23177379 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23178009 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23180375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23180495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23180828 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23181370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23181770 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23184304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23186374 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 23186431 T C N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 19 23188353 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23188401 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23189353 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 23190626 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23190630 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 23191337 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23191451 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23193914 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23195920 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23196059 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23198879 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 23201589 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23201625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23206371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23208077 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23209704 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23209706 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23209867 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 23209895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23215792 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23217705 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23217764 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23218790 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23220384 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23220385 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23221812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23222995 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23223309 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23223902 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23224972 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 23225005 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 23225042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23225309 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23225336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23225817 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 23225852 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 23228123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23228811 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23232344 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23232930 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 23233108 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23234155 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23234175 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 23235182 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23235744 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23236013 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 23236176 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 23236329 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 23236419 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23236458 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 23236539 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 23236584 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 23236643 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 23236669 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 23236843 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23236877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23236886 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23236946 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23237002 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 23237004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23237017 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23237561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23237791 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23238109 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 23238289 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23241068 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23241385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23243554 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 23243855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23244123 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 23244163 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 23244173 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 23244242 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 23244297 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 23244349 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 23244352 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 23247699 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23247783 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 23247856 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 23247862 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 23247985 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23248025 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 23248062 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 23248064 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 23248075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23248125 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 23248157 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 23248203 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 23248355 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23248395 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 23248825 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 23248874 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 23249488 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 23250072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23250610 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 23251479 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 23251892 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 23251911 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23251921 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23252088 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 23253293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23254635 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 23254778 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 23256849 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23256914 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23258130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23258165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23259516 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23259559 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 23259659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23259694 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 23260439 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 23260455 C G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 23260703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23260788 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 23260864 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23260937 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 23261592 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 23269128 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23269778 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 23269826 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 23269963 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 23270057 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 23270116 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 23270403 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 23270443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23270503 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 23270655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23270666 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23270701 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 23271231 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23271325 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 23271559 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 23271678 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 23271732 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 23271749 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 23271766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23271779 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 23271846 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 23271877 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 23271968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23272155 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23272192 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23272380 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23272422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23272540 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23272568 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 23272626 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 23272698 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 23272747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23272890 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23272948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23273030 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 23273060 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23273107 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23273228 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23273234 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23273239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23273379 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 23273558 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23273570 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 23274238 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 23274575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23274584 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23274648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23274670 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23274696 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 23274697 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 23274710 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 19 23274720 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 23274721 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 19 23274734 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 23274837 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 23274841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23274934 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 23274958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23275087 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 23275098 C A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 23275188 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 23275542 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 23275567 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 23275745 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23275969 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23276036 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 23276091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23276207 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 23276326 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 23276446 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 23276632 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 23276708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23276735 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23276780 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 23276852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23276908 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 23276970 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23276985 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 23277367 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 23277368 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 23277572 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 23277798 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 23278286 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23278502 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23278799 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23278952 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23279183 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 23279250 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23279282 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23279931 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23280071 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 23280302 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23280520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23280648 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23283102 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23283265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23283505 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23283791 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 23284941 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 23287137 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23287304 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 23287399 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23287619 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 23288756 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23288771 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23289434 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 23289864 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23290037 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 23290089 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23290102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23290200 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23291256 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 23291310 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 23291587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23292351 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23293060 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23293582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23294013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23294705 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23297371 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23297760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23298172 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23302395 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 19 23302431 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23302511 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23302972 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23303965 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23305292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23305582 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 23307272 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23307943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23308983 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23310132 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 23310968 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 23312608 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23312609 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23313064 T C N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 19 23313669 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23316266 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 23317309 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23317556 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23322302 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 23329012 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 23329073 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 23329666 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 23331031 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 23331844 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23335739 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 23335785 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23336504 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23336705 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23336910 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23337045 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 23337076 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23337083 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 23337099 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 23337109 C A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23337118 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23337150 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23337209 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23337261 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23337262 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23337316 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23337368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23337560 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23337654 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23337863 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23337964 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23338223 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 23339005 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 23339428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23339574 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 23339861 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23340372 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 23340574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23340931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23340957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23341061 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23341281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23342307 T A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23342699 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23342731 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23342738 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23342968 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 23343522 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23343632 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 23343703 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23343729 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23343923 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 23344819 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 23345341 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 23345668 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23345749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23345837 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 23346249 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 23346385 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 23347381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23349838 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23350588 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 23350763 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 23351077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23352190 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23353262 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 23354382 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23357939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23357978 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23359646 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 23359654 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 23359721 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 19 23359731 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 23360017 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 23360082 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 23360181 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 19 23360182 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 23360199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23360200 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23360246 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 23360253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23360261 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23360276 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 23360286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23360291 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23360537 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23360645 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23360739 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23360959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23361023 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23361036 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23361040 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23361044 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 23361099 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23361120 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 23361234 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23361358 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 19 23361453 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 19 23361544 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 23361600 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23361617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23361649 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 23361716 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 19 23361764 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 23361799 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 23361840 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 23363926 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23364175 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 23364573 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 23365692 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23369253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23369496 A C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23369578 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23369689 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 23369972 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 23369981 T A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 23370517 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 23370529 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 23370562 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23370569 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23370573 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23370583 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23370632 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23370706 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 23371346 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23371422 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23371557 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 23371718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23372246 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 23372400 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23373439 T A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 23374050 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 23374082 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23374281 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23374288 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 23374364 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23374581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23375259 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23375300 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 23375339 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23375408 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23375431 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 23375460 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 23375478 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 23375481 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 23375519 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 23375601 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23375684 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 23375696 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23375703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23375818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23376023 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23376113 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 23376303 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 23376348 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 23376398 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 23376452 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 23376774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23377117 G A N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.230769230769231 0.0769230769230769 0.692307692307692 7 19 3 1 9 19 23377241 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 23377260 C T Y Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 19 23377460 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23377498 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23377559 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23377807 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 23377817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23377834 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23377847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23378092 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 23378208 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23378227 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 23378348 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 23378489 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23378543 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23378635 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23379511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23379512 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23379862 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 23379922 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 23379938 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23379953 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 23379955 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 23379960 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 23379973 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 23379976 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23379979 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 23380066 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23380094 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 23380323 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23380324 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 23380599 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23380660 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 23381176 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 23381455 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 23381496 G A N Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 5 5 2 1 2 19 23381789 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 23381796 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 23381873 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 23381952 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 23381994 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 23382384 T C Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 19 23382395 A T N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 19 23382403 T C N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 19 23382702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23384599 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23385842 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 23385864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23386057 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 23386091 G C Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 23386121 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 23386271 G A Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 23386520 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 23386579 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23386720 A T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23386999 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 23387177 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 23387481 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23387595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23387717 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23388016 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 23388040 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 23388121 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23388321 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 23388337 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 23388350 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 23388599 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23388682 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23388743 A C Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 23388972 C T Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 23388983 A G Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 23389042 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 23389070 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23389189 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 23389276 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 23389396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23389987 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23391066 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23391084 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23391157 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23391635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23391734 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23391755 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23391791 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23392087 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23392160 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23392206 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 23392236 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23392311 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 23392397 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23392436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23392614 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23392634 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23392734 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 23392747 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23392761 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 19 23392785 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23393081 C T Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 19 23393085 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 19 23393386 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23393409 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23393536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23393596 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23393612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23395919 T G Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 23396098 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23396379 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 19 23396439 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 23396530 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23396537 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23396556 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 23396557 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23396774 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 23396794 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23397186 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23397389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23397789 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23398171 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23398439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23399005 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23399144 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 23399914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23400041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23400396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23400555 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23401044 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 23401117 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 23401127 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 23401271 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 23401278 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 23401340 G A N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 19 23401397 G C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 19 23401499 C A N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 19 23401504 T C N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 19 23401505 T C N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 19 23401536 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23401551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23401594 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 23401662 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23401761 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 23401807 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23402098 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23403709 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23405202 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23405358 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23405677 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23405728 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23405742 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23406665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23406818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23407038 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 23407307 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 23407729 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 23408054 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 23408088 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 23408185 A C Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23408533 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 23408873 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23408920 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 23408988 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23409125 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23410140 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23410197 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23410225 A C Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 23410249 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23410424 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 23410436 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 23410572 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23410575 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23410606 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23410646 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23410785 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 23410964 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23410977 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 23411138 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23411399 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23411990 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23412199 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 23412378 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 23412393 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23412569 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 23412699 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 23412786 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 23412869 A C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 19 23412930 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 23413207 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 23413236 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 23413573 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 23413584 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 23413736 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 23413750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23413852 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 23414757 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 23414983 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 23415074 A C N N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 19 23415392 G A N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 19 23415552 G T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 23415890 T A N N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 19 23415913 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 7 5 3 1 2 19 23416084 A G N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 9 5 4 1 2 19 23416103 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 9 5 4 1 2 19 23416813 A G N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 19 23416975 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 23417013 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 23417131 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 23417283 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 23417287 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 19 23417308 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 23417347 A G N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 19 23417624 G T N N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 5 5 2 1 2 19 23417650 G T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 23417663 A C N N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 19 23417751 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 4 8 2 0 4 19 23417766 C T N Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 5 9 2 1 4 19 23417781 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 19 23417802 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 19 23417868 T A N N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 19 23418007 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 23418060 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23418063 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 23418090 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 23418153 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 23418160 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 23418196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23418837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23419149 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 23419243 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 23419380 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23422184 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 23423114 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23423252 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 23423286 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 23423677 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23423967 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23424122 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 23424151 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23424166 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23425209 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 23425260 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 23425458 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23425608 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 23425651 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 23425674 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 23425708 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 23425932 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 23426023 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 23426133 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 23426176 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 23426251 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 23426274 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 23426289 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 23426304 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 23426444 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23426508 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23426561 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23426657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23426702 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23426718 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 23426720 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 23426726 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 23426727 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 23426805 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 23427008 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 23427062 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 23427083 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 23427139 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 23427227 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 23427241 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 23427243 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 23427276 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 23427282 A C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.1875 0.0625 0.75 7 25 3 1 12 19 23427379 C T N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 19 23427408 C T N Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 19 23427547 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 23427575 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 23427576 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 19 23427625 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23427627 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 23427673 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 23427678 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 23428009 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 23428196 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 23428245 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 23428360 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 23428417 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 23428600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23428837 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23429149 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 23429333 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23429355 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23429370 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23429399 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23429418 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 23429716 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 23429819 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23429836 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23429842 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23429874 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23429919 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 23429970 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23430059 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23430650 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23430993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23431355 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 23431534 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 23431618 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23431640 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 23431676 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 23431859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23432155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23432225 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 23432373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23433046 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 23433161 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 19 23433985 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23434100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23434144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23434428 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 23435050 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 23435088 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23435224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23435303 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 23435368 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 23435399 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 23435499 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23435500 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23436187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23436372 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23436373 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23436379 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23436528 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 23436531 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 23436612 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23436616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23436644 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23436727 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 23436775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23436828 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 23436926 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 23437071 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23437075 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23437116 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 23437121 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 23437422 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 23437513 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23438036 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23438248 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 23438305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23439145 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 23439208 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 19 23439226 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 23439243 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 19 23439247 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 19 23439286 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 19 23439364 T C N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 19 23439560 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 23439574 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 23439594 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 23439647 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 23440048 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 23440325 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 23440345 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 23440374 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 23440428 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 23440527 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 23440533 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 23441148 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 23441612 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 23442147 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 23442760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23443629 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 23443731 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 23444721 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23445067 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 19 23445088 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 23445263 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 23445314 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 23445452 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23446238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23447886 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23448393 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 23448463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23449027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23449916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23450861 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 23450925 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 23451030 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 23451037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23451218 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 23451873 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 23452500 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 23452534 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23452592 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 23452710 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 23452776 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23452829 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 23452931 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 23452957 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 19 23452977 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 23453148 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 23453149 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 23453169 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 23453581 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 23453590 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 23453804 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 23453829 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 19 23453832 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 19 23453850 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 23453888 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 23454171 A C N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 19 23454285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23454334 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 23454336 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 23454521 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 23454638 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 23454837 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 23454857 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23455210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23455234 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 23455242 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 23455410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23455536 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 23455684 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 23455743 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 23456852 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23457993 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23458679 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23458942 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23459104 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 23459105 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 23459805 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23460627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23460803 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23461855 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 23462004 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 23462218 T C Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 23462238 C A Y N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 19 23462279 T A Y N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 19 23462512 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 23462570 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 23462581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23462585 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 23462589 G T Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 23462683 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 23462754 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23462761 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 23462819 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23462826 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23462895 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 23462910 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23463047 T G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 23463171 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 23463258 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 23463517 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23463540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23463562 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 23463756 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 23463760 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 23463761 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 23463801 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 23464757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23464956 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 23465146 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 23465178 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 23466491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23467872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23467890 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 23468341 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23468500 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23468712 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23468842 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23469215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23469314 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23469454 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23470401 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 23470402 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 23471233 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23471242 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23471305 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23471469 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 23471759 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 23472589 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23472765 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23472773 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23472812 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23473715 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 23473721 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 23475460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23475827 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 23475835 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23476100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23476223 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23477231 C T Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 23477707 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 23479003 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 23479192 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 23479241 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23479386 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23479411 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23479457 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23479685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23479701 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23479726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23479739 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23479785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23479946 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23480958 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23481032 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23481070 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 23481112 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 23481117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23481251 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23481914 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23481969 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 23481987 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 23482174 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23482201 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 23482242 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23482308 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23482331 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23482565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23482570 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23482620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23482657 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23482738 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23482826 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23482828 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23482857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23482975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23483099 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 23483230 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 23483627 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 23483966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23483987 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23483992 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23484229 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 23484286 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23484287 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23484550 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 23484623 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 23484684 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23484797 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 23484856 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 23484969 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23485002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23485096 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23485306 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 23485490 A T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 23485494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23485660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23485782 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 23485786 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23485829 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 23485854 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 23485856 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 23485873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23485950 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23486074 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23486086 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23486090 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23486194 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 23486307 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23486673 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23486694 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23486766 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23486789 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23486913 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23486930 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23487046 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23487059 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23487225 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 19 23487265 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 23487369 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 23487436 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 23487468 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 19 23487473 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 19 23487513 T G N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 19 23487610 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 23487616 C T N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 19 23487837 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 23487879 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 23487888 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23488066 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 23488111 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 19 23488229 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 23488299 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23488362 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23488830 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 23488838 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 23488844 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 23489062 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23489075 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23489112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23489812 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23489858 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23489960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23490226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23490276 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23490361 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23490369 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 23490451 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23490488 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23490498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23490503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23490674 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 23490753 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23490757 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23490763 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23490841 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23490984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23491653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23492215 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23492315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23492850 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 23492933 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23492985 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 23493221 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23493354 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23493384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23494075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23494935 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 23495088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23495111 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 23495116 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23495131 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 23495310 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23495744 A C N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 19 23495845 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23495967 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 23496095 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23496302 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 19 23496309 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 19 23496498 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 23496601 G C Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 23497271 T A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 19 23497281 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 19 23497403 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 23497421 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 23497491 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 23497673 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 23497865 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 23497870 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 23497944 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 23498131 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 23498223 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 23498231 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 23498294 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 23498476 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23498567 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 23498728 G T Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 23498746 C G Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 23498781 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 23498910 G T Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 23499142 C G Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 23499457 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 23499466 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 23499510 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 23499593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23499673 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 23499729 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 23500001 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 23500014 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 23500033 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23500146 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23500372 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 23500451 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23501649 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23501657 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 23501659 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 23501810 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 23501951 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 19 23502239 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23502565 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23502597 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23502759 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 23502875 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 23502880 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 23502893 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 23502917 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23503011 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 23503061 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 23503220 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 23503237 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 23503268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23503498 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 23503697 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23503710 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 23503744 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 19 23504230 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 23504351 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 23504547 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 23504617 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 23504686 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 23504835 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 23504838 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 23504879 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 23504898 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23504936 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 23505332 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 23505351 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 23505491 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 23505548 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 23505582 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 23505616 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 23505671 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 23505672 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 23505773 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 23505870 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 23505895 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 23505906 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 23505923 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 23506102 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23506168 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 23506171 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 23506185 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 23506212 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 23506219 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 23506411 G C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 23508328 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23508909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23509205 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 23509315 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23509371 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23509431 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 23509500 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 23509513 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23509518 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23509687 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 23509745 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 23509763 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23509901 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23510720 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23510874 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23510957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23510966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23511209 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23511368 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 23511369 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 23511403 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 23511509 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 19 23511702 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 23511706 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 23511719 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 23511769 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 23511774 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 23511812 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 23511835 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 23511847 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 23511864 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 23511965 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 19 23512139 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 23512226 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 23512264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23512361 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23512398 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 23512409 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 23512685 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23512813 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 23512878 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 23512941 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 23512965 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 23512975 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 23513274 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23513337 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 23513479 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23513482 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 23513541 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 23513961 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 23514194 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 23514343 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 23514423 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 23514426 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 23514602 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23514621 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 23514641 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23514999 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 23515172 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23515225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23516850 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23517201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23518333 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 23518644 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 23518696 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23518887 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23518926 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23519367 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 19 23519422 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23519431 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23519444 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 23519502 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23519614 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23519627 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23519710 G T N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 19 23519774 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 23519775 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 23519884 T C Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 23519910 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 23520044 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 23520118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23520136 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 23520151 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 23520379 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 23520396 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 23520561 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 23520644 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 23520700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23520751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23520752 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23520770 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 23520777 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23520778 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 23520782 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23520799 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 23520836 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23520934 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23520937 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23521266 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23521489 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 23522056 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 23522571 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23522715 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23522831 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23522890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23522926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23522945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23523322 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 23523520 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 23523554 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 23523592 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 23523706 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23523832 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23523909 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 23523966 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 23524052 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 23524160 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 23524202 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 23524245 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 23524329 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 23524459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23524547 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 23524567 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 23524667 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 23524734 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 23525158 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 23525262 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 23525317 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 23525439 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 23525487 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 23525551 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 23525656 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 23525862 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 23525941 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 23526000 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23526204 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 23526451 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 23526552 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 23526608 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 19 23526697 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 23527097 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 23527222 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 23527280 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 23527490 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 23527640 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 23527672 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23527697 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 23527791 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 23527806 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23527816 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23527836 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 23527955 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23528184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23528225 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 23528238 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 23528243 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23528394 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23528477 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23528538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23528753 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 23528966 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23529043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23529101 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 23529444 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 19 23529460 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 19 23529515 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 23529563 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 23529709 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 19 23529761 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23529764 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23529979 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 23529993 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 23530091 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23530126 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 23530244 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 23530991 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 23532204 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23532363 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 23532364 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 23532404 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23532406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23532407 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 23532448 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 23532531 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 23532532 C A Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 23532553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23532691 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23533051 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 23533186 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23533257 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 23535913 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 23536193 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23536196 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23536248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23537035 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 23537047 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 19 23537148 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 23538258 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23538291 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 19 23538294 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 19 23538303 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 19 23538536 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 23538651 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 23538766 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 23538797 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 23538866 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 23538892 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 23538893 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 23538898 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 23538908 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 23538920 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 23538930 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 23538948 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 23538950 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 23538954 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 23538971 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 23538974 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 23538981 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 23538990 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 23539021 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 23539027 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 23539050 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 23539227 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 23539273 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 23539281 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 23539293 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 23539301 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 23539308 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 23539326 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 23539353 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23539364 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 23539370 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 23539373 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 23539397 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 23539445 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 23539489 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 23539521 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 23539523 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 23539531 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23539568 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 23539574 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 23539615 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 23539783 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 23540147 C T N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 19 23540175 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 19 23540268 A T N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 19 23540716 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 19 23540902 G C Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 23541036 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 23541038 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 23541296 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 23541319 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 23541449 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23541452 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23541657 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 23541665 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23541698 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23541923 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 23542212 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23542236 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 23542390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23542921 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23542956 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23543424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23543460 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23544184 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23544348 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23545116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23545197 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 23545645 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23545658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23545672 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23545910 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23546278 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23546453 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23546668 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23546701 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23546702 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23546733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23546750 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 23547133 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 23547246 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23547358 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 23548239 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 23548276 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 23548348 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 23548371 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 23548584 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23548621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23548755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23549023 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 23549031 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 23549370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23549420 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 23549485 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 23549941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23549956 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 23550030 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23550051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23550078 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23550142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23550157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23550166 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 23550400 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23550417 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23550439 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23550523 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23550556 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 23550566 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 23550577 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23550584 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23550594 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23550638 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 19 23550867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23551298 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 23551570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23551628 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23551998 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23552099 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 23552695 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23553110 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23553989 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 23553996 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 23554224 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23554636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23554731 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23554734 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 23554946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23555367 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 23555633 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 23556287 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 23557743 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 23558222 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23558258 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23558460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23560059 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23560399 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23560426 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 23560450 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 23560454 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 23560488 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 23560913 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23560946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23560990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23561012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23561118 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23561149 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 23561377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23561434 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23561441 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 23561594 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23561595 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23561824 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 23561825 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 23561894 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 23562064 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 23562137 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 23562392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23562612 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23562644 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 23562740 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23562757 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23562797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23562801 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 23562879 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 23563040 C A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 19 23563064 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 23563305 C T Y Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 19 23563467 T C N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 11 5 5 1 2 19 23563524 T A N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 19 23563712 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 23563746 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 23564107 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23564188 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23564525 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 23564605 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23564648 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 23564806 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23565428 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 23565604 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 23566023 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23566169 C G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 23566218 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23566257 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 23566433 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 23566516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23566617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23566625 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23566638 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 23566690 G T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 23566693 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 23566718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23566744 T A Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 23566759 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 23566892 G T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 23566927 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 23567073 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 23567239 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 23567322 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 23567357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23567610 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23567646 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23567664 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23567681 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23567814 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23568479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23568690 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 23568825 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23569051 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23569151 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23569289 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 23569302 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23569380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23569427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23569532 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23569620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23569624 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 23569640 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23569663 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 23570538 A G N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 19 23570624 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23570634 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23570706 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23570738 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23570791 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23570821 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23570880 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23571021 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23571081 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23571294 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 23571366 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23571565 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23571615 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 23571617 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23571686 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23571694 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23571716 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 23571808 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23571923 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 23571932 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23572198 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23572310 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23572392 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23572418 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23572429 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23572468 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 23572546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23572653 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 23572699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23572895 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23572972 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23573010 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23573011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23573069 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 23573234 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23573469 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23573474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23573479 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23573634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23573641 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23573744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23573810 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23574115 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 23574122 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23574158 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23574224 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 19 23574263 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 19 23574378 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 23574694 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 23574696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23574756 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 23575081 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 23575136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23575192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23575293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23575343 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 23575417 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 23575529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23575558 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 23575627 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23575672 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 23575774 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 23575777 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23576010 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23576021 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 23576197 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23576331 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23576335 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23576702 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23576756 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23576942 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23576970 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23577045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23577071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23577308 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23577311 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23577461 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23577605 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23577720 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 23577766 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 23577847 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23578039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23578092 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23578320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23578368 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23580161 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 23581545 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 23581580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23581581 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 23581658 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 23581669 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 23581868 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 23581871 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 23582117 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 23582306 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23582392 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 23582478 T G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 23582511 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23582738 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 23582740 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 23582804 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23582828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23582850 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 23582936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23582941 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 23583195 C A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 23583200 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 23583346 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23583429 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 23583474 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23583509 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 23583689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23583692 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23583723 A C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 23583731 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23584010 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 23584014 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23584028 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23584086 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23584482 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23584537 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23584719 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23584857 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 23585019 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23585110 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 23585322 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 23585415 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 23585566 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 23586105 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23586163 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23586261 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23586377 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 23586495 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23586499 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 23586508 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 23586649 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23586790 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 23586816 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23586820 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23586834 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23587659 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 23587741 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23587750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23587843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23588051 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23588241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23588244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23588251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23588550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23588795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23589173 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23589224 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23589291 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23589325 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23589750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23589799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23590207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23590372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23590398 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23590893 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 19 23591020 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23591279 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 23591304 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 23591408 G C Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23591506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23591562 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23591772 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23592054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23592188 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23592256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23592429 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 23592557 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23593097 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 23593434 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23594132 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 23595317 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23595318 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23595409 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 23595619 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 23595671 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23595681 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23596085 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23596214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23596363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23596442 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23596477 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 23596701 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 23596751 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 23596757 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23596804 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23597057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23597458 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 23597467 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23597538 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23597894 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 23598112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23598669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23598752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23599357 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 23599675 T A Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 23599676 G C Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 23600578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23601060 T C Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 19 23601285 T C Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 23601376 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 23601380 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23601436 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23601454 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23601820 A G Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 23601981 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 23604629 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 23604697 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 23604700 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 23604718 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 23604780 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 23604781 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 23604789 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 23604823 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 23604824 C G N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 19 23604829 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 23604833 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 23604853 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 23604921 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 23604995 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 23605011 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 23605024 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 23605028 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 23605072 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 23605084 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 23605089 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 23605116 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 23605125 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 23605138 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 23605160 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 23605277 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 23605369 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 23605485 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 23605528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23605601 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 23606099 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23606846 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23606861 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23607183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23607184 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23607257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23607338 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23607355 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 23607480 T G Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 23607484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23607531 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 23607662 T C Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 23607793 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23608129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23608261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23608264 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23608265 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23608287 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23608398 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23608569 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 23608570 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 23608654 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23608792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23608793 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23608874 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23608939 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 23608961 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23609122 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 19 23609147 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 23609193 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 23609338 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23609373 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23609932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23610229 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23610576 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 23610665 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23610668 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 23611117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23612064 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23612279 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23612922 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 23613210 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23613620 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 23613782 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23613825 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23613929 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23613930 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 23614239 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 23614257 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23614437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23614689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23614893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23615023 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23616335 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 23616839 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23616874 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23617131 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 23617142 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 23617195 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23617259 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 23617276 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 23617349 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 23617434 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 23617474 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23617486 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 23617490 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23617693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23617709 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23617730 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23617847 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 23617896 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23618073 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 23618237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23618541 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23618823 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23620777 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23620791 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23620815 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23620821 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23620876 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 23620894 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23623556 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23623779 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 23623994 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 23624116 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23624414 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23624416 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23624426 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 23624427 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 23624682 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23624706 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 23624723 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23624763 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 23624773 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 23624948 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 23625013 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 23625195 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 23625287 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23625393 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 23625437 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 23625582 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 23625688 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 23625721 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 23626900 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 19 23627961 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23628069 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23628457 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 19 23628736 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 23628737 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 23628865 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 23629008 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 23629031 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 23629708 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 23629825 T C N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 19 23630082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23630098 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23630101 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23630122 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23630123 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23630356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23630511 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23630670 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 23630671 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23630704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23631792 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23634845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23635349 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23635377 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 23635384 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 23635500 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23635508 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23635904 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23636129 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23636243 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23636357 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 23636454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23636563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23636760 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23636838 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23636850 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23637239 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23637538 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 0.142857142857143 0.214285714285714 20 8 9 2 3 19 23637781 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 23637866 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 23638030 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 19 23638271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23638654 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 23638660 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23638720 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23638764 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 23638887 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 23638888 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 23638961 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 23638966 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 23638989 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 23639065 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 23639261 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 23639376 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 23639381 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 23639550 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 23639572 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 23639797 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 23639994 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 23640021 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23640047 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23640209 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23640232 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23640253 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 23640254 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23640274 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 23640698 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 23640989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23641175 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23641328 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 23641487 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 23641556 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23641975 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 23642018 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 23642047 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 23642087 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 23642104 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 23642126 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 23642127 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 23642457 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 23642823 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 23642885 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 23642888 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 19 23643145 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 23643215 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23643298 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 23643533 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 23643583 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 23643803 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 23643840 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 23644335 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 19 23644893 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 23644911 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 23645023 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23645203 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 23645586 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23645712 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 23646552 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23646745 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 23647385 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 23647466 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23647539 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 23647908 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 23648096 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 23648120 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 23648273 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 23648427 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 23648559 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 23648722 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 23648727 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23649083 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23649341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23649858 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 19 23649874 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 23650369 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 23650374 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 23650471 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 23650503 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 23650637 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23650739 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 19 23650889 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23651048 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 23651125 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 23651145 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 23651371 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23651405 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 23651478 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 23651485 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 23651559 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 23651575 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 23652044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23652113 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 23652172 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 23652195 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 23652260 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23652318 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 23652345 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 23652383 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 23652410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23652691 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 19 23652747 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 23653032 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 23653089 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23653234 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 23653267 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23653555 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 23653673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23653716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23653753 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 23653895 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23653912 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23653999 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 23654062 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23654193 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23654271 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 23654378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23654481 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 23654668 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 23654704 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 23654732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23654762 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23654822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23654901 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 23654934 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 23654957 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23655135 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23655357 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 23655666 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23655682 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23655933 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23655971 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 23656151 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 23656181 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 23656184 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 23656199 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 23656283 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 23656451 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 23656454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23656558 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23656598 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 19 23656632 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 23656700 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23656752 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 23656771 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23656849 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23657008 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 23657274 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23657534 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23657939 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23658070 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 23658080 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23658242 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23658439 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 23658457 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 23658979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23659044 G C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 19 23659089 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 23659521 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23659615 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 23659722 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 23659738 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 23659963 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23659970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23660040 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 23660323 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23660327 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 23660394 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 23660438 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 23660568 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23660780 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23660835 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 23661019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23661096 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 23661145 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 23661337 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 23661386 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 23661431 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23661559 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23661579 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 23661656 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 23661699 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23661754 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 23661913 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23661973 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 23661993 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 23662292 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 23662529 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23662561 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 23662646 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23662695 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 23662772 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 23662800 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 23662916 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23663247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23663793 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 23663887 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 23664029 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 23664285 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 23664400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23664476 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 23664507 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 23664513 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 23664529 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 23664542 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 23664770 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 23665103 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 19 23665141 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 23665202 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23665208 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 23665251 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23665295 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23665299 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23665673 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 23666080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23666520 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23666646 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23666707 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23666944 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 23667079 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 23667345 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 23667346 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23667353 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 23667498 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 23667703 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 23667981 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23668096 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 23668195 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 23668207 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 23668216 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 19 23668422 T A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 19 23668551 G C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 19 23669306 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 23669376 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23669596 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 23669911 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23669943 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 23670208 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23670246 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 23670294 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 23670419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23670424 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 23670470 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23670478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23670491 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 23670545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23670632 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23670664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23670696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23670866 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23670977 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23671020 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23671255 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23671405 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 23671419 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 23671501 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 19 23671508 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 19 23672308 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23672318 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23672358 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 23672416 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 23672436 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 23672462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23672645 G A N Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.6 0 0.4 6 4 3 0 2 19 23672899 C A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 23672913 T C N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.5 0 0.5 4 4 2 0 2 19 23673027 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 23673131 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 23673358 C A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 23673370 C T Y Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.4 0 0.6 4 6 2 0 3 19 23673506 A G N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.5 0 0.5 4 4 2 0 2 19 23673555 C T N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.4 0 0.6 4 6 2 0 3 19 23673611 G C N N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 5 5 2 1 2 19 23673672 A C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 23673684 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 23673884 G C N N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.5 0 0.5 4 4 2 0 2 19 23675509 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 19 23675592 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 19 23675675 C T N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.5 0 0.5 4 4 2 0 2 19 23676171 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 23676302 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 19 23676815 C A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 23678401 A T Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 19 23678420 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 23678557 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23678769 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23678955 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23679015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23679020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23679038 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23679072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23679162 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23679593 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23679620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23679703 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23679743 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 23679777 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 23680071 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 23680296 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23680984 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 23681186 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 19 23681278 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 23682062 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23682330 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 23682393 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23682438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23682461 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 23683464 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23683944 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23686406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23686641 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23687096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23691067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23695518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23698044 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 23698533 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23699279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23700653 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23703362 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 23704061 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 23704163 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 23704165 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 23704579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23704652 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23704653 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23704664 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23704684 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23704692 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23705086 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23705104 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23705395 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 23705429 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23705493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23705501 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23705688 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23705740 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23705819 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23705823 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23705858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23706012 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23706018 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23706258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23706316 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23706559 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23707066 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23707184 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23707210 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23707277 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23707308 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23707396 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23707759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23707835 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23707842 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23707932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23707944 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23708001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23708093 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23708308 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23709107 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23709114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23709143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23710357 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 23710434 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23710460 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 23710647 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 23711493 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23711516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23711600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23711601 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23711656 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23711749 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23711752 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23711834 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23711873 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 23711874 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 23711898 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23711948 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 23712031 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 23712052 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 23712083 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 23712084 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 23712089 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23712092 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23712127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23712143 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23712147 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23712149 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23712221 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23712261 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23712368 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23712522 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23712662 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23712887 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23712949 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23713089 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23713119 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23713318 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23713491 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 23713580 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23713845 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23714024 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23714025 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23714063 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23714241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23714445 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 23714570 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 23714644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23715119 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23715127 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23715144 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23715166 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23715182 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 23715246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23715265 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23715310 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23715337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23715399 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23715561 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23715749 T A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 23715750 T A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 23715768 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23715887 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 19 23716592 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23716661 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23716701 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 23716902 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23716914 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23717078 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23717624 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23718552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23718815 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23720032 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 23720430 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 23720689 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23720775 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23720911 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23720955 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23720979 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23721002 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23721070 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23721356 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23721469 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23721532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23721537 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23721646 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23722159 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23722179 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23722189 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23722263 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23722300 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23722301 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23722303 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 23722356 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23722573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23722663 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 23722697 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 23723316 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23725599 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23726490 C G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 23726592 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 23726608 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23726638 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 23726668 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23726726 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23726774 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23726862 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23727000 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 23727049 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23727088 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 23727106 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23727265 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23727450 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 23728032 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 19 23728037 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23728080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23728091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23728270 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 23728271 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 23728552 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23728571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23728601 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 23728823 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 23728825 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 23728920 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 23728929 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 23728944 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 23728972 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 23728978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23729058 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 23729097 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 23729273 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23729289 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23729343 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23729392 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 23729484 C G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 23729488 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 23729505 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 23729519 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 23729548 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 23729647 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23729734 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23729999 G C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 23730121 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 23730234 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 23730249 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23730344 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 23730415 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23730417 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23730694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23730738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23730847 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23731123 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23731624 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23731803 G C Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 23731825 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23731832 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 23732047 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23732150 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 19 23732155 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23732187 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 23732344 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 23732481 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23732563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23732777 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23733441 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23733888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23734262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23734571 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 23734921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23734939 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 23735495 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23735978 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23736283 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 23737668 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23738282 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 19 23739810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23740576 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 23740871 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 23740873 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 23740881 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 23741199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23741719 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23742054 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23742056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23742084 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23742126 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23742140 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23742806 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23743973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23744647 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23745227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23745691 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23746007 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23746165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23748375 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23748407 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 23748592 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 23751468 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23751572 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23751642 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23751935 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23751996 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23752125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23752551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23753124 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 23756257 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23756914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23759470 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23760269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23766968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23769719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23769922 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 23770539 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23771313 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23773148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23773271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23774701 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23776082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23776585 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 23777530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23778952 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23779407 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23781858 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 23782761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23785513 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23785540 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23785769 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23786055 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23786107 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23786169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23786401 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 23786505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23786506 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23786629 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23786713 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 23786732 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23786734 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23786826 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 23786991 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 23787072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23787119 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 23787146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23787150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23787283 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 23787324 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 23787337 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 23787725 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 23788017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23788021 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 23788040 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23788230 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 23788245 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23788541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23788935 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 23789257 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23789650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23789657 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23790013 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23790027 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23790053 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23790301 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23790816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23790966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23790975 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 23791075 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23791334 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23791881 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 23792486 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23792491 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 23795982 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23796005 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23796106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23797692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23798379 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23800948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23801071 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23802053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23803571 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23805355 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 23805565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23805735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23807293 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23809130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23811396 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23818246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23818393 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23819106 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 23819811 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 23819833 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 23820286 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 23820898 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 23821048 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 23821054 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 23821070 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 23821354 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23821643 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 23821648 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23821687 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23821705 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 23821904 C T N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 23821982 C T N Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 19 23822229 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 23823051 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 23823934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23824069 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 23824073 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23824389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23824658 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23828641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23828870 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 23828899 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 23828915 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 23828920 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 23828952 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 23828953 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 23830178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23830201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23834675 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 23835256 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23835750 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23836004 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23837297 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23837306 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23838751 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23838803 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 23840112 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 23841406 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23841816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23841945 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23842739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23844635 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23845806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23846117 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23846243 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 23846244 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 23846255 G T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 19 23846256 T A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 19 23846461 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23846494 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23846514 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23846552 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 23846853 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 23846860 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23846869 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 23847025 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23850206 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 23853072 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 23853075 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 23855037 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 23855053 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 23855074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23855132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23855435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23855949 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 23856227 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 23856400 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 23856561 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 23856841 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 23856882 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 23856891 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 23857071 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23857500 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23857505 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23857520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23857541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23857552 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 23857754 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 23857786 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23857830 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 23858112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23858238 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 23858245 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 23858260 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23858319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23858499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23858524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23858789 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 23858816 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23858940 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 23859051 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23859060 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23859061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23859198 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 23859207 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 23859713 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 23859913 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23860282 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 23860588 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23860684 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 23860738 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23860797 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23860976 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 23861031 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 23861176 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 23861208 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 23861241 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23861633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23861857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23861914 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 23862029 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23862100 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23862214 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 23862332 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 23862678 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23863312 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23863699 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 23863926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23864775 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23864987 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 23865205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23865309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23865381 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 23865454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23865900 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23866223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23866752 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 23866847 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23866900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23866948 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23866978 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23867065 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 23867449 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23867464 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 23867541 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23867543 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 23867557 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23868084 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23868235 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23868403 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 23869051 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 23869082 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 23869688 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 23871860 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 23871907 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23872210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23872321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23873039 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23873278 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23873422 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23874111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23874655 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23875101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23875168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23877347 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 23877836 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 23877880 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 23878110 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 23878486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23878774 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 23879005 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 23879018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23879105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23879512 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 23879571 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23879944 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 23879948 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 23880172 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 23880427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23880742 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 23881915 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 23881940 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 23881983 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 23884411 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 23885434 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 23887367 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 23888535 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 23889043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23889913 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 23890053 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23891009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23893623 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 23894269 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23894624 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 23895506 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23895511 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23898020 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23898423 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23900761 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 23901722 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 23902397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23902398 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23902414 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23902661 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 23902676 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 23903060 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23903159 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23903658 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 23903715 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 23904067 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 23904174 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 23904211 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 23904889 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 23905226 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 23905573 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23905583 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23906117 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23906173 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23906352 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23906453 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23906457 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 23906606 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23906620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23906647 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23906669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23906702 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23907121 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 23907167 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 23908090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23908183 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 23908300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23909033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23910347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23910687 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 23911995 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 23912902 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 23914868 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 23915274 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 23915548 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 23915825 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 23916024 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 23916586 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 23917041 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23917484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23917514 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 23917576 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 23917609 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 23917612 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 23917935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23918313 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 23918319 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 23918335 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 23918340 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 23918468 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 23918472 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23919161 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 23919719 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23919868 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 23919941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23920444 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23920902 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 23921032 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 23921241 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23921326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23921349 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 23921536 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 23921919 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 23922220 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 23922560 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 23923484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23924971 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23925756 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23925774 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23925798 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23925851 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23925945 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23926047 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23926071 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23926236 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23926266 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23926301 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23926319 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23926331 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23926354 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23926549 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23926557 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23926608 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 23926685 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 23926703 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 23926780 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23926859 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 23926960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23926971 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 23926987 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23927149 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 23927521 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23927810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23927893 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23927916 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23927923 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23928007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23928174 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23928928 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23928956 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23929249 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 23929266 G C N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 19 23929320 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 23929337 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 23929556 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23929576 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23929657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23929660 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23929816 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 23930319 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23930365 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23930395 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23930489 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23931028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23931045 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23931052 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 23931053 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23931149 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23931325 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 23931329 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 23931331 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 19 23931554 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23932194 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23932231 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23932996 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 23933095 T G N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 19 23933096 T G N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 19 23933248 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 19 23933251 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 19 23933376 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23933506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23933517 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23933578 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 23933624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23933883 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23933885 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23934002 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23934118 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23934498 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 23934499 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 23934728 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23935191 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 19 23935596 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23935598 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23935600 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 23935610 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23935661 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23935681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23935750 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23935782 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23935795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23935796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23935822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23935830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23935898 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23936641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23936701 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 23936885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23937025 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23937055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23937074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23937377 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23937493 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23937505 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23937745 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23937858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23938055 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 19 23938287 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 19 23938342 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 23938387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23938764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23938793 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23939722 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23939965 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 23940043 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23941838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23941859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23942058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23942401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23942683 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23942734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23943153 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 23943323 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 23943741 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 23943742 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23944358 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23944518 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23944712 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23944718 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23944746 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23944761 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23944771 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23944783 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 23944837 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23944968 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23944996 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23945119 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23945123 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23945144 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23945209 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 23945305 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 23945309 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 23945355 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 23945384 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 23945551 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23945560 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 23945594 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 23945649 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23945705 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23945880 A C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 23946127 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 23946282 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 23946293 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23946549 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 23946619 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23946976 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23947214 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23947281 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23947323 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 23947325 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 23947331 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 23947486 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23947488 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23947501 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23948333 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23949458 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23949486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23949522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23949583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23950132 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23950424 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23951585 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23951709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23951756 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 23951932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23951939 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 23951945 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23952032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23952071 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23952087 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23952095 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23952115 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23952126 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23952179 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23952572 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23952968 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 23952969 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 23953019 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23953071 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23953076 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23953084 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23953103 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23953107 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23953109 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23953162 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23953211 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23953231 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 23953240 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23953248 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23953310 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23953374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23953379 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23953462 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23953583 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 23954076 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23954599 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23954612 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23955330 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23955417 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23955466 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23955616 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23955874 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23956560 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 23956812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23957326 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23957442 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23958490 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23958585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23959073 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23959140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23959370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23959488 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23960990 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23967529 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23967720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23968959 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 23969330 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 23970053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23970128 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23970240 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23971320 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23971696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23971984 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 23973020 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 23974444 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23974941 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23975277 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23975290 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23975617 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23976844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23976931 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23976958 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23977148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23977776 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23978358 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23978423 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23978507 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23980822 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23981116 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23981279 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23982070 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 23982125 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23982144 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23982177 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 23982259 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 23982374 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23982418 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23982534 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23982659 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 23982666 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23982747 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23982783 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 23982805 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23982986 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23983007 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23983281 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23983533 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 23983948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23984638 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23985024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23985534 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23985592 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23985613 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23985681 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23985868 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23986027 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 23986297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23986341 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23986343 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23986481 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23987048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23987577 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23987584 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 23987587 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23987590 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23987792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23987981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23988000 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23988023 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 23988040 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23988075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23988095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23988300 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23988514 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23988911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23988981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23989097 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23989111 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23989145 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23989314 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23989640 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23989734 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23989812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23990107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23990142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23990310 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 23990401 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23990649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23990668 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23990698 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23990713 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 23991030 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23991056 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 23991179 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23991362 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23991455 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23991456 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23991474 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23991503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23991847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23991870 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23992011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23992032 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23992279 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 23992280 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 23992294 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23992323 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23992369 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 23993122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23993248 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23993390 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 23993452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23993464 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23993550 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 23993598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23993761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23993772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23993788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23994049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23994119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23995184 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23995188 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23995205 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23995219 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23995763 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23995765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23995864 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23996008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23996610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23996990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23997062 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 23997074 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 23997353 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23998443 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23998822 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23999165 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 23999461 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24001180 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24001643 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24003092 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24005410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24006076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24007522 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24007825 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24007961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24008141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24008355 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 24008601 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24009115 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 24009219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24009714 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24009774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24010022 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 24010684 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 24010705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24010922 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 24011072 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 24011126 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 24011159 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 24011349 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 24011446 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 24011528 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24012435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24012601 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24012683 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 24013008 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 24013066 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 24013555 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24014026 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 24014044 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24014103 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24014137 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24014155 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24014224 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24014349 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 24014886 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 24016205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24016369 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 24016429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24017340 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24017536 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24017609 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24017724 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24017731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24017734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24017735 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 24017801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24017814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24018365 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24018458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24018533 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24019524 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24019528 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24019712 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24019908 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24020636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24020740 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24020948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24021032 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24021063 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24021292 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24021403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24021630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24022084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24022293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24022359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24024444 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 24024469 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24024585 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24024950 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24026384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24026644 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 24026865 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 24027119 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 24027141 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 24027585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24027752 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24027872 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24027873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24027951 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24028970 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 24028971 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 24028982 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24029006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24029072 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24029141 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24029151 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24029223 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24029238 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24029243 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24029257 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 24029322 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24030022 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 24030139 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 24030173 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 24030277 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24030436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24030460 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24030462 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24030463 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24030508 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24030532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24030737 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24030769 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24030833 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24032199 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 24032673 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 24032854 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 24033126 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 24033563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24033781 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24033782 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24033936 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24035070 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24035291 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 24035372 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 24035395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24035398 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24036107 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 24036155 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 24036158 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 24036520 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 24036574 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 24036715 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 24036784 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 24036849 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 24036906 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 24037036 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24037088 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 24037121 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 24037438 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 24037447 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 24037505 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 24037890 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24038030 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24038081 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24038236 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 24038330 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 24038363 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 24038524 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24038537 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24038690 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24043678 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 24043849 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 24043867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24043891 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 24043951 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24044378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24044636 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24044818 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24045364 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24045472 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24045774 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 24046216 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 24046732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24047510 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24047829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24048299 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 24048405 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 24049285 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24049655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24049841 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 24049899 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 24049905 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 24049910 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 24050618 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 24050872 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24051088 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24051091 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24051927 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24052334 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 24052547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24052891 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24052899 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 24053700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24053894 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 24055989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24057381 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24057671 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 24058001 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 24058070 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 24058106 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 24058294 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 24058504 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 24058659 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 24058708 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 24058782 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 19 24059003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24059120 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 24061195 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24061528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24061801 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 24061853 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 24062123 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24062158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24062355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24062495 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 24062641 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24062717 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24062785 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24063155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24063554 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24063629 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24064121 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 19 24064474 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 24065019 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 24065478 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 24066068 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 24066152 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24066187 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24066215 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 24066244 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 24066269 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 24066393 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24066614 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24066619 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24067021 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 24067027 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 24067046 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 24067118 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 24067129 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 24067134 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 24067242 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24067268 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 24067269 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 24067310 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 24067311 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 24067332 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24067423 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24067427 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24067457 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24067458 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24067530 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24067553 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 24067567 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 24067962 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 24068116 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 24068782 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 24069141 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 24069280 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 24069455 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 24069456 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 24070076 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24070237 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 24070961 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24071320 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24071743 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 24071766 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 19 24072228 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 24072524 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 19 24072792 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 24072849 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 19 24073673 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24073677 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24075337 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24075338 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24077285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24077383 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 24078025 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 24078077 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 24078366 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24078803 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 19 24078979 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 24079322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24079584 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 24079608 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 24079711 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 19 24080086 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 24080116 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24080276 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 24080309 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 24080594 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 24081645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24082273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24083044 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 19 24083216 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 24083597 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24084058 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 24090614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24091111 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24093769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24095067 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 19 24095145 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 24095471 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 24095560 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 24095732 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 24096287 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 24096363 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 24098144 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 24099000 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 24099108 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24099282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24099700 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 24099854 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24100462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24101082 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24104542 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 24104714 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24104761 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 24105047 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24105559 G C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 24105843 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 24105917 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 24107013 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24108615 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 24117007 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24117127 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 19 24118213 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24120175 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24120848 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24120849 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24121198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24121212 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 24121249 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24121356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24121426 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24121438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24121540 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24121551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24121574 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 24121624 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24121717 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 24121748 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 24121764 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 24121905 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 24121906 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 24121974 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 24122055 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 24122151 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 24122187 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 24122192 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 24122217 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 24122225 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 24122250 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 24122573 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 24122578 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 24122601 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 24122644 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24122830 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 24123029 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24123030 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 24123089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24123179 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24123591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24123775 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 24124189 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 24124496 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24124616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24124809 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24125137 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 24125307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24125339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24125559 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 24125756 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 24125776 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 24125788 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 24125798 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24125868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24125884 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24126004 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 24126017 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 24126026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24126033 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 24126181 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 24126204 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24126269 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 24126323 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24126382 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 24126483 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24126529 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24126815 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24126823 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24127072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24127171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24127178 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 24127350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24127432 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24127483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24127603 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24127760 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24127900 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24128114 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 24128223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24128356 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 24128377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24128388 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24128432 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24128981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24130326 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 19 24130614 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 24130769 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24131065 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24131228 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24131241 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24131259 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24131311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24131321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24131370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24131583 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24131590 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24131636 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 24131699 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24131748 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24131766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24131794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24131822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24131839 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 24131967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24132001 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24132121 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24132143 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24133994 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24134103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24135669 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 24138947 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 24140105 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 24140559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24143349 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24148319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24148620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24149187 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24149301 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 24149309 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 24149534 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 24149828 T C Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 24150026 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24150027 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24150117 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 24150557 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 24150709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24151061 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24151494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24151797 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24152470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24152908 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 24153319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24153373 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 24153385 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24153714 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24153728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24153739 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 24153782 G T Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 24153992 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 24154151 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 24154405 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 24154670 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24154839 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24154960 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 24155132 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24155463 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 24155480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24155544 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 24155590 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 24155597 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 24155619 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24155623 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24155695 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 24156297 C G Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 24156345 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24156399 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24156567 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24156820 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24156830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24156846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24157057 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24157165 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 24157219 G C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 19 24157221 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 19 24157235 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 19 24157269 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 24159240 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 24159309 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24159407 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 24159971 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 24160007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24162234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24163826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24164478 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 24165126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24165145 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24165158 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24165236 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24165272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24165352 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24165357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24165382 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 24165399 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24165443 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 24165464 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24165510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24165518 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24165524 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24165555 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24165560 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24165616 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 24166640 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24167491 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24167714 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24170203 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 24170601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24171094 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24171521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24171906 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24171925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24172057 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24172451 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 24175019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24175078 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 24178275 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24178727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24182544 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24182574 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 24184697 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 24186860 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24187547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24187784 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 24187890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24188140 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24188941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24189198 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24189334 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24189453 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24189773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24190060 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24190120 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 19 24190160 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 19 24190306 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 24190419 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24190425 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 24190487 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 24190575 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24190625 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24190628 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24190653 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24190657 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 24190662 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 24190665 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 24190836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24190929 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 24191221 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24191597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24191711 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24191720 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24191733 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24192489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24193519 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24193679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24193743 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24194247 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24194248 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24194868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24194960 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 24195205 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24195258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24195512 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24195531 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 24195816 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24195901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24196301 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 24196308 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 24197425 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 24198066 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 24198133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24198236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24198262 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24198402 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24199638 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 24200360 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24202116 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24203203 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24203418 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24203750 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24203761 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24203898 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24204110 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24204273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24204522 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 24204677 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24205533 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 24205550 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 24205555 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 24205660 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 24207428 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 24209125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24210211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24210286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24210556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24210880 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24212775 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24213611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24213693 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24214070 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24218639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24219321 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 24219328 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 24219352 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24219357 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24219375 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24219380 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24219389 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24219513 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24219559 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24219561 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24219957 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 24219982 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 24219994 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 24220012 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 24220058 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 24220323 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24220347 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 24220349 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 24220554 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 24220576 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24220713 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24220828 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 24220896 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24221300 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24221684 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 24221761 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 24221863 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 24222284 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24222291 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 24222933 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 24222989 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24223303 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 24223352 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 24223480 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 24224138 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24224603 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 24224649 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 24225007 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 24225075 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24225127 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24225570 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24225576 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 24225601 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24225637 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24225660 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 24225774 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 24225791 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 24225846 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24225849 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24226029 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 24226032 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24226153 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 24226201 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 24226202 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 24226207 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 24226233 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 24226459 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 24226502 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 24226624 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 24226677 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24226715 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24226797 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 24226810 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 24226853 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 24227069 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 19 24232249 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24232650 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24233980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24234343 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24234554 C G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 19 24234726 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 24234880 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24235247 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24235255 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24235368 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 24235639 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 24235891 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24235928 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 24235942 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 24236013 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 24236067 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 24236078 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 24236131 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24236186 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 24236225 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24236670 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24236681 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24236716 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24237079 G T N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 19 24237143 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24237187 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24237225 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 24237477 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24238101 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 24238102 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 24238132 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 24238462 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 19 24238633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24238819 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24239548 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 24239570 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 24239575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24239812 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 24240322 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24240943 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 24240960 A C Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 24241531 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 24241649 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 24241650 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 24241707 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 24241815 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 24242335 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 24242525 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 24242721 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24242782 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 24242806 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 24242868 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 24243003 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24243004 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 24243033 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24243231 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24243466 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 24243486 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 24243714 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 24243975 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 19 24244069 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 24244148 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 24244254 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24244621 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 24244825 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24244962 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 24244965 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24244996 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 24245004 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 24245185 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 24245199 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24245429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24245508 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 24245633 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24245668 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24245739 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 24245981 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 24246081 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 24246799 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24247223 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24247272 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 24247310 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 24250926 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24252928 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24253849 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 24253952 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 24254818 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24254994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24255387 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24256233 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24256636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24257089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24257990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24258235 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 24258795 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24258862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24259057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24259114 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24259442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24260999 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 24262177 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24263942 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 24264778 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24265820 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24265843 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24266676 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24266677 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 24266938 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 19 24266954 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 19 24267522 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24267829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24268050 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24268080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24268395 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24268421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24268553 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24268762 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 24269273 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 24269283 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 24269538 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24269572 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 24269582 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 24269583 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 24269609 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24270022 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 24270197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24270352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24270398 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24270413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24270414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24270440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24270500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24270645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24270733 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 24270888 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 24271036 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 24271168 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24271512 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 24271816 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24272135 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24272513 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 24272982 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24274763 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24275451 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 24275734 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24275957 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 24276098 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24276370 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24276654 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 24277287 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24277493 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24278641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24278690 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24278725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24279179 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24279356 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24279569 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24279608 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24280417 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24280750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24280811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24281050 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24281058 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24281112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24281188 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24281379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24281385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24281404 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24281461 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24281474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24281508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24281670 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24281676 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24281684 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24281748 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 24281760 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24281825 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24282282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24283206 G C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 24283393 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24283405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24284546 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24286776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24289269 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24289270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24290300 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24290378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24290484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24290639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24290743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24290789 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24290931 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 24291315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24291461 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24292639 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24295110 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24295916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24296201 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24298150 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24299933 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24300100 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24300169 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24300326 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 24300376 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 24300446 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 24300489 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 24300731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24300942 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24300945 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24301024 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24301092 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 24301111 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24301139 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24301145 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24301173 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24301345 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24301366 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24301372 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24301378 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 24302109 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24302227 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24302923 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24303213 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24303301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24303355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24303527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24305732 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24305793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24308483 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24308782 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24309249 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24310835 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24310961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24311123 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24311507 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24311624 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24311717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24312181 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24313215 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24313433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24313977 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24315084 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 24315324 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24316138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24316630 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24317304 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24318587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24318753 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 24319834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24319982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24321261 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 24321264 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 24321316 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24322197 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 24322208 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 24322910 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 24322916 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 24322942 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 24322985 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 24324750 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24327449 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24327557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24332728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24333489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24333729 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24334059 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24335443 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24335484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24335627 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24335659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24335672 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24335794 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24337069 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24337210 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 24337799 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24337807 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24337834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24337966 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24337989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24338010 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 24338028 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 24338130 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24338331 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 24338388 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 24338403 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24338480 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 24338502 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 24338553 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 24338557 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 24338680 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 24338697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24338751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24338753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24338801 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 24339044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24339046 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24339094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24339245 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 24339263 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24339281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24339589 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24339735 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24339809 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24339851 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24339889 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24339968 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 24340009 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24340131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24340187 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 24340194 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 24340236 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24340253 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24340314 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 24340356 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24340396 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24340400 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24340409 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24340511 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24340608 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 24340788 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24340954 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 19 24340974 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24341007 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24341080 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 24341082 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 24341160 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 24341314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24342229 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 24342283 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 24342285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24342552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24342720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24342755 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 24342880 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24342884 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24343164 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 24343255 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 24343256 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 24343278 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24343312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24343799 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 24344209 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 24344213 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 24344222 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24344436 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 24344450 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 24344460 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 19 24344463 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 24344477 G T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 19 24344664 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 24344750 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 24344764 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 24344891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24344955 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 24345038 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24345048 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24345114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24345186 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24345326 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24345484 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24345713 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 24346170 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24346178 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24346374 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24349072 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24350291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24350585 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24350653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24350671 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 24350701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24350734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24350761 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 24350817 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24352192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24352234 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24352555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24352633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24352889 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24352931 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24353018 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24353350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24353531 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24353606 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 24353839 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24353848 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 24353903 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24354307 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24354579 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24354654 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24354672 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24354696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24354723 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24354807 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 24354808 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24355297 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 24355414 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24355474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24355989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24356148 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24356188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24356465 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24356483 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24356515 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24356529 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24356570 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 24357021 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24357061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24357160 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24357227 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24357409 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24358598 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24358786 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24359252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24359670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24359782 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24359836 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24360095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24360097 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24360802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24361140 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24362858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24365764 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24365871 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 24365917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24366899 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 24367404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24367499 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24367560 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 24367577 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 24367604 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 24367697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24367906 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24367912 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24367936 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24368011 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24368012 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24368022 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24368232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24368353 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24370074 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24370106 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 24370124 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24370230 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24370272 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24370324 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24370413 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24370501 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24370566 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24370573 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 24371482 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24371595 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 24371625 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 24371657 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 24371686 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24371716 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24371998 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 24371999 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 24372003 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 24372015 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 24372098 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 24372099 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 24372155 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24372157 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24372221 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24372389 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 24372406 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24372417 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24372426 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24372452 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24372456 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 24372686 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24372710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24372826 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24372851 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24372911 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 24372961 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 24373047 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24373219 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24373244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24373307 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24373370 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 24373508 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24373636 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24373802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24374198 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24374209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24374664 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24374836 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 24374863 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24374870 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 24374924 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24374927 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 24375015 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24375016 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24375027 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24375088 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24375273 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 24375280 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24375289 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24375330 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24375383 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24375473 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 24375509 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 24375515 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24375545 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24375547 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24375907 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 24375918 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 24376152 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24376196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24376409 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24377152 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24377295 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24378669 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 24378704 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 19 24379353 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 24379601 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 24379783 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24379901 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24380619 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24380648 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24380847 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24380883 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24381023 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24381058 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24381118 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24381121 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24381448 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 19 24381518 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 24381859 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24382175 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24382225 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24382268 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24382278 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24382323 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 24383773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24385853 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24385866 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24385885 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24385900 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24385950 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24385996 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24386401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24386795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24387710 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24387788 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24387912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24390532 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 24390643 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 24390681 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 24390984 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 24390987 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 24391004 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 24391100 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24391120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24391204 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 24391460 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24391501 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24391587 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24391590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24391684 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24391751 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24392083 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24392114 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24392319 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24392434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24392463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24392540 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 24392861 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24392932 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 24393014 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 24393466 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 24394393 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24394496 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 24394605 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 24394715 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 24395515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24395667 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24396175 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24396359 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24396564 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24396605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24396717 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24396748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24396770 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 24396877 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24396892 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 24396961 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24397017 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24397614 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 19 24397868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24397884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24398235 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 19 24399249 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 24399376 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24399438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24399490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24399550 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24399710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24399724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24399737 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24399752 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24399804 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24399829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24399933 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 24400078 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 24400103 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 24400419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24400429 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24400432 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24400436 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24400551 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24400656 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 24400825 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 24400840 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 24400899 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 24401037 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 24401223 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24401314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24403154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24404018 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 24404029 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 24404034 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 24404035 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 24404117 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 24404138 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 24404148 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 24404169 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24404175 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 24404220 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24404226 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24404298 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 24404307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24404423 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 24404476 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24404756 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24405411 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24405609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24405712 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24405982 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 24406135 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24406368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24406622 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 24406689 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24407894 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24407935 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 24408090 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24408318 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 24408337 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 24408346 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 24408447 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 24408659 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24408942 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 24409038 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 24409057 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 24409286 G C N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 19 24409408 T A N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 19 24409522 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24409572 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24409754 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24409842 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24410286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24410489 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 24410650 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24410887 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 24410910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24410944 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 24410952 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 24410958 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24411214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24411217 T C Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 24411438 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24411470 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24411835 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 24411956 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 19 24411975 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 19 24412116 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 24412812 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 24412835 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 24412837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24412913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24413160 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 24413233 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24413427 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 24413449 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 24413487 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24413490 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24413659 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 24413670 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24413671 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 24413751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24413823 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 24413887 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24413917 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24413923 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24414084 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 24414452 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 24414513 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 24414559 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24414720 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24414856 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 24414858 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 24414863 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24415278 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 24415283 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 24415410 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 24415508 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24415575 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 24415605 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24415742 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24415751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24415758 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 24415872 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24415918 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24416316 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24416318 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24416475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24416521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24416668 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24416669 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24416707 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24416808 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24416901 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24417205 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 24417244 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24417550 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24417684 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24417722 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24417724 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 24417751 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24417807 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 24417995 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 24418011 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24418015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24418024 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 24418028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24418050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24418051 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 24418091 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 24418096 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 24418110 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 24418112 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24418121 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 24418248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24418352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24418407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24418422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24418612 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24418730 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24418855 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 24418874 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 24418882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24418911 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24418912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24419163 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24419204 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24419213 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24419332 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 24419399 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 24419467 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 24419693 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 24419855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24420934 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 24420997 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 24421175 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24421348 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 24421500 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24421592 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24421693 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24421894 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 24421986 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24422002 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 24422020 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 24422039 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24422155 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 24422168 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 24422414 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24422513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24422519 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24422700 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 24422735 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24422861 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24422888 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 24422924 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24422931 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 24422989 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 24423070 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 24423092 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24423117 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 24423123 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 24423186 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 24423217 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 24423390 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 24423496 C T N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 19 24423545 A G N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 19 24423939 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 24423988 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24424059 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 24424287 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 24424351 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 24424400 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 24424617 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24424798 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24424822 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24424950 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 24424951 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24424993 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24425332 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 19 24425466 C T N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 19 24425569 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24425677 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24425682 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24425700 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24425817 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24425923 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24426530 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 24426950 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 24427084 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 24427126 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 24427270 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24427551 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 19 24427594 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24428134 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24428141 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24428161 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 24428556 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24428678 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24428899 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 19 24429085 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24430096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24430142 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 24430356 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 24430455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24430474 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 24430602 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24430631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24430658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24430662 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24430705 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 24430768 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24430815 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 24430897 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 24430902 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 24430980 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 24431062 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 24431096 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 24431340 T C Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 24431344 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 24431421 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24431436 T C Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 24431537 C A Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 24431974 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24432000 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24432052 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24432169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24432248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24432266 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 24432311 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 24432358 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 24432416 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24432670 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24432991 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24433068 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 24433115 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 24433247 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24433424 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24433493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24433548 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24433570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24433604 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24433668 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24433719 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24433770 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24433879 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24434019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24434032 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24434140 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24434266 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24434297 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24435097 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 24435109 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 24435174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24435197 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 24435243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24435251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24435380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24435391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24436025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24436057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24436119 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24436130 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24436136 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24436631 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24436798 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 24436983 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24437006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24437029 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 24437066 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 24438153 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24438692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24438764 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24438882 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 24439649 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24439829 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24439967 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24440171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24440213 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24440234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24440340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24440804 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24441270 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 24441457 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24441482 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24444564 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24444905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24445863 A C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 19 24445935 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 24446483 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24447761 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24447767 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24447892 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24447928 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24447933 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24447960 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24447983 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24448037 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24448066 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24448354 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24448569 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24449127 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24451371 T G N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 19 24451740 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 24451846 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24452000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24452162 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 24452361 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24452372 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24452394 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24452507 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 24452813 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24452816 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24452872 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24453203 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24453218 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24453831 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24454276 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24454323 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24454337 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24454356 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24454515 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24454517 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24454685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24454696 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 24454759 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 24454764 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 24454804 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 24454808 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 24454888 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 24454896 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 24454929 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 24455017 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 24455018 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 24455022 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 24455292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24455295 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 24455311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24455314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24455372 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 24455436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24455556 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 24455602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24455676 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 24455681 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 24455682 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 24455693 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 24455727 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 24455902 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 24455946 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 24455986 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 24456001 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 24456049 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 24456072 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24456074 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24456079 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 24456080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24456304 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24456420 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 24456427 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 24456446 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 24456454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24456481 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 24456613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24456689 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 19 24456709 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 24456711 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 24456723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24456745 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 24456898 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 24456968 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 24457000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24457089 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 24457112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24457145 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 24457146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24457168 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 24457184 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 24457225 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24457227 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24457247 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 24457291 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 24457292 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 24457312 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24457327 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 24457379 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 19 24457510 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 19 24457580 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24457586 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 24457670 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 24457698 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 24457718 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 24457802 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24457972 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24457986 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 24458145 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24458191 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24458437 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 24458583 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 24458609 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 24458618 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 24458751 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 24458772 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 24458785 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24458864 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24458890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24459091 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 24459114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24459163 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 24459164 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 24459165 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 24459240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24459319 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 24459321 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 24459407 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 24459550 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 24459552 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 24459733 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 24460813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24460934 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 24461935 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 24461990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24461991 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24462019 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24462060 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 24462115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24462121 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 24462130 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24462431 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24462856 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 24463323 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 24463424 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 24463661 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 24463777 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 24463844 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 24464144 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 24464150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24465005 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24465081 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 24465419 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 24465721 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 24465768 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 24465895 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 24466537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24468512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24468540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24468693 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24468861 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24469067 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24469403 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24469453 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24469471 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24469835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24471263 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24472405 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24475095 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24475593 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24476074 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 24476306 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24476383 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24476559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24476711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24476716 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24477756 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24478097 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 24479295 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24479630 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24479655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24479656 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 24479726 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24481122 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24481138 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24481512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24484659 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24485595 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 24485729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24488197 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24488201 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24489262 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24489413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24489622 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 24489684 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24489828 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 24490239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24490410 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24491148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24492816 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24494001 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 24494707 C A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 24494815 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 24495153 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 24495177 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 24495304 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 24495485 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 24495721 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24495914 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24496080 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24496275 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 24496291 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 24496740 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24496914 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 24497054 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 24497255 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24497326 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 24497383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24497583 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24498076 C A Y N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 24498240 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24498645 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 24498799 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24498920 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 24499346 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 24499412 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 24499417 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 24499650 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 24499927 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 24499964 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24499971 G T Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 24500015 A G Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 24500999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24501312 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 24501390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24501452 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 24502071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24502098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24502612 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24503142 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24503451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24503497 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 24503500 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 24503581 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24503716 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24503775 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24503860 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 24503889 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 24503896 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24504113 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 24504122 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 24504142 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 24504231 T A Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 24504232 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 24504473 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 24504634 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 24504678 G T Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 24504716 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24504749 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 24505010 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24505120 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 24505150 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 24505290 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24505329 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24505462 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24505492 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 24505832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24506318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24506320 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24506353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24506354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24506722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24507042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24507617 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 19 24507663 T G N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 19 24507926 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 24508012 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 24508132 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 24508161 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 24508189 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24508197 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 24508271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24508277 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24508365 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 24508421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24508509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24508510 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24508608 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 24508612 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 24508686 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24509117 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 24509202 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 24509359 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 24509408 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 24509467 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24509933 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24510339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24510922 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24511815 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 24512316 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24512787 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24512788 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 24515884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24516212 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24517778 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24517921 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24518081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24518466 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24518954 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24519013 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24519255 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24519960 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24521640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24522014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24523291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24523593 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24523844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24524049 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24524150 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24524444 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 24524471 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 24524725 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24525076 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 24525103 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24525454 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 24525463 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24525655 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24525661 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24526138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24526459 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24527057 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24527061 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24527399 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24527887 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24527960 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24528448 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24528693 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24528764 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24528898 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 24529081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24529101 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24529812 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24530424 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24531235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24531243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24532311 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24532427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24532732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24532845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24532856 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24532857 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24532905 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24532910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24532952 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24533022 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24533091 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24533171 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24533182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24533222 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24533258 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24533266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24533293 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24533294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24533300 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24533314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24533376 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 24533423 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24533433 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24533457 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24533500 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24533597 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24533674 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24533776 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24533834 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24534078 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24534100 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24534300 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24534315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24534353 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24534362 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24534599 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24534655 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24534792 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24534810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24534961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24535024 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24535252 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24535270 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24535281 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24535332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24535343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24535530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24535573 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24535615 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24535628 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24535664 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24535846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24536415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24536588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24536675 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24536750 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24536798 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24536953 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24537045 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24537309 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24537400 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24537431 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24537631 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 24537646 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 24537651 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 24537664 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24537687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24537706 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24537749 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24538282 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24538490 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24538519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24538692 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24539061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24539245 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24539276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24539388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24539516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24539531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24539537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24539635 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24539667 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24539676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24539694 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24539710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24539711 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24540016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24540232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24540367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24540610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24540674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24540677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24540714 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24540909 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24541244 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24541332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24542141 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24542213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24542288 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24542298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24542521 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24542837 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24542872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24542960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24543022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24543566 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24544194 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24544201 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24544746 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24544807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24544876 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24544959 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24544994 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24545126 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24545144 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24545182 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24545438 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 24545447 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24545474 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24545535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24545620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24545637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24545734 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24545875 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24546006 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24546044 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24546162 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24546243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24546368 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24546570 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24546623 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24546642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24546708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24546742 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24546862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24546871 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24546948 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24547100 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24547411 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24548135 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24548206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24548955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24549108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24552173 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24552232 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24552342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24552494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24555794 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24555861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24556503 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 24556588 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24556859 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24557211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24557252 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24557342 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24557871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24557887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24558003 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24558495 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24558637 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24559244 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24559247 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 24559254 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24559314 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24559329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24559381 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 24559811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24559956 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24560023 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24560026 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24560050 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24560055 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24560096 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24560280 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24560315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24560405 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24560443 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24560501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24560512 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24560672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24560678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24560839 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24560876 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24560884 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24560922 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24560931 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24561029 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24561055 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24561139 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24561294 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24561505 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24561535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24561591 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24561603 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24561666 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24561752 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24561758 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24561854 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24561862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24561885 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24561890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24561899 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24562233 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24562541 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24562545 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24562721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24562801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24562844 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24562847 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24562898 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24562920 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24562936 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 24563031 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 24563045 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24563082 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 24563177 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24563287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24563337 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24563340 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24563405 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24563415 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24563482 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24563524 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24563596 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24563619 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 24563632 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24563654 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 24563663 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 24563698 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24563854 T C N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 19 24563865 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 24563869 A G N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 19 24563933 A C N N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 19 24564184 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 24564291 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24564324 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24564363 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24564408 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24564443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24564501 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24564509 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24564537 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24564539 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24564564 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24564695 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24564742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24564907 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24565012 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24565090 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24565207 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24565467 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24565527 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 19 24565549 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 24565562 G T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 24565651 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24565705 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 24565719 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 24565762 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24565811 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 24565891 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24565906 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24565997 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24566044 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24566710 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24569205 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24569870 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 24569983 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 24571163 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24571754 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24572278 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 24572852 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 24572853 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24572976 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24573786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24573998 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24574065 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24575002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24575044 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24575465 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 24575984 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24576088 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 24576222 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 24576704 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 24577066 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24577080 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24577161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24577180 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24577332 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24577899 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24578013 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24578253 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 24578465 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 24578539 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24578541 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24578674 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24578878 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 24578918 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 24579079 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 24579199 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 24579294 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24579340 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24579365 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24579377 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24579509 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 24579554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24579585 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24579596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24579795 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 24579868 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24579908 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24579972 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24580020 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24580121 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24580134 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 19 24580224 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24580365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24580682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24581319 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24581417 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24581496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24581585 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 24581748 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24581914 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24582829 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24582840 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24582852 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 24582946 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24583032 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24583367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24583368 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24584686 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24585763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24586257 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 24586258 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 24587082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24587447 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24588698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24589708 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24590546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24591161 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 24591249 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24597400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24597801 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24597802 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24597817 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 24597822 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 24598787 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24599723 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 24600669 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 24601983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24604655 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24606674 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24607076 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24607535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24609897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24609951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24610378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24610616 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24611505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24611593 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24612677 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24612724 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 24612730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24613186 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 24617477 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24617704 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24618289 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24620952 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24621847 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 24623039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24623622 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 24625449 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24626772 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 24627414 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24627618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24628137 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24630789 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24632411 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 24632464 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24633483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24634077 A T N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 24634773 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24635349 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 24635371 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24636036 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 24636455 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24638898 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 24639071 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 24639171 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 24639184 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 24639200 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 24639202 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 24639315 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 24639354 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24639566 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 24639668 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 24639880 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24639906 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24640035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24640052 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24640685 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24641038 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24641079 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 24641375 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24642138 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 24642159 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 24642359 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 24642837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24642920 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 24642995 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 24643004 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 24643036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24643057 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24643172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24643173 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24643472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24643488 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24643663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24643756 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 24643943 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 24644353 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24644464 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 24644479 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 24644495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24644930 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 24645013 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24645189 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 24645220 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 24645237 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24645305 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 24645495 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 24645713 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24645931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24645933 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24645949 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24646007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24646036 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24646042 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24646064 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24646083 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24646984 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24647485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24647958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24648081 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24649874 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24651604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24652755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24654554 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 24656457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24656602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24658232 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24658634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24660068 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24663256 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 24663341 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 24663416 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 24663441 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24663444 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 24663467 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 24663480 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 24663492 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 24663494 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 24663495 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 24663795 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24663957 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24664427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24664654 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24664666 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24664855 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24665265 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 24665331 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 24665507 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 24665541 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 24665809 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 24665815 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 24665823 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 24666025 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 19 24666209 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 24666218 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 24666219 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 24666337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24666586 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 24666627 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 24666809 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 19 24666977 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 24667082 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24667107 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 24667223 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24667289 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 24667290 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 24667299 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24668086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24668283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24668433 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24674874 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 24676814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24678449 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24679852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24683017 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24683048 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24684298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24684718 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24685277 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24685548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24685549 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24685826 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 24689009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24691404 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 24692673 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24693642 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 24693700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24693981 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24694026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24694245 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24694955 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 24696307 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 24696321 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 24696349 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 24696365 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 24696429 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24696452 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 24696585 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 24696671 A C N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 24697452 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24700074 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 24701580 C T N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 24701772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24702181 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24702296 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 24702742 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 24702822 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 24702841 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24703881 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 24704477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24706398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24707171 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24708733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24709065 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24709743 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24712773 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24713263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24713436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24714398 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24714795 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24715141 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 24716414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24716416 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 24716659 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 24716662 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 24716766 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 24716896 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 24716994 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 24716995 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 24717034 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 24717610 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24717892 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 24717900 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 24717915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24717919 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 24717957 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 24718431 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 24718601 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24719584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24719937 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 24720017 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 24721082 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24721684 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24722048 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24723206 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24723796 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 24723882 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 24724037 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24724085 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 24724094 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 24724126 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 24724140 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 24724148 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 24724149 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 24724821 T A N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 19 24724831 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 19 24724897 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 19 24724944 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 24725026 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 24725066 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 24725546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24725628 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24725641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24725691 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 24725702 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24725771 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24725873 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 24726056 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 24726103 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 24726118 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 24726200 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 24726390 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 24726913 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 24727063 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24727359 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24727374 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 24727376 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24727377 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24727398 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24728127 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 24728166 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 24728178 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 24728270 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 24728287 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 24728377 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 24728422 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 24728475 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 24728476 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 24730099 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 24730319 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24730420 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24730872 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 24730878 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 24730913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24731177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24731636 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 24731886 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24731930 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24731944 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 24731985 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 24732181 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 24732350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24732757 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24732761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24732991 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 24733718 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 24733737 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24736134 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24737063 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24738367 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 24738738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24740225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24740333 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24740667 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 24742260 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 24742326 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 24743647 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 24743773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24744101 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 24744508 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24744781 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24745289 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 24745513 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24745730 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24746531 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 24747332 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 24747398 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 24747449 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 24747541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24747579 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24747604 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 24747805 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24747861 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 24747875 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 19 24748140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24758302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24759668 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 24760396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24760428 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 24761670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24761757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24764666 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24765637 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 24765678 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 24766139 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24767124 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24767475 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24767784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24768128 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24768289 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24768559 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24768683 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24768702 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24768707 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 24768835 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24768852 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24768864 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 24769109 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24769415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24769603 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24769604 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24771600 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24771691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24771749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24771805 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24771904 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24771911 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24771920 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24771945 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 24771984 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 24772164 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 24772233 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 24772234 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 24772367 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 24772422 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 24772557 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24772643 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24772760 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24772783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24772798 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24772835 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24774287 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24774648 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24774696 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24775023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24776507 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24776664 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24778120 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 24778482 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24781148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24784333 A C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 24784964 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24786278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24786657 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24788548 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24788897 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24789570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24790014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24791515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24792513 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 24793368 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24796049 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 24796602 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24796848 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24796892 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24797565 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 24798802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24799564 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 24800615 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 24801398 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24804590 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 24805838 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 24805897 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24807325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24808307 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 24808963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24809469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24810033 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 24810087 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24810125 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24810203 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24810860 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 24810970 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24810999 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 24811385 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24811550 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24811602 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 24811613 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 24811617 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24811651 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 24811720 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24811734 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 24811765 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24811863 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24811910 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24811918 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24811967 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 24811987 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 24811995 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 24812100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24813397 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24813733 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 24813734 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 24813755 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 24813945 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24814392 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24814393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24816201 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24816608 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 24817665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24817793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24818161 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 24819255 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24819366 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24819457 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 24819637 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24819853 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 19 24819894 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 24819901 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24820108 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 24820492 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24820691 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24820698 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24820921 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24820928 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24820968 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24820976 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24821215 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24821298 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24821299 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24821317 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 24821934 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24822338 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24823821 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24824991 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24825163 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24827305 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24827428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24828479 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24828610 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 24828813 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24829142 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 24829255 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 24829260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24829298 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 24829334 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24829335 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 24829344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24829375 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 24829413 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 24829501 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 24829537 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 24829589 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 24829717 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24829738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24829795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24829803 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 24829818 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24829921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24829961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24829987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24829992 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 24830073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24830119 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 24830266 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 24830462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24830757 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24831026 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 24831032 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 24831330 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24831572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24831846 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 24831932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24831967 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 24832100 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24832694 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24833458 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 24833674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24833750 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 24833761 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 24833762 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 24833776 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 24833891 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 24834049 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24834142 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 24834165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24834168 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24834262 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 24834264 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 24834299 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24834304 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24834353 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24834380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24834401 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24834445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24834563 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24834615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24834826 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 24834893 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24835014 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24835062 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24835323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24835416 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24835432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24835435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24835453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24835563 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24835587 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24835638 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24835648 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24835656 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24835848 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24835861 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24835956 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24836010 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24836048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24836628 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24836919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24837957 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24838338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24838383 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24838396 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24838589 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 24838625 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 24838630 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 24838789 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 24838916 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 24838981 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24839566 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 24839851 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 24839981 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 24840158 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24840652 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24841006 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24841008 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 24841080 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24841093 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24841234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24841328 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24841425 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24841427 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24841467 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24841500 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24841601 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 24841641 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 24841736 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24841761 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24841785 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24841795 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 24841981 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 24842085 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24842135 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 24843057 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 24843210 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 19 24843477 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 24843506 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 24843736 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 19 24843829 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 24843871 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 24845076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24845228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24846401 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 24846812 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 24849225 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 24853175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24854070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24854878 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24855178 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 24855681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24855765 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24858576 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 24858837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24858866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24859703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24859972 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24863888 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 24863889 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24864805 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24864878 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 24864939 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 24865364 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 24865430 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24865454 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24868004 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24868256 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24868566 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24868781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24868857 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24869240 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 24869562 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24869736 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 24869821 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24870025 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 24870110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24870440 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 24870585 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24870588 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 24870591 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24871031 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24871088 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24871241 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24871709 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 24871749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24871750 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24871819 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 24871842 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24871862 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24871864 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 24871879 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 24871880 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 24871994 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 24872043 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 24872071 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24872213 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 24872300 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 24872360 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 24872378 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 24872424 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 24872551 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 24872718 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 24873231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24873369 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 24873486 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24873593 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24873665 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 24873785 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 24873850 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 24874107 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24874160 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 24874183 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 24874280 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24874347 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 24874649 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 24874785 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24875224 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24875247 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24875295 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24875305 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24875347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24875759 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 24875887 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24876083 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 24876143 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 24876166 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24876184 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24876191 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24876194 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24876399 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24876528 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24876566 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24876925 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 24877030 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 24877164 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24877200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24877977 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24878040 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 24878243 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 24878257 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 24878584 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24878790 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 24878900 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 24878956 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24879180 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 24879182 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 24879197 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24879260 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 24879293 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 24879351 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 24879357 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 24879360 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 24879576 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 24879594 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24879729 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24879745 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 24879747 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 24879750 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 24879769 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 24879982 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 24879996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24880149 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 24880238 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24880328 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24880362 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24880568 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 24880612 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 24880804 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 24880825 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 24880842 C A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 24880843 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 24880973 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 24880983 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 24880986 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 24881067 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 19 24881099 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 24881117 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 24881122 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 24881132 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 24881137 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 24881238 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24881370 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24881401 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 24881408 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 24881545 T G N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 19 24881759 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 24882459 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 24882679 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 19 24882749 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 19 24882929 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 24882940 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 24882956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24882962 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 24883398 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 24883409 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 24883537 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 24883538 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 24883588 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 24883747 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 19 24883991 C A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 24884060 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 24884242 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 24884262 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 24884294 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24884331 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24884374 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24884423 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 24884504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24884524 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24884593 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 24884643 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24884753 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 24884829 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 24885334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24885344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24885537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24885843 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 24885967 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 24886187 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 24886217 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24886305 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 24886368 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 24886369 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 24886391 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 24886504 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24886524 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 24886535 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24886661 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24886700 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24886861 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 24887094 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 24887174 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 24887453 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24887526 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24887646 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 24887849 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 24887938 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 24888057 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 19 24888528 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 24888805 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 24888816 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 24889027 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 24889248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24889376 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 24889530 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 24889556 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 24889569 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 24889805 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24890007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24890604 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 24890790 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24890988 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24891320 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 19 24891321 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 24891359 T A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 24891493 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 24891517 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 24891822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24891923 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 24892179 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 24892293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24892719 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 24892752 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 24892762 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 24892928 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 24893026 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24893351 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 24893453 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 19 24893598 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 24893720 G A Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 24893763 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 24893981 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 24894232 C G N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 19 24894316 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24894322 G T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 24894470 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 24894518 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24894590 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24894739 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24894773 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 24894775 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 24894821 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 24895001 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 24895072 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 24895083 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24895210 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 24895246 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 24895370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24895734 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 24895749 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24895761 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 24895763 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 24895784 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 24896282 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24896380 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 24896805 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 24897220 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 24897238 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24897534 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 24897785 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 24897846 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 24897853 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 24898047 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 24898055 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 24898063 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 24898289 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24898391 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 24898452 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 24898492 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 24898570 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 24898691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24898966 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 24899028 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24899199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24899281 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24899460 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 24899699 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24899711 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24900140 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24900214 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24900525 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24900794 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24900951 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 24900952 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 24900989 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24901031 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24901032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24901059 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 24901329 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 24901436 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 24901441 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 24901442 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 24901447 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 24901497 C A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 24901499 T A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 24907934 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 24907938 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 24907996 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 24908060 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24908099 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 24908106 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 24908111 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 24908145 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24908256 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 24908593 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 24908641 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 24908643 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 24908857 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24908864 G C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 24908933 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 24908965 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 24908983 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 24909007 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24909008 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 24909042 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 24909044 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 24909108 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 24909111 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24909129 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24909179 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24909303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24909351 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24909688 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 24909711 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 24909717 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 24910134 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 24910296 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24910312 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24910384 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 24910442 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 24910487 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24910557 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 24910591 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24910811 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 24910924 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 24910945 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 24911082 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 24911318 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 24911609 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 24911615 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 24911628 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 24911645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24911655 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 24911739 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 24912560 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24912566 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24912929 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 24912939 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 24912972 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 24913397 G T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 24913423 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 24913460 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24913475 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24913484 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24913498 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24913538 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24913659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24913812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24913840 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24913869 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 24913883 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24914047 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 24914094 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 19 24914168 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 19 24914291 A G N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 19 24914351 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 24914378 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 19 24914381 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24914385 A C N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 19 24914387 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 19 24914438 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24914488 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24914513 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24914515 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24914587 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24914641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24914645 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24914668 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24915061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24915079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24915531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24915570 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24915574 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24915911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24915954 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24915987 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24916029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24916031 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24916038 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24916054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24916064 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24916305 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 24916334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24916482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24916567 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 24916586 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 24916595 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 24916627 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 24916765 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 24917655 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 24917844 A T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 19 24918050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24918117 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 24918311 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 24918904 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 24919053 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 24919249 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 24919300 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24920700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24921158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24921213 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24921291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24921305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24921309 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24921338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24921377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24921385 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24921393 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24921576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24921592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24921612 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24921627 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24921805 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24922017 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24922021 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24922076 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24922216 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24922217 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24922426 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24922552 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24922844 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24923595 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24923596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24923764 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24923926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24924144 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24924602 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24924661 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24925203 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24925770 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24925919 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 24926202 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 24926305 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24926337 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24926528 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 24926676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24926858 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 24927027 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 24927208 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24927218 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 24927247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24927262 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 24927371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24927402 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 24927572 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 24927647 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24927845 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24927942 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 24928086 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 24928098 C A Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 24928118 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 24928163 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 24928370 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 24928400 G T N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 19 24928403 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 19 24928483 G A N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 19 24928490 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 19 24928547 T C N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 19 24929645 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 24929728 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 24929893 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24929899 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24929910 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24929963 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 24930071 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 24930073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24930130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24930230 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24930245 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 24930257 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 24930287 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 24930363 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 24930524 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 24930536 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24930558 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 24930615 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 24930639 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 24930745 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 24930764 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 24930864 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 24930936 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 24931011 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 24931101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24931343 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24931405 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 24931416 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 24931422 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 24931423 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 19 24931465 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24932839 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 24932887 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 24932900 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 24933193 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 24933234 G C N N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 19 24933270 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 24933478 A G Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 19 24933547 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 24933555 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 24933586 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24933599 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 24933708 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24933737 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 24933797 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24933831 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 24933848 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 24934009 A C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 24934049 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 24934109 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24934180 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24934219 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 24934228 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24934585 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 24934626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24934936 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 24934959 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 24935069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24935152 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24935178 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24935263 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24935413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24935483 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 24938406 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 24938418 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 24939333 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 24941514 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24941550 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 24941551 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 24941835 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 24942041 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 24942242 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 24942276 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 24942308 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 24942382 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 24942556 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 24942558 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 24942590 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 24943209 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 24943211 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 24943213 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 24943399 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24944056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24944199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24945133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24945877 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24946705 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 24949058 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 24949189 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24949224 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 19 24950032 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24955051 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 24955182 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24956817 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 24956859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24956918 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 24956919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24957053 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 24957116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24957125 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 24957766 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24957851 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 24957903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24958014 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 24958067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24958093 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24958102 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24958117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24958390 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 19 24958455 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 24958464 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 24958491 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 24958548 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 19 24958590 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 24958654 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 24958720 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 24958946 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 24959321 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 24959426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24959516 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 24959616 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24962209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24962383 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24962512 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24962583 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24962731 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24963943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24964540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24964717 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 24964735 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 24964768 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 24965839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24966345 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24967009 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 24967039 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24967116 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24967150 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24967270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24967340 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 24967551 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 24967726 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 24967731 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 24967738 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 24968903 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24969284 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24969379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24969854 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 24970490 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 24971922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24972889 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24974102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24975619 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24976982 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 24977307 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 24979314 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24979702 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24979947 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24980028 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 24980032 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 24980234 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 24980335 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 24980344 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 24981191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24981572 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24984615 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 24984616 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 19 24985880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24986313 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 24986390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24994089 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 24994193 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 24994216 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 24994219 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 24994239 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 24994538 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 24994557 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 24994567 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 24994577 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 24994593 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 24994682 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 19 24995016 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 24995251 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 24995269 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 24995295 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 24995535 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24995539 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 24995651 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 24995815 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24996051 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24996406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24996421 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 24996459 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 24996774 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 24996787 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 24996891 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 24997267 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 24997798 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 24998044 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 19 24998491 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24998722 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 24998730 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 24998817 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 24999034 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 24999038 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 24999094 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 24999125 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 24999537 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 24999628 A T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 19 24999856 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 25000135 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 25000325 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 25000393 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25000511 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 25000525 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25001005 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 19 25001312 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 25001398 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 25001648 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 25002058 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25002298 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 25002548 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 19 25002625 G A N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 19 25002699 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 19 25003028 C A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 25003082 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 25003083 G T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 25003271 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 25003276 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25003808 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 25003819 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 25004018 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25004039 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 25004208 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 25004274 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 25004383 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 25004498 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 25004727 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 25004827 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 25004834 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 25005013 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 25005096 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 25005193 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 25005211 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 25005280 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 25005608 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 25005657 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 19 25006393 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 25006593 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 19 25006661 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 25006767 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 25006965 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 25007047 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 19 25007129 G T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 19 25007539 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 25007794 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 25008412 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25008520 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 19 25008609 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 25008775 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 25008857 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 25009025 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 25009270 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 25009296 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 25009304 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 25009547 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 25009608 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 25009744 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 25009745 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 25010503 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 25010950 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 25010997 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 25011035 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 25011064 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 25011181 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 25011516 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 25011781 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 25012162 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 25012301 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 25013390 G C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 19 25013443 A T N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 19 25013607 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 25013670 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25013756 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 25013984 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 25014192 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 19 25014258 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 25014310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25014867 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 25014930 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 25015027 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 25015095 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 25015497 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 25016103 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 25016106 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 25016212 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25016220 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 25016235 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 25016238 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 25016241 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 25016535 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 25016613 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 25016903 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 25017047 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 25017571 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 19 25017966 T A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 25018188 A T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 19 25018244 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 25018278 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 25018312 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 25018451 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 25018667 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 25018709 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 25018752 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 25018793 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 25019047 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25019168 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 25019457 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25019527 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 25021678 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25026027 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 25029252 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25029260 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25029494 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 25029648 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 25030127 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 19 25030321 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25030351 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25030501 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 25030914 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 25031467 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25031800 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 25031813 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 25031906 T A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 19 25032332 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25032736 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 25033271 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 25033415 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 25033434 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 25033640 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 25033675 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25033766 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 25033850 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 25034121 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 25034283 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 25034504 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 25034647 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 25034807 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 25034870 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 25035111 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 25035336 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25035444 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 25035529 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 25035601 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 19 25035757 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25036232 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25036506 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25037198 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25037274 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 25038699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25039452 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25039575 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25039798 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25039808 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 25041138 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 19 25041486 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25041498 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 25041508 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 25041558 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25042105 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 25042490 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25042615 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 19 25042970 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 25043295 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 25043304 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 25043355 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 25043364 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 25043455 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 25043458 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 19 25043463 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 19 25043523 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 25043549 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 25043587 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 25043588 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 25043636 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 25043699 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 25043701 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 25043824 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 25043900 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 25043904 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 25043925 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 25043967 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 25044004 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 25044012 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 25044046 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 25044066 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 25044068 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 25044129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25044155 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 25044156 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 25044223 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 25044253 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 25044284 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 25044304 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 25044330 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 25044356 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 25044364 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 19 25044368 C G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 19 25044398 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 25044434 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 25044446 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 25044591 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 25044644 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 25044681 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 19 25045271 C T N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 19 25045272 T G N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 19 25045274 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 19 25045281 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 19 25045407 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 25045538 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 25045701 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 25045901 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 25045945 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 25045946 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 25046030 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 25046304 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 25046310 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 25046318 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 25046481 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 25046611 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 25046699 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 25046707 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 25046743 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 25046749 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 25046763 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 25047022 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 19 25047571 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 25047635 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 25047653 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25047664 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 25048038 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 25048306 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25049106 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 25049130 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 25049524 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 25049558 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 25049766 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 25049801 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 25049813 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 25049991 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 25049995 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 25050024 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 25050054 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 25050082 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 25050114 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 25050124 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 25050163 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 25050182 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 25050201 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 25050295 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 19 25050299 A C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 25050468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25050480 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 25050490 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 25050526 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 25050638 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 25050783 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 25050856 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 25050938 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 19 25050972 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 25051127 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 25051141 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 25051191 T G N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 19 25051215 C T N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 19 25051248 A G N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 19 25051461 C T N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 19 25051466 G A N Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 19 25051510 T A N N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 19 25051511 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 19 25051817 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 25051869 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 25052165 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 25052486 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 25052634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25052743 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 25052791 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 25052821 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 25052928 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 25052969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25053127 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 25053179 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 19 25053599 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 25053854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25055190 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25055688 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 25055710 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 25056458 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 25056766 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 25056917 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 25056920 C G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 25057717 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 25057881 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 25058006 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25058016 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25058028 A C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 25058209 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25058213 C T Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 25058440 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25058609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25058796 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 25058929 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 25059129 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 25059282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25059312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25059691 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 25059694 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 25059701 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 25059968 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 25060056 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 25060520 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 25060533 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 25060745 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 25060763 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 25060988 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 25061173 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 25061220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25061242 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 25061248 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 25061256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25061271 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 25061302 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 25061335 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 25061375 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 25061471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25061533 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 25061573 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25061649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25061674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25061717 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25061944 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 19 25062446 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 25062945 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 25062946 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 25062947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25063043 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 25063432 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25063476 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25064050 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25064151 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25064175 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25064310 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25064748 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25064783 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 25064874 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 25065326 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25066174 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25066255 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25066342 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25066550 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 25066608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25066743 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 25066744 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 25066781 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 25066843 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 25066873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25066875 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 25066897 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 25066904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25066943 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 25066952 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 25067086 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 25067305 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25067770 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25067830 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25068110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25068128 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25068230 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25068402 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25068511 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25068517 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 25068521 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25068615 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25068693 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25068810 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25068885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25068976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25069125 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 25069126 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 25069497 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25069747 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 25069993 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25070380 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25070595 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25070675 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25070710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25070934 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25071136 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25072206 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25074212 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 25074423 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25075238 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25076178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25077783 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25077807 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25077912 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25078281 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25078413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25078499 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25078764 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25079256 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 19 25080688 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25080873 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25080884 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 19 25081061 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 25081225 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 25081230 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 25081256 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25081380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25081457 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 25081888 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 25081981 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 25082004 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25082041 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 25082061 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25082232 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25082291 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25082317 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 25082327 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25082353 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25082641 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 19 25082657 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25082670 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25082763 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25082771 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25082905 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25082995 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25083491 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25083817 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25083988 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25084002 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25084013 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 19 25084124 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 25084152 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25084702 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 25084751 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 19 25085489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25085583 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 25085807 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 25085858 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 19 25085893 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 19 25086060 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 25086088 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25086176 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25086194 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 25086208 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25086380 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 25086445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25086457 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 19 25086469 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 19 25086636 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25086715 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25086768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25086775 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 25086820 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25086857 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25086872 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25086883 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25087068 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25087072 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25087101 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 25087122 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 25087136 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 25087142 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 25087150 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25087173 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25087319 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25087328 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25087389 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25087623 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25087993 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25088072 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 25088181 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25088262 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25088277 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 25088323 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25088376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25088595 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25088862 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 25088910 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 25088924 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 25088925 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 25088962 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 25089240 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 25089344 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25089482 G T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 19 25089690 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25089696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25089728 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25089744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25089803 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25089811 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25089937 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25089938 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25090041 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25090045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25090079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25090108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25090823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25091001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25091003 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 25091059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25091218 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 25091283 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 25091384 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 25091702 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25091811 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 25091882 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 25092810 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 25092999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25093584 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25093646 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25093693 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25093787 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25093798 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 25093820 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 25093896 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25093922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25093986 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25094009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25094019 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25094024 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25094073 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 25094087 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25094274 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25094349 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25094703 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25094704 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25094744 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25094923 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25094927 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25095081 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25095112 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25095162 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25095186 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25095319 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25098044 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25098460 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25098742 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 25099882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25100173 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25100784 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25100888 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25100992 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25101251 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25101273 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25101965 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 25102384 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 25102510 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25102511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25102528 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25102549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25102640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25102941 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25102995 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25103265 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25103294 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25103678 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 25103687 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25103818 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25103857 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25103882 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25103884 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25104515 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 25105185 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25105413 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 25105486 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25105585 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25105994 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25106290 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 25106530 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25106540 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25106569 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 25106596 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25106597 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25106598 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25106678 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25106891 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 25106894 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 25106968 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25106998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25107003 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25107441 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 25107470 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25107515 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25108340 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25108376 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25108491 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25108704 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25108825 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 25109032 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25109057 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 25109058 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 25109116 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25109357 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25110002 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25110074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25111453 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25112124 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25112149 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 25112268 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 19 25112376 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 19 25112564 A C N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0 0.615384615384615 0.384615384615385 8 18 0 8 5 19 25112929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25112944 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 25113249 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25113285 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25113364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25113365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25113389 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25113434 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25113566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25113574 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25113575 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 25113583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25113704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25114038 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25114274 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 25114381 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 25114398 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 25114441 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 25114467 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 25114598 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25114619 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25114668 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25114670 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25114726 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25114735 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25114754 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25114771 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25114832 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25114844 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25114856 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25114930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25114978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25115029 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25115107 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25115108 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25115128 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25115167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25115356 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25115390 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25115399 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25115403 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25115409 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25115519 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 25115576 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 25115899 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25116006 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25116254 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25116407 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25116537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25116823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25116865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25116928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25116945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25117029 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25117036 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25117213 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25117485 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25117564 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25117583 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25118030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25118532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25118685 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25119916 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25120425 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 19 25120559 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25120585 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25120623 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25120720 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25120746 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25120755 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25121050 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25121128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25121137 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 25121174 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 25121262 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25121309 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25121355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25121601 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25121603 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25121643 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25121649 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25121678 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25121828 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 19 25122019 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25122076 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25122078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25122117 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25122139 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25122140 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25122344 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25122386 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25122542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25122639 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 25122640 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 25122697 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25122773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25122947 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25123367 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25123386 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25123481 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25123801 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25123816 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25123843 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25123847 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25123855 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25123857 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25123879 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25123893 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 19 25123903 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25123965 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25123971 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25124101 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25124313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25124325 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25124392 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25124798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25125225 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 25125360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25125485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25125677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25125974 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25126151 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25126212 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25126232 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 25126431 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 25126482 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 25126638 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25126663 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 25127303 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 25127380 G C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 19 25127381 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 19 25127459 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 25127504 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 25127918 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25128291 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25128299 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25128323 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 25128331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25128388 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25128420 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 25128453 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25128544 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 25128617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25129082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25129340 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25130312 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25130525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25132467 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25133682 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25133877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25134159 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25134736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25134776 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25134777 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25134803 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25134941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25135615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25136243 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25136756 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25137053 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25137182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25137556 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25137980 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25138017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25138037 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25138138 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25138251 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25138601 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 25138687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25138893 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 25138919 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 25138993 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25139060 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 19 25140146 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 25140199 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 25140230 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 25140231 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 25140247 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 19 25140258 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 25140299 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25140322 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 19 25140353 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 25140459 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 25140474 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 25140513 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 25140890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25140891 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25140921 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25140947 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25141080 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 25141568 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 25141653 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 19 25141674 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 19 25141717 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 19 25142177 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 25142380 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25142390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25143150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25143286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25143366 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25143367 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25143451 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25143517 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25143624 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25143784 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25143841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25144024 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25144312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25144449 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25144832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25144887 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25144894 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25145008 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25145026 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25145328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25145699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25146299 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 25146603 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 25146716 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25146735 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25146900 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25146908 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25146967 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25146968 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25147017 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25147098 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 25147152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25147254 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25147305 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25147348 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25147391 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25147467 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25147553 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25147611 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 25148013 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25148595 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25148681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25148939 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25149001 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25149007 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25149180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25149970 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25150546 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25151262 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25151403 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25151565 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25151584 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25151592 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25151607 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25151643 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25151697 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25151799 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25152031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25152043 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25152069 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25152073 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25152286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25152761 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25153174 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25153222 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25153529 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25153565 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25153569 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25153687 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 25153923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25153970 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25154262 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25154440 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25154474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25154517 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25154818 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25154898 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 25154975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25155309 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25155312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25155660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25155661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25155688 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25155905 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25155931 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25155944 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25155945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25155956 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25156145 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25156421 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25156446 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25156455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25156600 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25156651 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25156670 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25156790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25156792 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25156802 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25156892 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25156990 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 25157045 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 25157046 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 25157193 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25157213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25157268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25157296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25157326 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25157369 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25157381 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25157398 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25157521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25157723 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 19 25157758 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25158012 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25158035 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25158069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25158083 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25158114 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25158143 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25158587 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25158658 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25158667 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25158783 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 19 25158821 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25158888 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 25158959 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25158983 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25159866 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 25159867 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25159882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25160152 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 25160185 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 25160190 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 25160436 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 19 25160438 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 19 25160454 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25160543 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25160590 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25161012 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25161476 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25161568 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25161891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25162467 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 25162693 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25163405 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25163440 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25163582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25163888 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25163927 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25163970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25164187 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25164201 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25164203 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 25164276 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 25164345 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25164434 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25164482 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25164491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25164568 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25164712 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25164716 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25164717 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25164722 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 25164726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25164748 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25164808 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25164817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25164830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25164873 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25164892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25164920 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25164938 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25164939 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25165005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25165089 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 25165093 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 25165221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25165270 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25165364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25165383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25165400 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25165496 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25165822 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25165850 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25165852 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25165864 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25165934 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 25165936 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 25166001 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25166068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25166294 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25166327 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25166363 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25166381 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 25166472 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25166476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25166532 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 25166543 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25166558 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25166659 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 25166735 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25166754 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25167025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25167400 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 25167619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25167671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25167872 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25167989 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25168072 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 25168085 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 25168101 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25168148 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25168186 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25168381 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 25168782 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25168799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25168812 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25168813 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25169029 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 19 25169126 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25169155 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25169162 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25169337 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 25169338 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25169342 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25169366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25169367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25169376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25169435 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25169521 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 25169578 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 19 25169606 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 25169622 C A N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 19 25170090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25170145 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 25170154 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 25170448 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 25170684 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25170704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25170744 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25170852 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25170982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25170997 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25171515 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25171540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25172070 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25172128 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25172838 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 25172867 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25172880 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25173057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25173150 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25173308 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25173372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25173685 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25173758 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25173798 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25173810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25173854 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25175272 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25175567 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25176694 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25177228 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25178840 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25179033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25179099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25179608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25180503 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 25180506 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 25180522 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25180546 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25180566 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25180590 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25180595 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25180611 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25180730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25180742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25180835 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25180836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25181011 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25181831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25182349 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25182568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25182899 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25184417 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25184903 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 25185185 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 25186277 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25186309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25187619 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 25187969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25189791 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25190607 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25190897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25190931 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25191609 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 25192015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25195435 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25196437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25198362 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25198426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25198488 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25199644 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25199646 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25199668 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25199801 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 25200232 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 19 25200425 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25200450 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25200495 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25200501 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25200546 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25200643 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25200698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25200714 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25200795 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25200908 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25200927 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25201051 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25201053 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25201439 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25201608 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 25201779 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25201961 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25201962 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25202148 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25202561 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 25202625 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 19 25202770 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25202802 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 19 25202840 T G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 19 25202847 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 19 25203213 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 25203233 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25203300 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 25203328 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25203355 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25203374 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 25203463 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 25203464 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25203512 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25203521 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25203558 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25203712 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25203722 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25203723 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25203761 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25203927 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25203970 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25204384 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 25204673 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 19 25204681 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 25204690 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 25204695 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 25204721 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 25204759 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 25204769 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25204771 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25204776 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25204784 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25204805 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25204827 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25204929 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25205059 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 25205156 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25205219 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25205303 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 25205456 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 25205990 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 19 25206239 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25206251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25206266 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 25206367 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 25206930 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25207120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25207129 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25207218 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25207257 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25207325 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25207521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25207561 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25207584 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25207604 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 25207652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25207675 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25207756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25207807 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25207999 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25208142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25208337 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25208383 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25208582 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 19 25208827 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25208830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25208887 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 25209001 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25209089 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25209098 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25209198 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25209212 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25209288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25209357 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25209369 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25209844 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25209854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25209896 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25209904 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25209986 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25209994 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25210629 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25211323 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25212348 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25212523 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25212540 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25212546 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 25212639 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25212648 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25212658 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25212679 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 25212757 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 25212783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25212787 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25212789 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25212791 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25212814 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25212993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25212998 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25213032 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25213060 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25213083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25213243 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25213244 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25213257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25213368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25213374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25213377 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25213417 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25213549 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25213551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25213860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25213979 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25214101 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25214117 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 25214137 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25214169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25214185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25214248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25214263 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25214311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25214416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25214495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25214710 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25214778 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25214893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25215067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25215111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25215310 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25215312 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25215377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25215416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25215420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25215422 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25215501 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25215851 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25217897 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25217999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25218915 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25221146 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 25221168 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25221420 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 25221439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25221454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25221489 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25221587 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25221623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25221624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25221640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25221744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25221799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25222033 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25222099 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25222105 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25222150 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25222155 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25222170 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25222208 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25222218 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25222280 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25222395 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25222489 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 25222525 T C N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.214285714285714 0.642857142857143 0.142857142857143 15 13 3 9 2 19 25222541 T C N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 12 8 3 6 1 19 25222655 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 25222931 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25223581 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 25223636 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25223673 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25223730 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 25223737 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 25223746 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 19 25223797 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 25223799 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25223924 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 25223932 G A N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.166666666666667 0.583333333333333 0.25 11 13 2 7 3 19 25224171 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 25224195 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 25224490 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25224505 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25224513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25224527 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 25224557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25224558 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25224563 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25224699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25224764 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 25225274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25225342 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25225355 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25225417 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 25225424 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 25225590 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25225674 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25225830 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25225845 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25225859 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25225910 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25225989 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25226093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25226102 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25226103 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25226249 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25226358 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 25226376 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 25226389 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 25226406 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 25226470 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 25226771 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 19 25226868 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 25226882 A G N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 19 25226931 T C N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 19 25226932 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 19 25226979 T G N N 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 6 10 1 4 3 19 25227025 A G N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 19 25227041 A G N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 19 25227068 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 19 25227070 C A N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 5 11 0 5 3 19 25227485 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25227538 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 19 25227555 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25227590 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25227754 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25227807 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25227994 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25228007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25228017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25228034 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25228267 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 25228925 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 25228981 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25229000 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25229022 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25229147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25229253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25229458 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 25229491 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 25229650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25229795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25229797 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 25230140 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25230176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25230490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25230511 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25230782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25231303 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 25231325 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 25231436 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 25231437 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25231569 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 25231577 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 25231614 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 25231759 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 25231814 A T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 25231821 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 25231825 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 25232151 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25232207 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25232264 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25232642 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25232648 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25233030 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 25233042 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25233253 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25233482 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25233821 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 25233840 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25233841 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25233852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25233864 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25233894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25233896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25233961 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 25233977 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25234001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25234234 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25234310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25234398 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 25235087 T C N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 19 25235182 A T N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 19 25235190 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 19 25235191 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 19 25235318 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 25236383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25236455 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25236493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25238416 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 25238455 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 25238567 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 25238573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25238635 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 25238658 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25238661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25238664 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 25238689 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 25238935 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25240415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25240432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25240461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25240475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25240512 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25240547 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 25240584 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 25240613 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 25240617 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25240633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25240673 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 19 25240688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25240723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25240753 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 19 25240793 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25240891 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25241065 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25241103 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25241141 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 25241176 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 25241228 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 25241244 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 25241246 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 25241473 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 25242068 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 25242414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25242477 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 25242835 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 25243183 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 25244012 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 25244846 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25244851 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25246832 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25247325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25249693 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 25249729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25249825 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25251016 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 25251360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25251408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25251517 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 25251593 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 25251650 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25251661 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 25251688 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 25251689 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25251731 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 25251965 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 25251985 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 25252013 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 25252073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25252101 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25252141 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 25252292 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 25252702 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25252757 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 25252799 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 25253034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25253534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25254841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25254934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25255028 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 25255032 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 25255097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25255139 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25255143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25255156 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 25255439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25255496 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25255870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25256017 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 25256416 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 25256431 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25256491 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25256519 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 25256523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25256529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25256612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25256614 T A Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 25256629 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 25256630 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 25256685 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 25256732 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 25256757 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 25256809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25256827 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25256837 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 25256870 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25256885 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 25256888 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 25256903 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25257115 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 25257274 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25257339 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 25257352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25257377 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 25257418 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 25257567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25257609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25257623 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25257914 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25259500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25259748 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25259948 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25260249 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 25260446 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 25260576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25260672 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 25261185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25261312 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25261393 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 25261591 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25261845 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25261847 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25262290 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25262643 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25263215 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 25264474 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25265471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25265756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25265846 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 25266186 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25266215 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25266223 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25266277 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25266445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25266457 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25266561 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 25266597 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 25266769 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 25266781 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25266850 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25266866 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25266907 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 25266946 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 25266950 C G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 25267026 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 25267128 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 25267321 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 25267581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25268366 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 25268456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25268480 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 25268620 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 25268628 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 25268881 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 25269068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25269269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25269429 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25269794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25269906 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25270149 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25270866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25271835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25271845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25272158 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25272605 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 25272637 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 25272650 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 25272777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25272784 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25273276 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 25273963 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 25274303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25274956 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 25276352 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 25276355 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25276391 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 25276483 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 25276751 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 19 25276804 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 25276858 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 25276981 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25277471 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 25277625 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 25277740 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 25277966 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25278362 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25278656 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 25278845 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 19 25278859 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 25287471 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 25288251 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 25294374 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 25295798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25295963 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25296309 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25296679 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 25297310 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25297405 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25297592 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 25297817 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 25297955 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 25298824 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 25299085 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 25299157 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 25299251 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 25299317 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 25299333 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 25299985 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 25300041 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25300263 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 25300360 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25300535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25300664 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25300776 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 25300818 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 25300823 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 25300839 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 25300851 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 25300879 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25300885 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 25300930 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 25301018 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 25301210 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25301257 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 25301272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25301281 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25301309 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 25301378 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25301453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25301545 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 25301612 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 25301856 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 25301908 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25301940 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 25302170 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 25302483 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25302705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25302729 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 25302838 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25302842 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25302875 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 25302880 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 25302891 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25302929 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25303066 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 25303067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25303140 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 25303262 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 25303275 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 25303290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25303326 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 25303426 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25303522 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 25303588 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 25304162 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 19 25304164 G T N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 19 25304229 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 25304233 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 25304496 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 25304512 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 25304794 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 25304814 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 25304880 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 25304932 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 25304938 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 25305018 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 25305024 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 25305104 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 25305155 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 25305162 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 25305461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25305674 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25306102 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25306290 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 25306339 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25306454 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 25306456 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25306478 G C N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 19 25306855 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 25306859 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25306912 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 25306919 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 25307016 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 25307045 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 25307144 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 25307289 A G N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 19 25307750 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 25307895 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 25308045 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25308609 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 25308699 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 25308723 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 25309550 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 25309566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25309634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25310015 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 25310019 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 25310190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25310326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25311150 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25311323 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 25312386 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 25312646 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 25313419 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 25314188 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25314515 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25315131 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 25315482 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 25315802 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25315874 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25315891 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 25316945 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 25317168 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 25317593 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25317698 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 25317818 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 25318030 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25318123 G T N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 19 25318417 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 25318437 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 25318546 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25318748 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25318945 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25319060 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 25319311 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 25319554 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 25319585 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 25319725 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25319850 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25321206 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 25321762 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25322588 A G Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 19 25322601 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 25322628 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 25322711 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 19 25322830 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 25323726 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 25326675 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 25326755 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 25326902 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25326921 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 25326936 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 25326950 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 25327127 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 25327230 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 25327265 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 25327366 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 25327389 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25327426 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 25327514 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 25327648 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25327757 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25327835 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 25327885 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25327937 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25328055 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25328436 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25328476 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 25328575 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25329162 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25329719 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 25329720 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 25333421 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 25333555 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 25333616 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 25334957 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 25335052 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 25335184 G A N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 19 25335204 T C N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 19 25335239 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 19 25335310 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 25336028 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 25336036 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 25336357 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25336358 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 25336385 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25336964 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 25336980 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25337003 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 25337566 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 25337680 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 25337707 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 25337745 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25337763 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25337840 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 25338120 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 25338273 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25338345 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25338351 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25339608 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 25339631 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25340040 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 19 25340348 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 25340361 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 25340727 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25340730 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 25340850 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 25340969 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25341042 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 25341131 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 25341134 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 25341247 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25341395 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 25342071 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 25342290 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 25343171 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 25343250 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25343308 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 25343313 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 25343317 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 25343909 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 25343965 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 25344548 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 25344719 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 25345289 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25345341 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25345563 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 25346300 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25346320 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 25348726 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 25348743 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 25349061 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 25349301 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 25349550 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 25349887 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.153846153846154 0 0.846153846153846 4 22 2 0 11 19 25349915 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 25350818 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 25350843 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 25351063 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25351491 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 25351528 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 25351635 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25351770 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 25351771 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 25352004 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25352333 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 25352605 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25352736 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 25352740 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 25352940 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 25352965 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25352967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25353196 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 25353297 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 25353548 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 25353681 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 25353738 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 25353753 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 25353764 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 25353812 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 25353816 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 25354839 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25357961 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 25359279 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 25359996 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25361073 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 25361209 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 19 25361233 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 25361295 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25361321 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 25361336 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 25361771 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 25362363 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 25362539 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 25362602 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 25362729 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 25362768 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 25363760 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 25363809 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 25363925 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 25364157 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 25364507 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25364893 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25365364 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 25365640 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25369081 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25369435 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 25369570 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 25371768 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25372207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25372276 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 25372352 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25372488 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25372533 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 25372563 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 25372828 T G N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 19 25372944 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 25372947 T A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 19 25373068 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 25373265 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25373266 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25373338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25373517 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 25373593 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25373793 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 25374507 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 25374733 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25374949 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25374983 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25375203 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 25375209 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 25375408 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25375551 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25375595 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25376454 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 25377558 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 25377587 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 25380287 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25380313 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 25380708 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 25381152 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 25381178 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 25381506 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 25382098 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 25382133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25382336 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 25382340 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 25382617 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 25382633 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 25382937 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 25382987 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 25382988 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 25383248 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 25383420 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 25383591 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 25384009 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 25384126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25384630 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25385275 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 25385563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25385903 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 25386055 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 25386295 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 25386321 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 25386650 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 25386776 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25386809 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25387057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25387118 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25387172 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 25387408 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 25387428 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 25387435 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 25387498 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 25387542 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 25387557 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 25387613 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 25387664 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 25387720 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 25388379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25389993 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25390349 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 25390777 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25390824 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25391097 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 25391121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25391222 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 25391255 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25391256 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 25391470 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25391588 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 25391768 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 25391783 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25391864 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 25391873 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 25391877 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 25391895 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 25391922 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 25392143 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 25392147 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 25392166 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 25392203 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 25392289 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 25392327 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 25392358 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 25392390 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 25392429 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 25392633 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25393255 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25395267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25395352 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25395362 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25395385 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25395490 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 25395511 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 25395526 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 25395568 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 25395600 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25395706 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 25395727 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25396000 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25396085 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 25396088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25396233 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25396260 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 25396275 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25396513 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 25396547 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 25396906 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25396937 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 25396988 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 25396989 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 25397265 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25397297 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 25397333 C A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 25397335 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 25397381 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25397390 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 25397445 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 25397461 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 25397489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25397491 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 25397607 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 25397926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25398264 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 25398397 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 25399324 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 25399480 A C N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 19 25399572 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 25399599 C T N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 19 25400049 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 25400184 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 25400228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25400494 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 25400729 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 25400810 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 25401100 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 19 25401244 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 25401282 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 25401293 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 25401514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25401631 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 25402008 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25402041 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25402128 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 25402236 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 25402461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25402492 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25402552 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 25403112 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 19 25403159 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 25403376 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 25403535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25403830 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 25403948 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 25404008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25404073 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25404115 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25404874 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 25404892 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 25404894 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 25405166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25405218 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25405307 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25405336 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25405391 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25405426 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25405427 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25405476 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 25405485 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25405561 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 25405572 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25407224 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 25407240 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25407410 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25407737 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25407817 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25408147 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25408190 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25408308 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25408342 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25408369 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25408370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25408467 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 25408468 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 25408479 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25408496 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25408716 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 25409393 G A N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 10 6 4 2 2 19 25409471 C T N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 19 25409772 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25410671 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 25410713 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25410722 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 25412797 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 25413429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25413983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25414926 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25415913 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 25416693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25416743 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25417364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25417979 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25418006 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 25418547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25420175 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25420508 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25420665 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25424305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25424425 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25425435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25426444 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 25427453 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25429028 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 25429064 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 25430085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25435388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25440884 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 25447408 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25450548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25450643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25450674 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 25450907 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 25451211 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 25451611 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 25451885 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 25452577 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 25452827 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 25453039 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 25453305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25453489 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25453502 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25453538 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25453884 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25454026 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25454112 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 25454145 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 25454176 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 25454198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25454203 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25454231 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 25454293 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25454301 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25454381 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 25454396 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 25454504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25454613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25454739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25454806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25454855 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25454859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25454927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25455732 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 25455735 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 25455825 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 25455892 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 25455897 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25456133 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 25456147 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25456165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25456223 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 25456246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25456416 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25457721 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 25457759 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 25457773 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 25457780 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 25457916 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 25458168 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 25458205 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 25458394 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 25458678 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25458719 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 25459065 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25459066 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 25459095 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 25459208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25459259 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 25459301 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25459466 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 25459593 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25460198 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 25460264 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 25460286 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 25460347 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 25460362 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 25460405 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 25460587 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 25460588 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 25461080 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 25461117 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 25461407 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 25461462 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 25461675 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 25461677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25461691 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 25461780 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 25461848 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25461960 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25461969 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25462017 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 25462462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25462469 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25462537 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 25462766 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 25463080 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 25463093 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 25463123 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 25463217 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25463247 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 25463637 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25463690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25463822 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25463823 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25463919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25463977 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 25464037 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25464089 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 25464128 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 25464154 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 25464171 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 25464176 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 25464189 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 25464296 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 25464324 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 25464339 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 25464371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25464375 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 25464567 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 25464983 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 25465015 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 25465119 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 25465121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25465129 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 25465142 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 25465297 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 25465628 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 25465770 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 25465790 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25466181 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 25466498 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 25466541 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 25466801 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 25466804 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 25466948 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 25467257 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 25467274 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 25467361 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25467478 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 25467620 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 25467633 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 25467766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25467768 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 25467862 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 25468069 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 19 25468125 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 25468165 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 25468236 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 25468307 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5 0.1875 0.3125 19 13 8 3 5 19 25468742 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 25468760 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 25468769 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 25468827 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 25468927 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 25468934 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 25469362 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 19 25469411 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 25469739 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 25469888 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 25470288 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 25470350 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 25470415 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 25470567 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 25470715 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 25471115 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25471220 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 25471378 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 25471429 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 25471595 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25471781 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 25471784 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 25471900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25471924 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 25471973 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 25472328 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25472589 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 19 25472591 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 25472617 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 25472637 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 25472685 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 25472890 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 25472899 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 25473018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25473241 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 25473247 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 25473318 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 19 25473412 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 19 25474003 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 25474155 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 25474361 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25474396 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 19 25474710 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25474711 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25474733 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 19 25474862 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 25475063 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25475074 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25475081 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 25475111 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25475122 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25475256 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25475416 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 25475417 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 25475466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25475672 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 25475975 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 25475994 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 25476268 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25476541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25476835 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25476968 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 19 25477019 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25477193 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 25477218 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 25477220 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 19 25477838 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 25477873 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 25477931 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 25477936 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 25478008 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 25478119 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 25478125 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 25478220 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 25478275 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 25478856 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25480175 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 25480827 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 25481134 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25481612 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 25481635 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 19 25481898 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 25482157 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 25482238 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 25482240 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 25482892 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 25483090 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 25483205 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 25484219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25484771 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 25485138 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 25485660 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 25486133 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 25486218 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 25486326 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25486361 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 25486377 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 25486821 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 25486911 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 25486962 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 25486963 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 25487058 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 25487063 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 25487081 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25487125 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 25487225 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 25487437 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25487458 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25487594 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 25487595 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 25487651 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 25487692 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 19 25488090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25488100 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 25488126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25489781 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25490472 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 25490794 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25491415 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25493325 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 25493483 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 25494053 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25494527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25495092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25495241 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25496287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25496591 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 25496979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25497265 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25497288 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25498926 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25498982 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25498994 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25499046 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25499141 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25499144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25499197 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25499240 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25499247 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25499299 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 25499329 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25499753 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25500066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25500168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25500177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25500216 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 25500244 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25500264 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 25500291 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 25500507 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 25500590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25500630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25501082 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25501513 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25502146 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 25502159 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 25502216 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 25502625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25502756 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 25502867 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 25502930 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 25503429 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25503511 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 25503692 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 25504022 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 25504073 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 25504096 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 25504103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25504233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25504473 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 25504512 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 25504609 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 25505021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25505229 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 25505344 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 25505392 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 25505576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25505599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25505847 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 25505859 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 25505905 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 25505971 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 25505997 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 25506080 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 25506129 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 25506172 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 25506193 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 25506197 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25506205 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25506207 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 25506257 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 25506327 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 25506391 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 25506533 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25506541 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 25506638 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25506746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25506782 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25506800 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25506814 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25507083 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25507138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25507257 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25507273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25507310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25507658 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25507693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25507806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25508161 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 25508227 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 25508501 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 25508771 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 25508895 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 25509032 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 25509070 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25509081 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 25509169 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 25509379 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 25509683 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 19 25509711 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 25509749 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 25509772 A G N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 19 25510038 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 25510245 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 25510264 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 25510393 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25510417 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25510429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25510452 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25510501 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25510573 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 25510603 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 25510934 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25511006 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25511070 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 25511310 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25511608 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 25511707 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 25512558 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 25512660 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 25512714 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 25512783 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 25512784 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 25513881 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 25513947 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25514041 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 25514064 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 25514070 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 25514127 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 25514162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25514718 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 25514819 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 25514821 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 25514831 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25515161 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25515342 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25515396 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 25515413 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25515414 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25515445 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25515549 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25515640 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25515847 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 25515952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25516869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25516937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25516990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25517019 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25517364 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25517597 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25518630 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 25518645 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 25518653 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 25518777 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25518796 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25518803 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25518812 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25518819 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 25518836 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25518930 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 25518992 T A N N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 19 25519040 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 25519155 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 25519175 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 25519664 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 25519667 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 25519716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25519775 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 25519877 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 25520344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25520419 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25520451 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25521224 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25522078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25522654 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 25522840 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 25522854 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 25523227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25523395 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 25523630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25523857 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 25524391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25524507 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25524715 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 25524900 A G Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 25524919 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 25524985 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 25525279 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 25525414 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 25525415 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 25526030 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25526600 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 25526614 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25526619 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25526635 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25526804 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 25526889 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 25526894 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 25526996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25527367 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 25527669 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 25527954 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 25528017 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 25528046 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 25528161 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 25528195 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 25528239 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25528302 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25528338 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25528419 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 25528470 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 25528487 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 25528490 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 25528523 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 25528542 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 19 25528585 A T N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 19 25528633 T A N N 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 19 25528738 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 25528907 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 25528925 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 25528926 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 25528947 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 25529158 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 25529376 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 25529484 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 25529511 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 25529516 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 25529721 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 25529995 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 25530000 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 25530025 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 25530034 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 25530116 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25530149 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 25530155 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25530189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25530220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25530572 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25530627 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25530631 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 25530655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25530758 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25530839 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 25531678 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 25532358 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 25532387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25532514 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 25532550 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 25532562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25532566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25532903 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 25532933 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 25532992 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 25533157 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25533166 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 25533654 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 25533673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25533692 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25533694 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25533819 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25534113 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25534289 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 25534318 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 25534462 C A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 19 25534487 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 25534761 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 25534872 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 25535186 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 25535462 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25535553 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 25535681 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 25535695 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 25536132 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25536224 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 25536253 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25536519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25536520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25536623 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25536846 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25537189 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 25537254 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 25537418 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 25537881 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25537924 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 25538370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25538420 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25538604 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25538617 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25538623 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25538686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25538766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25538790 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25538885 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25538916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25538939 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 25539471 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 25539524 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25539699 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25539886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25539991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25540097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25540143 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 25540277 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25540300 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25540347 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 25540364 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 19 25540390 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 25540619 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 25540842 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25540853 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 25541000 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 25541035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25541133 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 25541268 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 25541337 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25541394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25541442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25541451 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 25541544 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 25541728 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 25541944 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 25542003 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 25542257 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 25542265 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 25542345 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 25542351 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 25542354 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 19 25542484 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 25542593 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25542686 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 25543276 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 25543482 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25544032 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 25544178 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25544247 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 25544250 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 25545193 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25545242 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 25545378 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 25545391 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 25545449 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 25545534 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 25545616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25545631 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25545632 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25545717 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25545765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25545784 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25545829 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 25545948 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 25546156 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25546157 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 25546200 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 25547491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25547565 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 25547575 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 25547768 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25547798 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25547799 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25547801 A C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25547832 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25547922 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25548188 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 25548343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25548390 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 19 25548421 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25548440 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25548670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25548765 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 25548803 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 25548987 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25549483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25549619 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 25549756 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 25549801 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 25549883 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 25549897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25549900 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25549933 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25550301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25550528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25550697 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25550882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25551998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25552209 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 25552453 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 25552981 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25553052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25553239 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25553351 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 25553955 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 25554293 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25554704 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25555261 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25555274 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25555644 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 25556319 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 25556526 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25558452 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 25561531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25561803 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25562040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25562055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25562446 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 25562852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25562861 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 25562994 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 25563033 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 19 25563173 T C N Y 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 19 25563210 T A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 25563298 C A N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 19 25563347 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25563457 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 25563459 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 25563649 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 25563650 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 25563688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25563784 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25563919 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 25563970 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25564063 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 25564077 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 25564122 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 25564231 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 25564232 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 25564260 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25564786 T C N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 19 25564799 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 25565091 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 25565594 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25566455 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25567883 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 25568284 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25568937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25569300 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25569325 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 25569536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25569572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25570944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25571142 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 25571167 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 25571175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25571283 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 25571409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25571550 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 25571626 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 25571764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25571906 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 25571998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25572069 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25572399 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 25572463 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 25572802 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 25572849 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 25572878 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 25572879 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 25572988 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 25573005 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 25573290 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 19 25573321 G A N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 19 25573415 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 25573839 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 25573958 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 25573997 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 25574063 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 25574116 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 25574158 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 25574185 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25574231 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 25574318 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 25574537 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25574589 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 25575368 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25575388 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25575450 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.125 0.8125 0.0625 17 15 2 13 1 19 25575580 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 25575643 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 19 25575686 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 25575687 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 25575688 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 25575708 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 19 25575821 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25576261 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 25576560 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 25576568 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 25576760 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 25576764 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25576807 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 25576821 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 25576822 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 25577596 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 25577600 A T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 25577968 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 25578931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25580890 G C N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 19 25580921 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 25580964 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 25581400 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 25581705 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25581829 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 19 25581958 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 25582242 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 25582819 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25582879 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 25583626 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 25583627 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25583636 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 25583653 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 25583688 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 25583881 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25583929 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25583974 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 25583985 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 25586740 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 25587167 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 25589205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25589515 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25589613 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25592214 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25593701 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 25593838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25593897 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25594003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25594557 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25594584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25596360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25597436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25598405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25598787 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25600276 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 25600548 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25600575 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25601347 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25603000 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 25603001 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 25603061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25603063 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25603144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25603363 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 25603400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25603416 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 25603417 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25603455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25603473 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 25603487 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 25603504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25603541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25603558 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25603816 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 25604012 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 25604131 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25604269 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25604319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25604620 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 25604755 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 25604787 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 25604793 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 25604835 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 25604863 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 25604868 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 25604878 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 25604935 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 19 25604986 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 25605016 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 25605064 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 25605083 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 25605157 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 25605176 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 25605197 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25605201 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25605318 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25605410 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25605535 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 25605571 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 25605611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25605682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25605785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25605886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25606164 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25606171 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25606214 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25606253 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25606286 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 25606440 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 25606690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25607641 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 25607655 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25607661 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 25607667 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 25607800 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25607813 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25607868 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25608351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25608483 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 25608508 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25608570 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 25608727 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 25610019 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25610125 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25610141 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 25610171 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25610217 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25610296 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25610441 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 25610453 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 25610456 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 25610475 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25610503 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25610506 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 25610611 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 25611057 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 25611150 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25611507 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 25611753 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 25613364 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25614180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25614426 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25614511 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25614867 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25615108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25615812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25616289 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25616358 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25616407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25616904 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25617078 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25617318 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25617344 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25617439 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25617448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25617450 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25617508 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25618021 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25618196 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25618465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25619501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25620180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25622017 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 25622448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25625069 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25626563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25628217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25628299 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 25628305 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 25628444 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25628584 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 25628616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25629000 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 25630519 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25630677 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 25630705 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25630740 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 25630777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25630784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25630833 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 25630840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25631336 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25631441 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25631469 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25631645 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25631663 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25631677 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 25632056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25633703 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 25633745 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 25633926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25634254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25635372 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25636397 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25642439 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25643367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25643543 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25643576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25644836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25645675 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 25646995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25647737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25648498 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 25648823 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 25649838 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 19 25649933 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 25650797 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 25651177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25651389 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 25651419 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25651441 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25653026 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25653696 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25653962 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25654695 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25657082 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25657894 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 25657919 A C N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 19 25658480 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25661843 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25661983 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 25661995 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25662031 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25662045 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25662189 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25662787 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 25663137 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 25663146 C T N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 19 25663191 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 25663195 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 25663239 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 25663269 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 25663396 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 25663452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25663605 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 25663610 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 25663662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25663675 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 25663944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25663957 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 25664070 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25664087 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 25664131 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25664228 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 25664414 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25664987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25665234 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 25665250 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 25665570 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25665585 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25665619 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25665751 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 25665757 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 25665779 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25665882 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 25665885 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25665889 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25665919 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25665955 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25666243 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25667044 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25667116 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 25667346 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25667347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25667603 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25667700 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25667704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25668001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25668055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25668118 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 25668195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25668354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25668571 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25668771 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25668782 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 25669032 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25671068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25671449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25671817 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25671838 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25672488 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25673046 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 25673692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25673865 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 25674523 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 25674592 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 25674733 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25674854 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25675276 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 25675479 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 25675777 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 25677006 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25680438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25681088 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25681090 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 25681112 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25681456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25681763 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25683294 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 25683839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25686223 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 19 25686534 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25686577 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25686835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25687034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25687148 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25687457 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 25687467 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25687998 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25688141 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25688513 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25688606 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25688607 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 25688919 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 25689345 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 25689912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25689915 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 25692917 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 25692962 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 25693064 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 25693477 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25695918 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 25695959 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25696120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25697005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25697281 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25700112 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25700266 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25700403 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25700412 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25700414 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25700507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25700616 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 25700689 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 25700816 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 25700845 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25700933 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 19 25701809 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25701906 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25701957 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25702054 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25702302 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25702450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25702739 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 25702751 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 25702851 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25702945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25703105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25703228 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 25703258 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 25703291 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25703540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25704151 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25704210 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 25704212 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 25704502 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25704815 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 25706434 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 19 25706445 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 19 25706583 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 25706655 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 25711010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25711520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25711858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25711881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25712255 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 25712289 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25712294 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 25712862 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25712895 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25713346 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25713491 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25713537 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25713580 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25713713 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25714142 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25714176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25714459 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25714687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25714724 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 25714807 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25714812 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25714954 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25714995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25715122 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25715217 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25715238 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 25715442 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 19 25715633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25715650 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 25715662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25715737 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25716083 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25716087 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 25716246 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 25716313 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 25716348 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25716485 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 25716693 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 25717566 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 25718308 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 25718427 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 25718556 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 25718621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25718662 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 25718955 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 25719032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25719963 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 25719970 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 25719972 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 25720041 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 25720048 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 25720262 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 25720512 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 25720593 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 25720776 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 25720796 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25720831 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25720849 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25721163 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25721290 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 25721533 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25721660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25721806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25722339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25723120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25723535 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25723590 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 25723622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25723659 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25723894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25724031 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25724942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25725980 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25726685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25728471 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25728763 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25729669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25730436 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 25731300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25732350 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25733180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25734003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25734169 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25735256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25740888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25741094 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25742025 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 25742065 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 25742073 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 25742094 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 25742095 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 25742135 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25742872 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 25743099 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 25743612 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 25744304 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 25744347 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25744387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25744571 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 25744689 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25744730 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25745220 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 25745644 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25745663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25746386 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25746844 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25746965 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25746970 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25747026 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25747119 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25747139 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25747586 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25747654 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25747789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25747850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25747933 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25748566 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25748926 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25748956 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25749927 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 25749949 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 25749972 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 25750032 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25750033 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25750076 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 25750149 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25750286 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25750308 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 25750478 C G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 19 25750565 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25750707 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 25750765 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 25750786 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25751241 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25751296 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 25752076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25752158 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 25752209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25752752 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25752930 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25752992 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25753157 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25754087 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25754141 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 25754191 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 25754211 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 25754553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25754554 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25754606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25755285 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 25755313 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 25755365 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 25756490 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25756543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25756948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25757195 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 25758573 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25762541 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25762720 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 25762760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25762835 T G Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 25762840 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25762881 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 25762933 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 25762979 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 25763375 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25763379 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25763448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25763633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25763739 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25764297 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25764320 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25765226 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25765259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25765315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25765762 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25765792 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25765807 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25765881 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25766974 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 25767024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25767118 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 25767162 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 25767341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25767659 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 25768046 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 25768256 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 25768420 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 25768685 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 19 25768696 T G N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 19 25768758 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 25769030 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25769095 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25769883 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25770452 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25770654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25771024 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 25771050 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25771311 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25771661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25771948 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25772297 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25772847 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 25773394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25773908 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25774068 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25775824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25775861 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 25776005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25776117 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 25776440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25776489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25776541 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 25777041 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25777121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25778095 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25778432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25778486 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25778613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25778761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25778813 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25779139 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25779251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25779267 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25779292 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 25779592 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25779812 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 25779930 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25780177 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 25780205 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 25781864 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 25782369 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 25782398 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 25782607 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 25782706 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 25784266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25784678 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25786999 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25787281 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 25787336 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25787536 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25787587 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25787675 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25787948 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 25787979 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 25787996 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 25788188 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25788518 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25788610 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25790469 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 25790471 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 25790559 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 25790572 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 25790805 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 25791067 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 25791295 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 25791370 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 25791392 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 25791403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25791488 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25791501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25791512 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25791761 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25791764 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25791802 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 25792092 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25793197 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 25793385 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 25793677 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25793816 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 25793866 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25794121 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25794176 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25794275 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 25794342 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 25794458 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 25794672 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25795627 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25795689 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25795934 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25796057 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 25796287 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25796556 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25797125 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 19 25797126 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 25797447 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 25800043 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25800957 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25801004 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 25801302 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 25801647 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 25802219 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 25802410 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 25802421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25802422 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 25802499 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25802607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25802656 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 25802683 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25802699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25802840 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 25804074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25805264 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 25805476 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25805838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25805839 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25806275 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25806344 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25806370 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25806813 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25808079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25808457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25808580 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25808584 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25808663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25809010 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 25809049 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25809694 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 25809909 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25810110 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 25810232 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 25810339 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 25810547 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 25810588 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 25810699 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 25810737 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25810741 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25811955 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25812943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25815693 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25817815 C G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 25820357 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25820376 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 25820651 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25821636 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25824742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25824965 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 25826514 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 25826526 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 25826531 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 25826587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25826613 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 25826672 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 25826676 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 25826700 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 25826966 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 25827014 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 19 25827056 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 19 25827471 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 25827496 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25827497 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 25827502 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 19 25828388 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 25828441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25828467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25828894 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25836900 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 25837103 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 25837143 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 25837354 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 25838078 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25845629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25846152 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25848328 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25853580 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 25854204 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25856785 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25857321 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25857659 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 25858374 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25858425 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25858451 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 25858828 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25859043 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 25859113 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 25859179 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 25860639 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 25862305 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25862840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25863995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25864153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25868352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25868356 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25868446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25868515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25869157 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 25873067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25873083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25873094 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25874029 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25874037 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 25875990 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25876252 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25876779 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25876783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25877881 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25878494 C T N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 19 25880260 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25881342 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 25881839 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 25882021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25882738 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 25883559 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25883917 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 25886786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25888653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25889337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25890482 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25890842 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25890866 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25891167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25891441 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25891447 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25891448 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 25891620 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25891621 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25891787 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 25892016 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 25892025 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25892046 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 25892382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25892430 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25892458 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25892506 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 25892711 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25892715 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25892756 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 25892857 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 19 25892881 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 25893592 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25893610 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25900040 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 25900046 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25900088 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25900135 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25900136 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25900194 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 25900446 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 25900580 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25900602 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 25900631 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 25900672 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 25900724 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25900727 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25900872 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 25900900 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25900915 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25901121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25901213 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 25901215 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25901224 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 25901246 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25901263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25901273 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25901290 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25901438 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25901467 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 25901483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25901525 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 25901557 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25901650 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25901654 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25901778 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 25905809 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 19 25905822 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 25905825 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 25905867 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 25905902 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 19 25905922 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25906229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25906327 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25906751 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25907090 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25907748 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 25908201 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 19 25908224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25908365 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 25908455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25908703 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 25909063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25909242 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 25909316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25909463 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 25909608 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 25909937 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 25910124 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25910266 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 25910299 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 25910442 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 25910636 A C N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 19 25910751 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 25911149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25912778 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25912831 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25912995 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 25913399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25913487 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25913598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25914494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25914598 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25914706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25914975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25916212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25916620 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25918927 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25920680 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25920904 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25921148 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25921269 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25921291 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25921577 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 25921633 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 25921651 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 25921853 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 25921855 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 25922701 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 25922751 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 25922885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25923380 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 25924577 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25924719 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 25925242 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25926852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25927137 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 25927727 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 25927784 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 25928101 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25930511 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25930787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25933411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25934420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25935640 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25935802 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25935923 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 25936008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25936526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25937007 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25937035 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 25937042 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25937243 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 25937807 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 25938136 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25938236 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25938372 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 25938418 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 19 25945351 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 25945382 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 25945396 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 25945695 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 25945702 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 25945780 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 25945796 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25945805 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25945839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25945842 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25946050 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25946115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25946120 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25946294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25946488 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25946604 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 25946618 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 25946697 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25946790 A C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 19 25947083 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25947174 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 25947202 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 25947271 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 25947603 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 25947810 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25947841 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25947848 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25947850 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 25947856 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 25948137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25948144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25948220 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25948237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25948243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25948248 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25948290 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25948492 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 25948640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25948680 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 25948681 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 25948872 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25950262 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 25950268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25950328 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25950360 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 25950525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25950807 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25950899 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25950926 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25951043 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25951044 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25951054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25951668 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 25951878 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25951958 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25951964 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25951968 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25952094 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25952159 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 25952236 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 25952559 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 25953078 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25953310 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 25953369 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 25953373 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 25953745 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25954013 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 25954367 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 25954514 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25954714 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 25954907 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 25954941 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 25955064 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25955069 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25955501 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25955529 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 25955597 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 25955642 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 25956028 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25956177 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25956343 C G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 19 25956413 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 25956628 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 25956796 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 25956803 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 25956825 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 25956834 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 25956937 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25957114 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25957195 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 25957251 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 25957288 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 25957534 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 25957540 T G N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 25957950 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 25957974 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 25958007 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 25958147 C T Y Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 6 10 1 4 3 19 25958178 T C Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 25958187 G C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 25958192 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 19 25958196 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 25958281 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 19 25958358 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 25958551 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 25958819 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 25959055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25959164 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25959189 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25959642 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25959647 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25959905 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 25959912 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25959939 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 25960110 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 25961773 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25961899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25962478 G A N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 19 25963343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25963385 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 25963677 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 25963690 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 25963904 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25964159 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 25964969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25966882 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 25967067 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 25967085 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 25967098 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 25967099 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 25967102 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 25967121 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 25967123 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 25967136 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25967170 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 25967171 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 25967189 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 25967255 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 25967495 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 25967511 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 25967759 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 25967852 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 25968787 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25970047 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 25970775 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 25971098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25971469 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25972091 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 25973463 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25973713 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 25974032 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25974119 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 25977690 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25977840 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25978069 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25979552 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 25979779 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25980617 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 25981889 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25981976 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25982180 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25982229 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 25982635 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 25982937 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25983172 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 25983301 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25983654 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 25983671 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 25983721 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 25983748 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 25983790 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 25983826 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 25983868 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 25983881 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 25983893 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 19 25983915 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 25984008 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 25984040 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 25984390 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25984590 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25984800 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25984873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25984884 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25985061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25985163 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25985494 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 25985529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25985660 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 25985674 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25985735 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 25986281 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25986492 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 25987324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25987391 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 25988569 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25988700 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 25989033 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25989601 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 25989631 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25989660 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25989731 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 25989801 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 25989804 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 25989816 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 25989901 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 25989969 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 25990029 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 19 25990055 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 25990220 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25990260 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 25990310 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 25990487 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 19 25990629 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 25990725 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 25990886 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 25990935 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25990953 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 25991067 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 25991178 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 25991319 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 25994844 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25995017 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 25995197 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 25995821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25996485 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 25996979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25997047 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25997057 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25997060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25997100 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 25997321 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 25997333 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 25997547 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25997708 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25997724 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25997740 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25997762 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25997807 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 25997855 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25997883 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25997988 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25998128 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25998140 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 25998165 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 25998773 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 25998813 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 25999399 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 25999637 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 25999664 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 25999767 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 25999900 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 25999968 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 25999998 G C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 26000117 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26000200 G T N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 19 26000347 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 26000460 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 26000551 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 26000573 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26000652 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 26000668 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 26000872 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 26000933 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26000951 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26000966 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26000967 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 26000977 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 26001026 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26001031 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26001247 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26001328 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26001417 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26001547 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26001606 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 26001640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26001719 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 26001753 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26001768 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 26002150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26002554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26002600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26002723 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 26003042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26003101 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26003482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26003562 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 26003573 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26003678 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26003721 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26003724 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 26003867 A T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 26004319 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 26004332 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 26004336 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 26004493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26004711 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 26004742 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 26005201 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 19 26005219 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 19 26005496 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 26005596 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 26005749 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26005800 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 26005817 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 26005824 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 26005832 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 26005891 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 26005897 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 26005960 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 26006001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26006002 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 26006212 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 26006215 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 26007362 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 26007381 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 26007385 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 26007493 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 26007496 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 26007727 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26007783 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26007926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26008142 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 26008570 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 26008571 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 26008587 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26008604 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26008670 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 26008686 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 26008722 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 26008741 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 26008992 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26009076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26009161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26009165 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26009167 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26009188 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 26009207 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26009224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26009234 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 26009237 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 26009259 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26009266 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26009386 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26009450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26009479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26009563 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26009934 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 26009939 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 26009952 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 26009953 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 26009989 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26010062 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 26010102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26010115 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 26010140 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 26010380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26010389 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26010441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26010457 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26010506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26010541 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26010559 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26010560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26010682 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26010757 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26010782 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26010789 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 26010811 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26010877 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26010919 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 26011001 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26011027 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26011155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26011177 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26011204 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 26011218 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 26011260 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 26011272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26011293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26011321 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 26011325 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 26011332 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26011430 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26011465 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26011680 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 26011746 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 26011788 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26012044 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26012048 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 26012139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26012205 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26012212 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 26012244 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 26012277 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26012357 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 26012419 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 19 26012454 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 26012530 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26012595 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 26012625 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 26012677 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 26012791 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 26012839 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 26012849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26013187 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 26013286 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26013288 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 26013306 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 26013422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26013488 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 26013510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26013521 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 26013591 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 26013611 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 26013618 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26013655 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26013737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26013766 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26013835 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26013853 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26013862 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26013865 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26013897 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26014163 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26014197 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26014263 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 26014830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26014908 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26015043 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 26015125 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26015410 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 26015426 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 26015459 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26015514 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 26015531 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 26015643 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 26015804 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26016025 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 26016689 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26017750 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26018659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26018909 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26018980 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 26019009 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 26019187 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 26020429 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 26020611 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 26021070 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26021374 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26022810 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 26023838 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26024049 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 26024468 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26025062 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26026253 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 26026277 C A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 26026407 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 26026498 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 26026527 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 26026564 G T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 26026568 A T N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 19 26026783 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26026838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26027278 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 19 26027367 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 19 26027410 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 26027436 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 26027566 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 26027594 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 26027645 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 26027674 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26027687 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 26027772 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 26027801 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26027872 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26027910 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26028088 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 26028119 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 26028160 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 26028197 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26028255 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26028269 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 26028327 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 26028345 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26028358 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26028537 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26028661 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26028674 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26028689 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 26028700 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26028707 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 26029362 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 26029369 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 26029831 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 19 26029873 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0 0.8 0.2 12 18 0 12 3 19 26030051 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26030203 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26030231 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26030275 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26030276 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26030314 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26030381 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26030439 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26030483 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26030497 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 26030597 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26030646 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 26037440 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26037501 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26037849 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 26037858 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 26038042 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 26038052 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 26038106 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26038204 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26038290 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26038304 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 26038312 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26038345 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26038352 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26038591 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26038594 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26038706 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26038707 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26038727 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 26038762 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26038902 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26038930 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 26038941 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 26039252 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 26039317 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 26039330 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 26039354 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 26039413 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 26039476 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 26039497 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 26039611 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26039677 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 26039697 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26039719 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26039774 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26039805 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 26039912 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26040002 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 26040110 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 26040162 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26040176 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 26040191 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 26040202 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26040533 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 26040626 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 26040659 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26040738 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26040912 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26040935 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26040962 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 26040963 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 26040973 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26040978 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26041012 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 26041148 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26041244 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 26041245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26041489 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 26041690 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 26041872 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26041875 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 26042141 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 26042171 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 26042173 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 26042238 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 26042240 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 26042250 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 26042318 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 26042336 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 26042349 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 26042472 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26042494 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 26042598 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 26042604 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 26042689 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 26042877 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 26042900 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 26043043 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 26043069 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 26043143 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26043280 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 26043292 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 26043309 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 26043420 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 26043852 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 26043910 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26043960 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 26044113 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26044249 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 26045153 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 26045298 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 26045534 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 26045593 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 26046275 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 26046404 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 26046438 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 26046486 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 26046652 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 26046934 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 26046969 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 26047008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26047066 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 26047567 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 26047572 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 26048269 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 26048400 G T N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 19 26048421 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 19 26048475 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 26048656 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 26048723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26048828 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 26049354 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 26049431 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 26049655 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26049740 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26049755 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 26049767 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26049928 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 26050527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26050672 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 26050853 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 26050888 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26051159 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 26051273 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 26051294 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26051367 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 26051413 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26051422 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 26051520 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26051527 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 26051671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26051715 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 26051720 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 26052120 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 26052123 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26052136 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 26052187 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 26052252 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 26052281 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 26052284 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26052324 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26052435 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26052505 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 26052506 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 26052563 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 26052576 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 26052740 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 26052788 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 26053210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26053946 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 26053985 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 26054149 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26054199 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26054350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26054404 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 26055081 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 26055146 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26055632 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26056086 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 26056479 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26056524 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26056552 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 26056583 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26056599 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26056922 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26057264 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26057557 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26057685 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 26057708 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26057809 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26057934 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26057998 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26058042 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 26058094 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 26058247 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26058290 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26058317 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 26058325 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 26058337 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 26058356 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 26058368 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 26058373 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 26058444 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 26058462 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 26058507 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26058530 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26058559 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 26058617 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 26058620 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 26058631 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 26058648 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26058878 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 26059026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26059401 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 26059491 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26059528 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26059574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26059595 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26059643 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26059672 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26059697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26059711 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26059893 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 26059944 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26059978 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26060074 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 26060629 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 26060651 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 19 26060921 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 26061285 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 26061332 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 26061435 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 26061481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26061555 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 26061584 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 26061594 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 26061601 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 26061633 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 26061779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26061910 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 26061914 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26061949 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 26062109 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 26062139 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 26062144 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 26062264 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 26062265 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 26062383 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 26062435 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 26062494 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 26062548 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 26062573 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 26062644 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26062680 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 26062851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26062982 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 26062991 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 26063276 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 26063554 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26063564 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 26063676 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26063680 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 26063681 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 26063734 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 26063784 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 26063840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26063885 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 26063977 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26063991 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26064001 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26064005 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26064045 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26064202 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26064324 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26064369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26064390 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26064419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26064425 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26064477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26064547 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 26064552 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26064644 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26064659 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 26064759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26064780 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26064783 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26064795 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26064947 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 26065141 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26065519 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 26065530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26065621 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 26065644 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 26065651 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26065661 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 26065949 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 26066136 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26066256 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 26066339 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 26066596 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 26066639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26066957 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26066995 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26067003 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26067367 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 26067630 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26068093 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 26068987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26069494 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26069665 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 26070151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26070268 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 26070785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26072231 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 26072760 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 26073453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26073911 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26074381 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 26074654 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 26075183 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 26075359 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 26075461 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 26075620 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 26076282 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 26077299 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 26077394 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26077500 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26077902 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 26078237 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 26078484 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 19 26078504 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 26078508 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 26078691 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 26078776 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26078949 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 26079194 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 26079336 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 26079388 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26079574 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 19 26079582 A G N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 19 26079667 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 26079726 C T N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 19 26079757 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 19 26079815 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 19 26079832 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 26079833 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 26079865 A C N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 19 26079927 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 19 26079932 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 19 26080101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26080143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26080269 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 26080561 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 26081114 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 26081629 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 26081647 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26081658 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26081836 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 26081888 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26081905 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 26081916 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 26082102 T G N N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 19 26082884 G T Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 26082886 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 19 26082981 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 26083001 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 26083064 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 26083123 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 26083136 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 26083192 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 26083237 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 26083280 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 26083415 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26083511 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26083533 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 26083574 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 26083677 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 26083892 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 26083948 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 26084123 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 26084197 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 26084310 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 26084846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26084878 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 26085501 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26094334 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 26094338 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26095229 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26095282 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26095341 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 26095510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26095732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26095850 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26096600 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26097046 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26098390 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26100073 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 26101430 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 26101551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26102461 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 26103014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26103173 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26106372 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 26106644 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26106930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26107262 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26107581 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 26107862 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 26107863 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 26107929 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 26107936 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 26107967 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 26108195 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 26108329 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 26108417 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 26108494 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 26108515 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 26108848 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 26110041 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 26110046 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 26110239 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 26110290 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 26110515 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 26110554 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 26110723 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 26110730 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 19 26111003 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 26111261 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 26111346 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 19 26111471 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 19 26111954 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 26112233 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26114265 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 26114411 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 26114429 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 26114430 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 26114454 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 26114459 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 26114486 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 26114495 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 26114609 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 26114647 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 26114683 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 26114687 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 26114690 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 26114712 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 26114718 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 26115092 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 26115260 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 26115268 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 26115306 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 26115474 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 26115579 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 26115594 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 26115631 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 26115632 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 26115732 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 26115733 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 26115862 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 26117399 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 19 26117715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26118758 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 26119039 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 26119990 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 26121700 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 26122002 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26122233 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 26122563 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 26123598 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 26123993 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 26124343 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 26124397 C G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 26124673 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26124759 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26124894 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 26125527 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26125650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26125657 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 26125826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26127247 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 26127271 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 26127400 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 26127466 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26127468 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26127675 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 26127838 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 26127861 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 26128003 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 26128117 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 26128573 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 26129265 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 26129363 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26129686 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26129710 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26129926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26130344 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26130352 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26130430 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 26130505 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26130763 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26130836 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26130952 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26130999 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 26131058 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26131123 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26131162 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 26131244 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 26131282 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26131293 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26131362 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 26131436 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26131506 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 26131585 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 26131600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26131607 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 26131833 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 19 26131856 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 26131976 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26132067 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26132223 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26132230 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26132298 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 26132356 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 26132396 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 26132476 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 26132574 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 26132579 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 26132623 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 26132781 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 26133399 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 26133563 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26133617 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 26133634 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 26133879 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26133882 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26133883 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 26133913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26134013 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26134147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26134288 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 26134322 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26134329 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 26134453 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26134514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26134596 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 26134951 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 26134962 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 26135024 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 26135077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26135172 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26135186 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 26135220 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 26135270 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 26135362 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 26135505 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 26135568 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 26135569 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 26135570 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 26135571 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 26135700 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 26135780 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 26135825 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 26135974 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 26135977 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 26136006 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 26136086 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 19 26136147 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 26136164 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 26136167 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 26136221 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 26136402 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 26136752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26136792 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 26136814 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 26136844 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 26137075 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 26137129 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 26137353 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 26137370 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 26137418 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26137430 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 26137621 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 26137718 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 26137745 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 26137781 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 26137789 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 26137811 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 26137847 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 26137869 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 26137884 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 26138145 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 26138654 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26138739 A C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 19 26139023 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 26139142 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 26139298 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 26139408 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 26139409 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 26139503 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 26139873 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 19 26139886 G T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 26139906 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 19 26139941 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 26140229 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 26140548 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26140651 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 26140822 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 26140919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26140959 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 26141082 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 26141163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26141252 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 26141373 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 26141550 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 26141869 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 26141898 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 26141932 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 26142238 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 26142247 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 26142346 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 26142413 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 19 26142427 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 26142559 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 26142566 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 26142693 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 26142723 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 26142915 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 26142970 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 26143005 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26143040 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 26143675 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 26144008 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 26144118 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 26144127 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 26144495 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 26145026 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 26145174 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 26145439 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 26145595 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 26145611 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 26145636 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 26145663 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 26145726 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 26145727 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 26145745 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 26145819 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 26145951 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 26145970 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 26146002 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 26146071 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 26146154 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 26146164 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 19 26146211 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26146394 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 26146440 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 26146529 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 26146563 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 26146599 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 26146681 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 26146702 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 26146765 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26146770 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26146771 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26148326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26148573 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26150225 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 26150393 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 26151976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26152477 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 26159031 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 26160159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26160863 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26161533 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26163518 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26163740 G C N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 19 26163791 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26164061 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 26164073 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26164742 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 26164905 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26165645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26166975 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 26167001 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 26167113 A T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 19 26167125 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 26167542 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26167724 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26168241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26168328 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 26168380 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 26168903 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 26172162 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 26172288 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 19 26172297 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26172306 A T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 19 26172338 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26172415 G T N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 19 26172544 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 26172601 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 26172615 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26172637 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 26172735 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26172770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26172925 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26172981 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26172997 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26173007 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26173010 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26173024 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26173193 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 26173213 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 26173218 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 26173386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26173416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26173426 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26173575 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26173583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26174002 C A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 19 26174052 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 26174087 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26174102 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 26174150 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 26174168 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 26174425 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 26174465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26174560 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 26174680 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 26174747 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26174822 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 26174996 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 26175094 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 26175254 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 26175625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26175819 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26175859 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 26175922 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 26176052 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 26176084 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 26176139 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 26176144 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 26176178 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26176212 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 26176339 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26176418 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26176470 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 26176471 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 26176870 G C Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 26176970 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 26177039 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26177262 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 26177360 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 26177383 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 26177400 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 26177405 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26177428 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 26177487 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 26177507 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 26177508 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 26177539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26177627 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 26177646 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 26177772 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 26177773 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 26178128 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26178228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26178832 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26179522 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26179617 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 26180119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26180293 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26180294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26181827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26181881 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 26182345 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26182474 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 26183604 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26184682 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26184783 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26185110 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26185372 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26188517 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 26188667 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 26189877 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26190852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26191488 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 26192580 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 26193156 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26193379 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 26193477 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 26193689 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 26193691 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 26200354 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26200373 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 26200380 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 26200403 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 26200639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26200739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26200902 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 26201038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26201180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26201307 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 26201950 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26202213 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 26202240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26202324 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 26202405 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 26202630 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 26202654 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 26202679 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26202697 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26202699 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 26202730 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 26202736 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 26202737 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26202806 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 26202808 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 26202951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26203312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26203335 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26203563 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 26203573 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 26203830 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26205084 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26205086 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26205354 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26206315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26207121 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 26208898 G T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 26209195 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26209869 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26210137 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26210527 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26211608 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 26212047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26212145 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26212150 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26212155 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26212307 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 26212324 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 26212387 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26212466 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 26212655 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 26212779 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 26213158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26213249 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 26213512 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 26214295 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26214332 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26214337 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26214525 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 26214578 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 26214637 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 26214733 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 26214807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26214847 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 26214860 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 26214933 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 19 26215447 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 26215462 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26215508 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26215695 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 19 26215833 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26215934 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 26215950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26215960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26216398 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26216452 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26216466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26216536 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 26216571 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 26216640 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 26216689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26216711 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 19 26216725 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 26216771 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26216840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26217104 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26217137 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 26217256 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 26217302 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 26217309 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 26217314 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 26217442 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 19 26217489 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 26217561 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 19 26217638 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26218065 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 26218152 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 26218181 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 26218707 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26219631 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26220128 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 26220381 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26220395 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26220534 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 26220666 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26220745 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26220990 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 26221035 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 26221055 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 26221292 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 26221311 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 26221454 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 26221877 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 26222132 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26222213 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 26223170 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 26223219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26223256 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26224176 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 26224208 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26226578 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 26227177 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26227791 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26227866 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 26228501 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26228814 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 26229003 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 26229396 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26229983 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26229984 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26230379 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26231866 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 26232047 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26232108 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26232112 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 26232569 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 26232647 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 26232679 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 26232724 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 26232738 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 26232749 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26232966 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 26233118 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 19 26233135 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 19 26233141 C T N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 19 26233549 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 26233556 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 19 26233601 G T N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 19 26233612 T G N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 19 26233670 A T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 19 26233725 G A N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 19 26233939 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 26234019 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 19 26234042 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 26234124 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 26234125 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 26234173 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 26234190 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 26234204 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 26234274 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 26234575 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 26234580 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26234656 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 26234723 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 26234742 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 26234778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26234790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26234828 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 26235326 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 26235371 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 26235398 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 26235767 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 26235866 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 26236068 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26236245 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 26236486 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 26236499 T G N N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 19 26236580 G A N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 19 26236596 C G Y N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 19 26236635 C A N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 19 26236651 A C N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 19 26236676 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 26236842 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 26236852 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 26236860 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 26236891 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 26236892 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 26236905 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 26236919 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 26236927 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 26237070 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 26237147 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 26237165 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 26237166 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 26237182 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 26237194 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 26237275 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 26237308 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 26237340 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 26237416 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 26237522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26237619 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 26237621 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 26237661 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 26237738 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 26237837 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 26237883 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 26237884 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 26238045 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 26238113 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 26238131 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26238171 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 26238249 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 26238255 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 26238334 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 26238374 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 26238689 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 26238756 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 26238775 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26238953 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26239041 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26239333 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 26239705 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26239748 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 26240259 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26240378 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 26240752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26240784 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26241475 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 26241563 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26241634 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26241686 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 26241898 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 26241905 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 26242107 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 26242189 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 26242243 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26242340 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26242353 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 26242363 C A N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 19 26242556 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 26242622 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26242656 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 26242670 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 26242687 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26242727 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 26242789 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 26242812 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 26242856 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 26242933 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 26242943 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26242957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26243238 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26243264 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26243393 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26243615 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26243824 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 26243992 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 26244351 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 26244399 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26244482 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26245289 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26245972 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26246027 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26246489 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 26246522 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 26246887 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26246890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26247049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26247145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26247197 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 26247242 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 26247287 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 26247921 T A Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 26247995 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 26248116 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 26248235 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 19 26248236 G C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 19 26248295 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 19 26248296 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 19 26248311 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 26248382 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 26248404 G C Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 19 26248575 T C Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 19 26248715 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 26248765 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 26248777 C T Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 19 26249167 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26249204 C G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 19 26249291 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 26249347 C G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 26249462 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 26249499 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26249520 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 26249527 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 26249529 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 26249575 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 26249586 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 26249756 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 26249791 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 26249812 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 26249854 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 26249861 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 26249864 A C Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 26250270 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 26250313 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 26250349 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 26250350 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 26250569 C A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 26250705 A C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 26250864 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 26251001 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 26251070 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 26251166 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 26251782 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 26251914 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 26251987 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 26252253 A T Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 19 26252727 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 26253047 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 26253630 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 26253658 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 26253792 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 26253832 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 26254082 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 26254149 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 26254232 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 26254403 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 26254425 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 26254559 A C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 19 26254560 A T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 19 26254604 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 26254617 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 26254684 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 26254701 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 26254712 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 26255174 C A Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 19 26255401 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 26255428 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 26255456 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 26255487 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 26255503 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 26255530 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 19 26255569 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 26255575 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 26255576 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 26255867 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 26256268 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26256285 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 26256433 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26256512 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 26256568 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 26256755 T C N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 19 26257904 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 26257914 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26257971 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 26258180 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 26258185 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 26258202 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 26258408 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26258428 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 26258513 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 26259083 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 26259272 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 19 26259354 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 19 26259532 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 26259585 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 26260055 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 26260355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26260517 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 26260724 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 26262444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26264293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26264422 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26265423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26265924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26265952 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 26266457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26266463 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 26266495 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 26266520 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26266639 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 26266728 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 26266751 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 26266836 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 26266959 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 26267000 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 26267391 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 26267417 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 26268061 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 26268451 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26268512 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 26268950 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 26273980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26274048 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26274285 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26274346 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26274354 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26274462 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26274770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26274790 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 26274805 C G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 26274848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26275002 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26275265 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 26275304 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26275531 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 26275583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26275605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26275651 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26275838 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 26275990 A C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 26276283 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 26276406 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26276479 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 26276508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26276745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26276995 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 26277751 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 26277987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26278105 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 26278240 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 26278323 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 26279401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26280000 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26280274 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 19 26280398 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 26280829 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26280932 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26281533 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26281545 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26281638 A C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 19 26281850 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 26282005 G T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 19 26282248 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26282345 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26282414 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 26282436 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 26282758 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26283159 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 26283236 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26283288 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 26283792 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 26283873 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 26284182 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 26285366 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 26285966 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 26285986 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26286008 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 26286251 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 26286774 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 26287130 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 26287801 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 26287840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26288060 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26288092 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 26288440 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26288617 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 26288655 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 26288762 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 26289298 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 26289302 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 26289475 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 26289977 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 26289979 T C N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 19 26289987 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 19 26290168 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 19 26290405 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26290436 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 26290468 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 26290532 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 26290788 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 26290943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26291000 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 26291022 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26291033 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 26291050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26291111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26291556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26292531 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26292651 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 19 26292774 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 26293832 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 26294320 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26294770 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 26295173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26295516 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26295622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26296095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26296675 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 19 26298350 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 19 26298587 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 26298745 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 26298749 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 26298824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26298885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26298916 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 26298951 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 26299279 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 26299865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26299870 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 26299934 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 26300236 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 26300261 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26300295 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26300403 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26300411 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26300491 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 26300492 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 26300837 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 26300905 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26300976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26301415 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 26301555 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 19 26301706 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26303232 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26303450 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26305061 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26305201 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 26305307 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 26305308 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 26306307 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 19 26307642 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 26307767 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 26307809 T C N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 19 26307974 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 26308198 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26308582 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 26308654 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 19 26308928 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 26309176 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 26309592 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 26309799 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 26310420 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 26310458 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 26310460 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 26310485 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 26310491 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 26310567 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 26310568 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 26310655 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 26310669 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 19 26310752 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 26310806 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 19 26310817 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 26310924 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 19 26310980 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 26311013 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 26311014 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 26311099 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 26311257 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 26311616 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26311622 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 26311676 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 26311739 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 19 26318527 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26318643 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 26318833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26318955 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26318987 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 26319042 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 26319179 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 26319682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26319759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26319872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26319882 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26319918 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26319919 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26319926 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 26319953 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26319979 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 26319980 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 26319983 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 19 26319989 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 26320020 C G N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 19 26320021 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 19 26320421 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26320645 C T N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 19 26320823 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 26321173 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 26321191 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 26321659 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 26322375 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 26322390 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 26322465 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 26322514 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 26322607 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 26322618 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 26323345 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 26323401 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 26323403 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 26323635 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 26323684 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 26323700 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 26324121 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26324599 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26326170 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26326219 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26327159 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26327915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26328254 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 19 26328339 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26328537 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 19 26329136 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26329175 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26329597 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26329710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26330049 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26330091 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 26330160 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26330546 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26330565 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26331292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26331642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26331888 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26331981 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26332014 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26332333 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26332762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26332771 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 26332798 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 26332812 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 26333631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26333762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26333777 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 26333979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26334051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26334052 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 26334651 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 26335152 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 26335166 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 26335299 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26335998 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26336319 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 26337124 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 26337141 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26337187 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 26337365 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26337825 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 26337835 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26337951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26338186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26338387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26338439 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 26338537 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 26338597 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26338649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26338705 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 26338762 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 26338775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26339122 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 26339319 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 26339540 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 26339650 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 26339873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26340154 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26340547 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 26341113 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 26341204 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 26341424 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 19 26341631 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 26341646 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 26341775 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 19 26342032 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 26342126 A C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 26342208 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 26342525 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 26342553 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 26343151 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26343288 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 26343320 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 26343359 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 26343513 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 19 26343547 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 19 26343912 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 19 26344032 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 26344039 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 26344207 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 26344255 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 26344283 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 19 26344316 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 19 26345390 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 26345435 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 26345598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26345691 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26345730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26345887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26345943 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 26346201 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26346335 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26346552 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 26346888 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 26347129 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26347793 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 26347910 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26347945 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 26348630 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 26348842 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 26348913 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26349579 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26349803 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26350866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26351017 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 26351708 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26352897 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26353031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26353389 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26353480 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 26353784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26353841 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26353924 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26353939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26354013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26354035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26354102 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26354141 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26354266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26354361 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26354377 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26354490 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 26354581 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 26354897 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26355310 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 26355745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26355972 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26356424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26357195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26359257 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26359602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26360663 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26360890 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26361136 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26362050 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26362098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26363335 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 26363440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26363545 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 26363710 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 26363767 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 26363897 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 26363906 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 26363944 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 26364001 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 26364019 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 26364662 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26364672 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26366160 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26366799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26367067 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26367869 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26368062 T A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 26368722 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 26368817 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 26368819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26369028 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 26369031 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 26369037 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 26369128 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 26369393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26369502 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 26369555 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 26369583 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 26369584 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 26369627 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 26369658 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 26370045 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 26371063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26371337 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 26371648 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26372405 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26372525 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26372977 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26373025 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26373113 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 26373385 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 26374192 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26374301 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26374653 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 26374750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26374829 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26376699 A T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 26376832 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 19 26376834 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 19 26377375 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 26377376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26378214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26378415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26378447 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26378698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26378937 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26379244 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 26381028 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 26381090 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 26381106 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 26381181 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26381199 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26381678 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26381692 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 19 26381732 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26382404 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26382433 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26382489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26382532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26382586 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26382749 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26383127 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26384270 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 26384388 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 26384511 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 26384561 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 26384628 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 26384669 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 26384698 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 26384701 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 26384706 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 26384753 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 26384847 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 26384881 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 26384892 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 26385017 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 26385038 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 26385047 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 26385081 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 26385218 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 26385308 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 26385349 C A N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 19 26385366 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 26385369 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26385487 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 19 26385614 G T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 26385729 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26385987 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 26386260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26386394 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26387718 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 19 26387754 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 26387986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26387993 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 26388580 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 26388592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26388915 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 26389338 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 26390555 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 26390822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26390982 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26390985 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 26391101 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 26391109 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 26391128 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 26391273 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 26391285 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 26391464 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 26391470 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 26391554 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 19 26391941 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 26392305 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26392329 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 26392401 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 26392406 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 26392515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26394060 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26395150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26395722 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26397375 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26397600 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26398368 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26399736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26399758 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 26399759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26399765 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26403461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26403479 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26404379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26405014 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26405501 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26405807 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26406531 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26406853 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26409364 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26409513 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 19 26409538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26410015 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26410077 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 26412476 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26412562 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 26413520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26413561 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26414127 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 19 26414144 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 26414266 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26414289 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26414377 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26414428 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 19 26415349 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 26415365 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 26415383 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 26415573 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26415778 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 26415780 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26416589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26416937 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 26417047 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26418225 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 26418308 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26418811 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 26418997 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26418999 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26419095 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 26419109 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 26419635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26419673 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 26419783 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 26419858 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 26419896 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 26420021 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 26420088 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26420154 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 26420297 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 19 26420357 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 26420373 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 26420445 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 26420573 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 26420695 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 26420699 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 26420778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26420825 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 26420880 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 26421140 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 26421150 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 26421958 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 26422028 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 26422033 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 26422254 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 26422282 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 26422698 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26422817 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 26422926 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 26423052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26423432 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26423669 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 19 26423718 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 19 26423751 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 26423921 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 19 26424029 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 26424038 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 26424041 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26424058 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 26424129 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26424352 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 26424450 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 26424468 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 26424532 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26424708 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26424792 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 26424881 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26424945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26425663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26425938 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26425968 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26426499 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 26426578 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26426580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26426680 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26426684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26427037 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 26427473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26427672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26427896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26428800 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 26428961 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26429572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26430109 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26430797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26430839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26430910 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26430953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26430956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26431007 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 26431065 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 26431068 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26432078 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 26434452 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26436121 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26436122 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26436376 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 26436990 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26438081 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 26438226 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26440563 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26440714 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 26441900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26443296 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26443297 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 26443574 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 26443586 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 26443948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26443993 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 26444065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26444138 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 26444390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26444602 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 26444744 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 26444864 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 26444879 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 26445061 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 26445238 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 26445353 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 26445373 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 19 26445428 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 26445672 G C N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 19 26445701 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 26445716 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 26445718 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 26445723 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26446211 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 26446235 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26446399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26447358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26449370 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 26449752 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 26449981 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26450011 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26450223 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 26450609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26450612 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 26450627 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 26451183 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 26451310 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 26451477 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26451698 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26451808 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 26451863 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 26452013 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26452054 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 26452082 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 26452088 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26452334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26452874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26453131 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 26453844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26453910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26453974 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 26454151 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 26454163 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 26454201 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 26454272 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 26454295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26454306 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 26454333 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 26454343 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 26454380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26454510 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 26454544 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 26454558 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 26454617 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26454682 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26454787 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 26454788 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 26455024 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 19 26455213 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 19 26455218 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 19 26455280 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26455759 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 26456469 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26456948 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26457352 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 26457491 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 26457527 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 26457836 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 26457840 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26457894 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 26457897 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 26458052 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 26458065 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 26458149 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 26459358 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26460831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26461515 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26462642 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 26462643 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 26462647 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 26462724 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26462732 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26462818 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 26462992 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26463169 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26463517 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26463534 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26463784 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26463927 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 26463943 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 26464065 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 26464118 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 26464150 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26464289 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 26464910 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 26465049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26465242 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 26465306 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 26465597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26465614 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26465823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26465979 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 26466334 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 26466382 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26466465 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26466880 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26466882 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26466986 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 26468032 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26470652 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 26470734 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 26470987 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 26471113 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 26471308 T C N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 19 26471550 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26471645 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 26471784 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26472111 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 26472219 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 26472314 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26472518 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26472858 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 26473190 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 26473219 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 26473463 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 26473512 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 26473635 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 19 26473983 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26474338 G T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 19 26474394 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 26474548 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 26474623 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 26474909 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 26475087 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 26475127 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 26475202 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 26475222 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 26475224 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 26475437 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 26475636 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 26475658 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 26475689 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 26475804 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 26475896 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26476091 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 26476243 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 26476250 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 26476752 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 26477032 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 26477039 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 26477157 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 26477201 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26477465 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 26478196 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26478342 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 26478476 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 26478490 T C N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 19 26479321 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26479859 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26479969 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 26481735 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26483487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26484605 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 26484624 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 26487704 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26488070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26489775 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 26489826 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26489894 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26490278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26493412 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26493414 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26494316 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 26494320 G T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 19 26494330 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 19 26494353 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 26494616 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 26494633 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 26494684 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 19 26494690 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 19 26494886 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 26495058 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 26495213 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 26495506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26495763 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 26495794 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 26495803 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 26496234 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 26496617 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 26497753 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 26497813 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26497959 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26498334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26498433 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 26498594 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 26498732 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 26498925 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 26500084 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26500216 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 26500900 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26501283 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26501303 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 26501365 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 26501371 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26501395 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26501398 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 19 26501799 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 26502007 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26502350 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26502564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26503061 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26503977 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26504236 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26504549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26504580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26506154 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26506643 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 26506666 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 26506828 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 26506928 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 26506931 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 26506954 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 26506955 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 26507055 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 26507156 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 26507346 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 19 26507397 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 26507446 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 26507462 C A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 19 26507729 G T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 19 26507850 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 26507866 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 26507918 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 26507963 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 26508026 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 26508037 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 19 26508039 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 19 26508042 C T N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 19 26508073 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 26508107 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 26508108 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 19 26508118 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 26508162 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26508311 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 26508320 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26508379 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 26508494 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26508568 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 26508712 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 26508837 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 26508867 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 26508881 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 26508899 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 26508905 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 26508923 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 26508987 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 19 26508997 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 26509032 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 26509059 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 26509130 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 26509253 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 26509315 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 26509320 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 26509324 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 26509325 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 26509368 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 26509386 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 26509451 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 26509455 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 26509478 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 26509519 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26509525 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 26509840 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 26509986 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26510002 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26510080 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 26510245 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 26510246 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 26510257 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 26510288 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 26510311 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 26510336 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26510337 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 26510378 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 26510615 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26510872 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 26510952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26511297 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26511344 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26511637 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26511961 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 26512694 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 26513174 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26513338 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26513804 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26514434 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26514601 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 26514626 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26514695 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 19 26514797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26514853 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 26514873 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 26514874 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 26514924 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 26515166 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26515173 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26515194 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26515240 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26515266 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26515277 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 26515278 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 26515292 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26515299 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26515349 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26515359 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26515673 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 26515946 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26516349 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 19 26517173 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26517417 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26517485 G C Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 26517546 T A Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 26517858 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 26517932 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26518021 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26518424 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 26518478 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 26518490 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 26518695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26518812 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26519363 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26519464 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 26519465 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 26519483 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26519530 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 26519844 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 26519970 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26520074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26520103 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 26520166 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 26521233 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 26523438 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 26523578 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26523608 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26523636 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26523642 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 26523737 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 26523738 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 26523920 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26524095 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26524190 C A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 26524370 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 26524375 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 26524389 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 26524392 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 26524503 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 26524585 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26524601 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 26524711 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 26524812 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 26524874 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 26524926 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 26524970 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 26524974 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26524987 C A Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 26525056 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 26525150 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 26525244 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26525297 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26525459 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26525546 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26527483 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26527544 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 26528962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26530096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26531286 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26534136 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26534371 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26534538 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26534543 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 26535112 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26535533 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26536885 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 26537210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26537634 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26538273 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26538512 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 26538650 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26538835 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 26539283 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 26539690 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26539781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26539954 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 26540139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26540810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26542286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26543278 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 26543487 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26543825 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26544205 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26544988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26545115 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 26546752 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 26547137 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 26547408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26548956 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26550421 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 26550503 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26550552 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 26550635 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26550819 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 26551531 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 26551722 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 26551828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26551929 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26552007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26552015 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 26552171 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 26552175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26552339 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26553035 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 26553168 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 26553370 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26553606 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26553636 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 26553709 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 26553730 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 26553733 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 26553782 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 26553917 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26553930 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 19 26553942 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 26553996 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 26554152 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26554245 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 26554438 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 26554440 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 26554634 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 26554684 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26554690 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 26554732 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 26554767 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 26554864 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 26554877 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 26554891 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 26554927 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 26554944 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 26554979 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 26555001 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 26555032 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 26555087 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 26555196 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 19 26555199 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 19 26555202 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 19 26555212 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 26555241 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 26555256 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 26555398 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 26555454 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 26555549 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 26555607 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 26555683 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 26555718 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 26555733 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 26555740 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 26555878 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 26555892 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 26555921 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 26556397 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26556402 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26556422 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 26556475 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26556582 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26556613 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 26557538 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26559243 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26559563 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 26560272 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 26560273 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 26560365 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 26560415 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 26560449 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 26560533 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 26560733 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26560888 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 26560899 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26561085 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 26561349 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 19 26561490 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 26561532 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 26561808 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26562888 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 18 22 2 14 4 19 26564554 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26564555 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26564756 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 26564835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26564848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26565005 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 19 26566355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26566484 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 26570246 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26570743 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 26571113 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 26571665 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 26571805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26571848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26571862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26571868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26572072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26572087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26572264 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 26572435 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 26572605 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 26572655 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 26572662 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 26572666 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 26572920 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 26572996 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 26573081 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 26573106 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 26573212 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 26573250 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 26573283 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 26573301 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 26573378 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 26573386 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 26573449 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 26573546 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 26573552 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 26573568 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 26573632 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 26573672 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 26573742 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 26573832 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 26573897 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 26573914 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 26574042 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 26574076 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 26574185 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 26574232 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 26574248 T A N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 19 26574249 T A N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 19 26574298 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 26574306 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 26574344 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 26574386 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 26574389 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 26574713 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 26574723 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 26574735 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26574768 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 26574890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26575005 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 26575699 C A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 19 26575704 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 19 26575813 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 26580475 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26581060 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 26581363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26581538 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 26585293 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 26586270 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26586439 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 26586669 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 26586951 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26587065 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26587510 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26589464 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26590733 G T N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 19 26590770 A G Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 19 26590779 T C Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 19 26590823 C T Y Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 19 26590851 C T Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 19 26590904 T C N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 19 26591118 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 26591124 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 26591210 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 26592130 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 26592212 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26592218 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26592230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26592642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26592712 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 26592727 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26592736 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26592753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26592780 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 26592995 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26593139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26593770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26593910 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26595266 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 26596436 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26596982 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 26597016 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 26600435 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 26600470 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26600871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26605479 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 19 26606176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26606249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26606719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26607117 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26608998 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26609986 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 26611261 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26615308 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26616290 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 26617429 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26617939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26618090 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26618570 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 26618622 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26618674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26618746 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26618822 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 26618955 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 26619009 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 26619242 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 26619659 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 26619824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26619830 A T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 26620379 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26620427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26620912 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 26621118 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26621121 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26621297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26621586 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 26621604 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 26621609 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 26621622 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 26621706 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 26621709 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26621784 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 26622215 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 26622352 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 26622447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26622502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26622754 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 26622799 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 26622806 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 19 26622811 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 19 26623176 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 26623471 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26623593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26624478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26625415 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26626391 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26627289 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 26627529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26630162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26631346 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 26633894 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26634668 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26634705 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26636389 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 26637485 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 26637618 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26638585 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26638945 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 26639784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26640013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26640544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26646756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26646827 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 26647083 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 26648597 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26649378 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26654869 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 26656578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26657286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26657928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26658242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26658260 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26658341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26658639 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 26658719 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 26659186 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26659187 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 26659296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26659891 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26660474 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 26660518 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 26660562 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 26660905 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26661749 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 26662483 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 26662805 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 26662829 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26663372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26663735 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 26664163 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 26664356 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 26664612 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 26664728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26664838 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 26665731 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 26665891 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 26666052 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 26666130 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 26666131 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26666518 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 26667767 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 26667799 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 26667859 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26668724 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 26668766 T A N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 19 26669259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26669366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26669484 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 26669558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26669912 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26670015 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 26670055 C G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 26670160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26670221 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 26670229 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26673088 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26674750 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26679773 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26680136 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26680194 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 26680201 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 26681435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26682942 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 26683180 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 26683597 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26684640 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 26684651 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 26684745 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 26684849 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 26684930 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 26684931 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 26685008 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 19 26686099 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26686675 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26686740 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26686763 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 26686866 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 26687039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26687729 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26688269 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 26689998 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 26690645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26690663 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 26690799 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 26691022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26691075 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 26691107 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 26691185 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 26693107 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26693521 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 26694995 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26697189 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26697994 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26698706 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26700723 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26701670 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26704401 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26705005 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 26705209 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 26705824 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 26705897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26706120 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 26706456 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 26706648 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26706809 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26706891 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 26707061 G C N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 19 26707064 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26707217 C T N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 19 26707286 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 26707305 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 26707344 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 26707384 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 19 26707815 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26707821 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26707823 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 26707951 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 26708007 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26708027 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 26708216 G C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 19 26708253 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26708454 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 26708463 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 26708798 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 26708817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26708938 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26708942 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26709253 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26709254 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26709406 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 26709436 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 26709567 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 26709584 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 26709616 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26709857 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 26709884 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26710051 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 26710083 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 26710210 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 26710512 T G N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 19 26710685 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 26710969 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 26711037 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 26711088 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 26711717 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 26711846 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26711898 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 26712035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26712765 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 26712937 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 26713053 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 19 26713061 G C N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 19 26713714 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 26713844 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26713874 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 26714013 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 26714014 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 19 26714205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26714305 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26714742 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 26715238 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 26715370 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 26715451 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26715468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26715577 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 26716014 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 26716267 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26716527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26716614 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 26716818 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26716841 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 26716923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26717465 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 26717687 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26718086 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 26718145 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 26718356 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26718495 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26719393 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 26719611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26719898 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 26719932 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 26720094 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26720234 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 26720385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26720501 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 26720521 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26720524 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26721075 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 26721430 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 26721751 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 26721773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26721912 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26721916 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 26722194 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 26722926 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 26722962 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 26723021 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 26723248 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 26723799 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 26723844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26723980 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26724047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26724506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26726197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26726619 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 26726693 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 26726829 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 26727027 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 26727464 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 26727478 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 26728128 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26728160 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 26728189 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 26728658 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 26728712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26728752 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 26729368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26729453 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 26729930 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 26730426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26730778 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 26731525 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 26731547 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 26731901 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26731973 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26732034 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26732144 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 26732170 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 26732190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26732782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26732956 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26734391 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26734460 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26734471 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 26734554 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26734625 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 26735252 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26735457 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26735650 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26736272 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 26736994 G T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 26737981 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26738537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26739172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26739261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26739402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26739540 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26739542 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26739971 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 26740126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26740413 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26742020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26742056 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26742820 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26744358 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 19 26744474 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26746788 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26747510 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26749025 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 26749691 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 26750232 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 26750549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26750577 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26751584 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 26751880 G T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 26752278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26752441 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26752465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26752785 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26753185 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26753186 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26753766 C T N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.272727272727273 0.181818181818182 0.545454545454545 8 14 3 2 6 19 26754417 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26754973 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 26755152 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 26755188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26755249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26756028 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 26756344 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 26756965 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26757246 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 26757321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26757401 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 26757476 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 26757533 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 26757601 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 26757623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26757722 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 26757764 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 26757786 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 26757916 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 26758107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26758150 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 26758163 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 26758469 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26758480 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 19 26758649 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 26759196 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 26759419 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 26759551 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 26759705 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26759762 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 26760007 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 26760206 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 26760465 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26760467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26760584 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 26760954 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26760966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26762189 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26762202 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26762692 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 26762710 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 26762785 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 26763099 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 26763150 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 26763170 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 26763207 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 26763220 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 26763233 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 26763253 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 26763271 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 26763410 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 26763503 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 26763513 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 26763537 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 26763543 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 26763647 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26764020 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 26764021 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 26764055 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 26764170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26764204 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 26764312 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 26764757 G T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 26764844 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 26765037 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 26765038 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26765118 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 26765119 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 26765147 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 26765186 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 26765263 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26765429 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 26765542 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 26765547 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26765565 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 26765690 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 26765752 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 26765762 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26765763 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 26765806 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 26766269 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 26766293 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 26767315 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26767527 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26767863 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 26768028 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 26768779 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 26768781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26768785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26768868 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 26768909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26769419 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 26769421 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 26769517 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 26769625 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 19 26769722 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 19 26769796 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 26769888 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 26769950 T C N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 19 26769990 G C N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 19 26770770 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26770993 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26772376 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26772668 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 26773402 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26773634 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26773694 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26773838 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26773899 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26774003 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26774041 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 26774192 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 26774329 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 26774434 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26774454 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26774545 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26774551 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26774578 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26774649 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 26774747 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26774774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26774826 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26774932 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26775230 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 26775466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26775471 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26775591 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 26775622 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 26775738 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 26775808 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 26775840 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 26775909 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 26775916 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 26776008 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 26776011 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 26776246 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 26776279 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 19 26776288 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 19 26776296 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 19 26776787 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 26776877 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 26776902 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26776968 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 26776970 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26777113 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26777145 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26777149 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26777193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26777282 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 26777352 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26777364 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 19 26777413 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26777833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26777898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26777961 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26777964 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 26778089 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26778139 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 26778234 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 26778260 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 26778343 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 26778411 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 26778456 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 26778472 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 26778518 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26778681 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26778697 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26778759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26779109 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 26779402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26780101 C T N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 26780104 C T N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 26780111 G A N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 19 26781512 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 26781592 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26781625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26781699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26781750 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26781999 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26782009 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 26782141 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26782326 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 26782391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26782419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26782472 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26782678 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26782720 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26782906 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26782928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26782947 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26783099 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26783111 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26783431 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 26783481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26783674 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26784087 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 26784098 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 26784249 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26785330 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 26786672 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26786799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26786818 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26786950 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26786994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26787162 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26787290 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26787310 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26787344 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26787534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26787664 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26787715 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26787785 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26787874 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26788622 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26788664 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26788708 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26788720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26788753 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 26788904 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 26788974 A G N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 19 26789173 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 26789290 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26789444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26789717 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 26790103 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26790667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26790710 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26790713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26790722 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26790757 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26790760 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26790761 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 26790835 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26790924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26790979 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 26790982 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26791024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26791061 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26791062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26791105 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26791106 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26791201 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26791335 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 26791443 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 26791549 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26791689 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26791705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26791751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26791973 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26792351 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26792363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26792446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26792559 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26792660 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 26793007 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26793010 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 26794132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26794209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26794486 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 26794697 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26794698 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26794762 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 26794829 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 26794886 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26794913 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26795013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26795014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26795046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26795101 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26795156 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26795161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26795202 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26795651 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26796070 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26796464 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26796554 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 26796759 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 26796772 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26796804 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26796815 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26796823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26796857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26796896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26796921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26796996 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26797279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26797334 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26797439 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 26797505 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 26798004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26798085 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 26798267 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 26798269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26798285 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 26798306 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 26798345 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 26798629 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26798660 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26799055 G A N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 19 26799184 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 19 26799219 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26799229 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 26799437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26800887 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26801135 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 26801136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26801882 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 26801926 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 26802959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26803043 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26803110 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26803127 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26803468 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26803550 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26803578 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26803591 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26803631 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26803633 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26803870 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26804392 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26804565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26804601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26804747 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26804758 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26804823 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26804841 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 26804917 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26805014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26805309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26806433 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 26808638 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26808740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26808784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26808834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26808932 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26809073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26809096 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 26809127 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26809466 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26809574 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 26809636 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26809682 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26809735 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 26810545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26810889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26810929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26811510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26811589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26811694 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26811715 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 26811763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26812064 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26812067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26812261 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 26812326 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 26812391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26812782 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 19 26812799 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 26819727 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 19 26820335 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 26824823 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26825929 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26826307 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26831957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26833946 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26834209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26836759 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26846117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26847523 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26850721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26850885 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 26851679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26852243 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26855289 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26855619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26856404 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 26856695 G A N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 19 26856804 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 19 26856865 C A N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 19 26856875 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 26856918 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26856940 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 26857201 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 26857344 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 19 26857424 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 19 26857459 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 19 26857478 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 19 26857540 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26857551 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 26857566 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 26857615 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 26857735 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 26858079 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 26858097 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26858336 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 26858472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26858493 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26858641 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 26858683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26858868 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 19 26858873 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 19 26858952 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 26858980 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 19 26858986 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 19 26859001 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 19 26859008 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 19 26859019 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 26859095 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 19 26859491 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 26859558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26859824 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 26860140 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 19 26860193 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 26860420 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 19 26860583 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 26860652 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26860659 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 26860678 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 26860684 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 26860722 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 26860810 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 26860886 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 26860938 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 26861021 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 26861182 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26861210 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 26861244 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 26861269 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26861325 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 26862461 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 26862469 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 26862493 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 26862520 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 26862623 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 26862669 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 26862752 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26863011 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 26863075 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 26863416 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 26863444 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 19 26863469 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 19 26863695 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26863730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26863760 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 26863800 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 26864041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26864072 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26864093 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 26864124 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 26864171 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 26864264 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 26864405 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 26864477 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 19 26864842 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 26864924 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 26865089 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26865661 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 26866828 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 26866874 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 26866974 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26867037 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 26867070 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 26867677 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 26867681 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 26868634 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 26868635 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 26868701 A T Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 19 26868711 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 19 26868853 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 26868948 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 26869169 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 26869426 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 19 26869453 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 26869507 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 26869849 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 26869916 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 26869985 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26870316 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 26870505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26870894 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 26870988 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 26871011 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 26871257 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26871369 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 19 26871374 G C N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 19 26872288 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 26872393 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 19 26872397 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 19 26872497 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26872617 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 26873066 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 26873243 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 26873344 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 19 26873478 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 26873495 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26873512 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 26873537 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 26873557 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 26873592 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26873642 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26874145 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 26874346 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 26874545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26874590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26874591 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26877441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26877679 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 26877752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26877905 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 26878648 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 26878766 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26878853 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 26878915 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 26879421 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 26879481 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 26879543 T G Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 19 26879625 G C Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 19 26879734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26879798 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 26879862 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26879940 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 26880103 C A N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 19 26880123 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 19 26880125 A C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 19 26880227 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 19 26881902 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 26882338 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 26882622 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 26883341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26883437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26883602 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 26883730 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 26883927 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 26884188 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 26884294 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 26884298 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 26884313 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 26884382 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 26885167 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 26885645 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 26885775 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 26885832 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 26885835 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 26885887 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 26886132 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 26886150 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 26886813 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26887023 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 26887203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26887841 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26887935 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 26888157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26888448 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26889947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26890959 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 26892058 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26894609 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 26894649 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26894828 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 26895619 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 26895677 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 26895727 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 26895733 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 26895750 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 26895859 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 26896561 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 26896586 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 26896633 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 26896868 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 26897357 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 26897644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26902532 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 19 26907393 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26907940 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26908205 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26910938 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26912085 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 26912124 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26912223 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 26912243 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 26912394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26912492 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26917579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26917924 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26918094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26918253 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 26918324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26918360 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 26918361 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26918568 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 19 26918662 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 26918668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26918795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26918885 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 26918926 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26919007 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 26919058 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 26919065 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 26919077 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 26919248 A C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 19 26919252 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26919274 A G N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 12 16 2 8 4 19 26919533 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26919948 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26920461 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26921192 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 26921513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26921516 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26921943 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 26922421 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26922765 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 26922766 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 26922886 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 26922961 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26923084 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 19 26923113 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 26923129 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 26923244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26923332 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 26923339 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26923453 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 26923621 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 26923771 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 26923797 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 26923799 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 26924389 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 26924483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26924564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26924672 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26924695 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26924747 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26924776 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26924893 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26924912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26924976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26925170 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26925254 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26925310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26925561 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 26925568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26925806 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26925858 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 19 26925919 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 19 26925935 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 26926044 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 19 26926493 A G N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 12 16 2 8 4 19 26926616 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 26926617 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 26926625 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26926630 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 26926651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26926772 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 26926797 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 26926848 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 19 26926859 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 26926885 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 26926964 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 19 26926966 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 19 26927003 G A N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 7 9 1 5 2 19 26927209 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 19 26927281 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 19 26927377 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 26927379 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 26927384 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 26927546 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 26927552 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 26927610 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 26927661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26927673 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 26927697 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 26927702 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 26927725 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 26927732 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26927746 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 26927823 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 26927843 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 26927893 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 26927897 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 26928016 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 26928044 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26928116 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 26928125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26928161 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 26928229 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 26928260 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 26928333 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 26928376 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26928405 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26928448 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 26928459 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 26928497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26928575 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 26928629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26928645 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26928738 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 26928747 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 26928768 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 26928862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26929025 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 26929141 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 26929277 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 26929720 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 26929724 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 26929737 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 26929817 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 19 26930713 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26930769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26930824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26930928 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26930983 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26931320 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26931474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26931514 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26932163 A C N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 19 26932164 A T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 26932403 C T N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 26933137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26933179 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 26933189 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 26933227 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 26933710 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 19 26934820 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 26934894 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 19 26934904 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 19 26934948 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 19 26934951 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 19 26935354 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 26935678 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 26936492 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 19 26936718 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 19 26936738 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26936770 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 19 26936833 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26937402 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26937590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26937596 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 26937643 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26938491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26938735 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 26938842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26939106 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26939310 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 26940428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26940441 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 26940442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26940736 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26940928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26940929 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26940987 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 26940990 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 26941209 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26941273 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 26941313 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 26941335 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 26941681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26941684 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26941978 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 26942064 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26942128 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26942159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26942476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26942665 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26942672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26942944 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26942963 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26942981 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26943028 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26943115 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26943123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26943169 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26943211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26943219 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26943243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26943269 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26943271 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26943286 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26943742 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 26943806 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26943942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26944016 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26944019 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26944191 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26944231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26944252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26944264 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 26944300 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 26944523 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26944548 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26944588 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26944786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26944803 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26944865 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26944880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26944974 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 26945013 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 26945021 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 26945240 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 26945485 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26945514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26945711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26945809 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 26946500 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26946574 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26946815 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26946935 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26947206 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26947327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26948150 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 26948205 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 26948224 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 26948333 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 26948365 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 26948395 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 26948415 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 26948458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26948665 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 26948687 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 26948705 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 26948717 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 26948928 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 26948955 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 26949227 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 26949469 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 19 26949597 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 19 26949626 T A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 19 26949653 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 19 26949663 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 19 26949766 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 26949871 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26949894 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 26949904 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 26949971 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 26950159 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26950390 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26951342 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 26951899 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26954527 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 19 26954534 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 19 26954643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26955531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26957679 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26957841 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26958046 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 26958234 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 26958331 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 26958335 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 26958577 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 26959351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26959427 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 26959475 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26960107 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 26960115 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 26960161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26960221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26960854 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 26960947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26962018 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26963977 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 26965030 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26965272 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 26966125 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 26966265 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 26966426 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 26966865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26966874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26967833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26968200 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 26973199 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 26973297 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 26974004 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 26974133 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 26974322 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 26974462 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 26974526 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 26974613 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 26974677 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 26974754 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26975267 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26976325 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 26976588 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26976599 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 26976670 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 26976936 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26976964 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26976998 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26977235 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26977272 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 26977304 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 26977536 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 26977543 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 26977796 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26977797 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26977916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26978275 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 26984379 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 26984420 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 26984880 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26985064 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 26985313 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 26985349 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26985378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26985489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26985507 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 26985521 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 26985589 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 26985639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26985760 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 26985997 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 26986086 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 26986114 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 26986229 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 26986270 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 26986278 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 26986291 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 26986349 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 26986517 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 26986719 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26986871 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 26986996 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 26987396 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 26987462 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26987475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26987719 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 26987749 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26987752 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 26987771 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 26987850 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26987890 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26988274 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26988310 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 26988316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26988365 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26988375 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 26988406 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 26988438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26988603 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 26988654 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 26988730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26988733 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26988783 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 26988807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26988888 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 26989123 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 26989198 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26989248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26989254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26989344 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 26989375 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 26989634 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26989637 T G N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 19 26989696 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 19 26989986 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26990064 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 26990196 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 26990317 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 26990379 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 26990401 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 26990434 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 26992795 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 26992942 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26993416 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 26994280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26994413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26994572 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 26994769 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 26994833 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 26994872 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 26995392 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26997168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 26997540 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 26998115 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 19 26998125 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 19 26998863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27002407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27004537 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 27004639 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27004775 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27005794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27006246 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27006426 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27006975 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 27007189 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 27007889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27009587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27010470 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27010785 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27011516 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27011780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27012882 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27012917 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 27013504 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27013738 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27013803 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27013866 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27014219 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27014485 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 27014529 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 27014598 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 27014634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27015351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27015462 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 27015463 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 27015475 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 27015563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27015810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27015822 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 27016356 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27016572 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 27016587 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 27016750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27016815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27016963 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 27017082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27017154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27017236 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 27017337 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 27017338 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27017435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27018083 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27018319 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27018712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27018997 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27019058 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 27019387 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27021520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27021713 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27021772 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27021837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27022305 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27022934 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 27023384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27023477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27023708 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 27023714 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27023989 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 27024129 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27025426 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27025735 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27025786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27025928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27026254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27026575 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27026593 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 27026774 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 27026801 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 27027083 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27027146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27027253 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27027528 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 27027700 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 27027702 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27027724 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27027725 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27027806 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27027889 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27028042 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 27028491 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27028670 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 27028719 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 27028745 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 27028769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27028798 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 27028923 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 27029034 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 27029636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27029674 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27029786 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 27029819 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 27030308 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27030415 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27030432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27030449 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27030497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27030521 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27030752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27030949 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 27031096 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27031330 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 27031343 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 27031975 C A Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 27032267 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27032308 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27032412 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27032571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27032770 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 27032810 G T Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 27033079 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 27033169 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 27033194 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 27033471 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27033974 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 27034137 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 27034219 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 27034253 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 27034345 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 27034702 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27034729 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 27034765 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 27034922 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 27035012 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 27035174 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 27035510 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27035651 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 27035979 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 27036073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27036300 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 27036340 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 27037491 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 27037685 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27037901 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 27037956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27038075 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27038744 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27038755 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27038768 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27038847 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27038875 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27039017 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 27039039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27039153 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27039193 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27039258 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 27039589 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 27040103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27040150 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 27040186 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 27040261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27040398 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 27040670 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 27040808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27040995 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27041030 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27041242 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 27041268 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 27041369 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 27041398 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 27041553 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27041834 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 27042101 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 27042787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27043367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27043468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27043810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27045395 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 27045658 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 27047033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27048505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27049416 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 27049708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27049941 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27050078 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 27050502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27051140 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 27051304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27051362 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27051594 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 27051763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27052183 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27052280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27053876 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27053906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27054709 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 27054722 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 27054723 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 27054816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27054845 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 27054870 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 27054882 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 27055001 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 27055045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27055093 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 27055096 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 27055436 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27055507 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 27055762 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 27055777 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 27055821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27055990 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 27056003 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 27056146 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 27056291 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 27056371 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 27056453 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 27056579 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 27056616 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 27056631 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 27056632 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 27056687 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 27056706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27056833 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 27057145 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27057215 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 27057261 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 27057337 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 27057371 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 27057393 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 27057481 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 19 27057700 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27057797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27057800 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 27057856 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27057883 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 27057986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27058572 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 27058611 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 27058677 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 27058720 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 27058830 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 27058840 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27058998 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27059019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27059029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27059235 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27059441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27059478 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27059635 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 27059681 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 27059706 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 19 27059725 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27059745 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27059901 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27059917 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 27059996 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27059997 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27060034 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 27060075 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 19 27060085 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 27060119 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 27060190 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 19 27060234 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27060254 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 27060321 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27060341 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 27060399 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27060513 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27060730 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27060738 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27060749 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 27060803 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 27061028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27061190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27061396 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 27062620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27062691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27062974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27063152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27063324 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 27063476 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 27064036 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 27064319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27064801 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27065097 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27065486 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 27065624 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 27065701 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 27065969 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27066137 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 27066437 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 27066527 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 27067569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27067597 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27072211 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27072810 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 27073486 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 27073498 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 27073574 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 27073662 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 27074015 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27074166 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27074220 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 27075419 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27076029 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 27078406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27078529 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 27078661 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 27078922 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27079218 A G N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 19 27082430 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 27082615 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27082853 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27083344 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27083620 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27083774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27084015 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27084016 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 27084078 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27084182 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 27084455 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27084464 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27084483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27084619 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27084724 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27085142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27085349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27085429 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 27085495 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 27085601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27085617 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 27085621 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 27085630 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 27086152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27086495 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 27086757 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 27086758 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 27086778 G T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 27086815 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 27087090 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 27087386 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 27087477 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 19 27087483 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 27087507 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 27087540 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 27087656 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27087802 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 19 27087877 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27088158 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27088178 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27089432 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27089741 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27090984 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 27091300 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27091497 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 27091707 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27091779 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 27091801 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 27092403 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 27092506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27092834 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27092945 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27093185 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27093385 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 27093450 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27093917 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27093978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27094475 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 27094480 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 27094977 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 27095005 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 27095038 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 27095089 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 27095145 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 27095195 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 27095305 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27095426 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 27095583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27095708 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27096339 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 27096341 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 27096467 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 27096513 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 27096565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27096771 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27096977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27097081 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 27097252 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 27098314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27101442 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27101722 C G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 19 27103683 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 27104134 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 19 27104135 C T N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 19 27104138 T C N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 19 27104687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27104881 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 27104894 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 19 27105983 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27106831 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27107241 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 27108667 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27109573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27109795 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 27111038 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27112250 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 27115099 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 27115105 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 27115106 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 27115298 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27115733 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 27115865 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 27115877 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27115905 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 27115930 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 27115943 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 27115970 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27117607 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27118566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27119272 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27120397 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 27121881 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 27122695 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 27122813 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 27122932 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27122991 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 27122992 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 27122993 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 27123020 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 27123031 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27123141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27123251 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 27123256 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 27123279 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 27123287 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 27123356 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 27123457 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27123538 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 27123624 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 27124377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27128949 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27129312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27129518 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27129531 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 27129684 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 27130092 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27130458 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 27131243 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27131283 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 27131818 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27131883 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27131989 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27132101 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 27132189 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27132295 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27132389 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 27132397 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27132400 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27132424 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27132665 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27132742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27132755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27132763 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27132852 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27133016 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 27133458 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27133463 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27133517 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27133591 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27133625 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 27133719 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27134147 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27134165 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27134180 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27134193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27134394 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 27134460 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 27134576 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 27134862 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 27134926 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 19 27135030 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27135073 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 27135140 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27135166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27135415 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27135423 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 19 27135637 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27135715 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27135764 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27135875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27136006 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 27136153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27136426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27137104 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 27137208 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27137228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27137232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27137387 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 27137614 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 27138138 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 27138176 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 27138405 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 27138416 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 27138430 A C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 19 27138462 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 27138478 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 27138512 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27138553 C G Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 27139015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27139227 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 27139270 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27139311 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27139655 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 27139716 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 27139726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27139761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27139882 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27140155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27140443 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27140448 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 27140569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27140645 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 27140690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27140740 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27140747 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27141015 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 27141069 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 27141128 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27141621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27141672 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27141868 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 27141923 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27142146 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 27142178 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27143018 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 27143710 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 27143875 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 27144369 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 27145087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27145099 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 27145100 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 27145198 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 27145265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27145471 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27145497 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 19 27145620 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27145675 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27145679 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 27145731 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 27145737 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27145805 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 27145894 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 27146099 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 27146439 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 27146527 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 27146626 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 27146922 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 27146933 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27146935 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27146965 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27147726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27149673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27151245 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 27152600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27152896 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27153552 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27154787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27154902 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27155872 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27156659 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27158111 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27158721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27160920 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27161473 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27161921 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27162121 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27162308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27162466 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27162528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27162538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27162686 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 27162965 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27163085 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27163224 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27163726 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 27163766 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27163889 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27164021 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27164162 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 27164311 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27164421 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27164449 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 27164510 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 27164537 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 27164539 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 27164543 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27164579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27165163 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 27165173 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 27165221 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 27165282 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 27165609 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 27165628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27168225 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27168392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27168447 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27168497 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27168569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27168972 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 27170339 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27170458 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27170656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27173205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27173266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27173281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27173395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27173901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27176209 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27178678 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27179094 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27179256 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 27179385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27179443 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27179756 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27180541 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27182452 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27183686 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27185392 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 27185409 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 27185437 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27185881 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27186077 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27186710 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27189564 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 27189824 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27189829 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27189980 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 27189988 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 27189989 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 27190042 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 19 27190210 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 19 27190292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27190458 T G Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 19 27190619 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 19 27190898 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 19 27190959 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27191903 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 27191936 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 19 27192069 G T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.3125 0.625 0.0625 20 12 5 10 1 19 27192966 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 19 27193299 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27193315 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27193397 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27193594 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27193627 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27193699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27193707 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 27194037 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27194093 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27194414 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 27196443 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27196654 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 27196686 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27197349 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 19 27197579 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27197655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27197698 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 27197851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27199727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27202035 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27205833 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27208405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27208421 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27208873 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 27209087 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 27211342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27211632 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 27213033 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 27213047 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27215329 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27218994 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27219083 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27219459 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27219644 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27219821 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27220610 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 27220710 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 27220780 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 27220791 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 27220816 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 27220952 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 27221043 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 27221395 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 27222120 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 27222970 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 27223159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27223316 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 27224172 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 27224351 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 27225658 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 27225915 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 27225929 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 27225947 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 27225967 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 27226043 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 27226143 A G Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 27226274 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 27226283 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 27226299 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 27226304 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 27226456 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 27226740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27227120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27227393 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 27229399 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27229533 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27231965 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27233082 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 27234105 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 27234127 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 27234162 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 27234204 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 27234304 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 27234453 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 27234499 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27234598 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 27234701 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 27234728 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 27234884 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 27235520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27235730 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27236063 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27236246 C A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 27236279 C A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 27236333 T G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 27236608 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 27236805 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27237108 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 27237488 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27239618 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27242609 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27244067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27244815 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27246082 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27246873 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27249463 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27251357 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27251400 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 27252952 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27253849 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 27254931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27255298 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 27256028 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27256676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27257191 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 27257929 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27258487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27258909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27259929 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 27260535 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27260755 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 27261107 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27261272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27261411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27261743 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 27261802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27261811 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 27261825 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 27261887 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 27261888 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27261927 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 27262137 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 27262151 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 27262398 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 27262399 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 27262473 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 27262575 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 27262579 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 27262601 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 27262719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27262738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27262764 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 27262773 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 27263033 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 27263045 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 27263066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27263078 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 27263145 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 27263146 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 27263257 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 27263574 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27263827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27264050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27264247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27264251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27264268 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 27264394 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 27264404 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 27264749 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 27264764 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 27264806 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 27265127 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 27265146 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 27265157 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27265516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27265597 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 27265598 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 27265721 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 27265798 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 27266147 C T N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 19 27266307 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27266418 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 27266548 T C N Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 8 8 2 4 2 19 27266620 C A N N 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 19 27266623 T C N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 19 27266979 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27267069 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 27267207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27267498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27267688 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 27267708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27267804 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 27267979 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 27268034 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27268048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27268550 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27268552 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27268733 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27268779 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27268816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27268838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27268890 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27268920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27268953 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27269004 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27269036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27269495 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27269872 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27270010 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27270295 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27270627 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 27270643 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 27270851 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 27270861 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 27270863 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 27270958 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 27271160 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 27272109 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 27272243 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 27272271 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 27272284 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 27272430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27275484 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27276652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27279115 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 19 27279608 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 27279610 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 27279793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27279852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27279881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27280114 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27281063 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 27281303 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27282489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27282787 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27283608 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 27284474 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27284486 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 27284550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27284850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27285001 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27285025 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27285957 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27285985 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 27286056 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 27286181 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27286397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27286403 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27286519 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27286915 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27286970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27287349 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27287975 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27288817 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 27289081 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 27289092 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 27290027 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 27292789 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27294199 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27294669 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 27295290 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 27295360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27295426 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27295473 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 27295501 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27295541 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27295545 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27295625 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27295626 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27295662 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27295704 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27295851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27296236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27296301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27296616 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27296727 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27296821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27296823 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27296839 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27297608 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27297809 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27297925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27298368 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27298772 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27298794 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27299037 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 27299368 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 27299460 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 19 27299588 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 27299679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27299756 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 27300399 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 27300470 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 27300510 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 27300530 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 27301300 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 19 27301430 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 27301510 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 27301628 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 27301862 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 27301923 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 27302079 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 27302341 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27302353 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27302423 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 27302471 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 27302523 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 27302531 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 27302532 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.176470588235294 0.705882352941177 0.117647058823529 18 16 3 12 2 19 27302563 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 27302983 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 27303057 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 27303194 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27303202 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 19 27303261 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 27303282 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 27303310 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 27303490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27304083 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 27304141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27304206 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 27304804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27304841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27304943 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 27305084 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 27305191 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27305555 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27305558 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27305908 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27305984 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 27306130 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 27306430 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 27306478 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27306769 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 27307043 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27307044 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27307156 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27307272 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27307289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27307356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27307412 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27307543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27307631 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27307736 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27307746 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27307777 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27307793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27307796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27307854 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27307861 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27308030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27308316 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27308362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27308475 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27308482 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27308495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27309487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27309789 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27309990 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 27311133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27311528 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27311682 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27312037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27313407 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27314919 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 27315999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27316027 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 27317391 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 27317694 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27317715 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27317914 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27318074 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 27318406 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 27318427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27319166 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27319318 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 27319327 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27319710 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27319774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27319776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27320412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27322757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27323213 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27323378 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27323506 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 27323507 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 27325987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27326650 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27326826 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27326907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27328269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27329392 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 27329801 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27330427 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27332377 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27333457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27333717 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27334099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27334838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27335019 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27335108 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27335596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27336382 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27336823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27337006 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 27337439 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27337945 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27338777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27340873 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27344120 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 27344865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27345006 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27345423 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 27345538 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27345622 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27346633 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27349943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27351979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27352896 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 27353013 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27353619 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27355384 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 27355616 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 27356503 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27358201 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27358519 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 27358620 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 27358675 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27358691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27358716 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 27358719 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 27358722 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 27358724 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 27358778 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 27358779 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 27359071 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27359129 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27359132 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27359160 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27359315 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 27359692 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27359797 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27359804 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27360002 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27361804 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27364103 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 27364623 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27364775 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27365552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27365771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27365997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27367016 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27367218 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27367754 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 27367790 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 27367853 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27367923 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 27367954 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 27367991 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 27367994 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 27368127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27368176 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 27368403 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 27368579 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 27368636 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 27371673 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 27372380 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27372888 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27374540 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27375383 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 27375897 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27376285 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27377261 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27377357 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27377403 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 27377512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27377800 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27377981 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27378544 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27379265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27381486 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27381500 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27381741 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 27381792 A G Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 19 27382233 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 27383008 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27383025 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27383071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27383339 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27383495 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 27383966 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 27384348 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27384438 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27386207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27386643 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27387724 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27387847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27387853 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 27388189 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27388311 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27389329 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 27389839 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 27390502 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27390509 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 27391004 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 27391047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27391052 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27391218 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 27391463 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 27391861 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27392096 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 27392290 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 19 27392549 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 27392678 C G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 27393301 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 27393324 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27393539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27393570 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27393647 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 27393713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27393799 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27393822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27393912 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27394091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27394229 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27394242 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 27394268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27394312 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27394410 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27394430 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27394691 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27395198 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27396588 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27397843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27397995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27399916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27400064 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 27400065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27400375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27400389 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27403051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27403262 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 27404095 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 27404146 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 27404204 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27404925 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27406244 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27406340 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 27406364 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 27406381 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 27406455 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 27406529 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27407500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27407602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27408852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27409725 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27410172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27410553 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27411429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27411462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27411647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27414407 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 27414926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27416482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27417082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27417939 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27418125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27418512 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27419030 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 27419131 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27419774 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27420154 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 27420168 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 27420255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27420438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27420476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27420673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27420790 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 27420956 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27421086 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27421213 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 27421216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27421282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27421348 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 27421725 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 27421851 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 27421948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27421994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27422040 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27422079 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27422089 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27422247 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 27422528 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 27422536 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 27422638 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27422705 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 27422760 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 27422784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27422849 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 27422853 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 27422861 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 27422862 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 27422863 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 27423047 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27423099 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 27423112 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 27423125 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 27423135 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 27423152 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 27423314 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 27423323 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27423386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27423608 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 27424623 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 27424643 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27424814 T C N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 19 27424923 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 19 27424928 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 19 27425246 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27425331 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27425436 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 27425456 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 27425463 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 27425691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27425866 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 27426011 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 27426909 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27433362 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 27433377 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 27433504 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27433669 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 27435632 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27436292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27438104 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27438133 G T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 19 27438952 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 27439131 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 27439601 G A N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 19 27439855 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27439897 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27439903 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 27439965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27440354 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27440423 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 27440528 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27440547 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27440652 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27440656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27440787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27441200 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27442709 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27443102 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27443122 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27443161 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27443786 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 27443795 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27443852 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27444112 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27445921 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 19 27446140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27446277 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27446770 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 19 27446887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27447853 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 27447855 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 27447915 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 27448514 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27448677 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 27448703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27449741 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 27449783 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 27450024 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 27450272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27450317 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27450466 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 19 27450528 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 27450609 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 27450610 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 27450738 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 27450752 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 27450802 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 27451376 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27451887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27452161 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27452352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27452552 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27452880 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 27452933 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 27453010 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 27453356 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 27453414 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27453437 T C Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 27453542 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 27453545 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27453560 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 27453686 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 27453854 T A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 27453882 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 27454047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27454130 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 27454579 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27454703 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27454779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27455000 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27455300 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27456426 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27456691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27456775 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 19 27456791 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 27459447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27460969 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27461117 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27463460 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27465432 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27466560 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27469816 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27472516 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 27472522 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27472877 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 27472907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27473465 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27473699 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27475324 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27476360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27483637 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 27484035 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27484065 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27484349 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27484647 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27485878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27486209 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27486629 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27486851 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 27487512 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27487560 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27487681 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27487960 A T Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 27488154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27488706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27488951 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27489175 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27489284 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 27489323 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 27489375 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27489435 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 27489729 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27489851 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 27489902 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27489936 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 27490252 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 27490289 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 27490324 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 27490394 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 27490471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27490486 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 27490501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27490732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27490975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27491057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27491189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27491436 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 27491535 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27491536 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27491734 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 27491765 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 27491871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27491875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27491976 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 27492018 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27492582 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 27493339 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 27493342 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 27493351 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 27493874 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27494065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27494120 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 27494169 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27494325 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 27494486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27494496 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 27494522 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27494736 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27494803 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 27495200 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 27495329 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27495392 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27495480 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27495556 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27495557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27496396 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27496405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27496424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27496522 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27496543 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27496590 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27496592 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27496596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27496643 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 27496690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27496699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27496938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27497031 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27497051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27497702 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27497837 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27497870 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 27497895 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27498502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27498641 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 27498883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27499151 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27499197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27499363 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 27499531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27499559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27499734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27499895 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27499965 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 27500277 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27500458 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 27500518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27500655 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 27500717 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 27500749 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 27501292 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 27501715 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 27501738 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 27501890 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 27502088 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 27502449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27502452 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27502699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27502706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27503048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27503075 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27503321 A C Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 27503548 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27504098 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 27504444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27504890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27505056 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 27505448 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27505549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27505739 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27506607 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27506811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27507340 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27509504 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27509633 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27509878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27510464 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 27510560 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27510917 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27511231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27511354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27511464 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27511469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27511475 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27511711 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27512254 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 27512366 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27512818 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 27512828 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 27512870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27512939 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27512959 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27513009 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27513677 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 27513878 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 27513886 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 27514386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27515003 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27515035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27517301 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 27519636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27519791 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 27519798 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 27520438 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27520758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27520786 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27520896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27520901 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27521111 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 27521147 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 27521380 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 27521463 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27521639 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 27521722 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 27521890 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 27521905 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 27521978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27522100 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 27522185 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27522215 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 27522229 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27522368 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 27522568 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27523031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27523035 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27523056 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 27523362 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 27523434 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27524472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27524602 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 27524604 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 27524833 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27524871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27524903 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27525600 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 27525632 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27525666 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 27526427 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 27526428 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 27526489 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 27526490 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 27527338 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27527377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27527862 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27527919 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 27527979 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27528240 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 27528378 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 27529195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27529200 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 27529243 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 27529509 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27529548 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27529656 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 27529856 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27530074 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 27530141 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27530623 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27530936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27531256 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 27531457 G A N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 19 27531665 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 27533090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27533095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27533171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27533241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27533545 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27534939 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 27535238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27535846 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27536498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27536526 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 27541102 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27541105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27542184 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27542602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27543521 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 27543601 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 27543720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27544015 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 27544085 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 27544102 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 27544321 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 27544333 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 27544461 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 27544561 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27544620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27544664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27544775 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27545403 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27545605 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 27545705 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27545716 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 27545717 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 27545973 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 27545976 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 27546306 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 27546349 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27546485 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 27546593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27546596 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27547260 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 27547815 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27547922 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27548111 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27548254 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27548329 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27548450 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 27548603 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 27548606 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 27548701 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 27549091 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27549299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27550016 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27550200 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27550214 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 27551108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27551315 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27551640 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27552282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27552292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27552466 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27552550 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27552669 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27552878 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27553187 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27554180 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 27554456 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27554928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27555402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27555551 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27555603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27555604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27555625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27555677 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 27555678 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 27555838 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 27555843 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 27555998 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 27556008 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 27556455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27556880 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27556884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27557193 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27557243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27557320 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 27557325 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27557461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27557480 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27557551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27557745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27557803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27558000 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27558204 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27558556 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27558638 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27558644 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27558739 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27558788 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 27558797 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27558831 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27558836 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 27558837 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27558841 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 27559023 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27559242 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27559327 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27559397 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27559427 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27559530 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27559536 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27559600 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27559601 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27559868 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27559956 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27560296 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27560374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27560533 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27560909 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27561004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27561026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27561076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27561451 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27561464 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27561473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27561533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27561559 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27561917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27561971 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27561986 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27562108 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27562186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27562331 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27562352 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27562980 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27563225 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 27563399 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27563672 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27563675 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27563869 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27564035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27564051 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27565512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27565867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27566025 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 27566630 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 27567250 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27572490 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 27573572 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27573857 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27576957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27577561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27578532 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27578533 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27579835 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27580032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27580109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27580423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27580431 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27581399 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27582047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27582053 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 27582127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27583366 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27584116 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27584971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27585793 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27585981 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 27586233 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27586462 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 27586828 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27587213 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27587498 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 27588456 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27589631 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27590064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27590138 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27590139 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27590146 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27590422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27590952 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 27591167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27592828 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27598986 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27601317 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27601501 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 27602630 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27602640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27603369 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27605563 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27606199 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27606311 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27606364 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27606557 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 27606636 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27606645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27606753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27606754 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27606927 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 27607214 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27607595 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27607838 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27607923 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 27607970 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 27608157 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27608358 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 27608514 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27609761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27609834 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 27609850 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27610180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27610688 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27610860 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27610937 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27611084 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27612017 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27612075 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27612397 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27612604 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27613199 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 27613619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27613746 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27615104 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27615362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27616015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27616252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27616330 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 27616459 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27616477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27616624 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27616668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27617194 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27617370 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27617429 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27617999 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27618311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27618483 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27619489 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 27620289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27621842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27622463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27622520 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27622706 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 27624228 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27624299 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27626106 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 27626251 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 19 27626634 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27627122 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27629201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27629327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27630212 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27630276 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27630508 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27631640 T A N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 27631837 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27632147 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 27632196 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27632304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27632472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27632473 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27633150 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27638329 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 27638685 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27641162 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27641461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27641608 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 27642277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27642858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27643034 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27643146 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27644420 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27644684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27645887 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27645910 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27645989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27646033 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27646171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27646225 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 27646299 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27646501 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27646576 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27646713 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 27646909 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 27647347 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 27647441 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 27647771 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 27648342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27650196 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27650350 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27650471 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 27650714 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 27651611 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 27652040 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27652321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27653398 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27655461 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27655462 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27655476 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 27656178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27658290 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27661940 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27663945 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27664794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27665119 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27667027 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27667564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27668345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27669502 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27670124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27671956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27677743 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 27678418 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27680647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27680784 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27680798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27681892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27682428 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27684631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27685047 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27685059 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 27685062 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27685162 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27685326 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 19 27685780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27686028 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27686721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27686956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27687211 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27687220 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27687317 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27687331 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27687383 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27687433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27687479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27687501 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27687508 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27687512 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27687560 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27687585 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27687657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27687716 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27687755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27687756 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27687790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27687800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27687823 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27688192 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 27688431 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 27688469 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27688536 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27688544 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27688607 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27688673 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27689076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27689104 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27689122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27689135 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27689138 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27689246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27689987 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27690576 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27691046 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27691209 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27691541 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27692631 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27692634 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27692636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27692907 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27692993 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27693081 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27693249 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27693419 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27693450 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27694558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27694799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27695325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27695438 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27695786 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27695820 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27695897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27695981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27696244 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27696724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27696877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27697411 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 27697434 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 27697656 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 27697773 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 27697792 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27698074 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27698158 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27698170 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27698185 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27698299 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27698358 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27698443 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27698463 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27698506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27698544 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27698978 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27699435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27700080 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27700597 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 27700710 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 27701473 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27701551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27701676 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27702142 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27702998 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27703044 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27703551 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27705182 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27705529 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27705530 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27705741 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27706482 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 27706501 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27706505 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 27706787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27706826 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27707143 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27707528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27708109 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 27709722 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27711794 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 27712524 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27712525 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27715498 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27721168 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27721354 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27722886 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27723007 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27723018 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27724967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27727805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27728590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27728758 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27729434 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27734905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27735643 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27740827 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 27741238 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27741354 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 27746098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27747030 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27747164 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27747549 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27747881 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27751662 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27751759 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 19 27751782 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 27751788 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 27751818 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27751838 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 27751847 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27751910 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27751912 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27751963 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 27751969 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27751970 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 27751991 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 27752030 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 27752084 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 27752086 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 27752090 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 27752163 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 27752170 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 27752193 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27752288 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 27752511 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 27752906 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27752951 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27752968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27753058 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27753366 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 27753753 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 27753764 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 27754104 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 27754106 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 27754130 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27754188 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 27754191 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 27754510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27754681 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27754883 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 19 27754965 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 27755800 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27756044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27756238 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27756389 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 27756857 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 27757025 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 27757698 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27757857 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 27757869 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 27757934 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 27757962 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 27757977 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 27758052 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 27758314 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 27758339 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 27759667 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 27759866 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 27759883 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 27759889 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 27759894 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 27760002 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 27760003 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 27760006 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 27760021 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 27760148 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 27760250 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 27760341 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 27760369 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27760502 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 27760556 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 19 27760815 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 27760950 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 27761013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27761052 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 19 27761103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27761130 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27761148 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 27761175 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 19 27761185 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 19 27761216 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27761219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27761230 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27761235 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27761278 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27761342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27761344 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 27761350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27761362 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 27761369 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 27761521 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27761559 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 27761836 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27762184 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27762347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27763002 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27763113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27763556 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27763709 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27763931 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27763953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27763994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27764050 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27764053 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27764175 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27764387 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 27764389 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 27764916 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27765089 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 27765222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27765223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27765288 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 27765293 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 27765304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27765332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27765339 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27765345 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27765394 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27765818 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27765952 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 27766113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27766118 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 27766997 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27768177 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27768321 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 27768969 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 27769025 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 27769042 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 27769053 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27769058 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27769143 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 27769544 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 27769572 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27769962 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27770318 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 27770341 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27770351 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27770434 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27770517 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27770542 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27770554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27770800 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27771020 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27771227 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 27771358 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27771359 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27771509 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27771539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27771600 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27771659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27771701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27771867 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27771885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27771934 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27772200 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27772425 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27772468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27772508 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 27772678 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27772723 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27773059 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27773101 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27773131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27773207 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27774345 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27774605 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27774731 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27774754 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27774986 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27775360 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27775394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27776607 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27777192 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27778707 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 27778872 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27781149 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27781951 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27782087 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27783406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27783738 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27784866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27785318 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 27790892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27791130 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27793875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27794458 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 27794820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27794856 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 27794948 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 27794969 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 27796318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27797378 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27797919 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27798059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27798380 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 27798397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27798463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27798464 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 27798495 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27802221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27802365 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 27803216 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 27803664 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27803712 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27803794 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27804536 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 27804980 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 27805201 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 27805396 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 27805480 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 27805521 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 27805538 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27805564 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27805598 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 27805705 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 27805782 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 27806189 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 27806333 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 27806371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27808283 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27808503 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27809223 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 27809759 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 27810090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27819292 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27824637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27824858 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 27825582 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 27833218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27833249 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 27833254 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 27833749 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27834204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27834779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27835151 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27835853 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27836690 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27837835 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27839404 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27839680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27840429 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27843051 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27843167 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27843463 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27843505 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 27843590 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 27844042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27847068 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27848358 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 27848904 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27851418 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27854194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27855543 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27856674 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27858205 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 27859169 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 27859639 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27860335 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27861028 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 27861107 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 27863329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27865377 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 27872597 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27872634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27872659 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27874828 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27875890 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27876032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27880192 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 27887518 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27890182 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27893107 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 27893111 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 27894722 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27895365 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27895832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27896446 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 27898965 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 27899048 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27900910 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27902263 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 27905005 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 27909026 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 27909823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27914234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27914521 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 27914774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27915671 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27917377 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27920914 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27922385 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 27922757 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27922982 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27924679 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27924758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27926276 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27928520 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27929886 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 27932604 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27934132 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27934624 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27935528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27936368 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27936805 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27937250 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27937360 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27937368 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27938410 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27939207 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 27940058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27940207 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27940229 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27940543 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27940685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27940779 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27941159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27941494 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27942669 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 27942826 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27944730 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27945793 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27948246 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27948476 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27950014 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27950977 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 27951360 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27951704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27957167 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27958797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27961174 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 27962142 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 27963638 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 27963796 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27963970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27963971 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 27964246 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27964325 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27965661 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27966036 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27966414 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27967085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27971175 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27972293 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27972505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27972941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27973377 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 27973457 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 27977796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27981907 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 27983639 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27983677 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27989954 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27991087 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 27992435 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27992683 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27993424 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27994517 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27994940 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 27996273 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27997930 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 27997933 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 27998349 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 27998355 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 27998771 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 27998846 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 19 27999471 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27999499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 27999519 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 27999560 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 27999585 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 28002137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28002858 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 28006359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28008106 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28009729 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28009732 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28009742 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 28011284 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28012204 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 28012379 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 28012401 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 28013005 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 28013876 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28013942 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 28015410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28016226 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28017910 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28020214 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 28020766 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 28020979 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28024616 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28025182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28026979 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28030272 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28030545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28033660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28034556 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28035064 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28035108 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28035138 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28035203 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28035224 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28035812 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28038689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28039231 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28039843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28039889 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28039921 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28040171 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28040271 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28040745 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28040941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28041159 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28041379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28041683 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28041836 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28043348 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28044743 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28047572 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28048183 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28048210 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 28049259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28049349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28049418 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28049952 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28050087 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28050429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28050681 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28051455 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28052290 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 28052424 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 28052965 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 28054075 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28054151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28055524 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28059345 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28059554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28060197 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28060727 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28062166 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28063078 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 28063814 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28064161 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28067100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28067317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28068012 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 28068523 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28069785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28069857 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28070606 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28071040 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28071492 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28071548 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 28071661 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 28071796 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 28071807 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28071917 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28072617 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 28072721 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28072965 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 28073203 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 28074096 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28074203 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 28074323 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 28075160 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28075185 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28075189 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28075236 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28075442 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28075509 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28075673 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28075678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28075714 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28075731 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28075842 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28075889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28075936 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28076070 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28077078 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 28077313 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28078239 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28078314 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28078331 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28078447 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28078817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28079783 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28080135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28082990 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 28083504 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28083505 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28083953 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28083971 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28085146 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 28086139 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 28086141 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 28086149 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 28086700 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28089839 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28090974 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 28092682 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 28093116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28093167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28093410 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28093702 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 28094358 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28095293 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28095873 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28096040 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28096181 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28097003 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 28097276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28097311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28098234 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28102142 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28102380 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 28102774 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 28103088 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28103577 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 28103747 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 28103840 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 28103988 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 28104203 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 28107579 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28107982 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28108878 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28108920 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28110258 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28110816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28110818 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28110828 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 28110882 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28110966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28110973 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28110985 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28111124 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 28111356 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 28111548 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 28111693 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 28112336 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 28112469 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 28113390 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 28113607 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28113803 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 19 28114051 C A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 28114069 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28114100 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28114859 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 28114929 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 28115329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28115449 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28115467 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28115488 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28115505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28115534 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 28119003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28119062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28120475 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28122583 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28125706 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 28130112 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28130744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28132144 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 28132197 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 28132722 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 28132762 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 28132907 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 28133332 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28133805 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28134145 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28134659 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28135932 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28136276 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 28136635 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 28136918 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 28137412 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 28137420 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 28137507 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 28138269 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28138757 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 28140782 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 28141122 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 28141492 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28141980 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28142038 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28142244 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28142661 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28142801 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 28143076 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28143404 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28143483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28143600 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28143633 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28143742 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28143809 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28143826 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28144072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28144147 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28144148 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 28144454 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28144625 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28145092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28146414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28146608 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28147226 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28147418 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28147783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28148700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28149597 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28149937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28150215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28151758 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 28151817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28151875 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28151932 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28152012 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28152102 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28152758 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28152829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28152832 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28152910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28152928 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28153016 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28153061 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28153100 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28153518 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28155284 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28155453 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28155563 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28155857 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28155947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28156053 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28156124 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28156143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28156320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28156347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28157003 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28158343 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 28158516 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28159899 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 28160812 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28161013 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28161948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28161969 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28162051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28162437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28162675 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28163617 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28164038 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28164088 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28165084 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28165841 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 28165935 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28166225 T A Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 19 28166576 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28166578 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28166774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28166795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28167550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28167630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28167671 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28168107 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28169250 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28169350 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28169485 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28169504 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28169729 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28169926 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28170329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28171147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28172842 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28172919 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28172943 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28173553 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28174515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28174536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28174548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28175889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28175967 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28177003 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 28177214 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 28177551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28178560 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 28179361 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28179859 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28180199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28180312 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28180503 T C Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 28180596 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 28180798 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28181920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28181949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28183175 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28183460 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28183692 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28185052 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28185121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28185138 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28185721 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28185744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28185953 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28186070 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28186112 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28186187 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28187506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28187827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28187867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28187961 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28187969 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28187996 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28191931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28193685 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28194935 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28195538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28196274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28196340 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28197193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28197804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28198079 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28198182 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28198263 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28198415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28198568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28198652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28198741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28198795 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28199320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28199341 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28199667 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 28200358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28200507 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28200530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28200874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28201153 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28201214 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28201313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28201347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28201351 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28202632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28202845 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28203230 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28203732 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28203983 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28204231 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28204829 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28204837 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28204840 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28204867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28204873 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28205631 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28205765 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28206090 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28206174 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28206411 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28206441 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28206562 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28206563 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28206617 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28206659 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28206786 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28206835 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28207009 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28207157 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28207241 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 28207247 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28207513 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28208424 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 28208449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28208570 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 28208888 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28209192 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28209193 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28209480 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 28209986 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28210813 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28211132 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 28216440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28217541 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28219110 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28219306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28219365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28221036 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 28221129 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 28221167 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 28221184 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 28222853 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28222935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28223413 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28232837 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28233588 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28234697 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 28236158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28236858 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 28237647 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28238571 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28238672 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28239010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28239226 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28240842 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 28241060 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 28241701 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28241924 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28242185 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 28244598 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28246662 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28246760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28247090 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 28250750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28250846 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28253519 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28254540 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28255091 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 28256044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28256429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28256698 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28256863 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28257268 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28257537 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 28257661 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28257675 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 28257705 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28257720 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 28257723 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28257754 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28257793 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28257955 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 28258326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28258919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28259745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28259870 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 28259885 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28259887 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28259937 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 28260111 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 28260456 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 28260544 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28260764 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 28260955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28262076 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 28262808 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28263465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28263585 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 28264738 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 28265012 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 28265858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28266658 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28267121 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28267650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28267937 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28269604 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28269675 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28269731 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28269782 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28270215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28272150 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28272337 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28272963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28273397 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 28273485 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28273610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28273640 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28275273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28275391 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 28275538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28275614 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28275669 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28275936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28276029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28276099 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 28276182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28276217 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28276308 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28276316 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28276353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28276583 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 28276584 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 28276587 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 28276674 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28276680 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28277262 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28277658 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28277711 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28279933 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 28280070 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 28280245 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28280263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28280378 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 28280439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28280714 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 28280750 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 28281363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28281585 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 28281877 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 28281972 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28282004 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28282086 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 19 28282374 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28282483 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 28282486 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 28282539 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 28284723 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28284876 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 28284880 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 28284888 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 28284890 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 28285255 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28285256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28285272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28285353 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 28285378 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28285603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28285729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28285737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28285814 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28286128 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 28286155 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 28286276 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 28286431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28286562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28286598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28286608 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 28286703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28287065 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 28287205 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 28287450 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28287506 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28287529 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28287640 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28288182 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 28288193 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 28288217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28289024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28289079 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28289091 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28289634 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 28289713 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 28289734 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 28289905 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 28290408 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 28290644 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28291152 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28291330 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28292123 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28292947 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28293094 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28293207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28294193 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 28294304 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28294384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28294740 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 28295126 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28297476 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 28297498 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 28297502 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 28297930 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 28297942 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28297997 C A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 19 28298247 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28298350 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28298601 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28298662 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28298699 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28298706 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28298761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28299067 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28299149 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 28301396 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 28301504 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 28301562 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 28301792 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 28303076 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28303130 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 28303317 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 28303480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28303975 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28304743 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 28305699 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28306325 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 28306517 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 28306887 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28307110 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28307166 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 28307213 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 28307342 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28307517 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 28307666 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 28307776 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 28308047 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28308076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28308081 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28308311 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 28308312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28308608 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 28308749 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28308802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28308841 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 28308874 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28309074 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 28309113 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28309454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28309626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28310355 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 28310622 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28310685 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 28310716 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28310790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28311341 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 28311364 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28311433 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28311732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28311839 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28312917 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 28312921 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 28312942 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 28313732 A C N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 19 28313926 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28314048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28314100 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 28314179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28314315 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 28314401 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 28314445 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28314465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28314539 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28314828 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 28315037 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28315199 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28315224 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 28315452 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28315533 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 28315534 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28315834 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28316025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28316240 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 28317119 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 28317207 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 28317347 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28317399 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28317512 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 28317579 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 28317619 A G Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 28317824 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28317936 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 28318042 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 28318161 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 28318175 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 28318178 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 28318291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28318304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28318317 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 28318378 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 28318684 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 28318696 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 28318749 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 28318754 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 28318789 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 28318792 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 28318862 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 28318938 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 19 28319183 C G N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 19 28319207 T C N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 19 28319208 G A Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 19 28319209 T C N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 19 28319377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28319403 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 28320249 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 28320285 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28320328 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28320386 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 28320416 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 28320492 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28320551 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 28320597 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 28321128 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28321134 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28321189 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28321549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28321556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28321564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28321572 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28321963 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 28322076 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 28322104 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 28322107 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 28322138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28322233 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28322261 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 28322262 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28322294 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28322295 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28322519 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 28322530 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 28322629 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28322771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28322844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28323169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28323275 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 28323575 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28323983 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28324024 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28324234 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 28324271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28324428 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 28324438 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 28324585 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28324599 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 28324649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28324784 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 28327281 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 28327618 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28328081 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28328141 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28328153 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28328774 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28329296 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 28329402 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28329403 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28330128 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28330130 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 28330171 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 28330610 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 28330808 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 28330857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28331422 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 28331468 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 28331643 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 28332032 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 28332134 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 28332165 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 28332258 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28332265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28332296 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28332298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28332353 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28332389 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28332390 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28332742 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28332980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28333002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28333508 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28334587 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28334692 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 28335563 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28335638 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28335970 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28335985 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28335998 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28336167 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28336194 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28336442 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 28336552 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 28336977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28337000 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28337109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28337223 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28337384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28337467 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 28337682 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 28337779 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 28337888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28338203 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28338318 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 28338343 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 28338491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28338544 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 28339605 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 28339669 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28339878 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28341299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28341916 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 28342552 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28342554 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28342691 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 28343589 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28343698 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28344142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28344213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28344214 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28344224 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28344285 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28344287 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28344299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28344336 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28344346 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28344477 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28344715 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28344724 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28344765 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28344778 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28344884 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28344887 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28344940 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28344945 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28344980 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28344983 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28345076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28345121 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28345158 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28345197 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28345370 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28345421 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28345637 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28345638 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28345648 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28345666 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28345676 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28345683 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28345714 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28345847 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28345958 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28345967 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28345972 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28345996 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28346022 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28346108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28346454 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28346506 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28346580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28346735 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28346852 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28346865 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 28346867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28346877 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28346986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28347078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28347105 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28347144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28347220 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28347237 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28347325 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28347361 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28347410 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28347629 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28347789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28348253 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28348270 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28348274 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28348557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28348592 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28348623 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28348761 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28349493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28350132 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 28350133 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 28350396 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28350582 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28350780 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28350893 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28351560 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 28351589 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 28351660 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 28354502 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 28354846 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 28354859 T G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 28354977 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28355076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28355222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28355237 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 28355392 G T N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 19 28355399 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 28355433 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 28355456 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28355462 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28355674 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 28355710 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 28356124 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 28356145 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 28356243 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 28356376 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28356391 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 28356417 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 28356426 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 28356503 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 28356587 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28356836 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 28357391 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 28357539 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28357652 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28357783 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 28357819 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 28358416 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28358484 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28358816 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 28359014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28359148 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 28359199 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 28359350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28359474 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28359859 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 28360059 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28360086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28360110 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 28360656 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28360834 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28361071 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 19 28361270 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28361361 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 28361438 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28361488 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 28361880 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 28362256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28362311 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28363317 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28363358 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28363384 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28363394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28364469 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 28365881 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 28366276 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28366967 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28367712 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28368799 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28368994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28369037 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28370475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28371926 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 28372319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28372326 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 28372669 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 28372673 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 28373384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28373920 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 28375060 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 28375236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28375271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28375305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28375356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28375704 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 28376183 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 28376327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28376423 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28376439 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 28376505 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 28376665 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 28376915 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 28377667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28377783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28377816 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 28378127 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 28378251 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 28379490 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28379653 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28380113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28381329 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 28381330 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 28381685 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 28381706 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 28381738 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 28381872 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 19 28382046 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 19 28382105 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 28382144 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 28382279 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 28382286 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 28382733 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 28383063 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 28383072 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28383141 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28383175 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 28383257 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 28383258 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 28383342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28383410 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28383493 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28383720 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 19 28383823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28383840 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 28383903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28383946 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28384473 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 28384508 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 28384591 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 28384682 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 28384744 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28384794 A C Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 28384834 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 28384961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28385704 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 28385793 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 28386093 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28387366 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 28387405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28387448 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28387513 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 28387654 A T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 28388310 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28388459 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 28388691 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 28388696 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 28388741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28388881 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28388882 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 28388892 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 28388903 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28389257 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28389974 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28389985 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28390255 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 28390352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28390736 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28393045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28393069 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 28393599 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28394979 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28395150 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 28395491 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 19 28395576 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 28395644 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 28395681 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 28395711 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 28395812 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 28395819 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28395842 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 28395972 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 28395981 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 28395992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28396036 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 28396048 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28396050 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28396289 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28396355 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28396832 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 28396838 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28396946 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28396950 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28396975 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 28397049 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28397080 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 28397168 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 28397211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28397343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28397406 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 28397450 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28397598 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 28397761 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28397892 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 28397959 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 28398617 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 28398631 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 28398764 T A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 19 28398981 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 28398990 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 28399249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28399298 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 28399489 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 28399498 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 28399544 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28399779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28400100 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28400122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28400132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28400198 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28400221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28400639 A G Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 28400753 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 28400856 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 19 28400909 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 28400924 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 19 28400944 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 28401278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28401311 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 28401322 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 28401363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28401416 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 28401437 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28401518 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 28401521 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 28401522 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 28401789 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 28401852 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 28401895 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 28402061 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 28402563 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 28403885 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 19 28404124 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 28404138 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 28404159 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 28404383 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 28404541 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 28404999 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 28405014 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 28405089 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 28405095 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 28405215 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 28405363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28405425 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 28405602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28405815 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 28405876 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 28406580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28407073 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28407138 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 28407204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28407223 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28407465 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28407640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28408068 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28408127 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28408130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28408150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28408426 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 28408575 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 28408819 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 28409127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28409132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28409618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28409644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28409857 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 28410403 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28410424 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28411161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28411361 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28411665 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28412405 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 28412711 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 28412747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28412790 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 28412791 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 28412837 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 28413118 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 28413121 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 28413475 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 28413538 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 28413582 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 28413618 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 28413800 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 28413805 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 28413808 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 28413852 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 28413860 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 28413868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28413905 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 28413906 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 28414188 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 28414225 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 28414421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28414806 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28414853 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28414884 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 28414934 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 28415215 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 28415340 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 28415381 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 28415657 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28415907 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28416092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28416166 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28416253 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 28416495 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 28416760 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 28416823 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 28417279 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28417621 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 28417626 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 28418017 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28418238 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28418457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28418559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28418698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28418733 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28419000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28419058 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 28419074 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 28419078 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 28419313 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 28419334 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 28419801 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28419808 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 28420037 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 28420061 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 28420649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28421222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28421249 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 28421369 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 19 28421808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28422066 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28427001 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 28427786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28427927 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 28428039 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 28428969 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28429065 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 28429407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28429426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28429584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28429777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28429908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28430012 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 28430253 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28430530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28430694 T G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 28430924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28431702 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 28432888 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28433709 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28434470 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 28434758 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 28434840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28434986 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 28435008 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 19 28435009 C G N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 19 28435020 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28435051 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 28435075 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 28435194 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28435430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28435677 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28435827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28435836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28436278 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 28436415 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28436948 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28437230 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28437585 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 28437787 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28438137 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 28438169 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 28438367 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 28439254 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28440247 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28440351 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 28440732 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28441247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28441408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28441788 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28442297 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28442910 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 28443320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28443451 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28444590 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28444957 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28447491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28447965 C G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 28447989 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28448158 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 28450156 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28452372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28453185 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28453249 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28453297 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28456133 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 28456340 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 28457724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28457732 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28457792 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28457793 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28457802 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28457844 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28457854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28457884 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28458617 T G Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 28458623 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 28458657 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28458761 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 28459048 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28459184 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28459451 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 28459463 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 28459482 C T Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 28459708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28459801 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 28459895 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 28460252 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28461040 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28461379 A C N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 19 28463035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28463697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28463740 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 28464204 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 28464594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28464681 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 28464979 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 28465039 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28465094 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 28465183 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 28465240 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28465336 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 28465394 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 28465774 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 28465839 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 28465849 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 28465991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28466050 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 28466765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28466766 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 28466866 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 28467028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28467069 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 28467194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28467203 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 28467464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28467486 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 28467489 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 28467509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28467623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28467717 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 28468274 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 28468831 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28468897 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28469125 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28469227 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 28469730 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 28470396 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 28471015 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28471291 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 28472608 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28472666 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28476309 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 28479316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28479445 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28479988 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 28482191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28483518 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28485373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28486034 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28486865 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28487424 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 28487427 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 28489419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28489420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28489648 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28490516 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28492507 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 28493072 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28495577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28496834 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28498435 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28498624 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28498965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28499497 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28499789 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28503112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28504128 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28504174 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28504524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28504997 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28505366 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28505964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28506066 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28506096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28506127 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28506310 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28506476 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28506540 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28506557 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28506813 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28506899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28507284 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28507856 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 28507927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28508177 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28508248 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 28508342 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28508346 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28508478 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 28508695 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28509013 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28509140 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28509300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28509387 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28509388 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28509578 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28509716 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28509860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28509932 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28510490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28510530 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 28511295 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 28511369 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 28511372 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 28511452 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 28511517 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28511596 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 28511672 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28515287 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28519244 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28523170 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 28524486 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28524541 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28525101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28527191 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28527651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28528294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28528474 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 28529066 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28529999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28530409 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28531491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28531736 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28531988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28532887 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28535111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28536401 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28537631 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 28538106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28540022 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28541034 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28541044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28541061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28541075 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28541077 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28541337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28543275 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28543335 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 28544490 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 28545589 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28546923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28547245 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28547361 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28547527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28547654 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28547811 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28548061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28548619 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28550990 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28551097 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28551108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28553558 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28556424 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 28559782 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 28562113 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 28562182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28562815 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28563864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28563932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28564140 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 28564144 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 28564214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28564330 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 28564973 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 19 28565252 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28565382 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 28565414 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28565425 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28565444 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 28565524 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 28565569 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 28565583 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28565601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28565727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28566285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28566350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28566621 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28566928 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28567339 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28567534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28567561 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28567654 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28567708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28568123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28570671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28570852 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28571200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28575094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28578442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28578796 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28579260 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28581318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28585394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28585573 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28585671 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 28588175 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 28589334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28591388 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28592600 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28592803 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28593784 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 28594052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28594075 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28594801 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28594991 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28594998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28595813 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28595846 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28596314 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 28596347 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 28596445 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 28596503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28596505 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 28596584 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28596695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28596743 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28596769 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28596773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28596778 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28597007 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28597484 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 28597798 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28597807 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28597902 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28598028 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28598116 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28598208 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28598248 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28598338 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28598367 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28598413 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28598575 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28598899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28598945 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28601801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28601876 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28601928 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 28601974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28602338 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28602673 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 28602779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28602782 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28603831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28605193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28605858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28605956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28607998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28608123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28609570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28610442 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 28613979 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 28614967 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28614982 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28615004 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28615152 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28615196 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28615284 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28615313 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28615342 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 28615447 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28615474 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 28615684 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28615774 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28615790 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28615803 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28615905 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28615974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28616030 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 28616097 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28616115 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 28616135 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28616163 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28616222 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28616235 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28616498 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28616527 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28616532 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28616565 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28616591 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28616594 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28616787 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 28617490 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28617523 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28619121 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28619446 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28619456 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 28619772 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28620062 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28621097 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28621099 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28621372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28621494 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28621582 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28622805 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28623886 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28623939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28624115 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28624327 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 28624331 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 28624726 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28624827 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 28624945 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 28625526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28625634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28625694 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 28626128 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 28626436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28626726 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 28626957 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 28627060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28627115 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 28627190 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 28627213 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 28627312 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28627405 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 28627520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28627544 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 28627666 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28627732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28627812 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28627814 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28627863 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28627908 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28627916 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28628416 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 28628608 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28628995 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 28628997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28629087 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 19 28629436 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28629941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28631014 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 28631138 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 28631227 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 28631625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28631872 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28633822 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28634023 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 28634107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28634125 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 28634181 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28634951 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28636588 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28638847 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 28639808 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 28640241 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28640244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28640362 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 28641033 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28642948 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 28643015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28643047 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28644009 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 28645085 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28646756 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28648398 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 28649103 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 28649349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28650536 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 28652113 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28652317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28653502 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28653647 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 28654389 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 28657133 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 28658028 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28659910 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 28659921 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28659922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28660588 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 28660593 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 28661276 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 28661388 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 28661707 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28662367 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 28663116 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 28663353 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 28663775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28664939 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28665354 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 28666213 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 19 28666624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28666982 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 28667046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28667066 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 28667154 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 28667197 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 28667247 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 28667282 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 28667896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28668035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28668077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28668094 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28668401 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 28668611 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28671384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28671400 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 28671928 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 28672104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28673184 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28673197 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28673205 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28673323 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28673407 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28673412 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28673458 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 28673677 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28674005 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28674236 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 28674623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28674693 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28674961 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 28675375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28677496 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28678701 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28679402 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28679568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28681357 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28681403 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28681559 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28681598 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 28682138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28682350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28682843 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28683347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28683891 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 28684417 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 28684461 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 28684491 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 28684628 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28685196 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 28685442 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 28685452 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 28685453 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 28685830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28686181 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28686271 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 28686392 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28686414 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28686491 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28686908 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28687324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28687632 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 28687844 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 28688282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28688742 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 28690513 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28691571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28691631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28693027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28696879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28697732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28698551 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28698855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28699295 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28699747 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28700071 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28700176 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 28700854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28701284 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28701335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28701867 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28702026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28703132 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28703496 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28703524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28704458 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28706194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28707612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28710843 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28711159 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 28711431 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 28711447 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 28711785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28712156 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28712214 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28712352 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 28712638 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 28712762 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 28712798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28712811 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 28712817 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 28712870 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 28713065 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 19 28713072 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28713114 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 28713188 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28713201 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28713321 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 28713335 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 28713496 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 28713565 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 28713644 G C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 28713848 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 28713913 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 28714004 T A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 28714045 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 28714525 C G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 28715103 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 28715902 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28716160 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28716998 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28717163 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28717246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28718050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28718539 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28718866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28718875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28718984 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28719065 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28719113 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28719544 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28719555 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28719937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28720011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28720224 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28721696 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 28721761 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 28721927 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28722019 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 28722026 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 28722119 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28722177 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 28722190 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 28722198 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 28722284 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 28722412 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 28722479 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 28722543 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 28722631 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 28722958 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28723049 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 28723402 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 28723411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28723870 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28724546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28724897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28725025 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28726021 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28726688 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28726794 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28727386 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28727580 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 28728570 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28730203 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 28730466 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 28730785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28730857 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28730932 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 28731298 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28732211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28732965 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 28733073 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 28733225 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28733842 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 28734161 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 28736231 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 28736406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28736482 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28737078 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28737772 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 28737793 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28738435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28738436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28739011 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 28740943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28740955 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 28741070 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 28741109 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 28741155 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 28741228 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28741231 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 28741232 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 28741282 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 28741381 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 28741536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28741694 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 28741714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28742454 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28742789 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 28743139 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 28744332 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28745319 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 28745552 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 28745580 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 28745842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28745909 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28746130 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28746324 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28746406 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28747402 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 28747506 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28748884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28749849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28750579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28750648 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28751047 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28751695 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28751969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28752191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28752802 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28753556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28758634 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 28760731 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 28760840 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28761214 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28761366 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28761370 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28761414 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 28761536 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28761590 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 28761849 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28762408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28762435 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28762563 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28762973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28763073 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 28763409 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 28763431 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 28763847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28765653 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28765658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28765685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28766352 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28766367 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 28766373 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 28766377 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 28766388 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 28766453 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 28766842 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28766880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28766906 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28767274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28767969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28768261 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28768780 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28769432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28769588 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 28769634 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 28769681 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 28769684 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 28769908 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 28769909 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 28769940 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 28769944 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 28770120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28770299 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 28770336 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28770413 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 28770417 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28770419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28770746 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28770951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28770987 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 28771289 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28771557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28771672 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 28771673 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 28771797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28772066 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 28772393 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 28772483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28772537 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 28772545 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 28772559 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 28772820 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28772903 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28772910 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28773485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28773490 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28773785 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28775015 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28775090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28775144 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 28775213 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 28775486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28775678 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 28775798 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28776114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28777129 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28777690 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28778638 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28778675 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28778761 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28778853 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28778859 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28779053 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28779808 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 28780166 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 28780181 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 28780213 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 28780280 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 28780397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28780492 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28780756 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28782863 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28783520 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28785644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28785694 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28785784 T G Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 19 28785792 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 28785810 A C Y N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 19 28785811 A C Y N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 19 28785824 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 28786016 C A Y N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 19 28786022 C A Y N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 19 28786058 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 28786062 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 28786090 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28786111 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28786143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28786145 C A Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 28786349 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28786708 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28787016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28787376 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28789011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28789025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28789873 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28789878 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28789892 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 28790244 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28791249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28791261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28791404 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28794605 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28794671 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28795341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28795373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28796455 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 28796556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28796665 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 28796741 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 28796867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28797037 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 28797103 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28797142 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28797219 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28797227 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 28797242 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28797260 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28797978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28797995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28798281 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28798339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28798370 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28798719 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28798720 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28798749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28798768 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28798772 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 28798833 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 28798988 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 28799067 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 28799082 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 28799143 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 28799165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28799170 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 28799202 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28799203 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28799246 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28799249 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 28799254 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 28799797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28799810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28800498 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 28801412 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28801457 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 28801504 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 28801598 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 28801627 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28801659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28801966 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 28802033 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28802276 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 28802730 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28803074 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 28803170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28803247 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 28805051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28805405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28805544 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 28806009 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28808295 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28813153 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 28814390 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28814680 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 28814722 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28814985 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28815555 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28816781 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28817205 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 28817344 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28817422 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28817423 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28817755 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28817915 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 28818207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28818266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28818920 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28818934 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28819107 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 28819519 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 28819562 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 28819695 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 28820043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28820379 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28820758 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 28820792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28820798 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28821024 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 28822723 G C Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 28822869 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 28823108 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 28823499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28823533 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28823617 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28823946 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28823971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28824613 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 28824757 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28824863 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28824937 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 28825295 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 28825308 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 28825345 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 28825449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28825463 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28825807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28825878 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28826041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28826053 A C N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 19 28826202 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28826333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28826475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28826851 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28827919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28827936 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28830073 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28830121 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28830122 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28830529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28830546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28830672 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28830710 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28830713 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28831092 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28831210 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28831281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28831316 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28831367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28831399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28831435 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 28831905 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28832371 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28832505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28833102 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28833132 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28833516 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28833668 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28833694 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28833776 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28833789 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28834080 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 28834208 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 28835211 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28836294 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 19 28836359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28836481 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28836688 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28836690 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28836742 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28836744 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28836811 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28837068 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28837270 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28838564 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28839045 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28839164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28839227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28839749 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28840743 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28840748 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28840991 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28841042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28842296 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28842334 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28842851 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28842859 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28842866 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28843200 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28848958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28850103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28850733 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28850799 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28850832 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28850849 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28850894 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28851157 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28851179 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28851272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28851286 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28851565 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28851577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28851845 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 28851876 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28851957 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28851978 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28852624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28852642 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28853284 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28853285 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28853351 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28853382 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28853442 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28853534 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28853541 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28853864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28854544 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28854607 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28855128 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28855663 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 28855710 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28855728 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 28855742 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28856375 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28857102 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28857159 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28857631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28857632 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 28857706 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28858252 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28858296 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28858369 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28858428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28858530 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28858562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28859280 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28859816 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28859929 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28860819 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28860829 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28860902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28860920 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28861844 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 28862351 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28865311 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28865829 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28865912 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28865928 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28865968 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28865983 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28866018 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28866040 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28866047 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28866114 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 28866134 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28866179 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28866233 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28866705 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28866881 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28866940 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28867277 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 28867425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28867442 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28867614 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28867639 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28867862 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28867900 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28867924 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28867979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28868079 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28868084 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28868173 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28868259 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28868491 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28868493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28868604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28868606 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28868635 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28869423 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28869586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28869617 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28869802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28869824 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28869839 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28869840 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28870036 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28870215 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28870624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28870819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28871706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28872004 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28872171 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28872308 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28872320 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28872322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28872343 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28872345 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28872389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28872399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28872623 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28872664 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28872787 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28872834 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28873278 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28873306 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28873433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28873517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28873546 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28873679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28873687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28873947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28874088 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28874104 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28874137 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28874212 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28874947 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28875174 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28875326 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28875495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28875599 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28875614 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28876043 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28876142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28876237 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28876270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28876293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28876296 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28876442 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28876443 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28876475 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28876885 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28876997 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28877022 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28877058 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28877212 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 28877223 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 28877396 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 28877529 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28877587 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28878798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28878966 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28878977 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28879099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28879105 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28879153 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28879160 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28879226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28879268 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28879302 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28879313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28879316 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28879517 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28879662 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 28879706 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 28879721 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 28879738 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 28879759 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 28880018 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28880615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28881348 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28881370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28881395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28881414 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28881526 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28881589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28881719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28881765 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28881918 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28882079 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28882182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28882196 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28882209 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28882279 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 28882494 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28882569 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28882588 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28882594 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28882663 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28882743 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28882773 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28882962 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 28883001 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 28883011 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 28883034 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 28883154 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 28883258 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28883272 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28883276 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28883294 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 28883295 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 28883388 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 28883416 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 28883455 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28883521 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28883579 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 28883936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28884122 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28884128 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28884418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28884443 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28884591 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28884688 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28884691 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28884783 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28884834 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28884846 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28884921 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28885162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28885177 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28885365 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28885390 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28885466 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28885480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28885749 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28885869 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 28885871 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28885903 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28885944 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0 0.764705882352941 0.235294117647059 13 21 0 13 4 19 28886026 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28886100 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28886154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28886244 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28886309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28886377 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28886673 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28886758 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28886784 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28886904 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28886967 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28887031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28887131 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28887174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28887301 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28887306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28887366 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28887548 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28888183 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 28888211 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 28888389 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28888501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28889542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28889742 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28890585 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 28890663 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28891040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28891098 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28891176 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28891179 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28891323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28891465 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28891473 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28891576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28891620 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28891764 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28891854 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28892065 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28892172 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28892219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28892225 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28892427 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28892522 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28892841 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28892871 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28892913 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28892960 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28892970 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28893014 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28893687 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28896252 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28897312 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28900756 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28902509 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 28902567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28902664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28902668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28905424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28908739 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 19 28910388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28910471 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 28910509 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 28910547 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 28911707 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 28911717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28911727 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 19 28912446 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28912545 C A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 19 28912808 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28912925 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 28913134 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 28913168 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 28913183 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 28913197 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 28913363 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28913634 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28913771 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 28913933 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 28913993 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 28914147 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 28914478 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 28914554 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 28914599 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 28914600 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28914617 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 28914631 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 28914705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28914859 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 28914876 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 28914890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28914974 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 28915549 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 28915580 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 28915672 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 28915707 A T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 28915711 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 28915879 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28915938 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 28915969 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 28915984 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 28916030 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 28916240 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 28916621 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 28916728 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28916734 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28916738 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28916753 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28917100 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28917294 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28917507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28917612 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28917909 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 28917911 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 28918025 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 28918276 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 28918301 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 28920081 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28920521 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 28920524 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 28920670 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 28920674 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 28920773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28921007 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 28921108 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28921981 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 28922922 G T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 19 28923363 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28923864 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 28925191 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28929368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28929886 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28930113 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 28930299 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 28930927 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 28930996 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 28931006 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 28931026 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 28931040 T A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 28931292 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28931420 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 28931426 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 28932028 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 28932176 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28932179 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 28932457 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 28932462 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 28933276 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28933882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28933986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28934887 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28935233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28935839 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 28936243 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 28938607 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 19 28938710 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 28938750 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28938955 G C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 28941121 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28941681 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 28941697 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 28941709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28941859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28942754 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28942915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28943073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28943597 G C Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 28943604 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 28943623 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 28943652 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 28943707 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28943716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28943782 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 28943817 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 28943822 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 28943824 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 28944277 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 28944278 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 28944358 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 28944387 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 28944481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28944572 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 28944608 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 28944658 C A N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 19 28944886 T C N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 19 28945004 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 28945764 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28945912 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 19 28945929 A T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 19 28945945 G C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 28946018 C A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 28946034 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 28946060 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 28946076 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 19 28946120 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 28946261 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28946298 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 28946410 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 28946572 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28946656 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 28946697 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 28946701 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 28946961 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28947034 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28947472 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 28947538 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 28947832 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 28948613 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 28949019 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 28949266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28950073 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28950726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28950835 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28951948 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 28952092 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 28952307 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 19 28952315 C T Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 19 28953029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28953848 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 28954782 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 28954974 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 19 28955172 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 28955506 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 28955598 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 28955710 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28955778 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 28955847 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 28956308 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 28956390 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 28956439 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28956571 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 28956602 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 28956666 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 28956678 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 28956974 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 28957171 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 28957397 C A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 28957471 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 28957527 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 28957581 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 28957589 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 28957669 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 28957680 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 28957774 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 28957955 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 28958113 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 28958279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28958367 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 28958492 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 28958584 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 19 28958625 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 28958627 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28958805 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 28958857 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 28958860 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 28958906 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 28958911 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 28959051 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 28959183 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28959299 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 28959507 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 28959510 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 28959573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28959624 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 28959812 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 28959867 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 28959870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28960045 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 28960065 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 28960111 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 28960117 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 28960318 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 28960378 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 28960419 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28960633 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 28960637 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 28960809 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 28960822 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 28960929 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 28961030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28961057 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 28961143 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 28961151 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 28961398 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 28961426 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 28961451 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 28961524 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 28961619 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 28961647 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 28961885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28962130 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 28962430 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 28962455 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 28962493 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28962551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28962562 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 28962572 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 28962667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28962672 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28962680 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 28962725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28962736 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28962767 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 28962787 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28963043 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 28963067 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 28963210 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28963395 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28963410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28963462 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28963472 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 28963505 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 28963535 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28963582 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 28963898 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 28963980 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 28964194 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 28964465 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 28964566 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28964569 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28964661 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 28964665 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 28964699 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 28964718 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 28964819 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28964933 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 28965110 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28965211 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28965230 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 28965553 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 28966200 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 28966254 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 28966304 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28966305 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 28966318 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 28966645 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 28966653 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 28966726 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 28966820 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 28966924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28967571 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28968035 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28968048 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 19 28968286 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 28968332 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 28968673 C G Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 28969307 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 28969319 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28969373 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28969469 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 28969579 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 28969629 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 28969630 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 28969657 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 28969740 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 28969958 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 28969974 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 28970141 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28970150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28973177 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 28973221 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 28973357 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 28974033 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 28974210 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28974257 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 28974352 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 28974418 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28974419 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 28975652 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 28975680 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28975782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28975799 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 28976250 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 28976253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28976272 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28976708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28977078 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 28977756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28978011 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 28978045 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 28978053 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 28978062 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 28978145 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28978342 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 28978442 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 28978459 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 28978509 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 28978531 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28978852 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 28979150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28979290 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 28979350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28979745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28980068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28980106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28980294 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28980462 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 28982059 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 28982061 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 28982151 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 28983522 C T Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 19 28986342 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 28988840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28988938 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28989082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28989775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28989785 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 28989860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28990143 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 28990200 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 28990201 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 28990245 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 28990517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28990677 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 28990744 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 28990838 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 28991364 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 28991515 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28991694 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 28991732 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 28991881 A T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 19 28992335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28992644 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 28993004 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 28993011 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 28993025 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 28993104 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 28993135 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 28993275 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 28993300 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 28993402 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 28993514 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 28993548 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 28993558 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 28993754 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 28993765 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 28993894 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 28993905 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 28993957 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 28994022 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 28994122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28994380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28994450 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 28995118 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 28995171 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 28997278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29000439 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29000827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29001067 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 29001116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29001182 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 29002166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29003077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29003612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29003627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29003691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29003715 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 29003940 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29003975 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29004018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29004218 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29004287 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29004325 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29004346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29004925 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 29005048 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29005063 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 29005874 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 29005940 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 29005947 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 29006315 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 29007112 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.466666666666667 0.2 0.333333333333333 17 13 7 3 5 19 29007128 G A N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.538461538461538 0.230769230769231 0.230769230769231 17 9 7 3 3 19 29007214 G A N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 12 8 5 2 3 19 29007277 A G N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.461538461538462 0.153846153846154 0.384615384615385 14 12 6 2 5 19 29007508 A C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 29008033 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 29008060 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 29008063 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 29008986 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 29009268 C T N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 19 29009326 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 29009592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29009599 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 29009644 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 29009648 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 29009694 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29009807 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 29009816 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 29009992 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 29010053 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 29010069 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 29010077 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29010222 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 29010485 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 29010487 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 29010492 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29010503 T A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 29010681 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 29010689 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 29011273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29011714 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29011879 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 29012285 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 29012449 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 29012633 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 29013691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29013801 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 29014141 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 29014409 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29014461 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 29014468 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 19 29014469 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 29014890 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29014917 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 29014994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29015087 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29015103 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29017253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29018360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29018917 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29020927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29021704 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 29021754 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 29021888 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29022215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29023892 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 29023900 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 29024140 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29024225 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29024226 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29024248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29024258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29024274 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29024339 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29024381 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 29024460 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 29024486 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 29024529 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 29024748 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 29024845 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29024847 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29024887 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29024902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29024953 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 29026838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29027104 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29027210 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 29027639 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29027649 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29027656 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29027677 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29027708 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29027774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29027832 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 29027896 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 29027907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29028026 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29028122 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29028211 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 29028212 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29028394 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29028559 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29028683 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29028684 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29028707 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29028893 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29028959 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29029109 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 29029532 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29029562 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29029571 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29029879 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 29029913 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 29029943 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 29029981 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 29029997 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 29030360 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 29031271 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 29031334 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 29031357 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 29031377 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 29031521 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 29031569 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 19 29031650 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 29031682 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 29031836 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 29031944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29032524 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29032548 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 19 29034598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29035954 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29035976 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29036051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29036147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29036350 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 29036419 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29036422 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29036432 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29036493 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 29036499 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29036562 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 29036631 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29036655 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29036967 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 29036968 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29037123 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 29037239 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29037346 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 29037394 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 29037437 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29037542 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 29037856 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29038776 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 29039021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29039977 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29040936 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29042282 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 19 29042380 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29042669 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29044840 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29044932 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29045179 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 29048839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29050134 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29052448 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29052558 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 29052670 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 29052731 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29053387 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29053561 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29054550 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29054778 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 29055637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29055916 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29056482 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29057542 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29058057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29059351 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29059568 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29060140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29061606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29062006 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29062084 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 29062117 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 29062484 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 29062550 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 29062820 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29063839 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29063989 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29064327 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 29064366 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 29064566 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29067956 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29067976 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29068618 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 29068927 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29069265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29069344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29069878 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29073724 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 29074038 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29074133 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29092485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29093829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29097257 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 29097524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29097914 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29098982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29099784 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29101087 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 29103221 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29105123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29109962 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29110145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29111605 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29112402 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29113143 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29113228 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29113347 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29113853 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 29114149 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 19 29114215 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 29114407 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 29114475 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29114542 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 29114736 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29114794 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 29114814 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29115422 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29115436 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 29115445 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 29115555 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 29115615 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 29115966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29116182 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 29116188 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 29116193 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 29116197 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29116518 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 29116785 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29116791 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 29116881 A T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 29117282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29117317 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29117362 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29117370 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29117380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29117445 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29117609 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 29118338 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 29119012 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 29119112 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 29119290 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 29119296 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 29119474 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 29119498 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 29119556 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29119679 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29120019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29121241 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29123014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29123136 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 29123172 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 29123189 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 29123227 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 29123306 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 29123696 T G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 29123700 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 29123738 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 29124340 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 29124341 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 29124470 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29125036 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 29125077 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 29125174 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 29125181 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 29125219 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29125935 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 29126082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29126167 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 29126233 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 29126240 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 29126779 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29126927 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29127649 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 29128173 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 19 29128180 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29128229 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 29128923 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 29128948 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 29129318 G A N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.181818181818182 18 4 9 0 2 19 29129572 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.166666666666667 0.25 16 8 7 2 3 19 29130825 T C N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 10 10 4 2 4 19 29130905 C A Y N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 14 6 6 2 2 19 29131007 G A N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 19 29131010 C T Y Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 19 29131539 G A N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 19 29131570 G T N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 19 29131633 T C N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 10 10 4 2 4 19 29131863 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 19 29131869 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 19 29132068 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 29132228 A G N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.363636363636364 0.181818181818182 0.454545454545455 10 12 4 2 5 19 29132486 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 29132540 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 29132937 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 29132963 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 29133024 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 29133043 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 29133164 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 19 29133227 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 19 29133242 A G Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 29133291 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 29133460 C T Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 29133522 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 29133680 G T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 29134484 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 29134595 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 29134717 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 29134924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29134947 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 29135273 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 29135324 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 29135352 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 19 29135373 C G N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 19 29135394 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 29135528 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 29135599 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 29136176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29136593 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 29136697 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 29136953 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 29137028 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 29137093 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 29137260 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 29137410 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 29137799 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29137808 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 29137892 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 29138063 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 29138269 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29138274 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 29138424 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 29138471 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 29138472 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 29138493 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 29138509 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 29138527 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 29138582 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 29138704 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 29138963 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 29139064 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 29139136 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 29139178 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 29139793 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29139953 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29139954 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29139957 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29140061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29140166 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 29140268 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 29140292 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 29140385 G A Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 19 29140391 C G Y N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 19 29140392 T A Y N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 19 29140647 C A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 29140758 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 29141117 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 29141138 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 29141997 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 29142161 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 29142309 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 29142352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29142513 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 29143869 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 29144130 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29145072 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29145092 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29145571 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 29145614 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 29145621 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 29145639 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 29145663 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 29146162 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29146426 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29147241 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29147985 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 29148503 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 29148515 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 29148698 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 29149297 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29150530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29150598 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 29150731 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 29151278 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29151292 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29151350 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29151489 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 19 29151670 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 29151866 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29152817 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29153572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29154994 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29155883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29164226 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29164249 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29165350 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29167304 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29168274 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 19 29173150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29173659 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29174310 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 29174343 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 29174409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29174594 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 29176304 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 29176385 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 29176703 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29176711 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 29176795 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 29177214 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 29177215 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 29177397 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 29177707 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 19 29177869 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 29177872 C G N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 19 29177909 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 19 29178104 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 29178610 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 29178888 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 29178946 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29179154 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 29179247 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 29179358 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 29179360 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 29179976 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29179983 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29180013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29180042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29180043 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 29180108 C T Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 19 29180119 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 29180153 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 29180158 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 29180576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29180928 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 29182665 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29183377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29183974 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29184077 A C Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 29184548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29184849 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29185043 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 29185053 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 29185152 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 29185256 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 29185285 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 29185309 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 29185325 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 29185336 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 29185349 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 29185474 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 29185477 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 29185585 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 29185734 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 19 29185903 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 29185983 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 29186363 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 29186551 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 19 29186856 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 19 29186873 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 19 29187323 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29187768 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 29187881 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 19 29187910 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 19 29187928 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 19 29188176 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29188183 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 29188191 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 29188209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29188267 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 29188288 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 29189013 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 29189093 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 29189099 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 29189146 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 29189157 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 29189221 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 29189342 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 29189557 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 29189558 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 29189845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29191473 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 29191594 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29192898 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29193466 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 29193760 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29194417 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29196306 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29196404 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29196676 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 19 29196708 T A Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 19 29196859 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29197061 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29197294 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 29197408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29197772 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 29197777 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 29197902 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29198384 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 29198456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29198519 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 29198631 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 29198679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29198686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29198700 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 29198769 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 29198770 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 29198793 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 29198830 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 29199081 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 29199107 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 29199149 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 29199849 A T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 29199893 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29199945 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 29199946 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 29199947 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 29199956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29199994 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29199998 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29200030 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29200066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29200225 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 29200278 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 29200386 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 29200510 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 29200537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29200626 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 29200840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29200950 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 29201020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29201468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29201471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29201485 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29201660 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29201674 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29201710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29201760 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 29201868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29201890 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29201908 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29201961 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 29202043 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 29202081 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 29202103 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 29202268 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 19 29202353 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 19 29202385 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 29202462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29202609 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 29202663 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 29202670 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 29202833 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29203114 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 29203548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29203585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29203861 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29204039 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 29204087 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29204173 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 29204508 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 29204552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29204798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29204804 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 29204960 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 29205123 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29205554 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29206053 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 29206082 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 29206205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29206250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29206619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29208040 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 29208058 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 29208628 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29208710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29208985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29209195 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 29209234 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 29209245 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29209257 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 29209300 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 29209412 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 29209460 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29209568 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 29209707 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29209856 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29210111 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29210217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29210342 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 29210470 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29210530 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29210597 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29210599 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29210627 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 29210637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29210651 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 29210816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29210819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29210857 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 29210922 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 29210925 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 29211000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29211242 G T N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 19 29211382 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29211401 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 29211469 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29211471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29211586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29211606 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29211842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29211852 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29211901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29211916 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 29212032 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29212077 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29212273 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29212395 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 29212427 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29212579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29212601 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 29212613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29213941 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29214205 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 29214206 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29214211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29214216 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 29214279 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29214547 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29214647 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29214899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29214978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29215630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29216652 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29217027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29219656 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29219676 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 29219701 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29219873 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29219879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29219905 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 29220213 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29220377 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29220583 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 29220775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29220910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29221026 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29221229 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29221295 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29221607 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29221698 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29221826 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29222932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29223373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29225433 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29225463 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29225471 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29225664 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29226288 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29226563 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 29227093 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 29227144 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29227219 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 29227228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29227384 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29227486 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29227505 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29227549 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29227600 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29227757 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29227811 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29227893 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29227910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29228031 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29228144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29228156 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29228197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29228205 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29228452 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29228509 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29228555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29228569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29228607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29228624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29229260 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29229635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29231654 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 29231775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29232130 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29232240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29232561 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29232562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29233466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29234082 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 29234101 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29235849 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 29236496 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29237826 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29237888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29237996 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29238114 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29238162 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29238178 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29238182 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29238253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29238725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29238922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29239979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29240608 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29240638 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29240681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29240812 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29240816 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29240937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29241529 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29241601 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29241605 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29241968 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29242401 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29242738 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29242798 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 29243477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29243724 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29243777 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29243811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29243812 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29243817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29243850 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29243905 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29243967 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 29244293 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 29244397 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 29244476 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29244481 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29244816 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29244839 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29244948 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29244995 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 29245000 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 29245060 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 29245084 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 29245102 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 29245107 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 29245242 G C N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 29245244 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 29245320 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 29245944 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29246079 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29246177 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 29246223 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29246453 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 29246629 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 29246658 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 19 29246677 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 29246940 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 29247285 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 29247371 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 29247389 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 29247393 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 29247423 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 29247489 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29247494 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 29247523 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29247538 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 29247570 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 29247830 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29247844 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29248304 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29248436 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29248472 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29248635 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29248638 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29248683 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29248686 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29248848 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29248871 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29248898 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29249008 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 29249128 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 29249179 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 29249202 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 29249302 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 29249343 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 29249577 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29249579 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 29249787 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29249825 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29249829 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29249890 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 29249948 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29250096 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29250125 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29250236 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29250296 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29250339 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29250386 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29250390 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29250442 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29250458 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29250466 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29250504 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29250668 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 29250682 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29250779 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 29250780 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 29250785 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 29250817 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29250826 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29250856 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29250896 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29251021 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29251029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29251198 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 29251414 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 29251492 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29251530 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29251534 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29251877 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29251887 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29251931 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29251934 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29251954 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29252065 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29252068 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29252083 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29252127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29252128 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29252206 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29252215 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29252475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29252559 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29252941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29253323 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29253483 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29253594 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 29253878 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29254425 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29254549 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 29254554 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29255424 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29256046 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29256175 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29256283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29256603 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29256842 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29256886 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29256912 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29256932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29256993 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29257547 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29257549 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29257552 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29257557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29257612 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29257724 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 29257748 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 29257764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29257879 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 29258010 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29258080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29258230 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29258294 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29258497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29258551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29258654 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29259154 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29259568 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29259628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29260256 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 29260957 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29261208 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 29261562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29261569 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 29261611 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 29261728 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29261743 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 29261777 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 29261842 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29263133 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 29263619 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 29263932 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 29264202 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29264309 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29264383 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29264560 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29264573 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29264579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29264902 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29265436 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 29265439 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 29265996 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29266122 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29266327 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29268208 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29270310 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29270648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29270704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29270889 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29271052 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29271396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29271417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29272010 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 29272021 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 29274955 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29278810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29280680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29283103 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29283195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29283662 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 29286924 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29287516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29288265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29288581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29293076 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 29295810 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29295819 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29299801 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29301725 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29304586 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 29304870 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29305273 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 29305656 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29305657 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29305676 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29305772 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29306227 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 29306344 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 29306476 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29308524 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29309987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29311197 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29311448 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29312321 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29312843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29313480 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29314834 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29315318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29315398 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29315572 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29315584 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29315985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29316019 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29316500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29316602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29316628 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29316652 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 29316653 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 29316659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29316959 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29317496 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29317621 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29317722 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29318086 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29318189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29318326 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29318704 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29318713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29318716 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29319075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29319364 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29319377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29319427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29319511 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29319515 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29319621 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29319733 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29319790 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29320122 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29320212 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29320222 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29320223 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29320289 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 29320296 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 29320298 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29320311 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29320549 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 29320599 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29320618 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29320628 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29320654 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29320781 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29320782 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29320797 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29320834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29320853 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29320873 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29320876 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29320902 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29321138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29321162 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29322753 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29322763 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29322900 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29323151 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29325083 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29325296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29325482 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29326761 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 29327982 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29328975 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29330261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29336991 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29339716 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29340214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29340870 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29341028 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29341795 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29342065 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29342071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29342393 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29342807 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 29343251 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 29343862 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29343888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29344030 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29344038 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29344127 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 29344166 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 29344167 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 29344356 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 29344477 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 29344642 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 29344870 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29344878 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29344966 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29345300 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 29345463 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 29345465 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 29345540 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 29345578 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 29346429 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29349331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29349337 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29349702 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29350042 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29350498 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29352924 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29353889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29357983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29359499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29359824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29359899 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29360105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29364040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29364130 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29364443 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29364538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29364743 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29365738 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29365946 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29366040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29368266 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29369411 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29370564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29371149 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29372976 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29374456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29374800 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29377101 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29377251 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29378687 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29381546 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29382039 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29382119 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29382568 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 29382826 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29383322 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29383337 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29383529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29383971 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29384250 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29384272 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29384273 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29384300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29384303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29384308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29384466 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29385376 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29385629 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29385845 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 29385849 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 29385862 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 29388503 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 29392934 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29395811 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29398494 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29398496 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29398543 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29398885 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29399745 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 29401612 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29402719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29403034 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 29404855 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29406351 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29406543 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29407650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29407785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29408423 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29408512 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29410481 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29414605 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29414632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29414974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29415582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29415640 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29416155 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 29418574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29418786 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29420350 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29420422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29420461 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29420470 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 29420655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29420661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29420668 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29421652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29421659 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29421664 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29421789 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29422200 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29422278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29422289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29422369 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29422463 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29423349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29423461 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29423664 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29424002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29424137 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29426916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29429397 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29430985 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29431179 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29432172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29432199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29432243 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 29432244 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29432273 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29432442 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29432454 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29433554 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29433580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29433882 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29433886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29434442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29434966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29434999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29435001 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29435033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29437656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29437923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29437992 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29438071 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29441911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29443213 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29444422 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29444964 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 29445517 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29445710 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29445954 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29446002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29448079 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29448340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29449000 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 29449707 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29449839 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29449844 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29450116 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 29450559 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29451104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29451183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29451184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29451293 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29451644 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29451954 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29452278 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29452373 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29453314 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29453352 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29453399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29453487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29453656 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29454195 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29454211 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29454235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29454393 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29454398 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29454401 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29454443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29454583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29454798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29454911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29455420 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29456638 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29458861 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 29458885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29460300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29460787 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 29461452 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29463325 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29464912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29466228 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 29466409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29466452 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29466609 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29466811 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29466879 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 29466989 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 29467121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29467672 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29468196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29468314 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29468541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29468577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29469705 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29469742 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29469878 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 29469943 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 29469978 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 29469979 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 29470003 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 29470059 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 29470212 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29470213 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 29470249 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29470253 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29470315 T A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 19 29470335 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 29470379 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 29470399 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 29470665 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 29470676 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 29470716 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29470782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29470884 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29471028 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 29471127 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 29471192 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29471204 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 29471511 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29471555 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 29471605 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 29471713 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 29471724 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 29471764 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 29471787 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 29472820 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 29474059 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 19 29475698 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 29475724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29475854 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 29477091 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 29477118 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 29477211 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29477239 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 29477454 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29477456 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29477519 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29477641 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29477800 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29478061 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29478082 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29478137 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29478223 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 29478523 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29478532 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29478539 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29478721 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29478754 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29478917 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 29479104 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29479254 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29479802 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29479814 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29482149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29482502 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29483112 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29483311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29484169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29484877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29490656 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 29491330 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 29491362 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 29491418 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 29491844 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 29491847 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 29492090 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29493178 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 29493382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29493973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29493985 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 29494077 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29494187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29494227 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29494482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29494509 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 29494725 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29494760 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 29494834 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29494857 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 29494877 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 29495145 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 29495530 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 29495533 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 29495668 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 29495670 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 29495690 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 29495828 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 29495859 A G N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 19 29495865 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 29496106 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29496145 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 29496657 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29498603 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29499696 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 29499697 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 29499724 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 29499762 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 29499989 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29500032 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 29500082 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29500103 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29500636 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 29501424 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29501529 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29502052 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29502161 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 29502174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29502241 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29502407 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 29502463 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 29503011 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29503130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29503166 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29503600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29503677 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29504411 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29504458 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29504591 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 29504674 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 29504924 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 29505588 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29505766 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 29505900 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29506056 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 29506180 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 29506236 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 29506458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29506464 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 29506753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29507058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29509131 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 29510610 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29512149 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29514025 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29515389 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29516106 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29517157 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29517917 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29518006 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29518007 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29518073 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29518158 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29518216 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 29518276 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29518953 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 29519011 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29519066 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29519350 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29519398 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29519530 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29519610 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29519641 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29519653 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29519676 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29519741 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 29519754 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 29519756 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 29519758 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 29519786 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 29519831 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29519836 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 29519845 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29519888 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29520023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29520031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29520071 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29520101 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29520117 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29520337 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29520452 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29521188 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29521280 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29521426 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29521489 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29522768 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29522868 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 29522879 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 29523129 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29523391 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 29523455 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 29523485 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 29523533 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 29523867 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29524129 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29524269 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29524277 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29524403 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 29524415 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29524498 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29524825 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29524866 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29524873 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29525125 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 29525180 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29525214 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29525230 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29525248 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29525307 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29525424 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29525440 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29525515 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29526023 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 29526084 T C N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 19 29526379 A T N N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 19 29526464 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 19 29526551 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 19 29528058 T G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 29528263 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 29529113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29529626 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29529763 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29529913 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 29529936 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 29529937 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 29529960 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 29529981 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 29529982 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 29530005 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 29531216 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29531350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29531592 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29531940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29532439 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29533492 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 29534288 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29536020 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29537324 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29537517 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29538329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29539565 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29539652 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29539858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29540660 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 29544349 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29546351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29546507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29548822 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 29549776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29549843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29549995 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 19 29550425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29550437 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29550466 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 29550486 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 29550586 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29550593 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 29550604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29550806 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29551048 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29551058 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29551154 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29551222 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 29551240 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29551257 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29551297 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29551317 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29551351 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 29551432 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 29551436 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 29551448 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 29551474 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 29551571 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 29551669 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29551764 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 29551843 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 29551868 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 29552084 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 29552951 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 29553118 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29553119 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29553570 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29553611 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 19 29553679 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29553860 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 29553896 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29553954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29554194 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29554248 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29554455 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29554488 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 19 29554681 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 29554686 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 29554694 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 19 29554704 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 19 29554722 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 29554800 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29554815 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 19 29554868 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 19 29554882 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 19 29554906 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 19 29555068 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 19 29555069 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 19 29555289 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 29555309 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 29555622 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29555681 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29555733 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29556013 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 29556448 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 29556468 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29556546 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 29556684 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29556753 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 29556933 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 29556949 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 29556963 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29557032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29557418 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 29557480 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29557521 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 29557600 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29557670 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29558259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29558295 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 29558298 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 29558411 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29560807 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 19 29561138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29562404 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 29563021 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29563252 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 29563376 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29563577 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 29563753 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 29563852 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 19 29563883 A T N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 19 29563944 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 29564040 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29564063 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29564181 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29564203 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 19 29564356 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 29564572 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 29564769 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 19 29564807 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29564841 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29564888 C G Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 29564914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29564930 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 29565071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29565108 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29565744 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 29565824 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 29565839 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 29565901 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29566033 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 19 29566056 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 19 29566117 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29566124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29566210 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29566237 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29566250 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29566262 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29566270 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29566450 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 29566528 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 29566529 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 29566578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29566596 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29566610 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 29566618 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 29566675 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29566704 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29566828 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 29566835 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29566899 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29566910 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29566938 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29567039 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29567074 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 29567088 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 29567256 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29567816 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29568237 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29568755 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29569760 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 29570127 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 29571303 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 29571371 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29573498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29573971 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29574220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29574915 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 29575371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29575610 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29576776 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29580709 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 29582639 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29583387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29583817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29583862 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29585201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29587314 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29590068 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29590861 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29591337 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29591352 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29591474 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29591479 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29591957 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29593647 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29594637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29595116 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 29595575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29597806 T C N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 19 29598628 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29599249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29602072 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 29602515 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29603461 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29604754 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 29604812 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 29606385 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29606603 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 29606924 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29607790 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 29607867 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 29608075 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29608121 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 29609287 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 29609329 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 29609943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29610041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29610149 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29610176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29610224 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29610505 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 29610515 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 29611027 C A Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 29611167 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 29611685 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 29611706 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 29611754 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 29612993 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 29614298 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29615837 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 29616074 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 29616141 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29617252 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29619460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29619625 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 19 29619783 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29620411 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29621140 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 29621221 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29622164 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 29622813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29624249 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 29624748 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 29625663 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 19 29626782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29626940 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29627333 A C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 19 29627463 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 29628774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29632384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29634262 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 19 29637461 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29638308 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 29641411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29642680 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29647663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29647685 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29648302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29650981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29651810 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29652283 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29653429 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29654374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29654603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29656226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29657817 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 29659163 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 29660459 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29660982 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 29661004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29661943 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29662396 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29663572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29664423 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29664426 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29664670 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29666003 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 29666051 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 29666057 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 29668039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29668161 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29669405 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 29669919 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 29670653 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 29670768 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 29670778 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 29670779 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 29670807 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 29670868 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 29670903 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 29670956 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 29671019 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 29671168 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 29671186 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29671196 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 29671858 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 29672046 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29672272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29672403 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29672670 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29674081 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29676238 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29677040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29677852 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29679101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29680299 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 29680577 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 29681238 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29681790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29682303 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29682581 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29683958 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29687820 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29687827 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 29688083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29688092 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 29688318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29688497 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29688602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29688835 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29689147 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 29689243 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 29689526 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29690151 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29690433 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 29690469 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 29690547 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 29690585 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29690650 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 29690663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29690888 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29691280 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 29691489 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 29691514 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29691745 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 29692134 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29692570 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29692601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29692747 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29692755 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 29692831 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29692920 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 29693124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29693281 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29693282 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29693300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29693379 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29693564 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 29693565 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 29693569 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 29693632 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 29693673 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 29693678 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 29693722 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 29693999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29694001 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29694032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29694040 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29694217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29694439 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 29694475 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29694487 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 29694488 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29694505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29694521 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29694738 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29694838 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29694886 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 29695104 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 29695137 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 29695180 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29695287 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 29695379 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 29695483 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 29695520 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 29695629 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 29695746 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 29695853 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 29695957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29696001 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 29696111 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 29696217 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 29696410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29696472 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29696475 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29696576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29696621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29696622 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29696639 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 29696828 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 29696858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29697153 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 29697957 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29698780 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29699737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29701323 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 29701330 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 29701415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29703462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29704585 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 29704665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29705492 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29705567 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29705580 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29705592 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29705610 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29706470 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29708166 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 29711449 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 29711608 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 29712197 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29715195 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29715207 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 29715703 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29715862 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29717646 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 29718207 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29718280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29718376 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29718414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29718493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29718541 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29718562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29718835 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 29719030 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29719143 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29719172 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 29719206 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 29719498 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29719605 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 29719619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29719629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29719687 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29719912 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29719943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29720296 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29720863 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29721089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29721094 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29721176 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 29721259 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 29721348 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 29721945 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 29724503 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 29725413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29726179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29726632 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29730197 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29730242 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29730266 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 29730267 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29730374 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 29730433 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29730571 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29730938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29731023 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29731186 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29731538 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29731778 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29731931 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29731961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29732155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29732205 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29732222 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 29732368 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 29732446 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29732482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29732567 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29732601 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29732677 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 29732700 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 29732753 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29732851 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29732852 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29732873 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 29732900 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29732915 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29733131 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29733202 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29733230 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29733287 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29733312 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29733604 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 29733689 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29733744 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29733755 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29733786 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29734134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29734417 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29734531 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 29734760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29734761 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29735493 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 29735505 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29735828 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 29735882 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 29736049 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 29736406 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29736425 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 29736790 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29736851 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29736936 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29736981 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29737080 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 29739611 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29741638 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29742693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29746913 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29748347 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29748538 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29748934 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29748984 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 29749063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29749084 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 29749139 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29749657 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 29750393 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29751198 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29751234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29751553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29752551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29753060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29754953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29756728 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29756751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29756989 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29757562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29758110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29758371 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29758386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29758696 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 29759497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29759619 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 29769166 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29769335 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29770031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29770551 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29770564 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29771085 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 29771295 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29771769 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29772179 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29772754 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29772917 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 29773150 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29773293 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29773370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29774487 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29774597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29777013 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29778520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29778820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29780947 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 29781066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29782458 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 29782974 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29789582 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29791297 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29791967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29792329 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29793651 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29794056 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29794257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29794936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29795140 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 29795828 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29798977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29799244 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29800013 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29800076 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29800346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29801150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29801398 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29803959 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29805279 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29805351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29805805 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29806525 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 29808508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29811106 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 29812952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29818334 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29818341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29828621 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29830086 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29836216 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29841532 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29842206 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29848082 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29851555 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29855299 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29856317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29856769 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29857827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29860393 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 19 29860401 C T N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 19 29860405 G A Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 19 29861859 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 29862476 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29864829 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29864852 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29868495 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 29871521 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29873636 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 29877942 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 29878232 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 29879704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29879738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29881141 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29881889 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29883497 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29883500 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29883569 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29884144 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29886922 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 29887134 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29888802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29891089 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 29891227 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 29891241 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 29891262 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 29891968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29892033 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 29892064 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 29892116 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 29892158 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 29892248 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 29892303 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 19 29892344 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 29892864 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 29892898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29892944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29892957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29893159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29893213 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29893258 T A Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 29893261 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 29893286 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29893640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29893756 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 29893914 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 29893932 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 29894028 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 29894034 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 19 29894035 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 29894039 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 29894516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29894544 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 29894545 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 29894551 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 29894643 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29894684 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 29894707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29895240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29895701 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 29895942 C T N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 19 29896107 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 19 29896119 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 29896122 C A Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 19 29896143 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 29896148 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 29896167 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 29896670 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29897561 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 29898095 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29898098 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 29898126 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29898159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29898388 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 29898475 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29898500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29898598 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29898735 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29898800 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29898859 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29899745 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29899791 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 29899999 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 29901847 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29903138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29903899 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 29904892 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 29905001 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29905162 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29905392 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29905871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29905915 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 29905939 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 29906338 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 29906341 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 29908551 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 29910960 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29911080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29913416 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29915700 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 29915749 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29915772 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29915800 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29915819 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29916075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29916419 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 29916475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29916674 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 29916930 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 29916960 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29917142 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29917145 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29917158 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 29917185 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 29917286 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 29917460 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 29917719 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29917740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29917785 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 29917796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29917822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29918189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29918229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29918329 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29918648 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 29918700 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 29918798 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 29918840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29918870 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 29920011 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29920130 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29920188 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 29920305 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29920330 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29920441 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 29920999 G T N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 19 29921070 A T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 19 29921153 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 29921178 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 29921188 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 29921269 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29921462 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29921536 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29921539 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 29921664 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 29921777 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 29921852 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29922185 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29922190 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29922214 T A Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 29922279 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29922308 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29922380 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29922402 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29922586 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29923283 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 29923339 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29923364 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29923403 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 29923696 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 29923719 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 29923732 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 19 29923786 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 29923881 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 29923969 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 29923986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29924165 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 29924192 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 29924194 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 29924392 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 29924400 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 29924456 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29925222 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 29925523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29925525 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 29925837 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29925958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29926061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29926209 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 29926244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29926245 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 29926278 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 29926281 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 29926362 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 29926408 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 29926596 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 29927314 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 29927329 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 29927546 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 29927691 T G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 29927706 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 29927709 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 29927795 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 29928006 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 29928039 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 19 29928181 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 29928216 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 29928226 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 29928272 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 29928326 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 29928355 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 29928511 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 29928568 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 29928585 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 29928686 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 29930141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29930378 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29930666 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 29930806 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 29930884 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29930904 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29930938 C T N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 19 29930970 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 29930982 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 29930996 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 29931018 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 29931172 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 29931175 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 29931183 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 29931284 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 29931364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29931388 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29931576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29931612 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29931832 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29931926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29931946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29932040 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 29932232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29932245 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29932324 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29932349 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 29932358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29932368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29932390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29932444 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29932921 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29933211 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29933229 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29933715 T G N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 19 29933849 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 29935213 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 29935282 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29935361 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29935590 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 29935695 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 29935728 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 29935748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29935812 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 29936109 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 29936144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29936222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29936296 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29936305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29936341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29936353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29936391 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29936417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29936466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29936697 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 29936958 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29937132 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29937379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29937423 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29937485 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 29937536 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 29937749 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 29937776 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 29937832 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 29937900 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 29937923 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29938162 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 29938370 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 29938502 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 29938601 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 29938642 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 29938764 A C N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 19 29938804 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 29938964 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 29939213 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 29939258 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 29939326 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 29939359 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 29939562 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 29939568 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 29939654 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 29939724 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 29940203 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 19 29940215 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 19 29940251 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 15 15 6 3 6 19 29940278 G A N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.357142857142857 0.214285714285714 0.428571428571429 13 15 5 3 6 19 29940365 A G N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.357142857142857 0.214285714285714 0.428571428571429 13 15 5 3 6 19 29940366 G T N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.357142857142857 0.214285714285714 0.428571428571429 13 15 5 3 6 19 29940381 A G N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 15 15 6 3 6 19 29940402 G C N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 15 15 6 3 6 19 29940404 T C N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.428571428571429 0.142857142857143 0.428571428571429 14 14 6 2 6 19 29940429 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 19 29940459 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 29940480 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 19 29940488 C G N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 19 29940489 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 19 29940621 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 19 29940673 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 19 29940769 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 19 29940819 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29940935 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 29941342 T C N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 19 29941360 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 29941663 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 29941731 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 29941751 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 29941778 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 29941852 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 29941853 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 29941943 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 29941967 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 29942163 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 29943248 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 29943501 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 29943967 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29944258 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29944365 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 29944386 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29944394 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29944399 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29944403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29944406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29944436 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29944919 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29945168 C G Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 29945557 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 29945747 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 19 29945898 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 29945900 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 29946002 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29946038 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 29946154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29946223 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 29946261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29946417 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29946455 C A Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 29946481 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29946766 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29946817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29946909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29947245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29947423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29947525 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 29947532 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29947574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29948563 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 29949007 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29949112 A T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 29949143 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29949567 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 29950009 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 29950548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29951052 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 29951361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29951717 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 29951724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29951825 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 29952192 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 29952196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29952682 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 29952702 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 29952706 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 29952865 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29952896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29952964 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29953053 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29953168 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29953179 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29953194 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 29953200 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29953222 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29953223 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29953350 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29953372 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29953692 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 29953704 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29953723 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 29953882 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 29953958 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29954059 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 29954164 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29954229 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 29954236 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 29954250 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 29954263 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29954355 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29954455 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29954680 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29954767 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 29954854 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29954958 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 29954994 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 19 29955032 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 19 29955394 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 19 29955411 A C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 19 29955420 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 29955489 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 29955505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29955643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29955961 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 29956062 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29956081 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29956237 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 29956522 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 29956528 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 29957023 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 29957043 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 29957464 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29958415 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.375 0.1875 0.4375 15 17 6 3 7 19 29958833 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 29958836 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 29958850 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 29958868 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 29959164 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 29959171 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 29960137 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 29960336 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29960740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29960781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29960906 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 29960950 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 29961500 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 29961617 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 29961965 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29961975 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29961986 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29961996 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29962049 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29962378 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29962886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29962924 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29963030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29963770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29963869 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29963994 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29964613 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 29964635 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 29964895 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29965349 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 29965354 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 29965403 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29965404 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 29965490 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29965926 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29965969 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29966117 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 19 29966437 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29966841 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29966854 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29966885 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 29966902 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 29966936 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29966980 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29966991 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 29967140 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 29967192 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 29967200 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 29967242 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 29967243 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 29967244 T A N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 19 29967884 T G N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.5 0.125 0.375 18 14 8 2 6 19 29968273 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29968485 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 29968487 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 29968529 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 29968554 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29968795 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 29968840 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29968964 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 29969030 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29969140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29969176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29969239 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 29969251 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 29969271 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 29969294 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 29969351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29969370 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 29969463 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 29969536 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 29969563 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29969571 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 29969583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29969703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29970019 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 29970035 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 29970043 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 29970119 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 29970153 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 29970154 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 29970231 T A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 19 29970854 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29970954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29971131 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 29971484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29971926 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 29972402 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 29972466 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29972557 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29972955 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 29973189 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 29973246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29973472 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29973561 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 29973757 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 29973759 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 29973989 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 29974003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29974276 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 29974470 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 29974524 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 29974552 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 29974717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29974806 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29975910 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29976006 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29976218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29978268 C A N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 19 29978488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29978680 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 29978711 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 29979057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29979911 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 29980341 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 29980428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29980709 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 29981141 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 29981387 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 19 29981499 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29981500 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29981509 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29981518 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29981671 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29982020 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 29982024 G T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 29982244 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29982335 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29982364 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 29982389 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 29982422 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 29983065 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29983106 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 29983239 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 29983387 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 29983521 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29983843 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 29983944 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 29984050 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 29984071 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 29984099 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 29984222 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 29984251 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 29984364 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 29984536 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 29984648 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 29984649 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29984768 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 29984784 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 29984813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29984963 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 29985303 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 29985412 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 29985454 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 29985505 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29985695 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29985920 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 29985985 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 29986008 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 29986136 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 29986328 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29986501 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 29987874 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 29988218 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 29988738 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 29988785 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 29990228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29990231 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 29990648 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 29991358 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29992425 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 29992646 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 29992844 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 29992958 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 29992966 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 29993427 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 29993432 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 29993488 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 29993655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29993747 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 29994123 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 29994161 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29994219 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 29994336 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 29994700 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 29994713 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 29994719 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 29994822 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 29994950 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29995413 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 29995461 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 29995561 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29995577 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 29995888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29995892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29995912 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 29996484 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 29996529 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 29996816 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29996964 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 29997072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29997270 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29997737 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 29998432 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29998570 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 29999055 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 29999067 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 29999106 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 29999188 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 29999281 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 29999389 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 29999569 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 29999794 G C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 30000509 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30000749 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30000925 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30000929 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30000949 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30001076 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 30001140 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 30001142 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 30001716 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 30001782 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 30003985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30004255 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30004474 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30004553 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 30005848 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30006052 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30006816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30007088 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30008151 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30009040 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30010763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30011418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30011469 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30012154 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30012327 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 30014303 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30015211 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30015269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30015659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30015772 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 30015835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30016233 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30016248 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 30016355 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 30017295 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 30017456 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 30017514 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30017676 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30017804 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30017811 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30017814 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 30018540 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30018568 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 30021095 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30021288 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 30021304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30021310 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 30021669 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 19 30026013 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30029671 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30029759 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30029814 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 30030971 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30032050 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 30032707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30032731 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30032973 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 30033104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30033874 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30034471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30036109 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 30036300 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 30037189 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 30037404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30037542 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30038297 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30039730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30040762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30041501 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30042026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30048744 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 30048789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30048943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30049116 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 30049143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30049385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30049410 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 30049486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30049515 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30049716 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30050582 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30050584 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30050710 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30050934 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 30051339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30052565 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30052676 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30052901 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30053100 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 30053329 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 30053552 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 30053698 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 30053911 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 30053942 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 30054214 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 30054332 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30054485 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 30054582 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30054597 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30054666 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 30054841 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30054895 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 30054904 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 30055070 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 30055132 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 30055177 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 30055586 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30055667 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30055953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30056011 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30056046 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 30056107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30057051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30057160 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30057340 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 30057448 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30057488 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30057563 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 30057564 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 30057873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30057933 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30057934 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30057952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30057953 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30057959 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30058046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30058969 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30059164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30059432 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 30059451 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 30059499 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30059924 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30060169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30060359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30060714 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30060860 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30060861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30060999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30061054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30061189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30061218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30061258 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30061503 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30061541 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 30061594 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 30061908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30061937 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30061994 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 30061995 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 30062026 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30062031 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30062049 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 30062088 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 30062326 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 30062328 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 30062355 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30062356 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 30062521 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30062522 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30062534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30062659 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30062666 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30062673 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30062731 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 30062858 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 30062874 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30062882 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 30062908 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 30063403 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30063410 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30063451 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 30063551 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 30063689 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 30063932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30064003 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 30064017 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30064050 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 30064122 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 30064188 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 30064450 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 30064467 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 30064503 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 30064556 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30064617 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 30064729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30064781 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 30064793 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 30065005 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30065049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30065093 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 30065101 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 30071696 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 30071783 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 30071826 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 30072326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30072457 T G N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 19 30072473 C T N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 19 30072534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30072550 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30072561 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30072580 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30072620 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30072740 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30072785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30072952 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 30073137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30073719 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 30073842 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30074397 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 30074629 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 30075198 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 30075241 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 30075464 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 30076930 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 30077449 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 30077493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30077532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30079139 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30079152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30079481 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30080076 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30080730 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30080789 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30080806 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30080808 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30080892 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30081725 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30082129 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30083015 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 30083029 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 30083286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30083304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30083442 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30083516 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 30083522 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 30083539 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 30084447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30084510 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30084939 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30085078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30085086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30085188 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30085273 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30085274 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30085580 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 30085649 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 30085679 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 30085899 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 30086362 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30086436 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30086533 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30086630 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30086957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30086972 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30086993 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30087008 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30087243 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 30087291 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30087305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30087366 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30087369 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30087451 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30087475 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30087509 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 30087511 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 30087516 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 30087861 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 30087927 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30088044 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30088152 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30088276 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30088591 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30088598 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30088681 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30088785 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30088811 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 30089029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30089084 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30089118 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30089202 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30089212 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30089370 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30089379 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30089743 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30089779 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30089806 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30089844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30089857 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 30089858 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 30089902 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30091216 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 30091583 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 30092429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30092970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30094154 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30095295 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30095795 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30095899 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30096587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30096905 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30097085 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30102376 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30102574 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30104693 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30106442 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30106573 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30106834 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 30108737 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30108970 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30112132 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30114079 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30114985 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30115178 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 30116668 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30116983 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 30117257 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 30117759 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30118358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30118524 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30121704 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30123416 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30126417 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30128310 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 30129764 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30131331 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 30131976 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30132550 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30133873 G A Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 30135877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30136421 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30137624 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30137742 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30138971 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30139634 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30146672 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30146924 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30153445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30155117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30155654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30156020 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 30157509 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30158157 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30158555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30158794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30159333 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30160036 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30162228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30162964 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 30163032 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30163082 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30163571 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30166356 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30167018 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30168044 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 30168567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30170459 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30170595 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30170596 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30170988 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 30171002 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30171073 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30172596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30173434 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30174067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30174544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30175622 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30176465 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30177589 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30180876 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30181275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30182055 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30182085 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30182645 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 30182735 A G N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 19 30182739 G C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 30182901 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30183331 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30183345 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30183379 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30183738 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30183904 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30183907 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30184089 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30184437 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30184491 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30184613 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30185003 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30186875 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30187693 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30187708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30187835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30187892 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 30187984 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30187985 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30188050 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 30188064 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30188898 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30189071 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30189363 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 30190010 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30190159 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30190231 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30190438 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30190761 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30190774 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30190934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30190976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30191299 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 30191508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30191563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30191564 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 30192133 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30192187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30192417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30192695 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30192818 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 30194328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30195618 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30196549 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30199127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30199975 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 30200000 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30200620 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 30200720 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30202348 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30202630 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30202655 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30202671 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30202682 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30203140 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30203177 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 30203220 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30203389 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30203685 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30203720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30203730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30203890 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30203912 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30203985 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30204137 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30204140 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30204168 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 30204203 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 30204329 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 30204540 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30204637 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30204760 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30204929 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30205093 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30205100 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30205145 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30205463 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 30205475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30205701 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 30205768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30205885 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30206098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30206401 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30206481 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30206657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30206806 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30206855 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30207067 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30207069 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30207099 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30207191 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 30207505 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30207547 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30207685 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30208049 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 30208097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30208099 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30208120 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30208212 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30208417 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30208584 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30208906 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30209028 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30209061 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30209684 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30210193 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30210237 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30210812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30210839 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30210858 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30210883 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30211089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30211103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30211130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30211153 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 30211154 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 30211217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30211247 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30211256 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 30211295 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30211460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30211535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30211726 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30211727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30211760 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30211785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30212111 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 30212178 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 30212259 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30212899 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30212927 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30212936 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30213022 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30213025 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30213042 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 30213137 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 30213197 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30213290 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30213322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30213401 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30213417 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30213639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30213645 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30213654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30213662 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30213679 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30213907 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30214036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30214043 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30214121 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30214268 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30214461 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30214529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30214553 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30214584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30214765 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30215435 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30215583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30215688 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30215694 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 30215765 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30215875 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30215936 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30216429 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30216498 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30216586 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30216850 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30216852 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30216874 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30216922 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 30216935 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30216962 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30217068 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30217245 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30217252 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30217306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30217313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30217483 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30217498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30217601 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30217814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30217818 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30217838 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30217839 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30217995 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30218038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30218072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30218074 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30218096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30218126 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30218177 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30218251 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30218297 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30218309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30219044 C A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 30219119 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30219552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30219562 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30219624 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30220036 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 30220138 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30220884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30220976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30222660 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 30223353 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30226158 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30226852 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30227033 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 30227034 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 30227987 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30229077 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30229350 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 30229502 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 30229507 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30229524 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 30229552 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 30229587 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30229693 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 30229701 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 30229716 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 30229745 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 30229848 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 30229854 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 30230074 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30230085 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 30230104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30230105 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30230125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30230144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30230281 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30230297 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30230354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30230362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30230382 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 30230529 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 30230721 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30232051 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 30232209 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 30232269 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30232286 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30232354 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 30232969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30232994 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30232996 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30233157 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30233306 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 30233399 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30233598 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30234809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30234838 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 30235010 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30235100 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30235542 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 30235611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30235776 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30235995 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30236167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30236230 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30236490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30237142 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30237403 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30237602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30237619 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30237709 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 30237815 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30238424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30239292 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30240344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30242176 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30242213 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 30243130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30243459 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30245787 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30245874 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30247031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30249880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30252785 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 30253132 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30253236 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30253592 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30253617 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 30253700 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 30253834 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30253970 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 30253971 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 30254048 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30254051 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30254064 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 30254113 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30254223 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30254239 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30254326 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30254435 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30254452 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30254645 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30254759 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30254865 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30254934 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 30255329 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30255646 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30255704 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30255735 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30255871 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 30255886 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 30255892 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 30256104 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 30256252 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 30256301 G T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 30256362 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30256381 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 30256599 T C N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 19 30256997 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 30257018 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 30257121 C G Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 30257399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30257456 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 30257495 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 19 30257543 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30257550 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30257552 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30257600 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30257704 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30257886 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 30257892 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 30257897 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 30257899 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 30258215 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 30258220 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30258228 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 30258229 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30258618 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 30258673 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 30258790 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 30258797 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 30258833 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30258873 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30258895 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30258929 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 30258930 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 30258982 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 30259145 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 30259192 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 30259208 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 30259213 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 30259325 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 30259444 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 11 7 3 5 1 19 30259541 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 19 30259544 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 19 30259564 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 30259769 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30259782 G C Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 30259801 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30259877 C A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 30259937 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 30260019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30260041 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30260238 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30260485 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 30260502 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30261040 C G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 30261171 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 30262268 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 30262297 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 30262310 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 30262381 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30262570 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 30262818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30262831 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 30263014 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 30264145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30264629 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30265599 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30266373 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30266730 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30268715 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30272029 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 30272357 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30272474 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30272536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30273715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30273786 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30276939 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30276946 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30277056 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 30277201 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30277276 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 30278008 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30278044 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 30278092 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30278094 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30278202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30278316 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30278347 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30278375 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30278383 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30278753 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30278757 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30278766 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30279378 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30279687 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30279809 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30279912 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30279973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30280006 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30280012 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30280021 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30280059 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30280099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30280110 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30280116 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30280278 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30280542 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30280577 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30280718 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30280942 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30280950 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30280962 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30280971 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30280983 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30281312 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30281369 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30281468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30281485 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30282417 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30282485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30282883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30283325 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30285112 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 30286864 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 30287344 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 30287349 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 30289099 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30289451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30289564 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30289974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30290036 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30290057 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30290058 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30290075 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30290505 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30291286 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 19 30291459 C A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 19 30292728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30292734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30292902 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30293043 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30293051 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30296446 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 30296502 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 30298920 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30299440 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 30299503 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 30299693 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30299749 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30300912 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30300961 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30300989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30301025 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30301028 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30301189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30301239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30301343 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30302438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30302509 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 30303077 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 30303211 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 30303459 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30303476 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30303482 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 30303807 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 30303949 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30303968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30304286 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30305966 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30307460 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30307489 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30307570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30307610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30307729 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30307741 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30307750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30307822 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30307881 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30308017 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30308094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30308477 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 30308514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30309225 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30309227 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30312428 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 30312439 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30312450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30313024 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30313169 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 30313271 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 30313393 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30313544 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30313714 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30313878 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30313882 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30313967 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30313981 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30314024 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 30314043 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30314057 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30314066 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30314086 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30314176 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30314225 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30314591 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30314645 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30314652 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 30314672 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 30314700 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 30314750 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 30314757 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30314809 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 30314894 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 30314954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30314992 A T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 30315000 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 30315043 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30315086 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30315221 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 30316041 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30316066 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 30316234 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 30316357 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 19 30316423 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 19 30316546 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 30316950 C G N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 19 30317086 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 19 30317715 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 30317718 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 30317755 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 30317756 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 30317768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30317793 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 30317812 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30318538 G A Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 30318905 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30318918 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 30319069 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 30319131 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 30319145 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 30319278 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 30319280 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 30319328 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 30319345 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 30319355 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 30319425 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30319443 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 30319512 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 30319570 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 30319630 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30319720 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 30319721 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30319809 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30319826 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30319845 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 30319847 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 30319850 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 30319874 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 30320016 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 30320173 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30320181 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30320705 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30321295 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30321921 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30323749 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30324847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30326166 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 30329189 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30329888 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30330108 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30330274 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30330296 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 30330312 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 30331126 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30333547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30333890 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30334167 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30335051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30335125 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30337393 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30337920 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 30339410 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30339649 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 30340403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30341240 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30342152 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30342330 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 30342476 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30342576 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 30342719 T A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 19 30342970 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 30343075 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 30343205 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 30343211 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 30343230 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 30343299 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 30343328 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 30343355 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 30343371 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 30343449 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 30343688 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 30343690 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 30343692 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 30343732 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 30343797 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 30343911 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30343936 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30343948 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30344068 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 30344154 C A Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 30344155 A T Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 30344262 C A Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 30344310 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 30344334 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 19 30344338 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 19 30344611 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 30344628 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 30344634 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 30344647 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30344716 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 30344861 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 30344918 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30344945 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 30344995 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 30344996 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 30345046 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 30345145 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 30345189 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 30345289 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30345336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30345442 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 30345631 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30345865 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30345903 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30345959 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30346037 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 19 30346075 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 30346366 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30346399 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30346608 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 30346944 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 30346958 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 30347389 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30347535 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 30347556 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 30347577 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 30347596 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 30347635 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 30347820 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 30347825 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 30347889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30347899 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 30347951 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 30347980 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 30348190 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 19 30348284 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 10 8 4 2 3 19 30349188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30349322 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30349404 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 30349419 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 30349461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30349927 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 30349954 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 30349960 C A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 30350024 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 30350418 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 30350459 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 30350695 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 30350775 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 30350930 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 30351269 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30351563 T G N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 19 30351655 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 30351932 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30352253 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 30353177 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 30355242 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30355837 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30356989 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30358162 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 30358182 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30358970 G T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 30360260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30360310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30360418 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 30360936 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30361744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30362194 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30364226 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30364678 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30365116 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 30365127 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 30365132 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 30365672 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30366220 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30366224 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30366280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30366282 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30366293 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30366338 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30366740 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30367263 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30367461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30367491 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30368907 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30369070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30369227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30369229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30369315 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30369328 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 30369364 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 30369408 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30369523 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30369567 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30369709 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30369713 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30370188 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30372315 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 30372705 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30372738 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 30372739 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 30373000 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30373480 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30373502 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30373583 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30373662 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 30373692 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30373949 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30373980 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30374362 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30374371 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 30374397 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30374413 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30374471 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30374475 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30374493 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 30374510 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30375429 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 30375435 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 30375489 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 30375501 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30376120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30376284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30376597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30376609 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 30376722 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 30376727 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 30376835 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30376837 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 30376890 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30377001 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 30377051 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30377086 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30377236 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30377237 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30378432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30378622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30385186 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30386004 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 30386135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30386158 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30386282 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 30386305 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30386478 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 30386648 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30386873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30386953 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 30386976 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 30387123 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 30387241 C T Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 30387259 A G Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 30387391 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 30387464 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 30387637 C A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 19 30387689 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 30387815 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 30387820 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30388271 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30388337 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30388376 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30388381 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 30388395 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30388763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30388770 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 30388771 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 30388774 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 30389013 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 30389261 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 30389732 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 30390275 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30391342 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30392133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30393148 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 30393287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30394378 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30394668 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30396047 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 30396615 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30398206 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30402423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30403875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30406096 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30408337 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30409264 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30409390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30411194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30413300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30414626 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30415104 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30417839 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 30421413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30424332 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 30426016 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30428471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30430098 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30430114 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30430295 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30430549 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 30430661 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30430839 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30430840 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30431075 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30431193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30434188 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 30434412 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30434902 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30435147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30435696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30436686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30437057 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30437288 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 30437322 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 30437611 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 30437774 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30437887 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30438018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30438055 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 30438157 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30438546 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30438989 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30439103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30439119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30439178 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30439179 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 30439293 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30439294 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30439363 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30439396 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30439407 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30439423 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30439977 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 19 30440133 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30440205 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30440793 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30441613 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30442790 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30442988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30442994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30443005 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30443060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30443240 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30443489 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 30443515 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 30443874 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30443998 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30444106 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30444493 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30444495 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30444534 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 30444590 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 30444705 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 30444815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30444826 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30444836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30444905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30444907 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30445083 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30445096 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30445127 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30445188 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30445192 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30445197 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30445226 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30445355 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30445357 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30445359 A T Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 30445372 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30445449 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30445519 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30445588 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30445629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30445638 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30445657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30445672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30445765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30445842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30445912 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30445982 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30445984 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30446280 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30446315 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30446407 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30446420 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30446477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30446626 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30446631 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30446814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30446949 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30447088 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30447102 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30447118 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30447226 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30447229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30447245 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30447421 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30448884 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30448999 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 30449018 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 30449354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30449653 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30450606 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30450712 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30450988 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30451056 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30451076 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30451104 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30451111 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30451207 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30451444 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30452477 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 30452572 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30455227 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30455522 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30456840 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30460019 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30460718 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30462346 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30464517 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30464707 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30464994 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30465721 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30465739 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30465779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30465780 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30465904 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30466032 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30466183 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30466361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30466649 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30466935 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30467107 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 30467561 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30467566 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30467897 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30467911 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30467965 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30468033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30468149 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30468356 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30468560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30468742 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30468927 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30468957 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 30469383 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 30469395 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 30469620 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30469740 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30469882 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30469939 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30469957 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30469999 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 30470050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30470065 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30470158 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30470274 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30470697 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30470753 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30470832 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30471707 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30471893 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30473727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30474765 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30479067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30482579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30482711 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30483233 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30483295 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 30483368 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30483403 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 30483431 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 30483482 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30483525 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30483711 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 30483761 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30483841 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30483895 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30483924 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30483992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30484405 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30484410 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 30485090 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30485446 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30485669 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30485673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30485912 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 30485919 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 30485932 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 30485937 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 30486240 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30486310 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30486601 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30486687 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 30486721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30486746 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30486930 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 30486971 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 30487587 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30487622 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 30487699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30487844 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 30488119 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30488148 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30488167 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30488195 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30488298 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 30489084 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30490623 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30492008 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30493012 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30493207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30495971 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30495991 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 30495997 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 30496035 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30496066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30496148 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30496155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30496281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30496397 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30496529 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30496576 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30496586 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 30496804 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 30497236 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 30497590 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30498674 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30499780 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30501859 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30501861 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30502056 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 30503691 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 30503916 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30503978 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30504996 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30506004 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30508851 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30509077 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30509110 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30509111 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30509379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30509380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30509525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30509589 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30513764 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30515330 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30515978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30517130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30518935 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 30519096 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30519252 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30519273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30519315 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30519437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30519867 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 30519886 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 30520060 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30520133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30520231 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30520848 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30521261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30521963 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30522080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30522275 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30522868 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30522947 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30523641 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30523650 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30524063 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30524225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30524549 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30524634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30524653 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30524745 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30525225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30525353 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30525358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30525364 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30526588 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30527268 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30527356 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30527397 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30527458 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 30527521 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30529319 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 30530306 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30530590 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 30531323 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30531662 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30534504 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30534799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30534902 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30535126 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30537846 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30538516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30539268 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30539389 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30543259 T A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 30544941 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 30546578 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30546631 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30546981 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30547407 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30549130 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30550273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30550545 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30551979 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30554279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30554451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30554958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30556164 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30556476 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30556899 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30556943 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30556983 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30558922 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30559868 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30562904 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30569383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30569419 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30587371 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 30590007 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30593089 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 30593433 C G Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 30595626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30596242 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30596271 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 19 30596354 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30596900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30597677 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 30598271 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30598360 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30598380 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30598406 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30598488 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30598526 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30598531 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30598562 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30598603 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 30598630 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30598642 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30598719 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30598723 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 30598784 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30598968 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30599191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30599192 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30599306 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 30599454 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 30599466 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30599592 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 30599717 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 30599743 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30599921 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30599953 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 30600034 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30600165 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30600925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30600931 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30601224 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30601664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30601888 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30601893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30601959 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30601979 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 30602082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30602174 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30602197 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30602304 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 30602324 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 30602658 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 30602664 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 30602746 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 30603136 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30603200 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 30603202 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 30603282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30603291 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 30603323 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 30603477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30603540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30603599 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30603638 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 30603874 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 30603893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30603903 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30603978 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 30604282 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 30604294 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 30604494 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 30604569 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30604894 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 30605725 G T N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 19 30605957 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30606221 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 30606288 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 30606324 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30606411 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30606424 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30606982 A G N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 19 30607169 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 19 30607312 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 30608547 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30608906 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 30609552 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 19 30609947 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 30609983 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 30610211 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 30610741 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30610755 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30610813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30611164 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30611238 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30611431 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30614859 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 30614930 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 30615071 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 30615094 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 30615111 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 30615177 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 30615817 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30615870 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 19 30615887 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 30616272 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30616854 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 30616874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30617221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30617492 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30617631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30618017 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 19 30618779 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 30619556 G A Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 19 30620306 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 30621658 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30621659 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30622515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30622810 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30624138 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30624882 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30625009 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30626936 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30626956 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30630421 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30631273 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 30634635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30634713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30635344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30635742 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30638574 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30638708 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30639257 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 30641952 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30642283 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30643172 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 19 30645312 C A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 19 30645738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30646949 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30647316 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30648200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30649165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30649186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30649232 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30649473 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30649475 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30649481 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30649557 A C N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 19 30650056 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 30650067 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30650284 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30650633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30650883 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 30651372 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 30651604 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30651994 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 30652077 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 30652085 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 19 30652105 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 30652266 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30652306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30652360 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30652466 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 30652575 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 30652694 T G N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 19 30652736 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30652770 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 30652782 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 19 30653653 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30653658 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30653767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30653768 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 30654242 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30654395 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 30654407 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 19 30654480 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 30654513 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 30654532 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 30654543 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 30654553 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 30654561 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 30654610 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 30654690 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 30654922 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 30654937 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 19 30655000 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 19 30655013 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 30655068 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 19 30655148 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30655229 T G N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 19 30655243 A T N N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 19 30655275 C T N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 19 30655284 G A N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 19 30655420 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 30655500 G T N N 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 10 14 2 6 4 19 30655537 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 30655653 A G N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 19 30655664 T C N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.0833333333333333 0.583333333333333 0.333333333333333 9 15 1 7 4 19 30655834 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 30655905 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 30656049 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 19 30656081 G A Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 19 30656091 C T Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 19 30656260 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 30656516 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30656567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30656700 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30656717 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30656839 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30656845 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30656945 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 30656989 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30657043 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30657074 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30657095 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30657176 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30657192 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30657253 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30657254 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30657315 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30657345 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30657444 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30657733 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30657800 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 19 30657926 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30657965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30657982 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30658011 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30658023 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30658092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30658272 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30658300 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30658305 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30658440 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30658489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30658512 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30658515 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30658585 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30658755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30658778 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 30658790 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30659052 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30659096 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 30659613 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 30659754 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 19 30660286 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 19 30660368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30660419 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30660637 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30660747 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 30661158 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 30661258 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 30661323 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30661381 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30661382 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30661403 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 19 30661656 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 19 30661797 G T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 19 30661874 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30662019 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 30662044 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30662054 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 30662092 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30662129 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30662201 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 30662955 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 30663206 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30663389 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30663485 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30663501 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30663541 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 30663928 A G N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 19 30664041 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 30664085 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 30664151 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30664253 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 30664276 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 30664332 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 30664508 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 30665095 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30665390 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 30665460 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 30665950 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30666198 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 30666818 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 19 30666945 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 30667155 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 30667194 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 30667305 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 30667454 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 30667504 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 30667701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30667707 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30667757 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 19 30667788 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 30667837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30667844 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 30667861 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 19 30668086 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 30668127 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 30668256 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 30668273 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 30668618 C G N N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.1 0.8 0.1 10 10 1 8 1 19 30668906 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 30668965 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 30669413 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 30669655 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 30669679 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 30669712 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 30669736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30669771 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 30669864 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 30669873 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 30670208 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 30670587 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 30670589 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 30670602 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 30670799 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 30670898 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 30670992 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 30671090 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 30671117 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 30671142 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 30671190 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 30671375 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 30671386 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 30671433 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 30671467 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 30671545 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 30671551 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 30671566 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 30671736 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 30671810 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 30672336 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 30672352 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 30672353 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30672369 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 30672462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30672481 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 30672514 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 30672663 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 30672677 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 30672729 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 30672834 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 19 30672837 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 19 30672879 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 30673237 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 19 30673314 T C N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.0714285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 11 17 1 9 4 19 30673372 G T N N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 19 30673501 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 19 30673689 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 30673891 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30674148 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 30674294 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30674336 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 30674417 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 30674471 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 30674618 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 30674629 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 30674649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30674693 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 30674737 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30674843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30674900 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 30675005 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 30675142 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 30675166 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30675183 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 30675189 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 30675391 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 30675468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30675530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30675614 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30675758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30675808 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 30676039 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30676107 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 19 30676221 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30676269 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30676270 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30676290 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 19 30676437 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 30676451 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 19 30676455 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 19 30676478 G T Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 19 30676483 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 19 30676486 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30676498 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30676506 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30677777 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30677867 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 30677927 A C Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 19 30677997 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 19 30678010 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 19 30678094 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30678780 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30679077 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 30679081 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 30679351 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30679385 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30679576 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 30679608 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 30679629 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30686311 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30686373 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30686374 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30686397 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30686402 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30686430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30686433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30686448 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30686529 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30686694 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30686728 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30686776 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30686850 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 19 30687201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30687204 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 30687246 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 30687354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30687773 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 19 30687832 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 30687861 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 30687868 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 30687873 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30687956 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 30688001 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 19 30688124 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 30688233 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 30688319 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 30688498 G A Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 19 30688502 G A Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 30688504 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30688598 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 30688679 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 30688680 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 30689372 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 30689429 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 30689438 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 30689453 C T N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 19 30689568 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 30689660 T A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 30689667 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 30689675 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 30689814 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 30690006 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 30690214 G A Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 30690273 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 30690419 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30690771 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30690840 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 30690957 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 30691039 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 30691125 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 30691185 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 30691226 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 30691467 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 30691652 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 19 30691799 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 30691813 C T N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 19 30691840 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 19 30691854 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 19 30692201 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 30692523 T C N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 19 30692650 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 30693085 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 30693478 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 19 30693483 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 19 30693545 T G N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 19 30693662 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30693697 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 19 30693868 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 11 7 4 3 2 19 30693891 G C N N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 9 7 3 3 2 19 30693902 A T N N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 9 7 3 3 2 19 30694168 G T N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 19 30694454 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 19 30694471 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 30694472 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 30694507 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 30694629 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 30694731 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 30694774 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 30694858 A C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 30694890 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 30694934 T A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 19 30694951 G T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 30694986 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 30695016 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 30695019 C T N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 19 30695075 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 30695177 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 30695230 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30695369 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 30695554 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 19 30695597 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 30695614 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 30695730 T C N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 19 30695790 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 19 30695822 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 30695868 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 30696070 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 30696125 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 19 30696162 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 19 30696466 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 30696537 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 30696709 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 30697923 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30698410 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 30700855 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30701536 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30701726 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30702839 A T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 19 30705147 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 30705200 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 30705292 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30707240 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 19 30707409 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 30707448 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 30707527 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 30707991 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30708099 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 30708164 A T N N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.333333333333333 0.583333333333333 0.0833333333333333 15 9 4 7 1 19 30708184 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 30708224 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 19 30708293 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 30708381 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 19 30708394 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30708395 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30708432 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 19 30708631 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 19 30708712 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 30708750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30708811 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30708829 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 30708863 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30708940 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 30708944 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30708955 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30709001 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30709048 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30709055 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30709104 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 30709141 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30709171 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 30709252 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 19 30709426 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 30709443 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30709448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30709470 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 30709602 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 30709625 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 19 30709629 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 19 30709682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30709698 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 30709737 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 30709784 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30709862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30709892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30709901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30710026 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 30710032 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 30711808 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 30713381 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 30713556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30713950 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30715387 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30716246 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 30716643 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 19 30716649 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 19 30716879 C A Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 19 30717159 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30717254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30717288 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30717405 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 30718112 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 30718508 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 30718992 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30719227 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 30719235 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 30719281 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 30719874 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 19 30720222 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 30720255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30720301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30720529 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 30721220 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30721523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30722634 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 30724339 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 19 30724813 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 30725336 T A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 19 30725604 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 30725695 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 30725701 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 30726247 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 30726320 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 19 30726643 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 19 30726769 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 30727039 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 30727431 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 30727519 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 30727523 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 19 30727524 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 19 30727628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30727633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30727720 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30727755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30727880 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30727901 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 30728034 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 19 30728057 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 19 30728109 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30728128 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 30728134 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 19 30728184 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30728205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30728281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30728407 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 30728431 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 30728734 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 30728806 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 30729003 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 30729044 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 30737144 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30737261 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30737267 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30737459 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30737712 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30737813 G C Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 30737908 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30737958 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 19 30738031 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30738095 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30738280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30738319 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 30738457 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30738767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30739413 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 30739431 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30739583 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 19 30739681 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30739933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30740655 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30741485 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30742179 T A Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 30742600 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 19 30743566 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30743612 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30744420 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30749766 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30751698 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 30752536 T C N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.0769230769230769 0.615384615384615 0.307692307692308 10 16 1 8 4 19 30752870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30754442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30754529 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30755532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30755914 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30756704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30756816 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 30760017 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30762512 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 30762569 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 30764609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30764642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30764783 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 19 30764876 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30764886 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30764907 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30764913 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30765044 T G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 19 30765171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30765183 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30765190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30765239 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30765257 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30765593 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 30765810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30766247 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 30766330 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 30766738 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 30766957 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 30766958 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 30767482 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30767637 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 30767815 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 30767881 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 30768078 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30768319 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30768448 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30768550 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 30769316 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 30769412 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 19 30769630 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 19 30769657 G C N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 19 30770050 C A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 30770107 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 30770760 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 30770839 G T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 30770846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30771140 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30771218 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 30771234 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 30771320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30771461 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 30771659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30771713 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 30771931 T G N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 19 30772030 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 30772115 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0 0.722222222222222 0.277777777777778 13 23 0 13 5 19 30772285 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 30773523 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 30775993 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30779637 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 30780497 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 30782254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30783982 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30784384 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 30784399 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 30785266 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 30785577 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30786027 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 30786068 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 30786969 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30787447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30787481 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 30788118 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30788187 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.15 0.75 0.1 21 19 3 15 2 19 30788198 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30788223 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.111111111111111 0.777777777777778 0.111111111111111 18 18 2 14 2 19 30788307 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.166666666666667 0.722222222222222 0.111111111111111 19 17 3 13 2 19 30788335 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.176470588235294 0.764705882352941 0.0588235294117647 19 15 3 13 1 19 30788510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30788661 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 19 30788809 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 30788841 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 30789062 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30789585 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 30789802 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 30789848 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 30790044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30790106 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30790196 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30790239 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 30790264 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30790334 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30790375 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30790380 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30790394 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 30790428 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 30790440 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30790466 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30790481 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 30790577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30790621 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 30790634 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 30790642 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30790651 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 30790782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30790791 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30790795 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 30790943 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 18 22 2 14 4 19 30791404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30791520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30791534 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30791555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30791948 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30791973 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30792293 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30792348 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30792600 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30792633 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30792796 A T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 30792841 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30792933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30793651 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30793675 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30793737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30793875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30793945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30794015 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30794059 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 30794148 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30794296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30794312 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 30794467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30794513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30794748 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 30794804 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 30794885 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 30794924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30795019 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 30795119 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 30795791 C A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 19 30795876 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 30796287 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30796404 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 30796685 T C Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 30796893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30797275 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 30797632 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 30797769 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 30797810 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 30797821 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 30797830 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30798122 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 30798252 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 30798292 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 30798391 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 30798412 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 30798450 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 30798477 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 30798853 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30798939 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 30799392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30799452 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30799480 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30799481 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30800053 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 19 30800054 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 30800073 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 30800547 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30800663 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 30800685 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 30800711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30800751 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 30800893 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 30800909 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 30801132 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 30801189 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 30801192 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 30801387 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 30801474 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 30801669 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 30801730 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 30801930 T C N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 19 30802180 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 30802273 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 30802894 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 30803098 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30803255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30803677 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30804262 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30804817 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 30805074 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 30805294 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30805321 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30805400 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30805870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30805896 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30805950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30806159 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 19 30806589 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 30806803 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 30806824 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30806980 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 30807054 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 30807111 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30807115 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 30807178 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 30807327 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30807450 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 30807734 G C Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 30807759 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 30808657 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 30808742 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30808801 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 30810435 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30810650 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30811476 G C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 30811843 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30812206 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30812758 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30814012 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 30815046 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 30815105 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 30815119 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 30817832 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30819546 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30820091 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30820751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30821909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30825279 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30825405 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30825769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30827867 C T N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 19 30828287 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 30828887 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30829032 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 30829323 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30829388 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 30829407 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 30829442 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 30829534 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30829601 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30829611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30829639 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30829691 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30829861 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30829869 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 30829888 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 30830018 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 30830132 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30830240 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 30830479 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 30830510 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 30830618 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 30830647 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 30830858 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 30830903 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 30831410 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30838446 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 30838522 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 30842637 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 30842685 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30842821 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30843159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30844697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30844827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30845656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30848447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30849952 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30854308 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 30855345 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 30855406 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30855647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30855705 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 30856146 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 30856916 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30857045 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 30857072 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30857230 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 30857312 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30858038 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 30858123 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 30858391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30858654 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30859011 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30859061 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 30859194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30859213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30859866 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 30859902 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 30860109 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 30860283 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 30860342 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 30860405 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 30860429 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30861552 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30862090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30862961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30863061 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30863528 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30864409 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30864536 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30865276 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 30865309 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30865328 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 30865505 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 30865567 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 30865748 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 30865817 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30866189 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30866428 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30867239 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30867378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30869521 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30869597 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30870606 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30872774 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30874403 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30875827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30876116 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30876427 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30877412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30877438 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30877502 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30877594 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30877609 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 30877796 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 30877936 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 30877977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30878087 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 30878142 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30878180 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 30878442 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30878524 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 30878604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30878610 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 30878612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30878802 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 30878905 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 30878909 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 30879043 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30879099 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 30879156 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 30879573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30879688 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 30879769 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 30879894 G T Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 30879954 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30880009 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30880039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30880162 A T Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 30880237 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30880246 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 30880286 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30880292 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 30880347 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30880416 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 30880684 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30880730 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 30880763 C G Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 30880820 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 30880879 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 30880982 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30881005 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 30881024 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30881027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30881144 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 30881699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30881840 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 30882051 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30882158 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 30882553 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 30882578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30882598 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 30882599 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30882739 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30882828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30882946 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 30882990 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 30883201 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 30884828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30885677 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30885867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30885926 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 30886124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30886409 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 30887372 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30887437 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 30887576 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30887663 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30887780 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 19 30888132 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30888352 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 30888439 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 30888483 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 30889028 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 30889080 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 30889173 A C N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 19 30889272 G T N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 19 30889300 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 19 30889323 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 19 30889577 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 30889604 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 30889779 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 30889830 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 30889850 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30889867 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 30889906 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 30889961 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 30890054 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 30890143 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30890371 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 30890400 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 30890453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30890569 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 30890583 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 30890967 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 30891175 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 30891209 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 30891222 T G Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 30891311 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 30891314 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 30891324 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 30891388 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 30891814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30891999 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 30892146 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 30892208 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30892237 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 30892306 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 30892359 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 30892373 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 30892402 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 30892449 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 30894171 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 30894184 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30894388 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30894975 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30895022 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 30895151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30895156 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 30895680 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30895689 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30895883 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 30895979 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30896413 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 30896721 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 30896765 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 19 30896883 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 30896988 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 30897039 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 30897052 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 30897095 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 30897185 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 30897546 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 30897642 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 30898004 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 30898018 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 30898034 A T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 30898078 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 30898224 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 30898227 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 30898286 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 30898315 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 30898328 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 30898342 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30898408 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30898435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30898456 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30898458 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30898482 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30898639 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 30898728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30899076 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 30899402 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 30899961 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 30900000 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 30900216 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30902485 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 30902735 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30902964 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30906914 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 30907050 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 30907184 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 30907518 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30907539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30907571 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30907615 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 30907722 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30908134 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30908245 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 30908475 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30908531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30908685 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30909563 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30909682 A T N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 19 30909713 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 30909842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30909977 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30909978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30909979 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 30910012 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 30910118 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 30910168 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30910203 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30910345 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 30910401 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 30910886 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 30910976 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30911004 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30911216 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30911719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30913006 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30913411 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 30913424 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 30913755 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30914187 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30914638 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 30915164 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30915420 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 30916266 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30916881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30918799 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30919529 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30919704 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30919901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30920249 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30925165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30925166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30925673 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 30926472 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30926486 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30926654 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 30926825 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30927108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30928405 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 30928622 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 30928693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30928739 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30928747 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30928769 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 30928776 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 30928803 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 30928885 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30928971 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30928973 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 30929017 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 30929206 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 30929258 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 30929656 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30930350 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30930653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30930871 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 30931144 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 30931651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30932167 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 30932455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30933834 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 30933857 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 30933951 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30934615 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 30934796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30935569 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 30935603 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 30935900 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 30936010 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 30936162 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30936212 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 30936903 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 30937477 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 30938018 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 30938182 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30938265 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 30938723 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 30938771 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30938788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30938968 C A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 30939374 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 30939616 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 30939661 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 30939820 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 30939824 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 30939831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30939925 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 30939952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30940000 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 30940042 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 30940123 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 30940130 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 30940175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30940313 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 30940765 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 30941260 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 30942658 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30942871 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30942946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30942978 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30943414 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 30943856 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30944413 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 30945301 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30945372 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30945741 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 30946119 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 19 30948276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30948692 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 30948731 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 30948944 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 30948962 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 30948966 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 30949091 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 30949141 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 30949333 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 30949428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30949608 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 30949623 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 30949965 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 30950008 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 30950027 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30950051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30950438 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 30950509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30950596 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30950925 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30950998 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 30951074 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30951178 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30951266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30951401 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 30951711 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30951712 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30951852 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 30951872 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 30952010 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30952445 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 19 30952554 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 30952580 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 30952712 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 30952797 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30953169 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30953263 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30953283 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 30953326 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 30953327 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 30953423 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 30953511 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 30953636 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30954033 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30954053 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30954146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30954336 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30954775 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30955309 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30955389 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30955871 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 30955937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30955984 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30956221 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 30956241 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 30956279 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30956454 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30956520 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30956559 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 30956747 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 30956770 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 30956802 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 30956812 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 30957106 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 30957184 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30957682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30958969 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30959601 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30959719 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 30960324 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30960337 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30960414 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30960525 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30960532 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30961122 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 19 30961294 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 30961628 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 30961724 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30961834 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30962234 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30962235 G T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30962429 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 30962517 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 30962559 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 30962711 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 30962774 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 30962977 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 30963168 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30963280 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30963330 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30964098 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30964107 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30964164 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 30964493 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 30964509 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30964575 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30964765 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30965030 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 30965076 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30965437 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 30965521 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30965733 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 30965791 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30965818 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30965833 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30965991 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30966173 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30966218 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30966222 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 30966228 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30966246 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30966271 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 30966314 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30966437 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30966541 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30966606 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 30966823 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30966827 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30966898 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30966933 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 30966945 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 30966958 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 30967090 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30967180 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30967244 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30967257 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30967428 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30967451 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30967482 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30967592 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30967601 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 30967612 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 30967646 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 30967648 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 30967764 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30967891 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 30969606 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 30970118 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30971309 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30971649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30972810 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30973146 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30973267 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 30973473 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30973554 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30973747 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30973756 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30973878 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30973903 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 30973948 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30974214 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30974347 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 30974630 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30975132 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 30975389 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 30975522 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30975957 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 30975961 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 30975985 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30976849 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 30979023 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30979406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30979981 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 30980019 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 30980020 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30980927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30980993 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30981010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30984342 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30985097 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30985692 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30985975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30986668 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 30987444 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30987446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30987462 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30987474 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30987478 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30987504 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30987528 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30987613 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 30987705 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30987723 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30987779 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 30987791 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 30987793 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 30987997 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30988045 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 30988086 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 30988164 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30988559 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 30988719 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 30988724 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 30988837 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 30988863 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 30989119 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 30989198 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 30989616 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30989725 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30989893 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30989914 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30990678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30991070 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30991097 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30991180 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30991817 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30991905 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 30991996 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 30992402 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 30992992 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30993704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30993719 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 30993813 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30993814 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30993939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30994093 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 30994094 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 30994173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30994294 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 30994303 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 30994438 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 30994617 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 30994757 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 30995029 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 30995195 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30995197 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30995248 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30995392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30995396 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30995502 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 30995564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30995566 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 30995842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30995901 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30995943 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 30996030 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 30996044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30996102 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 30996138 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30996142 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30996364 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30996368 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30996766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30996929 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30996944 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 30996974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30997009 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30997015 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30997183 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30997469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30997486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30997637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30997704 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 30997717 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 30997869 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 30998042 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 30998072 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 30998137 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 30998209 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 30998254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30998368 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30998415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30998500 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 30998646 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 30999053 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 30999064 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 30999255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30999391 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 30999430 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30999437 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30999495 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 30999523 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30999533 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 30999547 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30999645 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 30999646 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 30999707 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 31000193 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 31000240 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 31000242 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 31000382 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 31000418 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 31000838 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31001476 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31001663 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31001849 C A Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 31002190 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31003426 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31005180 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31005462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31005711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31007456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31008129 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31008677 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31008845 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31008955 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31009737 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 31009754 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31010520 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31010537 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31011251 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31012089 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 31012103 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 31012156 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 19 31012222 C G Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 31012233 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31012307 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 31012348 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31012425 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31012593 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 31012611 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 31012703 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 31012824 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 31012867 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 31013074 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 31013340 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 31013382 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 31013409 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 31013441 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 31013448 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 31013467 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 31013493 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 31013539 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 31013648 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 31013655 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 31013805 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31013823 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 31013978 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 31014606 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 31014666 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31014791 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31014906 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31015736 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31016267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31016708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31016926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31016980 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31017429 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31018012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31018270 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31018659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31019020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31019548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31019799 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31019838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31020492 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 31020539 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31020780 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 31020823 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31020894 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31021386 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31022095 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 31022742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31022777 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 31022835 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31022887 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 31023209 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 31023256 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 31023568 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 31023569 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 31023719 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31023789 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31023802 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 31023820 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31023833 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31023961 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31024075 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 31024246 A C Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 31024271 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 31024476 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 31024632 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 31024690 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 31024703 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31024968 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31025000 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31025227 A T Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 31025284 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31025942 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31025949 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31025950 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31025952 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31026014 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 31026024 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 31026041 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 31026045 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 31026051 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31026062 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 31026093 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31026185 T G Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 31026206 A G Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 31026238 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 31026351 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31026536 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31026676 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 31029669 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 31030024 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 31030251 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 31030687 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31031108 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 31031109 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 31034468 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31035140 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 31035194 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31036714 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31037539 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31044587 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31044975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31045758 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31046424 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31047356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31047382 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31047451 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31048044 A G Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 19 31048263 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31048366 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31048520 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31048533 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 31048572 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31048663 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31048669 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31049119 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31049176 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31049278 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31049308 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31049708 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 31050555 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31051218 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 31051281 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 31051564 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 31052859 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 31053678 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 31053854 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31053915 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 31054014 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 31054167 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 31054302 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 31054445 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 31054571 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 31054587 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31054866 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31055018 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 31055552 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 31055754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31056474 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 31056706 A G Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 19 31056851 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31057704 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31057945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31058347 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31059329 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31059638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31060261 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31060274 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 31060788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31060889 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 31061201 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31061324 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 31061362 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 31061379 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 31061418 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31061460 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 31061505 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31061568 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31061790 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31061814 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31062255 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 31062300 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 31062328 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 31062700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31064032 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31064174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31064225 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31066156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31067188 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 31067189 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 31067503 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 31067504 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 31067912 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 19 31068644 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31069124 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31072318 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31072509 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31073373 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31074294 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31074319 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31074336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31074400 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 31074402 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31075214 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31075415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31075887 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31076052 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 31076095 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 31076103 T A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 19 31076396 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 19 31076514 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31076567 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 31076568 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 31076647 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 31076654 C A N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 19 31076681 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 31076697 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 31076727 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 19 31076731 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 31076748 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 31076758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31076769 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 31076780 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 31076846 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 31076949 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 31076981 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 31077081 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 31077112 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 31077143 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 31077171 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 31077226 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 31077251 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 31077274 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 31077293 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 31077371 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 31077393 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 19 31077394 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 31077422 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 31077443 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 31077489 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 31077878 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 31077892 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 19 31077957 A C N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 19 31078042 C A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 31078164 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 31078269 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 31078470 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 31078475 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 31078479 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 31078482 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 31078590 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 31078595 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 31078625 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 31078630 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 31078631 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 31078660 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 31079275 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31079540 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 31079740 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 31079813 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31079871 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31080534 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31081063 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31081624 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31082173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31082445 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31082633 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 31082769 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 31082847 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 31082950 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 31082951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31082981 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 31083051 G C Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 31083073 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 31083228 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 31083317 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 31083324 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 31083498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31083518 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 31083648 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 31083723 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 31083732 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 31083849 C A Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 31083865 C G Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 31083955 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 31084162 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 19 31084174 A C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 31084208 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 31084212 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 31084309 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 31084328 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 31084340 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 31084346 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 31084380 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 31084384 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 31084415 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 31084423 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 31084489 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 31084490 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 31084501 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 31084510 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 31084512 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 31084517 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 31084572 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 31084584 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 31084602 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 31084603 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 31084611 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 31084624 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 31084740 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31084771 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 31085260 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 31085266 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 31085353 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 31085354 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 31085520 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 31085633 G T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 19 31085979 T C N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.75 0 0.25 12 4 6 0 2 19 31086063 A C N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.428571428571429 0.214285714285714 0.357142857142857 15 13 6 3 5 19 31086166 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31086205 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 31086210 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 31086480 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 31086665 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 31086703 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31086776 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 31086886 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 31086921 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 31086959 C A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 31086987 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 19 31087167 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 19 31087403 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 31087445 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 31088336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31091460 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 31091496 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 31091520 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 31091579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31091633 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 31091639 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 31091732 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 31091865 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 31091866 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31092110 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 31092286 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 31092474 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31092641 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 31092675 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 31092676 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 31092827 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 31092844 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 31093174 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 31093364 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 31093365 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 31093432 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31093436 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 31093450 G C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 31093464 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 31095379 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 31095420 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 31095437 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 31095497 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 31095513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31095671 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 31095811 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 31095935 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 31096088 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 31096119 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 31096195 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 31096429 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31096542 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 31096840 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31096851 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31096852 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31097303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31097565 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 31097576 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 31097611 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 31097620 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 31098015 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 31098209 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 31098313 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 31098398 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31098401 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31098484 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31098542 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 31098555 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 31098564 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 31098623 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 31098638 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 31098653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31098658 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31098918 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31098936 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31098964 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31098969 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 31098979 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31098987 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 31099004 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 31100056 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 31100120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31100136 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31101499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31101668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31102317 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 31102755 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 31102803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31102804 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31103259 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 31103311 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31103317 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31103381 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31103390 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 31104471 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 31104472 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31104640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31104689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31104691 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31104966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31105131 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31105430 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 31105533 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31105633 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 31105703 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 31105713 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 31106212 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 31106239 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 31106714 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31106828 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 31106833 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31106902 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 31107040 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 31107050 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 31107051 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31107064 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31107153 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 31107178 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 31107235 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 31107250 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 31107285 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 31107292 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 31107299 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 31107327 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 31107351 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31107363 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 31107369 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 31107377 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 31107480 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 31107490 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 31107579 C A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 19 31107673 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 31107736 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 31107788 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31107826 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 31107964 C A N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 19 31108048 C A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 19 31108101 A T N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 19 31108509 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 31109045 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 31109318 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 31109324 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 31109333 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 31109339 T G N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 19 31109343 C T N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 19 31109443 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 31109757 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 31109827 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 31109950 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 31110118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31110225 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 31110231 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 31110272 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 31110299 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 31110336 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 31110485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31110648 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31110654 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 31110744 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 31110746 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 31110756 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 31110795 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31110805 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31110833 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31110914 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31110954 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 31110993 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 31111006 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31111055 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 31111253 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 31111258 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 31111273 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31111464 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31111494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31111567 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 19 31111955 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31111983 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31111984 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31112699 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31112792 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31113780 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31114025 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 31114200 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 31114402 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 31114406 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 31114415 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 31114416 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 31114453 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 31114500 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 31114598 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31114793 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31114840 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 31114847 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 31114972 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 31115080 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31115098 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 31115226 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31116595 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31116702 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 31116725 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31117381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31117454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31119061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31119216 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31123315 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 31124604 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31124743 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31125335 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 31125616 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 31126215 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31126463 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31127148 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 31127188 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 31129732 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31130157 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31130170 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31132820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31134197 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 31137487 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31138084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31138815 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 31139454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31140137 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 31142874 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31142924 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 31142955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31143090 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 31143972 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31146029 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31146038 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31146067 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31146079 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31147134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31147348 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 31147654 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 31147821 C T N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 19 31147914 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 19 31147938 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 19 31147979 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 31148014 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 31148113 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 31148376 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 19 31148392 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 31148395 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 31148410 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 31148428 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 31148434 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 31148451 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 31148729 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 31148815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31148882 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 31148901 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 31148909 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31148927 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 31148978 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 31149156 G T N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 19 31149841 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 31150111 T G N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 19 31150129 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 31150382 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31150436 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 31150448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31150461 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31150572 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 31150574 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 31150589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31150603 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31150612 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31150647 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31151146 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 31151262 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31152053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31152143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31153394 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 31153566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31154625 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31154901 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31156537 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 31156642 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31157915 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31161821 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31161972 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31164777 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31167954 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31168020 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 31171187 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 31171489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31171565 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31173072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31173984 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 31174688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31175033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31175074 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31175483 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 31175687 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 31175978 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31176912 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 31177536 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 31177576 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 31177997 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 31178548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31178703 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 31179826 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 31179926 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 31180420 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31180670 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31180772 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31181017 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 31181216 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31181220 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31181260 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 31181458 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31181504 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31181662 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 19 31181714 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 19 31181753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31181810 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 31182102 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 31182114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31182274 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31182326 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 31182356 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 31183229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31183474 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31183765 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 31184132 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31184456 G T N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 19 31184819 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 31184969 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31185169 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 31185178 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31185623 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 31185624 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 31185691 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31185944 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31187247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31187455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31187791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31187795 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 31187880 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 31188091 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31188182 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31188284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31188433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31188468 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31188477 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31188662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31188688 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 31188720 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 31188799 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 31188806 A T Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 31188884 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 31189207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31189732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31190045 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 31190068 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 31190260 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 31190499 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 31191154 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 31191219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31191363 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 19 31191382 G T N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 19 31191389 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 19 31191465 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 31191486 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 31191570 T A N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.307692307692308 0.0769230769230769 0.615384615384615 9 17 4 1 8 19 31191615 T G N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.181818181818182 0 0.818181818181818 4 18 2 0 9 19 31191649 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 19 31191668 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 19 31191734 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 31191747 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 31191782 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 19 31191784 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 10 22 4 2 10 19 31191810 C A N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.214285714285714 0.0714285714285714 0.714285714285714 7 21 3 1 10 19 31192030 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 31192123 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 31192174 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31192276 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 31192279 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 31192398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31192436 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31192444 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31192526 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 31192555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31192579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31192688 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31192811 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 31192924 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31192966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31193078 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31193318 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 31194100 G C N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 19 31194325 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31194369 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 31194964 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 31195066 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 31195126 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 31195149 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 31195152 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 31195181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31195195 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 31195207 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 31195384 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 31195421 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 31195474 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 31195510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31195561 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 31195694 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 31195708 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31195719 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 31195738 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 31195767 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 31195988 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 31196019 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 19 31196134 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 31196347 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 31196390 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 31196480 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 31196589 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31196592 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31196594 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31196782 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31196825 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 31196837 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31196902 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 31196934 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31197014 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 31197081 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 31197265 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 31197271 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31197329 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31197376 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 31197378 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 31197391 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 31197508 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 31197529 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31197541 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31197571 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31197715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31197749 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31197788 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31198433 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31198482 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31198518 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31198596 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 31198623 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31198659 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 31198788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31198891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31199062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31199210 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31199237 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 31199320 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 31199344 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 31199797 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 31199843 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 31199851 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 31200061 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31200258 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 31200301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31200315 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 31200342 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 31200391 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 31200394 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 31200447 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 31200751 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31200768 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 31200907 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31200913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31201041 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31201060 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31201146 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 31201169 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31201208 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31201221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31201239 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31201267 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31201462 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 31201481 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 31201904 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 31202397 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31202446 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31202902 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 31202914 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31204123 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31204389 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 31205210 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31205229 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31205897 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31207523 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 31207540 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 31207541 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 31207573 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 31207587 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 31207614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31208158 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 31208499 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 31208950 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31209030 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31209154 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 31209339 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 31209356 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 31209436 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31209703 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31209853 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 31209915 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31210048 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 31210350 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 31210635 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31210784 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 31210824 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 31210826 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 31211015 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 31211110 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 31212268 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31212493 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 31213865 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 31214422 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31214642 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 31214916 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31214928 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 31215010 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31215085 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 31215131 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 31215252 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 31215357 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 31215375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31215401 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31215550 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 31215580 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 31215952 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31216295 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 31216296 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 31216397 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31216480 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 31216581 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 31216692 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31216743 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31217048 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 31217050 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 31217168 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 31217445 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 31217451 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 19 31217630 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 31217674 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 31217749 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31217770 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31218133 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 31218219 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 31218355 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31218566 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31218568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31218754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31218791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31218813 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31218831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31218846 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31218849 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 31219193 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31219464 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31219934 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31219951 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31220308 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31220355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31220414 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31221279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31221484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31221492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31221614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31222008 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31222447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31222461 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31222462 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31222563 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31222762 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31223631 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31223881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31224550 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 31224552 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 31224566 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31224607 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 31225434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31225444 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31225927 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31226614 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31226615 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31226626 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31226901 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31227080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31229071 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31230043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31232030 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31232036 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31232485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31232779 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31233041 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31233909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31234257 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31234302 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31234528 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31234570 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31234742 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31235021 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31235022 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31235067 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31235070 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31235237 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31236389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31238738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31239635 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 31240009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31240289 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31240719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31243008 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31243303 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31246490 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31247846 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31249753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31250866 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31253577 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 31254272 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31255252 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31256563 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31256760 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31257487 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31258524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31259299 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31260611 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 31260950 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 31261830 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31261894 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31262039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31262046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31262159 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31262162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31262199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31262203 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31262234 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 31262285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31262398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31262532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31262579 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31263087 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 31263235 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31263273 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 31263322 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 31263656 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31263751 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 31263953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31264070 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 19 31264456 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31264470 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31265133 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 31265633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31265670 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31265775 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 31265793 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 31265913 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 31265996 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 31266160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31266427 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 31266429 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 31266615 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31266619 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 31267195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31267317 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 31267492 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 31267584 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 31267748 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31268256 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 31268436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31268750 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 19 31269016 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 19 31269084 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 31269293 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31269634 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 31269668 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 31269899 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31269917 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 31270042 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 19 31270120 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 19 31270217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31270740 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 31270759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31270767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31270891 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31271361 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 31271651 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31271655 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31271662 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 31271677 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31271972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31272577 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31272920 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31272927 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 31272929 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 31272957 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 31273054 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31273315 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 31273371 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 31273456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31273700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31273785 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 31273875 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 31273887 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 31274127 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 31274153 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 31274197 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 31274199 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 31274322 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31274575 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 31275432 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31275498 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31275558 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31275562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31275599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31275802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31275925 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 31275976 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 31275997 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 31276066 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31276075 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 31276076 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31276098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31276104 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 31276117 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 31276189 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 31276190 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 31276325 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 31276402 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 19 31276488 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 31276509 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 31276532 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 31276539 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 31276553 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 31276564 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 31276569 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 31276599 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 31276885 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 31276930 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31277131 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 31277450 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 31277481 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31277549 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 31277560 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31277694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31277807 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31277879 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31279155 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31279466 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 31279700 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31279742 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 31280148 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31280184 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 31282347 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31282695 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31283050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31283516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31283602 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 31283793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31284245 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31284570 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 31284745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31285192 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31285457 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 31285573 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 31285644 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 31285669 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31285670 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 31285946 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 31286147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31286163 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31286335 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 31286412 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31286579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31287205 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 31287271 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 31288843 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 31288848 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31289716 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31290530 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31292825 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31292908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31294099 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31294641 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 31294807 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 31295140 T C Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 31295308 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 31295447 T C Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 31295697 A G Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 19 31295987 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 31296596 T C Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 31296848 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31296868 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31296975 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31297089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31297104 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31297360 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 31297422 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31297495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31297535 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 31297599 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 31297638 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 31297647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31298257 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31298467 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 31298814 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 31298818 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 31300044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31300162 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31300188 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31300568 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31301451 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 31301814 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 31302027 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 31302416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31302503 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 31302792 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31302819 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31302928 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31303011 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 31303356 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31303484 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 31303629 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31303637 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31303664 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31303835 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31303890 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31304016 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31304051 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 31304195 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31304210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31304310 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31304465 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31304530 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 31304724 A G N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 19 31304904 T A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 31304909 G C Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 31304915 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 31304929 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 31305107 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 31305586 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 31305617 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31305710 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31305723 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31305928 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31305947 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31305979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31306190 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31306242 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31306260 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 31306359 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31306587 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31306668 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31306716 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 19 31306773 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31306822 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31306918 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 31307090 A G Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 31307256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31307295 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 31307496 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31307595 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 31307631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31307660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31307671 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 31307721 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31307846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31308043 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31308068 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31308128 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31308256 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31308334 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 31308350 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 31312665 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 31312679 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31312805 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 31312842 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 31312859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31312876 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31312908 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31312948 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 31313011 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31313127 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31313137 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 31313354 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 31313393 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 31313400 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 31313408 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 31313428 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 31313519 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 31313684 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 31313704 C A Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 19 31313744 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 31313832 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31313886 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 31314043 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31314082 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31314296 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 31314346 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31314422 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 31314423 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 31314437 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 31314438 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 31314528 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 31314706 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31314993 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 31315003 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 31315008 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 31315031 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 31315161 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 31315187 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 31315209 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 31315372 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 31315396 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 31315405 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 31315531 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 31315947 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 31316238 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 31316518 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 31316559 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31316632 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 31316707 C A N N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 19 31316711 C T N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 19 31316892 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 31316955 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 31316993 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 31317004 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 31317051 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 31317075 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 31317076 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 31317087 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31317155 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 31317168 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 31317248 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 31317486 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 31317571 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31317618 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31317723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31317842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31317960 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 31318271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31318316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31318466 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 31319358 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31320580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31320717 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31320946 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31321299 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 31321420 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 31321904 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 31321934 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31321946 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 31321981 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 31321984 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 31322002 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 31322009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31322159 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 31322305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31322341 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 31322678 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31323323 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 31323338 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 31323355 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 31323389 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 31323444 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31323445 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 31323463 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 31323474 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 31323496 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31323543 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 31323601 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31323604 G C N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 19 31323810 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 19 31323902 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 31324050 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31324165 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 31324557 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 19 31324812 T C N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 19 31324908 A T Y N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 19 31324916 G C N N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 19 31325185 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 31325234 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 31325377 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 31325453 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 31325853 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 31325871 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 31326013 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 31326030 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 31326557 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 31326577 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31326583 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31326635 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31326653 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 31326655 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 31326682 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 31326780 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 31326794 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 31326798 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31326803 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 31326821 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 31326839 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 31326842 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 31326980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31327536 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31327860 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31327917 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31328286 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31328482 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31328564 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31328986 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 31329354 A G Y Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 19 31329591 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31329647 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 31329665 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 31329666 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 31329677 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 31329798 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31329813 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 31329840 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31330007 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 31330012 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 31330252 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 31330258 A C Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 31330290 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31330394 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 31330769 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31330813 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31330818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31330852 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31330918 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31331627 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 31331629 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31331715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31331798 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31331809 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31331888 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31331906 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31331957 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31332045 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31334027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31334054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31337018 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31337972 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 31338665 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31339159 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31340396 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 31340621 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31341383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31341390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31341455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31341671 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31341817 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 31342139 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31342880 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31344300 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 31344926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31344981 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31345256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31345318 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31345717 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31346001 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 31346110 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 31346160 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 31346581 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31347146 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 31347148 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 31347190 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31347232 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31347376 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31347451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31347574 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31347948 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31348545 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 31348624 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 31348637 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 31349086 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 19 31349092 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31349095 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31349119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31349445 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31349475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31349534 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31349562 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31349672 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 31349723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31349853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31349889 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31349942 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31350011 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31350049 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 31350139 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 31350392 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31350643 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 31350770 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 31350854 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 31350912 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 31350924 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31351060 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31351094 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 31351129 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 31351142 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 31351211 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 31351219 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 31351240 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31351260 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 31351266 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 31351297 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 31351329 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 31351700 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 31351740 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31351748 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 31351786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31351795 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31351865 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31351914 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31351975 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31352006 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 31352014 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 31352033 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31352038 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31352051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31352065 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31352095 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31352155 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 31352224 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 31352343 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31352376 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 31352416 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 31352435 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31352624 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31353017 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 31353025 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31353305 T C Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 19 31353459 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 31353622 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31353806 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 31353910 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31354449 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 31354489 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 31354575 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 31354648 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31354775 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31354794 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 31354914 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31354936 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 31355028 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 31355040 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31355119 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 31355142 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 19 31355273 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 19 31355364 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31355391 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 31355469 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 31355487 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31355505 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 31355892 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 31355916 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 31355946 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 31356353 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31356563 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 31356671 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 19 31356800 G C Y N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 31357826 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 31359217 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31359416 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31359464 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 31360058 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31360490 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 31360541 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31360546 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31361033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31361113 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31361990 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31362747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31362875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31363033 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 31363426 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 31363688 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31363703 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 31363707 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 31363918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31364031 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 31364092 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 31364126 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 31364181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31364207 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 31364248 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 31364285 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 31364289 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 31364320 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31364613 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 31364652 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31364745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31364913 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31364915 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31364928 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31364961 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31364979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31365001 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 31365013 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 31365031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31365051 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 31365103 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31365160 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31365176 C G Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 31365202 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31365299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31365316 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 31365326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31365396 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 31365631 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 31365656 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 31365700 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31365716 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31365866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31366119 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31366143 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31366484 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31366532 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31366588 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 31366729 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31366903 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 31367280 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 31367335 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31367387 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 31367401 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31367747 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 31367831 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31367873 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31367973 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 31368023 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 31368165 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31368208 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31368592 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31368661 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31369759 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31369783 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 31369918 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31370020 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31370071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31370209 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 31370210 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 31370243 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 31370372 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 31370458 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31370558 T C Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 19 31370819 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 31370931 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 31371077 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31371095 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31371132 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31371216 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31371243 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31371586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31372027 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 31372188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31372499 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31372755 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 31372804 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31373147 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 31373174 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31373184 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31373185 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31373192 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31373298 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31373308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31373345 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 31373415 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31373481 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31373499 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31373593 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31373706 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 31374110 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 31374128 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31374172 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31374193 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31374206 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 31374348 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 31374451 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 31375158 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 31375193 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 31375592 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 31375693 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 31376372 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31376460 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31376607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31376623 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31376627 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31377100 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31377247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31377732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31377788 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31377815 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31378052 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 31378067 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 31378176 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 31378275 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 31378332 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 31378344 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 31378564 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31378680 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 31378716 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31378868 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 31379078 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 31379147 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31379777 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 31379984 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31380131 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 31380422 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 31381125 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31381166 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 31381241 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31381348 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31381415 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31381445 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 31381460 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 31381488 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31381513 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31381605 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31381657 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31381725 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31381820 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31381823 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 31381935 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31382017 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 31382023 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 31382033 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 31382274 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 31382425 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31382485 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31382523 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 31382600 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 31382715 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31382721 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31382898 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31382941 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 31383236 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 31383259 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 31383357 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31383476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31383579 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31383667 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31383668 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31383793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31384284 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 31384371 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31384650 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31384657 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31384661 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31385006 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31385247 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31385842 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31385874 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31386170 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31386193 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 19 31386311 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31386622 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 31386834 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 31387089 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31387092 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31387202 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31387611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31387691 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31387829 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31387863 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31388019 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31388067 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31388107 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 31388235 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31388364 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31388415 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31388448 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31388466 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 31388687 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31388735 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31388841 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31388953 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31389553 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31389613 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 31390211 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 31390270 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31390361 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31390943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31391066 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 31391155 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 31391220 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31391317 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31391318 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31391335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31391406 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31391516 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31391541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31391673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31391737 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31391793 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31391819 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 31392463 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 31392708 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31392837 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 31392894 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31393167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31393192 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31393305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31393403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31393525 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31393832 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31393845 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31394033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31394198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31394511 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 31394738 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 31394953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31394986 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31394987 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31395270 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31395299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31395315 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31395413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31395414 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31395583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31395661 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31395687 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31395884 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31395963 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31395998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31396030 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31396060 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31396077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31396084 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31396103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31396163 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31396178 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31396210 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31396211 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31396343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31396414 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31396429 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31396487 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31396517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31396539 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31396545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31396587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31396596 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31396648 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31396666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31396726 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31396732 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 31397445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31397730 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31397922 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31398155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31398407 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31398494 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31398772 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31399119 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31399263 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 19 31399350 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31399567 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31399641 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31399768 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 31400074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31400110 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31400148 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 31400474 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 31400621 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31400808 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31400861 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31400956 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31400960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31400982 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31401040 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31401053 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31401077 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31402009 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 31402876 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 31403000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31403367 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31403484 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31404038 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31404057 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31404183 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 31404250 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31404511 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31404520 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31404835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31404852 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31404923 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31404943 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31404967 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31404986 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31405049 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31405102 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31405111 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31405114 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31405136 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31405141 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31405327 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31405330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31405345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31405389 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31405390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31405476 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31405709 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31405711 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31405819 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31406081 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31406130 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31406280 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31406290 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31406460 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31406505 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31406567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31406569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31406610 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31406624 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31406634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31406745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31406776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31407038 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31407049 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31407063 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31407138 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31407250 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 31407270 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31407325 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31407474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31407533 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 31407544 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 31407617 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 31407810 T A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 31407815 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31408198 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31408270 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 31408455 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 31408473 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 31408510 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 31408870 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31408871 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31408872 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31409025 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31409032 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31409175 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31409402 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31409638 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31410000 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 31410113 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 31410128 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 31410290 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31410638 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31410727 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31410831 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 31410901 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31411368 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31411420 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 31411528 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 31411568 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 31411674 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31411761 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31411939 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 31412087 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31412124 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 31412425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31412438 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31412481 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31412491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31412579 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 31412620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31412632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31412677 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 31412803 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31412894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31413002 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31413018 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 31413278 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31413286 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 31413354 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 31413366 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31413444 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31413459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31413584 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31413611 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 31413651 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31413669 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31413820 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 19 31413977 G T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 31414011 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 31414061 A C Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 31414423 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 31414455 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 19 31414579 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31414633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31414716 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31414741 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31414798 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31414992 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31415089 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31415163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31415401 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31415517 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31415814 T A Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 31415815 A C Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 31416425 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31416691 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 31416784 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 31416849 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 31417037 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 31417277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31417470 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31417684 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 31417767 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 31417771 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31417882 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 31417944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31417999 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 31418017 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 31418024 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 31418032 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 31418250 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 31418870 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31419235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31419276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31419462 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31419731 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 31419882 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 31419948 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31419974 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 31419975 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 31420389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31420889 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31420985 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31421135 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31421252 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31421381 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31421417 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31421454 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31421514 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31421605 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 31421624 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31421627 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31421666 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31421672 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31421791 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31421803 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31421821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31421868 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31421971 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31422050 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 31422084 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 31422086 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 31422120 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 31422262 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31422275 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 31422278 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 31422307 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31422583 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 31422662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31422684 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31422727 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31422777 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31422832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31422911 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31422934 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31422982 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 31423000 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 31423089 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 31423182 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31423247 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31423426 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31423578 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31423640 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31423810 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31423819 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31423913 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 31423991 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 31424032 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31424074 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31424121 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31424183 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 31424516 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31425608 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31426164 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 31426172 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31426180 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31426256 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 31426478 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31426513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31426680 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31426697 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 31426969 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 31427354 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 31427508 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31427576 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 31427688 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 31427809 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 31428049 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 31428144 C A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 19 31428250 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 31428329 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 31428483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31428635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31429054 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31429220 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31429304 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 31429601 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 31429656 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31429667 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31429685 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31429783 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31429831 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31429878 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 31429945 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31430145 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31430218 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 31430232 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 31430432 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31430474 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31430534 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31430609 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31430788 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31430849 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 31430964 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 31431391 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31431708 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31431851 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 31431898 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31431904 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31431905 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31432005 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 31432006 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 31432112 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31432162 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31432181 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31432209 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 31432306 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31432438 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 31432553 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 31432611 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 31432651 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 31432800 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 31432922 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 31432938 A T N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.545454545454545 0.363636363636364 8 14 1 6 4 19 31432939 C T N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 19 31433028 T G N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 19 31433097 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 31433136 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 31433189 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 31433216 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 31433277 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31433311 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 31433338 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31433420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31434455 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31434966 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31435546 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31436778 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31436950 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 31436968 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 31437196 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31437304 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31437683 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 31437696 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 31438248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31438572 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 31439135 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31439282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31439659 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 31439664 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 31439666 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 31439672 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31439723 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31439748 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 31439768 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 31439810 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31439819 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31439840 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31439857 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31439958 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 31440005 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 31440045 A T N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 19 31440100 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31440115 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31440193 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 31440455 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 31440511 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31440538 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 31440704 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31440713 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31440715 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31441113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31441175 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31441190 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31441224 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31441236 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31441335 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31441430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31441621 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31441789 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31441800 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 31441880 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31441911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31442038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31442148 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31442149 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31442181 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31442344 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31442894 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 31443631 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31443636 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31443825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31443925 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31444035 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 31444088 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 31444876 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31445269 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31445345 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 31445385 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 31445406 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 31445761 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 31446206 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 31446494 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 31447734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31448019 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 31448263 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31450523 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31451981 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 31452222 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31452297 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31452769 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 31452877 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 31453042 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31453232 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 31453321 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 31453493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31453523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31453563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31453964 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 31455113 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31455114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31455135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31455603 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31455686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31455693 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31455903 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31455969 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31456340 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 31457232 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31457737 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31457905 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31458062 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31458129 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 31458337 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31459346 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31459678 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 31459703 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31460291 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31460718 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31460746 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31460760 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31460876 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31461118 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31461529 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 31461972 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31462421 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31462533 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31462568 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31462769 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31462794 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 31462814 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31462856 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31462891 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31463041 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31463110 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31463244 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31463253 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 31463363 A C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 19 31463364 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 19 31463409 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31463443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31463499 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31463623 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31463654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31463669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31463694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31463700 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 31463765 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 31464164 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 19 31464521 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 31464561 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31464562 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31464809 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 31464947 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 31465379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31465387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31465476 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31465953 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31465957 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31466103 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31466134 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31466442 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31466518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31466549 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31466716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31466751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31466965 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31467582 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 31468355 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 31468380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31468472 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31468687 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31468757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31469621 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31469742 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31469773 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31469790 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31469846 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31469865 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31469867 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31469995 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31470194 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31470214 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31470246 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31470262 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31470314 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31470414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31470442 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31470749 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31470948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31471566 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 31471651 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31471808 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31471984 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31472017 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31472086 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31472187 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31472411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31472469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31472615 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 31472868 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31472877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31472902 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31473032 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 31473204 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 31473216 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31473237 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31473241 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 31473733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31473860 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31473953 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 31474753 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31475653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31475694 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31476699 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31477175 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31477211 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31477320 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 31477570 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31477599 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31477697 A C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 31478360 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 31478380 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31478550 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 31478753 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31478817 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31478837 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31479134 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31479153 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 31479173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31479206 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31479311 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31479670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31479781 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 31479830 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31479925 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31480380 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31481051 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31481300 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31481440 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 31481674 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 31481742 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 31481880 T G Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 31481898 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 31481988 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31481989 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31482059 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31482065 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31482091 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31482187 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31482213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31482227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31482255 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31482256 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31482396 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31482419 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31482435 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31482535 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31482565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31482601 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31482621 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31482668 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31482763 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31482764 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31482827 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 31482869 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31483024 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 31483067 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 31483103 G A Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 31483218 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31483382 C G Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 31484032 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31484055 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31484211 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 31484220 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 31484221 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 31484368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31484646 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31484813 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31485144 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 31485163 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31485269 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31485362 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 31485650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31485763 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31485903 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31485914 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 31486081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31486148 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31486234 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31487011 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31487415 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31488516 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31489029 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31489724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31489764 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 31490152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31491646 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31492563 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31493420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31494448 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31494496 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31494505 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31494552 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31494832 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 31495062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31495480 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 31495489 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31495713 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 31495845 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 31495856 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 31496016 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 31496074 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31496095 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 31496143 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 31496158 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 31496192 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 31496199 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31496235 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 31496274 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 31496307 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 31496329 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31496458 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31496469 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 31496895 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 31497224 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31497633 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 31498387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31498600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31498625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31498662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31498791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31498913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31500426 T C Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 19 31500538 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 19 31500558 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 19 31500683 A C Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 19 31501210 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31501350 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 31501626 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31501782 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 31501855 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 31502038 A T N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 19 31502056 A T N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 19 31502075 A C N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 19 31502078 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 31502172 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31502238 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 31502239 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 31502318 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 31502402 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31502763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31502904 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 31502907 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 31503080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31503111 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31503139 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 31503343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31503475 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 31503541 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 31503794 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 31504585 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31505869 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31507067 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 31507153 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31507403 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31507415 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 31507470 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31507528 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31507575 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31507901 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 31507913 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 31507924 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 31508212 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 31508246 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31508347 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 31508404 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 31508821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31508975 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 31509101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31509125 G T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 31509151 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31509266 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31509803 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 31509912 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31510136 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31510568 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31510833 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31510980 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31511050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31513127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31513176 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 31513393 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31513422 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31513436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31513454 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31513599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31514019 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 31514031 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31514257 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31514876 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31515120 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 31516900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31517079 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31517088 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 31517217 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 31517548 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 31517810 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31518078 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31518082 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 31518427 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31518442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31518849 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31519207 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31519342 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31520197 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31520515 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 31520840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31521532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31522366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31522729 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 31523668 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31523727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31525123 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 31526508 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 31530127 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31532250 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31532701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31532865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31533154 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31533495 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 31533803 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 31533892 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31534198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31534232 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 31534460 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 31534513 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 31535310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31536281 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31536359 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 31536484 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 31536572 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 31536573 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 31536611 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 31536612 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 31536722 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 31536724 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 31536748 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 31536751 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 31536795 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 31537071 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 31537095 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 31537491 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 31537782 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 31537998 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 19 31538093 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 31538103 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 31538228 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 31538233 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 31538235 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 31538291 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 31538353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31539144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31539461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31539502 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 31539906 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 31540178 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 31540553 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 31540741 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31540802 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31541190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31541245 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 31541457 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 31541584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31541649 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 31541834 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 31542363 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 31542478 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 31542741 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 31542841 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31542874 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 31543084 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31543273 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 31543292 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 31543338 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 31543382 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 31543492 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31543501 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 31544099 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31544219 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31544274 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31544459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31544652 C A N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 19 31544678 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31544917 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 31544933 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31544941 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31544964 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31546383 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31546448 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 31549042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31549108 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31551410 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 31551454 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31551637 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31551773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31551801 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31551862 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31551946 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31551987 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31552005 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31552034 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 31552046 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31552065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31552164 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31552166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31552189 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31552195 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31552335 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31552342 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31552350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31552373 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31552396 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31552422 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31552476 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31552524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31552694 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31552911 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31552912 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31553201 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 31553274 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31553413 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31553514 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31553517 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 19 31553518 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 19 31553614 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31553618 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31553619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31553634 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31553660 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31553781 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 31553931 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 31553961 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 19 31553978 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 31553984 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 19 31553991 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.2 23 7 11 1 3 19 31553998 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.176470588235294 27 7 13 1 3 19 31554422 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 19 31554483 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 19 31554495 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 19 31554631 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 31554726 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31554962 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 19 31554968 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 19 31555001 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 31555114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31555143 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31555164 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31555205 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31555325 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31555365 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31555373 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31555401 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31555402 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31555515 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 31555573 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31555589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31555638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31555639 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 19 31555642 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 19 31555711 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31555732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31555736 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 31555771 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 31555944 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31556050 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 31556060 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 31556063 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 31556074 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 31556170 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31556288 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31556290 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31556340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31556422 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31556540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31556579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31556804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31556987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31557048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31557055 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 31557122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31557204 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31557609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31557954 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 31557977 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 31558021 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 31558035 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 31558249 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 19 31558350 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 31558351 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 31558437 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 19 31558501 G C N N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.363636363636364 0.181818181818182 0.454545454545455 10 12 4 2 5 19 31558502 G T N N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 8 12 3 2 5 19 31558519 G A N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.375 0.125 0.5 7 9 3 1 4 19 31558525 T C N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.428571428571429 0.142857142857143 0.428571428571429 7 7 3 1 3 19 31558604 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 19 31558633 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 19 31558640 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 19 31558689 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 31558719 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 31558951 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31559505 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31559535 C G N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 19 31559542 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31559657 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 19 31559661 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 19 31559897 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31560061 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 31560146 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 31560158 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 31560318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31560758 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31560859 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31560861 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31561278 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31561312 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 31561449 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 31561488 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 31561550 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 31561683 G C N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 19 31561684 G A N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 19 31561689 G A N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 19 31561691 T C N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 19 31561952 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 31562783 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31563035 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 31563047 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 31563551 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31563614 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 31563842 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 31563952 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31564387 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 31564409 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 31564482 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 31564489 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 31564585 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 31564731 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31564739 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31564792 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31564803 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 31564877 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 31564898 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 31564936 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 31565008 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 31565067 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31565130 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 31565194 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 31565221 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31565241 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 31565248 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31565249 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 31565272 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31565273 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31565290 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 31565348 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 31565385 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 31565396 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 31565399 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31565412 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31565457 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 31565564 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 31565614 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31565770 A T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 19 31565878 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 31566142 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 31566145 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 19 31566175 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 19 31566245 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 31566592 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 31566647 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 31566654 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31566687 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 31566713 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 31566822 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31566824 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 31566831 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31566851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31566943 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31566955 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31567144 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 31567150 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 31567166 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 19 31567208 A G N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 12 8 3 6 1 19 31567595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31568237 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31568323 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 31568584 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31568683 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 31568732 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 31569162 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31569365 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31569369 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 31569392 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 31569623 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 31569676 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31569688 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 31569695 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31569708 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 31569731 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31569790 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 31570600 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 31570621 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31570635 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 31571315 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31571319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31571332 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31571902 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31571913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31571981 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31572012 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31572403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31572554 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31572567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31572568 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31572584 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31572594 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31572620 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31572639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31572949 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31573061 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31573180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31573373 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 31574316 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31575005 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31575312 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31576444 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31576478 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31576491 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31576725 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31576787 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31576854 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31576912 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31576939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31577041 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 19 31577079 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 31577080 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 31577102 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 31577192 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 31577374 T C N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.75 0.0833333333333333 0.166666666666667 19 5 9 1 2 19 31577384 C T N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.181818181818182 17 5 8 1 2 19 31577412 T A N N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 14 6 6 2 2 19 31577413 T A N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 15 5 7 1 2 19 31577539 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31577628 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31577656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31577691 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31577917 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31577941 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31577954 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31577970 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31578019 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31578134 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31578138 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31578267 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31578303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31578329 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31578391 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31578399 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31578408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31578458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31578481 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31578499 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31578527 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31578556 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31578632 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31578710 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31578770 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31578820 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31578831 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 31578862 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31578870 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31578928 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31579056 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 31579059 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 31579068 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31579096 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.1875 0.0625 0.75 7 25 3 1 12 19 31579127 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31579153 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31579218 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31579231 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31579239 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31579260 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31579272 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31579392 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31579425 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31579474 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 31579543 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31579934 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31580068 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31580071 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31580074 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31580115 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31580135 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31580174 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31580198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31580209 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 31580290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31580339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31580345 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 31580367 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 31580441 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31580497 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 31580557 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31580624 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31580810 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31580952 G T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 19 31581148 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31581213 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 31581344 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31581385 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 31581401 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31581591 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31581726 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 31581861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31581918 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31582129 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 31582178 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31582314 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 19 31582722 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 31582730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31582927 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 31582974 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 31583003 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 31583324 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31583548 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 31583569 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 31583863 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 31583935 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 31584049 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 31584129 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31584242 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 31584379 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31584472 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31584507 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 19 31584783 T G Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 31585005 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 31585060 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 31585251 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31585318 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 31585452 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31585585 A G N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.363636363636364 0.272727272727273 0.363636363636364 11 11 4 3 4 19 31585900 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 31585970 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31586100 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31586496 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 31586519 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31586783 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31586875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31586918 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 31586924 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31587315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31587507 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31587569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31587826 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31587829 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31587938 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31588104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31588207 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31588323 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31588331 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31588461 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31588586 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31588636 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31588746 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31588827 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31589065 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31589075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31589115 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31589253 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 31589358 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31589823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31590105 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31590154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31590226 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 31590352 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31590576 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31590605 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31590620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31591314 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 31591434 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 31591508 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31591512 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 31591772 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 31592032 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 31592076 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31592099 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 31592218 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 31592301 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 31593816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31594046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31594154 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 31594301 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31594482 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31594906 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31594954 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31595162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31595456 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31596241 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 31596402 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31596918 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31596989 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31597038 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31597438 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31597622 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31597796 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31598335 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31598781 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31598819 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31598904 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 31598952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31599588 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 31599673 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31599727 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 31599759 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31600110 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31600130 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31600191 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 31600227 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31600257 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 31600419 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31600481 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 31600646 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31600714 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 31600716 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 31600717 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 31600738 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31600739 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 31600816 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31600927 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31601315 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 31601322 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 31601364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31601419 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 31602645 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 31602677 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31603096 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31603118 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 31603220 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 31603254 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 31603417 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 19 31603473 G C N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.75 0.0625 0.1875 25 7 12 1 3 19 31603492 A C N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.75 0.0625 0.1875 25 7 12 1 3 19 31603510 C T N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 19 31603543 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31603555 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.176470588235294 27 7 13 1 3 19 31603591 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 19 31603627 G A N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.272727272727273 15 7 7 1 3 19 31603673 A G N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 19 31603681 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 19 31603755 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.176470588235294 27 7 13 1 3 19 31603797 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 19 31603953 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 31604147 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31604202 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31604275 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31604351 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31604543 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 31604636 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 31604811 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 31604854 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31604855 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 31604923 A C N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 19 31604924 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 19 31604944 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 31604954 T A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 31604955 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 31604958 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 31604999 G C N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 19 31605060 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 19 31605129 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31605269 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31605442 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 31605448 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 31605490 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 31605491 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 31605583 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 31605609 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 31605871 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 31606184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31606381 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 31606419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31606524 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 31606586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31606943 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31607238 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31607940 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31608197 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31608642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31609086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31609312 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31609327 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31609361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31609915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31610259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31610779 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31611543 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31611801 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 31612593 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 31612684 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 31612685 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 31612717 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 31612794 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31612815 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 31612836 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 31612910 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 31613742 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31614026 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 19 31614048 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 19 31614140 G C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 19 31614142 T G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 19 31614244 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 31614662 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31614802 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 31614878 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31615178 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 31615371 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 19 31615636 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 19 31615657 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31615741 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 31615908 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 19 31615982 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31616102 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 31616107 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 31616364 A T N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.615384615384615 0.153846153846154 0.230769230769231 18 8 8 2 3 19 31616396 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 19 31616528 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 19 31616579 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 31616601 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 19 31616652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31616667 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31616716 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31616856 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 31616881 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 31616894 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 31616900 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31617147 C A N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.636363636363636 0.181818181818182 0.181818181818182 16 6 7 2 2 19 31617171 T C N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 19 31617211 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 31617313 A C N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 19 31617353 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31617356 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31617402 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 31617444 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 31617561 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31617569 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31617618 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31617778 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 31617822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31617839 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31617902 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 31617927 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31617958 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31618010 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31618014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31618022 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31618024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31618305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31618312 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31618467 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31618581 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31618640 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31618687 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 31618699 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31618728 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31618731 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31618903 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 31619116 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31619330 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31619388 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31619390 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31619775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31620144 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31620220 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 31621058 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 31621234 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31621305 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31621314 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31621321 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 31621346 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 31621350 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31621385 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31621584 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 19 31621788 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31621860 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31621864 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 19 31621930 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31621951 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 31621982 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31621994 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 31622079 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 31622583 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 31622600 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 31622619 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31622626 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 31622628 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31622718 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31622733 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31622759 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 31622781 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 31622803 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 31622811 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31622887 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31622893 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 31622902 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 31623031 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31623117 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31623203 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31623221 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31623278 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31623355 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 31623399 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 31623412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31623421 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 31623483 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31623494 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 31623554 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 31623604 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31623610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31623638 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 31623659 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 31623927 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 19 31624263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31624449 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 31624547 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31624640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31624731 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31624760 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31624819 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 31624840 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31624935 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31624965 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 31625017 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 19 31625020 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31625075 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 31625120 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 31625158 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31625221 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31625251 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 31625339 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 31625373 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 31625403 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 19 31625450 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 31625578 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 31625581 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 31625642 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 31625667 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31625677 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31625798 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31625844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31625963 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 31625984 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 31625998 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31626198 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 31626237 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31626294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31626357 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 31626358 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 31626386 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 31626507 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 31626562 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31626570 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 19 31626677 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 31626689 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 31626725 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 31626881 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31626977 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 31627077 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31627550 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 31627551 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 31627629 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 19 31628140 G A N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.272727272727273 15 7 7 1 3 19 31628152 C A N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 15 5 7 1 2 19 31628170 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 31628180 A G N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.25 17 7 8 1 3 19 31628884 G A N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 19 31629002 G A Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 19 31629357 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31629870 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 31630011 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 31630155 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31630614 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 31631052 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 31631236 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31631323 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31631389 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31631455 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31631688 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31631735 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31631975 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 31632005 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 31632202 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 31632379 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31632421 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 31632673 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31632721 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 31632760 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31632893 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31633029 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 31633061 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 31633124 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 31633183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31633270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31633581 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31633682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31634233 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31634284 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31634293 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 31634310 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31634353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31634416 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31634455 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 31634589 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31634611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31634745 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31634910 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31635100 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31635112 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31635317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31635367 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31635401 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31635420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31635454 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31635825 T G N N 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.625 0 0.375 10 6 5 0 3 19 31635861 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31635866 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31635874 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31635887 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31635954 G C N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 19 31635991 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31636062 G A Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 31636105 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 31636251 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 31636456 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 31636501 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 31636550 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 31636815 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31636969 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 31637090 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 31638518 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31638799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31638806 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 31639324 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31639601 C G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 31639625 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 19 31639734 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31640169 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 31640216 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 31640454 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 31641220 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 31641597 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 31641760 A T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 31641961 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31642294 A T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 31642461 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31643554 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31643605 A C N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 19 31643635 C A N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 9 15 3 3 6 19 31643638 G T N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.272727272727273 0.181818181818182 0.545454545454545 8 14 3 2 6 19 31643872 A T N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 19 31643887 T A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 31643913 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 19 31644133 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31644216 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 31644266 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31644413 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31644555 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31644615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31645068 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31645378 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31645397 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31645418 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31645476 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31645518 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 31645606 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31645631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31645840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31645976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31646120 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31646146 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 31646154 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 31646492 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 31646760 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 31646771 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31647109 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 19 31647120 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 31647861 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31647879 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 31647905 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 31648046 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31648060 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31648062 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31648067 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31648121 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31648158 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31648168 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31648234 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 31648402 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31648405 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31648447 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31648568 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 19 31648585 A G N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 19 31648595 T C N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 19 31648706 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 19 31648846 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 19 31648983 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 19 31649031 G A N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 19 31649285 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 19 31649417 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31649582 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.285714285714286 0.0714285714285714 0.642857142857143 9 19 4 1 9 19 31649630 G A Y Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 10 18 4 2 8 19 31649845 G A N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.333333333333333 0.0833333333333333 0.583333333333333 9 15 4 1 7 19 31650076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31650089 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31650142 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31650150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31650257 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 31650477 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 31650855 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 31650872 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 19 31651127 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 31651548 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31651616 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 31651845 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31652070 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 31652111 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31652113 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31652180 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31652197 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31652233 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31652238 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31652274 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31652299 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31652302 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31652316 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 31652364 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 31652440 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 31652451 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 31652835 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 31652914 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31652935 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31653021 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 31653035 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 31653072 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31653107 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 31653120 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 31653447 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31653471 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 31653475 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31653480 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 31653488 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 31653550 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 31653590 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 31653766 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31653799 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31653832 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31653910 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 31653914 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 31654104 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 31654199 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 19 31654248 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 31654323 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 31654360 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 31654558 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31654672 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 31654693 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31654769 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 31654770 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31654839 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31654954 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31655025 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31655143 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 31655183 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31655383 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31655595 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31655774 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31656057 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 31656113 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 31656149 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 19 31656212 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 31656239 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 31656288 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 31656323 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.2 23 7 11 1 3 19 31656376 A G N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.75 0 0.25 18 6 9 0 3 19 31656384 T C N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.75 0 0.25 18 6 9 0 3 19 31656394 C T N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.230769230769231 19 7 9 1 3 19 31656501 G T N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 19 31656504 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 19 31656557 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 19 31656586 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 31656606 T G N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.75 0.0833333333333333 0.166666666666667 19 5 9 1 2 19 31656788 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 19 31656877 T A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 19 31657009 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 19 31657011 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 19 31657036 G C N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 19 31657043 A C N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 19 31657368 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31657372 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31657588 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 31657975 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 19 31658550 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 31658595 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 31658689 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 31658741 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 31658778 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 19 31658964 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 31659076 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 31659147 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 31659214 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 31659227 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 31659263 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 31659285 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 31659294 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 31659296 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 31659333 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 19 31659405 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 31659449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31659506 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 31659680 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 31659682 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 31659730 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 31659765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31659792 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 31663618 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 31663634 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 31663650 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 31663900 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31664014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31664068 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31664484 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31664812 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 31664863 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31664971 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31665083 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 31665154 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 31665646 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 31665859 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 31665906 C T Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 31665956 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31666117 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 31666225 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 31666281 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 31666316 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 31666381 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 31666383 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 31666473 A T Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 31666475 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 31666560 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 31666636 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 31666663 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 31666722 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31666916 G T Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 31666955 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 31666971 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 31667011 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 31667468 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31667609 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31667686 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31667764 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31668201 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 19 31668331 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 31668581 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 31669055 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31669080 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31669090 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 31669151 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31669154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31669232 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31669642 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31669657 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 31669675 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31669677 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 31669745 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 31669754 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 31670130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31670134 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31670214 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 31671266 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31671520 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31671715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31671965 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31672183 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 31672190 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31672236 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31672394 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 31672539 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31672663 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31672776 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 31672850 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 31673009 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 31673442 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 31673498 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 31673930 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 31674021 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 31674435 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31674444 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 31674473 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31674664 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31674693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31674835 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31674971 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 31675013 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 31675015 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31675029 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 31675031 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 31675047 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31675293 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 31675324 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 31675379 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31675465 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 31676403 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 31676432 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 31676839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31677175 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 31677385 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31677821 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 31677873 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31677902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31678030 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 31678033 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 31678468 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 31678494 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 31678615 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 31678847 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 31678856 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 31679057 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31679400 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 31679604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31679683 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 31679886 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 31680009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31680549 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31680813 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31680976 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31681078 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31681855 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 31681909 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 31682106 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 31682179 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 31682189 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 31682308 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 31682315 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 31682938 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31683623 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31684260 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 31684885 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31684981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31684998 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31685061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31685209 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 31685259 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 31685323 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 31685357 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 31685387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31685419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31685511 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31685533 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31685552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31685558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31686275 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31686727 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 31687314 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31687786 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31687857 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 19 31688492 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 31688495 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 31688552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31688559 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31688614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31688663 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 31688921 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31689158 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 31690609 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31693274 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31693711 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31693867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31694049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31694907 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31695038 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31695564 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31695611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31695707 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 31695746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31695778 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 31695898 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 31695913 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31696060 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31696138 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 31696311 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 31696560 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31696645 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31696649 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 31696788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31696864 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 31696882 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 31696930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31696943 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 31697025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31697532 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 31697798 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 31698656 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 31699461 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 31699685 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31699708 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 31699765 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31699863 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 31699893 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 31699897 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31699929 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31700030 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 31700214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31700269 C G Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 31700320 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 31700587 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31701224 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31701479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31701501 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31701622 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31702257 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 31702279 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 31702634 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 31702911 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 31703026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31703061 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31703137 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31703370 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 31703441 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 31703447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31703571 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 31703618 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 31703748 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31703876 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31703934 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31703993 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31704045 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31704066 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 31704073 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 31704117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31704214 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 31704396 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 31704630 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31704838 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 31704901 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 31704911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31704912 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31704937 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 31704955 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31704963 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31705309 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 31705327 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 31705350 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 31705415 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 31705707 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 31707442 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 31707553 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 31707610 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 31708180 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31708224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31708229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31708251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31708520 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31708753 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31708765 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31708875 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31709015 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31709381 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31709465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31709514 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31709760 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31709772 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31709776 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31709875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31709883 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31709913 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31709916 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31710064 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31710065 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31710077 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31710340 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31710779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31711087 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31711091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31711099 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31711112 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31711133 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31711342 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31711429 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31711553 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31711559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31711594 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31711708 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31711738 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31711848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31711958 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31711994 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31712017 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31712030 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31712239 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31712284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31712714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31713134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31713149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31713191 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31713498 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31713543 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31713588 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31714810 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31715226 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31715321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31715327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31715559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31715849 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31716504 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31716577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31716603 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31716888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31717138 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31717248 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31717439 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31717440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31717901 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31718015 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31718020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31718062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31718113 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31718259 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31718273 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31718274 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31718291 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31718324 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31718587 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31718619 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31718840 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31718911 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31719012 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31719139 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 31719256 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31719279 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31719364 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31719714 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31720560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31720615 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31720616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31721046 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31721060 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31721918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31722070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31724758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31728020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31728777 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 19 31728823 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 31728824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31729261 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31730390 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31730450 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 31730749 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31730877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31730974 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 31731432 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 31733088 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31733114 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 19 31733394 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 31733605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31737276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31738950 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31739745 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31741277 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31742784 T G N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 31744016 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31744410 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31744570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31746574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31748249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31749174 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31749834 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 31749939 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31751288 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31753881 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 31757259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31770597 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31770598 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31771327 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31772887 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31773308 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31773495 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31773496 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31773641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31773645 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31773732 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31774058 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31774127 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31774238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31774407 C G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31774578 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 31774628 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31775676 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31776072 T G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31776095 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31776400 G A Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 31776618 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 31776664 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31776673 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31776735 T A Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 31776762 A T Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 31776918 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 31777009 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31777041 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 31777244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31777319 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31777373 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 31777399 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31777479 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31777658 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31777890 G T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31777942 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31778016 G C Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 31778021 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 31778049 A T Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 31778060 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 31778169 G A Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 31778255 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 31778326 T C Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 31778354 T G Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 31778446 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31778467 A C Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 31778569 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31778597 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31778600 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31778709 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31778753 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31778929 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31778974 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31779160 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31779393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31779460 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31779581 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 31779677 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31779751 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31779769 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31779781 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31779991 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31780352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31780407 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31781531 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31781990 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31786792 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 31788212 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31792281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31792490 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31792578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31792637 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31794081 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31794531 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31794728 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31795988 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31796136 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31796184 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31796476 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31796648 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31805529 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31808447 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31808541 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31808544 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31811232 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31811268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31811278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31811393 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31811450 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31811452 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31811549 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31812890 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31814002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31814748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31815382 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31817642 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31817924 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31818257 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31818440 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31818696 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31818713 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31818747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31818760 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31818898 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31819163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31819276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31819312 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31819394 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31819399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31819520 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31820361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31820492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31820508 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31820514 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31820596 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31820625 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31820631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31820642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31822627 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31823641 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31824078 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31825871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31825872 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31827256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31830217 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31832292 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31834879 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31835424 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31836696 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31838009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31838423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31838564 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31838844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31839360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31839645 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31839670 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31842848 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31843081 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31843350 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31844423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31844875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31845528 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31851840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31853403 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31855201 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31855217 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31857025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31858725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31860107 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 31862013 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31862526 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31862755 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31863077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31865310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31866363 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31866641 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31868881 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31868958 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31869273 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31870115 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31874027 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 31875226 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31876139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31876662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31876831 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31877402 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31878461 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31880080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31880219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31881506 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31881662 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31882590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31883667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31884336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31884386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31884408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31884423 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31884485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31884509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31884551 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31885181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31885874 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31886976 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31887438 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31887862 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31888496 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 31888568 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 31888871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31888903 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31889248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31889489 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31890052 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31890380 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31890827 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31890892 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31891393 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 31891405 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 31891417 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 31891444 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31893362 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31893541 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31896074 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31896228 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 31896330 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31897340 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31897526 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31898200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31900876 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 31901377 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31901667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31902247 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 31902609 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31902762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31902921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31903041 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31903147 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 31904229 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31905129 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31905736 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31905748 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31905822 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31905905 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31906065 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31906352 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 31906562 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 31907202 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31907285 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31907604 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31907673 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31907783 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31907815 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31907988 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31908034 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31908135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31908136 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31908145 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31908190 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31908350 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31908391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31908437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31908471 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31908615 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31908993 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31909926 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31910046 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31911165 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 31911729 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 31911752 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 31916469 G T N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.133333333333333 0.666666666666667 0.2 14 16 2 10 3 19 31916482 C G N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 19 31916516 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 31916547 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 31916579 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 31916583 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 31916591 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 31916674 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 19 31916730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31916829 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 31916928 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 31916942 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 31916985 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 31916996 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 19 31917023 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 31917868 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 31917869 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 31917912 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31917941 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 19 31917956 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31918118 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31918482 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 31918622 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 31918660 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31918858 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31919137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31919146 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31919242 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31919274 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31919288 G A Y Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.0666666666666667 0.733333333333333 0.2 13 17 1 11 3 19 31919292 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31919375 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 31919583 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31919600 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31919830 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31920014 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 19 31920495 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 31920746 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31921744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31922204 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 31922706 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31923174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31923624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31924485 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31924493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31924499 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31924529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31924599 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 31924629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31924983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31925279 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 31925313 T C Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 19 31925325 C A Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 19 31925348 T A Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 19 31925450 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31925495 G A Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 19 31925543 T C Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 19 31925555 C T Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 19 31925642 C A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 31925731 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 31925878 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 31925926 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 31926256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31927135 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31927159 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31927261 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31927305 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31927336 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31927356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31927388 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31927401 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31927405 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31927477 C A Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 19 31927480 T C Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 19 31927518 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 19 31927638 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31927639 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31927643 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 31927687 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 19 31927742 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31927743 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31927773 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 19 31927805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31927861 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31927875 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 19 31927877 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 19 31928727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31928982 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 31929284 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31936368 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31936762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31937999 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31938521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31938686 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31938774 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31938840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31939048 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31939083 G C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31939085 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31939092 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31939094 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31939378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31939537 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31939542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31939573 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31939584 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31939595 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31939707 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31939789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31939843 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31939896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31939934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31940324 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 31942071 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31942451 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.1875 0.6875 0.125 17 15 3 11 2 19 31942584 T C N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 19 31942625 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 19 31943549 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 19 31945078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31945731 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 31946349 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31946774 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 31946859 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 31947401 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 31947518 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 31947780 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31948694 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 31948701 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 31948873 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 31949065 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31949399 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 31949591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31949592 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 31949876 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 19 31949902 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 31949915 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 31950020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31950200 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 19 31950510 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31950530 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31950547 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31950560 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31950644 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31950684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31950782 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31950786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31950820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31950825 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31950865 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31950930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31950962 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31951001 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31951019 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31951083 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 31951282 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 31951284 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31951412 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31951447 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 31951499 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31951528 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31951617 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31951622 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31952029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31952272 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31952697 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31952720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31952727 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31952773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31952792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31952856 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31952894 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31952924 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31952931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31953115 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31953244 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31953280 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31953303 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31953467 G C Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 31953478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31953513 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31953612 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31953620 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31953637 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31953667 C G Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 19 31953668 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 19 31953681 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31953736 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 19 31954077 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 31954161 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31954291 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31954386 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31954709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31954739 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31956906 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 31958165 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 31959027 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31959470 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31959546 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31960324 T A Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 19 31960725 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31960824 C T Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 19 31960976 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 31961012 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 31961028 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 31961165 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31961233 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31961236 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31961272 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31961275 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 31961335 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31961558 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31961579 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 31961615 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31961618 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31961712 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31961784 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31961832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31961954 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31961962 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31961964 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31962057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31962123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31962232 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31962269 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31962271 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31962275 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31962359 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31962429 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 31962734 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31962928 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 31962930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31962990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31962995 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 31963210 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31963388 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31963580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31963631 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31963642 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31963706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31963708 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31963750 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 31963827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31963840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31963923 C T Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 31963943 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31963994 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 19 31964020 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31964045 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31964066 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 31964088 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31964111 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 19 31964152 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31964164 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 19 31964183 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 31964239 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 31964240 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 31964454 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31964725 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31964812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31964853 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 31964871 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 31964882 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 31964887 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 19 31964971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31964975 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 31964992 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 31965227 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31965606 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31965608 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31965658 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31965714 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31966033 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31966127 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31966371 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31967122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31967445 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 19 31967456 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 31967483 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 31968063 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31968152 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31968561 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31970407 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31970497 A G Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 19 31970503 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 19 31970544 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 31970545 G A Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 19 31970903 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31970909 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 31970925 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31971070 A G Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 19 31971174 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31971733 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31972014 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31972977 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31973293 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 31973315 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 31973371 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 31973441 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 31973474 C A Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 31973481 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 31973506 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 31973556 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 31973558 C G Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 31973562 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 31973593 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 31973611 C G Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 31973620 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 31973627 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 31973657 A C Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 31973670 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31973696 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 31973885 C G Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 31973912 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 31973997 G C Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 31974049 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31974059 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31974129 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 31974209 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 31974219 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 31974334 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 31974386 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31974657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31974700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31975003 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 31975004 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 31975114 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 19 31975267 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31975268 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31975362 A C N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 19 31975381 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 19 31975632 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 31975665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31975765 A T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 19 31977548 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31977934 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31978132 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31980028 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 31980796 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31980802 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31980816 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 31980910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31981014 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 31981151 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31981188 A C Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 31981564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31981716 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 31981738 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 31981881 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31981892 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 31981905 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 31982000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31982009 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 31982102 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31982238 A G Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 31982239 T C Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 31982701 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31982888 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31982987 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 31982991 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 31983146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31983439 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 19 31983468 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 31983481 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 31983487 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 31983499 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 31983512 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 31983665 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 31984308 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31984471 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31984477 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 19 31984572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31985768 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31985856 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 31985948 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 31986430 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31986435 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31986619 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31986620 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 31986629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31988075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31988649 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31989069 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 31989080 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 31989511 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 31989525 C A Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 31989570 C T Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 31989591 A T Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 19 31989601 T A Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 31989889 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 31990379 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 31990630 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31990772 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31990821 A T Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 31990822 A T Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 31992069 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 31992114 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 31992509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31992626 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31992796 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 31992805 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 31992823 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31992958 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31993042 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31993065 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31993088 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31993133 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31993755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31993842 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31993950 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31994004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31994513 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 31994517 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31994527 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31994590 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31994733 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31996018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31996438 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 31997182 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31997330 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 31997427 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 31997864 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31998089 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31998373 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31998376 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31998442 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31998699 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31998735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 31998960 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 31999673 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 32002255 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32002372 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 32002687 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 32002758 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 32003107 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32003567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32003637 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32004200 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32005405 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 32006148 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32006333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32006417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32006540 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32008735 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 32009390 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32010032 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 32011070 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32011522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32019528 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32019728 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32019789 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 32019875 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32020114 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32020133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32020493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32020736 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32020768 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32021756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32021781 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32021814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32022001 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32022078 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32022342 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32022657 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32022676 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32022680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32022725 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32022816 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32022825 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32022830 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32022840 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32022890 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32022975 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32022986 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32023095 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32023101 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32023305 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32023311 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32023327 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32023348 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32023361 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 32023432 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32023585 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32023616 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32023778 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32023817 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32023841 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32023861 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32023902 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32023979 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 32024020 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 32024027 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 32024045 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 32024054 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 32024182 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 32024222 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 32024252 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 32024272 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 32024401 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 32024424 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32024437 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32024468 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 32024516 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 32024934 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32024962 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32024979 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32025184 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32025453 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 32025558 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 32025560 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 32025586 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32025968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32027453 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32028714 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32029076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32029254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32029958 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 32030297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32030932 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 32031101 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 32031119 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 32031135 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 32031178 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 32031289 T A N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 19 32031298 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32031316 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32031342 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 32031365 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 19 32031426 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 32031429 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 32031684 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 32031746 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32032251 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 32032252 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 32032260 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 32032390 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 32032710 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32032975 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32033034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32033040 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32033046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32033270 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32033348 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32033350 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 32033469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32033608 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 32033802 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 32034221 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 32034256 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32034272 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32034296 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32034301 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32034305 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32034519 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 32034522 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 32034592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32034733 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 32034835 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 32034915 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 32035037 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 32035224 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 32035316 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 32035634 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32035646 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 32035648 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 32035771 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 32035793 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 32035861 T C N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 19 32035868 C T N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 19 32035904 A C N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 19 32035937 C G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 32035938 T A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 19 32036152 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 32036528 C A N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 19 32036539 C G N N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 19 32036562 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 19 32036590 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 32036758 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 32036959 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 32037036 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 32037068 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 32037284 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 32037323 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 32037340 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 32037369 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 32037433 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 32037446 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 32037480 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 32037482 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32037535 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 32037647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32037680 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32037800 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32037865 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 32037870 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 32037872 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 32038140 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 32038793 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 32038804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32039544 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 32039589 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 32039650 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 32039676 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 32039723 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 32039725 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 32039847 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 32039929 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 32039941 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 32039957 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 32040544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32040765 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 32040773 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 32040809 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 32040862 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 32041173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32041351 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 32041466 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 32041631 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 32042130 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 32042447 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 32042454 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 32042728 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 32042776 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32043384 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 32043396 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 32043397 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32043578 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 32043701 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 32043726 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 32043784 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 32043852 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32043884 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32043957 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 32044039 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 32044222 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 32044504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32044599 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 32044640 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 32044648 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 32044686 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 32044736 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 32044742 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 32044808 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32044867 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 32045244 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 32045274 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 32045313 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 32045823 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32046123 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 32047059 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32047534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32048022 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32048112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32048251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32048448 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 32048524 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32048749 C A Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 32049692 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 32050232 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32050673 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 32051584 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 32052395 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32052871 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 32053232 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32053553 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32053761 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 32055036 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32055223 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32055539 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 32055859 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32056136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32056500 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 32056773 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32057000 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32059732 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32061935 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 32062053 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 32062199 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 32062227 T A Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 32062260 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 32062336 A C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 32062404 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 32062532 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 32062591 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 32062601 G A Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 19 32062719 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 32062728 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 32062729 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 32062749 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 32062750 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 32062814 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 32062868 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 32062998 T G N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 19 32063117 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 32063137 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 32063287 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 32063356 C T N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 19 32063458 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 32063733 C A Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 32063781 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 32064128 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 32064139 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 32064151 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 32064229 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 32064249 T A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 32064340 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 32064411 A T Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 32064414 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 32064567 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 32064620 C A Y N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 19 32064804 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 32064809 A T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 32064996 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 32065029 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 32065031 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 32065057 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 32065124 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 32065134 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 32065165 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 19 32065176 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 32065206 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 19 32065254 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 32065287 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 32065320 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 32065321 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 32065657 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 32065690 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 32065759 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 32065770 A T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 32065811 T A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 32065911 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 32065917 C A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 32065940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32066192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32066664 A G Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 32067204 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32067210 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 32067232 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 32067448 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 32067460 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 32067491 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 32067551 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 32067608 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 32067791 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 32067798 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 32067800 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 32067856 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 32067958 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 32068081 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 32068140 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 32068148 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 32068150 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 32068184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32068556 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 32068604 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 32068619 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 32068841 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32069093 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 32069259 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 32069264 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 32069613 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 32069630 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 19 32069788 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32069919 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32069951 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 32069960 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 32070616 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32070706 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 32071004 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 32071025 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 32071079 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32071127 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32071238 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32071259 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32071317 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32071606 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32071813 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32072529 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32072734 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 32072780 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 32073059 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32073061 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32073462 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 32073513 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32073574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32074055 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 19 32074252 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32074261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32074271 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 32074404 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 32074405 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 32074423 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32074464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32074608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32074685 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32074748 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32074781 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32074783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32074838 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 32074891 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 32074901 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 32074976 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32074997 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 32075000 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 32075007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32075012 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 32075042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32075088 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 32075115 T G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 32075160 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32075228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32075235 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32075280 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 32075368 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 32075467 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 32075577 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32075597 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 19 32075611 T C Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 32075615 G T Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 32075626 A G Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 32075647 A T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 32075653 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 19 32075654 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 32075811 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 32076030 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32076053 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32076279 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 32076890 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 32076950 G C Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 32077207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32078127 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32078512 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 32078870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32082501 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32083588 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 32084522 G A Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 19 32084671 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 32085996 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 32086270 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 32086316 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 32087258 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32088084 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 32088169 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32088216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32088310 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 32088518 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32088593 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 32088600 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 32088661 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32088737 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32088861 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 32088870 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32088881 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 32088990 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 19 32089075 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 32089174 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32089175 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32089197 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 32089222 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32089225 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32089234 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32089251 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32089283 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32089337 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 32089374 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 32089377 C A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 32089460 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32089687 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 32089693 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32089747 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32089800 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32089811 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 32089826 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 32089929 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 32089943 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32089969 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32089980 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32090042 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 32090125 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 32090239 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32090914 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 32090929 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 32091133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32091153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32091580 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 19 32091734 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32091795 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 32091810 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 32091943 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 32092114 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 32092901 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 32092969 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 32093009 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 32093012 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 32093038 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 32093093 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 32093125 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 32093396 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32093523 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 32093552 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 32093564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32093585 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 32093645 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 32093686 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 32093751 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 32093845 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 32094345 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 32094362 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 32094629 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 32094915 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 32095261 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 32095753 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32096241 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 32096594 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 32096666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32096692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32096730 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 32097249 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32097283 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 32097327 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 32097360 A G Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 32097497 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32097540 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 32097648 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 32097660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32097749 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 32098045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32098262 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 32098288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32098836 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 32099564 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 32099566 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 32099577 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 32099598 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32099663 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 32103766 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32103786 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32104831 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 32105319 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 32105569 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 32105570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32105649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32105695 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 32105830 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 32105878 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 32105907 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32105969 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 32106051 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 19 32106058 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32106453 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 19 32106591 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32106777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32106858 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32107043 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32107052 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 32107451 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32114699 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 32114838 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 32115036 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 32115124 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 32115978 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32116012 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 32116018 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 32116049 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 32116077 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 19 32116092 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 32116114 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 32116121 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 32116222 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 32116228 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32116921 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32117762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32118070 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 32118157 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32118223 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32118249 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 32118733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32118826 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 32118845 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 32118951 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 32118975 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 32119034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32119059 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 32119256 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 32119448 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32119465 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32119615 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32119652 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32119787 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32119919 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32120367 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32120887 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32120918 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32120920 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32121028 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32121141 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 32121147 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 32121190 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 32121243 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 32121479 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32121642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32121701 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 32121712 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 32121978 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32122001 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 32122059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32122243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32122279 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32122299 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32122479 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32122621 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 32122629 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32122645 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 32123099 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 32123500 G T N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 32123867 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 32124807 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 32126322 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 32126325 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 32126328 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 32126809 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 32127114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32129003 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 32130939 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32131062 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 32132224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32132251 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32135787 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32137572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32137640 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32137732 T G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 32137733 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 32138725 C G N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 32139759 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32141894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32143178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32143831 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32145518 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32146166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32146598 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32146691 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32146733 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32146795 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 19 32146835 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32146998 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 32147016 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 32147088 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32147278 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32147395 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32147777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32147927 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32148191 C A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32148280 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 32148472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32148646 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32148687 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32148694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32148826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32148837 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32148840 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32148902 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32149106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32150655 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32151197 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32151673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32151678 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32152337 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 32152370 A T Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 32152479 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 32153049 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32153358 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 32153495 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 32153629 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 32153646 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 32153647 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 32153670 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 32153739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32154096 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 32154295 C G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32154300 G T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32154365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32154403 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32155779 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32155780 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 32155789 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32155928 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 32155943 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 32156091 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32156443 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 32156562 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 32156742 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 32157017 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 32157039 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 32157088 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 32157170 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 32157297 A G Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 32157398 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 19 32157404 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 32157419 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 32157472 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 19 32157717 A G Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 19 32157812 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 32157832 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 32157846 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 32158135 T G Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 32158327 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 32158445 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 32158453 C A Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 19 32158519 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 32158562 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 32158606 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 32158631 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 32158671 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 32158693 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 32158714 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 32158838 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 32158848 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 32158902 C A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 19 32158903 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 19 32159015 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 32159022 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 32159122 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32159341 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 32159395 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 32159396 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 32159574 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 32159578 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 32159790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32161731 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 32162045 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 32162269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32162360 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 32162626 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 32162703 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32162886 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 32162953 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32163502 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 32163606 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 32163612 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 32164289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32164337 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 32164358 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32164864 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32164879 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32164932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32164994 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32165054 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32165282 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32165393 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 32165396 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32165659 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32165661 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32165826 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 32166351 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 32166788 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32166800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32166967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32167131 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32168475 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32169069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32169364 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 19 32169790 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32170020 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32170078 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 32170087 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32170108 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 32170159 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32170162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32170229 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32170446 T C Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 32170585 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32170792 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 32170990 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32171126 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 32171255 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 32171271 A C N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 19 32171287 C A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 32171736 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 32171760 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 32171776 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 32171778 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32171789 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 32171816 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 32171941 A G N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 19 32172536 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 32172640 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 32172676 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 32172756 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32172760 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 32172770 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32172779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32172918 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 32173133 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 32173144 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 32173201 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 32173301 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 32173380 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 19 32173508 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 32173532 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 32173583 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 32173605 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32173640 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 32173663 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 32173695 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 32173715 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 32173934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32174006 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 32174082 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32174347 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32174509 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32174788 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32174881 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 32174916 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 32174953 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32175301 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 32175356 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 32175366 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 19 32175452 A C N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 19 32175578 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32175922 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32175985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32176151 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 32176286 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32176302 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 32176332 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32176334 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32176405 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 32176460 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32176469 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 32176573 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 32176656 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 32176676 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 32177023 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 32177264 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 32177299 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32177641 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32177724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32177730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32177822 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 32178125 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32178129 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32178478 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 19 32178498 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32178649 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 32178865 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 32178905 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 32178965 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32178997 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 32179026 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 32179049 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 32179235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32179392 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 32179432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32179550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32179558 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 32179621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32179738 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 32179802 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 32180906 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 32181089 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 32181327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32181331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32181348 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 32181556 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32181927 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32181930 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 32182045 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 32182118 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 32182170 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 32182647 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 32182802 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32183302 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 32183327 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32183362 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 32183445 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 32183472 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32183500 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32183947 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 19 32183974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32184348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32184359 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 32184369 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 32184670 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 32184701 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 32184815 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32186694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32186770 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 32187257 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32187289 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 32189299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32189393 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 32189770 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32189804 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32189923 G A Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 32190032 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32190063 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 32190269 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32190352 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 32190526 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32190554 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 32190851 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 32190886 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32191006 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 32191122 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 32191312 T G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 32191647 A T N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 19 32191828 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32191927 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 32191998 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 32192086 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32192101 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 32192186 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 32192194 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 19 32192197 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 32192338 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 32192377 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 32192484 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 32192545 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32192714 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 32192773 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32192942 G C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 32193060 A G Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 32193079 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32193111 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 32193279 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 32193437 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 32194260 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32194661 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 32194848 G C Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 32194982 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 32195235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32195769 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 32196003 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 32196052 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32196122 T A Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 32196136 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 32196178 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 32196267 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 32196280 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 32196294 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 32196319 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 32196330 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 32196352 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 32200870 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 32200934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32201183 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 32201434 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32201564 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32201760 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32202004 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 32202039 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 32202063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32202112 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 32202223 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 32202498 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32203306 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32203313 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32203783 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 32203802 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32203927 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 32204209 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 32204233 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 32204357 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32204364 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 32204435 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 32204642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32204935 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 32205085 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 32205178 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 32205180 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 32205251 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 32205277 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 32205278 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 32205374 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 32205417 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 32205437 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 32205535 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 32205586 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 32205715 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 32207398 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 32207613 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32207629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32207702 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 32208261 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32208873 G A Y Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 19 32209148 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 32209151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32209229 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32209458 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 32209488 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 32209736 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 32209854 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 32209873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32209958 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 32210222 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 32210602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32210743 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 32212506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32212805 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 32214446 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 32214621 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 32215348 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32215520 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32215549 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 32216287 A C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 32217902 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 32219153 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 32219166 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 32220656 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 32221558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32224071 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32226448 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32226758 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32227462 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32228759 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 32228932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32229555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32231381 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 32231682 G C Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 32234488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32234843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32234954 C A Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 32234977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32235087 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 32235101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32235140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32235678 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 32236493 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 32236505 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 32237436 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 32238292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32238427 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32238615 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32239219 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 32239371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32239694 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32240050 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 19 32241050 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32241271 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32241679 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32241981 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 32242292 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 32242387 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 32242430 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 32242759 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 32243173 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 32243277 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32243855 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32244318 A T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 32244340 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 32244409 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 32244576 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 32245657 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 32246173 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 19 32246240 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 32246462 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 32246803 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 32247153 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 32247331 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 32247845 G T Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 32247910 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 32247942 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 32249401 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 32249418 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 32249532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32249574 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 32249704 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 32250085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32250223 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 32250603 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32250671 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32250706 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32250743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32250779 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 32250825 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 32250846 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32251416 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32251464 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 32251537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32252618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32252969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32253020 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32253205 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32254089 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 32254207 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 32255229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32256720 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 32256721 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 32257036 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 32257136 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 32257317 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32257342 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32257464 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32257504 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32257527 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32257531 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32257842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32257978 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 32258146 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 32258197 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 32258239 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32258261 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 32258348 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32258449 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 32258496 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32258500 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32258832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32259110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32259562 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 32260229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32260800 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 32262542 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32263308 T G Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 32263381 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 32263879 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 32264201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32264212 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 32264261 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 32264276 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 32264423 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 32264507 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32264573 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 32265203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32265399 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 32265405 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 32265743 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32265961 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 32265984 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 32266036 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32266327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32266469 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32267158 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 32267332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32267950 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32268572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32268752 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 32268922 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32269074 G A Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 32269196 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 32269197 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 32269221 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 32269330 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 32269755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32269826 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32269997 G A Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 19 32270072 A G Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 19 32270097 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 19 32270170 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 32270217 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 32270375 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32270382 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32270408 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32270552 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 32270938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32271678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32272038 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 32273148 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32273725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32273912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32273945 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32273986 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 32274023 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 32274051 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 32274148 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 32274660 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32275375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32275494 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32275591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32275775 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 32275940 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 32275999 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 32276101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32276244 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 32276612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32276943 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32285136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32286333 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 19 32286595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32288135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32288690 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32289100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32289807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32290147 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 32290169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32290337 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 32290417 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 32290445 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 32290464 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 32290488 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 32290584 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32290762 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 32290837 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 32290867 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 32290923 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 32291018 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 19 32291113 T A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 19 32291114 A C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 19 32291145 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 32291489 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32291518 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32291519 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 32292231 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 32292516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32292971 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32294049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32294058 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32294076 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32294499 C G Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 32294975 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32296959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32296962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32297342 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 19 32298078 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 32298466 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 19 32301577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32304262 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 32304654 T G Y N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 19 32304792 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32304858 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32304860 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32304920 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32304949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32304987 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 19 32305048 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32305594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32305644 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32305765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32305920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32306013 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32306938 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32307015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32308551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32309062 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 32309842 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 32309848 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32310266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32312497 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32313843 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32313947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32314457 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32314509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32315277 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32315413 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 32315607 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32315608 G A Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 32315625 T A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 32315749 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32315750 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 32315793 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 32316864 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 32317045 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32317087 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 32317117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32317320 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32317327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32317614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32317689 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 19 32317772 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 32317791 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 32317987 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 32318058 T G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 32318072 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 32318141 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 19 32318264 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 19 32318538 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 32318540 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 32318660 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32318816 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 32318915 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 32319345 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 32319975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32320681 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 32320888 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 32320891 T G Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 32320915 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 32321972 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 32324085 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 19 32324465 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 32324593 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32324716 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32325020 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32325281 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 32325827 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32327134 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32327350 T C Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 19 32327418 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 32329193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32329333 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32329339 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32330503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32330741 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32333273 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 32334047 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32334076 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 32334086 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 32334260 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 32334289 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 32334312 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 32334334 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 32334335 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 32334588 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32334677 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 32334772 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32334830 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32334832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32335405 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 32335447 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 32335490 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 32335514 A C Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 32335992 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 32336089 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32336727 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 32337398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32337771 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 32338103 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 32338462 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 32338664 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32338799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32338878 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 32338935 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 32338982 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 32339130 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 32339150 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 32339182 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32339380 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 32339388 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 32340055 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 32340292 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 32340301 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 32340304 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32340547 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 32340708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32341088 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 32341670 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 32341690 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32341702 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32341703 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32342585 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32342643 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 32343113 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 32343146 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32343255 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 19 32343264 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32343296 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 32343496 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 32343498 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32343512 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 32343745 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 32343974 T G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 32344016 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 32344049 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 32344424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32344460 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 32344842 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 32345893 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 32346247 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 19 32346467 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 26 14 12 2 6 19 32346495 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 32347182 T A Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 32347328 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 32347926 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 32348214 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 32348534 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 32348830 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 32348841 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 32348972 A C Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 32349053 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 32349121 G T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 32349242 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 32349714 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32349821 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 32350061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32350086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32350161 T G Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 32350392 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32350476 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32350964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32352165 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 32352336 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 32352393 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32352467 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 32352493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32352558 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 32352667 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32353462 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32353504 T G N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.333333333333333 0.2 0.466666666666667 13 17 5 3 7 19 32353671 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32353875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32353983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32354087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32354563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32354723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32355089 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 32355187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32355259 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32355300 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 32355567 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 32355790 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 32356142 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.315789473684211 0.0526315789473684 0.631578947368421 13 25 6 1 12 19 32356319 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 32358531 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32362086 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32363396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32364077 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 32364125 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 32364207 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 32364383 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 32364624 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32365424 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 32365477 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 32365930 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 32367751 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 32367906 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 32368991 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32369025 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 32369711 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32371347 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32372798 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 32374556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32374668 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32375170 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 32375504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32375527 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32376268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32376552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32379105 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32379106 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32379112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32379378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32379385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32381020 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 32381315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32383319 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 32383328 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 32383361 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 32383395 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 32383482 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 32383945 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 32383965 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32384663 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 19 32384757 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 32384862 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 32384980 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 32385552 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 32385600 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 32385603 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 32385611 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32385616 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 32385668 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 32385679 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 32385756 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 32385772 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 32387306 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 32387763 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32387772 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32387807 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32388124 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32389497 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 32390715 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 32391568 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 32392513 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32392690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32394567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32395554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32396034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32397297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32397514 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 32397515 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 32398813 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32401872 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 32401939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32402162 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32402395 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 32402922 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32404403 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32404926 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32406781 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 32407375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32407384 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 32407546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32407620 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 32407895 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 32408937 A G N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 19 32409373 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32410877 T C N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 19 32410953 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 32411294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32411638 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32411697 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32413328 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32413752 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32414019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32414740 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32415554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32416174 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32417588 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32417642 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32423538 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 32424343 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32424857 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32425071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32425133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32426399 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32427805 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 32427984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32429330 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 32429681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32430085 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 32430267 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32430656 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 32430798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32430974 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32433224 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32435251 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 32435406 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32435576 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 32435598 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 32435754 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 32436112 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 32436147 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 32436292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32436541 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 19 32436691 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 32437003 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 32437020 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 32437076 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 32437107 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 32437113 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 32437162 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 32437328 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 32437347 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 32437441 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 32437509 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 32437832 C A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 32437859 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 19 32437861 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 19 32438168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32438889 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32439215 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 32439238 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32439322 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 32439343 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 32439374 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 32439716 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 32439734 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32440409 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 32440523 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 32440611 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 32440624 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 32440827 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 32440863 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 32441179 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 19 32441185 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32441403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32441526 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 32441599 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 32441754 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 32442207 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32442270 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32442352 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32442356 C G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 32442358 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 32442446 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 32442449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32442465 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 32442472 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32442588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32442828 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32443432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32443664 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32443715 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 32443805 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 32444039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32444729 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 32444890 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32444905 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 19 32445558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32445794 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 32445907 A G Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 19 32446146 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 32446638 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 32446954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32447296 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 32447535 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 32447827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32447836 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32448514 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 32449097 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 32449779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32450322 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32450445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32450923 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32452180 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32452182 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32452196 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 32452533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32453616 A G Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 32453740 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 32454260 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 32454591 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 32456119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32456651 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32458477 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32458542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32458564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32458628 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32458636 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32460277 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32461305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32461866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32463255 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 32463326 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 32463488 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 32463572 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 32463634 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32463722 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32463770 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32463968 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 32465087 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 32465110 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 32465355 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 32465646 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 32465839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32466186 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 32467367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32468026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32468292 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 32468324 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 19 32468346 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32468443 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32468914 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32469153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32469313 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 32470125 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32470213 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32470252 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32470359 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32470370 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32470386 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 32470441 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 32470491 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 32470861 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32470862 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32470943 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 32470950 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32470963 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32471013 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 32471051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32471084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32471107 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32471337 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32471356 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32471363 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32471477 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32471490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32471533 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32472630 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 32473869 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32475310 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32476840 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 32476910 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32476953 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32477668 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 32477682 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 32477772 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 32477893 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32477919 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 32477920 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 32478025 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32478029 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 32478080 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 32478088 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 32478103 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 32478121 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 32478442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32478460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32478470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32478541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32478636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32478728 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32478736 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 32478786 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 32479004 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32479102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32479218 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 32479306 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 19 32479688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32479824 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 32479854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32479886 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 32479930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32480298 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32480415 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 32480473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32480575 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 32480745 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 32480985 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 32480986 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 32481128 T C Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 32481144 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 32481911 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 32482112 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 32482196 G T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 19 32482692 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 32483398 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32484464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32486593 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 32486612 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 32486632 G A N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 19 32486650 C T N Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.5 0 0.5 8 8 4 0 4 19 32486652 T C N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.25 0 0.75 4 12 2 0 6 19 32487095 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 32487140 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 32487212 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 32487241 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 32487248 T A N N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.25 0 0.75 4 12 2 0 6 19 32488036 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 32489170 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32489314 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32489497 A G Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 32489524 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32489649 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 32489987 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32490144 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 32490156 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32490501 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32490537 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32490637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32491192 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32492449 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32492558 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32492578 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32492604 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 32492709 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 32492715 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 32494042 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 32494129 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32494871 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32497890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32499633 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 32499824 C T Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 19 32500349 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32500954 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 32501030 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 32501191 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 32501473 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32504747 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 32504755 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 32505090 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 32505120 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 32505135 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 32505139 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 32505174 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32505247 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 32505406 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 32505622 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 32505646 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 32505781 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 32506032 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 32506184 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 32506476 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 32506775 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 32506807 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 32506812 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 32506947 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 32506990 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 32507348 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32507470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32507478 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32507599 C G Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 32507692 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 32507706 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 32508089 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 32508177 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 32508190 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 19 32508213 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32508321 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 32508352 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32508365 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 32508382 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 32508446 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32508455 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 32508542 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32508647 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32508698 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 32508718 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 32508780 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32508809 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32508835 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32508849 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32508933 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 32508959 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 32508976 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.210526315789474 29 9 14 1 4 19 32509039 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 32509044 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 32509063 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32509070 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 32509105 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 32509163 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32509166 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 32509273 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 32509294 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 32509379 T G Y N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.272727272727273 15 7 7 1 3 19 32509436 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 32509441 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 32509522 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 32509569 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 32509774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32509804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32509864 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 19 32510026 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32510160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32510373 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 32510416 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32510479 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 32510637 T C Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 19 32510690 A T Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.214285714285714 21 7 10 1 3 19 32510733 A T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 32510774 T A N N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 12 12 3 6 3 19 32510776 G C N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 19 32511103 A T N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.428571428571429 0.214285714285714 0.357142857142857 15 13 6 3 5 19 32511119 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32511122 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 19 32511197 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 32511357 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 32511390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32511564 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32511569 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 32511654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32511731 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32511763 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 32511769 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 32511808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32511840 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 32511851 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 32511877 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 32511884 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 32511904 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 32511946 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32511952 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32512017 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 32512297 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 32512395 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 32512400 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32512427 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 32512630 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 32512665 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32512815 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 32512967 A T Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 32513053 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 32513254 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 32513886 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 32513954 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 32513983 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 32514016 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 32514062 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 32514226 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 32514399 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 32514490 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 32514560 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 32514566 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 32514610 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 32514678 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 32514987 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32515213 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 32515572 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 32523719 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32525478 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32525783 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 32527957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32528062 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32528084 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 32530289 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32530401 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32530422 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32530555 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32530774 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 32531332 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32531350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32531426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32531547 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 32531786 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 32531811 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 32532613 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32532807 A T N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 19 32532827 A T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 19 32532846 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 19 32532861 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 19 32532884 T C N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 19 32533176 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 32533183 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 32533184 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 32533288 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 32533491 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 32533568 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 32533684 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 32533747 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32533900 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 32533905 A G N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 19 32534003 G C N N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0 0.6 0.4 6 14 0 6 4 19 32534204 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 32534220 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 32534298 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 32534430 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 32534565 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 32534634 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 32534661 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 32535235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32535623 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 32535628 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 32536035 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 32536217 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 32536218 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 32536283 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 32536285 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 32536308 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 32536426 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 32536482 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 32537116 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 32537310 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32537381 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32537383 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 32537516 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32537542 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 32537652 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 32537683 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32537701 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 32537743 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32537762 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32537771 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32537775 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32537821 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32537890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32537915 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 32538031 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32538036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32538115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32538146 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 32538557 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 32538624 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32542004 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 32543722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32543739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32544969 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32546394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32546961 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32547255 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32548409 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32550475 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 32550792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32550998 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 32551387 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 32551499 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 19 32554093 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 32554517 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32555020 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32556122 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 32556626 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 32556650 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 32557839 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 32558027 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 32558186 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32558877 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 32558884 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 32559119 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32559646 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32561874 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 32562008 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32562211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32562278 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 32565289 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32565292 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 32565376 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 32565731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32566138 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32566382 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32568653 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 32569306 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 32572272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32575117 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32578485 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 32583042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32583085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32584816 A T Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 32589122 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32589959 A C N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 19 32590780 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 32595232 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32597401 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 32597474 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 32597535 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32597828 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 32597830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32598671 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 32598696 T C Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 32598812 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32598848 T G Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 32599293 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 32599398 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32601189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32602306 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 32602307 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 32602452 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 32603810 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32603844 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 32604051 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 32604118 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 32604396 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 32604410 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 32604552 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 32604594 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 32604604 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 32604640 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 32604647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32604697 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 32604801 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 32604807 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 32605115 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 32605187 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 19 32605402 T C N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 19 32606060 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32606550 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 32606592 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 32606593 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 32606610 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 32606623 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 32607198 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32607669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32607873 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 32607920 G T Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 32608054 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 32608366 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 32608803 A C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 19 32609151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32610561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32610887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32611253 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32611744 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32613744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32614616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32615137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32615147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32615225 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32615879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32615937 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32617447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32618335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32619014 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32619366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32619375 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 32619478 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 32621796 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 32621865 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32621884 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 32622085 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32622633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32622805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32623121 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32623394 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 32623746 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 32623768 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 32623784 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 32623848 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 32624116 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 32624346 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 32624402 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 32624531 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 32624702 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32624813 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 32624833 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 32624885 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32625296 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32625870 C A N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 19 32625999 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32626121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32626144 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 32626247 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32627984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32628021 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32628048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32628458 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32628666 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32628864 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32631435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32631620 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 32631908 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 32631935 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32631950 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32631961 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 32631966 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32632289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32632308 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 32632364 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32633513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32633543 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32633626 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32633636 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 32633638 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 32634059 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32635345 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32636603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32643882 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 32644144 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 32644641 A C N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 32645063 T A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 32645843 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 32645953 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 32645966 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 32645974 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 32646117 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 32646189 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 32646204 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32646317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32646374 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 32646428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32646431 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 32646439 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 32646562 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 32646592 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 32646728 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 32646860 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 32647030 T A N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 19 32647078 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32647192 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 32647274 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 32647318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32647496 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 32647506 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 32647540 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 32647549 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 32647615 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32647639 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32647717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32647746 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32647754 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32648077 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32648078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32648108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32648117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32648463 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 32648474 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32648550 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32649041 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32649103 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 32649124 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32649151 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 32649223 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 32649301 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 32649310 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32649321 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32649336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32649441 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32649474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32649569 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32649624 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 32649758 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32649775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32649850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32649891 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32649901 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32649926 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32649999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32650012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32650025 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 32650038 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 32650082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32650095 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 32650106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32650108 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32650117 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32650126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32650162 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32650175 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32650250 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32650981 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32651186 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 32651233 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32651282 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32651348 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32651400 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 32651419 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 32651617 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32651782 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32651900 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32651984 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32652011 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32652122 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 32652214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32652703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32653765 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32653924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32653971 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32654340 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 32654772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32655857 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 32656195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32656208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32656394 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 32656682 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32656701 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32658784 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32660884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32660919 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32661070 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32661134 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32661827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32662276 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32663161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32665140 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 32665326 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32665413 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32667913 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32668154 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32668700 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32668850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32669231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32669612 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32669683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32669952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32669956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32671215 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 32671244 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 32671260 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 32671383 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 32671401 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 32671451 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 32671524 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 32671815 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32672167 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 32672204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32672207 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 32672325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32672441 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 32672501 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 32672570 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32672615 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 32672627 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 32672643 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32673074 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 32673081 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 32673376 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32673378 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 32673379 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 32673468 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 32673503 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 32673531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32673710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32673787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32673957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32674228 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 32674398 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32674513 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 32674528 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 32674736 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32675085 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32675184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32675423 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32675478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32675964 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 32677150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32677520 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32679165 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 32679187 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 32679509 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 32679653 G C Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 32679678 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 32679782 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32681107 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32682087 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32682527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32682964 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 32683107 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 32683410 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 32683482 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32684276 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 32685253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32685430 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 32685744 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32685762 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32685768 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 32685802 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32686228 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32686843 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32689731 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32689882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32690050 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32690078 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32690113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32690266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32690283 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32690547 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 32690786 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 32690988 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32691123 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32691963 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 19 32691986 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 32692410 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 32692711 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32693241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32693258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32693280 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32693323 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32693386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32696817 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32696879 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32697929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32697970 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32698077 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32698498 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 32699302 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32699402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32699664 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 32699693 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32700248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32700418 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32700472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32700503 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32700504 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 32700868 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 32701400 T A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 32701682 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 32702121 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32702240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32702598 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 32703328 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 32703896 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 32703912 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32703915 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 32704241 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 32704247 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 32704275 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 32704340 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 32705584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32706132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32706204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32706663 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 32706732 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 32706782 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 32706890 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32707059 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32708079 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32708330 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 32708760 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32709055 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 32709371 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32709406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32709490 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 32709492 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32709586 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 32709793 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 19 32709805 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32709806 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32709901 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 32710174 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 32710358 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32710359 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32710487 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32710840 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 32711006 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32711164 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 32711187 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32711246 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 32711370 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 32711603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32712468 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32712475 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32712911 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32712981 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 32713474 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 32713693 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32713695 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 32713888 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 32713890 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 32713892 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 32714435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32714532 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 32714733 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 32714745 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 32714760 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 32714955 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 32715063 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 32715183 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 32715297 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 32715530 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 32715539 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 32715712 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 32715738 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 32715744 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 32715752 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 32715767 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 32716130 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 32716136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32716165 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 32716436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32716460 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 32716468 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 32716564 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32716695 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32716715 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32716750 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 32716754 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32716899 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 32717045 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 32717069 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 32717159 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 32717207 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32717243 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 32717290 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32717309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32717459 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 32717620 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 32717769 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 32717836 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32717945 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32717996 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 32718030 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 32718124 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 32718165 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 32718381 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 19 32718599 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 32718684 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 32718963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32719179 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 32719236 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 32719463 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32719467 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32719682 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 32720024 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32720027 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 32720083 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 19 32720230 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 32721714 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 32722299 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 19 32722417 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 32722977 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32723267 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32723392 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32723848 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32723981 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32724314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32724795 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 32728520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32731622 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 32732151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32733101 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 32733520 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32734005 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32734348 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32735885 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 32737899 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 32737901 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 32738179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32738206 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32738420 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 32738513 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 32738683 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 32738928 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 32740323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32741458 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32742265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32742764 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 32744880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32747539 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32748025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32748185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32751444 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32751537 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32754464 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32754697 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32754869 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32754965 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32758839 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 19 32759051 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32759131 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32759270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32759700 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32760044 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32760120 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 32760259 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32762443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32765739 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32765948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32766525 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 32766902 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 32767908 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32768883 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32770420 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32771159 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32773951 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32774725 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 32775081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32775429 T C N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 19 32775444 C A N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 19 32775445 T C N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 19 32775669 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 19 32776189 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 32776204 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 32776380 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32776855 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 32776943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32777450 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 32777624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32777772 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32778248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32778772 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 32778780 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 19 32778987 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32779108 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 32779166 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32779196 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 32779414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32779442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32779848 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 32780188 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 32780377 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32780728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32780939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32782188 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32782281 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 32783009 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32783080 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32783312 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 32783798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32784005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32784175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32784224 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 32784275 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32784290 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 32784321 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32784438 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 32784710 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 32785056 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32785342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32785357 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32788163 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32788980 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 32789091 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32789149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32789885 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32790965 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32792168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32792434 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32792589 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32792626 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32792850 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32793036 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32793183 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 32793298 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32793299 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32793355 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32793360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32793468 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32793786 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 32793841 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 32794096 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32794182 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32794381 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 32795420 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 32795596 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32796982 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 32797468 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32802487 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 32802488 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 32803175 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32803318 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32803524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32804077 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 32804100 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 32804450 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32804451 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 32804463 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 32804465 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 32804621 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 19 32804689 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 19 32804711 T G N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 19 32805007 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 19 32805031 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 32805470 G A Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 19 32805521 T C Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 19 32805549 T C N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 19 32806097 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 32806117 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 32807592 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32807696 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32808007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32809824 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32810216 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32812760 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32814168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32814829 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32815089 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32816701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32819324 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 32820054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32820377 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32820393 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32820525 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 32822467 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32824057 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 32824695 G T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 32825967 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 32827019 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 32827020 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 32827327 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 32830094 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 32831231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32833232 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32835606 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 32836762 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32838483 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 32838488 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32838594 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32840889 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32840940 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 32841179 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32842422 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 19 32842785 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 32842942 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 32843768 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 32844119 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 32844153 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32845051 A G N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 19 32845444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32845757 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32845948 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 19 32847434 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 32848289 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32848398 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 32848755 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 32848784 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32850331 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 32850332 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 32850354 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32850464 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 32850633 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 19 32851283 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 32851420 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 32851425 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32851542 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32851902 T A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 32852007 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32852096 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 32852256 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32853478 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 19 32853553 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 32853980 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 32854299 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32854427 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32855098 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32855405 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32856013 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32856888 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32858315 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32858316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32858380 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 32858412 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32858790 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32858860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32858978 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32859739 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 32860244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32860886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32861131 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32861141 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 32861323 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32861707 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 32861941 G A N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 19 32862373 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 32862837 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 32863135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32863431 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 32863991 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 19 32864592 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32865118 T A N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 19 32865720 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32865994 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32866806 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 32867865 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32872269 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32873210 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32874770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32879431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32880499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32882278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32883133 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32883251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32883587 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32886030 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32886624 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 32887061 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32888310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32888686 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32888923 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32888925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32891422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32892063 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32898104 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32898438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32898535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32900972 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32901972 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32902937 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 32902950 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32903024 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32904385 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 32905170 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 32905187 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 19 32905729 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32905731 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32906548 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 32906576 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 32908230 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32910319 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 32912449 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32912640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32914177 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 32918201 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 32919593 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 32920293 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 32920837 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 32920905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32921340 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 32921381 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 32921397 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 32921436 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 32921448 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 32921463 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 32924072 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 32924387 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 32925986 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 32926218 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 32926253 A G N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 19 32926447 A C N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 19 32926470 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 32926892 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 32926961 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 32927325 T C N Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.5 0.125 0.375 9 7 4 1 3 19 32927506 T C N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 19 32927919 G T N N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 10 10 4 2 4 19 32927923 C T N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.454545454545455 0.181818181818182 0.363636363636364 12 10 5 2 4 19 32928004 T C N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.444444444444444 0.111111111111111 0.444444444444444 9 9 4 1 4 19 32928148 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 32928311 C T N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.454545454545455 0.181818181818182 0.363636363636364 12 10 5 2 4 19 32928387 T C N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 12 8 5 2 3 19 32928481 T C N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.545454545454545 0.272727272727273 0.181818181818182 15 7 6 3 2 19 32928774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32928817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32929074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32929616 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 32929781 A G N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 8 12 3 2 5 19 32929914 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 32930119 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 7 11 3 1 5 19 32930195 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 32930454 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 19 32930455 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 19 32931255 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32932105 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32932401 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32932549 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32932587 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 32932996 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 32933250 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 32933391 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 32933456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32933475 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32933744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32933938 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 32934249 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 32934255 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 32934564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32934608 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 32934613 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 32934789 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 32934804 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 32935293 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 32935322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32935421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32935729 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 32935843 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 32935929 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 32935950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32936079 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32936108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32936235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32936239 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32936295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32936753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32937633 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 32938233 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 32938303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32938334 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32938384 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32938409 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 32938423 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 32938429 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 32938431 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 32938563 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32938568 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 32938775 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32938835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32939153 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 32939154 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 32939460 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 32939570 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32939591 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32939641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32939652 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32939831 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32939889 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 32939979 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32940424 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 32940480 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32940532 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32940650 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 32940663 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 32940669 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 32940726 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32940773 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32940798 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32940821 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32940839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32940886 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 32940890 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32940977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32941324 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 32941325 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 32941585 G A N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 14 6 6 2 2 19 32941624 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 32941631 G C N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 19 32941750 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 32941800 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 19 32942152 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32942161 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32942270 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 32942376 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 32942820 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 32942834 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 32942837 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 32942965 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 32943023 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 32943037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32943142 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 32943268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32943452 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32943564 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32943589 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 32943673 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32943797 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 32943866 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32943987 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 32944351 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 32944376 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 32944826 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32944999 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 32945212 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 32945479 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 32945992 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32946321 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 19 32946439 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 32946472 G A N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 19 32946589 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 32946803 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32949199 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32949793 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 32949914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32950329 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 32950336 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 32950338 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 32950509 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 32950620 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 32950627 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 32956557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32959414 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32959611 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32960658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32960806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32960838 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 32961545 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 32961697 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 32962011 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 32962292 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 32963589 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32963827 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32964036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32965487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32965548 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 32965981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32966339 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32966707 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 32966762 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 32966868 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 32966895 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 32967210 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 32967321 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32967383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32967543 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32967598 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 32968361 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32968532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32968549 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 32969606 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32969608 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 32969828 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 32969891 A T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 32969986 A T N N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 9 9 3 3 3 19 32969994 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 32970020 C T N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 19 32970185 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 32970244 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 32970271 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 32970304 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 32970332 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 32970344 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 32970357 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 32970384 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 32970435 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 32970822 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32970823 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32970846 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 32970848 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 32970971 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 32971008 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 32971453 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 32971979 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 32972769 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 32975632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32978296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32979482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32979496 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32979881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32979953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32980191 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 32980287 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 32980919 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 32981072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32981133 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32981202 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32981426 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 32981811 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32981825 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32981971 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32981991 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 32982067 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32982120 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32982219 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32982772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32982779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32982910 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 32983378 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 32983387 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32983418 C T Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 19 32983497 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 32983751 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 32983756 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 19 32984468 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 32984490 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 32984684 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32985304 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32985315 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 32985361 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 32985514 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 19 32985532 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 19 32985558 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 19 32985566 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 32985595 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 32986518 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 32986765 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32987025 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 32987080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32987157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32987953 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32988351 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 19 32988492 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32988525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32989161 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 32989297 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 32989648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32989684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32989769 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32991394 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32991402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32995013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32995319 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 32995335 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 19 32995618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32996242 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 32996257 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 32996262 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 32996372 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 32996506 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 32996540 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 32996678 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 32996767 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 32996796 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 32996902 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 32996986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32997276 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 32997432 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 32997593 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32998211 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 32999500 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33000118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33001276 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33001281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33002135 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33002274 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 33003132 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33003578 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33004683 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33004750 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33004807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33004900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33005258 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 33005303 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33005460 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33006204 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 33006229 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 33007519 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33007900 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33010684 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33011395 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33011396 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33012480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33013013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33013705 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 33013837 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 33014213 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33016996 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33017262 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 33017293 T G N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 19 33017339 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 33017555 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 33018860 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33019129 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 33019347 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 19 33019387 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 33020254 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33020465 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33020558 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33020582 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33020593 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33020678 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 33020695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33021016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33022819 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33024255 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33025123 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33025580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33025731 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33026669 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33027112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33027265 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33027424 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33028700 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33028701 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33028712 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 33028936 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33029515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33029877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33029878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33030134 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 33031571 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33031613 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33031616 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33031639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33031767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33032790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33034397 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33035165 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33035977 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33038512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33040959 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 33041323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33043540 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33045547 T C N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.538461538461538 0.230769230769231 0.230769230769231 17 9 7 3 3 19 33047590 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 33047660 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33047712 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 33047715 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 33047750 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 33047752 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 33047811 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 33047816 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 33050157 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33050428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33051557 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 33051924 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33052311 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33052389 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33052944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33053577 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33055241 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33055530 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 33056635 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 33056640 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33057122 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 33057539 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 33057999 C T Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 19 33058047 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 33060910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33061096 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 33063290 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33066215 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33066342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33066412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33067176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33067862 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33068176 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33068297 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 33068340 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 33068525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33068543 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 33068706 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 33068727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33069022 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 33069032 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33069285 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33069296 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 33069554 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33069562 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 33069587 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33069649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33069881 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33070021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33070049 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33070051 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33070057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33070243 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33070276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33070414 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33070562 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 33070788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33070988 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33071488 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33071684 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 33071697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33071735 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33071953 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33072015 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33072277 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 33072617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33073176 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 33073400 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33074103 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33074149 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33075093 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33076706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33077258 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 33077347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33078011 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33078610 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33079014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33080764 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33081244 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33081341 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33081399 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 33083267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33083523 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33083643 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33083772 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 33084214 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 33084374 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33087475 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33088057 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33088239 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33088477 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 33088515 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33088818 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 33089011 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33089132 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 33089513 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 33089849 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 33089916 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 33090472 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33091314 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33092721 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 33093037 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 33094864 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33094872 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33094940 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 33095734 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 33096093 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33096331 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 33096652 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33097446 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33097635 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 19 33097712 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33098190 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33098439 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 33098562 A C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 33098585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33098657 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 33098660 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 33098773 G T Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 33098830 A C Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 33098852 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 33099040 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33099174 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 33099388 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 33099652 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 33099691 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 33099917 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33100606 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 19 33100975 C T N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.384615384615385 0.230769230769231 0.384615384615385 13 13 5 3 5 19 33100976 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 33101721 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 33101739 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 19 33102330 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 33102383 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33104841 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33105169 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 33107770 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 33107960 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 33108158 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33108226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33108262 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 33108457 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 33108573 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 19 33108926 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 33108976 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33109026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33109053 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 33109066 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 33109118 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33109357 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 33109403 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33109626 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33110309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33111389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33111773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33112045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33115782 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33118217 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 33122247 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33122260 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 33123018 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33124163 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33124883 C G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 33124968 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33125407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33125502 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 33126484 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33126635 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33126938 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 33127171 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 33127279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33127307 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 33128990 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 33129313 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 33129372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33129734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33129940 T G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 19 33129995 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 19 33130071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33130375 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 33130495 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33134731 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33136495 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 33137388 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 33137966 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 33138735 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 33138973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33139694 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 33139738 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33139775 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 33140537 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 33143156 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33143567 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 33143802 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 33143974 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 33144216 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 33144314 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 33144315 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 33148675 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 33149457 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 33152029 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 33153870 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 33154105 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 33155286 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 33157069 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33158202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33158799 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 33160492 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33160566 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 33160855 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 33161042 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33161079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33161126 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 33161134 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 33161141 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 33161504 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 33161574 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 33161607 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 33161636 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 33161759 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33162183 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33162216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33162244 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 33162360 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33162390 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 33162530 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 33162545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33162771 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33162778 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 33163016 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 33163032 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 33163049 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 33163063 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 33163140 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33163531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33164392 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 33164677 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 33165014 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 33165242 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 33165471 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 33165658 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 33165741 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 33165842 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 33165886 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 33166033 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 33166124 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 33166228 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 33166255 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 33166379 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 33166400 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 33166404 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 33166522 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 33166787 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 33166964 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 33167172 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 33167375 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 33167394 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 33168033 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 33168174 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 33168675 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33168720 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 33168828 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 33168844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33168869 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 33169008 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33169031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33169112 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 33169844 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 33170099 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 33171237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33171404 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33171422 C G Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 33171447 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 33172677 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 33172851 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 33172911 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 33173104 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 33175297 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33176223 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33177237 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 33178037 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 33178052 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 33178174 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33178394 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 33178615 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 33179442 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33179490 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 33179519 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 33179760 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 33179819 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 33179825 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 33179910 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 33180611 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 33180773 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 33180892 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 33181105 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 33181362 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 33181596 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 33182030 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 33182258 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 33182726 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 33182760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33182824 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 33182911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33183026 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 33183039 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 33183671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33183723 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 33183898 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 33183927 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 33184146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33184189 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33184496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33186011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33187599 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33187906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33190447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33190739 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 33190913 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 19 33190970 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 33192148 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 4 24 2 0 12 19 33192327 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 33192374 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33192661 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33193308 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 33193404 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 33193499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33193671 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33193827 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 33193928 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33194246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33194261 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 33194262 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 33194521 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 33194618 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 33194649 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 33194804 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33194913 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33195011 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33195053 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33195098 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33195252 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33195265 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33195293 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33195436 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 33195826 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33195944 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 33195965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33196207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33196487 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33196660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33196689 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33196811 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33196883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33196952 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 33197062 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 19 33197436 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 33197668 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33197930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33198067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33198347 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 33198578 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 33198684 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 19 33198835 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33199145 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 33199292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33199559 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 33199591 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 33199622 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 33199632 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 33200219 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 33200476 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33200539 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33200577 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 33201001 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33201002 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33201008 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 33201075 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33201204 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33201265 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 33201538 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33201789 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 33201862 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33202158 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33202280 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33202392 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33202534 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 33202551 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 33202593 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 33202596 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 33202616 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 33202634 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 33202656 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 33202739 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 33202747 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 33202990 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33203003 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33203010 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33203017 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33203060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33203114 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33203156 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33203169 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33203391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33203530 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33203536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33203677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33203784 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33203796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33203998 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 33204225 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 33204349 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 33204739 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 33205092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33205107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33207308 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 33207721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33208189 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33208288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33208892 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33209180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33209184 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33209693 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33210696 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33211100 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33211587 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33211594 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33212115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33212859 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 33213097 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 33213395 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 33213558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33215165 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33215468 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 33215471 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 33215912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33216326 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 33216384 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 33216627 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33217298 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33217430 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33217450 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33217658 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33218019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33218371 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 33218705 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 33218854 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33218940 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33219083 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 33219490 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33219909 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33219910 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33220114 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33220128 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 33220230 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 33220235 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 33220597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33221585 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 33221927 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33223138 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 33223695 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 33223704 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 33223779 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33224018 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33224192 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 33224201 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33224674 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33224903 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 33225354 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 33226278 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33227980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33231290 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 33231934 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 33232203 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33233232 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 33233429 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 33233669 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33234155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33235568 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33237769 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 33238677 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33238678 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33239397 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33239478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33239515 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33240535 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33242321 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33243030 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33243989 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 33244639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33244883 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 33244990 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33246976 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 33248900 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33248991 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33250694 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 33251475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33251521 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 33252043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33252842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33253452 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33253882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33254173 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33254594 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33254672 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33255149 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 33255459 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33256105 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33259081 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33259785 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33260369 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 33261607 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33262823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33265779 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 33268000 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 33268851 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 33271164 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33274484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33274560 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33275185 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 33275373 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 33276003 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33278397 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33280090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33281648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33282173 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33283603 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 33283686 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33286276 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33289721 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 33292616 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33296351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33303169 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33305092 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33306741 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33308857 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 33313430 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 33313612 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33314629 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 33315469 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33316409 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33316645 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 33317809 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33317944 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33318448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33318792 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33318799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33321580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33321635 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33322050 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33323758 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33325956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33326759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33336445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33338765 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33338977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33340517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33340554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33341148 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 33345215 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33345359 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 33346424 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 33346458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33347142 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 33348123 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33348130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33349697 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33352073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33352746 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 33356519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33359679 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 33368621 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33369861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33370217 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 33372856 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 33374410 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33374883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33374998 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33376076 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33376510 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33377111 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33377775 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 33377948 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33378500 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 33379333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33379410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33379801 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33379814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33381198 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33381897 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33382488 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33383271 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 33383348 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 33384190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33384570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33385679 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 33385724 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 33385922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33386117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33386823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33386958 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33387722 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33387926 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33388842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33389491 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 33389754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33391014 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 33392457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33392706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33393207 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33393777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33396534 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33396658 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33396829 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 33397405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33397658 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33402084 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33402333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33402341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33402413 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33402488 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 33402509 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 33402557 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 33403025 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33403372 A C N N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 19 33403498 G T N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 19 33403710 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 33403990 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 33404379 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 33404645 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 33404764 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 33404780 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 33404892 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 19 33404934 G T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 19 33405023 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 19 33405139 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 19 33405290 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 19 33405380 G C N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 19 33405390 T A N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 19 33405431 G T N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 19 33405457 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 19 33405470 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 19 33405532 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 19 33405533 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 19 33405582 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 19 33405640 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 33405658 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 33405815 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 33405870 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 33405914 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 33406134 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33406362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33407267 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33408092 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33408202 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33408656 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 33409681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33411618 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33411743 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33411754 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33411798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33412195 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 33412259 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33412940 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33412943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33413019 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33413026 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33413071 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33413170 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33413197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33413246 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33413282 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33413418 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33413581 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33413597 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 33413706 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33413764 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 33413779 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33413921 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 33413938 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 33413959 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 33414057 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 33414192 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 33414274 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 33414299 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33414426 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 33414628 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 33414735 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 33414810 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 33414853 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 33415092 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 33415121 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 33415180 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 33415181 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 33415187 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 33415224 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 33415387 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 33415408 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 33415534 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 33415625 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 33415711 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 33415713 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 33415734 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 33415882 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 33416182 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 33416791 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33420503 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33422389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33425929 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33426299 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33427300 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 33428599 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33429740 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 33429746 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33429959 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 33430323 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33431643 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33432974 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 33433187 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 33433298 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 33433456 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 33433758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33433905 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33434432 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 33434686 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 19 33434691 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 33434701 A C N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 19 33434787 T C N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 19 33434821 T G N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 19 33435077 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 33435083 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 33435126 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 33435371 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 33435375 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 33435473 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33435743 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 33436057 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 19 33436556 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 33436651 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33436665 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 33437005 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33437201 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 33437336 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33437617 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 33437845 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33438121 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 33438178 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33438399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33438463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33438568 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33438839 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33439191 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33439530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33439756 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 33439786 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33439916 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33439986 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 33440353 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 33440545 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 33440601 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33440792 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 33441084 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 33441300 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33441380 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 33441690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33442037 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33442373 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33442374 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33442388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33442508 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 33442598 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33443219 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 33443247 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33443519 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33443531 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 33443763 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 33445120 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33449047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33449617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33449632 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33451470 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 33454108 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 33454391 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33454897 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33455250 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 33456601 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33456743 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 33456778 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 33457391 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 33457407 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 33457503 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 33457512 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 33457606 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 33457637 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33457643 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33457656 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 33457680 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 33457705 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 33457866 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33457875 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 33457920 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33457967 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33458025 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33458063 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33458083 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 33458116 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33458119 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33458341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33458370 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33458397 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 33458538 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 33458578 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 33458622 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33458679 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33458793 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33458807 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33458813 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33458874 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33458901 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33458906 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 33459006 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 33459042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33459139 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33459195 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33459229 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33459290 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33459412 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 33459416 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 33459417 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 33459457 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 33459474 G T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 19 33459681 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33459702 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33459725 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33459835 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 33459837 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 33459855 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 33459949 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33460113 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33460209 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33460385 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33461177 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33461359 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 33461562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33461771 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 33461842 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33461888 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 33461899 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 33462376 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 33462393 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 33462459 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 33462532 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 33462626 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 33462841 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 33463215 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 33463225 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 33463428 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 33463479 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 33463484 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 33463819 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 33463870 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 33463871 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 33463874 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 33465094 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 33465103 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 33465122 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 33465210 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 33465265 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 33465294 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 33465418 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33465435 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 33465462 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 33465509 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 33466136 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 33466140 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 33466143 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 33466364 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33466403 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 33466456 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33466464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33466471 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33467110 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 19 33468002 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33470383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33470439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33473756 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33474249 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 33474692 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33476840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33481067 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 33486022 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 33486262 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 33486513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33488547 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 33490816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33491188 T C N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 19 33495935 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33497194 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33497219 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 33497241 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 33497258 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33497268 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 33497682 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33497741 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33497772 G T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 19 33497795 G A N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 19 33497850 A T N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 19 33498201 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 19 33498657 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 33498905 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 33498953 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 33498967 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33499270 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 33499390 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 33499486 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 33499598 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33499662 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 33499734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33499795 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 33499808 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33499978 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 33500009 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 33500073 T A N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 19 33500146 A C N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 19 33500241 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 33500245 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 33500288 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 33500313 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 33500465 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 33500466 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 33500549 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 33500795 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 33500878 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 33501023 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 33503424 C G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 33503489 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 19 33503841 A G Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 19 33504009 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 33504357 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33504830 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 33504877 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 33504981 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 33504982 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 33505084 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 19 33505396 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 33505755 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 33505768 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 33505917 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33505954 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33507128 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 33507168 G A N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 19 33509415 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 33509671 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33509864 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33510189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33510321 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 33510346 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 33510663 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33510839 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33510905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33511488 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 33511510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33512776 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33512983 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33513022 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33513147 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33521209 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33521817 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 33521856 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33522707 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33522929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33523209 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33523385 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33523425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33523476 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33523612 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 33523824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33523826 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 33524027 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33527366 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33527558 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 33528605 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33529716 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 33529904 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 33529998 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33530006 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33530663 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33531636 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 33531648 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 33531941 A T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 33532020 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 33532047 A G Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 19 33532069 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 33532077 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 33532402 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 33532573 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 33532620 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 33532996 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 33533258 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 33533447 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 33534603 G A Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 33534667 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33537872 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33539028 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33540646 A C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 19 33542080 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 33543645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33547089 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 33549988 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 33550078 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 33552443 C T Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 33574316 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 33574843 C G N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 33575435 T A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 33575441 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 33575498 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 33577162 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 33577787 C G N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 33578626 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 33578712 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 33578857 T A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 33578958 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 33579348 A T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 33579885 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 33580028 A T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 33580035 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 33580294 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 33580640 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 33580709 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 33580900 T A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 33581450 T C Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 33581724 C G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 33582259 C T N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 33583080 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 33583156 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 33583432 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 33583644 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 33584136 G T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 33584712 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 33585437 C A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 33585852 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 33586446 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 33587547 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 33587800 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 33587833 C A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 33588268 T G N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 33588564 A C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 33588644 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 33588691 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 33590042 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 33590293 T A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 33591090 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 33592290 T A N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 33592897 C T N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 33593450 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 33593572 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 33595591 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 33595603 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 33595722 G T N N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 19 33595791 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 33595831 A C N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 33596237 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 33596350 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 19 33596429 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 19 33596741 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 33596795 G T N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 33596940 G A N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 33597194 C A N N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 19 33597297 C T N Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 19 33597349 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 33597636 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 33597714 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 33597884 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 19 33598012 T G N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 33598296 C T N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 33598382 C A Y N 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 19 33598534 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 19 33598566 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 33598678 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 33598746 A T N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 33598820 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 19 33598833 T C N Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 19 33598972 T A N N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.5 0 0.5 4 4 2 0 2 19 33599210 G A N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.5 0 0.5 4 4 2 0 2 19 33599211 G T N N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.5 0 0.5 4 4 2 0 2 19 33599284 A G N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.5 0 0.5 4 4 2 0 2 19 33600577 T C N Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.6 0 0.4 6 4 3 0 2 19 33600598 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 33600780 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 19 33600784 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 33600799 T G N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 33600818 C G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 33600820 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 33600867 C A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 33600882 A C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 33600967 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 33600975 C T N Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 19 33600987 T A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 33601201 C T N Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 19 33601227 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 33601300 T G Y N 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 6 10 1 4 3 19 33601406 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 33601420 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 19 33601796 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 33601982 T G N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 19 33602338 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 33602489 C T N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.4 0 0.6 4 6 2 0 3 19 33602694 C T N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 33603114 G A N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.5 0 0.5 4 4 2 0 2 19 33603464 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 33603488 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 33603865 A C N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 33603990 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 33604403 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 33605494 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 33605548 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 33607017 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 33607053 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 33607418 A C N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 33613124 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 33613269 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 33614285 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 33614548 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 33614944 A G Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 33616252 C G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 33617441 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 33619087 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 33619806 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 33620832 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 33620882 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 33621335 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 33621463 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 33624153 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 33625118 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 33627351 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 33627357 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 33627873 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 33629025 C T N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.375 0.125 0.5 7 9 3 1 4 19 33629294 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 33629297 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 33630500 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 33630501 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 33630940 G A N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.428571428571429 0.142857142857143 0.428571428571429 7 7 3 1 3 19 33630996 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 33631228 G A N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 11 5 5 1 2 19 33631260 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 33631470 T A N N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.444444444444444 0.111111111111111 0.444444444444444 9 9 4 1 4 19 33631953 A T N N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 19 33632180 G C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 33633374 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 19 33633657 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 33633719 T G Y N 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.4 0.1 0.5 9 11 4 1 5 19 33633901 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 19 33641265 A T Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 33642649 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 33643098 A C Y N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.444444444444444 0.111111111111111 0.444444444444444 9 9 4 1 4 19 33643230 C A Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 33643379 G C Y N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 11 5 5 1 2 19 33643469 A T N N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 9 5 4 1 2 19 33644577 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 33644921 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 33645130 T G Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 33646514 G C N N 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 13 7 6 1 3 19 33646736 C T Y Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.444444444444444 0.111111111111111 0.444444444444444 9 9 4 1 4 19 33647056 A C Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 33647138 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 33648277 C T Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 33648414 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 33648587 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 33649202 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 33649854 C A Y N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 19 33649967 C A N N 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 13 7 6 1 3 19 33650007 G C Y N 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 12 8 5 2 3 19 33652284 A T Y N 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 19 33652522 T C Y Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.375 0.125 0.5 7 9 3 1 4 19 33654141 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 33654144 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 33654273 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 33654544 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 33654593 C A Y N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 19 33655776 A C Y N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 6 12 2 2 5 19 33656097 G A Y Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 9 5 4 1 2 19 33656118 C G Y N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 8 4 4 0 2 19 33656358 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 19 33656675 G T Y N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 9 5 4 1 2 19 33658736 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 33658846 T G Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 33659541 G A Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 33660188 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 33660479 T C N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 11 5 5 1 2 19 33660681 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 33660711 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 33660819 A C Y N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 9 5 4 1 2 19 33660876 A C Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 33661797 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 33662045 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 33680787 G A Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 33684659 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 33684825 G A Y Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 19 33685003 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 33685196 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 33694811 C T N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 33733142 C T Y Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 19 33733689 C A Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 33734987 T C Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 33735704 T C Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 33736524 T C Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 33737660 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 33737754 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 33737813 C T Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 33737857 A C Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 33739548 C T Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 33740161 A G Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 33740221 T C Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 33741725 C T Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 33743970 G C Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 33744389 C T N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 33746257 G A Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 33755700 T G N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 33758666 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 33762373 T G Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 33763400 A G Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 33767782 G A Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 33772669 T C Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 33772739 A T N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 33774184 C G Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 33776186 C A Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 33776661 T G Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 33795857 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 33808126 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 33809222 G A Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 33811363 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 33813013 A C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 33813793 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 33813829 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 33814249 G A Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 33814600 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 33814870 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 33819856 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 33820795 C T Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 33825222 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 33825626 C G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 33826422 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 33834755 G T Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 33835390 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 33835800 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 33847830 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 33854557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33854978 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33856854 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33857550 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33858292 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33859279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33859608 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33859865 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33860513 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33860515 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33860664 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33861075 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33861295 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33861297 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33861407 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33861511 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33863393 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33863539 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33863943 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33865380 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33866304 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 33866317 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33866542 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 19 33866792 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33866845 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 33867242 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 33867439 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 33868136 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33868883 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 33869030 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33869173 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 19 33869580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33869674 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33873119 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33873564 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33873903 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33874448 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33874729 G A Y Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.384615384615385 0.153846153846154 0.461538461538462 12 14 5 2 6 19 33874807 A G Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.3125 0.125 0.5625 12 20 5 2 9 19 33875114 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 19 33875235 A G Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 19 33875285 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 19 33875309 A C Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 33875378 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 19 33875454 T C Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 19 33875493 T G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.3125 0.0625 0.625 11 21 5 1 10 19 33875865 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33875868 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 33875875 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 33875934 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 33876333 T G N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.357142857142857 0.142857142857143 0.5 12 16 5 2 7 19 33876502 C A N N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 19 33877472 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 33880237 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 33880268 T C Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 33880473 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 33880531 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 33881780 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 33881904 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33882504 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33882728 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33883544 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 33884663 G T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 33894035 C G Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 15 5 7 1 2 19 33894865 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 33895778 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33897417 C T N Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.5 0.125 0.375 9 7 4 1 3 19 33897587 G T Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 33901456 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 33902673 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33903479 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33903589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33903903 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33904120 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 33905348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33908341 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 33908739 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 33909538 A C Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 33910305 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 33910310 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 33910545 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 33912202 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 33912216 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 33912702 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 33913152 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 33913305 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 33914597 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 33917481 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 33917485 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 33917745 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 33917924 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 19 33917997 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 33918076 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33918314 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33919629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33919674 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 33919941 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 33919978 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 33920539 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 33920557 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 33920572 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 33920652 A G Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 19 33921041 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 33921234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33921403 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 33921518 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 33921556 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33921736 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 33921849 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 33921881 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 33922078 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33922277 C G Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 33922281 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33922282 T G Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 33922957 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 33923054 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33923167 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 19 33923196 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 19 33923353 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 33923416 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 33923817 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 33924057 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 33924802 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 33924863 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33925090 T C Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 33925177 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 33925248 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33925552 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 33925734 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33925796 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 33925938 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 33926156 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 33926169 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 33926208 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 33926476 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33926819 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33927376 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 33927604 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 33928237 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33933163 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 33933939 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33934564 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33934582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33935329 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 33935439 A G N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 19 33935480 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.166666666666667 0.25 16 8 7 2 3 19 33935503 T A N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 19 33935521 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 19 33935667 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.266666666666667 21 9 10 1 4 19 33935671 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 19 33935711 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 33935734 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 33935780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33935966 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 33935986 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 33936211 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.263157894736842 27 11 13 1 5 19 33936877 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33937156 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 33939718 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 33941723 C G Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 33943065 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 33943178 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33943504 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 33944346 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 33944620 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 19 33945318 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 33945564 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 33945565 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 33945779 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.611111111111111 0.111111111111111 0.277777777777778 24 12 11 2 5 19 33945900 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 33945935 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 33945999 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 33946537 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33946753 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 33947006 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 33947021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33947078 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33947427 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 33947902 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33948201 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33948202 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 33948402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33948533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33954296 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 33954300 G T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 33954805 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.277777777777778 0.0555555555555556 0.666666666666667 11 25 5 1 12 19 33954813 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 19 33954821 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 19 33954838 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 19 33954856 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 19 33954874 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 19 33954903 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.263157894736842 27 11 13 1 5 19 33954975 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 19 33955004 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 19 33955175 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33955568 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 33955596 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 33955597 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 33955640 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 33955672 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 33955675 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 33955677 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 33955759 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 19 33955793 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 19 33955808 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 33956948 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 33957112 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33957165 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33957232 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33957321 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 33957332 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 33957354 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 33957674 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 33957689 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 33957723 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 19 33957792 A G Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 33957929 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 33957936 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 33957981 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 33958002 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 33958003 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 33958080 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 33958143 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 33958212 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 33958398 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 33958524 T C N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 19 33958525 G A N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 19 33958541 G T N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 19 33958651 T C N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 19 33958778 A T Y N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 19 33958822 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 33958970 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 33959082 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 19 33959132 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 19 33959226 G C N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 19 33959270 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 33959796 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 33959856 A G Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 19 33960063 C T Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 33960584 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33961567 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33962659 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33962844 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33963801 C T N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 19 33963861 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33964904 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33965106 C A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33965373 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 33965374 T G Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 33966255 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 33966586 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33966693 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33967745 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 33970195 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 33970729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33970941 A C Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 33971013 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 33971595 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33972228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33972578 A G Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 19 33972995 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33973088 T G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33973127 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33973434 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 33973534 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 33973584 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 33973750 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33973794 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 33974077 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 33974190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33974535 A T Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 33974536 G T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 33974919 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 33974946 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 33975040 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 33975222 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 33975238 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33975605 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 33975626 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 33975696 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 19 33975975 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 33976032 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 33976191 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 33976196 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 33976463 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33976683 T A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 19 33976684 C A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 33976795 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 33976848 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 33976932 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 33976963 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 33977082 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33977322 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 33977399 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 33977464 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 33977565 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 33977636 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 33977688 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 33977703 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 33977882 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 33977928 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 33978033 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 33978483 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 33979254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33979529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33979581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33980555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33980633 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33980709 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 19 33981137 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 33982695 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 33983519 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33983829 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 19 33985620 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 33985836 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33987815 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 33988755 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 33988900 C A Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 33989080 G C Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 33989795 T A Y N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 19 33989988 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 33991066 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33991175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33993170 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33995081 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33995085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33995880 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 19 33996655 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33997266 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 33998321 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 33998752 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34000068 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34000110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34001099 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 34001398 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34002389 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34002565 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34002605 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 19 34003777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34003962 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 34004728 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 34004945 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34005521 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34006154 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34006264 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34006681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34006723 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34007325 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34007521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34007774 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 34008128 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34010845 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34013053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34013077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34017252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34017925 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 34018609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34019297 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34021700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34021748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34034463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34035118 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34036016 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34036129 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34036417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34036593 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34036701 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34036901 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 34037897 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34038691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34038748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34038813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34038879 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34039146 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 19 34039169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34039500 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34039608 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 34040401 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 34040654 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 34040839 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34040904 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 34041083 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 34042006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34042340 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 34042830 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34042877 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34043456 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 34043467 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 34043492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34043516 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34043600 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34043654 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34043669 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34043701 C G N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 19 34044046 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 19 34044093 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 34044103 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 34044223 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 19 34044283 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 19 34044502 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34044531 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34044647 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34044667 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34044781 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 34044853 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 34044905 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 34045444 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34045445 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 34045446 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 34045482 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 34045502 A G Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 34045804 G T Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 34045921 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 34045928 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34046037 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34046050 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 34046516 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 34046590 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34046896 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 34046899 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34046964 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 19 34047017 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 34047693 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34047927 G C N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 22 10 10 2 4 19 34047985 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 34048047 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 34048167 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 34048282 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 34048406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34048512 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34048559 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 19 34048736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34048749 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34048758 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34048989 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34049144 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 34050097 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34050129 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34050189 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 34050509 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34050599 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34050841 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34050851 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34051694 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34051697 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 34051785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34051828 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34051914 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34052216 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34052509 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34052510 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34052557 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34052636 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34052669 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34052809 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34052867 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34053014 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34053281 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 34053349 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 34053572 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 34053607 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 34053969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34054018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34054189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34054332 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34054687 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 34056085 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34056677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34057187 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 34057190 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 34057302 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34057311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34057713 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34057951 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34057952 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34057996 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 34057997 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 34058010 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34058011 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34058114 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34058142 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 19 34058199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34058273 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34058569 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34058591 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34059061 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 19 34059588 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 34059947 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34060013 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34061495 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34062573 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34063256 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34063280 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34063282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34063285 G T Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 34063288 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34063483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34063667 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34065540 G A Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 34066264 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 34066631 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34066831 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34069165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34070153 T A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 34072343 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34073039 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34073312 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34076063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34076542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34076561 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34082770 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34082931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34083136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34085123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34087183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34087593 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34087705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34088074 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 34091453 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34093126 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34094622 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34096584 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 34096813 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34097047 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34097164 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34097529 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 34097831 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 34098145 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 34098301 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34098363 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34098660 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34098749 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34098888 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34098916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34098954 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 34099027 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34099048 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34099073 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34099125 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34099290 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34106498 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 34106569 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34107491 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34107924 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34109301 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34109767 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 34112340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34113483 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 34116332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34118950 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 34118981 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34119651 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34123983 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34124585 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34126106 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34127379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34129113 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 34129238 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34129738 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34131659 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 34131740 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 34132383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34133805 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34133842 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34133844 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34133846 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 34133914 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34133919 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34138039 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34139344 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34139396 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34140306 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 34140512 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 34142186 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34142267 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34142727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34142792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34142828 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34142858 T G Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 34145865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34146644 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 34148506 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34148611 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34148690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34148716 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34149217 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 34149288 A G Y Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 19 34149437 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 34149438 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 34149972 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 34150132 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34150187 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 34150391 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 34150698 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 34150860 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34150913 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 34151336 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 34151392 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 34151716 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34151738 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34152171 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34152200 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 34152371 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 34152467 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34153015 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34153169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34153698 T C N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 19 34153855 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34154644 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34154932 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 34154933 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 34155144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34155164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34155217 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34155231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34155293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34155320 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 34155466 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 34155581 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 34155630 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34155691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34155858 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 34156009 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 7 5 3 1 2 19 34160169 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34162015 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34163111 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34167359 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34167483 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 34167963 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34169020 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34169264 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 34169289 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 34169494 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34169497 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34169753 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34170298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34170347 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34170459 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34170518 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 34170588 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 34170803 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34170865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34170970 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 34172473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34172742 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34173131 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34176100 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34176173 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34176184 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34176662 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 34176844 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34176999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34177075 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34177104 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34177151 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34177368 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34177396 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34177490 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34177769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34177813 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34177907 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34177935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34178383 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34178457 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34178747 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34179233 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34179247 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34179329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34179330 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 34179499 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34179609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34183520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34183524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34183528 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 34183544 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 34183726 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34183796 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34183822 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 34183916 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34184029 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 34184137 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 34184196 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34184571 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34185601 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 34186249 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 34186306 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 19 34186623 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 34186631 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 34186640 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 34186706 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34186718 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34186736 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34186750 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34186762 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34187075 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34187256 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34187264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34188237 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34188304 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34188343 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34188429 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34188636 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 34189028 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 34189066 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34189077 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 34189156 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 34189203 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34189217 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34189281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34189286 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 34189299 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34189354 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34189482 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 34189668 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 34189865 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 34189943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34189964 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34190023 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34190046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34190175 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34190223 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 34190285 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 34190307 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 34190491 G T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 34190783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34190859 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 34190933 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 34190969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34191066 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34191076 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34191113 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34191124 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34191148 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34191173 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34191199 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34191201 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34191208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34191240 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34191290 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34191322 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 34191359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34191485 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34191487 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34191488 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 34191497 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34191504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34191512 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34191548 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34191573 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 34191584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34191588 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34191594 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34191629 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 34191687 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34191747 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34191759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34191779 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34191785 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34191802 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 34191812 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 34191903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34191971 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34192037 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34192147 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34192174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34192241 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34192445 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34192512 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34192538 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 34192539 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 34192627 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34192672 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34192673 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34192704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34192747 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34192883 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 34192895 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34192902 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34192913 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 34192934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34193128 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34193315 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34193409 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34193463 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34193510 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 34193573 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34193901 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 34193948 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 34194020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34194179 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34194370 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 34194400 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 34194523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34194657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34194671 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 34194736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34194825 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34194913 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34194935 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34195026 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34195088 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 34195166 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34195363 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34195385 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34195478 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34195497 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 34195500 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 34195509 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34195948 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34196029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34196205 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34196284 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34196346 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34196365 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34196389 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 34196407 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34196494 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 34196537 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34196655 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34196862 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34197053 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34197370 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 34197536 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 34197540 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34197549 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 34197766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34197806 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34197838 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34197927 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34198056 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34198058 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34198080 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 34198128 G T N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 19 34198149 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 34198273 C A N N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 19 34198327 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 34198342 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 34198673 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34198892 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 34198902 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 34198925 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 34198941 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 34199001 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 19 34199022 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 34199179 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 19 34199209 C A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 34199457 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34199498 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 34199518 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 34199850 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34199892 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 34199911 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 34199953 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 34200011 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 34200261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34200278 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34200475 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34200571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34200593 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 34200670 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34200746 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34200766 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34200786 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34200817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34200818 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34200988 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34201053 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 34201186 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34201236 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 34201270 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34201528 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34201640 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34201684 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34202345 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 34202373 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 34202455 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 34202534 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 34202549 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 34202677 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 34203010 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34203127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34203237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34203291 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 34203411 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 34203416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34203456 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 34203574 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 34203730 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34203760 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34203770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34203783 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34203823 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 34203828 A T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 34203830 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34203939 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34203997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34204035 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34204064 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34204069 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 34204085 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34204100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34204188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34204190 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34204192 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 34204322 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 34204388 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34204657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34204909 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 34205287 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 34212887 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 34212962 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34212972 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 34212973 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 34212983 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 34212984 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 34212990 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 34212994 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 34213023 G C Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 34213050 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 34213055 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 34213097 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 34213148 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 34213156 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 34213349 T G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 34213351 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 34213356 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 34213415 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34213463 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 34213487 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 34213501 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 34213796 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 34213919 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 34214113 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 34214274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34214290 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 34214382 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 34214426 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34214601 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 34214620 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34215213 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 34215220 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 34215273 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34215719 T A Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 34215803 T C Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 34215982 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 34216017 C T Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 19 34216054 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 34216141 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 34216287 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 19 34216796 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 34216807 A G Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 34216875 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 19 34216923 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 34216954 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 34217012 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 34217041 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 34217042 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 34217048 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 34217170 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34217195 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 34217271 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 34217316 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 34217344 C G Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 34217527 A C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 34218321 G T Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 34218474 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34218797 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34219768 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34219806 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 34219811 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 34220192 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34220417 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 34220492 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 34220516 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34220999 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 34221056 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 34221247 C A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5 0.1875 0.3125 19 13 8 3 5 19 34221283 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 34221336 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 34221370 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 34221465 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 19 34221472 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 34221490 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 19 34221514 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34221576 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 34221586 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 34221591 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 34221640 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 34221747 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34221755 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 34221770 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 34221785 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 34221881 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 34221959 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 34221964 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 34221993 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 19 34222069 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 34222085 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 34222139 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 34222155 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 34222361 C T Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 19 34222500 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 34222658 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34222807 T A N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 19 34222826 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 34222874 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 34222884 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 34223154 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34223201 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34223273 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 34223331 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 34223359 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 34223410 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 34223415 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 34223435 G C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 34223439 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 34223444 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 34223450 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34223522 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 34223536 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 34223599 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 34223603 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 34223615 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 34223996 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 34224024 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 34224099 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 34224475 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 34224479 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34224515 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 34224775 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 34224806 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 34224864 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 34224970 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 34225065 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34225561 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34225772 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 34225874 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34225940 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 34226032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34226511 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 34226849 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 34227482 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34227515 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 34227544 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 34227680 A G Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 34227791 C G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 34227824 C T Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 34227886 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 34227973 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 34227982 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 34228033 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 34228099 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34228115 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34228168 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34228247 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 34228548 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34228661 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 34228704 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 34228773 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 34236084 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34236202 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 34236926 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34237091 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34237413 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 34237432 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34237434 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34237473 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 34237527 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 34237535 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34237678 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34237732 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 34237766 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34237807 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34237809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34237883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34238041 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34238135 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 34238230 A T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 19 34238272 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 19 34238282 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 34238457 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 34238480 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 34238504 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 34238672 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34238678 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34238770 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34238775 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 34238788 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34238837 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 34238855 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 34239030 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 34239034 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 34239052 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 34239059 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34239073 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 34239123 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34239284 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 34239618 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34239694 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 34239971 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34239992 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34240035 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 34240079 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 34240089 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 34240102 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 34240131 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34240199 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34240229 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34240234 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34240351 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 34240357 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 34240358 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 34240651 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 34240692 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 34240880 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 34240960 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34241047 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34241108 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34241132 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34241141 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34241182 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 34241226 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 34241321 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34241351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34241791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34241862 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34242059 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34242209 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34242765 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34242847 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 34242997 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34243050 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34243080 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34243148 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34243205 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34243253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34243295 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34243296 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34243428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34243460 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34243504 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34243508 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34243553 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34243598 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34243617 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34243892 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 34245274 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 34245362 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 34245656 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34245699 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34245934 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 34246063 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34246144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34246154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34246167 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34246177 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34246264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34246285 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 34246312 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34246327 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34246335 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34246348 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34246468 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34246481 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34246483 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34246503 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34246519 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34246592 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34246599 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34246626 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34246628 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34246669 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 34246711 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34246742 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 34246972 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 19 34247081 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 34247090 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 34247136 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 34247412 T C Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 34247527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34247779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34248022 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 34248485 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34248542 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 34248581 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 34248952 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 34249257 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 34249491 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 34249537 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 34249701 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 34249715 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 34249844 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 34249958 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34249995 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34250160 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 19 34250332 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34250379 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34250726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34250840 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34250930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34251141 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 34251504 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34251632 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 34251673 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 34251680 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 34251751 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 34253283 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 34253293 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 34253620 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 34253727 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34253728 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34253858 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34254415 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 34255014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34255027 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 34255149 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34255615 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 34255717 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 34255898 T A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 34255968 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 34255973 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 34255983 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 34256055 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 34256056 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 34256162 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 34256231 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 34256252 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 34256262 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 34256300 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 34256341 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34256355 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 34256979 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 34256989 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 34256995 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 34257057 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 34257152 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 34257177 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 34257196 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34257277 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 19 34257329 G T N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 19 34257373 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34257435 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 34257437 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34257512 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34257529 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 34257573 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34258188 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34258311 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 34258362 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 34258464 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 34258552 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 34258623 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 34258651 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 34258731 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34258885 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34259010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34259085 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 34259088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34259147 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34259157 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34259263 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 34259268 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 34259707 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 34259743 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 34259901 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 34259992 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34260056 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34260112 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34260314 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 34260565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34260581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34260612 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34260659 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 34260680 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 34260830 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 34261013 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 34261025 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 34261135 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34261140 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 34261209 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 34261439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34261659 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34261674 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 34261710 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34262161 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34263899 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 34264469 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 34264663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34264686 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34264772 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34265384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34265690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34265906 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34266199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34266484 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34266508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34268259 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34268336 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34268420 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34268856 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34269541 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 34269983 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 34270260 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 34270491 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 34271874 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34272621 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34272870 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 34273340 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 34273358 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34273424 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 34273771 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34273857 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34274262 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34274291 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 34274305 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 34274307 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 34274911 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34275010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34275173 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 34275236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34275443 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34275629 T G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 34275917 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34276084 A C Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 34276106 C A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 34276584 A G N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 19 34276687 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 34276688 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 34276749 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 34277161 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 34277281 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34277617 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34282764 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 19 34282814 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 34283328 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 34283405 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34283618 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34283905 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 34283996 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34285851 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 34286585 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34286692 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34287104 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 34287109 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 19 34287210 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 34287297 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 34287322 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 34287383 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 34287420 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 34287443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34287584 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 34287587 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 34288318 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 34288471 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 34288716 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 34288750 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 34289314 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 34289505 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 34289548 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 34289565 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 34289724 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 34289744 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 34289750 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 34289895 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 34290020 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 34290108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34290126 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 34290340 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 34290855 G C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 34290991 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 34290992 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 34291017 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 34291089 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 34291101 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 34291214 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 34291481 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34291514 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34291636 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 34291784 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 34291906 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 34292052 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 34292176 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 34292279 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 34292399 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 34292617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34292689 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 34293075 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 34293229 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 34293240 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34293408 A G Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 19 34293415 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 34293578 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34293611 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 34293843 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 19 34294090 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 34294173 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34294189 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34294210 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 34294479 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 34294520 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 34294605 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 34294618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34294896 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 34294929 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 19 34294964 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 34295083 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 34295119 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 34295217 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 34295329 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 34295340 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 34295343 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 34295411 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 34295415 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 34295440 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 34295495 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 34295913 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 34295915 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 34296038 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 34296240 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 34296348 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 34296369 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 34296374 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 34296414 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 34296418 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 34296602 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 19 34296647 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34296825 A C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 34297201 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34297245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34297253 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34297265 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34297387 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 34297397 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34297413 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34297469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34297484 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34297496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34297511 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34297555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34297614 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 34297628 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34297671 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34298507 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 34298535 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34298580 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34298620 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34298650 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 34298667 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34298700 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34298755 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34298866 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34298883 C G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 19 34298971 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 34299031 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34299032 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34299042 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34299145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34299261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34299328 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 34299427 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34299446 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 19 34299462 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34299529 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 34299617 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34299870 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 34300019 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 34300081 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 34300254 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 34300269 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34300271 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34300491 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 34300612 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 19 34300830 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 34300970 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 34300977 G T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 19 34301029 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 19 34301309 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 34301316 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 34301659 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 34301727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34301737 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 34301764 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 34301768 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34301855 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 34301896 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 34302194 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 19 34302281 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 34302388 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 34302402 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34302423 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34302816 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 34302940 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 34303006 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34303102 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34303153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34303165 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34303166 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34303185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34303215 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34303292 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34303297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34303349 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34303383 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34303420 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34303450 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34303553 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 34303718 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34303720 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34303722 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34303928 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 34304072 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 34304123 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 34304163 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 34304169 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 34304189 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 34304275 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 34304355 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 34304422 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 34304555 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34304667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34304706 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 34304798 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 34304926 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 34304948 A G Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 34304975 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 34305040 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 34305063 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 34305078 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 34305094 A T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 34305181 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 34305265 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 34305280 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 34305281 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 34305295 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 34305394 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 34305408 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 34305414 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 34305468 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 34305500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34306247 A C Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 34306284 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34306377 T G Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 19 34306469 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34306511 G A Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 34306725 A G Y Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.333333333333333 0.25 0.416666666666667 11 13 4 3 5 19 34306756 T C N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.384615384615385 0.230769230769231 0.384615384615385 13 13 5 3 5 19 34306763 T A Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 19 34306774 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 19 34306806 C T Y Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 19 34307148 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34307206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34307271 G C Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 34307312 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34307432 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 34307742 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 34307987 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 34308101 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 34308300 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 34308612 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34308648 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34308686 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 34308786 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 34309234 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 34309379 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34309387 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34309431 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34309439 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34309594 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34309596 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 34310346 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34311101 A T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 19 34311135 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 19 34311146 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 19 34311223 C G Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 34311230 G A Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 19 34311327 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 34311355 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 34311401 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 34311517 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34312369 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34312601 T C Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 34312643 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 34312748 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 34312749 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 34313022 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 34313403 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34313407 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34313411 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34313426 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34313545 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34313563 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34313569 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34313693 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 34313736 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 34314569 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 34314577 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 34314617 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 34314869 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34314984 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34314991 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 34315003 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34315017 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 34315050 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 34315409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34315420 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 34315438 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 34315506 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34315739 T A Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 34315882 A T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 19 34315894 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34315996 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 34316319 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 34316324 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 34316325 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 34316341 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 34316377 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34316410 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34316423 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 34316424 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 34316463 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 34316483 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34316533 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 34316544 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 34316596 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 34316604 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34316752 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34316790 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 34316858 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34316874 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 34317265 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34317290 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 34317325 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 34317384 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34317391 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 34317589 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34317651 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34317770 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34317779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34317781 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 34318333 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 34318348 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 34318405 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 34318636 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 34318688 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 34318713 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 34318722 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 34318747 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 34318759 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 34318925 C G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 34319205 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 34319246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34319282 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 34319424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34319451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34319514 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34319610 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34319617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34319664 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34319685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34319744 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34319858 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 34320009 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 34320071 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 19 34320082 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 34320155 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 34320162 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 34320203 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 19 34320331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34320447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34320770 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 34320881 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34320892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34320894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34321072 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34321112 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 34321280 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 34321556 G C Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 34321692 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 34321777 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34321842 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 34321940 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 34321965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34322009 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34322107 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34322519 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 34322689 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 34322715 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34322738 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34322776 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34322881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34322992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34323049 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34323915 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 34323978 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34324071 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34324144 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34324275 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34324602 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34324666 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34324667 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34325127 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34325152 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 34325333 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34325424 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34326170 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 34326274 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 34326557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34326644 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 34326891 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34327099 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34327180 T G Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34327363 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 34327503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34327629 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 34327792 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34328080 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34328157 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 34329326 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 34329827 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 34330168 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34330199 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34330270 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 34330295 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 34330363 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 34330398 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 34330404 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 34330431 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 34330435 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 34330487 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 34330500 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 34330594 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34330702 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34332291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34332578 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 34332593 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 34333229 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34333397 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 34333981 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 34333982 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 34334275 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 34334337 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34334345 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34334354 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34334722 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 34334837 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 19 34334871 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 34335621 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34335649 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34335824 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34335989 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34336481 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 34336563 T A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 34336655 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34336959 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34337064 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34337069 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34337073 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34337138 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34337151 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34337200 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 34337207 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 34337486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34337967 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34338024 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34338546 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 34338987 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 34340468 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 34340643 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 34340751 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 34340925 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34341715 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34342087 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 34342160 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 34342683 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34342734 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 34342757 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34342786 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 34342909 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 34342924 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 34343091 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 34343118 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 34343119 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 34343145 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34343179 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 34343223 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 34343335 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 34343364 A C Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 34343460 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 34343594 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 34343618 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 34343789 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 34343797 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 34343899 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 34343982 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 34343984 T G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 34344035 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 34344045 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 19 34344049 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 34344168 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 34344212 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 34344447 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 34344683 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34345922 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 34346523 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 34347260 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34347271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34347632 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 34348087 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34349191 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 34349261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34349296 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 34349328 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 34349334 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 34349769 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 34350571 C T N Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 11 9 4 3 3 19 34351011 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34351032 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 34351043 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 34351052 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 34351221 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 34351248 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 34351587 G A N Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 19 34351590 C G N N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 19 34351763 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 34351769 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 34351790 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 34351842 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 34351869 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 34352240 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34352488 A T N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 19 34352712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34353039 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34353040 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34353341 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 34353441 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34353758 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 34353816 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 34353828 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 34353849 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 34354176 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 34354351 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 34354835 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 34354859 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 34355333 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 34355344 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 34356067 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34356309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34356322 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34356511 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 34356614 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34357969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34358569 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 34358876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34358930 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34358999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34359401 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 34359424 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 34359525 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34359531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34359658 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 34359880 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 34360373 T A N N 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 19 34360889 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34361087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34361223 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 34361239 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 34361249 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34361257 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 34361947 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 34362162 T C Y Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 19 34363347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34363492 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34363605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34365130 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34365391 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 34365833 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 34365968 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 34366513 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34366825 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34366990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34367257 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34367516 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34367604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34367988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34368372 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34368414 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34368559 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34369639 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 34369995 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 34370000 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 34370037 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 34370106 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 34370569 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 34370706 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34371115 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 34371311 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34371405 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34371452 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34371898 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34372166 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34372401 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34372430 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34372728 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34372771 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34373070 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34373171 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34373560 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 19 34373705 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34373759 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34373955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34374187 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 19 34374662 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34374663 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34374677 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 34374709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34374725 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 34374764 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34374794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34374806 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34375053 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34375120 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34375123 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 34375163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34375267 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34375299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34375329 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34375356 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34375371 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34375374 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34375449 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 34375451 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 34375478 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34375479 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34375495 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34375515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34375545 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 34375549 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 34375595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34375604 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34376139 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34376288 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34376380 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34376406 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34376516 T A N N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 19 34376546 C A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 19 34376595 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 34377521 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 34378101 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 34379268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34379292 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34379594 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 34379629 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 34379834 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34380124 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 34380288 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 34380452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34380742 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34381234 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34381607 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 34382024 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34383568 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34383613 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34383772 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34383776 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34383941 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34383980 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34383982 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34384035 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34384066 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34384295 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 34384959 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34385101 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 34385525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34385670 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 34385676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34385735 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 34385929 C T N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 19 34386121 A T N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 19 34387298 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34388134 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34388341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34389708 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 34390643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34390694 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34390747 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 34390838 C T N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 19 34391066 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34391194 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 34391693 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 34392057 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 34392218 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34392260 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 34392366 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 34392821 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34392849 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 34393018 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 34393031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34393156 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 34393193 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 34393729 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34393834 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34394178 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 19 34394248 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34394264 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34394668 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 34394705 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 34394708 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 34394777 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34395202 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34395696 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 34395815 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 34395906 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34397725 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34402203 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 34406174 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34409082 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 34409600 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 34410311 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 34410536 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 34410542 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 34410551 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 34410821 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 34410829 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 34410874 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 34410878 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34410884 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 34410928 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34410936 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34411007 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 34411014 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 34411108 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 19 34411564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34411795 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34411808 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34412568 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 34413106 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 34414980 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 34415164 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34416062 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34416519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34416528 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 34416681 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34416707 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34416895 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34416960 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34417027 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34417252 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34418500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34418833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34418943 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34419469 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34420233 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34420412 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34420460 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 34420746 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34420748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34421198 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34421217 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34421302 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34421367 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34421591 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34421675 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34421931 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34421983 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34422528 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34422543 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34422564 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34422582 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34422677 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34422690 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34422695 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 34422864 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34422887 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34423113 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34423142 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 34423339 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34423485 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34423521 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34423553 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34423566 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 34423711 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34423772 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34423889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34424065 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 34424066 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 34424225 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34424381 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34424397 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34424482 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 34424504 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34424751 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 34424797 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 34425185 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 34425211 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34425682 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 34425696 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34425779 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 34425784 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34425800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34425848 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 34425901 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 34426044 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34426185 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 34426480 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 34428110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34432426 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34432597 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34434921 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34435544 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34435633 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34436063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34436077 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 34436090 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 34436191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34436627 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 34436675 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 34436684 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 34437089 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 34437663 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34438006 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 34438020 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 34438062 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 34438219 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 34438266 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 34438326 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34438349 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 34438390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34438441 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 34438540 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 34438596 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 34438617 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34438622 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 34438815 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34438913 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34438922 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34439034 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 34439128 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34439278 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 34439284 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34439332 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34439918 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 34440659 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 34441867 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34441873 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34441888 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 34442191 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 34442462 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 19 34442467 C T N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 19 34442510 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34442583 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 34442605 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 34442633 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34442716 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34443005 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34443124 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34443343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34444127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34444584 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 34445060 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34445215 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34445503 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 34445536 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 34445861 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34446209 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34446247 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34446322 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34446372 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34446761 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 34446845 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34446961 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 34447110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34447159 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34447232 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 34447281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34447314 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34447318 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34447464 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34447671 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 34447703 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 34447798 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34447818 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 34447868 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 34447876 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 34447967 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34447979 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34447991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34448067 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34448184 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34448202 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34448310 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 34448321 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 34448328 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34448346 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34448392 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34448448 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34448625 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34448712 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 34448801 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 34448882 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34448905 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 34449019 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 34449219 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34449273 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 34449348 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34449360 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34449436 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34449574 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34449598 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 34449616 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34449652 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 34449674 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 34449731 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 34449824 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34449846 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34449904 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34449990 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 34450051 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34450225 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34450308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34450386 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34450406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34450492 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34450507 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34450728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34450882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34451190 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34451348 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 34451366 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 34451439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34451537 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 34452050 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34452202 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34452523 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34452602 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 34452606 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34452625 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34452648 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34452689 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34452692 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 34452700 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 34452785 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34452792 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34452844 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34452889 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34452930 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34453019 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34453324 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 34453513 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 34453586 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 34453597 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34453791 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34455286 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 34455289 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34455493 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34455748 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34455922 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 34456269 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34456333 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34459820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34459960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34460453 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34460484 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34462135 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34462155 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34462515 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34462632 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34464163 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34464521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34464836 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34465177 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 34465191 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 34465276 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34466190 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34466246 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 34466496 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34466589 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 19 34466608 C T Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 19 34466638 C T Y Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 19 34467038 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 34467145 G A N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 19 34467228 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 19 34467305 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 34467420 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34467521 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 34467565 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 34467577 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 34467836 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 34469071 A T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 34469424 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34469437 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34469973 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34470312 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 34470313 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34470651 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 19 34471209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34471228 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34471396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34472265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34472338 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34474259 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34474265 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34476589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34477248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34477325 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34478415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34478690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34479543 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34479838 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34480012 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34480106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34480307 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 34480625 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 19 34481033 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 34482483 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34482498 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 34482542 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 34482678 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 34482694 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 34482695 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 34482809 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 34482828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34482877 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 34483071 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34483075 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 34483101 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34483189 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 19 34483285 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 34483288 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 34483503 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 34483583 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 34483617 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 34483709 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 34484149 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34484227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34484264 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34484363 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 34484391 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 34484409 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34484414 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34484425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34484689 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34484721 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34484771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34485180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34485343 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 34485367 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 34485467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34485865 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34486614 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 34486934 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34487114 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34487457 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34487475 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 34487522 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34487555 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 34487754 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 34488411 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34488512 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34488721 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34488776 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34488830 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34488845 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 34489120 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 34489306 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 34491442 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 34491494 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 34492541 C A Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 34493005 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34493166 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34493650 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 34493699 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34493703 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34493812 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 34493879 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 34493970 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 34493978 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 34494924 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 34494965 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34495400 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34495409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34495463 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34495517 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34495542 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34495658 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 34495931 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34496032 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 34496231 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34496561 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 19 34496596 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 34496634 T G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 34496730 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34497036 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34497434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34498030 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34498054 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34498365 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34498882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34499171 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34499185 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 34499190 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 34499229 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 34499438 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 34499466 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 34499509 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 34499543 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34499548 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34499658 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 19 34500014 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34500295 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34500481 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34500502 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34500599 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34501271 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34501531 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34501628 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 34501666 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34501749 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34501912 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34501948 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34502076 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 34502087 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 34502188 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34502652 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34502732 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34502895 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 34502896 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 19 34502938 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34502981 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34502988 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34502993 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34503014 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34503065 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 34503073 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 34503121 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34503212 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34503240 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34503308 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34503426 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 34503442 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 34503475 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34503515 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34503608 C A N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 19 34503751 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 34503870 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34503904 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 34503968 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34504021 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 34504173 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 34504218 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 34504247 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34504366 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34504395 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 34504652 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34504714 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 34504888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34504925 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34504935 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34505025 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34505106 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34505127 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34505144 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34505206 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 34505216 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 34505258 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34505287 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 19 34505460 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 34505498 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 34505663 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 34505698 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 34505721 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 34505722 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 34505736 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 34505781 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 19 34505926 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34506290 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 34506309 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 34506313 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34506315 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34506326 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34506355 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34506387 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34506395 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34506403 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34506426 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34506802 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34507010 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34507022 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 34507352 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34507424 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34509715 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34509718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34509851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34510480 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34510922 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 34511824 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34513042 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34513538 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 34513700 G T N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 34514310 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 34514326 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34514342 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 34514458 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 34514489 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 34514492 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34514657 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34514682 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34514714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34514818 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34514892 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34515107 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 34515108 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 34515471 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34515718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34515967 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34516097 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34516403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34516418 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34516865 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34517786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34517899 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34518138 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34518162 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34518188 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34518204 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34518218 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34518219 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34518232 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34518305 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34518521 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34518559 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34518612 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34518646 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34518671 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34518696 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34518713 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34518822 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34518860 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34518917 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34519084 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34519280 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34520665 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 34521258 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34521399 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34522205 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 34522212 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 34522213 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 34522318 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34522404 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34522579 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34522631 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34522652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34523074 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34523101 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34523194 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34523325 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 34523409 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 34523469 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 34523570 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 34523768 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34523785 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34524035 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34524113 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34524152 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 34524284 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34524310 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34524609 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 34524615 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 34524842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34524961 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34525259 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 34525321 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34525834 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34526191 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34526473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34526527 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34526594 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34526770 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34526846 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34527126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34527536 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34528026 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34528057 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34528207 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34528223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34528381 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34528431 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34528616 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34528671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34528673 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34528744 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34528789 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34528877 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34528879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34528919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34528965 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34529696 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34529697 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34529882 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34530035 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34530066 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34530071 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34530308 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 34530374 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34530375 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34530405 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34530874 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34530879 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34531117 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 34531379 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34531606 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34531997 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 34532013 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34532256 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 34532270 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 19 34532435 G A N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 19 34532472 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 19 34532556 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34532638 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34533242 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 34533709 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34533710 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34533811 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 34533966 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 34533981 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 34533982 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 34534151 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34534174 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34534399 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 34534417 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34534422 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 34534508 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 34534521 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34534797 C A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 34534807 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 34534848 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34534875 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34534890 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34535043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34535075 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34535135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34535141 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34535289 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 34535307 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 34535574 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 34535605 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34535628 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34535703 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34535796 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34535954 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 34536596 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 34537503 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 34537534 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 34537644 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 34537768 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 34537782 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 34537907 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 34537924 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 34537931 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 34538021 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 34538038 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 34538064 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 34538269 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 34538311 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 34538541 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34538576 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34538595 G A Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 34538680 A C N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 19 34538770 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 19 34538927 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 34539008 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34539018 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34539052 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 34539053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34539096 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 34539214 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34539238 T G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 34539364 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 34539518 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34539682 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 34539868 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 34540268 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 34540723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34541372 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34541662 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 34542186 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34542213 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34542329 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34542346 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34542363 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 34542373 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34542376 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34542485 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34542532 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34542579 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34542584 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34542612 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34542769 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34542892 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34542907 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34543001 T G Y N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 19 34543088 C A Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 19 34543167 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34543182 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 34543260 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 34543312 C G Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 34543360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34543420 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 34543468 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34543492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34543655 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34543929 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 34543989 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 34544067 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34544087 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 34544114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34544154 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34544194 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34544206 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34544284 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34544372 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34544381 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34544526 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 34544528 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34544538 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 34544649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34544658 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 34544670 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34544765 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34544781 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 34544812 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 34544849 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 34544882 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 34544932 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 34545034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34545061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34545967 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34546078 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 34546328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34546386 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 34546412 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 34546676 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34546794 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34546861 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34547148 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34547153 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34547202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34547482 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34547626 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34547839 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34547842 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34547927 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34547961 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34547973 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 34547995 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34548002 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34548316 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 34548416 A C Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 34548755 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 34548773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34549206 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34549377 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 34549652 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34549764 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34549970 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 34549978 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 34550045 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 34550053 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 34550078 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 34550121 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 34550122 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34550315 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34550316 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34550328 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34550513 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34550543 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34550891 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 34551065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34551191 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 34551201 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 34551275 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 34551310 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34551495 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34551558 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 34551754 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34551786 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34551878 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 34552018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34552119 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 34552161 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34552266 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34552328 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 34552342 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34552384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34552475 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34552494 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34552924 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34552990 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34553072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34553359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34553425 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 34553438 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34553645 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34554306 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 34554685 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34555577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34555636 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34555652 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 34555674 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34555745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34555818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34556050 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34556056 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34557900 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34558123 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34564179 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 34564334 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 34564385 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 34564415 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 34564430 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34564463 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 34564468 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34564488 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34564607 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 34564625 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 34566707 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34566891 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34566899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34566911 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34567090 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 34567145 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 34567192 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34567262 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 34567422 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 34567429 A G Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 34567430 T C Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 34567651 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 34567733 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 34567813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34567841 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34567848 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34567853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34567966 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34568014 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 34568043 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34568044 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34568054 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34568108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34568168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34568204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34569045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34569224 A C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 34569235 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 34569344 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34569432 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 34569491 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34569533 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 34569713 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 34569797 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34570228 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34570572 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34570622 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34570634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34570678 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34570681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34570723 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 34570748 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 34570982 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 34571105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34571132 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 34571363 T G Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 34571460 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34571790 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 34571803 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 34571890 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 34571895 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 34571957 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 34572115 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 34572229 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 34573081 G C Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 34573160 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34573451 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 34573631 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34573791 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 34573902 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 34574072 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 19 34574144 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 34574238 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 34574283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34574303 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 34574315 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 34574326 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 34574334 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34574379 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 34574390 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 34574473 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 34574484 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 34574550 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 34574566 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 34574596 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 34574836 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 34574952 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 34574959 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 34574997 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 34575659 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 34575660 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 34575664 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 34575858 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34575990 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 34576281 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34576640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34576731 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34576868 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 34576935 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 34576980 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 34576991 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 34577124 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 34577245 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 34577355 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 34577357 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 34577384 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 34577536 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 34577573 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 34577609 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34577639 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34577854 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 34577909 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34577969 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 34578495 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 34578535 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34579167 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34579772 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34579777 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34579982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34581606 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 34581843 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 34581859 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 34582332 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 34582454 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 34582668 T G N N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.363636363636364 0.363636363636364 0.272727272727273 12 10 4 4 3 19 34582694 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 19 34582714 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 19 34582778 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 34582782 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 34582783 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 34582796 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 34582885 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 34582889 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 34582891 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 34583024 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 34583029 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 34583030 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34583050 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 34583076 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 34583099 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 34583390 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 34583404 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 34583740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34583836 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 34583887 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34583983 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 34584326 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 34584511 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 34584552 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34584691 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34585042 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 34585275 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 34585698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34585865 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34586616 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 34586646 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 34586923 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34587170 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34587254 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34587345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34587410 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 34587422 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 34587473 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34587498 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34587881 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 34587893 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34587899 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34588169 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 34588207 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 34588214 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 34588230 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 34588317 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 34588320 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 34588351 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 34588375 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 34588420 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 34588444 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 34588564 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 34588612 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 34588838 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34588934 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34589037 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 34589095 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 34589137 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34589281 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 34589390 G C Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 34589781 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 34589821 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 34589934 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 34590061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34590073 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 34590452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34590515 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 34590559 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34590916 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 19 34590976 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 34591126 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 34591134 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 34591154 C A Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 34591181 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 34591183 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 34591338 G T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 34591580 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 34591731 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 34592530 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 34594552 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34595952 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34596080 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34596248 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 34596268 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 34596599 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 34596673 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34596704 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34596767 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34597801 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 34598093 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34598219 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34598360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34598595 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34598930 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 34599281 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34599297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34599463 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 34599670 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 34599762 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 34599843 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34600029 T C Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 34600228 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34600355 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34600392 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34600642 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34600984 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 34601103 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 34601303 G T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 19 34601367 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 34601980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34602103 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34602118 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34602241 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34602314 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 34602323 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34602512 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34602534 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34602573 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 34602814 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 34602850 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 34602936 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 34602982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34602983 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 34603025 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 34603069 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34603101 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 34603115 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34603143 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 34603214 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 34603221 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34603250 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 34603328 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 34603332 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34603404 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 34603495 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34603543 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 34603663 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 34603819 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34604073 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 34604205 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 34604210 T A Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 34604350 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 34604383 T G Y N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 19 34605071 G A Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.538461538461538 0.230769230769231 0.230769230769231 17 9 7 3 3 19 34605635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34605974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34606102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34607443 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34607867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34607997 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 34608009 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 34608187 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 34608478 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 34608493 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 34608581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34608603 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34608604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34608988 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34609748 A G Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 19 34609997 G T Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 34610022 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34610261 C T Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 19 34610307 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34610331 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 34610587 A G Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 34611355 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34611665 A G Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 19 34611842 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 34612011 A T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 34612686 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 34612689 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 34612739 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 34612922 G A Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 34613649 T C Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 34613722 T G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34613804 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34614616 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34614912 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34615030 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34615485 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34615645 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34615788 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 34615887 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34615963 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34616543 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 34616550 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34616857 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34616868 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34616941 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 34616998 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34617016 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34617045 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34617092 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34617270 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 34617279 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34617544 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34618011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34618052 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34618305 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34618480 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 34619279 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 34619311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34619538 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34619636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34619762 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34619843 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 34620022 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34620101 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34620410 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34621265 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34621567 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34621914 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34621944 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 34622081 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 34622094 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34622258 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34622259 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34622335 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34622536 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34622545 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 34622547 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 34622670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34622714 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34622726 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34622729 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34622777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34622815 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34622829 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34622869 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34623013 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 34623158 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34623603 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34623750 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34623763 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34623800 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34623828 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34623888 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34624035 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 34624060 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 34624061 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 34624069 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 34624110 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 34624222 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 34624277 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34624374 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 34624610 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34624624 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 34624710 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34624725 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34624727 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34624766 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34624778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34624890 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34624896 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 34624914 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34624981 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 34625016 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 34625041 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 34625104 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34625121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34625176 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34625178 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34625202 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34625229 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34625248 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34625426 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34625462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34625471 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34625784 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34626323 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34626454 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34626473 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34626537 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34626551 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34626848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34627037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34627094 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34627147 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34627208 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34627221 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34627250 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34627277 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34627356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34627379 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34627559 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34627595 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34627625 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34627682 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34627684 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34627760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34627795 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34628004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34628056 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34628074 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34628203 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34628229 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34628371 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34630091 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34630366 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34630945 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34633847 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34636923 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34638042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34638109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34638571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34638741 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34639874 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34640082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34642191 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34642893 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34643990 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34644640 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34644721 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34646039 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34646134 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34648804 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34650192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34650690 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34651134 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34651135 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34651142 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34651527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34651549 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34651557 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34654920 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34655147 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34655456 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34656218 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 34664767 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 34666506 G C N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 19 34667242 T A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 34667473 A C N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 19 34668090 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 34668501 T G Y N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 19 34671192 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 34671774 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 34672000 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 34672563 A T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 34672887 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 34676859 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 19 34676896 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 34677026 T G N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 19 34677114 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 19 34677129 G T N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 19 34678640 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 19 34679320 G A Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 34679533 C G N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 19 34679601 G C N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 19 34679745 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 34680487 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 34680513 C G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 34680540 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 34680600 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 34680900 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 34685089 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 34685129 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34685532 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34685803 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 34688163 T A Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 34689199 T C Y Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 19 34689883 G T Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 19 34691159 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34691348 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 34691465 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34691474 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 34691641 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34691782 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 34691785 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34692376 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 34692775 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 34694078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34694642 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34694646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34694836 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34695043 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 34695068 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 34695235 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34695444 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 34695642 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 34696049 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 34696216 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 34696306 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 34696348 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 34696514 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 34696522 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34696526 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34696607 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34696639 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 34696681 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 34696741 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 34696765 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 34696952 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 34697147 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 34697497 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 34697531 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 34698587 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 34698755 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34699101 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 34699207 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 34699357 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 34699672 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 34700129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34700353 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34700536 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34700668 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 34701274 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34702078 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 34702328 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34702329 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 34702369 G T Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 19 34702914 A T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 34703368 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34703563 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 34703595 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34703853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34704714 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34705227 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34705891 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34705916 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 34706330 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 34706422 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34710711 G T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 34713579 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 34714251 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34721535 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34723275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34723515 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34723585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34723660 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 34723723 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 34723954 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 19 34724520 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34724828 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34725147 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34725186 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 34725372 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 34725737 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34725905 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34725980 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34726089 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 34726151 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 34726573 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34726617 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34726663 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34726667 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34726752 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34726866 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34727351 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 34727641 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34728536 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34728577 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 34728598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34728744 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 34728923 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 34728942 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34729309 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 34729457 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 34729458 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 34729652 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34729729 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 34729862 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34729878 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34729921 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 34730057 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 34730289 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 34730330 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 34730402 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 34730475 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34730491 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34730492 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34730528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34730559 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34730577 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34730698 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 34731029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34731086 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 34731209 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34731244 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34731493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34731600 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34731633 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 34731977 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34731985 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34732119 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34732581 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34732633 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34733360 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 34733494 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 34733708 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 34733727 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 34733822 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34733851 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 34734047 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34734078 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 34734509 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 34734512 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 34734535 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 34734683 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 34734690 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 34734981 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34735166 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 34735279 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 34735309 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 34735441 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 34735555 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 34735558 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 34735606 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 34735816 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 34735834 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 34735993 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34735994 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 34736360 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34736459 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 34736605 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34736808 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34736985 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 34737341 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34737855 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 34738660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34738688 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 34738851 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34739202 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 34739241 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 34739331 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 34739384 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 34739454 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 34739463 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 34739487 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 34739968 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34740033 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 34740128 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 34740195 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34740216 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 34740222 C G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 34740573 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34741272 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 34741725 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 34742109 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 34742677 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 34743120 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 34743688 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 34743706 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 34743721 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 34743729 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34744089 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34744101 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 34744199 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 34744212 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34744234 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 34744248 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 34744500 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 34744583 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34744708 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 34744724 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 34744770 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34744869 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 34744870 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 34745309 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 34745352 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 34745538 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 34746494 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 34748074 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 34748169 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 34748253 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 34748277 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 34748297 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 34748351 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34748588 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 34748762 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 34748858 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 34748890 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 34749088 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 34749166 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 34749283 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 34749326 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 34749344 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 34749413 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 34749535 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34749614 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 34749731 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 34749931 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 34749966 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 34750047 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 34750064 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 34750195 G C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 34750586 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 34750594 A G N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 19 34750596 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 19 34750602 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 19 34750628 A T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 34750634 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 34750706 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 34750709 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 34750716 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 34750789 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 34750817 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 34750834 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 34750930 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 34751280 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 34751428 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 34751668 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 34752069 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 34752084 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 34752140 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 34752272 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34752289 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 34752400 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 34752453 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 34752500 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34752535 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 34752540 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 34752686 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 34752818 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34753073 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 34753175 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 34753218 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 34753422 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 34753671 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 34753886 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34754010 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34754018 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34754183 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 34755033 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34755937 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 34756299 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 34756332 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 34756364 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 34756379 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 34756410 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 34756750 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34757870 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 34758529 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 34758536 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 34758669 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 34758675 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 34758712 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 34758806 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 34758853 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 34758910 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 34759148 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 34759155 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 34759166 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34759186 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 34759278 T G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 34759282 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 34759523 T A N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 19 34759615 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 34759619 A G N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 19 34759636 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 19 34759679 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 19 34759717 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 34759719 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 34759747 A C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 34759750 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 34759803 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 34759847 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 34759860 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 34760165 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 34760332 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 34760881 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 34761467 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 34761598 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 34761640 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34761667 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34761691 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34761714 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34762444 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 34762606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34762875 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 34763340 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 34763576 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34763684 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 34763745 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 34763767 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34763931 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 34763938 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 34763944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34763950 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 34763970 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34764007 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 34764075 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 34764370 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34764388 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 34765467 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 34766648 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 34767083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34767337 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34769009 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34769240 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 34769505 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34769673 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 34769695 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 34769838 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 34770331 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 34770334 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 34770486 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34770676 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34770694 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 34770865 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34770868 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34771077 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34771149 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 34771254 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 34771451 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 19 34771571 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 19 34771632 G C N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 19 34771952 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 34772101 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 34772102 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 34772300 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 34772471 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34772746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34773368 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 34774755 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 34774779 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34776093 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 34776843 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 34777111 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 34780398 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34782279 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34783821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34784029 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34784877 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34784962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34784993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34785282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34786130 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 34786818 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 34787086 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34787495 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 34788060 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34788231 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34788587 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34788661 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 34789168 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34789760 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 34790854 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34790861 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34790924 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34790926 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34791015 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 34791081 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34791995 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34792368 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34792784 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34792797 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 34792831 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34792867 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 34792868 T G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 19 34792872 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 34792990 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34793135 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34793170 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34793203 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 34793471 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34793484 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34793495 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34793555 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34793650 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 34793738 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34794569 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 34794714 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34794813 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 34794814 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 34795003 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 34795035 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34795047 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34795068 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 34795081 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 34796816 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 34796850 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34796901 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34797047 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34797207 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34797217 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34797229 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34797230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34797350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34797394 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34797419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34797429 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34797447 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34797501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34797741 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34797790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34797844 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 34797851 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 34797856 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34798020 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 34798429 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34799385 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 34799573 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34799599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34800206 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34800498 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34800694 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34800886 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34801243 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 34801541 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34801582 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34801612 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34801614 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34801617 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34801890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34801998 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 34802142 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34802162 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34802181 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34802276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34802308 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 34802343 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 34802421 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34802942 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34803011 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34803184 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34803386 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34803447 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34803655 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34803801 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34803889 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34803903 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34803920 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 34803950 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34803981 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34804047 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 34804374 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 34804850 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34805215 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34805614 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 34805856 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34806104 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 34806452 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 34806494 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 34806506 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 34806520 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 34806780 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 34806835 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 34806838 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 34806857 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34806881 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34806884 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34806950 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 34807546 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34807673 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34807992 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 34808258 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34808264 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34808495 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34808909 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34808974 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34809068 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 34809069 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34809096 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 34809140 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 34809321 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 34809336 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34809406 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34809443 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 34809444 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 34809560 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 34812008 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 34812021 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 34812032 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 34812084 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 34812226 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 34812269 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 34812531 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34812549 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34812560 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34812566 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34812790 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 34812870 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34813084 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 34813260 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34813549 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34813568 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34813771 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34813820 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34814034 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 34814292 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34814444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34814784 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34815822 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34815832 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34815882 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34815939 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34815945 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34815968 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34816008 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 34816010 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 34816029 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 34816050 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34816073 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34816116 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34816152 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34816165 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34816167 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34816194 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34816213 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34816221 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34816243 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 34816263 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 34816269 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34816311 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 34816312 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 34816326 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34816408 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 34816417 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 34816531 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34816539 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34816764 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34816839 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34816867 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34816877 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34816992 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34817129 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34817172 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 34817241 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34817324 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34817374 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34817507 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 34817534 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34818038 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34818656 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34819661 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34819927 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 34819935 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 34821215 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 34821781 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 34821801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34821899 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 34822078 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 34822465 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 34822543 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34822615 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34822866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34823167 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34823236 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 34823812 C A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 19 34824030 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34824050 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34824159 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34824196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34824242 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34825818 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 34826307 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 34826474 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 34826476 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 34826532 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34826567 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34826614 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 34826714 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 34826750 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 34826843 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 34826865 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 34826925 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 34827259 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34827298 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34827302 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 34827825 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 34827864 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34828746 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 34829038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34829619 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34829673 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 34829996 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 34830340 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 34830454 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34830549 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 34831227 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 34832036 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34832155 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34832333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34832645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34832664 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34832857 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34833098 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34833209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34833272 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34833599 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 34833711 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 34833752 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 34833964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34834077 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 34834154 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34834401 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34834813 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 34834899 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 34835081 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 34835260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34835279 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 34835583 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 34835627 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 34835663 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 34835711 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 34835734 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 34835739 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 34835778 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 34835838 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 34835850 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34835892 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 34835919 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 34836207 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 34836298 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 34836392 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34836436 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34836477 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34836490 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 34837111 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34837211 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 34837359 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 34837447 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 34837488 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 34837633 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 34837834 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 34838235 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 34838441 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34838450 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 34838533 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 34838591 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34838846 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 19 34838852 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 34838859 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 34839031 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 34839036 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 34839134 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 34839202 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 34839292 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 34839397 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 34839419 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 34839440 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 34839488 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34839558 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 34839714 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 19 34839812 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 34839844 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 19 34839975 A C N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 19 34839998 G A N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 19 34840017 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 19 34840069 T A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 19 34840103 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 19 34840189 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 34840196 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 34840201 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 34840240 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 34840298 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 34840419 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 34840485 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 34840512 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 34840520 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 34840549 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 34840610 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 34840713 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 34840845 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 34840916 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 34840917 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 34840923 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 34840962 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 34841014 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 34841057 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 34841114 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 19 34841203 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 34841210 T A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 34841237 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 19 34841331 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 34841409 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 34841557 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 34841595 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 34841612 A T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 19 34841634 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 34841704 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 34841769 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 34841908 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34841953 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 34842011 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34842048 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34842151 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 34842175 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34842184 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 34842321 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 34842411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34842448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34842542 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 34842574 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34842664 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 34843064 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 34843858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34844019 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34844584 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 34844633 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 34845257 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34845558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34846119 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 34846419 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 34846873 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 34846892 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34847154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34847789 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 34848049 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 34848120 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 34848207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34848411 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34848773 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34848842 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 34848858 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 34848969 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34848985 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34849111 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34849295 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34849332 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34849353 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 34849403 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34849414 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 34849544 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 34849618 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34849688 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 34849964 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 34849970 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 34849990 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34850022 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 34850024 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 34850034 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 34850124 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34850409 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34850599 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34850683 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 34850734 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 34850777 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34850850 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 34850875 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34850996 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 34851293 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 34851330 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 34851332 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 34851444 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 34851549 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 34851588 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34851590 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34851599 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34851635 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34851659 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34851668 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 34852040 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 34852103 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 34852124 C G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 34852177 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 34852319 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 34852324 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 34852441 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 19 34852703 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34852757 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34852827 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 34853126 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 34853141 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 34853193 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 34853287 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34853300 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34853504 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 34853663 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 34853735 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34853783 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 34853878 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34853882 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 34854036 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 34856051 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34856325 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34856535 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 34856945 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34856976 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 34857029 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 34857077 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 34857091 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 34857206 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 34857226 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 34857232 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 34857883 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 34857916 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 19 34857934 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 19 34858003 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 34858236 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34858321 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 34858493 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 34858740 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 34858758 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 34859893 T C Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 19 34859905 A G Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 19 34860121 T C Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 19 34860152 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34860201 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 34860274 A G Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 34860639 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34860856 T A Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 34860973 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34861505 C T Y Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 19 34861625 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 19 34862700 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 34863740 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 34863856 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 34864039 C T N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 19 34864069 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 19 34864398 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 34864399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34865201 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 34865304 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 34865410 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34865486 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 34865549 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 34865768 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 34866371 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 34866387 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 34866561 G T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 34867197 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 34867252 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 34867254 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 34867264 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 34867276 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 34867286 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 34867295 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 34867353 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 34867391 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 34867395 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 34867473 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34867627 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 34867659 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 34867664 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 34867930 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 34868123 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 34868220 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 34868264 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 34868367 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 34868375 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34868398 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 19 34868565 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34868579 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34868604 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 34868868 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 34868904 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 34869127 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 34869384 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 19 34869447 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 34869562 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 34870383 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34870672 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34870725 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34870821 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 34870854 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34871243 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 34871278 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 34871304 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 34871347 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 34871405 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34871493 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 34871520 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 34871743 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34871868 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34871883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34872830 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 34873605 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34873820 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34874026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34874360 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 34874364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34874421 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34874664 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 34874704 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 34874783 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 34875469 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 34876468 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 34876978 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 34877072 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34877134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34877276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34877525 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 34877684 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 34877699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34877845 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 34877943 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34878117 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 34878164 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 34878514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34878589 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 34878706 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 34878738 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34878873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34878885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34878895 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 34878899 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 34879001 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 34879046 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 34879132 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 34879158 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 34879383 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 34879423 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 34879468 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 34879946 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34880084 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 34880089 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 34880133 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 34881205 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 34882284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34882896 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34882972 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 34882996 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 34884764 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 34886010 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 34887331 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34887481 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34887635 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 34888537 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34889014 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 34889331 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34889710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34890073 G C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 34890462 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 34891611 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34892584 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34893490 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34893530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34894030 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 34894052 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34894416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34894504 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 34894562 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 34894946 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 34895348 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 34895470 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 34895729 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 34895825 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 34895833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34896155 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34896450 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34896500 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34896515 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34896586 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34896925 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 34896934 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 34896984 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 34896987 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 34897163 T C N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 19 34897491 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 19 34897848 T C N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 19 34897859 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 34898170 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 34898343 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 34898497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34898763 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 34899261 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34899804 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 34900144 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34900295 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34900441 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34900508 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 34900549 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34900577 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34900674 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34900717 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34900851 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34900891 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 34901009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34901148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34901230 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34903405 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34904495 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34904907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34906805 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34906897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34907580 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 34907795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34908181 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34908455 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34908820 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 34908847 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34908863 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 34909113 C T N Y 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 19 34909325 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34910128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34911561 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 34912071 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 34913551 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 34913864 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34913927 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34914096 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34914278 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 34914577 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34914657 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34914798 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34915145 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34915224 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 34915454 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 34915583 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34915729 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34915761 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34915779 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34915961 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 34916112 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 34916236 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 34916879 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 34917598 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34917611 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34917617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34917643 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 34917692 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 34917712 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34917947 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 34920071 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 34920325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34921128 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 34921137 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34921193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34921221 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 34921223 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 34922068 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34922120 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 34922137 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34922440 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34922448 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34922451 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34922862 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34923342 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 34923623 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34924236 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34924790 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34925082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34926505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34927410 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34928974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34929441 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 34929553 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 34929656 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 34929657 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 34929811 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 34930242 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34930625 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34930687 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 34930916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34931581 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34931692 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34931812 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34931853 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34931880 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34931949 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 34932046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34932125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34932177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34932494 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 34932537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34932599 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34932687 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 34932698 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34932795 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 34932815 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 34933021 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34933056 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34933078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34933106 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34933117 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34933126 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34933146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34933203 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34933516 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34933530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34933537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34933587 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34933655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34933680 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34933705 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 34933708 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 34933711 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34933794 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 34933900 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 34934042 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 34934053 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 34934102 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 34934771 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34934802 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 34934920 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 34934976 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 34934986 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34935007 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 34935111 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34935113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34935116 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34935372 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34935561 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 34935770 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34935916 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34936121 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34936144 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 34936163 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 34936716 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34936740 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34936755 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34936819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34936829 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34937243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34937373 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 34937537 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 34937538 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 34937553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34937739 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34937883 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 34937934 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 19 34938212 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 19 34938341 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34938466 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34938509 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34938581 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34938595 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34941041 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 34941103 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34941130 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 34941204 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 34941244 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34941470 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34941737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34942256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34942259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34942298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34942366 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34942367 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34942533 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34942549 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34942788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34942846 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 34942928 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 34942967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34943015 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 34943128 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34943204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34943335 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 34943531 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34943630 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34943650 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34943687 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 34943935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34944148 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 34944420 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34944688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34944861 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 34945019 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34945318 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34945384 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34945704 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34945714 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 34945738 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 34946571 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 34947557 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 34948095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34948241 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34948294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34948376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34948614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34949053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34949404 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34949454 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 34952723 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34954097 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34955894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34956272 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34956317 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 34956325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34956453 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 34956833 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34957181 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 34957184 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 34957251 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 34957262 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 34957392 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34957584 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34957689 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 34957704 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 34957707 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 34957787 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 34957844 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 19 34957846 T A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 19 34957887 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 34958176 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34958223 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34958283 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 34958365 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34958377 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34958379 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34958392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34958460 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34958635 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34958676 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34958840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34958893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34959017 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34959110 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34959535 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34959698 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34959734 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34959765 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34959778 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 34959840 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34959938 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34960016 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34960020 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34960095 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 34960102 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 34960331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34960419 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 34960424 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 34960514 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 34960603 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 34960607 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 34960641 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34960827 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 34960987 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 34961049 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34961163 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34961477 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 34961662 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34961790 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34962004 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 34962350 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34962492 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 34962620 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34962660 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34962673 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34962759 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34962785 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34963008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34963024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34963030 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34963046 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34963120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34963157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34963180 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34963193 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34963289 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34963395 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34963428 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34963449 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34963461 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34963505 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34963525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34963557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34963560 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34963811 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34964115 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34964169 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34964273 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34964381 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 34964451 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34964481 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34964514 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34964536 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34964629 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34965195 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34965567 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34966109 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34966224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34967256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34967600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34968292 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34968692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34969311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34969648 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 34969879 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34969950 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34971206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34971279 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34971750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34972076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34972384 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34972682 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 34973399 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34973886 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34974307 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34975184 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 34975285 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34975300 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34975349 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34975547 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 34975548 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 34975568 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34975747 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 34975845 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 34975928 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34976056 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34976066 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34976080 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34976252 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 34976528 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34976958 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 34977017 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 34977018 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34977104 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34977281 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 34977350 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34977359 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34977392 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34977397 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 34977413 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34977481 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 34977532 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34977608 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 34977664 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 34977727 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 34977730 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 34977835 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34977849 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34977948 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 34978624 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 34979004 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34979034 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34980040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34980199 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34981032 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34981044 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 34981069 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 34981084 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 34981096 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 34981185 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34981196 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34981198 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34981251 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 34981474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34983726 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34984159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34986651 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34986792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34987521 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 34990343 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34990515 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 34990528 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 34990861 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 34992451 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 34993047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34993301 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 34994802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34994959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34994988 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 34995032 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 34995203 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34995704 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 34995763 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 34995853 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34995902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34995925 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34995968 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34995982 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34995994 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 34996108 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34996242 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34996370 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34996381 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 34996468 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34996575 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 34996669 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 34996672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34996925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34996927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34997015 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 34997017 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 34997206 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34998265 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 34998310 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 34998571 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34998651 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 34999005 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 34999670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34999766 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 34999899 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 34999919 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35000099 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 35001525 A C Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 35001973 T A N N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 19 35002009 C A N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 19 35002035 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 35002499 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 19 35002842 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 35002891 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 35003022 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 35003181 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 35003211 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 35003220 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 35003225 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 35004278 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35004498 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35004615 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35004646 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35005019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35005162 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35005169 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35005432 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35005741 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 35005884 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 19 35005930 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 35006226 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 35006322 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 35006550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35006610 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 35006869 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 35006971 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35007267 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 35007469 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35007513 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35007895 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 35008293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35008304 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35008328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35008389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35008715 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35008836 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35009745 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35011660 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35015292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35015356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35016576 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35016598 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35018029 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 35024279 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35024509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35024529 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 35024560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35024713 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 35027685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35030913 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35031355 T A N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 19 35032391 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35033271 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35034068 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35034228 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35034231 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35035225 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35035773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35036549 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35037305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35038534 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 35041077 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 35042755 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35044827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35045072 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 35045690 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35045826 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35046069 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 35046127 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 35046491 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35047113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35047125 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35047200 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35047268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35047355 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35047614 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35047646 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35047708 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35047729 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 35047801 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35047894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35047920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35048249 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35048298 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35048326 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35048846 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35048961 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 35049274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35049277 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35049358 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35049398 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35049598 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35049606 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35049645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35049650 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35049703 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35049805 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35049960 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 35050254 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 35050274 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35050323 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35050451 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35050532 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35050588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35052574 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35052783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35054212 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 35057253 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35057261 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35060780 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35060906 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35061503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35062140 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35062594 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35062904 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35063059 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35063517 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35064200 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35065114 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35065274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35065819 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35065903 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35065957 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35066047 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35066311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35066316 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35066321 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35066447 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35066507 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35066602 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35067863 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35068228 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35068263 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35068484 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35068491 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35068504 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35068593 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35068730 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35068745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35068781 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35068908 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35068914 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35069023 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35069044 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35069248 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35069413 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35069639 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35069735 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35070009 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35070820 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35070826 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35070834 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35070878 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35070928 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35071037 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35071650 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35073396 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 35073970 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35073980 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35074771 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35074785 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35075029 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35075194 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 35075831 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 35075874 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 35076028 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 35076303 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35076483 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35076709 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 35076830 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 35077158 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35077203 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 35077205 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 35077221 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 35077342 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 35077394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35077404 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35077452 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 35077494 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 35077563 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 35077745 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 35078312 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 35078351 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 35078374 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 35078395 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 35078414 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 35078504 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 35078841 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35079000 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 35079007 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 35079273 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 35080749 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 35081256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35081487 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 35081835 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 35081868 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 35081986 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35082013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35082574 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 35082732 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35082750 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 35082757 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 35082821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35086923 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35087129 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35087676 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35087792 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 35087821 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 35087886 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 35088181 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 35088192 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 35088195 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35088477 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 35088560 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 35088668 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35088697 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 35088864 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35088937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35089083 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35090494 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35091111 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35091829 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35094445 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35095127 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35096153 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35096518 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35097132 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35097254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35097353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35097776 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35097899 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35098915 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35099415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35100441 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 35100746 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35102314 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35105584 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 35108415 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35109448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35109991 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 35110873 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35112017 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35112097 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 35112519 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 35113450 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 35113524 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35113631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35113857 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35114119 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35114173 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35114240 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35114283 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35114546 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35114840 A G N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 19 35115116 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35115241 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35115362 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35115517 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35115646 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 35115788 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35115966 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 19 35118994 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 35119768 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 35119868 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35119892 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35119943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35120010 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 35120187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35120221 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35120363 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35120406 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35120856 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35120918 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35121030 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35121722 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35121767 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35121783 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35121799 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35121833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35121844 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 35121991 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35122058 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 35122342 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 35122351 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35122371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35122497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35122557 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 35122596 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35122739 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35122758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35123018 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35123061 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 35123084 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 35123104 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 35123170 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 35123361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35123422 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35123461 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 35123551 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35123596 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35123684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35123775 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 35123803 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 35123845 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35124025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35124074 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 35124137 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 35124140 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 35124168 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 35124215 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 35124275 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35124325 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35124328 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35124572 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35124610 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35124931 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35125053 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35125082 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35125098 T G N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 19 35125225 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 19 35125242 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 19 35125266 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35125293 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35125331 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 35125362 G T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 35125540 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 35125581 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35125639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35125696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35125836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35125960 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 35125998 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35126189 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35126230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35126491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35126515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35126638 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 35126665 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35126681 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35126750 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35126872 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35126998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35127058 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 35127089 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35127149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35127300 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35127352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35127433 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35127583 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 35127609 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 35127793 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35127807 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35127814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35127936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35128318 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35128775 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35128944 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35128947 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 35129032 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35129263 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 35129332 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35130145 T A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 35130180 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35130489 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35130542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35130673 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35131026 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 19 35131044 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35131441 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35131474 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35131696 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35131836 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 35131968 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35131991 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 35132107 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35132195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35132210 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 35132212 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35132350 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 35132355 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35132376 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 35132384 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 35132408 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 35132416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35132817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35132838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35132881 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 35132995 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35133219 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35133239 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35133252 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35133257 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 35133469 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35133672 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35133725 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35133787 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35135385 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 35136651 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35139209 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 35141756 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 35142532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35142675 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35142769 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 35142902 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 35145039 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35145221 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35145358 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35145403 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35145413 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35145419 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 35145446 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 35145608 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35145650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35145655 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 35145657 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 35146242 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35146260 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 35146292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35146385 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35146443 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 35147578 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 35148677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35148919 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35149118 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35149407 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35150115 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 35155037 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35155042 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35155622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35156176 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35160926 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35161091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35162513 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35162524 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35163524 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 35163568 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35163636 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 35164103 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35165152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35165377 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35165724 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35166281 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35166284 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35166331 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35167149 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 35167819 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35167983 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35168394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35168703 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35168976 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35169288 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35169448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35169578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35170942 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35171188 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35171192 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35171491 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 35171789 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 35172149 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35172171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35172289 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35172327 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 35172393 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 35172540 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 35172561 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35172685 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 35172714 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35172752 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35172846 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35172865 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35173022 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35173379 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 35173593 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35173765 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35174829 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35174831 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35174842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35174866 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35174949 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35175005 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35175124 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35175192 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 35175210 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 35175261 C G N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 19 35175303 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35175335 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35175342 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 35175350 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35175381 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35175491 G C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 35175509 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35175585 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 35175712 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35175739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35175943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35176117 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 35176177 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 19 35176247 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 35176253 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 35176280 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 35176293 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 35176302 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 35176347 G C N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 19 35176373 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 35176440 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 35176465 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 35176518 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 35176519 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 35176523 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 35176532 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 35176571 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 35176666 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 19 35176752 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35176772 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 19 35176782 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 19 35176783 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 19 35177214 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 35177255 A T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 35177324 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 35177379 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 35177386 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 35177478 G C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 35177592 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 19 35177603 G A Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 19 35177606 A T Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 19 35177608 G A Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 19 35177730 A T N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 19 35177733 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 19 35177804 C G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 35177808 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 35177814 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 35177838 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 35177852 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 35177870 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 35177903 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 35177939 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 19 35178053 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 35178057 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 35178103 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 35178360 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 35178494 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 35178500 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 35178743 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 35178877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35178903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35178991 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35179033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35179208 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 35179363 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 35179471 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35179477 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35179481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35179488 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35179627 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 35179665 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35179768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35179876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35180110 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 35180136 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35180364 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35180730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35181312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35181494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35182475 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 35185436 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35186289 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35187996 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35188966 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 35190200 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 35191015 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 35191108 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 35191117 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 35192235 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 35192315 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 35193761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35194713 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35195163 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 35195192 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 35196586 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 35196701 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 35196743 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 35196777 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 35196836 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 35196950 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 35196963 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 35197216 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 35197219 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 35197241 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 35197284 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 35197698 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 35198056 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35198252 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 35198496 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35198542 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 35198614 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35198663 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 35198679 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35198682 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 35198701 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35198753 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35198754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35198765 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35198768 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35199319 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35199380 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35199418 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35199427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35199819 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35199886 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 35199898 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 35200020 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 35200288 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 35200507 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35200661 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 35201017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35201192 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35201499 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35201679 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35201749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35202549 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35202708 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35203077 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35203220 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35203298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35203353 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35203476 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35203706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35203781 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35204034 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35204383 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35204694 C T N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 35204830 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35204997 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35205362 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35205480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35205486 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35205531 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35205535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35206116 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35206697 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35209222 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35209501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35209577 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35209722 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35210363 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35210461 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35210828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35210902 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35210922 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 35211439 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 35211503 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35211515 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35211525 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35211533 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35211569 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35211615 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35211773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35211803 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35212051 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35212124 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35212148 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35212672 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35212904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35212956 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35213087 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35213311 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35213541 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35213739 G T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 19 35213799 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 19 35213811 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35214018 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 35214285 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35214371 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 35214510 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35214678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35214721 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 35215233 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35215381 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35216239 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35217039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35218436 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 35218618 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35218689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35218897 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 35219085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35219247 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35219659 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 35219923 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35220118 C A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 35220283 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35220940 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 35221253 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 35222257 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 35222333 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35222388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35222405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35222694 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 35223086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35223272 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35223496 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35224661 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35225013 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35225126 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35227541 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35227556 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35227573 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35227598 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35227660 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35228035 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35228920 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35228951 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35229077 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35229286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35229514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35229522 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35229526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35229652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35229679 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35229755 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35230636 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 35230646 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 35230828 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 35230829 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35230897 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35231069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35231586 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 35231678 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 35231933 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 35232379 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35232802 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35233532 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35233585 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35234073 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35235148 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35235202 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35235292 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35235522 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35235655 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35235687 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35235848 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35235926 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35235959 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35236022 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35236117 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35236126 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35236134 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35236141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35236297 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35236382 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35236420 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35236427 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35236851 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35236908 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35237051 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35237057 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35237071 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 35237101 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35237104 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35237159 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35237196 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35237208 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35237242 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35237303 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35237504 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35237535 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35237565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35237614 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35237789 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35237963 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35237964 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35237993 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35238046 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35238145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35238181 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35238221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35238290 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35238349 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35238357 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35238384 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35238435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35238467 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35238549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35238671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35238696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35238706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35238718 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35238788 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35239061 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35239075 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35239083 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35239097 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35239148 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 35239160 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 35239395 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35239637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35239748 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35239843 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35239875 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35239882 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35239941 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35239966 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35239984 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35240023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35240063 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35240091 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35240108 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35240325 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35240357 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35240458 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35240468 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35240639 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35241034 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35241348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35241435 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35241896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35242308 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35242719 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35242791 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35242976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35243273 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35243920 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35244121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35244544 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35244785 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35244871 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35245140 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35245435 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35245480 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35246683 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35246759 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35246844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35247063 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35247090 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35247263 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35247409 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35247893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35248448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35248840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35248851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35248859 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35249668 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35249810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35250019 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35250159 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35250644 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35250734 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35250770 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35251980 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35253968 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35254119 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35254798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35256009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35256808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35256901 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35256933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35256941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35257037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35257156 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35257165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35257250 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35257412 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 35257650 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35258265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35258333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35258948 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35259803 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35260097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35260807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35261127 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35261213 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35261250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35261730 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35261755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35261818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35261867 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35261954 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35261966 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35262138 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35262246 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35262509 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35262585 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35262618 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35262661 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35262670 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35262694 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35262748 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35262817 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35262943 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35263007 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35263082 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35263114 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35263185 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35263194 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35263276 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35263347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35263492 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35263494 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35263503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35263511 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35263619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35263631 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35263803 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35263934 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35263996 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35264171 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35264365 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35264639 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35264937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35265161 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35265289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35266233 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35267623 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35267702 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35267740 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35267753 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35267861 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35268074 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35268153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35268803 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35270418 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35272654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35274029 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35275125 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 35277921 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35277928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35278165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35279534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35279613 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35279871 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35281915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35282440 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35283733 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35283827 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35284014 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 35284092 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35285618 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35286243 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 35287697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35289051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35289587 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35290151 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35291048 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35291324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35292144 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35292158 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35294432 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35295004 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35295432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35295945 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35296616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35300407 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 35301519 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35301705 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35301735 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35301764 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35306199 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35306449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35306590 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35306623 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35307219 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35307275 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35307877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35308259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35308863 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35308925 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35315868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35316661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35316886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35317040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35317122 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35319236 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35319262 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 35319832 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 35320988 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 35321194 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 35322843 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35323081 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 35323879 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35324853 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35325518 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35326283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35327315 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 35327551 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 35328003 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35328729 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35330618 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35332225 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35332967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35333992 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35334420 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 35335253 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 35335350 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 35335400 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35335401 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35335421 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35335470 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 35335515 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35335630 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 35335677 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35336439 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35337084 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 35337156 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35337230 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35337265 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35337303 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35337498 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35337597 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 35337662 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35337692 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35337715 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35337821 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35337861 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35337992 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35337993 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35338035 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35338133 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35338174 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35338230 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35338242 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35338286 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35338367 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35338371 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35338456 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35338482 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35338514 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35338604 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35339097 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35339129 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35339329 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 35339533 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35340240 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 35341023 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 35341276 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35341425 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35341440 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 35341441 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35341464 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 35341480 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35341514 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35341535 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35341550 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35341581 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 35341643 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35341661 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 35341755 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35341899 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35341986 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35342079 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35342088 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35342099 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35342149 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35342193 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 35342204 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35342239 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35342323 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35342429 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 35342526 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 35342700 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35343639 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 35343769 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35343990 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 35344363 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35344382 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35344556 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35344599 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35345273 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35345443 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35345450 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35345547 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35345617 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35345639 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35345663 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35345780 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35346004 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35346035 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35346087 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35346172 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35346405 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35346484 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35346568 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35346637 A C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 35347085 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35347161 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35347513 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35347587 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35347701 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35348818 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 35348821 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35348975 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 35348997 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 19 35349011 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 35349020 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 35349040 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 19 35349119 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35349162 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35349175 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35349207 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 35349219 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35349260 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35349289 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35349311 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35349441 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35349595 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35349811 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35349873 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35349898 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35349906 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 35349977 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35350172 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 35350268 G T N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 35350485 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35350616 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35350623 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35350640 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35350679 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 19 35350741 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35350759 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35351107 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35351124 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35351129 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35351195 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 35351205 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35351219 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35351221 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35351235 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35351704 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 35351720 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 35351866 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 35351899 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 35351907 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 35351921 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 35351984 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35352101 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 35352102 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 35352114 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 35352133 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 35352157 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35352230 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 35352308 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 35352314 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 35352379 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35352383 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35352465 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35352488 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35352527 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35352531 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35352566 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35352597 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 35352615 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35352618 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 35352687 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35352716 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35352725 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35352747 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35352787 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35352848 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35353141 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35353203 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35353339 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 35353572 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35353609 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35353626 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35353630 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35353638 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35353830 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35353862 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35354169 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35354241 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 35354260 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 35354476 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 35355159 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35355783 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35355824 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35357624 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35357929 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35358928 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35359313 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35359843 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35361113 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35361381 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35361637 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35361999 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35362253 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35362361 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35362399 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35362432 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35363062 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35363565 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35363612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35363933 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35364251 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35364397 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35364756 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35365226 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35365323 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 35365336 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35365422 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35365541 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35365612 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35365647 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35365770 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35365808 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35365932 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 35366082 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35366299 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35366384 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 35366667 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35367162 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35367204 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35367244 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35367394 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35367414 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35367528 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35367768 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35367770 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35367903 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35368128 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35368258 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 35368694 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35368748 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 35368758 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 35368769 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35369143 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 35369205 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 19 35369236 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35369740 G C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 35370003 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35370024 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35370028 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35370135 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35370212 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 35370344 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35370359 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35370424 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35370461 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 35370625 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35370746 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 35370803 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35371054 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35371421 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 35371518 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 35371921 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 35373458 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35373505 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35374111 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35374117 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35376496 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 35376647 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 19 35376759 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35376884 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35376904 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35377041 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35377247 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35377248 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35378088 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35378521 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35380582 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35380601 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35380608 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 35380645 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35380652 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35380694 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 35380702 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 35380751 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35380778 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 35380782 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 35380788 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 35380840 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35380897 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35380938 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35380962 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 35381111 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35381202 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 35381208 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 35381266 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35381578 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 35381711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35382106 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35382225 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35382592 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35382886 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35383037 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35383105 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35383248 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35383250 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35383347 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35383414 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35383476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35383647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35383974 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35385148 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35385706 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35385978 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 35387815 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35388197 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35388304 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35388341 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35389401 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35389406 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35389571 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35389736 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35390153 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35390503 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35390578 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35390815 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 35391085 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 35391169 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 35392231 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35392496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35392944 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35393159 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35393453 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35393981 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35394217 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 35394317 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 35394430 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35394499 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35394668 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35394672 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35395082 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35395788 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35396063 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35396879 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 35397547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35397671 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35397914 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35397925 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35399438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35400910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35401250 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35401349 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35401890 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35401922 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35401940 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35402030 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35402039 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35402117 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35402201 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35402405 C A Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 19 35402568 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35402592 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35402637 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35402683 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35402730 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35403103 G A Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 19 35403144 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 35403215 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35403274 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 35403279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35403587 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35403621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35403780 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35403797 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35404434 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 19 35404656 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35404727 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35404772 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35404851 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35404888 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35405303 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35405317 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35405332 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 35405472 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35405475 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35405494 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35405516 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35405570 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 35405774 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35405798 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35405957 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35405962 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35405972 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35405989 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35406040 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35406049 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35406063 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35406087 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35406091 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35406218 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35406313 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 35406394 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35406552 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35406553 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35406834 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35406976 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35407002 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35407390 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 35414241 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 35414656 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 35417812 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 35417982 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35418044 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35418068 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35418106 C A Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35418117 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35418171 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35418181 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35418183 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35418234 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35418267 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35418433 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35418435 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35418477 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35418481 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35418484 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35418507 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35418571 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 19 35418609 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35418671 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35418719 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 35418730 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35418856 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 35418895 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 35418905 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 35419157 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 35419300 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35419365 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35419381 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35420043 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35420386 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35420453 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35420464 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35420606 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35420827 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35420931 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35420968 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 35420969 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35421030 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35421122 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 35421251 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 35421300 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35421338 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 35421421 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 35421447 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35421531 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 35421537 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 35421639 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35421645 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35421730 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35421768 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35421828 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35421900 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35422150 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35422194 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35422241 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35422250 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 35422278 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 35422302 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35422328 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35422348 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35422366 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35422385 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 35422386 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35422416 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 35422479 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35422503 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35422616 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35422685 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35422709 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35422780 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35422821 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35422838 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35422922 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35422926 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35422998 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35423015 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35423041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35423077 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35423327 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 35423328 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 35423363 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35423384 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35423413 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35423421 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35423608 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35423615 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35423832 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35423892 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35423955 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35424181 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35424557 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35424584 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35424681 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35425814 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35425822 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35425848 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35425972 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35426145 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35426313 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 35426447 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35426759 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35426770 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35426771 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35426901 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35426935 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35426937 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35427084 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35427105 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35427108 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35427191 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35427223 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 35427357 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35427500 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35427519 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35427540 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35427551 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35427604 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35427610 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35427642 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35427651 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35427692 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35427718 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35427722 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35427728 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35427745 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35427957 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 35427971 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 35428971 T C N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 19 35429136 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 35429181 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35429198 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35429212 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35429595 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35429919 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35429953 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35430156 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 35430407 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 35430480 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35430689 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35431501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35432953 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 35433064 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35433258 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35433410 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35433557 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35434849 T G Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35435440 G T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35435484 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35435557 T C Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 35435640 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 35435843 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35435857 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35435926 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35436062 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35436063 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35436223 A T N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 35437007 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35437023 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35437234 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35437612 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35437782 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35437895 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35438023 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35438942 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35440006 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35440805 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35441392 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35441678 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35442722 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35442936 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 35444795 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35444953 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35446070 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35446290 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35446468 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35446683 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35446712 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35446768 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35446774 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35447367 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35447707 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35448004 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35448365 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35448372 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35448894 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35448951 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35448959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35449662 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35449988 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35450274 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 35450940 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35451221 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35451357 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35451519 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35451749 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35451822 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35451888 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35451904 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35452122 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35452123 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35452453 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35452503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35453691 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35455540 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35456062 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35458479 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35458515 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35461507 C T Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 35464673 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 35465122 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35466616 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 35466859 G T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 19 35467303 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35467605 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35467849 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 35467964 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 35468214 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35468266 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35468493 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35468693 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35468800 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 35468985 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 35469026 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35469055 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35469262 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35469606 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35470262 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35470441 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35470947 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35470975 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 35471275 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35471396 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35471559 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 35471891 G T N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 19 35472362 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 35472919 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 35473166 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35473219 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35473317 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35473339 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35473359 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35473370 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 35473528 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35473672 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35473891 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35473928 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35474151 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35474158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35474822 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35474849 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35474963 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35475104 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35475106 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35475122 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35475185 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35475477 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35475778 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 35475887 G A N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 19 35475992 G T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 35476002 G C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 35476012 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 35476074 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 35476149 A C N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 19 35476160 A T N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 19 35476179 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 19 35476192 G T N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 19 35476221 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 35476281 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 35476450 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 35476463 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 35476471 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 35476544 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 35476554 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35476569 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 35476616 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 35476748 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35476750 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35476758 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35476824 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 35476827 A C N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 19 35476850 C G N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 19 35476893 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 35476903 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 35478841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35478891 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35478912 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35478927 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35478928 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35478955 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35478971 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35479017 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35479019 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35479043 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35479047 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35479105 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35479168 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 35479236 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 35479346 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 35479358 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 35479434 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35479501 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35479619 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35479674 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35479692 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 35479823 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35479837 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35479970 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35480185 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35480293 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35480708 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35480848 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35481177 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 35481229 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 35481422 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35481472 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35481527 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35481546 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35481850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35481902 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35481913 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35481976 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35482044 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 35482302 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35482321 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35482327 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35482335 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35482355 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35482380 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35482382 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35482444 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35482566 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35482641 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35482699 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35483151 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 35483606 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35483647 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35483776 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35484312 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35485026 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35485267 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35486032 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35486042 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35487847 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35488816 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35489317 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 35489813 G C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 35490118 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35490251 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35491515 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35492366 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35492411 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35492520 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35493882 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35494684 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35495212 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35496086 T G N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 19 35496415 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35496899 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 35497527 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35498251 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35499014 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35500661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35502915 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 35502929 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 35504188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35505768 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35508127 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35508433 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35508488 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35508659 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35508812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35508844 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35508978 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35509109 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35509709 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35510028 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35510609 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35511132 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35511136 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35511772 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35512293 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35512578 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35513125 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35513144 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35514116 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 35514353 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35514502 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35514520 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35514932 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 35515253 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35515425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35515549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35515557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35515629 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35515648 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35515774 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35515830 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35516184 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 35516313 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35516364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35516453 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35516603 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35517472 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35517522 C A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 35518079 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 35518241 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 35518276 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 35520233 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35520286 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35520298 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35520690 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35521347 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35521542 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35521811 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35522040 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35522159 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 35522412 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35522917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35523761 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35524043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35524585 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35524682 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35524906 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35525661 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 19 35525708 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35525710 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35525826 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35525901 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35526121 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35526171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35526292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35526387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35526422 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35526495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35526594 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35526613 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35526619 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35526687 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35527162 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35527244 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35527331 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35527344 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35527349 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35527378 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35527524 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35527546 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35527701 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35527713 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35528119 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35528254 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 35529210 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35529637 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35529757 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35529788 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35529970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35529981 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35530008 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35530184 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35530213 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35530255 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35530495 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35530659 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35530670 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35530691 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35530819 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35530897 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35530958 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35530960 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35531052 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35531096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35531240 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35531907 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35531921 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35531992 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35532198 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35532213 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35532251 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35532253 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35532269 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35532289 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35533558 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35535465 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35535537 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35535561 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35535775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35536066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35536706 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35536782 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35537215 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35537395 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35537431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35537666 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35537720 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35537721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35537954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35538011 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35538052 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35538116 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 35538139 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35538264 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35538283 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35538345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35538364 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 35538368 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35538392 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35538507 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35538550 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35538590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35538607 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35538618 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35538676 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35538813 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35538837 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35538841 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35538909 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35538934 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35538941 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35538944 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35539074 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35539091 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35539170 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 35540141 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35540982 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 35541875 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35541975 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35541986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35542347 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 35543204 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35543224 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35543308 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35543448 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35543509 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35543675 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35543688 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35544758 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35544795 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 35544875 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 35545006 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35545645 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35545939 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35546506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35546814 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35546824 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35546980 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35546981 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35547006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35547023 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35547029 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35547131 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35547133 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35547263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35547284 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35547529 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35547533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35547536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35547585 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35547620 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35547870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35547895 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35547965 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35548038 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35548076 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35548116 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35548880 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 35549452 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35549641 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35550291 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 35550341 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 35550353 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 35550480 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35550679 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35550688 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35550691 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35550702 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35550705 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35550716 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35550723 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35550738 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35550746 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35550773 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35550801 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35550824 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35550856 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35550883 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35550967 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35551150 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35551279 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 35551498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35551606 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35551924 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35551986 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35552255 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35552377 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35552619 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35552652 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35552668 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35552841 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35552912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35553142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35553320 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35553856 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35553912 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35553919 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35553973 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35555071 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35555092 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35555115 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35555216 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35555240 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35555256 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35555795 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35556255 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 35556550 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35556584 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 35556822 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35557080 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35557433 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35558052 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 35558247 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35558257 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35558769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35560391 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35560449 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35560512 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35560553 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35560558 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35560608 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35560695 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35560824 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35561102 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35561345 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 35561684 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35561772 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35561871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35563464 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35563975 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 35564157 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 35564669 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 35565017 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35565021 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35565117 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35566320 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35567052 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35568439 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35569199 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35569654 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35569726 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35570753 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 35573475 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35574065 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35576300 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 35576378 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 35577023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35578007 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35578874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35579720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35579984 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35579985 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35582373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35582881 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35583206 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35583543 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35584465 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 35585656 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35585683 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35585727 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35585782 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35586072 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35586089 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35589811 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35596195 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35596475 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35596536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35596684 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35597200 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35597251 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 35600453 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35600906 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35601815 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35602166 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35603037 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 35603139 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 35605434 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35606288 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 35606410 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35607152 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35607400 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35608681 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 35608682 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 35611904 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35612625 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35613910 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 35616197 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35616295 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35618619 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35618692 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35618731 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35618891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35619566 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35619995 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35620625 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35621079 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35623260 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35624165 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35624171 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35624245 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 35624246 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 35624271 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35624292 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35624339 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35624464 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35624742 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35624868 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35625258 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35625389 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35625398 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 35625399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35625599 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35625648 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35625966 A C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35626010 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 35626542 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35627575 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35627953 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35627977 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35629464 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35629481 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 35629555 A C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 35630380 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35630715 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35630718 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35630720 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 35630918 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35630940 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35630949 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35630984 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35630987 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35631042 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35631047 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35631051 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35631083 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35631084 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35631111 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35631286 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35631289 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35631362 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35631376 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35631458 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35631485 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35631497 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35631552 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35631560 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35631644 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35631654 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35631661 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35631671 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35631733 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35631766 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35631777 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35631808 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35631866 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35631913 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35632018 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35632023 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35632033 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35632064 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35632112 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35632131 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35632161 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35632270 T G Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 35632281 T C Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 19 35632344 A G Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 19 35632352 C A Y N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 19 35632354 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 19 35632363 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 35632393 A G Y Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 19 35632585 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 35632611 C A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 35632636 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 35632687 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 35632712 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35632715 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35632772 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35632817 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35632820 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35632859 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35632867 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35632870 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35632942 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35632967 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35633008 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35633027 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35633070 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35633081 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35633139 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35633197 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 35633254 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35633302 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35633343 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35633365 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35633367 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35633476 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35633481 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35633513 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35633523 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35633600 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35633616 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35633675 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35633688 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35633710 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35633725 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35633748 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35633752 T C Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 35633757 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35633767 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35633836 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35633841 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35633854 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35633932 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35633953 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35633977 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 35634087 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 35634261 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35634316 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35634366 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35634379 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35634417 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35634592 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35634631 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35634667 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 35634681 T G Y N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 19 35634691 T C Y Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 19 35634695 T C Y Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 19 35634697 G T Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 35634717 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 35634768 G C Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 35634771 C T Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 35634776 C T Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 35634797 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 35634800 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 35634825 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 35634838 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35634916 G T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 35634948 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 35635081 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35635202 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35635228 T A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35635242 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35635284 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35635401 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35635459 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35635495 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35635569 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35635624 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35635634 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35635655 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35635735 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35635751 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 35635770 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 35635957 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 35636110 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35636476 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35636560 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35636576 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35636613 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35636723 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35636951 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35637117 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35637170 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35637469 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 35637511 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35637527 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35637657 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35637922 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 35638335 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 35638485 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35638824 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35638920 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35638976 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35638977 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35638980 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35639318 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35639572 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35639648 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35639659 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35639725 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35639803 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35639874 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35639994 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35640041 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35640285 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35640476 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 35641007 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35641185 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35641210 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35641615 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35641877 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35642019 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 35642492 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35642503 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 35642717 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35643447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35643471 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35643579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35643594 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 35643687 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35643706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35643760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35643853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35643886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35643985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35644067 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35644088 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35644091 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35644115 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35644116 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35644333 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35644408 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35644424 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35644686 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35644722 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35644833 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35644862 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35644922 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 35644935 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 35645036 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35645082 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35645320 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 35645328 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 35645341 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 35645361 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 35645566 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 35645567 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 35645594 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 35645595 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 35645598 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 35645886 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35645992 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35646093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35646119 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35646466 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35647073 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35647552 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35647740 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35647788 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 35648414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35648431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35648755 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35648858 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35648868 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35649132 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35649136 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35649576 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35649794 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35649855 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35649945 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35650104 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35651525 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35654590 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35656419 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 35658842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35658952 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35659209 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35666519 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35668645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35668657 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35668769 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35675744 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35677782 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35678003 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35678418 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35679325 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35679886 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35682868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35685887 G A N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 19 35689612 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35690843 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35694566 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35697887 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 35699708 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35701656 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35701707 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35701715 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35701726 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35701734 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35701742 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35701775 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35701787 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35701870 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35702151 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35702341 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35702553 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35702818 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35702943 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 35703183 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35703222 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35703223 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35703273 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 35705268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35706407 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 35707547 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35707971 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35708521 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35709594 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35710965 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35711160 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35711354 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35711655 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35711780 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35711799 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35711884 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35711900 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35711962 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35712097 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35712180 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35712244 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35712373 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35712425 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35712482 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 35712549 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35712645 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 35712762 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 35712833 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35712846 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 35712861 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35713009 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35713073 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35713196 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35713205 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35713266 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35713279 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35713291 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35713315 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35713383 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35713410 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35713412 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35713519 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35713531 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35713572 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35713596 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35713634 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 35713635 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 35713649 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 35713671 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35713722 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35713785 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35713811 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35713834 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35713888 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35713937 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35714001 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35714222 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 35714535 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35714682 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35714689 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35714698 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35714921 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35714994 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35715445 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35715628 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35715671 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35715696 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35715841 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35716041 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35716268 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35716776 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35717174 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35720172 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35721195 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35731638 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35731797 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35731908 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35732392 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35732971 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35733015 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35734094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35739509 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35739511 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35739632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35739832 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35739846 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35739941 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35740055 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35740154 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35740537 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35740714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35748594 C A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 19 35748628 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35748642 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35748704 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35748724 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35748881 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35748937 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35748945 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35749022 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35749032 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35749254 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35749339 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35749510 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 35749979 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35750373 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35750475 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35750587 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35750888 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 35751485 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35751649 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35751669 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35751680 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35751720 T G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35751723 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35751794 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35752001 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35752186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35752486 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 35752739 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 35752849 A C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 35752983 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 35753022 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 19 35753023 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 35753025 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 19 35753159 C G N N 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 19 35753260 G C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 35753311 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35753576 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 35753597 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 35753632 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 35753640 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 35753652 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35753758 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 35753759 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 35753817 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 35753863 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35753869 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35753959 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 35754019 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35754040 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35754056 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35755453 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35756677 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35756894 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35757243 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35757329 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35757386 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35757636 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35757779 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35757787 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35758324 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35758587 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35758755 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35758986 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35759006 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35759051 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35759301 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35759335 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35759350 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35759351 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35759380 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35759604 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 35759619 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35759682 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35759689 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35759764 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35759862 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35759927 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35760033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35760088 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35760092 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35760173 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35760280 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35760291 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 35760345 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35760346 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35760394 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35760475 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35760538 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35761048 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35761488 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35761742 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35761776 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35761844 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35761845 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35761881 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35761900 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35762232 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35762287 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35764139 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35764241 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35764334 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35765572 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35765929 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35766279 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35767754 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35769442 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35770520 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35770521 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35770793 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35774837 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35775879 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35776048 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35776378 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35776651 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35776658 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35776665 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35776716 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35776717 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35776910 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35777017 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35777033 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35777148 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35777435 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 35777885 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 35777973 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35778015 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35778034 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 35778179 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 35778330 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35778343 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35778346 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35778366 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 35778419 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35778420 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35778508 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35778756 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35778989 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35779038 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35779196 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35779317 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35779381 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35779560 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35779658 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 35779777 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35780013 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35780177 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35780302 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35780353 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 35780424 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 35780506 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35780615 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35780946 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35780998 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35781007 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35781369 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35781415 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35781538 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35781542 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35781987 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 35782250 A C N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 35782430 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35782459 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35782489 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35782492 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35782498 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35782520 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35782525 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35782577 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35782708 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35782743 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35782845 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 35782878 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 35782881 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 35782887 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 35782903 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 35782989 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 35783019 C G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 35783092 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 35783153 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 35783175 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 35783190 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 19 35783266 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35783286 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35783289 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35783326 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 35783342 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 35783393 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35783533 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35783549 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35783557 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35783581 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35783740 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35783787 T A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 35783804 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35783816 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35783877 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35784048 A T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 35784067 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 35784092 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 35784251 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 35784372 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 35784405 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 35784439 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 35784466 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35784472 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35784475 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35784539 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35784576 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 35784606 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 35784714 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35784944 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35785017 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35785030 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35785033 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35785034 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35785098 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35785145 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35785172 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35785191 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35785194 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35785240 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35785378 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35785394 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35785455 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35785465 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35785485 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35785536 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 35785667 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35785764 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35785876 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35785894 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35785905 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35785919 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35785982 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35786017 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35786039 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35786066 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35786140 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 35786229 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 35786247 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35786255 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35786274 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35786298 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 35786333 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 35786346 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 35786359 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 35786413 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 35786428 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 35786487 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 35786541 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 35786554 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 35786570 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 35786773 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35786804 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35786863 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35786993 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35787193 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35787231 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35787315 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 35787316 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 35787458 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35787497 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 35787503 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 35787634 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35787999 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35788124 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35788152 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35788183 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35788242 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35788255 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35788295 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35788401 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35788447 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35788606 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 35789758 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35789784 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35789878 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35789879 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35789984 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35789999 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35790177 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35790301 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35790387 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35790435 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35790495 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35790635 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35790697 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 35790737 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35790744 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35790800 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35790894 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35790905 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35790929 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35790974 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 35790988 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35791042 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35791062 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 35791065 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35791123 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35791128 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35791133 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35791136 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35791160 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35791179 G C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 19 35791181 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 19 35791210 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 35791290 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 35791335 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 35791446 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35792627 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 35792750 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35793114 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35793780 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 35793849 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 35793854 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 35795161 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 35795289 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35795353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35795492 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35795581 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35795650 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35795661 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 35795699 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 35795723 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35795868 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 35795978 C G N N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 19 35796115 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 19 35796181 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 35796471 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35796490 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35796526 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35796529 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35796597 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 35796629 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 35796854 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 35796890 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35798738 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35799074 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35799677 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35800258 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35801406 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35803671 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35803698 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35803833 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35803951 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35805503 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35806022 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35806027 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 35806078 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 35806889 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 35806991 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 35807013 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 35807026 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 35807082 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 35807128 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35807132 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 35807188 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 35807212 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 35807215 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 35807282 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 35807298 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 35807299 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 35807363 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 35807437 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 35807456 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 35807459 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 35808740 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35808821 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 35808846 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 35808999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35809512 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 35810060 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 35810343 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35811280 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35811577 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35811627 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 35811908 G T Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 19 35812127 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35813324 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35813721 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35813835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35814055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35814090 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35814245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35814294 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35814487 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35814595 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35814698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35814785 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35815154 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 35815281 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35815360 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35815490 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35815762 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35816365 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35816503 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 19 35817177 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35817244 A T N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 19 35817856 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35817997 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35818799 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 35818872 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35819273 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 35819675 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35819853 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 35819854 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 35819856 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 35819961 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35821148 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35822084 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35822346 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 35822524 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35822583 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 35822584 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 35822636 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 35822656 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 35822677 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 35822702 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 35822707 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 35822710 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 35822809 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 35822825 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35822836 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 35823014 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 35823060 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 35823079 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35823116 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35823405 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35823413 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 35823454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35823573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35823876 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35823941 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35823964 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35823973 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35823986 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35824103 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35824134 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35824172 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 35825202 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35825392 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 35825442 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 35825449 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 35825566 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 35825611 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 35825680 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 35825699 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35825706 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 35825714 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 35825876 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 35826097 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35826107 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35826111 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35826254 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35826273 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35826340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35826406 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35826476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35826496 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35826558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35826579 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35826620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35826808 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35826917 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35827095 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35827232 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35827455 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35827552 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35827591 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35828029 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35828109 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35828466 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35828611 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35829054 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35829340 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 35829355 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 35829369 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 35829373 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 35829375 G T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 35829388 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35829397 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35829423 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35829441 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35829456 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35829499 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35829524 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35829535 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35829642 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35829711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35830106 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35830156 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35830338 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35830532 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35830571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35830651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35831226 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 35831297 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 35831410 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 35831719 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35831779 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35831863 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35832057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35832089 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35832107 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35832113 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35832171 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35832185 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 35832186 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35832205 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35832271 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35832816 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35832850 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35833183 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35833196 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35833369 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35833429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35833456 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35833534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35833601 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35833634 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35834549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35834729 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35834742 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35835039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35835040 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35835172 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35835178 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 35835265 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35835277 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35835486 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 35835506 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 35835655 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 35835999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35836046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35836086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35836175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35836234 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35836272 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 35836314 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 35836376 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35836595 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35836606 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35836658 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35836751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35837163 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 35837184 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35837222 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35839500 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35839730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35839736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35840138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35840262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35840377 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35840380 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35841047 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35841131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35841132 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35841285 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35841389 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 35841443 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 35841648 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 35841660 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 35841767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35841920 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35841994 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35842281 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35842345 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35842369 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35842405 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35842620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35842677 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35842748 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35843016 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35843117 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35843179 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35843422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35843663 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35843680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35843805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35843845 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35843876 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35844080 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35844314 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35845276 G C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35845297 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 35845580 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35845801 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35845854 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35846470 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35846568 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35847108 A C Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 35847178 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 35847906 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35847933 G C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 35849774 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35849957 G C Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 35850114 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 35850533 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35850714 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35850919 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35851139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35851530 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 35851649 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35851665 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 35851861 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35851978 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35852169 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35852277 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35852329 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35852401 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35852448 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35852468 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35852469 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35852582 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35852590 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35852725 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35852740 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35852760 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35852945 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35853199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35853324 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35853347 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35853401 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35853402 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35853416 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35853435 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35853436 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35853479 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35853734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35853791 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35853795 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35853894 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35853985 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35854420 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35854432 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35854435 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35854439 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35854541 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 35854576 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 35854642 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 35854673 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 35854752 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 35854767 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 35854778 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 35854854 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 35854927 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35854941 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35855088 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35855105 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35855184 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35855438 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35855694 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35855852 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35856270 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 19 35856500 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 35856684 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35856753 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35856891 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 35857106 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35857258 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35857264 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35857313 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35857327 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35857385 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35857541 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35857570 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35857621 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35857646 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35857696 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35857697 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35857741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35857826 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35857881 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35858415 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35858435 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35858496 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35858507 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35858517 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35858689 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35858768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35858939 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35859028 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35859193 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 35859202 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 35859223 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 35859256 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 35859269 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35859317 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35859369 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35859384 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35859478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35859509 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35859571 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35859819 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35860068 A G N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 19 35860364 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35860405 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35860545 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35861052 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35861157 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 35861158 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 35861233 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 35861556 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35861718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35861725 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35861727 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35861794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35861807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35861868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35861994 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35862026 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35862235 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35862540 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35862721 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35862875 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35862965 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35863110 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35863114 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35863412 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35863438 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35863441 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35863499 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35863503 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35863524 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35863583 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35863697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35863773 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35863885 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35863923 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35864096 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35864102 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35864133 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35864135 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35864143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35864268 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35864272 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35864350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35864394 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35864401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35864467 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35864684 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 35864853 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 35865026 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35865046 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 35865079 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35865247 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35865397 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35865399 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35865574 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 35865620 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 35865660 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35865712 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35865869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35865983 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35865990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35866007 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35866087 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 35866140 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 35866527 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35866670 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35866876 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35866877 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35866893 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35866919 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35867312 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35867313 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35867338 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 35867341 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35867775 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35867814 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35867940 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35867963 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35868007 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35868075 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35868150 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35868767 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 35868829 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 35869076 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35869137 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35869805 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35869827 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35870155 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 35870175 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 35870742 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35870771 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35870797 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35870806 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35871011 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35871077 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35871078 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35871181 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35871481 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35871541 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35871584 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35871626 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35871780 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35871846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35871938 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35872611 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 35873376 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35873434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35873462 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35873898 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35874396 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35874680 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 35874827 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35876094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35876499 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35876757 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35877219 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35878062 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35878075 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 35878147 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35878228 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35878327 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35878538 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 35878614 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 35878689 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 35878780 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 35878824 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 19 35878826 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 19 35878881 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 19 35879004 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35879006 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35879051 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35879076 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35879102 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35879168 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35879195 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35879685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35879810 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35880730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35880982 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35881132 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35881158 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35881530 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35881537 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35881601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35881675 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35881807 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35881841 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35881916 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35882032 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35882045 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35882086 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35882121 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35882173 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35882264 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35882295 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35882580 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35882603 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35882623 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35882690 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35882704 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35882723 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35882736 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 35882797 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35882826 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35882890 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35882916 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35882955 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35882966 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 35883087 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35883145 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35883433 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35883458 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35883639 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35883784 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 35883815 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 35883836 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35883838 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35883876 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35884030 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35884050 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35884065 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35884366 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35884412 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 35884607 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 35884667 G T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 19 35884727 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 35884736 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 35885002 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35885068 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35885115 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35885193 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35885225 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35885309 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35885357 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35885419 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 35885437 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35885511 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 35885518 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 35885842 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 35885847 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 35886193 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35886578 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35886683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35886792 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35887079 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35887436 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 35888293 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35888313 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35888343 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35888370 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35888381 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35888407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35888410 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35888492 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35888514 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35888521 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35888533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35888611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35888623 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35888642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35888805 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35888840 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35888854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35888880 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35888950 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35889005 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35889052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35889097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35889237 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35889874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35889896 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35889914 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35890074 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 35890228 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35890559 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35890606 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35890805 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 19 35890822 G A N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 19 35890833 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 35890861 A T N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 35891125 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 35891417 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35892068 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35892559 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 35893174 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35893561 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35893684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35895247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35895851 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35896365 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35896921 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35897391 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35897517 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35897550 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35897637 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35898282 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35898878 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35898909 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35898998 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35899641 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35899663 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 35899998 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35900199 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 35901025 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35901282 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35901409 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35901582 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35902196 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35902252 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35902293 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35902441 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35902442 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35903164 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 35903668 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35904226 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 35904729 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35904845 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35905567 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 35907808 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35907971 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35908042 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35908337 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35908343 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 35908448 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35908489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35908535 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35908557 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35908558 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35908826 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35908843 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35908883 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35909160 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35909890 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35910231 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35910356 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35910507 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35910656 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35910739 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35910883 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35910958 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35911423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35911445 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35911450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35911477 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35911513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35911517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35911537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35911555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35911718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35912027 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35912110 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35913423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35914019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35914473 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 35914655 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 35914876 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35914905 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35915118 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35915584 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 35915625 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35915643 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35915885 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35915960 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35916190 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35917417 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35917575 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35917992 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35919113 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35919569 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35919697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35919727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35919856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35920094 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35921806 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35922720 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35922761 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35923117 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35923119 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35925000 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 35925261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35926083 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35926818 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35927018 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35927035 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 35927102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35927123 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35927124 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35927347 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35927596 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35927845 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 19 35928998 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35929409 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35929807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35930000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35930192 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35931077 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35931954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35932063 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35932216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35932529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35932558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35933533 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35933712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35933947 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35934156 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35934291 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35934355 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35934622 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35934698 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 35935106 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35935172 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35935652 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35935874 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35935896 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35936031 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35936227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35936423 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35936797 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35936814 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35936992 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35937021 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35937267 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35937829 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35938646 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35938794 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35939248 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35939400 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35940099 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35941044 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35941548 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35941922 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35942092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35942093 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35942618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35942780 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35942969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35943083 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35943119 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35943130 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35943333 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35943628 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35943739 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35943766 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35943792 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35943801 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35943833 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35943946 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35943977 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35943990 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35944069 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35944136 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35944171 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35944182 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35944201 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35944270 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35944271 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35944377 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35944788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35944797 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35944837 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35944900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35947585 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35947600 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35947651 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35947815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35947947 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35948154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35949258 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35950849 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35950852 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35950969 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35950984 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35951007 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35951021 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 35951247 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35952171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35952372 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35955276 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35955557 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 35956356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35956375 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35956424 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35958518 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35959186 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35960619 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35961581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35964626 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35966198 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35968575 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35969406 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35969528 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 35970308 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35970614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35971973 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35972233 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35973835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35976824 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35977776 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35977883 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35986556 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35987221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35987521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35988577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35988728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35989215 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35989334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35989556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35989593 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35989679 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35989721 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35989739 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35989755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35989888 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35990012 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35990041 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35990053 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35990066 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35990123 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35990168 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35990169 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35990180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35990195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35990208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35990220 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35990232 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35990240 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35990288 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35990289 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35990322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35990328 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35990348 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35990389 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35990490 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35990517 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35990574 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35990614 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35990642 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35990714 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35990736 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35990788 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35990928 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35990936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35990994 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35991308 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 35991326 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 35991351 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 35991359 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 35991390 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 35991395 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 35991422 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 35991426 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 35991462 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 35991501 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35991529 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35991601 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35991792 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35991857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35991980 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35992051 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35992144 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35992146 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35992154 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35992440 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35992449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35992464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35992487 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35992504 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35992511 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35992630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35992664 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35992675 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35992898 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 35992945 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35993012 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 35993094 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35993119 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35993446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35993466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35993493 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35993548 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35993899 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35994340 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35994593 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35994629 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 35995269 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35995291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35995295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35995466 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35995557 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35995710 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35995959 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 35996268 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 35996343 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 35996707 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 35997065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35997121 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35997156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35997647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35998802 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35998875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35999198 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 35999274 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 35999645 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36000038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36000464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36000840 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36000852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36000924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36001005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36002055 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 36002090 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 36002151 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36002504 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36002795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36002828 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36003754 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36003876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36004033 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36004052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36005251 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36005452 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36005729 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36005800 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36006136 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36006894 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 36009720 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36011867 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 36017511 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 36017658 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36018539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36018725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36022222 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36022476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36022503 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36022913 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36023615 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36025217 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36028532 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 36028605 G T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 36028712 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 36028713 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 36032159 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36032612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36032621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36032704 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36032757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36033022 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 36033148 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36033319 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36034020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36034110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36034142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36034329 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36034881 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36035437 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36035644 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36035702 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36035966 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36036178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36036241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36036258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36036271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36036288 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36036330 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36036332 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36036735 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36036788 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36036874 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36036947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36036956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36036972 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36036986 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36037006 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36037236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36037342 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36037387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36037419 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36037581 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36037640 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36037669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36037703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36037749 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 36037762 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36037797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36037835 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36037898 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 36037992 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 36038004 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 36038384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36038778 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 36038844 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36039009 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36039776 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36039777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36039795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36039941 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 36040213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36040985 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 36041121 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 36043496 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36044982 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 36045015 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 36045017 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 36045216 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 36045225 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 36045507 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 36045523 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36046012 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36046143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36046210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36046259 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 36046391 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36046411 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 36046427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36046454 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36046533 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 36046752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36046763 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 36046872 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36046916 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 36046917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36046977 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36047040 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 36047053 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 36047060 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 36047130 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36047198 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 36047288 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 36047367 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36047553 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 36047602 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 36048215 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 36048228 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36048237 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36049123 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36050031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36050630 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 36051999 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 36053077 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36054246 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36054253 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36055339 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36058391 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36058420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36060383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36063515 C A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 19 36063598 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36066258 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 36067220 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 36067325 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36067539 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 36067540 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 36067553 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 36067587 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 36067950 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 19 36067954 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 19 36068052 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 19 36068120 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 19 36068130 A G N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 19 36068271 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 36068276 A T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 19 36068335 C G N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 19 36068377 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 19 36068487 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 36068554 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 36068579 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 36068602 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 36068628 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 36068741 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 36068803 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 36068867 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 36068913 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 36068934 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 36068943 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36069171 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 36069175 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 19 36069225 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 36069243 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 36069270 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 36069288 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 36069297 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 36069314 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 36069326 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 36069345 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 36069536 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 36069571 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 36069710 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 36069857 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 36069905 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36069945 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 36070017 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 36070037 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36070075 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 36070264 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 36070622 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 36070636 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36070859 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 36070919 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36071218 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 36071239 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 36071494 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 36071804 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36071866 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36071868 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36071879 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36071988 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36075885 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36078125 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36078796 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 36099878 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36100436 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36102052 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 36102330 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36102752 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36106472 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 36106891 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 36107031 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 36107296 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 36107297 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 36107347 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 36107412 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 36107418 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 36107638 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36107802 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 36108019 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 36108185 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 36108186 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 36108209 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 36108547 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36108777 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36108802 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36108935 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 36109377 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36109472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36109478 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36109525 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36109560 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36109758 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 36109775 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36109816 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36109845 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 36109919 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36109948 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36109971 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36109975 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36110018 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 36110099 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 36110196 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 36110207 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 36110385 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 36110398 T C Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 36110455 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36110637 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36110736 C G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36111980 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36112145 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36112225 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 36112280 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36112302 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36112305 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36112307 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36112574 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 36112669 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 36112683 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 36112747 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 36115267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36118118 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36118872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36122247 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 36123220 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 36123430 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36123946 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 36124199 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 36124302 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 36124403 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 36124454 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36124521 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36124585 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 36124624 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36124646 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 36128591 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 36130956 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36132436 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 36132696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36133723 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36134955 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36136197 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36136568 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36136704 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 36136744 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36136745 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 36138155 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 36138338 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36138891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36139781 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36140534 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 36140862 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 36141375 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36141510 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 36152064 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 19 36153316 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36153930 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36154679 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36154877 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36160803 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 36161163 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 36161592 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36162068 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 36162107 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 36162405 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 19 36162462 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 36163306 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36163323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36163332 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 36163370 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 36163382 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 36163862 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 19 36164193 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36164289 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36164623 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 36164707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36164715 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36164776 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 36164831 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36164970 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 36165306 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36165311 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36165324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36165343 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36165378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36165455 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36165736 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36165785 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 36165792 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 36165873 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 36165887 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 36165977 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36166081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36166115 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 36166119 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 36166136 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 36166146 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 36166201 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36166294 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 36166354 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 19 36166404 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 36166629 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 36166707 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 36166745 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36166758 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36166774 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 36166777 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 36166967 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 36167093 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 36167144 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36167297 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36167436 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 36167601 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 36167690 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 36167698 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 36167828 T A N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 19 36168002 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 36168078 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 36168150 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 36168319 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36168354 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36168538 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 36168806 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 36168902 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 36169128 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 36169156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36169228 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36169307 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36169345 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 36169413 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 36169560 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 36169731 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 36169879 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 36170373 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 36170428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36170562 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 36170582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36170667 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36171127 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 36171142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36171148 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 36171466 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 19 36171615 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 36171637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36171698 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 36171789 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36172388 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 36173593 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36173619 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36173720 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36174095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36174442 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36174571 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 36177715 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36177823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36178651 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 36179268 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 36180015 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36181210 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 36181875 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36182362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36182534 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36182849 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 36183301 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36184281 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 36184282 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 36184608 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36184621 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 36184717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36186241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36187374 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36188160 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36188384 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 19 36188576 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 36189104 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36189271 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36189776 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 36189834 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 36189912 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 36190243 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 36190506 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 36190753 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36190917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36191035 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36191499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36191701 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36191885 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36192128 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 36192494 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 36192756 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 36192963 A G N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 19 36192978 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 19 36193144 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 36193182 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 36193197 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 19 36193205 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 36193212 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 36193241 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 36193255 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 36193259 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 36193273 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 36193407 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 36193428 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 36193437 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 36193543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36194322 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36194363 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 19 36194423 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 36194807 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 36194887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36195039 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 36195045 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 36195054 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 36195124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36195319 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 36195368 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 36195514 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36195580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36195590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36195642 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 36195745 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 36196008 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 36196019 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 36196101 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36196141 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36196208 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 36196290 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 36196573 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 36196595 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 36196665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36196767 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 36197030 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 36197187 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 36197294 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 36197585 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36198210 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 36198334 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 36198446 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 36198493 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 36198586 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 36198624 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 36198633 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 36198717 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 36198759 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36198819 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 36199393 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36200752 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36200765 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36201869 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 36202055 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 36202272 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36202285 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36202604 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36202835 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 36203448 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36204052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36204426 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36204826 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 36205056 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36205097 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 36205171 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36205293 T A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 36205328 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 36205334 G C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 19 36205420 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 19 36205480 A G N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 19 36205589 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 36205619 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 36205634 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 36205637 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 36205650 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 36205806 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 36205822 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36205961 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 36206289 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 36206315 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 36206512 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 36206525 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 36206969 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36207007 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 36207033 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 36207266 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36207321 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36207327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36207371 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36207500 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36207744 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36208148 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36208236 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36208313 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36208685 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36209120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36212169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36212251 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 36212377 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 36212532 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 36212614 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 36212706 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 36212751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36212859 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 36213058 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 36213311 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 36213887 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 36213922 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 36213946 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 36213962 T A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 36214076 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 36214189 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 36214204 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 36214296 A C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 36214588 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 36214909 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36214932 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36215007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36215010 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 36215074 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 19 36215106 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36215163 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 36215296 T G Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 36215309 T C Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 19 36215327 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 36215369 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36215446 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 36215716 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 36215717 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 36215735 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 36215882 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36215883 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36215893 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36215984 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 36215989 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 36216064 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 36216076 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 36216077 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 36216152 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 36216182 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36216675 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 36216940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36217039 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 19 36217176 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 36217257 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36217331 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 36217364 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36217388 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 36217421 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 36217551 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 36217561 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 36217662 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 36217702 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 36217715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36217929 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36217935 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36218034 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 36218059 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36218245 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 36218439 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 19 36218500 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 36218585 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 36218693 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 36218907 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36218927 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 36218934 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36219161 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36219163 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36219176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36219194 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36219201 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36219595 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36220225 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 36220368 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36220390 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36220823 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 36221138 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 36221140 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 36221192 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 36221269 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36221503 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36221529 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 36221638 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36222009 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36222287 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36222295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36222393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36222405 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36222508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36222531 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 36222536 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 36222537 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 36222577 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 36222632 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36222914 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36223078 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36223339 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36223344 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36223483 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 36223490 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 36223496 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 36223656 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36223920 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 19 36223949 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 19 36224321 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 36224407 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36224681 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 36224766 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36224952 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36225043 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36225114 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36225125 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36225151 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 36225421 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 36225559 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 36225667 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 36225729 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 36225808 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 36226011 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 36226191 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36226816 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36227130 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36228898 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36229095 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36229957 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 36229993 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 36230196 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 36230209 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 36230230 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 36230692 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36231074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36231343 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36237570 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 36238857 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36239275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36239361 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36240245 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36240272 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36241856 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36241999 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36242044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36242413 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 36242738 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 36243445 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 36244091 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36244278 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 36244436 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36245035 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36245116 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36245196 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36245366 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36245483 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36245521 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36245537 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36245957 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36246029 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36246325 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36246447 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36246498 A C N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 19 36246525 G A N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 19 36246697 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36246789 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36246815 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36246866 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36246985 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 36247061 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36247105 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36247113 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36247151 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 36247464 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36247490 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 36247505 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 36247506 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 36247551 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 36247583 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 36247673 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 36247710 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 36247740 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 36247964 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 36248166 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36248177 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 36248178 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 36248210 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 36248263 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 36248301 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 36248357 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36248391 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 36248408 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 36248571 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 36248611 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 36248683 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 36248746 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 36248764 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 36248786 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 36248814 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 36249625 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 36249689 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36249741 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36249746 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36249801 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36249822 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36249926 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36249964 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36249973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36249989 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36250027 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36250418 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 36250490 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 36250552 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 36250689 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 36251212 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 36251380 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 36251538 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 36251546 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 19 36251556 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 36251721 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 36251731 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 36251736 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 36252226 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 36252254 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 36252298 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 36252343 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36252360 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36252368 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 36252395 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36252692 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 36252809 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 36252831 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 36252835 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 36252979 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 36253018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36253773 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 36253996 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36254692 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 36254912 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36255264 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36255958 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 36255995 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 36255998 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 36256021 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 36256130 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 36256164 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 36256184 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 36256198 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 36256199 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 36256264 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 36256412 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 36256537 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 36256702 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 36256730 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 36256816 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 36256830 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 36257047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36257235 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 36257835 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 36257952 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 36258115 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 36258699 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36258826 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 36259147 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36259247 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36261676 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36261774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36262353 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36262446 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 36263400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36263476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36265168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36265923 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36265953 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 36266114 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 36266448 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 36266581 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36266668 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36266706 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36266720 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 36267083 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 36267194 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 36267202 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36267226 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 36267342 A C N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 19 36267347 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 36267460 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36267482 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 36267501 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 36267513 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 36267514 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 36267529 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 36267562 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 36267697 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 36268220 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36268567 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36268856 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 36268859 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 36269071 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 19 36270656 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36270958 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 36271000 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36271345 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36272479 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 36272625 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36272833 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36273647 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36273662 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36274431 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 36274479 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36274492 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 36274493 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 36274542 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 36274547 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 36274609 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 36274627 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36274648 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36274657 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36274669 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36274680 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36274691 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36274692 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36274759 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 36274946 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 36275183 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 36275190 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36275414 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 36275487 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36275617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36275634 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36275766 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36276156 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36276216 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36276385 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36276417 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36276619 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36276646 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 36276800 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36279255 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36279277 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36279334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36279556 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 36279577 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36279635 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 36279757 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 36279985 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 36280233 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 36280262 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 36280277 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 36280305 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 36280467 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36280862 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36280917 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36281006 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 36281021 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 36281598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36281624 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36282047 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36282223 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36282616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36283464 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 36283528 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 36284544 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 36284562 C T N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.2 0.666666666666667 0.133333333333333 16 14 3 10 2 19 36284563 C T N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.2 0.666666666666667 0.133333333333333 16 14 3 10 2 19 36284747 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 36284889 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36285049 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 36285081 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 36285286 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 36285394 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 36287278 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36287344 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 19 36287453 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 19 36287481 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 36287562 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 36287629 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36287967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36288461 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 36288469 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 36288604 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 36289030 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 36289467 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 36289511 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 36289618 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 36289624 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 36289887 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 36290817 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 19 36290949 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 36290997 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 36291248 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 36291318 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 36291654 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 36291690 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36291737 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 36291741 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 36291758 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36291763 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 36292038 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36292108 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 36292119 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 19 36292225 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 36292419 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 36292421 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 36292547 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 36292914 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 36293158 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 36293292 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 36300130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36302877 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 36303213 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36303543 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36303639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36303901 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36303940 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36304118 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 19 36304129 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 36304289 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 36304311 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 36304727 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36304750 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 36304758 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 36304860 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 36304945 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36305995 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36306055 A C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 19 36306088 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36306167 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36306343 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36306409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36306412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36306703 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36306827 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36306920 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 36306987 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 19 36307006 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 36307075 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36307077 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36307093 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36307110 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36307134 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36307135 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36307168 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36307819 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 36307918 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36308071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36308181 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 36308219 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 36308370 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 19 36310877 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 36310925 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 36312010 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36312184 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36313026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36313607 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 36313645 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 36313665 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 36313774 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 36314043 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36314097 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36314859 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36314923 T C Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 36315564 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 36315618 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36315662 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 36315678 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 36315749 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36315757 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 36315818 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36315871 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 36315941 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36316061 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 19 36316080 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 36316270 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 36316290 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 36316386 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 36316405 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36316461 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 36316588 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 36316758 T A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 36316767 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36317314 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 36317478 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 36317512 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 36317533 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36318703 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 36318788 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 36318845 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 36318849 A T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 36318853 A T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 36318895 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 36318918 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 36319096 T A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 36319141 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 36319186 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 36319592 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 36319964 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36320239 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 36320265 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 36320351 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 36320358 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36320554 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 36320684 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36320729 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36321163 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 36322241 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36322740 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 36323882 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36323895 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 36323972 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 36323986 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 36324058 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 36324094 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36324226 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36324245 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36324399 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 36324403 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 36325280 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 36325456 A T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 36325686 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 36325719 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36325733 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36326137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36326180 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 36326240 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 36326327 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36326530 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 36326532 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 36328251 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36328427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36328443 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36328490 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 36328538 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 36328630 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 36328764 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 36329182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36329529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36330440 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 36330488 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 36330563 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 36330586 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 36330590 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 36330954 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 36330967 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 36331078 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 36331491 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36331631 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 36331636 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 36331847 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 36332424 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36332454 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36332471 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 36332522 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 36332834 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 36333037 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 36334783 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 36335250 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36335325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36335460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36335589 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36335924 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 36336041 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36336081 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 36336509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36336587 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 36336840 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36337615 G A Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 19 36338064 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36338802 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36339419 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 36339572 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 36339609 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 36339643 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36339736 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 36339741 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36339805 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36340280 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 36340601 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 36340816 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 36341737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36341764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36341878 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36341994 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36342182 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 36342397 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36342406 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 36342414 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 36342434 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 36342533 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36342673 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36342794 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36342800 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36342828 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 36342906 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36342982 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36343021 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 36343029 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 36343206 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 36343207 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36343225 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 36343299 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36343319 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 36343557 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 36343559 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36343560 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36343713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36343907 C A N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 19 36343945 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 36343983 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 36344176 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 19 36344187 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36344198 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36344303 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 36344533 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36344571 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36344596 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 19 36344608 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 19 36344670 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 19 36344676 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36344753 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 19 36344807 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 19 36345137 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 36345600 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 19 36345614 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 19 36345673 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36345807 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 19 36345937 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36345981 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 19 36346002 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 19 36346035 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 19 36346122 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36346219 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 36346231 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 19 36346275 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36346620 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36346628 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36346631 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36346697 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36346713 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 36346769 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36346779 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 36346781 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36346931 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 36346933 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 36347164 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 19 36347240 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 36347361 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 19 36347579 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 36348217 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36348456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36350410 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36350735 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 36350892 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 36350922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36351472 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 36352063 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36352371 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36352709 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36352780 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 36353670 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36353671 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36354375 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36354395 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36354396 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36354974 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 36354979 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 36355022 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 36355126 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 36355147 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 36355221 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 36355457 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 36355530 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 36355665 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 36355785 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36355845 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36355881 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 36356019 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 36356300 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 36356490 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 36356493 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 36356517 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 36356526 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36356529 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 36356610 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 36356726 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 36356928 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 36357141 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 36357242 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36357516 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36357519 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36357593 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36357941 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 36358135 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 36358192 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 36358292 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 36358303 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36358563 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 36358566 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36358792 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 36358988 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 36359177 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 36359260 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 36359261 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 36359808 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 36361574 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 36361656 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 19 36362751 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36362867 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 36362932 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 36362951 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 36362992 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 36363536 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36364980 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36365027 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36365500 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36370008 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 36371347 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36371378 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 36371498 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 36371540 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36371832 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 36371902 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36372257 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 36372407 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 36372592 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 19 36372706 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 19 36372851 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 36372869 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 36372912 G T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 19 36372949 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 36372969 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 36373014 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 36373133 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 36373245 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 19 36373289 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 36373376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36373568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36373805 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36375061 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 36375168 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 36375229 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36375711 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 36375960 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 36375990 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36376214 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 36376559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36377884 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36377939 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36378274 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36379132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36379198 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36380707 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 36382616 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36387919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36388439 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36390309 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36392471 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 36392486 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 36392542 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36392672 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 36392685 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 36392859 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 36394631 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 36394644 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 36394729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36394745 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 36394782 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 36394826 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36394861 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36394895 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36394899 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36394933 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36394971 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 36395058 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 36395223 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 36395383 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36395403 A T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 36395445 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36396060 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 36396133 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 36396305 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 36396370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36396681 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36396864 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 36397545 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 36397549 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 36397633 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 19 36397684 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 36397783 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 36397804 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 36397818 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 36398510 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 36398545 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36398860 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36402008 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 36404090 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36404493 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 36405829 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36407106 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36407163 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 36407281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36407385 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36407670 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36407741 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36408608 A G Y Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 19 36409886 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 36410876 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 36411496 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36411806 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 36412123 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 36412616 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 36412740 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36412902 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 19 36412905 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 19 36412927 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 36412935 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 36413158 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 36413167 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 36413241 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36413252 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 36413381 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36413398 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 36413411 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36413633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36413686 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 36413750 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36414808 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 36416376 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 36417286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36417383 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 36417529 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 36417553 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 36417622 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36417653 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 36417658 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 36417838 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36418232 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 36418241 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 36418631 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 36418726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36418920 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 36419021 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 36419052 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 36419090 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 36419100 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 36419121 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 36419155 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 36419172 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 36419173 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 36419442 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 36419445 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 36419459 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 36419654 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 36420894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36421023 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 36421529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36422646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36424679 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 36424778 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 36424833 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 36424908 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 36424937 G C Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 36424940 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 36425114 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 36425175 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 36425410 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36425597 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 36426629 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 36426964 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 36426994 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36427029 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 36427374 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 36427424 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 36427584 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 36427642 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36427928 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36428038 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36428108 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 36428131 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 36428168 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36428171 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 36428179 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36428189 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 36428230 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 36428343 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 36428429 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 36428786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36428854 G A Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 36429242 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36429273 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 36429860 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 36431480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36431483 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 36431493 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 36431516 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 36431592 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36431598 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 36431611 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 36431613 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 36431635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36431684 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36431762 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 19 36431885 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 19 36432083 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 36432086 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 36432206 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 36432263 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36432434 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 36432475 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 36432512 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 36432540 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 36432573 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 36432708 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 36432739 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 36432740 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 36432741 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 36432752 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 36433512 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 36433514 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 36433894 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 36433908 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36433969 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 36434098 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 36434137 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 36434188 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 36434237 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 36434277 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 36434501 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 36434554 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 36434603 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36434648 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 36434652 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 36434751 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 36435104 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 36435190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36435385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36435948 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 36436025 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36436422 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 36436531 G A Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 36436683 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36437607 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 36437831 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36438967 C G Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 36438975 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36439220 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36439224 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36439323 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 36439430 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36439525 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 36439584 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36439801 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 36439835 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36440724 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 36440841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36441124 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36441209 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 36441230 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 36441550 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 19 36441571 T C N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 19 36442006 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36442231 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36442233 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36442609 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 36444187 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36444698 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 36444729 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36445774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36446261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36446513 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36447356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36450220 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36452239 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36452823 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36453035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36455732 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 36456232 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 36456268 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36458300 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 36461531 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 36462539 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36464420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36464482 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 36464512 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36466836 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 36466939 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 36466951 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 36467029 T G N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 19 36467116 T G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 19 36467430 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 36467436 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 36467443 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 36467444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36467549 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 36467560 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 36467607 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 36467630 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 36467721 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 36467815 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 36467882 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 36467979 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36468262 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36468603 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36468623 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36468624 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36468642 A T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 19 36468889 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 36469184 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 36469318 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36469405 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36469568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36470141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36471743 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36472859 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 36473054 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36473889 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36473903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36474632 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36475726 T G N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 19 36475899 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 36476152 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 36476159 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 36476162 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 36476192 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 36476197 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 36476233 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36476361 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 36476562 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 36477528 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36477708 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 36477801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36477917 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36478020 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36478029 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36478039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36478055 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36478077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36478091 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36478298 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 36478316 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36478385 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 36478526 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36478672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36478842 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 36478905 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 36478959 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 36479065 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 36479510 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 36479805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36479984 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 36480002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36480248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36480252 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 36480255 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36480282 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36480308 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36480558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36480761 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36480810 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 36481265 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 36481297 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 36481484 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 36481911 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36481920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36482406 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 36482431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36482437 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36482762 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36482772 G T N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 19 36483638 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36483643 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36485181 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36485390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36485492 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36485648 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36486019 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36487468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36490841 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36493724 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 36494460 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36497041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36497828 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36503760 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36504006 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36504856 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36504926 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36506266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36506318 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36507522 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36507839 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 36514777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36515104 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 36515989 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36517897 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36518432 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 36519447 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 36520076 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36521546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36522374 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36524310 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 36524692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36530640 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 36530878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36532185 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36532404 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36532690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36533557 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 36533698 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 36533873 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 36533925 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36534009 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36534120 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 36534207 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36534324 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36534332 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36534430 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36534452 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 36534760 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 36534907 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36534910 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36535088 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 36535602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36535646 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36535697 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36535789 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 36535792 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 36536026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36536308 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 36536363 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 36536584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36537536 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 36537577 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 36537615 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 36539080 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 36539085 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 36539142 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 36539166 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 36539940 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36540170 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36540190 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 36540192 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 36540214 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 36540278 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 36540385 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 36540512 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 19 36540807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36540854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36540876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36540927 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 36540933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36540960 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36540969 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36540970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36541557 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36541691 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36541745 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 36541803 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 36541815 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36541843 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 36541878 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 36542385 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36542530 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 36542531 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 36542567 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 36542725 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 36542860 C A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 19 36542861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36543039 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 36543070 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 36544324 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 36544337 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 36544743 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36544762 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36544912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36547922 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 19 36548005 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36548283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36548410 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 36548599 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 19 36548665 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 36548742 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 36548751 T C Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 19 36548790 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36549185 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 36549434 G A N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 19 36550787 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36551212 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 19 36551259 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 36552448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36553063 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36554665 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 36558802 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 36561119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36561184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36561734 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36561838 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 36561858 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 36561984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36562031 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36562428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36562482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36562591 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36562662 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36562676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36562795 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 36563178 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36563182 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36563195 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36563246 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36563260 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36563331 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 36563332 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 36563862 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 36563899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36564126 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36564198 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 36564486 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36564491 A G Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 36564618 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 36564622 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36564763 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36564820 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 36564970 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 36565023 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 36565248 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36565253 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 36567508 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36567564 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 19 36567566 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 19 36568406 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 36568407 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36569125 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 19 36569137 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 19 36569184 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 19 36569328 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 36569360 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 36569692 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 19 36569767 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 36569802 A C Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 36569814 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 36570236 A G Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 36570485 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 36570507 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 36570585 C A Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 19 36570676 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36570861 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 36570876 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 36570948 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36571495 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 36571594 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36572024 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 36572064 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36572192 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 36572193 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 36572214 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 36572233 G C Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 36572302 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36572317 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36572378 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36572623 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36572700 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 36573166 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36573285 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 36573296 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36573374 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36573376 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36573466 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 36573540 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 36573635 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 36573694 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 36573744 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36573803 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 36573804 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 36573845 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 36573884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36573906 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36573912 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36573913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36574083 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 36574182 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36575301 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 36575307 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 36575320 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 36575360 T C Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 36575369 T A Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 36575398 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 36575512 C G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 36575720 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 36575808 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 36575877 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 19 36575930 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 36575961 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 36576118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36576254 A C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 36576319 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 36576351 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 36576359 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 36576397 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 36576433 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 36576436 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 36576502 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 36576525 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 36576552 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 36576634 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 36576680 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 36576842 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 36576903 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 36577077 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 36577083 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 36577155 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 36577157 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 36577159 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 36577393 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 36577475 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 36577498 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 36577512 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 36577618 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 36577833 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 36578015 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 36578103 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 36578238 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 19 36578368 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36578403 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36578535 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 36578553 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 36578614 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 36578624 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 36578774 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 36578886 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 36579319 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 36580436 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36580558 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 36580628 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 36581149 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36581670 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 36581671 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 36581680 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 36581902 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 36581911 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 36581912 T C Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 19 36582030 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36582074 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 36582192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36582450 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36582961 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 36583083 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36583193 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 36583269 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 36583450 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 36583641 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 36583744 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36583959 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 36584111 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36584123 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36584178 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 36584183 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 36584191 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 36584207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36584254 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36584369 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 36584836 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36585003 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 19 36585050 T C N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 19 36585056 T C N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 19 36585192 C T N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 19 36585202 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 19 36585203 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 36585339 A G Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 19 36585651 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 36585890 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36586253 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 36586349 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 36586415 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36586419 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 36586423 T C Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 36586472 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 36586728 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36587299 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 36587881 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36588699 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 36589146 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 36589201 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 36589217 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 36589643 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 36589656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36589746 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 36589976 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 36590230 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36590289 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36590450 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 36590482 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36590667 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 36590673 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36590761 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36590785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36591271 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 36591729 G T Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 19 36591803 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 36591815 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 36591960 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 36592106 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36592801 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36592855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36592870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36592871 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 36593117 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 36593250 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36593965 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36594408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36594993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36595388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36595611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36596061 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 19 36596209 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 36596214 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 36596700 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 36596701 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 36596710 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36596753 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 36596863 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36596871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36597174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36597465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36597799 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36598348 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36598535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36598774 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36598868 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36598934 C A Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 36599090 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36600727 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36601306 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 36601454 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 36601599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36601674 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 19 36601742 T C N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 19 36601746 G A N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 19 36601754 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 36601761 G A N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 19 36601774 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 36602123 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 36602515 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36602685 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36602848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36603205 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 36603241 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36603364 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 36603495 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36603624 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 36603756 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36605169 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 36605852 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36606067 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 36606087 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36606313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36606407 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36606416 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 36606445 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 36607055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36607127 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 36607410 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36607666 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 36607710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36608292 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 36608331 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 36608346 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 36609225 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 36609632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36609897 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 36609940 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 36610230 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 19 36610391 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 19 36610426 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36610465 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36610558 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36610575 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 19 36610594 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 36610595 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 36610696 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36611107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36611163 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 36611195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36611199 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36611237 T A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 19 36611238 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 19 36612272 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 36612279 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 36612301 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36612596 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 36612598 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 36613074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36613096 T G Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 19 36613118 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 36613121 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 36613420 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 19 36614060 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 36614073 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 36614175 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 36614345 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 36614386 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 36614420 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 36614531 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 36614645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36614730 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 36614861 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 36614916 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 36614996 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 36615031 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 36615068 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36615111 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 36615112 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 36615250 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36615260 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36615264 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36615393 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36615431 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36615438 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36615466 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36615484 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36615563 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 36615603 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 36615826 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 36615851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36615878 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 36616651 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 36616655 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 36617530 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 36617692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36618657 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36621223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36623040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36623421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36623702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36626050 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36628917 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 36629481 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36629840 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 36629932 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 36630089 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 36630262 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36630696 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36630774 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 36630897 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 36630975 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 36631091 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 36631094 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 36631103 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 36631251 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 36631252 A T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 19 36631475 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 36631521 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 36631672 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36631779 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36631795 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36632216 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36632724 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36632765 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36632771 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36632791 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 36632794 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 36632801 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 36632883 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 36632905 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36633511 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 36633536 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 36633701 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 36633726 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 36633944 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 36634099 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36634156 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 36634190 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36634208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36634284 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 36634500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36634502 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36634509 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 36634601 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 36634650 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36634916 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36635536 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 36635548 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36635687 G C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 36636291 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 36636630 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36637078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36638773 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 36639221 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 36639234 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 36639992 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 36640118 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36640338 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 36640417 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 36640612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36640631 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 36643288 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 36643291 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 36643411 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 19 36644216 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 36644832 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 36647768 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36648050 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36650093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36650785 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 36650836 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36650867 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36651097 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36654125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36654599 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 36654745 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36655211 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36656264 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36656573 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 36656620 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 36656695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36656758 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 36657105 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36657444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36659039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36660147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36660247 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36661714 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36662285 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36662302 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36662690 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 19 36663813 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36665000 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36665324 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36665959 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36667208 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36667847 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36670804 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36672265 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36672624 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36673011 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36675241 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36675398 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36678226 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 36678358 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 36680256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36680691 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 36681614 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36681637 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36684636 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36685157 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36689289 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 36689294 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 36689337 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36690346 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36691734 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36691865 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 36692913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36694665 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 36696133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36698096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36698237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36699417 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36700257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36702113 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36702348 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36703917 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 36704287 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 36704738 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36705090 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 36706260 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36709056 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36709370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36709677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36709842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36710511 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36712419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36712835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36712966 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36713188 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 36713241 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36713315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36713373 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36713475 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36713494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36713605 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36715107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36715499 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36716002 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 36716541 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 36716641 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36719776 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 36719829 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 36719846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36719863 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 36722013 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 36722899 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 36723077 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 36723136 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 36723137 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 36723174 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 36723394 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 36723518 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 36723610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36726192 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36727947 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36731990 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36734219 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 36734342 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36735044 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 36735204 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 36736317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36736441 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 36737091 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36739430 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 36740399 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36740942 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0 0.642857142857143 0.357142857142857 9 19 0 9 5 19 36741042 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 36741064 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 36741071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36741318 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36741368 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36741914 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36741979 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 36741995 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36742032 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 36742594 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36742608 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36742628 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36742708 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36742714 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36742899 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 36743209 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 19 36743244 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 36743295 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 36743998 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 36744232 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36744426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36744601 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 36744644 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 36744679 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 36744697 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 36744735 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 36744836 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36744966 A G Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 19 36745218 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36745246 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36745251 C A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36745252 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36745279 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 36745318 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 36745350 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36746410 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 36746419 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 36746867 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 36746873 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 36746883 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 36746953 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36747086 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36747358 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 36747360 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 36747452 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 36747464 A T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 36748319 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36749441 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36749493 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 36749564 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 36749595 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 36749841 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 36749993 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 36750180 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36750197 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36750661 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 36750689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36750836 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36751085 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36751174 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36751190 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 36751860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36752293 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36752311 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36752356 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36752389 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 36752471 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36752601 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36752644 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 36752650 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 36752685 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 36752844 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 36752875 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36753133 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 36753325 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 36753954 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36754091 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 36754100 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 36754189 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 36754300 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 36754341 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 36754488 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 19 36754731 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 36755054 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 36755285 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 36755435 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 36755589 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 36755894 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36755964 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 36755981 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 36755994 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 36756128 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 36756202 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 36756269 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 36756330 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 36756471 G C Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 19 36756504 G A Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 19 36756505 C T Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 19 36756846 A T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 36756912 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36756976 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 36757005 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 36757347 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 36757673 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 36758041 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 36758102 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 36758108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36758215 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36758317 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 36758377 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 36758413 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 36758423 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 36758534 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 36759283 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 36759301 C A N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 19 36759306 C T N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 19 36759426 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 36759533 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 36759548 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 36759594 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 36759656 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36760238 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36760271 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36760316 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36760475 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 36760735 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36760756 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36760815 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36762363 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36762577 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 19 36762772 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 36762899 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 36762995 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36763353 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 36763355 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36763948 A C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 36764003 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36764047 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36764163 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36764418 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 36764679 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36764772 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 36765112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36765400 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 36765527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36765650 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 36765851 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 36765883 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 36765992 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 36766053 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36766197 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36767504 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 36767930 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 36768095 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36768172 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 36768185 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 36768707 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 36768809 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 36768974 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36769059 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36769642 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 36769848 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 19 36770187 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 36770727 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 36770787 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 36771306 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 36771335 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 36771685 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 36771726 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 36771796 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 36771880 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 36772165 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 36772331 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 36772388 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 36772471 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36772610 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 36772971 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 36773057 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 36773080 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 36773095 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 36773139 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 36773141 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 36773246 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 36774497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36774566 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36776662 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 36776965 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 36777153 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 36777256 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36777376 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36777402 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36777660 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36777693 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36778065 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36778150 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36778282 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36780667 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36780813 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 36782421 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 36782889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36782890 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36783151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36783156 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 36783185 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36783189 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36783203 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36783244 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 36783352 T G Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 36783363 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 36783553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36783741 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 36783805 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36783814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36784234 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 36784263 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36784725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36784932 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 36785111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36785172 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 36785448 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 36786248 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36791906 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36795057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36810684 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36813699 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36818832 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36830915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36831885 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36831996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36833481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36833504 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 36833509 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 36833574 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 36833987 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36833988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36834063 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36834096 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36834325 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 36834332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36834433 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 36834549 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36834558 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36834568 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36834571 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 36834626 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 36834739 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 36835137 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36835259 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36835724 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 36835837 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 36835847 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36835949 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.578947368421053 0.105263157894737 0.315789473684211 24 14 11 2 6 19 36836171 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 36836462 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 36836477 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 36836484 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 36836546 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 36836547 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 36836863 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 36838372 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 19 36838398 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 36838556 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 36838604 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 36838954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36839211 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36839281 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 36839877 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 36840500 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 36840662 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 36840709 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 36840766 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 36840768 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 36840779 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 36840811 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 36840817 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 36840846 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 36840895 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 36840899 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 36840901 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 36840928 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 36840982 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36841088 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 36841094 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 36841180 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 36841705 T C N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 19 36841789 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 36841881 A T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 19 36841946 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 36841956 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 36842195 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 36842251 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36842253 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 36842697 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36843000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36843128 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36843295 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36843699 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 36843786 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 36843870 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 36843942 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36843964 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36843971 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36843985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36843989 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 36844199 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 36844215 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36844247 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 36844249 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36844317 G C N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 19 36844397 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 36844458 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 36844531 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36844582 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 36844590 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36844593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36844670 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 36844889 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 36845682 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36846157 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 36846269 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36846383 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36846559 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 36846597 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36846810 C T Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 19 36846870 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 36846876 T G Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 36847883 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36848036 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 36848197 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 36848231 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 36848994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36849059 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36849366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36849413 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 36849425 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 36849576 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 19 36849592 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 36849609 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 36849890 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 19 36849921 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36850060 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36850338 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 36850379 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36850526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36850561 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36850572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36850855 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 36850860 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 36850875 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 36850919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36851052 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 36851380 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36852723 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 36852824 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 36853091 A G Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 36853095 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 36853107 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 36853331 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36853357 T G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 36853477 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 36853529 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 36853539 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 36853556 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 36853710 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36854118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36854508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36854527 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36854528 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36854587 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36854599 T C Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 36854607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36854759 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 36854909 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36854927 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36855019 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 36855232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36855434 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36855754 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 36856357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36856791 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 36856999 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 36857016 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 36857022 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 36857023 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 36857063 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 36857142 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 36857159 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 36857182 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 36857183 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 36857186 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 36857254 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 36857256 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 36857278 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 36857404 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 36857415 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 36857957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36858025 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 36858463 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36858935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36858978 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36859721 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 36860237 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 36860298 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36860448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36860499 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 36860768 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 36860786 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 36860907 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36861181 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 36861797 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 36861854 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 36861858 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 36861892 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 36861943 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 36861991 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 36862214 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36862393 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 36862646 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36863014 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36863052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36863105 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 36863224 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 36863238 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 36863243 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 36863487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36863677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36863721 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 36863954 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 36863979 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36864034 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36864493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36869166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36869337 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36869752 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36870825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36871976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36872018 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 36875055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36879143 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36880393 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 36882520 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 19 36883530 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 36884134 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 19 36886651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36886796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36887012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36887062 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36888319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36888407 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36888772 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 36889263 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 36892477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36893110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36895904 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36896029 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36897155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36900084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36900511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36901939 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36904221 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36905017 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36905405 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36906356 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 36906789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36908555 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36909519 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36909807 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36910975 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36911002 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 36911554 T A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 19 36911763 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 36911802 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 36911825 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 36912621 A T N N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 19 36912667 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 36912949 A G N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 19 36913001 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.222222222222222 14 4 7 0 2 19 36913441 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 36913524 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 36913875 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 36914398 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 36915672 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 36916282 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 36916685 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 36917116 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 36917192 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 36917451 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 36917958 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36918077 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 36918492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36920157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36920163 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36920357 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36921276 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36922495 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 36922564 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36922565 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36924922 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36926339 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36926764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36928847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36929292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36929566 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36930830 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 36930835 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 36930986 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 36931984 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36934012 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36935157 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36935256 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36935719 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 36937199 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 36937451 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36938696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36938866 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36939568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36939758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36939790 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 36943110 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36943682 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 36944207 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 36944572 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 36944577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36944615 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36945409 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 36945504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36945657 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 36946452 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36946475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36946535 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 36946751 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 36947379 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 36948234 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36948803 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 36949022 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36949252 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 36949374 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36949665 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 36950365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36950403 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36950683 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36951315 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36951355 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36951569 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36952120 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36953739 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36957867 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36958443 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36958833 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 36960017 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36960065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36961372 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36962424 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36962723 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36965138 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36965572 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36966767 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36969347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36971474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36972043 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36972764 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36973337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36976433 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36976449 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 36976561 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 36976605 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 36976698 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 36977108 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36977163 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 36977284 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36977347 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36980830 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36981218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36981903 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 36982729 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36984773 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 36985746 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 36990986 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36991480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36993742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 36993842 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 36995004 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 36998571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37001835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37002232 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37002556 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37002735 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37002805 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37004172 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37007232 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37007255 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37013136 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 37015305 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 37016730 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37017460 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 37017567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37017615 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37017654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37019254 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37020622 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37020925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37021052 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37021196 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 37021197 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 37021201 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 37021361 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37022817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37022965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37023149 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37024545 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37025528 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 37026409 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 37026410 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 37026739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37026762 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37026981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37027420 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37027821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37027881 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37028050 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 37028133 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 37028160 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 37028179 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 37028232 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 37028319 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 37028343 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 37028362 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 37028492 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37028539 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 37028588 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 37028769 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 37028777 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 37028860 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 37028869 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 37028870 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 37029033 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 37029356 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 37031896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37031966 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37032074 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37033361 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37033451 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37036103 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 37038322 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37041916 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 37045511 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37050809 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37051913 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37053817 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37054348 G C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 37054917 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37061414 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37061502 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37061625 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37061874 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37063547 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37064090 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 37064233 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37065973 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37068002 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 37071393 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37071501 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37071577 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37071769 G T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 37072880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37078068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37079476 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 37081179 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37082823 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37082855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37084786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37087605 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37089851 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37091362 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 37092696 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37097436 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37099177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37101627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37107410 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37108352 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37108835 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 37109366 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37109443 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37109453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37109478 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37110069 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 37110886 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37111015 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37111044 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37111130 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37111267 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 37111470 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37111543 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 37111556 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 37111560 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 37111741 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37111975 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37111988 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37112474 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37112598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37113048 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37113110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37113111 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37113171 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37113185 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37113210 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 37113228 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37113321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37113734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37113774 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37113794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37113810 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37113832 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37113846 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37113874 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37113936 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 37113974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37114009 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37114051 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37114083 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37114378 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37114495 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37114507 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37114593 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37114847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37114898 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37115130 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 37115136 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 37115287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37116322 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37117943 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 37119503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37119799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37120693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37121877 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 37122284 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 37122295 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 37128358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37128591 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37130499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37130713 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 37131702 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37131704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37132327 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37133286 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37133320 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 37133629 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 37134090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37134659 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37134744 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37135473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37136819 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37137035 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37137843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37137849 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37138079 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37139037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37139462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37139975 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37140448 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37140588 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 37140742 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 37140752 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37140905 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 37140951 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37141034 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 37141337 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 37141645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37141679 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 37141918 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37141967 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 37142238 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 37142381 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 37143596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37144007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37144577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37145027 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37145483 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37146207 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37146327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37147974 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37148671 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37148760 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37154096 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37154458 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37154717 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37157089 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37157136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37157726 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 37159514 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 37159935 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 37160006 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 37160508 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 37161728 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 37161862 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 37161869 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37162047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37162219 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 37163947 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37164348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37164491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37165303 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37165344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37165442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37165703 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37165929 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37168435 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 37169811 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 37171671 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37172223 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37172367 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 37172411 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37172413 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37172542 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 37172657 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 37172693 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 37172778 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 37172823 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 37172838 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 37172840 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 37172853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37172859 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 37172891 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 37172979 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 37173024 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 37173050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37173109 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 37173126 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 37173127 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 37173222 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 19 37173291 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 37173350 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 37173401 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 37173596 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37173652 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37173799 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37174324 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37174483 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 37176341 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 37176600 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 19 37177349 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37177656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37177970 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37178217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37178593 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37179002 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 37179688 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37180662 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 37180752 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37180784 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 37180795 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37180858 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 37181269 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37181270 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37181517 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 37182004 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 37182008 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 37182011 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 37182020 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37182096 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37182513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37183260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37183556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37183701 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37183864 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37183866 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37184072 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37184252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37184400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37184771 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37184896 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 37185547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37185597 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 37185600 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 37185630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37187572 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 37187578 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 37187583 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 37187864 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 37188048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37188105 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 37188122 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 37188233 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 19 37188569 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37188642 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 37188648 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 37189291 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 37189403 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 37191048 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37192993 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37193661 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 37194515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37194745 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37194774 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37194779 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37194876 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37194897 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37195719 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37195763 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37195764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37195810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37195817 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37195834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37195850 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37195853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37195920 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37195922 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37195978 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37196050 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37196090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37196232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37196301 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37196416 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 37196443 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37196539 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 37196576 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 37196649 G C Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 37196708 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 37197028 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 37197033 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 37197044 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 37197064 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 37197292 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 37197368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37197373 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37197460 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37197522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37197737 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37197738 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37197799 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37197857 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37198013 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37198107 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37198182 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37198457 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 37198767 G A Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 37199461 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37200602 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 37200639 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37200740 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 37201408 C A Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 37201430 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37201598 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 37201789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37201878 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37201929 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37201930 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37202133 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 37203201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37203477 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 37203738 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 37204531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37204735 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37204922 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37206591 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37207512 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 37207636 C G Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 37207704 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37207842 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37208113 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37208252 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 37208261 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37208634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37208813 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37209085 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37210340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37210741 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37212607 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 37213135 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37213924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37214039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37214078 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37214116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37214302 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37214968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37215232 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37216494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37216684 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37216822 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 37217085 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 37217230 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37218548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37218653 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37219006 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37219015 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37219131 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37219139 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37219248 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37219389 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 37219795 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 37220056 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37220157 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37220221 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37220225 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 37221134 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 37221152 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 37221330 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 37221531 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 37222798 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 37223496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37223529 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37223553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37223841 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 37224640 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37224777 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37224810 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 37225561 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37225608 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37225799 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37226887 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 37228344 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37228759 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 37229548 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37229886 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 37231093 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37231283 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37232111 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37232499 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37232526 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37235224 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37236139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37236743 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37236971 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37238256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37241300 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37242743 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 37243044 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37244222 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37244330 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 37244385 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 37244881 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37246108 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 37246325 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37247289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37248211 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 37250590 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 37250942 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37252944 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 19 37253184 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37254023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37254134 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37254602 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37254987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37255053 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37255087 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37255214 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37255282 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37255516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37256364 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37256415 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37256741 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37256751 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 37256807 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37256816 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 37257277 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37257975 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37258124 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37258940 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 37259561 A T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 37259744 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 37259783 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 37259930 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37260125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37260178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37260209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37260273 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37260312 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37260384 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37260491 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37260519 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37260568 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 37260643 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37260667 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37260670 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37260726 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 37260734 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37260839 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37260852 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37260865 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 37260868 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 37260948 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37261198 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37261347 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 37261522 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37261526 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37261551 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37261553 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37261877 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37262084 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 37262733 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37263005 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 37263017 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 37263119 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37263156 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 37263560 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 37263727 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 37263743 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 37264405 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 37264441 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 37264466 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 37265136 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 37265148 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 37265366 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 37265748 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37265754 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37266087 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37266498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37266518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37266794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37267005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37267025 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37267437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37267716 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 37268054 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 37269599 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37269714 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.133333333333333 0 0.866666666666667 4 26 2 0 13 19 37269754 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 37269862 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 19 37269946 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 19 37269947 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 19 37270268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37270731 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37271333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37271982 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37272078 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 37272117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37272270 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 37273177 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 37273293 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 37274137 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 37274292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37274348 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37274479 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 37274496 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 37274600 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 37274764 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 37274955 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 37275064 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 37275067 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 37275252 C G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 37275304 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 37275313 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 37275351 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 37275485 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 37275729 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37275758 A T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 37276485 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37276487 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37276971 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 37278016 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37278575 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37278645 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 37278696 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 37278709 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 37278961 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 19 37278986 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 37279286 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 37279466 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37279478 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37279677 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37280388 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37280538 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 37280553 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 37280776 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 37280957 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 37280970 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37280991 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 37281099 G T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 37281141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37281189 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 37281247 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37281275 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 37281512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37282404 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 37282740 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37283113 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37283217 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 37283311 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 37283424 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37283755 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37284479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37284864 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37284900 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37285373 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37285447 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37285458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37285584 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37285665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37285748 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37285932 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37286006 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37286098 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37286219 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37286238 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37286251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37286390 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37286628 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37286682 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 37286772 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 37286777 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 37286845 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37286945 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37287238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37287267 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37287312 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37287399 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37287774 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 37287789 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37287834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37287844 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 37287850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37287897 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 37287898 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37287935 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 37288034 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37288146 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 37288251 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 37288252 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37288282 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37288289 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37288358 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37288396 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37288482 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37288920 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 37289131 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 37289149 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 37289282 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 37289471 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37289522 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37289748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37289848 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37289878 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37289982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37290020 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37290051 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37290132 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37290285 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37290309 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37290355 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 37290383 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37290457 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37290597 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37291014 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37293576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37294115 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37294524 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37295038 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37295733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37296948 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 37297285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37297611 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 37298345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37298351 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37298884 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 19 37299352 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 37299500 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37299824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37300199 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 37300330 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 37300426 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 37300455 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 37300508 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 37300649 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 37301027 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 37301126 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 37301191 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 37301216 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 37301307 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37301817 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37302624 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37302908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37304094 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 37306196 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37306242 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37309743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37309767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37311063 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37311094 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37314177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37314908 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 37315204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37315329 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 37315347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37315348 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37315654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37317057 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 37317841 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37317974 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37317996 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37318705 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 37320917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37330183 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37332168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37333686 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 37336408 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 37339244 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37340888 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 37341135 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37342915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37344434 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37345361 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 37345440 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 37345590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37346273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37349653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37351338 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37352020 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37352526 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 37352532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37353193 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37354030 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 37355631 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 37355777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37355893 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37356325 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37357693 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37358446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37358789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37362028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37364839 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37365529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37365713 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 19 37367706 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37368951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37370583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37376900 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37377440 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37378392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37378659 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37378708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37379001 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 37380856 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37381060 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37381061 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37381095 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37381103 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37381140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37381181 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37381250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37381287 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37381350 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37381402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37381431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37381444 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37381478 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37381497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37381517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37381666 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37381679 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37381717 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37381725 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37381767 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37381895 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37381973 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37382070 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37382592 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37383402 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37384248 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37384886 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37386324 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 19 37386656 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37386695 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37386714 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37386795 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37386825 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37386838 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37386863 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 19 37386864 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 37386974 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37387433 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37388694 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37388940 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37388957 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 37388980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37389303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37389331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37389943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37390033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37390149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37390387 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37390430 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 18 22 2 14 4 19 37390451 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37390461 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37390469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37390551 A T N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.125 0.6875 0.1875 15 17 2 11 3 19 37390650 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37391132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37391397 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37391405 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37391530 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37391918 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37391934 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 19 37391943 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 19 37392047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37392165 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 37392329 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37392392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37392703 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 19 37392727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37392960 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 37393000 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 19 37393253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37393273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37393325 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 19 37393449 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 37393578 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37393598 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 37393971 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37395505 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 19 37397094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37397168 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 37397570 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37397653 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37397753 G T Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 37397878 A T N N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 19 37398543 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 37399464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37400461 C T Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 19 37400520 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 37401314 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37401582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37401783 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 37402402 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 37402484 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37402594 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 37402629 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 19 37402713 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 37402717 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 37403722 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 19 37403977 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37404040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37404158 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37404333 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 19 37404611 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 37405084 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37405120 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37405285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37405572 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37405813 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37405973 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37405974 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37406073 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 19 37406242 A G Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 37406433 A T Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 37406556 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 37406563 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 37407098 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 37407138 A G Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 37407143 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 37407146 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 37407211 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37407289 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37407985 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37408015 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 37408206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37408604 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37411280 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37413021 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37413222 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 37414030 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37414219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37414332 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 37414394 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37414467 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 37414550 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 37414635 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 37414796 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37414897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37414968 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 37415115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37415801 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 37415807 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 37415845 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37416358 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 37416360 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 37416912 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 37416993 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 37417379 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 37417666 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 37417877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37417878 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37418066 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37418454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37419218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37419815 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 37420050 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 37420096 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 37420098 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 37420357 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 37420537 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37421353 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 37421418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37421607 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 37421728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37421896 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37422184 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 37422352 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 37422366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37422501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37422549 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 37422674 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 37422685 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37422689 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 37422852 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 37422908 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 37422987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37422996 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 37423495 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37423672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37423841 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 37423913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37424181 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37424228 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 37424354 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37424369 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 37424378 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 37424880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37424905 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37424978 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 37425102 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 37425106 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 37425119 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 37425133 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 37425496 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 37425527 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 37425558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37426083 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37426098 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37426109 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37426457 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 37426517 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 37426593 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 37426787 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37427078 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 37427092 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37427228 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 37427306 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 37427577 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 37427861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37427887 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37428080 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 37428130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37428313 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 37428346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37428994 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37429453 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 37429480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37429587 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 37429736 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37431142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37431619 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 37432538 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37432746 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 37433032 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 37433273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37433415 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37433812 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37433977 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37434059 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 37434123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37434128 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37434144 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 37434328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37434329 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37434535 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 37434794 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37434812 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 19 37434867 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37434956 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37434977 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37435026 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37435037 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 37435069 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37435206 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37435231 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37435400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37435440 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37435645 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37435709 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37436101 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 37436663 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 19 37437019 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37437305 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37437362 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37437369 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37437646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37437721 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37442544 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 37442885 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 37444997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37445122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37445447 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37445470 C A Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 19 37446632 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37447288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37450441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37450549 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37450595 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 37450649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37450755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37450931 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37451045 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37451561 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37451569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37451647 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37451992 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37452045 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37452358 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37452538 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37452820 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37453144 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37453165 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37453220 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37453225 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 37453232 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37453246 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37453247 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 37453578 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37453630 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 37453698 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37453787 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 37453974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37454002 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37454037 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37454246 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37454402 A T Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 37456149 C T Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 19 37457079 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 37457416 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 37457693 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37458337 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 37458559 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 37458567 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 37458652 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 37459348 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37459784 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 19 37460246 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 37460266 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 37460302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37460312 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 37460628 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 37460648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37461231 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 37461466 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 19 37462019 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37462535 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37463088 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37463390 G C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 37463423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37463494 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 37463533 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 37463904 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 37463916 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 37463922 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37464094 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37464489 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 37464793 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37465039 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37465084 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37465258 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 37465434 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 37465463 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 37465742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37466411 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37466558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37466819 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37466996 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37467129 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37467332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37467353 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 37467516 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 19 37467541 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 37467680 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 37467849 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37467937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37468058 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 37468335 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 37468355 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 37468372 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 37468373 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 37468404 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 37468459 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 37468675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37468716 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37468749 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37468842 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37468887 T C Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 37468895 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 37468898 T G Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 37468997 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 37469099 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 37469105 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 37469856 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 37470550 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 37470892 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 37471104 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 37471145 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 37471230 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 37471238 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 37471440 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 37471546 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 37471602 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37471636 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 19 37471783 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 37472042 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 37472075 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 37472154 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 37472224 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 37472273 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 37472383 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 37472451 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 37472504 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 19 37472727 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37472729 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 37473054 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 37473108 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37473110 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37473419 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 37473444 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 37473479 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 37473603 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 37473624 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 37473806 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 37473814 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 37473828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37474006 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 37474024 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 37474054 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 37474152 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 37474232 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 37474318 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 37474475 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 19 37474606 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37474817 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 37474857 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 37474964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37475183 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37475221 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37475270 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37475678 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37475717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37475942 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 37476101 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37476143 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 37476310 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37476588 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37476967 C T N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 19 37476972 A T N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 19 37477658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37477728 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37479597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37479633 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37479827 T A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 37480738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37481284 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37483385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37483810 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 37484045 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 37484111 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 37484161 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 37484330 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 37484507 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 37484544 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37484863 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37485077 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37485123 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37485206 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37485236 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37485293 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37485337 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37485375 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37485382 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37485525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37485555 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37485559 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37485673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37485692 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37485743 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37485744 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37485784 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37485924 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37485930 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37485945 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37486302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37486628 C A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 37486710 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 37486729 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 37486774 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37486817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37486870 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 37486872 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37486907 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 37486985 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37487048 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 37487306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37487343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37487511 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37488005 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37488027 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37488153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37488300 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 37488379 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37488406 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37488647 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 37488806 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 37488809 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 37488927 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 37489251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37489421 T A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 19 37490091 T C N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 19 37490950 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 37490956 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 37491079 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 37491080 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 37491197 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 37491441 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 37491644 T C Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 37492546 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 37493008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37493380 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 19 37493468 T G N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 19 37493544 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 19 37493726 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 37493727 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 37493794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37493870 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37494087 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 37494199 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 19 37494802 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 37495049 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 37495269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37495714 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37496179 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 37496681 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37496713 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 37496831 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 37496851 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37496931 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37497004 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37497191 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37497562 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 37497623 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37497736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37497948 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 37498004 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 37498061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37498416 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37498428 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37499213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37499281 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 37499300 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37500501 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37500580 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 37500690 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 37501743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37501769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37501778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37501856 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37502455 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37502629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37503226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37503252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37503580 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 37503803 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 37504499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37505361 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37506255 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37506458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37506532 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 37506604 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37506733 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37507290 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 37507310 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 37507470 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 37508093 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37508094 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37508372 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37511839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37511992 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37511994 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37512713 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 37514875 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37515705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37515751 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37515800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37516325 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37516953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37517354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37518432 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 37521595 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37522302 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 37524102 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37526645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37527475 A G Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 37528445 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 37529566 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 37529567 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 37529653 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 19 37529710 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 37530422 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 19 37530967 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37533990 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 37534864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37535373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37536838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37538940 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 19 37539859 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37540088 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37540111 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37540159 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.1 0.75 0.15 19 21 2 15 3 19 37540306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37540586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37541743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37541883 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.15 0.75 0.1 21 19 3 15 2 19 37543312 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37545173 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37545773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37545997 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 19 37546841 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37546862 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37546991 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37547168 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37547427 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 37548000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37548200 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 37549216 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 37549543 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37551265 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 19 37551282 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 37551337 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 37551370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37551388 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 37551424 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 37551515 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 19 37551634 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 37551675 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 37551702 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 37551732 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 37551748 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 37551777 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 37551895 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 19 37551910 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 37552048 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 37552227 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37552228 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 37552246 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 37552335 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 37552342 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 37552356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37552376 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 37552390 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 37552393 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 37552426 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 37552435 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 37552451 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37552466 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 37552524 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 37552538 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 37552574 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 37552600 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 37552692 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 37552718 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 37552748 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 19 37553129 G A Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 19 37553136 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 19 37553182 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 19 37553269 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 37553272 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 37553410 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 37553415 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37553433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37553434 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 37553561 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 19 37553673 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37553692 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 37553886 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 37553890 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 37553941 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 37553974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37554210 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 37554230 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 37554264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37554433 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 37554998 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 37556602 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 37559476 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37562397 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37562809 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37563738 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37564179 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 37565480 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37565808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37566088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37569643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37570672 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37571016 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 37571196 C T N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 19 37571464 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37571599 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37571707 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37571856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37572444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37572784 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37573191 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37573268 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37573721 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 37575317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37576655 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37577305 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 37577324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37577597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37578662 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 37579220 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 37579293 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 37580233 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37580743 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37582051 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37582398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37584017 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37584568 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37585841 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 37588085 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37590360 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37592906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37593407 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 37593624 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37593654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37593714 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 37593858 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37594000 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 37594237 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37594350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37601320 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 37602226 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 19 37602251 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37603396 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37603821 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37603825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37603851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37605467 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37605531 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 37606292 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 37606816 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37607532 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 19 37608090 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 37608096 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 37608812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37608814 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 37608939 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 19 37610067 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 37610260 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37610763 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37610821 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 37610859 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 37611169 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 37611243 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 19 37611414 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37611617 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 37611833 G T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 19 37612410 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37612765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37614097 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 37615158 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37615168 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 19 37615373 G C N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 19 37615687 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 37615696 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 19 37616146 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 37616209 C G Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 37616446 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 37616462 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37616515 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 37616544 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 19 37616605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37616692 C G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 37616697 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 37617189 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37617318 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37617462 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 37617574 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37617593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37618480 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 37618941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37619151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37619544 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37620083 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 37620085 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 37620508 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 37620512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37620580 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37622075 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 19 37622338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37622718 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 19 37622775 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 37623478 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37623613 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37623645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37623836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37624026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37625425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37627586 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 37628107 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37628957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37629465 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37629469 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37629702 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37629703 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37629734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37629857 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37629942 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37629952 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 37629958 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 37629982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37629991 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37630015 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37630016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37630541 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 19 37630562 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37630611 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37630636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37630821 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37630884 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 37631071 T A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 37631114 G T N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0 0.733333333333333 0.266666666666667 11 19 0 11 4 19 37631331 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 37631384 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 19 37631502 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 37631520 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 37631566 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 37631835 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 37631863 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 37631879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37631900 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37631944 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37632281 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 37632549 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37632840 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 37633183 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37633240 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 19 37634663 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37635652 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 37635734 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37637247 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 37638719 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37639991 G A Y Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 10 18 0 10 4 19 37644662 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37648923 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 37649520 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37649531 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 37650032 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 37650036 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 37650046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37650068 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 37650103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37650115 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 37650253 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 37650268 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37650286 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 37650335 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 37650418 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 37650461 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 37650599 C T N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 19 37650768 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 19 37650785 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 19 37650796 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 19 37650861 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 19 37650874 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 19 37650880 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 19 37650887 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 19 37650899 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 19 37651047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37651081 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 19 37651678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37652131 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37652179 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37652735 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 37652902 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37653387 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 37653747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37653793 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 37653991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37654125 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37655516 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 37655705 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 37655739 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 37655754 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 37655755 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 37656475 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37657007 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37657177 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 37657224 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 37657732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37657902 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 37657911 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 37658143 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 37658148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37658149 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 37658276 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 37658623 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 19 37658728 G T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 19 37658872 A G N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 19 37660281 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 37660403 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 37660426 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 37660759 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 37660772 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 37660785 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37660787 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 37660800 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 37660813 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 37660867 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 37661000 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 37661433 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 37661571 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 19 37661585 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 37661687 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37661750 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 19 37661773 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 19 37661946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37662000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37662202 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 37662300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37662447 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37662570 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 37662849 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 19 37663579 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 37663588 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 37663603 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 19 37663604 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 19 37663619 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 37663638 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 37664094 C G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 19 37664136 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 37664174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37664193 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37664276 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 37664437 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 19 37664453 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 37664808 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 37664843 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 37664862 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37664920 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 37665040 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 19 37665173 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 37665262 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 37665284 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 37665316 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 37665369 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37665706 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 37665712 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37665723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37665738 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 37665776 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37665794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37665886 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37665911 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37665916 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37665917 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37665935 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37665972 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 37665983 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 37665997 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 37666081 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37666202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37666244 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37666270 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37666312 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 37666348 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 37666408 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 37666468 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37666549 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 37667012 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 37667242 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 37667407 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 37667653 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37667851 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 37667922 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 37668096 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 37668112 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 37668116 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 37668233 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 37668622 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37668706 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 19 37668715 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 37668843 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 37668882 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 37668900 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 37668908 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37668920 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 37668957 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 19 37669298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37669843 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 37670041 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 37670130 C G N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 19 37670131 C G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 37670314 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37670430 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37670588 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37670633 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37670748 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37671081 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 37671102 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 37671319 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37671726 A G N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 19 37671799 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 19 37671872 T G N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 19 37671884 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 19 37672095 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 37672139 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 37672269 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 37672270 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 37672336 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37672477 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37672550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37673389 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 37673790 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 37673919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37673941 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 37674354 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 37674438 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37674452 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 37674499 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 37674528 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 37674617 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37674792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37674836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37675285 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 37675304 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 37675622 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 19 37675754 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 19 37675812 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 37675905 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37676780 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 19 37676918 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 37676952 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37677181 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 37677677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37677750 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37677779 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 19 37677819 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 37677880 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 37677890 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 37677909 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 37678050 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 37678078 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 37678081 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 37678095 T A N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 19 37678119 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 37678377 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 37678425 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 37678429 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 37678705 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37679035 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37679357 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37679457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37679514 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 19 37679562 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37679628 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37679644 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37679664 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37679755 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 37679779 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 37679812 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37679950 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37680042 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37680128 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37680147 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 37680154 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 37680311 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37680714 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 19 37680750 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 19 37680891 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37681242 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37681257 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37681327 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37681567 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37681702 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 37681709 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37681738 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37681899 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37681979 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 37682053 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 37683657 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 37683827 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 37683933 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37683951 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37684016 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37684147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37684220 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 37684609 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 19 37684612 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 19 37684648 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 37684800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37684848 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 37684925 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 19 37684951 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37685044 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37685142 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37685201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37685853 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 37685893 G T Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 19 37685931 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37685984 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 19 37686787 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 37686983 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 37687059 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 19 37687091 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 19 37687180 T G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 37687197 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 37687881 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 19 37688204 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 37688252 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37688637 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 37688698 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37688724 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37688741 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37688920 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 37688989 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37689000 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 19 37689087 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37689321 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 37689323 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 37689335 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 37689458 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37689518 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37689606 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 37689773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37689837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37689938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37690283 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 37690374 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 37690504 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 37690773 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37690803 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 37691689 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 37699006 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 37699076 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37699140 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37699174 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37699192 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37699193 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37699196 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37699200 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 37699206 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37699324 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37699349 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37699490 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37699539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37699738 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 37699791 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37699835 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37700044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37700349 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37700405 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37700524 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37700529 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37700615 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37700765 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 37700887 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37701086 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37701087 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37701128 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37701161 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37701291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37701326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37701363 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37701407 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37701651 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37701672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37701797 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37701801 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37701846 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 37701854 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37702034 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 37702059 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 37702061 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 37702079 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 37702380 C A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 37702480 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37702487 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 37702716 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37702752 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37702763 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37702779 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37702798 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37702808 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37702820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37702838 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37702976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37702981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37703043 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37703074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37703083 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37703239 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37703251 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37703317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37703328 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37703338 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37703347 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37703358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37703403 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37703409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37703449 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37703482 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37703487 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37703515 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37703518 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37703585 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37703603 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37703625 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37703646 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37703707 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37703708 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 37703748 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37703772 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37704008 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37704169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37704186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37704237 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37704300 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 19 37704374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37704386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37704708 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37704782 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 37704794 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37704900 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 37704901 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 37704957 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 37704961 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 37705000 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 37705103 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 37705423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37706175 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37706652 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37706754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37708821 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 37708966 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37709746 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37709783 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37709796 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37712387 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37714760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37714765 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37715134 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 37715282 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 19 37715569 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37715839 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 37716057 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 37716068 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 37716182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37716463 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 37716587 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37716613 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 37716829 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 37716849 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 37717503 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 37718310 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 37718395 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 37718455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37719551 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 37719562 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37719700 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 37719834 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 37719858 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 37719859 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 37719880 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 37719901 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 37719919 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37719942 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37720163 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37720165 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 37720343 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 37720360 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 37720493 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 37720558 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 37720641 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 37720666 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 37720746 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 37720905 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37721282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37721328 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 37721358 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 37721361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37721362 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 37721419 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 37721443 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37721490 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 37721500 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 37721514 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 37721684 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 37721946 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 37721973 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37721982 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37722051 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37722113 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37722146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37722155 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37722175 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37722225 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37722344 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37722440 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 37722444 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 37722452 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37722477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37722513 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37722559 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 37722560 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37722576 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 37722593 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37722721 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37723041 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 37723042 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 37723057 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 37723072 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37723080 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37723195 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37723196 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37723527 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 37723639 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 37723758 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 37723935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37723959 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37723964 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37724038 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 37724491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37724572 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 37724640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37724700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37724795 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 37724871 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37725088 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 37725368 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 19 37725375 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 19 37725846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37725851 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37725853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37725883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37726120 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 37726173 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 37726230 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 37726377 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 37727166 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 37727218 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 37727292 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 37727351 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 37727474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37727551 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37727552 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 37728008 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37728419 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37728443 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37728828 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37728969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37729196 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 37729469 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 37729850 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 19 37729889 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37729981 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37730347 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37730387 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 19 37730481 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37731485 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 37731566 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37731604 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37731777 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 37731791 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37731792 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 37731987 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 37731997 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37732028 A T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 19 37732101 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 37732139 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 37732142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37732424 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37733202 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37733404 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 37733660 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 37733677 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 37734020 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 37734025 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 37734072 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 37734253 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 37737006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37745401 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37748869 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 37750418 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 37750720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37750722 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 37750837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37751038 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 37751526 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37751966 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 37752035 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 37752581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37752795 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37753958 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37754676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37754749 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 37754959 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37755587 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37755825 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37756535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37759918 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 37760020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37760221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37761016 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 37761112 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37761127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37761301 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37761305 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37761344 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 37761509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37762192 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 37762202 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 37762381 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 37762613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37763381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37765181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37765668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37765976 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37766045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37767647 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37769331 A G N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 19 37769522 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 19 37769898 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 37774111 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37774341 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37774959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37776082 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 37777429 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37777442 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 37777492 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 37777598 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 37777649 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37777869 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 37777936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37778001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37778080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37778115 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 37778117 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 37778280 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37778688 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37779029 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37779041 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 37779076 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 37779114 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 37779863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37780134 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 37780449 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 37780517 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37780769 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37780822 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 37780867 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37780869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37781005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37781057 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 37781063 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 37781262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37781908 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 37782471 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 37782960 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37783485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37787731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37788231 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37790642 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 37790643 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 37790662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37791073 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 37791089 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 37793456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37794142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37795234 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37795472 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 37795524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37795529 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 37795543 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37795683 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 37796039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37797948 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 37797970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37798138 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 37798146 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37798170 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 37798176 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 37798202 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37798249 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37798409 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37798445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37798575 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 37798604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37798721 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37799274 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 37799284 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 37799300 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 37799314 C T Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 19 37800067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37800101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37800115 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 37800118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37800143 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 37800286 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 37800372 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37800508 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 37800639 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37800679 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37800682 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 37800702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37800711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37800823 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 37800849 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37800889 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 37800899 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 37800936 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 37801087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37801604 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 37801605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37801740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37801772 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37801920 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 37802074 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 37803141 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37803389 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37803731 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 37803843 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37804795 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 37804803 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37806468 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37808962 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 37809806 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37809985 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 37810110 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 37810789 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 37810848 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 37812026 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37812889 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 37813091 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 37814107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37814430 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37815107 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 37815323 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 37815328 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 37817085 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 37817296 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 37818083 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 37818097 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 37818862 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37819888 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 37821670 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 37826489 T G Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 37828233 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37828345 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 37829036 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37829597 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37833090 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 37833788 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37834197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37835365 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 37835374 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 37835433 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 37835454 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 37835513 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 37835837 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37835854 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 37835944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37835947 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 37836027 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 37836128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37836130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37836135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37836145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37836253 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 37836336 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 37836348 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 37836354 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 37836362 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 37836378 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 37836419 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 37836424 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 37836440 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 37836476 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 37836547 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 37836605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37836895 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 37836918 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 37837082 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 37837337 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 37837342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37837352 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 37837521 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 37838480 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 37838577 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37839160 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 37839189 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 37839973 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 37839975 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 37839994 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 37840307 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37840308 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 37840577 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 19 37840619 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 37840671 T A Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 37840734 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37840817 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37840847 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 37840921 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37841395 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 19 37841785 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 37841840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37841852 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 37841928 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 37842148 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37842364 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 37842418 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37842618 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37843234 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37843432 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37844154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37844824 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37845142 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 37845634 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37845783 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37846809 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37847116 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 19 37847332 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 37847484 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37847597 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 37847682 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 37847684 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37848477 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 37848604 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37848731 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37848987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37849282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37849541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37849892 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 37850949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37850967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37851063 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37851310 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37851582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37851625 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 37852375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37853179 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 37855049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37855606 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 37855842 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37856353 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 37856819 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 37858483 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37859323 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 37859336 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 37859383 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 37859743 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37860060 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37860111 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 37860326 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 37860369 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 37863172 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37872755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37873557 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37875022 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37875272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37876000 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37876996 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 37877012 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37877929 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37879405 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37880369 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 37880720 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 37882216 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 37882426 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 19 37883142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37883286 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37883367 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 37883486 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37883622 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 37883842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37884291 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 37884630 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37885692 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 37885941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37886016 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37887114 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 37887332 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 37887856 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37887892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37889213 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 37892501 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 37892919 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 37892969 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 37893220 A G Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 37895648 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 37896144 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 37896196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37896238 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 37896307 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37896410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37896498 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37896618 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 37896619 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 37896864 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37899380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37899456 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37899566 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 37899612 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 37899626 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 37899629 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 37899688 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 37899689 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 37899694 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 37899695 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 37899949 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 37900141 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 37900824 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37900976 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37901157 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 37904895 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 37905650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37905722 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37905889 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37905903 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37906144 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 37906215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37906245 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 37906327 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 37906390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37906458 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37906509 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37906671 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 37906940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37907089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37907098 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37907192 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37907297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37907378 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37907385 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37907507 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37907749 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37907884 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37907894 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37908598 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37908753 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37908761 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 37908792 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 37909293 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 37909295 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 37909319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37909368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37909392 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 37909510 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37909884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37909925 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37910035 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37910072 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37910328 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37910482 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37910884 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 37910886 T C N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 19 37910890 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 37911028 T C N Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 19 37911146 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 37911472 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 37911740 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 37912013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37912014 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37912044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37912051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37912416 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 37912448 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 37912452 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 37912460 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 37912797 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 37913122 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 37913269 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37913309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37913530 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 37913660 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 37913676 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 37914003 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 37914024 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 37914084 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 37914220 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 37914400 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 19 37914403 G C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 37914452 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 37914716 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 37914847 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37915101 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 37915349 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37915541 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 37915568 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37915629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37915748 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 37915766 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37915803 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 37915820 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 37915828 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37917610 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37919709 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 37919742 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 37919749 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 37919779 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 37919862 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 37919866 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 37919868 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 37919911 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 37920103 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 37920321 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 37920355 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.4 0.1 0.5 18 22 8 2 10 19 37920436 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 37920450 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 37920604 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 37921051 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 37921111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37921142 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 19 37921807 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 37921910 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 37922030 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 37922093 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 37922464 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.421052631578947 0.105263157894737 0.473684210526316 18 20 8 2 9 19 37922590 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 37922821 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 19 37923084 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37923092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37923174 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37923267 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.4 0.1 0.5 18 22 8 2 10 19 37923319 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37923434 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.421052631578947 0.105263157894737 0.473684210526316 18 20 8 2 9 19 37923522 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37923697 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.4 0.1 0.5 18 22 8 2 10 19 37923855 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 37924095 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 37924096 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 37924109 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 37924174 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 37924205 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 37925197 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 37925290 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 37925312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37926645 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37926918 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37927428 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 37927798 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 37928062 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 19 37928153 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 37928350 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 37928374 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 37928400 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 37928764 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 37928839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37928843 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37928857 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37929449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37929538 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37929553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37930492 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 37930505 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 37930548 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37930700 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 37930846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37930943 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 37930949 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 37931032 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 37931103 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.4 0.1 0.5 18 22 8 2 10 19 37931273 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.368421052631579 0.105263157894737 0.526315789473684 16 22 7 2 10 19 37931508 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.526315789473684 0.105263157894737 0.368421052631579 22 16 10 2 7 19 37931772 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 37931788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37932162 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 37932589 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37932590 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 37932632 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37932821 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.444444444444444 0.111111111111111 0.444444444444444 18 18 8 2 8 19 37932831 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.421052631578947 0.105263157894737 0.473684210526316 18 20 8 2 9 19 37933207 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37933462 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37933465 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 37933575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37933592 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37933718 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37933804 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37934181 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 37934700 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37934829 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 37934880 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37935201 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 37936206 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37936210 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37936609 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37936784 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37936882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37936991 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 37937056 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37937071 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 37937118 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 37937144 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 37937224 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 37937249 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 37937317 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 37937324 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 37937431 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 37937440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37937515 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 37937846 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 37937931 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 37938082 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 37938355 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 37938375 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 37938506 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 19 37938783 T A N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.357142857142857 0.214285714285714 0.428571428571429 13 15 5 3 6 19 37938826 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 37938845 G A N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 19 37938865 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 19 37938875 G T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 37938984 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 37939031 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 37939133 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 37939163 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 37939170 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 37939200 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 37939222 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 37939242 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 37939310 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 37939313 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 37939411 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 37939478 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 37939481 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 37939499 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 37939551 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 37939584 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 37939827 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 37940082 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 37940105 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 37940132 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 37940151 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 37940381 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 19 37940407 G T N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 19 37940507 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 37940710 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 37941148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37941251 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 37941320 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37941602 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37941889 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 37944339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37944399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37944708 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 37944778 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 37944805 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 19 37944809 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 37944811 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 37944868 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 37944887 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 37944890 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 37944969 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 37945064 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 37945082 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 37945361 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37945475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37945507 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37945802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37946234 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37946235 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 37946329 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 37946584 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37946588 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 37946890 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37946914 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37946941 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37947054 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37947086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37947269 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37947926 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37948370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37948411 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37948642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37948811 G A Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 37948814 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 37948868 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 37948957 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 37948980 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37949033 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37949046 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37949598 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 37949650 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37949673 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37949684 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37950140 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37950362 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 37950418 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 37950438 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 37950542 G C Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 37950608 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 37950644 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 37950648 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37950658 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 37951264 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 37951296 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 37951359 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 37951702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37951949 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 37951984 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 37952130 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 37952168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37952360 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 37952460 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37952612 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 37952688 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 19 37952848 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 37952858 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 37953096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37953145 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 37953189 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 37953205 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37953232 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 37953350 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 37953400 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 37953636 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37953638 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37953646 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37953670 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37953690 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 19 37954046 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 37954248 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 37954299 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 37954321 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 37954381 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 37954382 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 37954429 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 37954513 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 37954567 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 37954579 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 37954583 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37954602 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37954735 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37954828 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37954846 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37955065 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 37955068 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 37955082 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 37957889 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 37957974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37958322 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 37958330 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 37958332 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 37958337 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 37958962 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37958964 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37959426 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37959612 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 37959636 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 37959639 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37959646 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 37960032 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37960354 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37960705 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 37961177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37961518 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 37961538 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37961804 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 37961854 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 37961922 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37961944 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 37961954 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 37961973 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37962031 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37962343 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37962441 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 37962470 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 37962566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37962645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37962790 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 37962791 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37962912 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 37962940 C T N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 19 37962960 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 37962975 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 37963011 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37963052 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37963279 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 37963280 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 37963310 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37963334 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 37963663 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 37963708 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 37963714 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37963838 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 37964197 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37964410 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 37964447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37964492 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 37964554 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 37964873 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37965163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37965193 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 37965208 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 37965271 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 37965425 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37965516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37965647 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37965773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37965797 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37965969 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37966115 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 37966422 C A Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 37966453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37966588 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 37966811 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37966909 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37966983 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 37966988 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 37966991 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 37966999 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 37967000 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 37967063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37967093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37967311 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 37967370 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37967382 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37967399 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37967788 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 37968296 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37968302 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37968420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37969055 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37971203 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37971406 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37971819 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37973573 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37973624 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 19 37979167 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37979718 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37981267 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37981378 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37983186 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 37983921 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37986781 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 37986818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37988661 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37989494 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37989495 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 37989695 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 37989911 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 37990257 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37990274 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37990297 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 37990346 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 37990364 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 37990551 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 37990552 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 37990596 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 37990690 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 37990694 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 37990715 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 37991099 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 37991187 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37991225 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 37991335 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37991351 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37991373 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37991469 C A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 37991668 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 37991967 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37992268 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 37992965 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 37992993 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 37993200 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 37993722 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 37993942 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 37994024 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 37994063 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 37994338 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 37995145 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 37995436 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37997697 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37997982 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 37998186 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37998200 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 37998223 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 37999282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38001323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38001786 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 38002596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38003756 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38005365 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 38005809 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 38006620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38006817 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 38006819 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 38006836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38007344 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 38007346 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 38007526 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 38007540 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 38007699 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 38009220 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38009627 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 38009718 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 38009742 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 38009858 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38010498 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 38010759 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 38011032 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 38011141 G C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 38011277 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 38011298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38011319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38011459 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38011472 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38011493 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 38011495 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38011496 T G N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 19 38011655 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 38011960 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38013621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38013706 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 38013794 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 38014605 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 38014633 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 38014730 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 38014747 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 38014949 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 38015085 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 38015090 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 38015221 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 38015485 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 38015713 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 38015721 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 38015889 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 38015988 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 38016030 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 38016221 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 38016302 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 38016395 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 38016412 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 38016424 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 38016502 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38016633 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 38017534 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 38017625 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 38017632 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 38017705 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 38017711 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 38017731 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 38017758 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 38018416 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 38018719 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 38018757 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38018779 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 38018977 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 38019151 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38019404 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38019562 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 38019627 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 38019690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38019778 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38020084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38022072 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 38022327 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38022332 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38023048 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38023263 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 38024589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38025653 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 38025684 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 38025815 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 38026131 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38028305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38029729 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 38029821 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 38030694 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 38030713 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 38031076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38031537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38031538 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 38034056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38035750 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38035841 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 38035910 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38035962 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 38035965 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 38036259 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38036402 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38036462 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38036463 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38036681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38036697 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38036702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38036720 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38036754 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38036863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38037741 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 38037768 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 38037852 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 38037974 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38038026 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38038036 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38038107 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 38038293 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 19 38038482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38038502 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 38038670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38038824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38038855 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 38038873 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 38039361 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38039380 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38040105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38040176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38040513 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 38040541 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 38040544 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 38042390 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 38042415 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 38042426 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38042665 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 38042689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38042744 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38042785 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 38042830 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 38043256 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38043523 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 38045007 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38045008 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38045499 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 38045678 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38046711 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38047144 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 38048297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38048949 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38049526 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 38050137 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 38050561 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 38050795 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38052778 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 38055443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38056000 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 38056035 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38056109 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38056138 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38056145 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38056171 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 19 38056210 C T Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 19 38056606 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38056611 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 38056650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38056885 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 38056886 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 38056991 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 38056992 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 38057104 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38057571 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 38057594 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38057774 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38058384 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 19 38058488 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38058511 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38058717 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 19 38058789 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38058810 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 19 38058926 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 38059364 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38059407 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 38059408 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 38059433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38059614 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 38059843 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38059913 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 38059915 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 38059965 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 38059971 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38059994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38060177 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38060185 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 38060198 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38060205 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38060211 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 38060212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38060716 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 38060742 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38060770 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38060771 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38060777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38061172 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 38061313 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 38061639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38061790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38063180 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38064859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38065683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38065823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38065872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38066013 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38066382 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38066724 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 38066739 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38066789 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38067174 C A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 38067275 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 38068972 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 38068977 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 38069010 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 38069599 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38069952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38070057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38070977 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38071406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38071418 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 38071437 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 38071546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38072182 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38072626 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38072776 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 38072838 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 38073138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38073252 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38073324 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 38073552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38073650 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38073764 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 38073783 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38074140 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38074162 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 38074179 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 38074519 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 38074724 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 38075230 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 38075397 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38076316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38076453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38076456 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38076513 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38076569 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38076612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38076613 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38078115 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38078188 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 38078260 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 38078396 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 38078423 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38078515 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 38078614 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 38078838 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 38078922 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 38078938 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 38079067 A T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 38079073 C A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 38079097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38079102 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38079142 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 38079165 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 38079211 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 38079270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38079290 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 38079324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38079350 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 38079376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38079474 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38079492 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38079864 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 38079891 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 38079901 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38079905 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 38079909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38079951 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 38079990 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38080030 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 38080042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38080043 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38080098 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 38080236 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 38080248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38080279 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38080343 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 38080355 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38080362 T A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 38080378 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 38080546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38080581 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38080609 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38080882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38081231 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38081254 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38081268 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38081308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38081474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38081485 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38081641 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38081677 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38081686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38081700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38081716 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38081743 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38081812 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 38081900 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38082252 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38082445 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 19 38082529 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38082707 A C N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 19 38082745 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 38082772 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38082775 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38083017 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 38083045 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 38083073 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38083103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38083530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38083559 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 38083903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38084146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38084196 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38084246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38084528 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38084551 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38084674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38084942 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38084946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38085005 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 38085081 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 38085094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38085295 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38085689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38085765 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38085785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38085797 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38085798 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38085810 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38085906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38086096 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38086106 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 38086145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38086198 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 38086318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38086319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38086405 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 38086418 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 38086645 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 38086668 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 38086796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38086977 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38086995 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 38087049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38087072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38087100 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 19 38087112 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38087169 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38087210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38087275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38087308 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38087313 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38087461 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38087519 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38087757 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38087796 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38087809 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38087813 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38087820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38088323 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38088765 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 38088766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38088833 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 38088994 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38089010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38089257 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38089271 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38089349 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38089394 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38089406 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38089519 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 38089744 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 38089758 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38089770 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38089820 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38089911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38090065 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38090457 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38090462 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38090477 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 38090541 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38090607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38090612 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38090614 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38090651 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 38090828 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38090889 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 38090891 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 38090928 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 38090994 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38091089 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 38091170 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38091260 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 38091315 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38091376 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38091422 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 38091682 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 38091713 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 38091743 A T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 19 38091789 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 38091803 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 38092090 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38092334 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 38092348 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 38092429 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 38092561 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 19 38092562 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 19 38092576 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 19 38092578 G T N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 19 38092579 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 19 38092596 G T N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 19 38092654 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 38092655 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 38093087 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 19 38093159 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 38093962 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 38093974 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 38094009 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 38094125 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 38094203 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 38094269 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38094509 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38094511 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38094519 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38094540 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38094567 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 38094574 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 38094582 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 38094613 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 38094617 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 38094635 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38094645 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38094663 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38094669 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38094724 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38094976 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38097227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38097233 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38097289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38097426 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 38097607 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 38097627 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38097675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38097773 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38097906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38098059 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38098090 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 38098091 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38098092 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38098209 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38098273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38098321 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38098438 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38099198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38099257 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 38099268 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 38099282 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 38099343 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 38099409 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38099542 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38099555 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38099726 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38099733 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38099752 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38099767 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 38099806 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 38100145 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 38100167 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 38100188 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 38100387 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38100398 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38100450 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38100621 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 38100979 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 38100987 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 38101041 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38101168 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38101212 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38101305 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38101774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38101803 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38101898 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 38102148 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38102156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38102188 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38102330 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38102373 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38102457 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38102520 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38102680 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38102823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38102876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38103111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38103256 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 38104491 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 38104506 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38104517 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38104548 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38104720 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 38104750 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38104759 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38104767 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38104854 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38104885 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38105030 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 38105100 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38105105 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38105110 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38105123 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38105216 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38105246 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38105331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38105499 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 38105520 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38105532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38105591 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38105595 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38105750 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38105776 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 38105814 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 38105874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38105896 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 38105898 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 38105899 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 38106200 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 38106665 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 38106732 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38107116 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38107143 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0 0.842105263157895 0.157894736842105 16 22 0 16 3 19 38107305 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38107310 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38107320 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38107574 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 38107717 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38107828 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38107893 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38108093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38108148 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38108153 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 38108191 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38108374 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38108480 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 38108482 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 38108485 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 38108531 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38108548 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38108550 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38108637 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 38108659 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38108680 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 38108809 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38108839 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38108927 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 38108936 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38109633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38109789 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38109798 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38109852 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38109950 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 38109976 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38110442 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 38110479 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 38110527 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 38110599 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38110681 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38110685 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38110694 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 38110705 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 38110710 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 38110729 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38110762 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 38110868 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 38110909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38110975 A T N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 19 38111108 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38111113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38111159 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 38111193 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38111520 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 38111522 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 38111523 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 38111525 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38111765 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38111848 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38112116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38112177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38112183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38112219 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38112222 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38112346 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38112356 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38112363 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 38112375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38112419 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38112449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38112452 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 38112475 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38112525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38112704 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38112758 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 38112767 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 38113167 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38113219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38113583 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38113898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38114003 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38114150 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 38114245 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 38114254 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38114412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38114688 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 38115146 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38115238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38115263 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38115316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38115321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38115327 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38115397 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 38115458 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 38116189 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 38116196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38116284 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 38116295 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 38116296 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 38116377 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 38116381 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 38116405 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 38116492 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 19 38116501 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 19 38116508 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 38116595 C T N Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 19 38116662 A G N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 19 38116677 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 38116679 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 19 38116787 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 38116796 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 38116817 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38117271 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 38117289 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38117539 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 38117540 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 38117549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38117574 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38117671 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38117757 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38118546 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38118814 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38118935 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 38119093 T G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 19 38119101 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 38119175 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 38119248 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38119290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38119294 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 38119371 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 38119464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38119537 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 38119549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38119570 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38119653 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38119696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38119724 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38119891 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38119972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38120101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38120206 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38120207 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 38120244 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38120261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38120273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38120354 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38120360 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38120382 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 38120410 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38120412 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38120461 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 38120469 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 38120685 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38120721 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 38120764 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 38120792 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38120799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38120800 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38120811 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38120863 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 38120873 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 38120951 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 38120998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38121000 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 38121024 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 38121026 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 38121200 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 38121214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38121262 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 38121332 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 38121343 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 38121379 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 38121404 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 38121591 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 38121629 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38121808 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38121966 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 38122526 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 38122617 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 38122960 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 38123152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38123334 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38123345 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 38123366 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38123371 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38123620 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 38123640 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 38123667 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 38123678 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 38123681 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 38123792 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38123793 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38123856 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 38123858 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 38123867 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 38123980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38124095 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 38124235 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 38124418 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38124545 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38124600 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38124611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38124848 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38124877 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 38124908 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 38124948 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 38125058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38125316 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 38125384 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 38125616 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38125619 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38125629 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38125667 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38125723 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38125745 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38125887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38126015 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 38126057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38126068 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 38126070 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 38126071 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 38126104 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 38126177 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 38126181 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 38126443 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38126760 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 38126991 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 19 38127117 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 38127147 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 38127195 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 38127210 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 38127581 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 38127701 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38127846 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 38127984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38128173 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 38128223 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 38128234 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 38128293 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 38128919 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38129143 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 38129191 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 38129198 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 38129216 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 38129227 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 38129234 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 38129249 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 38129253 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 38129319 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 38129541 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 38129671 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 38129730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38129755 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38129840 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38129944 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38130629 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38130637 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38130711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38130713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38130720 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38130756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38130833 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 38130872 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 38131092 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 38131623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38132454 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38132467 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38132559 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 38132582 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 38133208 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38134041 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38134223 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 38134748 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 38134884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38134911 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 38135115 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 38135325 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 38135832 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 38135856 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 38136813 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38137902 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38138533 T C N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 19 38139142 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 38139377 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38139388 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38139433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38140576 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38140781 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 38143890 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 38144748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38145268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38145504 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 38145620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38146165 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38146446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38146621 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 38146632 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 38147460 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38147623 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 38148252 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 38148279 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38148281 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 38148855 A C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 38149348 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 38149514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38149549 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38149554 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 38149555 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 38150076 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 38150078 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 38150391 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38150520 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38150524 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38150614 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38150775 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38150785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38150806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38150869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38150932 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 38150941 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 38151219 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38151821 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38151835 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 38153372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38153397 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38153423 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38153832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38154079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38154125 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38154165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38156098 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 38156378 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38156720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38157604 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38159584 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 38160041 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38160827 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 38162755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38163208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38163355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38163661 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 38164492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38166159 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38167365 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38167460 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 38168025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38168203 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 38168631 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38169776 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 38170148 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 38170198 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 38170219 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38170884 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38172413 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 38172634 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 19 38173168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38173311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38173494 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 38173538 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 38173611 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 38173655 T C Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 38173694 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 38173764 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 38173791 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 38173946 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 38173947 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 38173972 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 38174377 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 38174555 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 38174573 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 19 38174611 T G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 38174619 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 38174632 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 38174682 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 38174818 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 38174876 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 38174949 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38175110 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 38175165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38175308 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 38176980 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 38177386 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38178207 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 38178277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38178595 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38178602 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38178647 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38179236 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38179514 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38179654 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 38179756 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 38179795 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 38179855 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 38180025 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 38180077 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 38180088 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 38180100 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 38180331 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 38180339 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 38180362 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38180821 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 38180866 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38181445 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 38181466 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 38181502 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 38181813 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 38182203 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 38183010 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38183089 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38183421 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 38183539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38183545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38183655 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 38183842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38183965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38184142 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 38184175 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38184399 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 38184441 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38184515 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38184654 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38184718 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38184808 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38184868 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 38184884 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 38185002 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 38185085 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 38185183 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38185189 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38185487 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38185545 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38185555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38185580 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38185611 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38185700 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 38185749 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38185828 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38186062 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38186368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38186380 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38188509 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38188985 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 38189043 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38189058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38189544 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 19 38189600 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38189602 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38189625 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 38189693 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38189694 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38190086 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38190137 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38190168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38190201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38190206 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 38190253 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 38191168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38191717 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 38191880 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38191953 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38192036 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 38192119 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 38192121 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 38192160 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 38192313 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 38192608 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 19 38192688 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 38192739 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 38192772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38192790 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 38193007 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38193177 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 38193231 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 38193281 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 38193286 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 38193375 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 38193412 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 38193414 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 38193416 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 38193473 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 38193536 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 38193544 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38193763 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 38193839 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 38194244 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 38194474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38194968 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 38194976 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 38195168 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 38195174 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 38195193 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 38195408 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 38195534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38195601 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38195659 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38196664 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38196800 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 38197092 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 38197507 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 38197563 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 38197592 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 38197600 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 38197603 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 38197614 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 38198191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38198690 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 38198802 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 38198836 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 38200599 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38201367 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 38201989 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 38202135 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 38202370 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 38202515 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 38202532 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 38202549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38202559 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 38202575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38202583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38202719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38202795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38202800 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 38202827 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 38202878 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38202881 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38202959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38202997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38203066 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 38203320 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38203324 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 19 38203426 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 19 38203480 A G N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 0.142857142857143 0.214285714285714 20 8 9 2 3 19 38203872 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 38203898 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 38204049 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38204279 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38204352 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 38204356 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 38204357 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 38204434 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38204494 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38204532 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38204549 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38204711 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 38204726 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38204845 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38204863 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38204870 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38204909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38204993 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 38205022 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 38205265 A T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 19 38205795 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38205808 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 38206035 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 38206038 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 38206130 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 38206144 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 38206162 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 38206192 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38206227 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38206379 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38206511 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 38206518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38206672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38206746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38206781 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 38206862 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 38207135 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 38207157 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 38207434 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38207462 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 38207498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38207783 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 38208064 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 38208084 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 38208103 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 38208105 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 38208180 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 38208227 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 38208362 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38208407 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 38208660 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 38208873 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 38209303 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 38209556 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 38209715 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38210002 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 38210085 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38210115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38210393 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 38210481 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38211230 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38211283 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 38211350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38211362 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 38211418 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 38211487 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 38211593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38212159 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 38212365 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 38212368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38212450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38212578 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 38212612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38212677 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 38212690 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 38212857 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38213010 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 38213020 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 38213275 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 38213367 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38213499 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 38213529 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 38213644 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38213697 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 38213717 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 38213959 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 38214165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38214247 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 38214384 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 38214399 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 38214426 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 38214428 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 38214538 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 38214622 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 38214630 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 38214709 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 38214760 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 38214790 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 38214815 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 38214831 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 38214949 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38215054 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 38215055 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 38215057 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 38215211 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 38215267 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 38215445 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 38215643 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 38216114 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 38216211 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 38216267 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 38216590 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 38216698 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 38216913 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 38216917 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 38216948 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 38216959 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 38217372 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 38217855 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 38217919 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 38218039 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 38218363 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 38218730 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 38219924 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 38220144 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 38220154 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 38220185 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 38220226 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 38220331 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 38220535 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 38221127 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 38221199 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38222442 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 38222797 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 38222904 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 38222932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38222959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38222993 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 38223174 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 38223248 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 38223363 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38223667 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 38223895 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 38223919 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 38223947 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 38223987 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 38224004 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 38224066 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 38224184 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 38224308 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 38224395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38224602 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 38224660 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 38225038 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 38225206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38225979 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38226011 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 38226142 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 38226436 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38226462 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 38226467 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 38226893 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38227269 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38227360 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38227407 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 38227681 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38227683 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38227774 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38227796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38227831 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38227852 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 38227853 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 38227867 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38227929 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38227931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38227986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38228115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38228172 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38228798 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38228873 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38229108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38229214 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38229432 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 38229461 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38229514 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 38229634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38229664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38229715 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 38229719 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 38229780 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38229846 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38230130 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38230194 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 38230207 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 38230647 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 38230813 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 38231211 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38231385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38231408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38231448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38231582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38231770 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38231806 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 38231828 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38232311 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 38232368 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 38232385 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38232488 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 38232491 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38233237 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 38233494 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38234016 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38235028 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38235075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38235308 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38235434 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 38235441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38236237 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38236253 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38236283 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 38236327 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 38236518 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38236587 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 38237449 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38237837 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 38237932 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 38237968 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38238269 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38240560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38241060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38241483 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38244268 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 38244396 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38244936 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38246201 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38246532 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 38246708 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38246762 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 38247988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38248609 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38249023 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38251312 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 38254368 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 38254856 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38255202 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 38255848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38255868 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38257284 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 38259855 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38261347 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38261850 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38262722 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 38262847 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 38263380 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 38263999 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38264013 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38267065 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 38267145 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 38267339 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 38267373 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 38268926 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 38270324 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 38272757 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38273589 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38273794 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 38273833 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38273877 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 38273913 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 38273956 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38274005 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 38274083 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 38274267 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 38274610 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 38274649 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 38274808 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 38274938 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 38275002 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 38275051 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 38275347 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 38275379 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 38275510 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 38275560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38275637 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 38275707 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 38275803 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 38275923 T A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 38276447 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 38276554 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 19 38276686 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 38276827 G A N Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 8 8 2 4 2 19 38277111 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 38277297 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38277323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38277351 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 38277550 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 38277551 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 38277620 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 38277670 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 38277714 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38277723 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 38277834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38277869 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 38277986 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 38278029 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 38278114 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 38278210 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 38278409 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 38278471 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38278479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38278671 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 38279137 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 38279217 G A N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 9 11 3 3 4 19 38279361 A G N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 19 38279499 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38279525 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 38279621 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 38279633 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 38279698 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 38279706 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38279806 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 38279904 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38279954 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38280099 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 38280107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38280193 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 38280208 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38280236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38280371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38280381 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38280714 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 38280901 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 38281007 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38281032 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 38281119 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 38281346 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38281348 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 38281352 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 38281386 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38281657 T A N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 19 38281685 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 38283127 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 38283153 C A N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 19 38283446 C G Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 38283540 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 38283566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38283577 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38283592 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 38283593 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 38283596 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 38283732 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 38283873 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38284042 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38284192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38284305 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38284360 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38284458 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 38284744 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38284805 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38285377 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38285481 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38286057 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38286269 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 38286345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38286627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38286786 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38286824 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38287048 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38287093 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38287149 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38287271 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 38287400 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38287717 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38287726 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38287727 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38287768 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 38287787 A T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 38287830 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38287942 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38288181 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 38288279 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38288398 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 38288696 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 38289278 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 38289306 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38289392 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38289547 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38289921 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 38290130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38290148 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38290198 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38290232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38290300 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38290461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38290533 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38290556 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38290575 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38290578 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38290663 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 38290691 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 38290728 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 38290834 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 38290886 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38290950 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38290959 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38290998 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38291026 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38291032 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38291293 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38291379 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38291488 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 38291534 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 38291727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38291760 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 38291886 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38292028 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38292037 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38292060 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38292204 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 38292209 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 38292267 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 38292375 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38292477 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 38292515 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 38292534 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 19 38292535 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38292578 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38292811 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 38292926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38293013 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 38293014 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38293090 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 38293144 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 38293167 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38293340 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 38293444 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 38293452 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 38293471 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 38293517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38293606 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 38293623 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38293653 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38294063 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38294094 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 38294139 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 38294327 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38294362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38294467 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 38294958 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38296417 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 38300700 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38302503 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 38302762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38303444 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38304749 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38304828 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38305085 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38309136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38309799 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 38310312 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38311263 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 38311396 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38313600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38314037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38314125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38314329 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 38314670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38314744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38314933 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 38315370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38316220 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 38316247 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 38316373 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 38316777 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 38316958 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 38317328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38317421 C T N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 19 38317452 G T N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 19 38317495 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38317864 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 38318048 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38318073 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38318217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38318430 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 38318434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38318949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38319261 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 38319461 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38320463 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 38320478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38321081 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 38321106 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 38321458 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38321970 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38322301 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38322493 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38322806 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 38323093 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 38323095 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 38323335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38323478 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 38323901 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 38324152 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 38324154 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 38324652 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 38324839 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 38324922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38324923 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38325007 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 38325141 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38325334 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 38325370 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38325371 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 38325380 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38325397 T C Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 19 38325445 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 38325504 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 38325596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38325682 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 38325697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38325698 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38325882 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 38325895 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 38325959 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 38325975 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 38326110 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 38326124 G T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 38326409 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38326819 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 38326873 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38327158 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 38327452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38328190 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38328230 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38328241 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38329057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38329254 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38329300 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38329356 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38329495 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 38329629 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38329631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38329742 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38329776 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 38329851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38329878 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 38330215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38330245 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38330350 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38330368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38330428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38330713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38331041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38331159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38331177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38331178 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 38331773 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 38331871 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 38332255 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38332506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38332597 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38333801 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 38333901 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 38333974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38334002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38334003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38334059 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 38334230 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38336816 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 38337241 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38337935 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38337989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38338330 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 38341154 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38346232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38346242 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38346670 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 38347327 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38347506 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38348059 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38348197 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38348544 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 38348608 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 38349295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38350151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38351162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38352071 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 38352735 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 38354289 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38355315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38356203 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38357403 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38357649 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38357984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38362931 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38362965 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 38363614 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38364668 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38364670 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38366782 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38367021 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38367705 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 38367881 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 38368364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38368409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38368719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38368982 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38369004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38369015 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38369318 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38369466 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38369488 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38369557 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38371500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38374636 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 38376097 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38376208 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 19 38376646 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 38377289 G C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 19 38377323 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 38377521 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 19 38377743 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 38377934 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 38378057 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 38378072 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 38378095 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 38378172 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 38378381 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38378469 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 38378963 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38379019 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38379032 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38379099 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38379235 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38379423 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38379472 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38379577 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38379615 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 38379749 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38379940 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38379970 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38382267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38384108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38384545 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38385525 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38386700 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 38388270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38390502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38391203 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38391323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38392430 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 38392847 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38392927 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38393046 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 38393784 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 38393800 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 38395094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38395290 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38395825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38396209 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38396994 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38397225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38398198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38398373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38399511 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 38400062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38400904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38401437 G C Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 38401473 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 38401522 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38401541 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 38401656 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 38401663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38401674 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 38401680 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 38401695 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38401745 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38401753 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 38401923 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 38402165 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 38402234 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38402246 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38402321 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 38402332 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 38402334 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 38402431 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 38402504 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 38402559 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 38402738 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 38403115 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38403315 A C N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 19 38403522 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38403723 G C Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 38404078 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 38404181 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 38404184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38405512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38405993 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38407159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38407421 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38407760 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38407897 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38407966 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 38408405 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 38408448 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 38408514 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38408524 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38408909 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 19 38408984 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 38409280 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 19 38409283 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 19 38409919 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 38409928 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 38409939 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 19 38409947 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38409965 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 38410048 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 38410256 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 38410440 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 19 38410458 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 19 38410572 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 38410640 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 38410666 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 38410685 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 38410691 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 38411073 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 38411554 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 38411715 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 38411765 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 38411788 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 38411798 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 38411802 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 38411923 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 38411969 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 38412010 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 38412131 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 38412257 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38412279 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38412280 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 38412585 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 38412600 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 38412621 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 38412980 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 19 38413017 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 19 38413039 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 38413084 G T N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.166666666666667 0.583333333333333 0.25 11 13 2 7 3 19 38413096 C T N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 8 12 1 6 3 19 38413219 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 19 38413230 C T N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 19 38413233 A G N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.153846153846154 0.615384615384615 0.230769230769231 12 14 2 8 3 19 38413318 C T N Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 9 7 1 7 0 19 38413326 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 38413557 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.125 0.6875 0.1875 15 17 2 11 3 19 38413786 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 38413824 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 38414051 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 38414075 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 38414134 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 38414268 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 38414289 G C Y N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.285714285714286 0.642857142857143 0.0714285714285714 17 11 4 9 1 19 38414290 T C Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.214285714285714 0.714285714285714 0.0714285714285714 16 12 3 10 1 19 38414342 T C Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 19 38414419 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 38414452 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 38414454 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 38414536 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 38414586 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 38414643 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 38414664 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 38414672 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 38414682 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 38414934 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38415192 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 38415371 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 38416208 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 38416405 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38420433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38421047 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38421266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38421524 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 38421686 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38421687 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38421796 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 38421883 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 38422058 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38422492 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38422691 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38422759 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 38422896 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38422971 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 38423001 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 38423416 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 19 38424034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38424363 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38424642 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38425838 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38427204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38427377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38427505 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38427762 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 19 38427763 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 19 38428329 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 38428428 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38429205 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 38429209 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 38429998 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38429999 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38430664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38434994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38435454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38436700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38436749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38436900 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38436908 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38437025 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38437534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38439430 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38440002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38440019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38440580 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 38440864 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 38441036 G T Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 38441116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38441236 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 38441561 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 38441882 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 38441981 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 38442344 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 38442742 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38443138 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 38443155 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38443159 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 38443271 G C N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 19 38443516 T C N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 19 38443583 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 19 38443618 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 38444059 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 19 38444141 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 4 20 2 0 10 19 38444161 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 19 38444275 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38444404 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 38444786 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 38444873 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 38445141 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 38445392 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 38445516 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 38445737 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 38445769 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 38445807 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 38445863 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 38445879 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 38445924 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 38446505 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 38446857 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38446988 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 19 38447162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38447195 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 38447255 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 38447359 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 38447369 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 38448356 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38449206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38456693 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38457472 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 38458731 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 38458895 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38459372 T G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 38459455 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 38459557 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38459562 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38459579 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 38459717 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38459770 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38459823 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38460032 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 38460356 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38460415 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38460784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38460801 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38460929 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 38460953 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38460962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38460991 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 38461045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38461217 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 38461358 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38461517 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38461537 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 38461770 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 38462661 T A Y N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 8 12 3 2 5 19 38462767 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 38462793 A G Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 38463149 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 38463205 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 38463241 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 38463271 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 19 38463396 G A Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 19 38463573 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 38463730 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 38464015 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38464665 G A Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 19 38464666 G C Y N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 19 38464672 G T Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 19 38464905 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38465229 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 38466496 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38466775 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 38467222 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38467799 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38468648 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 38471157 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 38471342 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 38471463 A G Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 38471529 G A Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 38471602 G A Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 38473502 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38474269 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 38476661 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 38477481 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38478159 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 38479570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38480244 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38480314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38480322 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 38480333 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 38480405 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38481091 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38481380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38481862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38482412 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38483251 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38483375 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 38484176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38484268 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38484508 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 38484654 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38485021 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38485564 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 38485819 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38485933 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 38485943 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 38485958 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 38486214 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 38486499 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 38486552 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 38486620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38486777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38486796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38486970 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38487096 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 19 38487490 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 38487536 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 38487606 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 38487738 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38487811 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 38487822 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 38487835 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 38487836 T C Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 38487852 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 38487862 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 38487867 T A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 38487905 T A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 19 38488211 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 38488225 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 38488259 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 38488292 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38488368 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 38488390 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 38488425 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 19 38488558 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 38488636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38488639 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 38488795 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 38489754 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 38490306 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38491478 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 38491898 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 38492132 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 38492478 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 38492611 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 38492699 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38492811 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 38493283 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 38493412 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 38493806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38493951 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38493970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38494036 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38494037 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38494431 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38494576 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 38495640 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 38495654 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38496507 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 38496759 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 19 38497007 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 38497139 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38497819 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 38500769 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 38500920 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38501268 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 38501372 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 38501392 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 38501501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38501640 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 38502029 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 38502126 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 38502176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38502196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38502302 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 38502376 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 38502671 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 38503071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38503072 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 38503088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38503200 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 38503250 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 38503463 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 38503469 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38503541 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 38503782 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 38503885 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 19 38503911 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 38504070 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38504362 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 38504457 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 38504484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38504493 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 38504524 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 38504572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38504582 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 38504591 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 38504599 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 38504609 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 38504659 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38504671 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 38504696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38504723 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 38504746 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 38504748 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 38504935 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38505016 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38505025 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38505098 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 38505243 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 19 38505247 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38505503 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 38505707 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 38505749 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 38505753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38505941 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38506069 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 38506090 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 38506161 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38506176 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38506304 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38506347 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 38507062 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38507276 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38507666 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38507751 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38508310 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38508664 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38510130 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 38510131 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 38510132 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 38510215 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 38510241 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 38510276 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 38510279 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 38510463 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 19 38510685 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 38510700 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 38510717 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38510745 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 38510786 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38510866 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 38511028 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38511060 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 38511120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38511397 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38511488 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 38511685 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 38511714 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 38511785 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 38512318 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38512333 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 38512406 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 38512435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38513977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38514392 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38515182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38515217 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38515240 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 19 38515280 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38515539 T G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 38516039 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 38516146 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38516156 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 38516186 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 38516269 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 38516407 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 38516444 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 38516470 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 38516474 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 38516607 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 38516645 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 38516745 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38516835 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38516841 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38516842 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38516871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38516923 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38516943 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38517065 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 38517067 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 38517642 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 38517898 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 38518039 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 19 38518105 G A N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.181818181818182 0.0909090909090909 0.727272727272727 5 17 2 1 8 19 38518391 A G N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 19 38518587 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 38518608 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 19 38518630 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 38518817 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 38520184 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.235294117647059 0.705882352941177 0.0588235294117647 20 14 4 12 1 19 38520300 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 38520354 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 38520561 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 38520633 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 38520677 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 38520703 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 38520731 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 38520744 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38520750 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 38520761 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 38520892 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38520902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38520904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38521138 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 38521205 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 38521215 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 38521556 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 38521572 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 38521575 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 38521588 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38521731 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 38521788 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 38521789 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 38521807 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 38521808 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 38521839 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 38521856 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 38522040 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 38522047 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 38522050 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 19 38522344 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 38522347 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 19 38522387 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38522440 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 38522456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38522477 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 38522634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38522743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38522785 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38523033 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38523501 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38523845 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38523855 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38524057 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38524557 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38524661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38525946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38526813 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 38527143 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38527208 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38527590 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38529113 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38529780 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38530096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38530257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38530269 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38530338 T A Y N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 38530596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38530897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38532934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38533293 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 38533494 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38535350 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38536034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38536992 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 38537168 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 38537222 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 19 38537258 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 38537714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38537831 A T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 19 38537856 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 19 38537932 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 38539315 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 38539326 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 38539973 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 19 38540000 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 38540163 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 19 38540323 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 38540510 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 38540801 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 38540814 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 38540999 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 38541036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38541255 G T N N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 7 11 1 5 3 19 38541271 G A N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 19 38541279 C A N N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 19 38541625 T A N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.333333333333333 0.25 0.416666666666667 11 13 4 3 5 19 38546790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38546796 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 38547314 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38547329 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38547712 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 38547713 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 38548009 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 38548122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38548176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38548227 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38548369 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38548457 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 38548460 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38548467 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 38548510 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38548532 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38548699 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38549271 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38551280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38551328 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 38551335 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 38551750 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 19 38551877 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 38553344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38555811 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38555995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38557008 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38557438 C T N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0 0.615384615384615 0.384615384615385 8 18 0 8 5 19 38557538 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38558492 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 38558514 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 38558553 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 38558554 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 38558660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38558710 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 38558992 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38559118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38559179 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 38559284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38559361 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38559448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38559589 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38559674 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 38559832 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 38560615 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38560735 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 38561135 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 38561145 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 38561208 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 38561469 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 38561550 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 38561689 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 19 38561823 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38562124 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 38562127 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 38563108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38563247 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 38563296 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 19 38563484 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38563554 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 38563592 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 38570169 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38570171 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38571103 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38571113 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38571870 C A N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 19 38572342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38572947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38573151 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38573475 G T Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 38573519 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38575592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38576311 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 19 38577559 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38577754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38577933 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 38577937 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 38578081 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38578164 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38578650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38578924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38578977 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 38579062 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 38579859 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38582339 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38583092 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38583295 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38583357 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 38583704 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38583802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38585137 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38586566 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 38587577 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 38588082 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 38588113 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38588493 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38588544 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38588584 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 38589706 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38589721 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38590048 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38590573 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 38590575 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38590580 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38590908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38591057 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38591184 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 38591431 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38593392 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38593536 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 38593707 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38593947 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38594020 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 38594082 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 38594109 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 38594610 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38595068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38595074 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 38595451 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 38596464 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38596738 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38598610 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38599632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38601191 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 38602408 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 38602925 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 38603261 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 38603432 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38604907 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38605187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38605220 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38605450 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38607295 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38608038 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 38608338 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38608899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38609857 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38609873 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38610177 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 38610233 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38610273 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 38610463 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 38610680 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38611856 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 38611859 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 38612016 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 38612019 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 38612052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38612072 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 38612078 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 38612103 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 38612474 G C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 38612487 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 38612490 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 38612685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38612758 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 38612797 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 38613031 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 19 38613151 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 38613184 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 38613209 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 38613257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38613295 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 38613304 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 38613580 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38613713 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38614075 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 38614098 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 38614247 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 38614254 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 38614363 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 38614569 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38615229 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38615433 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38616304 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 38616886 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 38616903 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 38616907 T C Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 38616917 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 38616922 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 38617088 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 19 38617780 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38617840 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 38617848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38618025 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38618635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38619057 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38621261 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 38621655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38623363 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38624169 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 38624485 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 38624645 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38625001 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 38625158 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 38625397 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 38625398 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38625436 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38625463 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 38625512 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 38625537 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 38625540 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38625546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38625616 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 38625685 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 38625785 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 38625815 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38625895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38625958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38626007 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 38626104 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 38626111 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 38626180 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 38626234 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38626258 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38626259 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38626718 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38626725 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38626890 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38626893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38626913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38627275 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38627286 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38627308 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 38627818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38627828 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38627853 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38627904 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38627915 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38627954 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38627957 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38628016 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 38628045 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38628104 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38628559 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 38628685 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 38629047 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 38629126 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38629343 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38629430 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 38629583 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38630299 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 38630770 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 38631086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38631321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38631720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38631894 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38632405 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 38632445 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38632467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38632796 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38632868 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38632872 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38632906 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38633605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38633763 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 38633771 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 38633791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38634245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38634509 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38634605 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 38634610 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 38634713 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 38634911 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 38634923 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 38635072 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38635193 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 38635210 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 38635212 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 38635385 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 38635408 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 38635452 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 38635475 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 38635479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38635493 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 38635551 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 38635802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38636284 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 38636835 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 38636846 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38638696 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 38638721 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 38638844 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 38638848 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 38639029 T A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 38639208 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 38639211 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 38639235 C G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 38639252 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 38639253 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 38639330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38639376 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 38639399 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 38639404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38639565 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38639672 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 19 38639705 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 38639850 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 38640346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38640435 T C Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 38640445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38640484 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 38640485 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 38640513 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 38640612 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 38640655 C A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 38640964 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 38641264 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 38641306 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38641404 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 19 38641584 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 38641616 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 38641618 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 19 38641622 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 38641636 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 38641695 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 38641961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38642034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38642135 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38642414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38642852 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38648031 C G Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 38648709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38648879 A C Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 38648977 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38650864 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38651198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38651370 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38651391 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38651403 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38651487 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 38651488 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 38651619 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38651924 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 38652629 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 38652668 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 38652714 C T N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 19 38652831 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38652984 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 38653195 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38653252 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 38653270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38653378 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 38653687 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 38653812 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38654775 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 38655084 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38655125 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 38655167 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 38655176 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 38655321 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 38655664 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38655704 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 38655857 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38657276 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38657383 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 38657441 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 38657453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38657756 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 38658426 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38658485 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38658658 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 38658691 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 38658738 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 38658750 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 38658809 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 38658812 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 38658820 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38658890 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 38658913 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38658947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38659014 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 38659287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38659319 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38659695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38659743 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38660019 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 38660072 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 38660139 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 38660148 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 38660239 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 38660322 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 38660430 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38660568 A C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 19 38660606 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38660767 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38660839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38660911 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 38661101 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 38661178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38661224 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38661297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38661306 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38661318 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38661396 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38661438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38661568 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 38661796 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38661828 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38661872 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38661876 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38661880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38662081 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38663109 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38663610 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38663742 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38663947 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38663953 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38664209 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38664284 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38664613 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 38665107 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38665529 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38665616 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 38665956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38666138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38666315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38666939 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38666940 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38666960 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38668252 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 38668518 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38668638 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38669650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38669916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38670520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38670663 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38670683 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38670740 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38670815 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38671006 A T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38671010 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38671349 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38671365 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 38671463 T A Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 38671473 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 38671496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38672293 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38672570 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38673942 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38674627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38675178 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 38675228 G A Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 38675272 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 38675405 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38675730 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38675731 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38676137 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38676259 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38676527 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 38676894 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 38677426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38677563 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38677692 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38678164 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38678230 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 38678347 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38678439 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38678753 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 38678788 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 38679099 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 38679129 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 38679171 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 38679532 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0 0.789473684210526 0.210526315789474 15 23 0 15 4 19 38679588 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 38679771 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 38680114 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38680394 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 38680521 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38680601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38680607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38681145 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38681267 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38681668 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38681859 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38681897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38682008 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 38682238 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38682569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38682941 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38682952 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38682994 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38683007 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38683008 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 38683059 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38683228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38683271 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38683358 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 38683400 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38683414 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 38683419 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38683420 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38683439 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38683441 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38685394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38685621 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 38685633 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 38685657 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 38685710 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38685810 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38685845 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38686090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38686166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38686216 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38686307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38686625 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38686671 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38686716 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38686773 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38686796 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38687384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38687487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38687583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38687711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38687853 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38687921 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38688206 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38689704 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 38690461 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38690557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38693084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38695468 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38695612 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38696137 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38697014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38697662 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38698032 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38698316 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38698396 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 38698427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38699053 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 38699054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38699247 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 38699318 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 38699322 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38699858 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38700073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38702971 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38704940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38705189 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38705467 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38706072 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38706725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38707292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38707299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38707332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38708416 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38708976 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38710030 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38710553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38712524 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38712584 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 38712655 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38712946 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38712984 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 38713054 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38714740 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38717106 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38719772 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 38720305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38720492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38721814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38721948 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 38722660 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 38722884 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38723037 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38723366 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38723451 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 38723612 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 38723662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38723686 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38723693 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38723834 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38724077 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38724384 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38724486 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 38724747 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38724868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38724874 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38725099 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38725275 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38725545 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38725732 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38725807 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38725855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38725977 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 38726101 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38726564 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 38726721 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 38726770 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 38726805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38726842 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 38726907 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 38726922 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 38726961 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 38726963 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 38727427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38727505 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38727972 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38728049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38728127 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 38728244 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38728286 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38728403 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 38728661 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38729056 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 38729066 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38729595 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38729695 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38729738 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38729746 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38730536 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38730816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38730880 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38731737 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38732331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38732411 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38732681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38735067 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38735273 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 38735450 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38735895 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 38735923 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 38736366 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38736369 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38736575 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 38736613 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38737515 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 38737564 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 38737693 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38737918 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38737974 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 38737978 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38738088 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 38738266 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38738274 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38738798 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38739006 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38739418 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38739631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38740180 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38740222 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38741876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38742417 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38747055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38747109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38747408 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38747452 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38747644 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38747820 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 38748255 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38748942 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38748986 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38749017 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 38749048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38749085 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38749173 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38749199 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38749242 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38749263 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38749372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38749388 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38749433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38749437 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38749496 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38749511 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38749528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38749635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38749636 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38749722 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38749965 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38749975 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38749982 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38750036 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38750090 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38750224 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38750301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38750314 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38750333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38750490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38750605 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38750637 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38750640 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38750665 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 38750693 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38750802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38750849 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38751034 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38751053 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38751405 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38751560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38751943 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38751959 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38752051 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 38752292 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38752351 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38752766 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38754016 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38754083 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38754361 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38754650 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38754715 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38754809 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38757870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38758460 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 38758476 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38758563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38758607 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38758641 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38758682 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38758708 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38758714 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38758741 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38758753 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38759021 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38759138 C A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38759213 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38759327 C G Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 38759408 A T Y N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 19 38759423 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 19 38760411 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38760546 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38760699 G C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38761107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38761247 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38761263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38761535 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38761968 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38761996 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38762056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38762168 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 38762334 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38762435 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 38762702 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38763521 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38763612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38764904 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 38765083 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 38765090 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 38765242 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38765531 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 38766056 C A Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 38766062 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 38766216 T A Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 38766240 T A Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 38766406 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 38766550 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 38766575 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38767254 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 38767272 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 38767316 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38767665 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 38767666 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 38767702 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 38767757 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38768187 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 38768353 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 38768663 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38768688 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 38768772 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 38768925 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 38769154 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38769176 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38769390 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 38769408 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 38769545 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38771068 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 38771229 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38771245 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38771260 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38771509 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 38772593 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38772644 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38772787 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 38773318 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38773325 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38773543 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 38773552 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 38773699 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38773795 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 38773823 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 38773904 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 38773976 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 38774567 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38774650 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 38774665 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 38774692 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 38774740 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 38774891 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 38774985 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38774989 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 38775041 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 38775200 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 38775275 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38775669 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 38776358 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 38776868 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38776959 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 38777025 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 38777146 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 38777806 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 38777809 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 38778922 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38779342 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 38779546 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 38779948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38780103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38780493 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 38780500 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38780683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38781104 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38781459 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 38781529 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38781681 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 38781780 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 38782175 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38782365 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 38782389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38782449 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38783848 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38785551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38785567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38786514 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 38787055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38787309 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 19 38787369 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 19 38787852 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38790256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38790515 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38790534 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 38790641 C G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 38790662 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38790707 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38790900 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38791022 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38791384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38791735 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38791740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38791743 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38791747 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38791758 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38791941 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38792721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38792737 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38793140 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38794645 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38794799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38795851 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38795956 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38797228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38797530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38797709 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38797994 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38798602 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38800824 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 38801053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38801156 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38802157 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 38802167 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 38802292 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 38802304 G T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38802383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38802395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38802766 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38803726 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 38803892 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 38805315 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38805512 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 38805641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38805796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38805983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38806031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38806148 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 38806383 A G N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 19 38806430 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 38806478 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 38806504 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 38806559 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 38806668 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 38806683 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 38806834 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 38806858 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 38806923 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 38806939 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 38806947 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 38807081 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 38807261 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 38807299 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 38807348 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 38807399 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 38807414 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 38807415 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 38807417 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 38807443 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 38807500 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 38807611 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 38807650 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 38807694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38807782 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38807860 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 38808107 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 38808110 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 38808138 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 38808182 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 38808213 G C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 38808220 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 38808224 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 38808290 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 38808420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38808604 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 38808689 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 38808967 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38810013 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 38810568 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38811562 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 38812648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38813383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38813689 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38813997 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 38814334 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38814792 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 38815205 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38815206 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38815267 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 38815279 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 38815284 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 38815296 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 38815297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38815309 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 38815365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38815444 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38815706 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 38815717 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38815726 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38815751 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 38815775 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38815844 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38815887 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 38816140 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 38816296 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38816388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38816413 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 38816434 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38816674 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 19 38816675 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 38816837 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38817918 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 38818016 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38818496 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 38818792 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38818897 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 38818950 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 38819050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38819206 T G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 19 38819309 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 38819333 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38819834 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38819868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38819968 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 38820282 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 38820363 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 38820592 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 19 38820722 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 19 38820747 G A N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 19 38821226 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 38821428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38821698 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38821725 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38821775 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 19 38822185 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 38822189 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 38822350 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38822351 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38822473 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38822611 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 38822684 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38822956 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 38823121 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 38823502 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38823630 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38823914 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 38824415 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38825316 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38827511 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 38827761 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 38828025 G C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 38829448 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 38829630 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 38829829 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 38830220 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 38830273 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 38830293 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 38832627 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38832787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38834173 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38834266 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 38835435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38836633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38836800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38836912 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38837213 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 38837675 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 38837736 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38837952 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38838046 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38838230 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38839141 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 38839601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38840085 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38840716 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38842911 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38843245 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 38844575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38845407 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38847996 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 38851041 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 38852050 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38852212 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 38853371 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38853825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38854032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38854043 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 38854092 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38854202 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 38854378 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38854518 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 38854526 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 38854574 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 38855206 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 38856919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38856969 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 38856987 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 38858107 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38858146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38858499 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38858657 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38858731 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38858825 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38858841 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38858848 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 38858849 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38858866 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38858906 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38859103 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38859776 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 38862021 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 19 38862029 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 19 38862088 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38862153 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 19 38862318 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38862335 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 38862533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38862775 G C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 38862800 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 38863120 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 38863309 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38863343 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 38863362 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 38863430 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 38863437 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 38864247 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 38866409 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38868272 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38868288 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 38868294 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 38868304 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 38868424 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38869235 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38871070 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 38871094 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 38871105 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 38871770 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38872206 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38872207 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 38872931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38873088 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 38873101 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 38873269 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 38873824 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 38876129 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38877477 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38877482 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38879165 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38879183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38879531 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 38879532 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 38880137 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38882160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38885777 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 38885914 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38887101 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38888397 A T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 38888741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38889407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38889494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38889547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38889570 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 38889595 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 38889708 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38889721 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 38891244 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38891512 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 38891616 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38891682 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 38891863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38891955 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38892678 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 38892987 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38893196 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38893823 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38893956 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 38893999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38894104 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38894393 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 38895382 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38895453 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 38895485 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38895498 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38895602 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38895603 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38895609 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38895705 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38895710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38895740 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38895886 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 38895905 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38895968 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 38896301 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 38896371 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38896484 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 38896485 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38896491 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 38896560 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 38896592 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38896682 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 19 38896786 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38896821 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 38896990 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 38897106 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 19 38897156 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 38897174 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 38897284 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38897448 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 38897479 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 38898034 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38898139 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38898269 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 38898328 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38898351 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 38898678 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 38898937 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 38898940 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 38899051 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38899418 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 38899540 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 38899599 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 38899681 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38899987 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 38900250 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 38900509 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38900540 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 38900567 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 38900597 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38900681 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 38900762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38900774 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38901042 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 38901071 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 38901134 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38901312 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38901327 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 38901497 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 19 38901642 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 38901646 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 38901666 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 38901883 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38902021 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38902030 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 38902050 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38902115 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38902331 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 38902526 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 38902602 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 38902609 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38902629 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 38903302 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38903314 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38903341 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38903976 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 19 38904307 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38905246 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38905300 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38905904 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38906380 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 38909865 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 38910192 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38910457 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38911838 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 38913585 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 38913697 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38913715 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38913894 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 38914563 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38914589 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38915292 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 19 38915389 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38915410 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38915447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38917957 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38918021 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38918034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38918224 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38918416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38919287 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38919763 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38919915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38920043 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38920051 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38920175 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 38920180 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38920211 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38920235 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38920300 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38920390 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38920448 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 38920633 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38920637 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38920648 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38920776 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38920864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38920915 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38921118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38921321 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38921407 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38921702 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 38921862 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38921887 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38922601 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38922602 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38923121 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38923156 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 38923484 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38923554 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 38923628 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 38923714 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 38923717 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 19 38923859 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38923912 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38924042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38924047 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38924167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38924272 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38924273 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 38924312 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38924432 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38924533 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38924570 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38924596 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 38924687 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 38924701 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 38924745 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 38924896 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 38925351 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 38925530 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38926341 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 38927720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38927820 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38928136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38928161 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38928201 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38928252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38928339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38928453 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38928507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38928518 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 38928524 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 38929405 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 38929500 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 38929996 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38930100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38930257 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38931203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38931621 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38931893 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38931990 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38932317 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38933921 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38934202 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38934496 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38934868 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 38935204 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38935426 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 38936241 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38936278 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 38936622 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38936648 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 38936730 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 38936782 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 38936824 T A N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 19 38937309 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38937401 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38937402 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38937410 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38937771 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 38938447 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 38939552 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 38939556 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38939614 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 38939784 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38939796 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 38939880 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38939921 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38939949 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 38940472 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 38940776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38940847 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38941001 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 38941004 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 38941466 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38941491 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 19 38942220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38942552 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38942953 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38943097 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 38943196 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38943213 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38943558 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 38943597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38943756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38943778 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 38943792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38943891 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38943912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38944120 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 19 38949525 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 38949529 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38949563 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 38949954 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 38950002 C G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 19 38950032 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 38950263 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38950405 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38950674 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 38950847 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 38951034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38951395 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38951441 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38951480 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38951515 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38951520 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38951591 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38951875 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38951961 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 38954535 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38954740 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38954871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38954906 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38954950 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38955432 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38955575 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38955636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38955649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38955846 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38955928 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38955960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38956035 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38956229 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 38956386 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 38957067 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 38957083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38957405 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38957592 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38957649 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38957893 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38958257 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 38958301 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 38958423 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 19 38958649 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 38958908 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 38958957 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 38960005 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38960118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38961108 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38961109 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38961384 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38961438 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 38961439 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 38961613 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38962115 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 38962174 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 38962379 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 38962638 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 38962776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38962866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38962998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38963068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38963413 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38963423 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38963506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38963529 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38963544 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38963559 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38963708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38963944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38963966 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38964071 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 38964176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38964398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38964439 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38964517 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38964891 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38965039 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38965178 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 38965695 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38966036 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38966129 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38966145 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 38966264 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 38966352 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 38966736 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38966894 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38967054 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38967064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38967079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38967257 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 38967481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38967839 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38967860 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38968110 C T Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 19 38968535 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 38968881 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 38968904 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38969121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38969152 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38969497 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 38969615 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38969625 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 38969820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38969840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38970042 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 38970172 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 19 38970181 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38970196 G A Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 19 38970207 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 38970412 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 38970840 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 38971283 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 38971488 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 38971533 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 38971585 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 38971896 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38971913 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38972203 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38972867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38973574 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38973883 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38973905 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38974031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38974940 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38975312 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 38976110 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 38976714 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 38978665 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 38979823 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 38982070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38983235 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38983368 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 38983707 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 38983723 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 38984570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38984575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38985954 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 38988445 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 38988918 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 19 38989097 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 38989118 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 38989830 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38989924 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 38989951 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38990560 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 38991645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38991661 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38991879 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38992990 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 38995157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38995269 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38995969 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 38996376 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38996717 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 38996865 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38996921 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 38996966 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38997092 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38997156 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 38997224 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38997620 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38997915 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38998174 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 38998217 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 38998261 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 38998291 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38998317 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 38998379 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 38998391 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 38998398 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 38998579 C G N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 19 38998603 C T N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 19 38998604 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 19 38998616 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 38998620 G T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 38998629 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 38998633 G A Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 38998642 G A Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 38999657 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 38999724 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 38999754 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 38999896 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 38999936 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 39000571 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 39000590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39000605 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39000618 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 39000652 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 39000666 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 39000809 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 39000925 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 39000954 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 39000965 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 39001086 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 39001087 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 39001218 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 39001247 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 39001258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39001263 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 39001317 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 39001433 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 39001961 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 39002109 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 39002110 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 39002249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39003159 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 39003162 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 39003184 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 39003742 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 39004407 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 39004829 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 39005474 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39005762 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39007490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39007672 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39007960 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39009678 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39010571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39012760 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 39015845 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 39016041 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39016723 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39017384 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39018003 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39018243 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39019358 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39019541 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39019573 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39021106 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 39021611 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 39021815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39021915 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39021925 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39022506 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39022955 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39023472 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 19 39023646 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39025219 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39026937 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39027915 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 39028324 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39028799 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39029022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39029339 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39029382 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39029394 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39029766 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 39029767 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 39029979 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 39030035 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 39030108 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39030740 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 39030837 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 39031312 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 39032888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39033354 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 39033493 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39034412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39034980 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39036208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39037154 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39037322 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39037561 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39037665 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39037866 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 39040957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39041393 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 39041643 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39042537 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 39043557 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39045024 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 39045239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39045605 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39045670 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39045945 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39046400 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39046966 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39047230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39047289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39047361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39047488 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39047502 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39047566 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 39047877 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 39047878 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 39047890 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 39048743 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39048960 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39049152 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 39049216 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 39049462 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39049642 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 39049667 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 39049835 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 39049914 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39050174 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 39050289 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 39050314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39050858 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 39050885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39051218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39053888 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39053898 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39055017 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 39055659 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 39055811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39055836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39055883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39056521 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39056899 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 39056930 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 39057457 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 39057493 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 39058037 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39058135 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39059097 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39059187 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 39059852 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 39059888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39059988 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 39060136 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 39061390 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 39061851 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39062048 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 39062158 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39062355 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39062356 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 39062363 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 39062373 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 39062476 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 19 39062488 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 19 39062504 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 19 39062534 C A N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 19 39062540 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 19 39062545 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 19 39062626 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 39062636 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 39062695 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 39062700 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 39063066 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 39063115 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 39063214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39063373 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 39063388 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 39063389 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 39063524 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 39063570 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39063615 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 39063622 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 39063633 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 39063792 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39063793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39063826 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39063844 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 39063962 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 39063976 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 39064021 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 39064173 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 39064236 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 39064479 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 39064507 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39064549 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 39064567 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 39064646 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 39064744 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39064777 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39066143 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 39066163 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 39066309 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39067539 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39067742 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 39067880 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 39067930 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39068093 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39068386 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39068618 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39068667 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39068700 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 39068729 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39068741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39068938 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39069220 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 39069577 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 39069716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39070259 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 39070525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39071274 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 39071444 A C N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 19 39071542 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 39071582 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 39071615 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 39071696 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 39071700 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 39071964 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 39072210 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 39072248 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 39072249 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39072261 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 39072269 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 39072307 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 39072311 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 39072340 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 39072347 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 39072369 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 39072503 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 39072527 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 39072572 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 39072603 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 39072667 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 39072685 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 39072719 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 39072721 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 39072887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39072897 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 39072910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39073026 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 39073039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39073068 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 39073275 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 39073325 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 39073780 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 39073878 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 19 39073970 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 39074481 G C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 39074618 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 19 39074656 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 39074835 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 39074858 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 39074979 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 39074980 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 39075006 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 39075318 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 39075373 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 39075441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39075464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39075488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39075511 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39075735 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 39075830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39075869 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39075994 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 39076004 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 39076005 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 39076218 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 39076577 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 39076725 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39077044 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 39077071 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 39077080 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39077103 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39077121 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39077312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39077374 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39077397 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 39077457 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 39077502 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 39077626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39077629 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 39077790 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 39077917 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 39077940 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 39077994 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 39078590 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 39078731 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 39078751 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 39078864 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 39078880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39079307 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 39079580 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 39079583 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 39079801 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39080339 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 39080359 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 39080486 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39080653 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39081382 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 39081568 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 39081641 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 39081791 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 39081824 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 39081926 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 39081989 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 39082109 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 39082210 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 39082867 C G N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 19 39083188 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 39083259 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39083562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39083706 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 39084104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39084138 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 39084248 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 39084457 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 39084578 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 39084680 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39086069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39086095 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39086787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39087923 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 39088768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39089416 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39090029 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 39090067 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39090437 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 39090495 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 39090669 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39090733 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 39091060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39091075 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 39091077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39091080 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39091086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39091420 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39091697 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 39091765 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 19 39091949 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 19 39092166 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 39092178 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 39092369 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 39092390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39092449 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 39092518 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39092623 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 39092819 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 19 39092879 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 39093114 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39093116 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39093709 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39093944 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 39094230 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 39094548 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39095791 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 39096267 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 39096374 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 39096412 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 39096694 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 39097207 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 39097318 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 19 39097456 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 39098456 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39098735 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 39098891 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 39098998 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39103757 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39104995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39105979 A T N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 19 39106059 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 39106630 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 39106988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39107642 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 39108209 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39109866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39110029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39114479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39114581 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39131318 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 39141434 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39146575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39146766 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39150108 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39150555 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 39151464 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 39152207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39154788 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39155371 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39155474 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39155730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39155744 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39157377 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 39159088 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39162754 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39162929 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 39163286 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39165816 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39166120 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 39168097 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39168411 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39169219 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 39174394 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 39175491 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39176251 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39178456 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39179436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39179797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39181112 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39183950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39188903 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 39190483 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39196952 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39198075 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39205180 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39210354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39210601 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39213132 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 39213729 C A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 39214369 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39214775 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39215307 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 39216145 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39216718 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39219865 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 39220050 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39230919 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39231115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39233835 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39238202 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39238295 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39238842 A C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 39239709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39240199 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39241108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39241368 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39242087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39248197 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39249227 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39249333 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39250675 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39250882 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39252069 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39254733 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39255366 A C Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 39257723 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39258498 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39259432 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39259730 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39260057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39260177 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39261611 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 39262282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39262381 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39264171 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39265798 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39265963 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39266573 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39269783 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 39274826 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 39274827 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 39275087 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39277002 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 39277568 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 39277624 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39278451 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39279803 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39280011 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39281624 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39282883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39283126 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39283561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39283660 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39283810 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39284656 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39284915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39285243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39285379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39286071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39288518 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 39288824 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39290634 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39290848 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39291876 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39293645 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39293864 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39294671 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39295463 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 39295830 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39296028 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39296182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39296456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39296487 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39297941 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39298301 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39300323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39300741 C G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 39301200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39301472 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 39302233 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 39303179 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 39304558 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39304732 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 39306878 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39307067 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39308471 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39308721 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 39311626 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 39312822 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39314334 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39316181 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39316735 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39324474 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 39327376 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39329125 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39345630 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39345768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39345985 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39345995 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39346001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39346024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39346179 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39346513 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 39346707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39347101 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39347178 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39347247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39347353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39347470 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 39347602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39347684 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 39347859 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39347883 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39348235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39348428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39348523 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39348731 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 39349027 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 19 39349298 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39349427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39349466 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 39349748 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 39349783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39349925 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39350400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39350942 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39350978 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 39352641 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39353005 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 39353155 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39353342 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 39354278 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39354290 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39354507 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39355193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39355816 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39355911 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39356272 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 39356295 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 39356709 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39356802 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39357111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39357224 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 39357288 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 39357938 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39358183 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39358277 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39358398 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 39358625 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 39359501 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 39359884 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39360048 C G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 39360421 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39360517 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 39360964 T G N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 19 39361361 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 39361889 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 39362035 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 39362176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39362238 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39363015 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39363123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39363821 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 39363929 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 39363953 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 39364037 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 39364103 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 39364370 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 39364461 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 39364511 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 39364691 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 39364718 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 39364768 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 39364829 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 39364883 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 39364956 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 39365032 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 39365284 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 39365296 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 39365368 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 39365749 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 39365847 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 39366012 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 39366131 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 39366292 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 39366302 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 39366311 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 39366618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39366693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39366929 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39368589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39368953 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 39369197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39369638 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39371736 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39372801 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39373568 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 39373796 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39376103 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39377490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39378996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39381731 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 39382569 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39382883 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39383422 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39385181 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39388404 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39388636 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 39389698 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39391270 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39391681 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39392777 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 39393505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39397325 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39400419 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39401230 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39402294 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39402591 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39402876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39403241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39404517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39411117 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39411901 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 39414000 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 39414902 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 39415915 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39417550 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39417708 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39419038 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 39419676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39420521 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 39420675 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 39421807 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39421808 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39425989 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 39432482 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39432936 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39432949 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39434420 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 39435935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39436404 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39436524 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 39437711 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39440109 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39440542 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39441167 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 39441324 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39441467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39443393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39444477 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39447669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39448190 C T Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 19 39448525 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39448892 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39451662 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 39451683 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 39453955 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 39454309 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39454590 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 39454823 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 39454830 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39455116 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39455371 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 39455422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39463202 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39463204 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39463240 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 39464594 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39464638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39465040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39465394 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39465462 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39466277 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39466406 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39473843 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39477607 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39478105 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39478321 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 39479683 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39480550 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 39482126 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39484503 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 39484909 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39485509 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 39485698 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 39486070 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39494717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39503001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39503270 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 39504299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39505814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39508000 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 39508014 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 39508894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39509212 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 39512003 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39512061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39512563 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 39512568 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 39513031 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39514514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39514684 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39514855 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39516825 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39517180 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39517915 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39518367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39519283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39521351 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39523702 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39524749 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 39525046 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39529120 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39530959 G A Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 39534170 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 39535032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39536303 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39538456 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39545589 C G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 39546238 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 39546398 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39546824 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39547296 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39547839 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39547943 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39548363 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 39549118 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39550006 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 39551354 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 39551602 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39553121 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39556661 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39557475 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39558023 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39558048 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39559091 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39559365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39559498 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39560239 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39560583 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 39560786 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39563620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39564252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39565041 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39569826 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 39573071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39574797 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39579308 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39583301 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39589512 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39601286 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 39603736 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39606748 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39626403 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39635206 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 39641433 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39644959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39652080 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39655207 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39659447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39668705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39686048 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39690934 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 39692142 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39705078 T A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 39706877 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 39706958 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39707118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39723184 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39741370 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 39746076 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39751020 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39774657 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 39797042 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 39804425 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39817751 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 39826181 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 39875781 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39890698 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 39909278 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 39937967 C G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 39941344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39943853 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 39944350 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 39944698 A C Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 39950431 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39953719 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39954572 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 39954735 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 39955970 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 39956872 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39959902 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39960475 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 39960629 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39961860 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39965858 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39979210 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39981827 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 39982455 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 39983735 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39991734 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39992190 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 39992737 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39993048 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 39996057 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40000333 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40002507 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 40004741 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 40004909 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40005137 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40007108 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40007420 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 40009016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40010264 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40012596 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40023397 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 40028071 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 40030552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40030575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40032106 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 40034321 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40034780 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 40047306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40049075 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 40050080 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40050620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40054709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40059071 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 40064934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40070121 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40071947 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 19 40088494 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40090644 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 40101985 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 40110989 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40114509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40114637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40114904 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 40115440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40115466 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40115515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40119736 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40120028 A T Y N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 19 40121145 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40121802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40124324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40125744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40125973 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40126416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40126926 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40127557 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40128433 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40128698 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 40130450 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40132507 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40132586 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40134468 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40138731 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40138936 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40140007 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40143853 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40147291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40147577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40150176 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40150674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40155701 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40158043 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 40158464 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40160114 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40160124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40162292 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40162921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40163141 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 40163580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40163646 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40163662 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40164435 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40165296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40165769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40165825 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40166607 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40166638 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40169960 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40171210 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40171978 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 40172063 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40172336 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 40172514 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40172805 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40173377 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40174305 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40174959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40174975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40175439 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40176005 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 40177244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40177611 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40177992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40178066 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40178548 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40178831 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40179025 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40179045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40184911 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40185345 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40185690 A T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 40185717 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 40185803 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 40186113 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40186509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40186965 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40187054 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 40187813 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 40187973 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 19 40189573 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40191941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40194055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40197137 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40197361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40199979 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 40205394 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 40215079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40216852 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40218506 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 40218691 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 19 40228359 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 40229753 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 40231427 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40231843 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40231852 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40232004 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40237343 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40238783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40239124 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40240321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40242547 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40248927 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 40249396 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40249789 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40250349 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40251773 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40252266 C G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 19 40252411 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40252715 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40252766 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 40253902 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 40253904 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 19 40253923 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 40254386 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40254717 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40254799 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 40254819 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40255438 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40256161 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40256256 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40256396 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40257161 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 40257710 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 40258162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40258560 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40259765 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 40259981 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40259985 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40260170 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40260375 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40260641 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 40260989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40261074 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 40261351 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 40261798 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 40261904 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 40261914 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40261977 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40262345 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 40263111 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40263138 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40263226 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40263227 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40264907 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 40265112 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 40266301 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40268119 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 40268123 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 40268247 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 40268419 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 40268498 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40268724 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 40269540 A G Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 40269779 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40269991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40270564 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 40270577 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 40271039 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 40271116 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40271342 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 40271346 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 40271393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40271796 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40272650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40273307 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 40273657 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40273680 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40273900 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40274198 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40274262 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40274284 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40274339 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40274433 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 40274454 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 40274699 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40274707 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 40274871 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 40274937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40274987 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40275121 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 40275123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40275191 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40275279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40275473 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40275904 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40276157 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40276339 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40276487 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 40276496 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40276626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40276906 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40277340 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40277420 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40277776 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40277777 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 40277953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40277983 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40278043 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 40278047 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 40278054 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 40278146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40278149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40278172 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 40278207 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 40278291 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 40278304 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 40278307 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 40278309 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 40278451 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40278471 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 40278549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40278551 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 40278648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40278787 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 40279015 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 40279878 A G N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 19 40279928 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 19 40279938 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 40279972 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40279991 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 40280001 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 40280029 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 40280065 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 40280066 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40280110 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 40280285 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 40280397 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 40280426 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 40280452 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 40280458 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 40280460 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 40280519 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 40280522 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 40280543 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 40280544 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 40280594 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 40280595 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 40280706 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 40280707 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 40281016 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 40281117 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 40281134 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 40281153 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 40281157 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 40281168 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 40281171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40281172 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40281216 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 40281253 T G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 40281289 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 40281495 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40281496 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 40281518 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 40281577 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 40281596 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 40281597 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 40281614 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 40281645 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 40281898 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 40282042 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 40282073 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 40282093 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 40282105 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 40282119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40282160 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 40282177 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40282808 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40284740 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 40284989 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 40285125 A G Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 40285131 A G Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 19 40285135 T G Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 19 40285140 G T Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 19 40285149 A G N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 19 40285152 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 19 40285293 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40285402 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 40285667 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 40285729 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 40286077 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40286083 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40286282 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 40286321 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 19 40286379 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 8 10 2 4 3 19 40286397 A C N N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 19 40286542 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 40286612 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 40286639 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40286704 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40288093 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 40288156 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40288224 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 40288278 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 40288328 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40288349 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40288365 A T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 40288475 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40288860 T G Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 40288862 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 40288866 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 40288929 C G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 19 40289006 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40289013 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 40289075 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 40290547 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 40290793 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 40291402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40291648 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 40291944 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40291966 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40292064 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 40292153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40292176 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 40292219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40292221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40292407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40292572 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40292697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40292816 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40292941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40292945 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40293613 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40293684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40293724 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 40293882 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 40294259 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 40294378 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 40294410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40294713 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 40294744 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 40294858 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40295259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40295295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40295842 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40295977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40296439 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 40296448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40297272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40297317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40297332 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40297448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40297493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40297829 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40297971 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 19 40298274 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 40298485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40298550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40300382 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 40300494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40302071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40302193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40303802 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40303818 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40304078 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 40304235 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40304507 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 40304510 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 40304513 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 40304526 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 19 40304528 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 40304594 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 40304669 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40304690 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 40304697 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 40304765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40304856 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 40304913 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 40305223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40305314 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 40305378 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 40305416 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40305529 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 40305597 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40305675 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40306292 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40307317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40307484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40307682 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 40308188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40308245 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 40308258 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 40308292 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40308347 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40308348 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40308354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40308366 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40308427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40308589 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40308592 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 40308617 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 40308933 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 40308955 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40308975 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 40309071 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 40309579 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 40310203 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 40310375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40310465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40310473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40310499 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 40310515 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40310708 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40310725 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40310805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40310809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40310868 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40310895 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 40310903 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40310926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40310961 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40311075 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40311079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40311163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40311341 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40311404 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 40311478 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40311479 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 40311536 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40311549 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40311614 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40311655 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 40311711 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 40311763 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 40311783 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 40312473 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 40312499 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 19 40312724 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 40312761 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40312812 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 40312819 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 40313038 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40313078 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 40313104 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 19 40313129 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 40313205 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40313209 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 40313435 T C N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 19 40313498 T C N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 19 40313512 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 40313549 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 19 40313563 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 19 40313662 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 19 40313664 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 40313713 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40313747 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 40313940 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 19 40313945 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 40314304 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 40314501 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 40314544 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40314810 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40315053 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40315088 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 40315451 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40315493 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 40315782 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40316281 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40316332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40316381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40316392 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 40316435 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 40316453 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 40316507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40316612 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 40316911 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 40316931 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 40316936 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 40316948 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 40317028 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 40317087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40317321 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40317331 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 40317412 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 40317539 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 40317540 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 40317545 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 40317594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40317618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40317742 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 40317886 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40318209 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 40318567 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 40318571 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 40318631 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40318757 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 19 40318848 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 19 40318869 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 9 5 3 3 1 19 40318906 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 40318930 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 19 40318953 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 40319085 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 40319332 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 40320059 T G N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 40320060 C T N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 40320303 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 19 40320677 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 19 40320702 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 19 40320716 C A N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 19 40320732 C A N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 19 40320746 G A N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 19 40320752 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 19 40320828 C T N Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 5 5 2 1 2 19 40320960 C G N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 19 40320965 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 19 40320975 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 40321203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40321326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40321619 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 40321622 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 40322068 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 40323509 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 40323575 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 40323576 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 40323756 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 40325065 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40325685 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40325853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40326090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40326318 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40326390 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40326601 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 40327797 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 40328203 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40328371 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40328372 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40328411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40328491 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 40329568 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 40331659 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 40334509 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40334806 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 40335247 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 40336075 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 40336191 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 40336224 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40336296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40336297 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40336408 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 40336473 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 40336480 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 40336531 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 40337903 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40339018 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40339384 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 40339717 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 40339763 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 40339770 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 40339784 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 40339817 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 40339858 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 40339923 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 40340190 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 40340207 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 40340365 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 40340371 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 40340522 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 40340560 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 40340609 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 40340615 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 40340630 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 40340721 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 40340954 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 40340981 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 40341169 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 40341331 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 40341418 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 19 40341730 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 40342209 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 40342352 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 40342506 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 40342573 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40342670 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 40342731 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40343012 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 40343717 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 40345515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40345767 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40346302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40347476 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40348785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40349474 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 40350640 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40352344 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40354067 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40355394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40355557 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40355656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40355793 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 40355906 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40356027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40356193 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 40356538 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40356696 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 40356697 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 40356700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40356738 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 40356842 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 40357064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40358048 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 40361186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40362740 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40363245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40366304 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40366396 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 40366631 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40369283 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 40369531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40369900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40370153 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40370633 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 40370911 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 40371319 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40371412 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 40371450 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40371595 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40371624 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 40372015 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 40372067 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 40372076 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 40372090 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 40372351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40372530 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40373375 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40374250 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40374981 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40375797 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 40375933 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 40375960 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 40376699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40377533 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40378634 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 40378684 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 40378784 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 40378792 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 40378827 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 40380184 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 40380215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40381340 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 40381343 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 40381485 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 40382254 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40382311 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40382650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40382948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40383200 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 40383641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40385551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40386084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40386091 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40387745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40388846 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40390325 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40391847 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40392469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40393017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40393049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40393457 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 40393473 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 40393502 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 40393551 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 40393552 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40393569 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40393612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40393642 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40393717 G C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 40394130 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 19 40394161 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 40394186 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 40394204 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 40394231 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 40394699 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40394905 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40395865 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 40396640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40396943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40398298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40399066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40399357 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 40399647 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40399694 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 40399920 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 40400061 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40400098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40400099 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40400144 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40400152 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 40400484 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 40400892 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40405208 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40405315 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 40405638 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40409807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40411627 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40411664 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 40412238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40413605 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40416595 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 40418289 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 40418385 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40418752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40419235 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40419680 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 40419756 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40421718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40422036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40422937 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40422951 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40423492 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 40423560 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40423690 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 40424025 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40424237 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 40425155 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40425702 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 40425709 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40425729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40426296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40426438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40426445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40426601 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 40426687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40426712 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 40426808 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 40426997 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 40426998 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 40427012 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 40427024 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40427159 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40427292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40427327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40427557 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40427649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40427672 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40427685 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40427776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40427792 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40428432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40428438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40428516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40428545 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40428573 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 40428727 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 40428737 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 40428753 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 40429014 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 40429016 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 40429086 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 40429135 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 40429508 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40429536 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40429904 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 40429916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40429933 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40429972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40430194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40430197 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 40430203 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 40430903 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 40434144 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40434442 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 40435198 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 40435647 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40438536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40438652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40439357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40439508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40439534 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40441015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40442305 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 40442793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40443959 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 40443995 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 40444059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40444095 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 40445621 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40445783 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40445810 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40446488 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40446751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40446942 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40447106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40447578 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40447608 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 40447885 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 40448529 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 40448546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40448869 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 40450430 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 40451230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40452515 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 40452602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40453137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40453166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40454009 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40454880 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40455082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40455675 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40456821 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 40458430 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40458587 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 40458951 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40459394 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40460335 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 40460995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40461207 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40461519 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 40461863 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40462511 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40463436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40464448 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 40464772 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 40466602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40466609 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 40468530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40469436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40469586 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40472197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40472570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40472883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40474183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40474342 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40475240 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40475284 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 40476103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40478702 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40479186 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40480237 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40480269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40480526 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 40480676 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 40480680 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40481560 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40481810 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40483569 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40484141 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 40484153 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40484267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40484273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40485922 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40486005 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40486684 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 40488112 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40488647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40489637 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40490119 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40490556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40491336 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40491473 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40491593 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40491869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40492132 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 40492363 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 40492413 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 40492481 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 40493057 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 40493241 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 40493334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40493494 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40493495 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40493538 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40493544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40493663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40493686 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 40494279 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 40494582 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 40494700 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 40494725 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 40494802 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40494970 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40496094 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40497243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40497723 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40497921 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40498812 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40500436 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40502261 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40503471 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40503525 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40504713 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40504758 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 40505203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40505276 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40505277 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 40505794 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40505901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40507625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40508011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40508055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40508084 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 40508430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40508472 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40508507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40508818 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40509050 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40509086 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40509379 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40509477 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40509616 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 40509642 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 40509804 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40509969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40509972 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40510013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40510117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40510172 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 40510725 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40510890 C G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40511060 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40511076 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40512305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40513554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40513997 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40514270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40515920 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40515989 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 40516005 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 40516049 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 40516066 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 40516071 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 40516073 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 40516084 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 40516220 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 40517146 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40517177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40517197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40517212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40517215 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40517280 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40517345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40517623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40517645 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40517679 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40517942 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40517969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40518084 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40518098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40518286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40518453 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40518881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40519066 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40519398 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40519584 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40519774 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40519795 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40520405 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 40520627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40520664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40520678 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40520776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40521401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40522037 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40523041 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40523246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40523823 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40524547 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40525041 C A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 40525047 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 40525303 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40525579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40525610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40525723 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40525742 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40525895 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40525933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40526002 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40526263 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40526502 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40526507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40526515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40526656 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40526665 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40526729 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40526758 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40526866 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40526923 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40526927 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40527523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40527806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40528331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40528694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40529606 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40530344 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 40531109 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 40531347 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 40531400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40531643 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 40532537 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 40533303 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40533905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40534246 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40534257 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40535055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40535265 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40535560 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40535562 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 40535650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40535694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40535695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40535701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40535738 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 40535845 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 40535937 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40535939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40536178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40536343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40536438 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40536889 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 40537385 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40537521 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 40537746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40537779 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40538056 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40538854 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40540783 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40542250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40542850 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40543476 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40544537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40545748 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 40546032 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40546141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40546280 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40546307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40546333 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40546857 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40546912 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 40547154 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 40547342 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40547505 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 40547657 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 40548029 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 40548146 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 40548151 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40548439 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 40548697 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40549025 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40549189 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 40550763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40551244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40551690 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40552596 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40553526 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 40553899 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40554030 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 40554071 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 40554276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40554341 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 40555106 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40555894 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40556417 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40557361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40557422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40560873 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 40562468 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40562476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40562552 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 40562557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40562684 C A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 40562706 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 40562860 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40563577 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40564464 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 40564631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40566434 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 40566524 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40566539 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40566563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40566575 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40566963 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 40567336 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 40567478 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 40567612 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 40567840 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 40567873 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 40567914 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 40569519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40570121 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40572540 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 40574477 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40574551 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 40576371 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40576563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40576697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40576864 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 40578440 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40578958 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40580791 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40581220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40581470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40582108 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40582294 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 40582833 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40585396 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40585924 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 40585925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40586377 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40586438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40587610 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40587944 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 40590730 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40592285 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 40594529 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 40596844 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40597321 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40598284 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40598479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40598652 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 40598799 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40598917 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 40598996 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 40599046 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 40599082 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 40599106 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 40599291 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 40599412 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 40600084 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 40600140 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 40600190 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 40600195 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 40600199 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 40600516 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40600625 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 19 40600751 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40600785 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40600805 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40600903 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 19 40601106 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40601108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40601121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40601149 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 19 40601169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40601184 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 19 40601231 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 40601233 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 40601237 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40602198 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 40602454 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 19 40602468 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 19 40603753 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40603755 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40604249 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 19 40604285 A T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 19 40604622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40604658 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40604761 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 40605013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40605033 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 40605391 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 40606048 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 40606441 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40607645 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 40607878 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40608046 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 40608060 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 19 40608078 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40608108 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 40608231 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 40608245 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 40608258 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 40608293 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40608309 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40608412 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40608423 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40608486 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 40608495 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40608525 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 40608618 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40608687 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40608704 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 40608824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40608850 A C N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 19 40608959 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40609052 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40609074 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 40609084 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 40609087 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 40609106 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 40609109 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 40609491 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40609521 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 40609571 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 40609586 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 40609631 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 40609797 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 40610034 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 40610065 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 40610173 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 40610325 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 40610367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40610546 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 40610728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40610827 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40610902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40611241 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 40611315 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 40611422 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40611446 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 40611451 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 40611484 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 40611494 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 40611538 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 40611666 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40611780 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 40612266 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 19 40612304 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 19 40612321 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 40612322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40612327 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 40613216 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 40613275 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 40613314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40613317 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40613589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40613769 A T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 19 40613781 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40613843 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 40614312 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40614521 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 40614707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40614729 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40614903 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 40614906 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 40614949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40614950 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40615024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40615038 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 40615069 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 40615096 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 40615105 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 19 40615144 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 40615217 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 40615296 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40615335 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 40615371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40615375 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 40615575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40615934 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 19 40615978 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 19 40616198 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 19 40616200 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 19 40616678 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40617057 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40617318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40617332 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 19 40617382 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 40618404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40618655 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40619663 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40619756 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40619785 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40620541 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 40620605 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 40621060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40622487 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40627085 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40627231 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40627346 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 40627348 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40627453 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 40627463 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 40627690 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40627691 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40627995 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40628030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40628145 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40628992 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40629446 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40629455 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40629488 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40630077 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40630096 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40630229 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40630296 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40630351 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 40630681 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40631310 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40631323 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40631460 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40631715 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40631800 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40632352 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 40632587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40632615 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40632652 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40633093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40633123 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 40633135 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 40633176 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 40636414 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40636423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40636425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40636539 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 40636692 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40636835 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40636839 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40636943 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40637136 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40637309 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40637351 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40637619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40637691 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40638188 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 40638466 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40639310 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 40639311 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 40640263 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40640325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40640500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40640516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40640644 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40640799 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40640813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40640832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40640874 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40640904 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40640912 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40640978 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40641167 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 40641202 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 40641988 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 40642006 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 40642312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40643007 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40643289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40643833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40645819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40646139 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 40646156 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 40646161 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40646177 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40646183 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40646187 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 40646220 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40646375 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 40646397 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 40646464 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40646537 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40646603 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 40646809 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 40646867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40647692 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 19 40648432 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 40648434 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 40648474 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40648580 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40648581 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40648677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40648943 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 40649318 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40650227 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 40650320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40650374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40650394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40650416 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40650433 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40650600 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40650638 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40651379 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40651632 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 40651992 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 40652122 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 40652495 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40652590 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40652888 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 40652993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40653013 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 40653021 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40653070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40653101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40653274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40653516 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40653561 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40653919 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40654010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40654174 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40654214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40654236 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40654621 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40654692 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 40655085 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 40655282 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40655337 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 40655432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40655515 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40655792 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40655932 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40655940 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40655976 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40656007 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 40656213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40656545 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40656775 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40656794 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40656833 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40657112 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40657129 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 40657133 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40657166 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40657169 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 40657181 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 40657196 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40657393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40657431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40657509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40657849 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40658150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40662901 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40665151 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40667871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40668757 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40670334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40670803 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40670808 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40670824 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40670892 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40671146 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 40671152 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 40671182 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 40671322 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 40671896 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 40672728 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 40673316 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40674385 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40675006 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40675701 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40675810 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40675860 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40675928 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40676336 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 40676536 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 40676693 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 40676710 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 40676744 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 40676749 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 40676957 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 40677120 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 40677198 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 40677748 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 40677989 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 40678226 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40678260 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40678430 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 40678439 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40678546 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 40678559 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 40678581 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 40678609 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 40678705 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 40678722 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 40678744 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 40678758 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 40678783 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40678798 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40678843 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 40678894 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 40678955 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40679162 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40679433 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40680315 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 40680360 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 40680534 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 40680743 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40680815 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40680852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40680867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40680909 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40681065 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 40681129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40681333 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 40681477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40682061 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 40682200 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 40682265 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40682273 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40682302 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 40682868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40683652 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 40683653 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 40683655 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 40683729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40684265 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40687344 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40687514 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 40687616 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40689801 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 40690029 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 40690073 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40690378 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 40692387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40692447 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40694122 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 40694529 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40694541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40695181 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40702529 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 40703703 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40706558 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 40706626 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40706995 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40707100 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40707206 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40707293 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40707318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40707451 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40707453 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40707503 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40707535 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40707789 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40707797 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 40708083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40708174 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 40708207 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 40708285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40708535 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 40708879 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 40709378 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 40709405 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 40709445 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 40709606 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 40709804 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 40710027 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40710718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40711169 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 40711585 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40711600 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 40712078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40712172 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 40712364 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 40712489 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 40712739 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40713116 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40714019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40714109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40714163 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 40714186 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 40714202 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40714761 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 40714943 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 40715094 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40715153 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40715334 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40715465 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40715556 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 40715633 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40715869 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 40715959 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40715963 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 40715991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40716059 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 40716089 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 40716284 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40716293 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40716442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40716486 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40716845 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 40717886 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 40719750 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40720343 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40721252 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40721508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40722066 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 40722408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40722630 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 40722679 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 40723743 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40723794 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40724292 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40724330 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40724640 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40724824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40725115 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 40725151 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40725552 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 40725960 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40727817 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40727857 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 40728050 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40728116 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40729624 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 40729640 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40729669 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 40729673 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40729929 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40730641 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 40730687 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 40730699 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 40730845 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 40730859 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 40731079 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40731185 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 40731207 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 40731362 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 40731390 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 40731489 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 40731495 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 40731766 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 40731886 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 40731909 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 40732571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40732873 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 40735412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40737332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40738093 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 40738896 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40738952 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 40738957 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 40739311 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 40739538 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 40739581 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 40739712 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 40739733 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 40739761 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 40739825 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 40739911 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 40739956 T G N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 19 40740362 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 40740386 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 40740436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40740523 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 40740535 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40740567 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 40740606 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 40741250 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 40741443 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 40741455 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 40741496 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 40741878 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40742395 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 40742629 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40743066 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 40743310 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40743370 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 40743372 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 40743409 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 40743431 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 40743497 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 40743511 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40743550 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 40743631 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 40743632 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 40743720 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 40743782 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 40743829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40743889 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 40743920 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 40743929 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 40743961 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 40743966 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 40744259 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 40744290 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 40744292 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 40744293 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 40744311 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40744333 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 40744536 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 40744649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40744834 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40745996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40746054 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 40746142 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 40746279 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40746425 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 40747081 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40747393 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40748066 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40748067 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40748073 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40748118 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 40748130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40748238 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 40748475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40748692 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40748777 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40749029 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 40749047 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40749097 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 40749116 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40749134 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40749139 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 40749168 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 40749282 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 40749456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40749516 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 40749554 C A Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 40749600 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 40749711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40750065 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 40750492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40750794 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 40750985 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 40751011 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 40751117 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 40751156 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40751323 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 40751607 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 19 40751870 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 40752111 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 40752232 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 40752315 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 40752326 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 40752371 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 19 40752373 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 19 40752603 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 40752609 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 40752653 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 40752814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40752835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40753061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40753112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40753115 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40753330 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 40753381 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 40753445 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 40753446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40753492 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 40753990 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40754009 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40754042 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 40754063 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40754088 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40754236 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40754280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40754367 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 40754442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40754466 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40754472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40754516 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 40754597 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 40754685 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 40754804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40754931 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 40754935 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 40755157 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40755160 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40755181 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 40755189 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40755212 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 40755240 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 40755245 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 40755338 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 40755551 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 40755619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40755641 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 40755752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40755839 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 40755893 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 40755965 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 40755974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40756092 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 40756093 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 40756267 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 40756283 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 40756325 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 40756368 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 40756384 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 40756535 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 40756589 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 40756603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40756625 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 40756711 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 40756772 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 40756792 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 40756850 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40757125 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40757200 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 40757400 C G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 40757466 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 40757472 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 40757487 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 40757580 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 40757663 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 40757698 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 40758372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40758873 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 40759181 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 40759566 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40759810 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 40759857 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 40759886 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 40759888 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 40759895 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 40760009 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40760194 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40760214 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40760228 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40760455 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 40760600 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 40760798 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 40760843 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 40760879 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 40760936 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 40761090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40761102 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 40761104 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 40761108 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 40761334 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 40761499 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 40761981 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 40762075 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40762146 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 40762175 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40762345 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 40762346 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 40762362 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40762387 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 40762395 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 40762400 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 40762411 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 40762550 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 40762555 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 40762784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40762827 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 40762903 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 40762928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40762962 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40762988 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40763019 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 40763061 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 40763269 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 40763623 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 40763707 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 40763764 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 40763781 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 40763897 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 40763899 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 40763932 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 40763972 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 40764100 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 40764420 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40764433 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 40764466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40764606 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 40764639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40764695 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40764758 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 40764759 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 40764771 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 40765283 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 40765292 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 40765294 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 40765422 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 40765626 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40765628 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40765691 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 40765699 A T Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 40765770 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 40765827 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40765859 T C Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 40765884 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 40766069 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40766070 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40766105 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 40766111 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 40766112 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 40766149 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 40766154 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 40766170 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40766395 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 40766437 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40766474 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 40766540 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 40766569 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 40766581 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 40766586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40766696 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 40766760 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 40766793 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 40766794 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 40767066 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 40767081 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 40767241 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 40767294 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 40767361 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 40767379 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 40767411 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 40767439 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 40767455 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 40767609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40767677 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40767731 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40767751 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40767807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40767872 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40767935 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 40768031 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 40768079 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 40768095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40768217 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40768219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40768364 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 40768403 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 40768452 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40768469 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 40768487 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 40768584 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40768591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40768796 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40768855 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 40768861 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 40768864 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 40768887 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40769116 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 40769132 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 40769336 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 40769349 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 40769401 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 40769503 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 40769505 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40769507 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 40769653 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40769709 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 40769725 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40769799 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40769809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40769991 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 40769996 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 40770059 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 40770072 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 40770133 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40770491 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40770521 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40770563 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40770580 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40770602 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40770682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40770710 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 40770741 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 40770872 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40770905 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40770907 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40770932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40771190 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 40771832 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 40771979 A C N N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 19 40772001 G A N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.545454545454545 0.272727272727273 0.181818181818182 15 7 6 3 2 19 40772023 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 19 40772025 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 19 40772040 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 40772054 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 40772088 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 19 40772343 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 40772360 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 40772447 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 40772688 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40773302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40773411 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40774640 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 40775116 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40775125 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 40775148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40775347 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 40775358 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 40775390 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40775629 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 40775649 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 40775665 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 40775704 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 40775717 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 40775722 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 40775926 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40776406 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 19 40776515 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 19 40776586 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 40776742 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 40776843 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 40776932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40777613 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40778361 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 40778641 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40778740 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40779457 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 40780862 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40781085 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 40781087 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 40781224 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 40781434 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40782852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40784407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40785359 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40785935 C T N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 19 40785961 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 40785980 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 40785996 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 40786120 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40786154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40787143 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 40787429 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 40787613 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40787640 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40787663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40787741 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40787823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40787825 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40787913 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40788417 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 40788422 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 40788720 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40788946 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40789015 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40789024 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40789043 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40789086 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40789304 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40789367 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40789424 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 40789483 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40789607 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 40789700 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40789731 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40789938 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 40789978 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 40790706 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 40791015 A T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 19 40791040 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 40791052 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 19 40791095 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 40791177 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 40791294 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 40791330 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 40791338 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 40791339 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 40791454 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 40791477 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 40791539 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 40791545 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 40791626 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 40791784 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40791835 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40794227 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 40794476 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 40794647 T C Y Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 19 40794784 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 40794836 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 40794863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40794973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40795121 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40796103 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 40797161 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40797623 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 40797739 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40798075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40798237 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40798297 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40798317 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 40798468 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 40798735 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 40799077 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 40799463 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40799473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40799666 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 40799715 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 40799784 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 40800029 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40800363 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40800780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40802378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40802785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40802898 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 40802934 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 40802968 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 40803149 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40803294 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40803415 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 40803532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40803579 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 40803599 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 40803610 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 40803834 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 40803890 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 40803914 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 40803915 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 40804023 G A Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 40804038 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 40804050 G C Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 40804140 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 40804440 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 40804502 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40804682 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 40804768 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40804810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40804867 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 40804879 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40805137 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 40805212 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 40805238 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 40805254 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 40805388 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 40805393 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 40805490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40805661 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 40805708 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 40806214 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 19 40806895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40807169 C T Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 40807282 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 40807520 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 40807600 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 40807803 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40808246 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 40808296 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40808440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40808475 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40808476 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40808523 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 40808661 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 40808681 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 40808797 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40808854 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40808899 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40809176 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 40809180 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 40809271 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 40809272 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 40809289 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40809375 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 40809437 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40809509 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40809522 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40809579 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 40809781 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 40809839 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 40810161 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 40810331 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 40810496 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 40810530 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 40810531 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 40810706 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 40810734 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 40810775 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 40810887 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40810900 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40810967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40811085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40811146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40811189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40811299 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 40811403 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40811473 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40811509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40811525 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40811568 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 40811593 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 40811662 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 40811831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40811857 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 40811885 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 40811898 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 40811939 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40812099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40812296 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40812710 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40813876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40814783 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 40815366 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40817571 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40817788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40818016 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40818170 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40818174 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 40818199 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 40818463 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40818481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40818825 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40818917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40819229 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40819277 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 40819377 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40820105 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 40820246 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 40820265 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 40820267 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 40820388 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40820971 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 40821428 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40822401 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40824383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40824452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40824933 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40828459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40829362 C T Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 40830184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40830212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40835361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40835596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40835957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40836163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40836708 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40838101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40839356 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 40839366 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 40839548 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 40840069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40840090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40840129 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40840517 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 40840570 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 40840587 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 40840760 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 40840761 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 40840875 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 40841081 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 40841292 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40841341 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40841717 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 40842021 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 40842237 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 40842293 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 40842327 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 40842356 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40842373 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40842374 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40842417 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 40842429 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 40842430 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 40842438 C G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40843593 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 40843706 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 40843715 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40844582 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 40844820 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 40844941 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 40845204 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40845561 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40845974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40846117 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 40846145 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 40846549 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40846689 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 40846747 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40846946 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 40846957 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40846958 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40847032 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40847043 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 40847178 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 40847204 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 40847236 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40847237 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 40847437 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 40847600 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 40847610 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 40848391 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40848778 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 40849618 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40850738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40852869 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40853011 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40853111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40853397 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 40853532 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 40853631 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 40853725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40853939 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40854131 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 40854310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40854381 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40854480 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 40854491 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 40854492 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 40854829 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 40854830 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 40854948 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 40854988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40855238 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 40855502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40855592 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 40855665 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 40856093 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40856343 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 40856482 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 40856556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40856895 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 40856936 C G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 40857206 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 40857357 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 40857439 G C Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 40858212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40858270 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40858368 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40858380 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40858404 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40858428 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40858573 C A Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40858647 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 40858660 A T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 40858872 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 40858896 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 40858981 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 40859015 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 40859027 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 40860981 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40867000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40867291 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40868405 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 40869403 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 40869442 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 40869446 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 40869595 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 40869885 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40870872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40873878 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40874684 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 40876347 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40879772 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40880776 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40880867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40881256 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40881640 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40881826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40881908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40882269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40882537 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 40882608 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 40882784 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 40882856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40883119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40883301 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 40883425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40883693 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40883905 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 40883950 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40883970 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40884135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40884138 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40884180 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40884273 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40884279 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40884404 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40884511 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40884572 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40884639 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40884645 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40884879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40884880 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40884983 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40885015 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40885194 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40885403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40885453 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 40885465 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 40885466 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 40885522 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 40885580 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 40885800 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 40886070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40886454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40886605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40887080 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40887131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40887144 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40888119 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40888169 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40888384 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40888470 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40888483 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 40888548 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40888569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40888752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40888790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40888793 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40888810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40888819 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 40888858 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 40888880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40888950 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 40888951 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 40888977 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 40889184 G T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 19 40889283 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 40889299 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 40889405 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 40889447 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 40889468 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40889472 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 40889589 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 40889639 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 40889685 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40889805 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40889867 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 40889889 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40889891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40890438 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40890534 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 40890543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40890819 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 40891079 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 40891099 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 40891191 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 40891285 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 40891287 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 40891298 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 40891323 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40891352 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 40891810 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 40891843 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 40891848 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 40891871 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 40891887 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 40892047 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 40892241 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 40892307 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 40892721 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40892769 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 40893306 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40894290 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40894311 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 40894554 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 40894843 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 40894928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40895380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40895754 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40896065 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 40896138 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40897459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40897476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40897766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40898557 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40898862 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40898866 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 40899062 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 40899114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40899205 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 40899206 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 40899213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40899250 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 40899266 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 40899378 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 40899566 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 40899626 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40899695 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40899702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40899735 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 40899736 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 40899737 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 40899739 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 40899787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40899948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40901499 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40902772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40902961 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 40903198 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40903319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40904378 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 40904574 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40908484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40909341 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 40909983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40911204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40912348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40912679 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 40914495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40915227 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 40915569 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40915631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40915737 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 40915840 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 40915944 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40916221 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40918026 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40918807 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40918861 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 40919322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40920104 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40921733 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40921790 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 40923769 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 40923929 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 40924049 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 40924145 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 40924152 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 40924595 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 40925171 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 40925307 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 40925345 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 40925522 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 40925630 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 40925633 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 40925653 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 40925827 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 40925839 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 40925880 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40926082 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 40926084 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 40926110 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 40926125 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 40926781 G A Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 19 40926975 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 40926984 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 40926988 A G Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 19 40927248 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 40927413 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40927434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40927536 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 40927697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40927794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40927919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40928112 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 40928330 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 40928435 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 40928715 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 40928772 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 19 40930197 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 40931999 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 40932330 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 40932852 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40933078 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 40933996 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 40934253 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 40934445 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 40934700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40935535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40935815 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 40936263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40936582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40938118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40938145 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40938166 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 19 40938186 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 19 40938264 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 40938389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40938447 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 19 40938502 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 19 40938967 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 40939100 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 40939222 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 40939429 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 40939538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40939563 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40939751 G T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 19 40939811 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 40940245 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 40940321 A G N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.181818181818182 18 4 9 0 2 19 40940418 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 40940799 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40941236 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40941818 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 40942077 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40942368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40942537 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 40942592 T C N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.214285714285714 21 7 10 1 3 19 40942608 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40943151 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 40943696 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40943701 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40943713 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 19 40943780 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 40943882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40944054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40944076 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 40944194 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 40944491 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 19 40944525 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 40944536 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 40944593 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 19 40944774 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 19 40945089 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 19 40945095 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40945295 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 40945594 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 40945749 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 40946243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40946559 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 40946615 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 19 40946937 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 40946955 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 40947329 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 40947594 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 19 40947684 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 19 40948039 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 40948085 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 40948173 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40948201 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40948580 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 40949004 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 40949093 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 40949150 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 40949197 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 40949215 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 40949332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40949376 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 40949581 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 40949826 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40949832 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 40950207 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 40950320 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 40950876 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 40951375 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 40952143 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 40952149 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 40952546 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 40952901 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 40952948 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 40952983 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 40952985 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 40953017 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40953114 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 40953422 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40953447 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40953502 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 40953629 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40954218 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40954223 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40954425 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 40954437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40954459 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40955215 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40955619 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40956390 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 40956423 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 40956436 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 40956458 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 40956558 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40956658 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40956982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40958583 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40958865 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 40959256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40959890 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 40960899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40961956 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40962067 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 40963306 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 40963575 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 40963873 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 40963928 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 40964170 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 40964547 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 40964629 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 40965702 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40966314 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40966702 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40967221 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40967259 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 40967262 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40968275 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 40968523 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 19 40968743 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 40969138 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40969650 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40970292 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40970392 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 40970397 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 40970467 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 40970723 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40971061 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 40972538 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40972982 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40973054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40973368 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 40973466 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40973758 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40973864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40973946 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 40974081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40974163 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40974375 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40974508 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 40974509 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 40974576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40974762 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40975230 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 40975259 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 40975291 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40975361 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40975472 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 40975836 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 40975946 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 40976522 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 40976882 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40976901 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40977303 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 40978344 C A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 40978445 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 40979180 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 40980386 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40980745 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 40981213 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 40981238 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 40982228 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40982304 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40982377 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40982461 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 40982643 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40982947 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40983072 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 19 40983762 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 40984776 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 40985112 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 19 40987273 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 40987796 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 40988044 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 40988146 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 40988217 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40988365 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40989160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40990132 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 19 40990557 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 40990945 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40993720 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40994162 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 40995317 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40998177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40998666 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 40998923 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40998925 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 40998946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40998982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 40999013 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 40999023 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41000164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41000476 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41000561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41000988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41001648 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 41001722 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 41001734 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 41001831 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 41001846 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41001847 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 41001938 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41002128 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 41002129 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 41002346 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41002554 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41002965 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41004256 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 41004310 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 41004318 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 41004369 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 41004412 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 41004418 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 41004451 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 41004458 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 41004461 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 41004462 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 41004663 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 41004728 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 41004730 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 41004835 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 41004923 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 41005165 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 41005256 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 41005629 G T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 19 41005708 G A N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 19 41005739 T A N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 19 41005777 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 19 41005778 G T N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 19 41005786 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 19 41006038 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 41006049 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 41006086 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 19 41006098 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 19 41006113 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 19 41006222 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 19 41006230 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 19 41006232 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 19 41006250 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 41006251 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 41006422 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 41006563 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41006631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41006707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41006821 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 41006838 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 41007008 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41007106 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41007112 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41007128 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 41007184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41007210 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41007463 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41008408 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 41008456 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41008460 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 41008587 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41008764 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41008773 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41008804 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41009090 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 41009268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41009280 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41009591 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41009677 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41009914 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41009924 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41009955 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41009960 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 41010123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41010154 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41010180 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 41010258 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 41010274 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 41010300 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41010316 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 41010322 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 41010412 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 41010414 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41010452 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41010526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41010553 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41010698 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41010908 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41010909 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41011006 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41011007 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41011113 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 41011266 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 41011450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41011485 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 41011489 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 41011623 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 41011630 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 41011662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41011669 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41011764 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 41011867 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 41011902 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 41012012 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 41012180 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 41012345 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41012406 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 41012429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41012488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41012499 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41012527 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41012823 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 41012846 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 41012848 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 41012869 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 41012897 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 41012901 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 41012925 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 41012993 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 41013008 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 41013065 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 19 41013080 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 41013081 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 41013103 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 41013205 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 41013246 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 41013293 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41013300 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41013310 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 41013551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41013564 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41013566 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41013648 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 19 41013792 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 41013940 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 41013968 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 41014041 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 41014049 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 41014052 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 41014074 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 41014100 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 41014177 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 41014182 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 41014215 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 41014304 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41014373 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41014613 A T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 41014627 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 41014630 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 19 41014820 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 41014886 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 41014953 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 41015032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41015251 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 41015288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41015392 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 41015421 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 41015424 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41015464 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41015552 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 41015557 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 41015734 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41015773 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 41016086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41016264 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 41016271 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 41016384 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 19 41016389 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 41016412 T C N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 19 41016557 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 41016659 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 41016685 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 41016706 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 41016709 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 41016713 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 41016779 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 41016833 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 41016846 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 41016884 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41017053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41017130 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 41017246 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 41017248 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 41017256 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 41017266 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 41017490 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 41017505 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 41017628 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 41017662 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41017673 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 41017696 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 41017724 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 41017729 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 41017746 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 41017756 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 41018077 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 41018092 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 41018096 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 41018112 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 41018222 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41018292 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 41018388 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41018865 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 41018977 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41019310 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 41019346 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41019674 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41019738 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41020170 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 41020335 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41020441 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41020801 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41021451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41021464 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41021472 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41021868 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 41022606 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41022683 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 41022697 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 41022728 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 41023050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41023494 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41023664 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41023706 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 41024129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41024426 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41024430 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41024711 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41025070 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 41025071 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41025195 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41025223 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41025334 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41025402 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 41025429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41027255 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41027809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41032686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41033727 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41034073 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41035320 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41037614 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41038654 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41038690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41039206 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41039680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41039921 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41040251 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41040414 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 41040515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41040527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41040547 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41040763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41040792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41040931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41041076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41041160 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41041239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41041337 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41041493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41041510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41041554 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41041659 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41041844 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41042000 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 41042569 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 41043165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41043173 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 41043268 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41046123 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 41046324 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 41046767 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 41046852 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 41047059 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 41047646 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41047685 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41048215 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41049026 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 41049373 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 41049399 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 41049538 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41049631 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41049646 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41049736 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41049756 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41049768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41049803 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41049923 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41050097 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41050123 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41052080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41052111 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 41052142 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41052150 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41052718 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41052909 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41052918 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41053383 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41053485 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 41054396 G T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 41055111 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41055227 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41056492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41058439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41060745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41060789 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41060842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41060877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41061067 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41061789 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41061915 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 41062001 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 41062016 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41062747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41062862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41066239 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41067195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41067563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41067613 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41068175 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41069285 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41069904 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41070426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41070691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41071160 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41072629 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41076289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41079337 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41079453 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41081008 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 41082930 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 41082938 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41083098 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41083287 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 41084856 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 41084857 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41086454 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41088120 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 41088930 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 41089862 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 41089922 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 41090217 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 41090236 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41090447 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 41090480 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 41090483 G T Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 19 41090579 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 41090699 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41090733 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41090751 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41090764 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41090898 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41090982 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41091381 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41091505 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41091788 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41092043 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 41092160 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41092262 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 41092278 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 19 41092354 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 41092527 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 41092756 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 41092763 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41092790 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41093241 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 41093344 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41093345 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41093351 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 41094013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41095029 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 41095557 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41095812 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 41096247 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41097342 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41097558 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 41097634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41097992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41099102 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41100917 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 41100922 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 41100923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41103850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41103901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41104537 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 41106229 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 41106430 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 41106475 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41106495 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41106873 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 19 41107142 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 41107162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41107384 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41107390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41107391 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 41107490 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 41107502 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 41107856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41107857 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41107875 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 41107939 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 41107974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41108208 C G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 41108281 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41108378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41108389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41108484 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41108906 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 41108914 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 41109031 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 41109345 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 41109665 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 41109693 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41109882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41109956 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41110547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41110735 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41110798 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 41110825 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 41110957 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 41111190 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41111352 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41111353 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41111361 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41111431 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41111446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41111630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41111729 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41111833 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41111838 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41111849 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41111872 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41111892 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41111915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41111926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41111942 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 41111991 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41112141 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 41112144 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41112208 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 41112221 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 19 41112262 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 19 41112431 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 41112700 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41112725 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41112755 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41112841 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 41112894 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41112955 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41113114 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 19 41113172 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41113200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41113441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41113444 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 41113498 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 41113520 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41113538 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 41113666 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 41113688 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41113689 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41113963 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41114217 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 41114229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41114531 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 41114552 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41120221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41120486 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41120850 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 41122040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41122370 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 41123043 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 41123044 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 41123241 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41123343 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41123445 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41123503 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 41123522 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 41123807 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 41123878 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 41123929 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 41123940 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 41123944 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41123956 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41123970 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41123997 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 41124003 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 41124033 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41124052 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 41124053 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 41124505 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41124641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41125160 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41126562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41126731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41126736 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41126761 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41127712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41127782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41127785 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 41128021 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41128030 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41128404 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41128563 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41128844 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41128848 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 41129087 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 41129199 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 41129203 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 41129561 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41129577 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 41129675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41129679 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41129693 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 41129700 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 41129722 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 41129735 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 41129736 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 41129754 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 41129915 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41130136 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41130178 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 41130196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41130203 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41130219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41130285 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41130774 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41131799 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 41133939 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41134284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41134484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41134900 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41136352 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41138075 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 41139145 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41141053 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41142283 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 41142637 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41142781 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 41144725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41145437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41145479 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41145482 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41145602 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 19 41145603 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 19 41145631 T A N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 19 41145828 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41145989 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 41146028 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 41147784 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41148785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41149049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41151698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41152063 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41153405 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 41155749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41155755 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41157002 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 41157004 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 41157100 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 41157132 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 41157646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41157872 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41157957 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41157968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41158007 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41158081 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41158142 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41158200 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41158227 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 41158292 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41158422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41158519 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 41158543 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41158561 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41158566 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 41158864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41158901 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41159113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41159434 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 41159691 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41159915 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 41159970 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41160137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41160300 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 41160663 T A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 41161128 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41161724 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 41161915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41163200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41163898 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41165665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41166391 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41166613 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 41166682 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 41167082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41167147 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 41167231 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 41167427 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41167494 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 41168323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41169402 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41169403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41170217 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41170234 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41170889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41170916 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41171007 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41171017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41171166 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 41171280 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 41171444 G T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 41171472 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41171953 C G Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 41171955 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 41172050 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 41172088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41172107 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 41173200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41173501 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 41173747 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 41173795 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 41173887 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 41173904 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41173983 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 41173998 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 19 41174002 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 41174238 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41174362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41174617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41174827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41174962 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 41175830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41176079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41176268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41176478 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 41176962 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 41177012 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41178470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41179222 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 41179687 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 41179690 G T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 41179773 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 41180115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41180525 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41180993 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 41182120 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41184946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41186773 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41186829 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 41187097 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 41188065 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 41188144 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 41188354 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 41190839 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41190928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41191254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41191388 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41191439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41191452 C A Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 41191486 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 41192903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41193147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41193249 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41193573 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41193727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41194209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41195876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41196021 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41196117 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41197816 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41199043 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41199073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41199134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41199257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41200093 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 41200836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41201191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41202757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41203123 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41203160 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 41203207 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 41203224 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41203404 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41203468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41203493 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41204430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41204437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41204530 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41204565 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41204575 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41204612 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41204631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41204665 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41204734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41204772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41204847 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41204851 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41204856 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41204950 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41204986 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41205031 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41205049 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41205115 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41205224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41205386 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41205615 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41205709 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 41205992 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 41207314 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41207670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41208018 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41208023 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41208052 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41208228 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41208314 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41208349 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41208379 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41208442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41208487 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41208551 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41208558 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41208565 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41208901 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41209090 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 41209116 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41209121 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41209369 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 41209685 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41209878 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41209887 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41209965 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41209978 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41210192 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41210204 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41210208 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41210289 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 41210325 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41210326 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41210334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41210456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41210589 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41212276 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 41212491 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41212492 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41212556 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 41212560 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 41212631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41212735 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41213192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41213214 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41213384 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41213394 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41213398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41213403 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41213580 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41213610 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41213667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41213675 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 41214457 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41214475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41214564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41214681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41214725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41214810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41214867 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41214952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41215144 C G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 19 41215335 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41215582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41215605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41215709 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41215875 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41215880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41216044 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 41216109 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 41216227 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41216246 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41216339 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41216769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41217065 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 41217106 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 41217168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41225112 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41225248 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41225272 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41225881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41227713 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41227936 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41230301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41232679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41234440 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41236494 G T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 41236812 G T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 41236853 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 41237221 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41237655 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 41238119 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 41238348 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41238452 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 41238488 T A Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 41238490 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 41239183 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41239599 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41239831 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 41240133 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41243054 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41246355 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41247438 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 41247568 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 41248519 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41248598 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41248963 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41249682 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41250189 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 41250222 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 41250232 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 41250293 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41250909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41251312 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41251570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41252807 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41252947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41253772 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41254449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41254634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41255106 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 41255325 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41255350 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 41255382 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 41255505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41255699 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41255925 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 41256013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41256129 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 41256166 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 41256331 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 41256338 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 41256421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41256877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41257643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41258275 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41259006 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41259328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41260052 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 41260301 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 41260584 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 41262071 G C Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 41262404 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 41263741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41264015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41267270 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41267307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41268570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41268902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41269028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41269047 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41269325 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41271924 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 41272630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41273552 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 41273553 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 41273597 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 41273605 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 41273639 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 41273729 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 41273746 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 41273908 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 41273966 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 41273979 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 41274011 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41274036 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 41274095 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 41274292 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 41274443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41274446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41274512 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 41274568 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 19 41274674 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 19 41274750 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41274790 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41274870 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 41274879 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41274973 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 41275038 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41275041 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 41275059 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 41275060 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 41275304 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 41275311 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 41275474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41275656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41276001 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41276912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41277674 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41278337 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 41278867 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 41280298 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41280736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41280922 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41281600 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41287216 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41290914 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 41291191 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 41291476 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41291715 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41292650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41293672 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 41294114 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 41294192 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 41294935 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 41294948 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 41295272 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 41295360 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 41295443 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 41295518 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 19 41295519 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 41295585 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 19 41296195 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 41296396 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41296470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41296488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41296536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41296627 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 41296882 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 41296890 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 41296950 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41297133 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 41297383 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41298004 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 41298039 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 41299019 A T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 19 41299139 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 41299197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41299470 G C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 41299514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41299627 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 41300554 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 41300605 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 41300657 T G N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 19 41300709 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 41300736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41300809 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 41300856 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 41300871 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41300911 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 41300942 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 19 41300959 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 41301040 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41301052 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 41301074 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41301091 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 41301134 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 41301516 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 41301629 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 41301696 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 41302009 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41302017 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 19 41302057 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 41302117 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 41302437 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 41302482 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 41302499 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 41302500 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 41302608 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41302629 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41302631 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41302992 A T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 19 41303051 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41303052 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41303305 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 41303380 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 41303406 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41303443 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41303659 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 41303669 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 41303710 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41304065 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 41304098 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 41304270 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 41304335 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41304359 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41304375 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41304425 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41304487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41304542 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41304566 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41304662 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 41304856 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 41304868 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 41304883 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 41304895 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 41305121 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41305132 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41305232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41305285 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 41305321 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41305375 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 41305383 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 41305408 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 41305803 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 41305865 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 41306060 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41306062 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41306080 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 41306182 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 41306194 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41306207 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41306359 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 41306533 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41306616 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41306758 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 41306805 G A Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 41307102 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41307238 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 41307361 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 41307506 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41307586 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 41307841 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41307891 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41308096 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 41309408 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 41309965 T C N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 19 41309967 C G Y N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 19 41309968 T G N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 19 41310336 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 41310496 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41310726 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41310763 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 41310836 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 41310866 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 41311229 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 41311658 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 41311665 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 41311858 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 41312217 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 41312355 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 41312676 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 41312864 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41313179 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41313680 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 19 41313863 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 19 41314308 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41314336 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 41314471 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41314492 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 41314873 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 19 41314884 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 41315438 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 41315532 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 41315538 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 41315565 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 41315688 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 41315689 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 41315777 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41315802 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41315808 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 41315900 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 41316210 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41316255 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 41316326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41316604 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41316722 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 41316749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41316987 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 41317066 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 41317445 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 41317733 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 41317736 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 41317859 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 41317864 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 41317935 C A Y N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 19 41318017 T C N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 19 41318304 C T Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 19 41318683 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 41318835 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 19 41318941 T C N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 19 41319546 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 41319729 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 41319861 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41320228 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41320516 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41320520 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 41320717 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41320794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41320801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41320813 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41321241 G A Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 19 41321953 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 41321996 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41322114 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 41322117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41322307 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 41322332 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 41322384 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 41322858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41323334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41323389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41324143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41324704 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 41324896 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41325020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41325629 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 41325722 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 41325932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41325944 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 41326003 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 41326110 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 41326134 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41326627 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 19 41326641 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 41326650 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 19 41326704 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 41326852 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41327054 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 41327069 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 41327147 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 41327320 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 41327340 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 41327393 A C N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 19 41327405 T A N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 19 41327626 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 41327701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41327770 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41328122 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 41328207 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 41328208 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 41328212 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 41328272 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 41328310 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 19 41329018 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 41329251 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 41329261 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 41329286 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41329406 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41329532 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 19 41329629 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 41329631 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 41329683 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 41329833 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 19 41329834 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 41329917 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 41330158 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41330165 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41330176 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 41330291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41330330 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 41330359 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 41330846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41331798 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41332223 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 41332307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41334938 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41336114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41337423 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41337972 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 41338008 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41338697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41338767 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 19 41338972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41339187 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 41339271 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 41339539 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41339658 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 41340050 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41340233 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 41340381 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 41340382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41340526 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41340528 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 41340670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41340808 C T Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 41340848 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 41340930 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 41340937 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41341038 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 41341047 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 41341483 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 41341564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41341587 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41341777 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41341791 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 41341792 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 41341821 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41341893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41341943 C A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41342166 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41342340 A T N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 19 41342429 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 41342432 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 8 6 3 2 2 19 41342434 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 11 7 4 3 2 19 41342443 G A N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 19 41342463 A G N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 19 41342518 G T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 19 41342546 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 41342566 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 41342614 A T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 41342621 G A Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 41342703 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 41342723 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 41342735 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 41342746 C A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 41342780 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 41342848 G A Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 19 41343126 A C Y N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 19 41343176 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 41343312 G T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 41343913 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41343950 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 41344062 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 41344141 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 41344308 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 41344504 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 41344591 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 41344605 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 41345568 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 41345709 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 41345762 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41345888 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41349181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41349192 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41349388 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 41349516 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 41349580 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41349725 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41350036 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 41351243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41351410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41351578 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41351590 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41351638 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41351654 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41351686 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 41351755 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41351929 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41351936 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41351973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41352069 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 41352111 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 41352146 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 41352152 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41352155 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41352215 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41352227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41352261 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 41352366 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 41352510 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 41353504 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 41353785 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 41355492 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41356065 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 41356194 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 41356241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41356346 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41356352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41358782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41359177 C G N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 19 41359856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41360037 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 41360387 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 41360434 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41360597 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 41360651 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 41360682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41360751 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 41360866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41361354 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41361578 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41364037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41364815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41365390 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41366393 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 41367325 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41367329 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41367589 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 41367698 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 41367734 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 41367823 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 41367825 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 41367949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41367953 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41367971 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41367994 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41368010 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41368034 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 41368035 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 41368043 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 41368092 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 41368128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41368218 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41368363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41368422 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 41368494 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41368585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41368645 A T Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 41368670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41368757 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 41368758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41368816 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 41368831 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 41369434 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 41369481 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 41369483 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41369500 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41369520 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 41369688 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 41369692 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41369823 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 41370583 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 41372673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41374649 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41375234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41375328 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 41376193 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41376335 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 41376533 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 41376772 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41377004 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41377279 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41377285 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41377388 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41377464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41377530 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 19 41377538 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 41377564 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41377936 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41378000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41378737 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41379387 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41380196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41381984 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 41381988 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 41382246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41383483 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 41383864 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 41384329 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41385029 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 41385227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41385309 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41386031 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41386284 A G N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 19 41386335 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 41386424 C T N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.384615384615385 0.230769230769231 0.384615384615385 13 13 5 3 5 19 41386634 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 41387156 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41387206 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 41387407 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 41387656 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41387950 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41388497 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 41388696 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41388774 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41388831 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41389243 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41389244 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 41389287 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41389305 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41389313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41389318 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41389358 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 41389363 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 41389372 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 41389407 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41389432 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 41389504 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41389548 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41389898 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 19 41390202 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 41390247 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 19 41390490 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 41391278 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 41391294 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 41391311 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 41391435 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 41391726 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41391976 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41392154 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41392657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41392806 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 41392984 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41392995 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 41393469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41393668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41394280 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 41394330 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 41394524 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 41396322 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 41396417 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 41396432 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 19 41396686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41396991 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 41396993 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 41397010 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41397113 A T Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 41397374 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 41397580 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 41398142 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 41398386 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 41398484 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 41398650 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 41398818 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 41398962 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 41399332 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 41399457 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 41399714 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 41399794 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 41400726 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41403941 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41405916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41405947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41405986 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 41406251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41406325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41406613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41408696 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 41409026 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 41409124 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 41409657 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41409770 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41409874 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 41410024 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 41411313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41411380 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41411569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41412607 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41413937 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41417707 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 41419168 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 41419213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41419345 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 41419348 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 41420764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41421200 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 41421364 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 41421442 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41421451 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 41421459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41421769 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 19 41422513 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41422657 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41422750 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 41422754 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 41422779 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 41422780 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41423148 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 41423350 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 41423367 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 41423979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41424882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41424940 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41425240 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41425789 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41425938 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41427096 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41428221 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 41430586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41431286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41432663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41435261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41435668 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 41436704 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41436853 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41438115 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41440115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41441474 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41441753 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41441760 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41442249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41442271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41443458 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 41443678 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 19 41443981 G A Y Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.307692307692308 0.0769230769230769 0.615384615384615 9 17 4 1 8 19 41444041 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.1875 0.0625 0.75 7 25 3 1 12 19 41444074 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 19 41444084 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 19 41444271 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 19 41444350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41444847 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 19 41445155 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 41445450 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 41445599 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41445910 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 41445959 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41445974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41446884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41446998 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41447432 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 41447527 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 41447826 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41448985 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41449056 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 41449083 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 41449621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41449704 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 41450159 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 41451053 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 41451063 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 41451412 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41451602 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 41451713 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 41451742 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 41451782 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 41451854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41451865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41452090 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 41452187 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41452236 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 41452937 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41453365 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41454408 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41457838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41457994 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41458152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41458359 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 41458524 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 41460134 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41460246 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 41460306 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41460309 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41460481 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41460636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41460639 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 41461196 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 41461275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41461389 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 41461466 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 41461517 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41461588 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 41461670 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 41463006 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41463360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41464128 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41464706 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 41464728 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 41464767 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41464866 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 41464876 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 41464900 G T Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 41464907 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 41465009 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 41465052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41465120 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41465188 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 41465403 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 41465528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41465627 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41465756 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41466074 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 41466459 G C Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 41466912 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41467567 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 41467581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41467773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41467827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41467886 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 41468032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41468105 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 41469484 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41469494 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41469524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41469604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41469630 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 41469734 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 41469917 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 41470351 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 41470360 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41470372 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41470392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41470396 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41471054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41474703 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41475388 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 41477111 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41478380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41479257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41481303 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41483482 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41484504 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41484601 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41486619 A C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 41487505 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 41487614 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 41489095 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 41489626 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 41490068 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 41490346 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 41490488 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41491169 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41491824 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 41492013 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 41492380 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 41492809 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41492822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41493001 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 41493012 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 41493037 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 41493109 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 41493127 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 41493251 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 41493518 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41493683 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 41493804 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 41493813 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 41493988 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 41493992 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 41494192 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 41494233 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 41494236 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 19 41494325 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41494337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41494379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41494394 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41494406 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41494814 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 41494861 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 41494942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41494954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41495108 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 41495143 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 41510071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41510172 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41510541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41512304 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41513078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41513476 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 41514078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41514151 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41516204 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41517710 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 41517861 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 41519086 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41524000 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 41525240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41525816 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41527620 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 41528085 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41530775 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 41532940 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41539764 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41540456 C T Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 41540849 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 41540964 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 41542024 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41542123 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41549632 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41549716 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41550688 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41550771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41550819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41552672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41553909 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41554370 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41554412 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41554607 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 41554793 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 41554824 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 41555471 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41555650 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 41556122 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 41556952 T G N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 41560073 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41561191 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41561446 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41562820 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41562962 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 41563120 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 41564540 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41565571 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41565936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41567271 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 41567382 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41568272 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 41568434 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 41568453 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 41568631 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 41569360 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 41569426 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 19 41569920 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 41570429 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 41571127 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 41577411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41580513 T G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.75 0.0625 0.1875 25 7 12 1 3 19 41586851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41591771 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41592983 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41593555 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41594272 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 41594353 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 19 41594954 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 41599110 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 41604070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41604282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41605256 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41606058 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 19 41608935 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41608984 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 41610977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41611534 A T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 19 41612354 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41614237 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41616132 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 41621168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41622449 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 41626797 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41627937 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 41629014 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 41629411 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 41635185 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41635549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41640717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41644391 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41647431 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41651166 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 41654475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41656420 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41656444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41657527 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41657661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41658249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41659242 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41659328 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41663916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41663930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41665115 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 41665178 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 41665183 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41666012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41666303 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41667415 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41667959 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 41668041 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 41668104 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 41668199 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41669109 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 41669709 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41670702 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41671916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41671962 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 41672095 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41672872 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 41672972 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 41673210 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 41673758 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41673872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41674852 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41674867 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 41674944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41674945 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 41675335 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 41675462 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 41676708 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41678116 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41678371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41680783 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41681996 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 41682055 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 41682452 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 41682589 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 41682931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41682988 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 41683018 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 41683119 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 41683143 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41683196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41683256 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41683293 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41683294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41683336 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41683716 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41683737 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41683947 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41684329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41684753 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41684821 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41685002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41685021 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41685181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41685601 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41685670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41685755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41685879 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41685895 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41685922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41685976 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41686050 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41686175 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41686204 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 41686205 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41686208 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 41686244 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41686273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41686497 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41686867 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41687364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41687365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41687687 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 41687693 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 41688329 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41688351 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 41688353 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41688840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41689453 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41689515 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 41689530 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 41689540 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 41689541 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41689674 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41689834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41690792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41692938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41693127 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41693779 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41694038 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 41694078 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 41694106 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41694333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41694334 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 41694669 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41694674 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 41694956 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41695102 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41695111 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 41695240 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 41695247 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41695624 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41695714 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41697045 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 41698148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41699149 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 41699159 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 41699341 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 41700351 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41700763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41701173 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41701179 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41701269 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 41701282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41701395 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 41701467 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41701560 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 41701570 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41702501 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41702563 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 41702612 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41703033 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41703406 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41703658 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41703964 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41703998 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41704980 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 41706042 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41706064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41706391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41707553 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41708265 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41708509 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 41708871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41708949 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 41708995 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 41709268 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 41709289 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41709315 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41709339 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 41709340 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41709342 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41709698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41709795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41709806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41709824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41710064 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 41711864 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41713151 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 41713841 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 41713940 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 41714057 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 41714392 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 41714401 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 41716546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41716600 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41717527 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 41717860 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 41718134 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41719062 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 41719066 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 41719067 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 41719140 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 41719202 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 41719274 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 41720318 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 41720340 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41720432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41720441 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41720461 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41720750 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41721214 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 41721238 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 41721389 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 41721664 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 41721698 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 41722000 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 41722091 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 41722177 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41722273 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41722281 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41722311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41722332 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41722365 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41722372 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41722406 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41722989 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 41723100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41723216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41723404 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 41723985 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 41724269 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 41724386 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41724451 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 41724476 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41724492 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 41724752 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 41724791 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 41724931 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41725090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41725098 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41725444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41725763 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 41725772 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 41726032 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41726177 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 41726227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41726228 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41726804 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 41726903 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41726995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41727030 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 41727097 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 41727263 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 41727363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41727380 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41727383 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 41727395 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 41727465 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41727649 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41727652 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 41727656 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 41727748 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 41727845 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 41727850 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 41727851 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 41728058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41728096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41728159 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41728199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41728294 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41728348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41728396 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41729036 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 41729062 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 41729072 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 41729524 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 41730061 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41730111 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 41730361 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41730557 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 41730671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41730708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41730741 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41731130 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 41731780 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41731979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41732107 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 41732108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41732116 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 41732436 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 41732567 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41732636 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 41732866 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41732977 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 41733540 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 41734106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41734108 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 41734281 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 41734501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41734941 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41735064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41739366 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41740027 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41740405 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41740410 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41740422 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41740495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41740636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41740774 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 41740795 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 41741342 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 41742554 T G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 41742575 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 41742712 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41742975 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 41743043 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 41743045 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 41743294 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 41744213 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41746762 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41747762 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41748328 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 41748741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41750087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41750306 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41750639 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 41750659 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 41750775 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 41751788 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 41752392 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 41752660 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 41752668 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 41752768 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 41752770 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 41752797 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 41752867 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 19 41752882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41753001 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 41753011 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41753043 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41753152 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41753348 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 41753515 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41753608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41753626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41753637 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 41753803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41754188 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41754345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41754599 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 41755594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41755633 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 41756744 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 41756859 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 41756888 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41756921 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41757063 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 41757114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41757168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41757179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41757244 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41757335 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41757625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41757879 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 41757921 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 41757939 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41758024 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 41758029 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 41758207 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 41758266 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 41758382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41758452 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 41758513 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 41758516 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 41758517 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 41758698 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41759084 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 41759347 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 41759800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41760001 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41760303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41760404 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 41760480 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 41760818 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41760854 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 41761080 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 41761168 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 41761170 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 41761186 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 41761196 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 41761442 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 41761518 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 41761799 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41762254 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41762399 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 41762470 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 41762593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41762701 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 41762740 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 41763219 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41763536 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 41763589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41763840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41763995 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41764044 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 41764065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41764229 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41764517 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41764894 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41766203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41766389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41767295 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 41767314 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41767724 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41768641 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41768706 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41770921 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 41771096 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 41771124 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 41771363 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 41771364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41771420 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41771678 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 41771734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41776102 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41776744 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 41777705 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41780923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41780947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41783775 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 41784165 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 41784376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41785001 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41786432 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 41788226 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41788905 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41788935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41789008 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 41789069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41789526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41790445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41791085 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41791734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41791875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41792293 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 41792588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41792695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41793044 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 41793117 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 41793284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41793349 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41793363 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41793582 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41793635 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41793701 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 41793705 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 41793775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41794262 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41794461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41794842 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 41794973 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 41795004 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 41795775 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41795806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41795808 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41795823 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 41795905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41796102 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 41796107 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41796135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41796228 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 41796969 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41797080 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41797165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41797465 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41797469 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41797470 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41797500 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41797547 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41797555 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41798292 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 41798810 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41799867 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41800948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41800950 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41801331 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 41801523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41801754 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41802582 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 41802712 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41802802 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 41802834 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 41802850 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 41802862 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41802986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41803423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41803536 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 41803647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41805224 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 41805688 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41805692 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41806121 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41806615 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 41806723 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41807242 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 41807371 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41807385 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 41807537 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 41807676 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 41808578 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41808933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41810669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41811289 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 41811636 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41811983 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41813922 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 41815076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41815616 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41818988 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41819853 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41820354 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41820961 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 41821035 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41821118 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41821795 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41822438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41822844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41822845 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41822918 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41822946 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41822947 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41823071 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 41823111 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 41823192 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41823308 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 41823753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41823772 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41823774 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 41823778 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 41823987 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 41824327 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 41826078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41827066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41827432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41827443 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41827613 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 41827838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41828290 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41830041 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 41830926 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 41831941 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41832528 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 41833720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41835909 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 41836102 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 41836112 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 41836331 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41836384 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41836440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41836596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41837860 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 41838736 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41838748 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41838800 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41839033 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 41839228 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 41839375 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41839378 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41839388 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41839468 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41839481 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 41839593 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 41839696 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41839710 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 19 41839753 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41839852 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 41840225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41840663 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 41841245 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41841992 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41842223 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41842464 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 41842493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41842601 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 41842741 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41842955 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 41845736 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41845839 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41848759 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 41848992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41849133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41849181 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 41849184 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41849391 G C N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 19 41849538 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 19 41849668 C A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 19 41849732 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 41849751 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41850140 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41850661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41851650 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41852923 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41853891 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41854232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41854475 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 41854598 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 41854627 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 41854648 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 41854813 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 41854830 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 41854872 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 41854963 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 41854968 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 41855040 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 41855144 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 41855149 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 41855152 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 41855178 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 41855359 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41855378 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41856018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41856108 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 41856126 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41856301 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 41856504 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 41856545 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 41856550 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 41856596 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 41856625 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 41856714 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 41856744 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41856869 G T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 19 41856889 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 41857022 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 41857049 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41857166 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 41857174 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 41857511 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 19 41857555 G C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 41857558 A C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 19 41857616 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 19 41857708 G A N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 19 41857716 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 19 41857721 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 19 41857779 C A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 19 41857804 C T N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.0714285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 11 17 1 9 4 19 41857930 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 41857946 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 41858196 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 41858278 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 41858360 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 41859087 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 41859268 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 41860372 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 41860461 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 41860583 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 41860715 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 41860756 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41862381 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41862938 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41867215 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 41867318 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41867966 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41869661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41872326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41873078 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 41874895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41876222 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 41876238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41876987 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 41877332 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41877497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41878008 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 41879619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41881046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41882533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41882573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41882786 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 41882958 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 41886732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41887083 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41889166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41890103 C T Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 41890327 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 41891828 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 41891868 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 41891953 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 41892141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41892437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41892443 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41892458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41892858 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41892886 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 41892960 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 41893018 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 41893059 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 41893705 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 41895059 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41895921 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 41898087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41898323 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41900284 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41902650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41903008 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 41903042 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41903094 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41904047 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41904051 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41905509 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41905531 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41905794 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41911210 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 41911957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41912547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41913337 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41913652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41913953 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41914512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41914841 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 41915034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41919003 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41921622 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41923127 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41924275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41925337 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41925437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41925454 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41926740 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41927898 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41931860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41933716 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41935924 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41936282 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41936730 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 41936805 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41936981 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41937297 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41937298 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41937928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41940242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41940382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41942474 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 41942499 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41943045 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41945275 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41946736 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 41947898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41949199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41949204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41950907 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41951225 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41951649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41952090 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41952302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41952465 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41956038 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41957032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41958901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41959562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41960130 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41960280 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 41961193 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 41961214 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 41961260 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 41961670 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 41961758 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 41961954 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 41964874 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 41965077 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 41965191 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 41965338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41966601 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 41966679 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 41967313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41967347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41967626 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41967771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41968071 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 41968079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41969022 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41969078 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41969094 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 41969695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41971245 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 41975472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41975473 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 41975916 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41977776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41979343 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 41981573 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41981632 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 41983052 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41983267 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41983471 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 41984497 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41984503 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41987015 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 41989300 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 41990397 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41990908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41993751 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 41994016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41994367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41996756 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 41996958 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 41997537 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41997912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41998321 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 41998706 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41999033 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 41999487 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 41999503 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 41999875 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 42002056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42002622 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42002942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42003181 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42003365 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 42003845 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42004134 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 42004211 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 42004308 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 42004700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42004835 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42004903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42005052 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42005113 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 42005193 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 42005577 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 42005738 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 42005757 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 42005775 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 42005777 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 42005786 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 42005819 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 42005930 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42005976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42005981 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 42006045 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 42006215 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42006912 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42007485 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42008631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42009683 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42012103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42012437 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42013605 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 42014894 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 42015885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42017166 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42019505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42022297 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42026286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42027908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42027965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42028154 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42028402 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42028595 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42029483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42029714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42030173 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42031854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42033770 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42035096 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42035161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42036622 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42036653 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42036840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42038238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42038484 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42038828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42042939 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42043342 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 42044028 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 42044321 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42046386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42047109 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42047444 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 42048002 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42048357 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42048732 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 42049183 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42049184 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 42049398 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 42049704 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42051963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42053282 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42058644 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42059927 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42060014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42060986 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42060999 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42061304 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42064787 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 42064822 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 42067475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42067755 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42070104 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42071548 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 42072147 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42073498 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 42073799 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42074169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42075564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42075659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42076541 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42076824 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 19 42077228 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42077319 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42077332 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42077343 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42077590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42077743 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42078083 G C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 19 42078670 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42081303 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 42081341 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 42081748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42082083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42082642 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42082644 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 42082780 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 42082952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42083525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42083543 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 42084380 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42084438 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42084447 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42084490 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42084689 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42084722 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42084762 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42084872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42085224 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42085550 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42085965 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42085981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42086161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42086401 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42087585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42089784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42089786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42089833 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42089886 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42089981 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 42090299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42090382 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42090880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42091107 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42092168 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42092650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42092877 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 42092984 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42093640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42094404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42094768 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42095389 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 42095458 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 42095872 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42096048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42099689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42100081 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 19 42100179 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42105010 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42105016 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 42105524 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42106028 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42107522 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 42109800 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 42110051 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 19 42111066 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42111187 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 42111411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42111451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42111597 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 19 42111600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42111619 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 42111758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42111991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42112067 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42112435 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42112976 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42113928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42113985 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42114627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42114651 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42114711 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 42114745 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 19 42114789 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 19 42114813 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 42116763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42117264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42118147 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42118308 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 19 42118748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42118865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42119334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42120003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42120089 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42121464 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42121535 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 42121547 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 19 42121637 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 19 42121790 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 19 42121852 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 19 42122150 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 19 42122243 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 19 42122317 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42122387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42122912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42123014 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 42123421 T A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 42123445 C T Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.588235294117647 0.117647058823529 0.294117647058824 22 12 10 2 5 19 42123446 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 42124080 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 19 42124111 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42124339 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42124530 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 42124803 T C N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 19 42124876 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42124979 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 42125009 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 42125056 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 42125346 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42125694 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 42125698 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 42126207 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 42126573 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 42127858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42128287 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 42128349 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 42128414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42128417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42128479 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 42128597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42128671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42128706 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42128735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42128792 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42128827 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 42129457 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 42129619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42130481 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42131561 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42131602 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 42131856 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 19 42132105 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 42132176 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 42132184 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 42132387 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 42132399 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 42132431 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 42132462 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 42132648 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 42132808 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 19 42132872 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 42132968 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 42132975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42133113 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 42133313 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 42133348 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 42133386 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 42133430 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42133439 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 42133542 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 42133579 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 42133945 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 42133972 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 42134427 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 42134549 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 42134797 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 42134824 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 42135005 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 42135350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42135608 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 42135683 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42135690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42136084 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42136563 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 19 42136594 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 19 42136609 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 42136680 T G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 19 42136740 G C Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 19 42137134 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 42137989 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 42137990 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 42138613 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 42138643 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 19 42139364 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42139422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42139534 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42139545 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 42139588 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42140514 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 42140808 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42141192 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 42141557 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42141695 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 42141810 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 42141925 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42142004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42142155 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 42142170 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 42142337 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42142673 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 42142882 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 42142914 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 42143169 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 42143866 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42144601 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 42144692 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42144867 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 42144942 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 42144946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42144955 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 42145130 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 42145643 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 42145774 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 42145843 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 42145845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42146300 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42147944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42148159 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42148542 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 42148554 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 42149112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42149812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42150702 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42150717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42151247 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 42152683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42153677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42154256 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42154257 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42155127 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 42155550 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 42156203 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 42156993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42157859 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 42157916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42157934 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42157948 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42157991 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42157992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42158009 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 42158053 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 42158426 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 42158439 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 42158442 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 42158530 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 19 42158621 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 42158639 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 42158944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42159170 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 42159304 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42159721 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42160183 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42160206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42160208 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42161249 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42161696 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42161849 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 42162447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42162558 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 42162747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42162887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42163178 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 42163831 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 42163943 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 42164430 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 42164525 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 19 42164798 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 19 42166260 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 19 42166515 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 42166546 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 42166787 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42166789 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 19 42166864 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 42166979 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 19 42167116 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 42167337 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 42167354 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42167479 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 42167645 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 19 42167682 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 42167697 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 42167700 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 42167714 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 42167733 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 42167809 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 42168052 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 42168188 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 42168948 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42169082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42169094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42169121 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 19 42169554 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 42169646 C A N N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.272727272727273 0.272727272727273 0.454545454545455 9 13 3 3 5 19 42169786 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 19 42169918 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 42169955 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42169996 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 42170099 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 42170788 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 42170871 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 42170927 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 42171255 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 42171311 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 42171312 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 42171447 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 42172496 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 42172583 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 42172616 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 42172665 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 42172684 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 42172725 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 42172737 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42172740 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 42172792 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42173169 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 42173341 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 42173619 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 42173794 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 42174054 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 42174136 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 42174226 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 19 42174521 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 42174654 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 42174926 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 42174940 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 42175004 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 42175210 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 42175228 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 42175426 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 42175578 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 42175579 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42175855 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 19 42176073 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 42176464 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.411764705882353 0.117647058823529 0.470588235294118 16 18 7 2 8 19 42176599 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.352941176470588 0.117647058823529 0.529411764705882 14 20 6 2 9 19 42176833 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 42176980 G A Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 19 42177116 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 19 42177175 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 42177229 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 19 42177244 A T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 19 42177311 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 19 42177349 A T N N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.363636363636364 0.181818181818182 0.454545454545455 10 12 4 2 5 19 42177603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42177652 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42177821 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 42177850 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 42177863 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 42177908 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 42178163 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 42178354 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42178465 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 42178541 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 42178769 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 42178770 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42178884 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 42179039 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42179392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42179649 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 42179699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42179727 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 42180104 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42180238 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42180372 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 42182226 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42182260 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 42182526 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42182672 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 42182675 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 42182701 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42182754 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42182945 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 42183156 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42183179 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42183658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42184381 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 42184541 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42184803 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 42184908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42184960 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 42185025 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42185144 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 42185290 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 19 42185313 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 42185432 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42185447 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 19 42185448 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 19 42185462 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 42185471 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 19 42185522 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 19 42185561 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 19 42185562 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 19 42185571 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 19 42185700 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42186050 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 42186149 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 42186262 T A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 19 42186271 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 19 42186296 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 8 10 3 2 4 19 42187078 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 42187654 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42187684 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42187768 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 42187823 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 42188060 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 42188555 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 42188577 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 42188615 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 42188644 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 42188883 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42188926 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 19 42189449 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 42189667 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 42189768 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42190030 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 42190051 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 42190183 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 42190267 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 42190273 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 42191093 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 42191284 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 42191393 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42191562 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 42191901 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 42192446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42192454 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 42192571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42192597 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 42192608 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 42192703 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 42192809 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 42193087 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 42193280 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 42193446 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 42193450 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 42193575 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 42193876 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 42193885 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 42194009 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 42194106 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 42194375 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 42194925 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 42195040 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 19 42195113 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 42195148 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 42195209 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42195471 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42195541 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42195636 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42195859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42195935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42197371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42198836 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42198861 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 42199049 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42199267 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 42199333 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42199703 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 42199827 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 42200301 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 42203372 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42203385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42204518 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 42209129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42209358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42210409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42211435 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 42211492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42211495 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42211520 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 42211533 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42212283 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42212499 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 42213266 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 42213801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42218260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42223305 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 42223373 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 42223426 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 42223552 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 42223768 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 42223785 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 42223802 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 42223824 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 42223878 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 42224268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42224457 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42224623 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42224855 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 42224858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42225504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42225869 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 42225870 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 42225872 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 42225882 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 42226024 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 42226045 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 42226100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42226105 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 42226139 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 42226233 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 42227025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42227209 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42227579 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 42228166 A C N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 19 42228254 A G Y Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 19 42228255 C T Y Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 19 42228260 A C Y N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 19 42228901 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 42228934 G A Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 19 42229116 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 42229136 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 19 42229834 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 19 42229873 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 42230361 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 42230398 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 42230445 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 42230571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42230587 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 42230765 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 42230811 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 42230856 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 42230885 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 42231077 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 42231113 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 42231203 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 42231209 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 42231227 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 19 42231424 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 42231970 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 42231973 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 42232002 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 19 42232158 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 42232207 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42232216 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 42232321 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 19 42232448 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 42232465 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 42232559 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 42232575 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 42232591 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 42232698 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 42233684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42233829 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42233835 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42233986 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.4375 0 0.5625 14 18 7 0 9 19 42233991 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.4 0 0.6 12 18 6 0 9 19 42234262 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 42234451 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 19 42234475 C G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 42235377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42235829 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42237136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42237657 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 19 42240375 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42241429 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42242013 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 42242087 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42242262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42242473 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42242525 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42242633 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 42242644 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 42242645 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 42243446 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 42243653 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42243729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42243892 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42243967 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42244028 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42244753 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42244890 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 42244900 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42244928 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 42244957 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42245243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42245356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42245839 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42245854 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42246112 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42247033 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42247071 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 42247084 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 42247243 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42247289 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 42247965 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42248133 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 42248275 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 42248280 G T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 42248286 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 42248327 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42248944 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42248955 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42248957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42249966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42255900 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 42258994 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42259202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42259669 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 42259687 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42259982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42261397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42263134 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 42263371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42263651 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42263712 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 42263833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42264053 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 42264852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42266248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42267048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42267070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42267314 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42267806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42270314 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 42270632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42270741 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42271401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42271497 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42271736 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42271884 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42271895 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 42271972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42272260 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42272289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42272320 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 42272417 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42272433 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 42272444 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42272541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42272640 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42272711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42272723 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42273099 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 42273118 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42273247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42273358 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42273750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42273792 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42274007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42274026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42274053 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42274168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42274240 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42274250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42274305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42274539 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42274703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42275844 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 42277424 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 42277450 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 42277464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42277486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42277679 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 42277731 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 42277929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42278002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42278072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42278075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42278085 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 42278165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42278322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42278351 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42278550 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42279069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42279380 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 42279496 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42279621 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42279834 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 42279934 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42280033 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42280128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42280246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42280423 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42280777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42280786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42280789 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 42280847 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42280997 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 42281052 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42281066 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42281135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42281218 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42281230 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42281250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42281315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42281338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42281382 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42281401 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42281427 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42281615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42281665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42281674 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42281728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42281754 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42282312 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42282646 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42284727 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42284769 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42284818 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 42284935 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 42285090 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42285124 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42285159 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42285734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42285758 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 42285840 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 42285960 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42286116 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42286477 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 42286797 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42287009 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42287064 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42287355 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 42287356 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 42287531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42287607 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42287701 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42287854 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 42287906 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 42288054 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42288107 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42288505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42288741 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 42289602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42289716 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42290992 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 42291533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42292984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42293028 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42293047 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42293076 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 42293104 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 42293146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42293678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42293927 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 42294207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42294368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42294729 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 42294795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42294995 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42295108 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 42295187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42295189 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 42295225 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42295292 G T Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 42295863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42295931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42296012 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42296013 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 42296384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42296401 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 42296528 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 42296533 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 42296618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42296636 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42296692 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 42297132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42297247 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 42297769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42297782 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42297958 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42298057 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42298099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42298148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42298769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42298825 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42298966 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42299412 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 42300128 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42300905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42303751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42309458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42309956 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 42310698 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 42310757 A C Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 42310768 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 42310784 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42310888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42311259 A T Y N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 6 12 2 2 5 19 42311492 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 42311608 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 42311822 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 42311882 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42312691 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 42312927 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 42313203 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 42313365 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 42313406 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 42313551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42313560 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 42313691 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42313694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42313738 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 42313850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42314011 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 42314072 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 42314119 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 42314217 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 42314549 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 42314660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42315756 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42316639 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42317452 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42317991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42318195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42319072 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42322151 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42322504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42322957 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 42324505 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 42324831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42325902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42326410 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42326427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42326970 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42328448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42328510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42330708 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42332731 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42332752 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42334542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42334543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42334690 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42334834 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 42334890 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 42335010 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42335074 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42335611 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 42336585 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 42336697 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 42336907 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 42337318 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 42337607 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 42337621 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 42337860 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 42340927 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42341397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42341591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42341957 A T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 42342197 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42342211 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 42342302 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 42342511 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 42342581 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42342819 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42343397 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42347367 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 42349613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42350562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42350668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42350952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42351881 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42352211 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 42352363 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 42352395 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 42352407 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 42352421 T A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 42352447 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 42352548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42352622 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 42352911 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 42352950 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 42352958 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 42353000 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 42353602 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42355608 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42356931 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 42357452 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 42357719 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 42358449 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42358491 G T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 42358494 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 42358499 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 42358629 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 42359749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42359873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42360370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42360413 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 42360533 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 42360608 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 42360657 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 42360756 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 42361271 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 42362635 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 42363019 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42363809 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42364108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42364230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42364646 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 42364647 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 42364656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42364731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42364896 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42365117 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 42365239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42365350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42366401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42366443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42366662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42366943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42367153 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 42367641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42368010 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 42368029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42368041 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 42368208 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 42368303 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42368313 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 42368368 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 42368458 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42369107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42369611 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42369612 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42369831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42369852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42369967 A T Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 42369987 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42370046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42370215 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42370406 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42370495 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 42370504 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42370723 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 42370739 T A Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 42371001 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 42371018 A T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 42371289 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42371290 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42371470 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 42371486 T G Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 42371875 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42372404 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 42372423 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 42372675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42372683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42372715 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 42372848 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 42372966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42373000 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 42373056 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 42373110 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42373276 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 42373301 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 42373316 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 42373355 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 42373518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42373531 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 42373627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42373749 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 42374116 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42374297 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42374513 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 42374620 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 42374628 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 42374654 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 42374905 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42375299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42375946 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 42376016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42376123 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 42376284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42376400 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42376420 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42376580 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 42376828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42377076 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42377154 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 42377188 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 42377212 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 42377240 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 42377519 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 42377556 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 42378094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42378494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42378530 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42378786 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42379226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42380692 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 42380705 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 42381020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42381042 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42381058 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 42381215 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 42381633 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42382195 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42383528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42384256 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42385056 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 42385095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42385454 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42385891 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42386364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42389244 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 42389370 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42390096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42392056 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 42393960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42394346 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 42396027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42396606 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42397534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42397823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42397824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42398588 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 42398609 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 42398639 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42398713 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42398796 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42400222 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42400279 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 42400616 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 42400751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42400777 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42400869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42401001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42401012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42401128 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 42401281 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42401378 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42402122 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42402619 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42403071 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42403737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42404001 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 19 42404451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42404553 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 42406103 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42406928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42407050 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 42407165 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 42407179 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42407334 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 42407408 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 42407617 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 42407748 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42408325 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42408326 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42408695 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42408729 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42408984 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 42409336 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 42409592 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 42409671 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42409796 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42410197 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 42410659 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42410865 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 42410958 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42410999 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 42411000 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 42411034 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42411106 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 42411233 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42411254 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 42411362 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 42411373 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 42411470 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 42411482 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42411516 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 42411529 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 42411626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42411670 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 42411850 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42412624 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42412834 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 42412845 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42414394 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 42414395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42414498 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42414542 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 42414756 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42414773 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42415070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42415073 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 42415355 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 42415991 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 42416030 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 42416062 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 42416185 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 42416881 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 42416999 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 42417032 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 42417164 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 42417230 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 42417234 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 42417275 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 42417329 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 42417359 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 42417473 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 42417969 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 42418007 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 42418191 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42418370 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42418415 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42419060 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 42419067 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 42419158 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42419323 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 42419774 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 42419849 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 42420204 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42420237 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42425097 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42425129 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42425275 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 42425291 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42425361 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42425429 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 42425443 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 42425484 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42425654 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42425892 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 42425982 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 42426076 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 42426210 G A N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.285714285714286 0.642857142857143 0.0714285714285714 17 11 4 9 1 19 42426833 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42427534 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 42428187 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 42428213 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 42428231 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 42428380 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 42428502 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 42428976 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 42429171 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 42429339 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 42430146 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 42430727 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 42431076 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42431123 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 42431401 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 42431966 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 42433125 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42433432 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 42433870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42433928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42434226 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42434270 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42434590 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 19 42434705 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 19 42434827 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 42434830 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 42434831 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 42434873 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 42434942 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 42434970 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 42435582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42435695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42436421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42436910 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42436962 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 42438385 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42438578 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 19 42438754 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 42438768 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 19 42438813 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42438824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42438994 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42439633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42439944 T G N N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 19 42439961 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 19 42440234 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 42440511 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42440726 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 42441021 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 42441086 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42441234 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42441342 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 42441380 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 42441407 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 42441435 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42441595 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 42441681 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 42441786 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42441788 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42441805 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 42441817 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42442003 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42442309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42442548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42442871 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42442921 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42443012 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42443105 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 42443120 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 42443729 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 42443740 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 42443764 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 42443767 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 42443858 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 42444092 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 42444111 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 42444115 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 42444342 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 42444403 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 42444431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42444483 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 42445087 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42445131 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 42445252 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42445324 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42445460 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42445605 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42446942 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 42446978 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42447098 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 42447250 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 42447319 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42447490 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 42447573 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 42447733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42448088 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 42449188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42451995 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42455768 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 42455942 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42456432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42456439 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42456702 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 42456871 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42457073 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42457464 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42457619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42457781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42457875 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 42457890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42457893 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 42457965 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 42457974 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 42458077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42458235 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 42458313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42458397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42458691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42458728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42458747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42459300 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 42459397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42459422 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 42459441 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42459550 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42459578 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42459581 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42459590 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 42459736 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 42461897 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 42462328 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42462431 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42463526 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 42463736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42464621 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 42464900 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 19 42464968 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 42464985 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 42465255 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 42465308 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 42465395 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 42465654 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 42465710 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 42465831 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42465952 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 42466380 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 42466704 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 19 42466752 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42467046 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42467057 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 42467086 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 19 42467125 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 42467383 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 42467590 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 42467659 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 19 42467673 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 42467704 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 42467748 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 19 42467791 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 19 42467822 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 42467921 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 19 42468097 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 42468339 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 19 42468471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42468539 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 42468559 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 42468911 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42468931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42469090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42469358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42469584 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42469704 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42470355 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.333333333333333 23 13 11 1 6 19 42470683 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 19 42470903 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 42470912 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 42470913 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 42471311 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42471842 C A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 10 22 4 2 10 19 42472252 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42472814 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 19 42473027 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 42473085 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42473289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42474247 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 42474723 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 19 42474829 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 19 42474834 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 19 42475169 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 42475236 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 42475516 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 42475569 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 42475774 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 42476063 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 19 42476099 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.315789473684211 0.105263157894737 0.578947368421053 14 24 6 2 11 19 42476342 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 42476417 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 19 42476439 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.315789473684211 0.105263157894737 0.578947368421053 14 24 6 2 11 19 42476491 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 14 22 6 2 10 19 42476595 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 42476831 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 42477005 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 19 42477064 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 19 42477092 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 19 42477129 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.578947368421053 0.105263157894737 0.315789473684211 24 14 11 2 6 19 42477187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42477210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42477648 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 42478098 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 19 42478145 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 42478541 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 19 42478686 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 19 42478696 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 19 42478697 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 19 42478762 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 19 42478778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42480301 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 26 14 12 2 6 19 42480757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42480829 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 42480912 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 42481025 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.277777777777778 0.0555555555555556 0.666666666666667 11 25 5 1 12 19 42481566 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42482997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42483377 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 42483796 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 19 42484140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42484210 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42484345 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42484352 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42484358 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 19 42484803 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42484997 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 19 42485416 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 19 42486007 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 42486144 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.578947368421053 0.105263157894737 0.315789473684211 24 14 11 2 6 19 42486166 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.578947368421053 0.105263157894737 0.315789473684211 24 14 11 2 6 19 42486198 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42486312 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42486345 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 26 14 12 2 6 19 42486433 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 26 14 12 2 6 19 42486593 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5625 0.125 0.3125 20 12 9 2 5 19 42486597 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42486611 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 42486664 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42486796 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.611111111111111 0.111111111111111 0.277777777777778 24 12 11 2 5 19 42486841 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42486874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42486883 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42486891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42486907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42486910 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42486991 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42487146 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42487411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42487881 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42487924 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42488223 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 26 14 12 2 6 19 42488265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42488284 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.578947368421053 0.105263157894737 0.315789473684211 24 14 11 2 6 19 42488913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42490124 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 42490397 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 42491419 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 42491563 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 42491856 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42492051 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 42492052 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 42492053 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 42492071 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42492341 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42492342 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42492823 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 42492859 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42492909 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 42492926 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 42492997 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 42493516 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 42494130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42494137 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 42494213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42494795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42494921 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42494926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42494935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42494967 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42495086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42495535 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 42495654 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 42495833 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 42496033 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42496037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42496067 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 42496099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42496139 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 42496191 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 42496826 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 42496998 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 42497134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42497350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42497443 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42497466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42497499 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42497575 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 42497614 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 42497615 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 42497721 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 42497750 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 42497968 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 42498048 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 42498255 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 42498483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42498872 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 42499003 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42499161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42499201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42499257 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42499761 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42499772 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 42500516 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 42500808 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 42501192 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42501292 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 19 42501589 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 42501818 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 42501933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42502662 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 19 42502778 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 42502903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42503057 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 19 42503142 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 42503907 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 42504667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42504847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42505067 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 42505134 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42505167 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42505539 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42505926 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42505980 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42506050 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 42506192 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 42508183 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 42508259 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 42508530 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 42509016 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42509610 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42509695 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42509772 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42509779 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 19 42509785 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 42509795 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 42514201 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42514859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42515436 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42516645 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42518038 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42518695 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42519539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42520534 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 42520596 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 42521805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42522005 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 42522017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42522300 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 42522362 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 42522429 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 42523161 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42523410 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 42523832 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 42524216 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42525296 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42525602 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 42526033 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42526166 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 42526245 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42526342 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42526490 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 42526569 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 42526581 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42526619 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 42526697 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42527108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42527454 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 42527944 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 42528371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42528849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42529775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42530169 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 42530873 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42530877 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 42531135 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 42531534 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 42531592 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 42532034 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 42532436 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42532489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42532533 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 19 42532567 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42532597 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42532659 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42532892 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42532924 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42533008 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42533158 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42533964 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 42534172 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 42534173 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42534267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42534336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42535527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42536056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42536668 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 42536767 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 42536961 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 42537342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42537343 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42539214 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 42540992 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 42543994 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42544984 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42545701 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 42546782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42547169 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42547693 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42547694 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42547698 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42547841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42548170 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 42548419 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 42548789 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42548970 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42549011 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 42550013 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 42550122 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42550591 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 42551232 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42551251 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 42551455 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 42551486 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 42551803 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42552081 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42552254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42552256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42552300 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 42552823 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42552865 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 42553187 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 42553696 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 42553778 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 42554158 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42554163 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42554194 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42554206 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42554279 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42554593 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42554799 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 42554934 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42555083 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 42555348 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42555540 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 42555754 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 42555812 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 42555948 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 42556327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42556353 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42557520 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42557593 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42558912 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 42559816 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42560871 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42564826 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 19 42565125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42565255 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42566773 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42567976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42568146 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 42569704 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 42570888 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42575433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42575446 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42575460 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42576086 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 42576090 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42576126 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42577329 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 42577535 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42577886 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42578254 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42580830 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 42581865 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 42582301 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 42582592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42582638 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 42583004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42583172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42583430 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42583947 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42584157 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 42585322 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 42585555 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 42585634 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 42585638 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 42585697 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 42585804 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 42585821 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 42586228 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 42586436 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42586447 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 42586921 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 42587335 A C Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 42587681 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42587792 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 42588385 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 42588515 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42589002 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 42589213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42589232 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 42589481 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 42589686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42590217 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 42590257 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 42590594 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 42590647 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 42590877 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42591334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42591376 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42591410 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 42591533 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 42592029 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 42592500 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 42592551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42593081 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42593126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42593164 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 42593320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42593843 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42594371 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42594372 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42594430 C T Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 42594793 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42595459 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 42595463 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 42595491 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42595814 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42595989 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 42596173 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 42596177 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 42596294 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 42596667 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 42596771 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 19 42596982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42597062 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 42597101 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 42597186 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 42597279 T G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 42597306 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 42597366 A T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 42597862 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 42597898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42597913 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 42598068 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42598142 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 42598301 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 42598411 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 42598571 A G Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 42598673 G C Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 42598909 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 42598914 T A Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 42599009 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 42599031 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 42599094 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 42599136 C T Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 42599139 G A Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 42599525 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 42599583 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 42599600 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 42599640 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 42599641 G C Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 42599681 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 42599717 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 42599775 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 42599887 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 42600200 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 42600231 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 42600384 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 19 42600420 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 42600901 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42601080 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 42601327 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 42601390 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 42601858 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 42601951 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 42602056 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 42603278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42603450 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42603699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42604054 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 42604065 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 42604729 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 42604994 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 19 42605040 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 42605897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42606575 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 42607466 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42607761 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 42608022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42610371 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42610547 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 42610819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42611122 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 42611680 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 42611953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42612292 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42615139 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 42615709 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42615856 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42615912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42615952 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 42615984 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 19 42616837 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42617976 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 42618448 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 42618503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42618871 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 42619760 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42620070 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42620526 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42620606 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 42620977 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 19 42621977 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 42622038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42622123 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42626161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42627778 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 42627906 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 42628039 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42630525 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42630938 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 42631411 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42631412 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42635590 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42636376 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 42637155 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 42637341 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 42638209 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42638816 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 42639305 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42639308 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42639371 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42639377 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42639440 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 42639470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42639534 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 42639544 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 42639594 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 42639629 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 42640151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42640259 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42640323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42640379 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 42640387 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42640421 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42640461 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 42640462 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 42640634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42640829 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42640874 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42640919 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42641008 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 42641214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42641337 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42641521 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 42642159 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42642167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42642276 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 42642634 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42643145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42644730 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 42645220 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 42645719 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42645753 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42646058 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 42646167 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 42646349 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 42646376 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 42646525 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42646610 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42646672 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42646758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42647068 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 42647496 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 42647509 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42647528 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42647680 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42647829 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42648039 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42648148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42648264 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42649014 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 42649716 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 42650210 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42650838 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 42651774 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 42652050 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 42652120 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 42652531 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 42652587 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 42652908 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 42653360 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 42653794 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 19 42653820 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 19 42653885 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 19 42654382 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 42654433 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 42654852 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 42654922 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 19 42655000 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 42655015 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 42656241 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 19 42656393 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 42656491 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 42656531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42656962 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42657160 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42657164 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42657311 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 42657511 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42658152 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42658383 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 42658559 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 42658593 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42658613 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 42659059 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 42659271 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 42659389 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42659425 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 42659817 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42659991 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42660124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42660146 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42660324 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 42660342 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 42660363 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 42660377 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 42660383 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 42660930 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42661084 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42661099 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42661105 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42661162 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42661203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42661531 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42661545 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 42661579 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 42661587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42661613 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42661913 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42662023 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 42662038 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 42662298 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42662307 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42662323 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42662658 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42662673 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42662703 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42662704 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42662849 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 19 42662864 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42662867 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42662918 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 42662998 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 42663043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42663433 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42664088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42664236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42664295 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42664332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42664431 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 42664477 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 42664480 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 42664533 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 42664687 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 42664752 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42664775 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42664779 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42664972 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42665965 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42666006 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42666194 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 42666195 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 42666428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42666541 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42666572 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42666692 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 42666734 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42666981 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 42667179 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42667249 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42667266 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42668948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42668975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42669686 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42670379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42671130 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42671205 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 42671335 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 42671396 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 42671917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42672143 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42672950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42673021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42673852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42673981 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42674100 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42674293 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42674357 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 42674507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42674811 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 42675050 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 42675091 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 42675099 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 42675113 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 42675555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42675573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42675673 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42675839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42675868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42676039 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 42676058 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 42676065 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 42676082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42676354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42676554 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 42676650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42676727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42676870 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42676999 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 42677136 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 42677205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42677249 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42677263 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 42677344 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 42677409 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 42677411 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 42677424 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 42677444 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 42677463 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 42677519 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 42677524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42677546 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 42677589 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 42677590 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 42677912 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 42678090 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 42678166 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 42678177 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 42678186 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 42678276 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 42678577 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 42678587 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 42678606 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 42678834 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 42678920 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 42679234 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 42679259 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 42679539 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 42679540 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 42679896 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 42679908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42679925 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 42679971 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 42680104 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 42680140 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 42680189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42680222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42680257 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42680260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42680478 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 42680480 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42680586 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42680714 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42680785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42681304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42681480 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 42681502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42681555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42681676 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42681947 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42681950 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42682236 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 42682389 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 42682475 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 42682500 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 42682680 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42682907 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 42683099 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42683330 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42683464 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42683482 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 42683513 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 42683530 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42683564 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42683994 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 42684031 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 42684137 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42684176 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42684203 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42684207 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42684217 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42684252 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 42684305 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 42684376 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 42684433 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42684463 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 19 42684576 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 42684606 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 42684610 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 42684699 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 42684800 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 42684918 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 42685237 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 42685603 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 42686104 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 42686537 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 42686620 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42686637 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 42686649 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 42686721 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42686902 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42687112 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42687217 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 42687244 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42687276 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 19 42687456 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42687572 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42688067 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 42688089 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 42688099 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 42688267 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 42688690 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 42688879 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 42688911 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 42688928 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 42689088 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 42689114 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 42689134 A G N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 19 42689171 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 19 42689325 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42689583 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 42689663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42689744 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 42689766 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 19 42689886 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 42689942 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 42690315 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42690566 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42690607 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42691375 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 42692042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42692148 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 42692154 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 42692196 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 42692249 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 42692269 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 19 42692286 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 19 42692434 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 42692443 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 42692657 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42692681 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42692778 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 42692951 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 42692979 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42692986 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42693098 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42693103 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 42693123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42693124 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42693186 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 42693248 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42693434 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 42693510 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 42693520 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42693587 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42693609 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42693818 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 42693868 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 42693906 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 42693921 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 42693998 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 42694276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42694593 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 42694625 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 42694645 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 42694695 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 42694812 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 42695496 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 42695559 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 42695627 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42695645 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 42695740 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42696611 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 42696632 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 42696663 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 42696668 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 42696815 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42696961 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 42697198 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 42697696 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 42698573 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 42698603 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 42698610 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 42698802 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 42699241 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42700056 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42700096 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 42700125 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 42700331 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 42700391 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 42700449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42700478 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 42700667 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 42700870 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42701617 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42701659 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 42702022 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42702039 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42702045 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 42702079 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 42702126 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 42702254 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 42702422 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 42702503 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42702580 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 42702766 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42702781 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42702839 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42702890 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42703024 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 42703191 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 42704024 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42704224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42704463 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 42704477 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42704489 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 42704514 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 42704553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42704559 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42704566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42704695 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 42704914 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 42705034 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42705246 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 42705343 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 42705350 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 19 42705395 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 42705403 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 42705449 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 42705453 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 42705489 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 42705558 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42705609 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 42705727 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 42705844 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 42706697 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 42707148 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 42707166 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42707281 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 42707296 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 42707298 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 42707339 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 42707355 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42707377 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 42707398 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 42707475 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 42707604 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 42707608 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 42707729 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 42707760 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 42707765 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 42707791 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 42707799 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 42707804 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 42708095 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 42708116 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 42708256 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 19 42708263 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 19 42708269 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 19 42708591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42708593 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 42708895 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 42709217 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42709553 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 42709718 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42709736 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42709745 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42709781 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42709782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42709833 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42709995 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42710384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42710704 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42710708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42710911 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42710918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42710948 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42711009 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42711103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42711198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42711354 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 42711357 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42712136 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 42712270 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 42712332 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 42712986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42713223 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42713242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42713440 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42713459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42713472 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42713524 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42713554 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42713867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42714220 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42714355 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42714736 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42714885 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 42715186 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 42715239 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 42715514 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 42715591 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 42715617 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 42715625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42715725 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42715748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42715878 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42716286 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 42716486 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 42716772 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42717225 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 42717444 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 42717512 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42717538 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42717671 T G Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 42717923 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 42718167 G T Y N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 19 42718230 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 42718237 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 42718711 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 42718742 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42718856 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42719300 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 42719659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42719905 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42720552 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 42720591 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42721201 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42721432 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 42721458 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 42721544 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 42721780 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 42721805 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 42721809 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42721896 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42722118 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 42722211 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42724346 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42724440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42724582 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 42724587 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 42724599 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 42724690 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 42724732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42724768 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42724803 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 42724871 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 42725660 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 42725817 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 42725833 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42725849 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 42725868 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 42725892 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 42725970 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 42726029 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 42726052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42726216 T C Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 42726408 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 19 42726695 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 42727141 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42727320 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 42727476 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 42727514 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42727669 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42727908 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 42728090 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 42728226 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 42728262 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 42728290 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 42728292 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 42728310 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 42728336 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 42728436 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 42728489 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 42728501 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 42728549 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 42728598 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 42728630 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 42728657 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 42728680 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42728919 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 42728947 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42728968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42729349 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42729416 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 42729948 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 42730198 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 42730423 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42730480 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42730490 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42730856 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 42730865 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 42730905 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 42730908 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 42730915 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 42730994 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 42731047 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 42731068 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 42731074 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 42731111 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 42731118 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 42731141 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 42731150 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 42731161 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 42731198 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 42731199 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 42731251 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 42731397 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 42731533 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 42731914 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 42731991 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 42732342 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42732599 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 42732716 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 42733057 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 42733371 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 42733511 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 42734364 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 42734641 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 42734718 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 42734735 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 42734961 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42735007 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 42735091 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 42735230 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42735294 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 42735398 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 42735407 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42735413 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 42735531 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 42735601 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 42735635 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 42735650 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 42735668 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 42736037 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42736057 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 42736166 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42736167 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 42736322 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42736515 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 42736545 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42736771 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 42736927 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42736928 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42736951 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42737003 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42737176 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42737237 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 42737260 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 42737319 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 42737333 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42737351 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42737448 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 42737481 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 42737729 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 42737753 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 42737769 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 42737894 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 42737921 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 42738058 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 42738065 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 42738071 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42738096 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 42738122 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 42738152 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 42738244 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 42738272 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 42738292 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 42738334 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 42738802 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 42739208 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 42739282 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 42739325 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 42739337 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 42739371 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 42739514 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 42739969 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42740012 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42740065 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 42740466 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42740631 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 42740696 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 42740797 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 42740919 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 42741170 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 42741198 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 42741199 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 42741508 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 42741525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42741536 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 42741578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42741590 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 42741601 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 42741618 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 42741737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42741836 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 42742040 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 42742167 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 42742251 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 42742293 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42742299 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 42742473 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 42742492 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42742523 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 42742593 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 42742786 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 42742819 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42742854 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42742877 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 42742906 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42742971 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42743012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42743038 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42743115 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42743160 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42743261 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42743319 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42743391 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42743400 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 42743467 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42743559 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 42743657 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 42743679 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 42743707 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 42743753 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 42743817 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 42744537 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42744560 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 42744581 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42744592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42744625 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 42745568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42745825 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42746058 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42746129 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42746261 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 42746290 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 42746311 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42746804 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 42746885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42746952 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42746992 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 42747288 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.35 0.1 0.55 16 24 7 2 11 19 42747446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42748037 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 19 42748479 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 42748513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42748563 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42748576 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 42748645 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 42748832 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 42749024 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 42749212 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 42749213 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42749260 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 42749276 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 42749293 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 42749655 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 42749673 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 42749860 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 42750072 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 42750093 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 42750380 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 19 42750521 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 42750572 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 42750716 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 42750796 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42750915 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42751158 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42751242 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 42751293 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 42751325 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42751360 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 42751376 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 42751420 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 42751689 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 42751696 C A Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 42751728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42751768 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 42751912 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 42752346 A C Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 42752710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42752799 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 42752809 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 42753033 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42753122 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 42753356 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42753469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42753754 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 42753760 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42753762 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 42753782 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42753850 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 42753873 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 42753977 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 42754184 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 42754263 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 42754318 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 42754359 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42754407 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42754433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42754441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42754481 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42754605 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 42754642 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 42754682 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 42754750 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42754913 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 42754926 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 42754927 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 42754937 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 42755018 C A N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 19 42755166 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 42755345 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 42755565 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42755568 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 42755695 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 42755762 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 42755833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42756034 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 42756115 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 42756145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42756245 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 42756297 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 42756313 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 19 42756334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42756384 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.315789473684211 0.105263157894737 0.578947368421053 14 24 6 2 11 19 42756404 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 42756414 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 19 42756507 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 19 42756700 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 42756732 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 42756909 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 42757008 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 42757023 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42757033 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 42757046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42757217 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42757488 T G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 19 42757526 A C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 19 42757562 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42757606 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 42757648 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 42758034 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 42758213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42758245 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 42758513 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 42758562 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42758609 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 42758613 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 42758626 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 42758673 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 42758685 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 42758805 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 42759327 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 42759341 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 42759351 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 42759819 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42760290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42760535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42760641 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 42761519 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42761535 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42761707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42761751 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42761759 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 42761776 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 42761790 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 42761844 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 42761847 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 42761884 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42761913 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42761919 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 42761938 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 42762424 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 42762477 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 19 42762483 G A N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 19 42762500 T A N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 19 42762822 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 19 42762857 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 42762887 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 42762919 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 42763038 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 42763083 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 42763118 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 42763181 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 42763288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42763301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42763314 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 42763530 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42763641 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.375 0.125 0.5 14 18 6 2 8 19 42763659 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 42763840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42763990 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 42764014 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 42764131 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42764167 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 19 42764187 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42764506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42764560 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42764650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42764714 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 42764732 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 42764738 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 42764761 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 42764762 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 42764774 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 42765123 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 42765758 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 42765805 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 42765867 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 42765880 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 42766017 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 42766149 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42766420 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 42766582 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 42766601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42766657 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42767050 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 42767080 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 42767147 C T N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 19 42767472 T A N N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 19 42767476 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 19 42767496 A G N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 19 42767545 T C N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 19 42767548 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 42767620 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 42767637 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 42767644 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42767663 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 42767672 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 42767725 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 42767759 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 42767764 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 42767767 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 42767798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42767939 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 42767940 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42768079 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42768100 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 42768287 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 42768308 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 42768336 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 42768419 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42768468 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 42768520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42768522 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42768552 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42768580 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42768603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42768671 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42768779 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 42768893 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42768926 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 42768932 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 42769154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42769183 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42769218 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42769311 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42769356 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42769395 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 42769476 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 42769689 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42769749 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 42769922 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 42770021 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 42770083 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 42770134 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 42770186 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 42770345 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42770990 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42771357 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 42771405 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42771410 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42771445 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 42771462 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 42771503 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42771509 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42771599 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42771657 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42771859 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 42771948 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42772085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42772235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42772250 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 42772306 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42772318 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42772378 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 42773451 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 42773531 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42773618 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 42774191 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42774231 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 42774277 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 42774562 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 42774836 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 42774896 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 42774952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42775257 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 42775338 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 42775355 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 42775370 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42775376 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42775509 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 42775604 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 42777028 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42777534 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 42777538 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 42777560 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 42777707 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42777774 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 42777964 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 42778036 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 42778075 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 42778096 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 42778128 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 42779121 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42779286 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 42779464 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 42779494 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 42779626 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 42780425 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 42780584 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 42780746 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 42781150 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 42781440 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42781611 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42781880 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 42781943 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 19 42781962 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 42781972 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 42781983 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42782180 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 42782252 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 42782271 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 42782445 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 42782453 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42782589 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 42782597 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 42782600 C A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 42782626 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 42782631 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 42782719 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 42782793 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 42782909 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42783109 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42783150 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42783175 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 42783490 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 42784318 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42785896 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42785898 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 42786027 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 42786415 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42786423 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42786430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42786431 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42786492 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 42786530 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42786531 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42786690 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42786947 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 42787298 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 42787335 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 42787431 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 42787678 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 42787833 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 42787845 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 42787859 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42788120 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 42788267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42788304 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42788428 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 42788546 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 42788591 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42788634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42788660 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 42788765 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 42789057 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 42789083 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 42789177 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 42789199 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 42789368 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 42789437 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 42789494 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 42790863 T C Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 42790932 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 42790940 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 42791128 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42792360 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 42792366 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42792846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42793891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42794006 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42794370 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 42794464 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42794746 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42794927 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42795080 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 42795122 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 42795332 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 42795443 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 42795488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42796292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42796480 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 42796548 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 42796560 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 42796642 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42797471 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 42797567 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 42797622 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 42797652 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 42797779 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42797849 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42797940 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 42798137 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42798510 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 42798581 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 42798649 A G Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 42798753 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 42798784 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 42798809 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 42798927 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 42799038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42799140 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 42799188 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 42799213 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 42799317 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 42799343 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 42799394 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42799401 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 42799402 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 42799407 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 42799575 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 42799811 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42799863 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42800152 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 42800185 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 42800219 A C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 42800222 G T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 42800223 G C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 42800462 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42800557 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42800559 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 42800569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42800606 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 42800835 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 42800849 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 42800891 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 42800987 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42801017 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42801220 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 42801259 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 42801318 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 42801354 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42801525 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 42801567 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 42801915 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 42801986 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42802595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42803092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42803111 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42803651 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 42803968 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 42804339 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 42804347 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 42804362 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42804409 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42804572 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 42805819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42805924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42805981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42806010 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 42806072 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42806825 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 42806845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42806974 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 42807126 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 42807171 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42807178 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 42807193 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 42807222 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 42807274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42807379 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42807380 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42807546 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 42807558 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 42807720 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 42807943 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 42807978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42807988 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 42808003 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42808013 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 42808034 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 42808039 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42808291 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 42808472 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 42808512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42808554 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 42808606 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 42808663 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 42808834 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 42809257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42809651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42810010 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 42810153 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 42810217 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42810218 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42810253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42810279 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42810618 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42810656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42810924 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42811124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42811161 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42811166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42811315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42811432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42811472 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 42811595 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42811623 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 42811643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42812174 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 42812190 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 42812664 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42812884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42812982 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 42813320 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42813332 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 42813401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42813454 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42813508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42813530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42813590 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42813593 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42813613 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42813712 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42813893 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42813899 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42813907 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42814020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42814023 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42814080 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42814465 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 42814500 A T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 42814542 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 42814545 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 42814560 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 42814649 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 42814873 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 42814897 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 42814976 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 42815191 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 42815426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42815493 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 42815609 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 42815644 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42815659 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 42815662 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 42815777 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 42815781 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 42815799 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 42815852 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 42815854 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42815955 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 42815956 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 42816214 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 42816309 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 42816327 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 42816377 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 42816379 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 42816465 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 42816665 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 42816822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42817049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42817423 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 42817535 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 42817642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42817883 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 42817912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42818092 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42818123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42818154 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 42818741 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 42819068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42820107 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 42820462 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 42820647 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42820710 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42820726 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 42820733 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42820764 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 42820782 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 42820812 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 42820818 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 42820830 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 42820935 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 42821058 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 42821137 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 42821349 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 42821680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42821829 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 42822148 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42822254 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 42822292 C A Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 42822311 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 42822563 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42822601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42822612 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 42822626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42822672 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 42822677 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42822767 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 42822775 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 42823009 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 42823011 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 42823018 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 42823458 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 42823460 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 42823461 C T Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 42823569 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 42823610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42823725 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42823801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42823996 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 42824022 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 42824098 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42824206 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 42824225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42824321 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 42824375 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 42824469 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42824566 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 42824597 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 42824651 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 42824921 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 42824979 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42825054 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42825090 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 42825095 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 42825114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42825231 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42825353 G T N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 19 42825357 T A N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.545454545454545 0.363636363636364 8 14 1 6 4 19 42825492 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 42825583 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42825586 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 42825834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42825943 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 42826076 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 42826268 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 42826340 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 42826639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42826809 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42826820 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42826899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42826963 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 42827272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42828723 C A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 42829020 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 42829131 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42829251 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42829291 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42829484 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 42829507 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 42829532 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42829559 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 42829724 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 42829761 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 42829897 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 42830029 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 42830059 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 42830060 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 42830390 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 42830848 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42830929 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 42830937 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 42830990 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 42831150 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 42831370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42831555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42831666 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 42832192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42832633 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 42832833 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 42833021 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 42833040 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 42833106 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42833153 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 42833274 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 42833299 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42833315 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 42833444 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 42833532 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42833808 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 42833891 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 42833922 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 42833935 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 42834208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42835492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42836039 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42836113 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 42836154 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 42836769 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 42837233 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42837261 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42837334 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 42840083 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 42840733 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42840818 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42841174 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42843219 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42843831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42843860 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42844263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42844272 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42844412 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 42844479 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42844735 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 42844840 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 42844923 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 42844956 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42844985 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 42845080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42845098 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 42845376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42845678 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42846983 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42847060 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42847200 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42847227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42847232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42847286 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42847513 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 42847581 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42847857 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42847882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42847928 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42848616 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 42848678 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 42849905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42850708 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 42850854 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42850913 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 42850957 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 42851272 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42851371 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 42851685 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42851786 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 42852088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42852421 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 42852482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42852738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42852762 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 42853070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42853302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42853399 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42853471 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42853531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42854142 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 42854577 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 42854785 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 42854787 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 42855420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42855459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42855472 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 42855581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42855836 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 42855927 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 42855989 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 42856272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42856281 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 42856289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42856307 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 42856369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42856401 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 42856644 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 42857193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42858080 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 42858162 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42858167 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42858197 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 42858794 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42858804 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 42859231 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 42859386 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 42859431 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42859540 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 42859706 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42859744 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 42859855 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42859934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42862683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42863057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42863060 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42863115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42863461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42864401 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 42864722 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42864780 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 19 42864986 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 42865344 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42865679 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42866474 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 42866710 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 42867065 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42867604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42867918 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42868154 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 42868174 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 42868187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42868223 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 42868278 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 42868303 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 42868348 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 42868367 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 42868391 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 42868612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42868921 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 42868993 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 42869115 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 42869156 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 42869379 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42869640 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 42870012 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 42870109 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 42870246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42870455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42870545 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 42872453 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42874387 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42874434 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 42874946 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42875126 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 42875235 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 42875319 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 42875322 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 42875544 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 42875973 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 42876186 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 42876302 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 42876319 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 42876451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42876481 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42876973 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 19 42877020 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 19 42877326 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 42877399 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 42877402 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 42877562 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 42877965 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 42878057 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 42878104 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 42878643 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42878724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42878795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42879009 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 42879121 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42879619 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 42879681 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 42879714 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42879749 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42879801 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42879848 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 42880306 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42880383 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42880587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42880730 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42880759 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42880769 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42880842 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42881037 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 42881583 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42881678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42881979 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42882340 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42882989 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42882999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42883108 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42883217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42884032 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42885444 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 42886322 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42886770 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42886905 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42887122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42888688 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42888879 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42889243 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42889420 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42889705 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42890004 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42890097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42890702 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42890874 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42890921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42891084 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42891227 C A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 42891658 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42892569 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42892748 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 42893760 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 42893837 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42893906 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42894095 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42894232 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42894444 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42894504 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 42894689 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42894821 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 42895071 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 42895324 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 42895356 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 42895398 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 42895983 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42896667 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 19 42896971 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42897270 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42897432 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42897683 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42897725 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 42897734 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42897763 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 42897831 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42897885 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42898430 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42898905 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 42898976 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42900460 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42900710 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 42900857 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42900897 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42901054 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 42901305 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42901868 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42902380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42902678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42902824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42902936 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 42903349 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42903557 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42904563 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42905515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42905655 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42905749 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 42906184 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 42906191 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42906211 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 42906246 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42906269 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 42906272 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 42906319 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42906323 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42906352 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 42906358 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 42906449 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42906992 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42907042 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42907158 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 42907164 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42908225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42909230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42910063 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42911603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42912418 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 42916233 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42916891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42916991 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42917129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42918351 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42918740 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 19 42918864 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 42918959 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42919117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42919125 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 42919137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42919167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42920219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42920606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42922955 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42923239 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 42924929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42926909 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 42927163 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42927368 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42931761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42932575 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 42934557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42936371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42936437 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42939258 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 42940577 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42941039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42942796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42943167 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42943556 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42944721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42944789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42944790 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 42946398 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 42947239 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 42947754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42947768 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42947845 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 42947957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42948993 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 42949023 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 42949175 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 42949583 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 42949615 C T N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.75 0.0833333333333333 0.166666666666667 19 5 9 1 2 19 42950110 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 42950391 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 42950946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42951058 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 42951433 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 42951541 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42951650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42951854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42952362 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 42952571 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 42952580 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42952634 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42952673 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42952709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42952738 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42953018 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42953030 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 42953063 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 42953191 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 42953668 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 19 42953703 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 42953724 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 19 42953937 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42954016 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 42954071 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42954284 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 42954368 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 42954466 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 42954612 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 42954640 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 42954687 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42954822 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 42955011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42955042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42955133 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 42955177 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 42955189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42955427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42956041 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 42956246 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 42956385 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42956410 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42956831 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 42957048 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 42958177 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 42958200 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 42958219 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 42958292 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 42958455 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 42959915 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 42960042 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 42960759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42961336 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42962929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42962987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42963017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42963038 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 42963082 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 42963127 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 42963859 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42963868 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 42963937 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 42963946 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 42964224 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42964657 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 42964673 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 42965186 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 42965225 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 42965257 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 42965359 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 42965413 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 42965570 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 42965576 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 42965584 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 42965585 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 42965607 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 42965797 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 42965925 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 42967095 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42967206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42968016 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42968061 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42968257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42968345 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 42974847 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42975341 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 42975489 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 42977078 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 42977081 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 42977085 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42977178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42978015 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 42978086 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42978102 T G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 42978103 A T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 42978179 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 42978362 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42978664 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 42978701 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 42978894 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 42979081 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 42979606 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 42979637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42979998 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 42980104 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42980591 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 42980688 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42982280 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42982282 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42982353 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42982586 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 42983670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42984203 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 42985328 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 42985425 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 42985711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42985764 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 42985829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42986921 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42987811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42987844 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 42988133 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42988255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42988279 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42988389 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 42988484 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42988583 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42988885 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42988980 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 42989265 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42989732 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42989868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42990477 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42990538 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 42990731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42990827 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 42991137 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42991271 A T N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 19 42991510 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42991879 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 42992042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42992227 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 42992324 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 42992345 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42992421 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 42992430 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 42992501 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 42992508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42992605 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42992737 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42992781 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 42992866 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 42992878 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 42992883 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42992898 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 42992964 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42992975 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42992983 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42993020 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 42993072 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42993186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42993315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42993389 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 42993630 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42993980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42994570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42994594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42994653 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42995127 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 42995561 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 42995681 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 42995720 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42996235 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 42996273 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42996403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42996776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42996937 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42997121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42997598 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 42997737 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42998146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 42999157 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 42999179 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 43000345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43000388 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 43000491 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43001213 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 43001330 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43001521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43002209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43002831 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 43003206 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 43003730 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 43003971 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43004407 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 43004641 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 43004918 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 43005443 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 43005472 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 43005803 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 43006029 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 43006583 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 43006916 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 43008395 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43008419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43009774 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43011086 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43011617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43011748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43012425 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 43012607 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 43012926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43013073 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 43013324 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 43013335 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 43013896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43014752 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43015780 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 43016280 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 43016503 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 43016555 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 43016758 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 43016845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43017410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43017542 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 43017729 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43018542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43020073 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 43020305 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 43020421 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 43020682 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 43020695 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 43020705 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 43020708 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 43020718 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 43020803 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 43020848 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43021028 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 43021192 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 43021284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43021721 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 43021801 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43021847 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 43023221 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43023525 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 43023595 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 43023707 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 43025652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43026605 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43028219 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43028565 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43030699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43030977 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43031477 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 19 43031764 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 43031765 G A N Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 19 43032345 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 43032488 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 43032732 A C N N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 19 43032900 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 43033496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43033622 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 43033648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43034157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43034228 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 43034230 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 43034256 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 43034341 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 43034470 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 43034486 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 43034650 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 43034740 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 43034980 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 19 43036086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43036091 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 43036360 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43036363 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 43036519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43036584 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43036585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43036613 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 43036685 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43036716 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 43036743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43037106 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 43037332 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 43037373 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 43038268 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 43038543 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 43038544 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 43038676 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 43038742 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 43038806 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43038855 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 43038857 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 43039526 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 43039949 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 43040431 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43041533 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 43041978 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 43042085 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 43042224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43042298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43042333 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 43042457 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 43042525 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43042999 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 43043136 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43043171 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 43043525 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43043572 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43043618 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43043679 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43044186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43044441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43044444 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 43044567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43044655 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 43044745 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43044849 C A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 43044941 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 43045033 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 43045035 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 43045300 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43045302 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43045450 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 43045454 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 43045512 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43045596 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 43046504 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 43047121 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43047163 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43047184 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 43048283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43048338 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43049524 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43051779 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43054126 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43054426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43054461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43054510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43054690 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43055199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43055240 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43055303 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43055304 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43055322 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43055327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43055408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43055473 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43055681 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43055686 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43056018 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 43056210 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 43056269 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 43056342 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 43056716 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43056758 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 43056822 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43056824 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43057268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43057323 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43057328 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43057376 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43057483 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43057487 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43057808 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 43058348 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43058473 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43058536 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43058661 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43059136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43059358 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43059510 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43059516 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43059702 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43059703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43059974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43059998 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43060005 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43060101 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43060920 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 43063136 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 43063316 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 43063328 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 43063356 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 43063451 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 43063568 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43063656 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 43063841 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 43063842 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 43063914 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43063926 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 43063927 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 43064108 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 43064836 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 43065440 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43066221 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43066879 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43067701 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 43067865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43068088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43068275 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43068305 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 43068327 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 43068412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43068592 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43068718 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 43069168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43069267 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43069270 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43069610 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 43069909 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43069929 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43070805 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43070842 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43071101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43071197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43071812 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43071847 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 43072188 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43072208 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43072392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43072529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43072591 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43079748 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43080198 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43080223 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43080913 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 43080959 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43080991 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 43081133 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 43081143 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 43081352 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 43081605 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43081991 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 43082108 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 43082271 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 43082296 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 43082559 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43082598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43082661 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 43082725 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 43082800 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 43082924 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 43083038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43083314 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 43083439 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 43083492 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 43083571 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 43083587 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 43083752 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43083788 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 43083892 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 19 43083996 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 43084397 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 43084465 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43084720 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 43084924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43085485 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 43085487 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 43085747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43086088 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 43086270 A C N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 19 43086331 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 43086474 A C N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 19 43086557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43087244 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 43087413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43088114 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 43088144 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 43088182 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43088300 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43088469 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43088839 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 43089075 G A N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 19 43089326 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43089385 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43089846 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43092406 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43092937 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43094917 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 43095220 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 43095619 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 43095707 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43095798 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 43095895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43095896 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43095983 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43096043 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 43096134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43096767 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 43097703 G C Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 43098484 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43098533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43098872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43099334 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43099591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43099648 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43102193 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 43102198 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 43102610 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43102623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43102871 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43104417 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43104545 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43104575 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43105412 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 19 43105770 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43105843 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43106684 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43106826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43107100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43108096 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 43108211 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43108744 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 43108775 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43108812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43108895 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 43109119 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 43109140 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 43109241 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43109571 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43109992 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 43110260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43110513 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43110908 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 19 43111445 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 43111528 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43111699 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 43111890 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 43112005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43112293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43112442 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 43112546 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 43112927 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 43113035 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43113090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43113402 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43113724 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 19 43113787 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 43113900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43114098 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43114350 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43114380 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43114509 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43114611 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 43114629 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 43114631 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 19 43114655 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43115505 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 43115553 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 43115593 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43115609 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43115663 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 43115935 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43116003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43116040 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43116100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43116122 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 43116132 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 43116435 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 43116466 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43116483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43116937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43116961 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 43117543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43117986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43118139 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43118595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43118847 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43119151 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43120568 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 43120701 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43120708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43121123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43123522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43123843 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 43124167 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43124367 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43124527 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43125051 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43125551 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43125630 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43126292 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43126417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43126778 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43126815 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43126822 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43127134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43127234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43127258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43127379 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43127765 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43128285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43128349 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43128718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43129365 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 43130409 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43130615 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43131735 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 43131878 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 43131930 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43132106 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 43132716 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43136210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43136469 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 43136789 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43137060 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43137419 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43137466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43138371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43138476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43138606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43141090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43141244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43141615 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43143715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43144678 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43145563 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43147236 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43156415 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 43156628 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43158092 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 43158240 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 43160619 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43161615 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43161960 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43162421 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43164822 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43165590 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 43165906 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43165911 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43166063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43166531 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43166677 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43166773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43166788 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 43167293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43168196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43168343 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43168930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43170713 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43171055 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43173069 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43173104 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43173410 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43175000 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 19 43175247 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43175689 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43175835 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 43176982 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 43177489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43177550 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43177561 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 43177647 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43177747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43177828 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 43177944 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43177990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43178552 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43178626 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43178643 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43178748 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43179118 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43179196 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 43179213 A G N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 19 43180182 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43180258 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43180776 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 43180790 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 43181137 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43181178 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 43181359 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 43182078 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 43182198 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 19 43182208 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 43182240 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 43182595 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 43183081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43183110 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43183254 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43183535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43184158 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43186215 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43186938 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 43187633 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43189784 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 19 43190261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43190352 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43191149 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 43191599 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 43199695 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 43201221 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 43201548 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43202450 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 43202806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43203575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43207947 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 19 43209246 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43209636 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43211404 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43211589 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 43211988 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 43212419 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 43213653 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43213991 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 43214396 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43215623 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43215846 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 43216862 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43217693 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43218639 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43219932 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43220058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43223403 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43223798 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43224015 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43224076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43224161 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43224690 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43227464 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 43227684 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43228546 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43228877 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43230580 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43231238 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43231492 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 43231511 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 43231557 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 43231689 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43231850 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 43232322 T C N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 19 43232581 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 43232601 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 43232783 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 43232809 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 19 43232845 C A N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 19 43233277 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43233320 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 43233829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43234010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43234039 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43234052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43234098 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 43234513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43234774 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 43234784 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43234814 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43235715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43236286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43236320 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 43236522 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43236546 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 43236570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43236910 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 43236947 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 43237324 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 19 43237771 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43237796 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 43237888 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 43238073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43238343 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 43239412 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43239910 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 43240091 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 43240430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43240483 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 43241159 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43243006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43247991 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 43250131 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43260265 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43260979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43265535 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43265678 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 43268552 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 43274940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43274968 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43275001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43275043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43275232 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43276308 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43277726 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43278814 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43280571 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 43281395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43283959 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 43283993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43284457 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 43284720 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43284800 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43285274 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43285354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43285583 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 43285924 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 43285939 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 43286213 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43286335 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 43286674 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 43286821 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 43286892 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 43286901 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 19 43286906 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 43287127 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 43287187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43287263 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43287377 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 43287381 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 43287461 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 43287683 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43287775 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43287785 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43287832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43287850 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43288329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43289239 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 43289726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43289863 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 19 43290047 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43290557 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43290653 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43291091 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 43292755 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43293071 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 43293962 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43293963 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43294109 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43294658 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 43295550 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43296292 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 43296360 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 43296454 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43296501 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 43296542 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 43296562 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 43296685 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 43297050 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43297060 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 43297114 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 43297613 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43299891 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43300700 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43300717 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43300726 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43300780 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 43301107 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 43301341 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43301995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43302557 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 43302979 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 43303127 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43303165 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43303305 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43303385 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 43303747 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 43304063 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 43304744 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 43304763 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 43305060 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 43305104 C T Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 19 43305368 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 43305730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43306730 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 43306779 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 43307118 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 43307140 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 43307440 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 43307776 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 43307988 A T N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 19 43308139 A G N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 19 43308251 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 19 43308276 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 43308656 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 43308658 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 43308801 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 19 43308874 T G N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 19 43308999 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 43309031 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 43309107 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 43309220 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 43309748 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 43309763 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 43309802 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 43309955 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43309956 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 43312668 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 43312720 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 43312797 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43312816 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 43314420 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 19 43315158 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 43315973 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 43316351 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 43318048 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43318752 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 43319070 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43320244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43320366 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43325875 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43328343 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43330187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43331692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43332641 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 43332642 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 43334555 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43334928 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 43335964 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43337951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43338184 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43340485 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 43342694 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 43342701 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 43345454 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 43346985 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 43347234 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 43347509 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43350143 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43350664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43353814 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43355273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43356240 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43359108 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43360503 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 43361113 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 43361374 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 43365173 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43365760 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43373505 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43373600 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 43373638 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 43373829 A T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 43373861 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43374779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43374928 T C Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 43375142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43375634 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 43376431 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 43376674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43377184 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 43378324 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43378375 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43379526 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43379658 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43380544 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 43380735 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43380842 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 43381694 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 43382455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43383089 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43384963 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43385529 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 43386668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43387292 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43389461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43389463 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 43389476 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 43389987 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43390035 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 43390555 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43390658 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43390978 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43391165 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 43391278 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43391344 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 19 43391351 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 43391370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43391383 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43391389 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43392186 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 43392875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43392987 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43393191 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 43393614 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43393621 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43393756 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 43393795 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43394068 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43394215 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43400967 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 43401531 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43401804 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43402649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43403353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43403504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43403632 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 43404104 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43404493 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43404634 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 43404879 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43405031 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 43405046 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 43405303 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43405662 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 43405813 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43405819 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43405858 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43405886 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43405908 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43406349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43406787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43409543 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43409590 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43409971 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43410235 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43410432 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43410565 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43410594 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 43412146 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43412867 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43412986 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 43414279 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43415158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43415712 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43416553 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43416784 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43416923 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43417116 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43417422 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43417607 C A N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 19 43417632 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 43417634 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 43417664 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 43417851 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43418357 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43419331 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43419713 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 43419746 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43419906 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 43419927 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 43419980 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 43420426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43421565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43421580 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 43422108 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 43425981 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 43428081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43431205 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43431693 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 43432797 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 43433078 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43433441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43433518 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43433521 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43433846 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 43434978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43435150 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43435815 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 19 43436217 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 43436274 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43437541 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 43438755 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 43439540 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 43439599 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43439650 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 43439795 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43439832 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43442225 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43442629 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43442674 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 43442841 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 43443042 A T N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 19 43443255 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 43443346 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 43444533 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 43444838 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43445238 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 43445732 A C Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 43446499 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43446715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43446826 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43447045 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43447105 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43447162 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43447678 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43447680 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43447714 C A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 43447758 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43448553 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 43449068 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 19 43449849 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43449853 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43450877 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43453079 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43453224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43454557 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 43456057 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43460736 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43460834 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 43461410 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43465672 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 43466416 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 43466480 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43466493 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43466683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43467038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43467425 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 43467491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43467523 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 43467529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43467551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43467606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43467659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43468198 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43468610 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 43468669 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43468784 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43468809 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43468995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43469562 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43469722 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43470396 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43471624 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43472107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43473532 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 43474410 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43475613 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 43476206 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 43477320 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 43477327 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 43478160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43478291 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43479160 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43479223 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43479333 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43479590 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 19 43479636 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 19 43480016 G T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 43480119 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43480346 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43481367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43482418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43482668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43482838 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43483075 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 43483582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43484048 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 43484776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43485009 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43485141 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 43485480 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43485560 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43485749 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 43488998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43489074 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43489422 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43489623 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43489980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43490017 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43490173 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 43490390 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43490535 C G N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 19 43490648 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 43490679 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 43490698 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43490867 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43490884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43491098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43491208 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43491480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43491634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43491738 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 43491854 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 43491908 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 43492228 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 43492239 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 43492291 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 43492292 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 43492310 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 43492371 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 43492380 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 43492732 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 43492765 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 43492894 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 43493092 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43494110 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43494179 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 43494210 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 43495164 C A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 43495574 A C N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 19 43496022 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 43496044 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43496212 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43496439 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43496538 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43496657 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 43496717 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 43496728 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 43496780 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43496802 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 43496857 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43496954 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 43496966 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 43496986 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 43497041 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 43497108 A T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 43497178 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 43497268 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 43497419 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 43497444 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 43497506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43497677 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 43497747 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 43497755 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 43497808 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 43497840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43498045 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 43498053 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 43498374 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 43498423 A T N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 19 43498463 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 43498480 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 43498668 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 43498720 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 43498732 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 43498833 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 43498852 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 43498910 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 43498931 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 43498979 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 43499020 C G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 43500364 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 43500372 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 43500384 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 43500622 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43500735 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 43500837 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 43500864 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 43501300 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 43501429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43501480 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 43501548 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 43501554 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 43501615 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 43501642 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 43501670 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 43501672 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 43501674 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43502310 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43502384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43502400 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43502430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43502461 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 43502557 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43502569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43502631 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 43502657 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 43502736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43502844 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43503138 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43503297 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43503682 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43503713 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43503733 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43503737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43504050 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 43504055 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 43504080 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 43504082 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 43504476 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 43504523 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43504561 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43504670 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 43505163 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43505322 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 43505380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43505502 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43505926 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 43505932 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 43505963 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 43506224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43506306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43506588 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43507056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43507438 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43507616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43507812 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43507913 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43507939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43507952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43508014 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 43508114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43508194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43508269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43508322 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 43508564 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 43508612 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 43508722 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43508752 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 43508771 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 43508892 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43508912 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43508919 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43508947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43509065 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43509066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43509339 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 43509423 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 43509432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43509435 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 43509519 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 43509604 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43509815 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 43510178 G A N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 43510287 T C N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 19 43510294 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 43511361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43511673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43511993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43512248 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 43512270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43512512 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43514264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43514284 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43514311 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43514529 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43516038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43516137 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43516194 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43516335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43516608 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 43516714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43516823 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 43516874 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43516915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43516985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43520317 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43521240 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43521476 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43521675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43522658 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 43522688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43522766 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 43524002 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43525869 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43526142 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43526213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43527711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43527719 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43527731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43528069 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43528508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43529504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43529961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43530120 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43530806 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43530830 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43531748 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 43531813 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43531826 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 43531832 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 43531888 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43531969 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43532360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43532471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43532502 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43533118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43534118 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 43534170 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43534486 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 43534533 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43535003 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43535060 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 43535357 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 43535418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43535710 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 43535766 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 43535875 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 43535905 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 43535977 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43535980 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43535996 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43535997 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43536012 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43536153 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43536155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43536421 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43536776 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43537046 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43537229 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43537298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43537316 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43537380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43537397 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43537537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43537938 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 43537950 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43538046 G C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 43538107 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43538163 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 43538358 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 43538368 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 43541399 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43542086 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 43542428 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43546816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43546954 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 43547026 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43547117 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 43547146 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43547147 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 43547233 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43547316 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 43547604 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 43547948 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43547993 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 43548398 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43548836 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 19 43549045 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 43549061 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43549086 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 43549248 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43549384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43549538 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43549765 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 43549771 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 43549885 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 43550178 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 43550426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43550741 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43550889 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43551054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43551085 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43551192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43551232 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 43551307 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 43551499 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 43551570 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 43551643 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 43551790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43552016 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 43552125 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 43552239 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 43552332 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 43552474 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 43552647 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43552790 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 43552833 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43552898 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 43552992 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 19 43553041 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 43553089 G C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 43553105 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 43553162 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 43553185 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 43553265 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 43553328 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 43553421 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43553718 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 43554005 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43554428 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 43554441 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43554954 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43555150 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43555411 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 43555423 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 43555800 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43556079 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 43556080 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 43556221 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43556222 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43556366 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 43556385 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 43556589 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43556644 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 43556849 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 43556974 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 43557001 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 43557003 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 43557027 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 43557040 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 43557055 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 43557079 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 43557115 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 43557529 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43557712 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43557713 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 43557868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43557911 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43558044 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 43558088 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 43558116 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 43558133 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 43558180 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43558434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43558572 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 43558573 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 43558791 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 43558896 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 43559501 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43559507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43559689 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 43559705 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 43560136 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 43560217 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 43560779 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43560903 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 43561058 C G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 43561059 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 43561112 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 43561468 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43561545 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 43562363 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43563665 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43565482 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43567406 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43567614 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43568989 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 43571516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43572683 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 19 43572726 T A N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 43573456 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43573530 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43574003 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 43574046 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 43574279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43574382 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 43574898 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43575238 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 43575280 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 43575308 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 43576382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43577547 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 43577754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43578002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43578371 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43578629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43579735 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43579894 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 43579898 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 43580025 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43580033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43580091 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43580092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43580555 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43581117 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43581190 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43581738 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 43581947 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43582241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43582344 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 43582370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43582409 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 43583224 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43584683 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 43585604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43585891 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 43586261 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 43586262 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 43586385 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 43586562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43587003 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 43587044 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43587101 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 43587285 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 43587394 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43587426 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 43587440 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 43587443 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 43587667 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 43587755 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43587759 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 43588214 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 43588275 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 43588346 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 43588349 C A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 43588352 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 43588441 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 43588458 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 19 43588474 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 43588529 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 43588627 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 43588728 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43588963 A T N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 43588989 C G N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 43589303 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43589474 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43589491 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 43589657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43590190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43591352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43595107 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43598044 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 43598131 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 43598153 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43598182 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43598408 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43598564 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43599657 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 43600512 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 43600862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43601286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43604969 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43605636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43605644 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 43605665 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43606073 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 43606093 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43606579 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 43608150 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 43608185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43610747 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43610980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43612230 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 43621462 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 43621674 T A N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 19 43621821 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 43621909 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43622081 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43622821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43622930 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43623071 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43623095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43623355 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 43623655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43623981 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 43624871 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43625980 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43626058 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43626254 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43626481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43626740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43627056 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 43627183 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 43627484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43627938 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 43628154 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43628195 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 43628517 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43628802 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 43628886 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 43628946 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 43629177 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 43629435 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 43629438 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 43629832 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43630074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43630075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43630310 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 43630311 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 43630320 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 43630583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43630884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43630999 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43631036 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 43631115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43631141 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 43631315 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43631480 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43631486 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43631581 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 43631582 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43631612 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43631622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43631672 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43631814 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43631886 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43632452 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 43632541 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 43632559 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 43632590 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43632661 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 43632968 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43633124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43633188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43633204 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 43633283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43633297 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43633378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43633379 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43633563 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 43633641 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 43633771 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 43633783 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 43633814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43634079 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 43634194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43634267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43634613 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 43634750 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43634769 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43634784 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43634797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43634914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43635084 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 43635085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43635131 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43635154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43635199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43635553 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 43635570 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 43635602 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43635603 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 43635845 G T N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 19 43636497 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 43636785 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 43639386 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43644263 G A N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 19 43645377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43646331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43646423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43646564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43647069 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 43647149 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 43647692 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43647696 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43647833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43648448 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 43648674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43648700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43649464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43649467 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43649650 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43650425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43652196 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43652408 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43653230 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43654153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43654424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43655230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43655623 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43656808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43656813 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43656827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43657253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43657423 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43657871 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43658136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43658154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43658335 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43658855 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43659547 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43659654 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43659673 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43659716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43660274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43660320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43660548 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43661187 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43661284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43661335 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43661338 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43661357 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43661395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43661407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43661412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43661459 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43661582 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43661608 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43661628 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43661893 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43663279 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43664671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43665196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43665560 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 43665587 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 43665735 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 43666248 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43666669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43667304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43668312 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43668465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43668537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43668594 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43668610 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43668616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43668624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43668725 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43668730 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43668897 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43669126 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43669399 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43669531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43669742 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43669898 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43669983 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43670274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43670788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43671273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43671785 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43671842 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43672714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43674405 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43674760 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43674936 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43674958 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43674997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43675094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43675103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43675133 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43676444 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43680441 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43680442 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43680987 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43681089 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 43681159 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43681996 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43682857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43683168 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43683377 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 43684151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43687116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43688406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43689491 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43689878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43690994 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43692215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43692218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43692461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43694692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43696034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43696281 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43696368 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43696681 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43696747 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43696782 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43696790 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43696791 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43696806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43696819 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43696886 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43696900 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43697163 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 43697189 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 43697318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43697365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43697521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43697695 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43697814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43697993 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43698418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43699478 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43699855 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43700015 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43700281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43700380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43700476 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43700478 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 43700591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43700820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43700871 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43700878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43700930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43701009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43701010 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 43701783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43703655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43703997 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43705039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43705233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43705668 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43705681 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43706162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43706931 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43707031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43707565 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43707713 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 43708315 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 43709988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43710330 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43710368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43710374 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43710398 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43710419 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43710475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43710476 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43710565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43711035 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43711052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43711217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43711244 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43711410 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43712575 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43712583 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43712761 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43712827 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43712829 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43712862 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43713505 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43713645 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43713790 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43715059 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43715213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43715973 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 43716323 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43717032 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43717048 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43717178 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 43717200 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 43717453 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 43717454 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 43717544 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43717564 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43717572 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43717666 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 43717907 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 43718094 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43718117 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43718164 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43718202 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 43718216 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 43718354 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 43718735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43718751 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43718755 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43718784 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 43718913 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43718919 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43719034 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 43719162 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 43719355 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 43719742 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43719755 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43719828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43719839 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 43720637 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43720655 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 43720708 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43720735 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 43720895 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 43720919 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43720924 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43720939 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43720942 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43721093 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 43721095 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 43721297 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43721312 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43721747 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43721811 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43721897 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43722099 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43723739 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 43723855 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 43723980 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 43723982 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 43724019 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 43724658 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43724720 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43724978 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 43725525 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43725729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43725738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43727602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43728980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43729695 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43729711 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43729818 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43729826 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43729843 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43729847 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43730040 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43730045 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43731313 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 43731397 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43732466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43732759 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 43732787 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43734945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43735168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43735290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43735346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43737307 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 43737917 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43738245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43739461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43739734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43740024 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 43744512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43745157 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43745364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43745490 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 43747177 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43747535 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43750196 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43750408 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43750678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43753718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43754025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43754925 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 43757478 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43757524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43760723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43762649 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43762829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43767006 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43767319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43770729 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43770864 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43771648 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 43772503 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43774571 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43775985 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43776426 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 43776511 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 43776620 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43776724 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43776782 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43777081 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 43777296 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43777574 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43777580 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43777669 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43777795 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 43777939 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43777954 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43778193 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43778199 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43778465 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43778641 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43778791 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43779135 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43779446 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 43779494 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43781438 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 43781552 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43782824 G C N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 19 43784056 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 43784332 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 43784641 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43785188 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 43785205 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 43785390 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 43785546 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 43785664 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 43785677 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 43788514 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 43788542 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43788819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43788920 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43788931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43788949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43788969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43789113 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 43789164 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 43789169 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 43790585 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 43790653 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43790706 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 43790774 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43791305 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 43791319 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 43791536 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 43791568 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 43791578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43791638 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 43791859 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 43792088 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43792111 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 43792114 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43792133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43792136 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43792193 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 43792288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43792360 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 43792415 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43792417 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43792458 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 43792477 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 43793227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43793429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43793499 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 43794394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43796093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43797201 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 43797267 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 43797269 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 43797285 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 43797364 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 43797830 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 43799354 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 43800787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43801138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43801174 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 43801281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43801450 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 43801821 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43801881 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43802240 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 43802937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43803708 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 43803976 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 43805326 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43805825 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43806901 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 43808245 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 43810019 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 43811504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43812195 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 43812408 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 43813007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43813666 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 43813693 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 43814241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43814644 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 43816038 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 43816393 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 43817359 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43819026 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 43819039 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43819275 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43820575 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 43820682 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43821480 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43822512 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43823192 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 43824726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43826664 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43826671 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 43826966 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 43828173 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43828198 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43829162 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 43829730 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 43830981 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 43833681 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 43833851 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 43835974 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 43840280 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43840689 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 43841836 T A N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 19 43842087 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 43842130 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 43842148 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 43842216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43842270 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 43842840 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43842848 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 43842861 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 43842863 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 43842871 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 43842916 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 43842953 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 43842978 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 43843150 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 43843243 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 43843469 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 43843803 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 43844291 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 43845438 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 43845720 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 43845934 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43845985 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43847130 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43848059 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 43848642 C G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 43848692 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 43848864 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 43848875 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43849131 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 43849446 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43849529 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 43849531 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 43849534 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 43849538 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43849837 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 43850037 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43850122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43850125 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43850143 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 43850211 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 43850408 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 43850410 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 43850442 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 43850474 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 43850517 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 43850552 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 43850567 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 43850877 G A N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.230769230769231 0.538461538461538 0.230769230769231 13 13 3 7 3 19 43851038 C T Y Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 12 12 2 8 2 19 43851109 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43851218 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 43851221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43851247 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 43851306 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43852730 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 43853621 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43853812 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43853820 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 43853833 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 43853844 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 43854043 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 43855879 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 43856660 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43857388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43859215 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43859779 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 43859892 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43860720 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 43860913 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 43862545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43864523 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43864595 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 43864625 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 43864667 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43864858 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 43865606 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43865860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43866034 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 43866057 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 43866127 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 43866383 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 43866477 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 43866615 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 43866665 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 43866816 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 43867068 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 43869628 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 43869950 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43871278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43871385 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 43871993 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43872219 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 43872701 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43872915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43873331 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 43873361 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 43873493 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 43873513 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 43875591 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 43876908 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 43877030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43877061 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43877805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43878052 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 43878061 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 43878139 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43878661 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 43880296 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 43880670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43880832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43883379 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 43883384 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 43883486 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43883675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43883772 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43883872 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 43884291 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 43884323 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 43884472 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 43884521 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 43884618 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43884725 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 43884832 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 43884850 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 43884863 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 43885155 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 43885169 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43885185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43885315 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 43885647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43886065 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43886074 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43886183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43886217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43886338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43886342 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43886365 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43886375 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 19 43886949 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 43887311 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43888107 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 43889747 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43889754 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43890264 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43891196 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43891219 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 43892171 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43894768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43895305 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43897031 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43899759 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 43900277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43901310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43901597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43903354 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43903370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43907152 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43907880 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 43908200 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 43909975 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43910772 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43910947 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43911052 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 43911110 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43911143 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43911236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43911735 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 43911882 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 43912683 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 43913381 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 43913593 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 43914475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43914711 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 43914992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43914999 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43915304 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 43916204 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 43916208 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 43916322 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43916392 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 43916408 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 43916436 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 43916440 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 43916501 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 43916552 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 43916563 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 43916573 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 43916733 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43916946 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43917309 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 43917673 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 43917732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43917789 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 43917828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43917911 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43917977 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43917983 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43918029 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 19 43918304 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43918384 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 43918811 G C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 43919789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43920501 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 43920738 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 43920866 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43920949 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43921010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43921180 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43921467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43921667 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 43922470 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43922579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43923505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43923535 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 43923539 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 43923602 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 43923605 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 43924369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43925036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43925045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43925560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43926062 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43926267 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43927498 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 43928955 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 43929022 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43929037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43929047 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43929192 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 43929264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43930621 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43930982 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43933449 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 43933862 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43934852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43936489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43937058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43937098 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43937100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43937143 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 43937502 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 43937515 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43937555 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 43937567 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 43937764 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43937963 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43937974 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 43938018 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 43938079 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43938107 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 43938119 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 43938161 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 43938168 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43938496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43941432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43943280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43944063 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43944254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43944308 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 43945756 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 43946148 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 43946315 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 43946327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43947015 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43948088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43949124 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43950583 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43950661 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43951923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43952345 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 43953232 C G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 43953308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43953910 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43954400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43954432 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43954763 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43955319 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43955954 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 43956459 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43957368 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 43959045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43960411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43961328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43963643 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43964497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43964500 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43965680 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43965736 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43965821 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 43966176 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43966229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43966239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43966419 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43966911 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 43968369 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43968892 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43970356 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 43970472 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 43970505 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 43970610 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 43972033 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43973137 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 43973504 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43974164 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43974396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43974465 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43984441 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43986155 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43986429 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 43987100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43988750 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 43989230 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43989432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43989468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43989532 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43989560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43989760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43990250 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43990361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43990575 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 43990784 T G Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 43990786 T A Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 43990794 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 43990823 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 43990866 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 43991017 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 43991057 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 43991079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43991100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43991297 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43991327 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 43991379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43991403 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 43991535 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 43991679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43991717 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 43991910 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 43992048 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 43992170 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 43992639 T A N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 19 43992652 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 19 43992989 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 43993082 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 43993147 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 43993190 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 43993307 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 43993477 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 43993494 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 43993579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43993676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43994021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43994191 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43995723 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43995941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43996163 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43996166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43996234 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43996548 G T Y N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 19 43996706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43996877 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 43996984 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43997052 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 43997098 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 43997100 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 43997151 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 43997270 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 43997496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43998408 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43998477 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43998520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43998629 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43998667 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 43998859 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 43998867 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43998955 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 43999006 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 43999316 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 19 43999555 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 43999642 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 43999890 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 43999944 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 19 44000133 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 19 44000141 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 44000755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44000806 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44001864 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44002101 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44002270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44002354 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44002380 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44002526 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44002630 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 44002713 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 44002952 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 44003279 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 19 44003537 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 44003738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44003894 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44003911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44003930 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44003931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44004082 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 44004092 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44004117 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44004119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44004170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44004764 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 44004773 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 44004859 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 19 44004888 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 44005667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44006017 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44006375 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44006576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44007157 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44007359 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44007533 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 44010911 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44012284 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 44013743 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44014201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44014467 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 44015026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44016033 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44016737 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44016995 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 44017366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44017714 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 44018390 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44018559 C T N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 19 44018728 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 44018770 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44018844 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44019188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44019551 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 44019624 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 44019776 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 44019841 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44019915 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 44019922 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 44019923 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 19 44019940 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 44019990 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 19 44020072 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 44020372 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 44020394 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 44020397 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 44020586 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 44021033 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44021038 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 44021328 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44021350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44021442 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44021651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44022013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44022205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44022408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44022606 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44022622 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44022880 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44022889 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44023086 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44024026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44024192 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44025051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44025201 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44025483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44025666 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44025712 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44025989 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44026001 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44026025 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44027044 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44027260 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44028709 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 44028792 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44028859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44029137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44029160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44029229 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44029326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44030927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44031194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44031897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44031967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44032172 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44032232 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44032990 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44033492 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44033664 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44033893 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44034293 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44034433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44034447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44034464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44034494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44034587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44034688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44034831 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44034841 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44034870 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44035008 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44035061 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44035103 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44035184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44035191 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44035368 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44035371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44035421 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44035558 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 44035832 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44035870 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44035889 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44036019 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44036359 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44036381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44036393 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44036442 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44036451 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44036531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44036601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44036643 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44036818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44036862 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44036921 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44036960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44036980 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44037045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44037121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44037167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44037421 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44037589 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44037761 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44038439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44038692 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44038873 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44038908 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44039164 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 44039682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44040295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44041252 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44043264 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 44043318 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44043560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44043701 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44043883 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 44044013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44044296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44044446 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 44044513 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 44044615 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 44045354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44045498 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44045658 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44046252 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44046354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44046465 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44046624 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44046629 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44046704 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44046883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44047102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44047420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44047819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44048272 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44048665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44048763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44048886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44049002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44049181 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44049226 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44049263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44049759 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44049786 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44049789 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44051118 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44051499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44051573 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44052264 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44052542 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44052591 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44052600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44052626 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44052644 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44052730 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 44052772 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 44052848 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44052877 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44052947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44052965 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44053046 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44053595 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44053779 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44054354 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44054448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44054527 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44054606 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 44054693 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44054953 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44055044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44056090 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44056203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44056337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44057161 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44058073 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44058364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44059143 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44059550 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44063374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44063401 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44063452 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44064083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44064431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44066312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44067165 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 44067220 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44067458 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 44067880 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 19 44067881 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 19 44067888 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 44067930 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 44068153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44070747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44072348 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 44072840 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44073704 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 44079964 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 44081448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44081689 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44082498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44082593 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44083636 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44083801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44083830 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44083843 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44084050 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44084058 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44084373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44084445 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44084582 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44085071 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 44085207 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44086208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44086505 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44086579 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44086583 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44086587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44086591 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44086610 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44086875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44087126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44087268 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44087323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44087368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44087418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44087683 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44088021 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44088059 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44088169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44088254 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44088869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44088891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44088901 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44088907 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44091419 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44091422 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44091436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44091933 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 44091994 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44092049 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44092075 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44092106 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 44092149 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 44092271 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44093476 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 19 44093773 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 44093791 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 44093828 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44093971 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 44094056 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44094076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44094080 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44094106 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44095511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44097013 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44098069 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 44098550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44098722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44099716 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44099738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44100804 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 44103050 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 44106877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44107027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44107030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44107868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44108775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44110088 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44110882 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 44111466 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44111531 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44111646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44112167 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 44112255 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 44112257 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44112258 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 44112281 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 44112334 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 44112364 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 44112806 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 44113008 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 44113032 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 44113100 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 44113141 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 44113185 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 44113223 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 44113254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44113457 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 44113613 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 44113714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44114033 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 44114676 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 44115121 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 44115141 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 44115186 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 44115190 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 44115790 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 44115811 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 44115913 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44115928 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 44115946 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 44116289 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 44116434 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 19 44116538 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 44116703 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44116764 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44117194 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 44117278 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 44117408 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 44117488 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 19 44118094 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 44118316 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44119349 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44119558 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44120053 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44120121 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44120397 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44120400 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44120465 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44120505 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44121151 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44121179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44122371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44123270 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44124041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44125777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44127261 G A N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 19 44129092 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 44129491 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 44132143 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 44132212 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44132290 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 44132432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44132449 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 44132543 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44132699 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44132745 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44132898 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 44132926 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 44132933 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 44133312 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 44133344 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44133359 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 44133361 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 44133428 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44133450 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44133451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44133764 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44133770 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44133827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44133913 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44134236 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 44134240 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44134301 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 44134302 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 44134350 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44134419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44135442 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44136230 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44136310 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44138153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44139343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44139590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44140776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44140886 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44141034 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44141996 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 44142479 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 44142628 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44142672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44142696 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 44142813 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44142846 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44142944 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44143551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44143579 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44143581 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44144359 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 44144387 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 44144465 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 44144466 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 44144777 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 44144793 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 44144858 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 44144979 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44144993 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44145026 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 44145087 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44145128 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44145134 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44145191 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 44145949 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44146221 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44147301 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 44147485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44148987 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 44149647 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 44149668 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44151838 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44151906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44152280 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44153033 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44153931 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 44154048 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44154389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44156920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44158091 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44158850 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 44159361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44161064 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 44161690 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 44161691 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44161692 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44161693 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 44165947 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44167339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44167537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44167717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44170534 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44172188 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 44173177 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44179741 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44180558 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44180919 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 44181749 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 44183088 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 44183172 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 44183915 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 44183960 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44184295 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 44184699 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 44184970 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44185836 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 44186715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44186746 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 44186860 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 44186973 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44187286 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 44187293 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 44187331 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 44187388 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44187600 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44188468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44189307 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44191208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44192099 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 44192209 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44192439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44192680 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 44193205 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 44193956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44194139 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44197207 A C N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 19 44197601 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 44197894 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44197954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44198476 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 44198631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44198640 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 44198670 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 44198679 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 44199100 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 44199221 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44199576 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 44199610 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 44199639 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 44199670 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44199750 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 44199850 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 44200014 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 44200296 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 44200727 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 44201033 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 44201246 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 44201558 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 44201664 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 44201740 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 44202074 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 44202299 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 44202307 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 44202519 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 44202526 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 44203126 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 44203286 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44203330 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 44204313 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44204505 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 44205172 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44205185 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 44205425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44205728 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44205806 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 44205943 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44206063 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 44206134 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 44206416 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 44206889 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44206976 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 44207029 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 44207057 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44207153 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44207673 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44207675 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44207955 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44208001 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 44208204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44208520 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44208606 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44208673 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 44208751 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44208753 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44208772 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44208780 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44208791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44208804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44208864 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44208962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44209004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44209024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44209115 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44209384 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44209537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44209680 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44209845 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44210738 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 44210891 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44211360 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44211378 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44211775 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 44212195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44212196 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44212218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44212243 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44212490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44213288 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 44213372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44214569 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44214605 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44214659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44214787 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44215140 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 44215221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44215243 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44215278 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44215354 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 44216156 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 44216242 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 44216529 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 44216540 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 44217255 T G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 19 44217404 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44217762 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 44217765 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 44217773 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 44217829 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44217852 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 44218612 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 44218729 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 44218756 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 44218760 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 44218774 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 44218827 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 44218844 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 44218845 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 44218866 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 44218920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44219040 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44219139 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44219157 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 44219170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44219258 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 44219387 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44219450 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 44219501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44219508 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44219768 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 44219795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44220083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44220189 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 44220221 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 44220364 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 44220365 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 44220382 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44220392 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44221098 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44221516 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 44221951 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 44221996 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 44222000 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 44222015 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44222064 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 44222126 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 44222229 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 44222749 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44222808 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44222851 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 44222871 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 44223013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44223279 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 44223288 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 44223311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44223353 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 44223361 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 44223846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44224127 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44224476 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44224679 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 44224833 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 44224923 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44225420 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 44225568 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44225662 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44226109 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44226418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44226445 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 44226705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44227534 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 44227560 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 44227720 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 44227865 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44227866 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 44227885 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 44227897 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44227926 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 44227946 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 44227974 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 44228032 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44228101 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 44228421 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 44228460 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 44228537 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 44228607 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 44228652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44228676 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 44228743 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 44228752 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 44229190 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44229229 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 44229243 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 44229325 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 44229339 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 44229345 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 44229365 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 44229433 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 44229441 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 44229580 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 44229660 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 44229662 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 44229719 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 44229730 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44230489 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 44230562 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 44230637 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 44230647 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 44230665 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 44230691 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 44230810 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 44230933 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 44231386 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44231846 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 44231959 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 44232112 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 44232157 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44232199 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 44232291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44232302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44232379 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 44232937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44233285 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44233904 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 44234088 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44234247 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44234878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44235180 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44235268 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44235386 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44235425 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 44235441 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 44235745 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44236035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44236834 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 44236906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44236958 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44236961 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44236970 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44236977 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44237034 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 44237046 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 44237107 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 44237295 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 44237930 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44238182 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44238243 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44238776 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44238943 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44239226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44239258 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44239259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44239263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44247510 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44247781 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44249489 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 44249701 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44249752 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44249834 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 44250012 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 44250078 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44250124 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44250360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44250595 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44250693 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 44250903 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44251063 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44251547 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 44251586 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44251612 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44251669 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 44251705 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44251776 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 44251805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44252179 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44252359 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 44252509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44252943 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 44253086 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44253322 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 44253429 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 44254537 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 44255079 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 44255085 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 44255139 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44256845 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 44256952 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44257411 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44257434 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44257616 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 44257973 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44258115 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 44258186 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 44258410 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44258735 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 44258868 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44259086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44260426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44261629 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 44261830 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 44262049 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44262066 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44262151 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 44262166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44262300 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44262403 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44265234 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44265920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44265957 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 44267804 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44270102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44271896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44272498 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44275179 G A N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 19 44275190 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 44275942 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44276895 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44277136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44278837 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44280027 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44282064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44283551 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44283578 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 44284439 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 44284631 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44284647 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44285952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44287740 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 44287763 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 44288499 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 44288990 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 44289056 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 44290211 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 44291182 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44291183 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44291250 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44291258 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44291462 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44291624 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44291645 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44291984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44292132 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 44300041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44302786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44303317 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 44304861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44304864 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44304941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44304993 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 44305954 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44306483 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44306791 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44307535 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44309782 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44309785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44310002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44310004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44311636 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44313570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44314441 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44316439 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44316467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44316848 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44318575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44322481 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 44322765 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44324409 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 44325343 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44325550 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 44328092 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44328483 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44330814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44330957 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 44330979 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 44331094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44331143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44331573 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44331696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44332055 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44332184 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44332263 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 44332304 C G N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 19 44332392 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 19 44332532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44333259 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44333303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44333338 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 44333345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44333368 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 44333563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44333580 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44333598 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44333666 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44333897 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44334349 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 44334359 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 44335191 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44335238 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 44335275 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44335312 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44335328 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44335371 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44335438 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 44335897 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44335924 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44336006 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44336038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44336108 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44336443 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44336628 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 44336644 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 44336660 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44336838 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44337567 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 19 44337694 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 44337794 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44337798 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44337849 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 44337861 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44337937 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44337982 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44338174 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 44338175 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 19 44338187 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 44338206 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 44338530 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 19 44338748 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 44339189 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44339354 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44339797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44340177 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44341038 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44343170 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44344122 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 44344156 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 44344158 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 44344256 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 44344280 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44344580 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 44344614 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44344616 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44344724 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44344811 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44345006 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44345024 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44345041 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44345249 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44345263 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44345393 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44345803 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44345834 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 44348026 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 44348042 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44348529 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44350143 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44350373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44350374 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 44350412 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44350467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44350550 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 44351664 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44351738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44352731 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 44353168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44353186 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44353331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44353364 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 44353424 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44353428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44353604 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44353613 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44353625 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44353657 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44353674 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44353719 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 44353791 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 44354012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44354099 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 44354235 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 44354271 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44354444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44354519 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44355612 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 44356875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44356911 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44356918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44360689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44361077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44361699 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44361964 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 44361974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44362027 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 44362098 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44362392 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 44362407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44362409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44362484 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44362532 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44362585 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 44362670 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44362676 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44362689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44362698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44364092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44364176 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44364250 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 44364395 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 19 44364661 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 44364662 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44365111 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44365178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44365201 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44365291 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 44365620 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 44365702 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 44365762 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 44365800 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 44365810 T A N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 19 44365813 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 44366110 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44366125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44366171 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 44367219 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 44368014 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44370464 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44370703 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 44370706 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 44370707 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 19 44370711 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44371863 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44371984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44371998 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44372864 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44373284 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 44373297 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 44373373 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44373627 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44374191 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 44374410 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 44374486 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 44374572 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 44375255 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44375685 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44375966 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44376368 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44376957 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44377483 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 44378297 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 44378922 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 44378975 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 44379065 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44379189 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 44379692 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44379699 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44379954 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44379956 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44380681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44381408 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 44381416 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 44381659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44382044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44382731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44383473 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44383845 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44384956 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 44384961 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 44385134 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44385171 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 44385196 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 44385212 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 44385262 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44385289 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 44385309 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 44385408 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44385430 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44385562 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 44386419 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 44386448 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44386457 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44386578 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 44386602 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44386977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44387898 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44388535 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 44388860 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44388915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44389651 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44390626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44390633 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44390947 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44391092 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 44393752 G C Y N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 19 44393805 G A Y Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 19 44393912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44394762 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44395102 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 44395625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44395680 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44395942 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 44396177 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44396404 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 44396504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44397789 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 44397886 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44398194 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 44399162 A G N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 19 44399380 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 19 44402085 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 44402310 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 44403411 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44403474 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44403488 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44403628 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44404127 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44404649 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44405404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44407213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44407329 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44407486 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44407512 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44407603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44407662 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44408576 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44408633 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44411646 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44411717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44411757 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44411884 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44411936 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44412187 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44412841 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44413031 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44413432 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 44413951 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 44414217 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44414512 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 44415320 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44415417 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44415646 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44415747 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44415783 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44415822 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44415876 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44416258 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44416429 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44416431 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44416449 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44416451 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 44416462 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44417280 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44417789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44418226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44418287 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 44418446 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44419639 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44420159 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44420714 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44420742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44420799 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44420807 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44420846 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44420850 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44421552 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44421968 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 44422056 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 19 44422215 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44422228 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44422246 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44422686 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 44422907 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44423741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44424251 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44424537 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 44425434 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 44425586 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44426216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44426302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44426320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44426576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44426585 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44426641 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44427094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44428298 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44428485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44429138 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44430153 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44430259 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 44430617 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 44431494 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44431937 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44431954 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44432029 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 44432415 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44432441 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 44432828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44432977 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 44433250 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 44433402 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44433403 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44433421 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44433441 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44433589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44433605 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44433641 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44433650 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44433936 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 44433937 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44434037 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44434094 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44435888 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44436485 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44440333 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44440688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44441490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44441706 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44441726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44441849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44443182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44443749 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44445001 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 44445619 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44445621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44446134 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 44446587 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44446969 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44447015 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44447032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44447228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44447332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44447795 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44447924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44448130 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44448578 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 44454103 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 44456037 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44456895 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 44457564 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44459557 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44460302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44460631 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44461014 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 44462281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44463016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44463033 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44463983 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 44464052 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 44464637 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 44464912 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 44465366 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 44465371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44466209 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 19 44466341 G A N Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 19 44467048 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 44467143 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 44467191 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 44467310 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 44467665 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 44469329 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 44469330 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 44469389 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44470533 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 44470912 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 44471000 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 44471416 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44473690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44474211 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44475547 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 44477120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44477429 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44479332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44479642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44479658 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 44480069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44480247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44480735 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 44484898 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44487993 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44489090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44489927 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44490331 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44491566 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 44491682 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 44493233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44493400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44494173 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44494179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44495109 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44495256 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 44495258 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 44495275 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 44495276 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 44495303 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 44496051 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 44497042 C G Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 44497084 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 44497199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44497345 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44497449 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 44497526 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 44497545 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44497554 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44497767 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 44498115 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44498150 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44498196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44498343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44498415 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44499638 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44499882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44501278 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44501906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44502768 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 44502970 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 44503053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44503058 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 44503098 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 44503684 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44504095 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 44504487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44505971 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 44505999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44507145 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 44507227 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44507534 A C N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 44507866 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44508170 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44508223 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 44508671 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 44509453 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 44509886 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 44509895 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 44510282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44510778 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 44511637 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 44512091 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44512111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44512896 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 44512928 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44513166 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 44513547 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44513844 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 44513869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44513879 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44514411 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 44514708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44515231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44515371 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44515950 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44516067 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44516260 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44516402 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44516554 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 44516831 T C N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 19 44516854 G A N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 19 44517558 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 44517575 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 44517584 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44517925 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 44517962 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 44517970 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 44518053 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 44518187 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 44518224 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 44518256 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 44518342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44518755 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 44518758 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 44518815 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44518886 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 44519035 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 44519067 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44519084 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 44519114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44519125 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 44519129 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 44519193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44519289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44519297 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44519634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44519648 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44519667 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 44519686 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44519732 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44519770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44519864 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 44520150 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44520202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44520309 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 44523238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44523857 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 44524315 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 44524339 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 44524497 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44524523 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 44524704 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44526659 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 44527482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44528344 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 19 44529353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44529808 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44530801 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 44531449 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 44532738 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 44533975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44534076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44534650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44535003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44535021 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44535047 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44535489 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44535930 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44536263 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 44536355 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 44536378 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 44536405 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 44536486 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 44536487 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 44536743 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 44537382 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 44538795 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 44539360 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44539546 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44540049 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 44540078 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44540107 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 44540110 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44540241 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 44540251 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 44540913 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44541028 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 44541232 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 44541233 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 44541704 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 44541839 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44541943 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44541986 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44542025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44542283 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 44542313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44542375 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 44542446 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44542470 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44542482 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44542507 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44542564 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44542632 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44542711 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44542736 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 44542780 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44542781 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44542813 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44542837 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44542857 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44542880 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44542883 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44542926 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44542965 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44543255 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44543351 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44543370 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 44543423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44543497 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44543504 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44543534 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 44543552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44543625 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 44543741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44543779 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44543788 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 44543829 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 44543867 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 44543959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44543985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44544002 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 44544003 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44544278 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 44544288 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 44544368 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 44544373 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 44544479 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 44544609 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44544932 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 44545055 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44545067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44545232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44545268 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44545276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44545343 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44545373 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44545556 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 44545657 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 44545769 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 44546105 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44546106 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44546197 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 44546440 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 44548931 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44549237 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 44549605 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44550380 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 44550425 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 44550554 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 44550573 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 44550936 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 44551011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44551029 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44551178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44551331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44551773 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 44552956 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 44553272 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44553344 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 44553515 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 44554072 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44554252 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44554371 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44555452 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 44555611 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 44555747 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44555760 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44556018 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 44556189 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 44556247 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 44557258 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 19 44557359 T A N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 19 44557744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44557746 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44558853 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 44558864 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 44558898 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 44558910 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 44558959 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 44559009 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 44559197 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 44559203 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 44559222 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 44559298 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 19 44559340 G T N N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 19 44559407 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 44559449 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 44559467 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44559511 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 44559530 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 44559556 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 44559602 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 44559680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44559824 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 44559983 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44560239 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44561001 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44561079 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 44561347 A T N N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.272727272727273 0.272727272727273 0.454545454545455 9 13 3 3 5 19 44561586 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 44562070 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 44562108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44562910 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 44562949 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 44563070 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 44563170 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44563249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44563332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44563589 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 44563592 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 44563599 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 44563632 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 44563653 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 44563960 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 44564231 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 44564446 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 44564667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44565018 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 44565035 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 44565074 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 19 44565553 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 44565608 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 44565616 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 44565624 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 44565646 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 44565888 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 19 44566621 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44566634 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44566679 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 44566726 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 44567178 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 44567234 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44567247 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44567275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44567306 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44568325 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44568585 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44568746 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 44569682 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 44569835 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 44570101 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44570118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44570263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44570337 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44571144 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44572380 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44573043 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44573045 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44573075 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44573076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44573319 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 44573381 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 44573704 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 44573738 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 44573739 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 44573887 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 44574487 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44574499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44574543 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44574578 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44574794 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44574847 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 44574849 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 44574997 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44575007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44575049 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44575376 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44575416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44575545 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44575727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44575835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44575872 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 44575992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44576128 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44576131 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 44576252 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 44576435 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 44576456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44576581 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 44576678 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44576749 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 44576854 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 44576883 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 44577020 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44577385 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 44577419 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 44577464 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 44577672 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 44577677 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 44578060 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 44578115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44578611 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 44578660 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 44578698 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 44578726 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44578798 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 44578835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44578881 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 44579666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44579868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44579869 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 44579960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44580004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44580240 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44580486 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 44581454 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44583516 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44583768 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44584166 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 44585089 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44587582 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44587814 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 44587883 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 44587922 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 44587952 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 44588085 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 44588219 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44588362 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 44588370 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 44589968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44589974 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44590168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44590628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44591134 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 44591329 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44591365 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44591366 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44591390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44591623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44591633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44591805 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44592095 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44592270 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44592437 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 44592438 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44592721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44592723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44592883 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 44592941 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 44593113 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 44593202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44593203 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 44593230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44593233 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 44593234 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 44593261 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 44593271 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 44593332 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 44593336 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 44593350 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 44593359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44593369 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 44593692 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 44593696 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 44593697 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 44593909 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 44594026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44594085 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 44594100 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 44595118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44596231 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 44596381 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44597916 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44598122 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44599440 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 44599582 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 44600670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44603870 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 44604824 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44605102 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 44605104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44605353 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44605687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44605692 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 44605797 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44605883 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 44606189 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 44606367 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44606406 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44606414 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44606441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44606544 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 44606593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44606904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44607199 T A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 44607404 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 44607646 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44608090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44608140 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 44608141 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44608228 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 44608514 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 44611651 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44611777 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44611778 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 44611960 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44612029 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44612044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44612053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44612061 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44612135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44612181 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 44612224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44612390 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 44612417 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 44613377 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44613378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44614079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44615003 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44616980 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44617324 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44617817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44618187 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44618390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44618949 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44620866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44624791 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44626614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44626903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44628148 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44629157 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 44629759 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44629831 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44629852 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44630031 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 44630118 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44630124 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44630139 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44630268 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 44630273 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 44630373 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 44630773 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 44631186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44631201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44631279 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 44632077 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44632088 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 44633122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44633236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44635252 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44635258 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44635304 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 44635308 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 44635420 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 44635549 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 44636467 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44636588 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44637442 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 44639759 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44639825 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44639956 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44640014 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 44640121 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 44640266 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44640506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44640533 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 44641011 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44641179 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44641504 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44641837 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44641952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44641999 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44642444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44642469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44643066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44643128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44643545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44643571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44643992 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 44644461 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 44644967 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44645049 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44645229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44645409 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44645520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44646236 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44646522 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44647451 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44648023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44648025 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44648033 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44648057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44648116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44648156 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44648700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44648868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44648920 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44648966 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 44649340 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44649834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44649863 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44650025 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44650193 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44650782 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44650839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44651311 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44651932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44652072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44652473 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44652724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44654267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44654529 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44654837 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 44655431 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 44655613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44655620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44655682 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 44655714 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44655871 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44656173 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44657826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44658124 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 44658253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44658532 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44658660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44658748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44658808 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44659052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44660003 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44660872 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44660911 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44660981 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44660986 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44661255 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44661263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44661758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44662273 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 44662559 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44662587 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44662635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44662935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44662972 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44662984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44663379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44663417 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44664414 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44664495 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44666524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44667037 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44667588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44667709 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44667724 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44667913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44668978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44670216 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 44671531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44671698 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44672008 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44672020 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44672049 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44672076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44672083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44672437 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44672438 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44672545 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44673676 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 44674689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44675368 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44676052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44676302 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44677103 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44677125 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44677148 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44677316 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44677335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44677543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44678802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44678835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44680125 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44680896 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44681063 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44681080 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44682171 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44682459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44687944 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44690492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44690654 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 44690943 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 44691143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44691495 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44691880 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44692187 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 44692977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44694165 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 44694181 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 44694283 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44694335 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 44694357 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 44694522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44695484 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 44695506 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 44695507 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 44695717 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 44695721 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 44695766 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 44695810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44696290 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 19 44698010 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 44699683 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44699777 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44700596 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44700674 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 44701174 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 44701204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44701694 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 44701832 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44702046 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 44702279 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44702405 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44704739 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 44705417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44705683 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 44706750 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44708780 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 44708924 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44710898 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44711408 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 44711531 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44712280 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44712458 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44714200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44714269 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 44714461 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 44714485 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 44716122 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 44716240 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44716563 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44716710 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 44717489 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 44717625 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44717660 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 44717700 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 44717734 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 44717768 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 44717786 A C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 19 44717988 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44718361 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 44718889 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44718949 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 44719603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44719877 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44720945 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 44721024 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 44721060 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 44721512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44721654 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 44721672 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 44721777 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 44721805 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 44721808 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 44721835 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 44721882 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 44722034 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 44722046 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 44722123 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 44722497 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 44722501 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 44722571 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 44722875 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 44723170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44723259 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 44723278 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 44723698 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 44723809 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 44723836 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 44723978 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 44724048 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 44724684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44724925 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 44725069 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 19 44725459 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 44725525 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 44726958 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 44727290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44727616 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44727641 T C Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 44727757 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 44728287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44728687 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 44728728 C G Y N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 19 44729144 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 44729154 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 44729212 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 44729551 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44729885 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 44729945 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 44729997 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 44730180 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 44732336 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44732904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44733475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44734149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44738329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44738598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44739825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44740938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44742326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44742491 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 44742585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44742775 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 44742815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44742846 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 44742866 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44742943 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 44743020 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 44744010 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 44744015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44744018 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 44744082 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 44744093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44744363 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 44746958 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 44747014 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 44747246 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44747496 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44748039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44748375 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44749118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44752260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44754386 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44754473 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44754559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44754926 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 44754941 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 44755065 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44755066 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44755144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44755192 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 44755252 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44755295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44755315 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44755392 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 44755395 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 44755415 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44755495 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44755591 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44755625 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44755655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44755950 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 44755970 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 44756023 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 44756113 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 44757970 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44758248 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44759246 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44759434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44760449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44760664 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44760731 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 44761073 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 44761158 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 44761207 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44761320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44761422 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44761429 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44761449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44761590 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 44762342 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 44762355 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 44762358 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 44762405 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44762431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44762639 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 44762768 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44762789 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44763226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44763376 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44763709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44765596 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 44767493 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44768837 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44768971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44769163 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44771183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44771453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44771765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44773326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44773518 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44776288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44776995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44778245 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 44778496 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44778508 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 44778562 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44778569 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44779217 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44779360 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44779376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44779381 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44779713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44780129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44780460 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44781042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44781079 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 44782936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44784156 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44784219 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44784698 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 44785168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44788996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44794355 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44794533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44795196 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 44795401 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 44795546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44796222 G C N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 44797766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44802859 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 44805509 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 44806525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44807218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44807295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44810716 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44810866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44811980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44812064 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44812828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44812976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44814884 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44819388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44821014 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44821054 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44821063 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44823363 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 44823558 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44824722 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44825094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44827251 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44828803 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44829149 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44829833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44830790 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44832753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44833366 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44834051 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 44834239 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44834436 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 44834444 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44836493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44836577 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44837636 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44838872 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44838891 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44839039 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44839101 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44840333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44842029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44842476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44843954 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44844160 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44844264 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 44844273 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 44844287 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44844324 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44844361 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 44844364 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 44844378 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44844782 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44844818 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44844819 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44844912 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 44845059 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44845077 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44845200 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44845854 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44846221 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44846306 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44846599 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44846623 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 44846681 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44846759 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44846872 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 44847047 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44847278 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44847865 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 44848051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44848253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44849024 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44849081 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 44849557 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44849788 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 44849858 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44850025 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44850728 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 44850795 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 44851141 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44851844 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44852000 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44852383 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44852430 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44852738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44853441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44853770 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 44854602 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 44855368 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 44856640 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44857746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44859154 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44860610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44861341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44861516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44863691 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 44863971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44865931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44868330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44868414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44868484 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44868497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44868529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44869095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44869805 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44872514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44874848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44877679 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44878177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44878419 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44878469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44879113 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44880147 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44880962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44882274 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 44883250 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44884883 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44885044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44885369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44887208 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44887236 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44889061 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44891371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44892325 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44893203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44896609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44897179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44897974 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44898125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44898636 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44899365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44899382 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44899409 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44899975 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44900080 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44900453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44900686 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44901231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44901284 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 44903210 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44904526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44908593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44913724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44913803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44917254 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44917388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44917505 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44917880 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44918945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44919062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44922599 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44922821 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44923763 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 44924958 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44925564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44931159 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44931614 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 44931840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44931997 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44932270 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44932530 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44932559 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 44932659 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 44932662 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44932717 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 44932721 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 44932737 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 44932758 A G Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 44932848 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44932977 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 44933000 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44933437 A T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 44933444 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 44933493 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44933544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44933636 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 44933656 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44934626 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44935092 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44935793 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44935902 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44939884 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44941459 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44944162 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44944531 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44945658 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44947600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44947986 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 44947990 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 44948863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44950803 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44951601 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44951611 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44952342 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44953095 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44954967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44955549 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44956132 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44956768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44958981 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44961056 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44962597 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44962750 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44962763 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44962900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44962991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44963231 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44963241 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44963325 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 44963407 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 44963450 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 44963668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44963752 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 44963760 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 44963777 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 44963943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44964140 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44965208 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44965214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44965284 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 44965607 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44966336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44969920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44971335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44971503 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44973258 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44974174 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 44974206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44975989 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 44976076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44976585 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44977358 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44977626 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44977963 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 44977966 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44978548 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 44978581 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 44978750 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 44978755 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 44980070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44980561 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 44983322 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44984477 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44984791 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44984985 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44985010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44985531 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44986846 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44986920 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44988848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44989435 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 44990126 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44990193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44990475 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44991107 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 44991580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44991635 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 44991925 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44992481 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 44992603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44992632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44992676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44992746 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 44992907 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44994584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44994627 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44994630 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44994710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44994928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44994934 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44994994 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 44994995 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 44995009 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44995109 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44995111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44995195 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 44995272 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44995278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44995286 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 44995324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44995513 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44995519 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44995662 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 44995921 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44996737 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44997077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44997210 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44997248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44997250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44997304 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44997342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44997438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44997667 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 44997676 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44997759 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 44997903 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44997940 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 44998110 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 44998111 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 44998438 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44998555 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44998581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44998665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44999128 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 44999148 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44999320 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44999478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 44999805 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 45000962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45001150 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45001947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45002085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45002230 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45002320 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45002569 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 45002687 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 45003105 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45003434 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45003502 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45003682 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45004119 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45007215 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45007764 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45011430 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45011526 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45012053 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 45012167 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45014384 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 45015172 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 45016969 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45019347 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45019419 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 45020573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45020946 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45023231 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 45024485 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 45026844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45029609 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45032044 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45032289 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45033257 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45034891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45036125 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45036417 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45039192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45039886 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45042755 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45042854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45044963 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45045473 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 45046728 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45046803 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45046845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45047091 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 45048956 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45049152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45049763 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 45049970 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45051341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45051419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45051530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45056478 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45057596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45057610 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45059312 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 45061632 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45067495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45069306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45069805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45070134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45070146 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 45070343 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 45070745 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45071825 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45071840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45072406 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 45072670 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 45073688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45074355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45074575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45074694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45074834 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45075502 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 45078517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45079338 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 18 22 2 14 4 19 45081019 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 19 45081162 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 19 45087158 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45087696 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 45087874 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45088670 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 45089052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45089568 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 45090403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45091391 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45091894 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 45093597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45094408 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45095901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45096109 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45096532 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 45096585 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 45096915 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45098322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45098685 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45099045 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 19 45100504 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 45101677 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45101953 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45102232 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 45102606 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45102653 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 45102738 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45103351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45104361 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 45104716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45105465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45106121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45108001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45108291 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45108296 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45109390 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45110810 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 45111260 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45111666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45111708 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45112084 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 45112369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45113335 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 45113575 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45115664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45115755 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45115880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45115921 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 45115968 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 45116084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45116096 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45117190 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 45117191 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 45117249 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 19 45117326 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 45117334 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 45117386 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 45117399 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 45117525 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 45118163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45118414 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 45118895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45120262 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45121402 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45121484 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45121977 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45122930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45123256 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45124345 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 45124875 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45125247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45125304 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45125319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45125362 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45125622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45126025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45126159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45126302 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45126823 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45127027 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45127359 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 45128232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45128276 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 45128509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45128749 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 45128754 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 45128911 C A N N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 9 5 4 1 2 19 45129348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45129871 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 45129906 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 45129923 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45129924 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 45130911 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45131038 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45131402 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45131414 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45131490 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45131535 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45131717 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45131836 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45131840 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45131949 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45131950 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45132017 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45132033 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45132211 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 45132265 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45132740 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 45132754 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45132895 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45132921 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 45132944 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45132961 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45132969 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45132996 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45133023 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45133039 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45133105 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 45133272 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 45133280 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 45133327 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45133396 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45133412 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 45133457 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 45133511 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45133670 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45133705 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45133753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45133784 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45135084 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 45135358 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45135603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45136210 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45136468 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 45136919 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 45137111 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45138309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45138618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45140472 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 45141904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45142716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45143527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45143572 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45144065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45144128 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 45145363 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45145511 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45146130 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45146528 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45146533 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 45146587 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 45147433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45147786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45147868 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45148009 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45148193 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45148558 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45148614 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 45149179 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45149506 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 45149509 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 45149514 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 45149530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45149570 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 45149633 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 45149637 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 45149674 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 45150502 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45150563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45150925 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 45150931 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45152630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45153296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45153570 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 45154529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45154546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45154658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45154858 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45155185 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45155208 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45155430 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45155713 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45155726 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45156239 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45157125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45157332 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 45157407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45157518 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 45159209 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 45159375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45159672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45160331 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45160413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45160520 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 45160644 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 45160789 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45160799 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45160822 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45160826 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45160873 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45160987 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 45160999 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45161134 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 45161268 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 45161510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45162756 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 45163221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45163384 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 45163934 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 19 45164243 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45171572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45172242 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45172300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45172569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45172600 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45172644 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45172811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45172892 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 45174068 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45174316 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45174958 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45175821 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45175860 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 45175899 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 45176281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45176829 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 45177065 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 45177476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45177701 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45177708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45177751 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45177778 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45177803 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45177850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45178156 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45178242 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45178993 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45179799 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45179918 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45181328 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 45181496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45181550 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 45181904 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45182076 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 45182165 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45182274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45182517 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45183143 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 45183623 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 45184061 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45184062 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45184081 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45184088 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45184137 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45184186 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 45184216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45184501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45185136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45185153 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45185342 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45185697 A C N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 19 45185784 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 45185805 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 45185844 C T N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 19 45185993 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 45186007 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 45186014 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 45186060 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45186119 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45186381 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45186557 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 45186626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45186654 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 45187063 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 45187103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45188085 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45188502 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 45188556 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45189375 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 45189478 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45189739 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45189874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45190178 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45191012 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 45191378 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 45191406 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45191730 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45192538 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45192573 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 45193365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45193438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45193481 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45194525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45194582 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 45194738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45194819 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45194860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45194862 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 45194908 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 45194925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45194955 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 45194991 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45195313 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45195459 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45195531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45195610 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 45195628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45195924 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45196110 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 45196150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45196391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45196614 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45196619 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45196650 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 45196913 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 45196962 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 45196991 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45197035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45197126 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 45197137 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 45197170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45197412 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45197562 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45197746 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 45197825 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45198481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45198485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45198654 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45198724 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 45198797 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45198903 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45199005 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45199170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45199285 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 45199292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45199368 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45199519 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45199638 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45199683 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 45199781 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 45199913 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45199977 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45200119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45200355 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45200375 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45200894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45200938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45201470 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45201513 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 45201517 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45201518 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45201551 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45201555 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45201575 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45201578 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45201581 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45201591 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45201610 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45201617 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45201700 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45201726 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45201741 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45201902 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45201938 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45201958 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45202033 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45202072 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45202123 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 45202149 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 45202281 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 45202515 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45202613 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45202617 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45202651 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 45202657 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45202833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45202906 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45202912 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45202956 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45203096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45203462 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45203645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45203739 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45203761 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45203775 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45203911 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45203957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45204015 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45204035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45204074 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45204078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45204099 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45204173 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45204201 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45204207 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45204256 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45204386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45204503 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45204543 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45204558 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45204800 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45204819 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45204846 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45205378 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45205684 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45205898 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 45206396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45206583 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 45206638 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 45206774 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 45206824 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 45207186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45207299 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 45207474 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 45207477 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45207626 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 45207637 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 45207704 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45207982 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45208017 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 45208071 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 45208073 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45208075 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 45208200 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45208269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45208324 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45208337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45208341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45208398 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45208399 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45208445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45208515 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45208595 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45208839 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45208841 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45208891 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45208900 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45208936 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45208970 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45209097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45209246 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 45209388 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45209595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45209703 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 45209704 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 45209707 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 45209725 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 45209736 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 45209750 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 19 45210054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45210192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45210201 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45210260 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 45210261 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45210366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45210775 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45210801 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45211074 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45211311 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45211381 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45211760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45211785 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45212039 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45212719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45212792 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45213282 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45213797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45214033 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45214145 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 45214329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45214472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45214489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45214675 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45215030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45215219 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 45215265 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45215282 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45215346 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45215423 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 45215623 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45215787 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45215994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45216003 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 45216054 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45216374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45216416 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45216801 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 45217064 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 45217557 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 45217560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45218138 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45219180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45219357 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 45219578 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 45219614 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 45219633 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 45219673 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45219777 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 45219782 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 45219848 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 45219905 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 45219937 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 45219957 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 45219978 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 45220027 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 45220604 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45220942 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45221688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45221921 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45222002 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45222375 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45222584 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45222645 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 45222685 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45222839 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45222852 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45223302 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 45224282 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 45224950 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45225313 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45225367 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45225885 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 45227278 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45227392 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 45227459 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45227474 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 45227561 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 45227728 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45227782 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45228236 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45228309 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 45228359 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 45228368 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 45228378 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 45229056 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45229466 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 45229758 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 45229957 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45230893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45231054 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 45231066 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 45231202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45231505 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45231964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45232074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45232241 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45232444 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45232867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45232930 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 45232935 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 45233163 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45233286 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45233322 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45233491 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 45233596 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45233739 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45234043 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45234659 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45234725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45235116 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45235212 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45235270 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45235382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45235383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45235433 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45235562 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45235599 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45235693 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45235778 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45235866 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45235985 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45236036 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45236073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45236096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45236782 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45237044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45237555 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45237682 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45237905 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45238025 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45238114 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45238600 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45238644 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45238648 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45239313 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45239588 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45239658 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45239818 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45239850 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45239859 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45239997 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45240125 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45240471 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45240749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45241109 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45241241 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45241471 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 45241526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45241607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45242073 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 45242610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45242724 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45242741 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 45242856 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 19 45242859 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 19 45242896 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 45242902 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45242991 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45243007 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45243255 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 45243341 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45243709 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45243865 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45243982 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45244004 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45244037 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 45244047 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45244062 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45244406 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 45244766 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 45244829 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 45244901 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 45244906 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 45244919 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 45245112 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 45245311 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 45245449 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 45245937 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45246166 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 45246202 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45246244 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45247371 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45247644 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45247974 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45248029 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 45248506 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 45249230 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45249267 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 45250672 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 45250739 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45250771 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 45251049 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45251166 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45251237 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45251244 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45251339 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45251396 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 45251397 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 45251409 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 45251445 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45251575 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 45251647 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 45251735 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 45251884 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45251960 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 45252023 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 45252061 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 45252200 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45252207 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45252461 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45252463 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45252516 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45253001 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45253172 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45253216 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45253510 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45253515 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45253534 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45253747 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45253748 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45253917 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45253970 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45254085 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45254165 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45254222 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45254247 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45254331 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45254361 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45254416 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45254445 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45254724 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45254809 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45254813 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45254826 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45254827 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45254893 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45254920 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45254994 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45255227 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45255287 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45255311 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45255331 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45255354 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45255404 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45255504 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45255519 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45255530 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45255684 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45255690 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45255700 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45266568 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 45266572 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 19 45266640 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 45266695 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 45266808 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 45266899 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45266911 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45266920 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45267218 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45267405 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45267428 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45267513 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45267598 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45267603 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45267642 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45267780 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45267787 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45267804 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45267832 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45268522 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45268580 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45268622 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45268752 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45268776 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45268794 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 45268920 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45269030 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45269137 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45269180 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45269226 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45269252 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45269276 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45269592 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45269609 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45269850 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45270033 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 19 45270316 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45270414 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45270525 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 45270848 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 45270857 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 45271200 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45271587 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45272762 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45272866 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45272926 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45273256 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45273354 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 45273430 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45274335 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45274394 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45274494 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45274540 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 45274561 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45274666 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45274784 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45274790 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45274801 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45274931 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45274958 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45274975 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45275124 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45275781 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45275891 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45275902 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45275994 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45276011 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45276074 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45276111 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45276186 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45276202 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45276281 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45276328 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45276476 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45276627 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45276974 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45277121 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45280361 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45280470 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45280503 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 45280587 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 45280592 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45280606 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45280611 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45280623 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45280629 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45280646 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45280717 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45280739 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45280748 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45281052 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45281081 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45281137 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45281205 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45281237 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45281407 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45281552 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45281554 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45281702 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45281722 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45281953 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45281984 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45283009 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45283018 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45283111 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45283116 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45283296 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45283538 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45283727 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45283816 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45283909 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45284318 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45284514 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45284526 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45284594 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45284781 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45284988 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 45285027 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 45285034 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 45285628 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45289166 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 45289364 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 45289534 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 45289776 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 45291432 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 45291452 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45292279 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 45292391 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 45292409 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 45292410 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 45292466 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 45292589 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45292600 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45292741 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 45292798 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 45292893 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45292948 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45293031 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 45293040 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 19 45293318 C T N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 19 45293350 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 19 45293413 C G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 45293466 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 45293470 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 45293484 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 45293522 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 45293674 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45293900 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45294037 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45294053 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 45294054 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45295394 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 45295424 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 45295709 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 19 45295891 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 45296134 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 45300984 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 45301011 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45301018 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45301450 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 45302047 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45303691 T C N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 19 45305090 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45305243 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 45307125 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45307511 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 45309381 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45313132 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45313316 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 45314606 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 45314819 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 45315657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45315840 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 45317435 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45317639 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45318029 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45318052 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45318497 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 45319238 T G N N 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 19 45319249 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 19 45319251 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 19 45319428 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45319997 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45320265 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 45320500 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45320536 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45321882 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 45321955 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45321972 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45322275 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45322853 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45322935 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 45323042 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45324773 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45325218 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45326933 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 45327096 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45327112 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45328356 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45328619 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45330037 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 45331268 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45331433 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45331851 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 45333939 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45333988 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45334452 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 45334574 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45335381 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 45337278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45339351 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 45346100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45349859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45351266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45355485 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45356149 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 45357053 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45357462 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45357919 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45359968 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 45359976 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 45360017 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45360030 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45360199 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 19 45360857 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 45361402 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45361431 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45361631 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45361775 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45362040 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45362396 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45362423 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 45362482 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 45362483 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 45362516 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45363037 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 45363430 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 45363481 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 45363512 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45363984 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 45364145 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 45364211 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 45364213 G T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 45364226 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 45364312 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 45364313 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 45364314 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 45364349 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 45364386 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 45364449 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 45364493 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 45364502 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 45364524 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 45364589 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 45364639 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 45364652 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 45364659 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 45364859 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 45364972 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 45364976 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45365177 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 45365318 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 45365329 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45366310 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 45366405 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 45366592 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 45366638 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 45367102 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 45367440 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45367485 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 45367814 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 45367871 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 45367889 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 45368575 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 45368650 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 45369399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45370103 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 45371891 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45372045 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45375178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45375457 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 45377536 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 45377550 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45377640 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45377973 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 45378187 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 45378326 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45378360 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45378651 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 19 45379191 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 45379564 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 45379587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45379802 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 45379970 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 45379991 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 45380002 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 45380016 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 45380331 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 45380465 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 45380471 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 45380518 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 45380974 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 45381040 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45381145 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 45381213 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45381216 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45381739 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 45382078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45382334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45382384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45382907 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 45383210 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 45383373 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 45383459 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 45383532 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 45384301 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 45384611 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 45384771 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 45384886 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45385041 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 45385071 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 45385095 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 45385105 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 45385206 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 45385211 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 45385216 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 45385368 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 45385420 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 45385591 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 45386000 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 45386001 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 45386317 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 45386976 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45387214 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 45387341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45387469 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45387587 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 45388374 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45388432 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 45388472 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45388498 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 45388760 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 45389053 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 45389334 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45389900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45390094 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45390137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45390169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45390292 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45390310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45390325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45390408 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45390592 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45390642 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 45390699 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 45390838 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45390916 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 45391049 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 45391114 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 45391125 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 45391129 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 45391160 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 45391485 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 19 45391759 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 45394073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45394303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45397055 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 45397444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45398109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45398454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45399421 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45399546 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 45399825 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45401982 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 45402545 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45402547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45403161 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 45403463 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 45403475 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 45403868 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 45404112 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45404223 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45404805 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 45404930 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 45405691 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45406556 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45406659 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 45406684 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 45406867 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45406894 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45406913 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 45407053 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45407080 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 45407091 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 45407117 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45407125 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45407132 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45407266 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45407313 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45407397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45407494 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45407521 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45407782 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45407792 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45407793 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45408352 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45408376 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45408388 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45408393 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45408402 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45408403 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45408507 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 45408554 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 45408760 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 45409164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45409430 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45409749 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45409933 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45410037 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 45410061 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 45410282 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45410472 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45410487 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45410536 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45410757 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45410934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45411763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45411818 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45411978 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45411980 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45411999 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45412061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45412141 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45412378 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45412412 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45413319 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 45413580 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 45413728 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45413867 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 45414504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45414522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45415205 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45415632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45417247 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45417248 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45417503 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 45417536 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45417716 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45417752 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45417892 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 45417963 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 45418759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45419020 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45419082 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45419365 T C Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 19 45419493 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 45419589 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45419639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45420106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45420739 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45420742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45421092 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45421123 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45421172 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45421183 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45422117 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45423147 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 45423176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45424603 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45426675 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45426899 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45427215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45427425 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45429956 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45430375 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45430777 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45431094 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45433532 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 45434651 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 45435763 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45436905 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 45437182 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45438256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45438901 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45439749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45440240 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45441351 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45441377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45441655 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45441830 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 45442963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45443365 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45443862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45443930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45445524 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 45450692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45451699 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45452140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45452443 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45452910 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45453022 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45454405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45454447 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45455519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45456729 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 45457506 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45458495 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45458499 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45458503 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45458510 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45459133 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45459319 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45459423 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45459639 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45459649 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45461949 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45463209 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45464004 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45464560 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45466719 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45466730 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45466948 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45468755 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45469555 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45469878 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45469879 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45471234 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 45472239 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 45472310 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45472765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45474365 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45475014 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45475132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45476342 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45478733 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45479117 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45479661 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 45480797 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45480867 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45481260 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45482388 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45483243 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 45483394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45483697 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 45483775 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45484662 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 45485200 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 45485397 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 45485424 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 45485425 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 45485891 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 45486038 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 45486204 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45489607 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45489637 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45491937 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45493630 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45494291 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45495848 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45495971 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45496330 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45496440 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 45496528 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45496818 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45497244 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45497386 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45497989 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45498207 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45498264 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45498756 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45502055 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45503790 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45503894 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45505014 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 45505186 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45505344 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45505590 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45506249 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45506429 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 45506484 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45507600 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45507734 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45509920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45510126 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 45510367 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45510995 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 45513831 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45513832 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45514041 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45515277 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45517467 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45517779 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 45518863 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45519152 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 45519763 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 45520563 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 45523598 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 45523847 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 45523961 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45524390 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45524628 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45524708 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45526285 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 45526712 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 45527285 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45529644 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45529845 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45532274 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 45534028 A G Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 19 45534987 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45535375 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45535845 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45537861 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45538857 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45539671 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45539951 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45540179 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45541876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45543532 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45546029 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45548188 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45549702 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45550241 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45550475 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 45552734 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 45554147 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45555278 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 45555340 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45555936 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 45556103 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 19 45556924 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 45558755 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45560378 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 45561725 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45562306 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45562478 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45563369 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45566457 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45567318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45567665 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45570546 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45571733 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 45572816 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45572909 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45574386 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45574732 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45577662 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45578362 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45580951 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 45581180 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45581298 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45582854 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 45585842 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45587241 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45591017 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45591099 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45592029 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45592352 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45593451 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45594868 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 45594870 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45594939 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45598435 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45598449 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45598517 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45598630 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45598802 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45599000 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45599003 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 45599008 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45599135 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45599327 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45599432 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45599655 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45600033 G C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 45600341 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 45600598 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 45600832 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45601040 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45601295 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45601316 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45601361 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45601385 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 45601413 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45601442 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45601514 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45602194 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45602514 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45602800 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45603087 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45603164 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45604557 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45604811 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45604828 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45604921 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45605800 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 45606503 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45607058 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 45607976 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45611996 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45612793 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45614069 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45614848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45616693 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45618475 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 45620174 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45626819 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45627210 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45628907 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 45630068 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45633202 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 45633298 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 45633366 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 45633681 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 45633761 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 45633820 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 19 45633828 T G N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 19 45634272 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 45635350 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45635687 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 45635696 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 45636384 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45636476 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 45636868 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 45636893 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45637456 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 45637956 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 45639857 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45639937 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45641153 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45642297 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45642572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45644149 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45644362 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45644569 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45648555 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45649641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45650969 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45651664 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 45652181 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45655312 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 45656686 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45657130 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45658064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45661586 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45663082 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45663567 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45664166 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45664196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45664223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45665858 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 45666444 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45666719 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45666968 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45667033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45667044 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45667624 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45667713 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45668406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45668436 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45668498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45668505 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45668506 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45668556 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45668680 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45668946 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45669178 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45669711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45670478 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45671100 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45671864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45672248 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45672601 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45672851 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45672932 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45672959 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45673152 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45673877 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45673971 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45674244 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45675079 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45675786 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45676311 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45676522 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45676534 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45678359 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45678871 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45678961 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45678973 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45678986 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45679326 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45679451 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45679709 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45680421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45681011 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45681133 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45681252 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45681263 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45682320 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45682446 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45682765 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45682855 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45682890 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45682928 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45683142 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45683583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45684579 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45684874 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45685072 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45685779 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45686129 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 45686282 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45686519 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45686531 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45686624 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45687071 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45687522 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45687638 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45687712 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45688031 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45688040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45688102 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45689096 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 45689697 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45690525 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45690697 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45690699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45691934 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45691995 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45692009 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45692195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45692446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45692470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45693081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45693426 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45693456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45693541 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45693996 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45694057 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45694359 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45694459 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45694940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45694949 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45694971 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45695107 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45695145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45695370 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45695381 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45695552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45695715 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45695893 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45695963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45696022 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45696113 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45696197 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45696389 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45698250 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45698339 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45698503 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45698553 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45699174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45699729 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 45699857 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45700360 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 45700507 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 45701226 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45701665 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45701991 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 45702225 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45702455 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45702732 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45702746 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45702777 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45702842 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45703368 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45703388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45703800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45704127 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 45704173 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45704310 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45704409 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45704545 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45704731 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 45704807 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45704922 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45704950 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 45705031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45705062 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45705065 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45705840 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45705985 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45706173 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 45706783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45706925 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45707342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45708028 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45708137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45708269 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45708718 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45708749 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45709018 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45709019 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45709220 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45709221 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 45709342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45709563 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45709657 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45709676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45709967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45709973 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45710049 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 45710115 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45710121 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 45710158 G A N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 19 45710511 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45710540 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45710809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45710893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45711045 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45712251 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45712252 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45712300 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45712317 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45713081 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45713082 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45713971 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45714615 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45715463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45716158 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45716188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45717482 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45718763 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45718787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45718794 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45719145 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45719167 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45719210 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 45719610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45719718 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45720095 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45720128 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45720273 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 45720467 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45720756 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45721398 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 45723243 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 45724246 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 45725882 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45727289 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45729102 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45729358 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 45730076 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45730081 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45730152 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45730488 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 45731032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45731075 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45731240 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45731740 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45732337 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45735093 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45735335 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45735393 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45735770 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45736217 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45739062 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 45740114 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45741648 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 45742137 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45743905 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45749124 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45751623 C A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 45754875 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 45755236 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 45759109 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 45759595 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 45761435 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 45763950 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45764888 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45765128 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45767123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45768071 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45769461 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 45770964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45781361 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45781578 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45783218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45783560 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45784994 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 45785001 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 45785004 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 45785040 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 45785046 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45785579 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45785966 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45786666 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45787096 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45787906 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45790554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45792037 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45792081 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 45792412 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 45793001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45793148 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 45793450 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45793576 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 45795362 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45795394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45795606 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45795611 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45795628 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45796243 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45798157 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45798363 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45801862 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45804475 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 45804813 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45805164 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45805245 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 45805270 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45805540 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45805565 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45807132 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45807453 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45808434 A T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 19 45808893 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 45810326 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 45820028 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45821662 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 45821819 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45822664 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45822995 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45823430 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45824494 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45826827 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 45828551 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45830356 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45831319 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45832204 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45832625 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 45832733 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45832737 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45833212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45833497 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45837444 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45838761 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45839362 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45840998 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45841059 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45841312 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 45843683 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45844363 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 45844527 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45845175 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45845402 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 45846731 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45848970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45849299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45849368 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 45849579 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 45849984 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45850487 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45850498 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45851973 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45852158 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45852308 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45853020 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45853388 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45853712 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 45853772 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45854087 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45854529 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45855083 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45856172 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45856691 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45856967 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45858046 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45858337 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 45861915 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45861970 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45861971 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45861992 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45863875 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45865530 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45865938 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 19 45866446 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 45867209 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45867627 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 45867814 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45867870 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45868099 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 45869333 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 45869825 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 45872920 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45872987 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45873490 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45874222 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45874237 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45874722 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45874816 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45876729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45876961 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45877121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45877398 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45877805 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 45878278 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45878290 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45878313 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45878382 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45878389 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45878438 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 45878444 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 45879291 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45879294 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45879380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45879617 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45879660 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45879687 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45879916 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45879989 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45880011 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45880025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45880251 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45881039 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45881122 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45882689 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45883120 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45883798 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 45884015 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45884240 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 45884348 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45884506 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45884621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45884724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45885434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45885872 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45886076 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45886203 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45886233 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45886417 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45886986 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45887040 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45888276 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 45888280 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 45889003 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45889046 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 45889048 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45889049 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45889239 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45889392 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 45890524 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 45892210 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45892642 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 45896315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45896593 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45896695 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45898863 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45899012 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45899714 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45899753 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45899979 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45900596 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45903237 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45905229 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45907302 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 45907769 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 45909154 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45909433 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45909599 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45910350 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45910473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45910818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45912774 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45912817 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45912827 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 45913610 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45913620 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 45913704 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45914216 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45914306 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45915462 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45915606 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 45915608 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45916041 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45916048 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45916107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45916179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45916289 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45916342 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45916371 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45916408 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45916559 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45917765 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45919564 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45921976 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45922262 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45922364 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45922425 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45922841 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45924353 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 45926608 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45926936 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45927513 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 45927520 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45927832 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 45929728 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45930470 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 45930845 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45931595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45931648 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45931911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45933119 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 45933531 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45933626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45933786 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45935078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45935178 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45935836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45939088 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45941380 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45941785 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45943660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45944069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45944392 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 45944664 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45944732 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45945921 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45946300 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45946587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45947434 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45948459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45948623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45949236 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45950067 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45953160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45953819 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45954163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45955656 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45956980 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45957216 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45957251 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45957254 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45957468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45957720 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45957985 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45957990 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45958021 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45958110 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45958297 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45958367 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 45958409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45958591 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45958600 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45958656 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45958684 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45958710 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45958897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45959058 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 45959122 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45959145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45959308 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45959674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45959869 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45959931 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45959946 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45960527 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45960540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45960565 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45960582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45960676 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 45960904 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45961492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45962632 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45962986 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45963185 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45963608 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 45964213 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45964852 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45965619 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45965637 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 45966716 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45967433 T A N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 45968259 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45968324 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45969273 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 45969462 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45969492 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45972561 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45972780 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45973767 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45974181 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45974215 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45974646 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45974776 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 45975027 G T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45977148 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45977981 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45979127 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45979851 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45980042 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45980330 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45980521 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45982275 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 45982353 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45983691 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45984486 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 45985957 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45986021 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45986578 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45986587 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45986626 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45986926 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 45986970 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 45987655 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45988807 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 45988825 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45990194 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 45990825 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45995898 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 45999006 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 46000762 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46000841 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46004094 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 46005931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46007723 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46007954 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46009351 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 46009510 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 46012814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46014569 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46016559 A C N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 46017644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46017826 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46018866 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46019843 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 46021069 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46021223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46022076 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46022583 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46023501 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 46024040 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46024414 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46025363 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46025852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46027048 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46027381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46027540 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 46027895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46028344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46028520 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 46028532 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46029708 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46030237 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 46030266 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46032004 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46032588 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 46034460 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46035054 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46035301 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46036105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46036915 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 46036947 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 46038386 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46038621 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46039020 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46039034 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 46039378 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 19 46039626 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 46039669 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46040091 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46040242 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 46040243 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 46040663 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46040858 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46041255 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46041276 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 46041724 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46041763 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 46041767 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 46041833 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 46041930 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46042094 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 46042139 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46042143 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46042164 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46042313 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46043970 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 46044324 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 19 46044784 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 46044872 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 46045285 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 46045392 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 46045644 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 46045754 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46045755 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46045758 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 46045796 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46045819 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 46045845 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46045930 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46045944 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46046375 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46046427 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46046781 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 46046817 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 46047257 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46047428 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46047633 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46047818 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46048622 A G N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 19 46049047 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 46049098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46049442 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46049574 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46049646 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 46049724 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 46049829 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 46049862 G C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 46049913 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 46050098 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 46050220 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46050274 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 46050411 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46050899 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46051232 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 46051474 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 46051475 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 46051677 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 46051864 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 46051893 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 46051895 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46051929 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46051982 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46052019 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 46052404 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 46052468 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 46052663 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 46052664 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 46052809 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46053267 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46053508 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46054368 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46054499 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46054786 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 46054826 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 46054832 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 46055817 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46056523 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 46056626 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 46056673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46057131 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 46057227 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 46058658 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46058683 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46061674 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46061762 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46063315 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46063347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46064408 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46064552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46066237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46066776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46067350 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 46067926 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 46068528 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46069574 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 46069754 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 46071543 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46071869 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 46071997 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46074260 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46074261 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46074684 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 46075027 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 46076139 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 46076304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46076685 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 46076820 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46077484 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46077831 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46079178 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46079186 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46079469 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46080570 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46082149 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 46082175 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46083313 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46083637 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46084890 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46085410 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46087769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46089794 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46090165 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 46090628 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 46090676 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46090876 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 46091858 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46092018 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 46092185 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46092394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46092974 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 46093006 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46093112 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46093728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46093898 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 46093965 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 46094317 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 46094760 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 46096689 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46096972 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 19 46097650 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46097982 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46098202 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46099522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46099893 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 46099972 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46099997 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 46100023 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 46100319 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 46100333 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 46100670 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 46100740 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 46101146 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46101556 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 46102536 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 46103290 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 46103617 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46104640 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 46106630 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 46109270 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46111680 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46112033 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46112719 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46116077 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 46116091 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46117446 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 46119882 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46122800 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46122968 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46129093 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46129770 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46130929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46135237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46137037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46137230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46138109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46141388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46144397 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46148067 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46148910 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46148964 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46153852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46154910 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46155947 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46155962 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 46156506 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 46158405 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46158444 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 46158456 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46159029 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46159958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46160730 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46162370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46163645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46163740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46163865 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 46163900 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46164492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46164869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46164889 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46165503 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 46166368 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46166411 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46167269 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 46167500 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 46167833 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46168129 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 46169646 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 46175177 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 46176882 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46179307 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 46181755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46181983 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46185189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46186249 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 46187590 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 46189946 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 46190788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46190982 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 46191086 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46191161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46191340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46191550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46192644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46192867 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 46192929 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46192979 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46193398 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46194086 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46195528 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46195887 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46196004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46196179 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 46196321 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 46198175 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 46198886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46199068 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 46200370 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46201162 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46206352 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46207168 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46209902 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46210216 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46212917 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46215274 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46216503 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46217012 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46219363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46219917 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 46220866 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46220881 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 46220943 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 46221281 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46221690 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46221821 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46222855 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46222936 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 46222964 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46223035 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46224126 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 46224475 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 46224543 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46225136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46226275 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46226545 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 46227245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46227387 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46227931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46228415 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 46228464 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46228637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46228873 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46229491 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 46232640 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46233032 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 46233548 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46234025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46234413 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 46234773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46234821 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 46234823 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 46234825 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 46234829 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 46234926 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46234968 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 46235656 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 46235875 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 46237107 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 46237205 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 19 46237547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46237634 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46237636 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46238255 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46238595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46238665 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46238973 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 46239120 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46240261 G C N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 46240418 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 46241616 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46242271 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46242276 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46242857 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 46242925 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46243385 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 46243386 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 46243813 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46243816 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46243826 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46243827 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46243852 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46243941 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46244781 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46245031 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46245183 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46245344 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46245466 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 46245525 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46245572 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46245596 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46245696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46245813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46246157 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46246239 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46246476 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46246605 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 46246613 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 46246963 A T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 19 46247061 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46247234 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46247428 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 46247465 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 46247538 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 46247581 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 46249022 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46249393 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 46251929 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46252865 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46253747 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46254587 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46254588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46255073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46255389 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46256384 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 19 46258455 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46260659 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46260731 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46262758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46262968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46262978 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46262992 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46263241 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46264616 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46264986 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 46266015 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 46268679 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 46270399 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46270607 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 46271525 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46271582 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 46271595 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46271662 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 46271921 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 46272594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46272665 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46272776 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 46272919 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46273273 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46273380 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 46273509 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46273628 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 46273647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46273674 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 46274000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46275481 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46275519 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46275824 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 46276140 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46276589 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46277060 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46277760 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 46277899 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46278144 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 46278491 G T N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 19 46278821 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46278822 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46278916 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 46279087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46281139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46281160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46281338 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46281443 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46281489 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 46283524 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46283687 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46285473 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46287359 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46287497 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46290113 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46290433 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46296033 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46296046 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 46296156 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46297457 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46298324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46298604 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46298726 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 46299508 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46300285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46300543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46301512 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 46301968 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46302568 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 46306466 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 46308393 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 46309791 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46310146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46311325 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46311326 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46311378 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 46312013 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46312097 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46313604 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46314654 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46316356 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46316505 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46316673 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 46317205 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46317987 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46318935 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 46319814 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46319874 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 46321168 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 46323426 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 46323597 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46325178 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 46325561 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46325795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46327933 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46329407 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46330337 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 46332200 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 46334130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46334727 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46335343 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 46338918 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 46339370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46339527 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46339640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46340295 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46340712 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46342781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46343085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46343231 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46343574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46344176 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46344220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46345301 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 46345419 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46346842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46346975 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46347423 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46347585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46348156 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 46348469 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46352501 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46352891 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46353040 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46355875 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46356630 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46356638 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46357727 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46358003 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46359748 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46359749 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46360118 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 46360206 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46362422 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46364374 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 46364551 C A Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 46364973 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 46365055 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 46365192 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 46365635 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 46365667 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46365727 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46365761 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46365802 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46365810 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 46366312 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46368126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46368235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46370507 G A N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 19 46371268 T C N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 19 46371837 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46373792 C T Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 19 46375313 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46375637 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 46375668 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46375995 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46378519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46378805 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46379842 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 46380429 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 46383431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46384575 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 46384795 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 46384943 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 46384978 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 46386408 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46386477 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46386767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46391038 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46391913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46392744 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46394072 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 46395162 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46396275 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 46396472 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 46398386 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46398622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46399785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46402489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46404551 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46404887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46407250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46407708 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 46408296 G T Y N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 46408438 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46409885 G A N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 19 46410269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46411642 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46413925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46414661 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46415578 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46418279 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46419678 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46420346 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 46420897 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 46423394 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46423685 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 46424388 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 46424414 G A N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 19 46424510 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 46424576 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46425062 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 46425352 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46425687 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46425690 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46425855 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 46425988 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46426232 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46426303 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 46426454 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46426508 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46426762 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46427213 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46427225 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 46427582 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 46427699 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 46428061 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 46428144 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 46428169 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 46428173 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 46428571 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 46428817 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46429350 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 46429590 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 46429635 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 46429723 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 46429724 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 46429730 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 46429774 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 46429844 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 46429851 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 46429894 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 46430144 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46430540 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 46430969 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 46431393 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46431522 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 46431700 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46432395 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46433197 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46433240 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46433863 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46435126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46435239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46436057 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 46436125 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 46436363 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 46436694 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46436793 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 46436814 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 46437075 A T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 46437117 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46437755 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46438469 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46438516 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 46438601 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46438846 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 46438906 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 46439273 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 46439615 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46439781 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 46440067 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 46440511 C T N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 19 46440556 C T N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.272727272727273 15 7 7 1 3 19 46440734 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 46441495 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 46441514 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 46441612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46441741 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46441880 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46442964 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46443125 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46443377 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46444199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46444659 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 46444902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46445832 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46445931 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46447922 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46449624 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46449896 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 46450290 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 46451272 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 46451351 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46451476 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46452058 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 46452232 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 46452351 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 46452394 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 46452732 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 46453500 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 46453551 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 46453840 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 46453877 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 46454847 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 46455194 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 46455200 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 46455491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46455701 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 46455955 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 46456545 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 46457069 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 46457142 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46457281 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46457665 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 46457668 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46458110 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46458270 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46458372 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46458469 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46459110 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 46459368 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 46460188 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 8 16 0 8 4 19 46460225 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 46460877 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 46460899 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46461563 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46461809 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46461866 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 46462111 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46462135 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46462162 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46462218 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46462257 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46462262 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46462354 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 46462362 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 46462380 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46464085 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 46465477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46465540 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46466510 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46467133 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 46470751 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46471136 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 46471828 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46473424 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46473446 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 46473456 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 46473750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46473853 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 46473958 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 46474096 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 46474330 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46475145 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 46476780 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 46477003 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 46477325 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 46477458 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 46478013 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46478215 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 46478328 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46478348 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 46478516 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46478845 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 46479109 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 46479534 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46479689 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46479750 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46479848 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 46479970 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46480014 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 46480060 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 46480292 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46480615 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 46480655 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 46480674 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 46480809 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 46480838 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46480893 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 46481145 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46481153 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 46481216 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 46481488 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46481782 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 46481789 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 46481802 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 46481824 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 46482097 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 46482126 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 46482134 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46482259 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 46482390 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 46482481 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 46482516 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46482595 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 46482831 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46483441 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 46483529 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 46483646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46483679 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 46484468 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 46484812 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 46484998 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 46484999 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46485018 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46485115 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46485231 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 46485272 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46485488 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46485712 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 46485741 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 46485884 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 46485951 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 46486121 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 46486259 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46486267 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 46486273 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46486330 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46486480 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 46486591 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 46486741 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46487515 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46487783 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46488901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46489764 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46490122 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46490727 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46490835 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46490994 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46491836 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46492966 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 46493150 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 46493372 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 46493373 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 19 46493387 C G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 46494531 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 46495227 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46495601 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 46495997 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 46497450 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46497677 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46499426 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 46499976 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46500105 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46500381 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46500979 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 19 46501438 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46501938 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46502735 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46503430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46504168 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 46504181 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46506637 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46507904 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46507924 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46509005 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46509110 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46510021 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46511604 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46512019 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46512682 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46513444 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46513748 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46514651 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46515582 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46520247 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 46521051 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46521363 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46521691 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46522857 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 46523412 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 46523457 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46525308 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46525463 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46525524 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 46526139 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46526163 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 46526645 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 46527127 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46528247 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46530144 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46531064 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46531728 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46531895 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46533509 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46533833 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46537356 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46538230 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46538301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46539542 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46542677 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46542951 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46543818 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46548348 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46550989 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46553148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46553164 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46553333 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46553430 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46553577 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46553580 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46554555 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46554562 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46554597 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46554926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46555501 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 46555523 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46555587 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46555942 A T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 46556279 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46556820 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 46557139 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 46557660 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46557673 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46557728 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 46557938 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 46557943 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 46557945 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 46558137 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 46559235 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46559365 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46559641 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46559751 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46559890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46560999 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46561205 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46561723 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46562644 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46564758 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46566193 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 46566197 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 46566318 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 46566483 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 46567277 A G Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 19 46567968 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46569506 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46569571 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 19 46569748 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 46569751 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 46569758 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46571578 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46571651 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 46571908 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46572033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46574985 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46578183 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46579269 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 46580668 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46580755 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46583626 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 46583657 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 46588256 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46588902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46589087 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 46590714 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 46593131 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 46593642 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46593737 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 46595410 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 46595425 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 46595948 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 46597253 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 46597276 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 46597673 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 19 46600319 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 46600415 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 46600535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46600611 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 46600747 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 46601224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46601322 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 46601422 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 46601567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46601594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46601644 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46601667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46601865 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 46601984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46602023 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 46602325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46603199 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 46603218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46603894 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 19 46604362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46604686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46605046 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46605065 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 46605324 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 46606317 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 19 46606363 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 19 46607598 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 46608156 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 46608226 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 46608248 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46608436 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 46608513 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 46609007 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 19 46609523 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 46609534 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 46609601 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 46609780 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 46610042 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46610381 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46610512 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 46610698 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 46610859 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 46610892 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 46610928 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 46610983 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 46611789 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 46611884 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 46612445 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 46612474 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 46612561 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 46613961 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 46614010 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 46614013 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 46614048 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 46614207 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 46614213 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 46614365 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 46615249 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 46615551 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 46616077 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 46616213 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 46616531 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46616555 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46616605 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46616771 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46617262 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 46617908 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 46617935 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 46618181 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46618384 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 46618408 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 46618455 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46618493 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 46618497 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 46618564 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 46618631 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 19 46618973 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 46619000 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46619028 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46619056 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 46619165 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 46619209 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 46619320 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 46619323 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 46619583 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 46619726 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 46620177 T A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 19 46620321 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 46620341 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 46620582 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 46620935 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 19 46621290 A G N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 19 46621836 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46621957 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46622115 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46622139 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46622158 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46622188 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46622337 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46622372 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46622383 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46622393 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46623032 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46623118 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46623634 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46623654 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46623703 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46623719 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 46623772 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 46623790 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46623829 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46623832 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46623837 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46623879 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46623884 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 46623897 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46623909 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46623999 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46624051 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46624226 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 46624402 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46624426 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46624496 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46624497 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 46624580 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46624582 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46624833 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 46624845 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 46624986 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46625187 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46625231 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 46625384 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46625428 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46625461 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46625512 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46625711 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46625822 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46625857 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46626045 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46626156 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46626162 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46626279 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46626553 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 46626606 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46626662 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 46626666 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 46626899 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 46626905 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46626945 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46627055 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46627084 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46627085 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46627101 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46627156 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46627214 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 46627311 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 46627317 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 46627330 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 46627395 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 46627856 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 46627863 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 46628179 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 46628230 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 46628416 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46628451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46628756 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 46628843 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 46629157 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46630205 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 46630533 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46630561 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 46631297 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 46631356 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 46631784 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46632147 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46632358 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46632473 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46633308 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46634443 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46634745 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 46635054 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 46635213 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46635240 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 46635769 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 46636715 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46637452 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 46638348 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 46639675 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 46640701 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 46641188 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 46641601 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 46642287 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46642607 C G N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 19 46642978 T C Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 46644233 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46645288 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46645367 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 46645628 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 46646667 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46646731 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46647276 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 46647334 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 46651149 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 46651462 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 46651485 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46651487 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 46651545 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46651866 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46651939 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46652074 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 46652078 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 46652389 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 46652440 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46652446 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46652458 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 46653560 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 46655586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46655637 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 46655644 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46656117 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46656155 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46657000 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46657640 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46657734 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 46657760 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 46657901 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 46657995 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 19 46659402 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 46659592 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46659666 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 46660590 T C N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 19 46660672 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 46660848 C G N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 19 46661320 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46661579 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46661590 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46661657 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 46662118 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 46662309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46662533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46662737 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 46662890 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 46662950 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 46662964 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 46663437 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 46663651 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46663697 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46663927 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46664107 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 46664111 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 46664160 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46664168 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 46664329 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 46664748 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 46665732 C T N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 19 46666078 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 46666177 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46666201 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46667687 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 46667754 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46667778 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 46667791 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 46668515 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 46668574 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46668630 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 46668726 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46668757 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46668891 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46669086 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 46669100 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 46669141 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46669397 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46669638 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46669686 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 46670050 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 46670202 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 46670206 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 46670221 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 46670394 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46670452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46670454 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46670491 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46670505 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46670611 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46670619 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46670647 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46670827 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46670966 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46670983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46671135 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46671372 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46671373 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46671438 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46671446 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46671471 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46671538 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46671562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46671643 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46671703 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46671735 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46671818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46672029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46672257 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 46672299 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46672405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46672770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46672877 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 46673490 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 46673491 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46674030 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46674274 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46674280 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 46674516 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 46674855 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46674866 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46674867 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46675093 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46675471 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 19 46675501 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 46675637 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 46676649 C A Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 19 46676672 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 19 46676673 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 46676690 T A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 19 46677428 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 46677429 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 46677617 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46677626 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46677717 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 46677731 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 46678282 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 46678349 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46678611 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46678623 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 46678649 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 46678765 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46678777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46678791 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46678802 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 46678803 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 46679116 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 46679400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46679409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46679465 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 46679565 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46679610 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46679622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46680311 T A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 19 46680528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46680741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46680817 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46680916 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46680923 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46681049 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 46681073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46681074 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46681138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46681323 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46681351 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 46681524 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46681572 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 46681603 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 46681781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46681825 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46681993 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 46682218 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46682230 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 46682380 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46682874 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46683027 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 46683140 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 46683216 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46683344 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 46683454 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 46683590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46683743 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 46683781 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 46683787 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46683809 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 46683887 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 46683917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46684299 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46684409 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46684463 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46684521 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46684524 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46684533 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46684759 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46684844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46684878 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46684891 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46685044 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46685047 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46685061 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46685099 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46685170 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46685197 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 46685720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46685754 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46686908 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46687024 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46687206 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 46687322 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 46687616 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46687703 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46687938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46687995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46688009 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46688010 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 46688060 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46688992 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46689001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46689113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46689147 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46689186 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 46689849 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 46691429 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46691456 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46691736 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46692389 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46692710 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 46693131 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46693138 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46693417 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 46693491 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 46693664 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 46693748 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 46693868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46693914 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 46693984 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46693995 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46694680 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46694782 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46694789 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46694999 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 46695497 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46695534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46695547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46695688 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46695857 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 46695981 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 46695998 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 46696052 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 46696241 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 46696766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46696883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46696918 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 46699663 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46699728 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46699839 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46700162 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 46700360 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 46700380 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 46700709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46700891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46700969 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46701891 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46702519 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46703362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46703768 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 46704037 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 46704237 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46704501 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 19 46704597 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46704737 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46704799 A C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46704873 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46704878 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46705093 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46705401 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 46705402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46705453 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46705523 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46705552 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46705764 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46705836 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 46705901 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46706014 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46706155 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46706421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46706436 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 46706448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46707226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46707522 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 46707563 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 46707825 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46707826 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 46707949 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46708871 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 46709056 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 46709379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46709959 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 46710468 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 46710541 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46710584 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 46710587 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 46712208 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46712220 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46712610 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 46712944 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 46713036 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46713038 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 46713577 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46714917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46715292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46715644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46717568 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46718149 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46718210 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46718481 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46719229 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46720829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46720943 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46721118 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46722355 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46722527 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46722941 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46723419 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 46723733 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46723873 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46723906 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 46723917 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46724102 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 46724280 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46726392 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 46726499 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46729238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46729895 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46730333 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 46730963 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46730998 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46732100 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 46733340 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 46733681 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 46734357 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46734794 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46735397 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46736433 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 46736849 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46737075 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46737109 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 46737344 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 46737599 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 46737693 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 46737739 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 46737986 T C N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 19 46738410 C T N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 19 46738793 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 46739025 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46739173 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 46739291 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 46739837 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46739868 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46739910 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 46739958 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 46740437 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46740557 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 46741498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46742290 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46742731 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46743105 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46743539 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46744169 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46744331 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 46744523 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 46744854 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 46745687 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 46746031 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 46746315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46747691 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 46754261 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46757827 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 46761630 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46761696 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 46765537 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46766426 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46766437 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46767272 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46767837 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46768029 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 46769562 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46770320 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46772952 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46773511 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46775062 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46775375 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46776011 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46778972 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46779800 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 46779970 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 46779983 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 46780212 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 46780269 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46780316 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46780849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46784503 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 46784531 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 46784586 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46784709 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46785048 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46785087 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46785095 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46785294 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46785873 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 19 46786409 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 46787332 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 46787352 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 19 46787835 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46788097 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 19 46788756 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46789381 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46794907 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 19 46795302 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46795538 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 46796076 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46796165 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 46796341 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46797058 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 46797096 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 46797221 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 46797246 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46797435 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 46798668 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 46799360 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46799447 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46799580 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 46799633 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 46801857 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46801890 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46802769 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 46803516 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46804108 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 46805125 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 46805245 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46807521 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46810404 G A Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 46813089 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46813419 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46813907 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 46814360 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 46814365 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 46814580 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46815065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46815349 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 46815353 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 46816962 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46817762 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46818542 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46819340 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46819848 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46820723 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 46823640 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46824539 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 46828662 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46829336 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 46830200 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 46831338 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 46833754 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 46834621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46835133 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46836653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46838502 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46839114 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46839190 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46839258 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 46839447 C G Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 46841489 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 46846044 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46847803 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 46848198 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 46849909 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46849985 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 46850018 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 46850167 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 46850561 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 46850826 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 46850933 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 46851492 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46852023 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 46852273 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 46853189 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 46854664 G C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 46856736 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 46857938 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46858828 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 46861616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46862867 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46864257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46866073 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46869602 A T Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 46872021 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46872102 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 46872145 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 46872146 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 46872293 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 46873818 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 46873997 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 46874532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46876280 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 46876292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46876335 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46876425 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46876745 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46877748 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 46878042 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 46878974 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 46878986 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 46879896 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 46879931 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 46880087 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 46880129 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 46880204 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 46880731 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 46880826 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 46880830 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 46880867 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 46880868 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 46880894 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 46881078 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46881364 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 46881407 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46881564 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 46881616 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 46882095 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46882351 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 46882433 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46882469 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46882472 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 46882624 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 46883096 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 46883228 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 46883483 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 46883515 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46883743 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 46884524 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 46886029 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 46886335 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46886801 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 46886821 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46886959 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46887207 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 46887327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46887522 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 46887545 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 46888012 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46888097 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46888171 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46888337 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 46888365 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46888391 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 46888860 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46888978 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46889195 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46890017 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46890567 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 46891437 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46891841 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 46891925 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 19 46892114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46892962 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 46894800 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 46895004 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 46895253 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 46895277 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 46895278 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 46896095 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46896467 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 46896727 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46897341 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 46899160 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46901395 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46902080 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 46902442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46904284 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 46904456 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 19 46904740 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46905060 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46905088 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 46905120 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46905322 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 46905687 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 46906780 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46907104 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 46907132 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 46907141 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 46907269 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 46907847 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 46907892 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 46908070 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 46908239 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 46908242 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 46908273 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46908436 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 46908470 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 46908529 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 46908587 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 46908804 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46909227 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 46909599 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 46910094 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 46910103 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 46910155 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 46910174 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 46910210 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 46910212 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 46910225 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 46910382 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 46910829 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 46911062 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 46911083 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46911095 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46911521 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 46911561 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 46911799 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46911857 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 46912016 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 46912039 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 46912384 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 19 46912385 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 46912426 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 46912486 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 46912563 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 46912687 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46912702 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 46912766 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 19 46913678 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 19 46913679 T A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 19 46913690 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46914232 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 46914349 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 46914587 C T N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.454545454545455 0.272727272727273 0.272727272727273 13 9 5 3 3 19 46914609 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 19 46915061 T A Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 46915339 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 46915834 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46916066 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 46916404 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 46916484 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 46916638 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 19 46916730 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 46917456 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46917506 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46917990 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46917991 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46918873 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 46921149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46922894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46922918 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 46924320 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46924653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46924657 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 46924673 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46924704 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 46924790 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46924819 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 46924825 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46925407 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 46925420 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46925717 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46925847 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 46926440 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 46926445 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 46926505 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 46926676 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 46926841 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 46926918 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46927423 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46927434 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46927499 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46927536 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 46929373 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46929469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46930609 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46930970 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 46931151 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 46932081 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46932322 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 46934500 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 46934986 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 46935890 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 46935906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46936475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46937432 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 46939689 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46940740 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46941096 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46941415 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 46942708 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46943773 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 46944090 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46944977 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46946111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46947110 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46947167 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 46947372 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46948506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46948626 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46949031 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46950003 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 46950935 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46951148 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46951212 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46953535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46953840 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46953943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46954730 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46956145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46957455 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46957691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46958224 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46958444 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 46958530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46958575 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46958950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46959414 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 46959587 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46960038 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 19 46960597 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 46961239 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46961572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46962868 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 46963256 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 46963289 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46963712 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 46963749 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 46963927 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46963983 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 46964209 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 46964335 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 46964964 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46965325 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46965366 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 46966900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46966902 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46967858 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 46968560 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 46968577 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 46968633 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 46968956 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 46969826 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46970003 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46970466 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 46970471 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 46970476 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 46970481 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 46970581 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46970586 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46970591 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 46970741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46970764 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46972456 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 46972591 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 46973147 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46973254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46973457 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 46973730 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46973769 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46974109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46974413 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46974725 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46976729 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 46977026 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 46977889 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46979460 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46979647 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46979861 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 46980128 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46980770 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46980972 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 46982421 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46983371 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 46983575 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46983656 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 46984117 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46984404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46984527 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46984871 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46984886 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 46985439 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 46985440 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46985498 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46986168 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46986306 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 46986493 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 46987175 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46987213 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46987475 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 46987493 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46987832 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46987849 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46988014 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46988151 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46988174 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46988195 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46988309 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46988367 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46988395 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 46988452 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46988505 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46988524 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46988572 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46989131 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46990704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46991142 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 46991254 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 46991567 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46991731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46992292 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46992293 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46992448 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46992763 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 46992824 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 46993350 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 46993361 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 46993755 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46993756 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 46993978 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 46994253 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 46994547 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 46994592 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46994762 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46994787 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46994855 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46995079 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46995195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46995324 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46995659 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 46996011 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 46996039 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46996093 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46996148 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46996167 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46996179 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 46996317 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 46996374 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 46996391 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46996400 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46996502 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 46996569 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46996664 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 46996768 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 46996914 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 46996963 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46997158 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 46997241 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 46997562 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46997784 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46997853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 46998221 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46998469 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 46998489 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46998635 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 46999437 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46999645 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46999791 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 46999801 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47000131 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47001646 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47002810 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47002813 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47002896 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47002993 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 47003653 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47003675 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47003984 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47004384 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47004511 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 47004750 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47004934 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 47005049 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 47005176 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 47005211 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 47005256 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47005404 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47005442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47005974 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 47006036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47006298 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 47006364 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47006568 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 47006849 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 47007065 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47007146 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 47007188 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47007284 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47007458 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47008907 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47008937 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47009194 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47009198 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47009301 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47009334 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47010826 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 47010864 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 47010897 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 47011277 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47011365 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 47011989 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 47012166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47013499 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 47014005 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 47014719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47015216 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47016297 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47016836 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47018798 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47019062 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47019104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47019538 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47020030 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 47020422 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47020877 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 47021103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47021105 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47021916 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47021935 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 47021972 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47022270 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47022856 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 47023407 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47023558 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47023902 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47024340 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47024795 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47024906 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47024920 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47025028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47025876 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47026397 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47026975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47026978 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47027630 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47027773 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47028272 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47030378 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 47031943 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47032142 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47032382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47033053 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47033259 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 47033380 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 47033619 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 47033712 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47034072 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47034277 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47034460 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47035822 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 47037278 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47037362 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 47039668 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 47040424 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47040744 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47042102 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47042508 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47042534 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47042721 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47042722 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47042764 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47042822 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 47042826 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 47043029 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 47043667 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 47043754 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47043921 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 47044188 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 47045094 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47046194 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47046326 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47046328 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 19 47047556 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47047614 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47047637 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47047893 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47047925 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 47047932 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 47047948 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 47048573 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 47049704 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47050158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47051887 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47053843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47056876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47058215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47058258 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47058323 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47058915 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 47059163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47059568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47059973 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47060423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47060971 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47061028 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 47061988 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47061996 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47062115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47062160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47062391 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47062518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47062587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47062728 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47062882 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47063340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47063386 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47063611 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47063710 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47063869 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47064029 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47065109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47067192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47068308 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47068378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47069082 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47069430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47073575 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47074206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47078664 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47079124 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47080437 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 47081442 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 47084459 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47086416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47086882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47092502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47093837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47094062 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47094088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47094089 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47094174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47094426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47094441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47095041 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47095054 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47095165 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47095255 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47095283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47095318 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47095321 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47095567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47095667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47095671 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47095731 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47095816 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47095820 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47095848 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47095871 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47095925 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 47096056 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 47096062 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 47096181 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47096239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47096479 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47096541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47096670 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47096843 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47096851 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 47096924 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 47096933 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 47096958 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47096959 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47097136 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47097155 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47097165 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47097184 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47097203 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47097266 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 47097411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47097526 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47097611 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47097984 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47098092 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47098559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47098868 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47099033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47099460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47099763 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 47099876 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47099885 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47099907 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47099961 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47100022 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47100026 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47100030 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47100538 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47100724 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 47100731 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 47100882 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47100947 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47101126 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 47101382 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 47101497 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 47101669 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 47101699 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 47101918 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47101976 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47102000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47102084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47102112 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47102153 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 47102439 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47102473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47102515 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47102554 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47102577 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47102855 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47103217 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 47103245 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47103464 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 47103519 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 47103767 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47104309 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47104705 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47104739 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47104742 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47105887 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47105999 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 47106138 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47106139 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47106155 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47106156 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47106642 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47106985 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47107237 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47107241 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 47107258 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47107361 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47107735 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47108378 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47108491 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47108553 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47108662 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47109188 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47109414 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47109439 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 47109623 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47109693 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 47109786 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47109942 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47110715 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 47111642 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47111887 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47113798 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47115226 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47115383 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47115430 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 47117726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47118424 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47118480 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47118558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47118615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47118721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47119505 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47119691 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 47119890 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47120051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47120144 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47120266 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47120603 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47120624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47120625 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47120665 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 47120745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47121343 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47121826 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47125921 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47126401 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47126545 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47126673 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 19 47127104 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 47127123 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 47127200 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 47127293 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 47127338 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47127461 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47127777 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47127902 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47127936 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47128732 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47129021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47129333 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47129502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47129748 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47129829 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47130468 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47130469 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47130475 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47130749 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47130803 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47131075 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 47131171 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 47131380 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 47131491 C G N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 19 47131728 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47132143 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47132144 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47132246 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47132286 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47132320 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47132344 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47132459 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 47132533 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47132548 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47134289 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 47134290 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 19 47134309 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 47134400 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 47134429 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 47134473 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47134500 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47134508 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47134513 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47134556 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47134630 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47134645 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 47134663 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 47134664 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 47134669 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 47134755 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47134790 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47134816 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47134916 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 47135452 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 19 47135603 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47135786 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47136187 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47138068 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47143350 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47143828 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 47143869 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47145156 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 47145387 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 47146684 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 47146742 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 47147173 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47147543 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47147626 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47147671 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47147918 C G N N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 19 47148523 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47148549 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47148751 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47148760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47149037 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47149067 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47149069 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47149183 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 47149204 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47149250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47149555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47149807 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47149979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47150336 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47150397 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47150410 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47150484 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47151061 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 19 47151070 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 47151360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47151904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47151995 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47152107 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47152138 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47152201 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47152219 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47152327 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47152404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47152694 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47152741 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47153002 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47153149 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47154583 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47154600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47155527 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47155680 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47156267 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 19 47156626 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47157405 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47157577 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47157589 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47157869 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47158289 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47158437 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 47158477 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 47159151 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 47160298 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 47160386 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47160714 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47161998 G C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 47162237 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47162461 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47162578 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47164591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47165173 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 47165420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47165601 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47167108 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47170284 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47170531 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47170543 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47170724 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47170732 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47170911 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47171635 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47171666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47171667 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47172843 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47173560 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47174309 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47175126 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47175738 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47175790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47175916 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47176903 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47177422 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 47177857 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 47177878 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 47180247 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47180859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47183210 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47183910 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47184348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47184707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47184777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47185320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47186635 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47187265 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 47188152 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47188637 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47191291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47191311 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47191348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47191497 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47191510 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 19 47191514 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 47192977 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47193528 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47195947 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47196048 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47196967 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47197394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47197846 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 47198035 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47199944 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47199996 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47200629 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47201354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47201918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47202297 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47203818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47204742 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47205356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47205707 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47206404 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 47206901 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47207806 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47208069 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47208356 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 47208431 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47208563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47209027 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 19 47209106 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47209606 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 47209820 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47212918 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47212919 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47212973 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 47213188 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47213344 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47213454 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47213534 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47213640 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 47213642 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 47213762 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47214111 C A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 19 47214112 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 47214176 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 47214190 G C Y N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 47214212 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 47214229 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 47214450 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 47214594 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47214722 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47215981 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47216098 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47216297 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 47216472 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 47216593 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 47216955 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 47217347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47217546 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47217786 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47218070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47218203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47218352 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47218629 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 47218939 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 47219065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47219097 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47219293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47219446 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 47219489 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 47220240 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47220572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47220790 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 47220831 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47220994 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 47221004 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 47221060 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47221079 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 47221147 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 47221224 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 47221339 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 47221365 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 47221412 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 47221488 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 47221517 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 47222294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47222600 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 47222828 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47223059 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47223305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47223310 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47223334 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47223350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47223371 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 47223400 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 47223406 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47223423 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47223442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47223558 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47223592 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47223612 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47223838 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 47223983 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 47224038 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47224285 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 47224290 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 47224482 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 47224617 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 47224659 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 47224868 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 47224937 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 47224940 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 47224961 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 47225419 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 47225421 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 47225481 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 47225499 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 47225831 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 47225835 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 47225885 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 47225911 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 47225919 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 47226283 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 47226295 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 47226397 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47226537 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47226840 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47226870 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 47226962 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47227274 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 47227303 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 47227509 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47227519 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47227680 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47227706 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 47228202 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47228204 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47229161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47229179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47229504 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47229785 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 47230034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47230107 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 47231148 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47231243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47231344 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 47231393 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 47231398 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47231476 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 47231717 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47231767 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 47232270 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 47232611 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47233838 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 47233913 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 47233967 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 47234031 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47234079 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 47234174 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 47234292 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 47234294 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 47234425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47234451 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 47234457 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 47234464 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 47234599 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47234686 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 47234692 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 47234697 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 47234778 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 47234809 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 47234953 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 47234997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47235014 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47235301 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 47235444 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 47235582 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 47235599 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 47235602 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 47235751 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 47235755 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 47235774 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 47235813 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 47235864 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 47235892 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47235957 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 47235964 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 47235992 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 47235995 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 47236104 T C N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 19 47236231 C A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 47236266 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 47236285 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 47236377 T A N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 19 47236430 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 47236482 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 47236529 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47236855 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47236879 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 47236903 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 47236908 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 47236999 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47237082 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47237128 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47237140 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47237199 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47237498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47237567 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 47237571 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 47237588 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 47237734 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 47238096 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47238110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47238133 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47238332 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 47238341 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 47238549 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47238556 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 47238619 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 19 47238656 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 47238870 C A N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 19 47238908 T C N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.25 0.0833333333333333 0.666666666666667 7 17 3 1 8 19 47239233 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 47239398 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47239422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47239446 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47239479 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47239493 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47239500 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 47239506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47239528 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47239552 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47239588 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 19 47239591 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47239601 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 47239661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47239966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47240239 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47240399 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47240516 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47240695 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 47240710 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 47240778 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 47240835 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 47240908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47240984 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 47240990 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 47240998 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 47241002 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 47241010 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 47241189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47241190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47241334 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47241341 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47241712 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 47241907 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47243167 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 47243570 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 47243623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47243809 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 19 47243868 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47244480 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47244591 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 47245027 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47245042 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47245070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47245144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47245167 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47245211 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 47245290 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47245320 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 47245349 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47245364 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47245390 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 47245463 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47245557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47245580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47245599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47245616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47245626 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47245727 T C Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 47245776 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47245838 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 47245849 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47245883 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 47246135 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47246186 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 47246211 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47246250 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 47246653 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 19 47246659 C A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 47246672 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 47246682 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 19 47246709 T A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 19 47246758 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 47246759 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47246775 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 47246826 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 47247384 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 47247503 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47247535 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47247729 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 47247741 T A Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 47247744 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 47247746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47247800 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 47247975 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47248140 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47249130 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 47249248 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 47250383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47250469 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 47250578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47251906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47252043 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47252872 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47254653 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 47254935 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 47255364 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47255494 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47255669 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 47255965 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 47258798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47259689 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47260440 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47261278 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47261347 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 47261885 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47262531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47262795 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 47262807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47262950 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47262951 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47263773 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 47263775 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 47263786 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47263814 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47264010 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 47264083 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47264127 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 47264182 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 47264346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47264400 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47264458 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 47264556 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47264831 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 47265050 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 47265147 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47265276 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 47265502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47265800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47265892 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 47266026 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 47266031 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 47266093 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 47266238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47266422 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47266448 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47266473 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 47266644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47267171 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 47267211 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 47267272 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 47267353 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 47267431 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 47267450 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 47268305 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47268403 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47268410 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 47268415 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 47268516 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47268537 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 47268540 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 47268653 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47268820 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47268862 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 47268880 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 47268886 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 47268953 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47268965 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47268973 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47268988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47269008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47269020 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47269049 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47269050 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 47269052 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 47271364 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47271488 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 47271497 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47271681 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47271868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47271976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47272025 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47272034 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47272178 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47272333 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47272337 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47272604 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47272685 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47272693 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 47272993 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47273007 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47273039 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 47273104 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47273334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47273466 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47273559 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47273574 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 47273771 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47273818 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47274407 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47274419 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47274420 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47274717 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47274730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47274858 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 47275077 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 47275201 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 47275256 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47275322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47275351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47275429 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47275489 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47275517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47275571 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47275591 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47275726 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 47275803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47275911 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 47275959 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47276247 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 47276377 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 47276601 C G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 47276776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47276833 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47276926 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47276956 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 47277826 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 47277916 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47278342 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47278644 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47278701 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 47278768 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47278814 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 47279253 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47279466 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47279676 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47279696 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 47279891 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 47279920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47280112 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47280926 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 47280949 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47280961 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 47281512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47281525 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47281562 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47281683 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 47281691 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47281758 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47281900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47282028 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47282510 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47282726 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47282743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47282781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47282807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47282991 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47283122 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 47283196 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47283205 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47283379 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47284258 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47284311 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 47284324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47284337 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 47284444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47284676 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 47284814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47285040 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47285132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47285141 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 47285170 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47285199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47285237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47285265 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47285453 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 47285458 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 47285523 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47285573 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 47285686 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47285704 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 47285739 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 47285789 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 47286148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47286157 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47286481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47286774 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47286811 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 47287034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47287043 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 47287135 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 47287210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47287459 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47287489 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 47287490 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 47287685 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 47287702 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 47287719 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 47287755 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47287763 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47287852 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47287893 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 47288210 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 47288300 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47288315 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47288396 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47288792 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47288825 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47288853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47289025 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 47289123 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 19 47289256 G A N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 19 47289287 A C N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 19 47289398 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47289613 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47289869 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47289980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47290170 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 47290322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47290455 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47290466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47290718 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 47291078 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 47291083 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 47291236 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 47291244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47291250 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47291270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47291352 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47291360 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 47291513 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 47291641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47291692 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47291755 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47291787 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47291886 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47292029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47292041 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47292110 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47292310 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 47292518 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 47292542 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47292746 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 47293010 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47293015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47293030 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47293039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47293183 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47293244 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47293287 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47293618 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47293641 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47293797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47293907 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 47293936 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 47293943 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 47294370 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47294448 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47294489 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 47294548 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 47294806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47294898 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47295116 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47295253 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47295319 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 47295516 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47295556 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 47295578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47295581 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 47295692 G T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 19 47296502 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 47296865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47297018 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47297337 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47297390 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47297537 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 47297705 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47297727 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47297798 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47297839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47297991 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47298273 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 47298280 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 47298296 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 47298435 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47298616 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 47298816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47298847 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47298862 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47298869 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 47298935 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47299080 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 47299172 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47299218 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47299245 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47299257 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47299292 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47299314 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47299337 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47299370 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47299372 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47299450 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 47299584 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 47299614 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47299628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47299643 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 47299693 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47299805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47299808 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47299904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47299926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47300235 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 47300240 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 47301061 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 47301087 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 47301214 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47301219 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47301230 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 47301238 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 47304796 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 47306094 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 47307095 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 47308711 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 47309143 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47309212 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 47309251 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 47309255 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 47309740 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 47309796 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 47310038 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47310073 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 47311037 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 47311341 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 47311675 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47311679 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47311701 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47311835 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47312428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47312532 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 47312693 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 47312739 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 47312861 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 47312964 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 47313052 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47313315 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 47314131 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 47314473 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 47314569 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 47314624 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 19 47314707 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 47315404 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 47315590 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 47315616 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 47315627 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 47316411 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47317204 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 47317382 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 47317397 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 47317617 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47318593 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 47319008 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47319018 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47319019 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47319057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47319118 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47319305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47319478 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47319737 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 47319971 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 47320063 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 47320213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47320266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47320280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47320299 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 19 47320351 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47320454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47320459 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47320668 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 19 47320797 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 19 47320888 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 47320903 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 19 47320915 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 19 47321512 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47321675 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 47322291 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47322973 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 47322997 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 47323290 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47324566 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 47324623 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 47324652 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 47324672 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 47324986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47325076 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 47325185 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 47327101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47327102 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47327603 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47327905 C A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 47328366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47329060 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47329578 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47330423 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 47330436 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47332010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47332223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47332506 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47333060 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 47333338 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 47333478 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 19 47333495 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 47333516 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 19 47333555 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 19 47334479 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47334516 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 47334548 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 19 47334583 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 19 47335179 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 47335409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47336011 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 47336269 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 47336332 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47336533 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 47336534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47337131 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 47337134 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 47337192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47338682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47339183 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 47339274 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 47339358 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 47339364 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 47339368 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 47339612 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 47339618 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 47339896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47340094 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 47340133 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 47340704 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47341112 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47342740 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 47342743 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47342752 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47343253 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47343283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47345177 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47345823 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47346368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47346471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47347013 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 47347062 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 47347563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47348145 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 47349516 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47351248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47352322 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47352528 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47352533 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 47352654 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 47352764 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47352784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47352936 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47353014 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47353089 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 47353405 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47353475 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 47353659 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47353819 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 47355287 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 47355726 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 47355817 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47355907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47356859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47356969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47357070 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47357288 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 47357368 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47357692 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47357720 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47357728 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47357767 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 19 47357818 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47357845 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47357850 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 47357938 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 47358019 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47358106 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47359519 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 47360062 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 47360512 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47360566 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47360760 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 47360763 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 47361494 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 47361500 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 47361633 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 47362065 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 47362215 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 47362429 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47362465 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47362569 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47362578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47362979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47363096 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47363109 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47363132 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 47363190 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47363302 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47363345 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 47363448 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47364248 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47364478 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47364652 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47364889 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47364926 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47364987 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47364999 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47365293 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47365332 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 47365389 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47365481 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47365535 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47365684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47366001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47366146 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47366364 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47366829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47366851 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47367568 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47367782 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 47367820 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 47367899 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 47368305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47368589 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 47368846 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47368916 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47368934 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47369242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47369379 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 47369391 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47369453 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 47369455 C A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 47369456 A T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 19 47369499 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 47369501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47369522 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 47369611 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 47369634 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 47369685 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 47369749 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47369800 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47369881 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47370007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47370025 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47370043 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47370062 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47370104 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47370760 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 47370763 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 47370830 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 47370929 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47371032 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47371442 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47371487 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47371646 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47371932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47372405 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47372673 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 47372735 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47373048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47373074 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 47373193 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47373204 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47373213 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47373236 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47373247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47373292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47373617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47373653 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 47373697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47373811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47373895 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47374155 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47374771 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47374866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47374944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47375117 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47375148 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47375181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47375740 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 47375896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47376266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47376347 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 47376398 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47376734 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47376792 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47377463 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47377629 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 47377753 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 47377792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47377829 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47377956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47378312 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 47378402 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 47378572 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47378573 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 47378695 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 47378835 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47378967 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47379723 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 47379726 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 47380345 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 47380499 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47380541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47380691 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 47381031 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47381127 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 47381128 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47381171 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47381395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47381486 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47381713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47381794 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47382873 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 47383579 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47383590 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47384864 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47385327 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47385442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47386482 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 47386488 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47386651 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47386941 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47387077 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47387478 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47387669 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47387684 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47387752 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 47387917 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47388090 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47388174 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47388179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47388200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47388221 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47388227 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47388515 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47388700 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47389469 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47389665 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47390152 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47390804 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47391754 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47391923 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47392264 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47392552 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47392682 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47392707 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47393160 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47394110 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 47394141 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47394175 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 47394246 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 47394433 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47394449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47394658 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47395280 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47395408 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47395500 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 47395848 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47396192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47396210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47396507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47396517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47396656 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47396671 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47396706 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47396805 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47396837 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47396909 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47397190 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 47397548 G A N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 19 47397587 G A N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 19 47397598 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 47397760 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 47399364 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 47399570 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47399592 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47400352 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47400413 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47401601 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 47403315 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47403703 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 47403966 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 19 47404226 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 47404276 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47404478 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 19 47404544 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 47404582 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 47404822 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 47404932 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47405750 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47406860 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 47408116 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47408553 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 47409005 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 47409171 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47409185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47409628 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47409968 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 47410706 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 47410720 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 47411018 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47411019 C G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 47411048 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 47411050 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 47411073 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 47411195 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 47411257 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47411474 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 47411832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47411842 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47411937 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47411979 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 47412033 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 47412077 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 47412233 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 47412369 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47412810 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 47412886 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47412918 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 47413009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47413017 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47413036 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 47413047 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 47413101 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47413235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47413356 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 47413530 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47413643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47413661 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47413704 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 47413795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47413800 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 47414212 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 47414614 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 47414756 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47414903 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47414995 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47415147 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47415901 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 47416255 C T N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 19 47417040 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47418088 A C N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 19 47418329 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47418571 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 47418598 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 47418856 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 47418862 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 47418952 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47419238 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 47419270 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 47419295 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 47419353 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47420351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47420363 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47420380 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47420390 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 47420393 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 47420436 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47420477 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47420533 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47420987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47421136 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 47421159 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47421416 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47421500 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47421910 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47422123 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47422249 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47422506 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 47422558 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47422702 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 47422708 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 47423205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47423212 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47423214 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47423290 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47423502 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47423587 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47423668 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47424050 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 47424081 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 47424546 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47424816 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47424993 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 47425011 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 47425244 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 47425274 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 47425289 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 47425314 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47425374 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 47426167 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47426225 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47426378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47426402 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 47426487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47426498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47426535 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 47426562 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47427007 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47427045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47427590 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47427681 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47427707 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47427977 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47427982 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47428179 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47428194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47428219 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47428258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47428325 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47428343 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47428366 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47428374 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47428404 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47428406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47428522 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47428552 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47428554 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47428811 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47428914 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47429376 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47429580 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 47429915 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47429976 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47430141 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47430238 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47430259 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47430511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47430622 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47430625 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47430631 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47430654 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47430806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47430906 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47431111 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 19 47431206 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47431251 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47431279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47431295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47431312 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47431409 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47431479 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47431685 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47431688 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47431768 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47431791 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47431799 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47431829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47431831 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47431841 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47431948 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47431949 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47431982 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47432001 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47432014 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47432055 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47432205 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47432336 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47432474 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47432489 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47432556 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47432711 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47432736 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47432869 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47433038 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47433289 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47433328 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47433452 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47433455 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47433498 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47433707 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47433825 C T N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 47434049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47434372 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47434543 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47434649 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47434670 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47434977 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47435153 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47435203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47435262 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47435288 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47435511 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47435676 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47435777 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47435885 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47435896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47436090 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47436121 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 47436246 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 47436603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47436665 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47436747 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47436749 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47436771 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47437007 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47437028 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 47437030 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 47437189 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47437190 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47437199 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47437236 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47437246 C T Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 47437248 C T Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 47437458 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47437466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47437606 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47437667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47437927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47438136 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 47438920 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47438970 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47438978 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47438985 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47439087 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47439100 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 47439202 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47439213 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47439293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47439417 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47439437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47439506 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47440126 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47440284 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47440355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47440540 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47440548 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47440624 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 47440635 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47440644 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47440659 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 47440779 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47440938 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47440953 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47440977 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 47441012 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 47441096 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47441128 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 47441416 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 47441673 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 47441852 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47441895 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47441916 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 47441930 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47441956 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 47442422 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 47442445 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 47442526 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47442646 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 47443154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47443165 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47443175 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47443300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47444194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47444285 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47444313 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47444368 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 47444804 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 47445315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47445484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47445614 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 47445655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47445822 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 47446172 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 47446382 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 47446984 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47447686 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 47447727 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 47447843 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 47447898 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 47448054 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 47448195 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 47448321 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 47448614 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 47448821 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 47448898 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 47448946 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 47448984 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 47448987 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 47449164 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 47449170 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 19 47449260 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 47449261 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 47449962 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 47450384 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 47451001 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 47451005 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 47451100 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 47451268 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 47451471 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 47451515 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 47451516 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 47451765 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 47451798 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 47451944 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 47451952 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 47451977 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 47452095 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 47452320 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 47452343 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 47452354 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 47452393 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 47452398 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 47452539 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 47452695 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 47453067 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 47453227 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 47453306 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 47453359 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47453645 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47453767 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47454289 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 47454296 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47454549 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47454689 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 47454772 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 19 47454784 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 47454837 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 47454854 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 47454862 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 47454893 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 47454905 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 47455046 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 47455049 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47455149 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 47455172 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47455178 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 47455200 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47455279 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47455326 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 47455337 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47455506 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 47455629 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 47455708 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 47455734 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47456151 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 47456608 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47456716 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 47456787 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 47456853 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 47456867 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 47456945 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 47457051 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47457101 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47457105 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47457142 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 47457174 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 47457178 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 47457206 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 47457387 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 47457392 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 47457500 G T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 19 47457745 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 47457758 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 47457917 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47458078 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 47458106 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 47458325 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47458374 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47458535 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 47458615 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 47458892 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 47459037 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 47459216 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 47459273 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 47459315 T A Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 47459953 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 47460093 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 47460100 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 47460139 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 47460177 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 47460592 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 47460669 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 47461044 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 47461109 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47461237 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47461273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47461545 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47461648 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 47461687 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47461719 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 47462092 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 47462247 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 47462511 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47462550 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 47462755 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 47462808 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 47463005 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 47463100 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 47463367 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 47463376 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 47463394 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 47464181 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47466597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47466954 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 47466970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47467470 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 47467687 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47467804 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47467840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47467847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47467871 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 47467904 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 47467940 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 47468346 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47469407 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 47469431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47469875 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 47469968 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47470304 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 47470361 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 47470636 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47470714 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 47470785 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 47471336 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 47471578 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47472157 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 47472176 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 19 47473977 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 47474276 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 47474684 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 47474754 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47474959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47475118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47475165 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 47476160 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47476324 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 47476468 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 47476871 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 47477203 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 47477232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47479168 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 19 47479210 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 19 47480069 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 47480097 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 47480121 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 47480361 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 47480387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47480650 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47482621 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 47482733 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47483056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47483320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47484323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47484415 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 47484971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47484994 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47485038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47485054 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47485122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47485132 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47485237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47485267 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47485271 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47485372 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47485400 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47485412 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47485446 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47485490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47485616 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47485647 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47485699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47485749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47485812 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 47485816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47485929 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 47486004 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 47486080 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 47486203 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 47486304 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47486310 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 47486402 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47486418 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 47486466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47486571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47486606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47486728 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 47486760 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 47486790 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 47486811 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 47486847 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 47487032 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47487116 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 19 47487311 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 47487317 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 47487391 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 47487411 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 47487547 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 47487791 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 47487821 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 47488107 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 47488300 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 47488559 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 47488649 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 47488684 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 47488695 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 47488986 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 47489170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47489234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47489384 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 47489492 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 47489559 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47490128 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 47490138 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47490731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47491012 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47491031 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 47491074 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 47491228 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47491388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47491409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47491417 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47491440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47491444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47491756 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 47492394 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 47492537 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 47493127 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 47493237 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47493240 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47493456 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 47493475 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 47493596 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 47493730 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 47493996 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 47494069 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 47494137 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 19 47494140 T A Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 19 47494239 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 47494253 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 47494289 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 47494294 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 47494348 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 47494448 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 47495852 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 47496029 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 47496101 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 47496359 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 47496411 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 47497661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47497693 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 47497733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47497867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47498545 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 47498583 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 47498584 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 47498607 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 47498753 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 47498754 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 47498853 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 47498941 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 47498955 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 47499034 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 47499277 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 47499335 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 47499454 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 47499749 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 47499760 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 47499800 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 47499821 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 47500020 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 47500021 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 47500055 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 47500063 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 47500184 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47500234 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 47500279 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 47500382 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 47500467 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 47500541 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 47500651 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47500709 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47501249 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 47501276 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 47501419 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 47501492 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 47501754 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 47501775 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 47501885 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 47501888 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 47502075 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 47502416 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 47502677 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47503052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47503210 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 47503549 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47503567 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47504000 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 47504033 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 47504044 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 47504840 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47504851 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47505630 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 47505982 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 47506891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47507625 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 47507740 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 47508213 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 47508374 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 47508956 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 47509001 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47509051 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 47509088 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 47509148 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 47509164 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47509253 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 47509396 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 47509412 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 47509431 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 47509964 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 47510061 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 19 47510158 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 47510216 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 47510325 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47510393 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47510416 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47510485 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 47510612 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 47510737 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 47510840 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 47511007 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 47511127 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47511283 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 47511346 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 47511347 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 47512341 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47512546 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 47512907 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 47513448 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47513517 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47513810 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 47513913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47513991 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 47514061 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 47514094 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 47514107 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 47514331 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 47514638 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 47514688 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47514988 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 47515268 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 47515297 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 47515308 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 47515466 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47515484 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 47515564 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 47516099 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 47516174 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47516214 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47518834 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 47519893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47521810 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47523573 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47525221 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 47525252 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 47525608 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47525627 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 47525644 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 47525719 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47525720 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 47526998 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 47527505 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 19 47527841 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 47528015 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 47528045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47528510 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47529093 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 47529123 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 47529348 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 47529379 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 47529410 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 47529450 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 47529502 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 47530344 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 19 47530347 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 19 47530348 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 47530403 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 47531033 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 19 47532318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47532363 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 47532598 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 47532800 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47532907 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 47533858 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47533921 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 19 47534132 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 47534222 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47534320 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 19 47534386 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 19 47534747 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 19 47534812 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47535232 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 47535259 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 47535361 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 47535553 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47535625 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 19 47536033 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47536367 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 47536422 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47536968 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47537244 G T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 19 47537831 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47538080 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47538184 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47538216 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 47538324 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 47538627 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 47540780 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 47544650 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47545443 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 47545626 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 47545807 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 47545984 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 19 47546003 A C Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.294117647058824 23 11 11 1 5 19 47546159 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47546358 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 47546359 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47546457 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 19 47546485 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 19 47546545 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 47546627 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 47546761 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 47546762 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 47546836 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 47546911 C A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 19 47546915 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 47546971 G C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 19 47546976 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.1875 0.0625 0.75 7 25 3 1 12 19 47547153 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 47547336 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 47547358 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 47547392 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 47547785 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47547942 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 19 47548114 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 47548737 C G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 19 47548767 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 47548989 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 47549248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47549257 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47549538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47549823 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 47550966 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 47551528 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.176470588235294 0 0.823529411764706 6 28 3 0 14 19 47552470 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 19 47552493 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 47552521 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 19 47553228 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 47553310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47553360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47553485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47553496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47553580 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 47553660 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 47553663 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 47553908 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 19 47553931 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47554308 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 47554368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47554558 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47554661 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 47554829 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47554860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47554959 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47554999 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47555228 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47555237 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 47556435 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 47556468 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47556603 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47557686 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 19 47557873 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 47557932 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 47558343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47558514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47559109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47559552 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47560862 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47561114 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 47561397 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 47561503 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 47561703 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 47561708 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 47562197 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 47562331 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 47562366 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 47562406 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 47563332 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 47564512 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 19 47564517 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 47565574 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47565754 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 19 47566093 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 47566339 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47566708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47567101 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 47567287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47567805 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 47567905 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 47568030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47568811 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 47568854 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47569617 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 47569711 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 47569715 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 47570106 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 47571859 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 47572193 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 19 47572447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47572560 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47572703 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 47572968 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 47573008 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 47573085 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47573344 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47573375 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47573470 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47573613 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47573967 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47574030 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47574031 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 47574395 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47574465 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 47575006 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47575345 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 47575413 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47575443 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47575605 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47575672 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 19 47575783 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 47575794 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 47575931 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 47576167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47576861 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 47577914 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 47580066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47581503 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47581805 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47582160 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 47582709 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 47582950 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 47582970 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47583172 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 47583772 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 47583910 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 47583956 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 47583970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47584104 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47584132 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 47584335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47584681 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 47584897 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47584985 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47585061 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47585066 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47585214 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47585339 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47585406 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47585723 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47585763 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 47585895 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 6 30 3 0 15 19 47585900 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 19 47585925 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47585982 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47586105 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47586107 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47586147 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47586526 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 19 47586616 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47587324 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 19 47587332 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47588031 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 47588119 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 19 47588481 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 47588577 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 47588663 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 47588683 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 47588684 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 47588706 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 47588723 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 47588919 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47589583 A G Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 47589657 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 19 47589675 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47589741 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 47589742 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47589815 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 47590018 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47590066 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 19 47590068 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 47590200 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47590234 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 47590352 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47590533 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47590893 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47590900 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 47591037 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 47591048 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 47591767 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 19 47591778 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 47591814 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47591826 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47592035 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 47592201 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 47592427 C T Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 47592623 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47592882 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 47592888 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 47593060 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 47593232 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 47593299 A C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 47593526 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 47593543 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 47593830 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 47594125 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47594187 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 47594392 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47594495 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47594737 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 47594774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47595044 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47595250 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 47595255 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47595490 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47595527 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47595673 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 19 47595713 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 47595718 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 47595719 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 47595803 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47596441 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47599643 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47599669 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47599688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47600539 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47600581 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47601400 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 19 47601873 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47602536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47602550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47602564 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 47602919 C T N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.375 0.125 0.5 7 9 3 1 4 19 47602926 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 10 8 4 2 3 19 47603236 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47603356 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 47603433 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 47603445 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 19 47603649 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 47603726 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 47603812 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47603878 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 47604075 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 19 47604086 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 19 47604096 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47604310 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.222222222222222 0 0.777777777777778 4 14 2 0 7 19 47606030 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 47608248 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 47608456 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47614500 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47616265 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47616328 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47616909 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47617069 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 47617321 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 47618065 T A N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 19 47618086 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 19 47618291 T G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 47618374 G T N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 19 47618590 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 47618593 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 19 47618656 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 47618898 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 19 47618946 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 19 47619182 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 47619280 T G N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 19 47619333 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 19 47619529 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 19 47619622 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 47619764 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 47620118 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 47620295 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 47620500 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 47620614 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 47620626 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 47620673 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47620706 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47620717 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47620736 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47620773 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47620777 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47620792 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47620876 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47620880 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47621166 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 19 47621185 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 19 47621270 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47621284 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 19 47621288 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47621356 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47621455 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 19 47621460 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47621489 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47621508 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47621719 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 47621836 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 47621893 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47621933 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47621993 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 19 47622045 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 19 47622061 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47622070 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 47622090 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47622132 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 19 47622236 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47622293 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47622297 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47622322 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 19 47622368 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47622398 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47622626 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47622640 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47622781 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 19 47622787 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 19 47622792 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 19 47622803 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 19 47622815 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47622831 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 19 47622832 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47622844 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 19 47622849 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47622866 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47622881 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47622930 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47622969 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47622970 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 19 47623040 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 19 47623057 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47623072 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47623085 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47623091 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47623141 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47623260 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47623304 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47623371 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47623375 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47623385 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47623387 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47623517 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47623662 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47623710 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 19 47623727 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47623729 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 47623782 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47623881 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 47624294 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47624868 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 47624886 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 19 47625630 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 47625739 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 47625863 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 47625987 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 47626456 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 47627225 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 47627295 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 47627454 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 19 47627526 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 47627614 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 47627631 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 47627843 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 47627884 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 47627956 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 47628040 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 47628042 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 47628057 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 47628068 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 47628082 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 47628105 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 47628154 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 47628239 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 47628330 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 19 47628470 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 47628756 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 47628802 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 19 47628843 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 4 24 2 0 12 19 47629427 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 47629585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47629652 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 47629852 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 19 47629896 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 19 47629988 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 19 47630076 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47630154 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47631170 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 47631248 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 47631262 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 19 47631301 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 47631360 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 19 47631521 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 47631770 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 47631771 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 47631931 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 47632374 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 47632487 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 47632513 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 19 47632550 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 19 47632606 A T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 47632907 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47632984 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 47633412 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 47633432 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 47633441 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 47633621 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 47633649 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 47633656 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 47633878 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 47633933 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 47634124 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 47634991 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 47634996 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 47635197 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 47635250 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 47635708 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47635738 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 47635748 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 47635844 T G Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 47636554 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 47636701 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47636842 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47637113 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 47637141 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47637208 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 47637399 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47637573 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 47637873 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 47638040 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 47638204 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 47638319 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 47638382 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 47638425 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47638427 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47638497 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 47638529 A T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 47638542 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 47638563 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 47638636 C A N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 19 47638667 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 47638779 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47638905 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 47639071 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 47639192 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 47639258 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47639360 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47639565 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47639679 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 47639772 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 47639961 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 47640052 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47640053 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 47640515 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47641142 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 6 8 2 2 3 19 47641149 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 19 47641173 A G N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 19 47641191 A G N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 19 47641383 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 47641394 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 47641580 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47641991 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 47642095 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 47642240 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 47642568 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 47642860 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 19 47643287 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47643587 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 47644153 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 47644176 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 47644641 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 47644777 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 47644823 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47644877 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 47645150 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 19 47645186 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 47645219 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 19 47645272 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 47645296 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 19 47645559 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 47645614 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47645631 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47645663 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 47646150 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 47646154 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 47646155 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 47646392 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47646456 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 47646487 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47646617 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 47646758 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47646785 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47646923 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47647000 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47648997 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47649078 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47650265 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 47651162 C T Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 19 47652207 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 19 47652404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47652695 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 19 47654800 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 47655069 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 47655204 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 47655372 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47655411 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47655620 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 47656203 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 47656471 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 47656506 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 47657484 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 19 47657844 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47658033 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 47658934 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 47658945 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 47659172 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 47659640 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 47660628 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 47660960 C T N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 19 47661174 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 47661354 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 19 47661458 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 47661789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47661821 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47661923 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 47661933 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47662136 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47662167 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 47662566 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47662748 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 47662867 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47663030 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47663160 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47664064 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 47664229 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47664248 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 47664250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47664386 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 47664487 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 47664606 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47664660 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47668157 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 47668381 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47669030 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 47669198 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 47669220 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 47669244 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 47669303 C G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 47669309 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 47669318 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 47669470 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47669586 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 47670060 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 47670252 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 47670504 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47670592 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47670621 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 47677609 A T N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 19 47677813 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 47677842 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 47677844 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 47677861 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 47678213 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 47678373 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 47678933 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 47679508 A C N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 19 47680297 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 19 47680444 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 47680929 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 47680990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47680995 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 47682115 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 47682157 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47682241 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 47682319 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47682563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47682657 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47682723 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 47682770 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47683949 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 19 47684692 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 47684984 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 47685007 C G N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 19 47685033 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 19 47685885 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 47685957 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47686513 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 19 47687080 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 47687081 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 47687181 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 47687271 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47687483 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 47688783 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 47688851 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 47688988 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 47689113 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47690240 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47692212 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 47692492 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 47692555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47692682 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47692956 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47693643 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 47693992 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 47694014 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47694062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47694143 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 47694266 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 47694360 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 47694442 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 47694680 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47695001 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47695317 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47695835 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 47695933 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47695944 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 47696534 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47697032 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 47697316 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 47697367 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 47697451 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 19 47697751 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 47697938 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47698097 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 47698521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47698585 G T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 47698728 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 47699094 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 47700006 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 47701714 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 47704320 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 19 47704335 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 19 47705966 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47706222 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 47706528 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 47706702 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 47706761 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 47706773 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 47706904 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 47707339 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 47707369 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47708075 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 47709801 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 47709931 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 47710325 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 47710683 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 47710930 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 47711383 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47711547 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47712294 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 47712680 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47712701 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 47712776 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 47712791 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 47712823 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47712872 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 47713113 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 47713685 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47713755 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47713984 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 47714479 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 47714578 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47714585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47714824 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 47714993 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 47715018 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 47715273 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47715641 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 47715868 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 47715926 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 47716135 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 47716701 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 47716995 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 47717450 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 47717666 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47717980 A T Y N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.214285714285714 0.142857142857143 0.642857142857143 8 20 3 2 9 19 47718018 G A N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 19 47718370 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 47718619 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 47718876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47718972 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 47719319 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 47719352 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 47719414 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47719418 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 47719558 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 47719604 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 47719685 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 47719708 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 47720063 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47720202 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 47720407 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 47720442 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 47720453 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47720506 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 47720521 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 47720527 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 47720793 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 47721334 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 47721349 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 47721421 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47721465 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47721853 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 47721859 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 47721978 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47722234 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47722779 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47723433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47723589 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47723859 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47724321 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47724433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47724879 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47725137 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 47725548 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47725578 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 47725583 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 47726497 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47726903 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 47726925 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 47726944 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47726980 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 47727157 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 47727271 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 47727818 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47728120 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47728123 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47728388 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 47728425 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 47728473 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 47728510 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 47728525 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 47728621 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 47729287 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47731672 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 47731843 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47732014 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 47732030 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 47733037 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 47733067 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 47733125 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 47733249 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 47734102 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 47734252 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 47734423 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 47734666 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 47734946 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47734948 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47735252 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 47735340 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 47736230 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 47736307 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 47736336 A T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 47736387 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 47736453 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 47736538 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 47736627 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 47736845 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 47736952 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 47736978 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47736992 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 47737049 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 47737082 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 47737138 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 47737153 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 47737214 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 47737294 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47737314 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 47737373 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 47737403 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 47737423 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 47737500 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 47737930 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 47738249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47738992 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47739002 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47739024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47739036 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47739051 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47739064 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47739080 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47739162 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47739259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47739508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47739832 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47739886 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47740335 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47740817 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 47740862 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 47740882 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 47741171 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47741295 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47741535 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47741560 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 47741753 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 47742285 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 47742297 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 47742302 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 47742369 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 47742446 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 47742458 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47742808 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47742890 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 47742923 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47743206 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 47743221 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47743337 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 47743344 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 47743351 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 47743367 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 47743660 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 47743977 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 47744235 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 47744364 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 47744488 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 47744811 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47744973 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47745246 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 47745263 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 47745377 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 47745480 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47745703 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 47745883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47746143 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 47746875 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47747319 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 47747530 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 47747557 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47747573 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 47747815 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 47747908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47748066 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47748176 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 47748202 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 47748248 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 47748270 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 47748579 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 47750288 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47750293 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47750369 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47750472 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47750583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47750624 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47750666 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 47750909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47750987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47751004 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 47751162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47751166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47751181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47751975 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47753728 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47754847 G T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 47754932 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 47756286 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47756313 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 47756329 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 47757028 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47757929 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47758467 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 47758487 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 47758534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47758622 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 47758885 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 47758921 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 47758953 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 47759787 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47760226 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47760252 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 47760384 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47760518 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47760566 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 47760590 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 47760615 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47761602 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47761979 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47762047 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 47762076 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47762109 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47762199 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47762224 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47762257 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47762434 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47762543 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 47762545 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47762635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47764599 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 47764942 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47765272 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 47765778 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47766134 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 47766197 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 47767029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47767084 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47767098 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47767210 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47767644 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47767646 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47767764 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47767907 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47768005 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47768126 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 47768309 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47769820 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47769882 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47769954 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 47770105 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47770130 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47770131 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47770283 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47770301 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47770337 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47770566 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47770586 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47770779 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47771017 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47771074 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 47771364 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47771902 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47772050 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 47772087 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 47772184 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47772194 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47772240 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47772354 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 47772554 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 47772584 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 47772589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47772814 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 47772940 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47773073 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47773396 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47773449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47773475 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47773521 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47773523 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47773589 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47773594 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47773674 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 47773705 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 47773770 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47773789 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 47773810 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47773837 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47773886 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 47774111 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47774113 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47774118 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47774161 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 47774278 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47774291 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47774510 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47774584 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47774645 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 47774992 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 47775008 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47775199 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 47775323 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47775382 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47776101 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47776528 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47776555 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47776980 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 47777119 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47777317 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 47777358 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 47777362 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 47777395 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47777402 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 47777410 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 47777449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47777505 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47777692 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47777748 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47777800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47777814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47777859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47777944 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47778000 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47778036 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 47779234 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 47779251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47779385 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 47779674 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 47779774 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47779837 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47779857 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47779980 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47780295 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47780681 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 47780686 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 47780806 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47780814 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 47781295 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47781643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47783380 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47783484 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 47783512 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 47783863 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 47786545 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47787211 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47787428 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 47787459 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 47787524 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 47787545 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47787881 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 47787913 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47788146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47788319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47788321 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47788570 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47788587 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 47788657 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 47788707 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47788858 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 47788930 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47788992 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47789108 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47789293 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 47789294 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 47789397 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 47789486 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47789733 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 47789869 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 47789935 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 47790081 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 47790085 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 47790147 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47790182 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47790188 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 47790189 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 47790231 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 47790241 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 47790399 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 19 47790445 T C N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 19 47791455 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47791525 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47791545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47791725 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 47791814 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47792009 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47792090 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47792255 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 47792295 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 47792531 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 47792704 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47792714 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 47792721 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 47792722 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 47792748 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 47792757 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47792778 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47792968 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 47792969 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47793020 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47793252 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47793360 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47793506 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47793518 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47793622 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47793774 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 47793887 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47793919 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47794034 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47794324 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47794461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47794504 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47794505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47794577 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47794697 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47795029 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47795099 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47795391 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 47795407 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47795797 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47795963 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47795994 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47796132 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47796705 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47796752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47797037 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47797069 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47797253 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47797545 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47797749 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47797951 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47797970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47797971 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47797972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47798068 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47798074 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 47798110 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47798386 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 47798826 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47798835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47798838 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47799024 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47799311 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 47799427 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47799522 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47799552 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 47799689 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47799886 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 47799956 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 47800055 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 47800066 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 47800177 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 47800179 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 47800185 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 47800395 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 47800748 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47800997 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47801085 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47801115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47801181 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47801259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47801378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47801635 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47801712 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 47801742 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47801782 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47801891 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 47802222 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 47802458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47802463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47802476 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47802766 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47802947 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 47803048 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47803619 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 47803703 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47804691 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47805114 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47805132 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47805308 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47805703 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 47806776 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 47807579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47808443 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47808724 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 47809596 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47810464 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 47811775 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 19 47811856 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 47812922 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 47813054 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 47813104 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47813473 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47813778 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 47814028 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47814238 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47815947 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47816414 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47817167 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47818270 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47818412 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 47818413 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 47818546 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 47818831 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47819150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47819205 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47819582 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 47819861 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47820273 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 47820415 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 47820996 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47821276 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47821324 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47821563 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47821956 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47821964 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47822051 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47823505 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47823710 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47823949 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47823984 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47825122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47825146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47825943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47825970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47826006 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47826033 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47826070 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 47826082 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 47826150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47827049 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47827352 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 47827370 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 47827392 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 47827401 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 47827432 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 47827518 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 47827687 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47827900 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47827951 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47828037 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47828302 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47829759 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 47829985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47830005 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 47830041 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47830044 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47830064 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47831157 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47831185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47832208 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47837258 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47837997 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47838037 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47840550 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47840551 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47842717 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47843662 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 47844297 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47845049 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 47845148 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47845839 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 47845843 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 47846026 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 47846271 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47846864 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 47847373 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 47847540 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47848252 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47848408 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 47848833 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 47848950 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47849421 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47849713 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47850412 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 47850645 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 47850669 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 47851870 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47852004 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47852067 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 47852264 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 47852284 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47852292 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 47852928 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 47854023 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 47854377 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 47854641 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 47854783 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47855118 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47855129 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47855133 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47855287 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47855610 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47856114 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 47856442 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47858724 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47858794 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47860933 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47861477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47864146 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47864981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47866334 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47867967 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47869095 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 19 47870170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47871484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47873382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47875327 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 47875639 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47876019 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 47877235 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47878509 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 47886934 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47887005 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47887177 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 47887189 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 47887314 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47887411 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 47887419 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 47887520 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 47887677 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47887687 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 47887744 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47887900 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47888082 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47888689 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 47889088 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 47889175 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47889607 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 47890108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47890988 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 47892342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47892941 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 47893946 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47894356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47894489 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47894555 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47898115 C G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 19 47898267 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47903008 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 47903062 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 47903118 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47903312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47905081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47906312 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47906335 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47906860 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 47907379 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47907712 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47907795 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47907941 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47908268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47909976 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47910343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47910483 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 47910698 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 19 47910985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47911207 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47913491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47913598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47915017 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47916534 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47923108 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47923253 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47923443 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47923829 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 47923986 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47924413 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47925399 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47925670 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47926008 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 47926350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47926512 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47926530 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47926873 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47927167 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47927452 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 47927455 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47927558 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47927594 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47927710 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 47927758 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 47927788 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47927803 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47927998 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 47928039 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 47928072 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 47928151 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 47928180 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 47928208 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 47928287 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47928332 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 47928489 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 47928501 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 47928589 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47930060 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 47930122 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47930262 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47930553 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 47931030 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47931061 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 47931109 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47931144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47931158 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47931277 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47931312 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47931383 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 47931390 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 47931450 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 47931481 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 47931499 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47931506 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47931859 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 47931872 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 47931983 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 47932033 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47932101 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 47932213 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47932634 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47932657 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47932833 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 47932838 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47932910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47933034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47933258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47933730 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 47933802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47934126 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 47934667 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47934859 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47935265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47936241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47936486 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 47936676 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 47936741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47936810 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 47936836 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 47937083 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47937157 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47937279 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47937299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47937363 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 47937586 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47937610 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 47937655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47937664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47937676 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47937701 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47937742 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47937798 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 47938007 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47938044 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47938073 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47938080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47938089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47938197 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47938210 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47938223 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 47938226 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 47938334 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47939099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47939592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47939881 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47939952 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 47940179 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 47941408 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47942306 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47942976 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47943184 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47943405 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47943501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47943548 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47943693 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47943694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47943695 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47943741 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47943788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47943880 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 47944522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47944905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47944979 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 47945308 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47945460 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 47945547 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47945934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47946268 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47946888 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47946894 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47947794 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47948063 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47948516 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47949610 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47949805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47950177 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47950710 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 47952011 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47952225 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47952736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47953225 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 47953715 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47954922 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 47955293 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47955307 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47955561 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47958289 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47958827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47959976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47960949 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47962013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47962026 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47962055 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47962072 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47962451 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47962468 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47962474 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47963052 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47963053 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47963802 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47963878 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47964246 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 47964269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47964302 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 47964512 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47965121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47965153 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47965230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47965590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47965625 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47965801 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47965865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47966027 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47966164 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47966290 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47966701 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 47967011 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 47967188 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47967486 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47967676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47968716 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47968765 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 47968769 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47969178 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47969251 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47969346 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47969489 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47969552 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47970199 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47970320 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 47970324 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 47970427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47970674 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47970719 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47970997 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47971324 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47971456 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47971536 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47971621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47971977 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 47972254 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47972914 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47973077 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 47973426 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 47973442 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 47973783 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47973842 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 47973908 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47974008 G T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 47974186 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 47974398 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47974823 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47975121 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 47975198 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47975217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47975391 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47975401 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47975690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47975726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47975831 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47975928 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47975969 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47976293 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47976351 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47976585 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47976713 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47977280 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 47977284 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47977418 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47977434 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47977639 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47978106 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47978133 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47979377 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 47979430 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47979764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47979812 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 47980223 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47980524 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 47980892 A T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 47981688 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 47982873 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47983257 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 47983299 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 47983747 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 47983752 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 47984531 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 47985309 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47985343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47985431 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 47985602 T A N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 19 47985671 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47985706 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47985791 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 47985796 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 47985862 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47985945 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 47986004 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 47986146 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 47986185 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 47986218 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 47986273 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 47986305 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 47986581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47986921 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 47987017 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 47987374 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47987655 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 47987813 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 47987943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47988026 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 47988277 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 47988442 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 47988593 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47988670 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47988682 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47988732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47988766 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 47988784 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47989063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47989185 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47989601 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47989870 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 47989899 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 47990124 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47990187 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47990213 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47990216 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47990270 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47990373 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 47990383 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 47990392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47990455 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 47990844 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 47990862 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 47990891 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 47990893 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 47990948 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 47991351 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 47991466 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 47991678 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 47991936 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47991996 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 47992124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47992749 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47992901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47992941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47992957 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 47993013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47993293 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 47993319 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 47993488 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 47993722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47993723 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47995410 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 47996166 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 47996223 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 47996902 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 47996925 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 47997012 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 47997069 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 47997637 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 47998949 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 48000013 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 48000085 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48001300 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 48002040 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 48002065 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48002108 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 48002645 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48002665 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48002666 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48002767 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48002776 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48002787 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48002822 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48004321 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48004488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48004618 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48004729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48004785 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48004890 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48004903 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48004915 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48005053 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48005245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48005335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48005463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48005659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48005712 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48005750 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48005806 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48005872 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48005884 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48006213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48006235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48006379 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48006434 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48006558 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48006571 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48006678 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48006679 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48006714 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48006878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48007244 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48007773 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48007955 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 48008471 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48008622 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48008633 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48008660 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48008682 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48008719 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48008720 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48008742 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48009024 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48009158 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48009178 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48009192 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48009251 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48009381 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48009390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48009556 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48009567 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48009570 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48009749 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48009757 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48009819 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48009856 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 48009951 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48010245 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48010618 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48010810 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 48010818 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 48010869 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 48010891 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 48010901 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 48011006 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48011043 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48011240 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48011359 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48011519 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48011536 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48011561 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48011607 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48011656 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48011738 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48011818 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 48011819 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 48011919 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48012479 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48012535 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48012768 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48013032 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48013155 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48013243 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48013405 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48013474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48013904 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48013964 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48014117 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48014159 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48014419 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48014548 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48014721 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48014984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48015027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48015057 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48015127 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48015295 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48015445 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48016059 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48016275 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48016477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48017223 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48017712 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48018126 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48018462 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48019336 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48019344 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48019435 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48019660 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48019678 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48020086 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48020167 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48020415 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48020735 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 48021052 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 48021057 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48021481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48021730 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48021810 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 48021811 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48021911 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 48022249 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48022932 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 48023050 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 48023243 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48023624 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 19 48024852 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 48025056 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48025088 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48025486 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48025919 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48026321 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 48026434 A G N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.181818181818182 0.0909090909090909 0.727272727272727 5 17 2 1 8 19 48026973 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 48026982 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 48027436 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48027447 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48028542 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48029071 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48032653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48032796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48034658 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48034924 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 48034946 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 48035386 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 48035389 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48035636 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 48035662 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48035715 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 48035732 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 48035733 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 48035869 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48036015 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 48036051 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 48036254 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 48036568 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48036630 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48036637 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48036641 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 48036646 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48036689 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48036692 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48036862 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 48036915 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 48037067 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 48037252 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 48037270 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 48037674 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48037729 A T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 48037771 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 48037923 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48037927 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48038278 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 48038320 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48038470 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 48038476 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48038746 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 48039986 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48040289 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48041205 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 48041849 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 48042339 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 48042496 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 48042616 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48043110 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48043196 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 48043302 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 48043502 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48043594 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 48043677 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 48043710 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48043899 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48044714 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 48044838 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48044860 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 48045083 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48045209 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 48045348 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 48046386 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48046413 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 48046509 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48046543 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48046580 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48046641 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48046779 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48046847 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 48046893 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 48047009 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 48047048 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48047209 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48047220 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 48047446 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48048203 A C N N 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.4 0 0.6 4 6 2 0 3 19 48048417 A C N N 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 19 48048429 T C N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.5 0 0.5 4 4 2 0 2 19 48048485 A G N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.5 0 0.5 4 4 2 0 2 19 48048500 G A N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.5 0 0.5 4 4 2 0 2 19 48048509 G T N N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.5 0 0.5 4 4 2 0 2 19 48048522 T C N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.5 0 0.5 4 4 2 0 2 19 48049354 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48050219 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48050881 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 48050883 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 48050897 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 48050898 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 48051005 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 48051056 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 19 48051182 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48051211 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 48051328 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48051479 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 48051647 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 48052002 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 48052044 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48052088 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 48052234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48052281 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48052287 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 48052426 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48052428 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 48052478 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48052512 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 48052637 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48052717 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48053067 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 48053099 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 48053286 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 48053484 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48053696 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 48053741 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48053776 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48054031 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 48054617 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 48054636 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 48054761 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48054832 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48054968 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48055263 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48055645 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48055887 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 48056108 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48056110 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 48056213 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48057115 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 48057121 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 48057122 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 48057149 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48057250 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48057300 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 48057328 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 48057346 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48057480 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 48057541 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 48057592 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 48057623 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48057707 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 48058147 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 48058323 C T N Y 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 19 48058464 C T N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 19 48058477 A C N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 19 48058548 T G N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 19 48058776 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 48058789 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48059090 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 48059114 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48059255 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48059338 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48059871 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 48060071 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48060142 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48060255 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48060472 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48060474 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48060803 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48060816 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 48060884 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48060912 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48060925 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48061120 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48061367 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 48061430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48061457 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48062026 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48062095 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 48062316 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 48062317 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 48062329 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48062420 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48062424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48062694 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48062860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48063142 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48063492 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48063808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48064048 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48064078 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 48064399 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 48064426 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 48064459 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 48064486 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 48064609 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48064794 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 48065370 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48067435 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 48069700 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 48070202 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48070284 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48070428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48070754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48070758 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48070805 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 48071061 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 48071083 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 48071320 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48071589 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48071661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48071678 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48071860 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 48071977 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 48072053 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48072212 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48072334 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48072354 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 48072357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48072425 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48072937 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48073507 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 48074856 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 48075856 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 48075888 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 48075975 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48076360 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48076572 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48077048 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 48077489 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 48077898 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 48077995 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48078094 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48078227 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 48078385 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48078555 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48078569 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48078574 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48078648 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48078829 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48078965 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48078997 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48079011 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 48079176 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48079189 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48079363 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48079408 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48079621 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48079713 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 48079796 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48079800 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48080190 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48080549 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 48080572 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48080796 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48080872 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48081039 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48081138 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48081225 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48081942 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48081963 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48082155 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48082186 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48082492 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48082855 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48083052 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 48083228 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48083231 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48083348 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48083602 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48084126 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 48084245 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 48084477 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48084664 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48085777 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48085877 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48086242 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 48086254 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 48086871 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48086950 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 48086965 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 48086969 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 48086987 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 48087099 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48087329 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48087423 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48087547 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48087600 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 48088363 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48088435 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48088509 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48088597 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48088621 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 48088646 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48088714 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48088807 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 48088844 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 48088953 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48089215 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 48089236 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48089278 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 48089288 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 48089312 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 48089361 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48089488 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 48089503 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 48089665 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 48089689 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48089772 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 48089859 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 48089921 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 48089936 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 48089946 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 48089982 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 48090061 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48090066 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 48090073 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48090205 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48090592 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48090961 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 48091325 G T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 19 48091705 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 48091761 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 48091796 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 48092012 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 48094254 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48094298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48096811 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48096814 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48098345 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48099826 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48099916 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 48100024 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 48100658 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48101317 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 48101852 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 48102432 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 48102539 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 48102710 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48102773 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 48102959 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48103058 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 48103096 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 48103206 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48103643 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 48104114 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 48105935 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 48106838 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 48107394 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48107436 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 48107744 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48108573 G A N Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 5 5 2 1 2 19 48109726 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48110138 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48110396 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48110689 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 48110846 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 48110876 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48110952 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 48110965 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48111268 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 48111608 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48112668 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 48112845 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48112987 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 48115354 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 48115368 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 19 48115690 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 48115906 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48116122 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48116130 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48116134 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48116398 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48116580 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48116594 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48116898 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48116955 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48117104 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48117143 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48117153 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48117177 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48117203 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48117224 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48117282 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48117428 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48117444 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48117656 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48117679 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48117706 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48117736 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48117765 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48117801 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48117804 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48117898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48117956 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48117990 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48118075 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48118085 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48118198 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48118278 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 48118319 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 48118321 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 48118500 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 48118504 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 48118510 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 48118693 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 48118699 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 48118930 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 48118975 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 48118976 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 48119085 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 48119108 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 48119269 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 48119272 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 48119635 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48119799 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 48120188 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 48120319 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 48120336 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 48120337 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 48120413 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 48120502 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 48120516 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48120518 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48120524 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48120561 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 48120568 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48120649 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 48120678 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 48120756 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 48120820 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48120851 A T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 19 48120865 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 48120897 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48120921 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 48120997 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48121016 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 48121283 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 48121313 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 48121503 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 48121513 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 48121571 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 48121891 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 48121893 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 48122010 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 48122135 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 48122146 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 48122207 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48122276 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 48122589 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 48122667 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 48122687 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 48122797 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 48122808 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48122860 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48122868 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 48123193 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 48123289 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48123312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48123379 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48124139 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 48124411 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 48124522 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48124650 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 48124715 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 48124816 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48125008 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48125223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48125770 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48126661 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48127162 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 48127238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48127242 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 48127432 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48127519 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 48127603 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 48127649 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 48127730 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48127773 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48127835 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 48127847 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48129155 G A N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 19 48129325 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 48129404 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 48129426 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48129443 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 48129651 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48129814 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48129879 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 48129967 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 48130036 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48130096 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48130220 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48130336 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48130387 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48130433 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 48130547 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 48130714 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 19 48130759 G T N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 19 48130765 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 48130807 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48130946 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48131015 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48131037 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48131072 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48131209 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48131479 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48131488 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48131499 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48131614 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48131634 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48131637 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48131738 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48131827 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 48131846 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 48131870 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 48131956 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48132002 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 48132023 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 48132063 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 48132071 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48132343 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 48134001 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48134865 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48134901 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48135536 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 48135942 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 48135949 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 48135954 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 48136122 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 19 48136679 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48138498 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48141170 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 48141470 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48141908 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48142022 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48142264 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 48143034 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48143264 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 48143607 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48145179 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48145499 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 48145679 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48145777 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 48146085 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 48146153 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 48146439 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48146546 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 48147379 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 48147437 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48147704 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48147815 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 48147873 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48148042 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 48148043 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 48148443 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48150121 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 48150181 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48150355 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48150606 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48151136 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48151206 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48151376 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48151471 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48152654 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48152938 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 48153912 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48154199 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48154207 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 48154834 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48154912 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48155259 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48155413 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 48155443 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 48155504 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48155513 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 48155532 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48155571 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48155579 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48155591 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48155869 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48156022 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 48156041 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 48156052 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 48156122 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 48156615 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48156758 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 48156966 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48157865 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48158359 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48158370 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 48158783 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48159090 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48159390 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48160967 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48160974 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 48160975 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 48161288 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48161394 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48161438 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48161984 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 48162154 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48162155 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48162312 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48162315 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48162702 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 48162705 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 48162900 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 48162930 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 48162939 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48162949 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48163308 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 48163594 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 48163824 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48163942 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 48164075 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48164184 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 48164471 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48164495 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48164640 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48164793 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48164878 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48164884 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 48164920 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48164939 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48164984 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 48164997 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 48165045 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48165066 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 48165089 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 48165091 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 48165132 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48165174 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 48165176 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 48165220 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 48165257 C A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 48165310 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 48165326 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 48165341 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 48165436 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 48165652 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48165659 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48165842 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48165941 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48165942 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48165987 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48166025 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 48166033 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48166076 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48166208 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48166394 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48166425 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48166480 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48166492 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48166789 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 48166896 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48166927 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48166976 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 48166998 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48167028 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48167179 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 48167195 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 48167223 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48167506 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48167570 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48167571 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 48167579 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 48167605 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48167656 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48167664 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 48167675 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48167696 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48167698 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48167779 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48167983 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48168070 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 48168089 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 48168094 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 48168144 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 48168289 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48168856 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48168867 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48168868 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48168880 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48168914 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 48169018 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 48169038 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 48169091 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 48169223 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48169498 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48169633 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 48169750 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 48169751 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48169841 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 48169852 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 48169867 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 48169938 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48170023 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 48170066 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 48170600 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48170603 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48170941 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48171328 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 48171423 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48171669 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48171683 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48171689 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48172175 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 48172192 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 48172303 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 48172326 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48172334 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 48172438 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48172441 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48172662 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48173354 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48173388 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48173544 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48173631 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48174781 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 48175035 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48175130 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 48175510 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 48175655 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48175960 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48176063 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48176726 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48176907 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48177143 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48177321 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 48177323 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 48177533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48177574 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 48177586 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48177827 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48177843 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48177925 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48177962 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 48178014 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48178072 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 48178208 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48178622 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48178822 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 48179210 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 48179270 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48179678 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 48179710 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48179793 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 48179824 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 48180583 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48180905 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48181019 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 48181159 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48181179 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48181385 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48181676 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 48181692 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 48181694 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 48181706 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 48181708 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 48181877 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 48182921 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 48182979 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 48183019 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 48183057 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48183364 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 48183367 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 48183733 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 48183737 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48183751 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48183846 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 48183891 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 48183902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48183938 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48184297 C A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 48184347 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 48184350 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 48184398 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 48184446 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 48184627 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 48184648 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 48184667 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 48184691 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 48184744 C T N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 19 48186065 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 48186178 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 48186485 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 48186520 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 48186542 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 48186688 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 48186695 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48186767 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 48187106 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48187797 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48187856 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 48187914 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48187964 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48188113 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48188198 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48189399 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 48189401 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 48189436 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48189541 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 48189860 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48189868 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 48189890 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48189923 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48190012 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48190018 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48190099 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48190141 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48190695 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 48190702 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 48190722 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 48190768 G A N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 19 48190776 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 19 48190803 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 19 48190893 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 48190912 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48191005 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48191012 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48191019 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 48191042 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48191295 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 48191298 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 48191327 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 48191759 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 19 48192002 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 48192270 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 48192591 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 48192758 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48192771 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48192791 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48192829 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 48192843 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 48192893 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 48192904 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 48192911 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 48192974 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 48193700 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 48193712 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 48194162 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48194177 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48194361 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48194838 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 48195062 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 48195082 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48195359 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48195414 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48196161 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48196197 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48196221 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48196376 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48196558 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 48196629 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 48196798 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48197411 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48197591 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48197716 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 48197760 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48197800 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 48197819 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 48197922 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48197987 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 48198066 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48198306 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 48198462 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 48198735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48198885 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 48198914 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 48198982 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48199045 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48199063 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48199133 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 48199171 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 48199547 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48199646 G T Y N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 19 48199711 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 19 48199721 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 19 48199765 G A N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 19 48199850 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48199971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48200109 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48200142 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48200155 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 48200215 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48200273 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 48200283 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48200375 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 48200812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48200877 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48201119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48201159 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 48201205 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48201314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48201792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48202022 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48202209 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 48202433 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 48202452 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 48202457 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48202486 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 48202496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48202549 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48202580 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48202687 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48202739 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48203015 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 48203553 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 48203626 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 48203674 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48204564 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48204573 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48204577 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48204679 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 48204703 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 48204711 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 48204712 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 48204738 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 48204778 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 48204797 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 48205072 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 48205099 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 48205101 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 48205118 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 48205200 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 48205247 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 48205399 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 48205781 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48205878 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 48205929 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 48205983 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 48206038 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48206222 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 48206257 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 48206596 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 48206597 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 48206640 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 48206720 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 48206733 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 48206760 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 48206915 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 48206919 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 48206970 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48207233 T A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 19 48207258 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 19 48207274 T A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 19 48207382 T C Y Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 19 48207394 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 19 48207408 A C Y N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 19 48207475 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 48207497 T G N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 19 48207504 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 19 48207549 A G Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 19 48207601 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 19 48207620 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 48207622 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 48207724 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 48207842 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 48208042 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 19 48208057 C A Y N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 19 48208099 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 19 48208130 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 48208363 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 48208427 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 48208499 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 48208725 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48208741 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 48208820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48209166 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48209204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48209370 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48209499 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 48209591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48209603 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48209616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48209646 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 48210021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48210126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48210173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48210177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48210222 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 48210247 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48210254 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 48210343 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48210347 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48210394 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48210416 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48210440 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48210549 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48210878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48211104 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48211572 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48212110 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 19 48212150 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 48212420 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48212442 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48212499 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48212841 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 19 48212976 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 48213799 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48214506 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48214719 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48214852 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48215298 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48215302 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48215570 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48215654 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48215678 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48216095 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 48216328 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 19 48216476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48216520 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48216565 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 48216653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48216812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48217079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48217753 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48218245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48220095 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 19 48220397 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48220961 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48221055 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48221223 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48221293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48223270 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 48223753 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 48225381 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48227018 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48227031 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48227041 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48227392 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48227399 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48227478 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48227479 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48227515 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48227524 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48227535 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48227801 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48227863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48227989 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 48228206 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48228208 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48228238 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 48228253 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 48228254 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 48228299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48228342 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48228429 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48228766 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48228767 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48228931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48229033 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48229078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48229079 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 48229139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48229165 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48229166 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 48229176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48229197 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48229203 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48229299 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48229342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48229381 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 48229413 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 48229786 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 48229923 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 48229969 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48229972 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48229978 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 48230064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48230199 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 48230217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48230252 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48230283 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48230346 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48230372 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 19 48230424 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 19 48230557 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 19 48230590 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 48230649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48230671 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 48230691 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 48230949 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 48230976 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 48230985 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 48231270 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 48231593 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 48231673 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48231823 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48231826 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 48231845 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 48231846 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48232016 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48232083 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48232090 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48232113 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 48232137 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 48232286 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 48232358 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 48232359 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 48232398 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48232399 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 19 48232421 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 48232517 G T N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 19 48232530 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 48232652 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 48233135 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 48233308 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 48233462 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 48233538 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 48233560 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 48233571 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48233581 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48233584 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48233599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48233603 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 48233613 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48233671 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 19 48233724 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 48233777 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 48233809 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 48233815 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 48233926 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48233932 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48233944 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 48233977 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 19 48234073 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48234112 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 48234148 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 48234189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48234261 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 48234337 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 48234339 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48234383 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48234395 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48234471 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 48234571 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48234756 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48234814 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 48234906 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 48234969 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 48235174 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 48235228 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48235252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48235343 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 48235355 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48235362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48235427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48235431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48235468 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48235476 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 19 48235524 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 48235530 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 48235855 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48235857 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48236015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48236128 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48236644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48236675 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48236967 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48237092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48237127 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48237339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48237441 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48237532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48237561 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48237661 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48237687 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48237709 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 48237722 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 48237784 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 48237797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48237830 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 48237837 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 48237844 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 48237905 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 48238058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48238064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48238066 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48238180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48238275 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 48238279 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 48238337 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 48238378 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 48238437 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 48238452 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 48238464 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 48238495 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48238508 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 48238510 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 48238578 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 48238678 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 48238808 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48238874 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 48238876 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48238960 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 48239082 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48239537 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 48239546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48239563 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 48239675 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 19 48239715 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 48239728 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48240209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48240411 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48240669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48241081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48242065 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 48242119 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48243200 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 48243212 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48243389 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48243536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48243718 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48243719 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48243743 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 48243751 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 48243831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48243833 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48244027 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48244074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48244168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48244182 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48244309 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48244518 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 48244678 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48244797 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48244811 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48244844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48245115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48245156 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48245222 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 48245443 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48245450 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48245452 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48245616 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 48245727 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48245925 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 48245965 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 48246003 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48246164 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48246557 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48246780 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48247180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48247575 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 48247578 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48247593 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48247678 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 48247799 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 48247954 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 48248047 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48248598 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 48248673 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 19 48248798 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 48248845 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 48248848 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 48248925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48248931 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48249070 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48249071 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48249090 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48249098 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 48249199 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48249282 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 48249322 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48249341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48249534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48249565 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 48249640 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 48249661 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 48249688 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48249697 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48249718 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 48249877 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48249967 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48250014 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 48250423 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48250488 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 48250774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48250808 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48250815 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48251022 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 48251030 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 48251486 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48251646 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48251692 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 19 48251731 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 48251851 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 48251933 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.176470588235294 27 7 13 1 3 19 48252913 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 48252916 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 48253033 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48253144 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 48253479 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48253564 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48253588 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48253681 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 48253762 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 48253870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48254253 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48254306 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48254307 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48254343 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48254351 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48254433 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 48254579 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48254686 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48255305 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48255527 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 48255716 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48256049 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 48256114 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48256508 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48256842 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 48257350 A G Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 48257483 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48257597 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 48258973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48259140 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48259651 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 19 48259654 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 48259725 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 48259826 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 48259880 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 48260226 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 48260297 A C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48260310 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48260326 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 48260328 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 48260334 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 48260354 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 48260392 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 48260394 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 48260457 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 48260479 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48260493 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48260498 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 48260509 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 48260552 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48260553 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 48261080 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48261325 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48261362 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 48261377 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 48261392 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 48261424 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 48261450 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 48261459 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 48261506 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 48262100 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 48262154 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48262181 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48262183 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 48262305 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48262307 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48262814 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48262833 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48262925 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48263170 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48263183 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48263312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48263339 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48263607 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48263710 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48263733 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48263810 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48263851 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 48263869 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48263898 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48264282 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 48264300 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 48264435 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 48264521 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 48264637 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 48264682 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48264684 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48264710 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 48264749 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 48264810 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 48264889 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 48264953 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 48265299 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 48265430 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 48265585 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 48265596 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 48265701 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 48265748 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 48265858 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 48266179 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 48267944 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 48269413 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48269422 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 48269652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48271173 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 48271534 C G N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 19 48272349 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 19 48272891 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48273003 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48273521 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 48274588 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 48274607 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 48274828 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 48275732 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 48275796 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 48275869 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 48276120 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 48276204 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 48276312 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48276366 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 48276544 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48277413 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 48277472 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48277475 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48278501 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48278859 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 48279187 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48279763 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 10 14 2 6 4 19 48280999 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48281041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48281152 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48281163 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 48281429 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 48281433 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 48281434 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 48281754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48281968 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48282025 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48282133 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48282195 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48282202 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48282312 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48282488 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 48282587 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48282810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48282930 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48283015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48283074 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48283096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48283147 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48283178 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 48283282 C G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 48283284 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48283338 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48283440 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48283832 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48284098 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 48284121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48284525 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48285233 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48285399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48286073 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 48286366 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48286493 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48286569 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 48286743 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48286842 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 48287202 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 48287892 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 48288021 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48288371 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48290411 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48290677 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48291649 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48291926 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48291984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48292445 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48292998 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48293104 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48293261 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 48293292 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48293424 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48293425 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48294467 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 48294490 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48294491 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48294543 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48294701 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48294791 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48294826 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48295053 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48295177 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 48295178 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48295247 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48295271 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 48295287 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 48295456 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 48295471 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48295534 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48295565 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48295608 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48295614 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48295628 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48295633 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48295666 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48295697 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48295705 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48295714 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48295741 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48295848 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 48295897 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48295911 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48296132 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48296371 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48296556 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 48296710 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48296729 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48296745 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48296756 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48296784 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48296979 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48297186 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48297334 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48297337 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48298204 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48298672 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 19 48298992 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 48299597 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48299711 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 48300197 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 48306827 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 48306928 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48307024 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48307050 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 48307071 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48307094 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 48307257 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 48307627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48307658 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48307995 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 48308105 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 48308182 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48308357 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48309102 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48309218 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48309397 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48309563 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48310287 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48310680 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48311049 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48311487 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48311543 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48312247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48312634 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48312644 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48312827 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48313894 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48313974 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48314060 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48314188 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48314192 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48314262 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48314367 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 48314417 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 48314477 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48314631 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 48314741 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 48314812 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48314819 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48314847 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48314915 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48315042 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 48315090 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48315205 C G N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 19 48315336 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 48315554 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48316914 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 48316973 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 48317020 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48317413 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 48317448 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48317702 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 48317736 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48318012 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 48318175 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 48318818 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 48318829 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 48318976 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48318993 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 48319054 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 48319136 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 48319290 C A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 48319981 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 48320132 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48320472 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 48320739 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 48320774 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 48320923 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 48320959 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 48321006 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48321013 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48321842 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 48322763 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48322773 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 48322988 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48323129 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48323178 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48323211 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48323551 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 48323572 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 48323590 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 48323592 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 48323635 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 48323663 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48323738 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48323739 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48323983 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48324010 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 48324510 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48324716 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 48324788 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48325009 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48325363 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48325364 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48325841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48326219 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48326490 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48328855 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 48328873 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 48329123 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 48329189 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48329463 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48330236 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48330385 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48330442 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 48330452 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48330538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48330575 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48330644 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48330747 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48330967 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48331151 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 48331250 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 48332252 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48332307 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48332432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48332568 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 48332917 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 48332958 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 48333068 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48333623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48335430 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 48335482 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48335822 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48336210 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 48336618 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48337207 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48337234 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 48337302 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 48338286 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48338318 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48338321 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48338512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48338848 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 48339032 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48339254 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48339322 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48339355 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48339390 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48339427 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48339485 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48339530 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48339556 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48339576 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48339903 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 48339936 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48339957 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48340111 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48340146 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48340190 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48340236 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48340458 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48340472 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 48340548 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48340766 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 48340884 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 48340947 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 48340960 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 48341001 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 48341244 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 48341251 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 48341304 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48341329 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48341378 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48341466 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48341487 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 48341601 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48341652 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 48341664 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 48341690 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 48341701 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 48341719 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48341772 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48341794 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 48341800 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 48341813 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 48341965 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48342023 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 48342144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48342217 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48342322 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 48342472 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 48342511 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 48343052 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 48343419 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48343534 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48343551 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 48343965 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 48343968 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48344062 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 48344203 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 48344281 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 48344604 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48344795 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 48344846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48345664 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 19 48345678 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 48345691 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 48345716 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 48345781 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 48345786 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 48346312 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 48346350 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 48346364 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 48346478 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48346520 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 48346583 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 48346603 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 48346648 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 48346682 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48346786 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 48346837 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48346890 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48347026 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48347054 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48347176 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48347184 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48347225 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 48347298 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48347304 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48347317 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48347377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48347559 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 48347565 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48347603 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48347637 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 48347653 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48347740 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48347749 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 48347897 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 48348209 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48348241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48348257 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48348337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48348351 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48348698 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48349920 T C N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 19 48349992 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 48350164 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 48350208 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48350277 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 48350662 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 48350678 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 48351101 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 48351330 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48351974 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48352530 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 48352547 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48352718 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48352876 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48353751 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48353825 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48353859 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48353926 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48353970 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48353992 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48354176 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 48354177 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 48354196 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 48354316 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 48354467 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48354796 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 48355154 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48357302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48357343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48357823 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 48357912 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 19 48358187 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 48358242 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48358265 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48358317 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 48358513 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48358915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48358927 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48358979 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48359190 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48359378 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 48359439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48359474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48359606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48359625 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 48359669 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48359705 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48359740 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48359787 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 48359877 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48359920 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 48360016 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 48360272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48360876 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 48360905 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48361318 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48361414 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 48361428 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 48361605 A G Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 48361767 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 48361810 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 19 48361907 T C Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 48362305 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 48362545 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 48362730 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 48362766 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 48362906 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 48362914 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 48362915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48363080 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 48363155 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 48363419 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.263157894736842 27 11 13 1 5 19 48363526 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 48363728 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 48363757 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 19 48363804 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 48363947 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.7 0.05 0.25 29 11 14 1 5 19 48363972 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48364009 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.222222222222222 0.0555555555555556 0.722222222222222 9 27 4 1 13 19 48364070 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 48364100 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 48364154 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 48364379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48364478 T G Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 48364538 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 19 48364608 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48364735 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48364840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48365007 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 19 48365064 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 48365098 A C Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 48365216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48365577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48366325 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 48366515 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48366609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48366968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48367086 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 48367387 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 48367669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48368207 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48371653 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48371863 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 48371907 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48372097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48373055 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 48373063 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 48373622 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48373715 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48373726 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 48373745 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48374739 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 48375142 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 48375177 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 19 48375449 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48376129 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 48376131 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 19 48376395 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 48376472 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 48376532 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48376806 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 48376871 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 48377163 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 48377621 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 48377724 T C Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 19 48377781 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48377861 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 48377907 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 48377954 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 48378096 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 48378224 A G Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 48378356 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 48378362 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 48378390 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 48378479 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 48378523 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 48378967 A C Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 48381315 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 48381423 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 19 48381558 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48381632 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 48381717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48381887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48382399 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 48382418 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 48382860 T C Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 48383117 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48383246 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 48383303 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 48383405 A C Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 48383499 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 48383526 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 48383565 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 48383705 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 48383733 G C Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 48383742 G T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 48383779 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48383828 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 48383953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48383963 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 48384542 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 48384599 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 48384680 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 48384916 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48385004 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 48385037 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 48385254 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48385414 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48385655 T A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 48385744 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48385745 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48385941 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 48385953 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48385974 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48386053 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 48386144 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 48386600 G A Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 48386924 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 48387131 A C Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 48387588 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48387603 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 48387605 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 48387685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48387738 T G Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 48387748 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48387804 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 48387924 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48388019 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48388604 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48389657 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48391262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48391421 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 48391762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48392894 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48393005 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48393336 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 48393387 C G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 48393394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48393551 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48393645 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48394343 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 48394444 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 48396065 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48396116 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 48396245 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 48396251 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 48396259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48396345 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 48396417 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 48397257 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48397943 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 19 48398534 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48399024 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 48399049 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 48399057 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 48399178 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 48399396 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48399433 C A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 48399444 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 48399470 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 48399672 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 48399731 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48399939 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 48399949 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 48400096 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 48400437 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48400648 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48401193 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 48401532 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 48401648 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48402026 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 48402237 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 48402279 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 48402281 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 48402362 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 48402770 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48402823 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48402851 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 48402859 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 48402941 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48403388 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 48403626 A G N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 19 48403664 G C N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.230769230769231 0.153846153846154 0.615384615384615 8 18 3 2 8 19 48403668 A C N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 19 48403784 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 48403844 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48404020 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48404070 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 48404079 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 48404083 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48404703 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 48404968 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48404987 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 48405051 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 48405057 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 48405169 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 48405175 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 48405316 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 48405346 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 48405692 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48405704 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 48405734 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 48405878 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 48405891 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 48406040 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48406048 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 48406144 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48406219 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 48406306 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 19 48406350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48406394 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48406563 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 48406776 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48406925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48406957 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 48407273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48407395 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 48407442 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 48407451 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 48407518 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 48407606 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 48407619 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 48407621 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 48407629 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 48407647 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 48407882 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48407915 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 48408011 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 48408026 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 48408142 G C N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 19 48408167 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 19 48408172 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 48408241 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 19 48408259 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 48408349 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 48408362 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 48408364 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 48408423 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 48408450 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 48408491 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 48408492 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 48408540 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 48408700 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 48408719 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 48408885 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 48408886 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48408948 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 48408952 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 48408956 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 48408969 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 48409279 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 48409471 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48409533 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 48409644 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 48409696 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 48409700 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 48409978 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 48410005 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 48410185 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48410197 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 48410203 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 48410279 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48410820 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48410899 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 48410950 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48410988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48411037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48411048 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48411063 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 48411134 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 48411217 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 48411265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48411319 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 48411515 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 48411517 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48411594 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48411632 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48411870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48411871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48411932 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48411995 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 48412041 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 48412146 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48412220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48412382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48412465 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48412513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48413269 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 48413402 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48414333 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 48414574 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 48414678 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 48414729 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 48414737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48414750 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 48414856 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 48414977 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 48414978 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 48414989 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 48415026 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 48415066 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 48415200 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 48415262 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 48415804 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 48415834 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48415850 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 48415904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48415955 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48416027 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 48416052 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 48416292 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 48416439 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48416557 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48416561 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 48416566 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 48416667 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 48416674 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 48416788 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 48416886 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 48416940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48416990 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 48416994 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 48417051 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 48417106 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 48417177 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48417206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48417228 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 48417487 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48417507 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 48417658 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 48418338 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 48418354 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 48418375 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 48418721 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 48421796 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48422905 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48422958 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 48423055 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 48423209 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 48423464 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 48423475 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 48423501 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48423575 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48423577 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48423735 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 48423799 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48423836 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 48423946 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 48423971 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 48424585 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48424618 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48424676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48424727 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48424930 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 19 48425581 T G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 19 48425621 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 48425639 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 48425650 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 48425686 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 48425693 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 48425778 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48425805 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 48425858 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 48426348 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 19 48426852 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48426982 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 48427020 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 48427036 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 48427092 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 48427110 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48427226 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 48427250 G T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 48427409 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 48427494 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 48427582 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 48427596 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 48428185 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 48428196 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 48428221 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 48428707 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48428826 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 48428983 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 48429401 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 48429608 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 48429657 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 48429674 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 48429919 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 48429944 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 48429965 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 48429994 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 48430104 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 48430131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48430148 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48430204 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 48430290 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48430367 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48430542 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48431420 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 48431492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48431697 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 48431730 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 48431773 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 48431960 G C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 48431983 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 48431990 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 48432019 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48432322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48432360 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 48432403 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48432551 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 48432587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48432588 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48432748 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48432757 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48433016 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 48433143 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 19 48433176 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 48433255 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 48433462 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 48433482 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48433938 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 48433973 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 48434025 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48434047 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 48434223 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48434355 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48434373 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 48434374 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 48434419 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48434471 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48434510 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48434524 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48434530 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 48434534 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48434542 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 48434722 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48434736 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 48434759 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48434808 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48434833 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 48435139 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 48435236 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 48435256 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 48435281 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 48435403 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48435599 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 48435609 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 48435611 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 48435802 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48436164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48437148 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 48437459 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 48437713 C A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 48438198 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48438614 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48438697 C G Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 48438931 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 48439311 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48439482 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48439497 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48439577 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48439631 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48439799 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48439971 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 48440024 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 48440025 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 48440259 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48440305 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48440327 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48440345 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 48440360 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48440503 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48440764 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48440826 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48440882 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48440965 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 48440966 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 48441040 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 48441101 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 48441485 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 48441508 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 48441645 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48441821 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 48441954 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 48442255 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 48442256 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 48442374 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48442476 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 48442894 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48443430 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48443462 C G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 48443630 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48443640 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48444012 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 48444014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48444469 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 48444595 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 48444699 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 48444780 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 48444928 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 48444965 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48445035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48445039 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 48445086 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 48445143 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 48445150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48445151 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 48445389 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 48445543 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 48445587 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 48446042 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48446128 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48446274 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 48446284 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 48446348 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48446374 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48446510 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48446560 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48446567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48446600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48446639 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 48446790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48447047 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 48447080 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 48447111 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48447252 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 48447350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48447383 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48447398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48447434 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 48447462 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48447864 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48448122 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48448124 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48448238 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48448365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48449055 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 48449218 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 48449219 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 48449479 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 48450182 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48450192 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 48450582 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 48451717 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48452125 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48452577 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 48452593 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 48453203 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48453676 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48454081 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 48454133 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 48454191 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48454367 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 48454370 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48454490 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 48454502 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 48454514 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 48454586 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 48454743 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 48454822 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 48454893 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 48454908 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 48454958 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 48455045 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 48455059 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 48455112 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 48455154 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48455240 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 48455318 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 48455373 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 48455417 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 48455458 T A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 48455461 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 48455641 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48455655 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48455792 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48455938 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48456482 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 48456765 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 48456780 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 19 48456787 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 19 48457707 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 48457869 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48457889 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48458142 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48458469 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48458539 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48458569 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 48458571 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 48458596 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48458833 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 19 48458895 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 48458918 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 48458983 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 48459082 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 48459117 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 48459162 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 48459176 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 48459201 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 19 48459213 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48459308 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 19 48459314 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 19 48459327 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48459396 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 19 48459456 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 48459795 C G Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 48459829 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 48459837 T G Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 48459850 G T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 48459930 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48459995 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48460014 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48460034 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 48460072 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 48460228 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 48460414 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 48460481 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48460498 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48460516 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 48460542 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48460545 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 48460550 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 48460589 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48460604 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48460703 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 48460708 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 48460769 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48460773 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 48460782 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48460851 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 48460853 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 48461053 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 48461175 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 48461366 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 48461407 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 48461429 C A N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 19 48461430 T G N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 19 48461462 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 19 48461620 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 48461668 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 48461740 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 48461815 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 19 48461908 G A Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 48461965 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48461969 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48462005 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 48462087 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48462229 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48462258 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48462357 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48462477 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48462478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48462597 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48462603 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 48462627 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48462645 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48462690 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 48462770 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48462789 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48462806 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48462818 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48463021 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48463122 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 48463187 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 48463576 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48463634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48463707 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 48463756 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48464011 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48464082 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 19 48464269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48464350 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48464465 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 48464583 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48464635 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 48464722 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48464968 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 48465049 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48465164 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 48465187 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48465275 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 48465301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48465369 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48465455 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 48465744 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 48465902 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48466150 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48466151 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48466193 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 48466579 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 48466625 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 48466627 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 48466735 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 48466843 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 48466944 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48466968 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 19 48467212 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48467426 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 48467440 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48467483 C G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 19 48467534 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 48467559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48467563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48467628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48467756 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 48467789 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48468084 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48468130 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48468171 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 19 48468567 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48468718 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 48468738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48468789 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 19 48468804 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 48469114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48469122 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48469123 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 48469247 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48469275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48469528 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 19 48469625 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 48470017 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 48470041 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48470169 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 48470744 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48470906 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 48470978 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48470998 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 48471144 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48471168 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48471192 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48471359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48471650 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 48471658 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 48471894 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 48471943 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 48472576 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48473058 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 48473131 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 19 48473430 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48473789 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48473861 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 48473964 T A Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 48473981 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 48473991 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 48474101 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 48474200 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 48474428 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 48474452 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 48474633 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48475029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48475234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48475245 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 48475267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48475278 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 48475309 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 48475345 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 48475382 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48475468 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48475518 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 48475974 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 48476055 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 48476403 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 48477268 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 19 48477385 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 48477475 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 48477501 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48477503 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 48477527 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 48477594 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 48477603 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 48477642 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 48477665 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 48477681 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 48477833 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48477920 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48477946 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48477995 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 48478003 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 48478004 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 48478200 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 48478631 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 48478660 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 48478695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48478699 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 48478703 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 48478714 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 48479242 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 19 48479445 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48479482 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48479663 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48483029 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 48483102 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 19 48483114 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48483175 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48483860 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48484334 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 19 48484380 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 19 48484419 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 19 48484430 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48485684 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 48485713 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48486129 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 19 48486145 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 19 48488651 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48488667 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48488722 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 48488743 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48488771 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 48489482 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 48489817 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 48489859 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 48490541 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 48490674 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48491545 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 48491729 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 48492256 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48492259 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48493619 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48494103 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48495665 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 48496025 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 48496237 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48496240 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48496793 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 48496852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48497518 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48497696 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48498255 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48498957 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 19 48499667 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 48499899 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48500128 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48500910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48501137 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 48501311 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 48501580 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 48501668 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 48501823 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 48501833 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48501943 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 48501947 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 48502020 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 48502133 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 48502176 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 48502207 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48502219 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 48502237 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 48503161 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48503302 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 48503978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48505106 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48505182 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 48505324 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 48505446 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 19 48505606 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 48505828 A G N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 5 15 2 1 7 19 48505864 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 48506181 A C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 19 48506182 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 48506206 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48506333 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 48506451 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48506455 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48506529 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 48507176 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 19 48507352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48507425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48507442 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 48507488 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 48507500 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 48507645 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48507785 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48507789 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48508009 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 48508161 A G N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.214285714285714 21 7 10 1 3 19 48508623 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 48508685 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 48508688 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 48508945 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 48509097 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 19 48509351 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 19 48509505 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 19 48509570 C A Y N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.8 0 0.2 16 4 8 0 2 19 48510289 G T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.3125 0.0625 0.625 11 21 5 1 10 19 48510596 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48510642 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 48510761 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 48510786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48510793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48510861 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 48510897 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 48511102 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 48511119 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 48511126 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 48511133 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 48511337 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 48511366 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 48511430 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 48511489 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 48511508 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 48511518 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48511556 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 48511579 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 48511615 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48511857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48511864 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 48511893 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 48511917 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 48511932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48511986 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48512025 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 48512093 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 48512115 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 48512380 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 48512448 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48512474 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 48512528 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48512626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48512704 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 19 48512709 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 48512711 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 48512802 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48512837 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48512895 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48512909 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48513083 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 48513255 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48513344 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48513518 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 48513543 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 48513584 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 48513593 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 48513613 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 48513638 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48513846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48513871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48513873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48514095 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48514158 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 48514171 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48514175 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 48514193 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 48514213 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 48514237 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48514588 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 48514787 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 48515042 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48515071 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 48515119 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 48515122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48515434 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48515525 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48515738 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 48515753 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 48515832 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48515853 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 48515889 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 19 48515896 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 19 48516143 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 48516180 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 48516197 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 48516236 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 19 48516257 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 48516258 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 48516336 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 48516408 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 48516449 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 48516510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48516550 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48516592 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 48516605 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 48516616 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 48516675 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48516898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48516909 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 48516961 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 48517011 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 19 48517091 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 48517096 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 48517128 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 48517305 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 48517421 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 48517438 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 48517653 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 48517660 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 48517831 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48518170 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 48518498 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 19 48518823 C T Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 48519516 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48519652 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48520082 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 48521626 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48521844 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 48522596 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 48522604 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 48523226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48523981 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48524939 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 48527059 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 48527477 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 19 48528109 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 48528110 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 48528134 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 48528409 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 48528469 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 48528541 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 48528641 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 48528697 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 48528702 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 48528746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48529737 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 48531110 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 48531758 C A Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 48532006 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 48532782 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48533556 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 48533991 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48534962 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 48536030 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 48536424 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 48536512 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 48536556 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 48536775 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 48537225 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 48537349 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 48537352 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 48537556 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 48538019 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 48538879 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 48539259 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 48539349 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 48539414 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 48539704 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 48539804 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 48539909 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 48539962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48540360 T G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 48540383 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48540482 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 48540563 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 19 48540777 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 19 48540796 T A N N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 19 48540933 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 48540937 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 19 48540982 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48541287 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 48541489 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 48541518 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 48541595 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 48541650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48541825 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 48541934 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48542019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48542050 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48542053 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 48542121 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 48542317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48542564 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 48542820 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 48543029 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 48543086 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 48543107 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 48543355 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 48543725 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 48544353 A T N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 48544552 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48544611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48545693 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48545903 G T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 48546277 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48546345 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 48546379 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 48546434 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 48546594 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 48546839 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 48546917 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 48547104 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 48547614 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 48547656 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 48547836 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 48547890 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 48548055 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 48548259 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 48548550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48549346 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48550215 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48550252 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 48550460 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 48550689 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 48551306 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48551345 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48555315 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48555454 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 48556250 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48556996 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 48557687 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48558151 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 48558291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48558425 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 48558486 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 48558628 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48558751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48558834 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48558870 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48560237 G A N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 19 48560337 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 19 48560422 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48560437 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 48560521 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 48560792 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 48560864 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 48560911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48560961 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48560973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48560984 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48561152 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48561250 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 48561304 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 48561503 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 48561522 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 48561692 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 48561713 T G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 19 48561729 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 48561992 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 48562240 G A N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 19 48562268 T A N N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 19 48562334 G C N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.75 0.0833333333333333 0.166666666666667 19 5 9 1 2 19 48562433 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 48562642 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 19 48562880 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 48563126 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 48563213 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 48563260 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 48563312 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 48563541 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 48563584 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 48563782 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 48564035 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 48564050 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 48564060 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 48564095 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 48564096 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 48564402 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 48564716 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 48564717 G T Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 48564976 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48565097 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 48565102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48565204 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 48565487 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48565725 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 48566439 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48567183 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 48567217 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 48567223 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 48567653 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 48567742 G T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 48567783 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 48567927 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 48568021 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 19 48568030 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 48568349 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 48568785 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 48568867 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 48571227 A T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 19 48571320 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 19 48571372 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 19 48571374 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 19 48571946 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 48571949 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 48572028 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48572060 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 48572102 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 48572160 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 48572178 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 48572385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48572453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48572715 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48572885 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48573183 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48573194 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48573354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48573359 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48573460 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48573493 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48573600 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48573645 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48573646 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48573737 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48573756 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48573759 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48573765 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48573792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48573800 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48573807 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 48573821 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 48573871 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48573882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48573953 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 48573954 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 48573957 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48573966 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48573981 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48573996 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48574024 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48574063 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48574196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48574250 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 48574634 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48575710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48575744 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48575765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48575799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48575880 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48575883 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48575887 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48575939 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48575959 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 48575970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48576007 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48576008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48576022 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 48576047 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48576053 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48576071 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48576072 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 48576100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48576107 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48576149 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48576169 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48576180 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48576191 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48576243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48576278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48576281 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48576288 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48576314 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48576366 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 48576406 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48576776 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 48576779 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 48576831 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 48576888 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48576900 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48576927 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48576979 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48577105 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 48577112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48577180 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48577217 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48577304 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 48577306 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48577375 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48577394 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48577398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48577403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48577442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48577807 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 48578000 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 48578034 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 48578118 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 48578180 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 48578185 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 48578529 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48578646 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48578956 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 48578987 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 48579257 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 48579299 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 48579364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48579478 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48580136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48580201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48580356 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 48580436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48580478 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 48580640 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 48580649 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48580654 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48580655 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48580659 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48580685 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 48580802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48580804 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 48580827 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48580856 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48581004 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48581176 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 48581182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48581187 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48581196 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48581218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48581240 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48581320 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48581390 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48581404 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48581566 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48581572 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48581692 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 48581694 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 48581697 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 48581711 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 48581736 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 48581860 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 48582002 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 48582017 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 48582026 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 48582127 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 48582452 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48582523 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48582755 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 48582811 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 48582830 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 48582833 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 48582856 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 48582894 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 48582993 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 48583051 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 48583249 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 48583279 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 48583599 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 48583710 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 48583795 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 48583876 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 48583896 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 48583932 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 48584180 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 48584202 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 48584220 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 48584243 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 48584256 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 48584465 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 48584468 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 48584480 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 48585764 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48586234 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 48586287 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 48588089 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 48588424 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 48588504 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 48588575 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 48588741 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 48588757 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48588797 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48588983 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 48589003 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 48589016 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 48589207 G A N Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 19 48589603 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48589648 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48589675 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48589743 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 48589755 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48589789 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 48589829 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 48589895 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 48589901 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48589988 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 48589990 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 48590397 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48590462 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 48590465 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 48590477 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 48590502 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 48590527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48590613 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 48590709 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 48590710 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 48590745 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 48590777 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 48590785 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 48590888 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 48591059 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 48591068 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48591081 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48591096 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48591118 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48591127 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48591131 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48591658 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 48591706 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48591754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48592201 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48592233 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 48592272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48592277 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 48592639 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48593321 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48593365 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 48593466 T C N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.636363636363636 0.181818181818182 0.181818181818182 16 6 7 2 2 19 48593731 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 48593746 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 19 48593748 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 19 48593769 A T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 19 48593829 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 48593961 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 48593986 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 48594081 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 48594097 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48594199 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48594374 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 48594457 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48594559 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48594617 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48594641 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48594925 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 48594999 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48595013 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48595047 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48595111 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48595123 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48595201 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48595243 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48595290 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48595381 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48595396 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48595406 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48595497 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 48595538 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48595603 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48595635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48595699 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48595759 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48595765 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 48595810 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48595811 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48595814 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48596351 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 48596386 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48596561 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48596597 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 48596621 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 48596735 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 48596759 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 48596805 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 48596811 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 48596863 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48597100 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48597195 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 48597287 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 48597334 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 48597468 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 48597577 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48597810 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48597864 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 48598599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48599294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48599511 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 48599992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48600210 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48602103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48602489 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 48602967 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48603279 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 48603298 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 48604270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48604661 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 48604683 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 48604770 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 48604860 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 48608988 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 48610528 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 48612934 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 48613950 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 48614027 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 48615545 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48615676 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 48615747 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 19 48615933 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 48616780 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 48616872 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 48616877 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 48616979 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 48617000 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 48617016 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 48617017 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 48617055 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 48617076 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 48617118 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 48617191 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 48617204 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 48617205 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 48617222 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 48617239 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 48617275 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 48617283 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 48617286 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 48617599 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 48617621 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 48617767 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 48618255 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 19 48619089 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 48620185 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 48621057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48621064 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48621202 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 48621241 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 48621323 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 48621494 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 48621598 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48621653 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 48621710 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48621919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48622032 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48622077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48622523 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 48622605 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 48622937 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48622967 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 48623243 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48623262 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 48623384 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 48623395 A T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 48623416 A G N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 19 48623431 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 48623450 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 48623528 T C Y Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 19 48623547 A G N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 19 48623710 A C N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 19 48623779 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 48623860 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48623862 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 48623896 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 48623898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48623989 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48624230 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 48624764 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 48624776 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 48625039 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48625081 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48625173 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 48626063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48626072 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 48626176 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 48626975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48627824 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 48627996 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 48628009 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 48628168 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 48628216 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 19 48628218 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 19 48628237 C A N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.357142857142857 0.214285714285714 0.428571428571429 13 15 5 3 6 19 48628299 G A N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 19 48628412 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 19 48628437 G T N N 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 9 11 2 5 3 19 48628579 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 48628608 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 48628614 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 48628772 A T Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 48628912 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48629050 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 48629069 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48629112 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 48629415 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48629462 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 48629512 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48629561 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48629796 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 48629807 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48629935 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48629950 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 48629956 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 48630034 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48630056 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48630101 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48630150 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 48630201 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 48631010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48631081 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 48631355 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48631938 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48632067 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48632600 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48633926 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 48634204 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48635488 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 48635693 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 48635702 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 48635728 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 48635909 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 48635920 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 48636210 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 48636232 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 48636381 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 19 48636838 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 48636862 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48636902 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 48636969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48637276 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 48637312 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48637359 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48637774 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 48637794 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 48637819 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 48637900 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48638005 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48638069 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 48638105 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48638109 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48638146 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48638257 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48638370 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48638431 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48638485 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 48638632 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 48639010 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48639276 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 48639737 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48640094 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48642303 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48642351 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48642466 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 48642639 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 48642839 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 48642886 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 48643239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48643292 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48643345 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48643357 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 48643802 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48644089 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 48644199 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 19 48644216 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 48644557 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 19 48644844 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 48644845 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 48645176 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48645334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48645660 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 48645671 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 48645676 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 48645757 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 48645904 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 48645929 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48646037 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 48646134 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 48646168 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48646184 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48646192 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 48646213 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 48646367 A G N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 19 48646579 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 48646691 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 48646692 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 48646718 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48646963 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 48647081 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 48647095 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 48647098 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 48647226 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48647259 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48647298 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 48647361 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48647429 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 48647464 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48647490 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 48647572 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48647719 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48647878 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48648018 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 48648047 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48648158 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 48648257 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 48648310 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 48648341 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 48648352 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 48648421 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 48648551 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 48648594 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48648706 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 19 48648716 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 48648718 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 48648725 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 48648756 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 19 48648827 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 19 48648841 C A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 19 48648890 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 48649001 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 48649026 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 48649259 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48649428 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48652623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48652631 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 48652859 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 48652993 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 48653110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48653300 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48653576 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 48653636 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48653729 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 48653991 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48654800 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 48654909 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48655031 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48655214 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48655253 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48655265 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48655328 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48655382 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48655399 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48655416 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 48655509 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48655510 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48655568 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48655584 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 48655606 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48655699 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 48655784 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48655805 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 48655841 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 48655884 C G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 48655885 T G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 48655907 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 48655959 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 48656025 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 19 48656299 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48656339 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48656507 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48656525 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 48656574 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 48656591 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 48656914 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 48656934 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48657028 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48657165 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 48657183 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 48657371 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48657654 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 48657695 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 48657852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48659252 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 48659903 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 48660064 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 48660129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48660178 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 48660353 A T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48660357 T G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48660489 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 48660602 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48660667 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 19 48660737 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 48660764 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 48660809 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 48660854 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.210526315789474 29 9 14 1 4 19 48660943 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 48660955 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 48660983 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 48661024 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 48661173 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 48661490 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 48661533 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 48661578 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 48662200 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48662399 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48662467 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48662575 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48662612 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48662658 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48662710 C G Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 48662725 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48662758 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48662943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48663022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48663162 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 48663688 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 48663710 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48663740 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 48663777 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 48663779 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 48663854 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 48663980 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48663993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48664293 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48664800 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 48664834 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48664836 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48664921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48665034 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 48666101 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 48667493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48669402 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 48669403 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48669487 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 48669774 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48669934 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 48670338 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 48670461 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 48670598 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48670636 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 48670803 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 48670913 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48670937 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 48670990 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 48671059 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48671265 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48671366 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 48671383 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 48671548 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48671648 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 48671659 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 48671692 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 48671744 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48671838 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 48671912 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 48671968 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 48672004 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 48672124 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 48672247 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48672410 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 48672445 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48672583 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48672675 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 48672678 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 48672913 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 48672938 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 48672941 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48672960 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 48673008 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 48673121 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48673160 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48673225 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 48673339 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 48673409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48673459 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 48673461 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 48673658 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48673771 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48674225 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48674580 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48674671 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 48674686 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 48674768 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 48675016 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 48675214 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 48675292 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 48675302 C T Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 19 48675347 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 48675391 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 48675419 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 48675919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48676064 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 48676270 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 48676294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48676335 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48676518 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48676519 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 48676629 T C Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 19 48676824 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48676825 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48677036 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 48677087 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48677417 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 48677960 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48678645 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48678799 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48678819 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48678840 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48678859 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 48678934 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 48678966 C A Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 19 48679002 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48679068 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 48679648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48680042 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48680404 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 48680491 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48680524 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48680601 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 48680686 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 19 48681016 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48681774 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 48681948 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48682129 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 48682603 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 48682630 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 48682813 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 48683243 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48683849 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48683995 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48684139 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 48684226 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 48684251 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48684338 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 48684380 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48684469 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48684758 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48684764 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48684765 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48685128 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48685256 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 48685405 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 19 48685501 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 48686999 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 19 48687102 C G N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.384615384615385 0.230769230769231 0.384615384615385 13 13 5 3 5 19 48687353 T A N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 19 48687609 G A Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 19 48687660 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 19 48687708 G A Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 19 48688594 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 19 48688655 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 48689335 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 48689447 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48689839 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48690430 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48690696 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48690996 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48691082 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 48691276 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 48691277 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 48691351 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 48691433 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 48691744 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48691769 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 48691813 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48691940 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 48692115 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 48692227 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 48692248 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 48692412 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 48692432 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 48692491 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 48692654 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 48692889 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 48693220 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 48695333 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 48695569 A C Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 48695677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48697472 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48698124 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 48698760 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48698807 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 48698900 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 48699556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48699592 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 48699598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48699601 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 48701568 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48701643 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48701696 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 48701855 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48702731 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 48702757 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 48702774 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 48702942 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 48703100 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 48703105 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 48703369 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48703441 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 48703853 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 48705774 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 48705981 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 48706031 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 48706103 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 48706225 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 48706489 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 8 10 3 2 4 19 48706757 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 48706910 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 48706987 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 48706989 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 48707028 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 48707030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48707089 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 48707363 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 48707486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48707550 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 48707668 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 48707678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48707695 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 48707811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48707828 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 48707872 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 48707903 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 48707924 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 48707961 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 48707979 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48708014 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 48708059 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48708170 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48708242 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48708574 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48708598 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 48708646 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 48708865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48709028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48709039 G C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 48709359 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48709498 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48709569 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48709863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48710626 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 48710974 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 48711887 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48712048 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 48712801 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 48713131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48713889 C A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 48714153 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 48715091 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 48715443 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 48715550 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48715964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48716613 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48716765 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48718177 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 48718350 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 48718721 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48718809 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 48718900 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 48719431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48719584 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48719693 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 48719952 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 48720479 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 48720725 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48720727 C G N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.25 0 0.75 8 24 4 0 12 19 48720743 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 19 48720765 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 48720773 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 48720807 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 19 48720834 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.222222222222222 0.0555555555555556 0.722222222222222 9 27 4 1 13 19 48720884 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.1875 0.0625 0.75 7 25 3 1 12 19 48720912 T C N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.230769230769231 0 0.769230769230769 6 20 3 0 10 19 48720919 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 48720937 G A Y Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 19 48720946 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 19 48721176 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 19 48721322 A G Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 48721344 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 48721356 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 48721370 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48721397 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 48721512 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48721525 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48721558 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 6 30 3 0 15 19 48721675 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 48721731 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 48721747 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 48721895 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48721987 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.222222222222222 0 0.777777777777778 8 28 4 0 14 19 48722062 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 48722136 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48722458 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.210526315789474 0 0.789473684210526 8 30 4 0 15 19 48722493 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 48722523 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48722527 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48722532 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48722534 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 48723035 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 48723164 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48723327 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 48723746 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48724013 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48724081 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48724565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48724705 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 48724847 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 48724876 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48724947 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 48724969 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 48724970 G T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 10 22 4 2 10 19 48724994 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 48725068 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48725085 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 48725147 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 48725177 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 19 48725183 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 19 48725732 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48725769 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48725904 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48726364 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 48726640 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 48727657 A T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 19 48727724 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 48727930 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 48727956 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 19 48727970 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 19 48728113 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 19 48728193 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 19 48728321 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 48728762 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 48728763 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 48730023 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 48730453 G T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 48730852 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 48730946 G T Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 19 48731011 T C Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 19 48731024 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 48731191 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 48731208 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 48731373 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 48731753 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 48731761 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 48731817 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 19 48732022 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48732093 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48732309 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48732475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48733621 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48733669 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 48733921 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 48734084 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48734553 T C Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 48734596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48734635 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48735119 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48735206 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 48735341 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 19 48735342 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 48735359 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 48735742 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 48735777 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 48736010 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 48736018 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 48736095 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48736102 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 48736215 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 48736307 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 48736356 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 19 48736361 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48737073 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 48737236 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48737544 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48737562 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 48737640 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 48737649 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 48737674 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48737813 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 48737814 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 48737854 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48737866 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 48737918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48739017 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 48739094 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48739099 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 48739100 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48739112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48739154 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48739674 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 48740308 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48740737 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 48740784 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48740811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48741000 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 48742449 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 48742751 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 48742829 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48742881 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48743003 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48743019 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48743149 G A Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 48743494 T G Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 48743545 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 19 48743555 A G Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 19 48743609 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 48743983 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 48744202 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48744205 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48744223 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 48744266 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48744283 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48744313 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48744325 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48744398 A G Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 48744415 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 48744423 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 48744462 T G Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 48744527 A G Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 48744586 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 48744594 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 48744666 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 48744673 G T Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 48744768 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48744920 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48744992 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 48745016 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 48745167 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 48745218 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48745315 A G Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 48745378 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 48745382 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 48746086 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 48746105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48746225 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48746392 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 48746755 T A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 48746774 A T Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 48746789 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48746794 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 48746812 A C Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 48746869 T C Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 48748382 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 48748726 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48748731 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48748746 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 48748848 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48749047 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48749235 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 48749546 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 48749621 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 19 48749646 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 48749721 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 48750379 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48750739 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 48750874 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 48750882 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48750905 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48750992 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48750993 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.210526315789474 30 8 15 0 4 19 48751155 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 48751161 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 48751316 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48751320 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 19 48751338 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 48751462 A C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 48751467 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48751529 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 48751623 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 48751850 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 19 48751858 A C Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 19 48751876 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 48752132 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48752808 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 48752844 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 19 48752856 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 48753034 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 30 6 15 0 3 19 48753165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48753258 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48753292 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48753326 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48753366 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 48753385 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 48753521 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48753577 G A Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 48753582 G T Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 48753603 C G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 48753773 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 48753943 C G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 48753964 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 48754016 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48754040 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48754082 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 48754138 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48754166 T G Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48754182 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48754479 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48754536 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 48754551 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 48754552 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 48754581 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 48754617 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 19 48754683 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 48754699 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 48754723 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48754735 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 48754757 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 48755077 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48755113 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 48755132 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48755218 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48755646 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 48755666 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 48756467 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 48756568 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48756631 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 48756669 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48756735 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 48756741 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 48756906 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48756951 G C Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48757432 T G Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 48757908 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48758303 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48758443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48758481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48758776 T G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 48758864 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 48758872 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 48758983 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 48759163 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 48759205 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 48759278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48759621 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 48759752 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 48759788 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 48760103 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 48760160 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 19 48760189 G T Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 19 48760205 A G Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 19 48760227 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.210526315789474 0 0.789473684210526 8 30 4 0 15 19 48760233 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.210526315789474 0 0.789473684210526 8 30 4 0 15 19 48760515 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48760598 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 48760707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48761372 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48761386 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 6 30 3 0 15 19 48761906 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 26 14 12 2 6 19 48762028 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 48762067 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 48762231 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 48762253 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 48762262 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 48762310 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48762407 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 48762950 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 48762993 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 19 48763017 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 48763215 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 48763413 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 48763437 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48763443 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48763472 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48763490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48763517 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48763583 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48763650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48763749 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48763823 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 48763842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48763844 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48763877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48763919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48764063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48764208 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48764242 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48764391 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48764544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48765175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48765516 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 48766030 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 48768712 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 48768890 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 48769637 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48769661 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48769810 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48770200 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 48770492 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 48770727 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 48770843 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 48771176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48771315 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48772912 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 48775706 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48776184 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48776605 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 48776849 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48777970 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48778040 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48778803 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48778926 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48778943 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48779036 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48779056 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48779081 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48779208 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 48779274 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48779343 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48779397 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 48779399 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 48779488 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 48779647 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 48779908 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 48780073 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 48780109 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 48780258 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 48780338 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 48780566 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 48780706 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 48780830 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 48780982 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 48780985 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 48781127 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 48781225 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48781936 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48781939 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48781963 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48781986 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 48781993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48782051 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 48782082 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48782288 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48782301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48782319 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 48782504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48782609 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48782684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48782718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48782730 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48782734 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48782741 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48782753 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48782778 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 48782813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48782870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48782905 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 48783114 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 48783181 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48783191 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 48783227 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 48783278 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 48783359 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 48783368 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 48783409 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 48783457 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48783545 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 48783649 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 48783663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48783691 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 48783778 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 48783834 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 48783871 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 48783952 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48783993 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48784648 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48784651 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 48784660 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48784681 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48784721 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 48784775 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 48784827 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 19 48785014 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 48785015 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48785223 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 48785611 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 48785619 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 48785627 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 48785639 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 48785792 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 19 48785976 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48786098 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48786110 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48786125 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48786151 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48786152 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48786188 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48786258 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48786296 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48786391 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48786406 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48786474 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 48786508 G T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 48786633 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48786654 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48786658 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 48786717 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 48786830 C G N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 19 48786840 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 48786949 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 48787076 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 19 48787116 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 48787154 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48787158 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48787211 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48787278 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48787295 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48787317 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48787325 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48787368 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 48787389 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48787397 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 48787408 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48787415 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 48787466 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 48787503 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 48787522 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 48787524 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 19 48787563 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48787564 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48787580 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 48787595 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48787791 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48788089 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48788102 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48788223 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 48788224 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 48788352 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 48788666 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48789171 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48789939 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 19 48790861 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48790892 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 48791227 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 48791889 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 48792021 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48792038 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48792041 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48792303 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 48792359 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48792424 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48792853 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48792872 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48792922 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 48793078 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48793116 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48793154 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48793170 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48793179 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48793201 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48793296 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 48793370 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48793670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48794027 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48794136 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48794651 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 19 48794660 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 19 48794682 T G N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 19 48794696 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 48794707 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 48795138 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 48795182 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 48795324 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 48795648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48795675 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 48795687 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 48795708 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48795967 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 48796033 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 48796113 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48796130 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48796224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48796263 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 48796434 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48796545 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48796655 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 48796735 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 48796905 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48796906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48796909 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48797010 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48797087 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 48797518 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 48797715 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 48797816 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 48797858 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48797964 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 48797990 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48798340 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 48798364 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 48798484 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 48798739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48798767 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48798952 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48799003 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48799547 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48800616 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 48800892 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48800955 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48801505 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 48801507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48801539 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48801682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48802327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48802349 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48802478 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 48802521 G C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 48802681 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 19 48802696 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 19 48802708 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 19 48802784 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48803164 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 48803188 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 48803209 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 48803225 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48803239 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 48803248 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 48803482 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 48803585 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48803725 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48803750 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48803911 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 48803954 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 48803955 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 48804225 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 48804243 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 48804361 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 48804410 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 19 48804527 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 48804551 G T Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 48804730 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48804784 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 48804789 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 48804825 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 48804829 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 48804941 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 48805001 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 48805110 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 48805129 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 48805243 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48805276 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48805330 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48805544 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 48805558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48805687 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 48806032 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 19 48806076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48806138 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 48806492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48806512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48806553 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 48806556 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 48806815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48806867 C G Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 48806896 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48806897 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48806954 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 48807072 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48807077 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48807079 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48807098 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 48807154 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48807214 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48807234 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 48807263 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48807337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48807461 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 48807577 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 48807734 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48807745 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 48807788 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 48807981 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48808012 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48808104 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 48808255 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 48808361 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 48808446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48808543 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 48808767 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 48808773 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 48808788 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 48808981 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 48809019 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 48809088 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 48809102 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 48809189 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 48809217 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 48809341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48809523 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 48809599 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 48811340 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 48811870 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48813138 G A Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 19 48813976 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 48814575 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48814796 A C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 19 48815321 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48815525 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48816992 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48817689 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48817878 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 48822024 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 48822031 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 48822119 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 48822233 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 48822342 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 48822641 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 48822915 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 48823076 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48823117 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48823121 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48823129 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48823298 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 48823400 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48823505 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 48823526 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 48823567 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 48823632 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48823634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48823660 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 48823715 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48824453 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 48825503 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 48826867 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48827801 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 48827877 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 48829134 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 48829179 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 48829455 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 48829524 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48829651 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48829790 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48829867 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 48829904 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48829927 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48829934 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 48829964 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48830146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48830350 C A N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 19 48830537 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 48831436 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 48831855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48832022 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48832435 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 48832450 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 48832515 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 48833452 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48834173 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48834768 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 48835575 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48835774 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 48835804 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 48835854 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 48835871 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 48835927 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 48836934 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48837217 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 48837304 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 48837332 T A Y N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 19 48837612 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48837623 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 48837749 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 48837829 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 48838088 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.166666666666667 0.25 16 8 7 2 3 19 48838098 A G N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 14 6 6 2 2 19 48838169 T C N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 19 48838245 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 48838374 A G N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 19 48838386 G A N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 19 48838675 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 48838728 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 48838750 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 48838992 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48839005 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48839023 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48839072 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48839141 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 48839207 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48839247 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 48839560 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 48839598 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48840147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48840347 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48840397 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48840471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48840970 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 48840985 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 48841561 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 48841687 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 48841731 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 48842271 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48842910 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48843042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48843845 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 48844138 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48844610 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48845211 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48845662 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 48845771 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48845934 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48846159 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48846510 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48846937 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 48848221 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48848448 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48848547 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48849007 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48849125 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48849134 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48849147 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 48849205 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48849213 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48849521 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 19 48849620 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 48849629 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 48849632 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48850342 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 48851124 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 48851379 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48851962 T A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 48852141 C G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 48852416 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 48852456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48852672 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48852873 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48852881 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 48853654 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48853683 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 48854325 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48854409 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48854425 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 48854454 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 48854520 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 48854591 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 48854669 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48854808 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48854935 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 48855076 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 48855153 T G Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 48855162 C T Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 48855358 A C Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48855490 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48855566 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48855771 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48855873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48855951 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48856042 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48856052 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48856078 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48856174 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48856204 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48856290 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 48856369 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 48856402 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 48856406 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 48856475 T G Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48856548 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 48856555 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 48856901 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48856951 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48857043 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48857203 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48858681 A C N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 48858944 C T Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 48859027 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48859112 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48859228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48859231 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48859677 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48859684 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48859685 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 48859909 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48859919 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48860174 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 48860203 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 48860219 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 48860241 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48860847 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48860921 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48861496 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48861578 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48861791 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48861855 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48861864 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48861867 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48861898 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48862003 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48862023 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48862085 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48862130 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 48862288 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48862521 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48862752 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 48863426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48863686 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48864162 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48864302 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48864341 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48864433 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 48864506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48864512 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 48864514 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 48864894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48864907 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 48865017 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 48865422 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48865513 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 48865571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48865642 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48865696 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 48865712 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 48865756 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 48865877 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 48866127 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48866182 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 48866368 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48866372 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 48866375 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 48866379 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 48866405 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48866411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48866441 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48866561 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48866786 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 48866898 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 48866931 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 48866961 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 48866962 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48866990 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 48867031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48867085 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48867103 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48867277 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48867283 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48867330 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 48867414 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 48867561 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 48867597 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 48867774 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48867871 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48868387 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 48868907 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48868939 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 48868949 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48868991 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48868998 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48869020 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48869030 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48869046 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 48869111 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 48869132 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48869207 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48869214 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48869240 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48869930 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48871633 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48872572 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 48873361 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48874840 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48875500 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48876304 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48876496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48877881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48877927 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48878922 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48879250 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48879824 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 48880243 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48880909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48880950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48881121 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48881198 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 48881534 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 48883918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48883973 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48884406 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48885348 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48885526 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48885940 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48886010 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 48886501 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48886844 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48887290 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48887706 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48887718 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48887764 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48887949 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48889582 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 48890108 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 48890550 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48891066 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48891774 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 48891850 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 48891910 A G N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 8 12 3 2 5 19 48894123 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48894172 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48894332 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48894507 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48894511 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48894583 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48894818 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48894853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48895168 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48895530 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48895573 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48895660 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48895664 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48895821 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48895945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48895991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48896021 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48896031 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48896034 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48896117 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48896472 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 48896605 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 48896672 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 48896758 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 48896842 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 48896978 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 19 48897137 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 48897325 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 48897440 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48897553 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 48897719 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 48898353 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 48898355 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48898746 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48898879 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48899058 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48899408 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 48899496 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 48899827 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 48899996 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48899998 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48900064 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 48900121 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48900228 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 48900250 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 48900283 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 48900285 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 48900291 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48900310 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48900318 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 48900323 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48900327 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48900385 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 48900436 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 48900470 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48900482 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 19 48900716 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48900739 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 48900750 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 48900831 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 48900846 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 48901050 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48901068 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48901115 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48901421 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 48901434 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 48901504 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 19 48901575 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 19 48901614 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 48901695 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 48901697 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 48901769 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 48901880 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 48901934 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 48902073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48902178 G T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 19 48902196 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 48902228 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 48902238 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 48902251 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 48902298 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48902300 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48902304 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 48902331 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 48902388 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 48902394 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 48902427 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 48902529 C G Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 48902742 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48902776 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 48902851 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 48902907 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 48902929 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 48903052 G T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 48903210 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 19 48903353 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 48903365 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48903579 G A Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 48903624 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 48903773 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 48903775 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 48903779 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 48903854 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 48903909 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 48904004 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 48904015 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 48904018 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 48904095 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 48904111 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 48904116 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 48904128 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 48904143 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48904158 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 48904165 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 48904170 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 48904189 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48904267 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48904479 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 48904663 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48904703 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48904801 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 48904829 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 48904957 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 48905014 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 48905019 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 48905090 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 48905149 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48905335 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 48905479 T C N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 19 48905525 A T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 48905619 A T N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 19 48905747 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 48905773 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 48906066 A G Y Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 19 48906110 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 48906149 C A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 48906377 A T N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 48906520 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 48906562 A G N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 19 48906583 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 19 48906732 C T N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 19 48906791 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48906845 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48906881 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48906911 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 48906918 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48906939 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48907185 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 48908244 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 48908294 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48908309 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48908336 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 48908792 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48909033 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48909290 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 48909577 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 48909725 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48909969 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48909984 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 48910296 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48910981 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 48911478 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 48912040 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 19 48912047 G A Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 19 48912089 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 48912205 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 48912218 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 48912347 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 48912409 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 48912427 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 48912442 C G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 48912486 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 48912505 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 48912539 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 48912694 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 19 48912728 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48912906 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 48912946 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48913070 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 19 48913521 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 48913575 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48913633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48914344 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48914362 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 48914373 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 48914457 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 48914638 G T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 48914921 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 48914963 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 48915007 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 48915124 G A Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 48915161 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 19 48915181 A T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 19 48915192 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 48915218 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 48915299 A C Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 48915364 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48915378 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48915854 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48916138 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 48916354 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 48916360 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 48916658 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48916780 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 48916796 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 48916837 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 48917051 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 48917123 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 48917129 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 48917148 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 48917434 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 48917518 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48917524 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 48917556 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48917620 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 48918078 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 48918109 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 48918116 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 48918159 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 48918175 C A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 48918189 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48918245 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48918310 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 48918403 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 48918419 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 48918442 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 48918454 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 48918457 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 48918470 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48918489 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48918569 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 48918617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48918850 C A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 48918968 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48918991 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48919044 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 48919062 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 48919082 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 48919086 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 48919098 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 48919107 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 48919138 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48919150 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48919191 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 48919195 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 48919219 C A Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 48919271 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 48919283 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 48919315 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 48919346 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 48919364 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 48919366 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 48919415 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 48919555 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 48919564 A G Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 48919680 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 48919704 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 48919784 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48919833 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48919878 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 48919890 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 48919948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48919980 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 48920049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48920257 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 48920641 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 48920816 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48920826 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 48920888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48921138 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48921304 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48921373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48921387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48921500 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48921645 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 48921646 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48921681 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 48921706 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 48921823 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48921948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48921962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48922118 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48922183 C G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 48922192 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 48922195 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 48922239 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 48922321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48922485 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48922488 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48922625 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48922882 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48922925 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48922930 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 48923078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48923133 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 48923252 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48923285 T C Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 48923579 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48923590 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48923789 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48923819 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48923820 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48923845 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48923862 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48924071 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48924112 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48924123 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48924142 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 48924207 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 48925027 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48925094 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48925177 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48925299 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48925361 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48925401 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48925402 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48925520 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48925521 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48925696 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48925808 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 48925823 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 48926112 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48926113 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48926146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48926319 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 48926490 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48926496 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 48926516 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48926584 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48926614 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 48927045 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 48927091 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 48927261 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 48927666 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48927755 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48927996 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48928780 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 48928947 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 48929019 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 48929057 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 19 48929577 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.6 0.133333333333333 0.266666666666667 20 10 9 2 4 19 48929582 A T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 48929869 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 19 48929874 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 19 48930270 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 48930341 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 19 48930354 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48931022 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48931027 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 48931145 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 19 48931685 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 48931730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48932253 G T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 48932466 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48932645 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 48932850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48932892 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 48933499 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48933644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48933760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48933828 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48934656 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48935010 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 48935898 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 48935937 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48936134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48936333 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 48937107 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 48937253 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 48937262 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 48937405 G C Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 48937418 T G Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 48937440 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 48937516 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48938993 C G Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 48939357 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48939398 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48939486 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48939554 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48939890 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 48940073 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 48940155 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48940197 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48940490 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48940514 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48940590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48941710 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 48941774 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48942556 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 48942606 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 48943083 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48943165 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48943755 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 48943782 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 48943848 T C Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 19 48943895 C T Y Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.636363636363636 0.181818181818182 0.181818181818182 16 6 7 2 2 19 48943912 T C Y Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 19 48944282 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 48944393 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 48944428 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48944491 T A Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 48944742 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 48945340 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48945341 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48945396 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 48945626 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 48945694 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 48946292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48947041 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 48947193 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48947299 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48947773 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 48948694 A G Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 48948947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48949097 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48949135 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 48949471 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 48949718 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48950332 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 48950361 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 48950398 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 48950406 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 48950451 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 48950475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48950667 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48950675 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 48950909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48951169 G C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 48951193 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 48951303 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48952231 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 48952251 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 48954427 T G Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 48954428 G C Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 48955318 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48956153 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 48956215 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 48956243 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 48956250 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 48956316 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 48956328 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 48956409 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 48956411 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 48956416 T A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 19 48956437 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 48956491 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 48956507 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 48956678 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 48956711 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 48956762 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 48956766 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 48956774 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 48956873 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 48956914 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 48956941 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 48956944 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 48956966 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 48957025 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 48957054 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48957138 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 48957424 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 48957428 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 48957501 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 48957527 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 48957533 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 48957546 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 48957565 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 48958174 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48958231 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 48958247 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 48958298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48958300 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48958372 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48958384 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48958539 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48958567 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48958802 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 48958844 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48959488 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48960006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48960072 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 19 48960119 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 19 48960919 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 19 48960962 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48961138 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 48961160 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 48961173 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 48961184 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 48961225 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 48961533 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.470588235294118 0.117647058823529 0.411764705882353 18 16 8 2 7 19 48961713 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 19 48961738 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 19 48961749 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 19 48961892 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 19 48962564 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48962696 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48962737 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 19 48963597 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48963966 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48964522 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48965159 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48965258 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 48965822 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48966473 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 48966749 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 48966992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48967044 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48967255 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48967267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48967488 A C Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 19 48967655 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48967714 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 48967730 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 48968049 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 19 48968308 T A N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 19 48968358 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 48968614 C G Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 48968826 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 48969108 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48969158 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 48969162 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48969247 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48969309 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 48969583 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48969599 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48969736 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48969875 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 48969926 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48970169 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 48970180 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48970231 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 48970258 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 48970327 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48970431 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48970440 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 48970832 A T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 48970848 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 48971002 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 48971074 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 48971091 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 48971516 T G N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 19 48971544 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48971593 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 48971897 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 48972362 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48972883 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 48972981 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 48972998 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 48973119 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 48973136 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 48973148 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 48973304 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 48973315 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 48973331 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 48973350 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 48973362 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 48973408 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 48973538 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 48973582 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 48973876 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 48973895 G T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 48973918 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.333333333333333 0.2 0.466666666666667 13 17 5 3 7 19 48973995 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 48974290 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48974317 C G N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 19 48974468 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 19 48974535 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 19 48974668 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 48974682 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 48974772 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 19 48974798 T C N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 19 48974814 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 19 48974833 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 48974850 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 48974853 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 48974877 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 48974910 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 19 48975038 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 48975437 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48975528 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 48975560 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 48975562 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 48975584 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48975585 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48975625 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48975772 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 48975785 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 48975814 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 48975825 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 48975864 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 48975900 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 48976131 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 48976145 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48976278 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48976333 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 19 48976424 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 48976479 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48976483 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48976530 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 48976558 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48976587 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 48976597 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 48976611 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 48976663 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 48976684 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 48976707 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 48976776 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 48977637 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 48977651 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 48977666 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 48977726 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48977868 G T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 48977887 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 48977979 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 48978027 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 48978093 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48978227 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 48978235 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 48978286 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 48978448 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 19 48978543 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 48978572 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 0.117647058823529 0.352941176470588 20 14 9 2 6 19 48978889 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48978891 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48978933 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 48978940 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 19 48978946 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 48978982 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 48978993 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48979175 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 48979193 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 48979209 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48979216 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 48979231 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 48979234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48979305 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 48979329 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 48979605 T G Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 48979663 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 48979667 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 48979704 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 48979724 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 48979754 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 48979755 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 48979786 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 48979867 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 48980042 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 48980046 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 48980156 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 48980188 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 48980210 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48980214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48980240 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 48980241 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48980268 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 48980353 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 48980355 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 48980358 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 48980439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48980456 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 48980840 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 48981099 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 48981180 G C Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 48981284 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 48981305 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 19 48981351 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 48981382 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 19 48981417 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 19 48981427 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 19 48981505 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 19 48981776 C G Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.4375 0.1875 0.375 17 15 7 3 6 19 48982707 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 48982794 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 19 48982821 C G Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 19 48982904 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48983093 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 19 48983615 T G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 48983719 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 48983830 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 48984043 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48984142 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 48984191 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 48984335 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48984375 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 48984577 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 48984582 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 48984667 A C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 48984749 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 19 48984858 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 48984861 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 48984952 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 48984953 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 48984963 T G Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 48984998 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 48985079 A C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 48985116 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 48985167 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 48985352 T A Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 48985404 G A Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 19 48985927 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48986001 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 48986088 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 48986249 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 48986400 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48986462 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48986465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48986835 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 48986899 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48986987 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 48987053 A T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 19 48987725 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 48988491 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 48988512 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 48988532 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 48988691 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 48989022 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 48989043 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48989187 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 48989349 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 48989509 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 48989510 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 48989613 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 48989870 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48989888 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 19 48990001 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 19 48990067 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 48990109 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 48990148 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 48990218 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 19 48990311 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 48990334 T C N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.428571428571429 0.142857142857143 0.428571428571429 14 14 6 2 6 19 48990440 G A N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 19 48990730 T C N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.454545454545455 0.181818181818182 0.363636363636364 12 10 5 2 4 19 48990748 T C N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.230769230769231 0.153846153846154 0.615384615384615 8 18 3 2 8 19 48990957 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 48991631 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48991764 C T N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 19 48991895 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 48991948 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 48991961 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 48992100 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 19 48992130 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 19 48992390 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 48992403 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 48992474 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 48992699 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 48992760 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 19 48992828 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 48992832 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 48992836 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 48992849 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 48992881 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 48992924 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 48992934 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 48992967 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 48993016 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 48993109 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 48993832 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 48994043 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 48994225 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 48994258 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 48994273 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 48994336 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 48994514 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 48994557 A C N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 19 48994558 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 48994562 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 48994744 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 48994932 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 48995203 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 48995675 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48995752 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 48995757 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 48995895 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 48995920 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 48996624 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 48996750 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 48996837 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 48996970 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 48997020 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 48997047 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 48997052 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 48997089 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 48997251 A G N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 19 48997763 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 48997810 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 48997889 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 48997956 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 48998029 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 48998058 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 48998396 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48998466 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48998504 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 48998620 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48998633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 48998754 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 48998803 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 48998901 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 48998997 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 48999142 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 48999171 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 48999195 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 48999289 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 48999300 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 48999405 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 48999516 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 48999650 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 48999664 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 48999697 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 48999744 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 48999748 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 48999791 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 48999830 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 48999836 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 48999884 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 49000032 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49000139 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49000661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49000947 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 49000963 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49001032 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 49001037 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 49001074 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49001112 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 49001142 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 49001234 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 49001235 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 49001308 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49001554 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 49001558 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 49001701 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 49001813 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 49001847 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 49001859 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 49002107 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 49002236 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 49002280 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 49002296 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 49002309 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 49002692 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49002713 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49002973 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49003073 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 49003076 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 49003244 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49003279 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49003283 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49003432 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 49003515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49003693 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 49003700 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 49003772 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49003971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49003997 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49004060 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 49004191 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 49004325 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 49004327 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 49004557 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 49004630 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 49004730 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 49004771 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 49004772 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 49004883 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 49005112 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 19 49005163 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 19 49005170 A C N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 19 49005246 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 49005481 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49005848 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 49005920 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 49005921 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49005963 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 49006000 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49006002 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 49006094 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 49006100 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 49006103 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 49006204 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 49006212 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 49006245 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49006342 T A N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 19 49006345 A G N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 19 49006593 A T N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 19 49006637 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 8 6 2 4 1 19 49006679 T C N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 19 49006809 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 19 49006815 C T N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 19 49013507 T A N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 19 49013528 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 49013686 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 49014235 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 49014326 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 49014327 A G N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 19 49014404 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 49014455 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 49014458 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 49014459 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 49014465 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 49014470 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 49014641 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 49014679 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 49014721 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 49014726 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 49014789 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 49014826 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 49014893 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 49014993 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 49014994 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 49015056 C G N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 19 49021035 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 49021038 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 49021057 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 49021074 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 49021128 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 49021178 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 49021197 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 49021335 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 49021377 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 49021409 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 49021426 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 49021548 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 49021584 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 49021587 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49021771 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 49021826 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 49021877 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 49021886 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49021996 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 49022079 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49022310 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49022771 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 49022834 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49022962 A G N Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 19 49023075 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 49023121 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 49023122 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 49023138 G A N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 19 49024403 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 49024425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49024472 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49024914 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49025538 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49025634 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 49025877 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 49027209 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49027725 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49030347 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49030624 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 49030652 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 49032161 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49032205 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 49032258 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49032317 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49033749 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 49034040 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 49034897 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 49035143 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 49035487 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49035911 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 49036240 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49036890 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49036988 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49037078 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49038309 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49038389 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49041817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49041875 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49042330 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49042393 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49042419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49042971 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 49043071 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49043374 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49043718 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 49044237 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 49044412 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 49044693 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49044730 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 49045222 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 49045312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49045442 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49045594 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49045805 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49045856 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 49045999 C A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 49046394 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 49046711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49046720 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49046925 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49047183 T A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49047191 C A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 49047200 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49047253 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49047269 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 49047891 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 49047922 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 49047931 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 49048148 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 49048247 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49048251 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 49048315 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49048352 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49048440 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49048589 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49048615 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49048633 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49048751 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 49048863 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 49048934 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49049105 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49049110 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49049194 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49049327 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 49049342 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 49049347 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 49049386 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 49049430 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 49049478 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 49049531 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49049564 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 49049703 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49049736 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49049738 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 49049764 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49049808 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49049834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49049845 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49049900 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 49050004 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49050026 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49050194 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 49050396 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49050544 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 49050661 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 49050972 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49051061 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49051264 C A Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 49051327 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49051373 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 49051411 C T Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 49051432 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49058044 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49058090 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 49058266 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49058286 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49058350 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49058374 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49058499 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49058531 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49058542 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 49058577 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49058600 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 49058609 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 49058638 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 49058659 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 49058666 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49058815 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49058924 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 49059012 C T Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 49059014 T C Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 49059058 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49059116 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49059146 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49059182 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49059196 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49059232 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49059492 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 49059496 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 49059628 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49059636 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49059691 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 49059698 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49059736 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 49059745 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 49059748 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 49059791 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49059978 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 49060817 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 49061776 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 49062039 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49062081 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49062088 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 49062095 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 49062833 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 49063143 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 49063363 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 49063633 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 49063839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49064081 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 49064203 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 49064251 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49064369 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 19 49064706 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 49064764 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 49065105 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 49065163 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49065179 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 49065257 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 49065261 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 49065315 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 49065459 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 49065572 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 49065702 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 49065755 C A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 19 49065756 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 49065832 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 49065954 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 49067715 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49067777 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 49068814 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 49069002 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 49069007 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 49069018 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 49069806 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 49069807 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 49069867 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 49069884 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 49070075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49070373 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 49071203 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 49071224 C T Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 49071247 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 49071305 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 49071842 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 49071846 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 49071931 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 49072063 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 49072178 T G N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 19 49072997 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 49073076 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 49073434 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 49073484 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49073620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49073635 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 49073674 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 49073770 T C Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 49073841 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 19 49073856 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49073910 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 49073943 A T Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 49073944 A G Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 49073971 G T Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 49074084 G T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 19 49074092 G A N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 19 49074410 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49074559 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 49074669 A T Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 49074791 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 49074818 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 49074916 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49075033 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49075036 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 49075067 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 49075200 C A Y N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 49075215 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49075329 G T Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 49075379 G T Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 19 49075399 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 19 49075524 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 49075545 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 49075844 T G Y N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 19 49075868 A G N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.384615384615385 0.230769230769231 0.384615384615385 13 13 5 3 5 19 49075962 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.333333333333333 0.2 0.466666666666667 13 17 5 3 7 19 49076055 T G N N 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 9 11 3 3 4 19 49076452 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 49076463 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 49076498 T C Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 19 49076533 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 49076604 C A Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 49076699 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 49076705 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 49076718 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 19 49076743 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 49076788 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 49076816 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 49076900 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 19 49076921 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 49076943 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 49077166 T C N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 19 49077225 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 19 49077342 A G Y Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 19 49077530 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 49077542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49078040 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 49078071 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49078074 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49078222 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49078285 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49078311 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 19 49078320 G A Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 49078366 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 49078533 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 49078579 T C Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 19 49078761 T C Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 19 49078830 C T Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 19 49078831 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 19 49079041 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 49079065 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 49079091 C A Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 49079101 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49079147 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 19 49079168 G C N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 19 49079296 G C N N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 19 49079546 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 19 49079656 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 49079666 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49079850 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 49079962 A G Y Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 19 49079975 T C Y Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 19 49080072 C G N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 19 49080098 G T N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 19 49080433 A G Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 49080533 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 49080636 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 49080683 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 49080887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49080928 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49081017 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 49081062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49081358 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49081445 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49081468 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 49081471 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49081529 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 49081536 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49081647 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49081687 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 49081948 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 49082083 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 19 49082165 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 49082528 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 19 49083041 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 49083147 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 49083154 T A Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 49083167 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 49083246 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 49083389 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 49083467 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49083663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49083738 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49083744 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49083757 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 49083758 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 49083766 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 49083890 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 49083908 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 49083922 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49083931 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 49084035 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 19 49084096 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 49084110 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 49084443 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 49084562 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 49085247 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49085388 G C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 49086053 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49086413 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 19 49086699 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49086840 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49087657 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 49087773 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 49087887 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 49088319 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49088327 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 49089693 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 49089854 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49090826 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49091210 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49091471 G C Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 49091514 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 49091993 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49092676 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49094260 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 49097045 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 49097904 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 49098252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49098670 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 19 49098935 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49099114 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49100451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49100564 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 49100610 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 49100727 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 49100856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49100981 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 49101019 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 49101023 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 49101026 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 49101055 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 49101249 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 49101275 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 49101375 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 49101465 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 49101504 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 49101554 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 49101710 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49101770 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 49102167 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 49102307 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 19 49102357 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 49102431 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 49102445 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 49102479 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 49102706 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 49102728 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 49102792 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 49102834 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 49102871 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 49102931 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 49102939 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 49102949 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 49102972 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 49102983 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 49102986 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 49103055 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 49103258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49103391 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 19 49103433 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 49103553 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 49103580 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 49103792 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 19 49103802 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 19 49103933 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 19 49103973 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 19 49104152 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 19 49104155 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 19 49104238 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 49104464 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 0.117647058823529 0.352941176470588 20 14 9 2 6 19 49104557 C A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 19 49104574 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 18 10 8 2 4 19 49104827 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 19 49104828 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 19 49104837 T A N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 19 49104987 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49105009 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 19 49105024 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 19 49105068 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 19 49105136 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 49105236 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 49105302 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 49105305 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 49105397 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 49105535 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 49105537 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 49105641 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 49105925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49105942 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 49106376 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 49106478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49106611 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 49107754 C A N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 5 11 2 1 5 19 49108048 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 49108558 T A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 49108997 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 49109214 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 49109764 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 49111253 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49111450 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49111460 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49111485 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 49111613 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 49112131 G A Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 19 49112211 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 49113082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49113364 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49113850 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 49113979 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 49114303 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 49114934 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 49117063 C A Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 49117420 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49119039 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 49119312 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 49119566 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 49119605 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49119747 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 49119784 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 49119807 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 49119835 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 49119912 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 49120073 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49120075 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49120131 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49120160 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49120166 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49120189 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49120193 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49120277 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49120368 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49120369 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49120889 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 49121881 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 49121954 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 49122072 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 19 49122111 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 49122116 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 49122238 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 49122508 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 49122520 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 49123260 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 49123429 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49123569 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49123973 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 49124309 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 49124470 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49124655 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 49124732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49127436 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49129573 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49130129 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49135396 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49135710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49137332 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 49138030 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 49138170 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 49138228 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 49138309 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49138321 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49138353 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 49138365 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 49138594 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 49138702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49138847 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49139317 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49139932 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49139960 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49140037 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49140056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49140249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49140629 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49140750 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49141086 A T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 49141309 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 49141675 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49141931 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49142081 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 49142092 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49142117 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49142244 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49143035 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49143138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49143624 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49143946 A C Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 19 49144028 T A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 49144438 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 49149806 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 19 49149860 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 49150351 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49150549 A T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 19 49150865 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 49151183 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49151544 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 49151643 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 49151772 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 49151863 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49152440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49152450 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 49152733 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49153770 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49154151 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 49155446 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49155910 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49156324 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49157405 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 49157442 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49157921 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49158566 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49159074 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49159278 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 49159386 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49159482 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49160488 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49160736 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49161370 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49161808 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 49162056 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49162635 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 49163283 G T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 49164071 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49165126 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49166070 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 49166190 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 49166287 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 49166618 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 19 49166654 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 49166720 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 49166766 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 49166773 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 49166810 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 49166873 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 49166990 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 49167097 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 49167154 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 49167164 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 49167294 A C N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 19 49167347 G T N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 19 49167368 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 19 49167389 C A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.1875 0.6875 0.125 17 15 3 11 2 19 49167626 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 19 49167627 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 19 49167733 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 49167839 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 49167868 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 19 49167997 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 49168043 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 49168073 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 49168078 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 49168107 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 49168137 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 19 49168194 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 49168223 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 49168291 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 19 49168305 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49168306 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49168339 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 49168411 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 49168512 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 49168565 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 19 49168591 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 19 49168650 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 49168690 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 49168695 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 49168739 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 49168753 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 49168835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49168851 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 49168934 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 19 49169011 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 19 49169048 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 49169106 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 19 49169164 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49169273 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 49169340 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 49169456 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 19 49169475 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 49169489 G C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 49169592 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 19 49169757 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 49169800 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 49169939 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 49169983 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 49169986 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 49170076 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 49170128 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49170145 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 49170302 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 49170395 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 49170437 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 49170528 A C N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 19 49170620 T G N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 19 49170621 T C N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 19 49170624 A G Y Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 19 49170741 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 49170798 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 49170888 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 49170902 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 49170961 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 49170971 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 49171001 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 49171026 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 49171189 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 49171273 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 49171483 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 49171509 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 49171596 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 49171686 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 49171729 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 49171743 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 49171788 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 49171877 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 49171910 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 49172058 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 49172415 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49172669 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 49172921 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 49173134 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49173962 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 49174109 T A Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 19 49174704 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 49177213 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49178909 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 49178915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49178934 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 49178940 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49179144 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 19 49179226 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 49179701 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49179849 G T Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 19 49179875 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 49179902 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 19 49179950 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 49180115 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 19 49180395 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49180690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49180775 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49180971 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49180990 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 49181577 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49181809 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 49182558 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49183228 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49183905 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49184139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49185578 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 49187125 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49187208 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 49187697 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 49187789 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 49187845 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 49189574 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 49190021 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49191590 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49192923 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49195102 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49195909 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49196244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49196932 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 49197279 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49197523 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49198753 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49198944 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49199106 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 49199672 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 49201541 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49201826 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49204562 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 49204774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49206773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49207208 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49208514 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49211599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49212161 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49215022 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 49215801 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 49216476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49218983 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49219027 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49219062 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 49219395 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49219432 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49220091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49220684 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49220725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49221913 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49221919 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49221925 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 49222354 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49222897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49223606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49223736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49223786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49224551 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49224562 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 49224626 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49225025 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 49226084 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 49226608 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 49226643 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49226723 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49226900 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 49226919 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49227105 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 49227114 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 49227230 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 49227232 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 49227366 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49227596 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 49228925 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49229163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49229180 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49229206 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49229312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49229348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49230548 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 49230590 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 49230804 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49230857 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49230881 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49230971 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49231086 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49231101 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49231187 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 49231200 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 49231296 G C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 49231545 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49231929 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 49231938 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 49231969 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 49232236 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 49232334 C A N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 19 49232409 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 19 49232583 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49233037 C A Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 19 49233154 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 19 49233166 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 19 49233338 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49233631 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 49233744 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 49233745 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 49233758 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 49233793 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49233809 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 49233844 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 49234108 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49234247 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49234262 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49234411 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49234483 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49234533 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49234596 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 49234809 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 49235140 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 49235379 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 49237624 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49237852 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49238714 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49238785 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 49238813 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49239105 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49239139 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 49239157 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49239202 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49239216 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49239241 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49239252 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49239286 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49239485 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49239626 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49239818 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49239879 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49239962 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 49240047 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 49240190 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 49240689 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 49240730 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 19 49240781 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49240827 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49240847 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 49240874 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 49240921 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49240952 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49240968 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 49241124 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 49241125 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 49241166 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 49241424 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 49241715 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 49241721 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 49242005 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 19 49242157 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 49242222 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 49242450 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 49242514 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49242533 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 49242808 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 49242823 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 49242873 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 49242900 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 49243140 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49243177 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49243206 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 49243207 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 49243222 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 49243265 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49243384 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49243521 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49243545 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49243630 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 49243647 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 49243684 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 49243792 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49244021 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 49244224 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49244258 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49244303 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49244315 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49244350 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49244413 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49244435 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 49244522 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49244532 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49244644 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49244716 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49244734 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49244948 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 49245179 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 49245181 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 49245522 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 49245567 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49245605 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 49245814 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 49245905 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 49245988 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49246070 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 49246087 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 49246111 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 49246132 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 49246405 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 49246433 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 49246591 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 49246595 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 49246633 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49246809 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 49246949 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49246983 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49247287 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 49247322 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49247376 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 49247474 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49247532 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49247543 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49247590 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49247636 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 49247641 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 49247664 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49247669 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 49247874 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49247887 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49247929 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 49247935 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 49248028 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49248165 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49248174 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49248219 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 49248261 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 49248265 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 49248336 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 49248422 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 49248486 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 49248499 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 49248682 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49248685 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49248726 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 49248755 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 49248771 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 49248780 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 49248838 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 49248881 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 49248905 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49248940 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 49249082 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 49249216 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 49249222 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 49249226 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49249272 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49249298 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49249327 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49249342 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49249467 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 49249497 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49249506 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 49249524 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 49249655 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49249662 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49250020 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 19 49250365 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 49250487 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49250592 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 49250625 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49250646 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 49250658 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 49250665 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 49250689 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 49250841 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 49257624 A T Y N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 19 49257762 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 49257844 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49257857 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49257939 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 49257958 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49257978 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49258028 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49258192 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49258234 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49258245 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49258248 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49258368 G C Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 49258468 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49258501 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49258554 C A Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49258722 T G Y N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 19 49258733 G T Y N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 19 49258743 A G Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 49258744 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 49258785 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 49258863 T G Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 49259049 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 49259145 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 49259192 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 49259211 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 49259221 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 49259295 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 49259302 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 49259314 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 49259342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49259382 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49259413 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 49259509 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 49259542 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 49259589 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 49260118 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 49260793 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 49260813 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49261251 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49261347 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 49261514 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 19 49262323 G A N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 19 49262356 G T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 49262419 G C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 19 49262487 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 49262490 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 49262499 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 49262524 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 49262536 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 49262569 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 49262581 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 49262625 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 49262644 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 49262677 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 49262686 G C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 49262696 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 49262742 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 49262887 C A N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 19 49264786 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 49264867 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 49265011 C G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 49265047 C G N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 19 49265049 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 19 49265071 G T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 19 49265076 G C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 19 49265081 A T N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 19 49265114 C A Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.6 0.133333333333333 0.266666666666667 20 10 9 2 4 19 49265181 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 49265182 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 49265206 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 49265222 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 49265232 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49265235 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 49265351 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 49265374 G A Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 19 49265393 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 49265415 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 49265538 G C Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 49265548 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 49265572 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 49265608 A T Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 19 49265867 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 49265891 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 19 49265940 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 49266019 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 49266087 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 19 49266289 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 49266301 T G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 49266547 A C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 49266683 G A Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 19 49266693 T C N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 19 49267746 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 49267780 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 49267883 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 49267896 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49267930 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49267998 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 49268048 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 49268060 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 49268322 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 49268379 C G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 49268411 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 49268502 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 49268802 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 49269197 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 49269531 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 49269900 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 49270281 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49270527 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 49271124 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 49271855 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 49272702 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49273012 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 49274861 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 49274992 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49276510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49276791 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49277246 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 49277773 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49277906 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 49277967 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 49278169 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49278844 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 49278873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49278904 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 49279078 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49279517 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 49279564 T A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 19 49279806 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 49279855 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49279916 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 49280845 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 19 49281270 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 49281298 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 49281566 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 49281769 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 49283158 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 49283540 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 19 49284054 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 49284123 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49284502 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 49284671 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49284967 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49287751 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 49288635 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49288751 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 49288795 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49288803 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 49288842 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 49288883 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 49288897 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 49289090 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 49289215 C T Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 19 49289340 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 49289389 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49289706 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 49290464 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 49290478 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 49291072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49293062 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 49293107 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 49293551 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49294286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49295182 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 49295183 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49295622 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49295756 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 49295836 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49295939 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 49296009 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 49296657 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 19 49296717 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 19 49296756 C A N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 19 49296842 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49297174 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 49297243 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 49297372 T A Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 49297414 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 49297461 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49297552 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 49298027 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 49298061 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49298106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49298252 G T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49298263 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 49298289 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 49298292 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 49298305 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 49298306 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 49298345 T A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 49298369 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 49298537 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 49298608 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 49298623 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49298830 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 49299097 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 19 49299151 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 49299153 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 49299383 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49299477 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49299486 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49299487 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49299591 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 19 49299673 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 49300138 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 49300158 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 49300169 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 49300709 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 49300814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49300924 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 49300928 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 49300997 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 49301012 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 49301044 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 49301276 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 49301371 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 49301375 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 49301391 G C N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 19 49301785 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 49301833 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 49301924 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 49301982 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49302138 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49302237 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 49302248 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49302378 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49302394 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49302668 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 19 49302746 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 49302796 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 49302915 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 49303135 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 49303276 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 49303893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49303926 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 49303995 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 49304041 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 19 49304326 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49304337 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 49304513 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 49304514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49305281 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49305761 G C Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 49306057 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 49306126 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 49306305 A C Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 49306306 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 49306497 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 49306672 C T Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 49306680 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 49306681 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 49306687 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 49306934 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49307008 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 49307257 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 49307556 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49308305 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49309775 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49309985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49310631 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 49310681 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49310958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49310964 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49311036 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49311099 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49311338 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49311458 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49311485 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49311503 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 49311538 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49311567 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49311580 A T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 19 49311627 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 49311647 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49311655 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 19 49311669 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49311679 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49311740 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49311848 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49311888 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49311920 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49311972 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49312042 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 49312059 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 49312079 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49312166 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49312170 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49312483 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 49312488 A C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 49312489 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49312502 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49312667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49312790 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49312871 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 49312901 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 49312916 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 49312988 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 49313003 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49313028 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 49313365 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49313387 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 49313411 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49313506 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49313799 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49313818 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49313825 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49313888 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49313934 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49313951 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49313971 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 49314082 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 49314110 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49314217 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49314247 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49314272 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 49314356 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 49314522 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 49314531 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 49314611 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 49314645 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49314670 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49314707 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49315014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49315168 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 19 49316019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49316054 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49316595 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 49316965 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 49317096 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 49317194 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49317344 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 49317627 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 49318167 G T N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 19 49318398 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 49318429 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49318458 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 49318525 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 49318533 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 49318550 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 49318599 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 49318603 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 49318620 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 49318734 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 49318829 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 49318926 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 49318955 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 49318963 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 49319093 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 49319096 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 49319108 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 49319214 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49319231 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49320636 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 19 49320756 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 49321544 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 49322035 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 49322154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49322203 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 49322264 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49322309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49322381 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 49322400 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 49322416 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 49322418 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 49322496 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 49322524 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 49322609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49322691 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 49322873 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 49323289 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 49323588 A T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 49323648 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49323799 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 49323839 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 49323972 G A N Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 11 9 3 5 2 19 49323980 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 11 7 3 5 1 19 49323991 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 49324420 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49324466 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 49324505 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 49325978 G T Y N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 19 49326068 A G Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 19 49327067 T A Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 49327175 T G Y N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 19 49327786 C T Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 19 49327922 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 49328082 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49328116 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 49328123 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 49328159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49328263 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49328365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49329062 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49329138 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 49329488 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49329492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49330130 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 49330308 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 49331032 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 49331195 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 49331217 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 49331397 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 49331444 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 49331695 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 49331696 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 49332072 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 49332087 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 49332118 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49332223 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49332256 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49332258 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49332355 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49332433 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49332531 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 49332577 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49332590 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 49332838 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49332955 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49333592 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 49333751 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 49333968 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 49334476 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 49334568 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 49334643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49334809 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 49335255 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 49335386 A T Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 49335757 T A Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 49335918 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 49335940 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 49336085 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 49336459 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49336463 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49336483 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 49336552 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 49336688 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 49336698 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 49336776 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 49336824 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 49336841 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 49336910 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 49337253 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 49337289 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 49337321 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 49337421 T G N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 12 16 2 8 4 19 49337524 T C Y Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 19 49337614 C T N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 19 49337637 A C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 19 49337771 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 49337829 A G N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 19 49338337 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 49338422 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 49338603 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 49338842 G C Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 49339000 T G Y N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 19 49339320 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 49339547 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 49339576 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 49339811 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 49339868 G T Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 49339953 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 49339965 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 49339995 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 49339996 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 49340009 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 49340096 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 49340241 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49340361 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49340421 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 49340636 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 49340832 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 19 49341458 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 49341480 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49341540 A G Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 49341553 G A Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 49341590 G T Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 49341920 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 49342061 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 49342084 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 49342098 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 49342201 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 49342240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49342327 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 49342720 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 49343312 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49343475 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49343818 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 49344057 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49344811 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49344910 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 49345356 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 49345375 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49346076 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49346538 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49346560 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49346566 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49346577 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49347448 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 49347885 A G Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 49348147 A C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49348248 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49348446 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49348907 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 49350034 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49350222 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49350289 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49350380 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49350422 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49350534 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49350750 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49350790 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49350937 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49350942 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49351042 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49351094 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49351155 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 49351220 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49351234 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49351243 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 49351511 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49351674 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49351686 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49351722 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 49351731 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 49351807 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49351826 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49351961 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 49352059 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 49352098 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 49352154 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 49352155 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 49352198 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 49352268 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49352493 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 49352542 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 49352636 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 49352640 T A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 19 49353016 A C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 49353355 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 49353412 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49353658 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49353737 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 49354039 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 49354126 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 49354211 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 49354282 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 49354283 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 49354388 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49354513 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49354662 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 49354804 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 49355093 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 49355157 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 49355348 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49355451 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49356046 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49356047 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49356312 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49356513 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49356966 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 49357028 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49357329 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49357491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49357582 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 49357681 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49357874 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 49357890 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49357979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49358031 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49358085 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49358146 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49358189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49358195 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49358258 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49358262 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49358302 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49358342 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 49358726 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 49358780 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49358806 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 49358898 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 49358944 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49358951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49358975 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 49359009 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49359041 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49359059 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49359106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49359239 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 49359285 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49359367 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 49359445 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 49359479 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 49359668 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 49359675 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 49359720 T A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49360027 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 49360151 T G N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 19 49360152 C A Y N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 19 49360161 C A Y N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 19 49360284 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 49360291 T C N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 19 49360313 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49360327 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 49360432 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 49360471 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49360544 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49360693 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49360710 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49360731 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49360983 T C Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 19 49361185 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49361203 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49361208 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49361227 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 49361233 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49361238 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 49361307 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49361569 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49361600 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 49361659 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49361690 G T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 49361709 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49361744 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 49361784 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 49362035 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49362094 A G Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 49362102 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49362114 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49362393 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 49362864 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 49362907 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 49363020 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49363063 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 49363132 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 49363344 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 49363533 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49363539 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 49363574 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49363606 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49363697 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 49363731 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49363833 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 49363894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49363920 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 49363967 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49364092 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 19 49364142 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49364192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49364265 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 49364357 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 49364511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49364575 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49364841 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 49364994 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49365013 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 49365082 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 49365214 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49365306 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49365403 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49365414 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 49365517 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49365642 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49365659 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49365685 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49365855 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49365929 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49365954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49365981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49366023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49366117 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49366120 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49366149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49366271 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 49366322 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49366329 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 49366351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49366463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49366567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49366603 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49366645 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49366654 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49366655 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49366665 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49366701 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 49366735 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 49366848 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49366995 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 49367264 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 19 49367275 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 49367278 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 49367406 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 49367449 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 49367661 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 49367684 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 49367786 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49367814 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49367861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49367947 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 49367976 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 49368002 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 49368003 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 49368101 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 19 49368271 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49368293 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49368421 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 49368484 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 49368492 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49368524 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 49368755 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 49368769 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 49368862 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 19 49368892 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49369050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49369195 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49369746 T C Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 49369760 C G Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 49369766 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 49369966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49370216 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 49370251 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 49370275 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 49370364 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 49370370 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 49370398 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 49370420 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 49370436 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 49370448 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 49370629 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 49370698 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 49370715 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 49370782 G C Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 49370801 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 49370818 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 49370968 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 49370994 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 49371004 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 49371008 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 49371053 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 49371078 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49371175 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 49371535 T G N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 19 49371541 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 19 49371549 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 19 49371596 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 49371783 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49371838 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 49371931 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 49372079 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 49372172 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49372310 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49372322 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49372413 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 19 49372434 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 49372774 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 49372816 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 49372943 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 49373013 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49373063 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49373256 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49373281 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 49373311 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 49373319 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 49373325 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 49373363 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49373639 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 49373702 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 49373713 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 49373758 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49374080 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 49374137 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 49374499 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 49374522 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 49374609 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 49374701 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 49374710 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 49374712 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 49374758 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 49374886 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 49375230 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 49375871 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 49375954 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 49376711 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 49376777 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 49376919 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 49377491 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 49377564 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 49377659 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 49378794 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 19 49379024 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49379026 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49379552 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 49379684 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 49379842 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 49380068 A C N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 19 49380238 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 49380302 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 49380352 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 49380423 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 49381027 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 49381068 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 49381300 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 49381407 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 49381872 A C N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 19 49381905 A T N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 19 49381974 T A N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 19 49382031 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 49382361 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 49382427 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 49382509 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 49382551 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 49382598 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 49383889 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 49384031 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 49384057 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 49384804 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 49385058 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 49385305 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 49385579 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 49385934 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 49386029 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 49386081 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 49386134 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 49386266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49386381 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 49386529 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49386545 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 49386563 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 49386617 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 49386630 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 49386691 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 49386740 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 49386813 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 49386872 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 49386915 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 49386948 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 49387065 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 49387548 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 49387626 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 49387639 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 49387879 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 49387883 A T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 49387885 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 49388008 C G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 19 49388018 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 19 49388117 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 49388182 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 49388212 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 49388379 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 49388388 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 49388422 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 49388447 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 49388502 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49388610 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 49388707 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 49388723 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 49388788 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 49388794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49388807 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 49388835 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49388842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49388843 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49388857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49389084 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 49389276 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 49389514 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 49389539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49389549 T C Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 49389592 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 49389749 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 49389991 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49390063 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 49390064 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 49390078 A C Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 49390161 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 49390196 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 49390336 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 49390341 C A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 49390380 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 49390586 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49390790 C G Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 49390825 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 49390883 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 49390941 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 49391054 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 19 49391315 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49391366 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 49391393 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49391398 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49391577 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 19 49391578 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 49391671 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 49391834 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 49391892 C T N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 19 49391920 G A N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 19 49392148 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 49392313 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 49392355 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 19 49392427 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 49393678 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49393703 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 49393715 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49393770 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49393787 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49393967 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 49394099 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 49394104 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 49394267 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 19 49394834 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 49394846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49395304 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 49395430 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 49395450 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49395458 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 49395644 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49396114 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 49396198 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 49396217 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 49396219 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49396231 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 49396274 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 49396422 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 49396434 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 49396440 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 49396484 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49396512 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49396618 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 49396646 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 49396670 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 49396757 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 49396758 G C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 49396852 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 49396870 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 49396943 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 49397008 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 49397279 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49397447 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 49397591 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49397777 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 49398105 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 49398714 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 49398783 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 49398807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49399111 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 49399143 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 49399147 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 49399176 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 49399179 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 49399223 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49399331 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 49399880 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 49402732 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 49403401 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49403665 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 49405041 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 19 49405304 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49405599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49407394 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 49422957 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 49423954 T A N N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 19 49424465 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 49424476 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49424936 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 49425134 T G N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 19 49425160 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 49425257 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49425396 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 49425398 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 49425610 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 49425806 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 49426120 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49426308 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 49426539 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 49426697 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 49426779 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 49426881 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49427309 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 49428088 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 49428138 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 49428387 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49428395 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 49428581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49428615 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49428702 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 49428725 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 49428924 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 49428939 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 49429082 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49429207 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 49429215 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 49429276 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 49429339 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 49429344 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 49429363 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 49429451 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 49429456 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 49429463 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 49429695 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 49429696 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 19 49429998 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 49429999 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 49430033 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 49430064 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 49430074 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49430078 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 19 49430108 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 49430134 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 49430152 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 49430321 G A Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 19 49430571 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 49430732 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 49430761 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 49431035 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 49431137 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 49431177 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 49431248 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 49431272 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 49431297 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 49431378 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 49431983 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49432127 G C N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 19 49432131 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 19 49432453 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49433118 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 49433262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49433480 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 49433502 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 49433905 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 49434157 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 49434258 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 49434311 T A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 49434817 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 49435197 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 49435231 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 49435373 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49435868 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49436465 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 49436533 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49436554 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 49436575 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49436804 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 49437325 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 49437631 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49437683 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49438722 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 49439247 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49439678 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49440565 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 49440722 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 49440785 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49441530 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 49442244 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49442791 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49443315 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49443950 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49444107 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49444901 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 49445280 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 19 49445386 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 49445765 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 49445863 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 49445942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49446050 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49446054 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 49446692 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 49447117 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49447740 G A N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.428571428571429 0.142857142857143 0.428571428571429 14 14 6 2 6 19 49448089 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 49448092 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 49448097 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 49448109 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 49448125 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 49448128 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 49448136 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 49448326 C G N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 19 49448449 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 49448508 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 49448534 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 49448789 T A Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 49449071 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 49449222 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 49449442 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 49449565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49449720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49450011 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 49450014 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49450051 C G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 49450357 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 49450593 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 49450663 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49450703 C G Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 49451182 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49451605 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49451851 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 49451876 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 49452094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49452471 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 49452487 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49452809 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 49452835 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 49452861 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49452866 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49452909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49452911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49452915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49452939 C A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 49452958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49453018 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 49453057 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 49453097 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 49453177 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49453205 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 49453208 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 49453397 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 49453408 G A Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 19 49453457 A G Y Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 19 49453498 T C Y Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 19 49453638 G A Y Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.571428571428571 0.357142857142857 10 18 1 8 5 19 49453640 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 49453957 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 49453986 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49454005 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49454013 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 49454146 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 49454204 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 49454263 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 49454471 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49454606 A G Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 19 49454665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49454950 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 49455681 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 49455723 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 49455793 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 49455927 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49456398 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49456944 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49457759 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 49458059 A T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 49458060 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 49458160 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 49458367 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 49459193 G T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 19 49459241 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49459426 C A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 49459618 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 49459625 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 49459648 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 19 49459720 G C N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 19 49460256 C T Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.466666666666667 0.2 0.333333333333333 17 13 7 3 5 19 49462007 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49462080 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.4375 0.125 0.4375 16 16 7 2 7 19 49462157 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 49462268 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49462269 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49462322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49462328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49462340 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49462685 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 49462704 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 49462762 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 19 49462801 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 49462969 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 49462993 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 49463003 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 49463045 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 49463304 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49463582 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 49463630 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49464198 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 49464391 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49464447 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49464449 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49464470 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 49464479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49464511 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 49464537 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49464585 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49464598 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 49464612 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 49464676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49464804 T G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 49464998 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 49465031 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 49465054 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 49465095 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 19 49465161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49465261 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 49465263 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 49465273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49465594 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49465595 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49465602 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49465708 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 49465897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49466971 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 49467242 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 49467314 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 49467426 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 49467429 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 49467547 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 49467610 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49467662 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 49467721 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 49467722 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 49467737 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 49467827 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 49467841 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 49467860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49467868 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 49467878 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 49467917 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 49467924 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 19 49467931 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 49468003 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 49468057 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 49468142 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 49468220 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 49468240 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 49468293 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 49468437 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 49468587 G C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 49468855 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 49469031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49469647 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 49469744 T A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 19 49472001 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49472193 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49473177 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 19 49473589 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 49475203 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49476463 C T N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 49476877 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49477020 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 49477100 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 49478120 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 49478279 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.45 0.1 0.45 20 20 9 2 9 19 49478329 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 49478367 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 49478397 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49478532 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 49478747 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 49478835 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49478853 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 19 49478895 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 49479417 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 49479423 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 19 49479431 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 19 49479456 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 19 49479466 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 19 49479721 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49479902 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 49480027 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 49480275 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 49480741 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49481072 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 49481378 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 49481742 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 49481854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49481983 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 49482110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49482135 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49482445 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49482585 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 49482763 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49483003 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 49483081 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49483177 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49483187 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 49483276 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49483643 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.45 0.1 0.45 20 20 9 2 9 19 49483749 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.45 0.1 0.45 20 20 9 2 9 19 49483755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49483889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49483958 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 49484005 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 49484031 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.5 0.111111111111111 0.388888888888889 20 16 9 2 7 19 49484137 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 19 49484138 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 19 49484430 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 19 49484439 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49484533 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 19 49484643 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 49484991 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49485130 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 49485144 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49486523 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 49486670 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 49486832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49486870 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 49487228 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 49487324 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 49487430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49488317 T A Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 19 49488431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49491219 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 49491428 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 49492148 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 49494705 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 49495042 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49495909 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 49496274 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 49497970 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 49498109 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 19 49498576 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 49498594 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 49498651 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 49498765 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 49498974 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 49499056 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 49499948 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 49499952 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 49500123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49500377 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 49500576 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 49500588 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49500654 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 49500728 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 49500800 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 49501434 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49501568 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 19 49501793 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 49502304 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 49502394 C A N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 19 49502523 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 49502575 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 49502657 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 19 49502707 A C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 19 49502814 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 19 49502874 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49502897 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 49503111 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 49503289 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49503328 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 49503398 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 49503622 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 49503898 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49503996 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 49504151 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 49504163 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 49504183 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 49504284 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 49504288 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 49504415 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49504471 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 49504595 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49504674 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49504676 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49506196 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49506854 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49507426 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 49507433 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 49508709 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 19 49508740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49508792 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 49509506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49509753 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 49510226 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 19 49510515 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 49510991 G A Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 19 49511675 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49512031 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49512120 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49512132 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49512265 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 49512269 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 49512317 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 49512327 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 49512363 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49512421 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49512549 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 49512869 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 49513007 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49513046 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 49513379 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 49513410 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 49513427 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 49513449 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 49513453 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 49513454 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 49513470 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 49513664 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 49513713 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 49514104 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 49514279 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49515068 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 49515089 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 49515122 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 49515158 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 49515298 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 49515299 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 49515317 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 49515331 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 49515332 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49515352 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 49515449 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49515550 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 49515604 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49515845 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 49515870 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49515937 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 49516016 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 19 49516044 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49516130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49516318 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49516506 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49516776 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 49516939 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 49516958 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 49517006 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 49517105 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 49517298 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 49517310 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 49517550 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 49517574 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 49517575 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 49517704 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49517851 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49517924 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 49517970 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 49518032 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49518165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49518460 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 49518492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49518539 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 49518706 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49518771 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49518812 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 49518835 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 49518963 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49519080 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 49519218 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 49519276 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 49519319 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 49519445 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 49520064 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 49520083 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 49520674 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 19 49520788 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 49520865 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 49520879 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 19 49520987 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 49521212 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 49521301 C T N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.416666666666667 0.25 0.333333333333333 13 11 5 3 4 19 49521583 T C Y Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 19 49521637 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 49521687 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 19 49521699 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 49521711 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 19 49521752 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 49521755 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 49521757 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 49521806 A C Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 49521808 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 49521811 C A Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 49521846 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 49521859 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 19 49521982 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 49522031 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 49522039 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 49522063 A T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 49522103 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 49522133 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 49522183 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49522194 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 49522231 T A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 49522299 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 49522330 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 49522479 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 49522504 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49522518 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 49522520 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 49522561 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 19 49522578 C T N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 19 49522612 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 49522643 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 49522686 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 49522709 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49522710 G T N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 19 49522764 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 49522767 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 49522830 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49522841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49522902 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49522915 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49522965 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 49522997 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 49523015 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 49523292 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 49523340 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49523394 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 49523422 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 49523586 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 49523593 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 49523604 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 49523715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49523821 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49523842 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 49523847 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49523850 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49523874 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49523932 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49524025 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 49524027 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49524127 T C N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 19 49524547 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 49524558 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 49524587 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 19 49524598 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 19 49524621 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 19 49524843 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 49524852 G T N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 19 49524899 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 49524975 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49524992 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 49525092 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 49525126 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49525134 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49525135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49525159 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 49525167 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 49525173 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 49525279 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 49525325 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 49525340 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49525351 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 49525646 T A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 19 49525787 T C N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.181818181818182 0.545454545454545 0.272727272727273 10 12 2 6 3 19 49526224 G C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 49526248 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49526308 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49526383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49526429 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49526452 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49527530 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 49527781 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49527829 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49527941 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 49528084 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49528199 A T Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 49528317 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49528318 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 49528333 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 49528482 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 49528851 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 49529282 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 49529306 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 49529319 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 49529320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49529356 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 49529377 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 49529449 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 49529530 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 49529610 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49529729 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 49529783 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 49529794 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 49529836 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 49529971 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 49530101 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 49530226 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 49530413 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 49530435 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 49530477 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 49530532 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 49530574 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 49530589 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 49530612 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 49530989 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 49530995 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 49531016 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 49531064 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 49531359 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 49531448 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 49531463 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 49531479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49531550 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 49531667 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 49531994 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 49532024 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 49532084 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 49532089 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 49532305 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 49532328 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 49532334 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49532349 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 49532489 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49532658 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 49532675 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 49532841 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 49532861 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 49532908 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 49532978 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 49533126 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 49533299 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 49533301 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 49533490 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 49533498 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 49533505 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 49533534 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49533609 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 49533645 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 49533677 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 49533678 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 49533689 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 49533724 A T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 19 49533754 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49533825 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 49533850 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49533899 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 49533927 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 49533965 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 49533966 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 49533990 T G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 49534001 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 49534019 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 49534058 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 49534206 C T N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 19 49534231 G A N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 19 49534234 T G N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 19 49534267 T A N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 19 49534278 T G N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 19 49534307 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 49534321 G C N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 19 49534401 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 49534407 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 19 49534459 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 49534574 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 49534601 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 49534689 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 49534722 C A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 19 49534734 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.5 0.125 0.375 18 14 8 2 6 19 49534762 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 49534779 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 19 49534781 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 19 49541904 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49542012 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49542092 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 49542102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49542131 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49542139 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49542277 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 49542278 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 49542484 G C Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 49542506 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 19 49542602 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 49542714 C A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 49542715 T A Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 49542732 G T Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 49542774 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 49543612 G A Y Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 19 49544439 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49544624 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49544652 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 49544731 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 49546497 C T Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 19 49546664 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 49547665 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 49548043 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 49548144 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 49548198 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 49548210 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49548234 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49548241 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 49548406 G C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 49548670 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 49548747 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 49548983 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 49549022 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 49549071 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 49549157 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 49549233 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49549465 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 49549776 A G N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 19 49549785 C A N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 19 49549909 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 49549968 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 49550215 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 49550491 C A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 49550783 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 49550934 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 49551023 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49551116 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 19 49551121 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 49551240 T C N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.0833333333333333 0.583333333333333 0.333333333333333 9 15 1 7 4 19 49551402 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49551427 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 19 49551673 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49551850 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 49551851 T G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 49551891 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 49551895 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 49551908 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 49552000 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 19 49552003 C T N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 19 49552046 T A N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 19 49552047 C T N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 12 12 3 6 3 19 49552079 A C N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 19 49552305 A G Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 19 49552307 T A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 19 49552383 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 49552496 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 49552544 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 49552579 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 49552618 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 49552636 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49552674 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 49552964 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 49553017 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 49553029 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 49553281 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 49553290 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 49553344 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 49553456 A G Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 19 49553567 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 49553657 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49553747 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 49553748 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49553792 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 49553881 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 49553928 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49553934 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49554217 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 49554249 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 19 49554262 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 19 49554280 A T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 19 49554422 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49554432 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 49554444 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49554473 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49554520 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49554528 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49554569 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49554649 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49555243 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 49555302 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49555337 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49555489 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 19 49555540 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49555601 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 49555698 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 49555718 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 49555730 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49555755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49555817 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 19 49555949 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49556010 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 49556030 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49556043 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 49556061 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 49556108 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 49556117 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 49556147 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 49556237 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 49556487 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49556490 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 49556555 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 19 49556582 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 19 49556640 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 49556696 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49556812 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 49556921 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 49556946 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49557015 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 49557016 T G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 19 49557063 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49557339 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49557405 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 49557489 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 49557561 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 49557562 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 49557719 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 19 49557751 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 49557786 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 19 49557876 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49557903 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 19 49557939 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 49557958 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 49557959 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 19 49557972 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 49558098 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 19 49558102 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 19 49558209 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 19 49558215 T G N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 19 49558296 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 49558430 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 49558455 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 19 49558460 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 49558466 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 49558498 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 49558527 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 49558595 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 49558601 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 49558626 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 19 49558628 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 49558664 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 49558779 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 49558905 C T N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 19 49558937 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 19 49559280 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 19 49559302 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.266666666666667 0.666666666666667 0.0666666666666667 18 12 4 10 1 19 49559367 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 19 49559404 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 19 49559427 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 49559451 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 19 49559477 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 49559478 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 49559487 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 19 49559492 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 49559570 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 19 49559614 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 49559703 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 19 49559727 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 19 49559764 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.166666666666667 0.722222222222222 0.111111111111111 19 17 3 13 2 19 49559793 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 49559869 T A N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 19 49559952 C A N N 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.25 0.75 0 10 6 2 6 0 19 49560152 A C Y N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 19 49560211 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 49560257 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 19 49560414 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 19 49560436 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49560461 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 49560477 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 49560536 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 49560577 T C Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 19 49560661 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 49560703 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49561033 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 49561059 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49561082 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49561087 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 49561099 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 49561111 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 49561192 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 19 49561203 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 19 49561204 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 49561214 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 49561256 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 49561275 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 49561443 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 49561846 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 49562238 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 19 49562258 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 19 49562749 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 49562772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49563012 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 49563021 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 19 49563148 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 49563405 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 49563432 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49563451 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 49563775 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 49563778 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49563779 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 49563789 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 49563903 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49563938 T G Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 49563941 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 49564078 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49564111 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 49564150 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 49564255 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 49564611 T C N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 19 49564917 C A N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 19 49564956 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 19 49565005 C T N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 19 49565027 A T N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 19 49565084 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 19 49565410 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 19 49565479 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 19 49565484 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 49565701 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49565813 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49565921 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49565953 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 49565981 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 49566120 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 49566286 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49566345 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 49566471 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 49566499 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 49566704 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 19 49566787 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 49566788 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 19 49566871 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 49566967 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 19 49567006 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 49567014 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 49567038 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 49567075 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 49567085 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 49567186 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 18 22 2 14 4 19 49567217 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 19 49567291 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 49567503 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 49567546 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 49567610 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49567614 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 49567757 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 49567849 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 49567855 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49567901 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 49567975 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 19 49567996 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 49568090 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49568135 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49568275 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 49568276 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 49568306 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 49568394 C G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 49568531 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49568661 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 49568709 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 49568927 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 49568951 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49569106 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 49569109 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 49569273 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 49569363 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49569443 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49569455 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 19 49569499 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.210526315789474 0.736842105263158 0.0526315789473684 22 16 4 14 1 19 49569511 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 19 49569678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49569919 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 19 49570063 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 49570131 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 49570230 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 49570432 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 49570810 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 49570854 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 49570859 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 49570873 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 49570921 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 49570953 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49571301 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 49571342 T A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 49571396 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 49572164 G T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 19 49572210 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 49572252 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 49572318 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 49572689 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 49572996 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49573051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49573093 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 49573376 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 49573624 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49574157 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 49574180 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 49574818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49574955 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49575220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49575535 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 49575577 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 49576035 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49576141 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 49576142 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 49576318 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 49576409 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49576424 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 19 49576947 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 49576957 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 49577308 C T N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.230769230769231 0.692307692307692 0.0769230769230769 15 11 3 9 1 19 49577612 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 49577674 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49577675 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49577701 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49577756 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 49577840 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49577852 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49577960 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 49578070 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 19 49578360 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49578935 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 49579125 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 49579472 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 49579869 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49579948 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49580246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49580396 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49580450 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 49580813 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 49580909 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 49580912 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 49580987 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 49580993 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 49582448 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49582762 C T Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 19 49582907 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49582959 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 49583004 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 49583015 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49583076 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 49583098 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 49583150 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 49583247 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49583248 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 49583271 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 49583319 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49583339 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49583342 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49583377 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49583381 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49583385 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49583655 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49583660 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49583721 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49583975 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49583989 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49584012 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49584092 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49584101 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49584137 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49584141 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 49584171 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49584172 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49584269 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 19 49584270 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 49584276 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 19 49584305 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 49584511 C T Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 19 49584644 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 49584668 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 49584683 C G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 49584702 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 49584717 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 49584749 G C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 49584807 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 49584882 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 49585027 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49585057 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 49585120 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 49585138 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 49585242 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49585279 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 19 49585295 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 19 49585298 T A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 19 49585355 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 49585435 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 19 49585448 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49585514 A T Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 19 49585620 G C Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 49585637 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 49585654 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 49585758 T G Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 49585902 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 49585910 C G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 49585973 C T Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 19 49586050 A T Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 19 49586117 A C Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 49586154 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 49586165 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 49586189 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 49586212 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 49586222 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 49586232 A T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 49586294 A C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 49586301 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 49586360 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 49586413 A T Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 19 49586423 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 49586472 A T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 49586473 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 49586494 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 49586498 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 49586501 C A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 49586518 A C Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 49586536 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 49586556 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 49586571 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49586634 A T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 49586647 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 49586664 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 49586679 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 49586733 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 49586740 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 49586857 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 49586895 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 49587011 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 49587032 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 49587043 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49587782 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 49587939 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 49587946 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 49587968 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49588413 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 49588414 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 49588549 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49588574 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 19 49588581 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 49588670 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 19 49588739 G A N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 19 49588844 G A N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 9 15 3 3 6 19 49589026 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49589044 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 49589081 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 49589392 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49589413 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 49589435 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 49589445 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 49589479 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 49589502 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49589523 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 49589529 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 49589787 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 49589797 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 49589903 G A Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 49590188 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 49590333 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 49590452 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 49590481 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 49590502 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 49590543 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 49590592 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.375 0.1875 0.4375 15 17 6 3 7 19 49590695 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 49590770 C G N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 19 49590816 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.3125 0.125 0.5625 12 20 5 2 9 19 49591164 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49591262 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 49591377 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 19 49591391 A T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 19 49591516 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 19 49591562 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 19 49591630 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 49591738 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 49591751 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 49591846 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 49591897 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 49592027 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 49592031 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 49592048 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 49592049 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 49592057 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 19 49592090 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 49592096 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 49592155 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 49592188 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 49592189 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 49592216 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 49592314 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 49592567 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 19 49592571 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 19 49592618 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 19 49592699 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 19 49592735 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 19 49592803 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 19 49592807 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 19 49592809 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 19 49592910 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 49593262 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 49593264 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 49593307 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 19 49593356 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 49593394 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 49593418 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 49593419 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 49593451 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 49593518 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 49593854 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 49593896 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 19 49593941 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 19 49593961 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 49593966 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 49593982 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 49594001 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 49594426 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 49594481 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 49594750 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 49594873 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 49594913 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49595168 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 49595458 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49595828 A C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 19 49596009 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 19 49596148 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49596316 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 49596362 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 49596431 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 19 49596544 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49596702 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 49604328 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49604685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49604985 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 49605106 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 49605136 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49605160 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 49605237 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 49605370 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49605371 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 49605439 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 49605462 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 49605480 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49605481 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 49605716 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 19 49605938 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 49606262 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 49606326 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49606518 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49606664 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 49606685 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 49606777 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 49606868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49606896 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49607063 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 49607085 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 49607143 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 49607148 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 49607155 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 49607506 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 49607598 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 49608716 A T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 19 49608730 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 49608776 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 49608930 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49609021 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 49609202 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 49609262 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 49609266 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49610010 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 19 49610507 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49610833 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 49610854 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 49611205 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49611259 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 49611608 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 49611948 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 49612153 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 49612262 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 49612536 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 49612559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49612638 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 49612658 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 49612752 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 49612780 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 49612803 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 49612821 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49612834 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 49613119 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 49613662 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 49613795 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 49614042 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49614231 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 49614422 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 49614670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49615077 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 49615126 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 49615170 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 49615283 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 49615580 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 49615685 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 49615907 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 49615977 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49616077 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49616758 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49616759 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49616765 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49617146 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 49617244 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49617317 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 49617371 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 49617553 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 49617612 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 49617638 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 49617649 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 49617695 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 49617727 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 49617758 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 49617812 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 49617825 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 49617921 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 49617970 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 49618016 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 49618079 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 49618177 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 49618248 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 49618763 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 49619040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49619242 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 49620493 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 49620980 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 49621023 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 49621143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49621166 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 49621346 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49621377 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49621426 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49621500 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49621576 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49622448 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 49622527 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 49622636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49623605 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 49623673 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 49623831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49624096 T A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 49624159 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49624304 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 49624460 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 19 49624817 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49624841 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49624951 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 49625026 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 49625037 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 49625173 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49625187 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49625188 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49625265 A C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 49625281 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49625345 A T Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 49625441 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 49625468 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 49625475 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 49625539 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 49625603 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 49625614 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 49625697 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 49625754 A T Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 49625770 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 49625785 T C Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 19 49625796 T A Y N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 19 49625854 A G Y Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 19 49625878 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 49625888 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 49625891 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49625916 T C Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 49625967 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 49626053 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49626132 G T Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 49626169 G T Y N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 19 49626316 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 49626381 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 49626464 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49626573 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 49626647 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 49626689 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49626809 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 49626878 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49626938 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 49627128 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 49627361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49627461 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49627917 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49628490 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 49628546 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49628601 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49628669 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49628732 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49628750 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49628874 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 49629021 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49629099 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 49629223 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49629254 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49629652 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 49630080 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49630093 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 49630106 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49630148 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49630356 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49630494 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49630582 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49630588 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 49630606 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 49631779 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49631899 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49632172 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 49632445 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 49632624 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 49632680 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 49632904 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 49632905 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 49632973 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49633352 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 49633491 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 49633498 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 49633604 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 49633605 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 49633611 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 49633652 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 49633700 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 49633841 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49633861 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 49634445 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 49634926 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 49635245 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 49635830 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 49635978 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 49636013 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 49636074 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 49636122 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49636326 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 49636409 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 49636476 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 49636732 C A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 19 49636763 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 49636781 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 49636809 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 19 49636867 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 19 49636910 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 49636912 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 49636914 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 49636925 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 49636944 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 49636948 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 49636980 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 49637107 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 49637126 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 49637161 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 49637198 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 49637413 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49638873 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 49639272 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49639486 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 49639716 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 49639782 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 49639827 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49639905 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49639951 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 49640072 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 49640183 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49640504 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49642688 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49644047 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 49644639 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49645663 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49646660 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 49646805 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 49647097 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 49647105 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 49647836 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49648300 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 49649064 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49649197 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49652189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49652257 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 49652789 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49653049 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 49653070 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 49653511 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 49653521 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 49653572 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 49653753 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49653821 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 49653834 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 49653980 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 49654260 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49654347 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 49654359 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49654579 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49654724 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 49654943 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49655479 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 49655487 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 49655511 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49655560 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 49655615 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 49655620 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 49655845 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 49655927 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49656431 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 19 49656445 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 19 49656518 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 49656560 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 49656785 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 49656896 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49656910 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49657129 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 49657234 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 19 49657252 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 19 49657286 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 19 49657449 A C N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 19 49657451 G T N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 19 49657649 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 49657680 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 19 49657755 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 49658015 A T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 19 49658057 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 49658429 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49658460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49658877 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 19 49659562 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49659672 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 19 49659948 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 49660106 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 49660207 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 49660245 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 49660389 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 49660673 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49660675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49660786 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49660856 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49660874 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49660875 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49661333 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 49661507 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 49661584 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 19 49661785 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49662118 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 49662226 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49662241 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 49662242 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 49662279 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 49662346 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 49663503 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 49665239 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 49665240 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 49665632 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 49665682 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 49665965 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 49666047 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 49666275 A T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 19 49666523 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 49667141 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 49667177 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 49667290 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 49667595 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 49667603 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49667716 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 49667789 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 49668229 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 49669654 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49669769 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49671163 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 49673150 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49673864 A C Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 49674306 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 49674331 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 49674349 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 49674439 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 49674449 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 49674517 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 49674520 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 49674658 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49674674 G C N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 19 49674976 G A N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.25 0 0.75 4 12 2 0 6 19 49675455 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 49675932 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 49676051 T A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 49676086 A C Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 49676106 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49676702 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 49676749 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 49676797 G T Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 49677114 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 49677173 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 49677180 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 49677327 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 49677336 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 49677375 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 49677398 C T Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 49677406 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 49677416 T G Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 49677454 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 4 24 2 0 12 19 49677529 T A N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 19 49677533 G T Y N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 19 49677554 T C Y Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 10 8 3 4 2 19 49677565 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 8 6 2 4 1 19 49677570 A T Y N 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 8 6 2 4 1 19 49677810 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 19 49677955 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 49677970 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 49678003 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 49678007 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 49678091 T C Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 49678106 A G Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 49678164 T G Y N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 19 49678301 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.25 0.666666666666667 0.0833333333333333 14 10 3 8 1 19 49678376 C T Y Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 13 7 4 5 1 19 49678405 C A N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.230769230769231 0.153846153846154 0.615384615384615 8 18 3 2 8 19 49678418 T C N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 19 49678531 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 49678575 A G Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 49678595 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 49678651 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 49678719 A C N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 19 49678838 G T Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 19 49679002 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 49679007 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 49679160 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 49679455 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 49679703 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 49679914 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 49680017 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 19 49680044 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 49680055 T A N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 19 49680090 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 49680167 A C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 49680434 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 49680480 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49680560 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 49680561 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 49680672 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 49680754 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49680779 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49680838 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49681053 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49681110 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49681160 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49681884 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49682325 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49682571 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 49682804 T G N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 19 49683304 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 49683446 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 49683973 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 49684180 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49684252 C A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 49684624 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 49684974 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 49685761 C G N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 19 49686173 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 49686645 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 19 49686746 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 49687262 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49687517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49687714 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 49688395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49688418 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 49688467 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49688617 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 49688667 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49688813 A C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49688977 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 49688990 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 49689032 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 19 49689038 G A Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 49689382 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 49689383 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 49689485 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 49689573 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49690006 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 19 49690268 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49691246 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 49691342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49691649 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49691788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49692117 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 49692738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49693544 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 49693794 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49694421 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 49694747 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49695139 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49695175 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 49695216 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 49695291 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49695554 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 49696094 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 49696133 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 49696161 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 49696479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49696835 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 49697374 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 49699763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49700526 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 49700673 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 49700880 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 49702392 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 49702454 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49702548 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 49704977 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49705418 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49705766 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 49705930 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49706089 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 19 49706116 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 49706515 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49706723 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49707565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49708026 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49708983 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49709329 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49710056 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 49710105 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49710122 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 49710172 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 49710411 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 49710425 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 49710552 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 49710555 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49710565 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 49710631 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 49710664 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49710668 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49710803 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49710864 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 49710873 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 19 49710892 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 49710935 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 49710978 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49711024 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 49711399 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49711599 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49711630 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 49711717 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 49711728 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49711793 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49711823 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49712032 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49712077 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 49712088 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 49712155 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49712164 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49712206 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 49712252 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49712258 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 49712335 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49712654 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49712695 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49712787 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49713008 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 49713036 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 49713209 C G Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 49713239 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49713399 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 49713817 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 49714051 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49714059 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49714265 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 49714412 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 49714539 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 49714548 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 49714901 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49715012 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 49715050 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 49715091 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 49715123 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49715152 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 49715159 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 49715417 A G N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 19 49715574 T A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 19 49715607 A T N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 19 49715626 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 49715655 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49715677 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 49715691 T G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 49715726 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 49715757 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 49715966 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49715970 G T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49716005 G T Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 49716006 G T Y N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 49716012 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49716030 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 49716081 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 49716086 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 49716139 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49716304 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49716390 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 49716542 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 49716654 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 49716736 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49716756 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49716764 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 49716844 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49716849 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49716871 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49716911 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 49716982 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 49717040 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49717047 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 49717630 C T N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 19 49717633 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 19 49717814 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49717859 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 49717964 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 49718045 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49718058 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49718117 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 49718142 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 49718310 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 49718322 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 49718344 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49718347 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 49718417 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 49718513 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49718753 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49718772 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 49718799 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 49718839 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 49718840 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 49719097 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 49719125 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 49719153 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49719180 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49719266 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49719285 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49719374 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49719395 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49719507 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49719521 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49719533 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49719676 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49719824 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 49720093 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 49720148 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49720167 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49720186 A T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 49720196 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 49720683 T G N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 19 49721043 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 19 49721114 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 49721999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49722143 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 49723305 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49723471 C T N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 19 49723555 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 49724160 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 49724182 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49724403 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49724417 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 49724553 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 19 49724597 A G N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 19 49724607 A G N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 19 49724648 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 49725485 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 49726105 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49727453 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49727464 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49727480 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 49727742 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 49728103 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 49728226 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49728367 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 49728453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49728478 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 49728508 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 49728554 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 49728555 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 49728561 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 49728646 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 49728649 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 49728820 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49728905 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 49729023 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 49729107 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 49729272 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 49729300 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 49729509 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49729630 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49729646 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49729656 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 49729685 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 49729688 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 49729709 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 49729751 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 49729807 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 49729841 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 49729883 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 49729904 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 49729924 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 19 49729930 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 49729943 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 49729950 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 49730056 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 49730177 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 49730231 G C N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 19 49730389 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49730556 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49730669 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 49730715 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 49730792 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49731455 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 49731513 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 49731662 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 49731682 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 49731744 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49731810 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 49731871 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 49732180 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 49732187 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 19 49732392 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 49732501 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49732694 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 49732978 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 49733145 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 49733197 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 49733525 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 49733717 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 19 49733745 C A N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 19 49733879 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49733912 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 49734294 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49734305 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49734315 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 49734418 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49734532 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49734535 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49734555 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49734685 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49734702 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 49734718 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 49734723 G T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 49734801 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 49734826 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49734835 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49734838 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49734890 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49734946 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 49734947 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 49734950 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 49735015 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 49735102 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49735160 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49735244 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49735544 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49735617 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 49735697 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49735986 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 19 49736204 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 19 49736426 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 49736435 A G Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 19 49736487 G T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 49736504 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49736601 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 49736618 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 49736870 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49736922 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 49736957 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49737153 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 49737211 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49737274 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49737284 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49737295 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49737323 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49737335 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49737629 A T N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 19 49740742 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49741029 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 49741066 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49741084 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 49741172 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 49741237 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 49741267 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 49741925 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 49742878 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49742986 C A Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 19 49743013 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 49743036 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 49743060 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 49743181 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 49743652 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 49743744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49744824 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49745023 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49745835 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49746157 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49746196 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49746210 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 19 49748287 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49749861 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49750019 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49750141 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 49750466 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 49751221 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 49751451 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 49752215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49752554 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49752791 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49753041 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49754543 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49755378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49755413 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 49755614 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 49755909 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 49755964 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49757070 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 49757175 A T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 49758099 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49758344 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 49758586 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49758641 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49758673 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49758680 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 49758930 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 49759108 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 49759223 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 49759304 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 49759357 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 49760772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49760824 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49760951 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 49761754 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 49761948 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 49762277 T C Y Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 19 49762317 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 19 49762444 T C N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 19 49762792 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 49763172 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 49764464 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 49764475 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 49764577 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49764675 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 49764882 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49764930 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 49764956 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49765126 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 49765223 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 49765233 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 49766100 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49766595 C T N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 19 49767246 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 49767477 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 49767717 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 49770259 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49771508 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 49771512 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 49771801 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49772032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49772655 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 49772805 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49774029 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 49774172 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 49774645 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 49775198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49775357 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 49776273 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 49776762 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 19 49777043 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 49777059 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49777129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49777421 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 49778265 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49780466 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49781367 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 49782138 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49782592 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49782613 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49782682 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49783167 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 49783429 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 49783441 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 49784323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49784352 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 49784571 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49784629 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49784705 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49784892 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49785646 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49785736 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49785749 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 49785750 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49785920 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 49786869 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49786909 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49786983 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 49787015 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 49787036 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49787258 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49787435 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49787665 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49787929 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 49787982 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49788050 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49788377 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 49788565 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49788585 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49788604 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 49788639 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 49788660 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 49788670 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 49790056 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 19 49790064 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 19 49790067 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 19 49790069 G C Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 49790107 A G Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 49790132 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49790146 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 49790268 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49790311 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49790381 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49790418 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49790433 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49790628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49790695 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49790756 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49790857 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49790948 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49790977 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49791047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49791130 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49791210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49791272 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49791784 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49792125 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49792186 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 49792215 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 49792243 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49792288 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 49792334 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 49792473 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49792475 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 49792845 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49792851 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 49792852 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 49793002 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 49793052 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49793059 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 49793268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49793590 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49794104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49794217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49794478 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49794588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49794756 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49794793 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 49794847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49794904 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49794905 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49794917 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49794942 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49794947 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49794948 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49794973 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49794997 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49795038 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 49795780 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49797058 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 49797183 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 49797298 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49798480 A C Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 49798598 A C N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 19 49798599 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 49798606 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 49798759 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49799512 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 49799897 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 49801586 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49801745 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 49802866 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 49802867 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 49802942 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 49803231 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49803939 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 49804752 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 49805281 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 49805284 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 49805285 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 49805317 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 49805358 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49805502 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49805809 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 49805826 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 49805908 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 49806043 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49806313 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49806320 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49806394 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49806566 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49806630 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 49806650 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49806662 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49806730 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49806828 G T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 49806974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49807009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49807019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49807032 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 49807250 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 49807320 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 49807366 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49807663 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49807845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49807864 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49807928 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49808196 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49808213 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 49808228 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 49808339 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 49808392 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 49808432 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 49808529 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49808638 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49808663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49809105 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 49809199 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.176470588235294 27 7 13 1 3 19 49809233 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.176470588235294 27 7 13 1 3 19 49809303 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 49809344 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 49809358 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 49809427 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 49809472 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49809483 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49809568 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49809660 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 49809847 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49809932 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49809953 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 49810047 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49810256 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 49810257 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49810329 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 49810600 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49810909 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49811013 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49811073 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 49811239 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49811261 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49811297 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 49811415 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49811479 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49811480 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49811497 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49811510 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 49811562 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 49811566 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49811734 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49811856 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 49811943 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 49812011 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49812113 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 49812121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49812274 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49812326 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 49812369 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49813562 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49813576 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 49813668 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 49813873 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 49813974 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 49815000 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 49815157 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 49815191 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 49815193 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 49815260 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 49815748 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49816243 C G Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 49816865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49817199 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49817602 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 49817603 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 49817607 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49817625 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49817631 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49817635 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49817664 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49817767 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49817804 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49817938 C G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 19 49818026 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49818111 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 49818125 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49818261 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49818346 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49818359 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49818433 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49818449 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 49818479 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49818525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49818662 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49818801 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49818895 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49819590 T G Y N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 19 49819649 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 49819693 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 49820116 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49820157 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49820249 C T Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 19 49820330 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49820338 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49820574 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49820643 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49820661 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 49820706 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49821112 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49821117 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 49821156 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49821187 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 49821268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49821432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49821440 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49821682 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49821717 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49821816 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49821821 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49821825 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49821837 A T Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 49822011 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49822017 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49822030 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49822039 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49822083 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49822119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49822351 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49822581 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 49822619 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 49822628 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 49822651 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 19 49823625 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 49823721 C T Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 19 49823769 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49823784 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 49823842 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 49823867 C T Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 19 49824009 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 49824166 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 49824225 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49824248 G T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 49824250 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49824358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49824473 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49824480 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49824530 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49824563 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49824591 A T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49824603 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49824627 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49824707 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49824955 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49825134 C G Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 49825169 G C Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 49825294 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 49825325 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 49825644 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49825839 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49827895 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49828118 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 49828177 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49828256 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49828435 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49829034 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49829937 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49830012 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49830089 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49830147 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49830361 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49830377 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49830384 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49830390 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49830623 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49830674 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49830743 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49830826 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49830844 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49830846 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49830870 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49830920 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49830961 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49830998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49831071 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 49831155 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49831163 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49832245 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49832388 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49832860 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49833372 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 49834488 G T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49834514 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49834574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49834931 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49834950 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49834988 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49834993 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49835231 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 49835287 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49835379 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49835886 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49836165 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49836270 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49836317 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49836355 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49836392 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49836465 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49836507 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49836526 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49836583 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49836626 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 49836642 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 49836682 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 49836720 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 49836737 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 49836795 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49836877 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 49837088 C A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49837104 T G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49837933 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 49837969 A T Y N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 19 49837971 G A Y Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 19 49838060 G T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 49838065 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 49838134 G A Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 49838226 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 49838637 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49838652 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49838726 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49838960 T A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49838962 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49839173 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 49839359 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 49839397 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 49839681 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49839709 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49839812 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49839856 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49840033 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 49840099 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 49840127 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 49840140 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49840170 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49840248 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49840271 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 49840320 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49840434 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 49840444 T A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 49840453 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49840512 T G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 19 49840649 T G N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 19 49841248 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49841258 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49841280 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49841309 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49841484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49841507 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 49841526 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49841698 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 49841811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49841852 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49841885 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49841993 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49842079 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 49842190 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49842195 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49842201 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49842213 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49842223 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 49842244 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49842588 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49842593 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49842598 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49842690 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 49842750 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49842776 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49842977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49842987 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 49842999 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49843068 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 49843069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49843074 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 49843228 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 49843269 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 49843342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49843361 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49843565 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49843631 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49843919 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 19 49843965 A G N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 19 49844046 G A N Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 19 49844167 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 49844201 T G N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 19 49844363 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 19 49844457 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49844824 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 49844831 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49844834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49844836 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49844851 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 49845100 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49845292 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 19 49845452 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49845589 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49845858 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 49845868 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49845904 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49845917 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49846175 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 49846370 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49846735 C T Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 19 49846742 C T Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 19 49847702 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49848290 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49848575 T C N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 19 49848707 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 49849623 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49850540 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 49850550 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 49851050 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 19 49851198 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 19 49851295 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 49851416 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 49851444 A T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 49851458 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 49851469 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 49851578 A T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 19 49851752 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 49851969 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 49852055 A C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 49852284 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 49852426 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 49852498 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 49852578 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 49852784 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 49853129 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49853167 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49853340 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49853434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49853617 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49854183 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49854294 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 49855757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49855944 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49855962 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49856214 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 49856899 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 49856924 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 49857137 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 49857252 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49857697 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49858785 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49859151 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 49859247 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49860226 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 49860435 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 49860659 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 49860695 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 49860713 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 49860780 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 49860858 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49861091 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49861236 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 49861301 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 49861390 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49862192 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 49862426 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 49862627 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49862659 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49862910 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 19 49862931 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 19 49863001 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 49863085 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 49863104 G C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 49863133 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 49863164 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 49863174 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 19 49863253 A G N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 19 49863397 A G N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 19 49863430 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 49863491 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 49863543 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 49863566 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 49863757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49863887 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 49863961 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49864251 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 49864393 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49864398 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49864502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49864670 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49864675 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49864749 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49864848 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49864874 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49864899 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 49864941 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 49864971 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 49865033 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49865044 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 49865237 A C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 19 49865568 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 49865625 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49865646 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49865900 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 49865904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49865936 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 49865977 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 49866030 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 19 49866093 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 49866181 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49866228 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49866263 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49866305 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 49866311 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 49866324 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 49866706 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 49866722 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49866881 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 49866883 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49866925 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49866944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49866960 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49867108 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49867394 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49867427 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 49867565 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49867568 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49867599 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 49867657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49868039 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 49868367 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49868413 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49868470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49868477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49868673 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49868682 A T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49868695 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49868823 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49868937 G T Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 49868942 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49868976 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 49868993 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49869013 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49869289 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49869359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49869360 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49869366 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49869543 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 49869834 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 49869893 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 49869900 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 49869938 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49870174 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49870296 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49870371 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49870389 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49870400 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49870457 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49870538 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49870608 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49870753 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49870792 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49870796 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49871145 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 49871154 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49871192 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49871216 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 49871225 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 49871260 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 49871296 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 49871338 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49871339 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49871340 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 49871382 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 49871384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49871462 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49871472 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49871493 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49871525 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49871590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49871813 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49871834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49871920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49872152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49872177 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49872436 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49872463 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49872574 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49872581 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49872582 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49872639 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 49872655 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 49872659 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 49872681 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49872695 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49872713 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 49872720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49873129 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 49873183 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 19 49873296 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 19 49873389 A G N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 19 49873560 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49873576 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 49873686 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49873715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49873745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49873765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49873768 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49873995 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49874170 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49874197 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49874478 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49874829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49874911 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 49875023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49875122 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49875289 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49875341 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49875404 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49875476 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49875494 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 49875546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49875593 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49875603 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49875633 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 49875754 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 49875772 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49875794 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49875822 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49875842 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49875972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49876154 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49876275 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 49876342 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49876343 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49876429 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49876632 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 49876704 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49876790 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49876792 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49876877 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 49876992 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 19 49877091 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 49877323 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 49877326 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 19 49877435 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 49877475 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 49878061 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49878108 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49878174 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 49878245 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49878248 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 49878418 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49878419 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49878475 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49878476 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49878538 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 49878604 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 19 49878631 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 19 49878907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49879204 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 49879211 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 49879214 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49879215 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 49879329 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 49879399 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 49879433 C T Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 49879434 C T Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 49879464 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49879482 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49879512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49879526 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49879671 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49879702 T G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 19 49879712 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49879728 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 19 49879964 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49879980 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49879991 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 49880014 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 49880015 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49880102 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49880179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49880191 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49880294 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49880404 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49880412 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49880446 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49880468 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49880469 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49880500 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49880525 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49880585 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49880696 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 49880697 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 49880713 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 49880819 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 49881289 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49881314 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 49881343 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49881467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49881509 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49881558 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49881715 C T Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 19 49881796 A T Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 19 49881835 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 49881931 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 19 49881962 A C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 19 49882030 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 19 49882149 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 49882190 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49882264 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 49882331 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 49882459 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 49882599 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 49882604 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49882659 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 49882864 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49882874 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49882902 T A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49882917 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 49882979 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49882980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49883293 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49883467 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49884284 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49884802 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 49885326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49885495 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 49886039 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49887133 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 49890042 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 19 49890183 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 49890620 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 49890937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49892352 A T N N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 19 49893345 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49894241 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 49895789 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 49897035 C G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 49898646 C T Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 19 49899838 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 49900687 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49901047 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 49901218 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 49901431 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 19 49901640 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 49901761 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49901928 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 49902147 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 49902189 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 49902233 G C Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 49902533 G T N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 19 49903638 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 49903685 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 49904947 G A N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 19 49905444 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 49905894 G T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 49906161 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 49906603 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49906660 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49906733 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 49906751 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 49906831 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 49906973 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49907044 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 49907168 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 49907194 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 49907207 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 49907270 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 49907281 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 49907324 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 49907354 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 49907400 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49907413 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49907426 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49907441 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 49907483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49907566 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 49907768 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 49907781 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 49907825 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49907897 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 49907993 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 49907998 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 49907999 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 49908005 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 49908119 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 49908130 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 49908145 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 49908175 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49908335 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49908381 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 49908394 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 49908410 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 49908436 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 49908558 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 49908575 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49908696 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49908848 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 49908954 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 19 49909013 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 49909267 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49909450 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49910872 T G N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.333333333333333 0.133333333333333 0.533333333333333 12 18 5 2 8 19 49910913 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 49910993 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49911141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49911187 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 49911262 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49911401 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49911441 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49911490 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49911642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49912007 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 49912125 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 49912136 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 49912199 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 49912357 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49912788 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 49912793 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 49912829 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 49913303 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 49913457 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49913949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49914334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49915231 C A Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 49915683 A T Y N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 19 49915824 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 49915884 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49915938 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 49916788 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 49917317 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 49918927 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 19 49919802 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 19 49919966 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 19 49921047 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49921754 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 49921767 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 49921885 G T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 19 49922111 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 49922371 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49923957 T C N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 19 49926863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49928371 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49928516 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 49928543 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 49928823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49929552 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 49929871 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 49929881 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 49929997 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 49930389 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 49930623 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 49930735 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 19 49930921 C T N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.75 0.0833333333333333 0.166666666666667 19 5 9 1 2 19 49930975 C T N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.75 0.0833333333333333 0.166666666666667 19 5 9 1 2 19 49931087 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 49931189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49931903 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49931921 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 49932031 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 49932098 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 49932113 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 49932123 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 49932169 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 49932226 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 49932465 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 49932549 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 49932925 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 19 49933075 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 49933185 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 49933187 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 49933198 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 49934116 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 49934146 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 49934539 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 19 49935916 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 49936214 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 49936259 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 49936262 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 49936325 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49936433 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 49936610 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 49936624 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 49936768 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 49937002 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 49937188 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 49937197 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 49937509 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49937621 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49937886 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 49938052 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 19 49938213 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 49938311 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 49938411 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 49938413 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 49938456 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 49938461 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 49938530 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 49938651 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 49938659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49938670 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 49938776 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 49938834 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 49938867 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 19 49938934 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 49938981 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 49939296 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 49939346 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 49939427 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 49939441 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 49939556 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 49939591 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 49939627 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 49939729 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49940066 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 49940154 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 49940472 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49940535 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 49941147 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 49941245 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 49941402 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 49941412 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 49941424 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 49941489 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 49941497 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 49941513 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 49941519 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 49941523 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 49941547 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 49941572 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 49941579 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 49941684 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 49941723 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 49941804 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 49941827 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 49941851 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 49941879 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 49941930 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 49942000 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 49942066 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 49942067 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 49942105 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 49942108 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 49942127 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 49942141 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 49942168 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 49942208 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49942223 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 49942256 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 19 49942279 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 49942549 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 49942605 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 49942628 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 19 49942654 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 19 49942683 T C N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 19 49942700 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 49942795 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 49942798 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 49942839 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 49942898 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 49942939 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 49942951 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 49943025 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 49943180 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 49943219 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 49943679 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 49944080 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 19 49944090 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 49944267 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 49944318 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 19 49944334 C T N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 19 49944511 C T N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 19 49944960 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 49945010 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 49945011 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 49945910 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49946090 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 49946380 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 49946769 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49947624 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49948624 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 49948663 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49948921 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49949984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49950560 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 49951505 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49951518 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49952415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49952918 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 19 49954020 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49954326 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 49954513 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 49954790 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 19 49955022 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 49955464 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 49956406 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 49956677 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 49957041 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 49957069 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 49957077 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 49957207 C G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 49957208 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 49958109 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 19 49958382 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 49958403 G A N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 19 49958415 G T N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 19 49958957 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 49958974 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49959833 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 49959878 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 49961161 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 49963055 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49963145 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 49963224 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 49963274 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 49963294 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 49963298 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 49963458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49963557 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 49963608 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 49963616 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 49964065 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 19 49964319 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 19 49964576 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 49964680 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49964872 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 49965061 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 19 49965248 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49965453 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 49965480 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49965527 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49965580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49965605 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 49965608 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49965679 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 49965745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49965901 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49965915 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49965975 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49965990 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 49966072 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 49966097 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.222222222222222 14 4 7 0 2 19 49966120 A G N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 19 49966152 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.166666666666667 0.25 16 8 7 2 3 19 49966666 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 49966677 G T N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 19 49966678 C A N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 19 49966683 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 19 49966689 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 19 49966752 C T N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 19 49966776 A G N Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 19 49967023 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 49967134 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 49967145 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 49967382 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 49967527 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 49967806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49968979 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 49969395 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49970377 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49970391 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49970419 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 49970431 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49970462 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49970482 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49970488 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49970516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49970541 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49970548 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49970549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49970608 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49970676 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49970753 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49970833 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49970960 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49970996 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49971475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49971517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49971646 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 49972107 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 49972709 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49974767 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49976538 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 49976753 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 49976827 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 49977143 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 49978988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49982528 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 49984407 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49985045 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 49985725 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 49986514 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 49989119 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49990734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49993037 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 49993770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49994795 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 49995004 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 19 49995015 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49995054 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 49995282 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 19 49996457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49996692 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 19 49996719 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 49996812 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 49997392 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 49997911 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 49999061 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 49999067 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 49999094 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 49999168 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 49999220 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 49999232 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 49999238 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 49999243 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 49999252 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 49999313 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 49999332 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 49999341 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 49999366 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 49999393 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 49999469 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 49999470 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 49999532 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 19 49999534 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 19 49999650 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 49999830 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 50000157 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 50000352 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 50000367 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50000385 C G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 50000609 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50000714 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 50000716 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 50000754 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 50001107 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 19 50001397 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 50002796 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 50003528 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50003529 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 50003556 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 19 50003566 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 50003796 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 50003948 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50004297 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 50004534 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 50004539 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 50005331 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 50005752 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 50006088 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 19 50006200 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 19 50006601 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 50006679 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 19 50006697 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 50006769 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 50006823 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 50006865 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 50006891 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50007064 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 50007125 C G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 50007208 T C Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 50011638 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 50012969 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 50012985 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 50013340 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50014224 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 50014577 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 19 50014887 A C N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 19 50015324 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 50015347 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50016634 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 50016683 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 50016715 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50016800 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50017008 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50017259 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 50017655 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 50017884 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 19 50018366 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 50019766 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50020116 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 19 50020655 A T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 19 50020736 T C N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 19 50021270 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 50021874 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 50022187 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 50022188 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 50022208 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 50024437 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 50024795 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50024803 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50025015 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 50025030 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 19 50025047 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 50025101 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 50025288 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 50025307 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 19 50025318 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 50025556 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 50026021 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 50026231 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 50026392 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 50026572 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 50027137 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 50027437 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50027447 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 50027571 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 50028446 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 50028481 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 50028487 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 50028608 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 50029448 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 50029482 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 50030045 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 50030609 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 50030784 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 50030852 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 50030869 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 50030928 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 50031398 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 50031405 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 50031530 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 50031611 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 50031665 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 19 50031710 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 50031722 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 50031723 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 50031742 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 50031762 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 50031782 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 50031795 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 50031838 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50031846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50031872 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 50031903 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 50032013 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 50032018 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 50032029 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 50032057 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 50032077 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 50032115 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 50032119 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 50032165 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 50032174 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 19 50032337 C A N N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 9 9 3 3 3 19 50032383 A T N N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 19 50032389 G A N Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.5 0.125 0.375 9 7 4 1 3 19 50032478 C T N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 19 50032494 A G N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.272727272727273 0.272727272727273 0.454545454545455 9 13 3 3 5 19 50032725 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 50032772 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 50032806 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 50032820 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 50032862 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 50032975 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 50033038 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 19 50033074 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 19 50033150 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 50033187 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 50033188 G C N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 19 50033263 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 50033304 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 50033412 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 19 50033413 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 50033414 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 19 50033512 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 50033735 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 50033763 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 50033856 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 19 50033941 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 50034191 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.263157894736842 0.0526315789473684 0.684210526315789 11 27 5 1 13 19 50034251 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 50034267 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 50034305 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.294117647058824 0.117647058823529 0.588235294117647 12 22 5 2 10 19 50034413 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 19 50034460 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 19 50034557 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 50034560 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 19 50034736 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 50034853 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 19 50035182 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 50035394 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 50035401 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 50035455 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 50035882 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 50035994 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50036133 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 19 50036293 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 19 50036302 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 19 50036327 G C N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 19 50036444 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 50036450 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 50036478 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 50036532 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 50036804 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 50036896 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 50036909 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50036999 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 50037044 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 50037071 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 50037304 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 50037348 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 50037548 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 50037564 C A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 19 50037567 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 19 50037573 G T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 19 50037575 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 19 50037793 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 50037836 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 50037887 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 50037897 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 50037952 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 50037989 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 50038012 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 50038276 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 50038279 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 50038281 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 50038313 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 50038317 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 50038328 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 50038346 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 19 50038347 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 50038461 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 19 50038462 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 19 50038544 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50039161 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 19 50039220 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 50039440 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 50039607 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 50039771 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 50039841 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 50039957 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 50040023 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 50040041 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 50040044 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 50040085 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 50040087 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 50040091 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 50040103 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 50040161 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 50040178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50040270 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 50040403 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 50040404 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 50040634 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 50040735 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 50040797 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 50040986 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 50041023 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 50041117 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 50041152 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 50041201 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 50041205 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 50041213 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 50041235 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 50041297 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 50041329 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 50041384 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 50041389 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 50041471 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 50041523 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 50041534 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 50041539 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 50041547 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 50041555 T A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 19 50041556 T G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 19 50041571 A T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 19 50041659 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 19 50041674 T A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 19 50042005 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 50042046 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 50042389 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 19 50042459 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.375 0.0625 0.5625 13 19 6 1 9 19 50042505 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 19 50042579 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 19 50042617 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50042657 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 50042862 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 50042951 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 19 50042956 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 19 50042973 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 19 50043051 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 50043067 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 50043101 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 19 50043130 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 19 50043156 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 19 50043196 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 19 50043441 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 19 50043446 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.277777777777778 0.0555555555555556 0.666666666666667 11 25 5 1 12 19 50043488 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 10 22 4 2 10 19 50043496 G C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.294117647058824 0.117647058823529 0.588235294117647 12 22 5 2 10 19 50043569 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 50043629 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 50044170 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50045976 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50046030 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 50046290 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 19 50047191 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 50048115 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50048330 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50048762 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 50050015 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 50050084 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 50050644 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 50050772 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50050941 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50051382 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 50051408 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 50051493 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50051618 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50051663 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50051688 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 50051692 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 50051961 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50052301 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50052916 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50053069 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 50053395 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50054599 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50054630 A C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 50055978 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 50056686 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 50057909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50057914 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50058100 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 50058280 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 50058776 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50058950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50060011 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50060164 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50060667 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 50062578 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 50063509 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50063597 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50063766 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50064316 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 50064836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50066044 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 50066419 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 50066855 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 50067196 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50067587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50068024 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50068919 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50070026 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50070578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50071382 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50071484 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50071607 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 50072935 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50073973 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50074176 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 50074278 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50076760 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50077344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50077365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50077853 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50078858 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 50079116 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 50079170 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 50079174 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 50079177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50079270 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50079338 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50079352 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50079498 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 50079537 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 50079587 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50079604 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50079792 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 50079852 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 50081360 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 50081488 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 50082114 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 50082125 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50082329 T A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 50083273 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 50083650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50083877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50083959 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 50084015 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50084569 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50085163 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 50085212 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50085327 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 50085374 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 50085462 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 50085486 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 50085548 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 50085559 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 50085738 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 50085790 C T Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 19 50085901 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 50085904 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 50086620 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 50086701 T G N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 19 50086705 A T N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 19 50086719 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50086732 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50086778 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 50086789 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 50086916 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 50087068 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 50087207 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50087284 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 50087291 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 50087323 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 50087392 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 50087615 T C Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 50089760 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50089838 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50089988 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50090208 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 50090294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50090392 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 50090404 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 50090411 A C Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 50090480 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50090950 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 19 50091472 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 50091916 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 50091977 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 50092256 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 50092263 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50092454 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 50092718 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 50092888 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50093417 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 50094725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50094997 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 50095057 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 50095068 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50095112 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 50095137 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50095295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50095446 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 50095644 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 50095649 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 50095757 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 50095887 G A Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 19 50096060 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 50096213 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 50096520 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 50096779 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 50096973 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50100267 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50100858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50101644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50101751 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50102994 C T Y Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 19 50103466 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50105409 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 50105643 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 50105941 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 50106089 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 50106142 C A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 50106178 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 50106180 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 50106828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50107017 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50107049 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50107078 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50107094 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 50107108 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50107136 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50107207 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50107293 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50107309 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50107941 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 50107970 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50108057 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 50108088 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50108211 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50108213 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50108691 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50108751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50108837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50110427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50110821 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50113617 C A Y N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 19 50114902 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50117555 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50117801 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50118097 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 50118146 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 50118253 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 50118642 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50118780 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 50119511 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50119981 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50120094 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50121029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50122728 G C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 50122843 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50122919 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 50122940 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50123228 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 50123293 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 50123330 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 50123345 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 50123346 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 50123437 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50123742 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50123818 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 50123894 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 50123974 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 50123989 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 50124117 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 50124363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50124385 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 50124456 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 50124526 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 50124557 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 50124676 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 50124803 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 50124848 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 50124915 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 50125110 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 50125336 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50125406 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 19 50125458 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 50125526 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 50125649 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 50125657 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 50126155 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 19 50126189 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 50126220 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 50126446 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 50126513 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 50126602 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 50126664 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 50126941 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 50127015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50127111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50127268 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 50127325 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 50127353 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 50127555 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 50127765 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 50127950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50127971 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 50128023 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 50128326 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 50128553 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 19 50128701 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50128837 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50128890 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 19 50129055 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 50129199 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 50129317 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 19 50129367 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 50129370 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 50129468 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 19 50129537 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 50129560 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 50129581 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 50130007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50130138 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 50130264 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 50130445 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 50130543 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 50130754 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 50130792 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 50131087 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 50131089 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 50131549 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 50131737 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 50131921 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 50131998 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50132060 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 50132332 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 50132379 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50132404 G T Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 50132423 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50132512 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 50132671 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 50132684 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 50132795 G A N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 19 50132847 C G N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 50132874 G C N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 50132995 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 19 50133002 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 19 50133187 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 50133203 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 50133275 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50133682 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50133778 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50133820 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50133860 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 50133875 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 50133883 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 50133900 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 50134236 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50134290 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 50134306 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50134338 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 50134347 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 50134405 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 19 50134406 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 50134411 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 50134420 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 19 50134424 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 19 50134463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50134477 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50134481 A C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 19 50134539 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 50134544 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 19 50134548 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 19 50134549 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 19 50134570 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 50134571 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 50134621 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 50134649 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 50134652 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 50134721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50134759 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 50134792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50134833 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 50134835 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 50134955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50134958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50135017 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 50135019 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 50135189 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 50135281 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 19 50135431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50135578 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 50135637 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 50136692 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50136822 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 50137410 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50137463 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 50137475 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50137666 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50137702 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 50137800 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 50138244 C T N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 19 50138247 C T N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 19 50138259 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 19 50138261 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 19 50138281 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 50138314 T C N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.214285714285714 0.642857142857143 0.142857142857143 15 13 3 9 2 19 50138365 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 50138487 C G N N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 19 50138515 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 19 50138685 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 50138709 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 19 50138724 C T N Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 19 50138728 G A N Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 19 50138753 T A N N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 19 50139076 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50139375 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50139579 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 50139624 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 50139682 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50140256 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50140797 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50140798 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50140831 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50140879 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50141354 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 50141633 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 50141710 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 50141887 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50142230 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 50142251 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 50142304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50142580 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50142665 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 50142692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50142697 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50142874 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 50142943 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50143120 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50143190 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50143191 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50143218 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50143230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50143349 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50143988 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 50144234 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50144932 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 50145463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50145649 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 50145803 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50145865 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 50145901 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50146214 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 50146304 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 50146501 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 19 50146569 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 50146822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50146898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50146899 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50147130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50148138 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 50148462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50150345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50150782 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50150839 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50151185 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50151608 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50151996 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50152336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50152417 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 50152739 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 50152756 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 50152864 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50153069 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 50153072 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50153483 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50154556 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50154928 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50158935 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 50158964 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 50159763 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 50160201 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 50160678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50160836 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 50161088 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 50161138 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50161208 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 50161309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50161351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50161513 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50161582 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50161669 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 50162070 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50162231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50162237 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50162310 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 50162425 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 50162439 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 50162498 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 50162559 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 50162682 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 50162727 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 50162772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50162823 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 50162898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50163108 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 50163132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50163139 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50163150 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 50163503 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50163515 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50163538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50163559 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50163614 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50163627 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50163696 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50163779 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 50164029 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50164272 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50164294 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50164407 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50164719 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50164782 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 50164815 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 50164878 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50164885 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50164887 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50164895 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50164924 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50164952 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 50165057 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50165099 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50165518 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 50165534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50165550 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50165557 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 50165597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50165843 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50165846 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 50165858 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50165901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50165904 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50165948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50165992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50166009 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50166067 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50166264 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 50166298 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50166656 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 50166753 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 50167055 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 50167061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50167072 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 50167073 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 50167145 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 50167160 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 50167254 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50167289 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 50167335 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 50167350 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50167451 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 50168115 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50168189 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 50168343 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50168362 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 50168415 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50168416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50168441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50168614 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50168757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50168804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50169099 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50169187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50169308 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50169348 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50169381 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50169405 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50171386 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 50171492 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 50172151 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 50172268 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 50172380 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50173115 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50173379 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 50173950 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 50173968 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50173973 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 50174054 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50174339 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 50174926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50175382 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 50175644 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 50175884 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50175922 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 50175990 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 50176478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50176840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50176913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50176922 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50177170 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 50177244 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 50177351 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 50177956 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50178131 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 50178703 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 50178736 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50179186 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 50179231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50179413 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50179783 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50179858 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50180099 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50180505 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50181350 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50182058 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50182217 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50182236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50182241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50188963 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50189277 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50189404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50189483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50189581 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50189631 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50190425 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50191006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50191499 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50192483 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50192555 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50193441 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50194399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50194512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50196111 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50196705 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50197146 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50197343 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50197486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50197521 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50198140 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50198199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50198368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50198642 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50198730 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50198961 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 50199713 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 50200616 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 50200633 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 50200653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50200687 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50200750 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 50200829 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 50200830 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 50200873 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 50201247 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50201622 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 50202128 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 50202150 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50202188 G T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 50203488 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50203494 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50203520 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50203648 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50204556 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50204873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50205175 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 50205216 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50205232 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50205733 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50205876 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50205935 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50206174 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50206448 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50206499 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50206866 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50207295 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50207610 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 50207624 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50207894 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50208009 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50208047 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50208070 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50208082 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50208430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50208449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50208566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50208678 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 50209384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50209519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50209547 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50209656 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50209659 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50209662 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50209751 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50209967 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50210020 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50210381 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50210518 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50210606 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 50210718 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50210741 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 50210816 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 50211643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50211728 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 50211729 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 50211748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50211835 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 50212427 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50212709 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 50212729 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 50212891 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 50212978 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 50213169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50213171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50213313 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50213403 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 50213425 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 50213537 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 50214335 A T N N 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 19 50215552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50216244 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50216736 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50218251 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50218820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50219079 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50219126 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50219741 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50220445 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 50220548 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50221880 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50222760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50222998 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50223022 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50223053 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50223056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50223105 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50223107 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50223187 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50223195 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50223299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50223317 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50224662 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50225079 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50225579 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50225960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50225988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50226024 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50226218 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50226364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50226375 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50226433 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50226692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50226922 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50227018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50227062 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50227171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50227334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50227564 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 50227582 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 50227654 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 50227670 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50227738 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50227930 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50227978 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50227982 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50228036 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50228265 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 50228267 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 50228271 G T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 50228307 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 50228333 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 19 50228334 C A Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 19 50228484 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 50228828 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50229445 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 50229609 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50229643 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 50229723 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 50229963 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50230729 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50230923 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50231104 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50231248 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 50231249 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 50231266 G T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50231312 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50231379 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50231458 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50232241 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50232370 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50232397 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50232452 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50232498 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50232501 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50232520 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50232543 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50232554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50232639 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50232711 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 50233131 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50233143 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50233192 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50233340 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50233377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50233386 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50233428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50233432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50233456 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50233657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50233712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50233827 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50233829 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50234003 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50234059 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50234230 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50234247 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50234860 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50234933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50235013 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50235154 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50235205 T A Y N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 19 50235257 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50235604 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 50235712 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50235740 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50235808 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50235902 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50236138 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50237252 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50237492 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50238004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50238236 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 50238400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50238673 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50239392 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50240184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50240981 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50241351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50241413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50241422 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50241539 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50241747 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50241767 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50241768 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50242040 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 50242042 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 19 50242062 G C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 50242092 C G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 50242093 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 50242109 G T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 50242111 A T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 50242132 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50242139 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 50242142 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50242147 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50242169 C G N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 19 50242174 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 50242209 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 19 50242210 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 50242220 A C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 50242262 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 50242326 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50242390 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 50242397 C A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 50242399 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50242422 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50242434 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50242452 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50242544 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 50242701 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50242720 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50242771 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50242772 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50242775 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 50242786 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50242799 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50243046 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50243239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50243368 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50243437 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50243477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50243505 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50243541 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50243571 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50243607 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50243783 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50243837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50244059 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50244103 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50244577 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50247165 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50247220 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 50247231 T A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 19 50247452 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 50247525 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50247793 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 50247846 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 50247879 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 50247884 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50248035 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50248213 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 50248224 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50248230 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50248265 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 50248339 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 50248342 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 50248365 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 50248556 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50248719 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 50248808 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 50249096 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 50249178 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 50249335 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 50249361 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50249415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50249744 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 50249796 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 50249927 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 50249930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50249933 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 50249947 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50250137 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50250187 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 50250327 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 50250356 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 50250389 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50250717 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50250782 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50251078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50251184 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 50251484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50251540 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 50251574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50252721 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50252993 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 50253003 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 50253042 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50253344 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 50253394 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50253435 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50253492 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 50253527 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50253560 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50253584 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50253667 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 50253800 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50253945 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50254085 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50254313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50254314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50254356 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 50254607 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50254610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50255180 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 50255264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50255477 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 19 50255503 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 50255533 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 50255929 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 50256095 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50256416 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50256693 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50256795 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50256972 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 50257476 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 19 50257507 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 50257509 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50257885 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 19 50257921 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 19 50258325 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 50258397 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50258681 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50258702 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 50259268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50260646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50261168 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50261208 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 50261321 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50261366 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 50261367 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 50261380 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 50261431 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50261474 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 50261793 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50261957 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 50261980 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 50262026 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50262045 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 50262054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50262692 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50263467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50263483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50263528 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 50263614 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50263878 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 50264007 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 50264056 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 19 50264117 T G N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 19 50264166 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 50264185 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 50264276 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 50264422 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50264602 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50264814 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50264816 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50264861 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 50265106 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 50265129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50265511 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50265651 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 50265762 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 50266056 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50266230 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 19 50266367 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 50266536 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50266621 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50266622 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50266645 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50266677 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50266789 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 50266821 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50266841 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50266847 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50266925 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50266940 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50267060 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 50267063 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50267621 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50267863 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50267953 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50268040 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 50268045 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 50268055 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50268062 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 50268330 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 50268434 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50268580 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 50268621 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 50268790 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 50268835 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 50268861 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 50268940 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 19 50269008 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 50269016 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 50269398 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 50269489 G A N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 19 50269496 G A N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 19 50269535 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 50269606 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 50269744 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 50271367 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 19 50271385 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 50271918 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 50273054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50274514 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50274985 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50275220 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 50275321 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50275396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50275408 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50275483 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50276250 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 50276741 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50276789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50276833 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50276969 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50277081 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50277327 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50277522 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50277792 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 50277822 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 50278025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50278103 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 50278248 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 50278411 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 50278415 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50278417 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 50278454 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 50278471 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 50278502 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 50278506 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 50278525 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 50279046 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50279125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50279211 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50279265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50279572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50279747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50281093 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50282344 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 50282373 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50282378 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 50282407 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50282521 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 50282525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50282773 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50282806 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50282818 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 50282896 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 50282982 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 19 50283087 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 19 50283568 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 50283675 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 50283786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50283878 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50283920 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 50283983 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50284156 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50284186 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50284405 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50284589 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 50284592 A T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 50284693 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50284757 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 50284864 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50284966 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 50285061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50285080 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 50285268 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50285363 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 50286007 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 50286020 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 50286046 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 50286154 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50286155 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50286501 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 50286519 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 50286592 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50286668 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50286731 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50286766 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50286782 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50286828 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50286912 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50286928 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 50286942 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 50287135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50287188 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 50287299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50287510 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50287653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50287789 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 50287830 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50287860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50287880 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50288072 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50288125 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50288135 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50288151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50288174 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50288176 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 50288236 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50288248 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 50288260 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50288309 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 50288317 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 50288360 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 50288381 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 50288506 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50288624 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50288696 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50288707 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50288996 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 50289003 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50289705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50289782 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50289999 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 50290001 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50290015 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50290016 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50290147 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50290234 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 50290312 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 50290394 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50290531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50290564 A C Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 50290596 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 50290610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50290645 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 50290697 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 50290778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50290993 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 50290995 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 50291024 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50291048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50291199 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 50291466 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 50291776 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 50291777 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 50291860 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50292073 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 50292140 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 50292225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50292251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50292471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50293216 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50293282 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 50293306 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50293455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50293719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50294881 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 50294887 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 50295174 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50295269 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50296072 G C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 50296101 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 50296274 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 50296282 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 50296599 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 50297149 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 50297188 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50297329 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 50297425 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 50297430 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 50297513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50297526 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 50297893 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50298159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50298350 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50298737 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50299334 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50301199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50301328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50301989 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50302190 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50303249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50303280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50303530 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50304820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50305822 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50306180 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50306517 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50306613 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50306655 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 50306962 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 50306980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50307356 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 50307505 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 50307519 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 50308259 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 50308381 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50308414 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 50308417 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 50308521 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50308553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50308803 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50309067 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 50309101 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 50309110 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 50309289 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 50309400 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 50309545 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 50309718 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50309958 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 50309980 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 50309982 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 50310217 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 50310673 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50310677 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50311852 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50312509 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50313010 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50315410 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50315584 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 50316202 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50316748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50316933 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50317187 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 50317334 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 19 50317444 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 50317550 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 50317719 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 50317727 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 50318022 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 50318047 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50318129 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50318134 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50318210 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50318353 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50318495 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50318599 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 50318809 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50320192 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50320355 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50320381 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50320585 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 50321018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50321046 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 50321695 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 50321726 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 50322063 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50322127 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50322136 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50322137 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50322197 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50322328 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50322535 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 50322540 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 50322721 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50322737 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 50322826 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50323066 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50323076 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 50323237 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50323362 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50323992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50323999 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50324125 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50324127 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50324245 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50324250 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50324282 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50324359 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 50324360 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 50324376 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50324387 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50324435 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50324472 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50324649 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50324783 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 50324999 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 50325018 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50325021 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50325459 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50325462 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50325510 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 50325765 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 50325911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50326179 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 50326263 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 50326286 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 50326544 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 50326570 C G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 50326585 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 50326600 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 50326689 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50326692 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50326732 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 50326827 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50326957 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50327123 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50327180 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50327195 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50327672 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50327698 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50327727 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50327951 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50328009 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50328054 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50328269 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50328289 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 50328318 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 50328330 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 50328337 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 50328367 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50328402 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50328475 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50328537 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50328563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50328622 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50328729 G T Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 19 50328735 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 50328750 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 50328763 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 50328813 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 50328837 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 50328854 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 50328930 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 50328983 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 50329003 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50329243 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50329301 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 50329525 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 50329535 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 50329591 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50329634 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 50329908 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 50329972 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50330012 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50330095 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50330147 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50330149 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50330160 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 50330171 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50330372 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 50330424 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50330439 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 50330633 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50330758 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 50330770 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 50330866 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 50330919 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 50331358 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 50331370 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 50331382 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 50331456 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50331460 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50331703 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50331797 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50332008 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 50332041 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50332076 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 50332097 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 50332795 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50333912 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50334396 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50336990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50337349 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50337479 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50337755 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 50338429 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 50338495 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50338544 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 50338577 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 50338613 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 50338629 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 50338802 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 50339725 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 50339731 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50339857 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50339972 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50340109 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50340285 G T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 19 50340311 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 50340481 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 50340533 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 50340552 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 50340566 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 50340606 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 50340689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50340924 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 19 50341048 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 19 50341142 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 18 22 2 14 4 19 50341594 G T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 19 50341938 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 50341944 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50342706 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 50342971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50343453 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 19 50343680 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 50343798 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 50343799 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50343862 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50343989 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 19 50344000 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50344017 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 19 50344030 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50344048 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 19 50344089 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 50344209 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 50344712 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50344783 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 19 50344891 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50344977 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50345264 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 50345418 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 50345421 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 50345560 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50345565 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 50345856 G T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 19 50346056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50347896 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50347989 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 50348034 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50348187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50351099 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 50352209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50352481 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 50352747 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50353299 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 50354037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50355594 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 50355968 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 19 50356285 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 50356350 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 50357093 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 19 50357140 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50357459 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50357461 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 50357762 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 50357808 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 50357826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50358074 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 50358096 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50358119 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50358563 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50358564 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50358634 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50358713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50358729 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50359273 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50359550 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50359582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50359618 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50359679 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 50359811 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50360101 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50360279 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50360306 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50360365 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 19 50360367 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 19 50360397 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50360407 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 19 50360462 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 50360465 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 50360595 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 50360613 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 50360642 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50360658 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 50360696 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50360777 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50360801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50360843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50360943 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 50360954 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50360987 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50361222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50361236 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50361671 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50361800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50361832 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 19 50361862 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50362062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50362905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50362930 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50363154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50363398 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50363826 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50363879 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 50364685 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 50364703 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50364783 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50365161 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50365298 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50365332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50365412 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50365797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50366199 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 50366201 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 50366634 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 50366649 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 50366654 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50366897 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 50366921 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 50367155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50367161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50367162 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50367168 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50367394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50367510 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 50367714 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50367797 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50368073 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 50368308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50368397 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50368428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50368431 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50368504 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50368708 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50368758 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50368836 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50369053 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50369064 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50369070 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 50369103 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50369151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50369378 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50369475 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50369588 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 50369607 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50369612 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 50370044 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 19 50370358 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50370741 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 50371170 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50371477 C T N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 19 50371822 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 50371835 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 50371867 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 50371880 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50372131 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 50372608 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50373033 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50373047 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50373187 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 50373635 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50374831 T C N Y 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 19 50375170 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50375190 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50375197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50376143 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50376184 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50376472 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50376769 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 19 50378549 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 50378654 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50378844 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50378845 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50378898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50379000 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 19 50379128 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 50379744 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50381507 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 50381551 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 50381575 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 50381590 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 50381888 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 50382161 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 50382359 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50382576 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 50382749 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 19 50382886 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50382945 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 50383087 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50383280 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 50383524 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 50383692 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 50383881 G T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 50384025 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 50384242 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50384346 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 50386465 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 50386792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50386954 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 50387306 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 19 50389641 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 50390562 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50391816 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50393327 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50394942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50395598 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 19 50395789 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50396117 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 50396935 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50397573 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50397729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50398966 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 50399057 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50400259 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 50400376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50401077 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 50401400 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 50401580 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 50401655 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50402012 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50402092 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 50402216 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50402281 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 50402364 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 50402373 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 50402583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50403311 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 50403487 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 19 50403800 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 50403901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50403936 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 50404157 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 50404218 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 19 50404233 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 50404433 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 50404876 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 19 50405215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50405625 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50406536 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 50406557 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50406694 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50406781 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 50406962 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 50407040 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50407111 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 50407304 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 50407361 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50407469 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 50407477 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 50407541 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 50407597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50407640 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 50407669 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50407708 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 50407739 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50407746 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 50407824 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50407830 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50407933 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 50408090 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50408157 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 50408229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50408290 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50408316 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 50408463 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 50408481 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 50408531 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 50408554 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 50408590 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 50408628 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 50408660 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 50408687 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50408744 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50408764 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 50408985 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 50409254 C A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 50409259 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 50409272 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 19 50409341 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 50409510 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 19 50409545 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50409553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50409565 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50409863 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50410126 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50410162 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50410176 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50410183 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50410317 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 50410401 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50410416 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50410822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50410940 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50410955 T C Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 19 50410965 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50411002 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50411057 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50411226 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50411278 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50411282 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50411290 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50411294 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50411310 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50411363 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50411371 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50411405 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50411430 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50411458 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50411472 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50411496 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50411544 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50411553 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50411604 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 50411625 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50411631 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50411672 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50411746 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50411764 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50411767 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50412016 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50412049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50412069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50412093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50412189 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50412304 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50412308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50412310 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50412398 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50412570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50412813 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50412917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50413194 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50413319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50413320 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50413418 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50413550 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 50413588 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50413736 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50413739 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50413839 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50414041 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50414151 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50414209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50414229 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 50414254 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 19 50414345 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50414363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50414440 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50414456 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50414473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50414554 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50414655 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 50414779 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50414845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50414871 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50414900 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50414907 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 50414910 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 50414947 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50414991 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50415003 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50415008 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 50415019 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 50415035 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 50415056 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50415075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50415450 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50415568 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50415574 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 50415616 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50415661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50415691 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50415693 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50415751 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50415863 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 50415867 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 50415989 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 50416012 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 50416055 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 50416063 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 50416145 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50416204 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 50416259 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 50416372 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 50416448 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 50416614 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50416635 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 50416738 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50416748 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50416904 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 50417101 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 50417127 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 50418755 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50418947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50419313 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50421415 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50421428 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50421920 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 50422477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50425510 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 19 50429376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50429467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50430745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50431733 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50432298 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50432397 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 50432489 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50432516 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50432541 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 50432641 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50432658 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50432677 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50432780 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 50432806 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 50432882 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50432935 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 50432972 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 50433010 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50433411 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50433445 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 50433447 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50434885 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 50436311 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 50436376 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 50436393 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 50436504 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 50436558 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 19 50436561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50436618 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50436748 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50436909 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 50436969 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 50438043 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50438054 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50438335 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50438524 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 50438544 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 19 50438637 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 19 50438679 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 50438730 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 19 50438739 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 19 50438860 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50438873 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50439076 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 19 50439107 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 19 50439164 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50439176 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 50439306 C A Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 19 50439437 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50440110 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 50440124 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 19 50440214 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50440239 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50440349 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 50440662 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50440699 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 50440896 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 19 50441019 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 50441068 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 50441369 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 19 50441733 C G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 50441815 G A Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 19 50441991 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 50441992 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 50442437 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 50442485 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50442511 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 50442604 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 50442791 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50443012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50443026 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 50443152 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 50443381 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 50443393 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 50443410 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 50443757 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 19 50443817 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 19 50443858 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 50444116 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 50444168 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 50444248 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 50444344 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50444572 C A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 50444621 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50444633 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 19 50444805 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 19 50444871 A T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 19 50444882 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 19 50445110 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 19 50445491 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50445806 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 50446873 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50447305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50447433 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50447434 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50448124 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50448757 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 19 50449045 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 19 50449362 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 50449411 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50449480 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50449730 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50450034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50450963 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50451410 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 50451439 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 50451728 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50451778 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 50451800 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50451869 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50452813 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50453200 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50453820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50454199 A C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 19 50454224 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 50454264 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 19 50454655 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50454790 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 50454850 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 50454950 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 50455357 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 50455378 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50455535 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50455541 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 50455555 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 19 50455616 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 50455947 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 50455962 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 50456042 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50456059 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 50456881 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 19 50456897 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50456912 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 50456984 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50457097 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50457122 G T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 50457338 G A N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 19 50457381 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 19 50457968 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50458136 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 50458141 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 50458159 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 50458164 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 50458210 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 19 50458218 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 50458571 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 50458699 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 50458738 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50458813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50459504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50461567 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50462226 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 50462587 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50463013 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 50463289 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 19 50463787 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 50465093 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50466015 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50467840 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50468376 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 50469651 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50469939 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 19 50470470 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50470483 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50470586 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50470889 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50471103 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 19 50471368 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 19 50471410 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 19 50471786 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50472030 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50472559 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50473105 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50473432 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50473813 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 50474035 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 19 50478208 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 19 50478274 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50478957 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50479171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50479188 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50479221 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50479227 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50479307 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50479330 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50479344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50479413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50479522 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50479641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50480330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50481226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50481677 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50481720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50481734 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50481741 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50481811 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50481837 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 50481877 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50481881 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50481926 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50482031 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50482068 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50482082 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50482110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50482658 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50482756 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50482839 C A Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 50482906 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50482967 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50482986 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50483089 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 50483253 A C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 50483265 C T Y Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 10 6 3 4 1 19 50483286 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 50483294 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 50483295 C T Y Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 19 50483334 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 50483358 G A Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 19 50483372 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 50483458 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50483588 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50484183 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50484197 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50484200 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50484235 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 50484239 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 50485355 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50485444 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 50485458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50485627 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50485812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50485813 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50485882 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50486181 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50486439 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 19 50486583 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 19 50486600 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50486649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50486923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50486998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50487028 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50487034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50487058 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 50487171 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 50487221 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 50487270 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 50487285 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 50487295 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 50487371 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 50487387 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 50487404 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 50487922 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 50487964 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 19 50488175 T G N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 19 50488401 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 50488806 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 50489043 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50489553 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 50493382 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50493447 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 50493725 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 50493766 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 50493878 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 19 50494130 G C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 50494180 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50494363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50494531 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50496345 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 50496830 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50496974 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 19 50496992 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50497002 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 50497044 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 50497300 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 50497315 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 19 50497347 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 19 50497366 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 50498015 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 50498324 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 50498963 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 50499672 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 19 50500280 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50500537 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 50500543 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 50507763 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 50508200 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50510112 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 50510751 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50510843 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50510904 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 19 50510949 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50511017 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 19 50511554 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 50512049 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 19 50512057 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 19 50512068 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 19 50512144 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50513154 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50513689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50513781 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50514704 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 50514768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50515086 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 50515088 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 50515101 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 19 50515155 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 50515290 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 50515698 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 19 50515906 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 50515934 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 50516068 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 19 50518671 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 19 50519192 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 19 50519356 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 50519364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50519502 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 50519698 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50520066 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50520585 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 19 50520768 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50521842 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 50521915 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 50522244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50522474 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 50522559 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 50522679 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 50522717 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 50522721 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 50523083 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 50523188 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50523647 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 50523717 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 50523887 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 50524100 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 50524130 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 50524182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50524216 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50524272 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50524306 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 50524336 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 50524491 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50524522 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50524563 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 50524564 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 50524566 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50524589 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 50524621 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50524677 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 50524772 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 50525024 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 50525771 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 50526654 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 19 50526828 G T N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.266666666666667 0.666666666666667 0.0666666666666667 18 12 4 10 1 19 50526849 G C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 19 50527066 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 19 50527091 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 50527246 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 19 50527251 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 19 50527257 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 19 50527294 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 50527506 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 50527726 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 19 50528046 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 19 50528122 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 50528188 T C N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.0666666666666667 0.733333333333333 0.2 13 17 1 11 3 19 50528309 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 50528348 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 19 50528445 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 19 50528533 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 50528540 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 19 50528696 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 50528765 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 50528791 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 19 50528820 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 19 50528893 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 19 50529303 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 50529667 A G N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 19 50529755 T G N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 19 50530089 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50533049 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50533696 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50534503 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 19 50534504 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 50535404 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 50535497 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 50535586 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 50535661 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 50536011 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 19 50536316 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 19 50536866 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50537155 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 50537311 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 50537378 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 50537393 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 50537475 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 50537571 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 50537635 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 19 50537782 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50537977 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 50538014 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50538038 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 50538064 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 50538094 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 50538128 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 50538156 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 50538157 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 50538188 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 50538254 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 50538342 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 50538472 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50538560 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 50538623 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 50538633 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 50538707 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 19 50539052 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 50539115 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 19 50539223 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50539246 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 50539252 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 50539267 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 50539495 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 50539577 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 50539613 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50539700 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50539849 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 50539872 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 50539908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50539909 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50539994 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50540049 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 50540068 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50540071 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50540607 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 50540729 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 50541347 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 50541420 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 50541522 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50541541 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 50541600 T C N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 19 50542064 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 50542069 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 50542141 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 50542204 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 50542233 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 50542295 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 50542591 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 50543347 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50543668 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 19 50543669 A T N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 19 50543672 G A N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 19 50543741 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 50543904 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 50543910 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 50544341 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 50544359 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 50544391 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 50544400 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 50544440 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 50544456 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 50545239 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 50545242 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 50545302 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 50545534 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 50545571 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 50545732 A G N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 19 50545762 C G N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 19 50545820 T C N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 19 50545860 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 19 50545998 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 50546094 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 50546134 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 50546217 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 19 50546573 C T N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.181818181818182 0.545454545454545 0.272727272727273 10 12 2 6 3 19 50546655 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 50546745 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 50546930 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 50546953 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 50546981 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 50546986 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 50547239 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 50547265 A T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 50547361 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 50548047 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 50548137 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 50548298 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 50548689 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 50550078 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 50550147 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 19 50550520 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50550534 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 50550579 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50550623 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 50550694 G T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 50550754 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50550796 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 50550828 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 50550861 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 50550914 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50550969 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50550997 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 50551077 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 50551349 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 50551641 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 50552296 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.466666666666667 0.2 0.333333333333333 17 13 7 3 5 19 50552677 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 50552695 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 50552747 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 50552774 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 50552800 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 50552801 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 50552804 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 50552830 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 50553338 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 50553341 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 50553474 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 19 50553475 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 19 50553485 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 19 50553536 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 19 50553549 G C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 19 50553552 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 50553572 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 50554090 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 50554372 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 50554492 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 19 50554536 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50554564 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50555467 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 19 50555652 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 50555653 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 50555735 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 50555805 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 50556141 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 50556161 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 50556172 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 50556216 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 50556362 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50556530 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 50556531 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 50556546 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50556565 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50556604 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50556617 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 50556735 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50556907 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 50556938 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 50557197 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 19 50557330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50557524 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50557536 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 19 50557547 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 50557597 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50558120 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 50558546 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 50558553 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 50558839 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50558938 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 50559082 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 50559095 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 50559114 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 50559119 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 50559134 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 50559138 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 50559210 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 50559243 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 50559342 G C Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 19 50559363 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 50559377 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 50559446 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50559774 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50560182 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 50560241 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 50560252 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 50560327 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 50560687 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50560955 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 50561071 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 50561266 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 50561318 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 50561678 T A N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 19 50561901 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 50561958 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 50561965 G C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 50562190 G A N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 19 50562445 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 50562462 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 50562496 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 50562576 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 50562587 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 50562589 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50562625 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50562653 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 50562836 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 50562907 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 50562911 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50562918 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50562919 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 50563032 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50563079 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 50563483 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 50563520 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 50563527 T G Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 50563592 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 50563662 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 50563678 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 50563711 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 50563729 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50563879 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 19 50563899 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 50564016 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50564171 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50564255 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50564305 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50564546 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50564576 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50564579 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50564600 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 50564618 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 50564894 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50564913 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 50564914 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 50564925 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50564928 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50565004 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 50565054 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 50565189 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 50565511 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 50565539 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 50565748 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50565904 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 50565916 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 50566298 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50566366 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 50566367 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 50566378 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 50566403 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 50566417 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 50566580 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50566593 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 50566637 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50566640 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50566724 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 19 50566741 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 19 50566748 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 50566814 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 50566818 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 50566866 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 50566882 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 50566940 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 50566999 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 50567022 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 50567058 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 50567094 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 50567105 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50567109 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50567320 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 50567486 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50567769 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50567906 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50567916 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 50567923 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50567999 C T Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 19 50568050 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 50568230 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 50568316 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50568499 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 19 50568636 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 19 50568702 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 19 50568732 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 50568874 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 50568888 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50568908 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50569113 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50570949 C G N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 19 50570975 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 19 50570976 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 19 50571014 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 50571196 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 50571224 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 50571245 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 50571248 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 50571276 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 50571301 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 50571304 C A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 19 50571601 A T N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 19 50571766 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50572105 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 50572109 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 50572190 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 19 50572359 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 50572360 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 50572385 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 50572403 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 50572410 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 50572496 A T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 19 50572507 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 50572526 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 19 50572578 A T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 19 50572579 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 50572613 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 19 50572684 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 19 50572703 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 50572704 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 50572862 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 50572882 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 50572905 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 50572920 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 50572965 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 50572991 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50573011 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50573155 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50573228 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 50573328 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 50573382 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 50573472 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50573514 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 50573561 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 50573606 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50573647 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 50573768 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50573770 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50573805 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 50573816 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 50573831 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 50574071 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 50574211 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 50574228 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 50574232 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 50574317 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 50574396 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 50574435 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50574639 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 50574645 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 50574662 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 50574716 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 50574717 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 19 50574965 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 19 50575077 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 50575140 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50575141 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50575170 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 50575214 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50575237 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50575291 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50575300 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50575306 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50575330 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50575485 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 50575544 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 50575546 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 50575619 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 50575710 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 50575715 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 50575802 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 50575892 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50575923 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 50575952 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50576068 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50576087 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50576090 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50576137 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50576158 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50576281 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 50576289 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 50576304 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 50576337 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 50576344 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 50576458 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 50576495 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 50576674 A C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 19 50576829 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 50577016 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 50577259 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 50577275 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 50577288 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 50577308 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 50577384 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 50577440 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 50577442 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 50577517 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 50577629 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 50577703 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 50577794 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 50577844 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 50577845 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 50577931 G C Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 50577987 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 50578010 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 50578162 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 50578167 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50578171 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50578181 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50578767 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 50578768 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 50578861 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 50578909 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 50579075 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 50579478 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 50579481 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 50579522 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 50580041 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 50580119 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 50581545 G T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 50581546 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 50581714 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50581863 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50581867 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 50582111 C A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 50582454 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50582727 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 50582926 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50583045 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50583090 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50583107 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50583334 T G Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 50583341 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50583354 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 50583389 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 50584076 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50584107 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50584451 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50584527 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 50584691 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 50584810 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50585138 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 50585153 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50585961 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50586399 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50586460 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 50586671 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50586742 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50586814 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50587104 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50587205 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50587237 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 50587295 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50587550 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 50587593 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50587658 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50587706 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 50587825 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50587946 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50587968 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 50587997 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 50588040 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 50588089 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50588190 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50588230 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 50588272 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50588367 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50588831 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50589111 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50589615 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50589617 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50589682 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50589860 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50589901 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50589942 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50590003 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50590051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50590087 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50590468 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50590541 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50590542 G C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 50590545 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50590578 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50590617 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50590626 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50590689 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50590701 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 50591083 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50591144 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 50591265 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50591296 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 50591306 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50591432 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50591561 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50591633 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50591981 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50592219 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 50592233 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 50592274 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50592373 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 50592595 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 50592623 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 50592643 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 50592654 T C Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 19 50592799 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 50592897 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50592929 A C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 50593143 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 50593193 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50593255 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50593261 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50593289 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50593350 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50593356 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50593422 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50593494 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50593554 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50593559 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50593628 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50593671 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50593700 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50593707 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50593734 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 50593772 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50593811 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 19 50593947 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 50593948 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50594069 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50594101 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 50594102 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 50594121 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50594152 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50594174 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50594189 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 50594232 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 50594399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50594534 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50594537 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50594546 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50594599 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50594601 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50594696 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 50594709 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 50594715 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 50594731 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50594813 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50594891 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 50594962 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 50595227 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 50595357 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50595369 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50595407 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50595488 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 50595498 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 50595725 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 50595830 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 50595839 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50595878 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50595885 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50596843 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50596933 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50597515 C G Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 50597835 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50598151 T A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 50598280 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50598373 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50598847 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50598862 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 50598896 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50598904 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 50598925 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50598926 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 50598951 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50599002 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 50599086 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 50599102 T C Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 50599149 T G Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 50599150 C A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 50599210 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 50599244 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 50599262 A T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 50599452 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50599516 C A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 50599656 A G Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 50599683 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 50599692 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50599695 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 50599772 A T Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 50599797 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 50600017 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 50600038 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 50600089 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 50600112 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 50600215 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50600335 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 50600336 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 50600367 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50600463 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50600468 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50600516 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50600589 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50601078 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50601213 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50601326 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50601440 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 50601451 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 50601879 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50601910 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50602187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50602388 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50602408 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50602426 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50602503 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50602511 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50602649 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50602673 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50602676 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50602725 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50602741 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50602758 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50602818 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 50602922 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 50602956 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 50602962 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 50602963 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50602970 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 19 50602975 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 50603011 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50603017 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50603025 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50603085 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 50603395 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 19 50603490 A G N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 19 50603538 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 50603550 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 50603595 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50603651 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 50603661 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50603701 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50603714 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50603729 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 50603732 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50603755 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50603775 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50603802 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50603850 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 50603864 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50603954 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50604021 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 50604121 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50604130 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50604156 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50604217 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50604256 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 50604310 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 50604379 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50604398 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 50604399 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 50604498 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50604505 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50604571 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50604667 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50604713 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 50604731 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50604805 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 50604891 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50605059 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 50605287 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50605784 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50605852 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 50605916 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50606202 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50606444 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 50606481 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50606501 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50606533 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50606621 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50606660 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50606885 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50607244 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 50607289 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50607398 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50608042 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 19 50608095 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50608166 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50608191 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50608365 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50608462 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 50608717 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 50609626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50609628 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50609702 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50609881 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 50609890 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 50609924 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50609940 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50610012 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50610030 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 50610052 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50610075 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 50610177 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50610183 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50610198 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 50610232 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 50610318 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50610424 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50610490 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50610535 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 19 50610611 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50610684 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 50610699 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50610701 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 50610709 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 50610712 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 50610716 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 50610717 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 50610741 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50610794 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50610837 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 50610888 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 50610936 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50610959 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 50611009 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50611013 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50611065 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50611157 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50611177 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50611179 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50611188 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50611200 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 50611204 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 50611227 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 50611285 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50611307 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50611645 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50611658 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50611902 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 50612004 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50612119 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50612156 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50612225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50612246 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50612309 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50612376 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50612421 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50612516 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50612780 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50612819 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 50612873 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 50612905 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 50612913 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 50613100 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 50613342 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 50613440 T A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 19 50613554 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 50613763 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 19 50613992 G A N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 19 50614260 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50614307 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 50614580 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50614760 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 50615594 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50615619 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 50615634 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50615838 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 50616124 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 50616152 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 50616153 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 50616206 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50616790 T C N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 19 50616829 C A N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 19 50617201 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50617223 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50617252 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 50617296 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50617429 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 50617512 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 50617538 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50617540 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 50617564 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 50617625 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50617822 G C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 50617829 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50617891 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 50617915 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 50618324 G A N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 19 50618356 G C N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 19 50618448 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 50618466 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 50618891 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 50618906 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 50618918 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50618925 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 50618939 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 50619000 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 50619078 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50619176 A C N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 19 50619245 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50619347 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50619373 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50619802 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50620088 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50620137 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50620220 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 50620290 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50620595 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 50620968 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 50621439 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50621581 A T N N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.1 0.8 0.1 10 10 1 8 1 19 50621647 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 50621663 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 50623261 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50623304 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50623817 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50623911 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50624363 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50624380 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50624855 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50625079 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 50625302 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 50632705 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 50632894 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 50632947 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 50633330 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50633410 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 50633645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50633751 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 50633761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50633792 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50633866 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 50633997 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 50634196 C G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 50634281 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 50634791 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50634826 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 50634838 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 50634842 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50634876 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 50634923 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 50635036 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50635525 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 50635635 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 50635803 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 19 50635850 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 19 50635904 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 50636105 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 50636332 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50636333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50636521 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 50636553 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 50636612 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 50636696 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50636876 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50636953 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 50637160 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50637213 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50637255 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50637360 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 50637367 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 50637419 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50637442 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50637446 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50637621 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 50637676 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 50637846 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 50637889 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 50637912 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50637930 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 50637966 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 50637993 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50638007 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 50638042 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 50638106 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 50638120 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 50638125 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 50638394 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50638433 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 50638540 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 50638597 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 19 50638626 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 19 50638712 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 50638805 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 50638946 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50638980 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 50639078 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 50639304 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 50639536 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 50639613 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50639654 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 50639812 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50639819 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 50639832 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 50639841 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 50639959 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 50639965 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 50640072 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 50640081 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 50640116 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 50640144 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 50640212 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 50640413 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50640419 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50640511 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50640602 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 50640796 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50640801 A T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 19 50640983 G T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 19 50640993 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 50641127 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 50641230 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50641290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50641333 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50641563 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 50641613 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 50641694 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50641874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50642011 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50642053 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 50642063 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50642088 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 50642096 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 50642112 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50642169 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 50642170 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 50642230 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50642240 G C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 50642247 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 50642353 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50642382 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50642388 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50642410 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 50642504 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 50642625 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 50642701 C A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 19 50642750 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 50642798 C A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 50642954 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 50643046 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 19 50643067 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50643155 A T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 19 50643229 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50643346 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 50643354 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 50643562 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50643585 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50643617 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50643650 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50643684 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50643984 C T N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 19 50644011 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 50644013 G A N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 19 50644070 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 50644268 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 50644443 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50644606 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50644681 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50644788 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50644839 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50644985 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50644987 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50645012 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50645108 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 50645346 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 50645361 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 50645436 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 50645544 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 50645755 C G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 50645770 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 19 50646118 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50646194 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 50646241 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50646568 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50646754 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50646966 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50647068 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 50647407 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50647633 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50648133 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50648165 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50648202 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50648204 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50648487 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50648695 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 50648989 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50649021 C G Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50649184 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50649365 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50649595 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50649623 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 50649754 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 50649788 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50649811 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50649925 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50650028 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50650050 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 50650172 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 50650236 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 50650358 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50650601 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 50650845 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50650851 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50650854 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50650939 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50651314 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50651417 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50651421 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50651422 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 50651649 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50651675 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50651717 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50651724 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50651727 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50651744 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50651854 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 50651892 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 50651893 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50651927 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50651999 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50652031 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50652051 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 50652060 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50652117 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50652509 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 50652668 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50652809 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 50652943 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 50653041 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 50653137 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50653504 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 50653533 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 50654115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50654452 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50654504 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 50654510 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50654564 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50654821 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 50655013 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 50655156 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 19 50655164 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 50655204 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 50655364 A T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 19 50655368 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 19 50655390 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 19 50655827 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 50655835 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 50655861 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50655871 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 50655922 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 50655941 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 50656094 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 50656336 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50656421 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50656446 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 50656784 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50656794 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 50656900 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 50656935 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 50656969 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 50656981 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 50656998 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 50657340 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 50657745 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 50658024 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 50658463 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50658616 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 50658649 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 50658836 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50659163 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 50659447 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50659474 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 50659502 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 50659528 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 50659529 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 50659592 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 50659606 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 50659625 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 50659630 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 50659635 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 50659703 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50659720 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 50659765 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50659875 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 50660012 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 50660119 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 19 50660162 A T N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.230769230769231 0.538461538461538 0.230769230769231 13 13 3 7 3 19 50660249 T G N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 50660449 C A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 19 50660488 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 50660493 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 19 50660495 A C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 19 50660567 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 50660676 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 50660691 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 50660848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50660904 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50661213 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 50661247 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 50661306 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 50661333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50661341 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 50661390 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 50661447 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 50661571 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 50661611 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 50661651 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 50661694 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 50661951 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 50662065 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 50662115 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 50662736 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50662750 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50662961 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 50663041 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 50663042 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 50663076 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 50663202 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 50663460 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 50663842 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 50664064 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 50664078 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 50664405 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 19 50664408 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 50664642 T A N N 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 19 50664793 A T N N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.142857142857143 0.714285714285714 0.142857142857143 7 7 1 5 1 19 50664807 T A N N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.142857142857143 0.714285714285714 0.142857142857143 7 7 1 5 1 19 50664819 C A N N 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 7 9 1 5 2 19 50664902 A C N N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 19 50665074 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 50665127 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50665149 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50665262 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50665263 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50665296 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 50665357 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50665449 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50665450 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 50665555 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50665582 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 50665588 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50665610 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50665675 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50665699 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50665762 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50665906 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 50666016 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 50666039 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 50666119 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 50666162 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 50666227 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50666246 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 50666247 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 50666264 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 50666312 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 50666315 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 50666328 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50666331 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50666333 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50666336 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 50666441 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 50666732 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50666850 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 50666870 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 50666875 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 50667061 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 50667282 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 50667393 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50667394 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 50667880 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 50668363 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 50668533 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50668618 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50668722 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50668803 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50668881 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50668991 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 50669303 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 50669349 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50669351 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 50669434 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 50669452 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50669483 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50669727 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50669730 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 50669769 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50669884 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50669886 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50670105 G T N N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 19 50670111 C T N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 19 50670585 G C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50671007 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50671088 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50671100 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50671109 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 50671136 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50671194 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 19 50671325 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 50671430 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 50671669 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 50671795 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50671962 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 50672022 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 50672120 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50672170 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 50672287 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 50672329 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50672373 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50672375 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50672513 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50672563 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50672564 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50672620 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50672690 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50672759 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 50672766 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 50672772 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 50672790 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 50676494 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 50676509 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50676591 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50676597 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50676614 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50676641 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 50676673 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50676734 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50676737 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50676756 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 50676780 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50676830 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50676854 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50677000 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50677145 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50677153 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50677463 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 50677473 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 50677498 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 50677530 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 50677668 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 50677761 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 50677840 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50677945 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50678001 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 50678020 C G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 50678124 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 50678321 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50678337 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50678346 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50678379 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50678469 G T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 50678486 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50678623 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50678677 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50678799 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50678846 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50678848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50678866 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50678901 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50679269 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50679282 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50679343 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 50679369 T A Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 50679377 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50679389 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 50679391 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 50679421 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 50679490 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 50679768 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50679799 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50680145 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50680149 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 50680225 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50680261 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50680498 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50680510 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 50680564 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50680679 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50680762 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50680943 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 50681223 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50681273 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50681452 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50681503 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50681790 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50681953 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50682393 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50682746 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50682775 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50682821 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 50682835 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50683108 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50683426 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 50683445 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50683671 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50683851 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50684369 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50684403 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 50685165 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50685475 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50685601 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50685834 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 50685887 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50685912 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50685913 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50687616 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 50687688 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 50687815 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50687863 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50687977 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 50688034 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50688079 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50688103 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50688245 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 50688286 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 50688317 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50688509 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50688590 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50688821 T A Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50688832 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 50688849 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50689044 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50689135 T A Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50689150 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50689495 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 50689864 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50689897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50690111 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 50690249 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 50690277 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 50690370 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50690628 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50690774 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50691146 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50691151 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50691204 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 19 50691438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50691445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50691548 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50691582 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50692266 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 19 50692532 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50692914 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50693261 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50693275 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 50693498 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50693780 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 50694189 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 50694210 A C N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 19 50694281 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50694529 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50694721 T C Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 50695220 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50695263 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50695358 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50695443 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50695448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50695518 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50695526 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50695723 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50695743 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50695758 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 50695802 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50695869 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 50696121 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50696185 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50696302 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50696656 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 50696934 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 50699099 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50699991 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 50700186 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 50700387 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50700633 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 50700887 A T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 50701667 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50701744 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 50704033 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50704138 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50704173 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 50704191 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50704373 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50704382 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 50704384 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 50704391 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50704614 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 50704629 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 50704630 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 50704635 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 50704652 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 50704766 A T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 50704776 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 50705212 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50705406 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50705471 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 50705476 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50705755 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50705804 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 50705869 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50705941 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50706151 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50706171 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 50706398 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 50706487 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 50706848 A G N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 9 9 3 3 3 19 50707057 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50707685 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50708210 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 50708250 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50708321 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 50708326 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50708475 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 50708820 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50709174 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50709179 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50709683 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50710049 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50710131 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 50710149 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 50710478 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50710587 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50710596 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50710711 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 50710966 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 50711130 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50711170 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50711328 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50711433 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50711913 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 50711936 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50711988 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50712237 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50712298 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50712308 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50712309 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50712537 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50712585 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50712645 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50712897 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50713161 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50713211 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50713230 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 50713349 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 50713752 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 50714132 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 50714140 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50714219 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 50714242 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 50714429 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50714710 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 50714750 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 50714788 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50714828 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50714829 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50714976 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50715011 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50715039 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50715114 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50715129 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50715374 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 50715376 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50715483 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50715486 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50715562 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50715618 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50715728 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50715850 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 50715935 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50715961 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 50715985 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 50716083 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50716088 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50716118 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50716134 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 50716214 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50716343 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 50716526 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50716530 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50716705 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50717017 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 50717046 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50717056 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50717080 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50717099 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50717405 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50717414 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50717421 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50717422 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50717485 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50717520 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50717529 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50717595 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50717603 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 50717639 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 50717657 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 50717707 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50717732 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 50717833 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 50717836 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50717956 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50718038 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50718049 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 50718251 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50718301 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 50718561 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50718626 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50719075 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 50719268 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50719314 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 50719330 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50719490 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50719611 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50719693 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50719759 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50719796 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50719819 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50719854 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 50719898 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50719941 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50719942 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50720020 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50720049 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50720079 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50720086 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50720091 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 50720131 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50720177 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 50720218 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50720227 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 50720233 T G N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 19 50720236 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 50720312 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50720323 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50720336 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50720354 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 50720432 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50720637 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50720786 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 50720793 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 50721028 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50721030 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50721048 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50721070 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50721143 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50721173 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50721174 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50721391 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50721503 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50721532 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50721553 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 50721562 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 50721595 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50721639 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 50721652 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50721715 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50721719 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50721792 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50721813 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50721833 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50721856 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50721933 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 50722247 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 50722402 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50722405 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50722681 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50722696 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 50722699 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50722812 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 50723327 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 50723329 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 50723372 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 50723484 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50723522 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50723556 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50723598 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 50723716 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50723924 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50724069 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50724081 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50724109 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50724227 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 50724374 C G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50724406 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50724467 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50724552 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 50724809 C G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50724970 T A Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50725136 T G Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 50725455 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50725628 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50725720 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50725755 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50725799 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 50725839 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50726147 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 50726256 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50727045 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 50727364 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50727835 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50728031 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 50728231 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 50728232 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 50728368 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 50728404 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50728408 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50728410 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 50728420 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50728497 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 50728502 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 50728544 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 50728563 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 50728670 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 50728907 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50729044 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50729055 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 50729133 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 50729468 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 50729671 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 50729846 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50729921 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50730108 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50730122 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 50730312 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 50730318 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 50730562 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 50730679 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 50730768 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50730803 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50730907 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50731173 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50731308 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 50731339 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50731384 C T Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 50731420 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50731448 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50731478 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50731494 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50731600 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50731639 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50731729 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50731769 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 50731966 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 50732235 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50732334 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50732339 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50732363 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50732381 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 50732419 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 50732455 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50732538 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 50732539 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 50732557 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50732558 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50732663 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50732678 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50732749 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50732896 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50732948 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 50732961 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50732994 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50733025 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50733046 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50733101 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50733152 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50733167 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50733261 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50733308 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50733384 T A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 50733450 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50733462 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50733487 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50733642 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50733736 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50733753 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50733763 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50733805 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50734038 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50734281 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50734335 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50734417 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50734915 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 50735115 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 50735140 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50735387 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 50735515 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 50735620 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50735624 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50735716 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 50735751 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50735822 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 50736198 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50736248 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50738995 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50739031 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50739123 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50739164 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50739185 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50739186 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50739193 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50739600 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50739788 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 19 50739982 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50739983 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 50740045 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50740052 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50740161 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50740352 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50740652 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 50740721 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 50740810 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 50740841 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 50740850 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 50740863 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 50740874 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 50740884 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 50740951 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50740991 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50741201 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50741721 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50741955 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50742017 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50742194 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 50742588 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50743245 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50743260 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50743417 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 50743440 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 50743730 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50743767 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50743771 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50743931 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 50743937 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 50743938 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50743947 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50743960 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50744232 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 50744388 G T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 50744444 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50744607 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50744668 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50744683 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50744684 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50744734 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50744781 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50744840 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50744935 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50745225 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50745309 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50745944 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50746351 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 50746438 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50746677 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50746684 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50746779 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50746789 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50746809 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 50746821 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50746822 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 50746841 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 50746955 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 50746978 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50746990 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50747026 G T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 19 50747036 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50747082 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50747274 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50747330 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50747447 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50747496 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50747546 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50747687 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50747694 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50747696 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50747889 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50748073 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50748108 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50748118 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50748119 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50748164 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50748218 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50748244 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50748282 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50748283 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50748391 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50748392 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50748404 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50748606 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50748628 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50748661 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50748686 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50748752 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50748757 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50748785 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50748880 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50748991 C A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 50749002 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 50749128 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50749130 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50749188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50749250 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50749651 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50749666 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50749718 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50749969 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50750021 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 50750130 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50750215 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 50750249 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50750331 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50750427 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50750592 T C N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 19 50750995 A T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 50751010 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 50751021 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 50751074 C A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50751114 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50751146 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50751175 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50751181 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50751819 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 50751827 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 19 50751927 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50752029 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50752063 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50752091 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 50752094 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 50752104 T C N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 19 50752194 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 50752218 A T N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 19 50752527 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50752651 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 50752662 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50752704 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50752804 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50753843 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50753862 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50754271 C A Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 19 50754272 A T Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 19 50754469 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50754631 G T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 50754760 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 50754931 A G Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 19 50755022 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 50755056 A G Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 19 50755113 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 50755115 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 50755138 G A Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 19 50755143 A T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 19 50755283 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 19 50755358 A C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 50755447 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 50755468 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 50755593 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50755607 A T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50755749 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50755889 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 50755951 G T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50756031 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50756034 G A Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 50756035 T C Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 50756056 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 50756097 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 19 50756177 T G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50756215 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50756356 C T Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 50756513 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 50756597 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50756619 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50756751 C T Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 50756757 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 50756788 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50756795 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 50756803 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 50756847 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50756877 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50756904 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 50756939 T G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50757006 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50757033 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50757044 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50757057 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50757066 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50757118 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50757125 A C Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 50757288 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50757298 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50757379 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50757380 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50757473 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50757474 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50757478 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50757490 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50757501 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50757504 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50757591 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50757609 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50757636 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 50757707 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50757735 C A Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50757738 T A Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50757807 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50757808 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50757990 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50758159 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50758198 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50758240 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50758246 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50758252 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50758293 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50758330 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50758344 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50758366 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50758392 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50758422 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50758467 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 50758481 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 50758520 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50758529 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50758724 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50758740 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50758797 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50758804 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50758813 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50758832 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50758857 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50758858 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50758871 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50758971 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50758975 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50759014 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50759140 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50759160 G T Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 50759200 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50759220 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50759306 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50759315 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50759352 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50759411 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50759542 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50759624 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50759636 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50759641 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50759668 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50759702 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50759710 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50759866 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 50759952 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 50759996 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 50760096 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 50760105 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 50760141 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 19 50760157 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 50760167 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 50760197 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 50760268 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 50760275 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 50760298 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 50760381 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 50760504 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50760545 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50760763 C A N N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 19 50761039 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50761047 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50761091 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50761158 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50761166 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50761180 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50761185 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50761239 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50761361 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50761433 G C N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 19 50761445 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 50761478 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50761521 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50761526 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 50761527 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 50761588 G T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 50761634 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50761635 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 50761679 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 50761748 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 50761759 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 19 50761911 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 50761966 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 50762421 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 50762881 C T N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 19 50762888 C T N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 19 50762895 C T N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 19 50762975 A T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.4375 0.1875 0.375 17 15 7 3 6 19 50763062 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50763295 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 50763542 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50763548 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50763562 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 50763564 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50763609 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50763624 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 50763663 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50763729 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 50763753 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 50763755 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50763757 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50763761 C A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 50763781 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 50763980 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50764005 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50764007 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50764170 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 50764188 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50764191 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 50764208 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 19 50764337 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 50764520 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 50764713 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 50764841 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 50764852 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 50764881 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 50764885 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 50764950 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 50764960 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 50764961 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 50765089 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 50765228 A C N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5 0.1875 0.3125 19 13 8 3 5 19 50765314 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 50765315 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 50765331 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 50765339 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 50765471 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 50765526 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50765527 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 50765551 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 50765633 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 50765651 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 50765652 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 50765658 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 50765664 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 19 50765705 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 50765800 G A N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 15 15 6 3 6 19 50765822 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 50765894 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 50765933 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 50765994 G A N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.538461538461538 0.153846153846154 0.307692307692308 16 10 7 2 4 19 50766035 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 50766167 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 50766169 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 50766197 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.6 0.133333333333333 0.266666666666667 20 10 9 2 4 19 50766258 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 50766261 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 19 50766289 C T N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 19 50766395 C A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 19 50766401 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 19 50766473 C A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 19 50766503 G T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 50766534 G T N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 19 50766537 T A N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 19 50766555 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 19 50766605 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 19 50766618 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 50766652 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 50766675 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50766717 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 50766759 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 50766843 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 50766891 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 50766940 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 50766987 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 50766991 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 50767005 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 50767040 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 50767101 G T N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 19 50767114 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 50767115 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 50767172 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 50767246 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50767485 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 50767543 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 50767544 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 50767575 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50767585 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50767586 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50767768 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 50767869 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 50767949 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 50767986 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 50767998 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 50768014 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 50768056 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 50768216 C G N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 19 50768227 C G N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 19 50768230 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 50768240 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 50768255 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 50768281 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 50768300 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 19 50768394 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 50768398 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 50768441 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 50768469 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 50768525 C T Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 19 50768549 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 19 50768711 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50768762 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 50768793 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50768978 T C Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50768996 T G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50769008 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50769041 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50769170 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50769179 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50769262 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50769492 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 50769608 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50769796 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 0.117647058823529 0.352941176470588 20 14 9 2 6 19 50770167 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 19 50770308 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 19 50770313 T C Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 19 50770320 C A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 19 50770357 T C Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 19 50770456 T C Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 19 50770471 C A N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 19 50770544 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50770570 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 50770583 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 50770594 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 50770630 T G Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 50770737 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50770819 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50770840 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 50770852 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 50770890 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 50770893 G T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 50770895 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 50770961 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 50770997 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 50771057 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 50771060 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 50771262 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50771484 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 50771530 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50771895 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50772012 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50772180 T C Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 50772264 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50772290 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50772305 A T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50772527 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50772698 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 50772739 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50772787 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50772806 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 50773848 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50773898 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50773911 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50773936 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50774255 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 50774347 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 50774441 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 50774484 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 19 50774649 A T Y N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 19 50774936 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 50774995 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 50774996 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 50775059 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50775276 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 50775430 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50775438 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50775449 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50775510 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50775526 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50775545 T C Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 50775786 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 50776062 C T Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 50776163 T G Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 50776171 A G Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50776185 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50776199 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50776205 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50776282 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 50776363 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50776399 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50776429 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50776430 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50776465 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 50776482 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50776508 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50776517 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 50776525 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50776612 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50776719 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 50776738 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 50776744 T A N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 19 50776846 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 50776903 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 50776922 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 50777096 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50777137 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 50777175 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50777184 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50777224 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50777288 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50777289 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50777342 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50777396 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50777451 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50777649 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50777731 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50777786 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50777859 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 50777902 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50778306 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50778376 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50778425 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50778506 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50778668 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50778814 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 50778833 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 50778961 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 10 14 4 2 6 19 50779078 A T N N 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 19 50779098 G A N Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 19 50779161 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 8 10 2 4 3 19 50779163 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 8 10 2 4 3 19 50779166 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 8 10 2 4 3 19 50779250 A C N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 19 50779256 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 19 50779607 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 50779608 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50779724 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50779781 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50779814 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50779898 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50779977 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50780116 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50780241 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50780270 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 50780397 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 50780491 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50780541 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50780542 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50780579 T G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50780800 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 50780819 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 50780959 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 50781035 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 50781085 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50781159 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 50781250 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 50781290 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 50781526 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 50781585 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 50781742 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 50781780 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50781816 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50781833 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50782042 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 50782124 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50782190 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50782205 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 50782211 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 50782407 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50782577 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50782585 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 50782651 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 50782734 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 50782745 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50782821 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50782893 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50782900 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50782926 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50782933 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50782943 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50783108 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50783163 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 50783359 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 50783382 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50783422 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50783452 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50783461 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50783490 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50783507 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 50783546 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 50783586 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 50783841 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50783958 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50783990 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50784114 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50784258 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50784329 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 50784456 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 50784513 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50784549 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50784576 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 50784671 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50784790 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 50785021 G T N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 19 50785129 A T N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.230769230769231 0.538461538461538 0.230769230769231 13 13 3 7 3 19 50785229 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 19 50785612 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 50785642 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 50785679 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 50786055 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 19 50786210 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 50786789 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 50786864 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 50787101 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50787256 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50787393 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 50787421 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 50787594 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50787671 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 50787799 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50787841 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50787898 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50787961 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50787997 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50788184 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50788186 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50788318 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50788376 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 50788415 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50788606 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50788607 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50788639 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50788729 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50788915 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50788976 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 19 50789330 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50789352 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50789353 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50789468 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50789572 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50789806 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50789834 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50790021 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50790077 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50790094 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50790157 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50790173 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50790199 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50790281 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50790332 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50790401 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50790604 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50790637 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50790877 C A N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 19 50791014 A T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 19 50791065 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50791130 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 50791323 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 50791420 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50791668 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 50791671 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 50791815 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 19 50791862 C G N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 19 50791865 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 19 50791891 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 19 50792005 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 50792028 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 50792104 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 50792118 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 50792195 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 50792357 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 50792393 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 50792431 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50792432 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50792442 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50792549 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 50792562 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50792711 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 50792726 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 50792739 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 50792778 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50792779 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50792781 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 50792913 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50792963 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50792976 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50793013 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 50793109 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 50793168 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 50793170 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 50793310 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 50793523 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 50793754 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 50793970 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 50794041 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50794056 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 50794094 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 50794152 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50794155 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 50794220 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 50794227 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 50794387 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 50794550 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50794614 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 50794661 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 50794695 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 50794696 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 50794755 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 50794782 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 50794817 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 50794824 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 50794915 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 50794916 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 50795160 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50795308 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 50795443 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50795472 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 50795718 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 50795985 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 50796559 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50796609 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 50797214 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 50797287 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50799041 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50799163 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50799474 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50799545 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 50799574 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50799705 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 19 50799720 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 50800198 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 50800258 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50800301 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 50800455 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 50800624 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 19 50801605 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 50801712 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50801721 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 50801732 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50801746 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50801785 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 50801811 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 50801812 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 50801882 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 50801960 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 50802051 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 50802062 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 19 50802122 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 19 50802151 G T Y N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 19 50802323 T C Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 50802392 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 50802419 T C Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 19 50802421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50802424 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50802706 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 50802905 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50802924 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 50802937 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50802992 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 50803165 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 50803200 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 50803251 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 50803392 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 50803408 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50803417 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50803434 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50803448 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 50803497 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50803519 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 50803548 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 50803605 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 50803657 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 50803674 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 50803800 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 50803820 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 19 50804038 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 50804047 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 50804066 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50804102 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 50804103 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 50804220 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 50804259 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 50804300 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50804311 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 50804398 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50804440 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 50804525 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 50804576 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 50804595 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50804750 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 50804786 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 50804829 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 50805058 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50805268 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 19 50805285 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 19 50805361 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 50805364 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 50805880 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 50806491 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50806581 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 50806591 T C Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 50806712 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50806796 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 50807075 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 50807138 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50807416 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50807600 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50807719 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 50807807 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 50807968 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50807999 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 50808275 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 50808426 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 50808978 A C Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 19 50809043 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 50809103 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 50809135 T A Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 50809218 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 50809261 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 50809439 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 50809445 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 50809673 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 50809759 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 50809792 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 50809847 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 50810081 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 19 50810399 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 19 50810811 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 50810940 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 50810998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50811016 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 50811056 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 50811082 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50811101 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50811219 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 50811475 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 50811482 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 19 50811490 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 19 50811518 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50811574 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 50811674 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50811749 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 50811799 T C Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 19 50811886 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 50811939 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50812015 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 50812057 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 50812250 T A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 50812331 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50812676 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 50812717 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 50812794 T G Y N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 19 50812831 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 50812961 T A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 19 50813056 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 50813266 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 50813294 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 50813298 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 19 50813305 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 50813396 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 50813488 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 50813591 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 50813608 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 50813651 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50813693 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50813737 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 50813753 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 50814027 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50814063 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 50814121 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50814452 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50814560 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 50814565 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 50814955 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 50815082 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 50815143 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 50815302 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 50815324 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50815955 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 50816008 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.5 0.111111111111111 0.388888888888889 20 16 9 2 7 19 50816049 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 19 50816054 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 50816091 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 19 50816144 G C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 50816271 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 50816293 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 50816315 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 50816316 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 50816723 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50816775 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 50817295 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50817762 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50817874 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50818662 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 50819244 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 50819438 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 50819703 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 50819711 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 50819911 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 50819916 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 19 50819933 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50820335 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 50820736 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 50821335 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50821494 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50821578 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50822192 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 19 50822359 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 50822694 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 50822899 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 50822978 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50823033 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50823081 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50823361 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 50823362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50823664 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50824027 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 19 50824206 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50824398 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 50824709 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50824713 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50824729 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 50824802 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50824936 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50825062 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 50825063 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 50825653 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50825703 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 50825887 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 50825981 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 50826085 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 50826195 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50826295 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 50826329 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 50826424 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 50826509 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 50826542 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 50826545 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 50826586 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50826627 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50826996 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 50827132 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 50827419 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 50827420 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 50827629 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 19 50827729 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50827732 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 50827913 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50828010 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50828017 A C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 50828038 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 19 50828060 T A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 19 50828079 G T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 50828106 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 50828236 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 50828241 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 50828273 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 50828304 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 50828403 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 50828414 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 50828438 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 50828501 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 50828614 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 50830718 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 50830849 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 50831091 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 50831199 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 50831305 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 50831454 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 50831476 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50831548 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 50831606 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 50831882 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50831939 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 50832116 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 50832156 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50832184 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 50832204 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 50832233 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 50832266 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 50832617 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 50832663 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 50832675 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 50832700 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 50832842 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 50832887 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 50832911 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 50832927 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 50832964 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 50833017 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50833038 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 50833079 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 50833123 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50833147 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 19 50833195 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 50833497 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50833515 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 50833841 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50833856 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50834191 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 50834259 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 50834340 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50834736 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 50834819 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50834958 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50835120 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 50835484 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50836007 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 50836072 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50836358 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50836542 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 50836588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50836641 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 50836830 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 19 50836861 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 50836904 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 50836909 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 50836974 T A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 19 50836988 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 50837067 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 50837120 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 50837184 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 50837193 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50837250 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 50837261 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50837305 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50837456 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 19 50837628 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50837728 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50837765 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50837818 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50837953 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 50837980 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 50838023 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 50838206 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50838451 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50838519 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 50838525 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 50838604 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50838609 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50838917 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50839076 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 50839362 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50839572 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 50840032 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 50840343 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50840476 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 50840564 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 50841105 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50841566 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50841583 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50841990 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50842362 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50842921 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 50843003 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50843976 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 50844934 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 50844943 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 50845174 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 50845570 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 50846304 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 50847237 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 19 50848027 T G N N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 19 50848582 T G N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 19 50849022 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50849445 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 50849523 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50850103 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50851189 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50851194 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50851333 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 50851460 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 50851531 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 50851559 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50851582 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 50851595 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 50851639 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50851752 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50851910 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 50851960 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 50852020 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 50852486 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50852508 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 50852750 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 50852782 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 50852902 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 50852966 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50853539 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 50853629 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50853690 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 50854379 A T N N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 19 50854705 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50854729 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50855666 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50855669 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50855782 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50855941 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50856227 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50856260 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50856977 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50857056 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50857861 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50859068 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50859100 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50859314 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50859382 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50860628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50860748 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50860977 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50861135 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 50861156 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50861620 A T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 50862041 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 50863172 T G N N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.545454545454545 0.272727272727273 0.181818181818182 15 7 6 3 2 19 50863314 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 50863489 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 19 50863609 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 19 50863622 G A N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 19 50863664 T A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 50863686 G T N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0 0.642857142857143 0.357142857142857 9 19 0 9 5 19 50863722 A T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 19 50863734 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 19 50863755 T A N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 19 50863810 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 19 50863978 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 50864013 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 50864049 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 50864074 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50864110 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 50864114 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 50864135 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 50864199 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 50864810 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50865588 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 50865613 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 50865667 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 50865760 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 50865819 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 50865821 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 50865826 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 50865848 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50866389 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50866523 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50866568 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50866855 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50866907 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50867194 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 50867321 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50867390 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 50867562 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 50867586 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 50867613 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 50867617 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 50867631 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 50867832 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 50867866 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 50867887 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 50867888 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 50867910 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 50867911 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 50867966 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 50868016 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 50868183 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 19 50868224 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 50868299 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 50868316 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 19 50868781 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 50868820 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50868849 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 50868850 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 50868879 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 50868905 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 50868914 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 50868928 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50868934 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 50868946 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 50868962 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 50869074 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 50869095 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 50869151 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 50869185 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50869227 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 50869243 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 50869335 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 50869399 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 50869415 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 50869445 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 50869453 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 50869507 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 50869558 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 50869569 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 50869570 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 50869670 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 50869735 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50869840 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 50869845 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 50869861 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 50870957 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 50871096 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 50871237 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 50871254 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 50871330 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 50871494 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 50871559 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 50871567 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 50871806 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 50872015 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 50872541 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 50872569 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 50872636 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50872637 G C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 19 50872662 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 50872724 T G N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 19 50872843 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50872941 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 50872977 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 50873120 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50873132 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 50873167 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 50873373 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50873466 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 50873493 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 50873595 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 50873619 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 50873695 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 50873717 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 50873727 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 50873746 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50873796 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 50873816 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 50874169 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50874303 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 50874308 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 50874834 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 50874868 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 19 50874883 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 50875139 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 50875368 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 50875401 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 50875795 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 50875921 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 50875927 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 50876051 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 50876088 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 19 50876205 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50876467 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50876485 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50876572 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 50876812 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50876869 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 50876900 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50876958 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 50876967 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 50876968 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 50877104 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 50877541 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 50877608 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50877686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50877711 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 50877731 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50877911 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 50877960 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50877971 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 50877996 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 50878016 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 50878156 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50878172 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50878195 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50878234 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50878383 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 50878387 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 50878396 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50878508 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50878510 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50878518 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 50878568 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 50878671 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 50878674 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50878725 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50878761 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 50878872 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50878892 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 50878903 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 50878958 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 50878960 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 50879026 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50879031 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50879067 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 50879068 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50879090 A C N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 50879276 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 50879335 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50879353 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50879355 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 50879372 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50879483 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50879569 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50879571 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50879584 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50879687 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50879713 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50879716 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50879737 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50880014 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50880026 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 50880066 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 50880068 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 50880075 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 50880122 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 50880136 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 50880148 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50880181 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50880196 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 50880342 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50880343 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50880358 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 50880395 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 50880414 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 50880483 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 50880675 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50880679 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 50880700 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50880710 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 50880736 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 50880834 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 50880939 C A N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 19 50880946 T C N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 19 50880953 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 19 50880971 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 19 50881056 T A N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 19 50881072 C A N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 19 50881083 C A N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 19 50881086 C A N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 19 50881119 C T N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 19 50881134 T C N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.25 0 0.75 4 12 2 0 6 19 50881140 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.222222222222222 0 0.777777777777778 4 14 2 0 7 19 50881196 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 50881252 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 50881258 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 50881314 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 19 50881318 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 50881322 A T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 50881350 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 50881354 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 50881357 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 50881460 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50881482 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 50881597 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 50881598 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 50881688 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50881707 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50881744 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50881751 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50881872 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50881899 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 50881926 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50881996 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50882180 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50882191 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50882209 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50882216 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 50882233 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50882252 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50882253 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50882264 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50882308 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50882354 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50882376 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50882397 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50882409 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50882425 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50882438 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50882448 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50882460 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50882470 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50882515 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50882692 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50882708 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50882840 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 50882843 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 50882955 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50882964 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50883019 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50883104 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50883114 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50883243 C A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 50883384 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 19 50883524 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 19 50883525 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 19 50883639 G T N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 19 50883663 G C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 50883718 G T N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 19 50883844 G T N N 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 19 50883989 G C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 50884045 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 50884095 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 50884109 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 50884133 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 50884135 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50884140 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50884176 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50884209 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 50884217 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 50884309 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50884319 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50884492 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50884523 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50884549 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50884624 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 50884662 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50884671 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 50884675 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50884693 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50884715 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50884762 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50884767 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 50884812 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 50885008 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 50885293 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50885341 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50885479 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50885644 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50885768 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 50885855 G C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 50885943 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 50886015 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 50886039 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 50886151 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50886157 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50886164 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 50886409 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 50886829 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 50886840 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 19 50887501 A G N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 19 50887691 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 50888722 T C N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 19 50888753 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 50890021 G T Y N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 19 50890319 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 50890464 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 19 50890945 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 19 50891722 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 50892295 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 50892559 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 50892611 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 50892696 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50892914 T G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 50892919 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 50892956 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 50893111 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 50893694 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 50894297 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 50894605 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 50895390 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 50895722 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 19 50896182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50896225 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50896249 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50896465 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 50897150 C A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 50897471 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50897662 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50897691 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50897761 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 50898001 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 50898010 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50898050 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50898135 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50898148 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50898170 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50898373 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50898452 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50898490 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50898508 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50899261 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50899592 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 50899671 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50899678 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50899739 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 50899740 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 50899770 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50899772 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50899850 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50899866 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50899944 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50900108 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50900517 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 50900529 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 50900621 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 50900624 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 50900785 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 50901226 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 50901239 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 50901251 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 50901267 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50901279 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50901317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50901366 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50901388 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50901428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50901471 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50901576 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50901610 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50901634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50901758 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 50901854 A C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 19 50901977 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50901978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50902075 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 50902076 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 50902101 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50902204 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 50902234 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 50902237 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 50902254 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 50902271 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 50902288 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 50902293 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 50902297 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 50902334 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 50902338 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 50902353 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 50902370 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 50902384 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50902387 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50902404 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50902559 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 50902621 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 50902687 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50902731 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50902745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50902754 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50902777 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50902809 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50902810 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50902830 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50902840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50902859 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50902894 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50902896 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 50902927 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50902945 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50902950 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50902961 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50902964 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50902983 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50902996 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50903010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50903067 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 50903068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50903123 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50903129 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50903151 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 50903251 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50903255 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 50903256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50903318 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50903324 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50903332 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50903337 C G Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 50903338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50909593 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50909601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50909746 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50909830 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50910531 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 50910600 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 50910650 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50910663 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 50910729 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 50910832 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 50910867 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50910869 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 50911136 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50911193 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 50911255 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 50911403 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 50911562 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50911627 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 50911673 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50911714 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 50911723 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 50911815 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50911910 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 50911915 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 50911998 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 50912007 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 50912051 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50912061 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 50912101 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 50912114 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 50912333 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 50912436 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 50912525 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50912545 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 50912560 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 50912649 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 50912671 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 50912845 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50912847 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 50913755 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50913799 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 50913807 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50913832 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50913885 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 50913942 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 50913962 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 50913968 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 50914011 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 50914015 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 50914035 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 50914075 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 50914076 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 50914094 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 50914109 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 19 50914181 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 50914217 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 50914261 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 50914339 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 50914367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50914387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50914414 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 50914444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50914505 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50914547 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 50914620 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50914649 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50914835 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 50915049 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 19 50915144 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50915157 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 50915263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50915286 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 50915312 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 50915515 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50915579 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 50915656 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 19 50915660 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 50915681 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 50915805 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 50915889 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 19 50915986 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 50916032 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 50916074 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 50916114 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 50916250 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 19 50916315 A G N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 19 50916608 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 50916614 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50916625 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50916628 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 50916634 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50916744 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 50916826 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 50916850 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50916906 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 50916998 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50917124 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50917140 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50917202 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 50917612 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50917703 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 50917715 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 50917928 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 50917996 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 50917997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50918038 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 50918173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50918340 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 50918399 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 50918468 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50918507 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 50918674 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 50918885 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50918949 A T N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 19 50919238 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50919241 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50919501 C A N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 19 50919584 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 50919618 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 50919631 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 50919670 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50919718 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 50919796 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 50919877 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50920104 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 50920137 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 50920409 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 50920416 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 50920505 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 50920520 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 50920710 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 19 50920713 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 50920813 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 50921135 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 50921243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50921579 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 50921611 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 19 50921748 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 50921768 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 50922131 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50922381 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 50922388 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 50922414 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 50922585 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 50922594 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50922654 G T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 19 50922680 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 50923093 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 19 50923120 A C N N 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 19 50923130 A C N N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 19 50923150 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 50923190 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 50923273 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 50923375 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 50923699 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50923764 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50923783 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50923825 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50923848 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 50923859 C A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 19 50923889 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 50923925 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50924014 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50924039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50924214 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50924292 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50924326 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50924581 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50924776 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50924816 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 50924953 T C N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 19 50925046 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 19 50925157 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 50925204 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50925345 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 50925488 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 50925530 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 50925563 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 50925595 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 50925641 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 50925733 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 50925739 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50925774 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 50925858 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 50925976 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50926043 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 50926161 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 50926436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50926496 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50926526 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 50926527 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 50926578 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50926807 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50926839 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50926874 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50926875 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50927143 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 50927202 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50927292 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 50927310 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50927365 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 50927390 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50927392 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50927704 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50927838 T G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 19 50927861 C A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 50927896 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 50927963 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 50928113 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 19 50928116 G C N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 19 50928557 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 50928575 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 50928582 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 50928629 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 50928769 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 50928785 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 50928828 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50929074 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 50929305 C T N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 19 50929334 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 19 50929344 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 19 50929403 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 50929437 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 50929442 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50929480 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 50929536 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50929710 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50929843 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 50929987 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50930021 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50930032 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 50930110 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50930149 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50930163 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50930167 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50930174 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50930184 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50930186 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 50930187 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50930498 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50930507 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 50930573 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50930623 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 50930630 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 50930635 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50930662 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 50930692 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 50930722 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 50930724 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 50930746 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 50930751 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 50930864 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 50931046 T C N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 19 50931065 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 19 50931095 T C N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 19 50931188 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 50931285 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50931328 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50931369 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50931376 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 50931396 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50931420 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50931491 G C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 50931588 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 50931617 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50931714 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 50931927 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50931934 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50931941 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50932076 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50932115 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50932124 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50932125 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50932131 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50932686 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50932768 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50932779 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 50932792 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 50932806 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50933060 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50933135 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50933147 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50933269 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50933343 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50933381 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50933382 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50933429 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50933457 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50933636 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 50933706 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50933777 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50933780 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50933794 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 50933813 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 50933871 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50933894 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50933923 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 50934066 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50934103 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50934158 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50934164 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 50934173 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50934178 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 50934190 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 50934246 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 50934267 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 50934315 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 50934316 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 50934321 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 50934368 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50934393 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50934412 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50934466 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50934480 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 50934492 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 50934582 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50934668 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 50934705 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 50934791 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 50934831 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50934874 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 50934917 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 50934998 T A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 50935003 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 50935142 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 50935172 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 50935214 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 50935277 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50935319 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 50935371 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50935377 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50935410 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50935415 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50935577 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50935626 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50935657 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50935749 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50935882 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 50935887 A C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 19 50936044 G A N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 19 50936228 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50936296 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50936306 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50936360 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50936364 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50936367 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50936409 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50936491 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50936535 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50936541 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50936543 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50936584 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50936623 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50936628 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50936743 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 50936756 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 50936856 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 50937024 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 19 50937069 T A N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 19 50937090 A C N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 19 50937135 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 19 50937152 C A N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 19 50937189 T A N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 19 50937221 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 19 50937337 A C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 50937389 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 50937399 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 50937402 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 50937418 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 19 50937433 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 19 50937435 G C N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 19 50937499 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50937548 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 50937551 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 50937681 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 50937712 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50937727 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50937729 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50937774 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50937782 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50937788 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50937804 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50937919 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 50940553 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 50940655 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50940691 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50940746 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 50940777 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 50940824 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 50940871 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 19 50940874 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 19 50941001 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50941009 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 50941046 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50941051 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50941096 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50941232 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50941303 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50941312 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50941346 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 50941386 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50941390 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50941422 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50941439 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50941470 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50941627 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 50941778 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50941819 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50941983 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50942040 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50942246 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 50942386 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 50942523 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50942559 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 50942588 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50942655 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50942668 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50942678 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50942692 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50942699 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50942713 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50942733 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50942910 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50942946 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50943009 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50943059 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50943062 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50943072 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 50943095 G T N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 19 50943419 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 50943432 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50943457 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 50943471 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50943566 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50943617 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50943711 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 50943732 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 50943746 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 19 50943830 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 50943961 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 50943977 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 50944046 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 50944109 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50944178 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 50944179 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 50944185 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 50944227 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50944266 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 50944463 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 50944537 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50944538 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50944550 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50944781 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50944789 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50944830 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50944836 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50944862 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 50944864 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50945541 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 19 50945544 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 19 50945655 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 19 50945674 C A N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 19 50945678 A G N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 19 50945701 C T N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 19 50945746 C T N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 19 50945804 C G N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 19 50945806 A G N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 19 50945821 C T N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 19 50945874 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 50945909 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 50945966 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 50945985 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 50946011 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 50946031 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 19 50946101 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 50946119 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 50946127 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 50946268 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 50946434 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 50946437 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50946560 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50946582 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 50946642 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 50946709 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 50946807 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 50946922 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 50946933 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 50946937 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 50946953 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 50947270 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50947637 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50947770 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50947810 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 50947856 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50947937 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50948014 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 50948135 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50948377 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 19 50948484 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 50948573 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 50948662 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50948811 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50948847 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 50948874 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 50949119 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 50949391 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 50949442 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 50949444 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 50949540 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 50949543 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50949776 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50949957 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50949981 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 50950032 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50950232 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 50950235 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 50950237 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50950373 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 50950653 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50950685 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50950688 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50950692 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50950797 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50950852 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 50950948 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 50951010 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 50951102 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50951134 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 50951142 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 50951226 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50951273 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 50951480 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50951539 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50951613 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 50951653 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 19 50951654 G T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 50951655 G C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 19 50951745 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 50951747 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 50951918 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50952145 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 50952196 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50952251 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50952256 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50952280 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 50952308 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 50952398 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50952472 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 50952512 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 50952558 C G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 19 50952567 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 50952568 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 50952698 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 50953214 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 50953230 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50953499 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 50953500 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 50953541 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50953597 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50953675 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 50953897 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 50953955 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 50954052 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 50954201 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 50954245 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 50954283 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 50954318 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 50954335 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 50954358 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 50954364 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 50954370 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 50954401 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 50954432 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 50954512 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 50954583 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 50954925 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 50954951 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 50954991 A T N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.153846153846154 0.615384615384615 0.230769230769231 12 14 2 8 3 19 50955047 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 50955211 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 50955477 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 50956183 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50956404 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 50956419 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 50956630 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 50956669 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 50956704 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50956722 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 50956866 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 50956946 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 50956952 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 50956957 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 50956990 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 50957049 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 50957145 C A N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 19 50957157 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 50957187 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 50957209 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 50957233 A G N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 19 50957274 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 19 50957277 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 19 50957451 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 50957676 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 50957686 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 50957725 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 50957826 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 50958255 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50958295 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 50958469 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 50958481 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 50958482 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 50958500 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 50958565 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50958613 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 50958907 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50958989 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 50958991 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 50959028 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 50959048 A C N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 19 50959180 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 50959232 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 50959304 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 19 50959377 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50959394 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 50959434 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 50959610 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 50959635 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 50959890 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 50959930 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 50960065 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 50960210 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 50960233 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 50960337 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 50960491 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 50960547 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 50960697 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 50960786 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 50960818 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 50960829 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 50960847 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 50960960 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 50961007 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 50961354 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 50961369 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 50961404 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 50961480 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 50961927 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50961936 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50962130 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 50962695 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 50962761 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 50962873 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 50962895 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 50962928 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 50962956 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50962995 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50963002 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 50963027 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 50963098 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50963144 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 50963146 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50963374 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50963707 A T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 50963738 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 19 50963797 T C N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 19 50963820 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 50963892 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 50963925 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 50963992 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 50964177 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 50964245 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50964271 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 50965054 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50965741 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50966935 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50966954 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50966962 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50967129 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50967153 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50967223 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 50967225 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 50967289 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 50967420 G T N N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.5 0.125 0.375 9 7 4 1 3 19 50967430 A G N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.444444444444444 0.111111111111111 0.444444444444444 9 9 4 1 4 19 50967457 A G N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.454545454545455 0.0909090909090909 0.454545454545455 11 11 5 1 5 19 50967472 G A N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.416666666666667 0.0833333333333333 0.5 11 13 5 1 6 19 50967485 A C N N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.363636363636364 0.0909090909090909 0.545454545454545 9 13 4 1 6 19 50967554 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.333333333333333 0.2 0.466666666666667 13 17 5 3 7 19 50967634 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 50967687 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50967688 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50967696 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50967827 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50967865 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50967933 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50968303 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 50968327 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 50968578 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 50968656 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 50968723 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50968802 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50968912 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 50968932 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 50969014 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 50969055 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 50969234 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50969281 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 50969492 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 50969714 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50969727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50969746 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 50969748 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 50969768 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 50969898 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 50969905 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 50970043 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 50970137 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50970140 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50970380 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50970538 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 50970638 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 19 50970657 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50971128 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50971157 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 50971427 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50971448 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 50971673 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 50971729 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50971829 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 50971905 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 50971934 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50971969 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 50971998 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50972271 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 50972287 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 50972575 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 50972588 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 50972681 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 50972703 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 50972706 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 50972851 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 50973028 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 50973111 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 50973147 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 50973151 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 50973482 A T N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 19 50973511 T C N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 5 15 2 1 7 19 50973538 T A N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 19 50973540 G T N N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.454545454545455 0 0.545454545454545 10 12 5 0 6 19 50973589 C A N N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 19 50973617 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 19 50973619 T A N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 19 50973713 A T N N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 19 50973718 G T N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 19 50973725 C A N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 19 50973758 T A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 19 50973770 T A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 50973781 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 50973800 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 50973803 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 50973810 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 50973825 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 50973836 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 50973961 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 50973967 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 50974002 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 50974016 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 50974036 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 50974038 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 50974062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50974069 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 50974087 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 50974127 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 50974128 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 50974201 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 50974655 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50974689 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 50974690 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 50974818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 50975026 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50975067 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50975157 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 50975171 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50975185 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 50975205 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 50975206 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 50975282 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50975337 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 50975338 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 50975346 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 50975421 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50975541 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50975876 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50975946 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 50976017 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 50976183 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50976244 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50976245 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50976289 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 50976343 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 50976405 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50976418 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 50976453 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 19 50976497 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 19 50976543 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 19 50977131 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 50977139 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 50977236 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 50977266 A T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 19 50977391 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 50977447 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 50977471 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50977483 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 50977579 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 19 50977582 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 50977609 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 19 50977610 C A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 19 50977625 C A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 50977629 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 50977632 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 19 50977648 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 19 50977720 C A N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 19 50977815 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 50977827 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 50977850 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 50977860 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 50977869 G T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 19 50978027 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 50978032 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 50978163 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50978204 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 50978249 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 50978292 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 50978293 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 50978298 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 50978421 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50978441 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 50978457 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 50978491 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50978509 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 50978525 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 50978529 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 50978588 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50978603 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50978645 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 50978646 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 50978657 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50978823 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50978824 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50978921 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50978939 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50978946 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 50979044 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50979132 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50979176 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 50979325 A G N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 19 50979560 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 50979573 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 50979678 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50979704 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50979711 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50979748 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50979754 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50979799 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 50979990 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 50980001 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 50980079 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 50980088 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 50980116 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 50980119 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 50980367 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 50980481 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50980634 G C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 50980685 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 50980739 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 50980757 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 50980811 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50980821 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50980967 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50981229 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50981366 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 19 50981489 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 50981513 C A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 50981539 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 19 50981855 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 50981856 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 19 50982061 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 50982147 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 50982162 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 19 50983137 G A N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 19 50983263 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50983415 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 50983563 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 50983657 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50983844 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50984124 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 50984149 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50984151 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 50984206 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 50984207 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 50984259 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 50984285 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 50984343 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 50984388 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50984391 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 50984877 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 50984888 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 50984908 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 50985048 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 50985105 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 50985215 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50985258 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 50985638 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50985646 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 50985810 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 50986042 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50986242 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 50986251 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 50986285 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 50986348 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 50986382 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 50986415 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 50986429 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 50986480 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 50986863 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 50986877 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50986930 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 50986933 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50986973 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 50986998 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50987052 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50987054 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50987116 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 50987163 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 50987201 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 50987202 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 50987222 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 50987351 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 50987364 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 50987365 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 50987367 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 50987374 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 50987420 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 50987440 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 50987441 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 50987459 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 50987474 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50987498 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 50987529 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 50987610 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 50987620 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 50987700 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50987769 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50987779 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 50987785 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 50987904 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50987975 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50988043 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50988132 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 50988220 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50988400 A C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 19 50988508 A T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 50988683 T A Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 19 50988732 G A N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 19 50988915 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50989072 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 50989180 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 50989219 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50989256 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 50989404 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 50989444 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50989841 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50989886 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 50990027 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 50990071 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 50990085 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 50990101 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 50990117 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50990264 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 50990424 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 50990445 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 50990460 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50990469 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50990478 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50990530 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50990564 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 50990617 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 19 50990655 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 50990684 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 50990709 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 50990723 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 50990724 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50990734 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 50991009 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 50991066 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 50991115 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50991142 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50991181 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50991188 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50991203 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50991236 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 50991256 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50991288 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50991309 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 50991310 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50991313 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50991347 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50991348 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50991395 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 50991397 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50991400 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50991422 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50991426 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50991462 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 50991594 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 19 50991767 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 50991842 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 50991994 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 50992266 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50992323 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50992419 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50992504 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 50992533 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 50992552 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50992635 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50992655 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 50992666 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 50992698 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 50992699 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 50992702 A T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 19 50992743 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50992760 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50992863 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 50992940 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50992948 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50992951 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50993093 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50993105 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50993106 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50993131 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50993138 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50993189 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50993193 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50993199 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50993272 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50993273 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50993278 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50993336 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50993338 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50993399 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50993408 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50993442 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50993468 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50993556 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50993557 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50993577 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50993597 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50993625 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 50993663 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50993705 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50993795 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50993811 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50993866 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50993930 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 50993982 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50993989 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50994015 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50994105 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50994106 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50994216 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50994286 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50994323 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50994339 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50994357 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50994369 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50994392 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50994393 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50994419 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50994453 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50994560 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 50994602 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50994647 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50994707 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50994716 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50994725 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50994781 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 50994800 C A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 50994815 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 50994926 T G N N 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 19 50995034 A T N N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 19 50995073 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 19 50995083 G C N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 19 50995150 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 19 50995187 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 50995253 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 50995308 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50995325 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50995335 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50995362 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50995375 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50995378 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 50995410 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 50995547 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50995565 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50995581 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 50995589 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50995725 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50995758 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 50995762 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 50995784 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 50995791 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50995813 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50995878 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 50995883 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 50995936 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 50995969 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 50995986 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50996167 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50996189 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50996258 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50996359 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50996363 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50996379 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 50996394 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50996513 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 50996514 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 50996535 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 19 50996536 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 19 50996542 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 50996572 C A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 19 50996682 T C N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 8 12 1 6 3 19 50996746 A T N N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 19 50996931 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 50997042 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50997138 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50997162 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50997193 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50997212 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50997256 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50997257 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50997276 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50997286 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50997308 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50997321 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50997396 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 50997397 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50997411 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50997495 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 50997526 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 50997607 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50997624 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 50997652 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 50997663 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 50997713 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 50997714 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 50997799 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 50997806 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 50997820 C G N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 19 50997877 A G N Y 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 19 50997883 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 51000139 C T N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 19 51000167 T A N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 19 51000298 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 19 51000317 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 51000335 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 51000397 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51000467 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51000480 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 51000539 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51000615 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 51000640 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51000641 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51000665 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51000688 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 51000740 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 51000794 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51000838 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51000901 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 51000914 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 51000975 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51000981 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51001019 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 51001022 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51001050 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 19 51001064 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 19 51001071 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 51001080 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 51001084 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 19 51001114 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 19 51001133 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 51001167 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 51001172 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 51001186 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 51001210 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51001277 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 51001285 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51001286 G T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 19 51001334 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51001346 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51001376 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51001409 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51001522 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51001524 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51001527 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51001536 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51001544 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51001844 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 51001881 G C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 51001926 T A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 19 51001927 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 19 51002162 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 51002207 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51002439 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51002470 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 51002582 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 51002655 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51002771 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51002813 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51003496 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 51003640 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51003683 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 51003871 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51004167 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 51004324 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51004646 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51004856 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51005579 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51005724 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51005893 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 51005955 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 51006250 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 51006306 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51006576 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 51006580 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 51006658 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 51006866 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51007074 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 51007076 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 51007109 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 51007211 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 51007221 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 51007230 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 51007244 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 51007298 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 51007340 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 51007422 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 51007449 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 51007508 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 51007529 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 51007543 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 51007545 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 51007554 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 51007628 C A N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 19 51007629 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 19 51007632 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 51007812 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 51007871 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 51007876 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 51007902 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 51008053 C T Y Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 19 51008145 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 19 51008160 A T N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 19 51008174 T C N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 19 51008175 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 19 51008271 T G N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 19 51008276 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 51008288 G C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 19 51008304 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 51008577 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 51008587 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 51008615 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51008626 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 51008669 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 19 51008675 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 19 51008783 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51008828 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 51008929 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 51008935 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 51009013 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51009022 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51009111 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51009180 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 19 51009181 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 51009222 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 51009578 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 51009606 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 51009749 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 51009825 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51009895 G C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 19 51009906 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 19 51010017 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 51010055 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 51010116 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 51010140 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51010179 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 51010180 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 51010198 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 51010252 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 51010268 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 19 51010425 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51010454 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 51010463 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51010527 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 51010585 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 51010674 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 51010682 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 19 51010749 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 19 51010761 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 51010777 T A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 19 51010882 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 51010883 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 51010884 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 51010926 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 51010937 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 51011014 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 51011037 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 51011062 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51011130 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 51011187 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51011268 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51011274 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51011334 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51011425 A T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 19 51011436 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 51011464 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 51011468 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 51011494 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 51011596 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 51011775 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 51011861 G T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 19 51011866 C A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 19 51012002 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 51012059 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51012060 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 51012114 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 51012143 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51012477 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51012610 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51012705 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51012777 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51012849 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51012870 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 51012874 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51013048 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 51013054 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 51013081 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51013117 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 51013289 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51013338 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51013350 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51013535 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51013543 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51013550 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 51013581 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 51013617 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 51013668 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51013670 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51013714 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 51013726 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51013728 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51013750 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51013769 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51013776 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51013849 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51013898 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51013916 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 51013945 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51014062 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 51014087 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51014213 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 51014230 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 51014292 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 51014416 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 51014713 C T N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 19 51014794 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 19 51014819 A T N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 19 51014849 G C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 51014890 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 19 51014929 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 51014937 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51015027 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 51015039 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 51015103 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51015112 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 51015117 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51015167 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 51015270 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51015284 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51015292 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51015427 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51015530 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51015583 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51015696 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51015763 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51015774 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51015830 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51015926 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 51015942 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51015945 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 51016031 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 51016089 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 51016135 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 51016146 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 51016162 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 51016182 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 19 51016214 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 51016346 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 51016360 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 51016367 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 51016380 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51016434 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 51016442 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 51016462 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 51016466 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51016538 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51016557 G T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 19 51016589 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 51016653 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51016719 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51016776 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 51016928 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51017024 G C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 51017028 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51017071 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 51017202 G T N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 19 51017410 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51017506 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51017589 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51017621 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51017644 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 51017723 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51017852 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51017923 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51018079 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51018082 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51018145 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51018227 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 51018277 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 51018303 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51018367 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51018396 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51018435 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51018712 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51018743 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51018758 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51018784 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51018785 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51018796 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51018829 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51019004 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 51019046 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51019069 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51019070 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51019133 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 51019172 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 51019243 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51019250 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51019274 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 51019483 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 51019576 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51019737 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51019842 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51020057 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 51020131 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 51020140 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51020167 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 51020441 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 51020528 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51020865 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51021990 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51022317 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 51023618 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 51024018 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51025702 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 51026142 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51027105 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51027309 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51027691 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 51027977 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51028064 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 51028364 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 19 51028524 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 51028561 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 51028583 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 51028658 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 51028745 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51028874 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 19 51028878 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 19 51028978 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 19 51029080 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 19 51029120 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 51029133 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 19 51029162 C A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 51029391 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 19 51029473 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51029499 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 51029547 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 51029646 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51030301 C A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 51030503 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 51031032 T C N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 19 51031455 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 51031456 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 51031777 T G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 51031931 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 19 51031974 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 51032042 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 51032109 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 51032296 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 19 51032348 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 51032764 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 51032791 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 51032870 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 51033513 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 51033937 C G N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 19 51034176 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 19 51034521 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 51034533 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 51034539 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 51034781 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 51034846 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 51034877 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 51034908 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 51034955 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51034966 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51035006 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51035011 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 51035227 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 51035278 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51035358 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 51035379 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 51035549 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51035797 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 51036077 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51036264 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 51036293 G T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 19 51036487 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51037173 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 51038547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51039524 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51039584 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 51040104 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 51040128 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 51040214 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 19 51040230 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 19 51040317 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51040328 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51040370 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 51040555 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 51040717 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 51041768 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51043361 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 51043402 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51043716 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 19 51044503 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 51044561 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51046513 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51046808 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 51046998 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 51047267 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 51048060 A C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 51048480 C T Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 51048882 G T Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 51048896 T C Y Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 19 51052535 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51053828 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 51054058 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51054077 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51054102 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 51054206 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51054355 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51054488 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 51054552 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51054832 A T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 51054846 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 51054877 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51054889 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 51054891 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51054897 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 51055007 T G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 51055063 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 19 51055183 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 51055184 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 51055198 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 51055252 A G N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 19 51055311 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 51055478 G A Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 19 51055886 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 51056325 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51056399 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51056473 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51056522 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51056543 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51056627 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 51056834 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 51056882 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 51057105 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 51057589 C A Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 19 51057604 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 19 51057733 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 19 51057923 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51058159 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51058203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51058308 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51058319 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51058344 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51058765 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 51059040 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51059093 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51059150 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 51059156 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51059161 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51059198 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51059307 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 51059386 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 51059429 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 51059459 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51059599 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51059662 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 51059711 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 19 51059712 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51059724 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51059828 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 51059920 C T Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 19 51060118 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 51060325 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 51060709 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 51060981 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 51061078 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 51061094 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 51061318 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51061380 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 51061445 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 51061537 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51061641 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51061715 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51061736 A T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 51061757 G C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 51061771 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51061852 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51062291 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 51062292 G C Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 51062313 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 51062314 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 51062369 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 51062373 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 51062393 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 51062644 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51062652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51062733 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51062830 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51062883 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 51062932 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51063006 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51063024 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 51063125 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 51063127 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 19 51063218 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 51063792 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51064045 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51064080 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51064155 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51064176 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 51064247 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 51064316 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51064324 T G Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 51064344 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51064358 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51064419 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51064732 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51064753 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51064914 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 19 51064942 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51065049 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51065061 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51065082 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51065142 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51065166 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 51065182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51065207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51065339 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 51065374 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 51065394 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 51065402 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 51065433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51065438 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 51065476 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 51065575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51065653 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51065670 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 51065728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51065770 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 51065921 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 51065957 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 51066003 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 51066004 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 51066057 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 51066212 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 51066213 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 51066234 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 51066262 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51066281 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 51066297 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 51066419 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 51066568 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 51066618 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 51066626 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 51066635 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 51066667 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51066739 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 51066764 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 51066774 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 51066782 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 51066817 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51066836 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 51066978 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 51067150 G T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 19 51067203 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 19 51067239 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 51067245 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 51067385 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51067780 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 51067795 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 51067803 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51067804 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51067849 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51067893 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 51067924 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 51068048 T G N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 51068052 T G N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 19 51068070 A T N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 19 51068082 A G N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 19 51068107 A T N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 19 51068112 A G N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 19 51068162 C T N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 19 51068197 G A N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 19 51068548 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 51068700 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 51068796 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 19 51068959 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 51069245 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 51069518 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 51069645 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 51069823 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 51069838 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51070222 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51070323 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 51070488 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 51070612 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51070761 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 51071319 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51071533 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 51071571 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 51071664 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51071746 T G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 51071757 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 19 51071889 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 19 51072137 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 51072147 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 51072153 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 51072206 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 51072214 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51072251 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 51072266 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 51072324 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 51072329 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 51072373 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51072556 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 51072576 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 51072654 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 51072674 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 51072754 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 51072773 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51072857 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 51072969 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 51072994 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 51073121 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 51073157 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 51073169 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51073494 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 51073495 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 51073571 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 51073591 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51073622 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 51073701 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 51073746 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 51073993 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51074155 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 51074266 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 51074480 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 51074491 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 51074509 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 51074734 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51074795 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 51074819 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 51074967 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 51075095 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 51075100 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51075302 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 51076271 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 51076941 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 51077092 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 51077094 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 51077114 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 51077146 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 51077414 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 51078586 A T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 19 51078652 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 19 51078736 A C N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 19 51078828 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 19 51078929 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 51078963 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 51078988 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 51079008 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 51079089 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 51079125 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 51079139 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 51079151 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 51079470 T A Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 51079494 G T Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 51080779 A T Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 51081085 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 51081346 T C N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 19 51081509 A G Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 51082841 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 51082853 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 51082953 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 51082962 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 51083013 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 51083016 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 51083026 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 19 51083031 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 51083110 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 51083179 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 51083180 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 51083200 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 51083214 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 51083358 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 51083575 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 51083677 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 51083973 T A N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 19 51084114 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 51084150 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 51084151 T G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 51084220 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 51084351 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 51084424 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 51084444 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 51084449 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 51084584 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 51084767 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 51084868 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 51084903 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 51084907 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 51084956 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 51085769 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 51085781 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 19 51086422 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 51086438 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 51086591 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 51086670 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 51086776 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 51086815 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 51086937 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 51086958 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 51087036 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 51087063 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 51087091 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 51087267 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 51087636 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 51088065 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 51088323 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 51088454 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 51088514 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 51088533 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 51088604 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 51088653 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 51088977 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 51089041 C A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 19 51089226 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 51089467 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 51089509 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 51089557 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 51089628 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 51089673 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 51089763 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 51089906 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 51090013 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 51090084 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 51090370 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 51090464 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 51091025 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 51091445 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 51091480 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 51091565 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 51091611 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 19 51091689 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 51092239 C G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 51092360 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 19 51092409 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 19 51092628 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 51092747 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51092844 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 51093021 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 51093033 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 51093122 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 19 51093124 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 19 51093232 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 51093256 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 19 51093472 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 51093561 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 51093601 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51094160 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 51094237 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 51094371 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51094453 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51095245 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 19 51095254 T G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 19 51095858 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 51096421 G A N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 19 51098233 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 51098494 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 19 51098585 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 51099003 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 51099140 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 51099346 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 51099404 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 51099414 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51099418 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 51099701 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51099801 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 51100087 G A N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 19 51100453 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 51100459 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 51100705 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 19 51100842 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 51100971 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51101353 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 51101396 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51101929 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 51102120 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51102525 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 51103001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51103046 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 51103569 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51103600 A T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 51103642 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 19 51103936 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51104230 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51104904 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51105077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51105434 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51106120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51106770 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51108461 G T Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 19 51108492 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51108514 A T Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 19 51108662 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 51108815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51109894 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51110200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51110273 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51110349 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 19 51110717 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 51111094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51111931 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 51112050 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 51112107 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 51112451 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 51112487 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51112518 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51112527 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51112651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51112727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51113120 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 51113298 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51113311 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51113530 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 51113555 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51113590 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51113734 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 51113763 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51113793 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 51113794 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 51113809 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 51113838 C G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 19 51114193 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 51114300 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 51114400 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 51114463 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 51114499 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 51114640 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51114775 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 51115581 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51115620 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51116339 C T Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 19 51116505 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 19 51116532 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 19 51116552 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 51116643 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 51116654 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 19 51116772 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51117362 A C N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 19 51117367 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 19 51117376 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 19 51117405 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 19 51117791 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 51118334 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 51118422 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51118507 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 51118545 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 51118624 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51118878 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 51118879 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 51118998 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 51119036 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 51119069 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 51119077 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 51119089 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 51119207 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51119287 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 51119316 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 19 51119674 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 51119726 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 51119807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51119983 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 51120016 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 51120021 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51120030 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 51120040 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 51120054 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 51120055 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 51120095 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 51120096 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 51120110 C A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 19 51120298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51120304 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 51120333 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 51120354 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51120398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51120409 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 51120414 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 51120420 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 51120454 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 51120466 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 51120775 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51120826 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 51120827 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 51121201 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 51121329 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51121884 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51121903 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 51121983 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 51122125 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 51123238 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 19 51123367 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 51123400 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 51123426 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 51123432 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 51123438 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 51123467 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 51124820 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 51125001 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51125248 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 51125315 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 51125316 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 51125352 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 51125582 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51125693 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 51126115 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 19 51126318 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 51126350 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 51126362 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 51126387 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 51126486 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51126580 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 51126789 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 51126817 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 51126953 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 51126995 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 51127019 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 51127340 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 51127370 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 51127469 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 51127503 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 51127526 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 51127534 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 19 51127589 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 19 51127756 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 19 51127940 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 51127987 A T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 51128323 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 51128796 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 51128949 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51128975 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 51129192 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51129243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51129343 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 51129811 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51129830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51129860 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 51129925 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51129972 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51130049 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51130190 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 51130245 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 51130249 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 51130322 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 51130613 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 19 51131005 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 51131070 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 51131089 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51131430 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51131512 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51131569 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 19 51131573 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 51131689 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51131690 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 51131701 T G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 51131711 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 51131776 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 51131810 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 51132039 T G N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 19 51132141 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 51132166 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 51132721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51133014 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 51134015 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51134693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51134884 A T Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 51134918 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51135000 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51135120 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 51135123 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 51135131 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 51135218 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 51135225 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 51135231 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 51135246 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51135314 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 19 51135430 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 51135457 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 51135516 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 51135519 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 51135524 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 51135633 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 51135651 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 51135682 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51135718 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 51135738 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 51135754 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51135774 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 51135844 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 51136015 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 51136045 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 51136247 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 51136269 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 51136608 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 51136891 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 51136924 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51136973 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 19 51137217 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 51137329 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 51137506 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 51137552 G C Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 51137592 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 51137595 A G Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 51137624 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51137628 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51137660 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 51137728 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 19 51137743 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 51137799 C G Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 19 51137855 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 51137877 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 51137887 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 51137972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51138002 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 51138107 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51138679 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51138680 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51138892 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 51139051 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51140310 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 51140363 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 51140370 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51140477 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51140513 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51140527 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51142567 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51142958 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 51145373 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 51145855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51145897 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 51145948 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 51146044 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51146287 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 19 51146845 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51147029 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 51147255 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 51147285 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 51147357 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 51147363 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 51147572 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51147686 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51147748 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 51147872 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51147981 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 51147982 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 51147999 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 51148004 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 51148011 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 51148073 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 51148252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51148300 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51148322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51148371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51148794 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 51148813 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 51155354 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 51156016 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51156676 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 51159156 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 51159530 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 51169307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51169579 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51170567 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 51170808 A T N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 19 51171043 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 51171305 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 51171369 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 51171632 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 51172834 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51178109 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 51178698 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 51179901 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51182556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51182598 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51190738 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51190768 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51191194 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51192845 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51192875 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 51194464 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 51195577 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 51197317 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 51197430 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 51197667 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 51197991 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51198110 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 51198396 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 51199744 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 51200417 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51200485 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 51201814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51202217 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51202392 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51202762 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51202926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51203423 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51204435 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 51204540 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 51205916 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 51206207 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51206243 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 51206299 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51206391 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 51206658 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 51206689 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 19 51206728 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 19 51207429 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 51207448 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 51207453 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 51207467 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 51207481 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51207539 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 51207582 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 51207966 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 51208002 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 51208994 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 51209151 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51209292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51209701 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 51209742 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 51210079 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51211035 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51211303 G C Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 51211826 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51211942 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 51212178 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51212520 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 51214910 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 51217062 C T N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 19 51217063 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 51217776 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 51218189 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51218193 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51218391 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 51218733 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 51218876 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 51218892 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 51218963 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 51219053 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 51219131 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 51219220 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 51219237 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 51219394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51219412 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51219671 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 51219672 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 51221010 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 51221371 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 51221408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51222233 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51222891 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51223025 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51223103 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51224237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51224820 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51224867 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 51224886 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51224905 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51224909 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51224910 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51224932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51225544 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51225856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51226038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51226735 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 51226872 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 51228042 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 51228408 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 51228420 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 51228556 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 19 51232734 G T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 51234117 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51234118 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51234132 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 51234616 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51234681 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51234733 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51234749 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51235021 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51235069 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51235088 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51235099 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51235314 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51235380 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 51235393 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51235494 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51235507 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51235529 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 51235639 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 51235675 A C Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 51235721 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 51235722 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 51235817 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 19 51236067 T C Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 19 51236249 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 51236298 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 51236432 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 51236584 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 51236603 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51236622 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 51236918 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 51237003 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 51237013 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 51237022 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 51237107 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 19 51237224 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 51237589 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 51239372 T G N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 19 51239446 A C N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 19 51239449 G A N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 19 51239672 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 19 51239768 A T Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 19 51239779 C G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 51239816 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 19 51239884 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 51239911 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 51240159 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 51240303 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 51240390 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 51240461 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 51240502 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 51240564 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 19 51240582 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 19 51240635 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.611111111111111 0.111111111111111 0.277777777777778 24 12 11 2 5 19 51241489 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51241559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51242105 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51242434 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 19 51243649 G T N N 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 19 51246766 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 51249974 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51250649 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51251201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51251227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51251996 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51252511 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 51253877 T A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 51256280 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 51257049 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51257984 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51258453 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 51258547 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51259832 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51261535 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51263296 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51265797 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51265927 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 51266070 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 51266090 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 51266091 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 51266173 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 51266174 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 51266185 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51266217 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51266317 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51266473 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51266598 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51266604 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51266722 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 51266882 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51266945 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 51266976 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51267102 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51267342 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 51267524 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 51267585 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 19 51267915 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 51267974 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 51268015 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 51268418 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 51268437 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51268668 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51268758 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51269186 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51269187 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51269251 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51269279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51269340 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51269354 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51269370 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 51269374 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 51269424 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 51269473 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51269545 C A N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 19 51269582 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 51269651 G C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 51269660 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 51270498 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 51270545 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 51270558 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51270624 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 51270760 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51270787 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51270837 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51270851 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51270902 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51271065 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51271088 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51271092 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51271306 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 51271513 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51271522 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51271548 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51271562 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51271619 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51271641 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51271651 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51271749 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51271754 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51271772 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51271779 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51271782 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51271839 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51271914 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51271918 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51271966 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51271994 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51272117 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 51272245 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51272259 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51272271 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51272346 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51272540 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51272556 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51272574 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51272724 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51272764 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51272946 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51273067 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 51273115 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51273198 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 51273199 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 51273210 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 51273280 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51273325 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51273355 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51273367 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51273588 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51273653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51273717 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51273774 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 51273807 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51273846 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51273894 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51273903 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51273940 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51273979 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51274010 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51274192 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 51274196 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51274335 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51274463 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51274486 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51274635 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51274660 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 51275461 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51275598 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51275630 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51275634 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51275665 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51275682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51275728 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51275787 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51275799 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51276286 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51276456 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 51276470 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51276476 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51276490 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51276546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51276671 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 51276723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51276772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51277001 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 51277309 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 51277327 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 51277389 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 51277467 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 51277482 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 51277538 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 51277705 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 51277711 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 51277734 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 51277740 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51277794 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 51277909 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 51277925 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 51277929 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 51278023 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 51278033 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51278051 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 51278187 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 51278214 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 51278292 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51278359 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51278393 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51278425 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51278481 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51278537 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51278551 G C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 51278639 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 51278656 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 51278657 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 51278717 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 51278760 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 51278771 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 51278805 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 51278834 G C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 19 51278855 G A N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 19 51278882 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 19 51278924 T G N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 51278931 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 19 51279088 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 51279199 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 51279221 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 51279277 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 51279284 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51279321 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 19 51279351 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 19 51279405 G A N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 19 51279407 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 51279409 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 51279510 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 51279541 C T N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 19 51279590 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 51279696 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51279742 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51279841 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 51279922 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51279923 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51279932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51279937 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51279957 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51279975 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51279983 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51279986 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51279989 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51280004 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51280023 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51280101 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51280247 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 51280286 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51280301 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51280448 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51280452 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51280475 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51280511 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51280547 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51280603 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51280653 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51280739 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51280747 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51280757 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51280763 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 51280831 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51280845 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51280880 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51280918 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51280922 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51280947 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51281008 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 51281063 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 51281136 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 51281159 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 51281311 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 51281414 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 51281664 T A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 19 51281671 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 51281727 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51281814 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 19 51281861 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 51281910 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51281984 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 51282008 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 51282062 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51282201 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51282288 G T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 51282307 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 19 51282403 G A N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 19 51282405 T G N N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 19 51282428 G A N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 19 51282793 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 19 51282847 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 51282888 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 51282891 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 51282944 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 51283014 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 51283061 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 51283141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51283448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51283598 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51283753 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 51283806 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 19 51283828 A C Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 51283849 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 51284113 T G Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 19 51284265 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 51284328 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 51284441 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 51284649 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51284848 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 51284955 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 51284958 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51284969 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51285122 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 51285194 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51285405 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 19 51285709 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 51285732 T G N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 19 51285755 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51285783 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 51285827 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 51285873 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 51285906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51285927 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 51285964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51285992 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51286040 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 51286069 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 51286152 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 51286357 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 51286392 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 51286484 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 51287972 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 51288106 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 51288111 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51288119 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51288168 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51288171 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 51288214 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 51288231 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 51288255 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51288322 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 51288328 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 51288345 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 51288395 A T N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 19 51288451 T G N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 19 51288498 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51288570 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 51288579 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 51288633 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 51288638 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 51288706 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 51288708 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51288911 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51288948 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 51289012 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 51289016 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 51289063 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 51289078 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 51289144 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51289152 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51289183 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51289207 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 51289304 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 51289329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51289353 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51289366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51289387 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 51289393 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 51289421 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 51289456 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51289457 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51289490 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 51289506 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 51289552 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51289563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51289630 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51289643 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 51289704 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51289706 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51289730 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 51289748 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51289766 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 51289778 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51289917 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 51289942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51290043 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 51290263 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51290342 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 51290373 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51290387 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51290424 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51290531 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51290651 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 51290712 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 51290871 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51290938 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 51290943 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51290953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51291022 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 51291028 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 51291061 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 51291206 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51291221 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 51291252 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 51291291 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 51291323 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51291346 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 51291348 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 51291457 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 19 51291625 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51291683 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51291757 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51291768 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 51291803 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51291810 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51291832 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 51291877 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 51291932 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51292000 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 51292023 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 51292067 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 19 51292203 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 51292238 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 51292255 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 51292269 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 51292277 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 51292292 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51292305 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51292333 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 51292340 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 51292378 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 51292398 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 51292432 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51292478 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51292485 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 51292507 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 51292565 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 51292591 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51292592 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 51292606 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 51292657 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 51292672 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 51292707 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 51292727 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 51292747 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 51292778 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 51292782 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 51292790 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 51292903 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 51292956 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 51292976 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 51293097 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 51293100 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 51293129 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 51293130 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 51293136 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51293180 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 51293184 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 51293186 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 51293228 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 51293255 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 51293411 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 51293570 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 51293791 C G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 51293927 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 51294161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51294342 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51295947 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51296124 A T N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 51296382 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 51297042 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51297511 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51297640 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51297988 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51298133 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51298194 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 51298508 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51298573 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 51299192 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51299273 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51299277 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 51299289 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51299661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51300031 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 19 51300203 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51300283 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 51301101 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 51301745 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51302268 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 51302452 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 51303066 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 51303196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51303529 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51304070 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51304411 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51304917 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51305052 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51305097 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51305142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51305246 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51305718 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51305750 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 51306116 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51307059 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51307212 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51307489 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 51308016 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 51308030 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 51308165 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 51308238 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 51308267 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 51308287 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 51308462 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 51308525 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 51308597 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51308676 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 51308723 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 51308724 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 51308881 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51308895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51309192 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51309266 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 51309376 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51310076 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 51310246 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 51310324 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 51310340 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 51310401 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 51310407 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 51310567 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 51310592 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 51310658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51310728 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 51310914 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 51310925 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 51311127 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 51311267 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51311361 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 51311391 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 51311400 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 51311429 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 51311456 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 51311603 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 51311643 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 51311736 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51311737 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51311951 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51312056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51312066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51312511 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51312571 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 51312586 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 51312595 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 51312736 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51312832 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 51312868 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 51312895 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 51312900 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 51312905 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 51312959 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 51312967 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51313033 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51313105 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 51313125 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51313240 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 51313381 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51313383 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 51313445 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 51313713 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51313818 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 51313831 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51314227 G T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 51314241 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 51314564 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 51314565 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 51314736 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 51314761 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 51314764 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 51315066 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 51315151 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 51315406 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 51315561 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51317729 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 51317795 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 51318466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51318818 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51318834 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51318984 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51319330 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 51319538 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51319614 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51319652 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51320015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51320065 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51320071 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51320114 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 51320186 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 51320500 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 51320610 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 51320642 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51320794 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 51320828 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 51320999 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 51321219 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51321316 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 51321362 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 51321439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51321556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51321598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51321663 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51321741 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 51321770 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 51321829 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 51321836 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 51321881 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51321896 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51321900 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51321901 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51321929 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 51322091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51322222 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 51322435 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51322560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51325964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51326001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51326128 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51326159 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51326169 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51326192 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51326223 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51326226 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51326246 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51326258 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51326446 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 51326599 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 51326723 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 51327038 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51327393 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 19 51327637 A G N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 19 51327845 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 19 51328024 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 51328033 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 51328042 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51328092 T C N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 19 51328254 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 19 51328379 A T N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 19 51328582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51328583 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 51328751 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 51328762 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 51328955 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 51329037 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 51329071 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 51329143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51329285 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51329300 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 51329322 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 51329337 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 51329353 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 51329366 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51329413 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 51329449 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51329542 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51329543 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51329606 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51329667 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51329752 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 51329812 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 51329813 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 51329900 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51329908 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 51329989 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 51330534 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 51330685 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51330701 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51330724 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51330746 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 51330803 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 51330996 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51331111 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51331284 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51331409 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51331499 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 51331535 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 51331642 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51331650 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51331653 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51331671 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51331691 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51331722 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 51331725 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 51331728 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 51331733 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 51331771 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51331843 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51331913 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 51331966 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 51331988 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 51331997 A T N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 19 51332112 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 19 51332211 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 19 51332244 A T N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 19 51332280 G T N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 19 51332306 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 19 51332355 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 19 51332431 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 19 51332499 T A N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 19 51332621 G A N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 19 51332683 A T N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 19 51332720 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 51332724 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 19 51332786 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 51332854 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.25 0.166666666666667 0.583333333333333 8 16 3 2 7 19 51332918 A G N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 19 51332924 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 51332951 A G N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 19 51332979 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 19 51332986 A G N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 19 51333051 A T N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 19 51333090 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 51333140 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 51333185 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 51333228 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 51333242 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 51333360 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 51333670 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 51333876 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 51334502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51335534 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 51335587 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51335790 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51335908 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51335930 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 51336588 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51336798 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51337150 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 51337623 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51338455 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51338659 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 51338910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51339218 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 51340608 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51341733 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51341735 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51341959 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51341966 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51342025 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51342075 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51342847 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 51342898 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51343178 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 51343185 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 51343234 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 51343644 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 51344211 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51344334 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 51344376 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51344496 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 51345177 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 51345235 G C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 19 51345355 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51345422 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 51345439 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 51345512 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 51345555 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 51345613 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 51345689 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 51345857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51345858 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 51345945 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51345999 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51346026 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51346051 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 51346246 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 51346405 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51346619 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 51346626 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51346654 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 51346666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51346713 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 51347013 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51347117 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 51347338 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51347386 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51347429 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51347488 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51347534 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 51347642 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51347734 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 51347809 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51347880 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51347909 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 51347910 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 51348029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51348063 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 51348584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51348720 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51348736 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51348760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51348777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51348815 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 51348816 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51348964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51348999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51349133 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51349193 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51349288 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51349361 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51350757 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51351074 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51351772 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51351860 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51351872 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51352067 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 51352376 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51352377 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51352405 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51352499 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51352650 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 51353263 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51353281 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 51353521 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 51353644 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 51353652 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 51353689 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 51353811 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 51353962 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 51354532 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51356307 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 51358220 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51358506 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51359471 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 51359551 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51359982 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 51360210 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 51361541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51362199 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 51362223 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 51362858 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51362869 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51362968 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51364299 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51365217 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51365353 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51365523 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 51365786 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51366456 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 51366567 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 51366636 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51366693 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 19 51366737 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 51366939 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 51367009 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51367242 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51367390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51367462 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51368482 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51368920 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 51369045 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51369204 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51369981 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51370009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51370016 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51370123 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 51370188 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51370259 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51370437 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51370445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51370476 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51370493 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51370518 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51370680 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51370880 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 51370951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51371016 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51371205 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 51371242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51371330 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51371602 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51371603 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51371612 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51371760 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51371786 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51371802 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51371803 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51371815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51371826 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51371864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51371918 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51371936 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51371937 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51371998 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51372078 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51372103 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51372120 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51372393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51372469 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51372493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51372497 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51372507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51372533 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51372542 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 51372560 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51372575 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51372617 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51372665 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51372721 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51372855 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51372858 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51372888 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51372958 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51372998 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51373036 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51373069 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 51373112 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51373186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51373200 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51373260 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51373378 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51373402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51373432 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51373439 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51373465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51373752 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51373788 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51373803 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51373961 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51373965 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 51373988 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51373991 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51374095 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51374134 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 51374155 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 51374164 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 51374225 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51374269 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51374283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51374290 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51374300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51374347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51374352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51374414 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51374430 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51374440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51374453 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51374463 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51374528 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51374659 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51374676 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51375292 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 51375469 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51375473 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51375484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51375583 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51375644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51375664 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51375784 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51375872 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51376123 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 51376173 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 51377066 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51377231 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51377257 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51377316 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51377599 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 51377854 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51377902 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51377903 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51377908 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 51377951 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51377959 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51378009 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51378271 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51378395 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51378403 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51378712 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51378806 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51378934 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51379089 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51379262 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51379278 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51379303 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51379309 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51379324 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 51379340 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 51379345 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51379351 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51379507 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51379641 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 51379724 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51379725 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51379740 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51380048 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51380069 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51380086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51380136 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51380160 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51380171 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51380177 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51380196 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51380218 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51380298 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51380362 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 51380485 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51380538 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51380631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51380670 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51380729 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51380850 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51380884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51380899 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51380985 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51381228 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51381427 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51381464 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51381486 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51381608 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51381662 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 51381663 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51381690 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51381746 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 51381811 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51381866 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51381956 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51381970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51381979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51382221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51382292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51382368 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 51382455 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 51382528 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51382531 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51382653 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51382659 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51382683 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 51382807 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 51382828 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51382829 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 51382863 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 51382870 C G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 19 51383205 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51383259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51383288 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51383362 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51383517 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 51383524 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51383554 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 51383559 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 51383592 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 51383632 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51383955 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51383985 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51384081 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51384109 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 51384131 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51384151 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51384159 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 51384162 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 51384163 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 51384172 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51384206 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 51384231 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51384252 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51384446 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51384458 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51384466 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 51384467 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 51384481 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 51384524 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51384650 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51384692 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51384752 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 51384753 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 51384755 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51384777 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 51384785 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51384854 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 51384862 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 51384864 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51384873 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 51384896 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51384914 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 51384930 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 51384933 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 51384953 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 51384968 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 51384992 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 51385060 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 51385526 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 19 51385611 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 51385753 T G N N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 19 51385766 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 51385783 G A N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 6 10 1 4 3 19 51385794 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 51385796 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 51385816 G C N N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 19 51386030 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 51386074 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51386090 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51386142 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51386153 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 51386172 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 51386179 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 51386194 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 51386207 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51386247 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 51386248 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51386347 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 51386359 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51386571 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51386661 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 51386676 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 51386729 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51387270 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 51387343 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51387495 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51387533 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 51387536 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 51387694 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 51387814 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 51387834 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51387888 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 51387947 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 51388070 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 51388136 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 51388171 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51388180 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51388232 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51388243 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51388277 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51388278 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51388299 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51388311 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51388334 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51388401 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51388644 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51388700 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51388738 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51388972 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51388974 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51388998 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 51389025 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51389029 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51389204 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51389226 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51389326 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 51389331 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51389361 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51389429 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51389472 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51390098 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 51390181 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 51390317 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 51390502 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51390547 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 51390554 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51390612 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 51390646 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 19 51390763 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51390830 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51391107 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51391125 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51391142 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 51391217 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51391421 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 51391430 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 51391452 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51391477 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51391564 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 51391574 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51391779 C A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 51391818 G C N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 19 51392140 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 19 51392191 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51392234 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 51392631 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 51393062 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51393109 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 51393230 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51393752 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51394397 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51394718 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 51396068 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 51396079 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 19 51396161 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 51396268 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 51396342 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 51396476 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51396591 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 51396602 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 51396804 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51396922 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 51396936 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 51397119 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51397375 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51397488 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51397496 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 51397678 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 51398002 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 51398009 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51398023 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51398087 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51398094 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51398097 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51398175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51398189 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51398191 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51398212 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51398305 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51398319 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51398337 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51398338 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51398361 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51398387 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51398486 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51398672 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 51398710 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 51398843 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 51398846 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 51398887 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 51399127 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 51399155 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 51399166 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 51399724 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51399849 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51399943 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 51400181 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 51400191 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 51400972 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51400983 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51401012 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 51401256 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 51401325 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 51401339 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 51401535 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51401556 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 51401944 T G N N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 19 51402164 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 19 51402453 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 51402749 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 51402761 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 51402795 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 51402829 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 51402833 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 51403031 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51403125 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 51403142 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51403145 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51403209 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 51403240 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51403322 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 51403411 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51403488 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 51403592 T G N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 19 51403632 G A N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 19 51404023 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 51405354 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51405504 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51405515 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51406033 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51407619 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51408373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51408416 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51408485 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 51408631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51409090 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 51409812 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 51409852 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51410696 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 51411258 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51412153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51412781 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 51412785 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51413591 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51413618 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51413887 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51414131 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 51414153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51414828 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51415003 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 51415130 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 51415231 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 51415321 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 51416075 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 51416135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51416196 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 51416208 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 51416410 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 51416424 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 51416463 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 51416487 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 51416501 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 51416504 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 51416659 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 51416678 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 51416710 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 51416844 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 51416871 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 51416872 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 51416915 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 51416985 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 51417081 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 51417158 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 51417285 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51417398 C G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 51417423 G T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 51417447 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 51417487 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 51417500 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 51417501 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 51417506 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 51417509 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 51417528 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 51417747 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 51417780 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 51417986 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 19 51417995 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 19 51418238 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 51418243 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 51418281 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 51418308 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 19 51418633 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 51419049 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 51419104 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 51419148 A T N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 19 51420275 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 51421083 C A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 19 51421113 G T N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 19 51421371 C G N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 19 51421501 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 51421577 T A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 19 51421589 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 51422040 A C Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 51422067 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 51422142 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51422405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51422541 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 51422649 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 51422746 A G Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 51422748 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51422840 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51422947 T A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 51422980 G T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 51423067 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 51423068 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 51423109 G C Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 51423181 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 51423299 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51423316 C A Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 51423386 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 51423411 C T Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 51423630 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 51423668 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 51423782 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 51423852 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 51423885 C G Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 51423981 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 51424286 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51424814 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51425057 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51425482 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51425624 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 51425673 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51425674 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 51425688 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 19 51425776 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51426217 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51426524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51426526 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51427109 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 19 51428049 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 51428133 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51428484 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 51428605 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51428741 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 51428782 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 51428787 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 51428824 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 19 51428860 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51428952 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51428960 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 19 51429175 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 19 51429188 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 19 51429230 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 19 51429244 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 19 51429409 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 51429471 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 19 51429496 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 19 51429498 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51429546 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51429813 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 51430874 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 51430897 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 51431011 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 51431053 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 51431096 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51431106 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51431131 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51431264 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51431295 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51431440 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 51431441 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 51431504 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 51431521 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 51431900 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 51431921 C A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 19 51431963 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 51431978 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 51432029 G T N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 19 51432069 T A N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0 0.642857142857143 0.357142857142857 9 19 0 9 5 19 51432124 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 51432239 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 19 51432319 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51432351 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 19 51432413 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51432785 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 51432960 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51433088 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 51433095 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 51433109 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 51433200 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 51433205 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 51433296 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 51433397 T A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 19 51433420 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 51433431 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 51433458 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 51433525 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 51433558 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 51433578 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 51433584 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 51433618 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 51433655 T G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 19 51433731 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 51433768 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 19 51433769 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 51433772 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 19 51433777 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 19 51433790 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 51433810 C G N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 51433824 G T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 51433827 T C N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 19 51433912 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 51433922 A T N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.230769230769231 0.615384615384615 0.153846153846154 14 12 3 8 2 19 51433946 T C N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 19 51434002 C A N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 19 51434031 C A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 19 51434059 C A N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 19 51434101 C T N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 19 51434109 T A N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 19 51434126 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 51434130 C G N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.153846153846154 0.615384615384615 0.230769230769231 12 14 2 8 3 19 51434168 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 51434175 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 19 51434241 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 19 51434242 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 19 51434268 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 51434289 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 19 51434295 G T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 19 51434310 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 51434313 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 51434367 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 51434441 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 51434486 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51435073 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 51435489 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51435623 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51435768 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 51435778 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 51435790 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51435801 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 51435853 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 51435911 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 51435925 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51435939 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51435955 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 51435994 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 51436043 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 51436111 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 51436127 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 51436229 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 19 51436437 A G N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 19 51436519 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 19 51436792 T A N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 19 51436835 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 19 51436846 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 19 51436904 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51436940 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 51436989 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 51437005 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 51437015 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 51437150 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 51437157 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 51437158 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 51437224 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 51437262 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 51437276 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51437289 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 51437574 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 51437609 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 51437652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51437815 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 51437828 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 51437846 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 51437869 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 51437935 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 51437941 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 51438011 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 51438023 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 51438361 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 51438499 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 51438517 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 51438656 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 19 51438689 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 51438725 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 51438817 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 51438885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51438908 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51438963 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 51439076 G T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 51439089 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 51439128 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 51439132 G C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 51439170 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 19 51439731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51439910 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 51440261 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51440292 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 51440322 C A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 19 51440337 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 19 51440349 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 19 51440410 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 19 51440517 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 19 51441248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51441373 G C Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 51441501 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 51441596 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 51441725 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 51441742 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 51441877 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51442137 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51442407 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 51442544 T A Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 19 51442592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51442866 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51442922 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51443312 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 51443384 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 51444057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51445024 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51446401 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 51446433 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 51446754 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 19 51446807 G T Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 19 51446959 T A Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 51447025 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 51447040 A C Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 19 51447347 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51447481 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51448184 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 51448273 G T Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 51448404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51448427 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 51448469 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 51448518 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 51448524 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 51448614 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 51448629 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 51448744 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 51448757 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 51448840 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 51448841 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 51448933 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51448948 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 19 51449004 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51449047 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 51449098 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51449139 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 51449141 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 51449150 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 51449307 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 51449319 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 51449412 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 51449419 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 51449451 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 51449513 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 51449517 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51449570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51449601 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51449617 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51449632 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 19 51449825 A C Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 51449877 G T Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 51449935 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 51449969 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 51449985 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 51450007 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 51450010 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 51450023 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 51450101 C G Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 51450147 T G Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 51450148 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 51450215 C T Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 51450216 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51450219 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51450247 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 51450260 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51450285 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 51450412 A T Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 51450463 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51450524 T C Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 51450593 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 51450608 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 51450654 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 51450695 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 51450803 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51450811 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 51450868 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 51450893 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 51451060 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51451163 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 51451222 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 51451254 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51451297 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51451334 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51451335 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 51451351 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0555555555555556 0.722222222222222 0.222222222222222 15 21 1 13 4 19 51451368 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 19 51451431 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51451461 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 51451464 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 51451483 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 19 51451612 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 51451636 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51451963 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51452476 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51452527 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 51452914 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51453212 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51453321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51453410 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 51453757 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 51453788 G T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 19 51453887 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 51454106 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51455152 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51455337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51455492 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51456493 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 51459163 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 19 51459389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51462432 T A N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 19 51463445 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 51463489 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 51463528 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 51464196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51464424 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 51464842 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 51465134 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51465220 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 51465275 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51465289 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51465868 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 51465942 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51466059 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 51466354 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 51467007 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 51467045 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 51467575 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51468370 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 51469130 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51469229 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 51470021 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51470037 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51470056 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 51470099 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 51470143 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 51470300 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 51470430 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 51470473 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51470515 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 51470556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51470557 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 51470571 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 51470616 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 51470693 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 51470730 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 51470781 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 51470839 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 51470844 T A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 19 51470849 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 51470864 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 51470888 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 51470924 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 51471007 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 51471030 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 51471054 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 51471057 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 51471174 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 51471212 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 51471341 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 51471347 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 51471353 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 51471384 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 51471430 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 51471513 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 51471517 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 51471565 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 51471643 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 51471805 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 51471839 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 51471879 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 51471907 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 19 51471909 A C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 19 51471996 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 51472004 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 51472068 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 51472101 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 51472146 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 51472149 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 51472161 A T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 19 51472278 C G N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 19 51472309 T C N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 19 51472345 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 51472346 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 51472365 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 51472433 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 51472448 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 19 51472477 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 51472519 C A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 51472529 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 51472548 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 51472568 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 51472575 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 51472578 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 51472715 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 51472900 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51473047 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51473065 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 51473171 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 51473429 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51473492 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51473644 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 51473744 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 51473801 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 51473828 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51473877 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 19 51474150 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51474297 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51474312 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51474401 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 51474470 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 51474510 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51474551 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51474606 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 51474625 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51474630 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51474901 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51474945 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51474983 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51475007 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51475049 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51475068 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 51475346 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 51475396 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 51475409 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 51475417 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 51475433 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 51475439 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 51475480 C A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 19 51475493 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 19 51475680 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 19 51475851 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51475950 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51475982 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 19 51475987 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 19 51475992 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 19 51476131 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51476136 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51476382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51476489 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 51476533 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 51476630 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 51477100 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 51477111 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 51477240 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51477245 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 51477270 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51477561 A T Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 19 51478119 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 51478274 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51478350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51478446 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 51478458 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 51478505 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 51478541 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 51478888 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 51478971 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51478981 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 51479057 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 51479110 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51479122 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 51479159 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51479622 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 51479629 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 51479631 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 51479638 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 51480114 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51480134 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 51480539 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51480567 A C Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 19 51481715 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 51483487 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51486778 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51487869 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51487889 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51487890 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51488001 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 51488080 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 51488129 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 51488133 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51491478 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51491499 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 51491753 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 19 51491773 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51492762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51492767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51494060 C T Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 51494370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51494401 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 51494472 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51494659 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51494661 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51494694 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 51494702 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 51494783 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 51494900 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 19 51494905 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51494970 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 51494982 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 51495045 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 51495112 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 51495141 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 51495142 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 19 51495167 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51495198 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 19 51495293 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 19 51495342 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51495386 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 51495789 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 51495790 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 51495951 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 51496223 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 51496241 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51496302 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 51496306 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 51496426 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 51496640 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51497190 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 51497307 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51497553 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 51498321 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 51498323 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51498335 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51498459 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51498502 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 51498520 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 51498586 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 51498596 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 51498641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51498707 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 51498768 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 51498782 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 51498846 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 51498862 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 51498876 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 51498920 G C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 51498924 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 51498935 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51498949 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 51499227 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 51499288 A C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 51499341 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51499381 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51499451 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 19 51499516 T G Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 19 51499657 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 51499796 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 51499879 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 51499974 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 51500011 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51500035 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 51500178 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 51500457 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51500507 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51500619 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 51500691 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51500717 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 51500751 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 51500762 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51500820 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 51500866 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 51500893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51500901 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 51500937 C G Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 51500962 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51501248 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 51501325 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 51501364 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51501409 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 19 51501526 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 51501648 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 51501657 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 51501722 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 51501769 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51501834 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 51501868 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51501876 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 51501987 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 51502178 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51502206 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51502339 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 19 51502452 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 51502456 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 19 51502520 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51502613 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51502637 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 51502674 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 51502683 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 51502806 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 51502873 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 51502986 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 51503220 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 19 51503418 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51503470 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 51503490 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 51503516 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 51503559 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 51503583 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 51503733 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51503806 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 51503845 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 51503937 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 51503978 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 51504202 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51504317 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51504396 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 51504430 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51504515 C A Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 51504521 T C Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 19 51504543 A G Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 19 51504568 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 19 51504580 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 51504684 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 51504712 A G Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 19 51504825 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 51504921 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51504927 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 51505149 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 51505223 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 19 51505302 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51505364 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 51505552 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51506087 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 51506186 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 51506189 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 51506299 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 51506362 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 51506367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51506368 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51506402 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 51506633 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51506651 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 51506791 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51506845 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51506861 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 51506870 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 51506898 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51506911 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 51507104 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 51507359 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 51507376 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 51507571 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 51507616 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51507688 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 51507737 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 51507938 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51507978 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51508062 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 51508064 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 51508103 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 51508198 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 51508241 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 51508404 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 51508479 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 51508558 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51508559 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51508586 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 51508627 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 51508689 C T Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 19 51508734 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 19 51508893 A T Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 51508980 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 51508993 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 51509065 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51509165 T G Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 51509348 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 51509508 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 51509631 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 51509789 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 19 51509871 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 51509885 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 51510056 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 51510386 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51510583 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51510641 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51510692 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 51512698 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51512712 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 51512881 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51513094 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51513132 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51513154 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51513168 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 51513178 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 51513226 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51513249 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 51513261 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 51513304 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 51513438 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 51513639 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 51513718 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51513720 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 51513752 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51513997 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51514004 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51514037 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 51514149 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 51514152 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 51514153 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 51514201 T A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 51514271 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 51514289 C A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 19 51514541 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 51514607 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 51514608 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 51514628 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 51514672 T A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 19 51514716 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 51514940 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51514947 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51515072 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 51515295 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 51515316 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 51515319 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51515387 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 51515518 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 51515539 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 51515550 T G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 51515607 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 51515632 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 51515661 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 51515735 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 51515769 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 51515791 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51515819 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 51515848 G C Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 51515860 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 51515871 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51515912 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51516157 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 19 51516165 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 19 51516189 A C N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 19 51516227 G A Y Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 19 51516293 A G Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 19 51516323 T G N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 19 51516427 T G Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 19 51516555 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 19 51516594 G A N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 19 51522928 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 51523210 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51523230 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 51523273 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51523464 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 51523468 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 51523472 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 51523659 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51524148 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 51524286 T G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 51524419 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 51524432 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 51524527 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 51524609 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 51524645 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 51524662 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51524995 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51525008 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 51525189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51525411 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 51525936 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 19 51526396 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51526422 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51526705 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51526706 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51526734 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51526744 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 51526907 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 51526982 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 51526990 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 51527004 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 51527038 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 51527225 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 51527226 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 19 51527502 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 51527659 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 51527824 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 51528007 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51528280 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 51528404 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 51528655 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 51528735 G A Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 19 51528774 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51528799 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 51528835 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 51528859 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 51528881 A T N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 19 51529097 T C N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 19 51529687 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 51529760 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 51529911 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 51529928 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 51529946 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 51530010 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 51530049 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 51530050 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 51530101 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 51530119 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51530223 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 51530333 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 51530565 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51530627 T A Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 51531017 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 51531222 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 51531480 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 51531651 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 51531664 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 51531674 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 51531817 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 51531905 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 51532091 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51532148 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 51532165 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 51532191 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 51532388 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 51532444 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 51532603 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51532661 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 51532674 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 51532737 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51532777 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51532806 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 51532920 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 51533122 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 51533154 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 19 51533249 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 51533311 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51533673 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51533735 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51533746 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51533753 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51533817 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51533824 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51533829 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 51533902 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51540813 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51540902 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 51541087 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 51541111 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 51541499 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 19 51541509 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 51541561 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 51541569 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 51541971 A T Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 19 51542065 T G Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 51542251 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51542441 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51542605 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51543825 C G Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 51550080 A G Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 51550374 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51550600 T A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 51550985 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 51551118 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 51551167 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 51551222 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51551403 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51551406 A G Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 19 51551528 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 51551585 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51551694 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 19 51551714 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 51551988 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 19 51552098 C T N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 19 51552200 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 51552205 C A Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 19 51552294 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 51552316 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51552363 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 51552475 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 19 51552512 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 51552595 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51552897 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51553103 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 51554037 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 19 51554443 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 51554991 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51555638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51556031 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51556535 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51556695 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51557150 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 51557151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51557152 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51557906 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51558038 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51558438 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51560583 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51568525 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51569053 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51569464 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 51571512 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51572336 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51572505 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51573712 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 51574577 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 51575307 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51576376 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51576941 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 51577035 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51577686 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 51579269 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 51581275 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51581334 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 51582019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51582472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51582493 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51584054 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51584096 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51585424 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51585577 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51585835 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51586001 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 51586611 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 51586903 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51587258 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 51587270 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51587759 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51588834 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 51588971 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51589480 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51589673 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51589914 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51591656 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51591836 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 51592220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51592940 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51593160 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 51593805 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 51593912 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 51593991 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51594002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51594038 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51594495 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51596179 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51598165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51598608 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51599160 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 51599381 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 51599612 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 51600163 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51601284 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51601412 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51601673 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 51601710 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51602306 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 51602342 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 51602366 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 51602515 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 51602613 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 51602968 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 51604735 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51604876 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51605627 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51605785 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 51605855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51606123 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 51606127 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 51606150 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51606233 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51606301 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51606332 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51606335 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51607496 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 51607640 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 14 22 0 14 4 19 51608372 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 51608562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51608599 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 51608749 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 51608779 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 51608786 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 51609205 T C N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 19 51609235 G C N N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 9 7 2 5 1 19 51609332 C A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 19 51609731 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 51609745 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 51609753 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 51609754 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 51609768 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 51609804 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 51609890 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 51609920 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 51609925 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 51609937 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 51609986 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 51610018 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 51610041 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 51610100 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 51610117 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 51610139 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 51610175 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51610350 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 51610517 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 51610567 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 51610571 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 51610585 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 51610625 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 51610734 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 51610792 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 51610829 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 51610898 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 51610979 A T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 51611006 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 51611007 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 51611031 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 51611041 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 51611066 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 19 51611079 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 19 51611211 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 51611306 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 51611387 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 51611388 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 51611396 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 51611490 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 19 51611597 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 51611794 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 51611827 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 51611891 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 51611923 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 19 51611926 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 51611928 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 51611953 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 51611957 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 51611987 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 51612096 G C N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 19 51612128 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 19 51612136 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 19 51612149 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51612155 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51612170 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 51612198 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51612290 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 51612292 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 51612293 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 19 51612313 C G N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 19 51612403 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 19 51612653 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 51612803 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 51612840 A T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 19 51612996 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 51613050 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51613067 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51613235 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 51613238 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51613321 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 51613491 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51613532 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 51613611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51613733 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 51613938 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51613982 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 51614344 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51614415 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51614790 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51614921 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 51615048 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 51615111 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 19 51615124 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 19 51615207 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 51615289 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51615303 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 51615336 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51615354 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51615358 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51615575 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51615710 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 51615778 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 19 51615796 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 51615971 A G Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 51616265 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 51616342 A T Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 51616351 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 51616428 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51616543 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51616613 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51616684 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 51616697 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 51617020 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 51617131 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 19 51617188 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 51617221 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 51617325 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 51617523 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51617539 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 51617619 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51617775 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 51617814 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51617857 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51617998 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51618053 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 51618063 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 51618093 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 51618118 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 51618170 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 51618188 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51618208 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 51618223 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 51618226 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 51618267 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51624655 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 51624696 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 51624737 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 51624871 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51624943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51624951 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 51625044 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 19 51625079 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 51625080 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 51625086 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 51625094 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51625098 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 51625136 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 51625220 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51625258 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 51625284 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 51625285 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51625289 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 51625296 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51625336 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51625362 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51625447 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 51625497 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51625546 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51625553 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 19 51625559 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51625565 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 51625595 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51625605 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51625608 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 51625617 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51625659 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 19 51627838 G C N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 19 51627843 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 19 51628030 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 51628058 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 51628068 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 51628076 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 51628192 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51628278 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51628313 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 19 51628356 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 51628386 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51628404 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51628421 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51628491 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 51628507 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 19 51628513 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 51628514 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 51628747 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51628766 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51628820 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51628871 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51628906 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 51628919 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 51629068 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 51629138 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 51629161 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51629212 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51629219 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51629296 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51629328 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 51629386 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 51629459 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 51629561 A T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 19 51629614 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 51629738 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 51629807 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 51629893 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51629900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51630035 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51630043 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51630155 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 51630212 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 51630248 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 51630260 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 51630400 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 51630445 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 51630498 G C N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 19 51630504 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 51630506 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 51630772 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 51630804 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 51630941 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 51630944 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 51631090 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 51631093 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 51631098 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 51631119 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 51631442 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51631574 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 51631590 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51631712 G A N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 19 51631722 G T N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 19 51631786 A G N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 19 51631848 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 51631978 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 51632036 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 51632135 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 51632269 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51632298 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 51632320 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 51632347 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51632407 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 51632479 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 51632655 G C N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 19 51632667 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 19 51632671 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 19 51632690 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 19 51632769 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 51632789 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51632826 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 51632835 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 51632909 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 51632956 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51632961 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51632966 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 51632988 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 51633066 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 51633076 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 51633091 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51633254 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 51633272 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 51633284 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51633297 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 51633495 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 51633643 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 51634537 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51635181 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 51635364 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 51635470 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 51635494 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 51635603 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 51635658 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 51635689 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 51635702 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 51635716 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 51635791 T A N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 51635874 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 51635939 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 51635963 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 51635979 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 51635980 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 51635983 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 51635999 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 51636031 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 51636039 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 51636056 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 51636081 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 51636096 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 51636117 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 51636157 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 51636216 G T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 51636281 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 51636297 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 51636331 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 51636335 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 51636393 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 51636454 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 51636529 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 51636639 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 19 51636696 T G N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 19 51636727 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 19 51636838 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 51636873 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 51637007 A C Y N 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.428571428571429 8 6 4 0 3 19 51637081 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 51637087 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 51637149 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 51637213 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 51637313 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51637349 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 51637436 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51637511 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51637591 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 51637596 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 51637916 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 19 51638101 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51638102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51638316 T G N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 19 51638427 C A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 19 51638436 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 51638465 C A N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 19 51638480 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 51638507 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 19 51638672 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 51638810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51638846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51638987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51639133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51639157 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51639405 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 51639418 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51639693 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51639891 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 51639975 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 51640040 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 51640071 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 19 51640083 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 19 51640117 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 19 51640132 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 19 51640150 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 51640158 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 51640271 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 19 51640275 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 19 51640294 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 51640440 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 19 51640453 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 19 51640509 G A N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 19 51640554 C A N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 19 51640556 C A N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 19 51640591 C G N N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0 0.6 0.4 6 14 0 6 4 19 51640600 C T N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.545454545454545 0.454545454545455 6 16 0 6 5 19 51640706 A C N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 19 51640708 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 19 51640817 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51640937 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 51641042 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 19 51641140 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 51641164 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 51641320 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 51641369 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 51641588 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 51641601 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 19 51641607 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 51641636 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 51641688 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 51641714 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 51641716 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 51641747 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 51641749 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 51641853 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 51641858 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 51641952 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 51641984 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51641987 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 51642012 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 51642043 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 51642068 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 51642085 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 51642096 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 51642191 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 19 51642193 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 19 51642257 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 51642263 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 51642272 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 51642307 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 51642320 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 51642367 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 51642429 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 19 51642491 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51642515 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51642517 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51642525 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51642543 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 51642544 T A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 19 51642570 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 51642586 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 51642706 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 51642779 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 19 51642967 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 19 51643019 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 51643297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51643567 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 51643661 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51643845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51643987 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 51644143 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 51644151 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 51644916 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 51644929 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51645043 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 51645046 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51645059 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51645196 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51645320 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51645333 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 51645340 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 51645389 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 51645561 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 51645667 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 51645724 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51645728 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51645813 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 51645832 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 51645890 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 51645918 C G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 51645935 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 19 51646016 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51646258 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 51646274 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 51646331 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 51646670 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51646957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51647019 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 51647097 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51647102 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 51647366 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51647457 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 51647505 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 51647981 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51649742 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51650311 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51650374 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 51650559 C A Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 19 51652029 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51652684 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 51652685 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51652800 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 51653438 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51653852 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51654146 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51655027 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 19 51655066 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 19 51655067 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 51656716 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 51656722 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 51657125 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51657239 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51657293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51657329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51657481 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51658115 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51659979 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 51661050 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51661306 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 19 51662181 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51662265 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 51662316 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51662451 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51662890 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 51663175 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 51664232 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51665630 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51666196 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51666350 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51666416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51666648 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51667636 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 51668115 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51668364 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 51668374 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51668427 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 19 51668694 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 19 51668799 T A N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 19 51669435 C A Y N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.222222222222222 14 4 7 0 2 19 51669722 T C N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.25 0 0.75 4 12 2 0 6 19 51669983 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 51670231 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 51671649 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51671709 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51672496 T C Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 51672857 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51673808 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 51673887 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 19 51674767 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51674805 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51674971 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51675175 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51675279 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51675286 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51675291 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51675343 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51675360 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 51675413 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 51675424 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 51675448 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51675731 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 51675773 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 51675865 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 51676050 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 51676051 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 51676100 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 51676102 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 51676127 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 19 51676248 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51676252 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 51676289 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 19 51676323 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 19 51676326 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 19 51676342 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 19 51676474 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 51676523 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 51677190 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51677205 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 51677206 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 51677218 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 51677242 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51677587 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 51677711 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 51677952 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 51678366 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51678413 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 51678497 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 51678630 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51678845 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51678865 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 51678919 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51678957 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51678964 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 51679041 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51679220 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 51679357 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 51679429 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 51679511 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 51679598 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 51679858 G A Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 19 51679924 C A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 51680076 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51680103 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 51680104 A T Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 51680162 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 51680366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51680560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51680788 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51680915 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51681060 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51681063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51681399 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51681467 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51681642 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 51681679 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51682838 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51683401 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 51683967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51684758 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 51685229 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51685230 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 51685457 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51685719 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 51685778 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51686163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51687728 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 51688970 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 51689218 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 51690016 C A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 19 51690370 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 51690623 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 51690812 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51691224 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 51691336 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 51696209 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 51696819 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51698553 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 51698603 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51698803 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 51699260 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 19 51700409 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 51700550 A G N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 12 12 3 6 3 19 51700562 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 51700935 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 51701918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51702584 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51702675 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51702984 G A N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 19 51703471 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 51704136 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 51704173 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 51704219 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 51704286 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51704295 A C N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 19 51704637 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 51704693 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51704826 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 51704827 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 51705968 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 19 51705982 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 51705999 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51706253 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 51706331 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 51706516 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 51706830 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 51706971 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 51707010 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 51707161 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51707319 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 51707443 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51707777 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 19 51707806 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51707876 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 51707894 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 51707940 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51708032 C G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 51708126 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 19 51708334 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 51708347 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 51708471 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 51708520 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51708683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51708778 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 51709056 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 51709138 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 51709222 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 51709469 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 51709899 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 51709907 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 19 51710118 C A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 51710459 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 51710707 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 51711004 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 51711021 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51711935 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 51712223 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 19 51712263 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51712303 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 19 51712492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51712596 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51712723 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51712724 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51713049 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 51713059 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51713305 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 51713313 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 51713366 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 51713427 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 51713616 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 19 51713869 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 19 51713873 A C N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 19 51713906 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 19 51713926 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 51714148 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 51714188 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 51714382 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 51714391 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 51714400 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 51714546 C G Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 19 51714585 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 19 51714786 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 51714992 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 51714993 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 51715053 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 51715743 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 51715786 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 51715808 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 51716320 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 51716551 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 19 51716655 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 19 51716764 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 51717026 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 19 51717044 A C Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 19 51717053 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 19 51717081 A G Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 19 51717122 A G Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 19 51717384 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 51717445 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 51717493 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 51717509 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 19 51717573 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 51717574 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 51717684 T C Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 51717689 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 51717748 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 51718278 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 51719167 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 51719324 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 19 51719369 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 51720311 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51722648 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 19 51722905 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51724172 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51724173 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51730466 T G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 51730835 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 51734092 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51736190 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51740346 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51741203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51742094 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 51743104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51743276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51744408 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51744717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51744809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51746573 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 51746646 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 51746702 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 51747370 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 51747515 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 51747619 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51747646 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 51749749 G A Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 19 51760447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51761478 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51764945 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 51768846 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51769261 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51769449 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51776351 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51776720 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51778098 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51778536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51780477 A T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 19 51781118 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51783535 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 51789085 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 51789549 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 51789555 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 51790200 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 51792684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51793133 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 51794479 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 19 51795258 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51795825 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51796707 A G Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 19 51797563 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51803770 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 51803911 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 51804026 C A N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 19 51810602 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 19 51811535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51813420 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51814162 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 51814772 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51817000 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51817761 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 51819505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51819548 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.111111111111111 0.722222222222222 0.166666666666667 17 19 2 13 3 19 51819571 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 19 51819585 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 19 51819692 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 51819725 C A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 19 51819757 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 51819783 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 51819887 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 51819928 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51820045 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 51820072 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 51820144 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 51820147 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 51820156 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 51820242 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 51820343 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 51820386 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 51820483 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 51820500 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 51820528 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 19 51820547 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 51820579 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 19 51820674 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.133333333333333 0.6 0.266666666666667 13 17 2 9 4 19 51820692 C G N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 19 51820725 G C N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 19 51820730 A G N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 19 51820751 T C N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.230769230769231 0.538461538461538 0.230769230769231 13 13 3 7 3 19 51820789 A C N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 19 51820883 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 19 51820979 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 51821082 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 19 51821122 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 19 51821157 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 51821166 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 51821287 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 51821402 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 51821425 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 51821574 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 51821746 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 19 51821788 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 51821963 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 51822003 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 51822032 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 51822102 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 51822610 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 51822617 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 51823228 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 51823248 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 51823605 C G N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 19 51825444 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 51825526 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51825858 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 51825972 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 51826174 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51826200 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51826310 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51826323 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51826353 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51826613 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 51826716 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 51826891 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 51826958 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 51827204 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 51827411 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 51827412 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51827458 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 51827593 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 51827613 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 51827637 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 51827652 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 51827656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51827669 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 51827727 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 19 51827728 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 51827763 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51827773 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 51827795 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 51827813 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 51827860 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51827989 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 51827993 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 19 51828027 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 51828042 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 19 51828046 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 51828084 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 19 51828110 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 51828364 C T N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 19 51828368 T A N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 19 51828385 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 19 51828386 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 19 51828422 T C N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 19 51828433 C G N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 19 51828474 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 19 51828481 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 19 51828521 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 51828536 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 51828579 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 51828662 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51828667 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51828675 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51828755 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 51828784 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51828809 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51828811 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 51828819 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 51828824 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 51828837 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 51828842 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 51828844 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51828863 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 51828888 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 51829083 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 51829097 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 51829121 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 51829324 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 51829325 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 51829340 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 51829347 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 51829355 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 51829369 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 51829370 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 51829701 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 51829712 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 51829726 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 51829867 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51829968 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51830140 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 51830270 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 51830346 C G N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 19 51830426 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 51830491 T G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 51830504 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 19 51830642 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 19 51830757 C A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 19 51830834 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 51830845 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 51830881 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 19 51830885 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 19 51830902 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 51831064 T A N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 19 51831223 A T N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 19 51831228 T A N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 19 51831355 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 51831370 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 51831475 A C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 19 51832127 C A N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 19 51832317 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 51832849 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 51833010 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 51833065 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51833068 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51833751 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51834019 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51834385 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 51834576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51834759 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 19 51835468 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 51837336 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51840454 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 51840510 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 51840688 C A Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 51840937 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 51840938 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 51840970 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 51841015 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 51841394 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51841463 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 51841480 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 51841734 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 51841740 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 51841886 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 51841984 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 51842113 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 51842114 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51842267 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 51843072 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 19 51843154 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 19 51843168 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 51844714 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51844872 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 51844922 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51844935 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 51844970 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 51845236 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 51845288 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 51845314 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 51845334 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 51845351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51845389 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51845397 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 51845459 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 51845463 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 51845478 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 51845500 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 51845506 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 51845535 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 51845550 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 51845613 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 51845677 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 51845735 C A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 51846373 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 51846501 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 51846654 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 51847057 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 19 51847269 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 51847287 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 51847510 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 51847537 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 51847648 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 51847687 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 51847696 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 51847824 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 51847869 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 51847920 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 51847954 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 51848207 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 51848271 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 51848276 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 51848333 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 51848424 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 51848522 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 19 51849286 G C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 51849292 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 51849306 T A Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 51849310 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51849969 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51850571 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51859393 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51859898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51860163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51861166 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51863399 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51863626 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 51863733 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 51863734 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 51863777 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 19 51863839 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 51863841 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 51864031 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51864289 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 51864481 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 51866432 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 51866960 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51867003 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51867240 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51867534 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 51867558 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51868037 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51868043 A T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 51869240 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 51869483 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 19 51869798 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 51870135 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 51871188 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51871357 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 51871807 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 51871809 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 51871971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51871992 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 51872024 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 51872036 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 51872173 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 51872348 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 51872521 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 51872562 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51872808 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 51872950 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 19 51873034 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 19 51873124 A T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 19 51873149 A C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 19 51873183 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 19 51873216 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51873220 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 19 51873236 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 19 51873251 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 19 51873280 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 19 51873328 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 51873384 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 51874082 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 51874138 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 51874139 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 51874144 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 51874177 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 51874198 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 51874305 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 51874366 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 51874791 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 51874792 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 51874886 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 19 51875045 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51875308 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51875550 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51875590 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51875603 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 51875670 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51875721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51875890 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 19 51875932 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 51875956 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 19 51876004 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 51876023 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51876050 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 19 51876074 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 51876094 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 19 51876308 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 51876314 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 51876345 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 51876372 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 19 51876401 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 51876517 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 51876536 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 19 51876537 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 19 51876561 C G N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 19 51876861 C A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 51877118 T C N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 19 51877205 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 19 51877405 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 51877632 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 51877645 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51877692 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 51877748 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 19 51877961 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 19 51878204 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51878435 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51878462 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 51878719 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51878762 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51878870 C T Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 19 51879304 A C Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 51879519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51879903 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 51879961 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 51880265 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 51880271 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 51880272 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 51880324 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 51880367 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51880615 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 51880972 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51881026 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 51881057 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 51881067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51881096 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 51881272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51881378 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 19 51881397 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 51881823 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 51882157 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51882368 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51882775 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51883137 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51883692 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 51884828 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51885611 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 51886133 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 51886151 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51886325 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51887759 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51888358 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 19 51889673 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 51889807 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 51890925 A T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 51891171 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 51891989 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 51893081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51893177 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 51893183 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 51893193 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 51893200 C A Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 51893700 G T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 19 51894678 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51895505 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 51896029 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 51896089 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51897023 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 51897853 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 51897918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51898066 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 51898220 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51900092 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 51901034 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 51901445 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 51901926 C A Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 51902632 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 51902643 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 19 51902671 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 51902692 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 51902705 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51902720 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 51902758 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51902808 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 51902820 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 51902935 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 51902989 G C Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 51903192 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 51903273 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 51903290 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 51903307 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 19 51903327 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 51903409 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51903599 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51903638 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51903645 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 51903720 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 19 51903732 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 51903745 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 51903857 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 51903934 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 51904460 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 14 10 4 6 2 19 51904665 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 51904735 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 51904786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51904841 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51904931 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 51905026 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 51905566 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51905762 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51905774 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 51905844 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 51906244 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 51906486 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 51906725 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51906774 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 51906884 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 51906996 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 51907061 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 51907130 A C N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5 0.1875 0.3125 19 13 8 3 5 19 51907227 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 51907228 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 51907252 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 51907681 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 51907703 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 51907853 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 51907923 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 51907949 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 51907955 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 51908093 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 51908197 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 51908459 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 51908687 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 51908854 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51909323 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 51909339 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 51909418 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 51909709 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 51909787 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 51913577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51925398 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 51926120 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51926346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51928524 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51932040 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51933619 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 51943918 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 19 51945069 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 51945554 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51946582 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 19 51946769 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 51947242 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 51947489 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 51948299 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 51951635 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51951948 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 51952013 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 51952209 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51952228 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 51952328 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 51952389 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 51952401 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 51952418 T C Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 51952503 T C Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 51952504 G T Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 51953091 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51954160 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 51954169 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 51954301 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 51954960 T A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 19 51954983 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 51955203 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 51955204 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 51955288 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 51955345 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51956494 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 51957342 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51957362 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 51957400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51957460 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 19 51957461 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 19 51957519 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51957593 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 51957602 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 51957628 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 51957645 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 51957707 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 51957720 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 51958507 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51960583 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51962364 T G Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 51963377 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 51963420 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51963636 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 51963761 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 51963810 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 19 51963853 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 51964043 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 51964076 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 51964200 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 51964225 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51964388 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 51964403 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 51964434 T A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 51964492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51964544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51964645 A G Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 19 51964902 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 51965097 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51965187 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51965242 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51966282 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51967202 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 51972895 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51982580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51985698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51985768 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51989224 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51990292 C G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 51991772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 51992248 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 51993939 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 51994560 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 51994733 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 51994811 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 51994831 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 51995558 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 51996396 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 51996527 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 51997447 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 51998131 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 51999142 C T N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 19 51999306 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 51999367 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 51999370 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 51999682 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 51999734 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 51999738 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 51999765 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 51999942 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 52000001 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 52000114 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 52000167 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52000237 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 52000253 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 52001090 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 52001665 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 52001666 T G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 52001706 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 52001828 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52001967 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 19 52002253 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 52002266 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 52002290 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 52002316 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 52002328 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 52002373 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52002413 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 52002479 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 52002482 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 52002725 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52002726 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 52002769 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 52003004 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 52003016 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 52003029 C T N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.466666666666667 0.2 0.333333333333333 17 13 7 3 5 19 52003123 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 52003143 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 52003285 G C Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 52003296 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52003389 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 52003394 C A Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 52003412 A G Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 19 52003415 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 19 52003426 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 52003530 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 19 52003580 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 52004020 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 19 52004054 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52004124 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 52004177 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 52004193 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 52004204 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 52004350 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 52004421 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 52004762 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 52004923 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 52005138 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 52005163 C G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 52005177 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52005336 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 52005344 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52005437 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 52005444 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 52005511 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 52005517 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 52005523 T G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 19 52005545 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 19 52005568 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 52005704 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 52005708 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52005736 A T N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 19 52005750 T G N N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 19 52005773 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 19 52005783 G A N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 19 52005792 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 19 52005802 A G N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 19 52005805 G A N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 19 52005833 T C N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 19 52006012 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 52006078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52006221 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 52006266 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52006267 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52006334 G C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 52006335 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 52006407 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 52006539 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52006549 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 52006570 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52006582 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52006831 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 52006851 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 52006871 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52006957 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52006963 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 52007089 G C N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.357142857142857 0.214285714285714 0.428571428571429 13 15 5 3 6 19 52007104 A G N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 19 52007174 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 52007193 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 19 52007198 G C N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 19 52007298 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 52007303 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 52007345 T G N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 19 52007359 C A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 52007414 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 52007659 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52007708 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52007714 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 52007774 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 52008029 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 52008045 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 19 52008052 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 52008062 T A N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 19 52008076 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 52008133 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 19 52008168 C A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 52008225 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52008236 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52008335 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52008345 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 19 52008346 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 52008425 G C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 52008431 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 19 52008456 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52008469 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 52008494 G C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 19 52008625 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 52008908 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52008986 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 52009009 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 52009011 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 52009016 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 52009018 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 52009067 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 52009184 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52009243 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 52009251 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 52009267 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 19 52009294 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 19 52009323 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 52009404 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 19 52009717 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 19 52009909 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52010048 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52010116 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52010124 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52010165 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52010271 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52010304 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52010305 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52010335 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52010385 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 52010600 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 52010616 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52010651 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52010660 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52010662 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52010813 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52010821 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 52011032 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 52011049 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 52011304 T G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 52011853 C G N N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 19 52012101 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 52012349 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52012618 A G N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 19 52012648 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 52012677 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 19 52012831 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52012840 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52012917 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52013170 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52013332 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 52013439 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52013512 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52013526 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52013608 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 52013681 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52013763 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52013784 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52013876 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52014083 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52014279 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 52014563 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 52014616 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 52014636 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 52014685 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 52014950 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 52015291 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 52015372 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 52015384 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 52015404 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 52015496 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 52015510 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 52015605 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 52015636 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 52015665 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 52015907 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 52016994 A T N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 19 52017002 T G N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 19 52017009 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 52017057 C G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 52017110 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 19 52017210 C A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 52017604 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 52018482 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52019846 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 19 52019942 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52020362 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52020452 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52020600 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52020650 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 52021222 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52022805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52023038 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 52023194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52023594 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 52032162 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52032179 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 52032511 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 52033759 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 52034031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52034359 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52034442 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 52036413 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52036938 G T Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 52037245 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 52037879 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52038310 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52038326 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 52038540 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52038886 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 19 52039136 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 52039301 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 52039328 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52039696 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 52039793 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52040141 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 52040263 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 52040400 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 52040628 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 19 52040764 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52040879 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 52041171 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52042264 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52042385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52042436 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 52042457 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 52042459 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 52042499 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 52042593 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 52042681 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 52042728 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 52042794 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52042817 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52042861 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52043456 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 52043554 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52043586 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 52043642 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52043786 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52043788 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52043884 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52043895 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52043909 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52043923 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 52043935 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 52044141 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52044172 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52044173 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52044209 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52044277 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52044468 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 52044482 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 52044520 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 52044640 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52044678 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52044720 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52044746 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 52044815 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 52044882 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52044918 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52045075 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52045288 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 52045488 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 52045493 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 52045558 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 52045735 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 52046060 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 52046090 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52046135 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52046438 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52046442 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52046511 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52046522 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52046883 G T N N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 19 52047047 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 52047053 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52047103 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 52047201 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52047239 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52047527 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52047812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52047876 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52047911 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52047949 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52048313 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 52048360 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 52048378 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 52048405 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 52048460 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 52048488 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52048490 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52048541 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 52048563 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 52048566 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52048608 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52048625 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52048895 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52048913 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52048998 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52049015 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52049017 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52049039 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 52049087 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52049299 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52049427 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52049499 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 52049603 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52049626 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 52049683 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52049724 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52049781 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52050749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52050847 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52050859 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52051345 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52051350 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52051374 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 52051413 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 52051416 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 52051426 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 52051555 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 52051588 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 52051628 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52051637 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52052314 T C N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 19 52052386 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 52052404 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 52052405 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 52052442 A T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 52052550 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 19 52052634 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 52052697 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 52052748 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 52052778 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 52052779 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 52052831 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52052858 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 52052963 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 52053009 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52053031 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 19 52053068 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 52053096 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 52053108 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 52053186 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 52053209 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 52053572 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 52053909 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52053932 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52053933 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52054379 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 52054861 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52055056 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 52055083 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 52055351 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52055370 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52055617 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52055848 A G Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 52055944 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52055958 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 52056100 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 52056176 T C Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 52056256 C T Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 52056271 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 52056276 A G Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 52056299 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52056343 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 52056422 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52056443 A G Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 52056444 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52056490 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 52056498 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 52056508 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 52056590 A T Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52056612 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52056631 T A Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 52056677 A C Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 52056739 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52056834 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52056845 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52056910 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52056959 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52056979 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 52056981 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 52057004 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52057036 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52057037 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52057064 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 52057144 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52057300 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52057308 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52057366 C A Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52057386 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 52057398 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52057403 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52057584 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 52057714 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 19 52057770 G C Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52057795 A G Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 52057848 C G Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 52057856 T C Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 19 52057960 A T Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 52058009 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52058037 T A Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 52058083 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 52058469 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 52058821 C G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52059070 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52059086 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 52059119 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 52059181 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 52059281 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 52059347 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52059373 T G Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 52059436 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 52059612 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 52059644 A C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 19 52059650 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 19 52059670 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 19 52059702 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 52059740 T A Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52060216 G C Y N 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 19 52060269 G A Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 19 52060465 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52060581 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 52060595 A G Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 19 52060709 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 19 52060812 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 52063240 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52063487 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 52064040 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52064146 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 52064202 T G Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 52064288 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52064427 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52064478 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52064539 C A Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 52064580 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 52064608 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 52064842 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52064891 G T Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52065121 A T Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 52065157 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 52065508 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 52065866 G C Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52065893 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 52066157 C G Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52066432 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 52066442 T C Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 15 15 6 3 6 19 52066563 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 52066643 G T Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52066650 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52066757 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52066791 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52066829 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52067020 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 52067073 C T Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 19 52067093 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 52067101 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 52067157 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52067197 C A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52067272 G A Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 52067284 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 52067440 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 52067481 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 52067503 C T Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 52067504 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 52067662 C G Y N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 52067721 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 52067767 C A Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 52067774 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 52068213 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 19 52068352 T C N Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 19 52068435 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 52068526 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 52068553 T C Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 19 52068572 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52068605 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52068620 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 52068624 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52068659 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 52068668 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 52068678 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52068699 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 52068722 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 52068785 G C Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52068791 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52068849 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 52068885 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 52068930 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52068931 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52068956 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 52068959 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 52069139 G C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 52069148 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 52069207 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 19 52069268 A C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 52069304 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 19 52069306 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 19 52069321 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 52069341 G T Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52069345 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 52069398 G T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 52069425 G T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 19 52069440 A T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 52069457 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 52069477 A G Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 19 52069526 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 52069542 T A Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 52069560 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 19 52069592 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52069645 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 52069839 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52069854 A C Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52069900 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52069948 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52069956 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52069994 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 52070653 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 52070696 G A N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 19 52070732 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 52070793 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 52070807 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 52070859 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52070875 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 52070890 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 52070929 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 52070959 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 52071014 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 52071098 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52071101 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52071111 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 52071113 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 52071333 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52071437 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52071515 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52071537 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 52071573 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52071587 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 52071636 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 52071645 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 52071868 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 52072026 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52072029 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52072102 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 52072148 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52072263 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 52072386 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 52072387 G T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 19 52072739 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 52072763 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52072774 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 52072839 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52072897 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 52072923 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 52072939 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52072940 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 52072961 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 52072979 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 52073056 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 52073100 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 52073109 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 52073198 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 52073502 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 52073531 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52073792 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 52073839 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 52073909 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52073941 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 52074048 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 52074153 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 52074164 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 52074165 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 52074332 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 52074363 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52074429 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52074480 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 52074542 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 52074552 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 52074557 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 52074568 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 52074630 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52074642 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 52074673 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52074760 C A Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52074952 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 52074978 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52075033 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 52075100 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52075251 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 52075269 A C Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 52075413 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 52075663 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52075712 T C Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 52075760 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52075904 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 19 52078214 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 19 52078762 C T Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 52078824 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 52078892 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 52078905 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 52079015 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52079179 C A N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 19 52079275 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 52079371 C T Y Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 19 52079414 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 52079463 A C Y N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 19 52079514 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52079537 A G Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 19 52079552 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 52079642 T G Y N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 52079655 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 52079762 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 52080096 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 19 52080562 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 19 52080713 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 52080880 G T Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52081122 G C N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 19 52081441 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52081534 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 52081709 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52081751 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52081756 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52081769 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52081798 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52081859 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52081875 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 52081893 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52081902 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 52081916 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52081938 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 52081940 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52081965 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52082001 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52082032 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52082050 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52082058 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52082081 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52082085 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 52082086 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52082111 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52082117 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 52082118 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 52082332 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 52082427 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52082450 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52082463 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 52082497 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 52082537 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52082549 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 52082567 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52082656 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52082728 C A Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52082764 A C Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52083074 G T Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 52083213 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52083231 C T Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 52083360 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 52083446 G T Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52083513 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52083613 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52083616 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 52083624 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 52083692 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 52083702 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 52083919 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 52083990 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 52084013 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52084043 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 52084044 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 52084082 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52084123 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 52084128 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 52084145 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52084226 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52084240 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52084350 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52084364 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52084376 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52084378 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 52084386 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52084399 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 52084456 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52084491 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52084515 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52084554 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 52084683 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52084727 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 52084741 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52084766 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52084785 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 52084854 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52084959 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52085019 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52085083 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52085153 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52085158 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52085223 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 52085243 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52085262 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52085335 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52085375 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52085399 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52085406 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52085477 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52085485 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52085498 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52085559 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52085616 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 52085637 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52085683 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 52085728 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52085735 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52085846 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 52085853 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52085941 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52086015 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 52086042 C G Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 52086075 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 52086184 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 52086225 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 52086253 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52086313 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 52086351 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 52086378 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 52086582 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 52086651 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 52086708 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 52086771 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 52086905 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52086954 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52086978 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52087013 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52087199 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 52087206 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52087263 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52087306 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52087320 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52087377 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52087430 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 52087911 C A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 52087969 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 52088300 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52088319 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52088335 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52088466 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52088751 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52089124 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 52089153 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52089582 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52089681 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52089761 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 52089939 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52089951 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 52089959 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 52090283 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 52090634 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 52090846 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 52090921 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 52091142 A G Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 52092113 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 52092192 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52092537 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52092618 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52092764 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52092832 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52092932 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52092960 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52093098 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52093127 A T Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 52093782 C T Y Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 19 52094146 C T Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 52096328 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 52098088 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52098188 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52098271 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52099565 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52099820 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 52100252 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52100424 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 52100436 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52100882 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52101626 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 52102052 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52102453 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52102536 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52102616 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 52102793 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52102834 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52102842 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 52102921 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 52102959 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 52102963 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 52102976 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 52102995 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 52103198 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 52103646 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52103740 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 52103842 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 52103862 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 52104298 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52104402 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52104432 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 52104468 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52104800 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 52104913 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52104946 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52105016 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 52105019 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 52105153 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52105204 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 52105332 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 52105334 G T Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 52105347 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 52105382 G T Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 52105395 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52105493 G T Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 52105502 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52105513 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52105591 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 52105757 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 52105773 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52105794 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 52105855 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52106025 T G N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 52106251 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 52106455 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 52106473 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 52106522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52106643 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 52107718 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 52108000 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52110560 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52110746 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 52110802 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52110805 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52110826 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 52110872 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 19 52111098 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 52111629 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 52112176 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 52112997 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 52113082 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 52113127 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 52113135 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 52113352 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 19 52114036 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 52114831 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 52115121 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 52115393 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52115593 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 52116018 A C Y N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 52116103 G C Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 52116875 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52118251 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 52118642 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52119293 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52119845 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52119996 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 52120101 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 52120341 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 52120712 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52120967 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52121052 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52121567 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 52122058 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 52122195 G T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 52122371 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 52124029 G A Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 52124295 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 52124299 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 52125262 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52125291 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52125373 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 52125557 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52125906 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 52126050 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 52126166 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 52126391 G T Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 52126580 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 52127404 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 52127486 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52127835 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 52128878 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 52129287 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 52130325 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 52130337 G C Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 52130436 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 52130739 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 52131136 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 52131616 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 52132076 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52132130 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 52132709 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 52132847 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 52132849 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 52132885 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 52132895 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 52133042 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 52133309 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 52133368 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 52133456 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 52133489 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 52133497 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 52133562 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52133656 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 52133754 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 19 52133865 C G N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 52134023 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 52134043 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 52134057 T A Y N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 19 52134078 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 52134119 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 52135153 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 52135705 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 52135739 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 52136357 G C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 52136889 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 52137115 A T Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 52137166 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 52137331 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 52137343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52137509 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 52137531 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 19 52137590 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 52137606 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 52137683 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 52137708 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 52137741 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 52137744 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 52137753 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 52137789 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 52137913 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 52137914 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 52137966 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 52138059 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52138154 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 52138302 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 19 52138319 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 52138379 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 19 52138483 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52138559 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 52138637 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 52138683 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52138729 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 52138760 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 52138807 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 52138829 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 52138851 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 52139134 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52139166 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52139190 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52139196 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52139313 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52139347 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52139364 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52139389 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 19 52139681 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 52139694 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 52139885 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52140190 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 52140233 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 52140299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52140476 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52140512 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52140517 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 52140620 T A Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 52140758 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 52140777 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 52140799 G C Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 52141805 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 52142472 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 52142473 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 52142594 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52142798 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 52142869 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52143000 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52143065 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52143110 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52143128 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52143292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52144820 G C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 52144870 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 19 52144872 C A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 52144960 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 52145206 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 52145324 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 19 52145475 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 52145505 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 52145513 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 52145696 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 52145726 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 52145731 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 52145738 G T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 19 52145888 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 52145889 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 52145894 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52145913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52145914 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 52146039 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 52146118 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 52146146 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52146160 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52146255 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52146378 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 52146385 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 52146432 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52146678 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52146784 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 52146918 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 52147254 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52147379 G C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 52147396 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 52147401 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 52147478 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 52147546 G T N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 19 52147551 C T N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 19 52147806 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 52147843 C G Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 52147876 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 52148112 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 52148261 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 19 52148312 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 52148423 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 19 52148476 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 19 52148492 C G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 52148530 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 52148531 C G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 52148553 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 52148630 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 52148649 C A N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 19 52148731 C A N N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 11 9 4 3 3 19 52148849 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 19 52148901 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 52148933 C T Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 19 52149073 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52149088 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 52149129 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 52149155 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 52149910 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 52151247 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 52151274 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52153539 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 52153593 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 52153925 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52155490 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 52155649 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52155754 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 52156389 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52157131 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52157807 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 52157976 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 52158063 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52158202 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52158414 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52158538 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52158596 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52158725 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52158819 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 52159075 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 52159100 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52159341 C A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 52159347 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 52159485 T C Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 52159718 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52159841 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52160667 T G N N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 4 8 2 0 4 19 52160690 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 52160799 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 52162118 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 52162271 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 52162670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52163232 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 19 52163240 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 19 52163258 G A N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 19 52163274 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 19 52163406 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52163490 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52163523 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 52163640 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 52163681 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 52163968 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 52163997 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 52164403 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52164427 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 52164468 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52164525 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52164555 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 52164558 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 52164574 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52164732 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 52164889 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 52164922 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 52164948 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 52164958 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52164974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52165161 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52165204 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 52165288 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52165317 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 52165505 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 52165583 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 52165619 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 52165632 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 52165649 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 52165654 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 52165655 T A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 52165667 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 52165737 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 52165763 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 52165774 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 52165797 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 52165824 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 52165956 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 52166084 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 52166116 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 52166133 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52166269 T A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 52166275 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 52166277 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 52166288 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 52166337 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 19 52166368 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 52166373 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 52166427 T G Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 52166429 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 52166433 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 52166443 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 52166453 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 52166576 G T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 52166656 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 52166819 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52166821 C A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 52166930 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 52167075 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 52167224 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52167274 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52167320 G T Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 52167358 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 52167359 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52167362 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 52167374 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 52167375 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 52167398 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 52167469 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 52167494 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 52167511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52167515 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 52167566 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 52167581 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52167652 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 52167681 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 52167696 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 52167702 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 52167707 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 52167711 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 52167724 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 52167732 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 52167738 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 52167792 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 52167812 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 52167857 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 52167872 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 52167893 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 52167897 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 52167903 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 52167950 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 52167963 G C Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 52167974 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 19 52168015 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 52168016 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 52168071 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 52168129 G T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 52168171 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 52168225 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52168250 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 52168257 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 52168296 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 52168305 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 52168332 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 52168336 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52168360 G C Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 52168409 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 52168413 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 52168416 G T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 52168434 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 52168509 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 52168553 G C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 52168557 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 52168575 A C Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 52168670 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 52168692 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52168776 C G Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 52168890 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 52168926 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 52169063 T G Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 52169079 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 52169087 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 52169094 A G Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 19 52169135 A C Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 52169182 T A Y N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 19 52169186 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 52169221 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 52169227 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 19 52169250 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 19 52169254 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 19 52169270 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52169274 T G Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 52169277 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 52169290 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 52169309 T A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 52169347 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 52169352 A T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 52169400 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 52169404 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 52169418 C A Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 52169520 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 52169582 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 52169584 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 52169621 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52169675 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 52169754 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52169892 T A N N 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 19 52169917 G T Y N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 19 52170107 G C Y N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 19 52170164 T C Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 19 52170271 G T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 52170378 T C Y Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 19 52170521 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 52170654 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 52170716 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 52170759 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 52170847 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 52170873 A T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 52170880 T G Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 52171094 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52171322 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 52171357 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 52171494 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 19 52171554 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 19 52171600 A G Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 19 52171604 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 52171724 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 52171766 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 52171807 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 52171822 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52171839 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 52171855 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 52171877 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52171880 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 52171881 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 52171902 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52171918 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52172013 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52172023 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52172058 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52172118 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52172168 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52172199 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52172201 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52172294 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52172439 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52172469 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52172570 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 52172606 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52172615 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52172790 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52172796 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 52172965 A T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 52173620 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 52174101 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 52174626 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 52174640 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 52174663 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 52174710 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 52174721 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 52175461 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52175475 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52175525 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 52176265 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 52176933 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 52178572 T C Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 19 52180160 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52180596 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52180832 T G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 52182650 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52183138 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52183924 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 52184305 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52184946 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 52186893 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 52187566 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 19 52188276 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 52188285 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 52188308 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 52188379 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 52188462 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 52188525 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 52188534 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 52188564 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 52188667 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 52188682 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 52188690 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 52188717 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 52188727 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 52188730 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 52188787 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 52188820 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 52188836 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 52188837 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 19 52188862 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 52188919 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 52188925 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 52188940 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 52188986 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 52189059 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 52189212 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 52189238 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 52189268 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 52189295 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 52189317 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 52189493 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 52189710 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 52189745 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 52189858 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 52190420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52190801 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 52191211 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 52191297 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 52191835 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 52191892 G T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 19 52191904 T A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 19 52192242 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 52192423 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 52192499 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 52192752 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 52192784 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52193148 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 52193274 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 52193284 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 52195707 T A N N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.363636363636364 0.545454545454545 0.0909090909090909 14 8 4 6 1 19 52195847 A T N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 19 52195886 A G N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 19 52195910 A G N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 19 52196162 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 19 52196209 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 52196278 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 52196289 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 19 52196290 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 19 52196793 A T N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 19 52197019 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 52197044 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 52197231 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 52197457 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 52197467 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 52197559 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 52197577 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 52197662 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 52197670 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 52197719 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 52198098 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52198108 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 52198131 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 52198313 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 52198629 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 52199011 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 52199070 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52199112 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52199118 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52199144 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52199151 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52199174 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52199187 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 52199261 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52199272 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52199273 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52199281 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52199287 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52199294 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52199324 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 52199404 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 52199406 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 52199426 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 52199480 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 52199491 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52199492 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52199575 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52199597 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52199753 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52200050 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 52200214 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 52200332 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 52200527 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 52200541 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 52200583 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 52200706 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52200723 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 52200724 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 52200756 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 52200772 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 52200862 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52200877 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 52200918 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 52202145 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 52202565 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 52202608 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52202760 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 52202827 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 52203213 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 52203337 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 52203378 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 52203700 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 52203701 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 52203786 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 52204021 A C Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 52204087 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 52204106 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 52204209 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 52204218 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 52204267 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 52204334 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 52204363 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 52204541 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 52204838 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 52204965 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 52205039 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 52206516 T G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 19 52207091 G T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 19 52207189 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52207515 C A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 52207730 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 52208018 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 52208166 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 52208652 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 52208874 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 52209160 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 19 52209338 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 52209489 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 52209756 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 52210597 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 52210860 A T N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5 0.1875 0.3125 19 13 8 3 5 19 52210973 G C N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 19 52211332 A G N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.384615384615385 0.230769230769231 0.384615384615385 13 13 5 3 5 19 52211888 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52212374 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 52212655 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52213427 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52213521 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 52213863 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52213990 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52214201 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 52214392 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 52214462 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 52214775 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52214895 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 52214908 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 52214977 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 52215009 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52215054 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52215229 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52215294 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52215957 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 52216150 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52216156 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 52216357 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52216751 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52216864 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 52217106 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 52217109 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 52217112 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 52217185 C A Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 52217245 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 52217353 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 52217401 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 52217475 C G Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 19 52217680 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 52217702 T G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 19 52217703 A C N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 19 52217813 C A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 52217911 A C Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 19 52217942 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 52218094 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 52218177 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 52218270 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 52218276 G C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 52218277 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 52218330 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 52218331 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 52218342 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 52218399 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 52218570 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 52218590 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 52218863 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 52218943 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 52219003 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 52219133 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 52219227 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 52219517 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 52220198 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 19 52220308 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 52220325 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 52220326 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 52220368 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 52220381 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 52220585 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 52220911 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 52221153 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 52221182 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 52221345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52221374 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 52221408 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 52221558 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 52221642 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 52221661 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 52221662 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 52221692 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 19 52222094 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 52222303 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 52222357 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 52222597 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 52222905 G A Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 52222911 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 52223083 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 52223147 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 52223183 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52223203 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52223251 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 52223299 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 52223473 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 52223474 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 52223488 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 52223491 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 52223611 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 52223618 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 52223651 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 52223777 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 52223874 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 52223875 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 52223883 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 52224010 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 52224082 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 52224186 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 52224217 A T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 52224249 T A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 52224265 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 19 52224455 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52224522 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 52224524 C A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 52224533 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 52224727 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 52224903 T A N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 19 52225058 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 52225071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52225082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52225143 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 52225180 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 52225189 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 52225212 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 52225249 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 52225262 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 52225313 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52225318 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52225339 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 52225383 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 52225472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52225631 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 52225812 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 52225999 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 52226000 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52226027 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52226028 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52226110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52226476 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 52226511 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 52226544 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52226625 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 52226637 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 52226695 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 52226787 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 19 52226789 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 52226822 C T N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 19 52227327 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 52227344 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 52227349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52227386 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 52227392 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52227423 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52227443 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 52227482 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 19 52227510 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 52231297 A G N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 19 52231320 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52231438 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52231583 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 52231672 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52231775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52231855 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52232138 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52232149 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52232465 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52232467 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52232558 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 52232563 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 52232658 C T N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 19 52232824 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 52233066 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52233165 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52233271 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 52234107 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52234300 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 19 52234485 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52234524 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52234674 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 52234841 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 52234985 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 52235163 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 52235186 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52235207 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52235227 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52235234 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52235283 G C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 52235319 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 52235530 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 52235627 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 52235648 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 52235858 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 52236045 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 52236371 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 52236751 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 52236754 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 52236816 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 52236875 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 52237102 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52237181 A G Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 52237217 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 52237278 T C Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 19 52237314 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 52237388 T G Y N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 52237434 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 19 52238018 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 52238116 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 52238668 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 52239517 A C N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 19 52239520 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 19 52240008 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52240804 T C Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 19 52241809 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 52241824 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 52241827 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 52242478 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52242535 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 52242591 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 52242676 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 52242677 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 52242678 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 52242689 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 52242743 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 52242855 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 52242977 A C Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 52242982 T A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 52243011 T A Y N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 52243016 T C Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 52243017 C T Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 19 52243040 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 52243059 A G Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 19 52243262 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 52243297 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 52243321 A C Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 52243323 G C Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 52243367 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52243414 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 52243487 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52243660 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 52243772 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 52243920 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 19 52244044 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 52244226 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 52244638 G A Y Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 8 6 3 2 2 19 52244700 G A N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 19 52244922 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 52244979 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 52244992 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 19 52245115 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 52245292 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 52245317 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 52245320 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 52245670 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52245683 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 52246077 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52246110 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 52246188 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52246364 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 52246463 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52246691 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 52246711 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 52246963 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 52247214 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 52247320 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 52247431 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 52247589 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 52247683 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 52247789 T G Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 52247793 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 52247903 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 52247907 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 52247909 T G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 52248078 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 52248169 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 52248365 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 52248367 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52248390 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52248556 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52248718 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 52248761 C G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 52248772 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52248985 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 52249026 A T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 52249116 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 52249209 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 19 52249336 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 52249521 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 52249522 T A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 52249545 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52249550 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 52249639 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 52249977 A T Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 52249978 A T Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 52250279 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 52250282 A T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 52250316 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 52250439 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 52250544 C A Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 52250658 G T Y N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5 0.1875 0.3125 19 13 8 3 5 19 52250710 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52251582 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52252376 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 52253722 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 19 52253882 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 52253904 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 19 52253959 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 52253967 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52254101 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52254450 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 52254462 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 52254474 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 52254633 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 52254692 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 52254697 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52254800 T G Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 52254901 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 52254969 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 52255086 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 52255087 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 52255116 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 52255135 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 52255264 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 52255443 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 52255478 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 52255578 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 52255581 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 52255585 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 52255596 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 52255661 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 52255810 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 52255828 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 52255831 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 52255833 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 52255881 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 52255931 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 52255940 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52257067 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 52257297 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 52257554 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52257635 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52257670 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 52258020 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 52258104 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 52258167 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52258342 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 52258479 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 52258522 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 52258723 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 52258904 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 52258994 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 52259023 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52259039 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 52259168 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52259186 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 52259337 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 52259345 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 52259460 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 52259584 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 52260096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52260108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52260109 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 52261246 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 52261408 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 19 52261496 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52261552 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 52262135 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 19 52262793 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 52262858 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 19 52262981 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 19 52262992 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 19 52263387 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52263471 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52264300 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 52264342 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 52264360 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 52264482 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 52264538 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52264778 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52265525 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 52265612 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 52265915 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 52265953 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 52266170 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.375 0.125 0.5 14 18 6 2 8 19 52266212 T A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 19 52266415 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 52266571 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 52266856 T C N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.272727272727273 0.181818181818182 0.545454545454545 8 14 3 2 6 19 52267795 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 52268024 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 52268297 T G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 19 52268300 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 19 52268364 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 52268377 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 52268563 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 52268565 T G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 52268588 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 52268623 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 52268724 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 52269315 G T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 52269411 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52269672 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 52269746 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 52269877 T G Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 52269879 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 52269883 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 52269923 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 52269985 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 52270015 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 52270446 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 52270610 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52270784 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 52270942 A C Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 52270943 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 52271022 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 52271119 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 52271177 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 52271208 C G Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 52271215 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 52271221 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 52271227 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 52271308 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 19 52271356 C T Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 52271405 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 52271485 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 19 52271486 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 52271540 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 19 52271554 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 19 52271561 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 52271743 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 52271777 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52271987 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 52272020 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 52272075 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 52272137 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 52272141 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 52272217 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 52272330 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 52272546 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 52272613 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 52272622 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 52272825 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 52272837 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52272861 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 52272888 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 52272891 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 52272908 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 52272928 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 52273074 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 52273412 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 52273457 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 52273478 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52273559 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 52273562 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 52273623 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 52273625 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 52273650 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 52273660 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 52273914 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52274437 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52274689 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 52274931 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 52274959 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 52275513 G A Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 52276013 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52276043 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 52276282 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52276337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52276987 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 19 52277742 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 52281351 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 52282356 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 52282595 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 52282756 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 52282758 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 52282769 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 52282780 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 52282787 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 52283877 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 52283989 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 52284134 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 52284196 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 52284228 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 52284357 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 52284542 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 19 52284608 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 52285538 A T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 52285630 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 52285720 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 52285864 C T N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 19 52285865 A C N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 19 52285874 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 19 52285921 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 19 52286053 G T N N 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 8 10 2 4 3 19 52286172 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 19 52286186 C G N N 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 19 52286220 G C N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 19 52286325 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 19 52286511 T C N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.454545454545455 0.181818181818182 0.363636363636364 12 10 5 2 4 19 52286567 C G N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 19 52286634 T C N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.538461538461538 0.153846153846154 0.307692307692308 16 10 7 2 4 19 52286698 T C N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.4 0.133333333333333 0.466666666666667 14 16 6 2 7 19 52286742 A T N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 19 52286856 A G N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.416666666666667 0.25 0.333333333333333 13 11 5 3 4 19 52286946 A G N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.307692307692308 0.230769230769231 0.461538461538462 11 15 4 3 6 19 52287483 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52287789 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 52287809 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 52287816 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 52287818 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 19 52287892 T A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 19 52288406 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 52288656 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 52288673 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 52288694 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 52288908 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 52288932 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52289140 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52289177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52289223 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 52289369 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 52289511 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 52289569 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 52289649 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52289896 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 19 52290844 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 19 52291018 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 52291034 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 52291112 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 52291133 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 52291182 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 52291201 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 52291263 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52291272 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 52291306 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 52291325 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 52291334 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 52291419 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 52291548 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 52291743 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 19 52291754 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 52291853 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52291872 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 52291924 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 52292122 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 52292130 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 52292143 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 52292156 A G N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 19 52292168 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 52292351 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 52292633 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 19 52292651 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 52292699 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 52292722 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 52292772 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 52292819 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 52292919 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 52292969 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 52293017 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52293054 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 52293169 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52293196 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52295262 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52295715 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52296400 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52296762 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52299047 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52300158 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52300872 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52300957 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 52300970 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 52301381 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52301399 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52301620 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52301846 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 52302453 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52302605 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 52302975 G C N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.375 0.125 0.5 14 18 6 2 8 19 52303062 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 52303085 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 52303097 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52303172 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52303303 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 52303404 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 52303411 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 52303468 C A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 52303631 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52303848 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52303973 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 52304052 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52304060 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52304239 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 52304273 C A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 52304274 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 52304331 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52304426 A T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 19 52304427 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 52304458 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.375 0.1875 0.4375 15 17 6 3 7 19 52304476 T G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 19 52304607 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 19 52304666 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 52304714 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 52304739 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 52304761 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 52304816 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 52305034 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 52305289 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 52305485 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 52305557 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 52305566 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 52305662 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 52305671 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 52305673 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 52305678 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 52305726 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 19 52305729 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52305807 C G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 19 52305880 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 19 52306284 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 52306333 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 52306393 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 52306433 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52307834 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 52307933 T A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52308509 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 52308590 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 19 52308674 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 19 52309137 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 52309417 C T Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 19 52309698 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 52309940 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 52310036 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 52310129 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 52310185 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 52310197 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 52310222 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 52310246 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 52310259 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 52310378 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52310432 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 52310437 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 52310468 A C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 52310489 G T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 19 52310491 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 52310555 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 52310611 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 19 52310665 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 52310675 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 52310806 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 52310853 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 52311288 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52311333 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 52311359 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 52311428 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 52311436 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 52311438 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52311455 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 19 52311513 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 52311638 G T N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 19 52311742 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 52311834 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 19 52311835 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 52311873 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52311881 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 52311997 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 19 52312026 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 52312059 C T N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 19 52312397 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 19 52312401 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 52312618 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 52312625 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 52312651 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 52312652 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 52312684 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 52312919 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 52313011 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 52313062 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 52313063 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 52313064 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 52313338 C T N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 19 52313410 C A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 19 52313532 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 52313677 G T Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 52313737 T G Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 19 52313754 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 52313786 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 52313883 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 52313893 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 52313994 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52313995 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52314073 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52314091 T C Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 52314099 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52314109 T A Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 52314114 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52314298 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52314373 T G Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 52314426 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 52314442 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 52314476 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52314542 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52314576 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 52314612 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 52314634 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 52314645 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 52314657 G C Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 52314677 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 52314745 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52314748 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 52314784 G T Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 52314882 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 52314896 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 52314980 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 52315276 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 52315291 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52315303 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 52315443 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 52315498 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 52315541 G T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 52315542 T A Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 52315598 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 52315786 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 52315961 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52316060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52316843 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 52316898 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 52316946 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52316950 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52316951 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52316959 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 52317011 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52317023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52317244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52317376 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52318177 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 52318193 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 52318194 T G Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 19 52318325 T A Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 52318328 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 52318959 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52319127 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 52319139 A C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 52320769 C G N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.375 0.1875 0.4375 15 17 6 3 7 19 52320894 G A Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 19 52323392 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52324359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52324796 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52325799 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52326766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52326865 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 52326866 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52327368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52327508 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52328828 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52332346 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52332428 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52332480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52332494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52333768 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52334073 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 52334339 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 52334356 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 52334658 C A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 19 52334685 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 19 52334806 C T N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.636363636363636 0.181818181818182 0.181818181818182 16 6 7 2 2 19 52334938 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 19 52334978 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 19 52335057 T C Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 19 52335070 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 52335077 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 52335112 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 52335134 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 52335135 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.6875 0.0625 0.25 23 9 11 1 4 19 52335194 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 52335301 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52335469 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 52335742 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 52335747 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52335787 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52335821 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52335823 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 52335847 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 52335863 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52335905 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52335975 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 52336065 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 52336066 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 52336077 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 52336090 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 52336144 A T Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 52336192 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 52336217 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 52336443 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 52336506 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 52336604 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 52336860 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 52336919 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52336934 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 52337053 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 52337118 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 52337123 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 52337142 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52337216 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52337274 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 52337297 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52337349 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52337435 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 52337490 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 52337698 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52337699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52337763 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 52337955 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 52337975 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 52338014 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 52338053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52338104 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 52338169 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 52338225 A C Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 52338274 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 52338283 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 52338300 C A Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 52338310 C G Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 52338347 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 52338349 A T Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 52338409 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 52338566 A G Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 52338617 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52338626 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52338887 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52338948 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52339126 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52339176 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52339221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52339293 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52339407 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52339630 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 52339631 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52339664 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 52339753 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52339851 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 52339985 G T Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 52340030 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 52340065 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 52340313 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 52340399 A C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 52340485 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 19 52340563 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 19 52340881 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52340912 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 52341094 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 52341104 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 19 52341374 C T Y Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 19 52341977 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 52342074 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 52343867 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 19 52344096 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 52344888 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 52345837 T C Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 52345944 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 52346202 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 52346205 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 52346233 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 52346291 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 52346458 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 52346850 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 52346858 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 52346900 A T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 52346991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52346997 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 52347039 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 52347059 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 52347144 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 52347147 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 52347228 A G Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 52347253 A C Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 19 52347288 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 19 52347375 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 19 52347402 G A N Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 19 52347478 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 19 52347620 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 19 52347701 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 52347897 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 52347900 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 52347957 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52347994 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 52348447 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52348514 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52348576 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52348844 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 52348894 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 52348926 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 52349010 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 19 52349017 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 19 52349052 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.214285714285714 0.142857142857143 0.642857142857143 8 20 3 2 9 19 52349055 T G N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.214285714285714 0.142857142857143 0.642857142857143 8 20 3 2 9 19 52349105 G A N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 19 52349111 C T N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 19 52349359 T C Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 52349382 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 52349399 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 52349425 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 52349484 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 52349586 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52349638 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 52349741 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 52349981 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52350073 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 52350124 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 52350144 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 52350170 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 52350449 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52350609 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 52350666 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 52350743 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 52350763 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 52350799 T G N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 19 52350805 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 52350827 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 52350891 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52350899 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 52350935 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 52351275 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 52351353 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 52351450 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 52351470 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 52351544 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52351582 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 52351620 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 52351710 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 52351724 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52351807 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 52351974 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 52351988 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 19 52352098 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 52352109 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 52352133 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 52352245 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 52352271 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 52352380 T A Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 52352618 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 52352749 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 52352999 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 52353040 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 52353125 C A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 52353207 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 52353211 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 52353253 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 52353288 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52353326 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52353350 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 52353435 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52353469 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 52353491 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 52353578 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 52353704 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52353708 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52353815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52353879 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 52353901 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 52353917 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 52353941 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 52353968 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52353970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52354077 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 52354095 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 52354100 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52354132 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 52354846 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 52355031 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52355103 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52355150 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52356196 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 52358528 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52359182 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52359365 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52359559 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 52359566 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 52359576 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 52359581 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52359628 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 52359641 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 52359667 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52359746 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52359771 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52359834 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52359861 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52359880 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52359942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52360009 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52360012 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52360192 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 52360282 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52360304 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 52360315 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 52360347 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52360361 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 52360399 G C N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 19 52360448 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52360739 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 19 52360927 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52360978 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52360980 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52361001 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 52361005 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 52361034 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 52361175 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52361203 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 52361325 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 52361329 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 52361499 A T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 52361532 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52361548 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52361559 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 52361565 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 52361579 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52361613 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 52361693 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52361715 G T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 52361731 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 52361782 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52361786 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52361943 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52361957 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52361996 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 52362221 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 19 52362362 T G N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.333333333333333 0.25 0.416666666666667 11 13 4 3 5 19 52362421 C T N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.416666666666667 0.25 0.333333333333333 13 11 5 3 4 19 52362439 G T N N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.272727272727273 0.272727272727273 0.454545454545455 9 13 3 3 5 19 52362493 T C N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 19 52362537 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 19 52362691 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 52362876 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 52362892 T G N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 19 52362934 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 52363786 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 52364001 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 52364068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52364080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52364215 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52364216 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 52364255 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52365111 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52366112 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52367289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52367879 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52368151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52368251 A G Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 52368303 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52368393 A G Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.294117647058824 0.117647058823529 0.588235294117647 12 22 5 2 10 19 52368523 G C N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 19 52368555 C A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 19 52368967 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52369483 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52369628 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 52369657 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52369684 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 52369751 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52370216 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 52370492 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 52370544 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52370806 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52370818 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52370885 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 52370951 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52371003 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 52371072 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52371182 A C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 52371188 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 52371193 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 19 52371381 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52371386 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52371397 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52371443 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 52371691 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52371822 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 52372109 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 52372117 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52372207 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 52372241 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52372276 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 52372277 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 52372388 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 52372759 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 52372888 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 52372918 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 52372932 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52373058 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 52373515 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 52373520 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 52373551 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 52373707 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 52373735 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 52373740 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 52374004 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 52374058 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 52374076 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 52374139 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 52374196 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 52374259 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 52374311 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 52374379 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 52374967 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 52375176 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 52375178 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 52375428 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 19 52375977 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52375996 T G Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 52376060 T A Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 52376064 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52376078 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52376136 T C Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 52376155 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52376176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52376194 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 52376201 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 52376323 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52376366 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 52376699 G C Y N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 19 52376852 A C Y N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.375 0.1875 0.4375 15 17 6 3 7 19 52377082 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52377088 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 52377110 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52377115 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52377199 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 52377241 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 52377587 G A Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 52377600 A C Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 52377601 A G Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 19 52377618 A T Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 52384313 C T Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 52384488 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52385197 A G Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 52385200 G A Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 19 52385400 A C Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 19 52385506 A C Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 52385733 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52385840 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52385885 A G Y Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 19 52387489 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 52387900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52387921 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 52387942 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 52389078 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 52390436 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52390540 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52390564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52390888 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 52390985 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 52390990 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 52391115 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 52391146 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 52391249 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 52391275 A G N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.461538461538462 0.153846153846154 0.384615384615385 14 12 6 2 5 19 52391391 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.466666666666667 0.2 0.333333333333333 17 13 7 3 5 19 52392940 A G Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 52393002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52393013 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 52393041 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 52393048 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 52393073 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 52393078 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 52393093 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 52393095 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 52393125 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 52393393 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 52393435 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 52393472 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52393490 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 19 52393596 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 52393751 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 19 52393773 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 52393812 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 19 52393863 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 19 52394043 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 52394076 A T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 52394100 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 52394107 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52394168 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 52394237 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 52394271 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 52394273 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 52394347 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 52394392 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 52394480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52394500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52394724 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 52394977 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 52394996 T A Y N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.428571428571429 0.142857142857143 0.428571428571429 7 7 3 1 3 19 52395086 T C N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 19 52395375 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52395453 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52395468 G T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 52395526 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 52395529 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 52395585 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 52395591 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 52395648 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 52395675 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 52395804 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 52395809 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 52395873 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 52395922 C A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 19 52395929 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 19 52395965 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 52396050 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 52396118 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 52396158 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 52396206 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 19 52396486 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 52396564 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 52396690 T A Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 52396792 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 52396882 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 52396959 C G Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 52396998 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 52397169 T G Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 52397471 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 52397473 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 52397494 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 52397917 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52398119 C A Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 52398130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52398248 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 52398269 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 52398274 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 52398855 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 19 52399642 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52399655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52399766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52400082 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 52400180 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 52400200 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 52400206 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 52400225 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 52400304 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 52400316 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 52400386 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 52400391 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 52400414 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52400472 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 52400508 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 52400513 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 52400514 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 52400519 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 52400541 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 52400564 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 52400786 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 52400799 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 52400804 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 52400822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52400868 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 52400966 A T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 52401067 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 52401092 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 52401244 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 52401306 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 52401313 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 52401327 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 52401332 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 52401353 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 19 52401525 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 52401616 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 52401881 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 19 52401896 C T N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 19 52402052 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 52402059 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 52402080 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 52402128 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 52402146 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 52402147 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 52402178 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 52402284 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 52402490 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 52402493 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52402532 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 52402556 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52402587 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52402603 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 52402904 A C N N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 19 52403022 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 52403221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52403351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52403352 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52403404 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 52403481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52403495 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 52403604 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 52403627 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 52403634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52403700 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 19 52403875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52403899 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 52403968 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 19 52404071 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 52404170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52404195 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 52404329 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52404351 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 52404595 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 52404839 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 52404986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52404997 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 52405313 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52405404 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 52405409 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 19 52405426 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52405435 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52405438 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 52405451 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52405461 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 52405480 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 52405487 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 52405491 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 52405507 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52405511 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52405792 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52405893 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52405963 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52406131 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52406134 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52406175 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52406176 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52406236 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52406560 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 52406673 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52406684 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52406719 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 52406739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52406910 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 52407034 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 52407096 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 52407231 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 52407456 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52407515 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52407591 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 52407662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52407720 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52407859 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 52407877 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52408180 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52408290 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 52408385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52408490 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 52408616 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 52408783 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 52408901 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 52408967 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 52408975 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52409065 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52409169 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 52409175 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52409207 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 52409323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52409516 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52409517 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52409647 T A N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 19 52409975 A T Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 52410739 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 52410775 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52410776 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52410827 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52411094 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52411119 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52411203 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52411513 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52411617 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 52411628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52411810 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 52412167 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 52412308 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52412326 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52412359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52412394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52412428 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52412429 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 52412442 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 52412447 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 52412634 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52412640 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 52412754 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52412867 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52412872 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52412873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52412904 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52412915 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52412944 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52412980 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 52413057 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52413205 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 52413219 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 52413322 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 52413374 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 52413387 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 52413636 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 52413731 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52413744 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52413819 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52413826 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52414007 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 52414010 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 52414079 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52414253 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52414319 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52414553 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52414570 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52414782 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 52414861 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 52415106 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 52415184 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 52415186 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 52415232 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 52415243 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 52415337 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 52415371 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52415599 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52415625 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 52415659 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52415771 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 52415825 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 19 52415958 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 52415961 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 52415969 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 52416039 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 52416074 A C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 52416122 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 52416181 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 52416239 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 52416910 A T N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 19 52416955 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 19 52416971 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 52416989 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52417113 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 52417210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52417227 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 52417238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52417253 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 52417334 A G Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 52417450 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 52417502 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52417594 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 52417657 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 52417735 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 52417765 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 52417766 G C Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 52417778 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 52417800 G A Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 52417832 A T Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 19 52417844 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 19 52417898 T C Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 52417917 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 52418008 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 52418034 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 52418061 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 52418191 T C Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 19 52418207 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52418223 T C Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 19 52418253 G T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 52418264 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52418282 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 52418310 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 52418322 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52418332 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52418349 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 19 52418591 T C N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 19 52418603 A G Y Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 19 52418860 A T Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 52418861 A G Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 52418947 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52418976 T C Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 19 52419002 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 19 52419052 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 52419082 A G N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 19 52419119 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52419120 T G Y N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 19 52419256 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52419293 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52419311 G T Y N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 19 52419345 G A Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 52419411 G A Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 52419562 T C N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 19 52419580 G T N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.636363636363636 0.181818181818182 0.181818181818182 16 6 7 2 2 19 52419586 T G N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 19 52419705 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52419800 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 52419838 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52419905 G T Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52419957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52420007 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52420070 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 52420199 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52420200 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52420214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52420436 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52420458 A G Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 52420533 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 52420553 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 52420703 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 52420726 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 52420934 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 52421092 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 52421103 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52421118 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 52421137 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 52421213 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52421220 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 52421517 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 52422031 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52422142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52422185 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 52422202 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52422742 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 52422880 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52422924 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52423118 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52423412 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 52423534 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 52423613 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 52423634 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 52423759 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 52424072 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 52424185 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52424665 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 52424807 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52424839 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 52425021 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52425026 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52425152 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 52425180 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52425352 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52425687 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 52425851 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 52425895 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 52426173 C G N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 19 52426187 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 52426209 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52426603 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 52426670 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 52426943 G T N N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 9 9 3 3 3 19 52427154 A G N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 19 52427161 G A N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 19 52427209 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 19 52427267 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 19 52427277 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 52427354 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52427355 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52427372 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52427405 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52427413 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52427452 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52427456 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 52427992 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 52428065 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 52428083 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52428095 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52428173 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52428309 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 52428695 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 19 52428717 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 19 52428912 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52428954 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 52429053 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52429071 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 52429079 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 52429094 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 52429105 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 52429142 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 52429149 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 52429151 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 52429212 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 52429317 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 52429337 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 52429356 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52429465 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52429553 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52429589 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 52429882 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 52429906 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52429936 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52430051 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 52430290 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 52430380 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 52430430 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 52430435 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 52430456 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 52430513 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52430633 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 52431411 G C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 19 52431480 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 52431523 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 52432304 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 52432578 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52432843 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 52432991 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 52433603 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52433858 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 19 52433860 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52433890 T A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 52434306 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 52434622 G A N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.272727272727273 0.272727272727273 0.454545454545455 9 13 3 3 5 19 52434952 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52435233 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 52435407 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 52435937 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 52436468 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 52436936 A T Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52438703 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52439433 A G N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.416666666666667 0.25 0.333333333333333 13 11 5 3 4 19 52440359 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 52440463 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52440841 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 19 52441549 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52441615 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52442313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52442669 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52442759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52443386 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 52443585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52444683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52444722 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 52445136 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52445966 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52447791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52448500 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52449995 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52450007 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52450053 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52451582 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 52452552 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 52454804 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52455261 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52455417 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 52455452 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52455637 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52455701 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 52455808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52456251 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 19 52460902 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52461385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52462198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52462383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52463170 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52465018 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52465202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52466790 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52467723 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52468045 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52468584 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52469025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52470670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52471058 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52471312 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 52471909 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52472303 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52472891 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 19 52472996 T G Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 52474243 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 52474438 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52474475 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 52475370 T C Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 19 52475823 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52476651 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52476732 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52477136 C T Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 52477176 T G Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 52477352 G A Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 19 52477573 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52477615 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52477642 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52477748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52477758 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52478139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52478210 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 52478365 G A Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.5 0.142857142857143 0.357142857142857 16 12 7 2 5 19 52478446 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 52478562 G C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 52479278 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52479313 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52479328 G T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 19 52479330 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 52479334 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52479382 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52479397 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 52479420 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 52479498 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 52479555 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52479565 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 52479576 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 52479611 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 52479733 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 52479859 A T Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 52479989 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 52480057 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 52480085 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 52480108 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52480113 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 52480170 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 52480353 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 52480390 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52480402 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 52480495 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52480733 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52480825 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 52480904 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 52481003 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52481150 G T Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 52481184 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 52481280 C A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 52481408 A T Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 52481418 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 52481588 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52481743 C G N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 19 52481760 G A Y Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 19 52481863 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52482034 T A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 19 52482059 C T Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 52482277 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52482325 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 52482543 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52482708 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 52483058 G A Y Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 19 52483136 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52483139 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 52483187 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 52483199 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 52483367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52483384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52483404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52483585 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 52483619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52483676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52483704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52483717 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52483784 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 52484122 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52484128 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52484137 C A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 52484174 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52484199 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 52484249 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 52484250 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 52484326 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 52485444 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52487594 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52487865 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 52487933 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52487938 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 52487961 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 52488099 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 52488291 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 52488723 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 52488746 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 52489061 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52489083 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52489108 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 52489110 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 52489197 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 52489213 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 52489232 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52489251 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 52489279 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 19 52489417 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 52489455 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 52489458 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 52489479 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 19 52489532 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 19 52489559 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 52489567 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 52489596 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 19 52489621 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 19 52489719 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 52490624 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52491922 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52492243 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52492832 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52493101 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 52493210 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 52494088 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 52494114 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52494123 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 52494196 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 52494296 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 52494557 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 52494580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52494591 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 52494698 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52494873 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 19 52494898 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 19 52495221 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 52495437 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52496156 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52496463 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 52496520 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52497926 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52498076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52498427 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52500316 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 52502010 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 24 4 12 0 2 19 52502337 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 19 52502688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52502900 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52503363 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 52503537 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 52504053 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52506660 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52509257 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52510326 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52512586 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 52513975 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52514996 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 52515001 C A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 19 52515618 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 52517438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52517900 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52519212 G A N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 19 52519376 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52520175 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 52520198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52520965 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52521020 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 52522786 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 52522871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52523525 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 52523578 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52523584 G C Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52524098 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52524318 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 52524357 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52524475 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 52524492 C T Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 52524507 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 52525020 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52525373 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52525374 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 52525443 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52525458 C A Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52525499 A T Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52525500 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52525551 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 52525599 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 52525629 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 52525774 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 52525903 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52525992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52526083 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 52526088 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52526098 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52526127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52526719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52526836 G C Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 52527049 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52527159 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 52527178 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52527289 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52527382 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52528030 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 52528235 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52528272 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 52528340 A G Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 52528529 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52528620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52528640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52528727 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52529817 G C Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 52529850 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52530177 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52530216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52530228 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52530328 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 52530933 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52530956 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 52531241 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 52531320 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52531414 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 52531447 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52531667 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 52531695 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52532046 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 52532071 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52532093 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52532200 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 52532231 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 52532256 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 52532408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52532626 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52532630 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52532659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52532690 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52532834 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52532901 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 52533457 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52533538 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52533842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52533953 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52533996 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52534040 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52534227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52534234 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52534260 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52534269 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52534345 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52534384 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52534386 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52534424 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52534432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52534434 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52534438 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52534670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52534748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52534767 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52534790 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52534800 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52534801 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52534865 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52534901 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52535067 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52535068 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52535076 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52535360 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 52535587 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52535590 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52535617 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52535689 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52535706 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52535774 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52535940 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52535975 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52536027 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52536079 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 52536211 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52536331 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52536352 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52536436 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52536454 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 52536458 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52536460 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52536473 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52536484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52536604 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52536610 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52536768 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52536973 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 52536981 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 52537032 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 52537036 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 52537066 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 52537290 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 52537299 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 52537307 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 52537308 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 52537320 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 52537504 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52537564 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52537581 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52537719 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52537745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52537854 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52538799 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52539049 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 52539419 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 52540048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52540207 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 52540325 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 52540415 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 52540497 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 52541047 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 52541049 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 52541400 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 52541466 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 52541470 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 52541565 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 52541609 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52541611 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 52541817 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 52541836 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52541915 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52541948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52542204 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52542279 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 52542283 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 52542662 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 52542764 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 52542850 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 52542887 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 52543235 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52543236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52543374 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 52543439 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52543542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52543609 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 52543775 T C Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 52544394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52544506 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52544669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52545044 C A Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 52545263 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 52545278 A G Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 52545995 C T Y Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 19 52546006 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 52546465 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 52546539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52546732 C A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 52546842 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 52547007 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52547393 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52547812 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52547977 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 52548059 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 52548168 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52548291 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52549333 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 52549408 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 52549577 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52549591 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52549629 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52549719 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52549731 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 52549732 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52549836 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52549923 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52550305 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 52550419 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52550446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52550455 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52550604 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52550615 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52550840 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52551175 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52551337 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52551400 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 52551406 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52551480 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 52551515 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 52551544 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 52551551 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 52551596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52551664 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 52551835 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 19 52551879 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 52551959 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 52552044 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 52552058 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52552061 G C N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 19 52552149 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52552159 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52552324 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 52552339 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52552357 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52552368 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 52552370 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 52552409 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52552415 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52552445 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52552851 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52552868 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52553001 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52553089 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52553188 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52553189 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52553908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52554680 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52554752 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 52554769 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 52554894 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 52554942 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 52554964 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 52554991 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 19 52555023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52555238 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52555304 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52555513 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 52555526 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 52555878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52556057 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52556302 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 52556394 T C N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 19 52556395 A T N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 19 52557466 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 52557549 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52557669 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52557746 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52557754 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52558204 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52558213 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 52558644 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 52558754 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52558792 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52558826 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52558962 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52559204 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52559205 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52559345 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52560226 G A N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 19 52560248 C G N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 19 52560251 T C N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 19 52560662 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 8 6 2 4 1 19 52560822 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 52560975 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52561220 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52561222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52561474 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52561618 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52561861 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 19 52563505 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 52564069 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52564334 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52564415 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 52564565 T C N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.363636363636364 0.363636363636364 0.272727272727273 12 10 4 4 3 19 52564595 T A N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 19 52564609 T C N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.384615384615385 0.153846153846154 0.461538461538462 12 14 5 2 6 19 52564722 G A N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 19 52564769 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 52564846 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 52564871 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 52564920 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 52565255 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 52565387 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 52565478 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52565485 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 52565502 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 52565584 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 52565668 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52565691 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52565989 T G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 52566173 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 52566667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52566914 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52567137 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52567201 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52567567 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52567681 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52568278 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 52568343 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52568402 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52569062 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52569161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52569195 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52569650 C G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 52569651 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 52570233 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 52571401 A T Y N 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 19 52571515 T G N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 19 52571537 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52571802 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52572279 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 52572709 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52572863 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52573366 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 52573671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52574280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52574585 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52575509 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52575838 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52575865 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52575874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52576712 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 52576928 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 52576959 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52577272 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52577418 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52577513 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52577743 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52577801 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 52578060 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 52578284 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52580711 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52581814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52582745 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52584159 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52584720 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52587444 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 52588295 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 52588399 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 52588627 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 52590955 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52591317 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52591349 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52591418 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52591563 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52591571 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52591627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52591651 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52591703 A T Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 52591806 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52591809 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52592032 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 52592089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52592416 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 52593195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52593923 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52594307 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52594817 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52595078 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52595617 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52595775 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52596294 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52599784 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 52600167 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 52600169 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 52604131 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52604168 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52605568 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 52606076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52607287 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52607670 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52608363 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52608581 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52612033 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52613158 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52617495 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52618939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52622372 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 52622845 A T Y N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 19 52622901 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 52623089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52623136 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52623450 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52623504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52623651 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52623797 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52623881 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 52624123 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 19 52624187 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 52624313 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52624393 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52624408 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 52624409 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52624413 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52624415 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52625021 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52625552 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52627514 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 52627876 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 52627879 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 52627920 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52627969 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 52627994 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 52628037 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 52628171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52628471 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 52628502 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 52628516 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 52628548 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 52628556 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 52628699 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 52628783 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 52628869 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52629028 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 52629048 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 52629049 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 52630647 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52631973 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52632243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52632283 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 52632305 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 52632346 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52632347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52632472 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 52633791 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 52634096 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 52634272 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52634864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52634876 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 52634877 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 52634923 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52635001 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52635108 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 52635154 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52635190 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52635191 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52635224 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 52635276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52635463 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52635519 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52635594 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52635743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52635872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52635943 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52636129 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52636213 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52636321 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52636358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52636429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52636572 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52636710 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52636732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52636871 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52636931 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52637103 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52637813 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 52638274 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 52639197 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 19 52639687 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 19 52639777 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 19 52639817 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 52639833 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 52639928 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 19 52640267 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52640279 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 52640357 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 52640365 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 52640450 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 52640515 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52640557 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52640606 T C N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 15 15 6 3 6 19 52640645 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 19 52640655 C A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 19 52641202 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52641290 A C Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 52641352 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 52641357 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 52641358 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 52641506 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 19 52641714 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52641735 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 52641792 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52642482 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 52643387 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 52643547 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 52643594 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 52643849 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 19 52643892 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52644178 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52644334 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 52644465 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52644731 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 52644864 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 52644942 C A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 52644963 A G Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 19 52645033 G A Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 52645051 G C Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 19 52645217 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52645266 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52645345 G T Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 52645359 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 52645381 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 52645402 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52645449 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52645579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52645700 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 52645776 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52645817 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 52645840 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 52645841 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 52645882 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 52645903 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 52645911 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 52645984 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 52646365 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 52646380 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 52646391 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52646432 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 52646490 G A Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 19 52646493 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 52646516 G A Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 19 52646553 C T Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 19 52646729 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 52646874 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 52647059 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 52647098 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 52647211 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 52647280 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 52647722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52649214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52649283 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52649606 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52649726 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52650954 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52651604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52652610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52652689 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 19 52652712 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52652841 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52653126 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 52653203 C T N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.454545454545455 0.272727272727273 0.272727272727273 13 9 5 3 3 19 52653269 G T N N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 4 8 2 0 4 19 52653343 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 52653814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52653897 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 52654347 G A Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 52654350 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52654372 T C Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 52654421 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52654610 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52654869 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52654965 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 52655130 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 52655292 T G N N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 8 8 2 4 2 19 52655542 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 19 52657981 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52658165 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52659001 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52659343 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52659588 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52659909 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 52660168 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52660914 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 52661356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52661399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52661498 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52661798 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 52662088 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52662817 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52663710 C A Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 52663756 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52663798 A C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 52664120 T G Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 52664228 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 52664675 T G N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 19 52664778 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 52664796 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 52664842 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 19 52665226 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52665836 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 52665922 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 52666226 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 52666950 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52667064 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 52667078 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52667269 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 52667510 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 19 52667705 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52667745 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52667837 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52667862 T G Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 52667946 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 52668190 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52668833 C G N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 19 52669449 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52669736 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52670562 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 52671114 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52672402 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 52672418 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 52672669 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 52672677 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 52672692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52672730 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52672741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52672831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52672854 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 52672875 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52672928 T G Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 52673074 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52673088 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52673090 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52673091 A C Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 52673132 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52673148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52673287 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52673381 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52673386 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 52673390 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52673627 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 52673635 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52673720 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 52673775 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 52674001 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52674074 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 52674283 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52674329 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 52675964 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 52676018 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52676264 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52678174 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 19 52678505 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52679399 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 52679664 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 52679989 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 52680028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52680427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52681011 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 52681535 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52681548 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52681579 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 52681581 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 52682002 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 52682529 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 52682612 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 52683220 A C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 52683612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52683998 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 52684152 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 52684153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52684318 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 52684764 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52685909 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 52686680 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52686787 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 52687384 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52687456 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52687920 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 52687936 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 52687961 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 52688005 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 52688023 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 52688032 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52688116 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52688417 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 52689266 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 52689279 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 52689306 T G Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 19 52689624 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 52690123 A T N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 19 52690699 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52692184 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52693164 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 52693561 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52693799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52694074 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 52694188 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 52694205 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 52694321 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 52694867 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52695128 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52695165 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52695276 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 19 52695279 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52695284 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 19 52695391 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52695425 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52695466 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52695467 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52695478 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 52695521 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 52695598 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52695872 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52696184 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 52696499 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 52697102 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 52697103 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 52699658 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52700649 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 52700963 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 52701723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52701730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52701771 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 52702298 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52703558 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 52706074 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 52706271 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 52706516 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 52706552 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 52708562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52708804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52708977 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 52709138 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 52709265 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 52709872 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52710030 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 52710082 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52710120 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 52711032 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 19 52711321 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 52711370 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52711949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52712133 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52712657 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 52713069 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52713083 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 52713581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52714589 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52715181 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 52716250 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52717340 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 52717344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52717355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52717437 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 52718594 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 52719674 T G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 19 52720702 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52720753 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52720764 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52722413 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52723000 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52723113 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 52723544 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52723552 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52723691 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 52723727 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52724370 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52724745 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52725112 A T Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 19 52725364 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52725409 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 52725428 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 52725620 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52725634 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52725661 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 52725663 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 52725893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52726585 G T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 52726609 C T Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 19 52726632 C T Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 19 52726641 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 52726807 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52726868 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 52726895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52727106 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 52727124 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 52727219 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52727271 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52727350 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 52727442 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 52727512 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 52727568 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 52727616 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 52727675 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 52727693 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 52727694 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 52727711 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 52727743 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52727760 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 52727805 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 52727882 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 52727889 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 52727960 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 52727994 T A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 52727997 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52728000 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 52728050 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 52728053 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 52728065 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 52728072 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 52728090 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52728186 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 52728204 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52728209 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 52728252 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52728864 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 52728875 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 52728893 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 52728923 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 52729361 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 52729761 T G Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 52729819 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52730123 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 52730534 A G N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 19 52731112 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 52731114 C T Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 52731208 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 52731296 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 52731351 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 52731385 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52731399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52731411 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 52731700 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 19 52731909 T A N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 19 52732178 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 52732296 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52732367 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 52732417 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 52732418 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 52732487 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 52732575 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 52732833 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 52732902 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 52732944 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 19 52733137 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52733239 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 52733315 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 52733328 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 52733334 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52733364 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52733691 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 52733989 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 52734236 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52736201 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 52736503 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 52736563 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52736862 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 52741300 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52742231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52742641 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 52742826 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52743163 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 19 52743271 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 52743285 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 52743446 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 52743505 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52743605 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 52743628 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 52743772 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 52744981 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52746494 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52749730 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 52749770 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52749910 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52751717 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 52751753 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 52751812 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52751987 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52752346 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 52752351 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 52752352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52752541 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52752605 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 52752677 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 52752726 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 52752741 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 52752752 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 52752755 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 52752848 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 52752870 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 19 52752926 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52752961 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52752968 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52752971 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52753001 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52753037 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52753039 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52753088 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 52753102 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 52753108 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 52753181 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52753318 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52753324 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52753343 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 52753401 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 52753418 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 52753447 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 52753455 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 52753573 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 52753612 C G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 52753732 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 52753954 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52754121 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52754122 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52754247 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 52754293 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 52754372 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 52754508 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 52754520 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 52754679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52754814 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 52754838 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 52755049 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 52755070 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 19 52755134 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52755242 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52755291 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52755412 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 52755443 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52755454 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52755458 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52755577 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 52755648 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 52756144 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52757606 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52758161 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52758225 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 52759442 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52759877 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52761246 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52762306 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52764596 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52764696 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 52764972 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 52764988 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52765106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52765116 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 52765220 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52765399 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 52765611 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 52766957 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 52767033 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 52767059 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 52767082 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 52767088 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 52767115 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 52767127 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 52767224 T G Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 52767299 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52767302 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52767329 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52767331 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52767470 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 52767973 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52767975 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52768014 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 52768106 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 52768164 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 52768304 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52768314 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52768580 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 52768684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52769234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52770224 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 52770583 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 52771284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52776218 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 52776262 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52776310 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 52776363 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 52776728 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 52776907 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 52777096 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52777195 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52777251 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 52777384 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 52777387 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 52777415 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 52777648 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 19 52777771 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 52777816 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52777830 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 52777999 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 52778000 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 52778018 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 52778034 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 52778148 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 52778158 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 52778198 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 52778200 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 52778284 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 52778535 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 52778545 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 52778555 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 52778639 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 52778754 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 52778950 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52778968 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 52778999 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 52779102 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 52779223 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 52779224 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 52779360 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 52779391 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 52779521 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 52779522 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 52779532 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 52779573 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52779720 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 52779746 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 52779833 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52779834 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52779856 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 52779944 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52780029 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 52780237 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 52780260 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 52780262 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52780266 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 52780392 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 52780410 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 52780507 G T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 52780526 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 52780545 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 19 52780569 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 19 52780571 T G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 19 52780601 T A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 19 52780634 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 19 52780706 G A N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 19 52780713 A T N N 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 19 52780754 G A N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 19 52781012 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 52781048 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 52781166 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 52781221 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 52781270 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 52781271 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 52781526 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52781578 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 52781709 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 52781805 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 52781811 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52782137 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 52782264 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 52782593 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 52782745 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 52782883 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52783061 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 52783166 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52783220 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52783228 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 52783241 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52783301 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 52783332 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52784141 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52784439 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 52784598 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 52784754 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 52785074 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 52785229 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 52785286 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 52785367 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 52785378 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 52785625 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 52785674 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52785724 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 52785925 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 52785937 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 52785955 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 52785983 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 52785987 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 52786004 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 52786061 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52786072 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52786120 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 52786245 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52786256 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52786532 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52786806 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 52786837 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 52786931 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 52787063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52787131 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 52787154 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 52787311 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 52787899 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 52787907 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 52788153 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52788209 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 52788272 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52788331 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 52788369 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 52788371 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 52788788 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52788962 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52789179 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 52789206 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 52789232 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 52789248 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 52789562 C T N Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 19 52789672 A T N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 19 52789676 C G N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 19 52789678 T G N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 19 52789704 G T N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 19 52790021 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 52790054 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52790080 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 52790192 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 52790266 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 52790336 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 52790726 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 52790884 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 52790900 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52790963 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52791006 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 52791251 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 52791299 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 52791439 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 52791452 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 52791588 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 52791619 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 52791668 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 52791907 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 52791945 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52791951 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 52792269 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52792297 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 52792498 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 52793046 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 52793121 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 19 52793148 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 19 52793228 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 52793445 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52793499 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52793503 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52793505 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52793527 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52793537 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52793556 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52793559 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 52794016 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52794468 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52794622 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 52794688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52794779 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 52794831 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 52794836 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52794926 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 52794927 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 52794931 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 52794946 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52794972 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 52794992 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 52795016 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 52795663 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 52795668 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 52797019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52797592 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52800680 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52802170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52803326 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52803727 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52803752 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 52803779 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52804019 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 52804080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52804196 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52804309 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 52804511 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 52804540 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 52804743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52804853 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52805079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52805155 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 52805162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52805335 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52805365 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 52805430 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 52805461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52805605 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 52805658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52805781 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 19 52805807 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52805809 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52805810 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52805912 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 52805964 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52806090 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52806107 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52806299 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 52806335 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 52806354 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52806410 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 52806538 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 52806638 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 52806684 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 52806884 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52806935 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52806946 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52807191 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52807301 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 52807484 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.1875 0.0625 0.75 7 25 3 1 12 19 52807485 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.1875 0.0625 0.75 7 25 3 1 12 19 52807600 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 52807718 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 52807773 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 52807783 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 52807784 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 52807797 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 52807897 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 52807989 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 52808320 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52808412 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52808851 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 52809044 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52809090 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52809091 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52809489 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 52809703 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 52809794 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52809901 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52809938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52809974 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52810160 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52810866 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 52810896 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52810897 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52811318 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52811405 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 52811434 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 52811449 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 52813431 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52814284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52816813 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 52816850 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 52817008 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 52817148 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 52817232 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 19 52822453 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52822677 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52822775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52822847 G T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 52822861 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52822919 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52822951 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52822966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52822980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52823063 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52823080 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52823104 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52823112 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52823299 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52823323 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52823393 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52823441 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52823461 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52823518 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52823546 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52823558 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52823563 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52823574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52823607 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52823656 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52823670 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52823675 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52823698 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52823707 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52823746 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52823770 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52823771 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52823791 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52823850 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52823851 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52823956 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52823981 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52824017 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52824036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52824055 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52824083 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52824095 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52824160 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52824211 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52824244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52824251 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 52824322 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52824333 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52824337 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52824376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52824438 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52824505 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52824531 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52824567 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 52824574 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 52824593 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 52824717 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52824732 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 52824875 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52824960 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52824979 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52824987 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52824995 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 52825077 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 19 52825198 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 52825690 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 52825853 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 52825864 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52825877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52825878 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52825934 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 52825948 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 52826017 A C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 19 52826161 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 52826174 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52826193 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52826315 A T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 19 52826613 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 52826643 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52826660 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52826797 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52826847 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52826896 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52826914 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52826940 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52827087 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52827116 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52827131 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52827216 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 52827251 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52827348 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52827364 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52827371 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52827634 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52827755 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52828087 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52828099 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52828114 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52828207 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52828221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52828225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52828253 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52828469 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52828503 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52828524 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 52828553 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52828582 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 52828684 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52828693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52828717 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52828800 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52828824 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52828839 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52828842 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52828886 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52828888 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52828892 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52829041 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 52829134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52829185 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52829255 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 52829297 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52829330 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52829342 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52829670 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52829761 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52829791 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52829817 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52829856 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52829918 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52829939 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52830054 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52830063 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52830082 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52830288 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52830434 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52830441 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52830479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52830664 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52830928 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52830947 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52831045 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52831063 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52831155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52831166 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52831418 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52831481 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52831592 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52831608 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52831735 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52831759 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52831772 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52831910 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 52831911 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 52831922 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52831936 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52831969 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52831970 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52832121 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 52832224 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 52832378 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52832407 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52832816 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 52832873 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52832901 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52833045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52833106 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52833157 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 52833172 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52833200 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 52833259 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52833284 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52833375 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52833816 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52833881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52833926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52833963 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 52834005 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52834055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52834062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52834352 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 52834414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52834426 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52834858 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52834884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52835084 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 52835208 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52835271 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52835451 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52835491 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52835624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52835892 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52835928 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52836175 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52836337 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52836488 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 52836520 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52836611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52836648 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52836739 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 52836851 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 52836978 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 52837105 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 19 52837187 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 52837224 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52837296 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52837407 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 52837584 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 52837719 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 52837749 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 52837832 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 52837851 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 52837937 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 52837947 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52837948 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 52837958 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 52837975 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 52837992 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52838228 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 52838320 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 52838321 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52838496 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 52838508 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 52838550 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52838943 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 52839073 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 52839074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52839130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52839158 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52839345 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52839358 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52839362 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 52839436 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 52839498 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 52839519 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 52839612 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 52839736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52839761 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52839803 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 52840102 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 52840174 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 52840236 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 52840435 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52840437 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 52840517 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 52840703 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 52840711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52840729 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 52840759 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 52840760 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 52840776 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 52840792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52840804 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 52840921 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 52841175 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 52841294 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 19 52841481 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 52841906 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 52841926 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 52842102 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 52842382 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52842626 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 52842645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52842715 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 52842855 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 52842933 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 52843040 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 52843154 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 52843298 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52843856 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 52843873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52843921 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 52843922 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 52843958 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 52843972 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52843996 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 52844020 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 52844232 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 52844329 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 52844333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52844345 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 52844370 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 52844548 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 52844602 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 52844770 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 52844797 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 52844852 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 52844962 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 52844979 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 52846117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52846228 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52846446 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52846737 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 52847386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52847804 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52848454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52849347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52849772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52857602 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52858098 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52858609 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52859020 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52859645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52860968 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 52861123 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52861210 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52863913 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52864030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52864406 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52865829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52867141 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52870387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52871363 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52871706 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52874459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52874859 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52874972 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 52876268 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52876323 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52876748 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52876778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52877370 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52878645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52881011 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52881980 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 52883542 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52883601 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52884849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52885167 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52886461 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52889016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52889399 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52889820 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52890220 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52891114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52891274 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52891958 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52892028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52892964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52893828 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 52893836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52893872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52894041 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52894503 A G N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 19 52894599 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 19 52894676 A C N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 19 52894992 T C Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 19 52895001 T C Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 52895058 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52895240 A G Y Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 19 52897350 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 52897773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52897988 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52898271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52898411 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52898787 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 52898861 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 52898871 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 52898892 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 52898909 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 52898942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52899063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52899081 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52899147 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52899216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52899438 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52899722 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52899878 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52900061 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52900062 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52900080 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52900115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52900118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52900217 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 52900246 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52900265 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52900268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52900308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52900335 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52900363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52900365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52900645 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 52900770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52900863 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52900925 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52900939 C T Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 19 52901901 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52902384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52902403 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 52903217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52903378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52903414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52903466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52903599 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 52903853 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52904643 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52904696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52904951 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52904952 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52905199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52905499 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52905568 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 52905592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52905604 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 52905764 C A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 19 52905982 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 52906102 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 52906121 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52906325 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 52906373 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 52906432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52906599 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 52906608 G C Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 52906640 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52906655 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 52906706 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 52906739 A T Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 52907011 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 52907133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52907141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52907168 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 52907191 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 52907197 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 52907313 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 19 52907321 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 52907329 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52907615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52909712 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52909762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52910132 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 52910217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52910349 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52910552 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 52910610 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 52910966 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52910967 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52911373 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52912151 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52912333 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 52912441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52912575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52912692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52912769 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52912770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52912786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52912791 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52912873 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 52913154 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52913212 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 52913293 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52913363 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 52913375 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 52913942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52914159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52914212 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 52914275 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52914289 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 52914318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52914329 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52914372 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52914408 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52914434 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 52914489 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 52914510 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52914518 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 52914601 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52914621 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52914647 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52914712 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52914714 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52914823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52914981 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52915023 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 52915052 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52915069 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52915101 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52915126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52921875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52921902 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52921943 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52922294 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 19 52922450 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52922463 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52922466 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52922468 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52922502 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52922536 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52922553 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52922554 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52922562 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52922563 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52922579 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 52922597 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 52922605 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 52922619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52922768 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52922829 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52922943 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52922944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52922948 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52922962 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52923028 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52923080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52923101 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52923235 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 52923252 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 52923263 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52923507 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52923572 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 52923658 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 52923899 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52923907 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52923933 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 52924097 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52924216 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52924321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52924406 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52924448 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 52924472 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52924847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52924866 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52924872 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52924940 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52924944 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52925044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52925081 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52925108 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52925193 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52925209 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52925302 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52925304 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 52925419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52925590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52925626 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52925710 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52925734 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52925820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52925827 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52925982 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 52925991 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52926067 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52926136 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 52926263 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 52926268 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52926657 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52926676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52926752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52926763 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52926771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52926780 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52926855 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52926861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52927048 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52927137 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52927160 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52927191 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 52927200 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52927207 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52927237 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 52927344 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52927368 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52927415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52927518 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 52927670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52927673 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52927727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52927772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52927918 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52927973 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 52928082 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 52928113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52928115 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52928165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52928251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52928336 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 52928353 A G N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 13 7 4 5 1 19 52928407 G A N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 19 52928444 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52928502 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52928766 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52928871 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52928905 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 52929080 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52929082 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52929085 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 52929174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52929176 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52929228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52929246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52929259 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52929480 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52929482 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52929619 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 52932157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52932221 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 52932225 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52932247 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52932336 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52932337 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52932390 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52932400 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52932414 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52932434 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52932439 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52932463 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52932486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52932496 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52932532 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 52932611 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52932632 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52932636 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52932690 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52932708 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52932720 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52932728 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52932736 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52932748 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52932749 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 52932768 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52932806 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 52932841 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52933009 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 52933054 T A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 19 52933063 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 52933114 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52933226 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 52933342 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52933387 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52933393 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52933500 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52933526 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52933573 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52933599 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52933662 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52933757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52933807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52933961 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 52934002 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52934014 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52934015 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52934022 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52934127 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 52934170 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 52934252 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52934319 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52934354 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52934358 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52934446 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 52934577 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52934665 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52934756 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 52934808 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52934941 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52935024 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52935068 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52935106 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52935117 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52935130 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52935160 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52935221 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52935299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52935329 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52935585 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52935713 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52935737 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52935866 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 52935889 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 52935994 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52936171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52936244 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52936283 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52936317 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52936319 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52936345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52936353 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52936778 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 52937043 T C Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 52938347 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52939524 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 52939739 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 19 52939740 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 19 52939809 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52939827 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52939840 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52939856 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52939936 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52940182 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 52940203 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52940256 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52940264 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52940444 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52940607 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52940721 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52940819 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52940849 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52940850 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52940894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52940926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52940944 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52941010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52941053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52941134 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52941214 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52941304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52941305 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52941397 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52941456 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52941871 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52942036 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52942079 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52942095 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 52942117 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52942168 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 52942225 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52942226 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52942297 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 52942306 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 52942307 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 52942365 A C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 19 52942531 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52942585 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52942591 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52942617 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52942636 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 52942652 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 52942664 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 52942903 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52943203 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 52943289 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52943579 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 52943820 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 52944907 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52945269 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52945389 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52945448 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 52945523 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52945622 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 52945630 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52945814 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52945824 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52945869 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52945883 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52945907 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52946101 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52946142 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 52946409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52946561 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 52946846 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 52947181 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52947208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52947229 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52947238 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52947243 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52947272 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52947502 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52947560 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52947587 A T Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52947610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52947628 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52947757 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52947763 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52947822 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52947823 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52948570 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52948675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52949280 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52949376 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 52949419 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 52949421 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 52949530 T G Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 52950254 T A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 52950274 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 52950328 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52950341 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52950403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52950457 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 52950545 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52950556 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52950642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52950780 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52950801 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 52950858 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52950903 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52950935 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52950939 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52951055 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52951707 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 52951719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52951722 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52951789 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 52952182 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 52952295 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52952296 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 52952360 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52952435 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 52952823 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 52952928 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 52952933 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 52953217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52953947 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52954050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52954315 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52954349 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 52955262 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52955296 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52955682 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52955999 C A N N 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 10 14 2 6 4 19 52956663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52956708 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52956727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52957006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52957245 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 52957447 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52957482 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52957589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52957603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52957646 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52957734 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52957790 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52957948 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52958065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52958088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52958268 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52960780 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52960781 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52961045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52961277 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52961433 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 52961494 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52962685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52962707 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52962899 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52963023 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52963265 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 52963306 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52963342 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 19 52963374 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 19 52963393 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52963409 C T N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 19 52963449 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 52963648 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52963732 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52964088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52964237 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52964313 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 52964329 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52964380 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52964751 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52964859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52964880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52965126 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52965397 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52966368 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52967677 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52967724 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52967830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52967964 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52968205 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52968576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52968627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52968648 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52968744 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52968876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52969033 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52969089 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52969321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52971102 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52971359 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 52971569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52971966 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 52972042 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52972057 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 19 52972090 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 52972372 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 52973219 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52974546 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52975155 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52975640 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52975734 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52975753 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 52979811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52980551 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52980603 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 52980805 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 52981237 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52983308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52983506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52983801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52983816 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52983835 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52983911 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52984231 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52984473 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 52984489 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52984491 C A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 52985999 A C N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 19 52986016 G A Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 19 52986024 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 52986402 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 52986436 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 52986612 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52986622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52986633 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52986646 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 52986926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52987030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52987192 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 52987214 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 52987486 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 52987735 T G Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 52987868 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 52988277 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 52988353 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52988421 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 52989988 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52992092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52995231 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 52995325 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 19 52995365 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 52995724 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 19 52995779 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 52995787 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 19 52995824 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 52996032 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 52996233 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52996285 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52996290 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 52996835 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52996894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52997173 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 52997205 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 52997322 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 52997832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52997929 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 52998410 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52998516 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52998532 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 52998682 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 52999439 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 52999491 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 53000247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53000294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53000341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53000433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53000481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53000562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53000682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53000734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53001487 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 53006982 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 53006990 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 53007281 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 53007301 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 53008086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53008431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53009636 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 53009653 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53009659 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53009689 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 53009693 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53009749 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 53010072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53010083 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 53010207 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 53010695 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53010797 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 53011098 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 53011123 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 53011467 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 53011778 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53011910 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 53011955 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 53012066 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 53012091 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 53012122 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 53012131 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 53012215 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 53012281 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 53012432 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 19 53012457 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 53012522 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 53012603 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 53012904 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 53012914 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 53012980 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 19 53013011 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 53013067 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 53013304 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 53013365 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 53013690 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 53014003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53014555 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53015228 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53015304 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53015368 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53015409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53015767 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 53015891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53016185 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 53016450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53016810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53016836 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 53016839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53016984 G C Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 53016989 C T Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 19 53016990 A G Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 19 53017002 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 53017012 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 53017029 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 53017044 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 53017048 G T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 53017153 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53017249 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 53017273 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 53017285 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 53017342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53017533 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 53018006 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53018065 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53018211 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 53018220 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 53018250 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 53018435 G A N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 19 53018559 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 53018683 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53018687 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53018949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53018980 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53019215 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 53019385 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53019651 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 53019754 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 19 53020109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53020165 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 53020238 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53020594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53021028 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53021332 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 53021375 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53021411 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53022242 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 53022348 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53022356 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 53022434 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53022519 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53022615 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 53022702 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 53022710 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 53022730 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 53022745 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 53022776 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 53023380 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 53023428 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 53023431 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 53023908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53024360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53025086 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 53025204 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53025251 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 53025265 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 53025319 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 53025606 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 53025623 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 53025774 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 53025775 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 53025845 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 53025922 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 53026122 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 53026190 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 53026216 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53027118 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53027390 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 53027836 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 53028030 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53028060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53028065 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 53028179 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 53028190 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 53028203 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 53028204 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 53028331 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53028334 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 53028343 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53028768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53028801 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 53028812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53028813 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 53028954 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 53028955 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 53029028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53029351 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 53029450 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53029501 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 53029554 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53029736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53029800 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53030278 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53030703 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53032390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53032909 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53032949 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 53033245 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53035604 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 53035625 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 53035903 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 53036198 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 53036278 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53036659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53036677 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 53036702 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53036735 C A Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 53036881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53037033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53041122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53041304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53042222 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53045944 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53047026 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 53047399 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 53047429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53047974 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 53048002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53048071 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 53048072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53048110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53048164 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 53048171 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 53048301 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53048362 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 53048464 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53048485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53048554 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53048648 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 53048725 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 53048741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53048776 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 53048806 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 53048816 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53049200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53049465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53049508 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53049718 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 53049732 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53049877 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53049992 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53050170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53050233 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53050523 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53050871 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53050914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53051084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53051118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53051152 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 53051417 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53051421 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53051429 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53051507 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53051882 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 53051893 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 53051917 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 53051919 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 53051927 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 53051958 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53052003 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53052034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53052073 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53052103 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 53052209 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53052239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53052302 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53052328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53052344 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53052411 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53052698 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53052729 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53052735 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53052745 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53052747 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53052762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53052917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53053176 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53053177 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53053240 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 53053337 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53053352 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 53053423 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53053542 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53053599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53053658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53054752 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53054928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53055673 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 53055677 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 53055678 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 53056024 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 53056232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53056283 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 53056536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53057495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53057555 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 53058380 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53058486 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 53058683 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53059567 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53059842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53059889 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53065462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53065639 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 53065864 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.105263157894737 0.789473684210526 0.105263157894737 19 19 2 15 2 19 53066850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53067133 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53067352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53067425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53067757 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53067830 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53068132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53068374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53068598 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 53068864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53069267 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 53069496 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 53069713 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 53070204 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 53070225 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53070553 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 53070935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53071342 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53071668 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 19 53072005 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53072514 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53072557 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 53074264 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 53074303 A T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 19 53074306 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 19 53074370 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 53074496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53074585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53074718 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 53075610 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 53076012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53076128 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 53076129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53076166 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 53076313 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53076582 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 53076720 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 53076731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53076812 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 53076861 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 53077085 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 53077640 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 53077649 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53077987 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53078022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53078057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53078067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53078502 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53078770 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53078987 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 53079027 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 53079051 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 53079111 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53079126 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 53079127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53079201 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 53079381 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 53079384 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 53079387 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 53079405 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53079490 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 53079627 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 53079630 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 53079755 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 53079807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53079808 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 53079877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53080077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53080289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53080290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53080324 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53080388 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53081031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53081087 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53081766 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53081895 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53082802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53082908 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53082950 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53082971 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53083159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53083325 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 19 53083519 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53083601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53083714 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 53083776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53083866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53083897 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 19 53084341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53084435 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 19 53084577 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53085363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53086005 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53086055 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 53087605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53088387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53088743 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53088798 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53088807 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53088884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53089243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53090511 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53090731 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53091456 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 19 53091502 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53091550 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 53091600 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 53092804 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 53093410 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53094245 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53095914 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53096098 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 53096178 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53096382 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53097000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53097401 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 19 53097452 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53097468 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53097488 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 19 53097606 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53097659 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 19 53097662 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 19 53097670 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 19 53097671 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53097702 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53097727 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 19 53097736 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 19 53097809 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 19 53097810 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 53097918 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 53097976 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53097980 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53098018 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53098081 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53098100 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53098447 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53098882 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 53098901 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 53099283 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53099297 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 19 53099321 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53099332 G C Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 19 53099353 G T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 19 53099476 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53099568 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53099678 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53099682 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 53099791 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53099965 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53099978 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53100207 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 53100287 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 53100338 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 53100409 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 53100442 A T Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 19 53100514 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 53100531 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53100597 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53100659 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53101035 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53101679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53101781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53101908 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53101925 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53102140 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53102170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53102181 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53102185 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53102387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53102679 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53102814 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53102831 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53103010 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53103090 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53103422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53103457 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53103463 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53104159 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53104201 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53104743 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53104887 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53104919 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53105113 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53105359 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 53105370 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53105470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53105583 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53105601 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53105838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53105936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53106256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53107105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53107381 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53107440 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 19 53108032 A T Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 53108035 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53108246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53108557 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 53108570 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 53108901 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53109029 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 19 53109380 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53109383 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53109387 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53109561 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53109593 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 53109646 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 53109692 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 53109835 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53110078 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53110117 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 53110241 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 53111034 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 53111381 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 53112054 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 53112086 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 53112149 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 53113286 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53113324 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53113551 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53113689 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53113770 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53113916 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 53113978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53113984 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53114026 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53114049 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53114150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53114234 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 53114293 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53114347 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53114388 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53114501 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 53114675 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53114786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53114836 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 19 53114887 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53115065 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53115185 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 19 53115186 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53115547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53116830 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53117410 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53118830 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53118995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53119128 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53119134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53120128 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53120951 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53121005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53121119 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 19 53121155 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 53121237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53122764 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 53124284 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53124961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53126545 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53126552 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53126555 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53126787 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 19 53126788 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 53127883 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 53127886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53128070 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53128290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53128300 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53128317 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53128330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53128358 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 53128383 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 53128467 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 53128468 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53128833 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 53128855 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 53129611 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53129683 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53129870 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53130326 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 19 53130452 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53131021 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 19 53131068 T G N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 19 53131377 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 53131672 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53131818 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 53132230 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53132302 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 53132527 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53132566 T C Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 53132869 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 53132906 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 53132930 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53133304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53133360 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 53133518 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 53133976 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 53134086 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53134116 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53134127 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53134128 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53134135 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53134267 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53134375 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 53134384 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53134530 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 53134558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53134602 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 53134630 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53135425 T C Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 53135629 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 53135643 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 53135678 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 19 53135748 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 53135912 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53135930 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53136018 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53136140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53136165 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53136190 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 53136303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53136440 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53136480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53136494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53136534 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 53136644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53137538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53137540 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 53137549 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53137571 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53137577 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53137652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53137944 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 53138062 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 19 53138083 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 53138395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53138895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53139476 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 53139585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53140226 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53141100 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53141101 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53141104 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 53142524 T G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.117647058823529 0.764705882352941 0.117647058823529 17 17 2 13 2 19 53144300 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 53146114 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53146855 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53146910 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53147815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53148476 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53148632 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 53148736 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 53148764 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53148836 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53148844 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53148909 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53149212 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53149215 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 53149309 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 53149398 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53149640 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53149760 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 53149819 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 53150074 A C N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 19 53150110 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 53150306 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 53150333 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53150416 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53150467 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 19 53150493 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53150612 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 19 53150767 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 53151844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53152946 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 19 53153173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53153465 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 53153746 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53153974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53156055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53156712 A G Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 53157746 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53157846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53157847 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53158645 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53159060 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53159561 A G N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0 0.75 0.25 6 10 0 6 2 19 53159694 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 19 53159937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53160402 T C Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 19 53161075 C A Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 53161076 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 53161143 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53161230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53161260 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53161393 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53161477 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53161492 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 53161583 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 53161585 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 53161938 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 53161962 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53162008 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 53162299 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 53162350 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 53162426 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53162479 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 53162507 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53162779 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 53162802 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 19 53162818 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 19 53163108 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 53163357 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53163418 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 53163421 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53163783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53163872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53163877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53164006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53164076 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53164105 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53164242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53164265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53164294 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53164306 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53164315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53164604 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 53164712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53164754 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 53164883 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 53164948 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 53164956 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 53165082 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53165118 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53165148 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 53165270 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 53165276 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 53165312 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 53165317 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 53165391 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 53165625 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53165832 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53165850 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 53165921 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 53165959 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53165977 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53165994 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53166359 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 53166362 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 53166420 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 53166439 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 53166622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53166657 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 53166704 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 53166906 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53166908 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53167060 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53167077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53167121 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53167133 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53167153 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53167155 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53167211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53167245 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53167256 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53167570 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53167689 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 53167837 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53167853 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53167858 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53167882 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53167900 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53168026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53168152 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 53168174 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 53168340 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 53168482 C T N Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 19 53168517 C G N N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 19 53168561 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 19 53168696 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 53168702 T A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 53168719 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53168775 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 53168777 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 53168864 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53168901 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 53169117 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53169283 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53169806 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 53169855 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53170022 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53170093 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 53170112 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 53170292 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 53170424 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53171694 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 53171738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53171768 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 53171913 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53172017 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 53172020 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 53172134 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 53172285 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 53172386 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 19 53172456 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 19 53172571 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 53172573 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 53172692 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 53174324 C T Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 53174594 G T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53175860 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 53176620 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 53176730 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 53177095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53177170 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 53177256 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 53177350 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 19 53177359 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53177533 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 53177553 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 53177621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53177966 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 53178090 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 53178150 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 53178208 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 53178762 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53178766 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53178793 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 53178851 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53178913 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 53178918 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53178944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53179014 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53179163 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53179164 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53179419 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53179448 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 53179472 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 53179548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53179772 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 53180000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53180218 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53180356 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 53180436 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 53180982 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53181135 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53181205 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 53181211 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 53181261 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 53181535 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53181549 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53181715 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53181813 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53181878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53181883 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53181891 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53181921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53182015 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53182026 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 53182055 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53182270 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53182275 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53182284 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53182572 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53182600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53182688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53182770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53182936 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 53182942 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 53183238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53183293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53183371 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53183417 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 53183558 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 53183586 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 53183745 G A Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 53183810 C A Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 53183954 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 53184814 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 53184851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53184982 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53185509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53185543 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53185660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53185756 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53185843 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53185884 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53185940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53185984 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53185993 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53186045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53186136 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53186154 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53186177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53186196 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53186254 G T Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 53186378 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53186424 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53186436 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53186444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53186908 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 53186944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53187179 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53187291 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53187324 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53187602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53187618 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53187698 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53188076 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 53188357 T C Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 19 53188362 G T Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 53188508 A G Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 19 53189107 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53190596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53190992 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53191759 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53193661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53193664 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53194012 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53194020 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53194042 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53194101 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53194487 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53194510 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53194819 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53194844 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53194859 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53194933 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53195145 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53195276 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53195587 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53195588 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53195902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53195904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53195915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53195935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53195944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53195969 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53196156 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53196347 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53196822 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 19 53197114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53197135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53198726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53198827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53199651 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53199798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53199842 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53200544 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53200946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53201002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53201162 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 53201163 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 53201277 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 53201857 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53201974 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53202176 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53202761 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 53202995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53203681 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53204767 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 53204864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53205009 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 53205074 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 53205096 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 53205162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53205499 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53206353 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 53207290 T G Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 53207397 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 53207409 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 53207414 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 53207621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53208268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53208357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53208405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53208894 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53208898 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 53208977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53209143 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53209210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53209668 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53209770 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 53209824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53210751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53211100 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 53211509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53211562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53211696 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53211744 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53211841 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53212530 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 53212765 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 53213356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53215260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53216616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53217677 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53219598 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53219619 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53220062 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53220745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53220757 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53220982 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53221820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53222732 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53223762 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 53223783 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53223848 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 53223989 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 53224074 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 53224280 T A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 19 53224407 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53224575 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53225308 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53225441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53225474 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53225734 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 53225895 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53226150 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 53226364 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 53226697 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 53227300 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53227317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53227332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53227383 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 53227642 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53227647 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53228474 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53228562 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53228563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53228834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53228835 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53229121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53229257 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 53229510 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 53229541 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53229647 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53229979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53230118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53230188 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53230284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53230847 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 53231014 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 53231234 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53231253 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 53231268 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53231284 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 53231363 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 53231392 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53231416 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53231490 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 53231504 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 53231584 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 53231626 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 53231700 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 53231725 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53231773 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 53231934 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53232001 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 53232003 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 53232009 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 53232118 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53232150 T G Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 19 53232165 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 53232237 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 19 53232317 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 53232403 C T Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 53232434 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53232444 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 53232490 G C Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 53232513 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 53232557 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 53232646 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53232697 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53232777 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 53233076 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 53233105 A C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 19 53233228 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 53233384 A G Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 19 53233468 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 53233487 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53233527 G T Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 19 53234007 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53234024 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53234034 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53234512 G C N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 19 53234582 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53234603 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53234632 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 53234692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53234719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53234726 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53234814 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53234874 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53235171 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 53235424 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53235445 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 19 53235453 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53235588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53235621 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 19 53235635 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53235816 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 53235821 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 53235833 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53235927 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53236423 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 53236438 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 19 53236531 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53237070 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53237513 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 53237659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53237720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53237825 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53237833 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53237852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53238045 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53238218 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 53238237 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53238334 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53239167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53239225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53239296 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53239306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53239312 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53239373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53239439 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53239456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53239629 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53239928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53239933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53240470 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53240855 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53240879 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53240896 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53241380 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 53241874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53242002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53242179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53242256 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53242588 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53242786 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53243847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53243928 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53244002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53244502 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53244509 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53244511 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 53245473 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53245546 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 53245582 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53245623 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53245638 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53246004 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 53246173 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 53246205 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 53246216 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 53246376 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 53246491 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53247087 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 53247133 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 53247383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53247811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53248145 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53248767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53248926 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53249266 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 53249303 C G Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 53249304 C A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 53249310 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53249397 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 53249846 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53251961 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53252873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53253386 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53253419 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53258026 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53259664 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53260820 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 53262096 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53262140 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53262205 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 53262234 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53262254 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 53262775 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 53264663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53265098 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53265286 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 53265698 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53266466 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 53266838 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53268571 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 53268581 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53269985 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 53270075 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 53270119 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 53270346 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 53270347 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 53270659 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 53271026 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53271459 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 53272890 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 19 53273095 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 53273283 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53274025 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 53274113 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 53275017 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 53275060 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 53275637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53275667 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53275672 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53275684 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 53275765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53275799 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53275926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53275954 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 53276009 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53276491 A G N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 19 53276583 A T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 19 53276584 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 53277078 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 53277083 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53277145 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 53277155 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53277387 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 53277388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53277432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53277475 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53277639 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 53277675 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53277892 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 53277909 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 53277985 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 53278025 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 53278106 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53278212 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 53278219 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53278482 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53278993 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 53279442 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53279445 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53279448 C G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 53280012 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 53280107 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53280257 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53280425 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 53280428 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 53280589 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 53280627 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 53280662 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 53280722 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53280753 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 53280976 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 53281723 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 53281745 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 53281975 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 53282335 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53283081 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53283485 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 53283569 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53283570 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53283594 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 53283885 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53284221 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53286056 C T N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 19 53286563 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53286573 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53286899 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53287126 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 53287515 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 53287687 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 53287944 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 53289498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53290188 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53290611 T C N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 9 15 3 3 6 19 53290626 C T N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 19 53291085 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 53291114 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 53291663 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 53291916 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 53292931 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 53293374 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 53295532 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53296823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53297978 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53298254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53299296 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53301204 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 53301685 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 53301841 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53301859 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53301905 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 53301911 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53302096 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53302115 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53302151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53302289 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 53302311 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 53302422 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53302506 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 53302564 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 53302618 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 53302680 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53302721 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 53302799 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 53303251 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53303483 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 53303504 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53303784 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 53303997 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 53304161 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 53304214 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 53304243 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 53304313 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53304349 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53304352 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53304407 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 53304618 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 53304735 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 53305298 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 53305309 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 53305384 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 53305408 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 53305496 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 53305585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53306475 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53306712 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 53307066 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 53307084 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 53308652 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 53308702 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 53308719 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53308827 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53309018 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53309651 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 53309718 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 53310055 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53310174 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 53310246 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 53310446 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 53310557 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 53310635 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 53310680 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53310834 C A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 53310879 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53310975 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 53311176 C A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 53311669 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 53311672 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53311692 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53311709 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 53311812 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53311878 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53312082 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 53312163 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53312506 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 53312597 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 53312608 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53313198 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53313207 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 53314473 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53314474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53314572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53314653 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53314654 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53314714 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 53314818 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53314857 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 53314994 C A N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 19 53315194 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53315410 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53315420 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 53315479 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 53315526 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53315886 T G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 53316098 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 53316107 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 53316134 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 53316135 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 53316337 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 53316415 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53316419 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53316447 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 53316500 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 53316538 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 53316716 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 53316746 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53316811 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 53316871 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 53316907 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53317068 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 53317294 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53317295 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53317334 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53317510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53317517 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53317535 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53317541 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53317556 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53318025 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53318079 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53318381 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53318472 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53318486 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 53318536 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 53318791 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53318838 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 53318840 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 53318991 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53319192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53319200 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 53319372 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53319385 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53319529 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 53319859 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 53320163 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53320564 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 53320765 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 53321622 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 53322202 A C Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 53322203 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 53322492 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53322590 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 53322832 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53323042 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53323378 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 53323987 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 53323997 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53324058 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 53324079 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 53324158 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 53324245 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53324385 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53324849 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 53324906 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 53324921 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 53324993 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53325147 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 53326208 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53326907 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53326981 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53327253 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53327458 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53327543 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53327599 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 53327640 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 53327720 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53327753 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53327788 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53329940 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53330756 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 53330812 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 53331068 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 53331861 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 53331894 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53332336 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 53332392 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53332453 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53332758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53333021 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53333124 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 53333195 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 53333234 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 53333579 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53333950 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53333980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53334720 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53334895 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53335855 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 53336625 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53336812 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 53337991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53338167 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53338247 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 53338484 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 53339740 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53340083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53340785 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53342435 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 53344249 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 53344440 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53345446 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53346839 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53346852 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53346963 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53348833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53349527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53352553 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53353123 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53353145 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53353191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53353199 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53353251 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53353282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53353303 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53353576 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 53353696 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 19 53353825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53353854 G A Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 19 53354640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53355372 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53355895 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 19 53356011 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53356099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53356362 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 53356660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53356915 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 53357141 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 53358319 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53359004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53359014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53359112 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 53359444 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53359461 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53359620 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53359747 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53359968 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53360082 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 53360326 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 19 53360334 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53360347 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53360360 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53360381 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53360395 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53362269 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 19 53362308 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53362322 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 19 53363014 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 53363220 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53363282 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53365434 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53365515 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53368721 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 53370276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53370939 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 53371444 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53371499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53372371 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53372454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53372558 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 53372759 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53372842 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53373228 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 53373252 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 53374140 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53374534 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 53374789 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 53374810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53374811 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 53375011 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53375115 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 53375400 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53375808 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 53376041 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 19 53376207 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 19 53376219 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 19 53376244 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53376320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53376572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53377045 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 53377133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53377667 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53378306 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 53378481 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 19 53378633 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 53378713 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53379133 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53379156 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53379696 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53380246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53380605 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 53381334 C G N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 19 53381939 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 19 53381979 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53382848 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53383858 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53383881 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53384382 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53386707 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53390057 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 53392050 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53393315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53395043 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 53395850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53396438 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53396795 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53396881 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 53398044 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 53398184 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53399430 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53399532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53400072 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53400405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53401217 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 53402880 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53406496 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53406860 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53410743 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53411229 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 53411487 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 53411764 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53412831 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53413799 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 53414076 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53414406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53414854 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53415365 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53415977 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 53416016 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 53416467 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53416500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53416516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53416753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53417232 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 53417546 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53417558 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53417930 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53419082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53420331 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53420909 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 53421423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53421589 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53423139 C A Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 19 53423151 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53424314 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 19 53424322 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 19 53424462 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53424832 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 53425156 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53425191 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 53425506 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53425750 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53425899 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53426252 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 53426512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53426877 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 53427440 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53427715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53428213 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 53428497 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53428656 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 53428885 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 53428895 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 53428896 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 53428986 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 53429271 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 53429851 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 53431560 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 53431622 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 53432350 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 53433253 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53433722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53434119 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 53434269 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53434454 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53434745 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 53434959 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 53435192 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 53436560 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53437007 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 53437066 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53437716 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53437768 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53438036 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53438392 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53439997 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 53440440 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 53440683 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53440830 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53442002 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 53442136 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 53443500 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53443705 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53444861 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53444925 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53444998 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53447439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53447561 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 53449879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53451171 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 53452045 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 53452528 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 53453609 C T Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 19 53461959 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53461990 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53464049 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53466480 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53466600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53466659 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53466923 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 53467686 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53469187 G C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 53470042 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53476352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53477585 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 53477874 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 53480959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53482398 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53482550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53485123 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53485601 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 53487096 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 53487218 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 53487711 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 53487823 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 53488259 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53488277 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 53488653 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 53489537 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 53490146 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 53490553 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 53490566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53490608 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 53490635 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 53490705 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 53490731 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 53490930 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 19 53490932 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53491115 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 19 53491466 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 53492582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53492677 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 53492905 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 53494070 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 53494548 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 53494603 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 53495220 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 53495328 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 53495413 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 53495547 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 53495654 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53496870 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 19 53497085 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 53497152 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 53497548 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 53497709 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0 0.7 0.3 14 26 0 14 6 19 53497955 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 53498035 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 53498197 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 53498225 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53498234 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53498255 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0 0.65 0.35 13 27 0 13 7 19 53498302 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 53498781 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 53498788 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 53498811 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 19 53498856 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 53498908 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53499064 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53499192 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 19 53499638 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53499679 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 19 53499739 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53499789 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0 0.65 0.35 13 27 0 13 7 19 53499862 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 53500613 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53501766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53501824 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 53502060 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 53502103 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0 0.65 0.35 13 27 0 13 7 19 53502147 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 53502268 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 53502281 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 53502349 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 53502652 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 53502733 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0 0.65 0.35 13 27 0 13 7 19 53502789 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0 0.65 0.35 13 27 0 13 7 19 53502894 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0 0.65 0.35 13 27 0 13 7 19 53502905 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0 0.65 0.35 13 27 0 13 7 19 53502994 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0 0.65 0.35 13 27 0 13 7 19 53503006 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 53503592 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 53503634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53503692 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 53503720 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53504736 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 53504999 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53505000 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53505205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53505212 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 53505314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53505341 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53505788 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53506352 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 53506700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53507728 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 53507950 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53508038 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 19 53508390 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53508396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53509323 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 53509338 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 19 53509417 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 53509506 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 19 53509543 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 19 53509641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53509645 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 53509671 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 53509733 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 53509871 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 19 53509942 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53509972 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 53509973 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 53509982 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 53510050 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 53510167 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 53510170 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 53510345 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 19 53510373 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 53511454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53511501 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 53511523 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 19 53511711 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 53511804 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 53511956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53512261 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 53512301 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 53512498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53512609 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53512978 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 53513096 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 53513123 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 53513143 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53513381 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 53513675 C G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 53514031 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 53514283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53514332 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 53514530 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53514547 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53514548 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53514590 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 53514708 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53514716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53514897 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53515075 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 19 53515325 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53515364 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 19 53515684 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 19 53515830 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 19 53516464 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 53516570 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53516821 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 53516823 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 53517037 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 53517584 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 12 24 0 12 6 19 53517634 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0 0.7 0.3 14 26 0 14 6 19 53517645 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0 0.7 0.3 14 26 0 14 6 19 53517669 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0 0.7 0.3 14 26 0 14 6 19 53517863 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0 0.65 0.35 13 27 0 13 7 19 53518271 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 53518295 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 19 53518314 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 53518341 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0 0.7 0.3 14 26 0 14 6 19 53518518 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 53518715 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 19 53518955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53518960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53519023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53519041 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 19 53519463 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53519514 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 53519591 T C Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0 0.7 0.3 14 26 0 14 6 19 53519651 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53519656 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 53519721 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 53519916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53520262 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 53520781 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 53521335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53522097 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 53522289 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53523045 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53523268 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 19 53523427 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 53523449 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 53523605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53523765 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 53523871 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 53524118 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 53524183 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 53524196 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 53524277 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 53524524 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 53524670 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53524744 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 53525948 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53526066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53526263 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 53526534 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 53527540 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 53528577 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 53529108 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 53529129 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53529316 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53529834 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53530287 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53530288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53530595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53531044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53531427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53531448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53532583 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 53533955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53534057 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 53534380 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53535723 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 53535743 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 53535749 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 53536143 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53538261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53538646 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53539707 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 53539747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53540636 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53541179 T A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 53541268 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53542024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53542369 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 53543336 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53543709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53543895 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 53544018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53544793 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 53545227 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 19 53545586 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 53546165 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53546579 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53546597 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53547214 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 53547463 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53547529 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 53547531 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 53547541 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 53547544 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 53547617 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 53547722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53547732 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53547776 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 53547789 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53547899 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 53547914 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 53547980 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 53548002 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 53548056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53548198 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53548213 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53548307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53548951 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 53548972 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53549003 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 53549004 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 53549013 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 53549021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53549025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53549026 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53549504 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 53549594 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 19 53549601 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 19 53549650 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 53549675 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53549678 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53549820 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 53549875 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 53549876 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 53550085 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53550090 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 53550104 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53550109 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 53550136 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 53550237 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53550276 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 53550281 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 53550303 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 53550304 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 53550357 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53550366 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53550420 G A Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 19 53550589 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 19 53550638 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 53550677 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 19 53550698 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 19 53550771 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 19 53550780 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 19 53550783 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 19 53550940 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 19 53550951 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 19 53550980 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53551350 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 53551356 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 53551877 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 53552169 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 53552244 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 53552848 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 53553017 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 53553051 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 19 53553094 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 53553439 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 53553483 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 53553927 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 53554360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53554720 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 53554962 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 53555290 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 53555324 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 19 53555344 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 53555435 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 53555527 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 53555627 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 53555797 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 53555880 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 53556059 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 53556101 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 53556155 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 19 53556335 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 53556455 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 53556650 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 53557277 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 19 53557498 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 53557502 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 53557686 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 53557917 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53558121 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 53558351 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 53558418 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 53558924 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 53559260 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53559273 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53559372 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 53559387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53559637 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 19 53559669 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 53559847 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53559901 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53560268 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53560288 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53560311 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53560332 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53560366 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53560380 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 53560391 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 19 53560396 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 19 53560416 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 53560465 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 19 53560643 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 53560887 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 53560912 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 53561565 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 53561641 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 53561702 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 53561718 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 53561796 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 53561798 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 53561846 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 53561856 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 53561910 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 53561994 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 53562014 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 53562056 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 53562209 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 53562331 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 53562365 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 53562366 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 53562414 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 53562519 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 53562865 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 53563395 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 53563546 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 53563612 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 53563790 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 53563941 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 53563949 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 53564082 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 53564153 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 53564241 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 53564264 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 53564282 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 53564459 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53564508 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 53564539 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 53564548 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 53564603 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 53564733 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 53564736 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 53564739 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 53564740 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 53564784 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 53565050 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 53565061 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 53565155 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 53565439 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 53565548 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 53565560 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 53565584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53565827 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 53565900 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 53566163 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 53566223 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 53566258 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 53566269 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 53566386 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 53566603 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 53566788 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 53566844 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 53567108 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 53567619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53567746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53568110 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 53569226 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 53569721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53571560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53572467 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 53573394 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 53573699 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 53574109 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 53575141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53575976 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 53576933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53577145 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 53577189 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 53578515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53578937 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 53578991 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 53580012 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 53581133 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53582430 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 53583289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53584899 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 53586932 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 53587166 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53587882 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 53588422 G C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 53589084 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 53589132 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 53589923 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53590903 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 53591019 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 53591045 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 53591046 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 53591121 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 53591247 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 53591259 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 53591302 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 53591307 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 53591314 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 53591329 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 53591354 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 53591361 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 53591402 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 19 53591403 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 53591446 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 53592613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53592768 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 53592801 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53593105 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 53593203 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53593205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53593268 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 19 53593389 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 53593425 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53593486 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 53593491 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 53593544 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 53593642 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 53593734 C T Y Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 19 53593746 T C Y Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 19 53593748 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 8 16 0 8 4 19 53593786 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 53593802 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 53593820 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 53593844 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 53593923 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53593987 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 53594002 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53594037 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 53594065 G A Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 53594070 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53594439 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 53594445 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 53594490 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 53594496 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 53594504 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 53594706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53594756 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 53594798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53595133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53595306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53595391 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 53596346 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53597036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53601272 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53601485 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 53601545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53603046 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 53603234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53604507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53604756 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53604762 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 53604970 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 53605161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53605991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53610464 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 53610710 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 53610730 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 53610842 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 53611208 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 53611225 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 53611252 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 53611265 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 53611283 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 53611316 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 53611536 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 53611815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53612197 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 53612271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53612285 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53612352 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53612418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53612419 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 53612721 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 53612731 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 53612861 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 53613006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53613156 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 53613221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53613281 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 53613340 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 53613349 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 53613388 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 53613395 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 53613679 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 53613773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53614879 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 53614986 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 53616926 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 53617115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53617368 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53617419 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 53617696 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 53618051 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 53618751 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53619085 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 53619087 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 53619117 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 53619480 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 53619510 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 53619901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53620838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53620875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53621046 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 53621389 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 53621513 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53622146 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 53622333 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53622337 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 53623176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53624304 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 53624870 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53624914 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 53625123 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 53626238 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 53626383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53626446 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 53627062 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 53627135 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 53627244 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 53629201 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 53633181 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 53637782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53638081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53640567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53642915 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53645725 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 53645925 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 53645957 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 53645973 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 53645978 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 53645991 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 53646059 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 53646171 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 53646220 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 53646253 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 53646699 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 53647195 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 53647250 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53647285 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53647303 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53647853 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 53647912 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 53648043 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 53648058 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 53648193 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53648299 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53648475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53648688 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 53648775 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53648895 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 53648906 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 53649496 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 53649571 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 53650833 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 53650838 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 53651277 A C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 53651376 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 53651474 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 53651632 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 53651772 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 53652652 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 53652734 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53655148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53655634 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 53657241 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53660779 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 53667044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53669369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53669720 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53670014 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53670569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53672591 T G N N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 19 53673525 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53674520 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53674766 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53674868 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53675407 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53675802 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 53676077 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 19 53676082 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53676146 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 53676444 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 53676758 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 53676785 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 53676851 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53676867 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53676909 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 53676953 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53677027 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53677546 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 53677550 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 53677620 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53677775 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 19 53677790 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53677801 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53678170 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 53678255 A C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53679044 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53679825 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 53679828 A C Y N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 19 53679960 G T Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 53679973 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 53680155 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53680166 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 53680265 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 53680832 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 53680883 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 19 53680921 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53680954 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53681022 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53681071 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53681412 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 53681747 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 53681789 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53681860 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53681954 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53682188 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 53682273 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 53682341 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 19 53682728 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 19 53683389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53683487 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53683817 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 53683924 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 19 53684296 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 53684353 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 53684549 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53684765 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 53685202 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 53685431 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 53685437 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 53685802 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 19 53685903 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 53685986 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 53686239 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 53686492 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 53686892 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 53687001 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53687203 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 53687253 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 53687700 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 53687846 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 53687919 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53688250 G A N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 19 53688254 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 19 53688575 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 53688857 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 53689206 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53689496 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 53690020 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 53690392 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 53690553 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53690932 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53690946 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53690977 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 19 53691080 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53691104 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53691131 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 53691136 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 53691243 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53691281 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 53691763 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 53691821 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 53691849 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 53692000 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 53692032 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 53692065 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53692206 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 53692290 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53692459 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53692495 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53693489 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 53694751 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 53694957 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 53694991 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53695675 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 53695693 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53695918 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53697507 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53697509 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53697737 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 53698110 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53698400 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53698443 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 53699184 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 53699703 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53699817 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53700825 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 53700848 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 53700900 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 53701510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53702344 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53703955 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53707185 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 53707250 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 53707860 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53709205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53711823 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53714494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53714651 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53716729 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 53716897 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 53717005 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 53717207 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 19 53718904 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53720030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53720103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53720754 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53721225 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53721809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53722398 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 53722818 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 53722853 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 53723004 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 53723040 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 53723093 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 53723291 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 53723292 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 53723296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53723423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53723755 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 53723952 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53724001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53724107 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 53724259 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 53724313 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 53724615 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 53725089 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53725090 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 53725133 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 53725387 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 53725476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53726031 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 19 53726382 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53726395 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53726514 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 53726607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53726610 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 53726612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53726727 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53727000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53727019 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53727350 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 53727364 C T Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 19 53728508 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 53731240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53732989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53734193 T G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 53734550 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53735001 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53735004 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53735159 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 53735214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53735318 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 53735332 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 53735435 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 53735516 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 53737085 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 19 53737296 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 53738119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53738807 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 53740243 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 53740405 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 53740407 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 53740463 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53740568 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 53740771 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 53741139 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53741328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53741341 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 53741406 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 53741464 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 53741821 T A Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 19 53741831 A T Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 19 53741946 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53741970 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53742573 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 53742593 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 53743049 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 53743158 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 53743320 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 53743336 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 53743337 G T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 19 53743347 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 53743364 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 53743470 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 53743824 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 53743996 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 53744062 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 53744093 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 53744097 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 53744207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53744231 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53744299 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53744312 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 53744347 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 53744364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53744374 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53744522 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 53744930 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53744978 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53745009 T A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 53745011 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53745111 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 53745192 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 53745591 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 53745642 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 53745705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53745760 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 53745767 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 53745851 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 53745870 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 53746015 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53746671 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53748879 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 53749106 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53749255 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 53749272 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 53749890 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 53750050 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53750183 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 53750292 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 53750297 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 53750391 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 53750791 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53751082 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53751283 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53752096 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 53752790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53752862 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53753446 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 53755013 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53756195 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 53756331 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 53756450 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 53756486 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53756708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53756824 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 53756935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53756976 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 53757162 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 53757439 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 53757635 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 53757947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53757982 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53758180 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53758186 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53758261 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53758267 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53758272 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53758450 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 53758636 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 53758648 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 19 53758667 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53758750 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53758964 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 53758976 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 53758995 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 53759051 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 53759082 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 53759359 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 53759796 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 53760132 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 53760154 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 53760256 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 53760972 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 53761013 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 53761035 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 53761093 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 53761310 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 19 53761354 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 53761565 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 53761884 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 19 53761928 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 19 53762140 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53762146 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 53762223 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53762356 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 53762365 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 53762907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53762949 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 53762964 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 53763041 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 53763257 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 53763274 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 53763390 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53763392 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53763496 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 53763671 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53763783 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 53763800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53765076 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53765078 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53766237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53766578 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 53766749 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 19 53766973 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 53767293 G A Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 53767315 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 53767855 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 53767857 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 53768451 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 53770537 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 53770579 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 53770629 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53770960 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 53771377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53771823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53771883 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 53773647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53773694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53774061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53774709 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53776113 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 53776897 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53777984 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 53778191 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 53778606 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 53778642 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 53779718 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53780140 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53781506 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53782178 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 53782222 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 53782482 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 53783300 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 53784095 T A N N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 19 53784176 G T N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 19 53784357 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53784547 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 53784729 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53785233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53786414 T C N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 19 53786442 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 19 53786608 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 53786615 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 53786623 G T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 53786649 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 53787369 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 53787384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53787842 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 53788004 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 53788051 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 53788671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53788807 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 53790332 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 53791053 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 53791162 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53793206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53794135 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 53794214 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 53794376 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 53794453 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53794567 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 53794678 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53794761 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 19 53795690 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53796108 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 53797104 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53797836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53799352 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53799821 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 53799879 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 53800069 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 53800109 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 53800145 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 53800216 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 53800544 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 53800698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53800719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53800721 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 53800737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53800750 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53800755 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53800782 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 53800824 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 53800868 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53801680 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53801711 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53801778 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 53801820 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 53802198 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53802221 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53802419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53802428 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 53802805 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 53803033 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53803190 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 53803249 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53804785 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53805225 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53805720 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 53805779 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53805815 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53806031 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 53806036 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 53806065 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53806074 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 53806082 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 53806128 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 53806298 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 53806357 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 53808882 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53809037 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53809607 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53810622 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 19 53811650 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 53813174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53813956 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53815147 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53815469 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 53815493 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 53817020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53818661 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53818763 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53819030 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53819087 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 53819129 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 53819148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53819162 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 53819171 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 53819185 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 53819221 A T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 53819272 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 53819357 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 53819557 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 53819642 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 53819722 G A N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 19 53820344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53820686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53821057 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 53821121 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53821124 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 53822085 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 53822093 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 53822377 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 53822481 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 53822489 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 53822501 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 53822669 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 53822774 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 53822784 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 53822839 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 53822872 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 53822884 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 53822968 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 53823017 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 53823175 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 53823612 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 53823691 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 53824329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53828055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53829743 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 53829870 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 53829887 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 19 53829922 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 53830538 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 53830552 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 53830735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53830802 T C Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 53831511 A C Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 53832075 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 53832109 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53832389 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53832574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53832613 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 53832962 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 53832975 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53833253 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 53833264 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53833919 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 19 53834084 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 53834267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53834625 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53834753 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 53834808 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 53834929 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53835050 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53835182 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 53835320 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 53835599 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 53835735 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 53835875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53836005 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 53836013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53836848 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 53837068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53837565 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 53837584 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 53838069 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 53838077 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 53838119 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 53838121 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 53838405 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 19 53838506 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 53838654 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 53839063 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 53839064 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 53839068 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 53839106 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 53839137 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 53839249 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 53839360 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 53839459 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 53839556 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 53839560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53839819 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 53840283 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 19 53840444 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 53840462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53840897 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 53840940 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 53841661 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 53841721 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 53841830 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 53841952 C G Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 53841996 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 53842029 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 53842030 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 53842051 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 53842692 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 53842887 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 53842982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53843216 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 53843325 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 53843326 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 53843369 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 53843463 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 53843570 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 53843581 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53844028 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 53844323 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 53844325 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 53845513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53846532 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53849298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53849599 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53853023 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.5 0.142857142857143 0.357142857142857 16 12 7 2 5 19 53853526 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 53853527 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 53853924 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 53854114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53854649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53854802 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53854905 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53855780 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53856200 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53856598 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53857042 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 53859716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53860087 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 53860405 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53860450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53861754 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 53864309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53864797 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53864798 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53865074 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 53865435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53865724 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53866691 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 53866713 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 53866771 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 53867711 G A Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 19 53868874 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 53868990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53869129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53869331 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53870093 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53870094 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53872464 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 53872842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53872926 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 53872995 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 53873401 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53873404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53873576 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53873595 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53873633 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 53873636 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 19 53873900 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53874053 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53874112 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 53874193 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 53874385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53874810 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 53877285 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53880302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53880924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53881120 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53882580 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 53882621 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 53883508 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 53883563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53884098 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53884607 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 53884608 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 53884674 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 53884704 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 53884843 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53884845 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53884848 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53884861 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53884908 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 53885272 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 19 53885485 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 53885560 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 53885776 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53885833 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 53885870 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 53886195 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 53886601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53886875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53887065 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53887325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53888020 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53888086 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53888122 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 53888263 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 53888425 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 53888453 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 53888548 T G Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 53888710 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53888887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53888979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53889037 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 53889091 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53889141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53889158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53889214 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53889292 A C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 53889376 A T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 53890579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53890883 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 53891065 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53891146 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 53891159 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 53891218 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 53891558 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 53891840 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 53892269 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 53892588 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53892629 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 53892971 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 53892990 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 53893129 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 53893131 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 53893183 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 53893265 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53893341 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 53893704 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 53894084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53894152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53894654 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 53895245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53895392 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 53895431 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 53895671 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 53896272 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 53896316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53896716 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 53897104 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 19 53897897 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53897928 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 53897941 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 53898062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53899331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53900430 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53900521 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53900583 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 19 53900657 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 19 53900663 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 19 53900720 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 53900744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53900760 A C Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 53900782 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 53900846 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 53900877 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 53901968 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53901997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53902127 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 53902530 G T Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 53902764 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 19 53902769 T A Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 19 53902915 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 19 53903047 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53903690 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 19 53903707 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53903716 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 53903762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53903774 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 53903782 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 53904040 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 53904343 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53905187 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53905430 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 53905438 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 53905465 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53905660 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53906363 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 53906525 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53906650 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 53907032 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53908191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53908362 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53908364 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 53909019 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 53909391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53909426 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53910066 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 53910940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53911515 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53911518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53911893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53914019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53915087 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 19 53915684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53916125 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53917417 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 19 53917425 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 53917567 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53917667 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 19 53918111 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53918133 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 53918349 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53918960 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53918961 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53919095 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53919373 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 19 53919667 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53919935 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53920308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53920611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53921074 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 53921663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53922822 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 53922995 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 53923260 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 53923304 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 53923546 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 53923553 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 53923569 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 53923782 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 53924463 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53925069 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 19 53925268 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 53925343 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53925578 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 53925586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53925847 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53927155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53927728 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53928579 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53928924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53929961 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 53930627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53930637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53931993 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53932308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53932309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53932504 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53932813 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 53933401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53934255 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 19 53934285 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 19 53934308 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 19 53934309 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 19 53934749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53934792 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53934853 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 53935264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53935811 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 53936233 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53937476 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 19 53937491 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 53937616 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 53937624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53937916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53937998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53938240 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53938549 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53938686 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53939297 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53939554 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 53940089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53940122 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53940213 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53940510 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53942795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53943638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53943717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53943938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53943986 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53944485 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 53944496 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 53944608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53944662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53944665 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53945424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53947271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53947547 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53947575 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 53947717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53947729 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 53948119 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 53948274 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 53948306 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 53948326 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 53948679 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 53948691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53948694 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 53948991 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 53949099 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 53949353 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 53949511 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 53949644 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 53949670 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 53949700 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 53950012 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 53950312 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 19 53950440 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 19 53950719 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53950746 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 53951466 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53951564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53951628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53952074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53952185 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 53952227 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 53952237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53952250 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 53952629 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 53952657 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 53952718 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 19 53952815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53952841 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 53952865 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 53952953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53952973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53953030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53953067 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 19 53953398 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53953616 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53953730 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53953749 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53953847 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53953875 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53953972 G A N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 19 53953991 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 4 24 2 0 12 19 53954062 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.133333333333333 0 0.866666666666667 4 26 2 0 13 19 53954133 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 4 24 2 0 12 19 53954248 G T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.133333333333333 0 0.866666666666667 4 26 2 0 13 19 53954262 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 53954295 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 53954605 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 4 20 2 0 10 19 53954769 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.153846153846154 0 0.846153846153846 4 22 2 0 11 19 53954819 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 53955134 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 53955157 T G N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 4 24 2 0 12 19 53955191 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 19 53955328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53955844 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53956202 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53956243 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53956252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53956400 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 53956414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53956420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53956550 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 53956558 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 53956874 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53957081 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 53957222 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 53957717 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53957721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53957765 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53957774 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 53958072 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 53958163 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53959179 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 53959215 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53959258 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 53959356 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 53959362 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53959415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53959443 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 53959447 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 53959457 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 19 53959462 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 19 53959624 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 53959980 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 19 53960150 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53960586 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 19 53961073 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 53961927 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 19 53962652 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 53963496 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53963601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53964938 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 53965261 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53965330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53966670 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53967137 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 53968238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53968888 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53969329 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 53969387 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 53969951 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 53970047 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 53970232 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 53970423 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 53970509 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 53970529 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 53970729 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 53970787 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53970958 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 53971051 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53971139 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 53971180 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 53971352 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 53971353 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 53971416 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 53971442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53971465 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53971529 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53971655 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 53971671 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53971958 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 19 53972878 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 53973040 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 53973059 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 53973562 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53973650 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 53973749 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53973815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53973847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53973873 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 53973879 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53973914 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 53973970 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53974137 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 53974173 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53974377 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 53974873 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53975373 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 53975551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53975602 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 53975630 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 53975645 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53976106 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 53976378 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53976379 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53976509 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 53977406 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53977482 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 53977594 G T N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 19 53978915 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53978928 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53979183 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53979216 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53979577 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 53979606 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 53979629 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 53979775 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 53981932 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 53984011 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 53984203 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 53985232 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 53985392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 53989234 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53989411 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53991092 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 53991521 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 53991726 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53992187 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53993033 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 53993667 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53995976 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 53996068 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 53996271 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 53997170 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 53998338 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 53998480 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 53999667 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 54002065 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 54003428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54003905 G T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 54004607 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54006303 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54007064 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54009134 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54010920 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 19 54011110 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54012663 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54017370 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54018834 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54018962 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54020275 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 54020285 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54020427 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 54020717 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54020916 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54021710 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54021860 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54022219 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54022308 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 54022661 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54023486 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 54024428 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 54024611 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 54025038 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54025907 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54026103 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 54026104 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 54027060 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 54028301 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 54028468 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54028545 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 54030125 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54030202 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 54030249 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54030662 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 54031444 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54032093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54033492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54033506 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54036349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54037340 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54039418 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54039436 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54040953 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54042663 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 54043084 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54045237 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 54045998 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 54046525 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54051574 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54052194 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54052272 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54053024 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54053219 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54054095 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54054964 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54055308 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54056366 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54056834 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54056845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54056847 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54057116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54057253 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54057418 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 54057923 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 54058237 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54058511 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54058782 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54058827 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54058888 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54058934 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 54058936 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 54058941 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54059041 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54059368 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 54060135 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 54060252 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54061177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54061711 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 54061768 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54061821 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54063457 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54064007 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54064061 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 54064097 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54064278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54065095 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 54067698 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 54069143 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54071196 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54071604 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54072043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54073776 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 54074319 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54078354 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 54079421 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54081904 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54082214 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54085736 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54087005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54087910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54090004 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 54090327 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54090331 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54091531 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54095506 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54098262 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 54098847 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54099258 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54104250 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 54105215 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54106804 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54108182 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 54108375 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54110103 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 54110358 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 54111525 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 54112415 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 54112803 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54113302 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 54113306 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 54113316 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 54113550 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54114144 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54115575 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 54120278 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54122938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54123538 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 54123542 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54123569 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 54125736 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54125885 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54125887 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54126048 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54126094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54126440 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 54126638 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54126801 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54127287 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 54127346 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 54127666 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 54127667 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 54127711 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 54127799 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 54127834 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 54128434 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54128842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54129190 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 54129209 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 54129235 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 54129240 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 54129299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54129410 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54129497 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54129541 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54129551 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54129559 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54129973 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 54130257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54130477 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 54130535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54130670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54130776 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 54131013 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 54131014 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 19 54131169 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 54131181 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 54132050 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 19 54132180 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 54132249 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 54132276 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 54132302 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 54132326 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 54132476 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 54132493 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 54132499 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 54132859 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 54132913 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 54132924 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 54132978 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 54133089 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 54133120 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 54133288 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 54133921 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 54134819 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 54134828 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 54134896 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 54135207 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 19 54135353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54135880 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 54136663 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54137255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54137690 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 54138434 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 54138792 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54139230 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 54139336 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 54139466 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 54139478 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 54139515 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 54139537 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 54139584 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 54139595 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 54139718 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54139750 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 54139756 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 54139759 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 54139848 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 54139864 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 54140333 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 54140410 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54140711 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 54140841 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 54141375 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 54141408 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54141631 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 54141901 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 54142305 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54142496 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 54142497 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 54142526 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 54143025 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 54143363 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 54143864 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 54143938 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 54144087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54144641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54144853 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54144859 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54144863 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54144883 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54144899 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54145015 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 54145234 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54145378 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 54145472 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 54145511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54145641 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54145736 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54146117 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 54146183 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 54146367 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 54146426 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 54146543 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 54146582 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 54146583 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54146633 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 54146642 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 54146671 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 54146672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54146694 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 54146732 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 54146740 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 54146882 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 54146903 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 54146928 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 54146947 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 54147192 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 54147318 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 54147366 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54147367 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 54147375 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54147557 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 54147818 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54148008 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54148105 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54148515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54149494 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 54149706 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54149811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54149916 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54149928 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54149935 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54149959 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54149986 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54150015 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54150077 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54150083 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 54150129 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54150183 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 54150217 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 54150256 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54150258 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54150300 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 54150333 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 54150340 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 54150364 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 54150367 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54150374 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 54150536 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54150576 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54150730 C A N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 19 54150746 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 54151005 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 54151020 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 54151064 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 54151083 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 54151181 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 54151182 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 54151188 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 54151223 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 54151243 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 54151254 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 54151256 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 54151266 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 54151342 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 54151390 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 54151417 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 54151418 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 54151440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54151503 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54151517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54151547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54151742 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54151772 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 54151834 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54151896 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 54151921 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54151937 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 54152047 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54152560 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54152836 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 54153161 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54153449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54153485 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 54153518 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 54153535 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54153701 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54153848 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 54153849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54154204 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 54154297 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 54154366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54154384 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54154421 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 54154463 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54154723 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 54154793 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54154944 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 54155003 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 54155072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54155124 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54155651 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 54155895 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54155978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54156072 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 54156527 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 54157277 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 54157476 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54157490 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 54157598 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54157633 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 54157741 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 54157757 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 54158475 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54158496 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54158505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54158561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54158577 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54158587 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54158835 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54158971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54158972 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54159121 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54159152 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54159521 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 54159769 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 54159870 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 54159908 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 54160013 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 54160399 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 54160739 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54160831 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54161936 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 54162572 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54163204 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54163210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54163218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54163345 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54165622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54165644 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 54165672 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 54165707 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54165791 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 54165844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54166396 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54166454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54166772 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 54167718 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54167873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54168035 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54168771 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54169117 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 54169216 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 54169231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54169407 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54169545 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 54169600 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 54169789 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 54169808 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 54169811 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 54170226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54170817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54171302 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 54175184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54176282 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 54176812 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54176931 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54178598 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 54178613 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 54178716 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54178745 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54178836 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 54178955 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 54179271 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54179290 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 54179303 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 54180242 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 54180246 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 54180374 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 54180375 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 54180399 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 54180732 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54180763 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 54180839 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54180840 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 54180897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54180970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54181623 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 54181867 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54181936 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54181979 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54182483 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 54183536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54183926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54184179 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 54184214 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54184308 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 54184460 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54184774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54184926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54184981 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54185355 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 54185359 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54185441 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54185520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54185565 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 54185764 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 54185993 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 54187379 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54187680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54188005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54188507 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 54188838 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54189835 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 54189992 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 54191106 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54191224 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54191348 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54191815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54192120 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54192195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54192587 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54192602 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54193595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54193716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54193749 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54193771 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54194009 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 54194163 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54194193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54194194 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54194727 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54196686 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54197573 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54198469 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54198674 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54199035 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54199129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54199619 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54199624 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54201392 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54201504 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54201564 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 54201641 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 54201838 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 54201847 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 54201880 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 54201928 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 54201955 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 54202073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54202172 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 19 54202201 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54202236 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 54202237 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 54202618 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 54202668 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 54202723 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 54202728 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 54202868 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54202925 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54203008 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 54203036 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 54203055 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54203060 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54203061 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54203132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54203160 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54203461 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54203490 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54203551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54203724 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54203730 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54203799 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54203824 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54203857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54203992 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54204118 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54204119 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 54204139 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54204156 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 54204166 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 54204193 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 54204195 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 54204987 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54205139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54205292 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 54205537 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 54205613 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 54205835 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 54206208 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54206523 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54206542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54206610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54206672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54206751 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54206912 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54206932 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54207219 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 54207306 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54207549 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54207592 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54207601 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54207618 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54207684 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54207769 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54207778 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54207880 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54207909 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54208017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54208315 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 54208397 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 54208518 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54208893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54209743 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 54210544 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 54210567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54217123 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54217194 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54217580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54217755 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54218264 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 54218840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54218944 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 54219098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54219112 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54219154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54219195 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54219390 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54219426 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 54219437 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54219946 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 54219992 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 54220380 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54220403 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 54221365 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54221865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54222586 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54223691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54223728 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54224586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54228606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54228764 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54230054 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 54230625 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 54230874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54231642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54232381 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54232605 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54235373 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 54235450 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 54236434 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 54236466 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 54236477 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 54236517 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54236534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54236548 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 54236664 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 54236749 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 54236754 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 54236764 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 54236766 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 54236793 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 19 54236796 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 54236800 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 54236801 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 54236827 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 54237132 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 54237343 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 19 54237350 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 19 54237374 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 19 54237475 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 54237481 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 54237519 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 54237578 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 54237618 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 54237661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54237706 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 54237879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54238513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54239151 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54239331 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54240079 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 54240111 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 54240351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54240629 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 54240742 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54240821 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 54240857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54240920 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 54240983 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54241325 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54242222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54242344 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54242413 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 54242629 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 54244279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54244671 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 19 54244898 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54245053 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54245182 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 54245202 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 54245214 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54245384 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54245447 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 54245523 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54245764 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 54245778 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54246004 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 54246008 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 54246079 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 54246085 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 54246144 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 54246216 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54246656 A C Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 54246802 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54246831 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54246958 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54247031 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54247142 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54247435 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 54247669 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54247798 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54247828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54248555 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 54248568 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 54248584 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 54248699 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 54248724 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 54248761 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 54248845 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 19 54249137 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54249179 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 54249444 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54249564 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54249570 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54249643 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 54249664 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 54249700 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 54249740 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 19 54249789 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 19 54249791 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 19 54249817 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 54249876 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54251575 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54251869 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54252308 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54253805 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 54254257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54254630 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 54258505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54258535 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54258545 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54258763 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 54259169 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 54259186 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54259473 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 54259516 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 54259537 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 54259594 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 54259605 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 54259618 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 54259671 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 54259858 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 54260016 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 54260614 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 54260941 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 54261171 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 54261254 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 19 54261618 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 54261646 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 54261652 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 54261768 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 54261797 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 54261813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54261822 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54261972 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54262018 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 54262040 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 54262370 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54262422 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54262506 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 19 54262518 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 54262607 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 19 54262615 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 54262622 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 54262680 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 54262690 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54262724 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 54262863 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 54262880 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 54262934 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 54263204 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 54263297 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 54263304 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 54263322 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 54263353 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 54263445 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54263463 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 54263517 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 54263526 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 54263539 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54263650 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 54263745 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 54263860 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54263984 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54264141 C G Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 19 54264288 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 54264292 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 54264332 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 54264381 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 54264602 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54264665 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 54264680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54264835 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54264976 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 54265532 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 54266099 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54266375 A G Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 54266586 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54266618 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54266672 T A Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 54266872 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 54266929 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 54266974 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 54266980 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 54266981 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54267024 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54267541 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 54267602 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 54267613 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 54267614 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 54267624 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 54267667 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 54268031 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 54268032 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 54268066 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54268471 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 54268474 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54269044 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 54269115 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 54269192 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 54269203 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 54269210 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 54269315 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 54269539 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 54269540 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 54269731 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 54269741 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 54269988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54270097 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54270115 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 54270399 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 54270555 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 54270613 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 54270714 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 54270783 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 54270792 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 54270829 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 19 54270858 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 54271816 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 54271889 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 54271905 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 54272010 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 19 54272078 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 54272147 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 54272166 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 54272171 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 54272176 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 54272182 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 54272226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54272231 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 54272262 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 19 54272389 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 19 54272426 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 19 54272459 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 19 54272533 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 54272564 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 54272604 G A N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0 0.615384615384615 0.384615384615385 8 18 0 8 5 19 54272882 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 54273583 C T N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 19 54273852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54274606 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 19 54274691 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54275128 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54276121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54277606 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 54278165 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 54278276 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 54278800 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54279258 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 54279484 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 54279599 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 54279649 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 54279846 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 54279870 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 54279924 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 54279986 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 54280021 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 54280228 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 19 54280297 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54280448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54280480 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 54280741 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54280853 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 54280926 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54281163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54281458 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 54282269 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 54282303 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 54282335 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54282429 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54282485 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 54282510 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54282665 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 54283269 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54283948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54285220 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 54285309 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 54285326 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54285332 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 54285366 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 54285398 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 54285422 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 54285444 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 54285460 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 54285509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54285881 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 54286296 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54287848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54288413 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 54288431 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54288453 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54288470 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54288542 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 54288640 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54288890 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 54288905 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 54288912 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 54288924 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 54289012 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 54289037 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 54289187 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54289216 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54289702 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 19 54290092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54290101 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 54290220 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 54290241 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 54290362 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54290486 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 54290666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54290837 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 54291024 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 19 54291548 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 54291631 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 54291764 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 54291811 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 54291833 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 54291840 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 54291851 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 54292445 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 54292619 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 54292675 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 54292709 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 54293050 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 19 54293102 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 54293132 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 54293139 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 19 54293221 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 54293231 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 54293309 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 54293389 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 54293408 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 19 54293409 T G N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 19 54293516 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 54293527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54293618 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 54293633 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 54293869 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 54294010 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 19 54294215 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 54295866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54296493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54296596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54296608 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54296984 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 54297221 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 54297291 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 54297416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54298610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54299334 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 54300008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54300283 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 54300532 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 54300721 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 54300747 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54300783 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 54300784 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 54301990 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 19 54302097 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54303041 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 54303102 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 54303103 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 54303700 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 54303957 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 54303989 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54304140 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 19 54304168 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 19 54304193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54304225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54304270 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 19 54304306 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54304380 A C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 54304925 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 19 54304931 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 19 54304939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54305016 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 54305544 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 54305832 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 54305889 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 54305946 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 54306039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54306048 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 54306120 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 54306144 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54306159 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 19 54306160 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 19 54306572 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54306695 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54306855 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 54307882 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 19 54307883 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 19 54307888 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 54307989 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54308118 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 19 54308134 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54308155 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 54308185 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54308735 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54308997 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 54310500 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 54311161 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 19 54311346 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 19 54311389 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54311557 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 54311561 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 54311753 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 54311848 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 19 54311855 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 54311856 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 54311906 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 19 54312019 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 54312234 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54312291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54312292 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54312407 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 54312450 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54312463 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 54312572 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 54312971 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 54314036 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 19 54314108 C G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 19 54314195 A C N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 19 54314427 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 54314471 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 54314487 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 54314496 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 54314583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54314605 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 54314618 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54314920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54314973 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54315070 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54315091 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 54315094 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 54315113 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 54315130 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 54315140 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 54315185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54315374 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54315724 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54315852 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54316426 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54316542 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 54316608 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 54316783 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54318582 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 54320006 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54321944 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 54321945 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 54321969 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 19 54322813 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 54323001 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 54323202 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54325099 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 54325100 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 19 54325114 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 54325174 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 54325312 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 19 54325409 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 19 54325468 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 54325688 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 54326489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54326519 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 54326571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54326656 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 54326731 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 54328717 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54328826 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 19 54330647 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 19 54330650 T C Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.1875 0.6875 0.125 17 15 3 11 2 19 54330700 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 19 54330722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54330731 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 19 54332012 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 54333490 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 54333536 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54334595 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 54335438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54335530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54335660 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 54337595 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54337735 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 54338783 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 54341656 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 54342135 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54342163 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54342171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54344398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54344612 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 54344879 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54344897 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54345004 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54345344 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54346325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54346927 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54346993 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 54346999 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 54347421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54347647 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 54352262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54353005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54355928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54356088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54357801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54359483 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54359743 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54361435 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54363194 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54363713 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54363859 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54364579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54365967 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54366487 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54367588 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54368097 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54368295 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54369109 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54369900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54371078 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 19 54372088 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54373043 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54373949 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 54373966 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 54377098 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54378438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54384379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54384476 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54385717 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 54386212 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 54386458 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 54386711 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 54388127 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54388158 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 54388379 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 54388424 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 54388505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54388507 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 54388524 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 54388762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54390104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54390390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54390564 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 54390588 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 54390601 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 54390605 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 54390731 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 19 54390758 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 19 54390780 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54391907 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 54391962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54392297 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 19 54392728 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 54392985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54393511 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 54394406 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54395887 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 54396127 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 54396323 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 54396394 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 54396405 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 54396411 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 54396435 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 54396617 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 19 54396631 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 19 54396819 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 54396851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54396957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54397176 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 54397380 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54397429 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 19 54397432 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 54397473 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 54397478 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 54397893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54398053 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 54398223 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54398224 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54400420 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 54401170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54401469 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 54401734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54401782 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 54402085 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 54403268 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54403297 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 54403351 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 54403385 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54403479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54403519 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 54403525 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 54403584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54403612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54403616 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 54403642 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54403722 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54404037 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54406127 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 54406586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54407665 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54409202 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 54410775 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54410892 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54413290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54415097 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 54415154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54415627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54416093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54416887 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 19 54416923 A G N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 19 54419842 T A N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 19 54419885 G T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 19 54419926 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 19 54419972 T A N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 19 54420018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54420068 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 19 54420128 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 54420202 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 19 54420218 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 54420289 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54420552 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 54420571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54420626 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54420641 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54420682 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 54420752 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 54420827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54420855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54421233 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 19 54421234 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 54421864 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54421893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54421986 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54422084 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54422161 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54425763 G T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 19 54427536 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54427603 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 54428077 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 54428278 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 19 54428290 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54428369 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 19 54429236 T C Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 19 54431633 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 54431687 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 54432267 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 19 54432268 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 19 54432271 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 19 54432272 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 19 54432741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54433300 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 54433442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54433975 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 54433994 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 54434015 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 54434041 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 54434065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54434222 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54434591 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 19 54434668 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 54436676 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54436916 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54437173 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54438561 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54442571 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 19 54443313 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54444817 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 54445312 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54446544 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54446781 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54447254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54447350 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54447848 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 54449134 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 54451048 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54451489 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 54452050 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 54452077 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 54452147 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 54452424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54452602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54456314 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54457412 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 54457499 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 54457821 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54457873 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54457888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54458547 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54458549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54458569 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54458626 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 54459068 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54459069 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 54459226 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54459818 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 54459826 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 54464074 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54464109 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54465727 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 54465922 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54466385 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 54466417 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 54466442 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 54466443 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 54466472 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54466478 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 19 54466580 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54466640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54467149 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54467235 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 54467430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54468269 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 54468273 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 54468395 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 54468859 G C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 54469107 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 54469335 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 54469482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54470084 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 54470086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54470721 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 54470772 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 54471242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54471585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54471729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54472485 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54472605 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 54472612 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 54472621 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 54472707 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54472849 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 54473292 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54473905 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54473979 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 54474024 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 54474060 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 54474244 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 54474280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54474381 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 54474409 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54474846 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54474856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54474977 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 54475386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54475409 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 54475471 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 54475483 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 54475614 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 54475701 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 54475705 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54475906 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 19 54476190 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 54476323 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54476619 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 54479262 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 54479466 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54479503 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54480300 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54481184 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 19 54481551 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54481919 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 54482505 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54483183 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 54483290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54483543 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 54484511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54484564 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54484694 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 54485357 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54485861 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 54486015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54486055 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 19 54486117 A T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 54486238 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 54486247 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54486305 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 54486416 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54486431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54486883 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54487088 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54487097 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 19 54487353 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54487625 G A Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 19 54487724 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54487761 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54487951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54488355 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54488450 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 54488718 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54489099 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54490239 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54490262 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 54490291 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 54490579 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 19 54490645 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 54490646 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 54490805 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 54490807 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54492118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54492128 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54493591 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54496425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54496715 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 54496929 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 54496996 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54497062 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 54497077 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 54497079 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 54498091 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 54498284 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54498481 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 54498885 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 19 54498886 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 19 54498893 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 54498983 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 19 54499216 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 54499456 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54499484 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 54499587 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 54499589 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54499596 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 19 54499661 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 19 54499701 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 54499803 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 54499820 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 54499842 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 54499875 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54500282 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 54500487 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 19 54501159 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 54501241 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 54501244 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 54501472 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 19 54501947 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 54502003 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 54502068 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54502841 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54502905 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 54502964 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54503098 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 54503107 T G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 19 54503780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54504121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54504182 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 54504370 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 54504375 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 54504401 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 54504423 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 54504575 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 54504578 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54504699 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54505174 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54505217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54505335 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 54505398 A G N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 19 54505543 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 54505561 T A N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 19 54506048 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54506363 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 54506566 A G Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 18 10 8 2 4 19 54506637 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.6 0.133333333333333 0.266666666666667 20 10 9 2 4 19 54506666 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 18 10 8 2 4 19 54506706 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 54507059 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 19 54507600 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 54507756 T C N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 19 54508231 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 54508446 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 54508511 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 54508531 C A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 54508581 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 54508589 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 54508655 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 19 54508776 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 54509018 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 19 54509073 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 19 54509158 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 54509261 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 54510439 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 54510689 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 54510727 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 54510747 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 54511473 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54511896 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 54512257 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54512662 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 54512821 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 54513105 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 19 54513116 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 54513173 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 54513176 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 19 54513412 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 54513466 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 19 54513587 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54513687 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54513700 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 54513765 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 54513783 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54513791 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 54513814 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 54514312 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 54514448 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 54514480 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 54515838 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54516241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54516764 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 54516766 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 54516906 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54516991 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54517111 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 54517122 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 54517297 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54517311 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 54517347 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54517369 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54517381 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54517770 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54517840 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54518015 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 19 54518052 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 54518683 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 54519073 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54519226 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 54519381 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 54519415 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54519484 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 19 54520436 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54521023 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 19 54521136 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 54521270 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54521489 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54521541 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54521826 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 54522041 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 54522054 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54522565 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 54522590 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54522607 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 54522615 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 54522619 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54522633 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54522888 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 54522917 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 54522919 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 54522921 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 54523258 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54523516 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54523531 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 54523594 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54523953 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 54523974 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 54524003 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 54524041 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54524775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54524852 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54525015 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54525064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54525234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54525297 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54525443 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54525560 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 54525930 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54525933 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 54525968 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 54526111 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 54526127 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54526250 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54526805 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 54528624 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54528892 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 54528913 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 54528987 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54529097 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54529492 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54529696 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54529879 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54529892 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 54529930 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54529975 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 54530035 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 54530036 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54530081 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 54530188 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 54530222 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 54530250 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 54530420 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 19 54530429 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 19 54530470 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 54530543 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54530783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54530839 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54530952 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54531091 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 54531147 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 54531317 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 54531560 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 54531978 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54532101 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54532152 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 54532798 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 19 54533008 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 54533088 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 54533095 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 54533255 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54533390 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 54533531 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 54533535 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 54533553 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 54533920 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 54534041 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54535330 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 54536039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54536205 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54536484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54536524 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 54536620 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 54536743 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 54536796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54536918 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54536919 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54536992 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54537482 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 54537486 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 54537533 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54537698 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 54537740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54537748 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 54537756 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 54537945 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 54538451 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 54538559 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 54538569 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 54538571 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 54538634 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 54538652 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 54538655 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 54538839 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 54538878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54538934 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 54539274 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 54539345 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 54539532 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 54539617 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 19 54539647 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 54539919 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 54540312 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54540901 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54541364 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54542070 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 54542463 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 54542585 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 54542595 G T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 19 54543106 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 54543136 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 54543586 T A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 19 54544177 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54544670 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 54544698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54545090 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 54545330 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 54545340 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 54545565 A T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 54545584 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54545666 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 54545667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54545810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54545895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54546043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54546539 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54546545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54546599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54546815 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 54546827 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54547031 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54547408 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54547810 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 54547876 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 54547883 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54548613 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54548652 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54548870 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 54549128 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 54549696 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54549716 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54550276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54550454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54550886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54550908 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54551083 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54551103 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 54551376 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54551475 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 54551476 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 54551494 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 54551538 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 54551544 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 54551600 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54551681 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54551932 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54551984 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54552032 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54552034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54552101 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 54552132 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 54552196 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54552205 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 54552877 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54552878 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54553168 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54553244 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54554934 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54555030 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54555456 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 54555581 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 54555772 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 54557021 G T Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 54557490 G C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 54558527 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 54558673 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 54558690 G T Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 54558714 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 54558873 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 19 54559037 T A Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 54559038 C G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 54559161 G T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 54559183 T G N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 54559328 G T N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 19 54559356 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 54559482 C G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 54559555 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 54559635 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 54559825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54560049 C A Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 54560083 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 54560137 T A Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 54560213 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 54560345 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 54560349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54560646 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 54561477 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 54561702 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 54564403 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 54564783 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54565320 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54565910 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54566569 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54567037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54567565 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 54567634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54567725 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54567884 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54568026 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 54568592 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 54568999 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 54569292 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54569293 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54570394 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 54570589 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 54570637 A G N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 19 54570711 C T N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 19 54572079 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 54572093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54572371 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54573611 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54575017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54575538 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54576243 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54576290 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 54576310 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 54576352 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 54576671 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 54576842 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54577181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54577207 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 54577223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54577293 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 54577513 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54577525 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54577608 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 54577643 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 54577844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54577886 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 54577892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54577942 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 54578063 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 54578130 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 54578150 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 54578237 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 54578336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54580116 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 54580120 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 54580448 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 54580496 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54580512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54580527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54580550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54580598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54580660 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 54580764 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 54580779 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54580815 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54580855 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54580952 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54580997 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 54581054 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 54581078 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 54581177 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 54581191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54581375 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 54581381 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 54581431 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 54581433 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 54581448 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 54581567 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 54581576 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 54581634 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 54581811 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 54582216 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 54582254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54582284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54582300 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54582380 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54582381 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 54582487 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 54582502 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 54582550 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 54582554 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 54582562 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 54582700 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 54582783 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 54582991 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 54583355 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 54583365 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 54583419 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 54583420 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 54583529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54583531 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 54583574 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54584113 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54584915 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 54584929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54585025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54585211 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 54585400 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 54585401 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 54585538 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 54585554 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54585688 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 54585926 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 54586271 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 54586272 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 54586432 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 54586435 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54586856 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 54587173 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 54587669 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54588073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54589586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54590453 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 54591152 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 54591688 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54591800 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54591927 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 54592829 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 54593671 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 54594280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54595333 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 54595765 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54595865 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 54596067 T G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 54597008 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 54597018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54597043 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 54597778 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54597853 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 54597868 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 54598063 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 54598127 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 54598727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54598881 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 54598923 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 54598962 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 54599114 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 54599153 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 54599154 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54599227 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54599294 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54599298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54599336 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54599406 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54599625 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 54599643 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 54599694 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 54599807 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 54599877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54600003 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54600032 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54600311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54600356 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54600524 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54600534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54600708 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54600731 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54600803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54600920 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54601020 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54601683 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 54602065 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54602078 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 19 54602222 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 54602292 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54602431 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 54602448 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54602737 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 54602771 A C Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 54602794 A C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 54602806 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 54602833 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 54602845 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 54602965 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 54603279 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54603474 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54603603 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 54603672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54603780 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 54603925 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 54604842 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 54604896 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 54605135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54605427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54605949 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 54606041 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 54606083 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 54606104 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 54606106 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 54606155 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 54606172 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 54606174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54606354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54606361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54607462 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 54607603 T C Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 19 54607651 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 54607735 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 19 54607779 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 54607790 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 54607880 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 54607931 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 54608066 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 54608224 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 54608475 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 54608721 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54608787 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 54608859 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 54608922 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 54609256 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 54609280 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 54609292 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 54609348 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 54609386 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 54609434 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 54609435 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 54609455 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 54609538 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 54610760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54610893 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 54610916 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 54610938 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 54611010 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 54611056 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54611117 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 54611128 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 54611302 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 54611910 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 54611917 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 54611975 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 54612013 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 54612088 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 54612411 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 54612441 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 54612446 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 54612460 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 54612475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54612491 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 54612530 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 54612607 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 54612652 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 54612675 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 54612676 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 54612746 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 54612748 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 54612910 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 54612911 T G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 54612933 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 54613296 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 54613482 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 19 54613598 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54613721 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 54613879 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54614037 G T N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 19 54614055 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 54616714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54618163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54618999 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54619712 G T Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 54619989 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54620304 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 54620336 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 54620396 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 54620613 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 54621207 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54622019 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54622135 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54622278 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54622286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54622305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54622351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54622365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54622384 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54622408 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54622428 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54622622 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54622646 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54622838 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54623005 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54623047 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 54623563 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54623588 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54623920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54624057 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 54624386 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 54624430 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 54624711 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 54624765 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 54625011 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 54625383 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 54625559 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 54625598 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 54625646 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 54625735 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54625944 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 54625978 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 54626243 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 54626718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54626953 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 54627646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54627700 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 54628000 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54628261 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 54628484 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 54633923 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 54634333 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 54634390 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 54634401 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 54634421 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 54634456 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 54634483 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 54634486 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 54634544 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 54635007 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 54635036 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 54635995 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54637225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54637470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54638704 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54641586 C G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 54641737 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 54641974 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 54642056 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 54642588 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 54644577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54645060 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 54645129 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54645139 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54646711 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54646830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54646930 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 54646973 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54647055 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 54647335 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 54647400 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 54647519 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 54647594 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 54647629 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 54647877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54647972 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54648224 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 54648416 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 54648634 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54649020 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 54649283 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 54653707 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54654601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54655168 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 54655359 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54655461 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 54655740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54655924 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54656067 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54656341 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 54656375 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 54656547 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 54656675 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54656704 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 54656837 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 54656850 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 54656854 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 54657198 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 54657239 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 54657300 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 54657389 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54657395 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54657541 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 54657570 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 54657691 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 54657713 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 19 54657753 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 54657762 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 54657820 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 54657937 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 54657987 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 54658018 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 54658039 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 54658608 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 19 54658729 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 54659064 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 54659131 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 54659133 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 54659158 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54659178 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54659655 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54660069 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54660131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54660231 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54662862 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54662875 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 54662894 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 54662950 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54662953 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54663027 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54663168 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54663243 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54664810 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54664946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54665343 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54667643 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54669574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54670059 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 54671432 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54672669 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54673686 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54674114 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 54675424 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 54677651 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 54678198 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54678212 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54678658 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54679505 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 54680617 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54683578 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 54684510 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54684813 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 54685528 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54686564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54692453 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54692636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54693019 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54695842 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54695889 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54696003 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54696161 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54696376 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 54696443 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 54696517 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54696976 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 54697004 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 54697030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54697537 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54697957 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54699148 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54700024 A T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 54700837 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54701360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54702229 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54702404 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54703102 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 54704062 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 54704278 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54705401 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54705402 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54706150 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54706175 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54706867 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54707960 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54708335 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54708350 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 54709414 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54709676 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 54709697 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 54709698 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 54709699 G A Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 54709756 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 54709757 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 54709782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54709812 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 54709820 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 54709895 A C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 54709897 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 54709980 T A Y N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 54710210 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54711211 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 54711845 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 54711913 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 54711988 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 54712249 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 54712501 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 54712797 A C Y N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 19 54712905 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54712928 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 54712977 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54713017 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 54713046 C A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54713054 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54713181 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 54713202 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 54713297 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54713304 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 54713522 G C Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 54713552 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54714247 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54714626 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 54715017 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54716155 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 54716239 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54716526 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 54716794 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54717023 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 54717726 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54719515 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54719585 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 54719824 G A Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 54719825 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54720143 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54720437 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 54720858 C A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 54721092 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54721140 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54721593 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54721789 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54721998 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 54722008 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 54722069 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54722107 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54722123 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54722126 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54722165 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54722203 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 54722236 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 54722323 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 54722442 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54722476 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54722518 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54722549 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54722649 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54722777 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 54723047 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54723090 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 54723265 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54723325 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 54723709 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 54723714 C A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 54723847 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 54724258 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 54724539 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54724688 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54724919 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54724971 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 54725259 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 54725272 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54725294 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54725660 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 19 54725903 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54725942 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54726132 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54726138 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 54726185 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 54726596 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 54726649 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 54726716 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 54726717 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 54726747 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54726901 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54726926 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54727012 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54727062 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54727074 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54727186 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54727467 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54727544 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 54727547 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 54727580 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 54727679 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 54727832 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 54727846 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 54728076 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 54728080 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 54728159 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 54728200 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54728204 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54728235 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54728237 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54728336 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 54728347 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 54728398 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 54728404 C T Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 54728407 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54728668 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 19 54728729 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 54728754 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54728791 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 54728882 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54728894 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54729110 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 54729114 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 54729299 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 54729346 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 54729435 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54729515 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 54729525 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 54729627 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 54729656 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 54729713 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 54729718 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54729922 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 54730031 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54730162 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54730262 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 54730388 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 54730706 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 54730977 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54731055 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 54731171 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54731249 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54731384 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54731451 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54731458 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54731667 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54731779 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 54731802 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54731923 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54732012 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 54732074 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 54732120 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54732139 G A Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 54732234 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54732241 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 54732244 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 54732245 A T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 54732401 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54732404 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54732451 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 54732559 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 54732583 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54732591 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 54732597 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54732604 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54732679 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54732691 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54732740 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 54732763 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54732819 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54732996 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 54733020 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54733110 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54733131 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54733425 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 54733559 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 54733628 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 54733653 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 54733683 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 54733692 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 54733769 C A N N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 19 54733990 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 19 54734509 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54734742 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 54734771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54734812 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 54734841 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 54734941 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 54734977 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54735083 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 54735169 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 54735245 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 54735264 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54735450 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 54737403 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 54738618 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 54739064 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54739178 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54739212 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54739275 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54739281 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54739368 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 54739496 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 54739505 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 54739581 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 54739869 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 54739979 A G Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 54740787 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 54741160 G A N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 19 54741468 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 54741546 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 54741638 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 54741654 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 54741667 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54741684 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 54741730 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 54741797 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 54741849 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 54741914 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 54742041 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 54742372 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 54743826 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54743884 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54743889 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54744115 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54744647 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54745366 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54746450 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54747823 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 54747920 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54748070 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 54748086 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 54748126 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 54748298 G T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 54748924 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 54748928 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54749174 A G Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 54749396 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 54749549 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54749941 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54750050 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54750265 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54750452 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 54750518 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 54750923 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54751041 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54751229 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54751426 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54751496 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 19 54751576 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 54751789 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54751794 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 54751804 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 54751823 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 54751829 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 54751876 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 54752004 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 54752131 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 54752728 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 54752768 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 54752800 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 54752936 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 54753173 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 54753186 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 54753317 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 54753388 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 54753462 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 54753471 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 54753536 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 54753542 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 54753577 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 54753616 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54753640 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 54753718 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 54753901 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 54753973 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54754115 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54754158 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54754250 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54754252 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54754262 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 54754322 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54754323 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54754345 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54754390 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54754422 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54754462 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54754494 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54754512 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54755170 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54755261 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54755309 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54755310 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54755325 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54755762 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 54755779 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 54755828 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54755906 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54756019 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54756083 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 54756654 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54757057 C T Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 54757094 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 54757109 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 54757219 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 19 54757370 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 19 54757598 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 54757751 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54758093 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 54758510 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54758651 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54758808 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54758828 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54759139 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 54759174 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 54759302 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54759527 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54759712 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 54759849 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 54760097 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54761753 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54762038 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54762532 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54763925 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54764165 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54764279 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54765152 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54766032 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54766562 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 54766850 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54767078 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54767102 G T Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 54767182 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54767188 C A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54767248 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54767270 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54767286 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 54767312 G C Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54767335 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 54767336 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 54767347 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54767383 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54767509 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54767576 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 54767601 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54767631 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 54767634 A C Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 54767635 A C Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 54767644 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54767688 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 54767813 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 54767874 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54767888 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54768468 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54768562 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54768564 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54769374 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54770258 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 54773000 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 54773652 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54773996 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54776151 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54776974 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 54779294 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54779964 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 54782819 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54783024 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54783537 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54783939 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54784020 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 54790549 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 54792480 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 54794035 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 54795817 A T Y N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 19 54796131 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 54796220 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 54796975 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54797857 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54799406 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54800114 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 54800314 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54800381 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54800392 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54800705 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54800797 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54800961 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54801033 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54801077 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54801153 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54801370 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 54801547 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54801580 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54801668 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54801804 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54801897 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54802011 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54802027 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54802028 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54802055 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54802066 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54802157 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54802502 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54803053 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54803281 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54803351 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54803422 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54803527 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54803634 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54803694 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54803701 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54803721 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 54803770 T G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54803818 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54803931 C A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54804052 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54804129 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54804161 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54804478 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54804743 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54804784 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54804787 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54804801 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54804895 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54804903 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54805167 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54805669 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 54805691 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 54805982 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 54805995 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 54806183 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 54806557 T C Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 54806579 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 54806992 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 54806998 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 54807000 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 54807043 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54807207 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 54807248 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 54807330 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 54808044 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54808143 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54808927 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54808929 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54809151 A C Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 54809159 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54809172 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54809174 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54809205 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54809550 A C Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 54809668 T A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54809672 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54809677 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54809727 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54809760 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54809777 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54809853 C A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54809942 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54810124 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54810163 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54810322 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54810336 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54810372 T A Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 54810388 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54810541 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54810543 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54811393 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54811419 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54811420 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54811496 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54811502 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54811695 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54811928 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 54812364 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 54812382 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54812609 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 54812670 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 12 6 5 2 2 19 54812695 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 54812743 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54812805 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 19 54813135 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 54813192 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 54813427 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54813434 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54813435 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54813468 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 54813562 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 54813613 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54813616 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54813719 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54813873 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54813892 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54814064 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54814128 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54814129 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54814205 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54814331 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54814428 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 54814512 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54814689 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 54815226 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 54817318 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 54818074 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54818201 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54818507 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54818509 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54818630 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54818801 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54818931 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54818991 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54819081 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 54819463 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54819733 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 54820225 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 54820342 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 19 54820553 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54820638 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 54821548 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54821555 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 54821665 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54822121 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54822133 C G Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 54822685 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54822952 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54823280 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 54823496 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 54823925 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 54826446 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54827177 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54827350 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54827665 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54827668 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54830575 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54831580 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54832958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54834484 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54835685 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 54835851 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 54835971 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54835987 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 54836178 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54836215 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54836700 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 54836717 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 54836734 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54836778 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 54836841 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54836860 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 54836910 G C Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 54837317 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 54837334 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 54837392 C A Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 54837477 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 54837536 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 54837656 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54838079 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54838376 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 54839023 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54839522 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 19 54839893 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54840028 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54840281 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54840489 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54840715 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 54840969 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 54841114 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54841123 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 54841185 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54841189 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54841200 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 54841222 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 54841858 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 54841957 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 54842200 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 54842299 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 54842307 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 54842314 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54842451 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 54842816 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 54842844 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 54842845 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 54842878 C T Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 54842980 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 54843056 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 54843084 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 54843581 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 54843626 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 54843798 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 54843806 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 54843889 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 54844153 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54844447 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54844526 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54844565 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 54845094 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54845109 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54845222 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54845228 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54845229 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 54845270 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54845273 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54845306 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54845315 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54845340 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54845364 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54845369 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54845373 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54845378 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54845397 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54845514 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54845619 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 54845638 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 54845639 T G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 54845676 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54845730 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 54847300 C T Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 54847347 A G Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 54847370 T C Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 54847384 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 54847419 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54847420 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 54847468 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 54847547 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54848128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54848423 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 19 54848424 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 54848510 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54848589 G T Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 54848737 G T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 54848738 G T Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 54848852 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54848868 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54848902 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54848915 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 54848951 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 54849015 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54849054 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54849057 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54849182 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54849190 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54849424 T A Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 54849493 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54849500 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54849504 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54849528 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54849558 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54849577 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54849670 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54849918 C G Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 54849948 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54849989 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54850000 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54850015 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54850033 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54850136 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54850160 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54850209 T A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 54850234 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54850314 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54850357 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54850430 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54850459 A C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 54850503 G A Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 54850504 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54850508 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54850536 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54850558 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54850575 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54850610 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54850630 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54850854 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54850906 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54850928 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54850950 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54850978 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54851219 G C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 54851290 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 54851797 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 54852559 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54853026 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 54853338 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 54854662 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54855047 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54855097 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54855218 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54855272 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 54855331 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54855400 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54855467 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54855520 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54855962 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 54857274 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 54857293 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54859640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54859808 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54863269 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54863999 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54864600 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54864666 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54868095 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54868498 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54869410 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 54869654 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54869656 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54870688 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 54870890 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 54871143 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 54872240 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54873188 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54874628 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54876635 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54876754 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54876794 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 54876807 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54876893 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54877060 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 54877104 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54877154 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54877177 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54877308 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 54877396 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54877565 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54877699 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54877719 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54878026 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 54878042 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 54878270 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 54878284 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54878312 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54878519 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54878544 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54878612 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54878703 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54878753 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54878835 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54878871 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54878882 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54878902 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54878966 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 54879059 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 54879073 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 54879224 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 54879347 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 54879451 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 54879936 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 54880038 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54880124 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54880145 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54880293 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 54880375 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54880383 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54880441 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 54880646 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54880672 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54880856 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54880992 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 54881020 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 54881134 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 54881244 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54881295 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54881343 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 54881726 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 54882098 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 54882185 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54882202 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 54882809 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54882857 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 54882913 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 54883049 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 54883858 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54884339 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54884916 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54884960 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54887275 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54887598 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 54887919 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 54888788 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54889472 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 54889535 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54889924 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54891307 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54892786 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 19 54893692 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54893869 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 54894404 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 54894650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54897534 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 54897670 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 54897831 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 54898078 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 54898871 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 54899014 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 54899030 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 54899039 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54899063 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54899114 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54899315 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 54899324 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 54899354 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 54899381 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 54899398 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 54899413 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 54899636 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 54900130 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 54900208 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 54900252 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 54900340 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 54900361 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 54900376 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 54900493 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 54900511 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 54900586 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 54900599 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 54900620 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 54900839 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 54900865 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 54901039 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 54901368 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 54901369 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 54901383 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 54901436 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 54901472 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 54901507 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 54901617 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 54901663 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 54901708 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 54901847 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 54902001 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54902073 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 54902076 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54902084 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 54902285 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 54902338 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 54902350 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 54902359 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 54902472 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54902536 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54902537 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54902617 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 54902647 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 54902755 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 54902773 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 54902776 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 54902812 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 54902850 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 54902934 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 54902947 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 54902952 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 54903184 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 54903253 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54903302 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 54903590 A T N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 19 54903803 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 54903938 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54903979 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 54904204 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 54904360 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 54904392 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 54904942 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54905191 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54905319 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54905713 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54906382 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54906759 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54906861 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54907021 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54907441 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54908634 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 54908663 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54909454 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54909961 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54909998 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54910110 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54910191 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 54910321 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54910322 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54910381 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54910451 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54910468 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54910555 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54910556 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54910578 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54910722 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54910831 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54910927 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 54910928 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 54910973 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54911377 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54911798 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 54912337 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54914335 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54914919 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 54915124 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54917647 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54918061 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54918497 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54918689 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 54919153 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 54920356 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 54920480 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54921609 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 54921790 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54922523 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54924893 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54925911 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54927220 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 54927225 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54927282 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54928881 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54930633 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54932052 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54933059 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54933716 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 54933739 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54934511 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 54934576 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 54934587 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 54934716 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 54934753 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 54934786 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 54935195 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 54935769 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 54935776 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 54935796 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54936575 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54937002 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54937327 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54937824 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54937976 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 54938307 C T N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 19 54939383 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54940740 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 54940814 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54941837 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54941871 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54942021 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54942159 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54942328 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54942349 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54944910 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54945559 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 54945610 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54946499 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54947395 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 54947653 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54948202 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54948213 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54948216 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54948246 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54948306 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54948439 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54948908 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54949013 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54949022 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54949041 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54949051 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54949084 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54949523 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54949593 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54950237 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54950404 G T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 54950933 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54951792 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 54953821 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54953837 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54953874 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54953982 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54953992 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54954005 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54954011 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54954033 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54954045 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54954230 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 54954512 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54954690 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54954778 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54954962 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54955006 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54955154 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 54955221 T G Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 54955635 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54956057 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 54956060 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54956065 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54956114 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54956217 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54956227 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 54956438 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 54956496 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54956518 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54957421 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 54957456 A T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 54957763 T G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 54957841 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 54958057 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 54958074 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 54958121 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 54958164 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 54958203 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 54958222 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 54958223 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 54958313 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 54958521 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54958688 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 54958701 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 54958731 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 54958864 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54958922 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 54958968 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54959334 T A Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 54961836 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 54962216 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54962363 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54962364 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54962780 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 54963679 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54963743 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54964259 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54967726 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54968441 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54968672 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54969022 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 54969032 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54969033 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54969046 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54969186 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54969268 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 54969657 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54969997 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54969999 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54970405 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54970699 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 54970773 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54970864 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54971159 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 19 54971618 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54971703 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 54971875 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 54971879 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 54972399 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 54972572 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54972654 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54972999 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54973060 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54973219 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54973252 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 54973279 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54973419 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 54973698 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 54974267 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 54974429 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54976345 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 54976354 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54976375 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54976742 A T N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 19 54976873 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 19 54976983 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 54976988 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 54977354 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 54977367 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54977498 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 54978009 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 54978229 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54978253 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54978257 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 54978469 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 54978596 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 54978606 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 54978644 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 54978658 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 54978886 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54978973 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54978980 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54979123 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54980045 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54980572 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54980593 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54980647 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54980673 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54980758 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54980820 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54981143 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 54981228 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54981307 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54981366 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 54981518 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 54981537 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 54982042 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54982170 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54982250 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54982304 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54982572 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 54982659 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 54982956 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54983238 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 54983794 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54983952 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 54983985 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54984345 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 54984535 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54984744 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54984748 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54984749 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54984798 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54984951 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 54985034 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54985122 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54985182 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54985189 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 54985195 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 54985359 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54985373 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54985385 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54985394 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 19 54985437 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54985559 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 54985572 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54985649 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 54985651 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 54985791 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 54985841 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 54985857 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 54985897 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54985949 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 54985980 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 54986035 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 54986076 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54986098 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54992754 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54993068 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54993131 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 54993137 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54993316 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 54993324 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 54993381 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 54993415 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 54993437 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 54993712 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 54994203 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 54994231 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54994272 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54994327 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 54994665 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 54994745 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54994750 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54994988 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54995092 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 54995242 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 54996348 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 54996495 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54996628 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 54996719 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 54997297 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 54997298 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 54997657 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 54997694 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 54997703 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 54998056 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54998204 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54998574 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 54998813 A T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 54999521 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 54999898 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55000345 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55000354 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55001649 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55002532 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55003575 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55004263 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 55004856 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 55005005 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55008745 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55011742 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 55011745 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 55011770 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 55012360 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 55012388 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 55013026 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 55013204 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 55013308 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 55013506 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55013595 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55014329 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55014748 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55014836 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55014977 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 19 55015444 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 55015775 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 55015931 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 55015947 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 55015955 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 55016031 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 55016033 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 55016190 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 55016200 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 55016290 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55016449 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55016452 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55016499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55016780 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55016853 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55016869 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55016884 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55016910 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55017012 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 55017159 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 55017200 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 55017490 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 55017493 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 55017556 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 55017784 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 55017797 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 55017859 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 55017974 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 55018262 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55018338 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55018445 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55018561 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 55018799 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55018806 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 55018981 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 55019757 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 55019764 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 55019874 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 55019985 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 19 55020063 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 55020168 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 55020342 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 55020422 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55020434 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 55020585 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55020866 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 55021050 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 55021332 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 55021377 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55021714 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55021722 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55021939 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 55022034 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 55022043 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55022153 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55022618 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 55022658 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 55022723 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 55022763 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 55022953 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 55023148 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55023217 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 19 55023270 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55023285 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55023372 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 55023432 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55023435 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 55023439 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55023456 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55023554 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 55023556 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55023638 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55023651 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55023666 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55023667 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55023706 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 55023736 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55023737 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 55023764 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55023998 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55024118 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55024194 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55024209 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55024351 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55024436 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55024535 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55024545 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55024608 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55024834 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55024950 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 55025170 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 19 55025178 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 19 55025251 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 55025653 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 55025655 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55025696 C G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 55025712 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 55025723 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 55025749 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55025786 G C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 55025789 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55025856 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55025884 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 55025980 C A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 55025999 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 55026052 A T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 19 55026054 A T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 19 55026120 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 55026217 A T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 19 55026313 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 19 55026316 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 19 55026348 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55026406 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55026427 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 55026663 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55026952 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55027229 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55027526 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 55027684 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55028282 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 55028484 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 55028552 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55028554 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55028637 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55028707 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55028762 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55028862 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 55028875 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 55029274 G T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 55030246 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 55030283 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 55030713 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 55030980 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55031016 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55031101 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55031139 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 55031346 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 55032170 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55032440 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55032519 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 55032676 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55032680 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55032694 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 55032711 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55032863 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55032958 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55033196 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55033230 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 55033237 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 55033507 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55033543 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55033703 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 55033737 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 55033784 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 55033845 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 55033850 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 55033919 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55033938 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55034054 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 55034244 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 55034359 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 55034496 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 55034520 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 55034536 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 19 55034823 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55034865 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 55034904 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55034960 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 55034976 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 55035008 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 55035376 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.571428571428571 0.357142857142857 10 18 1 8 5 19 55035406 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 55035638 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 55035784 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 55035859 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 55035881 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 19 55036020 G C N N 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 19 55036021 G T N N 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 19 55036594 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 55036604 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 55036653 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 55036702 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 19 55036750 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 55036899 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 55036985 T A N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 19 55037064 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 55037181 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 55037201 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 55037278 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 55037282 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 55037499 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 55037528 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55037649 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 55037858 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55038036 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 55038055 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 55038245 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 55038330 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55038412 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55038503 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 55038571 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 55038607 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 55038614 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 55038624 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55038637 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55038688 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55038760 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55038766 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55038940 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55039238 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 55039246 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 55039364 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 55039372 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55039391 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 55039397 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 55039456 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 55039588 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 55039935 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55040012 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 55040047 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 55040048 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 55040138 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 55040248 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55040416 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55040500 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55040515 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55040561 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55040624 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 55040958 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 55041461 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 55041473 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 55041500 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 55041604 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55041751 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 55041774 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 55042378 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55042419 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55042590 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 55042593 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55042643 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55043167 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 55043260 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55043325 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55043430 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 55043502 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 55043586 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 55043852 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55043999 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55044215 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55044225 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55044226 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 55044317 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55044422 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55044456 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 55044489 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55044512 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55044566 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 55044603 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 55044862 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 55044886 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55044908 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55044978 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 55044991 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 19 55045052 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 55045183 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 55045348 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 55045370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55045394 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 55045425 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 55045449 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 55045461 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 55045512 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55045533 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55045864 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55047383 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55047494 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55047544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55047573 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55047648 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 55047795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55047833 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55048035 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 55048186 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 55048199 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 55048213 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55048220 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 55048285 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 55048358 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 55048368 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55048400 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 55048419 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55048435 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 55048451 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55048498 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 55048657 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 55048825 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 55048850 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55048912 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 55048913 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 55048921 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 55048934 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 55048990 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 55049078 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 55049107 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 55049144 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 55049151 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 55049155 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 55049166 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 55049202 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 55049218 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 55049241 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 55049245 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 55049352 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 55049411 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 55049534 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 55049571 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 55049591 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 55049592 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 55049607 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 55049616 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 55049630 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 55049705 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 55049709 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 55049713 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 55049749 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 55049769 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 55049770 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 55049791 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 55050076 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 55050110 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 55050227 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55050245 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 55051007 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55051335 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 55051518 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 55051700 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55051746 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 55051756 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55051819 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 55051880 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 55051887 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55051999 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 55052019 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 55052220 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 55052267 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55052275 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 55052305 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 55052403 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 55052613 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55052625 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 55052769 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55052822 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 55052921 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55052942 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 55052944 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 55053001 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55053274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55053275 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55053411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55053531 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55053543 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 55053925 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 55054049 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 55054075 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 55055218 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 55056259 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 55056313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55056374 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 55056417 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 55057257 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 55057328 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55057391 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 55057630 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 55057658 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 55058156 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55058260 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 55058511 C A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 55058617 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 55058742 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55058791 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55059048 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55059192 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 55059621 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55059707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55060371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55060620 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55061846 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55062251 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55062321 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 55062494 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55062845 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 55062932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55062947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55063005 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55063171 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55063440 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 55063782 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 55063860 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 55064027 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 55064188 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 55064293 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 55064312 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 55064319 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 55064378 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 55064407 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 55064670 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 55064680 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 55064686 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 55064706 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 55065014 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55065022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55065206 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55065303 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55065418 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 55065507 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 55065508 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 55065511 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 55065587 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 55065608 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 55065978 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 55066333 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55066369 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 55066438 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55066510 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55066535 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 55066547 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 55066686 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 55066729 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55066920 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55066944 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55066949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55066954 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55067026 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55067114 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 55067648 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 55067745 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 55067761 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 55067824 C A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 55068024 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 55068094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55068103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55068370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55076185 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55076577 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 55077622 G C Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 55078200 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 55078203 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 55078241 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 55078460 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 55078494 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 55078829 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 55078855 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55079027 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 55079060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55079091 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55079096 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55079103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55079136 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 55079156 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 55079211 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 55079570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55079639 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 55079665 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 55079733 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 55079780 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 55080072 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55080301 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 55080316 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 55080390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55080429 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 55080473 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 55080490 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 55080514 T C Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 55080521 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55080611 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 55080664 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 55080715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55081349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55082073 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 55082313 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 55082347 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 55082430 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 55082677 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55082719 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 55082761 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 55082801 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 55082805 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 55082868 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55082994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55083381 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55083390 C G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 55083417 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 55083499 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55083530 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55083554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55083575 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55083603 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 55083646 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55083707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55083844 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 55084037 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 55084063 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 55084109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55084518 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 55084562 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 55084726 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55084798 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55084838 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55084931 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55084985 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 55084990 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 55085319 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 19 55085351 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 10 14 2 6 4 19 55085367 G A N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.181818181818182 0.454545454545455 0.363636363636364 9 13 2 5 4 19 55085779 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 55085867 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 55085888 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55085958 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 55086018 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 55086058 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 55086411 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55086434 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55086859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55087169 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55090910 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55091004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55092810 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55092957 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 55093407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55094737 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 55095322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55095435 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 55095582 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55096600 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55096702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55097038 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 55097131 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55099052 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 55100310 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55103776 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55105369 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 55106737 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55107076 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55107430 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 55107528 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55108187 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55111119 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 55111150 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 55111173 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 55111180 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55111591 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 19 55111599 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 55112162 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55112220 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 55113157 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 55113697 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55113720 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 55113735 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 55113746 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 55113841 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 55113933 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55113983 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 55114127 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 55114148 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 55114177 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 55114192 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 55114197 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 55114247 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 55114261 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 55114323 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55114405 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 55114432 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55114741 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 55114757 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 55114878 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 55114889 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 55114972 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 55114993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55115051 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55115064 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 55115101 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 55115223 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 55115773 C T N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 19 55116067 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 55116460 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 55116461 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 55116527 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 55116686 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55116851 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55117195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55117248 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 55117302 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55117484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55117983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55118427 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 55120156 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 55120195 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 55120681 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55120861 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55121059 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55121190 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55121219 T G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 19 55121220 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 55121236 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55121271 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 55121292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55121735 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 55121931 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 55122101 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 55122170 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 55122182 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 55122219 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 55122391 A T Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 55122397 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 55123287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55123995 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55124045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55125258 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 55125280 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55126904 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 55127564 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 55127901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55128127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55129517 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 55131027 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 55131054 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 55131057 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 55131078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55131206 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55131268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55131276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55131290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55131337 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55131350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55131375 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 55131387 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 55131392 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 55131546 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 55131556 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55131561 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55131585 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55131787 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 55131845 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 55131906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55131925 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55131936 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55131991 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 55132212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55132227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55132235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55132250 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55132255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55132575 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 55132644 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 55133004 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 19 55133081 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 55133858 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55133866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55133886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55133894 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55133966 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55134020 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55134159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55134313 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55135131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55140606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55140909 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 55140951 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55142396 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55142736 C G Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 55147114 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55147672 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55148299 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55148368 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55148672 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55150229 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 55152835 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55153181 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55155008 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55155135 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 55157414 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55158514 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 55158534 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 55158773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55161589 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55162155 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 55162302 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 55163590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55165287 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 55165394 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55165406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55165422 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 55165440 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55165676 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 55165742 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 55165922 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55165972 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55166081 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55166372 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55166563 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55166628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55166642 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55166649 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55166735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55167057 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 55167058 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55167100 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55167112 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 55167240 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 55167250 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 55167281 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55167440 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55167551 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55168845 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 55170165 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55170169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55170435 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55170587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55170747 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55170754 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55170916 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 55170953 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55170983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55170989 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55171040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55171236 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55171464 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 55171504 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 55171563 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 55171853 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 55171963 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55171977 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55172214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55172471 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55172472 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 55172484 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 55172566 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55172721 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55173317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55174251 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55174346 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 55174427 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 55174459 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 55174624 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55174645 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 55174698 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55175028 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 55175620 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 55176494 T G Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 55176505 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 55176753 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 55176765 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 55177115 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55177873 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 55177994 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55178862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55178889 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 55180160 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 55180583 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 55180604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55181694 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55181695 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55181748 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 55181894 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55182102 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 55182594 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 55182678 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55183218 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55183290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55183320 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55183502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55183993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55184030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55184161 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55184208 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 55184219 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 55184258 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 55184380 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 55184406 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 55184416 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 55184448 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 55184547 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 55185259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55185691 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55186220 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 19 55186357 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55186457 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 55186816 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55186824 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55186832 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 55187071 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55187075 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 55187125 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55187212 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55187750 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55188582 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55188787 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 55189204 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55189240 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55189553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55189661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55189663 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55189674 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55189681 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55190070 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55190073 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55190350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55190437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55191681 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55192086 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55192136 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55192583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55193129 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 55193504 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 55193627 T C Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 55193692 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 55193864 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 55193979 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55194118 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55194220 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 55194471 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55194548 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55194608 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55194931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55195008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55195743 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55195865 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55195927 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55196401 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 55197086 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55197088 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55197108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55197109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55197158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55197401 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 55197653 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55197825 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 55197967 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 55197992 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55198087 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55198152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55198175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55198238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55198317 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55198318 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 55198465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55199868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55200234 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 55200265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55200301 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55200405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55200411 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55200663 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 55200729 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55200732 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55200814 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 55200880 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 55201180 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 55201640 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 55201648 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 55202010 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55202016 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 55202030 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55202119 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 55202562 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55202566 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55203831 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55204269 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 55204304 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 55204325 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55204332 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55204350 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55204371 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55204454 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55205146 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 55205196 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 55205240 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 55205328 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 55205357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55205377 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 55205421 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 55205430 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 55205498 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 55205523 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 55205624 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55205834 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 55205914 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 55206000 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 55206012 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 55206233 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55206480 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 55206500 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 55206554 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 55206567 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 55206764 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 55206778 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55206792 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 55206868 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 55206890 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 55207633 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 55207684 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 55207792 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 55207827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55207857 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 55207874 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 55207975 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 55208060 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55208363 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 55208389 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55208430 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55208515 T C Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 55208526 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55208534 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55208744 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55208787 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 55208843 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 55208875 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 55208952 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 55209051 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 55209474 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 55209897 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 55210036 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 55210110 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 55210119 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 55210170 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 55210196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55210458 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 55210585 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55210709 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 55210786 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 55211424 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55211494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55211762 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55211788 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55211873 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55211988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55212034 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55212099 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55212103 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55212131 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55212279 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55212359 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55212591 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 19 55212682 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55212716 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55213006 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 55213087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55213089 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 55213101 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 55213122 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55213128 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 55213249 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55213291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55213293 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55213326 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55213342 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55214301 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55214369 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 55214489 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 55214730 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55215352 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55215396 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 55216495 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 55217420 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55218035 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 55218242 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 55218352 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 55220164 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55221843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55221932 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55222096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55222317 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 55222365 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 55223199 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 55223265 G A N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 5 11 2 1 5 19 55223284 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 55223500 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 19 55223543 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 19 55223599 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 19 55223898 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 55223979 A G N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 13 7 6 1 3 19 55225130 C T N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 19 55225521 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 55225819 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55225961 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 55226353 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55226516 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55226684 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 55226887 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 55227312 T A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 19 55227341 G A Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 19 55227546 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55227649 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55227921 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 55228055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55228151 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 55228294 T C N Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 5 5 2 1 2 19 55228563 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55228606 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55228613 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 55228950 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55229019 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55229101 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 55229127 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 55229142 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 55229169 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 55229180 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 55229183 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 55229224 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 55229290 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 55229465 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55229486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55229507 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55229509 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 55229866 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 55229890 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 55230152 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55230347 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55230464 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55230500 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 55230544 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 55230556 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 55230598 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 55230611 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 55230909 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 55230939 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 55231147 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 55231179 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55231205 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55231414 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55232280 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 55232286 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 55232313 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 55232361 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 55232371 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 55232497 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 55232658 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 55233247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55233375 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55234295 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55234316 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 55234389 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 55234852 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55234991 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55235063 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55235256 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 55235442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55235705 T A Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 55236132 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55236614 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 55236713 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 55236943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55236983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55237317 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55237612 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55237693 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55239050 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55239136 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 55240197 A T Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 55240200 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55240501 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 55240719 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 55240727 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55240745 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 55240806 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 55240826 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 55240836 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55240880 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55240906 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 55240918 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 55240944 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 55241112 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 55241166 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55241368 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55241372 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55241397 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55241707 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 55241759 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 55241775 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 55241924 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 55241992 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 55242136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55242280 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 55242324 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55242438 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55242753 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 55242768 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55242787 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 55242826 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 55242927 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 55243000 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 55243043 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55243073 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 55243163 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 55243168 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 55243356 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 55243516 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 55243571 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55243604 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 55243612 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 55243621 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 55243659 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55243660 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 55243707 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 55243829 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55243926 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 55244104 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 55244451 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 55244453 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 55244499 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 55244536 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 55244571 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55244633 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 55244646 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 55244679 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 55244979 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 55245000 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 55245033 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 55245219 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 55245327 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 55245386 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 55245389 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 55245489 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 55245505 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55245876 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55245929 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 55245933 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 55246129 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 55246250 A C Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55246451 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 55246470 T A Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 55246608 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 55246880 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 55246952 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55246959 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55247087 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55247093 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55247148 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55247149 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 55247228 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 55247242 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55247287 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55247298 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55247395 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 55247409 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 55247443 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55247508 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55247524 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55247542 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 55247631 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55247666 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55247835 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 55247846 T A Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 55247881 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55247888 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55247913 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 55247987 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55248099 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 55248947 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 55248948 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 55249103 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 55249374 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55249581 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55249642 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 55249663 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55249674 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55249726 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55249730 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 55250053 G A Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 55250079 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 55250311 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 55250318 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 55250758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55251622 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55251998 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55252042 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55252351 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 55252520 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55252584 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 55253986 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 55254388 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55254554 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 55254693 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 55254784 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 19 55255301 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 55255423 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 55255431 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55255619 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 55255622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55255847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55256267 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 55256391 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55256567 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 55256574 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 55256599 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55256715 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 55256836 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 55256857 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55256868 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55256989 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55257789 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 55257804 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55257979 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55258087 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55258749 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 55258820 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55258839 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 55258935 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55259222 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 55259476 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 55259483 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55259497 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55259502 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 55259588 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 55259613 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55259747 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55259795 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 55259826 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55259864 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55259891 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55259998 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 55259999 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55260031 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 55260110 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 55260359 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55260398 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 55260521 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 55260608 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 55260609 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 55260672 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 55260726 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55260752 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 55260808 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 55260815 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 55260817 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 55260829 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55260856 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 55260860 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 55260994 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 55261194 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55261544 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 55261546 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 55261828 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 55261934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55261965 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55262208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55262244 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55262268 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55262275 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55262437 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55262444 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55262456 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55262518 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55262617 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 55262649 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 55262686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55262785 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55263346 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55263594 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55263724 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 55263997 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55264072 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 55264088 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55264372 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55264378 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55264443 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55264456 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55264577 A T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55264621 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55264945 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 55265428 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55265611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55265635 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55265639 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55265765 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55265792 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55265793 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55266056 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 55266146 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 55267333 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 55267437 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 55267438 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 55267500 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55267615 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 55267945 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55267952 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55268038 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 55268080 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 55268155 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 55268201 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55268229 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 55268381 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 55268433 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 55268454 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 55268485 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 55268489 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 55268628 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55268683 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55268923 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55268991 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 55269075 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55269447 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55269520 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 55269828 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 55269852 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 55270070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55270137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55270361 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55270580 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 55271001 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55271332 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 55272074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55273390 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55273425 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 55273480 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55273497 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 55273846 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55274979 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55276191 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 55276297 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 55276631 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 55276686 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55276703 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 55276707 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55276942 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55277198 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 55277344 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 55277347 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 55277384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55277517 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 55277699 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 55278373 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55278374 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55278485 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 55278550 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55278573 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55278613 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55278688 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 55278765 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55279043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55279175 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55279320 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55279418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55279631 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 55279797 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55279909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55279972 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 55279986 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 55280005 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55280560 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55280881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55280940 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 55280971 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 55280989 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 55280990 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 55281083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55281116 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55281275 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55281350 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55281500 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 55281608 G A N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 19 55282151 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 55282273 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 55282315 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 55282741 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 55282930 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55282933 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 55283308 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 55283344 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 55283459 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55283617 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55283752 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 55283756 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 55283763 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55283859 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55284259 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 55284267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55284521 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 55284535 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55284552 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55284942 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 55284945 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 55284950 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 55284982 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 55284987 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 55285291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55285374 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 55287118 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55287144 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55288078 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55288907 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 55289818 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55289831 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 55289832 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 55289945 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 19 55290435 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55290470 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 55290474 C A Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 55290552 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 55291558 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 55291617 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55293000 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 55293038 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 55293130 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55293177 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 55293405 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 55293615 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 55293621 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 55293751 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 55293765 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55293800 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 55293811 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 55293900 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 55293920 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 55293961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55294010 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 55294138 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55294155 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 19 55294156 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 55294549 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 55294552 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 55294615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55294662 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 55294774 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55295028 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55295267 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55295307 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 55295587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55295654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55295720 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 55295756 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 55295918 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 55295919 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 55296550 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 55296645 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55296672 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55296705 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 55296808 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 55296859 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55297058 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 55297122 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 55297174 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 55297517 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55297653 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 55297667 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 55297670 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 55297678 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 55297691 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 55297736 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 55297973 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 55298043 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 55298149 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55298282 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 55298328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55298330 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55298396 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 55298487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55298547 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55298550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55298943 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 55299344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55299411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55299700 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55299705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55299781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55299875 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 55299877 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 55300425 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 55300565 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 55300587 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 55301299 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55301368 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55301410 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55301448 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55301618 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 55301748 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 55301750 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 55301754 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 55301773 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55302023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55302170 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 55302294 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 55302295 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 55302567 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 55302585 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 55302626 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 55302878 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 55303738 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 55303776 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 55303777 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 55304051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55304266 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 55305886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55307655 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 55308016 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55308234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55308261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55308282 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 55308367 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 55308485 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55308535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55308568 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55308602 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55308692 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55308748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55309342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55309371 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 55309388 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55309428 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55309565 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55309650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55310437 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55310445 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 55311030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55311142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55311395 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55311432 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 55311581 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 55311582 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 55311636 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 55311658 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 55312052 G A N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 19 55312205 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 55312244 G C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 55312249 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 55312253 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 55312400 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55312402 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 55312612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55312700 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 55313041 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55313464 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 55313488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55314152 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55314309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55314411 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55314483 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55314519 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55314577 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55315222 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55316134 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55317428 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 55319927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55320541 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55320623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55321865 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55323820 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55324151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55324750 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55324943 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55325314 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55325348 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 55325499 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 55325535 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 55325673 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55325685 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 55326191 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 55326803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55327058 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55327281 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55327539 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 55327634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55328578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55329151 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55329589 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 55330876 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 55337228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55339052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55339053 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55340094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55340502 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55343655 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 55345049 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 55347520 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55348567 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 55348575 G A N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 19 55348576 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 55348906 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 55349062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55349959 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55350768 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55352845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55353037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55353577 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 55353920 C T Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 55354660 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 55355049 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 55355134 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 55355415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55356401 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55356428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55357997 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55358310 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 55359660 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55361008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55364872 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 55365005 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 55365204 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55366256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55368369 T C Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 55368927 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55369299 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 55371397 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 55371450 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55371671 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55371680 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 55372252 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55373974 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55376357 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 55376684 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55377804 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55377861 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 55378647 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 55379449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55379482 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55380046 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55380082 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 55381969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55381987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55384456 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55385202 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55385730 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 55385842 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55385997 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55386010 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 55386166 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55386352 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 55386902 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 55387055 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 55387128 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55387654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55388655 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55389249 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55389718 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55390315 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 55390432 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 55391909 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 55391999 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 55392038 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 55392058 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 55392104 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 55392312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55392497 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55392777 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 55392795 T G N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 19 55392981 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55393047 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55393408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55393668 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 55393669 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55393937 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55394013 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 55394952 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55395035 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 55395102 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 55395267 T C N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 19 55395362 G T Y N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.181818181818182 0.454545454545455 0.363636363636364 9 13 2 5 4 19 55395542 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 55395615 T A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 19 55395640 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55395749 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55396152 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 55396160 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 55396229 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55396573 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55397098 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 55397163 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 55397302 G A Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 19 55397329 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 55397356 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55397392 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 55397512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55397634 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55398113 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 55398395 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55398652 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55398722 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55398747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55398755 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55398807 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 55398932 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55398937 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 55399010 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55399228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55399607 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 55399610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55399678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55399712 A C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 19 55400201 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 55400338 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 55400518 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 55400562 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 55400591 A C Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 55400620 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 55400929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55400943 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 55401035 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55401315 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55401329 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55401384 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 55401713 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 55401787 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 55401866 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 55401929 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 55402126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55402220 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55402257 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 55402305 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55402328 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55402349 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55402398 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55403142 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 55403155 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55403652 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 55403770 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 55403870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55406002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55406270 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55406294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55406557 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55406609 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 55406742 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55407417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55408068 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 55409249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55409368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55409659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55411378 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 55411412 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 55411995 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55412114 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55413266 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 55414876 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 55415357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55415966 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55416215 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55423476 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55425032 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55427656 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55428357 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55428737 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55429598 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55430477 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 55432907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55434083 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 55434431 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55434518 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 55435239 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 55435295 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55439188 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 55439425 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 55439925 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 55439966 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 55440006 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55440171 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55441370 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55441526 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55445304 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55445347 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 55445561 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 55445902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55446145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55447633 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55447854 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55462229 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55465454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55466357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55468053 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55469347 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 55471441 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55473243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55473946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55474851 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 55474858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55475230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55477302 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 55477468 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55477478 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 55477657 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 55477716 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 55477767 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55477855 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55478062 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 55478490 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55479130 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 55479309 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55479598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55484341 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55488109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55488730 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55491027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55492082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55492620 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55494781 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55495092 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 55495547 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55498183 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55498532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55499502 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 55499503 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 55499916 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55500178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55500233 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55500346 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 55500941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55501247 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55501249 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 55501357 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 55502012 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55502321 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55502325 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55502339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55505582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55505583 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55505636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55505787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55506045 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55506063 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55506172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55506203 A T Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 55506438 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55506677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55506751 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 55507278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55507302 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55507430 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55508758 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55508805 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55509145 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55510507 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55510868 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 55512517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55512928 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55514258 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55517722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55521196 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 55521874 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 55522569 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55522614 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 55523650 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55524174 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55524183 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55524923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55525062 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55525259 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 55525284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55526141 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55526739 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 55526796 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55526865 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55526868 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 55526950 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55527446 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55527485 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 55527782 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 55528180 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 55528530 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55528719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55528999 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 55529140 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55530845 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 55530904 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 55530929 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 55530977 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 55531008 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 55531144 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 55531365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55532124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55532130 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55532209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55532275 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55532351 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55532912 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 55533040 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55533266 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 55533274 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55533323 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 55533793 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 19 55533858 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 55533948 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 19 55533954 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 55534031 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 55534084 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 55534096 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 55534106 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 55534125 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55534130 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 55534145 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 55534208 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 55534228 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 55534233 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 55534291 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 55534303 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55534353 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 55534357 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 55534405 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55534483 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 55534515 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55534554 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55534635 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 55534637 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 55534666 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 55534829 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55534832 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55535028 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 55535304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55535851 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 55535860 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 55536574 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55536689 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55537606 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55537720 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 55538392 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 55538909 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 55539229 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55539514 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55539527 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55539606 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55539645 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55539953 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55539963 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55539976 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55540017 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55540142 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55540143 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55540182 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 55540289 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 55540337 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55540340 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55540382 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55540477 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55540585 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 55540723 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 55540763 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55540896 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55542213 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 55542573 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 55542890 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55542934 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55543148 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55543439 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55543442 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55543839 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55543966 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 55544153 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55544368 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55544608 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55544657 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 55544677 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 55545205 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55545440 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 55545441 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55545915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55545923 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55545958 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 55545987 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 55546124 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 55546152 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55546300 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55546431 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55546500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55546558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55546585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55547158 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55547404 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55547538 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 55548047 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55548206 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55548216 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 55548480 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 55549883 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 55549884 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 19 55549889 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55550165 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 55550209 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 55550268 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 55550407 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55550414 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55550428 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 55550444 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 55550446 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 55550480 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55550752 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 55550836 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 55550975 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 55552667 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 55552814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55552905 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55553461 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 55553469 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55554891 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 55554903 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 55555056 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 55555197 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 55556899 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55557246 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 55558535 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55559566 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 55559577 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55559731 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 55559816 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 55559998 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 19 55560377 A G Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 55560382 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 55560679 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 55560818 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 55560830 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 55560898 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55561401 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 55561730 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 55561970 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 55562018 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55562020 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 55562307 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55562322 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55562463 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 55562500 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55562524 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55562577 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55562589 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55562828 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 55563180 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 55563557 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 55563567 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 55563593 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 55563618 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 55563822 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 55563826 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 55563961 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 55564000 A T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 19 55564037 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55564061 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55564125 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 55564378 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 55564391 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55564701 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 55564736 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 55564741 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 55564898 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 55564967 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 55564990 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 19 55564996 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 19 55565085 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 19 55565144 T C N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.307692307692308 0.615384615384615 0.0769230769230769 16 10 4 8 1 19 55565173 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 55565363 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55565364 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55565387 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 55565388 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55565779 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 55565783 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55565914 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55565923 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55566170 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 55566364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55566728 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 55566963 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55567177 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 55567207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55567309 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 55567334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55567401 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55567457 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55567568 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 55567780 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55567833 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 55568358 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 55568429 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 55568435 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 55568532 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55568545 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55568586 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 55568599 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 55568665 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 55568694 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55568817 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55568901 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 55568984 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 55568998 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 55569506 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55569647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55569695 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55570619 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 55570730 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55570925 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55571014 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55572044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55573413 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55573918 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55574511 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 55574750 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 55574767 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 55574825 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 55574895 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 55574896 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 55575789 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55575834 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 55576141 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 55576248 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 55576464 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55576616 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 55576978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55577000 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55577440 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55577446 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55577596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55578275 G A N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 19 55578857 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 55579064 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 55579353 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 55579361 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55579426 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55579428 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 55579504 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55579530 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 55579536 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 55579666 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 55579740 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55580011 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 55580025 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 55580290 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55580338 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 55580575 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 55581631 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55582435 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 55582801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55585214 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 19 55585396 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 55586277 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55586412 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55586757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55587490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55587505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55587614 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55587671 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 55587702 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 55587725 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55587786 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55587804 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55588236 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55588319 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 55588335 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 55588385 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55588495 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55588773 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 55588944 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55589124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55589236 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 55589237 T C Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 55590534 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55590721 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55590841 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 55591361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55591513 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55591655 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 55591926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55592560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55593163 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 55593756 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 55593842 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 55593863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55594223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55596132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55596330 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55598061 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55599493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55599668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55601780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55602229 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55602507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55602608 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55604907 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55604973 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55605052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55605222 C G Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 55605608 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55605612 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 55605692 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55606379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55606660 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 55606706 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 55606752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55606756 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 55606805 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 55606824 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55606827 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55607024 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55607412 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 55607625 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 55607651 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 55607730 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 55608148 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55608171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55608208 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 55608228 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 55608229 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 55608898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55608905 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55608972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55609075 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55609169 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55609305 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 55609330 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 19 55609534 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 55609585 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55609613 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 55609643 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 55609774 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 55609819 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 55609862 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 55609863 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 55609870 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 55609997 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 55610049 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55610060 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55610296 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 55610395 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55610499 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55610510 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 55610545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55610567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55610607 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55610683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55610742 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55611297 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 55611355 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 55611362 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 55611363 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 55611528 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 55611592 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 55611744 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 55612026 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55612053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55612158 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 55612203 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 55612391 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55612469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55612479 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55612708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55613358 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 55613378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55613526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55613603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55613651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55613660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55613712 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 55613874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55615192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55615245 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 55615301 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 55615427 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 55615482 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 55615564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55616084 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 55617633 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55619009 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55620165 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55620167 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55620707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55620775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55621533 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55621860 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55621919 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 55622534 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55622559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55622772 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 55623103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55623221 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55623615 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 55624452 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 55625084 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 55625207 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55625593 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 55625621 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 55625696 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 55625725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55625791 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55625870 A C Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 55625880 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55625895 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55626221 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55626234 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55626998 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 55627129 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55628795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55629644 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 55630798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55630852 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55632362 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55634222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55634317 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 55635841 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55636014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55636147 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55636526 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55636707 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 55638007 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55638763 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 55639774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55641245 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55641366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55641621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55641698 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55641739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55641991 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 55642686 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55643022 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 55644527 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 55644783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55644940 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 55646090 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55646188 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 55646569 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 55647261 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 55648503 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55648596 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 55648703 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 55648948 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55650825 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55650915 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 55651783 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55654853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55655383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55659214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55661158 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 55661235 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55662282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55662502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55662528 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 55662569 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55663187 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 55663206 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 55663272 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 55663548 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 55664117 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 55664125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55665493 C T N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.272727272727273 0.181818181818182 0.545454545454545 8 14 3 2 6 19 55665622 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 55665638 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 55665653 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 55665936 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55666083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55666426 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 55666428 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 55666820 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 55666869 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 55667094 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 55667322 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 55667399 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 55667452 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55667472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55667734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55667950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55669647 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 55670725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55674461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55675403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55675526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55675633 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55676042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55676135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55676245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55676557 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55676747 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 55676822 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 19 55676981 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 55677102 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 55677246 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 55677275 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55677343 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 55677417 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 55677437 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 55677466 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 55677621 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55677624 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 55677753 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 55677869 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 55677899 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 55677903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55678035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55678433 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 55679032 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 55679789 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 55679849 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 55679876 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 55679884 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 55679899 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 55680294 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 55680403 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 55680414 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 55680486 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 55680760 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 55680764 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 55683034 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55683480 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 55683933 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 55684001 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55684047 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 55684171 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55684545 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55684718 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 55684844 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55684900 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 55684927 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55684955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55684979 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55684981 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55685018 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55685068 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55685206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55685823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55686298 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55686323 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 55686740 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 55687069 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55687229 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55687458 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55687556 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 55688373 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55688515 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55688767 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55688924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55689218 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 55689257 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 55689259 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 55689390 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 55689467 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55689801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55690076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55690272 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 55690307 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 55690962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55691095 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55691544 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 55691640 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 55692068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55692206 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55692490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55692494 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 55692521 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 55692583 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 55693320 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55694781 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 55694933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55695918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55696019 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55696224 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55696910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55697230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55697744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55697837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55697870 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 55697871 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 55697954 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55697998 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 55698072 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 55698263 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 55698293 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 55698497 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 55698793 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 55698826 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55699180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55702575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55702587 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 55702927 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55704307 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55704908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55705969 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 55708950 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 55709583 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55709883 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55710305 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 55710486 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 55710727 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55711745 G C N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 19 55712009 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 55712178 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55712300 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 55712316 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 55712338 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 55712380 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55713039 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55713094 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55713198 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55713224 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55713295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55713721 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55714059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55714741 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55715081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55716825 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55718708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55718832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55718845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55719709 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 55719720 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 55719966 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 19 55719976 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55719979 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55720046 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 55720237 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 55720286 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 55720305 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55720910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55721313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55721484 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55721497 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55721578 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 55721785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55721890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55722213 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55722348 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55722605 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55722823 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55722909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55723274 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 55723487 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55724359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55724920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55725089 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55725494 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55727609 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55727974 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 55727985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55728025 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 55728037 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55728703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55729247 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 55729365 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 55729407 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55730485 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55731106 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55732521 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55733196 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55733201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55734135 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 55734138 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 55734139 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 55734973 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 55735010 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55735260 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 55735569 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 55735788 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55735851 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55736308 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 55736383 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.611111111111111 0.111111111111111 0.277777777777778 24 12 11 2 5 19 55736543 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55736783 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55736799 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 55737502 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55738275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55738554 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55738578 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 55738580 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 55738582 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 55738606 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 55738788 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 55738821 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 55738825 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 55739573 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 55739741 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55740249 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55741737 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 55741806 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 55742329 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55742883 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55743101 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55743126 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55743135 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55743203 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55743239 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55743433 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55743698 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55744795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55744931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55744943 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55745404 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55745751 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55746364 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55748817 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 55748940 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55748970 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 55749515 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55749731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55750269 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55750969 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55751353 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55751356 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55751471 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55751536 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55751637 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55752241 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 55752616 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55752842 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 55753132 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 55753156 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 55753428 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 55753734 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 55753771 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 55753877 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55755008 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55755343 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 55755349 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55755488 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 55755780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55755789 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55755841 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 55755887 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 55756031 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 55756057 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 55756067 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55756179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55756283 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55757178 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 55757750 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 55757922 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 55757952 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 55758057 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 55758129 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55758143 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55758640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55758756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55759289 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 55759401 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 55759517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55759678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55759682 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55759684 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55759702 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55759939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55759943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55760127 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55760492 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 55760925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55761025 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 55761634 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55761917 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 55762630 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 55762631 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55762761 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55763186 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 55763265 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 55763523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55763624 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 55763625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55763812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55763850 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55763913 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55763946 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 55764079 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55764139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55764429 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 55764630 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 55764636 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 19 55764643 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55764871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55765229 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 55765307 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55766158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55766429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55766488 T G Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 55766537 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55766842 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 55766984 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55766992 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 55767058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55767596 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 55767621 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 55767646 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 55767932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55767944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55768148 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 55768318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55768520 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55768927 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55768962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55769030 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55769161 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55771098 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 55772445 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55772565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55772685 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55772859 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55772862 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55773463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55773486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55773841 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55774112 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55774917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55774918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55775102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55776658 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 55777176 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55777610 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55777710 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55778447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55778477 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 55778508 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 55778581 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55778772 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55778791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55779800 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 55779886 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55780027 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 55780047 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 55780074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55780217 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55780478 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 55780634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55780635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55780644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55780683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55781035 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 55781084 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 55781099 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 55781144 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 55781238 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 55781420 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 55781450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55781468 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55781469 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 55781714 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 55781721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55781849 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 55782312 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55782448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55782475 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 55782482 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 55782574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55782854 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 55782940 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55783360 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55783411 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 55783427 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55783891 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 55783921 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 55784286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55784424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55784452 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 55784957 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55785033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55785057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55785266 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55785437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55785599 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 55786063 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55786573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55788525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55788568 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55788742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55789026 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55789037 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55789136 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55789190 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55789209 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55789228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55789374 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55789657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55789677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55789797 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 55789922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55789931 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55789940 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55789950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55790088 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 55790256 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55791022 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55791099 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55791244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55791621 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55791636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55791686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55791691 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55791845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55792001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55792003 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55792007 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55792021 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 55792071 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 55792356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55792373 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 55792426 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 55792669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55792697 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 55792797 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55793027 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 55795258 T G N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 19 55795267 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 55795307 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 55795481 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 19 55795523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55795680 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55795682 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 55795699 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 19 55795923 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55795941 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 55796308 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 55796510 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55797095 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 55797192 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55797313 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 55797316 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 55797462 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 55797469 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 55797858 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 55797860 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 55798282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55799648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55800047 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 55800521 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 55800525 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 19 55800526 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55800658 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55800741 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 55800742 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 55800978 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 55801007 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 19 55801019 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 55801086 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 55801107 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 55801119 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 55801130 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 55801318 A T N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 19 55801319 T G N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 19 55801355 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 55801503 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 55801753 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 55802164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55802205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55803332 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55804707 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55805586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55806589 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55806592 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55806629 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 55806701 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55806968 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55806973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55807061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55807412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55807884 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 55808014 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 55808156 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 55808292 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 55808293 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 55808317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55808552 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55809086 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 55809235 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55809308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55809335 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 55810428 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 19 55811009 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55811933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55812397 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 55812510 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 55812557 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 55812738 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 55813049 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 55813070 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 55813081 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 55813082 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 55813102 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 55813530 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 55813780 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 55814472 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55819016 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55819224 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 55821427 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55823423 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55826178 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55829467 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55830297 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 55833713 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 55833717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55834386 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 55834392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55834485 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 55834570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55834944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55835114 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55835124 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55835705 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55836074 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55836148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55836501 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55836503 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 55836879 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55836886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55837031 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 55837508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55837976 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 55839303 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 55841064 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 55841220 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 55841518 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 55841716 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 55842002 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 55842875 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 55843295 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 55843438 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 55844009 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 55844408 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 55844431 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55846399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55847102 A C N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 19 55847334 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 55847782 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55847861 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 55848412 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55848954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55849347 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 55850066 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 55850118 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 55850137 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 55850249 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 55850265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55850958 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 55851321 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 55851333 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 55851690 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 55851694 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 55851739 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 55851775 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 55851894 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 55851993 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 55852209 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 55852237 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 55852432 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 55852654 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 55853099 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 55853139 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 55853687 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 55854521 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 55854740 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 55854821 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 55855087 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 55855131 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 55855132 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 55855239 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 55855383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55855531 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 55855691 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 55855722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55856338 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 55856399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55856547 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 55856854 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 55856878 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 55856904 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 55856922 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 55857352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55857660 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55857690 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 55857999 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 55858124 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55858215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55858654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55858726 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 55859035 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 55859160 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 55859212 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 55859253 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 55859303 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 55859370 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 55859407 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 55859415 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 55859666 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 55860585 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 55860974 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 55861189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55861317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55861340 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55861748 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55862083 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 19 55862307 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 55862378 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55862600 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 55863595 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 55863639 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 55863665 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 55863729 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55863789 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55863858 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 55864125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55864872 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55865687 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 55865900 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 55866613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55867341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55867365 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 55867721 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55869398 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 19 55870373 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 55870550 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 55870612 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 55870786 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 55870910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55871460 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 55871549 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 55871763 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55871823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55871865 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 55871895 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 55871935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55872300 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 55872306 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 55872619 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 55873534 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 55873602 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 55873824 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 55873841 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 55873861 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 55873862 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 55874144 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 55874192 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 55874423 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 55874556 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 55874578 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 55875278 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55875618 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 55875735 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 19 55875986 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 55875993 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 19 55876049 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 55876054 G C Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 55876210 A G Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 55876229 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 55876233 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55876258 T G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 55876262 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 55876274 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 55876317 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 55876336 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 55876365 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 55876416 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 55876538 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 55876675 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 55876721 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 55876733 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 55877017 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 55877283 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 55877540 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 55877571 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 55877739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55877745 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 55878276 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55878334 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 55878515 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 55879624 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 55879725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55879918 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 55880674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55880949 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 55881039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55882416 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55882439 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55883640 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55883819 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55884022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55884515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55884743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55886401 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 55887353 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 55887376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55887379 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55887446 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55887493 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 55887829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55887876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55888165 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 55888476 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 19 55888672 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 55888706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55888920 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55889407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55889497 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55890070 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55890344 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 55890381 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 55890496 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 55890545 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 55890661 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 55890664 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 55890731 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 55890965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55891088 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 55891154 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 55891202 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 55891350 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55891572 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55891578 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 55891600 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 55891708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55891831 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 55892004 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55892355 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 55892370 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55892392 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55892510 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 55892572 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55892676 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55892734 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55892742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55892805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55892897 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 55893001 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55893307 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 55893659 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55893893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55894180 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55894435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55894451 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55894582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55894626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55894717 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55894739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55894912 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55894998 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55895020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55895048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55895259 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55895623 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 55895752 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 55895851 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55895893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55896028 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55896419 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 19 55897180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55897218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55897515 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55898195 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55898297 A C Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 19 55898590 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 55898705 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55898714 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55898774 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55898868 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55898978 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55899557 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55900008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55900226 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55900307 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 55900314 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 55900805 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55900820 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55900864 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55900875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55900994 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55901063 T A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 55901153 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55901458 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55901465 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55902048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55902945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55903428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55904578 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 55904734 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 55904836 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 55904992 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55905239 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 55905455 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 55907306 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 55907307 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 55907324 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 55907328 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 55908199 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55908382 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 55908648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55909349 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 19 55909691 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 55909810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55910765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55911052 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55911144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55913091 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55914913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55914984 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55915204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55915493 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 55916430 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55916693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55918062 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 55918598 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55918635 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 55918686 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55918783 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 55918934 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55918965 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 19 55918976 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55920125 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 22 14 10 2 6 19 55920160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55920352 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55920638 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55920727 C A Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 55920847 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 55921922 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 55923013 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 55923050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55923100 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 55923559 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 55924996 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55925606 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 55926057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55926703 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 55927067 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 55927172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55927248 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 55927685 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 55928232 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 55928773 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 55928845 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 55928878 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 19 55928945 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 19 55929110 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55929358 G T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 55929405 G C Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 55929410 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 55929659 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 55929955 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 55930040 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55930055 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 55930140 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 55930216 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 55930327 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 55930406 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55930478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55931557 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55931585 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 55931692 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 19 55932692 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 55932984 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55934173 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 55934393 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 55934685 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 55934833 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 55935110 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55935375 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 55935383 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 55935562 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 55935750 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 55935809 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 55936054 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 55936154 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 55936349 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 55936384 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 55936438 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 55936522 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 55936531 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 55936591 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 55936609 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 55936648 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 55936972 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 55937096 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 55937200 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 55937215 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 55937436 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 55937539 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55937671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55938081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55938082 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55938235 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55938940 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55939111 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55939550 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 55940149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55940236 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55940582 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55940639 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55940647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55940718 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55940764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55940851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55941038 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55941215 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 55941336 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 55941572 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55941833 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 55942070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55942087 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 19 55942110 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55942457 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 55942505 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 55942535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55942591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55942659 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 55942688 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 55943569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55943705 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55944068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55944884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55945991 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55946438 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 55946439 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 55946446 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 55947115 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 55947135 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 55947360 A T N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 19 55950661 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55950685 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 55950785 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55950798 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 55950958 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55952749 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 55952982 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55953145 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 55953834 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 55954387 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 55955318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55955491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55955728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55955764 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55955931 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 55956272 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55956651 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55957037 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 55958080 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 55958094 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 55958436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55959965 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 55960069 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55961798 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 55961862 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 55963726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55963930 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 19 55963931 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 55964219 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55964226 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 55964420 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 55964445 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 55964480 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 55964530 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 55965200 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55966105 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 55966574 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55967075 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 55967151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55974817 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 55975015 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55975368 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55975434 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 55976745 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55978833 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 55978953 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55979497 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 55979895 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55979995 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 55980003 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 55980103 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 55980119 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 55982695 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 55983985 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 55984088 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 55984170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55984382 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55984646 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55985112 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 55985367 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55985405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55985952 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 55986306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55986435 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 55987160 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55987894 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 55988584 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 55993459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 55994523 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 55994975 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 55995159 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 55995800 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 55995906 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 55999182 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56001390 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56001575 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56003106 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 56003414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56003622 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56004287 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 56004754 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56008595 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 19 56009170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56009364 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 56009370 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56009595 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56009607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56009722 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 56009745 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 56010003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56010120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56010121 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 56010773 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 56017305 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 56017357 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56019164 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 56019643 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 56020332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56020823 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56021301 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 56021635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56022100 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56022200 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56022751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56023194 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56023659 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56024246 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56024288 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56025095 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 56025608 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56030490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56033094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56038181 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56038277 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56039401 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56040097 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56040224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56041176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56041446 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56041746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56041866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56041919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56042346 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56043069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56043522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56043657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56045221 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56046550 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56047692 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56047705 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 56047706 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 56048043 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 56048502 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 56048588 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56048962 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56049315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56049381 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56049511 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56049512 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56049529 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56049532 A C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 56049687 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56050060 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56050310 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 56050364 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56050592 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56050624 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56050734 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56051211 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56058467 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56058623 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56058627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56058656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56058665 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56058694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56058787 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56058805 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56059041 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56059789 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 56061395 T C N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.8 0 0.2 16 4 8 0 2 19 56061442 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.8125 0 0.1875 26 6 13 0 3 19 56062189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56062191 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56062320 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56063120 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 56063235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56063300 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 56063519 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 56063565 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56063587 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 56063609 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 56063631 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56063645 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 56063781 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56063808 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56063846 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56063949 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56064116 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 56064124 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 56064239 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 56064241 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 56064253 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56064269 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 56064310 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56064382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56064439 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56064479 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56064552 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 56064558 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 56064976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56065011 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 56065489 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56068095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56068197 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56068854 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56069752 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 56070474 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 56070511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56070846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56070867 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 56071204 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 56072828 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56074503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56076451 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 56076518 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56076547 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 56076908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56076920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56076978 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56076994 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 56077016 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56077055 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 56077445 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 56077549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56077625 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 56077648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56077739 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 56077775 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 56078171 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 56078902 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 56079099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56079886 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 56079978 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56080480 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 56080609 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56080710 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56080788 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56081027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56081090 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56081673 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56081791 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56082736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56083033 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 56083383 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 56084505 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 56084519 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56084926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56086418 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56086458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56087154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56087338 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 56087359 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 56088514 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56088701 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56089429 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 56089475 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 56089517 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 56089642 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56089833 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 56089868 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 56090038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56090788 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56090934 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 56090961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56091025 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56091049 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 56092661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56092813 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 56093759 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 56093764 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56094198 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 56095194 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 56095227 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56095244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56096434 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 56096481 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 56096547 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 56096849 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56097434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56097729 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 56097876 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56097939 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56098051 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56098068 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56098070 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56098214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56098309 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56098329 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56098420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56098440 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56098473 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 56098548 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 56098557 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56098561 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56098679 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56098699 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56098777 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56098860 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 56098946 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 56098950 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 56099027 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 56099079 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56099113 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 56099322 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 56099333 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56099575 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56099582 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56099622 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56099727 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 56099750 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 56099780 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56099896 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 56099936 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 56100012 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56100021 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 56100136 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 19 56100193 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 56100474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56100640 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 56100694 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 56100737 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 56100765 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 56100774 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 19 56100775 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 56100984 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 56101110 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 56101238 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 56101251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56101281 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 56101352 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 56101362 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56101376 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 56101411 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 56101432 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 56101445 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 56101453 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56101455 G T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 56101494 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 56101531 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 56101535 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 56101603 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 56101676 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 19 56101688 T G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 19 56101692 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 19 56101885 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 56101910 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 56101975 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56102036 G A N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 19 56102142 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 56102163 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 56102416 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 56102604 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 56102671 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 56102707 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 56102708 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 56102713 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 56102862 G T Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 56102900 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 56102997 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 56103062 T A Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 56103739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56107278 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56108503 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56108554 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 56109306 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56110810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56111100 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56111785 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 56112005 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56112029 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 19 56116133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56117930 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56120319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56121213 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56121590 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56121644 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56122080 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56122976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56123286 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56130948 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56130994 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56131261 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56132276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56132366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56133341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56134933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56135030 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56135045 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56135057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56135068 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56135101 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56135428 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56135462 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56135478 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56135488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56135717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56136022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56136051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56136235 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56136372 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56136390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56136461 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56136580 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 56136978 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56137051 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56137259 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56137306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56137312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56137580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56138086 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56138598 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56139050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56139358 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56139367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56139377 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56139580 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56139726 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56139776 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56139786 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56139925 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56140029 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56140081 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 56140489 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56140513 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56140680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56141008 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56141033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56141087 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56141109 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56141163 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 56141433 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 56141531 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56141559 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 56141616 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56141728 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56141889 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56142200 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 56142284 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56142448 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56142701 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56142754 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56142915 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56142934 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56142975 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56143146 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 56143170 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 56144020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56145147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56145189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56145301 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56145620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56145636 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 56146244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56146318 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56146324 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 56146470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56147060 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56147112 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 56147513 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 56147706 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56147754 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56147906 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56148252 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 56148432 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56148454 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56148511 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56148589 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56148615 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56149092 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56149142 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 56149143 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 56149239 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56149244 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56149248 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 56149393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56149517 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 56149565 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 56149594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56149847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56149849 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56149978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56150147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56150193 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56150257 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56150287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56150407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56150567 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 56151070 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 56151350 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56151432 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56151863 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 56152080 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 56152115 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 56152319 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 56152703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56153334 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56153859 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 56154071 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 56154309 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56154346 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 56154368 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 56155122 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 56155232 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56155400 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 56155553 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 56155586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56155587 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56155875 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56157246 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56157423 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56157605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56157675 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 56157705 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 56157984 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56158235 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56158260 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56158272 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56158310 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56158324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56158575 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56158617 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56158620 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56158663 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56158725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56159245 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56159503 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 56159729 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 56160189 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 56160242 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 56160496 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 56160506 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 56160641 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56160897 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 56161224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56163648 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 56163680 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 56163701 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56163991 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 56164136 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 56164151 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 56164237 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 56164238 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 56164466 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56164819 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 56164831 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 56165171 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 56165183 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 56166634 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 56166686 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 56166868 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 56166869 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 56166894 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 56167640 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 56167642 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56167728 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 56167736 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 56167773 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 56167774 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 56167799 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 56167920 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56167944 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56167949 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56167985 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 56167988 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 56168031 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56168067 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56168087 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 56168192 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 56168624 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56168690 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56168825 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56168937 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56168939 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56168961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56169217 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 56169245 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56169255 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 56169571 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56169914 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56170591 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56170903 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 56171434 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 56171478 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 56171943 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 56171952 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 56172465 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 56172492 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56173042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56173100 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 56173348 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 56173350 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 56174560 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 56174968 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 56175485 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 56175588 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56175742 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 56175785 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 56175814 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 56176233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56176320 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56176335 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56176872 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56177370 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 56177380 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 56177411 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56177703 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 56177725 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 56178072 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 56178135 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56178152 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56178253 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 56178387 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56178492 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 56178736 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 56178802 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56179169 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 56179197 T C Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 56179219 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 56180009 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 56180464 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 56180534 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 56180536 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 56181036 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56181384 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56181402 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 56181930 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56181967 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 56182038 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56182437 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56182576 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56182725 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 56182952 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 56183279 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56183472 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 56183755 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 56183804 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56183850 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56184021 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 56184040 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 56187271 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56187478 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56188658 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56188747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56189979 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56190095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56190530 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 19 56190615 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56190746 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56191315 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 56192698 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 56192922 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56193051 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 56193187 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 56193228 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56193430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56193581 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56193658 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 56193666 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56193671 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56193684 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56193738 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56193865 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 56193934 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 56194307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56194694 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 56194976 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 56195256 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56195260 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56195284 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 56195446 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56195642 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56195664 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 56195791 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 56195963 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 56195980 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 56196171 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 56196234 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56196280 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56196489 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56196618 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 56196871 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56196888 T C Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 56197380 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56197432 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 56197461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56197556 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 56197641 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56197797 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56197841 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 56198095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56198110 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 56198126 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56198211 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 56198262 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 56198414 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56198456 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 56198487 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 56199050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56199187 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56199563 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56199700 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56199733 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56200325 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 56200394 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 56200414 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56200442 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 56200479 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 56200918 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 56200928 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 56200934 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 56200944 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 56201005 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 56201006 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 56201029 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 56201034 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 56201196 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 56201353 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 19 56201465 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56201480 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56201575 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 56201688 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56201749 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56202020 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 56202091 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 56202115 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 56202279 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 56202280 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 56202321 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 56202377 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 56202405 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 56203787 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56203874 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56204258 A G Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 56204968 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56205257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56205426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56205725 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 56205984 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56205996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56206049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56206465 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 56206611 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 56206657 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 56207834 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56208083 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 56208484 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 56208562 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 56208690 T G Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 56208881 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56208962 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 56208992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56209005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56209103 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 56209152 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56209162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56209391 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 56209428 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 56209601 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56209879 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56210386 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56210453 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56210474 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56210575 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56210724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56210990 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56211769 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 56212449 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 56212493 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56212618 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56212729 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56212738 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56212908 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56213207 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 56213273 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56214096 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 56214198 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 56214266 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56214268 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56214324 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56214511 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 56214578 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56214998 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 56215062 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 56215348 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 56215456 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 56215792 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 56215800 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 56215937 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 56215939 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 56215948 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 56215980 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 56216226 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 56216252 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 56216402 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 56216418 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 56216428 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 56216431 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56216455 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 56216614 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56216616 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 56216621 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 56216634 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 56216719 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 56216752 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 56216991 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56217080 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 56217165 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 56217269 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 56217293 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 56217355 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56217370 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 56217394 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 56217522 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 56217530 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 56217535 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 56217556 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 56218305 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 56218336 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 56218450 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 56218549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56218738 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 56218813 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 56218843 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 56218857 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 56218890 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 56219082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56219190 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56219382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56219462 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56219467 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56219679 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 56219820 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56219891 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56220076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56221370 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56222504 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 56222619 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 56222625 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 56222626 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 56222654 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 56222878 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56222954 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 56223116 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56223215 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 56223737 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 56223785 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 56224521 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56224557 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56224620 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 56225695 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56225835 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56225836 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 56225867 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 56225978 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 56225989 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 56226000 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 56226076 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 56226228 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 56226511 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56226634 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 56226750 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 56226931 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 56226955 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 56227007 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56227008 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 56227019 C A Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 56227027 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56227081 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 56227753 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56227759 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 56228103 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56228953 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 56229081 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 56229431 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56229483 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56229629 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 56229633 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 56229800 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56229930 A G Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 56230114 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56230271 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56230655 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 56230802 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 56230814 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 56230819 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 56231142 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 56231216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56231229 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 56231257 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 56231258 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 56231503 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 56231787 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 56232212 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 56232327 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 56232390 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56232589 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56232594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56232652 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 56232799 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 56232971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56233042 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56233101 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 56233162 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 56233369 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56233456 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56233537 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56233768 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 56233831 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 56234036 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 56234097 A G Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 56234131 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 56234135 A T Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 56234252 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56234409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56234610 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 56234659 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56234722 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 56235017 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56235246 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56235292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56235399 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 56235416 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 56235420 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 56235452 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 56235743 G C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 19 56236627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56237169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56240249 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56240281 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56241335 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56241373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56241380 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56241673 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 56242029 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 56242126 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 56242127 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 56242312 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 56242467 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 56242664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56242693 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 56242822 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 56242948 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 56242970 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 56243095 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 56243102 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 56243234 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 56243332 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56243463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56243504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56243691 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 56243856 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 56243875 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 56243917 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 56243952 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 56244103 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 56244237 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 56244499 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56244668 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56244752 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 56244770 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 56244808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56244824 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 56245260 A C Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 56245346 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56245355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56245939 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56245971 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 56246002 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56246289 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 56246651 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 56247240 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 56247296 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56247372 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56247437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56247878 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 56248194 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 56248269 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 56248664 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56248665 C G Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 56248768 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 56248788 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56248811 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 56248902 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56248968 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 56249085 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 56249217 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 56249259 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 56249278 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56249288 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 56249347 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 56249554 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 56249593 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 56249843 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 56249845 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 56249929 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 56249938 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56250011 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 56250029 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 56250080 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 56250202 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 56250230 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 56250267 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 56250362 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 19 56250440 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 56250457 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 56250472 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 56250549 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 56250569 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 56250631 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56250636 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56250916 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 56250917 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 56251118 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 56251134 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 56251187 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 56251188 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 56251189 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 56251192 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56251299 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 56251501 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 56252033 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56252414 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 56252436 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56252494 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56253145 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 56254068 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 56254152 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 56254200 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 56254232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56254803 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 56255032 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 56255049 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56255111 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56255216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56255315 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56255378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56256528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56256627 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 56257342 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56258018 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56258868 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 56260135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56260279 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 56260481 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 56260628 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 56260667 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 56260940 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56260987 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56261476 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56261554 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 56261562 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 56261667 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56261816 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56261951 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 56261999 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56262129 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 56262596 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 56262621 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 56262738 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56263210 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 56263256 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56263351 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56263575 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56263692 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 56264108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56264141 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 56264196 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 56264280 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 56264859 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56265090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56265120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56265425 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56265443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56265966 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56266004 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 56266019 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 56266087 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56266093 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 56266126 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 56266148 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56266290 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56266512 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56266572 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56267092 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 56267374 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56267423 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56267511 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56267557 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56267857 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56267910 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 56268049 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56268056 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56268231 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56268235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56268606 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 56268639 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56270021 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56270541 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 56270969 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 56271841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56272011 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 56272202 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 56272351 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 56272451 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56272462 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56272480 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56272705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56272753 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 56272763 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 56272887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56272952 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 56272995 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 56273012 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 56273236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56273572 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56273643 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 56273651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56273812 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 56273826 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 56273827 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 56273860 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56273903 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 56273905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56273930 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 56273952 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 56273968 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56274107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56274232 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56274463 G A N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 19 56274812 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56274903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56274933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56275026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56275053 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 56275078 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 56275185 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 56275403 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 56275631 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 56275687 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 56275694 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 19 56276008 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56276016 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 56277031 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 56277066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56277281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56277720 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 56277747 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 56277748 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 56277856 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 56277950 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 56277959 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 56277977 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 56278113 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56278125 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 56278245 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 56278773 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56278777 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 56279179 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 56279580 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 56280082 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56280149 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 56280187 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 56280232 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 56280602 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 56280702 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56280867 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 56280997 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 56281025 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 56281514 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56281634 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 56281955 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 56281967 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56281989 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 56281996 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56282034 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 56282114 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 56282134 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 56282604 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56282605 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 56284637 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 56284698 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 56284799 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 56284807 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 56284808 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 56284934 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 56284955 T G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 19 56285220 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 56285383 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 56285761 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 56286003 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 56286146 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56286177 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 56286302 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56286460 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56286498 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 56286590 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 19 56286631 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 56286748 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 56286955 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 56287075 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 56287416 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 56287732 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 56287776 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 56287864 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 56287995 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 56288592 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56288855 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 56288893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56289115 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 56289132 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56290867 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 56291236 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56291587 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56291613 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56291699 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56293120 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 56293358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56294086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56295414 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56296712 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56297258 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 56297286 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56297507 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56299047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56299500 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 56299541 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 56299764 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56299789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56299794 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56299799 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 56299990 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56300250 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 56300269 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 56300304 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 56300330 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 56300507 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 56300555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56300571 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56302311 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56302906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56303573 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 56303604 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56303819 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 56303859 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 56303870 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 56303871 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 56303888 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 56304263 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 56304442 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 56304484 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56304948 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 56306323 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 56306330 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 56306341 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 56307489 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56308688 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 56308691 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 56309540 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 56310482 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 56310884 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 56310927 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 56311122 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 56311131 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56311728 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56311883 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56312481 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 56312528 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56312538 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56312544 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56312608 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56312928 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56313017 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56313162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56313980 G T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56315401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56316125 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 56316267 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56316739 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56317111 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56317381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56317440 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56317641 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 56317693 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 56317759 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56317793 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 56317798 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56317816 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 56318001 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 56318034 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56318075 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 56318174 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56318253 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 56318298 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56318317 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56318581 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 56318768 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56319070 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 56319220 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56319590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56319659 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56320017 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56320124 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 56320241 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 56320354 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 56320382 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 56320558 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56320664 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 56320848 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 56320875 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56320938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56321055 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 56321220 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 56321234 A C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 56321239 G T N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 19 56321356 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 56321367 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 56321461 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56321606 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 56321608 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56321984 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56322073 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56322101 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 56322121 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 56322279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56322290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56322370 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 56322702 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 56322775 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 56322796 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56322819 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56322924 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56323098 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 56323358 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 56323413 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 56323437 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56323593 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 56324259 A G N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0 0.916666666666667 0.0833333333333333 11 13 0 11 1 19 56324283 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 56324314 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 56324358 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 56324424 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 19 56324478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56324481 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 56324659 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56324687 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56324692 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56324735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56324779 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56324867 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56324897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56324903 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 56325154 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 56325183 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56325238 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56325249 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56326407 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 56326418 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 56326463 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 56326493 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56326504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56326565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56327102 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56327832 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 56328207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56328222 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56328260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56328410 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56328569 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56328620 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56328671 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56328704 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56328770 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56328831 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56328843 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56329234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56329248 C A Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56329326 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 56329327 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 56329402 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56329690 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56329885 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56330162 G C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56330286 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 56330318 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 56330434 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 56330447 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56330453 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56330889 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56330952 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 56331079 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56331410 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56333569 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 56333584 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 56334550 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56335492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56335855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56335861 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 56336187 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 56337217 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56337254 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 56337384 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56337793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56337933 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56337987 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 56338023 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56338024 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56338204 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56338543 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56338716 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 56338838 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 56339095 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 56339154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56339173 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 56339219 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 56339285 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 56339335 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 56339413 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 56339499 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 56339507 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56339530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56339552 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 56339565 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 56339567 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 56339863 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 56339891 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 56339986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56340042 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56340072 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 56340377 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56340643 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56340967 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 56341087 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 56341112 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 56341272 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 56341664 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56342166 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56342397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56342468 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 56342515 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 56342542 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56342590 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56342657 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 56342925 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56343092 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56343129 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 56343186 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 56343339 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 56343343 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56343380 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56343448 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56343543 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56343595 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 56343601 C A Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56343603 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56343782 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 56343789 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 56343862 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56344610 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56344630 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56345164 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 56345374 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56345422 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56345431 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56345643 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56345679 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 56346419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56346765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56346788 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56347643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56348163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56348172 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56348363 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56348598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56348724 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56348751 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56348881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56348949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56348972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56348981 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56348982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56349048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56349095 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56349179 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 56349180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56349288 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56349340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56349810 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56350279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56350314 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56350380 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56350714 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 56351036 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 56351254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56351288 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56351295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56351400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56351442 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 56351672 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 56352050 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56352095 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56352276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56352286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56352408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56352425 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 56352506 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56352768 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56353256 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56353420 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56353478 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56353490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56353579 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 56353601 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56355966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56357374 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56357779 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56357790 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56357842 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56357851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56357852 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56358025 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56358120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56358134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56358163 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56358351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56358583 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56358652 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56358668 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56358738 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 56358757 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56359041 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56359206 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56359236 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56359345 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 56359385 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 56359404 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 56359435 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56359468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56359535 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56359558 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 56359736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56359830 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56360216 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 56360235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56360377 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56360530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56362306 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 56362476 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 56363032 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56363144 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56363193 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56363213 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56363217 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56363231 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56363630 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 56364013 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 56364300 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 56365198 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56365354 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56368140 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 56368514 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56369129 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56374266 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56374616 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 56374881 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56375474 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 56375561 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 56375601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56375955 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56376207 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56377457 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 56377545 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 56377560 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 56377749 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 56377952 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56378019 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56378503 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56378669 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 56378701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56378827 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56378940 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56379369 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 56379376 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 56379430 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 56380513 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 56380550 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 56380841 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56381300 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56381435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56381506 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 56381602 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 56381639 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 56381828 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 56383667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56383669 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56383745 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 56383781 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 56384036 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56384070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56385260 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56385265 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56385400 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56385488 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56385509 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 56385602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56385725 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 56385767 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 56385806 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56385979 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56386183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56386443 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 19 56387901 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56387924 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56388361 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56388850 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56388969 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 56389340 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 56389439 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 56389546 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56389560 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 56389613 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 56389807 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 56389881 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56389885 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 56389891 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56389900 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56389925 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 56390302 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56390658 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56391173 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56391176 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56391206 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56391570 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 56391712 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56391751 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 56391907 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 56391918 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 56394648 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56395517 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56395962 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 56396238 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56396414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56396507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56396543 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56398119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56398335 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56398417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56398592 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56398900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56399063 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56400156 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56400472 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 56400558 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56401042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56401367 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56402437 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56403612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56405311 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 19 56405502 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56405893 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56405900 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56406080 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56406216 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 56406255 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 19 56407569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56407608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56407649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56407655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56407683 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 56407814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56407978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56408508 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56408523 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 56408551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56408636 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 56408694 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 56408890 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56408936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56409088 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56409179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56409639 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 56410852 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 56411323 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56411332 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56411416 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 56411476 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 56411499 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 56411529 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 56411562 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 56411620 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 19 56411674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56411741 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56412022 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56412082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56412185 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56412222 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56412641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56412921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56413173 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 56413185 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 56415054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56415731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56415905 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 56416596 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56418737 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56418801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56418825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56419422 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56419637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56421783 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 56422164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56422202 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 56422606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56422639 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56422912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56423335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56423708 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56423942 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56423967 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56424335 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56424433 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56424544 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56425017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56425230 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 56425292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56425456 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 56426171 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 56426245 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56426286 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56426488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56426614 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 56427098 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 56427195 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56427303 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 56427304 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56427333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56427374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56427378 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 56427381 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 56427569 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 19 56428060 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 56428096 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56428202 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56428466 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56428682 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 56428709 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 56428950 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 56429141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56429288 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 56429620 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56429737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56429826 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 56429949 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56429966 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 56430467 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 56430479 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56430501 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56430547 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 56430584 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 56430618 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56430662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56430980 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 56431102 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 56431113 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 56431143 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 56431198 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 56431203 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 56431267 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 56431321 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 56431324 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 56431467 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 56431587 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 56431611 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 56431620 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 56431633 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 56431654 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 56431905 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56431931 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 56432312 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56432332 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 56432338 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56432349 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56432365 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56432399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56432420 T G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56432476 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56432538 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56432683 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56432720 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56432721 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56432728 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56432950 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 56432965 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56433082 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 56433282 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 56433769 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56433907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56433976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56433986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56434576 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 56434583 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 56434729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56434768 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56434804 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 56434834 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56434874 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56434883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56434889 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 56434893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56434924 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 56435021 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56435033 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56435034 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56435131 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 56435139 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 56435164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56435241 A T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 56435261 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 56435299 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 56435306 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 56435325 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 56435344 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 56435372 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56435389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56435443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56435451 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56435468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56435535 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56435540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56435565 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 56435577 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 56435770 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 56435774 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 56435797 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 56435839 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 56435978 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 56436121 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 56436234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56436482 A C Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 56436523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56436602 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 56436611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56437500 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56437955 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 56438012 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56438263 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 56438545 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 56438571 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 56438731 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56438744 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 56438750 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 56439478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56440683 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 56441222 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56441431 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 56441938 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 56442881 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 56442892 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56443200 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 56443386 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 56443485 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 56443546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56443580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56443774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56443778 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56443791 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56443809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56444072 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56444073 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56444166 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 56444185 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 56444202 C A Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 56444216 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 56444464 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 56444680 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 56444916 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56446368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56446429 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 56446464 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 56446656 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 56446981 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 56447109 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 56447271 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 56447613 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56447673 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 56448086 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56448393 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 56448607 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56448831 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56449546 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 56449752 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56449809 G T Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 56449843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56449983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56450090 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 56450126 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 56450151 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 56450196 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 56450491 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 56450547 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 56450888 C A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 19 56451258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56451466 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 56451869 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56451873 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56452521 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56452626 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 56452883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56452910 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 56452914 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 56453098 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 56453220 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 56453223 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 56453475 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 56454237 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56454342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56454534 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 56454646 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56454786 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 56454849 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 56454862 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 56454909 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 56455095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56455107 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 56455248 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 56455288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56455314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56455361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56455532 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 56455629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56455639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56455703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56455713 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 56456181 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56456186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56456513 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56456585 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 56456628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56456831 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56456987 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56458154 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56458236 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56458390 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56458417 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56458781 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 19 56458818 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 56458870 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 56458952 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56458998 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 56459022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56459173 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56459593 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 56459628 C T N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 19 56459735 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 56459826 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 56459869 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 56459907 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 56460009 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 56460172 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56460178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56460215 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56460445 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 56460451 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 56460456 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 56460547 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 56460567 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 56460571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56460612 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 56460633 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 56460638 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 56460683 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 56460720 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 56460758 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 56460783 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 56460796 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 56460819 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 56460832 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 56460889 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56461250 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 56461252 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 56461567 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 56461833 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56462003 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 56462019 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 56462059 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 56462125 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 56462299 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 56462405 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 56463015 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 56463425 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 56463599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56463628 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 56463635 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 56463662 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56463684 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 56463706 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 56463766 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 56463807 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 56463815 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 56463939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56464040 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 56464264 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 56464283 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 56464538 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 56464783 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 56464836 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 56465021 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56465160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56465317 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56465319 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56465345 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 56465348 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 56465361 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 56465483 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 56465551 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 56465559 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56465582 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 56465585 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56465663 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 56465665 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 56465782 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 56465783 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 56465967 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 56466207 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56466436 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 56466513 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 56466880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56467636 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56467672 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56467804 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56468281 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 56468376 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 56468421 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 56468468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56468795 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56468874 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 56468878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56469345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56469429 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 56469512 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56469549 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 56469980 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56470192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56470201 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56470209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56470442 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 56470551 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 56470564 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 56470567 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 56470694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56471558 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56471837 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56471950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56471997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56472126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56472709 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56473451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56473624 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 56473765 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 56473773 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 56474565 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 56474574 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 56474575 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 56474781 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 56475171 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 56475398 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56475491 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 56475505 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 56475520 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56475730 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 56475854 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56475901 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 56476359 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 56476382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56476649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56476735 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 56476980 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 56477114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56477135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56477196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56477204 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 56477273 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56477280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56477292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56477294 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56477375 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56477393 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56477488 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56477501 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56477504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56477517 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 56477518 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56477595 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56477621 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 56477622 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 56477699 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56477704 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56477766 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 56477871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56477892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56477936 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56477946 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56478032 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56478106 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56478121 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56478269 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56478277 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 56478294 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56478322 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56478474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56478480 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56478511 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56478532 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56478645 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56478659 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56478668 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56478673 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56478702 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56478762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56478779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56478858 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56478947 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56479007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56479075 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 56479456 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 56479557 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 56479797 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 56479857 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 56479884 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56479885 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56480021 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56480416 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 56480547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56480584 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 56480964 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56481639 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 56481747 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 56481915 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 56481958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56481987 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 56482003 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56482170 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 56482291 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 56482347 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56482368 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56482425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56482569 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 56482582 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 56482603 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 56482710 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56482722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56482984 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56483170 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 56483192 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 56483193 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 56483214 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 56483248 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 56483252 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 56483294 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 56483398 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 56483496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56483658 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 56492219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56493463 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 56494262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56494840 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56495102 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 56495923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56496107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56496257 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 56496279 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56496284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56496296 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 56496636 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56496641 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56496801 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56496857 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56496980 C A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 56497055 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 56500977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56501755 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 56502363 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56503553 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 56503861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56504031 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 56504072 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 56504115 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56504257 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 56504543 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 56504579 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56504583 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56504768 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 56504775 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56504816 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56505426 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 56505427 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 56505430 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 56505616 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 56505623 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 56506421 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 56506521 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 56506666 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56506824 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 56506903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56506978 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56507041 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 56507054 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56507106 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 56507225 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56507272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56507403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56508562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56509814 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56509866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56510216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56510263 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56513612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56513647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56513778 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 56515059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56516091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56517250 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 56517624 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 56517676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56517861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56517975 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56518146 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56518248 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56518401 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56518824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56519279 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 56519361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56519416 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 56519892 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 56519986 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 56520377 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 56520681 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 56520727 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 56520742 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 56521008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56521624 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56521717 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56522038 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 56522044 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 56522051 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 56522668 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 19 56522792 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56522929 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56523127 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 56523319 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56523334 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 56523416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56523551 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56523566 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56524097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56524299 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56525018 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56526651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56527171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56528077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56528112 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56528424 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56528786 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 56528807 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 56528857 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 56528859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56530558 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56530867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56531073 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 56531404 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56531405 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56531447 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56531489 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56531576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56531609 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56531834 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 56531856 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 56531878 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 56531883 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 56532330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56532364 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56532394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56532612 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56532635 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56532691 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 56532715 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56532788 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56536054 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56539826 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56540734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56541149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56541289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56542860 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56543449 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56543663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56543675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56544645 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 56545067 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 56545370 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 56545477 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 56545623 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 56545668 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 56545808 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 56546181 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 56546302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56546399 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 19 56546468 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 19 56546471 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56546488 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 56546527 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 56546539 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 56546698 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 56546769 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 56546805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56546909 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 56546924 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 56547035 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 56547132 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 56547417 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 56547448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56547486 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 56547532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56547558 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 56547620 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 56547847 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 56547850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56547927 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 56548052 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56548596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56548756 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56548803 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56549403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56549527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56549825 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 19 56549884 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 56549915 T G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 19 56550108 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56550116 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 56550122 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56550172 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56550216 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56550248 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 56550395 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56550420 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 56550508 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 56550514 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56550657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56550665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56550683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56550698 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56550717 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56550801 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56551065 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56551082 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56553399 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 56553452 C G Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 56553867 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 56553952 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 56554029 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 56554245 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 56555333 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56555622 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56555801 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 56556143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56556144 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56556224 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56556243 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56556354 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56556589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56556990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56556994 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56557124 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 56557298 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 56557306 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 56557319 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 56557359 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 56557383 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 56557405 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 56557532 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56557871 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56558287 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 56558300 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 56558319 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 56558688 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56558745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56558806 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 56558813 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 56558885 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56558902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56559300 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 56559336 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 56559501 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 56559645 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 56559667 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 56559698 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56559880 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56559950 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56559958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56560082 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56560407 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56560652 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 56560741 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 56560849 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56561036 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 56561211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56561310 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 56561401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56561423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56561530 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 56561534 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56561647 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 56561687 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 56561729 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56561732 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56561757 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56562001 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56562012 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56562027 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56562028 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56562061 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56562237 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 56562333 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 56562556 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56562925 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 56564279 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56564366 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56564478 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 56564835 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56564972 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 56565511 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56565574 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 56565713 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 56565751 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 56565941 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 56600790 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 56605967 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56606057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56606191 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 56606243 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 56606930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56608114 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 56609553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56610086 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 56610177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56610483 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56610668 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56610726 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 56611191 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56611205 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56612059 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56612516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56612949 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 56613032 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 56613093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56613146 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 56613586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56613633 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56613773 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 56614107 G T Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 56614134 A T Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 56614235 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 56614315 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 19 56614317 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 56614489 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 19 56614903 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56614924 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56614970 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56614974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56615243 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56615303 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56615348 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56615420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56615607 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 19 56615612 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 56615617 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 19 56615625 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 56615761 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 56615980 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56616577 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56617855 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56618001 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56618072 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56618074 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56618730 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56618756 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 19 56619334 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56619413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56619693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56619863 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56619873 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56620031 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 56620117 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56620369 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 56620868 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56621109 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56622027 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 56622505 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56623268 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 56624543 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 56627707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56631192 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 56632887 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56633206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56633421 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56636240 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56636353 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56636977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56642528 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56643308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56647127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56647421 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56648444 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56650904 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 56654591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56656647 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56657415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56661339 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56662510 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56664223 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56665945 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 56667079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56668039 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56668986 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56673525 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 56674587 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 56674699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56674712 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 56675100 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56675314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56676632 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56678077 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56678883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56679005 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 56679074 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56679169 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56679196 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56679365 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56679722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56679799 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 56679805 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 56679806 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 56679812 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56680196 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56680433 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 56680587 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56680612 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 56680996 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 56681696 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 56681710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56681760 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 56681837 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56681860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56682254 A G N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.153846153846154 0.615384615384615 0.230769230769231 12 14 2 8 3 19 56682284 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 56682534 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56682615 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 56682755 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 56682772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56682803 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 56682848 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 56682864 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 56682896 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 56682903 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 56682922 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 56682978 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 56682995 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 56683253 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 56683333 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 56683400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56683514 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56683539 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 56683750 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 56683788 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 56683900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56683925 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 56684065 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 56684093 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 56684299 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 56684477 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 56684679 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 56684689 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56685009 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 56685129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56686039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56689007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56690845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56692319 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 56692339 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 56693776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56694074 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56698329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56698958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56700381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56700528 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56700987 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 56701037 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56701478 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 56701496 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 56701635 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 56701715 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 56701931 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56702132 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56703530 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 56704399 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56704822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56705188 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 56705364 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56705638 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56705791 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 56705887 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 56706609 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56706974 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 56707872 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 56710934 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56712066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56714731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56717642 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 56722400 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 56725376 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 56730103 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56731696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56732791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56733712 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 56733713 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56734676 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 56734980 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 56736778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56736870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56737434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56738690 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56739156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56740445 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56740702 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 56740711 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 56741049 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56741767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56743123 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56743262 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56743274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56743357 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 56743510 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 56743884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56743902 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 56744263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56744349 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 56744737 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 56744742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56744744 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 56744906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56744970 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56745376 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 56745452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56746672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56748010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56748320 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56748571 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56748587 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56748611 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56749136 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56750628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56752211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56752718 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 56753954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56754746 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56754854 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 56754866 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 56755048 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 56755069 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 56755838 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56755926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56756298 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56756772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56757339 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 56757480 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 56757481 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 56757494 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 56757518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56757707 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 56757708 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 56758004 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 56758096 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 56758158 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 56758398 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56758416 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 56758596 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 56758629 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56758669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56758846 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56758955 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 56758973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56759668 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 56760616 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 56760619 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56760791 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 56760915 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56760927 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56761475 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56761608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56761712 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56762093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56762221 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56762280 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 56762357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56762358 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 56762499 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56762518 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56762525 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56762546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56763220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56763342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56764010 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56765545 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56766095 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56766612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56766826 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56767272 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 56767544 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56767818 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56767893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56767913 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56769377 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56769729 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 56769770 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56770045 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56770663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56770935 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56772605 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 56772668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56772850 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56772877 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56773073 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 56773141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56773142 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56773269 G A N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 56773342 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56773707 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 56773768 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56773798 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 56774066 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 56774317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56774778 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56774843 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 56774850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56774867 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 56774936 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 56775427 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 56775434 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56775597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56775914 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56776106 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56776483 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 56776597 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 56776644 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56776828 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 56777046 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 56777160 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 56777197 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 56777203 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56777286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56777586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56779979 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56780964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56781217 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 56781224 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 56781255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56781291 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 56781304 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 56781706 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56781742 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 56781743 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 56781753 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 56781765 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 56781767 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56782159 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 56782217 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56782278 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56782327 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56782373 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56782377 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56782399 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56782723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56782749 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56783097 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56783198 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56783199 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56783226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56783245 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56783474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56783550 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56783719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56783800 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56783804 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56783900 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56783934 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56783958 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56784045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56784058 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56784059 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56784089 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56784134 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56784205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56784308 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 56784387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56784445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56784455 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56784462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56784658 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56784735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56785274 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 56785563 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56786030 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 56786102 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 56786134 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 56786150 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 56786159 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56786160 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 56786390 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 56786438 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 56786532 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56787280 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56787560 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 56787563 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 56787565 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 56787743 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56787756 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 56787850 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 56788092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56788586 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 56789856 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 56790910 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 56791344 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 56792055 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 56792894 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56793635 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56794119 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 56795034 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56795054 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56797275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56798543 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56800868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56801321 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56801455 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 56802576 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 56802878 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 56803508 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 56803963 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56804100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56806595 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 56806672 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 56810072 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56810860 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56811022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56811097 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 56812068 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56813286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56813439 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56813818 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56813952 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 56814325 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 56814373 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 56814374 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 56814528 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 56814664 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 56814941 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 56814962 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 56815108 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 56815529 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 56815632 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 56815942 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56816007 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 56816166 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 56816303 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 56816327 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56816336 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56816438 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56816455 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 56816456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56816589 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 56816856 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 56816986 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 56817613 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 56817626 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 56817640 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 56817705 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56817708 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56817835 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56817860 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56817954 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56817998 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56818160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56818191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56818442 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 56818647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56818774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56820259 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56820470 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56820518 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 56821009 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 56821074 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 56821116 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 56821173 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 56822022 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56823523 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 56824356 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56824675 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56825319 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56826644 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 56827042 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 56827905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56828515 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 56828518 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 56828549 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 56829507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56832237 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 56833361 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56833502 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 56833562 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 56833565 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 56833753 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 56833775 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 56833813 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 56834132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56835599 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56836361 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56836415 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 56836447 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56836691 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 56836713 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 56836990 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 56837649 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56837671 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56837680 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56837689 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56837701 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 56837730 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56837928 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56838000 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56838908 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 56838939 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 56838957 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 56838958 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 56838969 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 56839007 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 56839027 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 56839164 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 56839278 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 56839314 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 56839363 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 56839386 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 56839478 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 56839491 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 56839554 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 56839629 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 56839682 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 56839691 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 56839698 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 56839842 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 56839845 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 56839862 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 56839882 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 56839891 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 56839905 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 56839918 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 56839970 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 56840064 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56840258 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 56840292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56840321 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 56840367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56840509 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 56842790 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56843312 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 56843558 C A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 56843597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56844921 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 56844980 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 56845174 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56845447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56845666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56845917 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56846125 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56846446 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56846499 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56846514 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 56846546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56846651 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56846732 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 56846737 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 56847313 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 56847327 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 56847767 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 56847792 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 56847845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56847863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56847965 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56848004 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 56848164 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 56848227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56848357 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 56848364 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56848371 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56848403 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 56848406 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56849584 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56851095 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56851100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56851365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56852801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56853584 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56854083 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56854312 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56854315 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56854361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56854554 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56854597 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56854665 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56855002 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 56855138 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 56855298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56855546 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56855690 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 56855697 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56855717 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56856733 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 56856891 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56856892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56856962 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 56856992 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56856998 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 56857061 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 56857158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56857163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56857426 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 56857441 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56857457 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56857570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56857577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56857580 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56857867 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56857944 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56858192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56858418 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56858611 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56859143 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 56859201 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 56859270 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56860510 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56860548 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56860582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56860783 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56860823 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 56860894 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56861069 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 56861722 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56861724 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56861740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56862236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56862305 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 56862749 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 56862874 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 56862950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56863228 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 56863384 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56864318 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56864776 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 56865056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56866087 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56866138 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56867226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56867237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56867266 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56867724 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56868559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56868834 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56869104 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56869458 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56869605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56869625 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56869988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56869990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56870047 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 56870745 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 56870848 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 56871079 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 56871130 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56871191 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56871246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56872052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56872717 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56872733 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56873377 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 56874024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56874205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56874930 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56875589 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 56879188 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56879477 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 56879505 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56879798 G T Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 19 56880366 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 56880523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56881189 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 56882695 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 56882791 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56882794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56882804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56883197 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 56884102 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 56885242 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56885872 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56885920 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56885990 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 56886077 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 56886096 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 56886795 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 56886843 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56886876 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 56887098 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 56887728 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 56887738 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 56887778 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 56887806 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56889425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56889649 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56889847 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 56890256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56891016 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56891477 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 56891483 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 56892137 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56892170 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56892283 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56893186 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56893624 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56893934 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56894739 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56894895 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56894906 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56895228 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56895488 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56895585 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56895832 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56896073 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56896268 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 56896432 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56897279 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56897948 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 56898015 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 56898061 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 56898119 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56898888 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 56899019 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 56899185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56899839 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56900046 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 56900114 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 56900186 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 56900217 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 56900536 G T Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 56900785 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56900797 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56901069 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56901373 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 56901801 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 56902942 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 56902970 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 56903320 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 56903387 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 56903692 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 19 56903929 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 56904017 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 56904498 T A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 56904513 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 56905462 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56906001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56906801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56906840 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56907509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56907606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56907667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56908175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56909955 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56909981 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56910633 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56910902 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 56911012 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 56911051 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 56911054 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 56911066 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 56911069 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 56911238 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 56911288 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 56911404 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 56911553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56911665 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 56911874 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 56911944 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56912391 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 56913304 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56913417 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 56913842 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 56913897 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 56913952 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 56913979 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 56913990 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 56914133 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 56914232 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 56914686 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56915173 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 56916161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56919378 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56920027 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 56920136 C G Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 56920888 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56920894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56923363 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56923364 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56923421 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 56923796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56923823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56924688 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56927629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56927668 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 56928476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56928956 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 19 56928967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56928989 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56929263 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 56929308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56929463 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56929675 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 56930282 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 56931597 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56933186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56935062 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 56936192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56936441 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56936853 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56937136 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56937659 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56937962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56937981 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56938073 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 56938201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56938487 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56939201 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 56939270 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56939537 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 56939654 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 56939860 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 56939908 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56940127 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56940128 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56940488 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56940701 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 56940918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56941227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56941684 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 56942204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56942536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56942761 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 56943170 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 56943484 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56944210 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 56944250 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 56944316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56944324 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 56944644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56944754 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 56944798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56944818 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56944837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56945192 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 56945313 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 56945490 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 19 56945590 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 56946394 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 56946502 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 56946503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56946529 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56946706 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 56947166 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 56947500 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 56947537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56948308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56949209 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56949233 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 56949255 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56949346 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 56949397 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56949514 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56949751 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56950158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56950180 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56950320 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 56950597 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 56950624 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56950735 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 56950774 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56950788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56950802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56951170 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 56951399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56951547 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 56951559 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 56951563 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 56951779 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56951820 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 56952048 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56952204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56952403 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 56952558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56952884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56952917 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56953153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56953172 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 56953253 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 56953326 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 56953377 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 56953392 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 56953410 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 56953412 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 56953421 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 56953461 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 56953464 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 56953610 G C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 56953649 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 56954040 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 19 56954186 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56954211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56954368 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 56954584 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56954734 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 56954741 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 56954743 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56954843 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56954897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56955492 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 56955557 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 56956293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56956473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56956948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56957090 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 56957446 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 56957465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56957554 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 56957823 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 56957892 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 56957995 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 56958144 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 56958319 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 56958536 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 56958779 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56958850 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 56958851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56959035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56959063 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56959070 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56959265 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56959722 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 56959937 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56959948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56961842 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56961937 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 56962354 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 56962473 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 56963283 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 56963832 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 56963912 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56963953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56963977 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56963995 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 56964190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56964268 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 56964329 C G Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 56964362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56964510 A G Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 56964603 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56965044 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 56965197 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 56965724 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 56965785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56965792 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56965799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56965945 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56966074 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 56967771 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 56967857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56968059 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56968176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56968177 G T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 56968712 C T Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 56968789 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56968882 C G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 56968890 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56968901 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 56970166 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 56970423 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 56970857 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 56970892 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 56970921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56970958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56971151 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56971231 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56971475 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 56971610 C A Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 56971611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56971672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56971687 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 56971992 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 56972264 G T Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 56972382 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 56972463 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 56972972 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56973103 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56973557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56974437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56975018 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56975672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56976059 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56976128 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 56976401 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 56976430 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56976514 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56976610 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56976642 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56977113 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56977119 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56977472 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56977667 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 56977696 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 56977706 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 56977719 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 56978177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56978190 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 56978238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56978271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56978288 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56978762 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56979388 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56979846 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 56980021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56980099 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56980329 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56980379 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56980396 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56980412 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 56980425 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56980609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56980610 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 56980641 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56980675 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56980808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56980948 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 56980952 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56980977 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 56981329 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56981467 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 56981468 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 56981538 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56981562 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 56981633 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 56981644 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 56981811 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 56982349 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 56982810 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 56982940 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 56983084 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56983173 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 56983265 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 56983311 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 56983374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56984066 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 56984250 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 56984337 G C Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 56984395 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 56984561 C G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 56984562 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56984604 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 56984614 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 56984829 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 56984840 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 56985066 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 56985310 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56985338 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 56985473 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 56985689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56986002 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 56986168 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 56986188 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 56986301 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 56986319 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56988271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56988372 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 56989974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56990280 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 56991224 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56991813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56991821 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 56992023 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56992211 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 56992217 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 56992252 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 56992276 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 56992278 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 56992290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56992428 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 56992446 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 56992516 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 56992686 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 56992904 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 56993142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56993324 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56995586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56996219 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56996603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56996662 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 56996671 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 56996753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56996785 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 56996909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56997392 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56998134 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56998204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56998523 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 56998741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56998829 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 56998862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56998869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56999173 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 56999180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 56999210 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57000812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57000932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57002108 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 57002546 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 57002787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57005513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57006735 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57006875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57006904 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 57006918 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 57007338 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57008125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57008718 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57009272 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 57009446 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57009490 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 57009595 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 57009601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57009866 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57010507 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57010619 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 57010756 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 57010763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57010799 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 57010830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57010858 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57010881 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57011108 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 57011175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57011338 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57011639 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 57011663 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 57011771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57012001 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 57012033 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 57012099 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57012100 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57012204 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 57012220 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 57012261 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57012377 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57012430 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57012436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57012782 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57013094 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57013170 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 57013301 G C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 57013354 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 57013439 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 57014171 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57014445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57014500 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57014501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57015452 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57015457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57015839 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 57015864 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 57015908 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 57016048 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 57016190 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57016205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57016248 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57016249 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57016317 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 57016649 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57016663 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57016677 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57016702 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 57016784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57016834 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57016886 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57017171 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 57017866 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 57018184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57018403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57018866 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57019412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57019468 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 57019472 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 57019661 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 57019705 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 57020009 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 57020133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57020343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57020417 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57020541 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57021078 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57021146 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57021194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57021235 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57021349 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57021720 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57021721 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57021814 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57022037 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57022258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57022380 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57022824 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57022932 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 57023032 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57023240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57023263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57023331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57023961 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 57023978 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 57023979 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 57024048 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 57024226 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 57024246 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57024597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57024791 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 57025647 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57026673 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 57027549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57028566 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 57028689 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 57028799 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 57028867 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57029005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57029007 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57029073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57029138 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57029364 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57029380 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57030018 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 57030347 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57030397 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57030416 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 57030812 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57030938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57031010 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57031050 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57031675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57031724 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57031733 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57031801 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 57031820 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 57031936 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57032352 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57033528 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57034718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57034785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57034869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57035230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57035298 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57035570 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 57035671 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 57035686 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 57035768 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 57035773 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 57035789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57035796 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 57035805 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 57035821 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 57035878 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 57035938 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 57036242 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 57036295 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 57036449 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 57036450 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 57036591 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57036696 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57036833 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 57036903 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 57037432 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57037497 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 57037502 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57037556 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 57037784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57037958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57038308 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 57038343 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57039145 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57039206 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 57039566 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 57039788 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 57040030 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57040086 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57040095 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 57040150 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 57040199 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57040517 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 57040750 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 57040909 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 57040946 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 57040968 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 57041098 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 57041248 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 57041282 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 57041413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57041442 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 57041568 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57041753 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 57043136 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 57043244 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 57043279 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57043285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57043329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57043402 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57043490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57043759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57044793 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57044798 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57044811 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 57044813 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 57044846 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57044970 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 57045156 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57045586 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 57045657 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 57045688 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 57045727 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57045855 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 57045914 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 57045959 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57046049 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57046281 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 57047389 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 57047495 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 57047534 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 57047576 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 57047612 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 57047697 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57048215 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 57048216 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57048268 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57048441 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 57048523 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 57048634 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 57048685 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 57048980 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57049176 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57049235 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57049320 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 57049419 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57050147 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57050372 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57050409 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57050475 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57051039 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 57051545 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57051585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57051694 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57051877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57051905 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57052011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57052049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57052639 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57052649 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57052666 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57054177 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 57055389 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57056324 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 57056564 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 57056579 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57056659 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 57056716 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 57057100 T G N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 19 57057899 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57058304 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57058501 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 57058594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57058665 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 57058778 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57058807 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57058876 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 57058891 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 57058948 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 57059000 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 57059035 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 57059157 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57059158 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57059371 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57059456 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 57059581 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57059612 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57059647 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57059953 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 57060160 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 57060168 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57060233 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57060265 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 57060272 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 57060322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57060381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57060645 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57060779 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 57060992 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57061183 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57061387 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 57061453 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57061454 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57061485 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57061494 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 57061708 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57061776 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 57061794 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57061882 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57062043 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57062050 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57062052 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57062065 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57062082 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57062129 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57062130 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57062183 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57062207 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57062253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57062273 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57062966 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 19 57062980 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 19 57063138 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 57063158 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57063333 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 57063354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57063457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57063761 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57063835 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57064393 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57064455 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 57064496 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57064881 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57064908 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 57065231 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 30 6 15 0 3 19 57065329 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 57065569 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57065832 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57066422 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57066436 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57066722 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57067007 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 57067464 A C N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 57067596 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 57067667 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 57067831 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57068127 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57069105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57069190 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 57069239 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57069389 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 57069654 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57070312 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 57070591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57070602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57070673 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 19 57070775 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57071899 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57072162 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57072236 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 19 57072287 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57072365 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57072491 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57072495 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57072513 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57072582 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57072612 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57072645 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 57072888 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 57072924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57072943 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57073137 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57073233 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 19 57073301 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57073449 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57073508 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57073734 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57073816 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57073859 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57073966 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57074047 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 57074268 C T N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 19 57074309 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 19 57074323 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 19 57074452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57074706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57074976 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57075024 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57075062 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57075069 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57075107 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57075750 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 57075910 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 57075914 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 57075995 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 57076030 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 57076167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57076285 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 57076327 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 57076371 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 19 57076374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57076837 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57076861 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 57076963 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 57076964 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 19 57077098 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 57077099 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 57077120 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57077289 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 57077593 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 57077916 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 57078276 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57078283 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57078337 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 57078873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57079251 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57079600 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 57080902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57080967 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57081541 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57081558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57081850 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57082220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57083841 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 57083968 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 57084204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57084504 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57084521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57084580 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 57084641 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57084647 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 57084761 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57084833 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57084844 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57084850 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 57084873 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 57084887 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 57085026 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 57085484 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57085504 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57085528 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57085659 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 57086228 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 57086407 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57086497 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57086562 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 57086567 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57086572 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57086603 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 57086616 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 57086844 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 57087117 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 57087196 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 57087485 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57087620 G T Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 57087899 C G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 57087983 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57088203 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57088211 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57088309 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 57089139 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 57089530 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57089644 C G Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 57089685 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57089707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57090243 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57090461 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57090521 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57090865 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57090983 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57091017 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 57091033 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57091040 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 57091043 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57091081 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 57091235 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57091355 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 57091356 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57091555 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 57091564 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 57091621 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 57091794 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57091809 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57091945 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57091993 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57092000 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57092025 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 57092046 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57092229 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57092356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57093162 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 57094961 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 57095095 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 57095186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57095258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57095263 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57095270 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57095350 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57095389 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57095518 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57095845 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 57096292 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 19 57096480 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 57096649 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57096800 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 57097169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57097291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57097352 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 57097536 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 57097796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57098152 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 57098198 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57099444 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 57099452 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 57099532 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57099605 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57099982 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57100009 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57100039 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57100114 G T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 57100134 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 57100151 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 57100153 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 57100312 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 57100329 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 19 57100478 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 57100557 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57100677 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 57100814 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 57100891 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 57100923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57101046 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 57101324 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 57101495 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57101545 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 57101706 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57101710 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57101791 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 57101796 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 57101927 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 57102054 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 19 57102070 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 8 10 2 4 3 19 57102123 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 19 57102163 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 57102191 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 19 57102339 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 57102418 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57102422 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57102531 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 57102768 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57102840 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 57103027 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57103136 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 57103282 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57103528 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 57103645 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 57104009 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 57104201 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 57104231 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 57104378 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 57104390 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 19 57104391 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57104396 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 57104436 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 19 57104530 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 57104806 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57105071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57105498 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57105988 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57106387 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57106632 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57106641 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 57106658 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57106778 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57107492 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57107597 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57107698 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57108326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57108532 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 57109200 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57109243 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57109250 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57109264 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57109335 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57109484 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 57109496 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 57109523 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 57109844 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 57109849 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57109892 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57109987 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57110000 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 57110001 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 57110041 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 57110056 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57110085 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57110121 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57110128 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57110313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57110364 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57110394 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 57110647 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 57110697 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 57111003 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 57111266 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57111636 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 57111651 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 57112568 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57112705 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 57113094 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57113145 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 57113301 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57113496 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 57113900 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57115169 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 57115195 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 57115425 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57116338 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 19 57116472 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 57116566 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 57116713 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 57116989 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 57116994 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 57117056 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57117140 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57117186 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 57117283 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 57117284 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 57117393 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 57117590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57117602 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57117615 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57118049 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57118314 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 57118526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57118530 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 57119178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57119501 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 57119526 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57119668 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57119684 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 57119687 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 57120888 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 57121085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57121261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57121263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57121653 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57121676 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 57121879 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 19 57121900 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 57121931 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 57122113 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 57122117 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 57122401 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 57122451 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57122593 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57122863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57123012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57123738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57124174 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57125005 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 57125053 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57125234 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 57125237 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 57125398 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57125439 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 19 57125986 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57126033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57126042 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57126224 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57126248 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57126528 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57126540 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 57126741 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 57126775 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 57126852 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57126991 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 57127302 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 57127344 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 57127467 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 57127584 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57127613 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57127706 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 57127748 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 57127836 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 57127930 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 57128104 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 57128214 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 57128480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57128632 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57128649 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57128715 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57128724 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 57128919 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57129090 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 57129397 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57129539 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57129767 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57129958 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57130240 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 57130510 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57130698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57130819 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 57130870 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 57131030 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57131089 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57131149 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 57131150 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 57131188 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 57131273 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57131438 G C Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 57131475 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 57131593 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 57131643 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57132005 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 19 57132030 G A N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 19 57132103 G T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 19 57132105 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 19 57132135 A C N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 19 57132300 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57132528 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57133322 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57133421 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57133463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57134070 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57134185 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57134210 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 57134319 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 57134886 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 57135099 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 57135260 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 57135485 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57135977 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 57136025 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 57136073 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 57136129 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 57136142 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57136240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57136325 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 57136337 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 19 57136352 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57136487 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57136501 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57136622 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 57136664 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57136673 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 57137038 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 57137147 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 57137192 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 57137361 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57137484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57137493 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 57137554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57138060 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 57138388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57138389 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57138696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57139002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57140571 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 57140866 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57141060 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57141147 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 57141401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57141405 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57141453 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57141524 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57141537 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57141608 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57141810 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 57141892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57142778 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 57142811 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 57142870 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 57142893 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 57142905 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 57143196 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 57143484 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 57143529 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 57143635 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 57143667 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57143679 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57143728 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 57143757 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 57143924 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57144013 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 57144115 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57144170 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 57144268 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 57144290 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 57144333 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57144346 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 57144567 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 57144583 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 57144638 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 57144641 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 57144970 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57145229 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 57145370 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 57145580 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 57145744 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 57145928 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 57145929 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 57146311 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 57146435 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 57146518 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 19 57146566 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 57146603 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 57146648 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 57146673 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 57146690 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 57146747 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 57146762 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 57146774 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 57147122 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 57147555 G C Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 57147626 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 57147690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57147809 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 57147826 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57147881 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 57147935 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 57148220 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 57148260 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 57148440 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 57148504 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 57148550 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 57148556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57148558 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 57148629 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 57148630 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 57149158 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 57149194 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 57149195 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 57149255 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 57149268 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 57149576 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57149588 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 57149627 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 57149641 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57149650 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 57149659 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 57149679 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 57149715 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 57149752 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 57149818 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 57149839 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 57149934 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 57149982 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 57150266 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 57150347 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 57150571 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 57150577 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57150653 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57150846 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 57150982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57152364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57152681 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 57152768 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 57152806 C G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 19 57152865 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 57152958 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57153288 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 57153359 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57153371 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 57153411 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 57153415 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 57153536 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 57153582 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 57153625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57153646 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 57154121 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 57154621 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 57154676 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57154714 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57154971 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 57155199 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 57155590 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57155597 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 57156065 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 57156992 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57157048 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 57157072 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 57157120 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57157219 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 57157375 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57158263 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 57159176 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 57159319 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 57159339 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 57159473 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57159757 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 57159793 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57159937 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 57159979 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 57160000 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 57160323 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 57160802 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 57161595 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 57161923 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 57162046 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 19 57162249 C T N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 19 57162500 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 57163225 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57163263 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 57163284 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 57163308 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 57163350 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 57163412 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57163622 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57164261 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57164387 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 57164464 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 57164498 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57164500 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57164507 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 57164546 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 57164555 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 57164654 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57164687 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57164814 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 57164852 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 57164854 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 57164947 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 57165200 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 57165448 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 57165844 G T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 19 57165865 A G Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 19 57165979 T C N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 19 57166063 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 57166107 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57166163 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 57166454 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 57166484 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 57166497 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 57166518 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 57166683 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 57166689 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57166951 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 57167141 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 57167236 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57167257 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 57167341 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57167525 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57168060 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 57168062 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 57168075 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 57168082 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 57168104 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57168237 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57168355 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57168419 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57168485 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 57168603 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57168743 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 57168849 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 19 57168945 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57169598 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 57169600 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 57169666 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57169704 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57169768 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 57169769 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 57169806 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 57169932 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 57169980 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57170182 A T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 57170316 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 57170335 T A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 57170866 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57171134 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57171262 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 57171838 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57171893 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57171922 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57171969 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57172030 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 57172031 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57172217 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57172460 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 57172481 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57172513 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 57172526 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57172531 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57172715 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 57172815 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 57172835 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 57173111 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 19 57173296 C T Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 57173376 A G Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 19 57173443 C T Y Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 19 57173718 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57173738 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 57173857 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 57174458 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 57174475 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 57174645 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57175064 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 57175079 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 57175293 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 57175642 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57175782 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 57176192 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 57176255 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 57176656 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57176727 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57176821 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 57176847 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57176871 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 57176899 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 57176924 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 57176934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57176943 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 57176968 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 57177162 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 57177381 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57177412 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 57177413 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 57177440 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57177450 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57177552 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57177553 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57177564 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57177802 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57177825 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57177843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57178208 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57178865 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 57178868 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 19 57179001 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57179057 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57179081 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57179099 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 57179474 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 57181404 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57181415 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57181442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57181509 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57181525 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 57182080 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 57182172 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57182338 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 57182405 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 57182467 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57182813 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 57182941 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 57182986 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 57183174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57183744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57184895 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57185893 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57186116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57186828 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 57186946 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 57187026 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57187585 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 57188356 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.75 0.0625 0.1875 25 7 12 1 3 19 57189053 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 57189168 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 57189211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57189218 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 57189243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57189268 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57189362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57189610 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 57189681 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57189682 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57189763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57190059 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 57190065 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57190309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57190670 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 57191431 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 57191678 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57191840 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 19 57192173 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 57192175 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 57192338 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 57192364 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57193020 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 19 57193297 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 57193685 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 57193686 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 57193724 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57193799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57193828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57194060 A C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 57194068 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 57194123 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 57194186 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 57194261 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 57194344 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57194394 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 57194892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57195336 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 57195345 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57195439 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57195457 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57195470 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57195632 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57195639 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 57195653 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57197235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57197360 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 57197361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57197362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57197494 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 57197528 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57197531 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57197683 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 57197769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57197796 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 57197979 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 57198027 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 57198086 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 57198090 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 57198113 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57198185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57198278 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57198350 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 57198411 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57198689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57199400 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 19 57199690 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 57199834 G T N N 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 19 57199927 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 19 57199960 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 57200459 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 57201373 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 57201537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57201565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57201583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57201601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57201750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57201785 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57201955 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 57201970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57201971 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 57202141 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 57202144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57202153 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57202169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57202525 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 57202828 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 57203037 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 57203106 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 57203108 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 57203126 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 57203204 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 57203311 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 57203348 G C N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 19 57203399 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 19 57203402 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 57203405 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 57203408 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 19 57203473 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57203707 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 57203871 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 57203881 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 57203893 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 57203962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57204242 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 57204257 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 57204264 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 57204418 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 57204449 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 57204646 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 19 57204652 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 19 57204660 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 57204682 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 57204684 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 57204709 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 57204740 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57204857 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 57204901 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 57205437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57205622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57206122 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57206142 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 57206233 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57206240 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57206260 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57206322 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57206339 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 57206345 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57206357 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 57206412 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 57206440 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 57206582 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57206784 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57206796 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57207032 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57207100 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57207321 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 57207323 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 57207501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57207900 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57208099 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 57208251 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 57208359 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 57208420 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 57208512 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 57208690 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 57208691 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 57208723 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 57208749 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 57208845 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57208901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57209104 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 57209167 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 57209484 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 57209551 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 57209752 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57210457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57210495 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 57210990 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 57211915 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57212370 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 57213590 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 57213591 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57213858 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 57214017 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 57215536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57215782 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57216000 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 57216093 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 57216160 A T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 57216166 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 19 57216167 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 19 57216921 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 57217175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57217209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57218909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57219607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57220793 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57220841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57223111 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57223172 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 57223297 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 57223413 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 57223464 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57223465 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57223509 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 57223513 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 57223595 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 57223719 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 57223726 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 57223841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57223870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57223884 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57223907 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57223937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57223956 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57224223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57224853 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57224861 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57224935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57224971 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 57225051 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 57225325 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 57225429 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57225436 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57225508 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57225564 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 57225604 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 57225686 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57225700 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57225764 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57225853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57225857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57225896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57226027 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57226065 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 57226109 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57226115 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57226169 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 57226172 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 57226443 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57226547 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57226567 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57226660 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 57226948 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 57226954 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 57227109 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57227147 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 57227290 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 57227992 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 57228181 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 57228305 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 57228320 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57228358 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 57228371 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 57228532 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 57228635 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 57228636 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 57228658 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 57228724 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57228756 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 57228858 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57229263 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 57229322 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 57229449 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57229476 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57229880 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 57229894 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 57229978 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57229989 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 57230033 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 57230115 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57230203 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 57230231 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 57230565 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 57230577 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 57230653 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 57230709 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 57230790 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 57230896 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 57230960 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57231042 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 57231424 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57233889 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 57233953 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57234323 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 57234348 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 57234366 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 57234443 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 57234762 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 57234813 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57234896 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 57234953 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 57234958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57235004 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 57235210 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57235399 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 57235401 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 57235443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57235763 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57235944 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 57236021 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 57236185 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 57236336 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57236378 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 57236560 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57236581 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57236662 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 57237128 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 57237208 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57237329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57237387 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 57237642 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 57237658 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 57237820 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 57237825 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 57237945 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 57237985 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 57238206 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57238510 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57239254 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 57239306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57239634 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 57240565 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57240690 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57240788 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 57240850 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57241032 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 57241300 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 57241427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57241456 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57241873 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 57242013 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 57242107 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 57242172 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 57242245 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 57242303 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 57242588 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 57242670 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 57242750 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 57242754 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 57242874 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 57242978 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 19 57243069 G A N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 19 57243410 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 57243446 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 57243773 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 57243790 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57243841 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57243872 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 57243997 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57244299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57244398 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 57244582 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57245166 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 57245250 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 57245402 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57246000 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 57246001 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 57246107 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 57246177 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57246212 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 57246386 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 19 57246574 G A N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 19 57246606 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 19 57246727 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 57246772 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 57246813 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 57246862 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 57247292 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 57247349 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 57247350 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 57247658 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57247664 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57247673 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 57248045 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 57248086 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 57248264 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57248284 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 57248509 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 57248576 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 57248909 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 57249105 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57249141 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57249160 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 57249161 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 57249361 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 57250058 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 57250880 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 57251194 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 57251829 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 57251854 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 57251926 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 57252028 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 57252202 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 57252211 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 57252242 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 57252262 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 57252337 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 57252585 G T Y N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 57252679 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 19 57252681 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 19 57252815 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 19 57255415 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 57255589 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 57255946 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 57256651 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 57256838 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57259577 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57261214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57261832 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 57262072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57262108 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57262132 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57262169 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 57262181 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 57262306 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57262316 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57263791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57266818 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57266897 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57268581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57273345 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57275468 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 57275832 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 57275899 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 57275961 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 57276555 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 57276814 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 57276843 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 57276984 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 57277220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57277398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57277828 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 57278186 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 57278377 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 57278431 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 57278791 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57280380 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57280624 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57280820 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57280847 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57280969 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57280984 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 57281264 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 57281335 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 57281366 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 57281387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57281628 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 57281826 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 57282180 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 57282241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57282356 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 57282417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57282834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57282908 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 57282923 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57282990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57283033 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 57283141 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 57283232 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57283299 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57283348 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 57283399 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 57283440 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 57283633 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 57283647 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 57283798 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 57283855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57284000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57284067 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 57284115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57284322 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57284454 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 57284616 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 57284664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57284747 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57285128 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 57285148 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 57285166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57285282 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 57285435 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57285437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57285639 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57285710 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57285718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57286162 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 57286163 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 57286521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57286795 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 57286826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57287164 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57287166 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57287269 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 57287274 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 57287288 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 57287469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57287768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57287818 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57287839 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57287850 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57287882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57287940 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57288077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57288094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57288286 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57288370 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57288452 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57288467 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57289003 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57289061 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57289126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57289142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57289150 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57289180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57289254 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57289280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57289360 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57289414 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57289517 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57289706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57289723 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57289728 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57289830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57290031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57290112 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57290116 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57290125 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57290395 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57292095 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57292549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57292562 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 57292938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57292980 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57293612 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 57294209 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 57294211 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 57294218 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 57294831 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 57294845 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 57295036 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 57295040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57295042 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57295099 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 57295148 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 57295150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57295267 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 57295286 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 57295416 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57295578 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57295581 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57295620 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 57295639 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 57295685 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57295712 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 57295824 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57295833 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 57295886 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57296016 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 57296151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57296168 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 57297484 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57297517 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 19 57297641 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 57297659 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57297677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57298061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57298172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57298311 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 57298371 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 57299193 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57303203 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 57305344 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 19 57305417 A C N N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 19 57305552 C T N Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 19 57305556 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 19 57305563 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 8 6 2 4 1 19 57305818 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 57306031 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57306041 A T Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 57306151 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 57306160 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 57306172 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 57306235 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 57306292 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57306303 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57306335 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 57307071 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57307141 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 57307158 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57307237 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57307411 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 19 57307618 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57307642 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57307750 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 57307788 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57308892 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57309162 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 57309506 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 57309555 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 57310321 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 57310375 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 57310601 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 57310661 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57311077 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57311306 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57311315 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57311710 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 57311794 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 57311970 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 57312368 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 57312817 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 57312999 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 57313109 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57313149 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57313204 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 57313607 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57313857 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 57313951 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57313966 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 57314019 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 57314057 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57314157 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57314280 C G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 57314445 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 57314464 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 57314478 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57315032 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57315724 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57315902 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57316152 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 57316325 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 57316548 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57316832 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 57317181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57317370 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 57317373 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57317853 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 57317888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57317916 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 57317993 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 57318592 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 57319161 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 57319927 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57320039 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57320056 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 57320284 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 57320321 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 19 57320338 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 57320475 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 57320558 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 19 57320683 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57320734 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 57320796 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57320840 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57320904 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57321466 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 57321824 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57321905 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 57322027 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57322037 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57322055 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57322085 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 57322109 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57322626 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 57322631 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 57322762 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 57322774 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 57323188 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 57323234 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 57323248 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57323273 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 57323332 G C Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 57323425 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 57323541 T C Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 57323567 C G N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 19 57323632 C G N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 19 57323653 A T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 19 57324064 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 19 57324094 C A Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 57324532 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57324533 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57324647 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 57324749 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57325349 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 57325445 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 57325485 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 57325978 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 57326012 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 57326245 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57326296 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57326374 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57326494 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57326803 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57326839 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 57327116 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57327236 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 57327387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57327493 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 57327718 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57328690 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 57328752 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 57328822 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 57328829 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 57328844 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 57329301 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 57329571 C T N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 19 57329578 G A N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 19 57329748 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 57329793 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57329857 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 57330086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57330132 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 57330177 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 57330224 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 57330277 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 57330311 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 57330528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57330549 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57330559 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57330586 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57330641 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57330793 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57330812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57331272 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 57331563 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 57331564 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 57331897 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57331975 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 57332042 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 57332062 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57332078 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 57332262 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57332275 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57332427 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57332428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57332765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57333235 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 57333286 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57333481 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 57333522 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 57333528 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 57333539 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 57333672 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 57333680 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 57333722 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 57333735 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 57333760 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 19 57333769 A T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 19 57333794 A T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 19 57333958 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 57335671 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 57335999 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57336459 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57336485 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57336699 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 57336745 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57336766 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57336767 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57336934 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 57336993 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 57337039 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 57337047 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 19 57337086 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 57337104 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 57337163 G A N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 19 57337301 T G N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 19 57337520 T G N N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.181818181818182 0.454545454545455 0.363636363636364 9 13 2 5 4 19 57337783 T C N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 19 57337883 A G N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 19 57338089 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 57338216 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57338219 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57338603 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57338637 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 57338681 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57338794 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 57338890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57338902 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 57338971 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57339000 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 57343692 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57344163 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57345602 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57345676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57346077 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 57346204 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 57346370 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57346442 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57346462 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 57346520 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 57346631 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 57346785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57347074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57347120 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 57348575 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57349386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57349606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57350242 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 57350653 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 57350719 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 57350847 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 57350878 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 57350911 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 57350912 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 57351022 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 57351068 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57351093 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 57351144 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 57351202 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57351356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57351412 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57351427 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 57351462 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57351492 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57351627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57351638 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57351640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57351659 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57351710 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57351794 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57351808 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57351854 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57351916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57352278 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57352314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57352725 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 57352938 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57353060 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 57353737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57353956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57354051 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57354210 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 57354238 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 57354319 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57354892 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 57354988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57355000 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 57355055 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57355095 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 57355216 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57355461 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57356389 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 57356524 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 57356528 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 57356614 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57356637 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 57356659 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 57356769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57356786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57356862 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 57356971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57357058 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 57357612 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57357685 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 57357752 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57357942 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 19 57358333 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57358540 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57358583 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57358988 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57359074 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57359169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57359241 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 57359357 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57359418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57359586 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57359705 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57360805 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57361260 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57362097 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 57362098 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57362153 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57362266 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 57362875 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 57363388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57363498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57364551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57365402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57366586 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 57366999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57368306 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57369266 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57369312 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57369421 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 57369423 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 57370493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57370700 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57370842 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 57371009 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 57371219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57371555 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 57371664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57371841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57371848 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57371978 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57372065 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 57372209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57372226 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57374044 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57374312 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 57374848 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 57374849 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 57374936 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57374981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57376688 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57376839 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 57378354 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 57378431 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 57378540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57379813 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57382398 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 57382478 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 57382612 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 57382857 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 57383109 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 57383363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57383369 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57383469 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 57383873 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57383955 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 57383972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57384019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57384093 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 57384139 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57384424 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 57384429 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 57384444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57384458 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57384459 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57384508 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57384543 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57384544 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57384658 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 57384668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57384754 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57384764 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57384879 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 57384984 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57385143 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57385378 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57385562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57385599 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57385631 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57385955 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 57385982 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 57386160 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 57386162 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 57386246 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 57386320 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 19 57386321 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 57386604 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57386638 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 57386752 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 57386777 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 57386788 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 57386789 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 57387103 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 57387130 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57388279 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 57388280 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 57388306 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 57388312 G C Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 57388731 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 57389553 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57389706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57389716 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57390038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57390255 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 57390256 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57390282 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 57390347 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 57390398 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57390549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57391293 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 57391429 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 57391670 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 57391693 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 57391746 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57391891 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 19 57392291 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 57392305 G T N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 19 57392317 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 57392412 A G N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 19 57392438 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 19 57392463 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 57392695 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.4 0.133333333333333 0.466666666666667 14 16 6 2 7 19 57392781 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 19 57392830 C G N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 19 57392843 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 57392862 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 57392961 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 57393107 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 57393126 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 57393130 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 57393163 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 57393284 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 57393417 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 57393963 T G N N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 19 57394458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57394788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57394843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57394959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57395116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57395143 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57395377 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 57395415 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 19 57395432 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 57395564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57396253 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 57396295 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57396342 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57396445 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 57396464 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 57396480 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 57396839 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57397240 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 57397449 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 57397653 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 57397730 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 57397930 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 57398081 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 57398186 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57398203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57398594 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57398701 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 19 57398842 A G N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 19 57398852 C G N N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 19 57399260 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 57400072 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 57400163 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57400219 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57400223 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 57400235 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57400276 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57400284 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57400300 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 57400307 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57400662 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57400668 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57400677 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 57400712 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 57400744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57400795 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 57400880 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 57400925 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57401375 A C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 19 57402017 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57402022 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57402113 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57402301 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57402745 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 57402941 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 57403186 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 57403190 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 57403241 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 57403330 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57404819 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 57404941 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 57405189 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 19 57405261 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 57405324 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 57405353 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 57405415 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 57405418 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 57405575 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 57405590 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 57405618 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 19 57405750 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57405896 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57405951 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57405952 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57405961 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57405996 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57405998 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 57406009 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57406033 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57406120 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 57406124 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57406132 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57406170 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57406266 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 57407657 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 57408396 T G N N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.272727272727273 0.272727272727273 0.454545454545455 9 13 3 3 5 19 57408412 G C N N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.416666666666667 0.166666666666667 0.416666666666667 12 12 5 2 5 19 57408719 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 57408896 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 57409175 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 19 57409377 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 57409395 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 57409404 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 57409633 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 57409711 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 19 57409806 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 57409896 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 57409969 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 57409991 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 57410014 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 57410735 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57410775 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 19 57410781 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 19 57410782 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 57410828 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 57410996 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 57411223 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 57411282 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 57411426 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 57411458 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57411540 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 57411541 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 57411682 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 57411684 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 57411823 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 57411855 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 57411902 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 57412267 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 57412298 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.3125 0.125 0.5625 12 20 5 2 9 19 57412721 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57412744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57412760 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 57412819 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57412854 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57412868 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 57412901 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57412905 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57412975 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 57413019 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 57413070 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 19 57413192 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 57413202 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 57413231 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 57413379 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 57413381 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57413396 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57413402 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 57413438 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 57413484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57413755 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 57413817 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 19 57414041 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57414350 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 57414392 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 57414563 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 57414638 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 57414657 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 57414717 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 57414739 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 57414751 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 57414768 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 57414838 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 57414842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57414912 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 57414945 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 57415053 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 57415244 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 57415364 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 57415463 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57415485 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 57415537 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 57415922 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 57415977 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57416013 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 57416071 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 57416078 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 57416147 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 57416175 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 57416466 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 57416470 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 57416668 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57416707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57416769 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57416915 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 57416935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57416957 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 57416967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57416980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57416994 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57417132 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 57417817 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 57417842 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 57417917 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57418022 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57418027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57418034 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 57418199 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 57418262 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 57418365 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 57418447 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 19 57418532 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 57418606 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 57418747 T A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 19 57418752 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 19 57419206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57419265 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 57419386 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 57419400 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 57419462 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 57419477 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 57419774 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 57423427 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.4375 0 0.5625 14 18 7 0 9 19 57423499 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.8125 0 0.1875 26 6 13 0 3 19 57423587 A G N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.153846153846154 22 4 11 0 2 19 57423606 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 57424024 T C N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.181818181818182 18 4 9 0 2 19 57424089 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 57424267 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 19 57424359 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 57424375 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 57424597 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.176470588235294 0 0.823529411764706 6 28 3 0 14 19 57424612 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 19 57424807 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.428571428571429 16 12 8 0 6 19 57424820 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 57424862 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 19 57424958 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 57425429 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 19 57426301 T G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 57426384 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 57426502 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 57426518 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 57426853 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 57426871 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 57427166 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 19 57427171 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 57427190 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 57427259 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 57427372 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57427418 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 57427513 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 57427514 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 57427625 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57427643 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57427651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57427702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57427949 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 57427961 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 57427975 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 57428038 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 57428096 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 57428165 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 57428265 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 57428718 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 19 57428779 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 19 57429637 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57429672 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57429755 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57430138 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 57430586 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57430841 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57430882 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57430939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57430959 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57431001 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57431140 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 57431160 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 57432144 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 57432262 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 57432269 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 57432292 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57432328 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57432589 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 57433063 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 57433118 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 57433182 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 57433237 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 57433781 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 57433866 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 57433867 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 57433965 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 57434436 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 57434445 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 57434486 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 57434731 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 57434769 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 57434812 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 57434921 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 57435028 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 57435087 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 57435830 T C N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 19 57435866 T G N N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 9 9 3 3 3 19 57436335 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 57437207 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 19 57437327 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 57437590 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 57437592 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 57437790 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 57438220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57438380 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57438788 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57438837 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57439197 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 57439218 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57440270 G T N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 19 57440495 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 57440811 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 57442313 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 57442694 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 57442715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57442852 T G Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 57442860 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 57443097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57443321 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57443350 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57443492 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57443558 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57443752 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 57444208 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57444209 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57444284 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57444413 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57444596 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 57444646 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 57444658 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 57444673 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57444872 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 57444893 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 57444921 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 57444984 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 57445283 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 57445286 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 57445298 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 57445322 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 57445386 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57445427 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 57445823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57446142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57446465 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 57446520 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 57446529 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 57446604 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57446607 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57446633 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 57446835 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 57446905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57447072 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 57447086 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57447181 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 57447299 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 57447390 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 57447416 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 57447484 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 57447550 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 57447569 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 57447587 G C N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 19 57447611 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 57448077 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57448333 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 57448477 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 57448736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57448774 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 57448834 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 57449019 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 57449030 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 57449257 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 57449387 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 57449416 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 57449435 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 57449516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57449535 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 57449587 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 57449590 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 57449614 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 57449636 C G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 57449736 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 57449852 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 57449896 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57449915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57449916 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57450049 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 57450092 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 57450118 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 57450777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57450948 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 57451061 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57451079 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 57452419 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 57452448 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 19 57452449 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 57452460 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 57452526 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 57452683 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 57452730 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 57452891 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 57452912 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 57453125 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 57453233 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 57453609 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 57453671 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 57453701 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 57453863 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 57454524 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 57454783 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 57454878 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 57455053 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 57455120 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 57455216 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 57455270 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 57455277 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 57455302 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 57455304 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 57455334 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 57455459 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 57455477 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 57455606 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57455657 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 57455764 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 57455884 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 57455953 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 57455996 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 57456244 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57456289 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 57456327 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 57456449 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 57456504 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 57456698 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 57457023 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 57457081 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 57457377 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57457447 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 57457463 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 57457487 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 57457503 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 57457621 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 57457681 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57457933 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 57458137 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 57458197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57458530 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 57458531 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 57458628 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 57458708 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 57458778 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 57459679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57459837 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 57459924 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 57459957 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 57460746 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 57460976 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 57461030 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 57461306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57462082 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 57462408 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 57462657 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 57462887 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57462897 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57463016 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57463154 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57463223 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 57463615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57463899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57463946 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 57464132 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 57464620 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 57464714 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57464743 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 57465186 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 57465187 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 57465207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57465234 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 57465360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57465553 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 57465682 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 57465801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57466150 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57466234 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 57466242 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 57466285 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57466299 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 57466303 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 57466325 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 57466403 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 57466477 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 57466521 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 57466558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57466978 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 57467000 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 57467035 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 57467170 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 57467584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57467697 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 57467853 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57467881 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 57467883 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 57468107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57468375 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 57468401 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 57468488 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 57468548 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 57468584 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 57468600 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 57468707 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57468743 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 57468826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57468857 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57468899 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 57469007 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57469024 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57469116 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 57469138 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 57469174 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 57469183 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 57469186 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 57469249 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 57469381 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 57469784 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 19 57469937 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 57470213 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 57470224 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 19 57470245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57470450 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 57470468 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 19 57470602 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57470616 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57470644 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 57470750 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 57470764 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 57470906 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57471022 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 57471589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57471633 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57471724 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57471730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57472382 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 57472478 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57472501 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 57472525 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57472599 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 57472616 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 57472618 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 57472768 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 57472794 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 57472833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57473333 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 57473438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57473461 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57473492 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 57473523 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57473603 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57473831 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 57473855 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57474049 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 57474274 A T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 57475709 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 57478125 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 19 57478678 T C Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 57480099 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 57481162 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 57481241 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 57482250 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 57482304 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 57482354 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 57482366 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 57482683 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 57482964 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 57483027 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 57483165 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 57483332 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 57483613 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 57483650 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 57483725 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 57484328 G A Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 57484457 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 57484681 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57484833 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 57485500 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 57485564 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 19 57486780 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57487972 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57488420 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 57488440 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 57488553 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 57488590 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 57489070 G A Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 19 57489382 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 57489992 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 57489993 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 57489997 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57490013 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57490756 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 57491886 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 57492027 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57492482 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57492564 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 57492840 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57493184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57493304 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 57493430 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57493501 C G Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 57494062 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57494998 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 57495584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57495760 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 57495813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57495955 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 57495957 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 57495978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57496049 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 57496102 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 57496339 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 57496370 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 57496465 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57496723 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 57499217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57505963 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 57506078 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 57506487 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 57507180 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 19 57507295 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57507329 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 57507800 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 57507827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57507917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57508222 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57508450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57509676 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57509979 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 57510100 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 57510250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57510334 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57510762 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 57510888 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 57510913 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 57511016 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 57511305 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57511827 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 57513332 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 57513472 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 57513481 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 57513492 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 57513582 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57513645 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 57514732 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 57515357 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 57515373 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 57515630 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57515665 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 57517138 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 57519109 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 57519217 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57520772 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57521265 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57521625 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 57522127 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57522718 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 57524143 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 57524478 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 57524704 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 57526130 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 57526906 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 57526925 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 57527851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57527949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57528014 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57528021 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57528080 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 57528097 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 57528132 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57528152 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 57528156 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57528157 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57528196 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57528199 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57528212 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57528243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57528255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57528458 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57528517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57528558 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 57528766 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 57528769 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57528777 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57528785 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57528962 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 57529047 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 57529120 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 57529353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57529364 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 57529760 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57530386 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 57530679 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57530883 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 57531086 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 57531145 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 57531329 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57531387 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57531506 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 57531562 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57531696 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57531721 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 57533700 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57535207 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57535669 A T N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 19 57536414 T G N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 19 57536514 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 57536642 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 57536706 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 19 57536803 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 57536863 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 57536916 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 57536930 A T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 57537040 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57537239 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 57537304 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57537400 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57537413 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57537414 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57537428 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57538394 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 57538574 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 57538606 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 57538933 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57539121 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 57540222 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 57540927 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 57540972 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57541154 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57541191 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 57541297 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57541355 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57541536 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57541798 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57541832 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 57541921 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57542139 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 57542314 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 57542367 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 57542428 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 57542900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57542970 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 57542975 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 57543306 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 57543326 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 57543347 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 57543630 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 57543740 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 57543765 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 57544137 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 19 57544268 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 57544318 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 57544320 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 57544405 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 57544438 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 57544644 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 57544645 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 57544658 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 57544734 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 57544888 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57545087 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 57545089 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 57545106 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 57545387 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57545409 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 57545743 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57545849 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57545939 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57546013 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 57546126 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 57546294 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57546862 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57547600 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 57547856 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 57548213 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57548350 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 57548427 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57548949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57549174 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57549570 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57549831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57549987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57550217 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57551794 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 57551807 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 57552032 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 57552077 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 57552114 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57552164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57552178 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57552192 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57552326 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 57552466 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57552573 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 57552715 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57553763 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57555333 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57555570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57555943 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57556018 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57556125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57556182 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57556185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57556274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57557303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57557973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57558339 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 57558341 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 57558368 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 57558910 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57558938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57559301 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57559397 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 57559950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57560060 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 57560065 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57560428 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57561708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57563439 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57563831 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57563832 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57563977 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 57564083 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57564139 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 57564142 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 57564288 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57564423 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57564448 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57564929 T C N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 19 57564994 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 19 57565020 A T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 19 57565212 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 57565382 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57565640 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 57565766 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 57566471 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 57566544 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 57566763 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 57566866 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 57567069 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 57567220 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 57567276 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 57567362 C T N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 19 57567657 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 57567759 G T N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 19 57567923 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 57567965 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 57567991 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 19 57568076 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57568106 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57568119 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 57568288 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 57568317 G C N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 19 57568637 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 57568798 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 57568963 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 57569009 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 57569029 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57569205 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 57569206 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 57569583 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 57569708 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 57569728 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 57569769 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 57570001 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 57570003 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 57570813 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57571411 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57571440 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57571493 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57571611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57571647 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 57571721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57571912 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 57571998 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 57572017 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57572074 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 57572233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57572365 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57572435 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57572483 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 57572955 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 57573130 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 57573133 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 57573151 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 57573163 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 57573211 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 57573415 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57573559 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 57573675 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 57573783 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57573792 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57573869 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 57573950 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 57573971 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57574253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57574586 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57575005 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 57575604 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 57575699 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 57575921 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 57575941 C G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 57576017 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 57576139 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 57576364 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57576410 C G Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 57576668 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57576684 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57576703 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57577529 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57577801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57579520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57580211 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 57580237 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 57580302 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57580523 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57580715 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57580727 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 57581078 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 57581086 T G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 57581110 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 57581301 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 57581589 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57583073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57583117 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 57583394 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 57583715 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57584368 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 57584675 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57585007 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 57585280 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 57586626 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 57587053 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 57587098 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 57587105 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 57587141 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 57587152 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 57588385 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 57597252 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57597412 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 57597518 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 57597599 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57597666 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 57597718 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57597863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57598075 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57598206 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 57598259 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 57598347 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 57598431 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57598460 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 57598474 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 57598526 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 57598610 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 57598661 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57598666 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57598756 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57599170 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 57599383 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 57599455 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57599569 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 57600322 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 57600449 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 57601676 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57601693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57601816 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 57601860 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 57601990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57601998 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 57602017 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 57602096 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 57602114 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 57602314 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 57602467 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 57602804 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 57602820 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 57602832 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57602880 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57603098 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57604126 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57604145 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57604160 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 57604180 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 57604270 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 57604349 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 57604530 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57604601 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 57604629 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57604642 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57605020 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57605060 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57605233 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 57605259 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57605297 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 57605373 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 57605432 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57605441 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 57606302 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57606551 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57606621 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 57606625 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57606745 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 57606751 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 57606850 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 57606987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57607169 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 57607271 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 57607375 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57607376 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57607388 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57607412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57607836 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 57607936 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 57607941 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57607942 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57607962 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 57608317 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 57608329 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 57608357 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57608402 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57608467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57608762 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 57608799 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57608947 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57608961 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 57609094 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 57609110 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 57609297 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 57609401 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 57609630 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 57609653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57609749 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 57609789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57609832 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 57610105 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 57610136 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 57610170 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 57610581 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 57610921 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57610947 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57611330 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 57612131 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 57612328 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 57612387 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 57612441 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 57612513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57612703 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 57612904 G T N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 19 57612926 T C Y Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.545454545454545 0.272727272727273 0.181818181818182 15 7 6 3 2 19 57612949 T G N N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 19 57613294 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 57613448 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 57613513 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 57613557 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 57613628 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 57613744 T G N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 19 57613829 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 57613970 A T N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.3125 0.125 0.5625 12 20 5 2 9 19 57614000 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 57614081 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 57614096 A C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 57614135 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 57614278 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 57614465 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 57614481 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 57614483 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 19 57614548 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 57614612 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 57614625 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 57614850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57614998 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 19 57615034 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 57615038 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 57615138 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57615277 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57615315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57615382 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 57615681 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 57615871 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 57615886 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 57615904 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 57615934 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 57616086 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 57616153 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 57616204 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57616236 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57616256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57616463 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57616679 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57616779 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 57616833 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 57616836 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 57616975 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 57616992 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 57617009 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57617026 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57617129 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 57617135 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 57617336 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 57617337 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57617428 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 57617431 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 57617451 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 57617647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57617649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57617652 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57617714 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57617763 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 57617826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57617921 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57618004 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 57619765 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 57620290 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 57620302 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 57620306 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 57620489 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 57620495 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 57620536 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 57620872 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 57620976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57620978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57620981 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57621175 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57621242 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 57621776 C G Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 57621785 A C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 57621802 A T Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 57621807 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 57621859 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 19 57621861 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 19 57622011 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 57622245 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57622382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57622533 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57622553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57622600 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 57622605 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 19 57622606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57622656 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 57622671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57623082 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57623106 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57623130 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57623178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57623188 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57623203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57623279 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57623296 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57623390 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57623446 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57624243 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 57624258 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 57624275 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 57624364 T A Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 57624578 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 57624649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57624705 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 57625048 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57625094 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57625096 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 57625206 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 57625248 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 57625338 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57625377 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57625933 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57626021 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57626044 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57626061 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 57626076 T G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 57626101 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57626128 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 57626460 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57626463 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57627442 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57627450 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57627612 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57627695 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57627841 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57627861 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57627939 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 57628100 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 57628289 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 19 57628447 G T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 19 57628549 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57628701 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57628723 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57628763 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 57628807 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 57628969 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57629254 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 57629270 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 57629328 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57629544 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 57629546 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 57629593 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 57629735 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 57629847 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 57629988 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 57630312 G T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 57630361 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 57630366 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 57630373 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 57630399 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 57630452 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 57630478 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 57630658 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 57631201 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57631251 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 57631385 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 57631533 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 57631630 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 57631642 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 57631647 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 57631660 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 57631695 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 57631703 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 57631709 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 57631726 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 57631767 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 57631788 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 57631823 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 57631896 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 57631955 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57632097 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 57632142 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 57632157 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 57632189 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 57632259 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 57632313 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 57632726 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 57633242 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 57633251 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 57633327 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 57633495 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57634003 G C N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 19 57634020 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 57634556 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 57634632 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 57635740 C A Y N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 19 57636116 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 57637427 T C N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.583333333333333 0.0833333333333333 0.333333333333333 15 9 7 1 4 19 57637971 T G N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 19 57638281 T C Y Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 19 57638696 C T Y Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.428571428571429 0.142857142857143 0.428571428571429 7 7 3 1 3 19 57638729 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 10 8 4 2 3 19 57638731 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 11 7 5 1 3 19 57638749 C T Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 11 5 5 1 2 19 57639026 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 57639259 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 57639756 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57639905 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 57639931 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 57640020 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57640132 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57640298 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 57641300 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 57641605 C A Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 57641719 T C Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 57642197 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 57642275 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 57642403 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 57642486 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57642497 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 57642861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57642888 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 57642953 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57642964 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 57643006 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 57643681 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57644083 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 57644135 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 57644137 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 57644579 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 57644587 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 57644686 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57644698 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57644776 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 57644822 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 57644843 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 57645206 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 57645217 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57645413 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 19 57645414 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 57645543 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57645552 G T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 57645559 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 57645614 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57645672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57646233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57646366 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 57647347 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 57649040 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57649092 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57649182 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57649228 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 57649258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57649272 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 57649325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57649483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57649731 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 57650581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57650618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57650628 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57650641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57650944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57651012 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 57651119 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 57651120 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 57651901 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57652058 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 57652939 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 57652951 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57653191 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 57653632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57653910 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57654132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57654218 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57654284 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 57654347 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57654363 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57654714 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 57655005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57655064 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57655195 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 57655312 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 19 57655690 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 57655693 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 57655716 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 57656261 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 57656325 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 57656373 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 57656737 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 57657043 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 57657330 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57657432 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57657524 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57657580 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 57657581 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 57657658 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57657722 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 57657724 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 57657727 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 57657750 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 57657753 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 19 57657949 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57657999 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57658167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57658182 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 57658199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57658206 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 57658269 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57658320 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 57658326 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 57658365 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 57658404 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57658424 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 57658425 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 57658428 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 57658488 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 57658516 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 57658517 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 57658522 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 57658691 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 57658818 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 57659255 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57659333 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57659406 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 57659462 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 57659503 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 57659609 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 57659631 A C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 19 57659682 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 57659725 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 57659822 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57660000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57660184 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57660478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57660962 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 57660966 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 57660974 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57661006 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57661203 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 57661365 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 57661524 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 57661785 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 57661802 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 57661844 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 57661865 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 57661875 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57661967 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 57661973 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 57661987 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 57662001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57662032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57662045 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57662084 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57662117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57662130 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57662141 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 57662201 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 57662217 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 57662281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57662311 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57662399 A T Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 57662629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57662635 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 57663454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57663471 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 57663486 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 57663529 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 57663533 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 57663585 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 57663848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57664178 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 57664389 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 57664616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57664697 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57664898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57665056 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 19 57665129 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 57665493 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 57665749 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 57665884 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57665933 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 57665952 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 57665981 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57666157 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57666186 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57666290 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 57666767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57666959 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57667384 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 57667671 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 57668406 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 57668603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57668838 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57669673 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 57670117 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 57670346 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 19 57670349 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 19 57670400 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 57670492 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 57670568 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 57670685 A T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 57670730 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 57670754 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 57670833 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 57671012 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 57671086 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57671116 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 57671160 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 57671242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57671268 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 57671272 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 57671313 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 57671371 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57671384 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 57671609 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 57671678 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 57671696 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 57671798 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 57671820 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57671899 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 57671927 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57671935 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57671946 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 57672285 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 57672424 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 57672553 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 57672753 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 57672798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57672809 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57672813 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 57672825 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 57673309 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 19 57673310 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 19 57673499 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5 0.1875 0.3125 19 13 8 3 5 19 57673633 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 57673677 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 57673831 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 57673904 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 19 57674469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57674714 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 57674977 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 57675003 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57676388 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57676985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57677755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57678318 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 57678888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57679194 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57679234 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57679761 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 57679861 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57679911 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57679920 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57680134 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57680442 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 57680769 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57680784 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 57680919 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57680931 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 57680965 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57681027 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57681101 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 57681311 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 57681493 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 57681758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57682025 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57682097 T G N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.214285714285714 0.642857142857143 0.142857142857143 15 13 3 9 2 19 57682479 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57682649 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 57683080 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 57683137 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57683421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57683531 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57683547 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 57683689 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57683854 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57684096 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 57684168 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57684761 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 57684762 G A Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 19 57684840 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 57684857 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57684981 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 57685033 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 57687147 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 57687282 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 57687643 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 57687745 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57687777 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 57687860 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 57688058 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 57688091 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57688172 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 57688173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57688286 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 57688346 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 57688367 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 57688385 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 57688576 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57688582 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57688805 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 57688903 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 57689072 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 19 57689400 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57689416 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 57690122 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 57690142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57690325 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 57690357 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 57690496 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57690527 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57691220 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 19 57691577 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 19 57691828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57692208 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 57692286 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 57692421 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57692424 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57692432 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57692441 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57692560 C G Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 57692771 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 57692797 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 57692841 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 57693511 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57693888 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 57694488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57694633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57694779 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 57694925 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 57694952 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 57695184 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 57695258 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 19 57695436 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 19 57695870 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 57696287 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 57696395 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57696668 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 57696909 A G N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 19 57696951 A C N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 19 57697076 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 57697303 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 19 57697670 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 19 57698102 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 57698324 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 57698496 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 57698554 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 57698603 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 57699868 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57699869 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57699890 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 57700064 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57700112 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57700184 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57700225 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57700235 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57700355 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57700362 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 57700587 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 57700622 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57700628 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57700652 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 57700663 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 57700943 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 19 57701181 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 57701784 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 57701786 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 57702270 T C N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 19 57703266 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 57705043 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57705533 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57707134 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57710694 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57711443 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 57711609 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 19 57711667 T G Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 19 57711897 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 19 57712345 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 57712895 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 57713145 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 57713491 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 57713533 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 57713585 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 57714671 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 57714720 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 19 57714816 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 57714968 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 57715400 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57716032 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 57716277 G T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 19 57716438 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 57716447 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 57716469 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 57716473 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 19 57716474 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 57716483 C A Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 19 57716698 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57716699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57716737 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57716748 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57716891 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 57717333 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 57717349 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 57717382 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 57717818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57717892 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 57717915 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57717919 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 57718055 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 57718083 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 57718137 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57718197 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 57718217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57718473 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 57718672 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57718682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57718912 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57719239 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57719269 C G N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 15 15 6 3 6 19 57719289 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 19 57719298 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 57719364 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 19 57719385 T A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 57719597 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57719598 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57719730 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57719740 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57719747 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57719759 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 57719766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57719807 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57719914 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 57719997 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 57720189 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57720229 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 57720317 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 57720919 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 57721043 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 57721069 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 57721114 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 57721124 A T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 57725927 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57727739 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 57728277 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 57728349 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 57736808 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 57737345 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57737978 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 57738142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57738545 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 57738879 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 57738922 C G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 57739137 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 57739206 G T Y N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.181818181818182 0.636363636363636 0.181818181818182 11 11 2 7 2 19 57739417 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57739514 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 57739532 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 57739552 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 57739577 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 57739630 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 57739913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57740122 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 57740216 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 57740357 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 57740373 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 57740806 C G N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.4 0.133333333333333 0.466666666666667 14 16 6 2 7 19 57740811 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 57740826 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 57740830 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 57740841 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 57740879 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 19 57740944 T G N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 19 57740949 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 19 57740984 A C N N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.166666666666667 0.75 0.0833333333333333 13 11 2 9 1 19 57741000 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 19 57741071 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 19 57741078 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 19 57741094 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 57743248 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 57743722 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 57743791 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 57743802 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 57743963 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 19 57744966 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 57748114 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 57748243 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 57748248 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 57748259 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 57748281 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 57748530 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57748552 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 57748700 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 57748806 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 57748878 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 57749131 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 19 57749169 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 19 57749175 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 19 57749487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57749761 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 57749825 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 57750026 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 19 57750065 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 57750131 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 57750774 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 57750776 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 57750933 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 57752367 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 19 57752523 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 57752526 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 57753078 C G Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 19 57754117 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 57754322 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57757108 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57757564 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 57758023 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 57758069 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 57758085 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 57758182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57758267 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 57758690 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 57758760 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57758922 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 57758928 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57758933 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57758936 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57759021 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 57759054 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57759066 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57759072 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57759077 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57759127 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 57759238 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 57759293 A G Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 57759365 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 19 57759376 G C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 19 57759419 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5625 0.125 0.3125 20 12 9 2 5 19 57759460 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57759533 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 57759731 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 19 57759939 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 19 57759974 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 57759988 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57759997 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 57760308 C A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 19 57760311 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 57760333 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 19 57760388 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 57760460 C T N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 19 57760586 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 57760662 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 57760686 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 57760696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57760739 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 57760758 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 57760779 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 57760817 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 57760850 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 57760896 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 57760942 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 57761781 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57761800 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 57762031 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 57762074 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 57762086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57762136 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 57762138 G T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 57762319 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 57762409 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 57762413 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 57762469 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 57762574 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 57762639 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 57762725 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57763000 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57763204 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 57763255 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 57763328 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 19 57763335 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 19 57763366 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 19 57763380 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 19 57763413 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57763507 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 57763708 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 57763712 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 57763907 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 57763911 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 57763947 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57764155 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57764274 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 57764527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57764546 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 57764615 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57764667 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57764668 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 57764777 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 57764790 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 19 57764834 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 57764867 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 57764936 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 57764946 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 19 57765154 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 19 57765159 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57765202 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 19 57765475 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 57765696 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 19 57766127 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 57766401 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 57766413 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 57766461 G C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57766523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57766524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57767260 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57767272 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 57767429 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57767647 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 57767715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57767796 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 57767914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57768398 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 57768878 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 57769034 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 57769357 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 57769374 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 57769453 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 57769550 T C Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 57770219 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 19 57770270 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 57770432 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57770556 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 57770991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57771005 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 57771661 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 57771769 G C Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 19 57771781 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 57771834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57772284 C A Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 57772392 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 57772416 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 57772439 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 57772779 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 57772787 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 57772818 A C N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 19 57772841 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 57772885 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 57773317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57773762 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57773773 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 57773778 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57774268 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57774803 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 57774834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57774911 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57774923 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57775006 T G Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 57775026 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 57775032 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 57775086 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 57775140 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57775190 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57775300 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57775366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57775396 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 57775431 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57775439 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57775504 G T Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 57775506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57775533 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 57775579 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 57775630 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57775725 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57775839 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 57775861 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57775902 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 57775932 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 57776009 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57776014 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57776091 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 57776103 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 57776158 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57776160 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57776161 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57776176 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57776186 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 57776194 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57776371 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 57776373 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 57776593 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 57776799 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 57776825 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 57776840 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 57777025 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 57777259 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57777281 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57777292 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57777457 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57777515 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 57777640 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 57777643 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 57777757 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57777859 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 57777970 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 57778078 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 57778169 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 57778218 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57778251 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57778260 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57778408 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57778449 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 57778451 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 57778463 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 57778584 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 57778676 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57778767 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57778770 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 57778853 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 19 57778877 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 57778923 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57778933 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57779067 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 57779097 G T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.4375 0.1875 0.375 17 15 7 3 6 19 57779214 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 57780115 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 57780410 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 57780525 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 57781454 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57781906 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 57782067 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 57782070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57782158 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57782161 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57784422 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 57784651 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57785122 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 57786292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57786312 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 57786481 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 57786483 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 57786503 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 57786539 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 57786565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57786762 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57786929 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57786980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57787195 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 57787322 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57787323 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 57787690 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 57787701 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 57787974 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57787981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57788942 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 57789009 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 57789479 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 19 57790022 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 57791602 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 57791761 T A Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 19 57791934 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 57795036 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57795071 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 57796531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57798276 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57798429 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57802176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57802361 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57802436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57803378 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57803506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57803732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57804231 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57804901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57805328 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57805801 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 57805920 T A Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 57806998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57808270 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 57808741 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 19 57808829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57809179 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 19 57809386 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57809703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57811450 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 57811849 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57812099 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 57812100 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57812162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57812218 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 57812266 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57812292 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57812318 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57812320 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57812413 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57812503 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57812631 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 57812633 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 57812636 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 19 57812654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57812682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57812730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57812758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57812774 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57812781 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57812823 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 57812828 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57812832 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57812986 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 19 57813010 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 57813049 A T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 19 57813112 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 19 57813118 G A N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 19 57813121 G T N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 19 57813218 T C N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 19 57813261 A C N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 19 57813550 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 57813609 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 57813656 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 57813691 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 57813692 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 57813755 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 57813835 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57814087 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57814140 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 57814197 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 57814211 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 57814271 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 57814300 A T N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 19 57814303 C T N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 19 57814304 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 19 57814316 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 19 57814536 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 19 57814553 G A N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 19 57814607 G A N Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 19 57814614 C T N Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 19 57814806 A G N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 14 6 6 2 2 19 57814813 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 12 6 5 2 2 19 57815091 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 19 57815420 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 57815467 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 57815759 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 57815766 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 57815887 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 57815915 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 57815958 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 57815968 A C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 57815969 G T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 57816076 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 57816199 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 57816489 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 57816535 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57816580 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 57816596 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 57816616 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 57816644 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 57816763 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 57816888 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 19 57816912 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 57816925 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 19 57817042 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 57817073 T G Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 19 57817085 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 57817113 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 57817148 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 57817162 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 57817298 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57817325 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 57817364 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 57817381 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 57817779 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 57817787 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 57817892 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 57817905 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 57817921 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 57818020 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 57818145 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 57818147 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 57818158 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 57818164 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 57818199 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 57818219 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 57818240 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 57818311 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 57818398 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 19 57818431 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 19 57818440 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 57818464 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57818467 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 57818667 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 57818671 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 57818697 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57818727 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 19 57818789 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57819021 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 19 57819194 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 57819563 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57821071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57821321 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57821800 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 57821803 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 57822254 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57826738 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 57826958 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 57828147 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57828723 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57829121 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57831110 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 19 57831111 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 19 57831622 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57832242 C A Y N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 19 57832522 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57832686 T C Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 19 57832816 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 19 57832960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57834589 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 57835324 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 57835432 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 57835501 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57835548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57835739 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 57835981 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 57835983 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 57836069 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 57836082 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 57836099 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 57836188 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 57836399 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 57836411 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 57836470 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 57836472 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 57836511 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 57836525 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 57836527 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 19 57836698 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 19 57836711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57836800 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 19 57836829 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 19 57837089 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 57837144 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 57837182 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 57837273 T A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 57837427 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 57837515 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 57837559 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 57837664 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57837712 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57837738 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 57837811 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 19 57837833 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 57837950 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57838008 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 57838107 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 57838142 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 57838149 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 57838166 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57838230 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 57838328 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 57838348 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 57838442 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 57838467 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57838589 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 19 57838713 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57838721 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57838785 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 57838849 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 57838851 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 57838866 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 57839108 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57839179 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 57839500 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 57839503 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 19 57840322 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 57840323 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 57840379 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 19 57840654 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 19 57840679 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 57840730 T A Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 57840737 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 19 57840760 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.352941176470588 0.117647058823529 0.529411764705882 14 20 6 2 9 19 57840865 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 57840891 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 57840995 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 57841012 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57841032 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 19 57841040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57841132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57841673 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 19 57842019 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 57842217 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 57842260 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 57842347 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 57842377 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 57842386 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 57842391 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 57842489 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 57842520 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 57842547 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 19 57842575 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57842605 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 57842630 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57842645 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57842663 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57842674 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 57842889 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 57843007 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 57843008 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 57843010 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 57843020 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 57843077 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 57843080 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 57843225 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 19 57843258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57843290 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 57843529 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57843533 T A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 19 57843999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57844229 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57844339 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 19 57844568 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 57849672 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57850395 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57852255 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 57852986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57853942 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 57854258 G T Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 57854372 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57854429 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 57854908 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57855074 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57855076 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57855184 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57855207 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57855261 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57855406 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 57855434 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57855444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57855640 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 57855780 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 57855791 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 57855814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57855846 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57855933 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57856017 T A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 57856186 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57856214 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57856216 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 57856218 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57856353 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57856365 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57856470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57856854 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 57856885 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57856886 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 57857097 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57857254 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57857317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57857337 T A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 19 57857343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57857374 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57857378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57857384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57857416 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57857559 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57857562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57857580 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57857586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57857613 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57857684 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57857705 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57857748 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57857786 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57858017 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57858036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57858087 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57858141 A G Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 57858291 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57858855 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 57858861 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57859043 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 57859131 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 57859529 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 57859701 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57859741 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57860089 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 57860406 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 57860644 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 57860712 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 57860927 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 57860954 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 57861693 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 57861773 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 57861999 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 57862246 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57862542 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 57862570 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 57862743 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 57862789 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 57862823 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 57863354 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57863380 T A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 19 57863595 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 57863639 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 57863751 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 57863752 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 57863774 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57863838 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 57863863 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 57863887 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 57863893 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 57863912 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 57863928 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 57864107 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57864210 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 57864383 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57864420 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 57864457 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 57864480 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 57864665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57864952 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57864954 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57864969 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57865003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57865063 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 57865064 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 57865068 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 57865090 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57865424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57865457 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 57865512 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 57865580 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 57865608 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57865692 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 19 57865758 G C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 57865759 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 57865988 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 19 57866017 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 57866035 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 19 57866036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57866063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57866360 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 57866369 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57866450 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 57866620 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 57866687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57866708 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 57867023 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 57867033 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 57867081 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 19 57867195 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 19 57867216 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 19 57867267 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 57867347 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 57867442 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 57867610 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57867682 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 57867896 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 57867974 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 57868275 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 57868347 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 57868421 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 19 57868464 C A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 19 57868478 A C N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 19 57868480 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 57868558 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.0666666666666667 0.666666666666667 0.266666666666667 12 18 1 10 4 19 57868788 C G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 19 57868992 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 57869015 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 57869099 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 57869150 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 57869282 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 57869545 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57869754 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 57871253 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 57871287 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 57871292 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 57871578 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 57871645 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 57871652 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 57871791 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 57871810 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57871885 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 57872041 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 57872042 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 57872244 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 57872468 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 57872637 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 57872738 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 57872901 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 57873534 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 57874014 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 19 57874147 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 57874163 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 57874222 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 57874292 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 57874400 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 57874421 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 57874585 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 57875002 G T Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 19 57875039 C A Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 57875094 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 57875294 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 57875328 T A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 57875448 A C Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 57875466 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 57875885 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 57875923 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 57876438 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 57876632 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57876839 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 57876877 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 57876890 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 57877053 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 57877138 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 57877230 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 57877371 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 57877425 T G Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 57877426 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 57877628 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 57877888 T G Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 57878094 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57878102 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 57878198 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 57878325 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 57878345 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 57879019 T A Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 57879238 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 19 57879356 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 57879364 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 57879434 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 57879477 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 57879479 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 57879667 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 57879678 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 57879856 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 57880159 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 57880172 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 57880638 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 57880769 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57881083 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 57881085 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 57881095 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 57881111 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 57881187 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 57881215 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 19 57881304 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 57881438 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 57881463 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 57881550 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 57881590 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 57881632 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 57881667 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 57881690 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 57881703 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 57881727 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 57881752 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 57881793 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 57881844 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 57881947 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 57882141 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 57882176 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 57882383 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57882549 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 57882737 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 57882893 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 57883292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57883304 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 57883374 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 57883410 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 57883492 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 57883511 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 57883579 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 57883641 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 57883657 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 57883789 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 57883814 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 57883853 T A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 19 57883886 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 57883997 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 57884352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57884596 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 57884640 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 57884645 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 57884756 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57884836 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 57884924 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 57885091 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 57885181 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 57885262 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 57885271 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 57885670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57885704 G C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57886134 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57886218 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57886299 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57886448 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 57886544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57886599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57886664 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57886731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57886847 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57886932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57887005 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57887074 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57887141 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 57887150 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57887160 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57887187 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57887287 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57887321 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 57887356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57887395 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57887410 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57887527 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 57887709 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57888246 C G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 57888491 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 57888567 T C N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.545454545454545 0.454545454545455 6 16 0 6 5 19 57888766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57888805 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57889056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57889057 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57889094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57889136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57889344 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57889357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57889717 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57890051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57890055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57890087 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57890228 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 57890260 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57891146 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57891286 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 57891292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57891690 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57892064 G T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57892188 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57892721 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57892973 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57894208 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 57895123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57895597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57895669 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57895675 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 57896075 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57896343 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57896503 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57896807 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57897611 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57900462 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57900470 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57900633 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57907582 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57907619 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57907758 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57907942 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57908275 T A N N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 19 57908702 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57908753 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57908811 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57908862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57909041 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57909144 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 57909478 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57910114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57910118 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57910392 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57910542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57910887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57911010 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57911011 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57911445 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 57912210 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57912444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57912720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57913350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57913528 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57913535 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57913688 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57913746 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57913909 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57913918 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57913968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57914174 A C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57914211 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57914235 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57914790 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57914884 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57914912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57915154 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57915438 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57915671 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 57916174 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57916583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57916928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57917048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57917150 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57917868 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57917936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57917998 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57918127 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 57918195 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57918257 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57918290 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57918310 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57918315 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57918351 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57918386 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57918389 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57918531 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57918640 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57918893 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 57919277 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 57919351 T C N Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 19 57919374 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 57919475 G A N Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 19 57919487 T C N Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 19 57919510 A G N Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 19 57919715 G C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 57919875 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 57919883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57919888 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57920150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57920247 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57920259 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 57920280 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 57920337 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 57920374 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 57920375 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 57920450 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 57920457 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 57920599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57920615 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57920689 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57920696 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57920766 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57920826 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57920873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57920875 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 57920898 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57920906 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57920964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57921053 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57921059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57921103 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57921108 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57921258 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 57921368 A T N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 19 57921457 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57921464 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 57921560 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57921653 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57921673 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57921720 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 57922104 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 57922154 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57925281 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57925289 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57925906 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57925928 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 57926071 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 57926184 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 57926185 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 57926201 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 57926202 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 57926211 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 57926258 C A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 19 57926300 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 57926313 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 57926372 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 57926398 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57926650 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57926679 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57926870 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57926984 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57926989 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57927132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57927369 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57927415 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 57927698 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57927860 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57928041 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57928050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57928088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57928411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57928437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57928547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57928636 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57928641 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57928691 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57928854 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57928903 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57928944 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57929095 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57929097 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57929284 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57929361 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 57929362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57929567 A T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57929586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57929633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57929773 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57929793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57929935 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57930225 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57930238 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57930501 G C Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 57930502 T C Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 57930537 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 57930541 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 57930651 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57930708 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 57930729 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 57930904 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57930992 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 57931094 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57931119 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57931163 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 57931253 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57931270 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 57931306 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 19 57931473 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57933114 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 57933219 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 57936429 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 57937592 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 57937923 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57937931 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57938051 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 57938097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57938106 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 57938127 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57938143 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57938153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57938241 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57938243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57938260 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57938286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57938358 A T Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 57938400 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 57939072 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 57939158 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 57939186 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57939363 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57939399 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 57939434 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57939549 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57939567 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57939798 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 57939955 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 57939964 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57940104 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 57940157 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57940329 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57940842 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 57940866 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57940879 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57940885 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57940974 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57941039 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 57941065 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57941076 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 57941113 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 57941180 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57942091 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57942106 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57942322 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57942615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57942698 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57942962 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57943007 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57943039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57943257 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57943339 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57943502 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 57944192 A G Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 19 57944285 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 19 57944478 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 57944582 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 57944687 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57944717 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 57944737 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 57944806 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 57944816 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 57944850 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57944891 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 57944987 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57944990 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 57945017 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 57945123 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 19 57945208 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57945224 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57945833 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57945851 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57945892 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 57946318 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57946331 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57946358 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57946948 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 57947078 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57947306 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 57947437 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57947705 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 57947715 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 57947720 G C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 57948228 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 57948266 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57948405 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 57948455 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 57948589 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57948707 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 57948955 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57949010 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57949011 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57949034 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 57949056 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 57949226 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 57949326 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 57949395 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 57949844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57950095 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57950194 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57950352 C G Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 57950482 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57950568 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 57950779 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57950785 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 57950870 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57950923 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57950935 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57950968 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57951118 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 57951131 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 57951230 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57951319 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57951450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57951469 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 57951492 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 57951977 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 57952587 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 57952727 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 57952728 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 57952740 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 57952840 G T Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 57953195 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 57953216 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 57953482 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 57953672 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 57953733 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57953820 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 57953904 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 57954011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57955699 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 57955828 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57955965 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57955969 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57956075 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57956425 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 57957169 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57957249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57957340 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57957458 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 57958905 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 19 57958924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57959142 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 57959483 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 19 57959562 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 57959986 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 57960553 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 57960681 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 57961459 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57961601 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57962368 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 57963246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57963939 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57964432 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57965217 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57967077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57967392 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 57967460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57967826 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57968583 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57969312 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 57969415 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57969470 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57969584 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57969724 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57970479 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57970700 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57970854 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57970968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57971241 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57971515 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57971556 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57971640 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57971659 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57971911 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57971969 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57972257 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57972394 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 57972403 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57972438 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57972542 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57972607 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57972622 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57972636 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57972690 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57972701 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57972710 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57972825 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57972841 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 57972956 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57973028 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57973060 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57973122 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 57973435 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57973447 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57973461 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57973478 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57973537 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57973587 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57973623 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57973646 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57973654 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57973662 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57973663 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 57973697 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57973709 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57973732 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57973737 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57973808 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57974028 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57974053 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57974375 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 57974396 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 57974442 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 57974446 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 57974512 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57974868 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57974959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57974967 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57975169 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57975202 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 57975239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57975289 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57975355 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 57975405 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57975494 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 57975602 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57975850 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57975894 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57975934 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57976121 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57976409 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57976696 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57976712 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57976723 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 57976776 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57976801 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57976900 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 57976906 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 57977054 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57977294 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 57977324 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57977492 T G Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 57977518 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57977566 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57977801 T A Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 57978179 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57978235 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57978458 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57978462 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57978467 G C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57978489 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57978490 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57978494 T G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57978523 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57978538 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57978607 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57978627 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57978634 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57978635 G T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57979324 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57979818 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57980742 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57980841 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57980866 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57981973 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 57981979 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 57981993 C A Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 57982028 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 57982060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57982199 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 57982238 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 57982244 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 57982245 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 57982278 T G Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 57982332 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57982407 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57982433 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57982456 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57982466 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57982829 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57982901 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57982959 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 57983044 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 57983370 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57983394 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57983439 T C Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 57983451 A C Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 57983569 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57983639 A T Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 57983658 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57983687 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 57983958 C T Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 57983992 A C Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 57984042 A T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57984049 T G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57984060 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57984073 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57984079 A G Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 57984166 A T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57984174 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 57984235 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57984576 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57984628 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57985230 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57985234 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 57985307 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57985346 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57985428 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57985473 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 57985475 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 57985677 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57986198 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57986333 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57986338 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57986492 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57987031 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 57987046 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57987052 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 57987099 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 57987147 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57987236 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57987291 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57987394 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57987474 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57987616 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57987617 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 57987811 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 57987912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57988305 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57988306 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57988328 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57988486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57988607 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57988645 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57989076 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 57989285 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 57989634 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57989666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57989851 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57989859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57990030 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57990104 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57990112 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 57990227 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57990387 T G N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 19 57990861 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 57990885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57991063 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 57991195 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57991219 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 57991238 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57991275 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57991329 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57991507 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 57991519 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 57991537 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 57991582 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57991584 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 57991609 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 19 57991719 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 57991883 T A N N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.181818181818182 17 5 8 1 2 19 57991907 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 57991949 A G N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 19 57992104 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 57992157 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 57992616 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 57992864 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57993248 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57993506 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57993549 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57993605 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57993626 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57994087 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 57994362 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 57994488 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57994536 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 57994585 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 57994658 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 57994744 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 57994997 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57995044 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57995137 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 57995257 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 57995390 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 57995519 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 57995551 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57995553 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 57995554 C G Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 57995600 A C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57995613 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57995664 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57995828 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 57995996 T A Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 57996195 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 57996417 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 57996485 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 57996491 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57996554 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 57996660 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 57996663 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 57996931 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57996948 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57996969 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57996973 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57996998 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57997078 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57997079 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 57997094 G T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 57997107 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 57997140 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 57997540 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 57997601 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 57997603 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 57997620 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57997640 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57997693 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 57997770 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 57997868 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 57997969 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 57998227 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 57998303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57998370 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57998374 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57998467 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 57998621 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 57998696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57998722 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57998754 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 57998755 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 57999285 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 57999338 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57999805 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 57999818 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58000153 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58001555 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58001949 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58002098 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58002141 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58002195 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58002328 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58002700 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58004404 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58004494 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58005239 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58006358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58006667 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58006764 T A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58006961 C G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58007003 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58007036 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58007078 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58007081 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58007097 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58007104 A T Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 58007155 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58007178 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58007353 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58007367 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58007395 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58007435 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58007495 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58007587 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58007618 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58007619 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58007650 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58007694 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58007962 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58008026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58008033 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58008068 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58008105 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58008231 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58008297 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58008352 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58008353 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58008397 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58008497 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58008584 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58008724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58008738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58008865 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58009173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58009189 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58009457 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58009866 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 58010209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58010458 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58010469 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58010533 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58010581 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58010625 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58010656 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58010755 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58010833 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58011034 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58011046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58012029 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58012062 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58012162 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58012182 G C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58012218 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58012366 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58012395 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58012396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58012448 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 58012485 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 58012949 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58012971 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58012972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58013077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58013092 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58013335 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58013364 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58013495 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58013517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58013615 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58013663 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58013758 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58013828 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 58014056 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 58014289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58014353 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 58014522 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58014556 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 58014757 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 58014935 T G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58014943 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58015091 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58015094 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58015192 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58015234 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58015323 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58015336 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58015352 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58015364 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58015503 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58015516 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58015819 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58015868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58015908 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 58016038 T C Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 58016192 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58016607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58016636 C A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58017683 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58017746 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 58018017 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 58018194 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 58018196 G T Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 58018551 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58018708 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 58018726 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58018962 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58019140 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58019245 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58019246 A G Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 58019622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58019829 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58019945 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58020000 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58020030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58020158 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58020278 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58020372 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58020553 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58020917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58021033 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58022234 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58022330 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58022333 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58022922 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 58022943 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 58022973 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 58023194 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 58023205 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 58023508 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58023520 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58024083 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58024344 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58024394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58024525 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 58024556 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58024863 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58025037 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58025045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58026409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58026493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58026629 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58026810 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58027154 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58027597 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58027616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58027742 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58027868 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58027926 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 58027960 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 58028005 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58028011 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58028117 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 58028209 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 58028259 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58028264 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58028311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58028374 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58028498 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58028524 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58028554 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 58028572 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58028678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58028903 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58028969 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 58028987 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58029189 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58029237 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58029380 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58029452 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58031076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58034100 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58034119 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 58034158 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58035881 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58035929 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 58036416 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58037134 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 58038029 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58038034 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58038040 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 58039678 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 58040453 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58040634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58040728 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58043504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58043913 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 58044137 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 58044774 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58044822 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58044916 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58045147 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58045191 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58045432 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 19 58045453 A C N N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 19 58045485 T G N N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 19 58045767 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58046083 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58046325 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58046341 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58046386 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58046435 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58046456 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 58046512 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 58046586 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 58046650 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58046836 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 58047100 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58047287 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58047336 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58047341 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 58047361 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 58047398 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58047405 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58047413 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58047550 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 58047622 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58047648 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58047853 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58047914 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58047958 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58048016 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58048185 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58048202 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58048207 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58048235 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58048499 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58048541 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58048542 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58048657 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 58048716 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 58048750 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 58048898 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 58049009 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 58049027 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 58049029 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 58049035 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 58049082 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 58049515 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58049615 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58049994 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58050075 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58050118 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58050189 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58050222 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58050484 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 58050584 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 58050588 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58050705 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 58050771 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 58050776 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 58050814 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 58050905 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58050935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58050984 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58051062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58051123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58051143 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58051251 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58051364 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 58051410 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 58051527 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 58051575 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 58051587 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 58051867 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 58051879 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58051997 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58052055 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58052095 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58052144 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58052417 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 19 58052523 C T Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 19 58052535 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 58052568 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 58052602 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 58052691 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58052747 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 58053037 G T Y N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 19 58053341 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58053465 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58053587 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58053671 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 58053756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58053848 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 58053969 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 58053992 C A Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 58054398 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58055188 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58055539 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58055668 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58055670 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58055675 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58055695 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58055840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58056274 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58056279 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58056282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58056402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58056412 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 58056546 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58056547 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58056592 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58056593 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58056669 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58056761 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 58056803 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58057070 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58057105 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58057165 G A Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 58057492 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 58057517 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 58057562 T A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 58057605 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 58057805 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58057922 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58057929 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58057955 C G Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58057973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58057985 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58058000 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58058010 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58058042 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58058079 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 58058102 T G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 58058169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58058233 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58058269 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58058285 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58058286 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58058305 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58058309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58058342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58058355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58058356 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58058431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58058446 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58058492 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58058493 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 58058513 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 58058527 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 58058544 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 58058566 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 58058572 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 58058619 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58058711 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58058747 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58058901 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 58059038 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 58059075 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 58059136 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 58059253 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58059578 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 58059808 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 58059995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58060079 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58060176 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58060302 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 58060519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58060641 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 58061164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58061258 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58061294 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58061319 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 58061480 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58061510 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 58061515 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58061620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58061678 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58061700 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 58061977 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 58062547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58062586 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 58062587 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58062608 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58062665 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 58062769 C G Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 58062795 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58062844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58062863 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 58062880 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 58062955 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 58063031 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58063406 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 58063594 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 58063599 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 58063608 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 58064297 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58064336 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58064337 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 58064359 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58064389 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58064471 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 58064548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58064607 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 58064610 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 58065113 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 58065194 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58065308 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 58065310 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 58065358 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 58065595 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58065626 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 58065629 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 58065644 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 58065682 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58065768 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 58066365 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58066488 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58066528 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 58066566 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 58066737 T C Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 58066960 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58067074 T G Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58067118 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58067163 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 58067220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58067348 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 58067392 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 58067494 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58067750 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58068416 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58068453 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58068835 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 58069435 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58069439 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58069601 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58069637 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58070365 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 58070381 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 58070442 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 58070459 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58070471 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58070578 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58070750 A T N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 19 58070795 T G N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 19 58071074 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 58071187 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 58071395 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 58071661 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58071780 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58071944 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 58071951 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58072135 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 58072170 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 58073007 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58073352 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58073423 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58073493 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 58073938 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58073943 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58074039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58074155 C G Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 58074437 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 19 58074544 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 58074615 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 58074775 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58074859 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 58075611 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 58075769 G A Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 19 58076439 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 58076681 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58076780 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58076823 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 58076977 A G N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 19 58077178 T C N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 19 58077185 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 58077368 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 19 58077374 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 58077421 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 58077463 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 58077643 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58077678 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 58077746 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58077791 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58077860 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58077942 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58078162 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58078186 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58078478 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58078696 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58078866 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 58078963 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58079057 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 58079262 T C N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 19 58079269 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 19 58080154 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58080389 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 58081407 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58082290 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58082667 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 58083727 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58083862 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58083884 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58085264 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58085521 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 58085850 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58086263 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 58086351 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58086560 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 58086628 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 58086808 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 58090333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58091515 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58091522 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58091618 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58092157 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58092796 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58094170 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58094609 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 58095579 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58095898 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 58096884 G A Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 19 58097850 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 58098479 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 58098480 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58098495 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58098722 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58098749 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58099472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58099998 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58100031 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58100065 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58100368 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58100403 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 58100430 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 58100459 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58100635 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 58100669 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58101257 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58101648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58103119 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 58103938 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 58104122 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58105593 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58105722 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58105747 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58105898 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 58106088 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 58106578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58107027 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58107392 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 58108599 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58108803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58109018 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 58111066 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 58111858 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 58112700 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 58113501 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58113628 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58113843 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 58114946 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 58115575 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58116296 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 58116332 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 58116374 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58116455 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 58117994 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58119003 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 58119599 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 58119666 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 58121002 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58123327 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58123342 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 58123492 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 58124559 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 58124636 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58124710 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 58124711 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 58124722 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 58124723 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 58124752 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 58124807 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58124936 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 58124987 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 58125034 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 58125042 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 58125072 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 58125500 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 58125512 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 58125523 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 58125784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58126076 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 58126077 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58127316 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58127326 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 58127348 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 58127350 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58127414 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 58127458 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 58127604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58127851 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58129575 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58130612 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58130914 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58130920 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58132327 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 58132728 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58133014 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 58133386 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 58133467 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 58133770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58134550 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58134963 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 58134967 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 58135648 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58135697 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 58135715 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 58135752 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 58135839 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 58136021 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 19 58136297 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 58136371 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58136569 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58136593 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58136605 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58136732 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58136758 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58136777 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58136851 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58137503 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 58137633 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 58137721 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 58137984 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 58138144 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58138173 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 58138379 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58138764 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58138871 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58138914 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58138996 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 58139175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58139280 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58139321 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 58139568 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 58141797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58141850 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58142833 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58142970 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58143055 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 58143157 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 58143211 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58143841 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 58143925 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 58144073 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 58144161 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 19 58144249 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 19 58144283 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 58144395 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 58144457 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58144503 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58144517 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 58144521 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58144535 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 58144620 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58144880 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58144924 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58144990 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58145115 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 58145129 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58145137 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58145287 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58145598 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 58145652 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 58145657 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 58145659 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 58145661 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 58145709 G C N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 19 58145760 A C N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 19 58145895 A G N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 19 58146234 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 58146331 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58146342 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 58146384 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 58146460 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58146463 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58146519 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58146550 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 58146891 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 58146926 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 58146992 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 58147111 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 58147221 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 58147224 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 19 58147339 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 58147367 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58147436 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58147522 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58147553 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58147571 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58147737 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58147741 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 58147851 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58147852 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 58147984 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 58148083 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58148349 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58148438 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 58148465 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 58148954 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58148957 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58149030 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58149087 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58149088 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58149136 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58149192 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58149193 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 58149218 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58149244 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 58149279 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58149303 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58149321 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58149337 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 58149370 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58149400 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58149425 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 58149677 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58149804 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58149827 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58149840 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58149857 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 58149858 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 58149864 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 58149867 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 58149969 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 58150022 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58150169 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 58150546 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58150620 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58150868 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 58150966 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58151133 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 58151219 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58151341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58152005 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58152211 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58152235 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58152388 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58152564 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 58152836 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 58152855 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 58153039 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 58153231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58153660 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58153963 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58153992 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58154047 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 58154084 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58154148 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58154154 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 58154164 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 58154171 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58154180 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 58154223 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58154279 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58154427 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58154430 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 58154478 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58154492 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 58154493 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58154554 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58154631 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 58154899 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58156539 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 58156712 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 58156775 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58156807 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58156834 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 58157388 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 58158899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58158956 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58159094 G A Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 19 58159218 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 58159303 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58159465 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58159591 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 58159599 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 58159652 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 58159660 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 58159708 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58159787 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58159863 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 58159970 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 19 58160065 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 58160128 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58160222 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58160444 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 58160646 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58160977 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 58160981 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 58161069 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58161313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58161406 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 58161548 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58161736 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58161812 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 58161843 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58161872 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 58161890 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 58161976 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58162036 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 58162241 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58162347 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 58162456 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 58162652 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58162872 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58163821 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58163870 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58164129 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58165118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58165959 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 58166234 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 58166315 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 58166407 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 58166592 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 19 58166819 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 58166866 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 58166991 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 19 58167029 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58167098 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 19 58167116 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58167148 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58167158 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58167172 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58167186 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 19 58167192 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58167379 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58167549 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 58167596 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58167940 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 58167962 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 58168035 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 58168076 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 58168093 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58168094 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58168417 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 58168431 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 58168734 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 58168908 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 58169003 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58169103 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 58169144 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58169227 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 58169349 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 58169529 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58169743 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 58169842 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 58169869 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58170099 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 58170186 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58170337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58170366 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58170422 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 58170593 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58170595 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58171045 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58171862 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58171900 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58172077 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58172138 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58172177 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58172250 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58172286 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58172317 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58172447 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58172637 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58172732 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58172766 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58172815 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58172833 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58172835 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58173314 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58173941 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58173946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58175820 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58176789 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58177053 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58177069 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58177115 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58177117 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58177156 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 58177170 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 19 58177348 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58177439 C A Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 58177502 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 19 58177507 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58177644 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 58177818 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58178396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58178640 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58179077 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 58179246 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58179542 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58179543 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58179802 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58180552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58180684 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 58181843 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 58181945 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 58182875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58183617 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58183960 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 58184141 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58184285 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 58184554 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 58184582 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 58185921 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 58185940 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 58186082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58186466 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 58186495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58186934 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58187014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58187079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58187083 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58187215 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 58187409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58187502 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58188492 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58188553 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 58188961 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58189140 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 58190023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58190045 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58190229 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58190845 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58191218 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 58191253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58191356 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58191503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58191634 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 58191640 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 58191776 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58191925 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 58192039 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 58192040 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 58192185 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58192224 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58192231 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 58192526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58192925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58192946 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58193024 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 58193517 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58193582 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58193782 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 19 58193920 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 58194005 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 58194020 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 58194025 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 58194066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58194068 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58194101 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 58194272 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58194281 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58194289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58194618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58194933 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 58194959 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 58195259 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58195360 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58195393 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58195581 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58195665 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 58195666 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 58195820 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 58195845 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 58195872 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 58195932 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 58195976 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58196064 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 58196199 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58196208 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 58196232 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 58196269 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58196300 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58196369 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 58196586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58196761 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 58197617 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 58197685 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 58197700 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58197764 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 58197779 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 58197802 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58198092 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58198113 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 58198227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58198236 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 58198265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58198359 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 58198969 C G Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 58199154 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58199355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58199692 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58200026 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58200200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58200339 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 58200543 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 58200787 C T N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.272727272727273 0.272727272727273 0.454545454545455 9 13 3 3 5 19 58201194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58201357 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58201481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58201610 G C N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 19 58201655 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 58201695 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 58201961 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58202071 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 58202264 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58202443 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 58202586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58202632 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 58202667 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 58204384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58204500 T G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58204724 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 19 58204824 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58204836 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 58204869 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58205070 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58205102 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58205155 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58205344 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58205493 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 58205727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58205733 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58205750 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58205937 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58206105 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58206285 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 58206464 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 58206468 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 58206856 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58208098 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58208675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58208700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58208712 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 58208760 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58208762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58208841 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 58208913 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58208922 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58209300 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 58209434 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 19 58209460 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 58209500 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58209515 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 58209753 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 58209800 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 58209809 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 58210068 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 58210297 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 58210417 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 58210418 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 58210493 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 58210641 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 58210747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58210749 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58210855 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 58210933 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 58211009 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58211031 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58211058 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 58211100 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58211186 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58211555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58211570 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58211582 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 58211586 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58212175 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 58212278 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 58212362 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 58212587 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 58212677 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 58212713 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58212747 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 58212778 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58212856 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58212897 G T Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 58212900 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 58212961 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58212982 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58213110 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58213139 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58213345 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58213445 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58213510 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 58213519 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 58213543 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58213642 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 58213660 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 58213664 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 58213740 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 58213752 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 58213841 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 58213934 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 58213990 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58213997 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58214079 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 58214227 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58214235 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58214257 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 58214776 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58214846 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58214937 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58214949 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58215034 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58215050 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 58215237 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 58215352 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 58215366 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 58215705 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58215706 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58215785 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 58215842 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 58215857 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58215897 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 58216026 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58216654 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58216728 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 58216769 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58216922 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 58216960 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58217025 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 58217039 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58217054 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 58217478 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 58217500 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 58217803 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58217868 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58217876 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58218269 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 58218407 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58218445 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 58218462 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 58218514 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 58218529 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 58218531 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 58219084 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 58219089 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 58219112 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 58219270 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58219276 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58219344 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58219384 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58219476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58219483 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58219488 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 58219553 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58219571 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58219604 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58220057 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58220232 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58220375 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58220386 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58220533 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58220564 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58220625 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 58220816 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58220872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58220877 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58220931 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 58220938 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 58221206 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58221246 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58221356 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58221449 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 58221601 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58221748 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 58221810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58221816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58221840 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 58221966 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 19 58222047 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58222088 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58222093 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 58222110 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58222128 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58222356 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58222813 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58222934 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58223494 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 58226269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58226483 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 58226520 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 58226735 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58226763 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 58226862 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 58226864 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 58226930 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 58227015 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 58227091 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58227099 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58228599 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58229490 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58229691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58230935 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58230979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58231007 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58231541 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 58232177 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58233219 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58233990 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58234075 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 58234700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58235108 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 58235140 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 58235315 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 58235396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58235591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58235975 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58236011 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58236070 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 58236630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58238018 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 58238051 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58238067 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58238118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58238150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58238162 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58238195 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 58238274 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58238325 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58238344 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 58238360 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58238447 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 58238516 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 58238604 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 19 58238964 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 58239336 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58239408 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58239577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58239922 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58239969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58240114 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 58240118 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 58240158 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58240323 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58240710 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 58240783 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58243626 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58243708 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 58243717 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 19 58243913 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 58244002 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 58244163 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 58244458 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 58245487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58245879 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58246010 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58246155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58246179 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 58246421 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58246557 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 58246575 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58246581 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 58246983 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58247095 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 58247136 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 58247150 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 58247180 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 58247234 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 58247454 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 58247481 A T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 58247574 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 58247827 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58248006 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58248079 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58248114 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58248156 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 19 58248470 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58249221 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 58249834 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58249973 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58250135 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58250256 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 58251141 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58251812 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58252360 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 58252492 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 58252493 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 58252504 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 58252556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58252581 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58252587 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 19 58252602 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58252649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58252759 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58252785 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58253035 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 58253061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58253070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58253075 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 58253115 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 58253146 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 58253301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58253368 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 58254905 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58256589 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 58256823 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58257136 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 58257150 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 58257296 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 58257357 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 58257466 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 58257504 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 58257510 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 58257618 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 58257728 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 58257754 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 58257792 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 58257802 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 58257814 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 58257863 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 58257864 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 58257892 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 58257903 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 58257911 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 58257938 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 58258078 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 58258240 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 19 58258304 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 58258312 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 58258373 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 58258443 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 58258482 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 58258588 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 19 58258605 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 19 58258687 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 58258695 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 58259201 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 58259259 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58259289 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58259315 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 19 58259405 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 58260145 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 58260329 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 58260761 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 58260765 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 58260816 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 58260913 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 58261151 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 19 58261386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58261444 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 58261635 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 58261645 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58261659 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 58262550 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 19 58263176 C A N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.25 17 7 8 1 3 19 58263763 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 58263851 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 58264557 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 58264897 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 19 58265006 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 58265036 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 19 58265152 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 58265217 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 58265263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58265379 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58265385 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58265502 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 58265815 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58265824 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 58265858 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 58265961 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 58266045 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58266215 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58266336 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58266583 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 58266586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58266593 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 58266712 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58266918 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 58267131 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 58267150 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 58267182 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58267210 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 58267274 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58267336 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58267452 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 19 58267486 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 58267511 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 58267547 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 58267548 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 58267653 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 58267669 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 58267672 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 58267733 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 58267742 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 58268476 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 19 58268706 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 58269164 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58269224 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 58269498 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58269847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58270318 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 19 58270326 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 58270446 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 58270450 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 58270480 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58270536 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 58270662 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58270683 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 58270684 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 58270722 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58270734 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 58270766 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 58270816 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 58270820 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 58270839 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 58270844 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 58271066 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 58271148 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 58271191 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 58271796 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 58271831 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 58271892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58272456 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58272610 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58272649 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58272698 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 58273172 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58273389 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58273453 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58274490 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 58274881 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58274924 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58275011 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 58275148 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 58275245 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58275301 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 58275372 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 58275393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58275555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58275556 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58276361 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58276383 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58276552 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 58276614 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 58276681 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 58276775 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 58276847 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 58276888 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58276902 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58276923 C T Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 58276925 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 58276987 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 58277283 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 58277308 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 58277374 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58277445 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58277714 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 58278138 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 58278261 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 58278651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58278661 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 58278882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58279002 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 58279015 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 58279025 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58279091 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 58279133 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 58279669 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 58279806 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 58279812 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 58279830 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 58280008 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58280344 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58280385 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 58280478 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 58280489 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 58280550 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 58280552 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 19 58280620 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 19 58280725 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 58280801 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 58280971 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 58281887 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58281899 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 58282132 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58282162 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 58282909 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58282953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58283052 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 58283176 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58283242 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58283439 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 58283567 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 58283848 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 58284257 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 58285150 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 58285196 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 58285201 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 58285210 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 58285483 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 58285924 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 19 58285961 C A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 58286116 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 58286305 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58286384 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 58286437 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 58286809 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 58286854 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 58286914 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 58287032 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 58287072 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 58287260 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 58288415 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58288427 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 58288469 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 58288541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58288810 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58288976 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 58288980 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 58288996 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 58289142 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58289234 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 58289305 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58289701 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 58289731 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58289782 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 58289850 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 58290037 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 58290183 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 58290282 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 58290358 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 58290397 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 58290462 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 58290670 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 58290675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58290705 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 58290762 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 58290896 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 58291230 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 58291344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58291429 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58291882 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58292641 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 58292720 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 58292805 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 58293357 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58293358 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58293561 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58294190 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 58294253 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58294735 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 58295112 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 58295283 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 58295580 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 58295777 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 58295835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58295907 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 58296268 G C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 19 58296434 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 58296482 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 58297236 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58298390 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58298678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58300257 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 58300595 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 58300614 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 58300638 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 58301439 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 58301442 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 58301447 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 58301620 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58301725 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58301912 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58301937 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58302109 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 58302214 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 58302394 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 58302582 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 58303506 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 58303607 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 58303912 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 58304143 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 58304578 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 58304632 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58304640 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 58304642 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58304751 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 58304767 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 58304867 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58304926 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 58304960 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 58305005 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 58305053 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 19 58305555 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 58305602 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 58306107 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 58306154 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 58306273 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 58306576 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 58307239 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 58307294 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58307598 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 58307851 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 58307914 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 58307918 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58308057 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 58308190 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 58308459 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 58308655 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 58308813 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 58308872 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58309086 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 58309184 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 58309207 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 58309266 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 58312327 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 58312358 T C Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 58313083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58313259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58316758 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58316874 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 58317489 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 58318951 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 58319003 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58319686 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58319753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58320839 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58321005 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 58322176 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 58323339 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58324443 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58324494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58324509 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58324541 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58324620 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58325445 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58325577 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58326485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58326975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58327186 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58328277 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58328353 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58328479 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58328698 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 58329110 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 58329494 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58329522 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 58329774 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 58329783 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 58329803 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 58330432 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 58330561 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 58331105 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58331539 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 58331666 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 58331937 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 58332267 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 58332299 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58332319 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58332362 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58332406 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 58332598 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58332886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58332922 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58332927 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58333092 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58333097 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 58333128 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58333205 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58333247 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 58333405 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58333424 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 58333752 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58333764 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58333775 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 58333776 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58333920 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58333991 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58334061 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58334071 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58334332 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 58334892 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58335066 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58335110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58335320 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 19 58335635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58336117 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 58336132 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 58336133 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 58336245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58336271 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58336307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58336312 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 58336375 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 58336404 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58336420 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 58336446 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 58336509 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58336516 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58336817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58337031 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58337033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58337113 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58337178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58337328 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 58337351 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 58337411 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 58337594 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 58337632 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58337978 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58338029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58338143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58338215 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 58338228 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58338347 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58338400 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58338623 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 58338627 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 58338670 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 58338941 T C N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 19 58339028 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 58339185 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 19 58339197 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 58339519 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 58339576 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58339611 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58339875 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 58339965 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 19 58339968 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58339973 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 19 58340028 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 58340061 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 58340111 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 58340120 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 58340150 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 58340182 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58340273 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.5 0.111111111111111 0.388888888888889 20 16 9 2 7 19 58340305 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 19 58340322 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 58340336 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58340377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58340402 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 58340430 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 58340440 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 58340462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58340471 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 58340512 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58340839 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 58340862 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 58340880 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58340890 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 58340900 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58341041 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 58341467 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58341627 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 19 58342221 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58342566 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 58343049 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 58343343 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 58343421 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 58343723 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58343852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58343916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58343917 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58344206 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 58344366 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 58344795 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58344867 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 58345040 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58345419 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 58345567 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 58345602 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 19 58345678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58345736 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 58345799 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58345974 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58346042 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 58346045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58346048 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58346049 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 58346239 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 19 58346281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58346315 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58346388 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58346457 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58346499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58346596 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 58346958 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 58346986 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 19 58347111 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 58347122 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 58347161 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 19 58347172 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 58347272 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 19 58348073 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 58348531 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 58348747 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 58348923 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58349043 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 58349200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58349444 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58349492 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58349854 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 58349873 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 58349896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58349931 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 58350001 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 58350174 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58350277 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 58350278 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 58350286 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 58350297 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 58350698 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 58350702 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 58350723 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58350727 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58350869 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 58350923 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 58350983 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 58351064 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 58351072 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 58351084 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 58351389 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58351448 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 58351479 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 58351642 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58351653 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 58351830 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58351877 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58351952 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58352108 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 19 58352235 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58352640 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 58352718 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58352728 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58352756 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 58352806 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58352938 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58353187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58353198 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58353232 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58353339 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58353368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58353440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58353515 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 58353565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58353979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58353984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58354023 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 58354646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58354775 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 58354862 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 58354947 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 58355010 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58355184 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58355193 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 58355402 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58355433 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 58355475 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 58355608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58356011 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 58356248 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 58356381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58356428 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 58356704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58356722 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 58356822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58356859 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 58356886 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 58356922 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58357163 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 58357196 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 58357224 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 58357253 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 58357463 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 58357552 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58357632 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 58357641 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 58359052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58359085 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 58359166 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 58359190 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 58359228 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 58359708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58359709 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58359746 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58359767 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58359798 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 58359811 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 58359813 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 58359823 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 58359833 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 58359844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58359869 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 58359870 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 58359939 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 58359965 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 58359980 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 58360185 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 58360798 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 58360981 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 58361013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58361031 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 58361129 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 58361213 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 58361243 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58361296 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 58361488 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 58361512 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 19 58361643 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 58361869 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 58361966 G T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 19 58362048 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58362095 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 58362517 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 19 58363390 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58363580 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 58364251 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 58364456 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 58364618 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 58364677 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 58364815 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 58364850 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 58364987 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 58365036 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 58365062 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 58367998 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 58368002 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 58368030 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 58368054 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 58368241 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 58368335 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 58368538 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 58368543 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 58368810 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 58368987 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 58369018 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 58369278 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 58369652 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 58369656 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 58369661 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 58369697 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 58369725 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 58369741 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 58369768 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 58369775 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 58369820 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 58369890 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 19 58369920 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 58370851 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 58370998 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 58371062 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 58371064 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 58371261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58371398 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 58371536 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 58372231 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58372348 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 58372565 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 58372677 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 58372690 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 58372719 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 58372803 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 58372939 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 58373056 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 58373126 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 58373195 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58373270 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 58373352 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 58373696 C A N N 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 19 58374567 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 58376054 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 58376171 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 58376276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58376702 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 19 58377120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58377160 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 19 58377270 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58378756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58379037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58379062 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 58379787 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 58380021 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 58380146 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 58380273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58380503 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 58380700 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 58380738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58380839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58380931 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58381321 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 58381793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58382378 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 58382610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58383614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58383649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58384012 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58384143 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 58384149 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 58384150 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 58384173 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58384203 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 58384324 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 58384351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58385013 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 58386312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58386571 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58386773 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 58386923 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 58387216 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 58387556 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 58388247 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 58388443 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 19 58389158 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58389923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58390936 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 58391062 G C Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 19 58391556 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 58391703 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 58391931 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 58391965 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 58392003 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 58393910 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58393913 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 58394706 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 58394720 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 58394731 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 58394732 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 58395799 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 58395965 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 58396002 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 58396185 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 58396202 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 58396213 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 58396273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58396286 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 58396389 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 58396772 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 58397070 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 58397653 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 58397776 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 58400490 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 58401205 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 58401491 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 58401637 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58401893 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58402287 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58402295 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58402392 A C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 58403015 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58403139 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58403218 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 58403250 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58403272 A G Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 58403378 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58403446 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58403495 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 58404250 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58404406 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58404759 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 58404779 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58404800 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58404904 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 58404949 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 58404960 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58404974 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 58405009 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 58405192 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58405203 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58405573 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 19 58405627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58405709 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58405770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58405884 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 58405984 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 58406047 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 58406154 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 58406181 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 58406184 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 58406217 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 58406241 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58406474 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 58406488 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 58406501 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 58406525 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 58406541 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 58406699 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 58406723 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 58406743 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58406793 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 58406848 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 58406871 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58406908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58407094 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 58407107 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 58407247 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 58407967 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58407976 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58408108 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58408141 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58408388 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58408704 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58408726 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 58408931 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58408946 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58408974 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58409195 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58409213 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58409505 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58409546 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58409842 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 58409977 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 58410029 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 19 58410180 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 19 58410228 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 58410274 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 58410415 C T N Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 19 58410918 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 58410920 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 58410921 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 58410990 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58411000 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 58411210 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 58411219 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 58411232 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 58411246 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 58411288 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58411298 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58411382 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58411447 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58412240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58412244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58412321 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 19 58412687 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58413171 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 58413183 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58413309 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 58413384 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58413431 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58413531 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58413546 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58413625 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 58413774 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58414476 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58414558 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58414723 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58415067 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 58415068 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 58415216 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 58415228 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 58415284 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 58415314 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58415385 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 58415450 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 58415470 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58416213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58416363 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58416378 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58416469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58416503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58416513 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58416559 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58416617 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 58416648 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 58416686 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58416687 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 58416709 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 58416790 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 58416903 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58416994 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58417035 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58417039 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58417050 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 58417059 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 58417100 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58417147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58417162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58417340 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58417356 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58417405 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58417427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58417611 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58417821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58417907 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58418113 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 58418165 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58418412 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 58418431 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 58418457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58418656 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58418970 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58419035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58419647 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58419951 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58420015 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58420149 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 58422705 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58423315 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 58424755 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 58425747 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58425933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58426212 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58426245 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58426776 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58426788 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58428149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58428367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58431368 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58431700 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58431726 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58432535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58432828 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58433485 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58434788 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58434843 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58434884 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 58434947 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 58435027 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58435105 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58435106 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58435234 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58435249 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58435301 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58435524 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58435530 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58435737 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58435766 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58436161 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58436258 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58436439 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58436458 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 58439258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58439491 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 58439660 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 19 58439982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58440125 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 58440355 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58440438 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 58440549 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 58440666 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58440966 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58441141 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58441240 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58441526 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58442029 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58442338 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58442841 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58442867 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58442936 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58443346 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58443364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58443519 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 58443580 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58443603 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58443623 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 58443718 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 58443753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58443838 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58443848 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 58443910 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 58443943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58444068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58444148 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 58444349 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 58444609 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 58444686 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 58445056 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 58445500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58445624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58446030 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 58446067 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 58446081 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 58446341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58446640 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 58446751 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 58446988 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 58447471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58447729 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 58447752 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58447889 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58447890 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58447913 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58447984 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58448387 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58448700 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 58448766 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58448777 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58448800 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58448830 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58448837 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58448845 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58449350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58449558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58449684 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58449807 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 58449816 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 58449847 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58450081 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58450206 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 58450218 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 58450267 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 58450284 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 58450285 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 58450290 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 58450375 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58450435 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58450674 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58450913 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58451484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58451770 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58451791 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58451865 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 58452015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58452016 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58452121 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 58452446 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58453054 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58453647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58453648 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 58453767 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58453826 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 58453906 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58454102 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 58454168 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58454183 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 58454197 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58454492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58454495 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58454568 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58454592 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 58454605 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58455047 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 58455189 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58455497 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58455612 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58456378 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58456919 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 58457142 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58457538 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58457666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58457822 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58458406 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 58458481 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 58458946 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58459009 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58459330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58460075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58460200 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58461657 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 58461665 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58462104 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 58462423 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 58462458 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 58462472 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 58462494 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58462504 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58463089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58463863 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 58463930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58464038 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58464452 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 58465461 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 58465504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58465630 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58466317 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 58466447 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58466623 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58466667 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 58466821 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 58466856 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 58467021 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58467201 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58467215 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58467237 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58467896 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58468256 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 58468284 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 58468322 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 58468345 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58468471 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58468493 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58468568 A T Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 58468713 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 58469218 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 58469454 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 58469487 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 58469510 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 58470093 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 58470306 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 58470363 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 58470428 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 58470881 C T N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 19 58470996 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 19 58471073 T G N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 19 58471193 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 58471489 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 58471954 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 58472027 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58472031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58472038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58472130 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 58472225 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 58472392 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 58472400 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58472533 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 58472535 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 58472583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58472707 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 58472893 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 58472988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58473277 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58473820 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58474262 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58476529 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58477161 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58478180 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58478208 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58478444 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58478546 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58478675 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58479118 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58479161 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58479170 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58479226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58479240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58479362 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58479367 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58479380 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58479756 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58479794 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58479808 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58479824 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58479825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58480017 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58480021 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58480201 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58480203 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 58480225 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58480270 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58480286 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58480769 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 58481735 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58481846 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58481864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58481934 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58482180 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58482263 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 58482440 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58482525 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58482592 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58482822 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 58483058 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58483128 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58483162 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58483312 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58483320 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58483430 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58483492 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58483728 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58483746 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58483848 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58483927 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58484157 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58485217 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 58485530 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58485772 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58485895 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58487980 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58488441 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58489741 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58491069 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58491850 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58491932 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58491949 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58491981 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58492145 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58492274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58492750 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58492967 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58492978 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58493344 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58494219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58494338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58496762 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58497411 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 58497771 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58498778 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58499917 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 58500587 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58500786 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58501138 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 58501187 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 58501269 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58501348 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58501688 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58501789 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58501980 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58502199 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58502697 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58502877 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58502898 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58502914 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58502939 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58502978 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58503053 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58503058 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58503213 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58503234 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58503269 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58503298 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58503308 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58503334 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58503342 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58503449 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58503457 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58503469 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58503672 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58503674 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58503729 G T Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 58503932 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58504019 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58504262 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58504268 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58504358 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 58504372 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 58504794 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58504834 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58504991 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 58505004 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 58505116 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58505155 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58505160 G T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58505250 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58505301 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58505373 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58505398 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58505527 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58505562 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58505807 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 58505857 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 58505862 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 58505926 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 58505959 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58506047 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58506120 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58506176 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58506255 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58506373 C G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 58506508 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58507100 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58507138 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58507194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58507339 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 58507349 C G Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 58507714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58507725 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58507747 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58507751 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58507782 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58507843 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58507848 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58507857 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58507873 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58507874 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58507910 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58508125 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58508152 T G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58508163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58508206 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58508254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58508278 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58508296 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58508468 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58508473 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58508475 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 58508609 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58508627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58508628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58508765 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58508779 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58508813 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58509406 C G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58509409 A C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58510028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58510043 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 58510337 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58510357 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58510444 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58510837 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58511005 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58511084 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 58511112 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58511226 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58511441 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58511834 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58512323 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 58512552 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58512624 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 58512662 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 58512668 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 19 58512709 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 58512815 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58513042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58513214 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58513390 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58513566 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58513575 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58513897 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58515084 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58515099 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 58516139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58516219 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 58516386 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58516472 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 58516871 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 58517162 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 58517245 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 58517465 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 58517553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58518322 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58519592 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58519985 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58520313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58520875 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58521044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58521228 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58521779 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58521894 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 58522538 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58522607 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58522611 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58522641 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58522671 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58522768 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58522770 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58522851 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58523161 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58523181 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58523257 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58523274 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58523293 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 58523328 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58523511 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58523684 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58523687 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58523749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58524231 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58524526 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58524573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58524886 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58525152 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58525559 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 58525825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58525851 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58525906 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58526109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58526514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58526984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58528398 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58528788 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58529967 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58533462 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58533670 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 58534456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58535403 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58535810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58536092 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58536216 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58536249 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58536277 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 58536397 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 58536678 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58536698 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58536759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58536781 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58537011 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58537030 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58537031 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58537250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58537376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58537387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58538367 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 58539054 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58539710 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58539713 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58539742 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58540140 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58540495 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58540889 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 58543530 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58543770 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58544053 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58544054 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58544081 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58544307 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 58544327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58545242 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58545559 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 19 58545854 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 58545938 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 58546551 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58546865 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 58547728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58547898 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 58547957 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58548132 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 58548640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58548648 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 58548962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58549785 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58550491 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58550531 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 58550611 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58550708 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 58550948 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58550978 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58551024 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58551047 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58551074 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58551087 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58551091 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 58551144 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 58551175 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58551206 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58551320 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 58551342 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 58551352 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 58551510 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 58551580 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58551766 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 58551769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58551777 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 58551839 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 58551871 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58551900 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58551924 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58551971 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58552001 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58552013 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58552200 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58552295 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58552376 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 58552377 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 58552461 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58552463 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 58552511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58552531 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58552734 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58552744 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 58552748 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 58553297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58553786 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 58553871 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58554176 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58554222 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 58554316 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58555098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58555187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58555571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58555589 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58556371 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58556460 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58556791 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 58556814 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 58556847 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 58557201 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58557229 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58557610 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 58557692 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 58558178 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 19 58558232 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 58558328 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 58558432 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 19 58558435 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 19 58559083 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58559136 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 19 58559270 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 58560120 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58560212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58560254 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58560264 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58560298 C A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58560478 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58560942 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58560972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58561008 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58561490 A T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58561635 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58561660 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58562030 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58562126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58562740 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 58563631 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58564004 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58564608 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 58565722 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 58565934 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58566496 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58567078 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58567344 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58567683 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58568047 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58568073 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58568129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58568155 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58568227 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58568556 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 58568650 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 58568654 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 58568721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58569013 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 58569019 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58569338 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58569404 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58569525 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58569605 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 58569667 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58570456 A T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58570607 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58570953 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58571186 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 58571333 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 58571356 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 4 24 2 0 12 19 58571436 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 58571535 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 58572142 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 58572193 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58572206 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58572245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58572261 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58572581 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58572670 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58572945 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58573114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58573164 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58573315 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58573346 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58573446 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 58574393 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58574585 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 58575441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58575854 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58575920 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 58576271 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 58576679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58577479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58577674 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58578072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58581247 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 58582029 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58582300 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58583801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58584291 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58584572 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58584658 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58584830 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58585155 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58585296 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58585297 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58585410 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58586941 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 58587164 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58587187 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58587224 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58587315 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 58587388 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58587526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58587971 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58588455 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 58588704 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 19 58588737 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 58588802 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 58589757 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 58589862 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58590557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58590643 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 58590709 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58591536 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 58593826 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58594043 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 58594250 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 58594422 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 58594919 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58595047 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 58595117 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58595678 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58596002 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 58596004 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 58596031 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 58596035 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 58596139 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58596261 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 58597388 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 58598009 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 58598115 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58598186 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 58598793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58598809 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 58598821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58598918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58599111 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58599264 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 58599521 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58599598 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58599652 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58599853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58599955 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58600232 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58600260 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 58600493 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58600614 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58601038 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58601048 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58601088 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58601648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58601652 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58601720 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58602468 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58604879 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58605692 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58605951 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58606083 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58606912 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 19 58608002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58608907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58610875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58610920 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 58611449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58611642 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58611651 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 58611962 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 58612169 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58613955 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 58614047 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58614543 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58614990 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58615226 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 58615669 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 58616756 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58616885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58618502 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58618701 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58618853 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 58619657 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58621207 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 58621627 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58621848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58621886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58622564 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58622926 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58623172 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 58623377 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 19 58623419 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 58623445 A G N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 19 58623488 A G Y Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 19 58624196 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 58624209 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 58625292 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58625521 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58625846 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 58628395 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58642095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58642974 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 58642977 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 58643157 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 58643197 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 58644020 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 58644459 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 58644476 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 58645279 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58645281 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58645308 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58645354 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58646363 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58646376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58646724 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 58647672 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58649199 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 58649387 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 58649529 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 58649795 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58649849 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58649940 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58652153 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58652202 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58652559 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58652622 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 58652770 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58652947 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 58652976 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 58653006 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 58653019 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 58653286 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 58653295 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 58653693 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58654478 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58654729 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58654869 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58655087 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58655151 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 58655167 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 58655220 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 58656656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58657180 T C N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 19 58657181 T C N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 19 58657220 A G Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 58657280 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 58658077 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 58659132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58659208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58659263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58659279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58659294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58659300 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58659326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58659477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58659595 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58659690 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58659697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58659746 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58659793 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58659887 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58659888 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58659978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58660032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58660195 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58660373 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58660415 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58660436 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 58660438 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58660440 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58660550 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58660605 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 58660606 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58660709 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 58660824 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58660938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58660984 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58661008 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58661174 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 58661195 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 58661237 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 58661418 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58661490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58661492 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 19 58661583 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58661593 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 58661616 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 58661956 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58662129 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58663599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58663815 G T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58663825 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58663849 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 58663945 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58663980 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 58663991 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58664278 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58664281 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58664302 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58664329 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58664338 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58664370 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 58664374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58664524 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58665130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58665620 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 58665636 C A Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58665982 G C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58666024 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58666058 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58666059 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58666152 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58666187 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58666431 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58666438 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 58666545 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58666546 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58666604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58666607 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58666682 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58666751 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58666892 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58666912 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 58667113 T A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58667171 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 58667179 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58667183 A C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58667190 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58667449 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 58667484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58667568 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 58667575 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58667576 C G Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 58667683 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 58667794 T C Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 19 58667797 G A Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 19 58667933 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 58667953 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 58667993 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 19 58668144 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 58668230 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 58668504 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58668739 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58668791 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58669932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58669935 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58670164 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58671069 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58672880 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58673525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58674613 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 58674960 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 58675029 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58675147 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58675232 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58675721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58675815 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58675879 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58675888 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58675891 G T Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 58676092 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58676165 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 58678612 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 58678687 A G Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 58678761 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 58678788 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58678879 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 58679059 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 58679204 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58679452 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 58679739 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58679808 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58679876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58679934 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58680076 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 58680085 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 58680399 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 58680422 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 58680566 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58680567 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58680741 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 58680994 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 58681319 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 58681531 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 58681535 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 58681620 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58681715 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58684076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58684651 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58684730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58684919 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 58684948 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58685700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58686962 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 58687409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58687417 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58687615 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58688575 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 58688646 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58688684 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58688855 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58688901 A T Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 19 58688903 G C Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 58688906 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58689074 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58689210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58690872 A G Y Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 19 58691287 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 58691312 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58691313 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58692711 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58692725 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 58692727 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 58692860 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 58692981 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 58693099 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58693557 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58696554 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 58697627 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 58697837 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58698427 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58698531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58698710 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 58698843 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58699123 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58699297 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58699886 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58700210 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 58700306 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58700504 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 58700584 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58700623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58700642 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58700673 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58700885 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58701050 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58701084 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58701263 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 58701776 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 58701976 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 58701986 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 58701991 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 58702138 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58702469 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58702945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58702992 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 58703245 A T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58704712 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58704884 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58704907 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58704912 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 58704953 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58705044 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58705079 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 58705688 A G Y Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 19 58705707 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 58705775 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58705801 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 58706382 C A Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 58706598 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 58706772 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58706979 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 58707098 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 58707697 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 58707910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58707986 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 58707992 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58708000 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58708503 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 58708629 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 58708634 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58708719 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58708743 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58708815 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 58708859 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 58708863 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 58708930 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58709280 A G Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 58709383 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 58709574 G A N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 19 58709602 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 58709656 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 58709700 A C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 58709701 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 58709704 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 58709719 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 58709781 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 58709803 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 58709842 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58709852 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58709873 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58709890 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58710135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58710320 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58710516 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58710643 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58710927 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 19 58710972 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 58711026 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58711584 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58711589 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 58711717 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58711795 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 58711802 T A Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 58711803 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 58711808 T C Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 58711953 T A Y N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 19 58711954 C T Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 19 58712021 C A Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 58712083 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58712092 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58712130 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 58712201 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58712307 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58712374 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58712390 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58712433 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58712465 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58712500 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58712545 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58712588 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 58712666 A G Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 58712757 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58712772 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58712805 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58712833 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58712897 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58712979 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58713011 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58713022 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58713067 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58713081 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58713083 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58713158 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58713239 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 58713338 G T Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 58713883 A G Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 58713892 A C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58713919 G T Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 58714061 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58714261 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 58714328 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 19 58714398 C T Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 19 58714618 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58714644 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58715007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58715009 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58715141 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58715144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58715155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58715289 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58715510 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58716035 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58716776 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58717010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58717390 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 58717938 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58717995 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58718548 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58718791 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58719301 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58719428 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58719729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58720101 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 58720147 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 58720357 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58720561 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 58720562 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58722311 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 58722467 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58722627 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58722676 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58722897 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58722903 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58722907 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58723086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58723132 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 58723319 C G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 19 58723327 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 58723670 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58724086 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58724096 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58724290 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58724449 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58724661 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58724856 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58725054 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58725251 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58725262 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58725484 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58726804 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 58726820 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58726995 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 58727219 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58727242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58727252 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58727317 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58727346 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 58727458 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58727678 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 58727737 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58727783 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58728074 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 58728174 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 58728291 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58728317 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 58728371 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58728591 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58728864 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58728964 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 58729011 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 58729055 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 58729102 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 58729110 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 58729176 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 58729234 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 58729442 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58729563 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58729625 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58729747 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58729791 C A Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58729823 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58729862 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58730273 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58730330 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58731435 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58731481 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 58731732 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58731794 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 58731893 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58732134 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 58732862 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58732867 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58732886 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 58733012 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58733039 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 58733176 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 58733254 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58733399 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58733403 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58733408 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58733507 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 58733517 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 58733777 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58735142 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 58735179 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58735550 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 58735939 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58736248 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58736261 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58736305 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 58736378 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58736437 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58736455 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 58736509 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58736600 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58736636 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58736672 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 58736788 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58737107 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58737298 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58737555 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 58737760 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58737811 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58737840 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58737997 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58738254 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58738655 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 19 58738957 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58739130 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58739425 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58739796 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 58739938 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 58740112 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 58741500 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58742979 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58743027 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58743675 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58745034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58745233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58745317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58745601 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 58745683 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 58745693 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 58745694 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58745945 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58746214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58746236 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58746317 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58746335 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58746550 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 58746557 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 58746756 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58746769 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58746815 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58746830 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58746841 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58746878 G T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58746992 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58747054 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58747069 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58747131 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58747140 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58747235 G T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58747543 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58747633 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58747733 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58747814 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58747873 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58747897 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58747935 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58747971 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58748521 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 58748525 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 58749057 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 58749112 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58749369 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58749376 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58749461 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58749842 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58751242 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 58753460 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58753876 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 58753939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58754029 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58754075 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58754374 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58754378 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58754418 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58755044 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58755064 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 58755082 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58755157 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 58755847 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 58755880 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58755900 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58755992 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58756228 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58756459 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58756579 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58756605 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58757295 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58757458 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58757465 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58757655 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 58758451 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58758483 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58759154 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58760692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58761872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58762953 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 58766601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58766821 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58766981 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 58767097 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58767119 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58767669 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58769012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58769816 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 58770176 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 19 58770577 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58772072 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58772377 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58773244 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58773257 T G Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 58773268 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58773429 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58777952 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58778145 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58778660 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 58779773 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 58780236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58782422 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 58782895 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58783231 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58783494 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58783659 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58784111 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58784133 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58784165 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58784171 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58784193 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58784347 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 58784459 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58784692 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58784710 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58784717 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58784754 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58784816 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58784849 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 58785016 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58785214 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58785355 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 58785712 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58785854 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58785894 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58785935 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58785963 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58786038 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58786212 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58786225 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58786384 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58786416 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58786875 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58786916 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58787147 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 19 58787282 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58787579 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58787651 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58787660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58787711 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58787924 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58787957 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58788205 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58788213 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58788350 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58788437 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58788484 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 58788557 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58788583 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58788610 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58788614 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58788652 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 58788891 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 58788951 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 58788960 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58789033 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58789290 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 58789293 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 58789553 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 58789693 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58789698 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58789745 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 19 58789746 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 19 58789766 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 58789852 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 58789863 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58789887 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58789890 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 58789937 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58789940 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 58790034 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58790143 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58791889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58792260 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58792271 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 58792986 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58793022 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58793073 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58794688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58794705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58795082 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 58798355 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58798603 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58800093 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58800644 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 19 58801078 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58801557 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58801937 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58803129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58806505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58808007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58808029 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58808077 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58808393 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 58808617 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58809050 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58809261 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58809322 T G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58809391 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 58809392 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58810370 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58810479 T A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58810588 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58811192 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58811202 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58811844 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58817400 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58817502 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58817525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58817632 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58818131 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58818444 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58818458 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 58818685 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58819428 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58820482 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58820583 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 58820882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58821769 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58821812 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58821842 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 58821846 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58822031 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58822494 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58823727 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58824097 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58824148 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58824326 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58824335 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58825963 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58826094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58828117 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 58828630 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 58829817 C G Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 58832043 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 58834777 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58835229 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58835439 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 58835924 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58835955 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58835984 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58836376 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 58836536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58836942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58837253 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58837380 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58837384 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58838562 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 58838963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58838977 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 58839132 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58839165 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 58839560 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 58839565 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 58839570 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 58839626 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58839687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58839718 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 58839855 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58839983 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 58840706 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 58841513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58841571 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58841816 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 58842581 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58843199 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58843232 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58843535 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 58843568 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 58843626 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 58843779 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58845235 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58845260 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58845468 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 58845507 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58845638 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58845672 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58847877 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58848637 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58848910 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58849677 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 58850079 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 58851712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58857409 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58857837 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 58862141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58862201 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 58862906 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58864559 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58865035 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 58865984 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58866006 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 58866027 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 58866029 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 19 58866070 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58866283 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58866290 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 58866472 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58866793 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 58866880 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58866960 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58867173 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 19 58867496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58868266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58868338 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58868670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58871316 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58871591 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58872261 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58875976 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 58876624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58877333 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58878466 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 58878891 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58878900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58880339 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 58883021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58884503 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58886101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58889440 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 58889444 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58889508 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 58889606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58889609 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58889721 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58890147 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 58890184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58890292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58890647 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 58891456 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 58891648 T G Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 58891741 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58891759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58891872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58891954 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58891964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58891977 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58891981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58891993 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 58892484 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58892558 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58892675 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58892815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58892886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58893437 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58893526 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58893718 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58893777 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58894160 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58894221 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58894224 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58894263 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 58894628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58894629 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 58895288 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 58895421 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 58895604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58896283 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58896381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58896408 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58896487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58896527 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58896541 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 58896542 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58896694 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 58896780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58897028 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58897207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58897757 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58898014 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58898112 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 58898128 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 58898275 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 58898468 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 58898568 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 58898668 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58898718 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58898850 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 58898930 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 58898993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58899134 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58899170 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 58899239 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 58899309 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 58899603 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58899626 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 58899694 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58899780 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58899799 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58899970 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58900274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58900283 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58900827 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58900838 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 58900839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58901007 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58901267 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58901489 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58901591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58901594 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58901731 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 58902090 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58902230 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58902500 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58903029 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 58903131 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 58903187 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 58903237 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 58903245 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 58903307 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 58903318 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58903508 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58903526 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58903692 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58903865 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58904381 T G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58904424 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58904479 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58904511 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58904535 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 58904629 C A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58905671 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58905707 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58905801 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 58905900 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 58905903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58906011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58906132 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 58906420 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58906436 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58906524 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 58907514 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 58907674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58907700 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58907804 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 58908098 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58908165 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 58908339 G T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58908423 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 58908507 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 58908646 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58908654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58908722 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58908798 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 58908924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58909119 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58909120 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58909233 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58909279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58909333 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 58910066 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 58910815 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 58910838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58910856 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 58910948 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58912145 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58912396 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 58913349 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58913350 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58914080 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 19 58918803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58919907 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 58920763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58921218 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58921917 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58922419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58922700 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58922712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58922768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58922788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58923110 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 58923176 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58923210 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58923267 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 58923300 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58923306 G T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58923496 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58923518 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58923662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58923674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58923691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58923871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58923903 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 58924412 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 58924700 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 58924768 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 19 58924868 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 58924960 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 19 58924988 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 19 58925025 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58925062 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58925081 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 19 58925147 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 19 58925221 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 58925223 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 19 58925310 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 58925520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58925679 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 58925685 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 58926270 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58926929 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58927036 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 58928964 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58930626 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 19 58930671 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 19 58930714 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 58930942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58931028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58931334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58931376 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58931381 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58931445 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58931535 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58931638 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58931665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58931931 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58932110 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58932328 G C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 58932340 G A Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 19 58932526 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 58932801 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 58932976 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 58933879 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 58933933 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 58934236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58934301 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 58934574 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58935170 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58935241 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58935252 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58935307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58935318 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58936077 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58936796 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58936933 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 58937181 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58937919 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58939662 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 58939695 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 58939723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58939734 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58939848 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 58939876 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 58939935 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 58940151 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 58940215 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 58940757 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58940948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58940985 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58941143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58941354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58941663 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58941672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58941687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58941796 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58941941 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 58942838 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 58942955 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 19 58943139 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 58943265 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 58943310 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 58943760 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58943789 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 58943800 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 58944024 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 58944035 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 58944053 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 58944250 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 58944313 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 58944397 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 58945500 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58945505 G C Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58945640 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58945804 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58946289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58946531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58946675 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58946721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58946815 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58947051 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58947115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58947138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58947265 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58947288 T G Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 58947299 G C Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 58947364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58947484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58947706 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 58947747 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58947975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58948046 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58948126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58948130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58948295 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58948338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58948551 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58948559 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58948611 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58948718 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58948719 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 58948834 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58948954 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58949066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58949102 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58949126 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58949171 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58949195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58949227 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58949256 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58949271 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58949569 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58950113 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58951389 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58952298 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58953078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58953588 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 58953613 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 58953629 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 58953735 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58953786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58953936 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58953994 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58954236 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58954355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58954375 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58954379 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58954424 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58954547 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58956517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58958272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58959314 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 58960121 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58960687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58961002 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58961520 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 58962784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58962991 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58966881 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 58967206 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58967777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58967827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58968017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58969039 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 58969734 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58969903 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58970179 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58970380 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58971102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58971718 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58977099 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58977233 G A Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 58977265 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58977568 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 58977600 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 58977664 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 58977844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58977873 C T Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 58977971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58978049 C A Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 58978071 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 58978101 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 58978538 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58978560 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 58978598 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 58978625 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 58978725 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 58978812 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58978915 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 58979001 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58979057 A T Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 58979328 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 58979535 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 58979552 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58979579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58979641 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58979707 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58979889 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58980026 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 58980034 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 58980045 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 58980053 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 19 58980380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58981367 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58981968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58982169 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58982264 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58982293 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58982419 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58982470 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58982522 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58982971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58982973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58983012 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58983033 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58983324 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58983376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58983679 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58983993 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58984799 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58985749 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58985963 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58986240 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58986271 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58986289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58986444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58986544 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58986844 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58986856 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58986902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58987256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58987285 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58987328 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58988210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58988267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58988270 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58988315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58988332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58988336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58988346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58988851 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58989147 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 58989565 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 58989775 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58990238 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58990260 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58990402 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 58990490 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 58990632 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 58990713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58990868 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 58990958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58990992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58991082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58991162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58991189 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 58991322 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58991424 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 58991660 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58991785 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 58991903 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58991996 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 58992101 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58992149 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58992163 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58992197 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58992277 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58992307 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58992455 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58992537 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 58992571 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58992650 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58992881 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58992882 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58993455 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58993560 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58994610 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58994722 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58994753 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58994815 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58994843 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58995095 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 58995214 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 58995244 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58995246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58995448 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58996268 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 58996292 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 58996519 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 58996577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58996584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58996679 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58996726 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58997054 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58997679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58997771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58997910 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58998076 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 58998178 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58998257 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58998322 C G Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 58998341 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 58998547 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58998560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58998610 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58998869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58998943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58998982 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58999191 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 58999214 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 58999245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58999257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58999309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 58999322 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58999326 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58999327 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 58999345 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 58999819 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 58999837 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 58999937 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 59000077 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 59000418 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 59000677 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 59000708 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 59000719 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 59000856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59000885 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59000926 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 59000930 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59000936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59000998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59001253 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 59001319 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59001375 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59001400 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 59001510 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 59002229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59002473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59002493 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59002511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59002564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59002652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59002707 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59003235 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59003262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59003604 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59003624 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59003706 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59003902 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59004451 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59004613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59004808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59005271 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 59005649 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59007056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59007324 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59007763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59008214 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 19 59008285 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 59008642 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 59008700 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 59008702 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 59008756 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59008773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59008827 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 59009142 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59009291 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59009328 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59009528 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 59009821 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 59009870 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 59010366 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 59010427 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 59010842 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59010847 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 59011002 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 59011084 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 59011088 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 59011288 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 59011335 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 59011709 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59012235 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 19 59013124 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 59013160 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 59013478 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 59013503 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59013533 C A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 59013541 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 59013738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59013799 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 59014005 T G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 59014052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59014068 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 59014134 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 59014222 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 59014236 G C Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 19 59014238 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 59014410 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59014426 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59014436 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59014448 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59014576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59014781 G T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 59016069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59016243 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 59016294 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59016368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59016626 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59016696 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59016733 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59016752 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 59017049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59017385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59017474 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 59017832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59018096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59018341 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59018393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59018399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59018433 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 59018501 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59018502 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59018522 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59018575 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 59018582 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 59018596 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59018691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59018745 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 19 59018782 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 59018826 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 59018841 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59018851 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 59018899 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59018944 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59018965 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59019037 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59019085 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 59019100 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 59019537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59019614 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 59019630 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 59019742 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 59019744 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 59019868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59020313 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59020611 G T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 59021654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59021658 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 59021777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59021837 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 59022617 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59023140 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59024195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59028978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59029748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59029805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59032413 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59032708 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59033954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59034520 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59034690 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 19 59035953 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59036018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59037130 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59038645 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 59039084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59042303 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 59042386 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 59042440 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59042816 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 59043335 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 59043398 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 59043952 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59044688 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 59045624 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59045915 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 59045994 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 59046205 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 59046457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59046700 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 19 59046891 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59047897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59048797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59049716 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59050491 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59051772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59053441 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59053718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59054970 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 59055513 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 59055886 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59055923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59056011 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 59056016 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 59057127 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 59058103 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59058243 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59058642 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59058662 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59058717 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59058860 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 59059277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59059391 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 59059831 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 59064222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59064559 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59066724 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59067302 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59067402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59070849 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59070890 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59071494 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59073326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59076230 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59077186 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59077836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59078169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59082263 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 59082296 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59082924 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 59083000 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 59083013 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 59083415 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59083736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59084273 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59084366 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59084863 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 59085227 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 59085382 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 59085433 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 59085492 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 59086383 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 59087161 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 59087291 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59087361 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59087383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59089617 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 59089947 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 59090112 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59090254 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59091217 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59091238 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59091411 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 59091596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59091917 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 59092339 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 59092844 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59095320 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59097025 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 59097224 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 59097235 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59097279 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 59097317 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59097398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59104215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59104791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59105349 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59105668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59105701 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59106112 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59106591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59106700 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59107305 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 59107308 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 59107362 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59107409 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 59107532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59107685 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59109246 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59109780 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 59110285 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 59110654 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 19 59110809 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59111091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59112319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59114038 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 59114105 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59115183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59115409 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59115474 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59118779 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59119323 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 59119565 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59119594 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 59119610 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59119803 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59120567 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59120659 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59121447 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 59121482 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 59121596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59123131 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59123365 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 59123607 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 59123644 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 59123712 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 59123733 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 19 59123755 A C Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 59125809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59125813 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59125814 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59125942 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 19 59126084 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59126791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59126984 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59126994 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59127014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59127877 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59128402 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59129836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59130654 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59130683 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 59131579 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59132573 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59132681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59134284 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 59135319 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59135444 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 59136257 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59136517 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59137121 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 59137594 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 59137722 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 59138074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59138301 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 59138411 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 59138430 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59138466 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 19 59138618 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 59138619 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 59138630 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 59139398 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59139445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59139801 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 59139850 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 59139851 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 59139897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59139988 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59140754 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59141136 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 59141339 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 59141539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59142388 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 59142698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59142724 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 59142752 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 59142768 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 59144250 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 59147278 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 59150614 T A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 59152121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59153647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59155796 A T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 59155860 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 59155870 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 59155894 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 59155912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59155948 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 59155981 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 59156495 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 59156505 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 59156512 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 59156516 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 59156520 T C Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 59157340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59157734 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 59158091 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59158612 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59159254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59160077 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59165584 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59165711 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59166497 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 59166509 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 59167203 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59167284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59167451 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 59167458 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 59167508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59167671 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59168210 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59168228 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 59168272 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 59169911 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 59169915 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 59169943 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59169959 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 59169967 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 59169988 C A Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 59169989 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 59169995 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 59169996 T C Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 59170325 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 59170394 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 59170404 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 59170430 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 59170519 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59170720 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 59170830 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59170899 C A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 59170905 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 59171024 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 59171226 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 59171291 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 59171381 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59171387 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 19 59171745 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 59172217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59172384 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59172416 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59172417 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59172709 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 59172921 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 59173642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59173676 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59173701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59173729 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59173746 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59173953 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59174294 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 59174382 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59174393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59174708 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59174737 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59174738 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59174740 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59175351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59175449 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59175458 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59175511 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59175557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59175633 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 59175708 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 59175732 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 59175786 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 59175804 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 59175864 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59175897 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59175939 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 59175940 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59175990 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 59175991 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 59176027 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 59176031 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 59176055 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 59176071 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59176108 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59176154 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 19 59176284 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 59176358 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 59176366 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 59176393 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 59176414 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 59176421 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 19 59176422 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 59176423 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 59176593 T A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 19 59176608 G T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 19 59176675 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59176740 G C N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 19 59176814 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 19 59176846 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 59176938 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 19 59177038 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59177167 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 19 59177180 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 59177361 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59177496 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 59177698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59177718 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59177719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59177859 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59177879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59177883 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 59178348 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 59179274 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 59179428 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 59179430 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 59179449 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59179601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59179624 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 59179643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59180023 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59180039 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59180062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59181049 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59181090 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59181667 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59181689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59182104 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 59182139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59182933 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59183704 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59185414 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 19 59187571 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59188633 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 59189085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59190084 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 59190512 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 59190516 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 59190594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59190666 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 59190822 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 59190870 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 59191035 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59191059 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 59191100 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59191116 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59191133 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59191136 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59191338 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 59192051 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 59195596 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59198419 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 59198457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59198616 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59198617 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 59198655 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 59199057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59199114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59199979 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 59200345 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 59201269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59201440 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 59201645 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59201654 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59201926 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59202026 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59202194 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59202564 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 59202603 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 59202825 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 59202828 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 59203383 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 59203560 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 59203572 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 59203631 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 59203633 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 59204245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59204732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59205238 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59206772 C A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 59206779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59206929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59207033 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59208062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59208261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59208316 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59209099 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59209105 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59212188 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59213114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59213337 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 59213370 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 59213384 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 19 59213491 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59215212 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 59215993 A C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 59216014 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 59217114 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59217121 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59217332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59219940 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59220070 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59220873 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59222201 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59222334 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59223056 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 59223409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59223936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59224599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59225470 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59225722 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59226557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59226919 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59227431 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 59228093 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 59229662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59230002 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59230105 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59230868 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 59230875 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59231110 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59231185 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 59231224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59231229 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59231789 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 59231795 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59231798 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59231971 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 59232245 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 59232246 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 59232560 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 59232563 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 59232589 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 59232607 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59232728 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59232743 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 59232800 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59232801 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59232885 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 59232886 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 59232889 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59232931 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59232932 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59232942 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59233208 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 59233590 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59233807 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 59234162 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59234164 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59234237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59234252 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59234341 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59234985 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59235052 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 59235076 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59236031 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 59236063 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59236369 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59236477 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 59236552 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 59236557 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 59237023 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 59237106 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59237340 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59237389 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59237433 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 59237946 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 59238260 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 59238502 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59238621 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59239599 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59242913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59243637 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59243717 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59251421 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59252467 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 59254374 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59255137 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 59255829 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59255912 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 59256401 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 59257639 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59257665 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59258045 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59258360 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59258388 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59258484 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59258641 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59258746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59258773 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59259464 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 59259529 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 59259675 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59259714 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 59259881 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 59259958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59260116 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59261340 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59262636 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 59263269 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 59263298 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 59263588 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 19 59263705 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 59264622 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 59264655 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 59265042 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59265049 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59265261 C A Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 59265976 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59266579 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 59267151 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 59268410 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 59268741 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59268996 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59269278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59269470 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59269501 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59269584 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 59269645 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59270362 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 59270455 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59270479 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59270517 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59270543 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 59270545 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 59270840 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 59271442 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 59271823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59271892 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59272055 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59272458 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 59272478 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59272629 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59272885 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59273030 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59274143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59276366 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59276479 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59276750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59277077 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59277220 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59277224 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59277256 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 59277479 G T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59277613 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 59277740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59277768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59278238 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59278634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59279253 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59280132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59281864 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 59281905 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 59282322 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 59282362 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 59283064 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59283475 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59283519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59283629 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59283734 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59283811 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59283822 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59283841 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 59283865 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 59283913 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59284195 C T N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 19 59284608 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 59284677 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59284850 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59285090 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59286893 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59287192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59287388 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59287405 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59287436 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 59290138 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59290831 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59291509 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59292290 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59292513 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 59292539 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 59293011 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59293184 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59293499 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59293985 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59294018 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59295707 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59295829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59295835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59295874 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59299565 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59299730 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 59300037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59300051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59300108 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59300120 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59300162 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59300174 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59300182 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59301087 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 59301088 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 59301213 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 59301278 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 59301570 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 59301608 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59301650 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59301651 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 59301705 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59301732 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 59301770 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 59301854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59301912 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 59302687 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 19 59302930 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 59302971 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 59303147 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59303207 G T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59303276 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 59303300 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59303412 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 59303472 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 59303573 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 59303584 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 59303682 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59303872 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 59303939 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 59304007 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 59304198 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59304303 G C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59304634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59304916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59304927 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59305295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59305526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59305539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59305632 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 59305745 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 59306095 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59306175 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 59306246 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59306307 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59306327 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59306411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59306651 A T Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 59306820 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59306982 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 59306992 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59307050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59307059 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59307096 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59307195 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59307237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59307455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59307462 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59307671 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 59307681 C G Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 59307684 G T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59307978 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 59308082 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59308109 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59308397 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59308447 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59308497 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59308537 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59308612 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 59308901 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59308903 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59309169 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59309170 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59309237 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59309242 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59309526 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59309562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59309597 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 59309665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59310036 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59310113 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59310194 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59310282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59310317 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59310369 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 59310396 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59310743 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59310817 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59310839 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59311130 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59311146 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 59311248 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59311786 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59312003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59312310 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59312351 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 59312363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59312393 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 59312592 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59312875 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59312965 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59313146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59313183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59313198 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59313543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59313548 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59313585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59313593 A T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59313810 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59313827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59314015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59314180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59315240 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59315442 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 59315535 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59315584 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59315662 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59315692 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59315721 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59315872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59316033 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59316305 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59316363 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59316399 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59316531 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 59316598 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59316739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59317202 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59317308 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 59317461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59317711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59317776 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59317792 A T Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 59317816 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 59317865 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59317968 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59318104 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59318119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59318215 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59318249 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59318429 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 59318453 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59318500 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 59318503 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 59318519 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 59318539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59318581 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 59318612 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 59318645 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 59318652 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 59318685 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59318791 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 59318862 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 59318868 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 59318906 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 59318942 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 59319055 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59319184 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 59319185 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 59319287 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 59319333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59319334 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 59319411 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59319463 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 59319489 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 59319513 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 59319517 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 59319580 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 59319909 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59319911 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59320131 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59320184 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59320258 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59320274 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59320349 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59320621 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59321213 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 59321417 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59321429 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 59321534 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59321667 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 59321701 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59321780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59321822 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59321853 C G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59321921 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59322157 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 59322185 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 59322197 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59322274 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 59322277 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 59322279 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 59322605 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59322656 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59322678 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59322733 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59322969 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59322987 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59322988 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 59323016 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59323053 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59323147 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59323205 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59323460 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59323582 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 59323957 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59324099 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 59324261 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59324403 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 59324473 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59324491 T A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 59324540 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59324754 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59324767 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59324769 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 59324814 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59324906 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59325423 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 59325471 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 59325925 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 59326366 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59326369 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59326431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59327297 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59327305 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59327448 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59327451 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59327467 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59327468 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 59327485 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59327676 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 59327678 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 59327722 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 59327723 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 59327773 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 59327781 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59327793 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59327797 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59327858 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59327906 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 59327957 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 59327968 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 59328063 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 59328065 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 59328198 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 59328605 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 59328616 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 59328900 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 59328965 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59328990 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59329120 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59329213 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59329312 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59329779 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59329904 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59329935 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 59329961 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 59330034 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59330481 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 59330548 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59330640 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59330684 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59330767 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59330780 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59331000 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 59331044 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59331071 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59331172 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 59331234 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 59331274 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 59331369 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 59331466 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59331470 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 59331576 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 59331577 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 59331578 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59331620 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59332321 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59332631 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59333080 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59333485 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 59333494 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 59333909 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59334832 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59334843 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59335112 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59335455 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59335653 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59335726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59336226 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 59336531 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59336716 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59337054 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59337391 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59337770 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59337773 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59338005 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59339964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59340131 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 59340339 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 59340816 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59341076 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 59341461 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59341656 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59342358 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59343293 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59343432 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59343801 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59343851 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59343855 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59343899 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59344028 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59344352 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 59344450 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59344485 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 59344688 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59344766 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59345024 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59345109 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59345236 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59345313 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59346356 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59346874 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59346875 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59347074 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59347572 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59347575 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59347600 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59347684 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59348620 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59348659 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59348668 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 59348928 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59349642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59350420 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59350542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59350623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59351190 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59351239 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59352244 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59353039 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59353323 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59355323 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59355324 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59355999 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 59356044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59357090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59357396 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59357490 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59358106 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59358222 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59358383 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59358746 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 59358959 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 59359033 C A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 59359286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59359395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59359428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59359431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59360217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59362153 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 59362292 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 59362515 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59362679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59362694 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59363065 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59363200 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59363517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59364095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59364288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59364444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59364503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59364724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59366624 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59367494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59367587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59368085 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59368193 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59368282 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59368365 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59368450 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59368941 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59371503 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 59372457 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59372536 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59373219 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59373595 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 59373722 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59374121 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 59374268 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59376819 C A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59377841 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59378261 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 59380308 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59381139 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59382197 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 59382304 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59382492 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59384410 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59385125 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59385212 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 59385793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59386044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59386179 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59386758 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59388715 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59389191 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 59389502 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59389730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59390225 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59391985 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 59392883 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59394490 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 59394757 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 59395188 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 59396320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59396687 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59397566 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59397669 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59397670 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59397753 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59398120 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59398400 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59398448 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59398541 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59398955 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59398982 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59399024 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59399028 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59399112 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59400244 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 59400280 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 19 59403248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59403890 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59407043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59407293 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59409368 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59409537 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59410294 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 59412665 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59412678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59412749 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59414738 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 59415485 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59416083 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59416138 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59416415 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 59416454 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 59416550 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59416562 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 59416678 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59416764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59416848 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59416969 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 59417310 T G N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 19 59417438 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59417493 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59417512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59417535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59418059 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59420030 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59420557 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59420709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59421334 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 59421463 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59421677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59421838 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59422028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59422119 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59422150 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59422576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59422720 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59422767 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59422904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59422935 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59422979 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 59423266 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59423390 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59423654 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59424032 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59424201 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59424303 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59424908 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59424960 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59425041 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59425085 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59425174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59425670 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59425711 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59425746 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59425749 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 59425901 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59426229 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59426690 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59426908 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59427557 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 59427750 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59427810 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59427833 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59427836 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59427902 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59427943 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59428188 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59428626 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59429266 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59429475 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59429660 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59429987 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59429999 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59430596 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 59430605 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 19 59430706 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 59431191 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59431570 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59431889 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 59432319 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 59432740 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 59432745 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 59432761 G T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59433192 C G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 59433282 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59434123 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59434229 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59434237 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 59434257 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 59434350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59434691 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59435722 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59436374 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59436377 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 59436477 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 59441002 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59442954 T C Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 59442959 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59443234 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 59443274 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 59443545 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 59443768 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 19 59444123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59445854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59446204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59447481 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59447784 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59447968 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59448021 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59448027 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59448190 G A Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 19 59448735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59448801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59449846 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 19 59450762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59452652 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59454422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59454913 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59454930 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59454973 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59455626 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59457115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59457176 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59457394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59457632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59457956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59458692 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59458869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59458985 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59459986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59460194 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59461971 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59461979 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59462015 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59462043 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59462096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59462395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59462718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59463115 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59463248 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59463744 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59463961 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59465045 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59465354 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59465420 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59466767 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59466915 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 19 59467009 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 59468608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59470227 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59470411 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59470733 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59471052 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59471089 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59471093 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59471189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59471201 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59471212 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59471286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59471360 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59471492 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 59471693 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 59471732 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 59471758 G C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59471941 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59472105 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 19 59472186 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 59472240 C T Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 59472280 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 19 59472287 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 59472338 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59472339 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59472362 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59472577 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 59472579 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59472615 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59472714 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 59472758 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59472765 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59472792 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 59472793 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 59472944 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59472966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59473404 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59473715 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 59473856 G C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 59474140 C G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59474238 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59474660 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59475408 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59476230 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59476235 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59476816 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59476902 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59476908 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59478082 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59478303 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59478427 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59478644 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59478694 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 59478833 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 59478842 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 59478880 G C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 59478882 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 59479047 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59479207 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59479515 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59479518 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59479536 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59479592 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59479646 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 59479817 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59480007 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59480086 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59480126 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59480230 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59480278 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59480281 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59480570 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59480845 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 59481077 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59481126 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59481405 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59481892 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59482763 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59483110 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59483198 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59483234 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59483681 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59483715 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59483917 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59484013 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 59484111 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59484162 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59484308 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59484321 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59484340 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59484409 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59484442 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59484524 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59484526 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59484624 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59484630 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59484746 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59485203 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 59485224 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 59485227 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 59485259 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 59485378 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59485425 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59485445 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59485549 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59485672 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59485834 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59485835 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59485838 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59485869 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59486112 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59486538 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59486539 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59486587 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59486604 G C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59486661 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 59486982 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59487221 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59487222 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59487292 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59487384 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59487471 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59487483 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59487492 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59487635 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59487651 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59487825 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59487833 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59487926 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59488204 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59488225 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59488329 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 59488454 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59488526 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59488559 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59488611 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59488745 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 59488830 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59488913 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59488998 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59489156 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59489170 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59489249 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59489426 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59489929 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59490060 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59490517 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59490858 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59491074 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 59491130 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 59491173 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 59491345 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 59491369 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59492028 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59492157 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59492245 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 59493757 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59494059 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59494080 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59494315 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59494669 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59495074 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59495344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59495501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59495826 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59495942 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59496139 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59496226 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 59496640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59496664 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59496965 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59497139 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59497143 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59497421 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59497578 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59499026 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 19 59499074 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59499209 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59499338 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59499906 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59500518 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59501000 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 59501910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59503176 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 59503559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59503562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59503926 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59504580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59504649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59504746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59504772 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59504779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59504838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59504842 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 59504868 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59504946 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 59505214 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 59505244 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 59505457 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59505684 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 59505710 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 59505764 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 59506142 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 59506277 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 59507079 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59507087 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59507097 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59507592 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59507640 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 59508050 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 59508071 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 59508231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59508259 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59508518 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59508649 C A N N 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 12 8 3 6 1 19 59508925 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 59509188 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59510130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59510142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59510293 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59512097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59512388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59512420 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59512555 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 59512626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59513499 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 59513500 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 59513623 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 59513787 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59513790 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59513858 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 59514225 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 59514415 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 59514447 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59514540 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 19 59514822 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 59514824 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 19 59516003 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 59516080 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 59516220 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 59516454 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 59516464 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 59516473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59516480 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 59516481 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 59516520 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 59516525 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 59516573 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 59516582 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 59516623 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 59516976 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 59517466 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59517517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59517558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59517866 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 59517888 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 59518047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59518059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59518140 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 59518142 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59518165 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 59518245 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59518295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59518532 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59518641 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 59518723 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59518987 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59519060 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 59519133 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 59519255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59519276 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 59520494 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 59520542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59520692 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59520882 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 59521384 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59521386 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59521425 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 59521771 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59521907 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59522213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59522334 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59522509 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59522549 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59522570 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59522637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59522671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59522719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59522911 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59522926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59523062 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59523412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59524002 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 59524106 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59524160 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59524589 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 59524906 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 59525719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59525752 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59525784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59525787 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59525930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59526375 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59526472 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59527024 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59527294 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59527910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59527979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59527996 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59527999 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59528227 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59528318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59528347 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59528420 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59528434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59528855 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59529738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59529832 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59530054 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 59530260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59530465 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 59531091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59531099 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59532081 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59532082 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59532297 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59532322 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59532690 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59532793 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59533028 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59534330 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59534406 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59534648 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59535222 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59535319 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59535539 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59535653 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59535722 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 59535818 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59536780 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59536813 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59537484 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59537603 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59537661 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59537689 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59537870 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59537889 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59537902 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59537966 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59538096 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59538201 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 59538288 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59538559 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59539243 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59539979 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59541311 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59542313 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 59542417 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59542424 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59543210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59543326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59543505 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 59543518 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59543581 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 59543663 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59543727 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 59543946 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59544364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59546126 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 59546730 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 59546885 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 59546888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59546995 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59547624 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 59547725 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 59547859 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 59547944 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 59547947 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 59548005 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 59548076 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 59548126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59548645 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 59548734 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 59548739 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 59548797 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 59548858 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 59548933 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59548934 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 59549000 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 59549026 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 59549037 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 59549046 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 59549199 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 59549266 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 59549287 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 59549526 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 59549556 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59549633 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 59549706 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 59549820 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 59549845 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 59549846 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 59549847 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 59550014 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 59550048 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 59550069 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 59550463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59550684 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59551740 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59552216 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 59553252 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 59553258 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 59554106 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59554202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59554246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59554616 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59554890 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 59555389 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 59555438 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 59555455 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59555460 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59555637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59555828 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59555995 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59556287 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 59556351 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 59556534 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 59556758 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 59556819 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 59557187 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59557323 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 59557397 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59557429 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59557463 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59557594 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59557630 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59558228 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59558249 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59558318 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59558611 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59558894 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59558944 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59559142 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59559211 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59559219 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59559286 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59559287 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59559351 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59559396 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 59559680 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 59560100 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59560731 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59560896 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59560950 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59561114 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59561798 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59562048 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59562603 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59563155 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59563233 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59563316 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59563693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59563812 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59563951 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59564021 A C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59564040 G C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 59564107 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59564132 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59564157 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59564224 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59564316 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59564461 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 59564538 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59564589 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 59564786 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59564921 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59565163 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59565458 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59565477 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59565506 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59565545 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59565633 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59565686 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59566193 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59566252 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59566604 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59566613 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59566640 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59567148 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 59567550 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59568093 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59568152 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59568197 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59568198 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59568525 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59568530 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59568583 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59568613 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59568693 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59568738 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59568810 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59568834 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 59568951 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59568958 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 59569217 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59569235 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59569548 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59569550 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59569628 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59569660 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59569691 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 59569692 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59569708 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59569853 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59569870 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59569901 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59571228 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59571347 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59571657 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59571658 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59571731 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59571768 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59571961 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59571999 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59572006 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59572447 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59572450 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59572475 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59572496 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59572635 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59572721 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59572865 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 59572975 C A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 19 59573270 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 59573415 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 59573437 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59573477 T G Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59573587 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59573707 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 59573939 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 59574035 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59575371 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 59575608 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 59575738 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 59575863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59577235 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59578065 G C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59578747 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 59579020 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 59579223 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59579714 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59579917 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59580565 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 59580852 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59581926 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 59582555 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59582802 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 59583241 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 59583594 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59584326 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59584601 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59584673 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 59584718 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59584879 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59585499 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59585908 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 59586033 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 59586285 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 59586323 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 59586407 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59586509 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 59586636 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 59586694 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 59586721 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 19 59586765 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 19 59586768 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 19 59586878 A G N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 19 59587068 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 59587185 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59587274 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59587442 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59587513 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59587546 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59587698 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59587825 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59587836 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59588096 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59588123 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59588124 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59588473 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59588490 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59588822 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59588825 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59588838 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59589059 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 59590776 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59590777 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59590932 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59591433 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 59591434 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 59591503 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59591756 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59591901 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59591961 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59592052 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59592245 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59592249 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59592267 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59592341 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59592502 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59592552 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59592872 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59592891 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59592902 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59593034 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59593499 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59593505 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59593658 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59593659 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59594052 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59594648 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59595240 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59595274 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59595286 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59595291 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59596059 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59596659 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59596774 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59596834 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59597292 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59597293 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59597613 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59597672 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59597736 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59597976 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59598684 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59598914 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 59598942 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 59599494 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59599547 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59599557 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59599613 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 59599691 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59599801 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59600033 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59600074 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59600075 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59600076 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59600283 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59600396 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59600423 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59600438 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59600544 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59600579 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59600632 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 59600867 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59600930 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59601023 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 59601076 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59601152 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59601444 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59601524 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59601726 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59601816 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59602006 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59602045 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59602067 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59602093 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59602590 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59602871 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59603120 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59603254 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59603256 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59603539 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59604038 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59604238 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59604254 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59604452 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59604633 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59604674 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59604677 A C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59604705 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59604754 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59604844 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59605062 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59605142 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59605224 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59605652 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 59606108 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 59606191 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59606226 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59606293 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 59606335 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59606393 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59606590 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59606722 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59606774 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59606850 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59607079 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59607345 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59607356 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59607421 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 59607462 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 59607577 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 59607606 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59607710 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 59607840 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59607917 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59608127 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59608853 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59608892 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59609023 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59609189 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 59609389 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59609421 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59609601 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59609625 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59609734 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 59609735 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59609970 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59609974 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 59610025 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 59610032 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 59610457 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59610665 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 59610674 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 59611027 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 59611031 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 59611266 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 59611461 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 59611479 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59611806 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 59611963 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59612103 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 59612197 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59612221 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 59612339 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59612353 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59612597 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59612845 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59613076 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 59613188 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 59613263 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59613272 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59613299 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 59613305 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 59613446 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59613872 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 59614018 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59614057 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59614138 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59615871 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59615927 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59616674 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59617143 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59617234 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 59617575 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 59618117 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59618182 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59618199 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59618220 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59618515 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59618544 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59618569 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59618640 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59618718 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59618795 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59618908 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59619025 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 59619252 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 59619427 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 59619466 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59619477 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59619511 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59619798 T G Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 59619873 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 59620278 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59620662 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 59620895 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59620896 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59620986 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59621070 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59621496 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59621578 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59621709 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 59621820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59622088 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 59622365 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59622369 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59622435 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59622629 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 59622688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59622716 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59622792 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59623082 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59623127 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59623266 G C N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 19 59623614 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59623647 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59623699 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59623869 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59623927 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59624100 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 59624487 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59624548 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59624579 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59625015 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59625017 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 59625278 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59625437 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59625516 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59625559 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59625576 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59625581 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59625851 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59625876 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 59625880 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59625942 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59625957 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59626024 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59626075 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59626080 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59626085 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59626096 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59626137 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59626171 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59626182 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59626198 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59626310 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59626562 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 59626563 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 59626570 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59626618 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59626783 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59627024 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59627065 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59627078 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59627133 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 59627134 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59627258 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59627265 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59627332 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59627679 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59627719 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59627738 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59627860 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59627952 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59628032 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59628064 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59628212 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59628224 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59628227 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59628313 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 59628335 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 59629048 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 59629172 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59629214 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59629463 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59629584 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59629718 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59629937 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59630112 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59630216 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59630227 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 59630390 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59630491 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 59630753 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59631376 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59631515 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 59631636 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59631717 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 59631869 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 19 59632347 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59632519 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 59632562 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59632606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59632608 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59632777 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59632868 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59632903 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 59632918 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59632943 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59633068 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59633120 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59633288 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59633294 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59633338 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59633372 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59633432 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59633453 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59633487 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59633505 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59633551 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59633561 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59633608 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59633614 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59634111 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 59634232 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59634249 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 59634550 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 59634578 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59634580 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 19 59635307 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 59635439 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 59635457 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 59635523 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59635620 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 59635645 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 59635659 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59635747 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59636115 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59636268 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59636312 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59636623 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59636642 G C Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59637478 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59637695 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59638256 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 59638383 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 19 59638763 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59639161 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 59639332 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59639407 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 59639432 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 59639623 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 59639799 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 59639962 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59640020 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59640042 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59640078 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59640173 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 59640514 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 59640567 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59640602 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59640734 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 59640790 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59640807 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 59640870 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 59640891 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59640961 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59641023 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 59641582 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59641728 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59641789 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 59642423 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 59642498 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 59642698 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 59643073 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59643079 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 19 59643081 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 59643085 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 59643120 G T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 19 59643121 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 19 59643136 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 59643182 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 59643387 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 59643491 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59643776 A C N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 19 59644551 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 59644827 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 59645009 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59645047 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 59645084 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 19 59645189 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 19 59645211 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 19 59645593 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 19 59646198 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59646595 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59647074 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 59647289 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 19 59647531 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 59647632 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 19 59647686 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59648370 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 59648438 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 59648516 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59648579 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59648651 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 59648677 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 59648878 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 19 59649679 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 59649709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59649994 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59650367 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59650893 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59651717 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 59652143 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59652198 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59652260 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 59652839 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59653142 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 59653580 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 59653582 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 59653587 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59653945 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59654021 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59654203 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 59654227 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 19 59655037 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 59655106 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59655115 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59655188 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 59655222 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 59655254 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59655282 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 59655314 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 59655381 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 59655440 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 19 59655451 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 59655638 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 59655913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59656177 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 59656900 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59656902 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59657437 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59657534 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 59657885 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59657997 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59658050 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 59658092 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59658169 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59658492 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 59658628 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 59658679 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 59658939 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 59658984 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 59658991 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 59659130 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 19 59659334 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 59659440 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 59659476 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 59659510 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 59659525 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 59659944 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 59660338 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 59660339 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 59660389 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59660845 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 59661007 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59661040 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 59661324 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59661796 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59661901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59662067 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59662122 T C Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 59662477 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59662484 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 59662931 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 59662986 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 59663027 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 59663449 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 59663482 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 59664766 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59664849 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59665441 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59665639 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 59665657 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59665780 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59665879 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59665972 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59666325 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 59666410 G T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 59666781 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59667355 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 19 59667763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59667774 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59667880 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59668008 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59668040 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59668314 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59668326 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59668632 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59668819 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59668849 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59668860 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 59669775 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59669956 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59670026 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59670276 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59670339 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59670343 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59670354 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59670400 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59670436 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59670889 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59670938 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59671059 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59671093 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59671440 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59671445 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59671446 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 59671460 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59671529 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59671543 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59671545 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59671549 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 59671565 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 19 59671642 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59671647 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59671711 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59671795 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59672071 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59672082 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 59672104 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59672132 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 59672164 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 59672199 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 59672206 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 19 59672262 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59672398 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59672575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59672672 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59672769 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 59672815 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 59672839 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 59672982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59673325 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 59674928 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 59674940 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 59674969 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 59675058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59675131 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59675179 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 59675195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59675274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59675292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59675301 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 59675307 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59675664 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 59675789 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59675790 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 59675958 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 59676300 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 59676319 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 59676343 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 59676385 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 59676403 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 59676492 C A Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 59676547 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 59676630 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 59676669 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 59676683 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 59676719 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 59676954 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 59676962 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 59676999 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 59677000 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 59677274 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 59677325 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 59677339 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 19 59677361 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 19 59677407 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 59677426 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 19 59677521 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 59677726 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 59677782 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 59677790 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 59678078 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 59678109 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 59678121 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 59678157 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 59678169 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 59678172 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 59678218 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59678411 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59678453 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 59678473 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 59678539 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 59678736 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 59678818 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 59678848 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 59678853 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 59678922 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 59678985 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 59679021 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 59679113 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 59679150 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 59686690 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 19 59687710 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 59687795 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 59688715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59689650 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 19 59690574 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 59690902 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 59691190 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 59691302 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 59691454 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 59691456 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 59691557 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 59691644 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 59691719 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 19 59691748 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 59691815 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 59691857 A C Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 59692333 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59692386 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 19 59692397 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 59692927 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 59692965 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 59692982 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 59693404 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 59693429 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 59693455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59693491 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59694040 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59694064 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59694109 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59694341 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 59694605 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59695112 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 59695864 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 59696075 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 59696191 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 59696289 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 19 59696314 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59696343 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59696366 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 59696369 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59696370 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 59696815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59696858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59697255 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 59697271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59697306 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 59697449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59697603 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 59697690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59698102 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 59698253 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 59698290 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 59698348 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 59698513 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 59698572 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 59698668 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59698772 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 59698995 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 59699131 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 59699198 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 59699375 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 59699595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59699598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59699611 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 59699808 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 19 59699814 A T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 19 59699872 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59700877 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 59700912 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 19 59700952 A T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 19 59701468 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 59701513 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59701636 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 19 59701904 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 59701905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59702958 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 59703023 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 59703303 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 59703388 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59703519 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 59703557 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 59703584 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 59704907 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 59705054 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 19 59705274 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59705393 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 59705529 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 59705729 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 59705930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59705949 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59705955 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 59705977 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 59706113 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 59706116 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 59706191 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59706237 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 59707167 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 59707176 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 59707273 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 59707381 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 59708608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59708710 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 59708857 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 59708972 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59709063 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 59709118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59710113 T C N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 19 59710245 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 59710781 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59711010 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 59711161 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59711663 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 59712702 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 59712767 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 59712829 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 59712885 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 59712995 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 59713004 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 59713056 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59713057 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 59713068 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 59713152 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 59713566 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 19 59713985 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 59713994 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 59714121 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 59714234 G A N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 19 59714428 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 59714539 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 59714571 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 59714721 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59714756 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 59714762 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 59714842 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 59715028 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 59716039 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59716570 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59716699 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59716837 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59717088 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59717313 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59718484 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59718599 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59718620 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59718628 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59718642 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59718677 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59718815 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59718834 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59718840 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59718845 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59718875 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59719186 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59719253 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59719320 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59719577 T A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59719957 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59719972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59720126 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59720259 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59720300 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59720327 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59720382 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59720676 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 59720722 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59720778 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 59720848 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59720892 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59720896 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59720924 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59720993 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59721014 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59721100 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59721129 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59721145 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59721260 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59721262 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59721303 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59721322 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59721454 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59721470 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59721540 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59721566 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59721818 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59722097 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59722102 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59722114 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59722156 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59722181 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59722215 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59722314 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59722435 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 59723108 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59723163 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59723201 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59723232 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59723330 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59723473 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59723544 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 59723784 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59723859 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59723889 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59723922 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59723957 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59724000 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59724019 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59724090 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59724158 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59724251 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59724257 A T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59724304 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59724377 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59724378 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59724385 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59724700 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59724713 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59724723 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59724839 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 59724955 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 59725026 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59725107 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 59725634 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59725737 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 59725786 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 59725911 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59725948 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59726002 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59726019 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59726048 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59726064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59726099 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59726240 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59726316 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59726692 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59726809 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59726821 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59726969 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59727273 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59727605 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59728117 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59728132 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59728345 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59729271 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59729456 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59729486 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59729635 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59730473 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 59730571 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 19 59730652 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 59730655 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 59730900 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 59730947 A G N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 19 59731247 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 19 59731278 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 59731466 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 59731470 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 59731567 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59731727 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59731885 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59731897 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59731934 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59731957 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59732028 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59732102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59732133 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59732137 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59732197 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59732382 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59732402 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 59732470 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59732661 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59732772 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59732978 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59733133 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59733169 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59733173 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 59733270 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 59733687 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59733815 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59733819 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59733830 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59733932 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59733957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59734406 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59734652 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59734696 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59734719 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59734885 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59735209 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59735243 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59735417 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59735474 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59735564 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59735599 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 59735647 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 59735847 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 59735994 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59736295 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59736314 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59736397 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59736411 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59736444 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59736578 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 59736684 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59736685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59736899 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59737289 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 59737296 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 59737378 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 59737408 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 59737588 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 59737593 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59737759 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59741170 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59741332 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59741436 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59741808 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 59741818 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 59742119 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 59742135 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 59742200 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 59742206 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 59742217 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59742238 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59742348 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59742378 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59742386 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59742392 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 59742513 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59742564 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 59742737 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 59742757 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 59742760 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59742781 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59742943 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59742970 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59742973 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59743170 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59743207 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59743278 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59743526 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59744266 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 59744338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59744660 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59744687 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59745160 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59745632 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 59745928 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59746189 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59746791 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59747129 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59747364 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 59747367 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 59747455 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59747474 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59748301 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 59748367 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59748380 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59748444 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59748459 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59748631 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 59748635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59748711 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59748792 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59748812 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59748899 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59749057 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59749096 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59749370 C A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59749374 A C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59749380 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59749760 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59749878 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59749904 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59749936 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59750041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59750048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59750062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59750076 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59750152 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59750177 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 59750308 C G Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59750375 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59750416 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 59750549 G T Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 59750565 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 59750644 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 59750842 T G N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 19 59750872 G A Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 59751004 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 59751874 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59751968 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59752183 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59752453 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59752553 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59752557 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59752978 G C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59753070 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59753172 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59753201 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 59754044 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59754523 T A N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 19 59755879 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59756557 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59756714 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 59757084 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59757128 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59757132 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 59757434 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 59757541 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 59757682 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59757713 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59758000 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59758038 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59758047 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59758241 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59758264 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59758530 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59758580 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59758619 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 59758683 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59758947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59758975 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59759158 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59759396 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59759410 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59759423 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59759424 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59759462 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 59759870 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59759926 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59760125 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59760126 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59760174 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 59760186 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59760191 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59760212 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59760236 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59760420 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59760699 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59760769 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59760782 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59760849 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59760984 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 59761246 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59761284 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59761491 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59761492 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59761558 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59761738 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 59761847 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59761898 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59762267 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59762484 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59762535 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59763604 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59763658 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59764257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59764273 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59764436 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 59764535 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59764589 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59764636 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59765439 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59765873 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59766389 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59766503 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59766680 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 59767041 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59767412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59767916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59768410 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59768601 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59768677 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 59768698 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 59768890 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59768998 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59769004 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59769011 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59769249 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59769268 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59769321 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59769368 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59769378 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59769379 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59769397 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59769706 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59770122 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 59770123 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 59770221 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 59770246 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59770288 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59770309 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59770339 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59770452 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59770577 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59770579 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59770657 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 59770819 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 59770863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59770964 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59771462 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59771557 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59771776 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59771826 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 59772124 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 59772406 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 59772471 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59772727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59773395 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 59773414 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 59773456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59773711 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59774176 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 59774408 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 59774592 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59774700 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59774712 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59774997 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 59775003 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 59775039 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59775220 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 59775230 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 59775287 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 59775506 C A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 59775512 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59776472 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59776696 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59776802 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59776982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59778106 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59778777 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59779137 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 59780031 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59780047 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59780057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59780347 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59780511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59780643 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59780757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59781452 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 19 59781666 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59781825 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59781841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59781928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59782025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59783087 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 59783439 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59783535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59784121 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59784161 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59784572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59784781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59784867 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 59784918 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59785072 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59785102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59785180 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59785215 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59785361 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 59785467 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59785533 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59785658 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59785710 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59785795 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 59786042 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59786052 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59786076 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59786083 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59786150 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 59786173 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 59786300 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 59786539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59786614 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59786679 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59786691 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 59786991 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59787057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59787361 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59787382 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59787542 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59787632 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 59787995 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59788033 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59788494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59789105 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 59789985 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 59790028 A T N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 19 59791665 A C N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 59791828 A C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 59792167 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59792210 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59792226 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59792447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59792641 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59792653 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59792734 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59792736 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59792937 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59792952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59792965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59792974 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59793109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59793185 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 59793194 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 59793233 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 59793348 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 59793380 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 59793997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59794190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59794294 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59794397 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59794410 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59794413 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59794432 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59794475 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59794484 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59794487 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59794742 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59794806 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 59795307 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59795390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59795400 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 59795758 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59796265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59796456 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59796602 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59796771 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59796773 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59796786 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59797015 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59797321 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 59797532 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59798327 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59798551 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59798594 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59798626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59798818 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59799052 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 59799165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59799173 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 59799296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59799346 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 59799466 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59799557 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59799642 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59799654 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59799689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59799757 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 59799772 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59799824 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59799853 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59799881 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59799889 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59800217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59800290 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 59800599 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59800604 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59800667 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59800793 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59800820 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59800840 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59800998 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59801004 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59801712 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 59801903 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59801958 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 59802037 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59802115 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59802124 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59802129 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59802264 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59802324 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59802518 G T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59802929 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 59802967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59802971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59803085 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59803373 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59804499 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 59804671 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59804705 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59804850 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59805191 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59805266 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59805562 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 59805708 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59805716 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 59807200 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59807462 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 59808321 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59808526 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 59808607 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59808925 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 59809225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59809291 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59809298 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59809907 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 59809914 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 59810039 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59810054 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59810074 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 59810132 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59810219 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59810591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59810768 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 59810934 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 59811041 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 59811071 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59811348 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59811384 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 19 59811507 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59811542 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59811544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59811610 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59812791 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59812963 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 59813034 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59813139 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 59813165 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 59813340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59813421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59813720 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59813989 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 59814607 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59814630 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 59814785 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 59814801 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 59814812 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 59814854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59814947 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59815394 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59815455 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 59815565 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 59815583 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59815636 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 59815654 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59815667 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59815716 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 59815735 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59815792 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59816115 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 59816132 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 59816502 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 59816530 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59816582 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 59816951 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59817469 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59817520 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59817564 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59817656 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59817723 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59818492 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59818858 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59818995 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59819350 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59819564 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59819669 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59819935 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 59820189 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59820274 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59820275 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59820305 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59820830 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 59820832 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 59820844 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 59820943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59821076 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59821109 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59821479 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 59821764 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59821817 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59822001 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59822106 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59822539 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59822560 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59822780 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 59822836 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 59822847 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59823864 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 59824485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59824529 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59824550 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59824614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59824653 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59825176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59825578 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59825834 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59826099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59826201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59826407 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59826509 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59826534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59826829 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 59826877 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 59827040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59827043 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59827100 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59827197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59827324 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59827667 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 59828486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59828573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59828623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59828655 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59831019 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59831324 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59831628 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59831639 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59831661 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59831723 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59831838 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59831854 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59831865 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59831870 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59831881 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59831900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59832053 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59832055 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59832138 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59832247 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59832303 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59832750 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 59833696 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59834685 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59834724 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59834801 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59834938 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59834944 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59834954 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59835193 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59835744 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59835784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59835894 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59835934 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59835994 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59836389 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59836665 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59836682 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59836708 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59836773 T C N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 19 59836877 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59836903 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 59836974 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59836975 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59837214 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59837517 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59837559 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59840684 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 59840964 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 59841323 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59841582 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 59841591 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 59841654 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 59841743 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 59842249 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59842255 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 59842369 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 59845258 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59845412 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59859185 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59859573 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59860615 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59860809 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59860924 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59861467 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59862325 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59862545 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59862920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59862934 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59862945 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59862973 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59863068 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59863249 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59863339 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59864128 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59864187 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59864444 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59864471 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 59864491 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59865323 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59865347 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59865558 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59865661 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59865666 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59865706 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59865724 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59866779 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59866785 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59866786 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59866822 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59866877 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59867451 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59867679 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59868101 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59868602 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59868729 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 59868933 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59869365 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59869489 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 59870755 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59871075 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59871807 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59873498 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59873606 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 59873646 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59873784 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 59873803 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 59873804 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 59873994 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 59874031 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59875051 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59875186 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59875207 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59875229 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59875328 A C N N 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.5 0 0.5 6 6 3 0 3 19 59875329 G A N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.5 0 0.5 6 6 3 0 3 19 59875418 T C N Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.5 0 0.5 8 8 4 0 4 19 59875432 G A N Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.5 0 0.5 8 8 4 0 4 19 59875440 A G N Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.5 0 0.5 8 8 4 0 4 19 59875568 A T N N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.6 0 0.4 6 4 3 0 2 19 59875572 A G N Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.6 0 0.4 6 4 3 0 2 19 59875690 T C N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 19 59875691 G A N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 19 59875811 C G N N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.428571428571429 0 0.571428571428571 6 8 3 0 4 19 59876029 G C N N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.428571428571429 0 0.571428571428571 6 8 3 0 4 19 59876074 A G N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.428571428571429 0 0.571428571428571 6 8 3 0 4 19 59876133 T C N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.5 0 0.5 6 6 3 0 3 19 59876203 G C N N 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.5 0 0.5 6 6 3 0 3 19 59876260 T C N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.5 0 0.5 6 6 3 0 3 19 59876787 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59876788 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59876812 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59876821 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 59877272 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59877481 C T N Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.5 0 0.5 8 8 4 0 4 19 59877834 T A N N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.5 0.125 0.375 9 7 4 1 3 19 59877973 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 19 59878160 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 4 8 2 0 4 19 59878245 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 59878651 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59881332 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59882158 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59882367 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59882390 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 59882391 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 59882854 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59883134 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 59883254 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 59883732 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59883750 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59883819 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59883822 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 59883939 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 59884008 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 59884402 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59884435 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 59884661 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59887353 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59887474 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 59887538 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 59887766 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 59888057 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59888090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59888364 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59889259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59889771 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59889825 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59889916 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59896204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59896514 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59896606 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59896779 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59896781 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59897034 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59897269 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59897694 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59897967 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59898031 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 59898041 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 59898363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59898415 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59898509 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 59898525 G T Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 59898544 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 59898611 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 59898641 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59898744 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 59898807 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 19 59898846 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 59898902 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 59898960 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 59899212 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 59899234 A T N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 19 59899260 A C N N 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 8 6 3 2 2 19 59899364 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 19 59899455 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 59899845 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59899853 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59899868 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 59899894 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 59900055 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59900116 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 59900129 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59900287 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59900401 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59900493 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59900497 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59900560 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59900638 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59900707 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59900730 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59900863 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59900876 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59900924 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 59900943 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 59901204 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 59902724 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59902932 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 59903016 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 59903136 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59903242 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 59903322 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 59903447 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 59903536 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 59903545 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 59903787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59904785 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59904822 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 59904969 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59905014 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 59905056 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59905057 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59905098 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59905126 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59905155 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 59905173 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59905215 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 59905228 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 59905231 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 59905445 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59905455 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59905487 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 59905559 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59905682 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 59905703 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 59905704 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 59906051 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 59906064 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59906066 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59906080 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 59906673 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 59907085 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59907167 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59908778 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59908930 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59908967 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59909617 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 59909730 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 59910209 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 59910212 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59910419 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59910457 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59910479 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 59910587 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 59910819 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 59910917 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 59911054 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59911485 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 59911486 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 59911555 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 59911571 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 59911667 A G N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 19 59911936 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 59912133 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 59912142 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59912244 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 59912413 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 59912577 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 59913089 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59913090 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59913181 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59914149 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 59914584 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59914591 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59914933 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59915580 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59917415 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 19 59917456 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 59917468 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 59917771 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 59917784 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 59917935 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 59918126 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59918127 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 59919020 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 59919204 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 59920151 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59920604 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 59920694 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59921624 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 59921886 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 59922614 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59923247 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59923413 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 59923450 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59923577 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59923636 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59924014 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59924755 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59924865 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59924918 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 59925125 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 59925152 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59925218 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 59925263 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 59925772 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 59926096 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 59926119 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 59926452 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59926629 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59926635 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 59926749 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59927351 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59927376 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59927382 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59927553 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59927864 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59928403 A C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 59928404 T A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 59928425 C T N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 19 59928871 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59929213 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 59929235 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 59929753 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 59929796 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 59929823 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 59929870 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 59929914 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59929927 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59929977 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 59930381 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 59931129 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59931296 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 59931618 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 19 59936738 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59937340 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 59937682 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59937702 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59937713 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59938170 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59938462 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 59938468 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 59938634 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59938798 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 59938932 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59939205 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59939217 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59939360 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59939439 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59939571 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59939608 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59939682 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59940015 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59940096 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 59940932 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 59941311 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 59941325 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 59941329 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 59941413 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59941446 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 59941459 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 59941493 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 59941494 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 59941662 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 59941689 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 59941946 A T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 19 59941994 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 59942124 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 59943354 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 59943956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59944634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59944807 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 59944878 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 59944934 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59945495 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 59945525 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 59945643 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 59945733 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 19 59945959 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 59946430 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59946462 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 59946466 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59946483 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 59946539 T A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 19 59946626 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 59946765 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59946817 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59946958 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59947146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59947324 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59947379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59950971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59950977 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 59950998 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59951056 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59951100 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59951161 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59951497 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 19 59951574 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59951616 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 59951708 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 59951777 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 59951812 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59952057 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59952125 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59952227 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 59952835 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59952954 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 59953049 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 59953101 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 59953112 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 59953483 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59953513 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 59953687 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 59953975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59954182 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 59954460 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 59954478 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 59955234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59955620 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59955739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59955782 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59955893 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59956132 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 59956167 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59956301 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 19 59956306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59956491 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 19 59956543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59956650 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 59957166 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 59957196 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 59957221 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59957225 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 59957441 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 59957526 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 59957536 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 59957541 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 59957705 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59958239 G T Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 59958476 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 59958709 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 19 59959011 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59959510 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 59959700 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59959916 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59959948 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59959970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59959973 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59960013 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59960014 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59960024 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59960025 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 59960078 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59960211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59960225 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 59960241 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59960244 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59960249 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59960264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59960289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59960309 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59960319 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 59960321 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 59960438 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 59960544 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 59960774 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59960787 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59961266 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 59961670 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 59961865 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 59962569 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 59962747 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59962934 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59962935 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59963043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59963379 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 59963382 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 59963384 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59964401 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 59965531 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 59965548 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 59968105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59968133 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 59968192 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 59968205 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 59968506 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 19 59968598 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 59968611 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59968688 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59968695 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 59968757 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59969070 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59969086 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 59969625 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59969741 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 19 59970257 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 59970412 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 59970582 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 59970827 T A Y N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 59970852 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 59970935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59970937 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 59971226 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 59971293 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59971557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59971590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59971864 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 59972182 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59972414 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59972813 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 59972960 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 59972966 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59973119 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59973241 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 59974252 C G N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 19 59974367 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59974414 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 59974462 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59974474 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 59974834 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59974872 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 59974976 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59975372 A C Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 19 59975467 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 59975529 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59975725 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 59975842 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 59976123 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59976149 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59976341 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 59976585 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 19 59976757 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 59976889 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59977310 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 59977312 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 59977498 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 59977588 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 59977910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59977933 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59978216 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59978242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59978328 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59978365 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 59978636 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59978726 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59978988 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 59979444 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 59979567 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59980104 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59980500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59982706 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59982846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59983580 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 59983644 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 19 59983742 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 59984524 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59985732 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 59985771 A C N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 59985800 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 59985810 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 59986039 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 59986454 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59986570 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59986596 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 59986757 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 59986770 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 59986844 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 59987059 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 59987204 A T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 59987262 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 59987265 T A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 59988136 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 59988275 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59988287 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 59988296 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 59988347 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59988885 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 59988918 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 59988975 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 59989102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59989113 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59989124 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59989593 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59989600 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 59990536 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59990636 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59990824 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59991032 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59991469 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59991761 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59992644 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59992676 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59992681 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59992734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59993190 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 59993191 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 59993289 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 59993329 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 59993408 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 59993979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59994102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59994184 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 59994537 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59994884 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59994963 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59995132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59995186 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 59995276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59995468 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 59996075 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 59996335 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 59996557 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 59997261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59997281 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59997422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59997644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59997660 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 59997837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59997907 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 59997998 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 59998405 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 59998408 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 59998435 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 59998603 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 59999520 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 59999627 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 59999784 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60000011 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 60000963 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60001382 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60001547 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60001802 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60002752 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60002985 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60003508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60003520 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 60003896 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 60003973 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60004481 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 60005919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60006004 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60006145 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60007761 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 60008264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60009752 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60010466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60011009 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60011302 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 60012147 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60012346 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60012620 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60012623 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60013731 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 60014075 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60014186 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60014232 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60015720 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60015915 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60016414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60016485 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 19 60016521 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60018208 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 60019017 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 60019043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60020678 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60021639 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 60021893 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60022789 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60022879 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60022929 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60023187 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 60023399 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60023623 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60023720 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60023739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60023803 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60023839 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60023954 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60024713 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60024975 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 60025311 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60025642 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60025653 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60025654 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60025791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60025812 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60026794 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 60026930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60026934 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60026966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60027368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60027813 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60027908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60027922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60028983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60029126 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60029207 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60029573 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60029629 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60029672 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60030066 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 60030081 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 60031158 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 19 60031476 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60031565 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 60033506 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60033553 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60034435 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60034483 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60034567 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 60034648 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60034684 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 60035818 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 60035949 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60035952 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60036222 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60036264 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60036532 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60036888 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 60037069 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60037087 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 60037299 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 60037571 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60037591 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 60037624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60037625 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60037626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60037627 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60037671 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60037676 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60037732 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 60037746 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 60038135 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 60038357 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60038501 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60038514 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60038571 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 60038581 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 60038590 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 60038615 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 60038714 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60039082 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 60039117 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60039133 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 60039192 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 60039327 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60039348 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60039357 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60039388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60039417 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60039490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60039564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60039629 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 60039641 A G Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 60039674 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 60039699 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 19 60039723 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60039724 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 60039960 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 60040266 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60040375 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60040817 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60041744 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 60041745 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 60041835 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60041986 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60041991 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60042014 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60042059 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60042113 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 60042514 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 19 60043119 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60044281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60044444 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60044605 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 60044680 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 60044723 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60044767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60044853 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60044855 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60045102 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60045160 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 60045189 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 60045312 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 60045407 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60045604 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 60045674 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 60045825 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 60045938 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 60046742 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 19 60047347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60047974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60048060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60048356 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60049296 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60049519 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60049728 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60050526 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 60051018 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60051331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60051335 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60051619 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 60051748 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60052977 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 60052991 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 60053041 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60053065 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 60053068 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 60053127 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60054605 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60054633 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 60054634 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 60054687 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60054742 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60054771 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60055077 T A N N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 19 60055131 G A N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 19 60055132 A C N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 19 60055312 C A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 19 60055394 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 60055530 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 19 60055668 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60055763 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 19 60055949 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 19 60056185 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 60056187 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 60056826 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 60057104 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 60057562 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60057913 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60058054 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 60058058 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 60058441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60058572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60058639 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60058657 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60058743 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 19 60058755 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60058952 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60058968 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60059675 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60059829 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60059830 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60059858 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60059909 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60060149 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 60060457 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60060462 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60060468 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60060512 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60060544 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60060590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60060876 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60060894 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60061013 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60061051 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60061300 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60061360 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60061898 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60062123 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60062174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60062191 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60062495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60062703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60062864 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60062934 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60063052 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60063219 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60064632 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60066018 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60066038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60066048 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60066342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60066372 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60066796 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60067167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60067220 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60067311 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60067340 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60067810 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60067845 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60068274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60068345 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60068528 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60068928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60069235 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60069245 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60069573 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60069626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60069883 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 60070084 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60070200 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 60070321 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60070454 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60070539 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60070585 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60070721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60070791 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60070795 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60070865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60071357 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 19 60072097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60073381 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60073519 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 60073660 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 60075856 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60076114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60076329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60076957 A G N Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 19 60076971 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 19 60077079 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 60077238 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 60077290 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60077512 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 19 60077996 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60078058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60078207 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60078472 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60078573 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60078585 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60079243 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60079329 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60079517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60079538 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60079539 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60080252 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60080482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60081132 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60081610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60081975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60082193 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 60082315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60082335 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60082530 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 60082619 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 60082645 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60082669 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 60082698 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 60083138 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 19 60084244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60084670 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 60085349 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60085655 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 60085712 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 60085984 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 60086093 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 60086132 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 60086254 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 60086387 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 60086401 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 60086435 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 60086453 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 60086462 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 60086578 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 60086655 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 60086701 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 60086706 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 60086801 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 60086854 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 60087082 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60087203 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 60087236 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 60087274 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 60087277 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 60087693 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 19 60088013 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60091003 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60091303 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60092255 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 19 60092282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60092326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60092327 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 60092907 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60092937 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60092959 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60092960 C A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 60093060 T C Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 60093225 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 60093340 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60093401 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 60093427 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60093477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60093747 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 60093815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60093927 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 60093937 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 60094118 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 60094261 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 60094503 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 60101522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60101524 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 60101611 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60101674 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 60101813 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 60101888 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 60102301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60102403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60102535 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 60102699 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 60102774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60102852 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 60102922 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60103271 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60103287 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60103687 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60104039 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 60104196 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 60104244 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 60104317 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60104357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60104497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60104565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60104587 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 60104878 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60105244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60105624 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60105663 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60105748 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 60106154 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60106491 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 60106747 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60107955 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60108012 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 60109772 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60109815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60110323 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 60110917 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 60111019 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60111193 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60111210 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 60111375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60111935 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 60112660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60112715 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60113878 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60115413 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60115556 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 60116770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60117518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60118212 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60118956 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60119069 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60119095 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60120253 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 60120475 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60120486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60120540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60120584 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 60122447 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60122569 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60122633 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60123232 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60123880 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 60124399 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60124501 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60124880 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60125138 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60125154 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60125191 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60125446 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60125447 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60125485 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60125494 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60125541 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 60125588 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60125827 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60125885 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 60125945 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60126097 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60126181 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 60126255 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 60126266 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60126621 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 60127038 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60127046 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60127096 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60127363 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60127442 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60127461 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60127463 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60127506 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60127586 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60127921 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60128021 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60128046 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60128101 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60128158 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60128178 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60128381 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60128404 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60128405 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60128484 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60128582 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60128634 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60128639 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60128658 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60128699 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60128706 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60128752 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60128753 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60128787 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60128832 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60128934 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60128968 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60128976 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60129077 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60129201 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60129267 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60129344 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60129610 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60129707 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 60129724 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 60129735 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60130152 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60130237 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60130252 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 60130320 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 60130341 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60130432 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60130621 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60130691 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60130699 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60130763 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 60130791 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60130842 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60131681 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60131744 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60131815 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60132075 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60133041 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60133180 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60133353 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60133577 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60133757 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 60133896 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60134011 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60134040 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60134096 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60134152 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60134241 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60134306 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 60134307 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60134322 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 60134405 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60134591 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60134630 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60134661 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 60134662 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60134663 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60134910 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60134936 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60135016 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60135118 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 60135491 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 60136517 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60137071 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60137380 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60137792 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 60137893 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 19 60137951 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 60137988 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 60138126 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 60138149 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 60138168 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 60138253 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 60138260 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 60138281 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60138478 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 60138882 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 19 60139217 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60139222 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60139233 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 60139426 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 60139627 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 60139654 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 19 60139741 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 60139886 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 60140015 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60140153 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60140212 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 60140449 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60140582 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 60141004 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 19 60141233 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60141436 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 60142051 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60142175 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 60142215 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 19 60142242 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 60142352 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60142392 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60142750 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60142903 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60143398 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60143519 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60143680 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60143748 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60143830 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60143984 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60144024 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60144187 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 19 60144238 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60144551 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 19 60144568 T G Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 19 60144581 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 19 60144583 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 19 60144630 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 19 60144893 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60144916 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60144917 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60144955 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60145054 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60145345 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60145435 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60146373 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60146567 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60146606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60146611 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60146628 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60146647 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60146676 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60146701 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60146811 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 60146812 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 60146823 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60146893 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60147013 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 60147202 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 60147247 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 60147315 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 60147527 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60147553 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60147600 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60147612 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60148022 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60148054 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60148116 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60148267 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60148606 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60148629 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60149400 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60149866 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60150004 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60150215 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 60150332 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 60150340 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 60150341 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 60150626 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60150892 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60150940 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60151496 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 60151501 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 60151522 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 60151604 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 60151630 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60151635 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60151671 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 60151686 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60151713 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60151734 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 60151806 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60151944 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60151950 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 60152158 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60152173 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60152176 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60152261 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60152291 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60152309 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60152313 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60152443 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 60152603 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 60152758 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60152761 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 60153337 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60153528 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60153626 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60153655 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60154563 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 60154565 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60154757 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60154760 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60155315 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60155357 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60155382 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60155386 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60155619 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60155631 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60155652 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60155705 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60155771 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60155829 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60155956 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60156007 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60156036 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60156148 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60156272 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60156346 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60156520 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60156533 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60156551 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60156567 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60156582 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60156615 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60156800 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60156826 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60156890 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60156905 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60156914 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60156945 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60156959 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60156985 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60157038 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60157055 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60168718 C T Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 19 60169018 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 60169025 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 60169120 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 60169241 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 60169348 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 19 60169449 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 60169790 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 60169802 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60170190 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60170192 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60170268 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60170509 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60170813 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60170851 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60171172 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60171213 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60171238 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60171247 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60171279 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60171288 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60171440 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60171467 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60171596 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60171684 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60171696 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60171832 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 60172016 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60172137 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60172170 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60172259 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60172307 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60172324 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 60172408 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60172467 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60172554 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60172847 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60172892 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60173390 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60173935 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60174337 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60174396 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60174632 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60174640 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60174662 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60174663 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60174754 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60174838 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60174848 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60174862 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60174982 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60175046 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60175119 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60175268 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60175389 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60175396 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60175530 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60175541 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60175700 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60175829 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60176106 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 60176271 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 60176285 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 60176315 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 60176355 G C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 60176540 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60176569 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60177322 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60177684 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60177701 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60177739 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60177993 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60178029 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60178141 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60178196 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60178242 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60178256 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60178273 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60178303 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60178326 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60178357 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60178385 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60178538 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60178549 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60178683 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60178854 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60178879 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60178964 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60179000 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60179059 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60179538 T C N Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 19 60179588 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 60179752 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 60179823 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60179875 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60179897 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60179998 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60180072 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60180084 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60180108 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 60180118 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60180169 T G Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 60180258 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60180287 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60180288 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60180297 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60180515 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 60180564 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60180626 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 60180628 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 60180649 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60180836 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 60181052 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 60181081 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 60181107 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 60181602 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60181779 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60181989 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60182157 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60182160 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60182203 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60182338 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60182391 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60182400 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60182664 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 60182688 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 60182712 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60182725 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60182889 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60183118 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60183133 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 60183404 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 60183497 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 60183552 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60183805 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60183975 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60184027 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60184147 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60184250 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60184364 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60184450 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 60184469 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 60184472 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 60184521 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 60184525 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 60184758 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 60185110 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60185306 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60185626 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60186141 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60186200 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60186434 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60187684 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 60187920 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60187967 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60188026 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60188184 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60188240 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60188501 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60188624 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 60188691 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 19 60188751 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60188994 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 60189242 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 19 60189928 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 60190125 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60190131 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 60190183 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 60190232 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 60190236 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 60190702 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60190737 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60190787 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60190829 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60191084 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60191454 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60191468 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60191570 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60191650 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60191727 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60192021 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 60192375 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60192480 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 60192526 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60192677 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60192689 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60192718 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60192719 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60192809 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60192867 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60193414 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 60193514 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60193525 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60193572 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60193763 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60193826 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60194665 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60194729 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60194739 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60194748 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60194767 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 60194828 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60194851 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 60194857 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 60194885 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 60194886 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 60195658 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60196038 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60196483 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60196528 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60196632 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60197327 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 60198155 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60198427 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60198459 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60198543 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60199441 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60199445 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60199512 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60199828 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 60200396 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60200745 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60200796 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60200933 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60202242 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60202516 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60202703 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60202808 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60202809 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60202824 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60203216 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60203611 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 60203765 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 60203845 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60203881 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60204110 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60204311 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60204332 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60204355 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60204364 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60204466 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60204501 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60204557 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60204634 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60204723 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60204724 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60204741 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60204785 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60204850 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60204947 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60205027 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60205083 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60205727 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 60205762 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 60206244 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 19 60206528 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 60206911 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60206924 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60206941 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60207132 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60207571 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60207572 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60207578 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60207692 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60207912 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 60208036 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 60208128 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 60208394 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 60208396 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 60208427 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60208501 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60208530 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60208955 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60209004 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60209094 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 60209129 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 60209157 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 60209311 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 60209326 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 60209334 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 60209793 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60209872 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60209874 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60209883 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60209916 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60210009 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60210084 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60210171 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60210176 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60210214 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60210341 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60210423 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60210702 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60210741 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60210951 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 60211065 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 19 60211261 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 60211345 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60211435 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 60211468 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60211506 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60211553 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60211566 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 60211596 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60211602 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60211650 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60211668 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60211759 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60211793 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60212395 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60213760 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 60213994 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60214479 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60214664 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60214833 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60214933 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 60215096 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 19 60215253 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 19 60215291 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 60215330 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 19 60215368 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 60215371 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 60215389 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60215408 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60215899 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 60216882 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 19 60217019 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60217134 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 60217423 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60217430 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60217451 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60217601 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60217626 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60217747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60217777 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60217948 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 60218087 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60218230 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 60218371 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 60218377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60218461 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 60218487 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 60218762 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 60219395 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 60219435 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 60219649 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 60220244 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60220574 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60220599 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60220619 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60221229 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60221331 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 19 60221530 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 60221720 A C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 19 60222223 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 60222269 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60222411 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60222589 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60222748 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 60222793 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60222925 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 60222928 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 60225421 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60225586 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60225608 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60226115 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 60226265 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60226596 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60226720 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 60226805 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 60228399 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60228443 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60228860 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60229433 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60229622 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60229650 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60229725 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60230149 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 60230651 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 60233269 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 60233467 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60234076 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 19 60234141 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60234517 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60235090 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60235106 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60237198 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60237346 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60237367 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 60237600 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 60237732 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60237792 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60237941 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60238075 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 60238089 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60238100 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 60238128 A G Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 60238203 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60238509 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60238612 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60238661 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60238851 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 60238942 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60239106 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60239463 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 19 60239678 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 60239769 G A N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 19 60240080 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 19 60240478 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60240731 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60240732 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 60241216 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 60241251 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 60241258 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 60241426 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60241432 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60241504 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60241871 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 60242267 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60242693 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60243002 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60243003 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60243179 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 19 60243263 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60243413 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60244067 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60244379 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 60244651 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60244816 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 60244888 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 60244917 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 60244921 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 60245379 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60245475 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60245659 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60245757 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 60245801 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60245870 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60246027 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 60246270 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60246635 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60247000 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 60247202 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 60247264 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60248420 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60248540 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60248594 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60248644 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 60248686 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60249097 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 60249468 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 60249534 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60250059 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 60250252 C T N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 19 60250887 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 60251340 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60251566 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60251894 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60252873 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 60253531 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60253877 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 60253919 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 60254038 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60254382 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60254489 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60254535 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60254590 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 60254682 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60255089 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60255250 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60255318 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 60255532 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 60255542 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60255694 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 60255850 T A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 60255851 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 60256201 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 60256480 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60256487 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60256499 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60256507 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60256508 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60256537 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60256635 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 60256640 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 60256693 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60256838 A C Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 60256874 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60256895 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 60256907 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60256979 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 19 60257108 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 60257577 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60257792 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60257795 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60258023 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60258037 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60258158 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60258294 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60258325 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60258508 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60258800 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60258901 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60259010 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60259052 A T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60259117 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60259310 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60259388 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60259634 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 60259678 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60259722 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 60260755 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60261782 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60261814 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60262093 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60262119 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60262129 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60262298 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60262349 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60262451 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60262527 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60262555 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60262631 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 60262661 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 60263036 T A Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60263260 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60263460 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60263546 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60263828 T A Y N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 19 60263938 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 19 60263948 A G Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 19 60264105 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 19 60264207 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60264775 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60265015 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60265063 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60265810 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60265941 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60265997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60266075 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60266102 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60266108 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60266315 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 60266454 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60266626 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60266677 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60266700 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60266815 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60266904 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60267031 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60267266 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60267384 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 60267393 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 60267492 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60267503 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60267931 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60268430 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 60268484 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60268657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60268661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60269020 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60269587 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 60269590 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60269610 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60269616 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60269636 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60269706 G C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 19 60269708 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 60269765 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60270071 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60271680 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60272160 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60272372 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 60272451 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60272518 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60273032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60273036 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60273597 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60273741 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60273889 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60273910 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60274245 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60274372 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 60274405 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 60275531 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60275730 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 60275854 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 60275855 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 60277049 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 60277180 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60277189 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 60277737 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60278199 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60278316 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60278437 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60278442 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60278727 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60279561 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 60279835 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 60281088 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60282620 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60282979 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60283282 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 60283298 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 60283426 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 60283507 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60284312 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60285502 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 60285826 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60285896 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60286130 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60286240 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60286266 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60286381 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60286393 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 60286455 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 60286457 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 60286655 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60286787 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 19 60286984 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 60287042 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 60287297 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60287672 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60287682 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60287688 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 60287845 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60287983 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 60288071 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 19 60288169 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60288645 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 19 60288769 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 60288977 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 60289049 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 60289143 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 60289209 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 19 60289260 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 60289342 T A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 60289351 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 60289359 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 60289378 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 60289467 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 60289545 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60289556 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 60289718 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60289731 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60289908 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60290114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60290260 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 60290278 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 60290866 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60291245 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60291442 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 60291454 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 60291536 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 60291991 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60291995 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60292551 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 60292650 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 60292839 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 60292925 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 60292980 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60293051 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 60293084 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 60293144 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 60293282 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 19 60293325 T A N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 19 60293430 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 19 60293673 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 60293820 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 60293846 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60294305 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60294395 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60294417 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60294467 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 60294488 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60294491 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60294492 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60294550 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 60294554 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 60294610 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60294868 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60294919 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60294930 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60294934 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60295242 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60295251 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60295271 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60295301 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60295326 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 60295380 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60295442 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60295448 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60295458 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60295488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60295688 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 19 60296248 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 60296362 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 19 60296878 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 60296886 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 60296963 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 60297005 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60297245 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60297399 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 60297403 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 60297457 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60297462 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 60297520 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 60297534 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 60297655 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 60297677 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 60297847 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 60297851 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 60297856 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 60297965 A C N N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 19 60297966 G A N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 19 60298104 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 19 60298329 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 60298376 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 60298437 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 60298575 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 60298599 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 60298602 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 19 60298653 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 19 60298656 A T N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 19 60298667 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 19 60298683 G A N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 19 60298723 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 60298867 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60298926 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 60299063 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60299373 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 60299426 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 60299497 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 60299519 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 60299601 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60299608 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60299640 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60299749 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 60299855 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60299900 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60299942 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 60300043 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 60300055 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60300135 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 60300269 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60300338 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60300409 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 60300437 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60300739 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 60301135 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60301214 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60301318 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60301340 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60301361 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 60301419 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60301479 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 60301520 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 60302115 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60302216 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 60302551 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60302661 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 60302825 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 60302885 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 60302948 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 60303049 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 60303343 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 60303391 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60303400 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 60303417 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 60304009 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60304225 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60304349 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60304406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60304856 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60304860 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 60304894 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60305108 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 60305127 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60305253 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 19 60306098 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60306253 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60306313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60306344 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60306360 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60306489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60306495 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 60306657 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60306751 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60306778 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 60306787 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60307183 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60307200 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60307255 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60307257 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 60307471 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60307613 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 60307713 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 60307744 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 60307866 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 60308169 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60308262 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60308275 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60308394 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 60308403 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60308420 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 60308520 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60308928 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60308929 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60308973 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 60309117 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60309474 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 19 60309587 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 19 60309777 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 60309903 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60310489 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 60310522 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 19 60310706 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 60310723 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 19 60310806 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 19 60310884 C T N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 19 60311013 T A N N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 19 60311040 C G N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 19 60311059 G T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 60311062 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 60311064 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 60311080 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 60311081 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60311086 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 60311087 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 60311098 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 60311105 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 19 60311111 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 60311134 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 60311173 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 60311285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60311469 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 60311759 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 60311793 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 60312068 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 60312080 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60312224 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60312289 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60312331 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 60312393 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 60312473 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60312569 A T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 19 60312598 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 60312600 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60312602 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 60312663 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 60312674 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 60312723 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 60312824 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60313020 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 60313040 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 60313207 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60313273 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60313306 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60313531 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60313593 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60313639 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 60313692 T G N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 19 60313704 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 19 60313719 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 19 60313807 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 19 60313957 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 60313983 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60314031 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60314061 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60314101 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 60314141 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 60314207 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 60314232 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60314416 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60314423 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60314444 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60314510 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60314613 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60314617 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60314643 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60314743 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 60314778 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60314801 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60315055 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 60315127 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 60315492 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60315586 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60316030 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60316284 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60316384 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60316997 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60317059 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60317124 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60317208 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60319044 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 60319364 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 60319554 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 60319592 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60319638 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60319693 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60319958 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60320101 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 60320212 A G Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 60320378 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 60320429 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60320465 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 60320531 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60320539 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 60321069 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 60321385 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60321414 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60321601 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 60321770 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 60321775 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 60321799 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 60322117 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60322128 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60322129 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60322189 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 60322230 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 60322281 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60322595 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60322640 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 60322666 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60322746 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60322851 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 19 60322883 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60322917 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 19 60323052 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 60323234 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60323433 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60323620 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 19 60323701 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 60323833 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60323904 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 19 60323989 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 60324009 T G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 60324326 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 60325240 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60325246 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 60325423 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60325579 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 60325794 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60325832 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 60325905 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60326077 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 60326208 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 60326419 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60326596 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60326615 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 60326617 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60326668 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60326711 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60326799 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60326820 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 60326848 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 60326849 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 60326863 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 60326906 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 60326908 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 60327392 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60327450 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60328057 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 60328141 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 60328206 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60328239 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60328269 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60328287 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60328317 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60328325 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60328343 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60328344 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 60328370 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 19 60328389 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 60328390 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60328430 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 60328582 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60328589 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60328602 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60328608 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60328612 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60328628 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60328640 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60328655 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60328665 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60328783 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 60328826 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60328850 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60328953 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 60329324 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60329453 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60329460 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60329541 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60329699 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 19 60329873 T A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 19 60330036 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 19 60330120 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60330133 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60330152 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 60330251 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 60330343 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60330345 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60330376 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60330387 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 60330757 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60330935 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60331141 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60331145 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 60331166 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60331172 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60331379 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 60331387 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 60331569 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60331608 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60331625 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 60331882 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60332280 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 19 60332283 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 60332320 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 60332334 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 19 60332373 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60332422 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60332884 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60333038 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60333040 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60333177 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 60333213 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60333338 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60333343 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 60333618 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60333794 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 60333952 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60334081 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60334096 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60334161 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60334205 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60334327 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60334330 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60334551 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60334741 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60336787 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60336905 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 60337343 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60337354 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60337678 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 19 60337805 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 60338045 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 60338149 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 60338174 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60338352 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 60338369 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 60338438 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 60338513 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60338696 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60338697 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60338706 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 60338796 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 60338921 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 60339152 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60339219 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60339311 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 60339435 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60339542 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60339720 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60340108 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 19 60340202 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 19 60340399 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60340662 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60341061 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60341077 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60341085 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60341113 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 60341268 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 60341326 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60341363 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 60341377 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 60341393 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 60341652 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60342066 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 19 60342099 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 60342737 A G N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 19 60342748 T C N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 19 60342984 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 60342995 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 60343010 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 60343065 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 60343740 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 60343790 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 19 60343889 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60343929 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60344164 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 60344210 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 60344316 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 60344369 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60344421 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 60344455 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 60344499 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 60344573 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60344579 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60344582 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 60344780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60344849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60344902 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60344931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60344949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60344962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60344992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60345132 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 60345133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60345144 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60345147 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 60345154 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 60345179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60345261 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 60345333 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 60345339 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 60345396 T A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 60345411 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 60345648 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 19 60345661 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 60345673 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 60345679 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 60345725 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 19 60345892 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 60346025 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60346108 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60346161 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60346162 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60346227 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 60346243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60346376 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60346407 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60346491 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 19 60346510 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 60346682 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 60346753 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 60346842 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 60347104 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 60347583 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 60347643 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 60347686 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 60347691 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 60347700 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 60347727 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 60347745 C A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 19 60347846 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 60347849 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 60347850 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 19 60347925 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 60347941 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 60347950 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 60347968 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 60348121 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 60348179 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 60348192 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60348395 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 19 60348420 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 60348431 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 60348500 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 60348697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60348780 T A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 19 60348832 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 19 60348884 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60349044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60349155 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60349180 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 60349197 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 60349199 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 60349200 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 60349238 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 60349318 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 19 60349321 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 19 60349359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60349360 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 60349419 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 60349473 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60349497 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60349633 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 60349647 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 19 60350018 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 60350025 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 19 60350032 C A N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 19 60350148 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60350164 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 60350226 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 60350240 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 19 60350334 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60350394 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 60350407 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 60350709 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 60351174 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 19 60351350 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60351421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60351751 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 60351824 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60352228 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 60352243 A C N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 19 60352291 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 19 60352294 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 19 60352483 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 19 60352602 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60352687 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60352720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60352747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60352761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60352779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60352833 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 60353247 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60353915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60353946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60354001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60354156 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 60354179 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 60354336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60354363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60354388 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60354593 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 60354603 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 60354633 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 60354696 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 60354753 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60354949 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60354975 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60355018 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60355144 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 60355264 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 60355350 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60355417 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 60355637 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 60355663 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60355668 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60355683 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60355769 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60356033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60356054 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60356130 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60356166 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60356335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60356344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60356381 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60356401 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60356435 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60356488 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 60356582 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 60356609 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 19 60356622 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 60356643 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60356652 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 60356672 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 60356685 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60356686 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 60356832 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 19 60356949 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 60357085 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60357484 T C N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 19 60358344 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 60358995 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60359940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60360329 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60360342 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 19 60360451 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60360500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60360550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60360642 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 60360805 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 60360854 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 60361133 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 60361145 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 60361166 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 19 60361209 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60361241 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60361247 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60361432 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60361657 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60361678 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60361814 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 60361818 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 19 60364395 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 19 60364514 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 60364787 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 60364797 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60364973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60365632 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60365972 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60366641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60366803 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60366824 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60367090 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 60367385 T A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 60367445 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60367618 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60367760 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60368865 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 60369286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60369466 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60370131 C T N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 19 60370464 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 60371024 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60371140 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 19 60371564 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 60371599 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60371610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60371703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60371805 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60371843 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60372178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60372610 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 60372823 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 60372861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60373165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60373269 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 60373282 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 60373333 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 60373607 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 60373665 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 60373681 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 60373725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60373785 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 60373816 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 60373966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60374103 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 60374315 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 60375029 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60375873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60376304 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 60376633 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 19 60377399 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60378624 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60378932 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 60379312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60379744 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60379814 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60379843 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60379973 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60380105 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60380201 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60380204 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60380382 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 19 60380408 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 60380450 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 60380487 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 60380837 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 60380879 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 60380948 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 60381039 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 60381593 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 60381716 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60382024 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60382049 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60382120 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60382153 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60382292 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60382321 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60382400 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60382525 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60382615 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60382659 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60382757 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 60382885 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60383308 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60383592 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60383593 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60383934 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60384107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60384111 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60384617 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60385038 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60385046 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60385059 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60386115 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60386155 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 60386197 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 60386248 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 60386734 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60387756 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60387962 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 60389038 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 19 60389216 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 60389584 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 19 60389589 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 19 60389629 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 19 60389646 C T N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 19 60389748 A G N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 19 60389799 G T N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 19 60389847 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 19 60389870 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 19 60389900 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 19 60389905 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 19 60389923 A T N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 19 60390015 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60390030 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 60390234 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60390254 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 60390277 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 60390410 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 60390522 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 60390890 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 60391274 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 60391699 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 60392115 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 60392355 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 60393259 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 60393990 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60394431 T C N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 19 60394770 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 60394860 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 19 60396232 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60396345 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60396390 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60396424 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60397297 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60397320 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 60397339 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 60397553 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60399578 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60399905 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60400399 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 19 60400591 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60400661 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60400667 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 60401140 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60401148 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 60402037 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 19 60402140 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 19 60402762 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60402774 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 60402777 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 60402868 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 60402878 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60402903 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60403452 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 19 60403540 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 60403592 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60403735 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 60403821 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 60403861 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 60403895 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 60404567 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 60404777 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60404970 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60405395 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 19 60405457 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60405490 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 60405693 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60405741 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 60405766 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 60405869 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 19 60405973 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60406122 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 60406244 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60406462 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60406702 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60406852 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60407204 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 60407221 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 19 60407783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60407788 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60407982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60408403 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60408529 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60408578 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60408604 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60408652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60408771 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60408807 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60408918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60409052 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60409060 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 60409073 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 19 60409178 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 19 60409193 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 60409211 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 60409619 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60409686 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60410030 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 60410043 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 19 60410923 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60410980 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60411160 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60411174 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 60411325 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60411385 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60411451 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60411513 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60411613 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 60411827 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60412101 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 60412122 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60412711 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 60413231 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60413338 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 60413350 C A Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 60413353 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60413621 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60413629 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 19 60413777 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 60413779 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 60413983 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60414310 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60414326 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60414728 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60414907 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60414940 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60414967 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60415840 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 19 60416000 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 60416292 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 60416363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60416409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60416438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60416643 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 60416673 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 60416800 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 60416871 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 60417080 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60417238 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 60417415 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60417628 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60417667 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 60417771 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 60417776 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 60417788 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 60417898 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 19 60417917 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 60418018 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 60418056 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 60418148 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 60418194 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 19 60418195 G T Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 60418213 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 60418331 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 60418349 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 60418354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60418530 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 60418544 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 60418814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60418825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60418996 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 19 60419050 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 60419106 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 60419158 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 60419164 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 60419203 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 60419207 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 60419228 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 60419365 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 60419728 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60419733 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60419892 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 60420062 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 19 60420170 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60420505 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 19 60420753 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60421150 A T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 19 60421387 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 19 60421449 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60421543 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 60421819 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60421826 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60423190 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60423412 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60431069 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 60431093 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 60431161 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60431242 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60433320 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 60434181 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60434205 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60435336 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60435367 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60436851 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60437072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60437143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60437393 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60437573 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60437625 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60437666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60437703 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60438069 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 60438085 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 60438311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60438482 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60438582 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 60438588 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 60439578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60439833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60439895 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 19 60439906 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 60440146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60440683 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60440748 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60441064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60441606 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60441754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60442193 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 60445362 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 60445407 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 60445778 A T Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 60446007 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 60446632 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 60447053 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 60447657 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 60447747 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 19 60448070 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 19 60448197 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 60448200 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60448224 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60448365 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60448522 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60448542 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 60448547 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 19 60448772 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 60448990 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60448998 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 60449376 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60449700 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 60449939 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 60450053 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.0588235294117647 0.705882352941177 0.235294117647059 14 20 1 12 4 19 60450054 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.0625 0.6875 0.25 13 19 1 11 4 19 60450055 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 19 60450186 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 60450264 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 60450612 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60450848 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 60450918 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 60451032 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 60451046 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 60451294 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 60451370 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 60451664 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60452353 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60452384 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60452550 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60452625 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60452664 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60452669 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60452831 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60452870 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60452917 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60452954 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60452982 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60453002 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60453151 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60453445 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60453746 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60453857 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60453885 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60454009 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60454134 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60454323 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60454335 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60454460 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60454564 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60454566 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60454699 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60454731 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60454893 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60454936 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60455180 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 60455225 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60455298 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60455302 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60455545 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60455573 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60455646 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60456325 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60456468 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60457170 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60457182 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60457258 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60457402 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60457487 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60457554 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 60457570 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 60457879 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 60457948 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 60458043 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 60458078 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 60458143 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60458733 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60459004 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 60459091 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 60459314 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60459318 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60459360 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60459361 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60459806 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60459924 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60459943 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60459949 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60459999 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60460057 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60460070 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60460103 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60460151 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60460199 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60460235 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60460341 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60460355 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60460840 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60461228 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60461317 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60461527 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 60461539 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 19 60461596 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 60461630 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 60461634 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 60461657 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 60461708 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 60461811 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 60461860 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60461864 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 60462001 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 60462341 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60462375 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60462456 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 60462486 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60462782 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60462796 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60462819 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60462865 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60462877 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60462918 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60462925 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60462944 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60463225 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60463450 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60463877 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60463932 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60464482 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 60465212 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60465415 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60465645 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 60465646 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60465792 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60465844 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 60466043 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60466048 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60466084 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60466096 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60466113 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60466120 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 60466312 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60466528 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 60467151 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60467221 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60467263 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60467264 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60467413 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60467600 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60468545 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60468672 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60468820 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60468948 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60468955 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60468969 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60468977 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60469313 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60469408 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60469534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60469650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60469657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60469767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60469810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60469867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60469966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60470038 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 60470061 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60470225 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 60470306 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 19 60470343 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60470575 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 60470617 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60470643 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 60470809 T C N Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 8 8 3 2 3 19 60470909 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60471022 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 60471099 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60471100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60471372 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60471378 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60471421 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60471867 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60472009 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60472886 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 60472901 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 60473103 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 19 60473129 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 60473162 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 60473221 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 60473311 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60473643 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60473684 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60473928 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60474106 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60474543 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60474582 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60474643 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60475082 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60475451 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60476305 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 60476324 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 60476854 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60477761 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60478226 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60478624 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60478655 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60478991 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 60479555 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60479569 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60479730 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60480126 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60480183 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60480232 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60480575 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60480697 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60481564 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 60481577 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60481698 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60481774 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 60481988 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 60482123 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60482131 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 60482343 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60482625 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 60483280 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 60483944 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60484272 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 60484492 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60484620 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60484921 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60484922 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60485544 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60485610 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60486053 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60486057 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60486152 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60486154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60486174 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60486320 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60486624 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60486688 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60486692 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60486708 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60487288 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60487642 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 60487867 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60488055 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 60488321 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60488334 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60488411 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60488415 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60488473 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60488521 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60488663 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60488719 T C Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 19 60488727 T C N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 19 60489283 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60489630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60489772 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60489829 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60490027 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 60490533 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 60490823 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60490892 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60490923 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60491210 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60491644 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60491689 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60491869 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 60492001 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 60492103 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 60492262 T A N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 19 60492899 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60492943 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60492964 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60493014 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60493538 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60494332 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60494542 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60494658 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60494774 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 60495023 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60495078 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60495355 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60495483 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 60495611 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 19 60495801 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 60495870 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 60495876 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60495923 C G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 60495959 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 60495994 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60496107 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60496204 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60496252 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60496666 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 60496698 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60496709 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60496736 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60496769 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60496873 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60496886 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 60496908 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60496916 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60497023 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60497106 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60497135 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60497144 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60497279 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60497306 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60497318 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60497500 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60497518 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 60497579 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60497644 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60497682 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60497728 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60497733 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60497783 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60497791 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60497847 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60497997 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60498116 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60498123 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60498554 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60498745 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 60498762 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60498769 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60498803 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60498853 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 60498916 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 60498917 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 19 60498922 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60498924 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60498934 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60498997 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 60499005 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 60499006 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 60499023 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 60499032 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 60499092 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 60499211 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 60499240 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60499241 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60499325 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 60499559 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60499611 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60499665 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60499675 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60499730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60499740 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60499789 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60499832 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 60499900 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60500024 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 60500029 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60500043 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 60500076 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 60500147 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 60500193 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60500865 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 60500875 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60500923 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 60500932 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 19 60501064 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 60501069 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 60501097 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 60501128 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 60501249 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 60501571 C T N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 19 60501583 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 19 60501694 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 60501818 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 60501909 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 60502097 T G N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 19 60502120 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 19 60502188 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 60502686 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60502713 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60502899 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 60503045 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60503265 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60503406 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60503420 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60503434 A C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60503684 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 60503798 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 60503848 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 60503889 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 60504131 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60504168 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 60504175 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60504195 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60504196 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60504247 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60504258 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 60504287 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60504292 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60504482 A T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 19 60504532 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.176470588235294 27 7 13 1 3 19 60504551 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 60504585 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 60504586 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 60504617 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60504618 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60504663 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 19 60504694 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 60505077 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 60505191 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 60505522 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 60505745 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 60505779 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60505845 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60506095 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 60506258 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 60506480 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60506545 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 60506974 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60506996 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60507019 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60507045 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60507668 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60507729 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 60507733 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60507795 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60507931 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60508161 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 60508179 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60508301 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60508362 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60508623 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60508840 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60508858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60509187 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60509408 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60509553 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 60509574 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60511471 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60511654 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60512737 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60513299 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60513401 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60513540 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60513630 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60514146 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 60514202 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 60514326 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60514437 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60514675 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60514943 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60515214 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60515221 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60515230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60515238 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60516002 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60516019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60517025 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60517403 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60517495 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60520704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60523353 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 60523570 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60523777 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 60523902 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60524473 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60524576 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 60524924 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 60525102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60525115 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60525157 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60525314 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60526048 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 19 60526218 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 60526374 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 60526392 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60526399 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60526433 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60526499 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60526571 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60526656 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60526657 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60526771 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 60526923 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60526931 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60527006 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60527018 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60527032 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60527150 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 60527151 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 60527164 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60527195 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60527197 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60527415 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60527527 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60527944 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 60528065 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60528240 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60528252 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60528260 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60528380 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60528385 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60528449 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60528481 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60528493 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 60528527 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60528531 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60528692 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60529028 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60529118 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60529122 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60529323 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 60529326 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60529337 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60529471 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 60529723 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 60529725 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 60529893 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60530019 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60530032 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60530189 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60530231 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 60530497 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60530500 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60531358 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60531746 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60531792 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60532201 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 60532451 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60532465 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 60532932 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 60533360 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 60533541 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 60533595 A C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 19 60533611 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 19 60533948 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60534037 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60534428 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60534532 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60535094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60535139 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60535211 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60535465 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60536521 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60536919 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 60536951 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 60536978 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 60537163 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 60537229 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 60538106 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60538145 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60538191 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 60538228 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60538238 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60538304 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60538379 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60538388 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60538531 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60538544 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 60538546 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60538650 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 60538855 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60538915 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 60538916 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60539230 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 60539304 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 19 60539528 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60539686 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60539998 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60540054 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60541281 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60541330 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60541556 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60541621 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60541695 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60541949 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60541979 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60542328 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60542441 A G Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 19 60542835 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 60542935 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60543405 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60544185 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60544682 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60545344 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60545539 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60545800 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60547387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60547550 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60548812 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 60549281 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60549303 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60549384 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60549442 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60550158 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60550226 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60550922 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60551043 G A N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 19 60551211 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 60551777 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60551845 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60551899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60552017 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60552341 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60552405 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60552669 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60552757 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 60552797 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 60552880 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60553150 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60553319 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 60553467 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 60553567 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 19 60553900 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 60554523 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60554812 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60557003 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60558062 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60559501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60559704 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60559928 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60560599 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60561040 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60561124 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 60561186 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60561309 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60561750 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60561846 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 60561909 T A N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 19 60561928 A C N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 19 60561934 A T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 19 60562017 T G N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 19 60562075 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 60562150 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 60562224 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60562285 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60562806 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60563880 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 60564145 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60564302 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60564339 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60564500 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60564696 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60564752 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60565228 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 60565394 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60565952 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60565988 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60566139 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60566150 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60566250 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60566295 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 60566308 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60566364 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60566389 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 60566431 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60566453 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60566594 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60566895 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60568697 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60568789 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60569373 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 60569381 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 60569403 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60569511 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60569697 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60569744 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60569753 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60569803 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60569856 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60570250 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60570256 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60570549 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 60570752 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 60570816 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60571125 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 60571248 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 60571253 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 19 60571669 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60571967 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60572152 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60572367 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60572399 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60572844 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60573415 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60573945 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60573967 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 60577023 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 60577120 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60578119 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60578136 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60578215 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60578637 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60578666 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60579543 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60579563 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60579704 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60579748 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60579798 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60579940 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60579958 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60580177 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60580211 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60580485 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60580617 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60580649 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60580988 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 60581256 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60581369 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 60581720 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60581737 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60581760 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60581816 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60581970 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60582396 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60582705 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60582768 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60583118 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60583129 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60583604 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 60584009 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60584214 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60584335 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60584409 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60584433 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60584542 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60584703 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60584933 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60584971 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60585157 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60585275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60585553 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60585746 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60585779 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60585804 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60585842 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60586335 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60586531 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 60586590 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60586678 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60586680 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60586698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60586730 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60586766 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 60586782 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60587619 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 60587740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60587977 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 19 60587978 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 60587979 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 60587980 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 60588013 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 60588495 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60588545 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60588801 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60588820 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60589028 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60589418 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60590023 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60590561 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60590960 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 19 60590991 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60591058 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60591663 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 19 60591911 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60592076 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60592125 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60592690 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 19 60592759 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 60592853 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 60592949 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 19 60593244 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60593386 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 19 60593527 A G N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.75 0 0.25 12 4 6 0 2 19 60593579 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 60593630 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 60593631 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 60593646 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 60593673 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60593674 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60593756 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 60593757 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 60593771 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 60593791 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60593801 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60593991 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60594026 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60594036 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60594046 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60594163 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 60594224 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60594296 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60594500 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60594623 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 60594831 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 60595088 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 60595140 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 60595341 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 60595650 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 60595872 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 60596435 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 60596459 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 60596878 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 19 60597323 T G N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 19 60597490 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 60597565 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 60597599 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 19 60597621 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 60597705 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 60598138 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60598157 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60599186 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60599288 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60600598 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60601217 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60601519 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 60601684 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 60601686 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 60601884 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60602717 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60602929 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60603019 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60604227 A T N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 19 60604392 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60605048 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60605067 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60605071 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60605869 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 60606039 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60606321 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60606437 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60606581 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60606733 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60606823 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60606844 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60607045 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 60607667 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60607706 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60607741 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60607837 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 60607876 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60607877 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60608276 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60608644 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 60608650 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 60608730 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 60608802 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 60608962 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60608970 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60608973 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60608975 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60609048 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60609082 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60609098 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60609266 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 60609274 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 60609364 A T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 19 60609499 T A N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 19 60609529 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 19 60609551 C T N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 19 60609851 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60609948 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60610226 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 19 60610326 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 19 60610365 C T N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 19 60610377 C T N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 19 60610571 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 19 60610683 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 60610846 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60610892 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60611214 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60611228 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 60611466 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 60611499 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 60611732 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 60611780 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 60611794 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 60612008 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 60612035 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 60612417 G C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 19 60612637 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60612674 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60612677 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60612734 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 60612973 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 60614340 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 19 60614350 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 60614512 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 19 60614958 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 60615041 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60615501 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 60615699 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60615864 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60615887 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60616031 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 60616355 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60616738 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60616847 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60618842 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60620264 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60621214 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 60621450 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 60621508 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 60621810 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60622091 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60622571 A G N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 19 60622973 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 60623176 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 60623539 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 60623803 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60623975 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 60624627 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 60625941 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 60626021 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 60626496 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 60626584 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 60626592 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60626964 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 60627295 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60627302 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 60627766 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 60627951 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60628797 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60630506 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 60631029 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60631141 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60631571 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 60632195 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60632239 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60632302 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60632524 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60632943 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 60633142 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 19 60633267 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 60633287 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 60633313 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 60633439 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 60633525 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60634592 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 60634989 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 60635253 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60635265 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 60635584 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60635607 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60635627 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60636127 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 60636562 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60636638 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 60636853 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60638331 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60638344 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60638368 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60638747 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 60640442 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 19 60640727 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 60640791 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 60641967 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60643189 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 60644102 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 19 60644220 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 19 60644240 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 19 60645128 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60645396 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60645605 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 60645650 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 60646573 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 19 60646688 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60649677 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 60649918 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 60649920 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60650041 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60650251 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 60651812 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 60652976 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 19 60653032 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 60653034 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 60653189 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60653306 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 60653359 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60653641 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 19 60654715 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60655016 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60655035 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60655474 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60655489 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 19 60655578 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 60655722 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 60655728 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 60655778 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 60655921 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 60655947 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 60657076 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 60657140 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 60657555 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 60657987 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60658811 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60659240 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 60659389 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 19 60660001 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 60660091 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 60660208 T G Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 60660281 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60660530 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 60660556 A T Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 60661069 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 19 60661234 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 60661357 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 60661371 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 19 60661479 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 60661503 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 60661578 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 60661659 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60662387 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 60662501 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 60663050 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60663192 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60663284 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 19 60663342 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60663435 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60663687 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60663715 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 60664249 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60664843 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 60665355 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 19 60665948 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 60665989 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60666873 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 60667037 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 60667092 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60667151 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 60667340 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60667396 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60667922 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60668175 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60669317 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60669645 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60670146 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 60670241 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60670337 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 60670390 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60670476 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 60670482 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 60670490 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 60670769 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60670806 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 19 60671178 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 60671906 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 19 60671950 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60672092 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 19 60672166 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60672520 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60672824 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 60672958 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 19 60673138 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 60673428 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60674112 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 60674342 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60674350 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60674679 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60675244 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 60675319 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 60675405 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 60677161 T C Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 60677897 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 60678232 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60678332 A T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60678393 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 60678610 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60678648 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 60678649 T C Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 60679281 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 60679311 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60679653 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60679701 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60680671 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60681285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60681484 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 60681493 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60681647 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 60681814 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60682382 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60682532 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60682639 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60682698 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60682874 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60682909 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60683032 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60683743 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60683786 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60683860 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60684262 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60684328 A T Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60684348 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60684464 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60684603 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60684722 A T Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60684805 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60684954 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60684965 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60685087 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60685127 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60685289 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60685293 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60685480 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60685559 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60685566 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60685693 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60685711 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60685738 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60685780 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60685865 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60685878 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60685975 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60686189 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60686202 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60686384 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60686409 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 60686550 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 60686716 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 19 60686782 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 60686797 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 60686873 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 60687053 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60687382 C G Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60687425 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60687439 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60687464 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60687595 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60687606 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60687699 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60687703 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60687990 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 60688145 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60688429 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60688610 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 60688698 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 60688718 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 60688792 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60688948 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60689102 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60689305 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 60689350 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60689425 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60689538 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60689556 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60689588 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 60689671 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60689772 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 60689780 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60689783 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60690032 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60690072 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60690187 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60690342 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 60690418 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60690642 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60690694 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 60691003 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 60691008 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 60691042 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60691157 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60691182 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 60691209 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 60691273 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 60691482 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60691492 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 60691561 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60691880 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60692166 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60692194 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 60693253 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60693258 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60693261 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60693268 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60693346 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60693481 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60693495 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60693503 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60693507 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60693520 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60694463 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60694783 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60695575 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60695612 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60695841 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60696363 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60696465 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60696643 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60696645 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 19 60696953 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60697008 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60697271 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60697828 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60698432 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60698935 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 60698998 T A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 19 60699280 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 60699505 T A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 19 60700768 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 60700899 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 60701240 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 60701460 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60701594 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60701632 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60701745 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 60701827 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 19 60701835 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 60701865 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 19 60702533 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60702664 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60703087 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60703608 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 60703639 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 19 60704088 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60704116 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60704241 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60704281 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 60704294 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 60704543 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60704617 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60704659 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 19 60704706 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60704709 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60704927 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 19 60704964 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 60704965 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 60705052 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60705064 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60705235 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 19 60705269 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60705310 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60705445 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 60705518 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 60705520 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 60705556 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60705655 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 60705697 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 60705702 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 19 60705761 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 60705894 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 60706150 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 60706176 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60706574 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60706712 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60706729 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60706748 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60706772 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 60706927 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60706972 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60706995 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60707522 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60707593 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60707594 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60707815 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60707973 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60708035 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60708302 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60708522 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60708659 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60708678 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60708865 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60709121 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60709145 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60709741 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60709838 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60709999 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60710537 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60710677 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60710821 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60710957 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60711812 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60712901 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60713377 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 60714517 C T N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 60714749 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 60714834 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60716604 T A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 19 60716645 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 60716846 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60716873 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60717081 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 60717082 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 60717098 G C N N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.363636363636364 0.363636363636364 0.272727272727273 12 10 4 4 3 19 60717107 G A N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 19 60718339 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60718377 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60718425 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 19 60718435 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 19 60718994 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60719070 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60719276 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 19 60719519 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60719542 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60726339 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 60726388 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 60726409 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 60726500 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60726613 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60726664 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60726701 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60726865 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 19 60727000 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60727053 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 60727081 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60727161 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60727185 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60727432 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 60727433 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60727517 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 60727590 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 60727760 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60727873 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60727996 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60728008 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60728166 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60728244 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60728720 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 60728749 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60728763 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60728793 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 60728835 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 60729248 T C N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 19 60729373 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 60729695 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 60729715 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 60729716 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 19 60729751 A T Y N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 19 60730344 C G N N 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 19 60730874 A T Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60730968 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60731237 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 60731475 G C Y N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 19 60731540 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 60732047 C A N N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 8 8 3 2 3 19 60732324 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 60732728 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60732748 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 19 60732751 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 60732825 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 60732832 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 60732852 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 60732968 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60733193 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60733218 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 60733236 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60733246 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 60733267 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60733392 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60733484 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60733541 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60733556 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60733590 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 60733913 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 60733924 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60734027 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60734242 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60734349 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60734426 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60734836 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60735371 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60735462 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60735667 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60735750 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60735808 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60735874 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60735935 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60735945 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60735946 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60736401 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60736585 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60736586 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60736632 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60736657 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60736768 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60736828 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60736847 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60736925 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60737053 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60737264 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60737393 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60737487 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60737495 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 60737510 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60737581 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60737770 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60737902 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60737943 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60737958 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 60738301 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60738351 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 60738383 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60738397 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60738587 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60738697 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60738718 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60738908 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 60738954 C G Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 19 60739295 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60739304 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60739367 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60739478 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60739480 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60739490 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60739504 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60739559 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60739569 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60739708 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60739989 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60740237 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60740366 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 60740380 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 60740560 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60741025 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60741470 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 60741671 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 60741989 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 19 60742508 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 60742553 T G N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 19 60742779 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 60742881 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 60743068 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 60744331 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60744451 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 19 60745052 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 60745398 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60745520 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 60745717 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60745722 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 60745791 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 60746047 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 60746057 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 60746069 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 60746080 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60747192 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 60747510 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 60747678 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 60747769 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60748098 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60748326 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 60749142 C G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 19 60749159 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 19 60749600 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60749643 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 60749695 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 60749697 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 60750251 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60750316 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60750387 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60750507 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60750797 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60750956 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60751652 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60751726 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60751882 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60752098 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60752382 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60752549 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60752568 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60752759 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60752781 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60752810 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60752987 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60753072 A T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 60753122 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 60753213 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60753277 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 60753287 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60753782 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60753982 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60754141 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 60754343 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60754568 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 60755119 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60755158 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60755850 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60756394 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60756412 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60756413 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 60756499 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60756512 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60756541 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 60756715 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60757018 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60757119 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 60757319 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 60757574 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60757818 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60757980 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60758190 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60758305 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60758469 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60759292 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60759306 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60760116 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60760370 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60760427 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 19 60760503 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60760951 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60761068 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 60761328 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60761410 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60761465 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60761477 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60761514 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60761519 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60762057 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60763118 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 60763152 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 19 60763173 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60763186 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 60763194 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 60763278 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 60763279 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 19 60763484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60763577 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60763637 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 60763652 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 60763800 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60764675 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60764679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60764716 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 60765062 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60765205 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60765451 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 60765458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60765707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60765860 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60765878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60765906 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60765942 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60766312 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60766852 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60766897 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60767036 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60767238 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60767321 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60767487 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60767676 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60767803 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60767960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60767962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60767998 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 60768255 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60768546 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 60769007 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60769165 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 19 60769344 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60769371 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60769372 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60769398 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60769590 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60769603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60769774 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60769823 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60769868 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 19 60770743 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60770949 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 60770952 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60770996 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60771020 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 19 60771025 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 60771063 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60771574 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60771588 T C Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 19 60771720 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60771781 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 19 60771806 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60772007 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60772042 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60772533 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60772886 A G N Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 19 60772983 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 19 60773014 A C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 19 60773022 A C N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 19 60773041 A C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 19 60773046 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 60773186 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60773203 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60773342 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60773449 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60773499 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 60773753 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60773784 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60773845 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60774183 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60774481 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 60774492 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 60774560 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60774731 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60774928 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60776018 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60776046 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60776164 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60776231 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60776234 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60776518 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60776755 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60776775 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60777058 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 60777059 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 60777085 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 60777261 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 60777715 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 19 60777723 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60777821 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 60777822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60778163 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 60778596 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 60778702 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 19 60778707 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 19 60778725 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 19 60778747 T C N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 19 60778894 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 60779144 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60779155 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60779249 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 60780730 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 19 60780757 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60780779 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 19 60781506 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 60781687 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60781732 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60781765 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60781971 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60781974 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60781996 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60782003 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60782032 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60782092 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60782119 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60782236 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60782406 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60782422 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 60782471 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60782521 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60782614 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60782858 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60783012 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60783013 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60784059 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60784189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60784520 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60784533 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60784541 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60784587 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60784597 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60784613 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60784776 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60784829 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60784985 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60785552 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60785575 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60785718 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60785744 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60785783 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60786077 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60786159 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60786304 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60786327 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60786779 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60786868 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60786875 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60786932 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60787183 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60787244 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60787279 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60787347 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60787414 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60787824 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60787886 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60787945 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60787946 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60788080 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60788321 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60788411 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60788462 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60788518 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60789574 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60789725 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60789895 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60790385 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 60790392 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 60790411 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 60790570 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 60791132 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 60791450 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60791508 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60793430 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 60793504 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60794296 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60794539 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60794806 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 19 60796170 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60796621 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60796911 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60797436 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 60798891 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60799019 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60799123 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 60799140 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60799236 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 19 60799650 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 60799711 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 60799723 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 60799726 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 60800114 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60800237 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60802133 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60802946 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60803149 G C Y N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 19 60803626 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60803931 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60804701 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60805334 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60805595 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 19 60806809 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60808206 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60808241 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60808280 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60808731 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60808800 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60808925 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60809144 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 60809181 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60809187 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60809215 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60809930 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 60809935 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 60810052 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 60810078 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 60810092 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 60810093 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 60810198 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 60810234 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 60810281 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 60810300 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 19 60810338 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 60810676 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60810716 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60810763 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60810875 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60810993 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60811258 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 60811264 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 60811266 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 60811286 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 60811341 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 60811452 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 60811652 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 60811703 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60811806 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60812000 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60812004 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60812104 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60812188 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60812873 G T N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 19 60813590 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 60813593 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 60813716 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60814344 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 60814467 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 19 60815030 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 60815667 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60815716 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60815907 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60815963 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60816085 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60816256 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60816403 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 60816503 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60816525 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 60816704 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60816839 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60817361 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60817399 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60817517 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 19 60817779 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60818130 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60818275 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 60818318 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 19 60818757 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 60818788 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 19 60818997 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60819018 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 60819438 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60819667 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60820273 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60820444 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 60820801 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 60821059 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60821474 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 60821631 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60821902 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60822000 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60822317 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60822527 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 60822973 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60823110 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 60823189 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 60823249 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60823288 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 60823328 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60824064 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60824104 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 60824477 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 19 60824584 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60824844 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60824946 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60825346 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 60825347 A T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 60825393 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 60825506 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 19 60825548 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 19 60825647 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60826185 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 19 60826193 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 19 60826247 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 60826598 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60826635 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60826884 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60827238 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60827249 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60827254 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60827446 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60827487 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60827489 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60827763 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60827809 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 60827979 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 60828004 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60828435 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60828637 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 60828821 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 60828985 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60829892 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 60829896 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60829940 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60830353 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60830396 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60830438 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60830905 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60831028 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60831657 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 60832741 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60833466 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60835024 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60835119 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 60835369 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 60836386 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60836564 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60836580 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60836775 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60836818 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60837321 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 60838493 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60838882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60839418 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 60841142 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 60842213 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60842778 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60843153 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60843248 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60843438 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60843712 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60843912 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60844054 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60844424 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60845151 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60845998 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 60846033 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 60846071 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 60846948 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60847375 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60847437 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60847681 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 60848245 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60848919 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60849054 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60849149 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60849446 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60849491 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 60849744 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60850106 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 60850905 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60851262 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60851310 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 60851773 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 60851799 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 60852676 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60853053 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60853435 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 60853602 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60853619 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60854472 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 60854473 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 19 60854701 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60854731 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60854758 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60854774 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60854853 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60855059 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60856355 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60856387 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60856815 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60857453 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60857618 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60858164 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 60859097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60859397 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 60859646 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60859737 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 60859956 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60860542 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60860747 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60860788 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60860912 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60861752 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 60861783 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60861851 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60861855 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60862190 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 60862239 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60862404 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60862437 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60862694 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60862837 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60864093 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60864327 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 60864540 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60864597 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60864869 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60865360 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 60866970 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60866975 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60867067 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60867927 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60868002 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60868077 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60868160 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 60868189 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 60868493 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60868692 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 60869134 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60870078 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60871147 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 60871185 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60871792 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 60873112 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60873215 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60873964 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60873978 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60874046 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60874141 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60874154 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60874236 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60874688 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60874741 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60874744 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60875090 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60875202 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 60875291 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60875716 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60875757 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60875942 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60876053 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 60876268 A G N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 19 60876351 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 19 60876533 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60876536 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60877264 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60877288 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60877312 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60877313 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60877756 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 60877776 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 60878054 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60878385 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60878483 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60878537 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60878774 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60879801 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60880054 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 60880256 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60880396 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60880629 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60880660 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60880708 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60880862 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60880938 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60880942 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60880948 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60881077 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60881657 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60882112 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60882120 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60882145 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60882758 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 60882761 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 60882802 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 60882825 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 60882934 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 60883008 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 60883140 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60884070 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60884217 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60884231 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 60884381 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 60884690 T A N N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 19 60885699 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60886358 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60886479 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60886493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60886534 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60886538 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60886687 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60886693 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60886699 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60886770 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60886783 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60886875 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60887347 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60887363 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60887371 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60887395 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60887628 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60887695 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60887777 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 60887972 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60887974 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60888029 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60888069 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 60888163 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 60888170 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60888259 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 60888414 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 60888426 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 60888566 A T N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 19 60888569 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 19 60888582 G T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 19 60888625 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 19 60888797 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 60888914 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60889152 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 19 60889274 C G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 19 60889703 A T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 19 60889853 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 19 60889996 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60890051 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60890097 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60890160 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60890233 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60890300 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60890301 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60890537 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60890675 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60890678 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 60890864 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60890892 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 60891029 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 60891044 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60891203 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60891217 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60891255 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60891262 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60891339 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60891347 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60891354 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60891394 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 60891427 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60891440 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60891486 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60891625 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60891626 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60891724 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60891907 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 60891984 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 60891996 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 60892145 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60892164 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60892323 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60892348 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60892417 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 60892495 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60892511 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60892665 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60892906 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60893075 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60893235 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60893257 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60893304 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60893559 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60893592 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60893699 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60893728 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60894001 G A Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 19 60894116 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 60894490 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60894621 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60894645 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60894710 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60894806 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60894880 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60894889 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60895067 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60895288 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60895289 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60895528 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60895529 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60895675 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 60895792 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 19 60895802 C A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 60896064 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 60896207 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60896361 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60896366 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60896369 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60896387 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 60896425 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 60896426 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60896732 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60896750 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60896775 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60896901 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60896919 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60896947 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60896962 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 60897036 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60897084 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60897101 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60897128 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60897489 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60897507 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60897717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60897718 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 60897755 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 60897764 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60897894 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60897936 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60897952 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 60898044 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60898046 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60898168 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60898351 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60898373 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60898512 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 60898544 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 60898789 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 60899078 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60899137 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 60899359 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60899394 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60899395 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60899474 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60899481 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60899611 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60899957 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 60900148 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 60900486 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60900528 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60900626 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60900633 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60900696 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 60900797 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60900841 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 60900881 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60900898 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60901092 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60901130 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60901202 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60901236 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60901363 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60901416 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60901549 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60901570 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60901598 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60901637 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60902002 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60902026 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 60902089 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 60902120 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60902302 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 19 60902316 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 19 60902647 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 60903092 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 19 60903094 C A N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 19 60903120 G T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 19 60903388 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 60903408 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 60903693 A T N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 19 60903716 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 19 60903741 T C Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 19 60903749 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 60903780 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60903814 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60903837 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60903894 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60904089 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60904435 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60904511 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60904554 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60904589 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60904627 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60904641 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60904648 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60904704 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 60904716 A C N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 19 60905523 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60905545 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60905548 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 60905561 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 60905608 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60905640 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60905713 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 60905730 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 60905789 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 60905978 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 19 60906611 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60907043 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60907065 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 60907484 C T N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 19 60907541 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 19 60907542 A G N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 19 60907839 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 60907951 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60907958 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60908004 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60908021 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60908171 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60908353 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60908698 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60908751 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 60908887 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 60909018 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60909096 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60909109 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60909230 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60909251 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 60909454 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60909467 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 60909645 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 60909677 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60909681 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60909762 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 60909785 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60909801 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60909865 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60909869 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60909944 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60910010 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60910022 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60910077 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60910152 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 60910248 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 60910545 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60910576 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60911054 A G Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 60911434 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 19 60911488 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 60911563 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 60911609 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60911641 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60911767 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60911976 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 60911977 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 60912086 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 60912148 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60912331 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60912387 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60912466 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 60912577 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 60912779 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60912800 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 60912844 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60913064 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 60913065 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 19 60913109 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60913175 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60913296 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60913409 A C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 60913436 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60913554 A T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 60913563 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 19 60913564 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 19 60913649 A G N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 19 60913724 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 19 60914085 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60914443 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60914459 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 60914514 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60914533 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60914547 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60914671 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60914760 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 60914761 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 19 60914870 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 60914921 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 60915070 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 60915260 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60915264 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60915356 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60915396 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60915445 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60915478 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 60915563 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60915625 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60915739 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60915756 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60915789 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60915832 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60915899 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60916068 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 60916093 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 19 60916095 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 19 60916118 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 19 60916136 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 60916293 G T N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 19 60916297 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 19 60916461 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 60916670 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60916847 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60917070 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 60917078 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60917083 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60917155 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60917320 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60917356 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60917578 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60917594 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 60917597 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 60917602 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 60917705 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60917866 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60917903 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 60917912 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 60918198 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 60918364 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60918375 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 60918479 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 60918587 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60918596 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 60918599 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60918713 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 60918810 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60919009 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60919082 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60919105 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60919136 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 60919159 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 60919624 T A Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 60919639 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60919642 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60919652 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60919677 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60919683 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60919730 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 60919905 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 60919915 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 60920069 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60920097 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60920235 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 60920474 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60920491 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60920544 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60920595 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60920611 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60920623 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60920631 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60920652 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 19 60920707 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60920812 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 60920860 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60920928 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60921048 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60921058 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60921113 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60921132 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60921149 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 60921271 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60921526 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 60922127 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60922184 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 60922186 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 60922198 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 19 60922413 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 19 60922541 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60922723 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60922730 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60922784 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60922860 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60922898 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60922980 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 19 60923034 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60923051 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60923068 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60923363 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60923458 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60923686 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 19 60923886 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60923902 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 60923918 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60923951 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60924046 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 19 60924070 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 19 60924078 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 60924111 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60924459 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 19 60924494 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 19 60924674 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60924681 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60925073 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 60925207 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60925256 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60925257 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60925399 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60925436 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60926052 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 19 60926064 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60926169 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60926172 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60926440 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60926839 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 19 60927042 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60927235 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 19 60927289 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60927291 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60927392 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 60927542 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 60927633 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 60927700 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 60927892 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60927959 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 60928198 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 19 60928366 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 60928545 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 60928547 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 19 60928681 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60928704 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 60928768 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60928918 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 60928938 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 60928963 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 60929181 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60929359 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60929385 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 60929752 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 19 60929880 T G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 60930007 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 60930037 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 60930054 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 60930207 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60930221 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60930435 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60930447 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 60930483 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60930586 G C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 60930661 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60931019 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 19 60931115 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60931184 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 19 60931231 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 60931234 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 60931309 T G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 60931395 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60931419 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 60931697 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60931853 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 60931871 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60931935 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 60931969 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 60932267 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 60932297 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 60932402 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 60932447 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 60932455 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 60932594 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 60932598 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 60932614 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 60932621 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 19 60932721 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60932825 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 60932864 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60932931 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60933244 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 60933432 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 60933474 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60933645 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 60933661 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60933697 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60933744 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 60933756 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 60933770 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 60933773 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 60933840 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 60934040 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60934136 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60934175 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60934255 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60934365 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 60934382 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60934421 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60934612 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60934653 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 60934683 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 19 60934716 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 19 60934745 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 60934749 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 19 60934759 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60934770 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 19 60934819 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 60934992 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 60935047 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 60935128 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 60935132 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 60935193 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 19 60935232 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 60935362 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 60935369 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 60935475 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 60935517 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 60935562 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 19 60935609 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 19 60935687 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 60936203 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 60936291 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60936364 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 60936429 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 60936524 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 60936679 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 60936783 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 60936817 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 60937165 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60937190 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60937191 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60937232 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60937343 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 19 60937531 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 60937541 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 60938311 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 19 60938447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60938813 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60939104 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 60939140 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60939203 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 60939339 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 60939345 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60939356 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60939374 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60939395 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 60939404 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 60939574 A G N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 19 60939577 C A N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 19 60939938 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 19 60940323 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 60940370 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 60940715 G A N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 19 60941042 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60941120 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 19 60942008 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 19 60942240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60942612 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 60942652 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60942947 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 60943080 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60943138 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 60943339 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60943560 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60943858 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 60943963 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 19 60944201 C A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 19 60944392 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 60944443 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60944567 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 60944824 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60944894 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 60944947 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 60944973 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60945016 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 60945024 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 60945038 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 19 60945060 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 19 60945115 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 19 60945126 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60945716 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60945727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60945856 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 60946204 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60946244 G T N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 19 60946323 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 19 60946435 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 19 60946580 C T N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 19 60946619 A G N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 19 60946777 T C N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 19 60946800 G A N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 19 60946972 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 19 60947204 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 60947613 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 60947673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60948202 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60948367 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 60948682 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 60949227 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 60949408 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 60951387 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 60954114 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 60954194 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60954262 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60955043 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 60955146 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 60955459 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 60956509 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 19 60957844 A T N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 19 60958105 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 19 60958440 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 60958809 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60959057 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60959206 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60959275 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60959327 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 60959349 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60960122 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 60960206 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 60960239 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60960308 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60960894 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 60960898 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 60960904 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60961197 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 60961395 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 60961396 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 60961660 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60961677 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 60961689 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60961707 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 19 60961724 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60961771 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 19 60962103 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 60962149 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 60962308 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60962385 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 19 60962483 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 60962544 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 60962576 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 60962650 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60963041 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60963076 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60963087 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60963088 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60963363 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 60963385 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 60963505 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60963592 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60963942 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 60964087 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 60964183 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 60964349 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 19 60964520 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 19 60964700 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60964731 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60964754 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60965046 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60965225 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 60965402 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 60965860 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60966705 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 60966706 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 60967924 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 19 60967979 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60968440 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 60968513 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60968875 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 19 60968876 A C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 19 60968959 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 60969496 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 19 60969504 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 60969539 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 60970015 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60970076 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60970109 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60970211 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60970317 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60970833 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60970848 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60971489 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60971626 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60971799 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 60972186 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 60972816 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 60973582 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60973965 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60974584 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60975269 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60975310 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60975348 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 60975460 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 60975566 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60975606 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60975778 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60975843 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 19 60976026 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 19 60976292 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60976371 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 60977172 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 19 60977217 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60977747 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60978177 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60978361 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60979022 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 60979503 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60979725 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60979977 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 60980259 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 19 60980332 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 60980468 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 60980626 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 19 60980639 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 60980772 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 19 60981024 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 19 60981240 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60981429 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 60981459 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 60981479 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 60981595 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60981644 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 19 60981770 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 19 60981841 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 19 60982308 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 60982580 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 60982861 A G Y Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 19 60983953 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 19 60984106 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 19 60986011 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 19 60987110 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 60987457 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 60987781 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60989425 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 60989496 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 60989707 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 60991224 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 19 60991336 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60993193 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60993902 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60993920 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 60994027 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 60994108 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 60994140 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 19 60994193 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60994237 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 60994676 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60994936 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60995247 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60995581 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60995608 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 60995630 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60995787 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60995815 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60995867 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60995869 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60995909 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60996090 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 60996324 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60996346 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60996624 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60996748 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60996860 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60997043 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60997128 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 60997352 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 19 60997457 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 60997596 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 60997682 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 60997757 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 60998141 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60998410 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 60998446 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60998714 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 60999061 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 60999075 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 60999151 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 60999321 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 60999430 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 60999440 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 60999641 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 61000001 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61000066 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 61000194 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 61010211 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 19 61010567 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 61010590 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 61010656 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 61011137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61012074 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 61012536 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 61012643 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61012678 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 61013066 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 61013090 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 61013091 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 61013177 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 61013178 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 61013456 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 61014204 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 61014508 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61014608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61014704 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 61014716 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 61014811 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 61014996 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 61015027 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 61015505 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 61015526 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 61015597 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 61016095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61017127 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 61017405 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 61018094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61018574 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61020154 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 61020751 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 61020752 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 61020780 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61020842 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 61020849 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 61020988 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 61021026 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 61021043 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 61021051 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 61021969 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 61022152 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 61022265 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 61022389 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61022620 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 61022752 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 61023545 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 61025067 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61025932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61026063 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61026763 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 61026873 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 61027657 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61029206 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61029650 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61029797 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 61029850 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 61029851 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 61030419 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 61030755 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61030792 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 61030803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61030828 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 61030904 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 61030905 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 61030917 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 61031127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61031148 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61031254 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61031293 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61031321 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61031334 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61031396 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61031562 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61031767 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 61031915 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 61032097 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 61032286 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 61032366 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 61032874 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61032903 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61033118 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 61033204 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 19 61033532 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 61033589 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 19 61033703 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61033704 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61033734 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 61034058 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61034166 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61034418 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61034438 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61034455 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61034457 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61034768 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 61034836 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 61034947 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 19 61034964 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 61035070 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 61035150 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 61035224 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61035376 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61035413 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 61036060 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61036071 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 19 61036219 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 19 61036224 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 61036807 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61037073 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 61037129 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 61037149 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 61037189 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61037191 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 61037267 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61037304 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61037482 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 61038087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61038197 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 61038735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61039163 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 61039640 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 19 61039864 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 61039971 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 61040613 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 61040772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61040942 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 61041117 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 61041124 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 61041156 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 61041581 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 61041670 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 61041807 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 61042185 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 19 61042585 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 61043128 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 61043214 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 61043315 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 61043334 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 61043403 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 61043547 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 61043552 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 61043575 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 61043724 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 61043755 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 61043905 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61044469 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 61044610 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61044712 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 61044801 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 61044816 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61044889 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 61044961 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 61045041 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 61045107 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61045209 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 61045502 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 61045528 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61046077 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 61046081 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 61046503 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 61046506 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 19 61046581 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61046582 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61046719 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61046789 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 61047365 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 61047623 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61047945 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 61048197 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61048815 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 61049282 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61050458 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 61050719 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 61053796 T A N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 19 61054968 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61055901 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61056761 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 61058627 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61058784 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61058915 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61059168 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61059256 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61059953 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61060064 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61060102 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 61060564 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61060641 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61060867 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 19 61061237 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 61061355 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61061494 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61061606 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61061857 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 61062224 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 61062225 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 61062517 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 61062649 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 19 61062701 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 61063263 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 61063845 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 61064144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61064574 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 61064961 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 61066223 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 61066255 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 61066499 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 61066667 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 61066804 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 19 61066995 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 61067042 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 61067153 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 61067190 T C Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 19 61067233 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 19 61067408 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 19 61067416 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 61067475 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 61067516 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61067558 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61067630 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61067801 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61067993 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61068092 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61068289 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61068302 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 61068410 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 19 61068994 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 61068997 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 61069177 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61069288 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61069472 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61069477 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61069671 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 61069846 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 19 61069859 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 19 61069863 C A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 19 61069943 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 61070058 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 61070105 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 19 61070590 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 61070769 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61070903 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61071241 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61071907 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 61073375 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61074225 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 19 61075072 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61075448 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 61075449 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 61075756 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 61075919 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 19 61077350 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61077678 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 61077884 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61078097 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61078188 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61078216 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61078254 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61078348 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 61078542 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61078551 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 61078926 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 61078940 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61078948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61078964 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 61079055 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61079476 G C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61079521 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61079541 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 61079641 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 61079870 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 61080383 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61080423 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61080611 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61080617 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61080712 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 61080985 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61081419 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 61081686 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61081689 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61081702 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 61082355 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 61082939 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 19 61082966 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 61083076 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61083215 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 61083737 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 61084209 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61084755 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61084865 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61084964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61085324 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 61087819 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61088199 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 61088434 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61088465 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61088795 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61088804 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 61088888 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 61089270 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 19 61089276 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 61089302 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 19 61089362 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 61089367 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61089376 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61089628 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 61089976 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 61090004 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 61090127 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61090188 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61090307 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61090335 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61090339 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61090407 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61090416 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61090436 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61090490 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61090679 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 61090680 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 61090688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61090876 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61090947 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 61091298 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 61092289 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 19 61092942 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61093457 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61093713 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61093790 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 61093918 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 61093925 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 61094113 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61094116 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61094262 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 61094331 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61094588 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 61094750 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 61094780 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 61094968 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61095211 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61095272 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61095290 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61095409 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61095877 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61095975 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61096000 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61096027 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61096086 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61096270 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61096720 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 19 61096763 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 61096983 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61097203 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61097224 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61097228 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61097519 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61097798 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61097976 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61098270 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 61098577 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61099250 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61099556 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 61099689 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 61099705 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 61099880 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61100099 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 61100112 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 61100594 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 61101012 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 61101026 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61101037 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 61103117 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61103301 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 61103339 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61103354 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 61103445 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 61103465 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61103513 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 61103597 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61103654 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 61103753 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61103901 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 61104247 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 61104659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61104663 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61104742 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 61105083 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61105133 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61105170 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61105172 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 61105246 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 61105385 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61105612 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61105692 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61105814 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 61106117 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 61106481 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 61106684 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 61106690 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 61107255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61107807 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 61108265 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 61108280 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 61108417 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 61108545 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61108561 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 61108878 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 61108907 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 61109201 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 61109841 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 61110741 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 61110743 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 61110888 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61111298 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61111604 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 61113353 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61113677 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61114970 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 61115481 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61118023 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61118252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61118442 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61118454 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 61118511 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61118514 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61118815 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 61118958 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61119088 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61122710 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61122786 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 19 61122817 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 61123071 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 61123105 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61123236 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61123551 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61123552 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61123667 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61123818 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 61123898 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61123900 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61125067 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61125387 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 61125533 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 61125623 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 61125728 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 61126073 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61126258 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61126525 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61126557 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61126622 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 61126652 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 61126702 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 61126741 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 61126931 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 19 61127136 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 61127231 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61127354 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 61127402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61127433 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61127460 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61127906 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 61127980 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 19 61127982 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61128298 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61128354 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61129163 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 61129566 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 19 61130250 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 61130307 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 61130695 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61130710 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 61130796 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 61131011 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 19 61131026 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 61131208 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 61131215 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 19 61132365 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 61132483 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 19 61132693 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 61132756 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61132859 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 61133561 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 61133562 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 61133659 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61133873 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 19 61133878 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 19 61134004 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 61134310 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 61134347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61134839 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 61134875 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 61136243 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 61136345 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 19 61136537 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 19 61137084 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61137092 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 61137125 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 61137344 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 61137453 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 61137564 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 61137829 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 61137998 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 61138412 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61138603 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 61138641 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 61138844 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 19 61138939 A C Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 61139149 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 61139156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61139237 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 61139257 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 61139724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61139766 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 61140217 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 19 61140493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61140506 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 61140791 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 19 61141212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61141346 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61141395 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61141481 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61141513 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 19 61141554 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 61141611 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 61141651 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 61141825 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61141875 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 61141881 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 61142392 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 19 61142524 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 61142837 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 61142851 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 61143098 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 19 61143232 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61143258 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61143616 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61143645 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61143940 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61143952 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61144017 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 61144087 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 61144101 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 61144947 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61145090 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 61145705 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 19 61145817 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 19 61145945 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 61146327 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61146765 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61146893 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61147028 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61147246 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 61147590 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 19 61147695 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 19 61147944 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61148273 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61148571 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61148658 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61149522 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 61150217 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61150735 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 61151600 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 61152505 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61152519 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61153093 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61153123 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 19 61153149 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61153411 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61153511 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61153605 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61153648 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61153689 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 19 61153733 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 61153929 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 61153952 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 19 61154374 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61154385 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61154560 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61154595 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61154632 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61154639 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61154714 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61154746 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61154824 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61154864 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61154915 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61154921 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61154944 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61155018 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61155818 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 61155829 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 61155869 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 61156283 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61156551 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61156746 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61156900 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61157037 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 61157051 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 61157394 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61157489 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61157909 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 61157994 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61158178 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61158227 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61158371 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61158391 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61158519 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61158583 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61158700 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61158759 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61159127 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61159269 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61159285 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61159292 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61159375 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61159495 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 61159837 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61159958 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 61160287 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61160484 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61160570 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 61160787 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 19 61161169 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61161280 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61161561 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61161795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61162046 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 19 61162610 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 61162611 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 19 61162812 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 61162839 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61162882 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 61163144 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 19 61163451 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 19 61163486 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 61163500 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 61163525 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 19 61163585 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61163592 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 19 61163661 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 61163721 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 19 61164344 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61164873 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 19 61165133 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61165156 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61165427 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 19 61166099 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61167036 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 61167264 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61167387 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 61167388 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 19 61167390 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 19 61167514 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61167959 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 61168731 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61169359 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61169653 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 19 61169847 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61169940 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 19 61172122 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61172630 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 61173055 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 61174179 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 61175889 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61176279 T A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 19 61176400 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 19 61176705 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 61178246 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61179446 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 61179586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61179676 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61179738 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 61179872 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 61179916 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 61180309 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61180314 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61180339 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61180387 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61180421 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 61180731 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61180887 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61180893 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61182818 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 61182907 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61183066 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61183361 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61183441 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 61183856 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61184035 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61186029 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61186097 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61186342 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 61186417 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 19 61188420 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61188877 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 61189303 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 61191173 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61192357 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 61193667 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 19 61196288 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 61196421 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 61196524 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 19 61197827 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61198112 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 61198966 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 61199279 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 19 61200340 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61200643 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 19 61201831 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 19 61201902 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 19 61202120 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 61202577 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 61202818 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61203316 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61205610 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 19 61206721 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 61207030 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 61207128 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 61207186 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 61207404 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61207427 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61207613 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 61207982 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 61208072 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 61208323 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61208351 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 61208610 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61208675 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 61208918 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61209051 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 19 61209156 G T N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 19 61209297 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 19 61209629 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61209650 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 61210194 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61210460 G T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 19 61210744 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 61210856 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 61210948 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 61211656 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 61211986 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 61212007 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 61212135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61212154 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61212268 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61212497 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 61212546 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 61212577 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 19 61212685 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 61213466 G A Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 61213474 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 19 61214894 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61216334 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61216836 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 61216852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61224739 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61224763 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61225261 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 61225518 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 61225627 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 61225769 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 61225927 T G N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 19 61226012 G A N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.4 0 0.6 4 6 2 0 3 19 61226029 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 19 61226148 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 19 61226261 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61226272 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61226381 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 61226410 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61226765 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 61227179 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 19 61227386 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 61227388 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 61227408 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 61227416 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 61227428 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 19 61227582 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 61228082 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61228185 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61228200 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61228339 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 61228350 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 61228398 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61228451 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61229343 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 61229350 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 61229987 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 61230046 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 61230577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61230891 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61231007 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 61231147 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 61231665 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 61231921 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61233017 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 61233588 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 61233721 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61233960 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61234543 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 61234579 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 61234828 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 19 61235280 G A N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 19 61235541 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 19 61235554 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 61235756 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61236074 T G N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 19 61236364 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 61236366 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 61236380 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 61237165 C G Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61237281 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 61237415 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 61237627 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 61237648 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61238153 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 61238340 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 19 61238469 A T N N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 19 61240113 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 19 61240114 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 19 61240154 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 19 61240313 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 19 61240322 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61242733 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61242889 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 19 61242940 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 61243006 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 61243078 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 19 61243993 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 61244033 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61244282 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61244361 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 19 61244422 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 19 61244425 G C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 19 61244435 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 19 61244442 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 61251239 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 61251908 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 19 61253008 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 61253144 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 61253539 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61257997 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 61263174 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61263187 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 61269396 A T Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 19 61270122 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 61272021 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61276559 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 61276751 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 61276826 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 61277717 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61280464 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 19 61282844 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61283468 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 61283830 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61286182 C A Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 19 61286352 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 19 61286554 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 61290286 G T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 19 61290377 T A N N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 19 61291018 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 19 61291787 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61292197 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 61292782 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 19 61293406 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 61294919 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 19 61295655 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61296514 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 61297070 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61297371 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61300653 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61300654 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61301121 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 61301583 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 19 61301949 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 61303254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61304201 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61305205 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 19 61306258 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 61307403 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 61308328 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 19 61309009 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61309928 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61311535 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 61311565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 19 61313059 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 19 61313469 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 61319042 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61322379 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61322668 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 19 61322820 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 19 61322943 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61323809 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 61329615 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61330354 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 61330713 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 19 61332329 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61333922 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61333993 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 61336191 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 19 61337203 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 19 61337389 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 19 61340899 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10